Nom du Laboratoire/Service€¦ · Web viewDes indicateurs statistiques de la performance d’Aires Marines Protégées ont été développés (Amand et al., 2004 ; Pelletier et

Rapport d'Evaluation des Unités Thématiques en 2008

RAPPORT DE BILAN et PROSPECTIVE

Période comprise entre le 1er janvier 2004 et le 31 décembre 2007

DEPARTEMENT ECOLOGIE ET MODELES POUR L’HALIEUTIQUE

1. Présentation de l’Unité

1.1. Intitulé de l’Unité - Département - Centre de rattachement :

Département « Ecologie et Modèles pour l’Halieutique »,Centre Ifremer de Nantes.

Le département EMH résulte de la fusion au premier janvier 2005 de deux laboratoires du Centre de Nantes :

le laboratoire d’Ecologie halieutique (Ecohal) ; le laboratoire de Mathématiques Appliquées à l'Evaluation des Ressources Halieutiques

(Maerha).

1.2. Responsables : laboratoire Ecohal : Jacques Bertrand ; laboratoire Maerha : Benoît Belliaeff ; département EMH :

o premier janvier 2005 au 10 septembre 2007 : Jacques Bertrando depuis le 11 septembre 2007 : André Forest.

Selon les décisions portant sur l’organisation générale de l’Ifremer, les départements sont constitués sur la base d’une identité de métiers ou de thématique. Le département est structuré en 3 pôles :

Ifremer / CST Janvier 2008 1

Responsable de DépartementAndré FOREST

Pôle Écologie :Pierre PETITGAS

Pôle Modélisation pour l’halieutique :

Marie-Joëlle ROCHET

Pôle Observation halieutique intégrée :

Verena TRENKEL


1.3. Lieu(x) d’implantation : - Positionnement dans l’organigramme Ifremer : le département EMH est rattaché au Centre de Nantes et

constitue un des Départements de la Direction des Infrastructures et des Opérations.- Groupes homologues ou proches (du point de vue de l’activité) en France et à l’étranger (Citer les

groupes).(Présentations très synthétiques, voire schématiques).

En dehors de l’Ifremer, en France, la recherche en modélisation et écologie pour l’halieutique est conduite dans différentes structures :

L’IRD, dans le cadre de différentes unités de recherche (UR) : o l’UR ECO-UP, équipe principalement implantée à Sète (Centre de Recherche

Halieutique méditerranéenne et tropicale, CRH) dont les travaux portent sur la structuration et le fonctionnement des écosystèmes d’upwellings exploités ;

o l’UR THETIS, implantée au CHR/Sète et à La Réunion, composée d’une dizaine de chercheurs et ingénieurs, spécialisée dans les recherches sur la dynamique des populations de thonidés tropicaux et l’incidence du comportement sur la structure et la capturabilité des populations ;

o l’UR RAP (Réponses Adaptatives des populations et des peuplements de Poissons aux pressions de l'environnement), localisée à Sète, Brest et Dakar, composée d’une dizaine de chercheurs et ingénieurs et dont les travaux portent principalement sur les mécanismes d'action et les conséquences des pressions naturelles et anthropiques exercées sur les systèmes perturbés et/ou surexploités, avec des applications aux systèmes aquatiques continentaux, mais aussi estuariens.

Agrocampus Rennes, et plus particulièrement son laboratoire d’écologie halieutique composé d’une dizaine de chercheurs et ingénieurs et qui développe en propre ou en partenariat avec les organismes de recherche nationaux (INRA, IRD, Ifremer, Universités), des travaux sur le fonctionnement des habitats essentiels (nourriceries en particulier), les aires marines protégées comme outil de gestion des écosystèmes, l’impact du changement global sur la stratégie démographique des populations de saumon atlantique, le développement de modèles trophodynamiques, le fonctionnement des écosystèmes estuariens ;

Le CEMAGREF de Bordeaux, dont l’UR DYMECO mène des recherches sur les communautés de poissons des écosystèmes lacustres et estuariens et sur les populations de poissons amphihalins : facteurs structurant des écosystèmes estuariens et des populations, liens entre structure et fonctionnement de ces systèmes, mécanismes d'utilisation des espaces aquatiques par les poissons migrateurs, allocation d'énergie entre croissance, reproduction et migration, transfert de biomasse dans et entre les réseaux trophiques, etc.

L’INRA sur l’écologie comportementale et la biologie des populations de poissons amphihalins (Saint Pée sur Nivelle, partenariat avec l’Université de Pau et des Pays de l’Adour), l’impact des perturbations environnementales sur les stratégies d’histoire de vie et l’évolution des populations et des communautés, leurs conséquences sur la dynamique des réseaux trophiques, le rôle des habitats et de leur niveau de connectivité dans les processus écologiques (Rennes, en partenariat notamment avec Agrocampus)

Quelques Universités : l’UPPA (partenariat avec INRA Saint Pée), le laboratoire d’océanologie et de géosciences de l’université du Littoral/Côte d’Opale (habitats essentiels, étude de la croissance, …), laboratoire de biologie et biotechnologies marines de l’Université de Caen (biologie, dynamique des populations et écologie des céphalopodes).

A l’étranger, la structuration de la recherche en halieutique est très différente selon les pays. Ainsi, en Europe, les schémas sont très divers, entre l’Italie, avec un éclatement géographique et inter organismes, et le Royaume Uni qui concentre sa recherche halieutique essentiellement sur deux Centres (Lowestoft et Aberdeen). Dans ce panorama, il n’est pas aisé d’identifier des « structures » proches de EMH, mais dans des organismes comme l’IMARES (Institute for Marine Resources and Ecosystem Studies, Pays Bas), le DTU Aqua, (National Institute of Aquatic Resources, Pays Bas), l’Institut of Marine Research de Bergen (Norvège), le DIFRES (Danish Institute for Fisheries Research), le Cefas (Centre for Environment, Fisheries and Aquaculture Science (Royaume Uni), Pêches et Océans (Canada), l’Institute of Marine



Biological Resources (Hellenic Centre for Marine Research, Grèce), ou la NOAA (USA), on retrouve des thèmes identiques à ceux abordés par le département.

1.4. Composition de l’équipe : Mouvements entre 2004 et 2007 et effectifs après réorganisation :

Personnels permanents Ifremer cadres (noms et nombre) : (Cadre de recherche HDR, avec thèses, autres, Ingénieurs, nombre de cadres ayant une activité d’expertise et/ou d’avis, de management avec indication du grade C1, C2 ou C3)La période 2004-2007 se caractérise par des mouvements importants en personnel. Ainsi, 8 cadres ont quitté EMH (2 départs en retraite, 2 départs de l’Ifremer, 4 mobilités internes), contre 4 arrivées (dont 2 recrutements). En 2008, 2 cadres quitteront le Département. Ces départs concernent plus particulièrement les spécialités en biologie des populations et écologie. Au cours de la période, le département a vu se confirmer son évolution vers une spécialisation plus forte en écologie quantitative et en modélisation.(voir annexes 1 et 2)

Personnels permanents Ifremer techniciens / administratifs (noms et nombre) :L’équipe technique n’a pas connu de modification pendant la période 2004 – 2007 ; par contre, le jeu des mobilités internes a fait que l’équipe administrative a enregistré de nombreux changements.(voir annexes 3 et 4)

Accueil de personnels permanents d’autres organismes :(voir annexe 5)

Personnels Ifremer titulaires d’un contrat à durée déterminée :(Techniciens, Administratifs, Cadres)Un total de 24 CDD ont été accueillis entre 2004 et 2007, répartis en 19 cadres et 5 non cadres. Pour 20 d’entre eux, il s’agit de personnels financés sur contrats de recette. (voir annexe 6)

Doctorants, Post-Doctorants et stagiaires :(voir annexes 7, 8 et 9)

1.5. Partenaires privilégiés dans le cadre de structures (UMR, GDR, …) :Niveaux d’insertion régionale, nationale, internationaleLe département est associé à l’école doctorale Vie-Agronomie-Santé qui regroupe les universités de Rennes I et II et Agrocampus. Il accueille ainsi des étudiants qui préparent un doctorat d’Agrocampus-Rennes, spécialité halieutique.

1.6. Infrastructures – Equipements : (voir annexe 10)Les équipements EMH consistent essentiellement en : matériel informatique : matériel pour la réalisation de campagnes à la mer :



La description des activités portera sur les actions déterminantes pour l’Unité. Le détail des activités pourra faire l’objet d’annexes qui pourront éventuellement consister en la fourniture des rapports annuels déjà disponibles. Les rubriques ne seront remplies que lorsqu’elles correspondent à l’activité de l’unité évaluée.

2. Description globale des activités (2004-2007)

2.1. Rappel des mandats pour la période évaluée :

La gestion des pêches européennes a amorcé une profonde évolution, vers une démarche prenant plus largement en compte les interactions entre la pêche et l'environnement marin. Pour soutenir cette évolution, la recherche doit élaborer une représentation conceptuelle des systèmes en interaction, analyser la variabilité des composantes de ces systèmes, caractériser et hiérarchiser les principaux processus de contrôle et de régulation. Il est enfin nécessaire de mettre au point des méthodes de diagnostic sur l'état et la dynamique de ces systèmes ainsi que des outils de simulation de scénarios d'évolution sous différentes conditions.

Dans cette perspective, et conformément au mandat de l'Ifremer, le département EMH a pour mission de fédérer et développer des compétences en vue de :

Contribuer aux recherches sur les écosystèmes d'intérêt halieutique afin d'aider à la définition des conditions d'une exploitation durable des ressources marines vivantes,

Développer et diffuser des méthodes mathématiques et statistiques qui concourent à une utilisation durable des ressources halieutiques et des écosystèmes marins.

Ce mandat général est complété par celui des responsables d’Unité Opérationnelle qui ont les responsabilités suivantes :

Animation de leur unité en matière de vie interne, de prospective et de moyens ; Gestion des personnels et de leur compétence ; Animation scientifique et technique dans le cadre des projets et des programmes de l’Ifremer ; Activités fonctionnelles et partenariales.

2.2. Thèmes fédérateurs et programmes de rattachement :Le département participe prioritairement aux activités menées dans le thème 4 Ressources halieutiques, exploitation durable et valorisation et dans le thème 2 Surveillance, usage et mise en valeur des mers côtières de l'Ifremer.

2.3. Aire géographique dans laquelle s’exerce l’activité de l’Unité :Le département a une vocation nationale et de ce fait intervient dans des aires géographiques variées ; au cours de la période 2004-2007, ses champs d’action sont principalement dans le golfe de Gascogne, sur le plateau Celtique, en Manche-mer du Nord et en Méditerranée.

2.4. Domaines de spécialité de l’Unité (mots clés) :Le département est organisé de façon à prendre en charge l'étude de questions complexes dans les domaines de l'écologie des populations marines exploitées et de l'évaluation des populations et des peuplements d'intérêt halieutique. Il a la capacité à associer des approches descriptives et de compréhension du fonctionnement des systèmes exploités, en prenant particulièrement en compte les dynamiques spatiales, les forçages environnementaux et la pression halieutique aux différentes échelles spatiales et temporelles. Ses champs d'application portent en priorité sur les systèmes pélagiques des plateaux continentaux et les systèmes démersaux et benthiques côtiers. Pour tenir ces objectifs, le département gère et fait évoluer ses compétences dans les domaines disciplinaires suivants :



Ecologie descriptive et fonctionnelle de la dynamique des ressources et des écosystèmes exploités sous contraintes environnementales (modélisation spatiale, couplage de modèles physiques et biologiques, analyses de séries à long terme, méthodes de caractérisation des habitats essentiels). Les principaux modèles biologiques de référence retenus pour ces développements méthodologiques sont les populations et peuplements pélagiques et benthiques, en particulier ceux du golfe de Gascogne. Acoustique halieutique, otolithométrie, biochimie, biologie naturaliste, méthodes d'observation directe ainsi que statistique, systèmes dynamiques et développements informatiques associés pour répondre aux besoins de l'observation et de la compréhension du fonctionnement des systèmes exploités.Modélisation et statistiques appliquées à l'évaluation des ressources marines vivantes (modélisation dynamique, construction d'indicateurs, évaluation d'impact, analyse de risque). Les applications concernent les diagnostics sur les ressources exploitées et l'évaluation de l'impact de diverses options de gestion, l'évaluation des interactions entre la pêche et les écosystèmes marins (modélisation bio-économique, couplage dynamique des ressources et des flottilles), les procédures de collecte et d'archivage des données halieutiques, ainsi que l'observation in situ des populations cibles et des peuplements associés.Le département a une longue expérience pour organiser et diriger des campagnes pluridisciplinaires sur des navires de recherche hauturiers et côtiers.

En complément de ses compétences scientifiques, le département dispose de capacités spécifiques d'animation ainsi que de gestion administrative et financière pour le thème Ressources halieutiques, exploitation durable et valorisation.

2.5. Principaux travaux et résultats concernant les missions de soutien en interne et en externe, les avis, les expertises, les résultats de travaux de recherche obtenus pendant la période d’évaluation :(Présenter une synthèse et terminer par un graphe indiquant les poids relatifs (%) des activités par grands types -Recherche, avis et expertises, soutien aux équipes, etc.-).

Une très large partie de l’activité du département est consacrée à la recherche en appui à l’approche écosystèmique des pêches. Toutefois, et même si ce n’est pas sa vocation première, il assure également une fonction d’avis et d’expertises aux niveaux national et international.Le département n’est pas structuré en laboratoires, mais en trois pôles de compétence complémentaires dans le domaine des sciences halieutiques : Ecologie halieutique (animateur : Pierre Petitgas) Modélisation pour l’halieutique (animatrice : Marie-Joëlle Rochet) Observation halieutique intégrée (animatrice : Verena Trenkel)

Pour la partie recherche, ce rapport a été structuré pour refléter l’activité de ces pôles, en s’appuyant sur les résultats ayant donné lieu à publications. Par ailleurs, le département mène ses activités de recherche dans le cadre des programmes de l’Ifremer dans lesquels il apporte ses compétences disciplinaires propres. Ceci implique de nombreuses collaborations tant en interne avec d’autres départements de l’Ifremer qu’avec les partenaires étrangers. Cette approche permet le développement de synergies pour répondre aux questionnements scientifiques mais rend plus difficile la présentation de ce qu’est vraiment l’activité du département puisqu’il ne développe pas ses programmes propres.Si besoin, des informations complémentaires peuvent être trouvées dans les quatre rapports d’activité annuels EMH fournis en annexe.

AC TIVITES DE RECHERCHE

[1]. Pôle « Ecologie halieutique»



Les recherches en écologie halieutique menées au département EMH dans le cadre des programmes de l’Ifremer contribuent au développement d’une approche écosystémique pour la gestion des pêches. L’écologie au département est menée en interaction avec les pôles Observation et Modélisation. Les travaux s’appuient principalement sur des données de campagnes à la mer et consistent surtout en des analyses de données ou des expériences menées avec des modèles. Si le plateau continental Ouest-Européen (golfe de Gascogne et mer Celtique) est un chantier privilégié, les travaux se déroulent aussi dans d’autres régions (Méditerranée, mer du Nord, pente continentale). Les systèmes étudiés sont les poissons petits pélagiques, la communauté des poissons démersaux sur le plateau continental, les nourriceries côtières de poissons plats.Les individus, populations et communautés sont envisagés dans leur dimension spatiale, avec leurs forçages hydro-climatiques et leurs interactions trophiques. Les recherches visent à comprendre les forçages sur les fonctions biologiques et les contrôles de l’organisation fonctionnelle des populations et des écosystèmes. L’accent est mis sur la compréhension des mécanismes relatifs à la capacité des habitats et des peuplements à maintenir les ressources. L’acquisition de connaissances débouche sur le développement de modèles nouveaux de populations et de peuplements pour le diagnostic et la prévision.

Principaux résultatsFonctions biologiques, marqueurs individuels

Le suivi chez les individus de marqueurs des fonctions biologiques (otolithe, génétique) permet d’apprécier l’influence de facteurs proches mais aussi lointains puisque l’histoire biologique des individus peut être reconstituée. Dans le domaine côtier, trois indices ont été utilisés comme indicateurs de qualité des habitats côtiers (Gilliers et al., 2004, 2006) : la croissance, le rapport RNA/DNA, et l’indice de condition K ; l’application au groupe 0 de trois espèces (sole, plie, limande) a montré que les cinq nourriceries étudiées offraient des habitats de qualité équivalente, alors que les perturbations anthropiques y étaient d’intensité et de nature différentes. Dans le domaine pélagique, l’analyse des otolithes d’anchois a montré (Petitgas and Grellier, 2003) une distinction entre des lots aux croissances différentes dans la population ; ces lots présentent des différences de recrutement, de taux de survie et de reproduction. Ainsi, les individus à croissance rapide se reproduisent et meurent, alors que ceux qui présentent une croisssance plus lente survivent. L’âge et la taille des anchois détermine la fenêtre de ponte : les individus plus vieux et plus gros élargissent leur fenêtre de ponte, ce qui augmente la probabilité d’un bon recrutement. Des marqueurs génétiques sont utilisés pour suivre la structure de la population et les conditions du maintien de la diversité des contingents (Petitgas and Lenfant, 2005). Les capacités physiologiques différentes entre individus conduisent à envisager l’importance de la diversité des contingents au maintien de la population. Pour expliquer les variations dans les routes de migration et l’occupation des habitats par les populations de poissons, l’hypothèse comportementale « d’entraînement » a été avancée (Petitgas et al., 2006). Selon cette hypothèse, les jeunes copieraient le comportement des plus âgés, ce qui se traduirait par une transmission entre générations de la connaissance des habitats et des routes de migration. Cette hypothèse pourrait expliquer que la restauration de stocks surexploités est souvent plus longue que ne le laissent prévoir les modélisations basées sur leurs traits de vie ; elle pourrait aussi permettre de comprendre les changements parfois importants de l’organisation spatiale des différents stades du cycle de vie de populations de poissons. Cette hypothèse a été testée pour différentes espèces (harengs de l’Atlantique nord-est, sardine de Californie, anchois du golfe de Gascogne, merlan, merlu, thon rouge, stock de dorade aux USA, ..) lors d’un atelier tenu à Nantes en 2007.

