Le monde MLe monde Microbienicrobien Bactéries (taille 1-5 µm) monocellulaire

– Procaryotes (noyau simplifié, paroi)– Multiplication rapide sur milieux (109 <24h)

Virus (taille 10 nm)– Un seul acide nucleïque (ADN ou ARN)– Multiplication dans cellules obligatoire

Prions ou Agent Non Conventionnel– Proteine, accumulation intracellulaire

Parasites-Champignons eucaryotes– monocellulaire Protozoaires (Paludisme..)– ou pluricellulaires: helminthes - Arthropodes

Existence de micro-organismes responsables d'infection

Epidémies et moyens de lutte– Tableaux cliniques identiques– Transmission entre individus

(Peste 25 millions de morts 1347 en Europe) Infection expérimentale

– Agent infectieux responsable– Reproductibilité (Postulats de Koch 1884)

Microscope optique– microscope 17ème s, coloration de Gram fin 19 ème

s Microscopie électronique

– Mise en évidence Virus (agents ultrafiltrables à

travers filtres bactériens 0,25 μm)

Prions ou Agents Transmissibles Non

Conventionnels

Accumulation dans le système nerveux – encéphalopathie spongiformeGrande résistance aux protocoles de base de désinfection

Virus à symétrie hélicoïdale et cubique

Bactéries

Microscopie électronique

Microscopie optique

Coloration de Gram

Champignons

Forme filamenteuse Forme levure

Protozoaires

Ectoparasites

Taille des agents infectieuxTaille des agents infectieux

EpidémiesEpidémies

20ème siècle

TuberculosePaludismeAmibiaseSchistosomiaseFilarioseRougeoleHIV SIDAPoliomyélite

Amérique du sud, Afrique et Asie

19ème siècle

VarioleCholéraDiphtérieLèpreTuberculoseTyphoide

Europe

Culture des Bactéries

“Génération spontanée?” (Pasteur 1861)

Chirurgie antiseptique (Lister 1867)

Lavage mains et réduction fièvre puerpérale (Ignace Semmelweis 1847)

Agents ultra-filtrables-Microscopie électronique

La majorité des micro-organismes ne sont pas pathogènes: notion de niche

écologique Eaux douces,

mer, résiduaires sols propres et

contaminés Végétaux Animaux

Homme: les flores Cutanée tube digestif autres muqueuses

Notion de PathogénicitéNotion de Pathogénicité germes saprophytes

– Danger 0 Bénéfice Hôte (symbiose)

germes commensaux– Danger +/- Bénéfice Hôte +/-

(mutualisme)

germes pathogènes– Danger + Bénéfice parasite (parasitisme)

Flore « normale » ou flore de barrière à préserverFlore « normale » ou flore de barrière à préserverLimiter au maximum le danger de la flore commensaleLimiter au maximum le danger de la flore commensalePrévenir le contact ou la susceptibilité aux germes pathogènesPrévenir le contact ou la susceptibilité aux germes pathogènes

Comment les micro-organismes peuvent ils être responsable

d'infection?

Facteurs de virulence– Adhérence (infection

urinaire)– Toxines (Choléra)– autres facteurs limitant les

défenses de l’organisme ou favorisant la multiplication des germes.

Bactéries

ChromosomePlasmide

Flagelles

Peptidoglycan Membrane externe(endotoxine)

Adhésines

La microscopie électronique montre la structure type

prokaryote

Prokaryotes et Eucaryotes

ont une organisation

cellulaire différentes

Présence d ’appendices externes caractéristiques: pili (fimbriae) et

flagelles

La microscopie électronique révèle des différences

anatomiques importantes entre Bactéries Gram + et Gram -

Classification des bactéries

Morphologie et coloration de Gram– Coques, bacilles, spirilles…– Gram+, Gram-, autres….

Caractéres culturaux– Aérobie, anaérobie, microaérophiles– Exigences nutritionnelles– Profil biochimique

Génétique Pathogénicité

Classification

Morphologie et colonisation

Différentiation des Différentiation des coloniescolonies

Pourquoi tous les individus ne font pas une infection?

Immunité naturelle Immunité acquise les moyens de défense de l'organisme

Mécaniques humoraux immunité cellulaire non spécifique immunité cellulaire spécifique Autres facteurs: fièvre-cytokines

Nutrition

Immunité cellulaire non spécifique

Bactéries intra-cellulairesBactéries intra-cellulaires

Ad

hére

nce

Capsule et phagocytose: Streptococcus pneumoniae

Epidémiologie des infections

Prévention– Hygiène-vaccination-Prévention

transmission

Traitement Nouveaux agents pathogènes

– Adaptation- résistance aux antibiotiques = anciens agents

– nouveaux agents