Gérer ses références bibliographiques avec ZoteroChoix des options pour l’export des références (pdf, copie d’écran, mots-clés) Activation de l’indexation des pièces

Gérer ses références bibliographiquesavec Zotero

Christiane Roure, Christine Silvy, Dominique Fourni erMontpellier - 29 mai 2012

Objectif� Présentation des principales fonctionnalités permettant

– la collecte des références bibliographiques (import, saisie, …)

– la gestion des références (dossier, tag, …)

– leur utilisation dans un document (citation, bibliographie, style)– la synchronisation avec le serveur Zotero

– le partage des références bibliographiques

Christiane Roure, Christine Silvy, Dominique Fourni erMontpellier - 29 mai 2012

Plan de la présentation� Caractéristique du logiciel� Installation� Interface� Collecte des données � Enrichissement des références� Organisation des données (Collections)� Recherche� Liens avec traitement de texte (Word)� Synchronisation des références avec le serveur� Partage des références avec des groupes

Christiane Roure, Christine Silvy, Dominique Fournier


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ZoteroPrésentation générale

� Créé fin 2006

� Projet du Center for history and New Media (University georgesMason, Virginia USA)

http://chnm.gmu.edu/

� Fonds de plusieurs institutions et fondations

Unitive States Institute of Museum and Library Services (IMLS) http://www.imls.gov/

Andrew W. Mellon Foundation http://www.mellon.org

� Ethymologie : vient du verbe albanais zöteroj =« master, acquire »« apprendre »


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ZoteroLogiciel libre de gestion

bibliographique� Extension du navigateur Firefox (> version 2)� Extension de firefox, mais données stockées indépendamment

� Multi-plateformes (Linux, Mac, Windows)

� Captures de pages web

� Orientation hypermédia (vidéos, images, pages html, billets de blogs)

� Possibilité d’annoter les références

� Multilingue dès le départ (dont le français)

� Utilisation individuelle et/ou collective

� V2/V3 : synchronisation, collaboration, partage de données etc.

� Fort dynamisme de développement

� Version 3 (Firefox et Standalone)


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Zotero version 3.0.7 (mai 2012)

� Support adapté à la version 3 de Zotero pour Firefox

� Nouveautés V3/V2 et (V3 Standalone)� Recherche des doublons

� Recherche simple : 3 modes de recherche

� Insertion de la biblio dans word

� Zotero devient mobile sur iphone, ipad, Android…

� ZotPad client ipad pour Zotero


Installation de Zotero 3.0


Zotero standalone� Version 3 actuelle

compatible Mac OS X, Windows et Linux� Télécharger Google Chrome et les connecteurs (sous

environnement windows)� Téléchargeable sur la page d’accueil de Zotero.org� Plus besoin d’avoir l’extension Zotero de Firefox ouverte pour voir

sa bibliothèque� L’interface et les fonctionnalités restent les mêmes� Zotero Standalone partage un répertoire avec Zotero/Firefox, les

articles de l’un sont donc sauvegardés dans l’autre� Voir le Forum correspondant sur le site de Zotero

http://forums.zotero.org/14/


Interface Zotero 3.0

Liste des dossiers

(collections), marqueurs

Références de la collection, du

marqueur ou de la recherche

Détail de la référence

sélectionnée

Barre de menu


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Le menu et les icônes de Zotero(détail de chaque fonction)

Créer nouvelle collection

Nouveau groupe

Roue denteléeActions(détails plus loin)

Ajouternouvel élément

Créer un nvel éltà partir de la page courante

Ajouter un élémentpar son identifiant

Nouvelle note

Joindre/attacher un fichier(voir plus loin)

Recherche avancée

Synchronisationavec serveurZotero

BasculeModeplein écran

Fermer Zotero

Recherchesimple

Affichage page web


Personnalisation de ZoteroPréférences

� Choix du répertoire pour sauvegarde des données� Choix des options pour l’export des références (pdf, copie

d’écran, mots-clés)� Activation de l’indexation des pièces jointes� Import par défaut des fichiers RIS (à désactiver si

utilisation d’EndNote)� Paramétrage du résolveur de liens (SFX)� Paramétrage du compte pour la synchronisation� Gestion des styles

Flèche verte au dessus de l’onglet info

�Le Bouton Afficher (petite flèche au-dessus de l’onglet info) est actif quand la réf. est un site web. Un clic sur ce bouton fait

apparaître la page du site dans le navigateur.