Modélisation individu-centrée et couplage avec l’environnement

S’appuyant sur l’histoire individuelle que l’analyse des otolithes permet de reconstituer, le forçage d’un modèle individuel poisson par un modèle hydrodynamique ou de production planctonique permet de construire des outils complexes de prévision dynamique et d’analyse numérique des contrôles des fonctions biologiques. Un modèle de dérive et survie larvaire a été développé pour la prévision du recrutement de l’anchois à partir des données de croissance de larves et de juvéniles acquises à la mer (Allain et al., 2007a et b). Les résulats montrent que ce type de modèles permet d’explorer l’influence sur le recrutement des mécanismes d’interactions physiques et biologiques, ainsi que la dynamique de ponte à différentes échelles d’espaces et de



temps. Une synthèse des méthodes et limitations des modèles biophysiques larvaires a été effectuée (Gallego et al., 2007) et la sensibilité de la dispersion larvaire à différents paramètres du modèle a été revue (Huret et al., 2007). Un modèle bioénergétique a été développé pour la prévision de la croissance et de la reproduction de l’anchois, forcée par la température et la production planctonique (Pecquerie, 2007) ; ce travail a permis de mieux comprendre et de quantifier l’effet des conditions environnementales sur la durée de reproduction d’un individu ; ces conditions déterminent la taille de l’individu (donc son potentiel reproducteur) ainsi que la quantité d’énergie mise en réserve pour la reproduction (mobilisable pour la survie en cas de conditions limitantes de nourriture). Structure en taille de la population et conditions environnementales déterminent ainsi les fenêtres de reproduction. Par ailleurs, il a été possible d’identifier les conditions de nourriture nécessaires à la survie des larves jusqu’au stade juvénile, et le lien entre métabolisme du poisson et formation de l’otolithe a été explicité, ce qui permet de reconstruire la quantité d’énergie assimilée par un individu au cours de sa vie à partir de la structure de l’otolithe. Ces outils constituent des plateformes de simulations permettant d’envisager des expériences pour comprendre les contrôles et les effets cumulés des forçages ainsi que d’effectuer des prévisions dans le cadre de scénarios de changement climatique ou de gestion spatialisée. Ils constituent des étapes complémentaires vers l’objectif de prévision opérationnel du recrutement et d’intégration de la variabilité de l’environnement dans la gestion des pêches.

Caractérisation de l’environnementDisposer de séries d’indicateurs des facteurs hydro-climatiques sous forme de séries temporelles ou de séries de cartes est essentiel pour caractériser le potentiel des habitats et l’histoire du milieu. Les sorties des modèles hydrodynamiques ont été utilisées pour caractériser les paysages pélagiques en envisageant leur évolution saisonnière (Planque et al., 2004; 2006). Le département a participé à la définition de produits de l’océanographie opérationnelle (Buffaz et Planque, 2006) et contribue à la constitution d’indices environnementaux intéressant l’halieutique (bulletin Prévimer). Chaque année des produits d’océanographie opérationnelle (stratification, upwelling) sont calculés selon une procédure standardisée (Allain et al., 2001) et un document de travail décrivant les conditions potentiellement favorables et défavorables à la survie des larves dans le golfe de Gascogne est fourni au groupe d’évaluation de l’anchois du CIEM. Les séries de températures mesurées à la mer sont aussi un élément de caractérisation du milieu, permettant d’identifier des changements à long-terme (Woehrling et al., 2005). La tendance dans la série des températures en Manche a été reliée à la période de reproduction de crustacés, et se basant sur une analyse de regression, un modèle prédictif de l’apparition des larves d’araignée dans le plancton en fonction de la température moyenne entre février et mi-mars a été mis au point (Martin et Planque, 2006).Par ailleurs, un indicateur enzymatique (activité pyruvate kinase PK dans le mesoplancton) a été développé pour caractériser l’environnement biotique planctonique des petits poissons pélagiques (Bergeron 2004, 2006). Cette indicateur mesure le taux d’assimilation par le mésoplancton des glucides, première classe de molécules issues de l’activité photosynthétique des producteurs primaires. Il permet ainsi d’estimer la productivité biologique du milieu. Il est facile à mettre en oeuvre au cours d’une campagne scientifique, et sa sensibilité permet de détecter l’assimilation des glucides même quand ceux-ci sont présents en faibles quantités.

Habitats, distributions spatiales

L’analyse statistique des séries de données de campagnes scientifiques a permis de caractériser les conditions abiotiques potentiellement favorables à l’occurrence des organismes. Dans le domaine benthique, la relation entre les conditions environnementales observées sur le fond (profondeur, température, salinité) et la densité des principales espèces a été analysée pour la période 1992-2005 (Persohn et al., 2007) ; les juvéniles de certaines espèces (merlu, tacaud, merlan,…) montrent une préférence marquée pour une gamme de profondeurs ; les relations observées pour toutes les espèces certaines années entre densité, température et salinité ne sont pas influencées par leur abondance et il n’a pas été observé de phénomène de densité dépendance.Dans le domaine pélagique, les potentiels de ponte des anchois et sardines ont été cartographiés à partir des conditions hydrologiques (Planque et al., 2007) et leur évolution à long-terme a été caractérisée (Bellier et al., 2007). Pour l’anchois, il a été montré que les panaches de la Gironde et de l’Adour sont des sites réguliers de



ponte, mais que les frayères peuvent s’étendre plus au large les années de ponte intensive ; il a également été montré que l’aire de distribution des œufs s’est étendue vers le Nord, ce qui pourrait être un effet du changement des conditions environnementales. L’habitat vertical des œufs d’anchois a été étudié à cause de son importance dans les dérives dues aux courants. Un modèle de distribution verticale a été développé (Petitgas et al., 2006). Il a été montré que la densité des œufs variait en fonction de la salinité de surface (Goarant et al., 2007), ce qui a pour conséquence que l’habitat vertical des œufs est assez constant quelles que soient les conditions sur le plateau continental. Dans le domaine côtier, les méthodes utilisées sont similaires. Toutefois, les paramètres du milieu permettant de modéliser les conditions potentiellement favorables incluent des variables de la faune épibenthique (Le Pape et al., 2004, 2007) et macrobenthique (Nicolas et al., 2007). En effet, les travaux sur la sole ont montré que bathymétrie et nature des sédiments n’expliquent qu’en partie l’attractivité des habitats pour les juvéniles. La prise en compte de l’épifaune a permis de montrer que la distribution des juvéniles de sole est reliée à la densité des détritivores, des suspensivores et des canivores.L’estuaire de la Seine constitue une nourricerie potentiellement importante pour les poissons plats, mais il est fortement impacté par les activités humaines. Une approche composite prenant en compte des indicateurs de contamination du milieu et de performance de la croissance et la comparaison avec d’autres zones géographiques a permis de démontrer que l’altération de la fonction de nourricerie de l’estuaire de la Seine est liée à une perte d’habitats correspondants et à une qualité moindre des surfaces résiduelles (Le Pape et Gilliers, 2007). Se basant sur des séries de campagnes à la mer, des indicateurs d’occupation spatiale ont été développés (centre de gravité, inertie, aire d’extension, structure à micro-échelle, etc.) pour un certain nombre de stocks (morue, hareng, anchois, rouget-barbet, merlu) de différentes régions (mer du Nord, mer de Barents, mer Baltique, golfe de Gascogne, Méditerranée) ; un lien a été démontré entre l’organisation spatiale des populations et les paramètres clé de leur dynamique comme abondance, recrutement et mortalité (Petitgas et al., 2005; Woillez et al., 2006, Woillez et al., 2007). Les indices spatiaux constituent ainsi des indicateurs complémentaires pour évaluer l’état des populations et peuvent être particulièrement utiles dans le cas de stocks en déclin et de pertes d’habitats. Ces développements permettent d’envisager des méthodes relevant de la surveillance (Cotter et al., 2007) pour analyser les séries temporelles de ces indicateurs et leur application au suivi des distributions spatiales à partir des données de campagnes à la mer (Petitgas et al., 2007; 2008).

Connexion des poissons aux maillons trophiques inférieurs et supérieursLa prise en compte d’indicateurs biotiques dans les études sur la qualité des habitats amène logiquement à envisager les poissons dans l’ensemble du réseau trophique. En élaborant des modèles de flux trophiques, il s’agit de relier la structure observée des réseaux, par exemple à travers les échantillonnages biologiques, et leur fonctionnement. Ceci permet de mieux appréhender les éléments clés, espèces ou groupes écologiques, du fonctionnement de l’écosystème (Lobry et al., 2007; Marquis et al., 2007) et d’avoir une approche fonctionnelle de la capacité de l’habitat pour le maintien des ressources halieutiques tant dans le domaine côtier (Lobry et al., 2008) que pélagique (Marquis et al., 2007). En décrivant la diversité au sein de l’écosystème, tant en terme d’espèces que d’interactions biotiques, ces approches permettent de mieux caractériser la stabilité de l’écosystème et sa capacité de réponse aux perturbations d’origine naturelle ou anthropique.

Patrons structuraux dans l’espace et le tempsLes données de campagnes à la mer montrent une variabilité à différentes échelles de temps et d’espace pour les différentes espèces. Des études ont été entreprises sur les communautés benthiques et démersales avec des méthodes basées sur les ACP. Ces méthodes ont été appliquées dans des lacs canadiens pour analyser les contributions de facteurs à différentes échelles spatiales à la variation globale des communautés de poissons, leur densité et leur biomasse (Brind’Amour et al., 2005). Il a aussi été mis en évidence une forte stabilité interannuelle de l’organisation spatiale des assemblages démersaux de l’est de la Corse (Gaertner et al., 2005 a et b). De même, si les assemblages de poissons et de crevettes dans l’estuaire de la Gironde sont fortement structurés depuis l’aval vers l’amont et montrent de variations saisonnières importantes, il n’a pas été détecté de différence dans leur distribution spatiale entre les années 1980 et 2000 (Lobry et al. 2006).



Par contre, il a été montré que les variations à long-terme de certaines d’espèces dans les communautés sont liées au changement climatique ; ainsi, l’analyse des résultats de séries de campagnes de chalutages de fond sur le plateau continental du golfe de Gascogne et en zone côtière montre que les espèces à large distribution et affinité subtropicale voient leur abondance augmenter, tandis que celle des espèces à affinité tempérée tend à diminuer, voire même à disparaître des captures pour certaines d’entre elles (Poulard et Blanchard, 2005 Désaunay et al., 2006). Les relations spatiales entre prédateurs et proies potentielles ont été analysées pour caractériser les conditions trophiques (Trenkel et al., 2005, Certain et al., 2007). Il a ainsi été montré que le comportement de deux espèces de crustacés qui semblaient en compétition trophique (la langoustine et le crabe Goneplax rhomboides) pourraient contribuer à réguler les assemblages, ces deux espèces se nourrissant à des moments différents, réduisant ainsi leur compétition (Trenkel et al, 2007).

[2]. Pôle "Modélisations pour l'halieutique"

Les halieutes sont sollicités pour établir des diagnostics sur l'état des ressources et des pêcheries et pour fournir des avis quant aux implications à court ou moyen terme de telle ou telle option de gestion. Dans un contexte de forte variabilité et d'interactions complexes, tant les recherches que les avis nécessitent l'analyse de masses importantes de données provenant de la pêche et des campagnes scientifiques, ainsi que le recours à des modèles dynamiques. Le département contribue au développement et au bon usage des méthodes d'analyse des données et des modèles mathématiques essentiels à l'halieutique.Ces outils sont utilisés dans des approches mécanistes ou statistiques pour :

Décrire les populations, les peuplements, les écosystèmes marins, les activités de pêche et leurs interactions ;Interpréter leur fonctionnement, caractériser les habitats ;Fournir de nouveaux outils scientifiques utiles à la gestion des pêches dans une perspective écosystémique.

Principaux résultats Modèles de populationDes modèles de population, objet classique de l’halieutique, sont développés au département dans trois contextes principaux : halieutique, biologique et écosystémique. En réponse à la dégradation des données de captures commerciales, la re-formulation de modèles classiques permet de tenir compte de leur degré de fiabilité (Cotter et al., 2007), ou de n'utiliser que des données de campagnes scientifiques. Ceci a fait l’objet du projet européen FISBOAT, piloté par le département, qui s’est déroulé de 2005 à 2007 (Petitgas, 2008) et a vu le développement d’approches basées sur les indicateurs (Cf infra) et de plusieurs modèles (dont Trenkel, 2007). Des modèles en stades ou en longueur ont été proposés pour évaluer les stocks dont l'âge est difficile à déterminer comme les langoustines (Mesnil, 2003 ; Mesnil, 2005) ou le merlu (Drouineau, 2008; Drouineau et al., 2008).

Modèles d’interaction population – environnementLes répartitions spatiales des populations et leurs dynamiques sont structurées par l'environnement, par des facteurs densité-dépendants et par les effets de l'exploitation. Pour les poissons pélagiques (anchois), ces relations sont abordées par la quantification de l'effet structurant de l'environnement à différentes échelles de temps et d'espace, que ce soit au stade de la ponte (Planque et al., 2007), des œufs (Petitgas et al., 2006), des larves (Allain et al., 2007a; Allain et al., 2007b), ou dans un modèle intégré tout au long du cycle de vie (Pecquerie, 2007). Ces analyses s’appuient sur une modélisation ad hoc de la dynamique de l’environnement (Planque et al., 2006; Gallego et al., 2007; Huret et al., 2007). Pour les écosystèmes démersaux et benthiques, ce sont les fonctions-clés pour les processus impliqués dans le renouvellement, la qualité ou la diversité des ressources halieutiques qui sont examinées, comme les relations proie-prédateur (Trenkel et al., 2005) qui peuvent être déterminées exclusivement par la taille (Benoît et Rochet, 2004). Certains de ces écosystèmes présentent une fragilité structurelle ou acquise, potentiellement aggravée par l'anthropisation. Il s'agit



d'identifier, de caractériser et de comprendre le fonctionnement des milieux de première importance pour les ressources halieutiques ; un important effort a été consacré aux nourriceries de sole et autres poissons plats (Gilliers, 2004; Gilliers et al., 2004; Le Pape et al., 2004; Gilliers et al., 2006; Le Pape et al., 2007a; Le Pape et al., 2007b).

Modèles population – pêche – réglementation

Une pêcherie peut être définie comme un système réglementé constitué d’un ensemble d’espèces exploitées par différentes flottilles dans une zone géographique bien délimitée. Les distributions spatiales et saisonnières des populations et de l’exploitation sont à la fois hétérogènes et interdépendantes. Des modèles de pêcheries prennent en compte ces aspects saisonniers et spatiaux par le couplage de modèles de dynamique des populations et des activités de pêche, dont les échelles spatio-temporelles sont reliées aux caractéristiques des navires et aux tactiques de pêche, contraintes par le contexte économique et réglementaire (Drouineau et al., 2008). Différents types de modèles ont été utilisés pour évaluer la cohérence des mesure mises en œuvre aujourd’hui (De Lara et al., 2007) et pour comparer leur efficacité potentielle avec celle de scénarios de gestion spatio-saisonniers comme les zones marines protégées (Ferraris et al., 2005; Doyen et al., 2007). Les facteurs déterminant ces systèmes sont mis en évidence par des analyses de données utilisant des modèles statistiques multivariés (Mahévas et al., 2004; Mahévas et al., 2007).Les indices d'abondances issus des campagnes scientifiques à la mer servent de plus en plus directement pour évaluer l'état des populations et des peuplements. La relation entre l’abondance des populations présentes dans une zone et les captures des navires (qui servent à calculer ces indices d'abondance) est caractérisée par la capturabilité. Cette dernière dépend de l'engin de pêche mis en œuvre, de sa sélectivité et de la réaction des poissons à son égard. Les recherches sur la capturabilité des poissons par les chaluts de fond scientifiques sont abordées grâce à une modélisation statistique visant à dégager les facteurs qui la déterminent (Trenkel et al., 2008), et par une modélisation probabiliste du processus de capture (Trenkel et Skaug, 2005).

Plates-formes de simulationA partir de modèles flexibles et génériques, plusieurs plates-formes de simulation ont été conçues. Une attention particulière est portée à l'usage rigoureux de ces outils, au travers de plans statistiques de simulation.

