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Microbiologie BIOL 3253 La génétique microbienne: les mécanismes de la variation génétique

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Microbiologie BIOL 3253

La génétique microbienne:

les mécanismes de la variation

génétique

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Reproduction sexuée et asexuée

Contrairement aux organismes eucaryotes, les procaryotes n’effectuent pas de reproduction sexuée.

Procaryotes: fission binaire Eucaryotes: méiose

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Les mécanismes de la variation génétique chez

les procaryotes

Mutation: Modification stable et héréditaire de la séquence de l’ADN. Peut engendrer des modifications phénotypiques. Les mutations peuvent être induites ou survenir spontanément.

Transfert génétique horizontal:

Processus unidirectionel chez les procaryotes. Un fragment d’ADN d’une cellule donneuse est transféré dans une celleule receveuse. Habituellement, l’ADN transféré est intégré dans le chromosome de la cellule receveuse.

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Quelques définitions

ADN (acide désoxyribonucléique): Une double chaîne de

nucléotides liés les uns aux autres (dont le sucre est le

désoxyribose); la substance fondamentale dont sont composés

les gènes.

Gène: Fraction d’une molécule filiforme organisée en double

hélice, appelée acide désoxyribonucléique, abrégé en

ADN.

Allèle: L’une des différentes formes d’un gène qui peuvent exister

au niveau d’un même locus.

Chromosome: Un arrangement linéaire ou circulaire de gènes et

d’autres types d’ADN, parfois associé à des protéines et de l’ARN.

Génome: Ensemble du matériel génétique contenu dans un jeu de

chromosomes.

Ploïdie: Le nombre de jeux de chromosomes.

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L’acide désoxyribonucléique (ADN)

La double hélice d’ADN est composé de deux chaînes entrelacées de nucléotides.

Double brin d’ADN

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L’appariement des nucléotides

Les chaînes

nucléotidiques

sont antiparallèles.

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La transcription et la traduction

ADN

ARN

Protéine

(détermine la forme au

niveau cellulaire)

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Transcription de l’ADN en ARN

Un gène peut être défini comme un fragment d’ADN spécifiant un ARN fonctionnel.

ARN: 1) Composé de nucléotides comme l’ADN mais le sucre est le ribose.

2) À la place de la thymine (T), l’ARN contient l’uracile (U).

3) Addition de nucléotides de 5’ vers 3’ (comme avec la réplication d’ADN).

Le transcrit Même séquence que le brin non matrice d’ADN

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La traduction de l’ARNm en protéines

La structure primaire d’une protéine est composée d’une chaîne linéaire d’éléments

appelés acides aminés. La synthèse protéique se déroule dans des organites

cytoplasmiques appelés ribosomes. Les ribosomes se fixent à l’extrémité 5’ de l’ARN.

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Triplet de nucléotides

Anti-codon spécifique de l'ARNt

Acide aminé spécifique

Cheminement de l’information génétique

Complexe

codon/anti-codon

présentant les

orientations 5’ - 3’

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Le code génétique

4 x 4 x 4 = 64 codons distincts, chacun correspondant à un

acide aminé ou à un signal de terminaison.

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Transfert génétique horizontal

Transfert de gènes d’un organisme mature, indépendant, vers un autre.

Exogénote Un fragment d’ADN donneur.

Endogénote Génome du receveur.

Mérozyogote La cellule receveuse devient temporairement

diploïde pour une partie de son génome.

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Trois mécanismes

de transfert de gènes

La production et le devenir des mérozygotes

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Les plasmides bactériens

Petites molécules d’ADN double-brin, habituellement circulaires qui peuvent exister indépendamment du chromosome de l’hôte.

Les plasmides sont des réplicons

Ils ont leur propre origine de réplication.

Peuvent exister sous forme de copie unique ou multiples.

Curage

Élimination de plasmide(s) par une cellule hôte.

Peut se produire de façon spontanée ou être induit par des traitements qui inhibent la réplication des plasmides sans affecter la reproduction des cellules hôtes.