�Le Bouton Localiser , au-dessus de l’onglet Info : lien vers CrossRef et vers les moteurs ; dans les préférences de Zotero, le

résolveur de lien est paramétré par défaut vers WorldCat, pour localiser le document (on peut modifier ce paramétrage vers un autre

catalogue par le menu actions-> préférences, par exemple vers le SFX de l’INRA)



Création de collection (s)

� Cliquer sur l’icône « Nouvelle collection »

– Collection: fichier ou base bibliographique dans lequel sont enregistrées les références bibliographiques (classement thématique par exemple)

– Pas de limite du nombre de collections– Par défaut, le dossier « Ma Bibliothèque » contient la

liste complète de toutes les références des différentes collections


Collecte des références (1)�Automatique pour les sites compatibles : simple

clic sur l’icône présent sur la barre de navigation

� Se positionner au préalable dans la collection� Liste des sites compatibles avec Zotero (import par

simple clic sur la barre de navigation) ou partiellement compatibles (export document par document ou via format RIS, txt ou Endnote)http://www.zotero.org/translators/

liste de références

une référence


Collecte des références (2)�Si import automatique impossible, 5 possibilités :

1 : import d’un fichier de références (exemple EndNote)2 : saisie manuelle d’une référence3 : création d’un élément à partir de la page web en cours4 : recherche d’une référence biblio à partir de son

identifiant (DOI, …)5 : récupération des métadonnées à partir d’un fichier pdf

1 2 3 4

5


Collecte : Import d’un fichier Endnote

� Dans Endnote, sauvegarder les références avec le style format RIS

� Dans Zotero, importer en cliquant sur « Actions »

� Les références se trouvent dans collection « importéle… ». Les copier dans la collection choisie puis les retirer (ne pas les supprimer)


Collecte de notices bibliographiques à partir de son identifiant (DOI, ISBN, PMID)

�Cliquer sur l’icône « ajouter un élément par son identifiant »

�Saisir le DOI, ISBN ou PMID

Démo DOI : 16/jfoodhyd.2005.06.009


Création d’une référence à partir d’un fichier PDF

�Création d’un élément à partir d’une copie d’un fichier (sauvegardé sur votre ordinateur)

�Possibilité de récupérer les métadonnées du PDF (via Google Scholar) et de renommer le PDF

Démo pdf


Création d’un nouvel élément à partir d’une page web

� Cliquer sur l’icône « créer un nouvel élément à partir de la page courante »

– capture d’une page web (présente un intérêt pour veille) ou d’un pdf

Démo page web


Création d’une référence à partir d’une note de lecture

�Sélection d’une note sur internet, clic droit

�Elément créé dans Zotero


Saisie manuelle de référence�Choix du type d’élément

� ergonomie de la grille de saisie

�Renseigner les différents champs


Collecte de références bibliographiques

Web of Science ☺☺☺☺clic sur barre navigation

Cab Abstracts ☺☺☺☺ ��clic sur barre navigation (pb de pagination) (pb WoS – WoK 5 ?)

PubMed ☺☺☺☺clic sur barre navigation

Econlit / Francis ��export format RIS + Import dans Zotero

Science Direct ☺☺☺☺clic sur barre navigation et Import direct dans Zotero depuis l’icône pdf

Nature Publishing Group ☺☺☺☺clic sur barre navigation (+ pdf)

Horizon ☺☺☺☺clic sur barre navigation

Sudoc ☺☺☺☺clic sur barre navigation

Google Scholar ☺☺☺☺clic sur barre navigation

Scirus ☺☺☺☺clic sur barre navigation (pour SD) ou export RIS


Enrichissement des références (1)

�Ajout de marqueurs (= tags, mots-clés)- mots-clés (auteurs, perso)

- thèmes de recherche- classifications- autres (facteur d’impact, équipe de recherche, …)

– Saisie manuelle

– Par glisser-déposer

� tous les marqueurs sont mélangés


Enrichissement des références (2)�Possibilité d’attacher plusieurs types de fichiers

à une référence

� possibilité de récupérer les pdf lors de l’import des références à partir d’un site d’éditeur (option à cocher dans les Préférences de Zotero)

Le fichier va être stockédans les données de

Zotero : vivement conseillé


Liaison entre références

�Possibilité de relier des références (chapitres d’un même ouvrage, traductions d’une même œuvre, …)


Gestion des références

�Classement par collections

�Dupliquer une référence, la retirer de la collection et/ou la supprimer de la bibliothèque (suppression définitive)