ISIS-Fish, développé dans le cadre des logiciels libres, permet de simuler la dynamique de pêcheries complexes et d’évaluer les effets de scénarios de gestion (Mahévas et Pelletier, 2004; Pelletier et Mahévas, 2005). Cet outil est destiné non seulement aux modélisateurs pour faire évoluer les modèles et améliorer la compréhension des systèmes, mais aussi aux experts et aux gestionnaires pour intégrer l’information disponible sur les pêcheries d’intérêt, faciliter les discussions avec les professionnels de la pêche et aider à la décision. Ainsi la plate-forme a été utilisée pour examiner l’effet de différentes mesures de gestion des pêcheries de langoustine (Drouineau et al., 2006) et d’anchois (Lehuta et al., 2006) dans le golfe de Gascogne.Une plate-forme de simulation de modèles couplés biologie-physique est mise en œuvre pour la dérive et la survie larvaire, à partir des résultats d'un modèle hydrodynamique et de cartes de pontes. Les effets des interactions entre ponte et climat sur le recrutement peuvent être testés.

IndicateursDans le contexte de complexité et d'incertitude des écosystèmes exploités, diagnostics et avis peuvent être donnés sous la forme d’indicateurs : des variables simples et compréhensibles par tous dont la combinaison permet de juger si les objectifs de gestion sont atteints (Shin et al., 2005; Rochet et Trenkel, 2007). Le département contribue au développement, à l'évaluation, à la synthèse et à la communication d'indicateurs de l'état des populations et des peuplements, de l'activité de pêche et de la pêcherie dans sa globalité. Ainsi une méthode de diagnostic permettant de déterminer si l'effet de la pêche a augmenté sur une période donnée a été développée et mise en œuvre au sein d'un réseau de valorisation des données de campagnes de pêches scientifiques, appliquée à une population (Trenkel et al., 2007) ou à un peuplement (Rochet et al., 2005). Pour trier parmi les très nombreux indicateurs proposés pour une approche écosystémique des pêches, le département a contribué à l’élaboration et au test d’une grille d’évaluation (Rice et Rochet, 2005; Rochet et Rice, 2005). Des indicateurs statistiques de la performance d’Aires Marines Protégées ont été développés (Amand et al., 2004 ;



Pelletier et al., 2005; Claudet, 2006 ; Claudet et al., 2006). L’approche par indicateurs s’accompagne d’une réflexion sur leur lisibilité et leur appropriation par les acteurs (Claudet et Pelletier, 2004, Prigent et al, sous presse, Rochet et al, sous presse).

[3]. Pôle "Observation halieutique intégrée"

La description, l’évaluation et l’étude fonctionnelle des écosystèmes d’intérêt halieutique, en référence aux habitats, aux populations cibles des pêcheries et aux peuplements (biodiversité) associés impose la collecte de très nombreuses données et le département EMH contribue à la mise en œuvre et à la validation de certaines méthodes d’observation ainsi qu’à leur diffusion. Toutefois, EMH ne réalise pas les travaux d’ingénierie et de technologie qui sont effectués en collaboration.Les questionnements découlent des priorités définies par le pôle « écologie » et l’exploitation des données est organisée en collaboration avec le pôle « modélisation », dans le cadre des programmes de l’Ifremer.

Principaux résultats Conception de plans d’observation des systèmes et évaluation des estimateurs

Beaucoup de modèles halieutiques (évaluation de stock, dynamique de pêcherie,...) sont alimentés par des données issues des professionnels de la pêche : captures, caractéristiques techniques des navires et des engins de pêche, tactiques de pêche, etc. Pour connaître la structure des captures (en longueur, en âge…) des échantillonnages sont menés sous les criées et à bord des navires de pêche. Une méthode pour évaluer les plans d’échantillonnage et la qualité des estimations qui en sont dérivées a été mise au point (Vigneau et Mahévas, 2005; Vigneau et Mahévas, 2007). Depuis quelques années, l’estimation des rejets en mer effectués par les navires de pêche commerciale (individus trop petits ou sans valeur marchande) a pris de l’importance, notamment du fait de la mise en place d’une réglementation européenne visant à assurer la collecte d’informations sur les captures commerciales (Data Collection Regulation). Le département a contribué à l’évaluation des plans d’échantillonnage ainsi qu’à la comparaison des estimateurs pour les rejets au niveau des flottilles (Talidec et al., 2005; Rochet et al., 2006a). Une comparaison entre des observations par vidéo des langoustines et les observations de captures sur les navires de pêche a démontré l’impact de la stratégie de pêche sur le pattern journalière des captures (Trenkel et al., 2006a). Les équipes du département planifient, organisent et mènent de nombreuses campagnes à la mer, autant dans le domaine pélagique (campagne Pelgas, 30 jours au printemps), que démersal, benthique ou planctonique, à la côte et au large, depuis plus de 20 ans. Elles y ont acquis une expérience de la mise en œuvre de navires de recherche et de pêche professionnels. Dans un certain nombre de cas (campagne Pelgas), des observations complémentaires sont faites par des équipes spécialisées (oiseaux, mammifères marins) ce qui permet d’avoir une approche globale de l’écosystème. Des études plus particulières peuvent être réalisées comme par exemple l’évaluation de l’impact de la durée des traits (Battaglia et al., 2006) ou du design de la campagne (type de chalut, saison,…) sur les captures (Trenkel et al., 2004c). Un impact significatif des conditions environnementales rencontrées pendant les campagnes scientifiques de chalutages sur les captures a pu être démontré (Poulard and Trenkel, 2007).

Observations directes in situ

Les membres du département EMH ont beaucoup pratiqué, pour l’évaluation de la biomasse des petits poissons pélagiques et plus généralement les travaux sur les écosystèmes pélagiques (Massé et al., 2006a; Massé et al., 2007), et fait évoluer la méthode acoustique appliquée à l'halieutique depuis son apparition dans le domaine scientifique (années 1970). Ils ont largement participé à la conception de nouveaux outils et de nouveaux concepts, notamment le sondeur multifaiseau halieutique (SMFH), installé sur le navire de recherche halieutique Thalassa en 2005 (Trenkel et al., 2006b; Trenkel et al., 2007b) mais aussi à l’étude de l’utilité de différentes fréquences pour l’identification des espèces à partir de leur énergie acoustique (Massé et al., 2006b). Les domaines privilégiés de l'équipe concernent la classification des agrégations, l'occupation de l'espace et l'analyse de données. L'analyse des bancs observés au cours des campagnes PELGAS a permis de caractériser les systèmes agrégatifs des petits poissons pélagiques dans le golfe de Gascogne en étudiant des images



acoustiques et les liens qui existent avec les pêcheries et les conditions environnementales (thèse de H. Villalobos). Le département EMH est l’un des rares pôles de compétence français en ichtyoplancton (œufs et larves de poissons). Le département dispose d’une expertise technique pour l’adaptation et la mise en œuvre d’engins d’échantillonnage à la mer (filets, luges, pompes). Lors des campagnes pélagiques le département met en œuvre sa capacité à réaliser une observation couplée simultanée sur l’ichtyoplancton (pompe CUFES 1, filets) et les poissons (acoustique), ce qui a permis par exemple de mesurer la densité in situ des œufs d’anchois (Goarant et al., 2007) mais aussi des études écologiques des habitats de ponte.Le chalutage est la méthode classique mise en œuvre par le département pour échantillonner les populations et peuplements démersaux et benthiques (chaluts de fond à perche ou à panneaux) et, en liaison avec l'approche acoustique, dans la colonne d'eau (chaluts pélagiques). Des nombreux travaux ont été effectués pour estimer la capturabilité des poissons par chalutage, en appliquant une méthode de séparation du processus de capture (Trenkel and Skaug, 2005), et en comparant des estimations de densités de poissons profonds issues des observations vidéos et des chalutages (Trenkel et al., 2004a). Pour obtenir des observations sur les individus à une échelle spatiale fine, la vidéo est utilisée (Trenkel et al., 2004b), complétée par la mesure des tailles de poissons in situ (Rochet et al., 2006b). Les résultats montrent que la vidéo est une approche fiable pour obtenir des estimations de densité, à condition que la visibilité soit bonne et que les espèces ne réagissent pas trop, comme dans les zones plus profondes (Trenkel et al., 2004b), ou pour les espèces benthiques comme la langoustine (Trenkel et al., 2007a).

Observation directe des espèces (au laboratoire)L'identification des sous-espèces, espèces et taxons supérieurs est une étape indispensable dans la connaissance de leurs interactions avec le milieu, leur capacité de régulation et de résilience. Pour les eaux côtières françaises, le département EMH a développé des compétences dans les domaines de l’identification des œufs et larves planctoniques, essentiellement poissons et crustacés décapodes, ainsi que dans l’identification d’espèces d’invertébrés du macrozoobenthos (Carpentier et al., 2005; Drévès et al., 2006), et bien entendu des adultes d’espèces halieutiques. Le travail de nomenclature et sa normalisation constante selon les standards internationaux permettent de gérer les synonymies dans les séries historiques de données de campagnes à la mer et de constituer des référentiels pour les bases de données.Pour aborder la dynamique biologique au sein des habitats, les captures doivent être caractérisées par leur nombre, leur taille et leur composition en classes d’âge. Des clefs taille-âge sont établies après lecture des structures annuelles des pièces calcifiées (otolithes) pour la majorité des espèces exploitées par les départements en charge de ces espèces. Le département EMH dispose d’une expertise particulière en otolithomètrie larvaire (extraction, préparation et lecture de stries journalières sur otolithes de larves). L’analyse des structures fines permet la détermination rétrospective de l’âge (date de ponte) et de la croissance des poissons durant leur première année de vie (Petitgas et al., 2005).

Qualification, archivage et gestion des donnéesLa conduite de recherches et d'expertise halieutiques ne peut se concevoir sans l’existence de bases de données fonctionnelles rassemblant et permettant la gestion de l’ensemble des données recueillies et analysées. Le département apporte une contribution tant sur la conception des systèmes de gestion des données (en particulier pour les campagnes halieutiques, EMH gère la base de données acoustiques) et anime le développement méthodologique de la démarche qualité pour toutes les données halieutiques (mise à jour de la documentation technique, rédaction de tables de qualification, rédaction des règles de qualification ; Tuffery et Mahévas 2006).

ACTIVITES D’EXPERTISELes activités d’expertise portent essentiellement sur les pêcheries ; cependant, le Département intervient également dans d’autres domaines.

Expertise sur les pêcheries :

1 CUFES continuous under water fish egg sampler



Expertise internationale : le Département a participé à la coordination et à la réalisation de l’action « expertises internationales » qui contribue à l’établissement de diagnostics sur l’état des pêcheries internationales importantes pour les flottilles françaises et à la simulation de l’impact de scénarios de gestion. Un chercheur du Département a été membre du Comité d’avis pour la gestion des pêches du Conseil international pour l’Exploration de la Mer (CIEM) pendant la période couverte par ce rapport.

En dehors de la coordination de cette action, EMH est intervenu plus directement sur l’évaluation de la pêcherie d’anchois du golfe de Gascogne. Le diagnostic s’est appuyé notamment sur les évaluations de stocks par méthode acoustique réalisées lors des campagnes Pelgas organisées et pilotées par EMH. La fermeture de la pêcherie depuis 2005 a entraîné une attente très forte de la part des gestionnaires et des professionnels en terme d’avis scientifiques sur l’évolution de ce stock, et une mobilisation conséquente de certains personnels du Département (nombreuses réunions avec professionnels et gestionnaires, participations à des groupes de travail, organisation de campagnes expérimentales etc.).

Expertise nationale : EMH n’est pas directement responsable de la formulation de réponses à des demandes d’avis ou d’expertise, tâches qui relèvent des Département régionaux. Cependant, le Département intervient en tant que de besoin en appui à l’élaboration de ces réponses (fourniture de données ou d’expertise scientifique) ; depuis 2007, une cellule de relecture des avis Ifremer portant sur les pêches a été constituée, et un chercheur d’EMH en fait partie. Chaque année, le Département contribue ainsi à l’élaboration d’une vingtaine de réponses.

Le Département a réalisé une étude pour le compte de la Région Pays de la Loire portant sur l’évolution des ressources bentho-démersales côtières du golfe de Gascogne et leur évolution entre 1980 et 2000. Elle conclut à une augmentation de la capacité de capture des flottilles côtières ; au niveau de l’environnement, on constate un accroissement de la température de l’eau de 1°C en moins d’un siècle et des changements locaux de la structure des sédiments dûs à la conchyliculture, au développement de faciès particuliers (crépidules, vasières à Haploops, petit crustacé qui élabore des tubes souples et modifie ainsi le substrat), aux travaux d’aménagement côtiers et aux extractions de granulats (Lobry et al, 2006).

Action concertée EASE : EASE (« European Advisory System Evaluation ») avait pour objectif d’évaluer les performances (qualité/coûts) des procédures d’avis sur la gestion des stocks dans l’Union européenne et de suggérer à la Commission européenne d’éventuels redéploiements des moyens. Cette action a permis d’estimer les coûts des actions conduisant aux avis récurrents (8 M€ pour la France), d’évaluer la performance des évaluations de stocks et d’identifier les principaux problèmes, de faire une analyse approfondie d’approches alternatives et de faire quelques propositions de réformes.

Etudes d’impacts : le Département est amené à intervenir dans divers domaines :

Suivi de l’impact des grands aménagements : il apporte sa contribution à la surveillance écologique et halieutique des sites de centrales nucléaires littorales. Au-delà de l’organisation de sorties en mer et de la réalisation de la synthèses des observations halieutiques pour différents sites à destination d’EDF, EMH aanalysé plus particulièrement les observations sur les larves de grands crustacés et les relations entre date d’apparition et températures. Certains résultats ont été valorisés sous forme de publications (Woehrling et al, 2005, Martin et Planque, 2006) ;

Extractions de granulats : les connaissances acquises dans le domaine côtiers, et plus particulièrement sur les nourriceries ont été mises en application pour la participation aux travaux sur les interactions entre extractions de granulats, ressources halieutiques et pêcheries (un rapport de convention Ifremer - Ministère de l’Industrie, un rapport de contrat Ifremer – groupement des sabliers du grand Charpentier) ;

Mesures compensatoires à l’extension du port de Donge – Est : la reconstitution d’une nourricerie est une des mesures prévues pour compenser les dommages écologiques occasionnés dans l’estuaire de la Loire par ces travaux ; compte tenu de son expertise dans le domaine du fonctionnement des nourriceries, EMH a été sollicité pour contribuer à la mise en place et au suivi de ce projet (participation au Conseil Scientifique et Technique et aux réunions de groupes de travail).



Références

Allain, G., P. Petitgas, and Lazure P.. 2007a. The influence of environment and spawning distribution on the survival of anchovy (Engraulis encrasicolus) larvae in the Bay of Biscay (NE Atlantic) investigated by biophysical simulations. Fisheries Oceanography 16(6): 506-514.

Allain, G., P. Petitgas, and Grellier P. 2007b. Biophysical modelling of larval drift, growth and survival for the prediction of anchovy (Engraulis encrasicolus) recruitment in the Bay of Biscay (NE Atlantic). Fisheries Oceanography 16(6): 489-505.

Amand, M., Pelletier, D., Ferraris, J., and Kulbicki, M. 2004. A step toward the definition of ecological indicators of the impact of fishing on the fish assemblage of the Abore reef reserve (New Caledonia). Aquatic Living Resources, 17: 139-149.

Battaglia, A., Trenkel, V., and Rochet, M. J. 2006. Estimating end effects in trawl catches. ICES J. Mar. Sci., 63: 956-959.

Bellier, E., B. Planque, et al. 2007. Historical fluctuations of spawning area of anchovy (Engraulis encrasicolus) and sardine (Sardina pilchardus) in the Bay of Biscay during 1967-73 end 2000-2004. Fish. Oceanogr. 16(1): 1-15.

Benoît, E., and Rochet, M.-J. 2004. A continuous model of biomass size spectra governed by predation, and the effects of fishing on them. Journal of Theoretical Biology, 226: 9-21.

Bergeron, J.-P. 2004. Contrasting years in the Gironde estuary (Bay of Biscay, NE Atlantic) springtime outflow and consequences for zooplankton pyruvate kinase activity and the nutritional condition of anchovy larvae: an early view. ICES J. Mar. Sci. 61: 928-932.

Bergeron, J.-P. 2006. Small-scale variability of zooplankton pyruvate kinase activity in the Gironde Estuary plume (Atlantic French Coast): A case study under unusually low freshwater discharge. Estuar. Coast. Shelf Sci. 69: 662-666.

Brind’Amour, A., D. Boisclair, et al. 2005. Multiscale distribution of littoral fish community in relation to environmental variables. Limnology and Oceanography 50(2): 465-479.

Buffaz, L. and B. Planque 2006. Application of operational oceanography to fisheries management: the case of anchovy in hte Bay of Biscay. ICES CM 2006/?:10.

Carpentier, A., Vaz, S., Martin, C. S., Coppin, F., Dauvin, J.-C., Desroy, N., Dewarumez, J.-M., Eastwood, P. D., Ernande, B., Harrop, S., Kemp, Z., Koubbi, P., Leader-Williams, N., Lefèbvre, A., Lemoine, M., Loots, C., Meaden, G., Ryan, N., and Walkey, M., 2005. Atlas des habitats des Ressources Marines de la Manche Orientale. Ind.

Certain, G., E. Bellier, et al. 2007. Characterising the temporal variability of the spatial distribution of animals: an application to seabirds at sea. Ecography 30: 695-708.

