Embed Size (px)
Citation preview
• Acquisition des données • 4 VIEW - Signal
• Surface
• Reconstruction 3D
• Analyse
• Affichage
• Mesures
Camera CCD intensifiée
Objet à imager
Chambre noire
• 4 vues de l’animal: dorsale, ventrale
et les 2 côtés.
• Compatible en bioluminescence et
fluorescence
• Acquisition en temps réel du signal
• Enregistrement simultané des 4 vues
• Image de l’ensemble de l’animal
• 4 vues de l’animal: dorsale, ventrale
et les 2 côtés.
• Compatible en bioluminescence et
fluorescence
• Acquisition en temps réel du signal
• Enregistrement simultané des 4 vues
• Image de l’ensemble de l’animal
SignalSignal
• Reconstruction automatique par suivi
d’un point lumineux sur la surface
• Reconstruction automatique par suivi
d’un point lumineux sur la surface
SurfaceSurface
• Retrouver l’emplacement en profondeur l’origine du signal de
bioluminescence
• Retrouver l’emplacement en profondeur l’origine du signal de
bioluminescence
ObjectifObjectif
• 4 vues du signal de bioluminescence: dorsale, ventrale et les 2 côtés.
• Maillage surfacique de l’animal
• Maillage tétraédrique de l’animal
• 4 vues du signal de bioluminescence: dorsale, ventrale et les 2 côtés.
• Maillage surfacique de l’animal
• Maillage tétraédrique de l’animal
DonnéesDonnées
• Projection des 4 vues du signal sur le maillage surfacique.
• Reconstruction des sources grâce à l’équation de diffusion de la lumière
• Projection des 4 vues du signal sur le maillage surfacique.
• Reconstruction des sources grâce à l’équation de diffusion de la lumière
MéthodeMéthode
4 View4 View
MaillageMaillage
SourcesSources
• Affichage superposé de 2 volumes. (Viewer.SetOverlay)
• 2 valeurs d’isosurfaces distinctes
• 2 valeurs de transparence différentes
• 2 contextes d’affichages différents (LUT, min, max)
• Extraction automatique des 3 plans de références (Visilib.IpPlaneExtract)• axial• sagittal • coronal
• Navigation au sein des piles de coupes
• Affichage superposé de 2 volumes. (Viewer.SetOverlay)
• 2 valeurs d’isosurfaces distinctes
• 2 valeurs de transparence différentes
• 2 contextes d’affichages différents (LUT, min, max)
• Extraction automatique des 3 plans de références (Visilib.IpPlaneExtract)• axial• sagittal • coronal
• Navigation au sein des piles de coupes
AffichageAffichage
Affichage : coupe obliqueAffichage : coupe oblique
MesureMesure
• Méthode d’analyse
• Utilisation d’un volume supplémentaire de type LABEL pour les ROIs.
• Méthode d’analyse
• Utilisation d’un volume supplémentaire de type LABEL pour les ROIs.
MesureMesure
• Cas des ROI géométriques. • Cas des ROI géométriques.
MesureMesure
• Cas des ROI « baguette magique ». • Cas des ROI « baguette magique ».
MesureMesure
• Utilisation des 2 volumes Signal (type float) et ROI (type label).
• Extraction des plans des 2 volumes
• utilisation de la macro : I_analyze
•Récupération d’un objet de type Analyse
•Affichage des mesures : Data.GetInfoField, Data.GetFieldArray
• Utilisation des 2 volumes Signal (type float) et ROI (type label).
• Extraction des plans des 2 volumes
• utilisation de la macro : I_analyze
•Récupération d’un objet de type Analyse
•Affichage des mesures : Data.GetInfoField, Data.GetFieldArray
MesureMesure
Amélioration de la reconstrucion par l’utilisation d’un atlas de souris
Fusion avec d’autres modalitées du type CT ou IRM pour récuperer des informations anatomques
based on DIGIMOUSE , a 3D mouse atlasB. Dogdas, D. Stout, A. Chatziioannou, and R. M. Leahy, "Digimouse: A 3D Whole Body Mouse Atlas from CT and Cryosection Data." Phys Med Biol. 2007 Feb 7; 52 (3): 577-87
Merci!