�Tri par colonne A �Z (simple clic)

�Choix de l’affichage des colonnes


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Recherche simpledans ma bibliothèque ou une collection

- Recherche dans toutes les références + fichiers attachés + notes et dans tous les champs y compris les marqueurs(+ dans les pdf si sont indexés)- troncature * et opérateurs AND/ET implicites

- minuscules / majuscules sans importance

3 modes de recherche sélectionnés


Recherche dans la base (2)

�Recherche par marqueurs


Recherche dans la base (2)

� Recherche avancée : – Dans tous les champs de Zotero– Recherche dans le texte intégral des pièces jointes et les

annotations

� Possibilité de sauvegarder sa requête � création d’une nouvelle collection qui comprend toutes les références correspondant à la recherche + nouvelles références répondant à la requête (collection dynamique)


Sauvegarde d’une collection ou de la bibliothèque

� Se positionner sur la collection + clic droit ou clic sur l’icône « Actions »

� Sauvegarde de la collection (Zotero RDF) avec ou sans notes et fichiers

� Pour récupérer la sauvegarde, import du fichier RDF� Synchronisation sur le serveur pour stockage /

sauvegarde


Edition de liste de références

�Clic-droit sur la collection ou sur une sélection de références � créer une bibliographie

�Sélectionner un style de citation �Choisir un format (RTF, HTML, presse papier)

� liste de références éditable, imprimable, exportable


Rédaction d’un document avec Word (1)

� Installation du Word Processor Plugin

� Affichage d’une barre d’outils Zotero dans Word

pour insérer une ou plusieurs citations dans le texte

pour éditer une citation déjà insérée (suppression auteur, page)

pour insérer une bibliographie complète (avec styles)

pour éditer la bibliographie (changement de style, actualisation)

pour mettre à jour vos citations dans le document

pour éditer les préférences, choisir le style de citation à insérer

pour enlever les codes


Rédaction d ’un document avec Word (2)

�Insertion des citations dans le texte

Démoword


Rédaction d ’un document avec Word (3)

� Création de la liste bibliographique finale en utilisant le style de la revue (= instructions aux auteurs)

Pré-visualisation des styles : passage de la souris sur la page des styles du site www.zotero.org/styles ou copier chrome://zotero/content/tools/csledit.xul dans fenêtre navigation Firefox

Style : Nature Journal

Style : Annals of Botany

Le partage de références

bibliographiquesde nouveaux outils pour collaborer


�Travailler avec des collaborateurs partout dans le monde

�Partager des références et des documents dans un

espace commun, sur le web

�Travailler et accéder à ses collections de n’importe où,

même depuis un ordinateur autre que le sien

�Gérer les publications d’un collectif et les publier sur le

web pour accroître sa visibilité

�S’intégrer dans une communauté scientifique

�Gérer son profil personnel et son identité numérique

Les chercheurs et le web2.0


�Nécessité de se créer un compte sur le serveur (enregistrement gratuit)

�Stockage de références bibliographiques et de documents (limite

gratuite 100 Mo)

�Récupération en local des références et documents (par

synchronisation entre le serveur et sa bibliothèque en local)

�Partage de références et documents en invitant des collègues

�Accès à des références et documents en se faisant inviter par d’autres

�Accès à des références scientifiques signalées par des chercheurs et

regroupées par thématiques (collections publiques) : Zotero, Mendeley

�Possibilité de travailler directement sur ses propres références sur le

serveur

Un espace collaboratif sur un serveur


Principe du partage de références

bibliographiques


Le partage avec Zotero


Création de groupes à partir du serveur web :Groups > Create a new group …Paramétrage des propriétés du groupe et des droits de ses membres Group SettingMembers setting (administrateur, propriétaire, membre)Library setting (reading, editing, file editing)

Synchronisation de l’ensemble des collections de ZoteroSynchronisation des pièces jointes: Preferences > Synchronisation > Settings

Accès à un très grand nombre de groupes sur le site Zotero.orgPossibilité de créer des fils RSS

Affichage de ses publis dans son profil Zotero (People) : import sous format RIS

Le partage de références

bibliographiques avec Zotero


�Sauvegarder sa bibliothèque en ligne sur le serveur

(synchronisation)