Claudet, J. 2006. Aires Marines protégées et récifs artificiels : méthodes d'évaluation, protocoles expérimentaux et indicateurs Thèse de Doctorat de l'Université de Perpignan et de l'Ecole Pratique des Hautes Etudes. Discipline : Océanologie, Université de Perpignan. 266 pp.Claudet, J., and Pelletier, D. 2004. Marine protected areas and artificial reefs: A review of the interactions between management and scientific studies. Aquatic Living Resources, 17: 129-138.

Claudet, J., Pelletier, D., Jouvenel, J. Y., Bachet, F., and Galzin, R. 2006. Assessing the effects of Marine Protected Area (MPA) on a reef fish assemblage in a northwestern Mediterranean marine reserve : identifying community-based indicators. Biological Conservation, 130: 349-369.



Cotter, A. J. R., Mesnil, B., and Piet, G. J. 2007. Estimating stock parameters from trawl cpue-at-age series using year-class curves. ICES J. Mar. Sci., 64: 234-247.

Cotter, J., P. Petitgas, et al. 2007. Manual of indicators and methods for assessing fish stocks using only fishery-independent survey-based information. ICES CM 2007/O:27.

De Lara, M., Doyen, L., Guilbaud, T., and Rochet, M.-J. 2007. Is a management framework based on spawning-stock biomass indicators sustainable ? A viability approach. ICES J. Mar. Sci., 64:

Désaunay, Y., D. Guérault, et al. 2006. Changes in occurrence and abundance of northern / southern flattfishes over a 20-year period in a coastal nusery area (Bay of Vilaine) and the eastern continental shelf of the Bay of Biscay. Sci. Mar. 70(S1): 193-200.

Doyen, L., Cohen de Lara, M., Ferraris, J., and Pelletier, D. 2007. Sustainable management of marine biodiversity and ecosystems through marine protected areas. Ecological Modelling, 208: 353-366.

Drévès, L., Lampert, L., Martin, J., Abernot Le Gac, C., Brylinski, J.-M., Vincent, D., Gaffet, J. D., and Schlaich, I., 2006. Surveillance écologique et halieutique du site électronucléaire de Flamanville, année 2005. Ifremer, Plouzané, 202 pp.

Drouineau, H. 2008. Développement et ajustement d'un modèle de dynamique des populations structuré en longueur et spatialisé appliqué au stock Nord de merlu (Merluccius merluccius). Thèse de Doctorat. Spécialité Halieutique, Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Rennes. 207 pp.

Drouineau, H., Mahévas, S., Bertignac, M., and Fertin, A. 2008. Assessing the impact of discretisation assumptions in a length-structured growth population model. Fisheries Research,

Drouineau, H., Mahévas, S., Pelletier, D., and Beliaeff, B. 2006. Assessing the impact of different management options using ISIS-Fish : the French Merluccius merluccius - Nephrops norvegicus mixed fishery of the Bay of Biscay. Aquat. Living Resour., 19: 15-29.

Ferraris, J., Pelletier, D., Kulbicki, M., and Chauvet, C. 2005. Assessing the impact of removing reserve status on the Abore Reef fish assemblage, New Caledonia. Marine Ecology Progress Series, 292: 271-286.

Gallego, A., E. North, and Petitgas P. 2007. Advances in modelling physical-biological interactions in fish early life history. Marine Ecology Progress Series 347: 121-126.

Gaertner, J. C., J. A. Bertrand, et al. 2005. Large spatial scale variation of demersal fish assemblage structure on the continental shelf of the NW Mediterranean Sea. Marine Ecology Progress Series 297: 245-257.

Gaertner, J.-C., J.-A. Bertrand, et al. 2005. Spatio-temporal organization patterns of demersal assemblages of the east coast of Corsica (Mediterranean Sea). Vie Milieu 55(2): 81-89.

Gilliers, C. 2004. Recherche d'indicateurs de la qualité des écosystèmes côtiers: application aux nourriceries côtières et estuariennes des poissons plats. Doctorat, Université du Littoral - Côte d'Opale. 194 pp.

Gilliers, C., Amara, R., Bergeron, J.-P., and Le Pape, O. 2004. Comparison of growth and condition indices of juvenile flatfish in different coastal nursery grounds. Environmental Biology of Fishes, 71: 189-198.

Gilliers, C., Le Pape, O., Désaunay, Y., Bergeron, J.-P., Schreiber, N., Guérault, D., and Amara, R. 2006. Growth and condition of juvenile sole (Solea solea L.) as indicators of habitat quality in coastal and estuarine nurseries in the Bay of Biscay with a focus on sites exposed to the Erika oil spill. Sci. Mar., 70: 183-192.



Goarant, A., Petitgas, P., and Bourriau, P. 2007. Anchovy (Engraulis encrasicolus) egg density measurements in the Bay of Biscay: evidence for the spatial variation in egg density with sea surface salinity. Mar. Biol., 151 (5) : 1907-1915.

Huret, M., Gohin, F., Delmas, D., Lunven, M., and Garçon, V. 2007. Use of Sea WiFS data for light availability and parameter estimation of a phytoplankton production model of the Bay of Biscay. Journal of Marine Systems, 65: 509-531

Huret, M., P. Petitgas, et al. 2007. Linking anchovy and sprat distributions with bio-physical oceanographic features: a Bay of Biscay - North Sea comparison. ICES CM 2007/G:14.

Huret, M., J. A. Runge, et al. 2007. Dispersal modeling of fish early life stages: sensitivity with application to Atlantic cod in the western Gulf of maine. Mar Ecol Prog Ser 347: 261-274.

Le Pape, O., Baulier, L., Cloarec, A., Martin, J., Le Loc'h, F., and Désaunay, Y. 2007a. Habitat suitability for the juvenile common sole (Solea solea, L.) in the Bay of Biscay (France): a quantitative description using indicators based on epibenthic fauna. Journal of Sea Research, 57: 126-136.

Le Pape, O., Gilliers, C., Riou, P., Morin, J., Amara, R., and Désaunay, Y. 2007b. Convergent signs of degradation in both the capacity and the quality of an essential fish habitat: state of the Seine Estuary (France) flatfish nurseries. Hydrobiologia, 588: 225-229.

Le Pape, O., Guérault, D., and Désaunay, Y. 2004. Effect of an invasive mollusc, American slipper limpet Crepidula fornicata, on habitat suitability for juvenile common sole Solea solea in the Bay of Biscay. Marine Ecology Progress Series, 277: 107-115.

Lehuta, S., Petitgas, P., and Mahevas, S. 2006. Assessing the potential effect of management scenarios for Anchovy (Engraulis encrasicolus) fishery of the Bay of Biscay using ISIS-Fish simulation tool. ICES CM 2006/R:10, 24 pp.

Lobry, J., Y. Desaunay, 2006. Les ressources bentho-démersales côtières du golfe de Gascogne. Etat comparatif des pêcheries côtières et de leur contexte environnemental entre les années 1980 et 2000. SMIDAP, Rapport d'étude: arrêté 2005 06986 du 25 juillet 2005, 81 p.

Lobry, J., M. Lepage, et al. 2006. From seasonal patterns to a reference situation in an estuarine environment: Example of the small fish and shrimp fauna of the Gironde estuary (SW France). Estuarine, Coastal and Shelf Science 70: 239-250.

Lobry J., Le Loc'h, F., and Niquil, N. 2007. Les compartiments-clé et les compartiments structurants de l’écosystème exploité du Golfe de Gascogne. Une approche par modélisation trophique. 8e forum halieumétrique "Changements réversibles et irréversibles dans les ressources et leurs usages", La Rochelle, France.

Lobry, J., David, V., Pasquaud, S., Lepage, M., Sautour, B., and Rochard, E. 2008. Diversity and stability of an estuarine trophic network. Marine Ecology Progress Series 358: 13-25

Mahévas, S., Bellanger, L., and Trenkel, V. sous presse 2007. Cluster analysis of linear model coefficients under contiguity constraints for identifying common spatial and temporal patterns. Fisheries Research,

Mahévas, S., and Pelletier, D. 2004. ISIS-Fish, a generic and spatially explicit simulation tool for evaluating the impact of management measures of fisheries dynamics. Ecological Modelling, 171: 65-84.

Mahévas, S., Sandon, Y., and Biseau, A. 2004. Quantification of annual variations in fishing power due to vessel characteristics: an application to the bottom-trawlers of South-Brittany targeting anglerfish (Lophius budegassa and Lophius piscatorius). ICES Jounal of Marine Science, 61: 71-83.



Marquis, E., P. Petitgas, et al. 2006. Influence of the small pelagic fish on the structure and functioning of the planktonic foof web on the continental shelf on the Bay of Biscay. ICES CM 2006/F:09.

Martin, J. and B. Planque 2006. Variability in the onset of hatching of spider crab (Maja brachydactyla Balss, 1922) in the English Channel in relation to sea temperature. Invertebrate Reproduction and Development 49(3): 143-150.

Massé, J., Méhault, S., Beillois, P., Duhamel, E., Planque, B., Petitgas, P., and Biseau, A., 2006a. Estimation du stock d'anchois lors de la campagne acoustique Pelgas06. ICES Working Group on the assessment of Mackerel, Horse Mackerel, Sardine and Anchovy, Galway, 5-14 September 2006, pp.

Massé, J., Trenkel, V., Kostecky, C., and Mehault, S., 2006b. An attempt to reduce species misidentification in acoustic assessments by using school descriptors, including multi-frequency indices. Maastricht, Hollande, pp.

Massé, J., Beillois, P., Duhamel, E., Huret, M., Planque, B., Petitgas, P., and Biseau, A., 2007. Direct assessment of pelagic species by the PELGAS07 acoustic survey and consort commercial vessels. Copenhagen, 30 pp.

Mesnil, B. 2003. The Catch-Survey Analysis (CSA) method of fish stock assessment: an evaluation using simulated data. Fisheries Research, 63: 193-212.

Mesnil, B. 2005. Sensitivy of, and Bias in, Catch-Survey Analysis (CSA) Estimates of Stock Abundance. Fisheries Assesment and Management in Data-Limited Situations, AK - SG:

Nicolas, D., F. Le Loc’h, et al. 2007. Relationships between benthic marcrofauna and habitat suitability for juvenile common sole (Solea solea, L.) in the Vilaine estuary (Bay of Biscay, France) nursery ground. Estuar. Coast. Mar. Sci. 73: 639-650.

Pasquaud, S., J. Lobry, et al. 2007. Facing the necessity of describing estuarine ecosystems: a review of food web ecology study techniques. Hydrobiologia 588: 159-172.

Pecquerie, L. 2007. Modélisation bioénergétique de la croissance, du développement et de la reproduction d'un petit pélagique : l'anchois du golfe de Gascogne. Ifremer/ Vreij Universiteit Amsterdam/ AgroCampus Rennes.

Pecquerie, L. 2007. Modélisation bioénergétique de la croissance, du développement et de la reproduction d'un petit pélagique : l'anchois du golfe de Gascogne. Doct. Agrocampus Rennes, mention : Halieutique, Agrocampus Rennes/Ifremer. 235 pp.

Pelletier, D., Garcia-Charton, J. A., Ferraris, J., David, G., Thébaud, O., Letourneur, Y., Claudet, J., Amand, M., Kulbicki, M., and Galzin, R. 2005. Designing indicators for assessing the effects of marine protected areas on coral reef ecosystems: A multidisciplinary standpoint. Aquat. Living Resour., 18: 15-33.

Pelletier, D., and Mahévas, S. 2005. Spatially explicit fisheries simulation models for policy evaluation. Fish and fisheries, 6: 307-349.

Persohn, C., P. Lorance, et al. 2007. Habitat preferences of selected demersal species in the Bay of Biscay and the Celtic Sea. ICES CM 2007/G :16.

Petitgas, P. 2008. Fisboat: Fisheries Independent Survey-Based Operational Assessment Tools. Final activity report. Nantes, Ifremer: 302p. + Annexes 390p.

Petitgas, P., P. Beillois, et al. 2004. On the importance of adults in maintaining population habitat occupation of recruits as deduced from observed schooling behaviour of age-0 anchovy in the bay of Biscay.

Petitgas, P. and Grellier, P. 2003. Size selective processes for anchovy in Biscay, 2000-2002: recruitment, adult survival and spawning. ICES CM 2003/N:07



Petitgas, P., Lenfant, P., Gonzalez, C., and Grellier, P., 2005. Tracking individual variability in Bay of Biscay anchovy population using genetics and otolith analysis to understand the mechanisms of population maintenance. 12 pp.

Petitgas, P., S. Magri, and Lazure P. 2006. One-dimensional biophysical modelling of fish egg vertical distributions in shelf seas. Fish. Oceanogr. 15(5): 413-428.

Petitgas, P., J. Massé, et al. 2006. Hydro-plankton characteristics and their relationship with sardine and anchovy distributions on the French shelf of the Bay of Biscay. Sci. Mar. 70(S1): 161-172.

Petitgas, P., J.-C. Poulard, et al. 2007. Comprehensive indicator-based diagnostics of fish stocks using fishery-independant survey data : the FISBOAT report on case studies. ICES CM 2007/O:16

Petitgas, P., D. Reid, et al. (2006). The entrainment hypothesis: an explanation for the persistence and innovation in spawning migration and life cycle patterns. ICES CM 2006

Poulard, J.-C., and Trenkel, V. M. 2007. Do survey design and wind conditions influence survey indices ? Can. J. Fish. Aquat. Sci. : 1551-1562.

Petitgas, P. and S. Vaz 2005. Investigating the interaction between population spatial organisation and population dynamics using an age-structured multi-site matrix model on anchovy in Biscay. ICES CM 2005/L:23.

Piet, G. J., Jansen, H. M., and Rochet, M. J. In press. Evaluation of indicators to be used in an ecosystem approach to fisheries management in European waters ICES Jounal of Marine Science,

Planque, B., Bellier, E., and Lazure, P. 2007. Modelling potential spawning habitat of sardine (Sardina pilchardus) and anchovy (Engraulis encrasicolus) in the Bay of Biscay. Fish. Oceanogr., 16: 16-30.

Planque, B., Lazure, P., and Jegou, A.-M. 2006. Typology of hydrological structures modelled and observed over the Bay of Biscay shelf. Sci. Mar., 70: 43-50.

Planque, B., P. Lazure, et al. 2004. Detecting hydrological landscapes over the Bay of Biscay continental shelf in spring. Climate Research 28: 41-52.

Poulard, J.-C. and F. Blanchard 2005. The impact of climate change on the fish community structure of the eastern continental shelf of the Bay of Biscay. ICES J. Mar. Sci. 62: 1436-1443.

Prigent, M., Fontenelle, G., Rochet, M.-J., and Trenkel, V. M. In press. Using cognitive maps to investigate fishers’ ecosystem objectives and knowledge. Ocean & Coastal Management,

Rice, J., and Rochet, M.-J. 2005. A framework for selecting a suite of indicators for fisheries management. ICES Jounal of Marine Science, 62: 516-527.

Rochet, M.-J., Bertignac, M., Fifas, S., Gaudou, O., and Talidec, A., 2006a. Estimating discards in the French Nephrops fishery in the Bay of Biscay. Ifremer, Nantes, Lorient, Brest, pp.

Rochet, M.-J., Cadiou, J.-F., and Trenkel, V. 2006b. Precision and accuracy of fish length measurements obtained with two visual underwater methods. Fishery Bulletin, 104: 1-9.

Rochet, M. J., Prigent, M., Bertrand, J. A., Carpentier, A., Coppin, F., Delpech, J.-P., Fontenelle, G., Foucher, E., Mahé, K., Rostiaux, E., and Trenkel, V. M. In press. Fishers' perceptions of recent changes in the Eastern English Channel ecosystem and fisheries are corroborated by scientific information. ICES Jounal of Marine Science,



Rochet, M.-J., and Rice, J. 2005. Do explicit criteria help selecting indicators for Ecosystem-based fisheries management ? An experimental test. ICES Journal of Marine Science, 62: 528-539.

Rochet, M. J., and Trenkel, V. M. sous presse 2007. Why and how could indicators be used in an ecosystem approach to fisheries management? In Future of Fishery Science in North America, Ed. by R. J. Beamish and B. Rothschild. Fish & Fisheries Series, Springer,

Rochet, M. J., Trenkel, V. M., Bellail, R., Coppin, F., Le Pape, O., Mahé, J.-C., Morin, A., Poulard, J.-C., Schlaich, I., Souplet, A., Vérin, Y., and Bertrand, J. A. 2005. Combining indicator trends to assess ongoing changes in exploited fish communities: diagnostic of communities off the coasts of France. ICES Journal of Marine Science, 62: 1647-1664.

Shin, Y.-J., Rochet, M.-J., Jennings, S., Field, J., and Gislason, H. 2005. Using size-based indicators to evaluate the ecosystem effects of fishing. ICES Jounal of Marine Science, 62: 384-396.

Talidec, C., Rochet, M.-J., Bertignac, M., and Macher, C., 2005. Discards estimates of nephrops and hake in the Nephrops trawl fishery of the Bay of Biscay: Methodology and preliminary results for 2003 and 2004. Lisbon, Portugal, pp.