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Épisomes

Plasmides qui peuvent exister sous forme libre

ou intégrée dans le chromosome de l’hôte.

Plasmides conjugatifs

Possèdent des gènes codant pour des pilis.

Peuvent transférer des

copies d’eux-mêmes à

d’autres bactéries au

cours de la conjugaison.

Les plasmides bactériens

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Les principaux types de plasmides

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Facteurs de fertilité

Plasmides conjugatifs.

i.e., Facteur F chez E. coli.

Plusieurs sont des

épisomes.

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Facteurs de résistance

Facteurs R (plasmides R)

Possèdent des gènes conférant la

résistance à des antibiotiques.

Certains sont des plasmides conjugatifs.

Habituellement, ils ne sont pas intégrés

dans le chromosome bactérien.

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Les plasmides Col

Contiennent des gènes codant pour la

production de bactériocines.

Protéines qui détruisent d’autres bactéries.

Normalement elles agissent uniquement

contre des souches apparentées.

Les colicines tuent E. coli.

Certains sont conjugatifs.

Certains portent également des gènes de

résistance.

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D’autres types de plasmides

Plasmides de virulence Portent des gènes codant pour la virulence.

i.e., Gènes qui confèrent une résistance aux défenses de l’hôte.

i.e., Gènes qui codent pour la production de toxines.

Plasmides métaboliques Portent des gènes codant pour des enzymes qui

métabolisent des substances.

i.e., Gènes codant pour des enzymes de dégradation de pesticides.

i.e., Gènes codant pour la fixation de l’azote.

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La conjugaison bactérienne

Transfert de

matériel génétique

par contact direct

entre cellules.

Découvert en

1946 par

Lederberg et

Tatum.

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Démontre que le contact directe cellule à cellule

est essentiel.

La conjugaison bactérienne

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Le croisement F+ x F-

F+ = Celleuse donneuse. Contient le facteur F.

F- = Cellule receveuse. Ne contient pas le facteur F.

Le facteur F se réplique par un mécanisme de cercle roulant et une copie migre vers la cellule receveuse.

La cellule receveuse devient habituellement F+.

La cellule donneuse demeure F+.

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Le croisement F+ x F-

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La conjugaison Hfr

Souches Hfr

Possèdent le facteur F intégré dans le

chromosome bactérien.

Les gènes

plasmidiques

et génomiques

sont transférés.

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La conjugaison Hfr

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La conjugaison F

Plasmide F

Formé par l’excision incorecte du chromosome.

Contiennent 1 gènes du chromosome

Les cellules F peuvent transférer leur plasmide F à la cellule receveuse.

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La conjugaison F

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La transformation par l’ADN

Prise par la cellule de molécules ou de fragments d’ADN nu, présent dans le milieu, et leur incorporation dans le chromosome receveur de manière héréditairement stable.

Cellule compétente

Capable de prendre l’ADN et d’être transformée.

Représente probablement une voie importante d’échanges génétiques dans la nature.

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La transformation par l’ADN

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La transduction

Transfert de gènes entre bactéries par

l’intermédiaire de bactériophages.

Phages virulents

Se reproduisent par cycle lytique.

Phage tempérés

Se reproduisent par lysogénie.

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L’alternance des cycles lytique et lysogène

du prophage lambda

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La transduction généralisée

N’importe quelle partie du génome

bactérien est transféré.

À lieu au cours du cycle lytique.

Dans le stade d’assemblage, lorsque les

chromosomes viraux sont empaquetés

dans les capsides protéiques, des

fragments aléatoires du chromosome

bactérien partiellement dégradé sont

également empaquetés par erreur.

Particule de transduction généralisée

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La transduction généralisée

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La transduction spécialisée

Aussi appelée transduction restreinte.

Est induit seulement par des phages tempérés qui ont établit la lysogénie.

La particule transductrice ne porte que certaines parties spécifiques du génome bactérien.

Se produit lorsque le prophage est excisé de façon erronée.

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La transduction spécialisée

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Mécanisme de transduction pour le phage

lambda et E. coli