�Travailler en ligne depuis n’importe quel ordinateur

�Partager des ressources avec des groupes publics ou

privés

Partage des ressources sur Zotero


Création d’un compte (1)Créer uncompteSe connecter


� Configurer les paramètres de synchronisation dans

roue dentelée -> préférences -> Sync

� On reçoit un mail de confirmation

� Lancer la synchronisation de sa bibliothèque en ligne

� On a accès à « My library », qu’on a sauvegardée sur le

serveur

� Pb : difficultés (lenteur de la synchro ou échec)

Principe de la synchronisation

avec le serveur


44Christiane Roure, Christine Silvy,

Dominique Fournier

Paramétrage de Zotero pour synchronisation

avec le serveur Zotero (1)

Onglet Actions > Préférences > Settings

Indiquer le compte sur le serveur Zotero

45Christiane Roure, Christine Silvy,

Dominique Fournier

Onglet Actions > Préférences > Reset

pour restaurer à partir du local et/ou du

serveur

Paramétrage de Zotero pour synchronisation

avec le serveur Zotero (2)

Lancement de la synchronisation


Création d’un groupe


Types de groupes

Arial narrow

taille 18

�Groupes privésSeuls les membres du groupe et les invités peuvent voir la page du groupeCes groupes n’apparaissent pas dans la recherche de groupe

�Groupes publics, adhésion restreinte :

la page du groupe est visible mais il faut une invitation pour le

rejoindre

�Groupes publics, adhésion ouverte, tout le monde peut le

rejoindre


Voir les groupes existants

�Sur le site zotero.org, une fois qu’on a créé son compte,

cliquer sur groups pour aller voir les groupes existants ou les

nouveaux groupes créés

� Au 22/05/2012, il y a 14888 groupes

� On peut parcourir les groupes existants ou faire une

recherche par discipline


Caractéristiques des groupes

�Les membres doivent accepter l’invitation

�Paramétrage des droits pour chaque groupe : Library settings

ajout de références

ajout de pièces jointes

�Ajout de références (et pdf) à partir de Zotero (local)

Accepter l’invitation

pour faire parti du

groupe : Join

Visibilité du contenu du

groupe (Privé / Public)

Droit pour ajouter des

références

Droit pour ajouter des

pièces jointes


Paramétrage des droits sur la bibliothèque

�- Library reading : autoriser la consultation de la bibliothèque

à tout le monde, seulement aux membres du groupe ou

seulement aux administrateurs

�- Library editing : autoriser la modification de la bibliothèque

seulement aux membres du groupe ou seulement aux

administrateurs

�- Droits et types d’utilisateurs : 3 rôlesAdministrateurPropriétaire du groupeMembre


Bibliothèque du Groupe

�- On peut ajouter un élément par glisser/déposer (en local) depuis sa propre bibliothèque vers la bibliothèque du groupe et ensuite on synchronise

� - On peut copier des références d’autres bibliothèques vers la sienne (pas par

glisser/déposer mais en ouvrant la réf et en cliquant sur l’icône de la barre

d’état)

� On peut déplacer une réf d’une collection à une autre mais çà la duplique

aussi dans ma bibliothèque

� On peut travailler sur la bibliothèque qui est sur le serveur

� On peut stocker gratuitement jusqu’à 100MB pour les fichiers attachés sur le

serveur de Zotero (très vite atteint), au-delà c’est payant

� On peut suivre les nouveautés d’autres bibliothèques par fils RSS (se placer

sur la bibliothèque de l’utilisateur et cliquer sur subscribe to this feed)


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�Mise en commun des références

Copie de références à partir de son environnement de travail

Accès aux références déposées par les membres du groupe

�Attention aux PDF si groupe public !

DémoChristiane Roure, Christine Silvy,

Dominique Fournier

Partage de références dans un groupe

Echanges de fichiers

-�- Avec d’autres utilisateurs de Zotero

– format RDF

� - Avec des utilisateurs d’autres logiciels bibliographiques :

– Reference Manager, Endnote (format RIS)

– BibTex (format BibTex)

� - Vers d’autres applications

– Excel (fichier .sqlite)



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Liens utiles

� Quelques tutoriels en françaisPlusieurs tutoriels mis en ligne sur la page logiciels documentaires de l’Université Paris Descarteshttp://www.bu.univ-paris5.fr/spip.php?article860

� Scoop it Zotero (élaboré par l’IGUL l’Institut de géographie de l’Université de Lausanne)

http://www.scoop.it/t/zotero� Forum Zotero

http://forums.zotero.org/

� Le blog francophone de Zotero

� http://zotero.hypotheses.org

� Comparatif lien sur Agropolis

Documents

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