Trenkel, V.-M. soumis 2007. A biomass random effects model (BREM) for fish stock assessment and management with application to Bay of Biscay anchovy. Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences,

Trenkel, V., Francis, R. I. C. C., Lorance, P., Mahévas, S., Rochet, M.-J., and Tracey, D. 2004a. Availability of deep-water fish to trawling and visual observation from an remotely operated vehicle (ROV). Marine Ecology Progress Series, 284: 293-303.

Trenkel, V.-M., Le Loc'h, F., and Rochet, M.-J. 2007a. Small scale spatial and temporal interactions among benthic crustaceans and one fish species in the Bay of Biscay. Mar. Biol., 151: 2207-2215.

Trenkel, V., Le Loc'h, F., and Rochet, M. J., 2006a. Interactions between Norway lobster diel activity variations and the fishing strategy of Nephrops trawlers in the Bay of Biscay 10 pp.

Trenkel, V.-M., F. Le Loc'h, et al. 2007. Small scale spatial and temporal interactions among benthic crustaceans and one fish species in the Bay of Biscay. Mar. Biol. 151: 2207-2215.

Trenkel, V.M. et Lorance, P. (2005) The contribution of visual observations to surveying the deep-sea fish community. Deep Sea 2003: Conference on the Governance and Management of Deep-sea Fisheries, Part 1: Conference reports. FAO Fisheries Proceedings 3/1, 309-322.

Trenkel, V. M., Lorance, P., and Mahévas, S. 2004b. Do visual transects provide true population density estimates for deep-water fish? ICES Journal of Marine Science, 61: 1050-1056.

Trenkel, V., Mazauric, V., and Berger, L., 2006b. First results with the new Multibeam Echo Sounder ME70. Japan, Hawaii, pp.

Trenkel, V. M., Pinnegar, J. K., Rochet, M.-J., and Rackham, B. 2004c. Different survey designs provide similar pictures of community structure but not of individual fish populations. ICES Journal of Marine Science, 61: 351-362.

Trenkel, V., Pinnegar, J., Dawson, W. A., du Buit, M.-H., and Tidd, A. N. 2005. Spatial and temporal structure of predator-prey relationships in the Celtic Sea fish community. Marine Ecology Progress Series, 299: 257-268

Trenkel, V. M., Rochet, M.-J., and Mahévas, S. 2008. Interactions between fishing strategies of Nephrops trawlers in the Bay of Biscay and Norway lobster diel activity patterns. Fisheries Management and Ecology, 15: 11-18.



Trenkel, V.-M., Rochet, M.-J., and Mesnil, B. 2007. From model-based prescriptive advice to indicator-based interactive advice. ICES J. Mar. Sci., 64: 768-774.

Trenkel, V., Scalabrin, C., Berger, L., and Mazauric, V., 2007b. Impact of beam angle on shoal structure and energy measurements: comparison of simulation results with data from new multibeam echosounder (ME70). Dublin, 17 pp.

Trenkel, V., and Skaug, H. J. 2005. Disentangling the effects of capture efficiency and population abundance on catch data using random effects models. ICES J. Mar. Sci., 62: 1543-1555.

Tufféry C. and Mahévas S., 2006. Fisheries quality management : toward quality indicators. ICES annual conference, CM 2006/M : 20, 11p.

Vigneau, J., and Mahévas, S., 2005. A new statistic for sampling design investigation: an application to length-structured landings sampling. ICES annual conference, Abeerdeen, pp.

Vigneau, J., and Mahévas, S. 2007. Detecting sampling outliers and sampling heterogeneity when catch-at-length is estimated using the ratio estimator. ICES J. Mar. Sci., 64: 1028-1032.

Woehrling, D., A. Lefebvre, et al. 2005. Seasonal and longer term trends in sea temperature along the French North Sea coast, 1975 to 2002. J. Mar. Biol. Assoc. U.K. 85(4769): 1-10.

Woillez, M., P. Petitgas, et al. 2006. Relationships between population spatial occupation and population dynamics: ICES CM 2006/0:05.

Woillez, M., J.-C. Poulard, et al. 2007. Indices for capturing spatial patterns and their evolution in time, with application to European hake (Merluccius merluccius) in the Bay of Biscay. ICES J. Mar. Sci. 64(3): 537-550.



3. Eléments quantitatifs de la qualité de la Recherche

3.1. Nombre total et liste de publications (si justifié par les activités de l’Unité)(Publications de rang A, autres publications dont chapitres dans des ouvrages scientifiques) – à joindre en annexe –

Année 2004 Production scientifique et technologiqueType de document Code ECOHAL MAHER

APublications dans revues scientifiques ou technologiques AVEC COMITE DE LECTURE

A11 13

Publications dans revues scientifiques ou technologiques SANS COMITE DE LECTURE

B

Ouvrages ou articles dans ouvrages (papier, multimédia) C 1Communications écrites dans des colloques, groupes de travail D 4 16Articles dans revues de grande diffusion ou de vulgarisation E 1 2Rapports de contrats (CEE, FAO, Convention, Collectivités) F 1 2Avis*, Expertises G 4Documents relatifs au contrôle qualité et à l'accréditation, aux procédures et protocoles HRapports référencés par les directions I 6 1Autres Types de Rapports: Missions à l'étranger et groupes de travail J1 3Autres Types de Rapports: Missions à la mer J2 1 1Autres Types de Rapports: Mémoires d'étudiant (DEA, ISPA, IUT, Maîtrise) J3 2 2Autres Types de Rapports: Documentations Techniques diverses J4 4Brevets KThèses et HDR L 1 1Organisation de colloques et de groupes de travail P1Posters et communications orales P2 7 10Intervention auprès des médias P3Réponse à Appels à propositions européens Q1 1Réponse à Appels à propositions nationaux Q2 1 1Réponse à Appels à propositions régionaux Q3 2



Année 2005Type de document Code Nbre

totalPublications dans revues scientifiques ou technologiques AVEC COMITE DE LECTURE A 23Publications dans revues scientifiques ou technologiques SANS COMITE DE LECTURE B

Ouvrages ou articles dans ouvrages (papier, multimédia) C 1Communications écrites dans des colloques, groupes de travail D 17Articles dans revues de grande diffusion ou de vulgarisation E

Rapports de contrats (CEE, FAO, Convention, Collectivités) F 2Avis*, Expertises G 1Documents relatifs au contrôle qualité et à l'accréditation, aux procédures et protocoles HRapports référencés par les directions I 3Autres Types de Rapports: Missions à l'étranger et groupes de travail J1Autres Types de Rapports: Missions à la mer J2Autres Types de Rapports: Mémoires d'étudiant (DEA, ISPA, IUT, Maîtrise) J3 9Autres Types de Rapports: Documentations Techniques diverses J4 2Brevets KThèses et HDR L 3Organisation de colloques et de groupes de travail P1 1Posters et communications orales P2 13Intervention auprès des médias P3Réponse à Appels à propositions européens Q1Réponse à Appels à propositions nationaux Q2Réponse à Appels à propositions régionaux Q3

Année 2006Type de document Code Nbre

totalPublications dans revues scientifiques ou technologiques AVEC COMITE DE LECTURE A 14

Publications dans revues scientifiques ou technologiques SANS COMITE DE LECTURE B 1

Ouvrages ou articles dans ouvrages (papier, multimédia) C 1Communications écrites dans des colloques, groupes de travail D 13Articles dans revues de grande diffusion ou de vulgarisation ERapports de contrats (CEE, FAO, Convention, Collectivités) F 6Avis*, Expertises G 1Documents relatifs au contrôle qualité et à l'accréditation, aux procédures et protocoles

H

Rapports référencés par les directions I 3Autres Types de Rapports: Missions à l'étranger et groupes de travail J1 5Autres Types de Rapports: Missions à la mer J2Autres Types de Rapports: Mémoires d'étudiant (DEA, ISPA, IUT, Maîtrise) J3 5Autres Types de Rapports: Documentations Techniques diverses J4 6Brevets KThèses et HDR L 1Organisation de colloques et de groupes de travail P1 2Posters et communications orales P2 10Intervention auprès des médias P3Réponse à Appels à propositions européens Q1Réponse à Appels à propositions nationaux Q2Réponse à Appels à propositions régionaux Q3

Année 2007



Type de document Code Nbre to-tal

Publications dans revues scientifiques ou technologiques AVEC COMITE DE LECTURE A 22Publications dans revues scientifiques ou technologiques SANS COMITE DE LECTURE BOuvrages ou articles dans ouvrages (papier, multimédia) CCommunications écrites dans des colloques, groupes de travail D 19Articles dans revues de grande diffusion ou de vulgarisation E 1Rapports de contrats (CEE, FAO, Convention, Collectivités) F 2Avis*, Expertises G 20Documents relatifs au contrôle qualité et à l'accréditation, aux procédures et protocoles HRapports référencés par les directions I 2Autres Types de Rapports: Missions à l'étranger et groupes de travail J1 6Autres Types de Rapports: Missions à la mer J2Autres Types de Rapports: Mémoires d'étudiant (DEA, ISPA, IUT, Maîtrise) J3 6Autres Types de Rapports: Documentations Techniques diverses J4 4Brevets KThèses et HDR L 2Organisation de colloques et de groupes de travail P1 1Posters et communications orales P2 23Intervention auprès des médias P3 ~4Réponse à Appels à propositions européens Q1 1Réponse à Appels à propositions nationaux Q2 1Réponse à Appels à propositions régionaux Q3

3.6. Activités de formation doctorales et postdoctorales :(Rappeler : i) de se reporter aux annexes 7 et 8, ii) le nombre total d’encadrements par année de la période concernée).Un total de 7 doctorants, dont 3 ont soutenu leur thèse ont été encadrés entre 2004 et 2007. Par ailleurs, 4 post-doctorants ont été accueillis au département.

3.7. Responsabilités collectives locales, nationales, internationales des membres de l’équipe :

Nom Locales Nationales InternationalesBrind’Amour A. Membre du CA de

l’Association Française d’Halieumètrie

A. Forest Membre du CST SMIDAP/Pays de LoireMembre du CS Agrocampus/Rennes

Membre du CS LITEAUMembre du Comité directeur du GRISAMMembre du CS Conseil Supérieur de la PêchePrésident, membre du CA de l’Association Française d’HalieumètrieMembre CSS INRAMembre/président de 6 commissions évaluation UMRCo-responsable du projet Ifremer EDERU-International

Délégué français au CIEMMembre du bureau du CIEMMembre du comité d’avis du CIEMMembre du comité des ressources vivantes du CIEM

Nom Locales Nationales InternationalesC. Dintheer Responsable du projet Membre du



Ifremer SIH-UsagesCoordonateur Ifremer DCR

PGCCDBS/CIEM ; président des RMC NE Atlantique et Méditerranée (DCR) ; expert au Comité de Gestion Pêche et Aquaculture

Lobry J. Membre du CA de l’Association Française d’Halieumètrie

P. Lorance Membre du CIRMATResponsable du projet Ifremer Actio Intégrée gascogne

S. Mahevas Responsable projet Ifremer MEQUAPROMembre du CA de l’Association Française d’Halieumètrie

J.Martin Membre du Conseil Scientifique Régional du Patrimoine Naturel (CSRPN)

P. Petitgas Membre/président du comité des ressources vivantes du CIEM ; Membre du Comité consultatif du CIEM

J.C. Poulard Secrétaire de la Commission « Ecologie des Ressources et Environnement Côtier » (ECOREC)

V. Trenkel Responsable du projet Ifremer OBSHALMembre du CA de l’Association Française d’Halieumètrie

Editrice du ICESJ. of marine Science



3.8. Réponses aux appels d’offres européens :(Liste des projets retenus et montants ; préciser si l’équipe joue le rôle de coordonnateur du projet).

Le tableau ci-dessus résume l’implication du département EMH dans des projets, qu’ils soient ou non financés par l’Europe ; ils sont regroupés selon leur appartenance aux « projets Ifremer ».

Le tableau ci-dessous donne la liste des projets financés par l’UE dans lesquels des agents du département interviennent. Pour chacun d’eux, seul l’intervenant principal du départements est listé. Les coordinateurs de projet ou de « Work packages » sont soulignés et en italiques.



Projet Titre Coordinateur Correspondants EMH

Période Recette Ifremer (€)

CATEFA Combining Acoustic andTrawl data for Estimating Fish Abundance

Ecole des Mines J.Massé 2001-2004 73 000

EASE European Advice System Evaluation

DIFRES/Danemark A.Forest B.Mesnil

2002-2006 71 775

SIMFAMI Identification des échos par l'utilisation simultanée de plusieurs fréquences acoustiques

FRS/Aberdeen J. Massé 2002-2005 276 000

TECTAC TECchnological development and TACtical adaptations of important EU fleets

IFREMER Boulogne S.Mahévas

CAFE Capacity, F and Effort FRS/Aberdeen S. Mahévas 2003-2006 192 088DCR Data Collection Regulation DPMA C.Dintheer 2002-2007 960 500EFIMAS Operational evaluation tools

for fisheries management options

DIFRES/Danemark D.Pelletier 2004-2008 102 505

BECAUSE Critical Interactions BEtween Species and their Implications for a PreCAUtionary FISheries Management in a variable Environment- a Modelling Approach

IHFS (Université Hambourg)

J.C. Poulard 2004-2007 106 155

FISBOAT Fishery independent survey based operational assessment tools

IFREMERP.Petitgas

P.Petitgas 2004-2007 308 640

INDECO Developing indicators of environmental performance of the common fisheries policy

IEEP (Institute for European environmental Policy)

M.J.Rochet 2005-2006 23 000

EUROCEANS European network of excellence for Ocean Ecosystems Analysis

IUEM (Institut Universitaire Européen de la Mer)

P.Petitgas 2005-2009 111 832

UNCOVER Understanding the mechanisms of stock recovery

BFAFI (Allemagne) M. Huret 2006-2010 349 849

IMAGE Indicators for fisheries MAnaGement in Europe

IMARES/Pays Bas M.J.Rochet 2006-2009 172 284

COST Common Open Source Tool IFREMERPort-en-Bessin

S.Mahevas 2006-2008 120 197

PROTECT Marine protected areas as a tool for ecosystem conservation and fisheries management

DIFRES/Danemark D.Pelletier 2005-2008 100 168

PECHE RECREATIVE

DPMA C.Dintheer 2006-2008 247 000

RECLAIM Resolving Climatic impacts on fish stocks

IMARESPays Bas

P.Petitgas 2007-2009 225 000

AFRAME A framework for fleet and area based fisheries management

AZTI-TECNALIAEspagne

S.Mahévas 2007-2009 173 455


http://cordis.europa.eu/search/index.cfm?fuseaction=proj.document&PJ_RCN=9579626&CFID=7892856&CFTOKEN=40346293&jsessionid=4230c857eb2412413576&q=3110DAC3F6E08EFFF327232D0F9B4455&type=sim

http://cordis.europa.eu/search/index.cfm?fuseaction=proj.document&PJ_RCN=9642831&CFID=7892856&CFTOKEN=40346293&jsessionid=4230c857eb2412413576&q=0F6BBF1B1DFC7330E0AFBBA29DF99903&type=sim

http://cordis.europa.eu/search/index.cfm?fuseaction=proj.document&PJ_RCN=9642831&CFID=7892856&CFTOKEN=40346293&jsessionid=4230c857eb2412413576&q=0F6BBF1B1DFC7330E0AFBBA29DF99903&type=sim

http://cordis.europa.eu/search/index.cfm?fuseaction=proj.document&PJ_RCN=9642682&CFID=7892856&CFTOKEN=40346293&jsessionid=4230c857eb2412413576&q=AACCE3CD99EAD8334E4F2A9BEE91B431&type=sim

http://cordis.europa.eu/search/index.cfm?fuseaction=proj.document&PJ_RCN=9642682&CFID=7892856&CFTOKEN=40346293&jsessionid=4230c857eb2412413576&q=AACCE3CD99EAD8334E4F2A9BEE91B431&type=sim

http://cordis.europa.eu/search/index.cfm?fuseaction=proj.document&PJ_RCN=7493912&CFID=7892856&CFTOKEN=40346293&jsessionid=4230c857eb2412413576&q=F7F8828A70A6B16896E4E9D7B7B5FFCE&type=sim



http://cordis.europa.eu/search/index.cfm?fuseaction=proj.document&PJ_RCN=7492640&CFID=7892856&CFTOKEN=40346293&jsessionid=4230c857eb2412413576&q=599944E5EDAAED3328EDF2C3A3974DEC&type=sim




3.9. Travaux et contrats ayant conduit à une recette pour l’organisme (hors appels d’offres européens) :(Liste indiquant l’origine du contrat (national : Etat, collectivités, territoires, entreprise, autres / international), l’objet du contrat, les partenaires, le montant de la recette, les retombées : brevet, publications, avis, expertises, etc.).

