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Jour 3 : Jour 3 :
La numérisation de La numérisation de données de biodiversitédonnées de biodiversité
Sommaire
L’infrastructure informatique de GBIF
Rôle et importance des nœuds GBIF (Mélianie)
Objectifs quotidien d’un nœud GBIF
Qui suis-je?
Michael Akbaraly ([email protected])
Ingénieur Informatique Au GBIF depuis mars 2009
Spécialisé dans les bases de données Intéressé par le datamining et le
développement Web
L’infrastructure L’infrastructure informatique du informatique du GBIFGBIF
Base de donnéesCollection
Observation
DiG
IR /
Bio
CA
Se
/ T
AP
IR/
IPT
occurrence record
taxon concept
indexing DB
raw occurrence record
extraction
occurrence record
taxon concept
portal DB working copy
raw occurrence record
processingharvesting
metadata
logs
Darwin Core
ABCD
UDDInames
copy
occurrence record
taxon concept
portal DB live system
raw occurrence record
swap
Data Portal UI
web services
registration
Provider domain Internet
Internet / public
GBIF / non-public
MapServer
status until summer 2009
Normaliser les données
GBIF : Réseau mondial
Besoin d’un langage commun à toutes les données
Adapter l’information au réseau Wrappers (IPT, Biocase, …) Standards (ABCD, Darwin Core)
Connecter les données
Index : Annuaire des données
Récupère les informations générales
Connexion directe aux données
Diffuser les données
Portail international
Publication des données
Géoréférencement
http://data.gbif.org/
Le Portail GBIFLe Portail GBIF
Quelles informations?Quelles informations?
Données sur la présence d’espèces (spécimens ou observations)
Noms Noms scientifiques & classification Noms vernaculaires
Recherche filtrée
Autre exemple :répartition géographique de Hirundo rustica (hirondelle de cheminée) à différentes périodes de l'année
Quelle utilisation?
Prédire la distribution d’espèces selon divers scénarios de changement climatique, écologique, etc.
Prévoir des sites pour la protection de la biodiversité, etc.
Anticiper les régions nécessitant des actions précises (combattre les espèces invasives, mettre en place des mesures sanitaires, etc)
Le nœud GBIF Le nœud GBIF FranceFrance
Sommaire
Historique
Présentation de l’équipe
Objectifs
Difficultés
Nœud GBIF France
Mis en place en 2006
Situé au Musée d’Histoire Naturelle de Paris
3ème fournisseur en nombre d’occurrences du GBIF
L’équipe du GBIF France
Responsables :
Eric Chenin et Régine Vignes
Communication :
Anne-Sophie Archambeau
Technique et développement informatique :
Delphine Gasc et Michael Akbaraly
Objectifs
Connecter les données
Identifier et contacter les fournisseurs de données du pays
Développer des outils utiles à la communauté GBIF
Portail GBIF FrancePortail GBIF France