Origine Titre du contrat Période Retombée Recette totale

Ifremer(€)

CNPMEM Thèse Laure Pecquerie 2003-2006 Thèse 20 700Affrètement d’un navire professionnel, campagne MERTAIL

2004 Rapport

Région Pays de Loire Les ressources accessibles au chalutage côtier de Quiberon à Noirmoutier

2004 Rapport 8 000

CR PDL/SMIDAP Restriction Nourriceries 2006-2006 Rapport 20 000CR PDL/SMIDAP Pêcheries côtières PECOS 2005-2006 Rapport 5 500 Convention granulats Ifremer-Ministère de l’Industrie

Interactions entre extraction des granulats, ressources halieutiques et pêcheries

2005 Rapport Recette globale Ifremer

Contrat Ifremer – Nantes – groupement du Grand Charpentier

Convention de mise à disposition du navire « Gwen Drez »

2006 Rapport d’expertise

35 100

ANR CHALOUPE CHAangement gLObal, dynamiqUe de la biodiversité marine exploitée et viabilité des PEcheries

2006-2009 En cours 155 640

ANR-GAIUS Gouvernance des aires marines protégées pour la gestion durable de la biodiversité et des usages côtiers

Fin 2007-2010 En cours 105 797

Liteau3-PAMPA Indicateurs de la Performance d’APM pour la gestion des écosystèmes côtiers, des ressources et de leurs usages

Fin 2007-2011 En cours 87 180

3.10.Campagnes/essais à la mer, essais en bassins, embarquements :(Insérer dans ce chapitre l’annexe 11 complétée).Voir annexe 11.

3.11.Travaux sous-traités :Isis-fish est un simulateur de pêcherie complexe écrit en Java. Le projet a été initié à la demande de l'Ifremer et financé par celui-ci. L'analyse et la réalisation technique ont été confiées à différents partenaires :

Irin (Institut de Recherche en Informatique de Nantes)

Cogitec ( http://www.cogitec.fr )


http://www.cogitec.fr/


Code Lutin ( http://www.codelutin.com )

3.12. Autres activités (s’il y a lieu) :

4. Positionnement et rôle de l’Unité

4.1. Collaborations extérieures régionales, nationales et internationales :(Liste des entreprises, organismes, laboratoires de recherche publics ou privés avec lesquels l’unité a eu des collaborations significatives –en terme de résultats obtenus- en précisant les thèmes et programmes auxquels l’unité est rattachée. Les classer en trois rubriques : collaborations dans le cadre d’une convention, collaborations non conventionnées mais suivies sur les cinq années, collaborations non conventionnées et limitées).

Bien que non formalisées dans le cadre de conventions, le département entretient de nombreuses collaborations :

Au plan national : Avec l’Agrocampus – Rennes, sous la forme d’accueils d’étudiants, de participations d’EMH à

la formation (cours, travaux dirigés, conférences,..), d’organisations de séminaires sur une base mensuelle (participation : essentiellement Agrocampus, EMH, Ifremer Lorient) ;

Avec l’université de La Rochelle dans le cadre de sa participation aux campagnes PELGAS (traitement des données collectées sur zooplancton, oiseaux et mammifères) ;

Avec l’IRD, notamment dans le domaine de l’acoustique et la participation à des projets (AMPHORE) ;

Au plan européen au travers de nombreuses participations à des projets de recherches ; Au plan international, notamment via le Conseil international pour l’Exploration de la Mer

(CIEM) et les participations à différents groupes de travail.

4.2. Participations à des Commissions, Comités nationaux et internationaux :Participation à des réseaux de recherche régionaux, nationaux, internationaux, pôles de compétitivité, réseaux de recherche et d’innovation, réseaux d’excellence.

RTP M3D : Réseau Thématique Pluridisciplinaire "Mathématiques et décision pour le développement durable » ; financé par le CNRS et mis en place à l’automne 2006 il a débuté en janvier 2008 ; MJ Rochet et V. Trenkel font partie des membres fondateurs. Ce réseau regroupe des chercheurs en sciences de l'univers, biologie, économie et mathématiques travaillant sur les modèles de gestion dans les domaines de l'écologie et l'environnement, des ressources naturelles, de la biodiversité et, plus généralement, du développement durable.

Site web : http://cermics.enpc.fr/~delara/RTP_CNRS_2007/RTP_CNRS_web/

EUR-OCEANS est un réseau d’excellence co-financé dans le cadre du FP6 qui se propose de contribuer à l’intégration des organisations de recherches européennes dont les travaux portent sur le changement global et les écosystèmes pélagiques. Au total, 66 organismes de recherches répartis dans 25 pays en sont membres ; trois communautés de chercheurs s’y retrouvent : celles des écosystèmes pélagiques, des biogéochimistes et de l’approche écosystèmiques des ressources.

P. Petitgas, M.J. Rochet sont impliqués au titre de « Principal investigator» (PI) sur le thème : « Ecosystem approach to marine resources ».

Une thèse et un post doc ont été financés dans le cadre de EUR-OCEANS.

Site web : http://www.eur-oceans.eu/


http://www.codelutin.com/


MarBEF est un réseau d’excellence fondé par l’Union européenne dans le cadre du FP6 qui comprend 94 Instituts européens en recherche marine. Son objectif est d’intégrer et de disséminer les connaissances et l’expertise sur la biodiversité marine, et de créer des liens entre chercheurs, industrie, clients et grand public.

La contribution EMH se fait au travers d’un projet de recherche : « Causes and consequences of changing marine biodiversity : a fish and fisheries perspective » regroupant 20 instituts de recherche, et dont P. Lorance assure la co-coordination avec un chercheur danois.

Site web : http://www.marbef.org/

AquaDEB est un groupement de recherche européen dont l’objectif est d’harmoniser les méthodes d’étude de la sensibilité de différentes espèces animales aquatiques à la variabilité environnementale d’origine naturelle ou anthropique, afin de comparer ces espèces et d’évaluer les conséquences de cette sensibilité à différentes échelles biologiques (individu, population, écosystème) et temporelles (cycle de vie, dynamique de population, évolution). Les méthodes utilisées au sein d’AquaDEB reposent le modèle des budgets d'énergie dynamique (DEB), qui permet de quantifier les échanges et les transformations d’énergie et de matière entre un être vivant et son environnement (bio-énergétique) et d’analyser la stratégie de répartition de l’énergie entre les différentes fonctions (croissance, reproduction, maintenance).

Plusieurs chercheurs du département EMH participent à ce groupement de recherche et une des espèces retenues est l’anchois.

Site web : http://www.ifremer.fr/aquadeb/

Mexico (Méthodes d'Exploration Informatique des modèles Complexes) est un réseau méthodologique regroupant des chercheurs de l'INRA, du Cemagref, de l'Ifremer, de diverses universités. Il vise à ouvrir les biologistes-modélisateurs au traitement statistique de leurs simulations et à une exploration raisonnée du comportement de leurs modèles, à initier de nouvelles recherches en statistique, à contribuer à la réflexion méthodologique en modélisation et à rendre ces méthodes accessibles aux modélisateurs. Plusieurs chercheurs EMH participent à ce réseau.

Site web :http://www.avignon.inra.fr/mexico/index.php/Accueil

4.3. Maîtrise d’une méthodologie ou d’une technique originale

Echantillonnage et observations à la mer. Mise en œuvre de moyens océanographiques lourds (navires côtiers et hauturiers) pour des campagnes de recherche propres (acoustique halieutique, chalutage, échantillonnage de plancton, hydrologie, observations visuelles et vidéo) et coordination de campagnes multidisciplinaires. Maîtrise des outils mis à disposition sur les navires de recherche de l'Ifremer (Thalassa et navires côtiers) : acoustique, outils d'échantillonnage biologique (échantillonneur en continu d'œufs de poissons (CUFES), compteur laser de particules in situ (LOPC)), etc. Le département gère en outre des équipements propres en planctonologie (filets à plancton, échantillonneur supra-benthique, filet à neuston), en hydrologie (bathysondes et carrousel pour CTD et fluorimétrie) et en ichthyologie (chaluts d'échantillonnage).

Acoustique. Sondeur portable. Logiciels Fishview et Movies+ pour l'interprétation des signaux acoustiques pour l'étude de la répartition, de l'abondance et de l'agrégation des poissons.

Biochimie. Outils de détermination de l'état nutritionnel de stades larvaire et adulte de poissons ; mesures d'activités enzymatiques sur le mésozooplancton.

Otolithométrie. Logiciel d'analyse d'image Visilog 5.0 et son extension TNPC (traitement des pièces calcifiées) pour la détermination de l'âge et des taux de croissance journaliers de larves et juvéniles de poissons (reconstitution d'histoires de vie).



5. Réponse à la demande sociétale, service rendu

5.1. Accréditation – Assurance Qualité :Le projet MEQUAPRO (MEthodologie - QUAlité - PROduits) est coordonné par S. Mahévas. Il vise à une exploitation optimale des données collectées sur les ressources et les pêcheries dans le cadre du Système d'Informations Halieutiques. Il répond à des questions concernant la qualité des données recueillies, stockées, extraites et des produits qui découlent de leur traitement. Il anime, coordonne et dans certains cas réalise les développements méthodologiques correspondants.

5.2. Questions de recherche soulevées par des «clients» :5.2.1. Prises en compte au cours de la période évaluée :5.2.2. Non encore prises en compte :

5.3. Nombre total et liste des avis et expertises rendus, des missions de soutien en interne et en externe : – à joindre en annexe –Cf. compte rendu d’activité, section 2 ; le département participe à l’élaboration de réponses à des demandes d’expertises et d’avis aux niveaux régional, national et international. Il participe également à des groupes de travail en appui à la politique commune des pêches pour l’établissement de diagnostics sur les ressources et la formulation d’avis ou la mise en place de la réglementation sur la collecte de données (Data Collection Regulation ou DCR). La liste des participations à ces groupes est donnée dans le tableau ci-dessous.

Dates Participants Groupe de travail Lieu1-5 mai 2004 Forest A. Revue technique du rapport

évaluation stocks de hareng/CIEMVigo

24 mai-4 juin 2004 Forest A. Comité d’avis sur les pêches du CIEM (ACFM/CIEM)

Copenhague

6-17 septembre 2004 Massé J. Groupe évaluation petits poissons pélagiques (WGMHMAS/CIEM)

Copenhague

13-20 mars 2005 Drouineau H. Groupe de travail évaluation merlu (WGMHM/CIEM)

Copenhague

24-28 avril 2005 Forest A. Revue technique du rapport évaluation stocks de hareng/CIEM

Vigo


Copenhague

11-14 juillet 2005 Massé J.Trenkel V.

Groupe CSTEP/UE sur évaluation stock anchois Gascogne

Bruxelles

5_16 septembre 2005 Massé J. Groupe évaluation petits poissons pélagiques (WGMHMAS/CIEM)

Vigo

24-28 octobre 2005 Massé J.Gouarant A.

Groupe comparaison des méthodes pour évaluation anchois

Vigo

3-8 octobre 2006 Dintheer C. RMC Atlantique/DCR Gijon1-3 mars 2006 Dintheer C. Groupe de planification des

échantillonnages des captures (PGCCDBS/CIEM/DCR)

25-28 mars 2006 Bertrand J. Planification campagnes scientifiques/DCR

Malte

25-30 mars 2006 Dintheer C. Planification campagnes scientifiques/DCR

Malte


Copenhague

Dates Participants Groupe de travail Lieu



6-19 mai 2006 Drouineau H. Groupe de travail évaluation merlu (WGMHM/CIEM)

Bilbao

27 novembre–1 décembre 2006

Beillois P.Massé J.

Groupe comparaison méthodes pour évaluation anchois

Lisbonne

22-27 avril 2007 Dintheer C. RMC Méditerranée/DCR Chypre7-16 mai 2007 Lorance P. Groupe d’évaluation des espèces

profondes (WGDEEP/CIEM)Copenhague


Copenhague

18-21 juin 2007 Massé J. Groupe CSTEP/UE sur évaluation stock anchois Gascogne

Ispra

3-14 septembre 2007 Massé J. Groupe évaluation petits poissons pélagiques (WGMHMAS/CIEM)

Copenhague

23-26 novembre 2007 Beillois P. Groupe comparaison méthodes pour évaluation anchois

Palma de Majorque

23-30 novembre 2007 Massé J. Groupe comparaison méthodes pour évaluation anchois

Palma de Majorque

5.4. Rapports et ouvrages scientifiques et techniques dont CD-Rom visant à la diffusion des résultats auprès des utilisateurs :(Nombre total de rapports, nombre total d’ouvrages, citer les principaux : 10 au maximum).Participation à la mise au point et à la réalisation du « bulletin des campagnes scientifiques » qui vise a rendre compte de l’état et de l’évolution des écosystèmes des plateaux du sud de la mer du Nord aux côtes orientales de la Corse à partir d’indicateurs basés sur les campagnes d’observation halieutique pilotées par l’Ifremer. Le bulletin s’appuie sur les résultats des recherches et les outils informatiques développés à EMH. Il a fait l’objet d’une enquête de satisfaction auprès des destinataires (DPMA, organisations professionnelles, administrations, etc.) en vue de son amélioration. Un site web a été créé pour présenter les résulats.

Référence du bulletin : SIH-C, 2007. Poissons et incertébrés au large des côtes de France. Indicateurs issus des pêches scientifiques. Bilan 2004. Ifremer Nantes, EMH : 07-001, 84 p.

5.5. Rapports et ouvrages scientifiques et techniques dont CD-Rom, émissions télévisuelles, films, expositions visant à la diffusion des résultats auprès du public :

5.6. Constitution de sites web pour diffusion électronique de résultats :Sites créés par EMH :

Site EMH : le département EMH à crée son propre site sur lequel sont disponibles diverses informations sur la composition de l’équipe, la liste des publications, etc.

http://www.ifremer.fr/emh/

ISIS-Fish est un modèle de simulation spatial et saisonnier qui décrit la dynamique des ressources, de l’exploitation et de la gestion. Il a été développé à EMH pour explorer les conséquences d’un ensemble de mesures de gestion sur la dynamique des pêcheries. Il permet de comparer les impacts respectifs de mesures de gestion conventionnelles comme les Totaux Autorisés de Capture (TAC), des contrôles sur l’effort de pêche, des mesures techniques sur les engins et des mesures de gestion spatialisées (Aires marines protégées,…). La description du modèle, la documentation correspondante et le logiciel lui-même sont en libre accès à l’adresse suivante :

http://www.ifremer.fr/isis-fish/index.htmlIndices de populations issus des campagnes de surveillance halieutique de l’Ifremer : Ce site créé par EMH présente des indices de populations calculés à partir des données du réseau de campagnes de surveillance


http://www.ifremer.fr/isis-fish/index.html

http://www.ifremer.fr/emh/


halieutiques opérées par l’Ifremer (cf. ci-dessus, point 5.4). Il contient des informations relatives à 15 séries de campagnes et propose 8 indices pour et reposant sur l’abondance, le poids moyen individuel, la distribution des longueurs.

http://www.ifremer.fr/SIH-indices-campagnes/

Projet FISBOAT : (Fishery independent survey based operational assessment tools) : ce projet de recherche supporté par l’Union européenne (FP6) et coordonné par P. Petitgas, a pour objectif de développer des outils utilisant les résultats de campagnes de recherche pour l’évaluation de stocks indépendamment des données provenant des flottilles de pêche commerciales et évaluer les capacités de ces outils à quantifier les effets de mesures de gestion. Le site met à disposition les différents rapports et documents de travail, une bibliographie sur le sujets, mais aussi des outils permettant le calculs de différents indicateurs (code R), des manuels, etc.

http://w3.ifremer.fr/drvecohal/fisboat/index.htm

Campagne PelGas : la campagne PelGas est une pateforme d’observatio de l’ensemble de l’écosystème du golfe de Gascogne (hydrologie, plancton, œufs et larves, poissons, oiseaux et mamifères marin). Un site web heberge toutes les données de la série des campagnes. Son accès est réservé aux participants aux campagnes.

Contribution à des sites web

Système d’information Halieutique (SIH) : le projet SIH constitue le réseau pérenne d’observation des ressources halieutiques et des usages associés. Au travers du projet MEQUAPRO (MEthodologie - QUAlité - PROduits), EMH a participé à la mise en œuvre de la démarche qualité du SIH : spécifications techniques pour les plans d’échantillonnage, la collecte, le stockage, l’accès aux données halieutiques, les restitutions internes et externes, ainsi qu’à l’élaboration d’indicateurs intégrés sur les pêcheries, la réalisation de synthèses à destination des acteurs de la filière pêche et du grand public. Ces documents sont disponibles sur le site du projet SIH :

http://w3.ifremer.fr/isih/affichagePageStatique.do?page=accueil.htm

Le projet MEQUAPRO a également développé son propre site intranet.

6. Formations données et reçues

6.1. Activités de formation : encadrement de stages, cours dispensés, etc. :(S’appuyer sur l’annexe 9, rappeler le nombre total d’encadrements par année de la période concernée et insérer ici l’annexe 12 complétée).Au total, 38 stagiaires ont été accueillis au département au cours de la période 2004-2007, soit environ 9 par an ; le nombre d’accueils est strictement limité par le montant des indemintés qui sont accordées chaque année à EMH pour rémunèrer les stagiaires.

L’annexe 12 fournit la liste des formations dispensées par les membres du département.

6.2. Liste des formations non « diplômantes » suivies par les membres des équipes :(Insérer dans ce chapitre l’Annexe 13 complétée).Voir annexe 13

6.3 Formations « diplômantes » suivies - titres et Diplômes obtenus :(Préciser licences, Masters ou équivalents, Thèses et HDR, titres d’Ingénieurs et de Techniciens etc. obtenus par le personnel Ifremer pendant la période d’évaluation).


http://w3.ifremer.fr/isih/affichagePageStatique.do?page=accueil.htm

http://w3.ifremer.fr/drvecohal/fisboat/index.htm

http://www.ifremer.fr/SIH-indices-campagnes/


Nom Prénom Année Diplôme UniversitéROCHET Marie Joelle 2004 HDR Claude Bernard/LyonTRENKEL Véréna 2006 HDR Montpellier IILORANCE Pascal 2007 Doctorat Bretagne Sud

7. Prospectives à 4 ans(A rédiger en relation avec les différents Responsables de Thèmes concernés)Cette réflexion s’appuie sur les exercices de prospective menés au sein des programmes de l’Ifremer auquel a contribué le département, et en particulier sur la prospective du programme Démarche écosystémique pour une gestion intégrée des ressources halieutiques (Demostem, thème IV) pour l'orientation de la recherche halieutique à l'Ifremer2 ainsi que sur les documents relatifs à la gestion prévisionnelle des emplois et des compétences (GPEC). Elle a été menée, notamment pour ce qui concerne l’évolution des moyens, en concertation avec le responsable du thème 4. Elle ne préjuge pas des résultats des réflexions stratégiques en cours et des évolutions possibles en matière de recherche halieutique à l’échelle de l’Institut.

7.1. Politique scientifique et technologique des unités et services ; argumentation des axes scientifiques et technologiques majeurs proposés (5 à 10 pages).

7.1.1 Des priorités pour la recherche halieutiqueLe secteur de la pêche est face au défi de sa viabilité à long terme dans un con,texte parqué par de profondes mutations (pleine exploitation ou surexploitation des ressources majeurs, croissance de la demande pour l’alimentation humaine, dégradation des milieux, effets du changement climatique, augmentation du coût du carburant, enjeux patrimoniaux, etc.). L’acuité du problème de l’usage durable des richesses de l’océan a incité à la mise en place d’une gouvernance élaborée et exercée dans un cadre multilatéral, en particulier sous l’égide des Nations Unies. Ainsi, différentes échéances jalonneront la décennie à venir : réduction du rythme d’appauvrissement de la biodiversité (2010), application de l’approche écosystèmique (2010), mise en place d’un réseau d’aires marines protégées (2012), restauration des stocks au niveau permettant d’obtenir un rendement maximal soutenable (2015). La recherche et l’expertise halieutique se trouve ainsi confrontée à des questions dont la nature se complexifie.

La réflexion prospective du programme Demostem rappelle (Ifremer 2006) que « l’émergence de l’AEP infléchit l’identification des priorités en faveur d’investigations intégrées et pluridisciplinaires, notamment pour les raisons suivantes :

l’objet d’étude est la viabilité d’un système complexe (c’est-à-dire englobant les dimensions biologique, écologique, économique et sociale des pêcheries),

il est attendu des expertises halieutiques qu’elles apportent les diagnostics et critères qui permettent une gestion ciblée et pluriannuelle des pêcheries, en s’appuyant sur un « découpage » de l’espace marin en entités soumises à des régimes d’accès spécifiques,

enfin, pour suppléer le caractère non réaliste des prévisions à long terme, les systèmes d’observation et d’information doivent conjointement évoluer vers la production en temps quasi-réel de « tableaux de bord » d’indicateurs (biologiques, économiques, ...) pour l’aide à la décision publique. »

Pour répondre aux besoins de l’approche écosystémique des pêches, des progrès de la connaissance sont attendus dans cinq grands domainesError: Reference source not found :

Dynamique des systèmes d’exploitation halieutique dans différents contextes écologiques, économiques et institutionnels ;

Systèmes de gouvernance des pêches, leur fonctionnement et leurs performances ;

2 Fromentin J.M., B. Planque & O. Thébaud, 2006. Prospective scientifique du programme DEMOSTEM. Ifremer. 27 p.

Ifremer, 2006. L’Approche Écosystémique des Pêches (AEP) : quelles priorités pour la recherche ? Ifremer, Dossier de presse. 10 p.



Dynamiques des populations ciblées par la pêche en réponse aux forçages d’origines anthropique et naturelle ;

Dynamique des écosystèmes marins : leurs réponses à l’exploitation et aux autres perturbations ; conséquences sociétales de leurs évolutions

Développement d’outils innovants (expérimentations en milieu contrôlé, marqueurs individuels naturels, modélisations statistique et dynamique, analyse de risque, indicateurs populationnels, écosystémiques et de performances pour le diagnostic et l'aide à la gestion).

7.1.2. Positionnement du Département EMHDans le champ multidisciplinaire de l’Approche Ecosystèmique des Pêches (AEP), le département s’inscrit dans trois thématiques sur lequel il poursuit une ambition d’excellence européenne et internationale: l’écologie halieutique, la modélisation pour l’halieutique et l’observation halieutique. Son activité dans ces domaines est positionnée explicitement selon trois registres complémentaires : la recherche, l’expertise et l’animation scientifique, les deux derniers découlant du premier.

Les trois thématiques du département :Les trois thématiques portées par le département contribuent à quatre des cinq domaines pour lesquels des progrès de connaissance sont attendus dans le cadre de l’AEP (fig. 1) : les populations exploitées, les écosystèmes, les outils et la dynamique de l’exploitation, avec des efforts particuliers vers les trois premiers domaines.

Thématique EMH

Ecologie

Modélisation

Observation

Domaine AEP

Populations

Ecosystèmes

Exploitation

Outils

Gouvernance

Figure 1. Contribution actuelle du département EMH aux cinq domaines de connaissances requis pour le développement de l’AEP.

En écologie halieutique, l’objectif est de caractériser et comprendre le fonctionnement des écosystèmes d’intérêt halieutique, d’en inférer sur les caractéristiques des habitats essentiels et de fournir ainsi des bases en vue du développement d’une gestion spatialisée des ressources et des usages. Les modèles de systèmes sélectionnés doivent répondre aux attentes du questionnement scientifique. Ils doivent être conservés sur une durée suffisamment longue pour permettre d’en appréhender les dynamiques temporelles. Dans un institut de recherche finalisée, ils doivent aussi permettre d’obtenir des résultats utiles à la gestion. Deux types de systèmes sont ainsi considérés en priorité par le département : le domaine pélagique de Gascogne (modèle anchois) et les nourriceries côtières (modèle sole).

En modélisation pour l’halieutique, l'objectif est de développer une capacité à établir des diagnostics sur l'état des ressources et des écosystèmes exploités, et à fournir des avis quant aux implications à court ou moyen terme de telle ou telle option de gestion. Le département contribue au développement et au bon usage des méthodes d'analyse des données et des modèles mathématiques essentiels à l'halieutique.

Les méthodes sont utilisés dans des approches mécanistes et statistiques pour (i) décrire les populations, les peuplements, les écosystèmes marins, les activités de pêche et leurs interactions y compris avec les habitats, (ii) comprendre et interpréter leur dynamique, (iii) fournir de nouveaux outils scientifiques utiles à la gestion des pêches dans une perspective écosystémique, notamment des indicateurs à intégrer dans des tableaux de bord.



Pour soutenir ses travaux, le département est amené à développer des outils d’analyse et de simulation dédiés (e.g. le logiciel de simulation de pêcherie ISIS-Fish, le logiciel d’aide à l’évaluation combinant acoustique et chalutage Barracuda, une méthode de couplage physique - biologie pour l’évaluation des forçages environnementaux sur la dynamique des populations). Ces outils ont vocation à répondre aux besoins des recherches développées dans le département, y compris au travers de collaborations3, ainsi que dans certains cas aux besoins opérationnels.

L’observation halieutique se trouve à l’orée de profonds changements tant par l’évolution des attentes suscitées par les perspectives de l’approche écosystémique des pêches (de l’évaluation des ressources exploitées vers une évaluation des écosystèmes exploités) dans un cadre européen de plus en plus formalisé (notamment dans la DCR 4, et plus généralement à travers la stratégie marine pour l’environnement) qu’en raison de l’évolution des outils d’observation eux-mêmes (e.g. sondeur multifaisceaux halieutique). Le département est fortement impliqué dans la démarche d’observation halieutique à l’institut, que ce soit sur le plan méthodologique (expertise fondée sur ses compétences en statistiques et en modélisation), sur le plan des outils (par son expérience de mise en œuvre d’une grande diversité d’engins, de l’acoustique aux échantillonneurs de la macro- et de la microfaune, en passant par les méthodes visuelles et vidéo), sur le plan biologique (analyses biologiques, alpha-taxinomie) ou en mettant lui-même en œuvre des campagnes de surveillance halieutique (PelGas, IGA - volet halieutique). Le maintien d’une capacité d’observation apparaît indispensable dans un département d’écologie. Elle nécessite des compétences spécifiques, voire des compétences très spécialisées pour la mise en œuvre de certains outils et moyens d’investigation.

Les métiers du département

La recherche : l’activité de recherche constitue le cœur des métiers du département. Elle est fortement structurée en réseaux à travers des projets européens et des projets nationaux (ANR, etc.). Un certain nombre de ces projets sont arrivés à leur terme en 2007 (Fisboat, Because), d’autres seront poursuivis (DCR, Efimas, Eur-Oceans, Pêcheries côtières PDDL, Protect, etc.). De nouveaux projets émergent (Cafe, Chaloupe, Image, Reclaim, Uncover, Aframe, etc.). Cette dynamique est soutenue par une participation significative à des forums scientifiques nationaux et internationaux (conférence annuelle du Conseil international pour l’Exploration de la Mer, colloques spécialisés, etc.). Dans le prolongement de cette activité, le département entretient une contribution à la formation par la recherche (accueil de stagiaires, doctorants et post-doctorants, incitation à l’acquisition d’HDR).

L’expertise scientifique : celle du département concerne aussi bien des domaines appliqués, comme les diagnostics sur les populations exploitées ou l’impact des extractions de granulats sur les habitats halieutiques, que des domaines méthodologiques (e.g. en application à la DCR). Par son expertise, le département peut aussi contribuer à l’orientation des stratégies européennes. Par construction, cette expertise s’exerce dans les domaines sur lesquels le département développe des actions de recherche. Il apparaît donc important de contenir l’implication du département dans l’expertise et la surveillance halieutique de façon à préserver sa dynamique d’innovation et de valorisation scientifique.

L’animation scientifique : lors de sa création, les équipes constitutives du département ont opté pour un engagement multiforme dans les réseaux de recherche. Ainsi, le département assume la coordination d’une grande diversité de projets et d’actions de l’Ifremer5, dans le thème IV et plus modestement dans le thème II, associant des scientifiques de différents laboratoires de l’institut. Il convient de noter que cette animation scientifique, notamment à travers des ateliers, s’est d’une certaine façon substituée à la fonction de soutien méthodologique qu’exerçait l’ex-laboratoire Maerha auprès des autres laboratoires halieutiques.

Au niveau national et au niveau européen, des chercheurs du département assument différentes actions d’animation scientifique (coordination de projets nationaux et européens, mandats dans des instances du Ciem, etc.). Des rapprochements plus formels avec d’autres structures ont été réalisés (réseau thématique du CNRS) ou en sont à

3 En particulier, le département ne prévoit pas s’orienter vers la maintenance d’outils au bénéfice d’une communauté scientifique élargie, une fois que ces outils sont opérationnels.

4 Data collection regulation

5 Animation de quatre projets et trente actions du thème IV, et trois actions du thème II.



une phase de contacts (avec Agrocampus Rennes). D’autre part, dans le prolongement de l’incitation de ses chercheurs à l’obtention d’HDR, le département s’est engagé dans l’école doctorale « Vie Agronomie Santé » de Rennes.

7.2. Résumé des moyens supplémentaires (équipements lourds) sollicités en liaison avec les argumentaires ci-dessus.

7.3. Politique de ressources humaines au sein l’Unité (les priorités argumentées en besoin quantitatif et qualitatif).

Les compétences actuelles à EMH

En référence à la nomenclature des emplois à l'Ifremer, les compétences actuelles du département sont regroupées selon deux disciplines : les sciences de la vie (78 % de l'effectif) et les mathématiques appliquées (18 % de l'effectif).

Sans prétendre enfermer chacun dans un champ de spécialité étroit, l'identification des contributions aux différentes spécialités (d'après la base d'information de la DRH) fournit une indication sur les grandes caractéristiques des profils de compétence actuellement existants. Ainsi, chez les cadres, les spécialités en sciences de la vie concernent principalement la biologie des populations et l'écologie, incluant une forte composante en halieutique (tabl. 1). Dans la discipline des mathématiques appliquées (4 cadres), les spécialités portent sur les bio-mathématiques (3 cadres), la modélisation et les statistiques.

Les compétences du personnel technique se réfèrent en majorité aux sciences de la vie (4/5), incluant des spécialités en biologie des populations, en acoustique appliquée, en instrumentation et en gestion de données. Un technicien relève de la discipline informatique (spécialités informatique système et informatique de réseau).

Tableau 1. Spécialités des cadres dans la discipline des sciences de la vie (d'après la base d'information de la DRH).

Libellé Spécialité 1 Spécialité 2Acoustique appliquée 1Biochimie 1Biologie des organismes 1Biologie des populations et écologie 7 2Biomathématiques 3 2Environnement 1Halieutique 2 4Mathématiques appliquées 2Modélisation 2Océanographie 1Statistiques 1 1Taxonomie 1Zoologie 1

La pyramide des âges des cadres du département est typiquement bi modale, avec un mode légèrement supérieur à 55 ans, l'autre près de 40 ans (fig. 1). Les spécialités sont diversement représentées selon les âges. Ainsi, les spécialités de la discipline des mathématiques sont portées par les chercheurs les plus jeunes, alors que les chercheurs les plus âgés sont majoritairement spécialisés en biologie des populations et écologie (fig. 2). Il convient également de noter qu’une part importante des compétences du département en modélisation de la dynamique de populations directement appliquée à l’expertise halieutique est portée par des chercheurs appelés à se retirer à relativement court terme.



30-34 35-39 40-44 45-49 50-54 55-59

C

TA

0

1

2

3

4

5

6

7

8

Effe

ctif

Age

Figure 1. Pyramide des âges à EMH

30-3

4

35-3

9

40-4

4

45-4

9

50-5

4

55-5

9

Biologie des populations et écologieHalieutiqueAcoustique appliquéeBiochimie

Biologie des organismesZoologie

OcéanographieEnvironnement

TaxonomieMathématiques appliquées

ModélisationStatistiques

Biomathématiques

0

1

2

3

4

Effe

ctif

Age

Figure 2. Répartition des spécialités (spécialités 1 et 2) des cadres du département selon les classes d'âge.

Cinq départs sont prévus en 2007 et 2008, quatre pour fin de carrière et un pour changement d'activité. Tous les cinq concernent des cadres exerçant dans la discipline des sciences de la vie : écologie halieutique (appliquée aux systèmes côtiers et aux systèmes démersaux des plateaux), ichthyoplancton, taxinomie.

Deux nouveaux postes de chercheurs ont été créés au département en 2006. L’un relève d’une double compétence en physique et en biologie (couplage modélisation physique et écologie), l’autre présente une compétence en écologie des populations et des peuplements marins (centré sur l’analyse des réponses des populations et des communautés aux forçages anthropiques et environnementaux). Le second poste représente une première étape de reconstitution de compétences dans le département dans le domaine de l’écologie halieutique côtière pour lequel la demande s’avère de plus en plus pressante, tant au niveau national qu'européen (DCE, etc.). Il doit ainsi permettre



de préserver le potentiel de développement d'actions de recherche originales et d’expertise basées sur des connaissances rassemblées dans le département pendant plusieurs décennies.

7.1.3. Les compétences à privilégier à EMH dans le dispositif IfremerLe département a proposé de maintenir et développer des capacités de recherche dans les domaines disciplinaires suivants, tous étant tournés vers des applications concernant le questionnement halieutique : biologie et écologie des populations, océanographie biologique, biocénotique, modélisation dynamique, statistiques, biologie descriptive (zoologie, taxinomie, etc.), acoustique halieutique. Pour répondre à l’objectif exprimé ci-dessus et compte tenu des principaux départs d’ores et déjà intervenus ou attendus à court terme, les axes suivants ont fait l’objet d’une attention particulière..

Des compétences à renforcer :Les propositions ci-dessous tiennent compte des compétences actuelles du département et de leurs principales évolutions attendues à court terme. Certaines ont été retenues par la GPEC 2007-2010 et ont fait l’objet de propositions de postes, d’autres bien que non identifiés dans le cadre contraint de la GPEC n’en constituent pas moins des orientation que le département EMH considère comme importantes.

Comportement des poissons dans les systèmes pélagiquesL’installation du SMFH à bord du NRH Thalassa ouvre de nouvelles perspectives d’étude des structures biologiques, notamment des petits pélagiques à partir des écho-traces acquises par différents faisceaux et fréquences. Il s’agira de conjuguer les questions sur la biologie et le comportement avec les développements méthodologiques permis par des moyens d’observation innovants. L’activité de recherche afférentes inclut le protocole d’acquisition in situ des données, (Pelgas, etc.), l’interprétation des écho-traces en fonction des caractéristiques de l’antenne SMFH, la contribution aux spécifications d’un logiciel d’analyses des données du SMFH (Movies 3D SMFH), qui sera utilisé pour la caractérisation quantitative et qualitative des populations de poisson, par exemple pour la caractérisation des petits bancs, les indices d’agrégation 3D, les indices d'échappement, les images 3D multi-fréquences. In fine, l’enjeu est l’acquisition de connaissances sur l’organisation spatiale des poissons, la mise au point de méthodes d’identification des peuplements repérés par acoustique, le développement d’indices de qualité des évaluations et d’indicateurs de l’état des populations régulièrement échantillonnées.

Dans le cadre de la GPEC, il a ainsi été identifié la nécessité de recrutement d’un chercheur en modélisation de l’organisation spatiale des bancs de poissons et leur caractérisation qualitative et quantitative à l’aide des fonctionnalités du SMFH.

Interactions ressources halieutiques et habitats benthiquesL'approche écosystémique des pêches nécessite d’étendre à la dynamique de leur environnement les recherches consacrées à la biologie des populations exploitées par la pêche. de prendre en considération une plus grande partie des écosystèmes au delà des seuls poissons exploités par la pêche. Si on considère les stocks benthiques et démersaux, la connaissance et la compréhension des processus à l’œuvre dans le domaine benthique doivent être approfondies, notamment les interactions trophiques entre espèces non exploitées et espèces cibles, ou encore l’identification des milieux (et la caractérisation de leurs propriétés) indispensables au succès des étapes de leurs cycles biologiques.

L’enjeu est de renforcer la capacité de recherche sur les relations entre la production benthique et la production halieutique, et sur les impacts directs et indirects de la pêche sur les écosystèmes benthiques. La finalité est la pertinence des réponses concrètes aux engagements su SMDD 2002, en particulier le ralentissement des pertes de biodiversité (2010), et la mise en place d’un réseau d’aires marines protégées (2012). Les domaines à considérer en priorité sont les écosystèmes des plateaux continentaux et les habitats originaux et mal connus situés au-delà des accores.

Le renforcement des compétences du département dans ce domaine est prévu dans la GPEC par le recrutement d’un chercheur qui développera des projets de recherche sur les interactions ressources halieutiques et habitats benthiques, dont les habitats essentiels du plateau continental, de la pente et du talus.



Analyse et modélisation de l’activité de pêcheEn complément de la mobilisation de compétences sur l’étude des relations ressources-environnement, il est nécessaire de développer la capacité d’action du département sur la relation écosystème-exploitation. L’objectif est de renforcer le potentiel de recherche sur les usages des « biens et services écosystèmiques », spécialement l’exploitation de leur production biologique par la pêche. Le champ d’investigation est l’ensemble des types de pêche, aussi bien ceux pratiqués dans les systèmes côtiers que dans les systèmes hauturiers.

Avec l’échéance proche (2012) de la mise en place d’un « réseau significatif d’aires marines protégées » (AMP) dans la ZEE communautaire et au-delà, les organismes en charge de la recherche halieutique doivent se doter des méthodes et moyens de définir quels « fragments d’écosystèmes » devront, dans un but de conservation des ressources vivantes et de la biodiversité, faire l’objet de restriction d’accès vis-à-vis de l’activité de pêche. Outre la capacité à produire des indicateurs et des synthèses utiles à l’autorité publique, ces mêmes organismes devront aussi posséder la capacité à évaluer les conséquences de décision de mise en place d’AMP, tant au plan biologique qu’au plan économique (articulation nécessaire avec les économistes du Département d’Economie Maritime).

Le recrutement d’un chercheur spécialisé dans la modélisation de la dynamique spatiale du système ressources – flottilles, avec application pour l’aide aux décisions de gestion (en particulier la définition d’AMP) a été retenu par la GPEC. Les scénarios d’évolution pourront être simulés notamment à l’aide du logiciel ISI-FISH développé par le département.

Observations et relevés à la mer, analyses de laboratoireLa conduite d’observations et de relevés à la mer constitue une activité indispensable dans une unité d’écologie halieutique. Elle englobe la collecte, l’analyse et la gestion d’information de nature variée (biologique, physico-chimiques, sédimentologiques, etc.) ainsi que le pré-traitement des données. Il s’agit de maintenir une force opérationnelle à hauteur des atouts que représentent les capacités d’observation de l’Ifremer (campagnes du réseau de surveillance halieutique et campagnes spécifiques, qui alimentent la base de données « Harmonie » du système d’Information Halieutique (SIH). Compte tenu de l’essor des méthodes d’observation indirectes, de la sophistication et du potentiel des nouveaux moyens d’investigation (cf. SMFH), une attention particulière devra être portée aux compétences en recueil et analyse des données acoustiques.

Un poste de « technicien acoustique » a ainsi été retenu dans le cadre de la GPEC.

Ecologie et modélisation des réseaux trophiquesDans tous les systèmes exploités par la pêche, le fonctionnement des réseaux trophiques constitue un processus clé de la dynamique des populations. Pour appréhender ce compartiment, il s’avère nécessaire de développer les capacités de couplage entre les fonctions biologiques de croissance et de reproduction à l’échelle de l’individu et de la population avec les maillons trophiques de l’écosystème. Il s’agit de développer des modèles permettant de prédire les réponses biologiques au changement climatique ainsi que les changements d’habitats potentiels et utiles.

Modélisation dynamique des relations environnement-ressourcesLes forçages climatiques écosystémiques et halieutiques modulent la réponse fonctionnelle des poissons (reproduction et croissance). Une modélisation dynamique du poisson est nécessaire pour la prévision de ces réponses. Il s’agira de développer des modèles du poisson permettant le couplage de ses fonctions biologiques (croissance et reproduction) avec la physique et les maillons trophiques inférieurs.

Ecologie larvaireAlors que les variations environnementales (climat, habitats, etc.) peuvent avoir un effet déterminant sur les stades jeunes (œufs et larves) et conditionner la viabilité des populations d'intérêt halieutique, ces processus sont très peu étudiés à l'Ifremer (à part le cas notable de l'anchois). L'objectif est de renforcer les compétences dans ce domaine. L’objectif est d’analyser les relations entre distribution et production des populations halieutiques et les conditions environnementales, d’estimer l'impact des changements.



Ecologie et modélisation du comportementLes poissons manifestent une capacité à apprendre, mémoriser et faire des choix. Une modélisation dynamique du couplage entre les poissons et leur environnement requiert de mieux comprendre et modéliser ces comportements spatiaux conférant un avantage sélectif, aux échelles de l'individu et du cycle de vie. Mission: Etudier et modéliser la part de comportement influençant les dérives larvaires, le choix des habitats et l'organisation spatiale des cycles de vie.

Capacité d’observation à la merObservations et relevés en mer constituent une activité indispensable en écologie halieutique. Il s'agit d'adapter la capacité opérationnelle du département aux nouveaux besoins, en particulier associés aux campagnes à la mer. Des personnels techniques (2) doivent venir renforcer les capacités du département pour la réalisation d’observations et de relevés à la mer, l’analyse et le traitement des données et des échantillons biologiques, notamment en soutien aux chercheur impliqués dans des projets sur les réseaux trophiques et l’écologie larvaire

Des compétences en recul

Ichthyoplanctonologie halieutiqueLe département EMH6 dispose d’une très longue expérience (plusieurs décennies) en ichthyoplanctonologie. Face aux départs de deux cadres d’EMH spécialistes dans ce domaine et à la perspective de création d’un pôle ‘Zooplancton’ à Boulogne-sur-mer, il est proposé de recentrer ces compétences dans le département EMH. Compte tenu de l’importance de ce compartiment pour la compréhension du fonctionnement des écosystèmes pélagiques, les recherches menées par le département dans ce domaine devront plus fortement s’appuyer sur des collaborations externes (futur pôle Zooplancton, mais aussi partenariats avec d’autres institutions, comme celui déjà engagé avec l’université de La Rochelle). Une compétence thématique sur ce compartiment ainsi qu’une capacité à développer des indices individuels devra toutefois être maintenue pour assurer le lien avec les partenaires.

Ce choix impliquera également l’arrêt progressif de l’activité correspondante menée par EMH pour le projet IGA.

Analyse biochimiqueL’importance de disposer d’indices individuels de condition pour caractériser le fonctionnement des écosystèmes pélagiques n’est plus à démontrer. Le département a acquis une compétence unique dans la mise au point d’indices d’état nutritionnel pour les larves et pour les adultes de poissons (ADN/C pour les larves, ARN/ADN pour les adultes) et d’indices descripteurs du fonctionnement de l’environnement biotique au travers du métabolisme du mésozooplancton (ATC, PK, Trypsine). Toutefois, celle-ci repose sur un seul chercheur.

Depuis le départ de la technicienne chargée de ces analyses, le département a pris le parti de faire réaliser à l’extérieur les mesures d’activité de l’aspartate transcarbamylase (ATC). En revanche, le département considère nécessaire de préserver une capacité à réaliser a minima des indices individuels.

6 Par les ex laboratoires ‘Œufs, larves, juvéniles’ et ‘Ecologie halieutique’.



Production scientifique et technologique

Liste des travaux du laboratoire Ecohal diffusés en 2004

A - Bergeron J.-P., 2004. Contrasting years in the Gironde estuary (Bay of Biscay, NE Atlantic) springtime outflow and consequences for zooplankton pyruvate kinase activity and the nutritional condition of anchovy larvae: an early view. ICES J. Mar. Sci. 61: 928-932.

A - Budzinski H., O. Mazéas, J. Tronczynski, Y. Désaunay, G. Bocquené & G. Claireaux, 2004. Link between exposure of fish (Solea solea) to PAHs and metabolites : Application to the "Erika" oil spill. Aquat. Living Resour. 17: 329-334.

A - Claireaux G., Y. Désaunay, F. Akcha, B. Aupérin, G. Bocquené, H. Budzinski, J.-P. Cravedi, F. Davoodi, R. Galois, C. Gilliers, C. Goanvec, D. Guérault, N. Imbert, O. Mazéas, G. Nonnotte, P. Prunet, P. Sébert & A. Vettier, 2004. Influence of oil exposure on the physiology and ecology of the common sole Solea solea: Experimental and field approaches. Aquat. Living Resour. 17: 335-351.

A - Gilliers C., R. Amara, J.-P. Bergeron & O. Le Pape, 2004a. Comparison of growth and condition indices of juvenile flatfish in different coastal nursery grounds. Environmental Biology of Fishes 71: 189-198.

A - Le Pape O., D. Guérault & Y. Désaunay, 2004. Effect of an invasive mollusc, American slipper limpet Crepidula fornicata, on habitat suitability for juvenile common sole Solea solea in the Bay of Biscay. Marine Ecology Progress Series 277: 107-115.

A - Planque B., P. Lazure & A.M. Jégou, 2004a. Detecting hydrological landscapes over the Bay of Biscay continental shelf in spring. Climate Research 28: 41-52.

A - Planque B., P. Lazure & A.-M. Jégou, in press. Typology of hydrological structures modelled and observed over the Bay of Biscay shelf. Scientia Marina.

A - Planque B., P. Lazure & A.M. Jégou, soumis. Typology of hydrological structures modelled and observed in the Bay of Biscay. Oceanol. Acta XXX: 000-000.

A - Poulard J.-C., F. Blanchard, J. Boucher & S. Souissi, accepté. Variability in the demersal fish assemblages of Bay of Biscay during the 1990s. ICES J. Mar. Sci.

A - Segond M., S. Mahler, D. Robilliard, C. Fonlupt, B. Planque & P. Lazure, 2004. An Algorithm for Detection of Retentive Structures in Coastal Waters. Proceedings of Artificial Evolution Conference 2003, LNCS (Lecture Notes in Computer Sciences), Springer Verlag 2936: 166-176.

A - Woehrling D., A. Lefebvre, G. Le Fèvre-Lehoërff & R. Delesmont, 2005. Seasonal and longer term trends in sea temperature along the French North Sea coast, 1975 to 2002. J. Mar. Biol. Assoc. U.K. 85 (4769): 1-10.

C - Pershing A.J., C.H. Green, B. Planque & J.M. Fromentin, 2004. The influence of climate variability on North Atlantic zooplankton populations. In Marine ecosystems and climate variations. N.C. Stenseth, G. Ottersen, J.W. Hurrell & A. Belgrano eds. Oxford University Press: Ind.

D - Bellier E., B. Planque & P. Petitgas, 2004. Historical fluctuations of spawning area of anchovy (Engraulis encrasicolus) and sardine (Sardina pilchardus) in the Bay of Biscay from 1967 to 2004. ICES CM Q (01): 21 + annexes.

D - Chen C.-S., G.J. Pierce, J. Wang, J.-P. Robin, J.-C. Poulard, J. Pereira, A.F. Zuur, P.R. Boyle, N. Bailley, D.J. Beare, I. Sobrino & L. Orsi Relini, 2004. The apparent disappearance of Loligo forbesi from the south of its range in the 1990s: trends in Loligo spp. abundance in the Northeast Atlantic. ICES CM 34: 24.

D - Planque B., E. Bellier & P. Lazure, 2004b. Potential spawning habitat of sardine (Sardina pilchardus) and anchovy (Engraulis encrasicolus) in the Bay of Biscay. ICES CM Q (02): 27.

D - Poulard J.-C. & J.-C. Mahé, 2004. Structure and spatial distribution of fish assemblages in the Celtic sea. Working Paper to 2004 ICES Working Group IBTS. 14 p.

E - Gilliers C., O. Le Pape, R. Amara, J. Morin & Y. Désaunay, 2004b. Les estuaires fortement contaminés: des nourriceries de poissons aux performances écologiques médiocres. In Bulletin R.N.O. Surveillance du Milieu Marin. Travaux du Résau National d'Observation de la qualité du milieu marin. Edition 2004. 1974 - 2004, 30 ans de surveillance du milieu marin. Ifremer: 19-31.

F - Désaunay Y., 2004a. Conséquences écologiques et écotoxicologiques de la marée noire "Erika". Projet n° 9 ECTOPHY-nourriceries. Rapport n° 4. Ifremer, Nantes. Rapport d'Etat d'avancement des travaux pour l'année 2003. Programme de suivi des conséquences écologiques et écotoxicologiques de la marée noire "ERIKA". R. Int. DRV/Ecohal. 37 p.

I - Berthou P., J. Bertrand, J. Boucher, F. Théret, J.L. Vallet, A.-M. Alayse & B. Planque, 2004. Ressources halieutiques, exploitation durable et valorisation. Rapport du groupe de prospective thématique. 18 mars 2004. Ifremer. 35 p.



I - Bertrand J.A., F. Coppin, O. Le Pape, J. Morin, J.-C. Poulard, M.-J. Rochet, I. Schlaich, V. Trenkel & Y. Vérin, 2004. L'état des communautés exploitées au large des côtes de France. Application d'indicateurs à l'évaluation de l'impact de la pêche. Ifremer. Ifremer/DRV/RH/RS/04-001. 170 p.

I - Delesmont R., J.M. Dewarumez, B. Hitier, G. Le Fèvre-Lehoërff, A. Lefèbvre, C. Luczak & D. Woehrling, en cours. Surveillance écologique et halieutique. Site de Gravelines. Novembre 2001 - Octobre 2002. Ifremer, Brest. Rapport scientifique et technique. DEL/BL/03.X. 170 p.

I - Drévès L., L. Lampert, J. Martin, C. Abernot Le Gac, J.D. Gaffet, M. Rumebe & I. Schlaich, 2004. Surveillance écologique et halieutique du site électronucléaire de Flamanville, année 2003. Ifremer, Plouzané. RST-DEL/SR/04.04. 176 p.

I - Halgand D., M.-L. Cochard, L. Dorobisz, J. Huet, P. Monbet, M. Rumèbe & H. Thillaye du Boullay, 2004. Surveillance écologique et halieutique de l'environnement marin du site de la centrale de Penly (Manche est) : année 2003. Ifremer, Nantes. Rapport définitif. DRV/RH/DT/04-01. 150 p.

I - Woehrling D., 2004. Le référentiel taxinomique du Système d'information halieutique de l'Ifremer. Ifremer, Nantes. DRV/RH/DT/04-04. 13 p.

J2 - Désaunay Y., 2004b. Campagne MISOLRE 2003. Ifremer, Nantes. Fiche technique de fin de campagne pour les navires côtiers Ifremer. 17 p.

J3 - Cloarec A., 2004. Description de la fonctionnalité de nourricerie des secteurs côtiers et estuariens à partir des peuplements suprabenthiques. Ifremer, Nantes. Mémoire de fin d'études pour l'obtention du Diplôme d'Agronomie Approfondie (DAA) Spécialisation Halieutique. 31 + annexes p.

J3 - Delalande C., 2004. Caractérisation des bancs de poissons pélagiques par acoustique : classification à partir de descripteurs morphologiques, bathymétriques et énergétiques. Ifremer, Nantes. Rapport de stage de fin d'études présenté pour l'obtention du Diplôme de Technicien Supérieur de la Mer (DTSM). 42 + annexes p.

J4 - Lampert L. & D. Woehrling, 2004. Charte IGA. Prescription pour la réalisation des rapports de surveillance du programme Impact des Grands Aménagements (IGA). IFREMER, Nantes. RST 04/04 LERN/ECOHAL. 32 p.

J4 - Petitgas P., 2004a. Classification des profils hydrologiques des campagnes PelGas 2000-2003. Ifremer, Nantes. Note interne Ecohal. 13 p.

J4 - Petitgas P., 2004b. Distance et classification de matrices de population. Ifremer, Nantes. Note interne Ecohal. 17 p.J4 - Planque B., 2004a. Ressources halieutiques, exploitation durable et valorisation. Prospective thématique. Ifremer,

Nantes. Document de travail. 6 p.L - Allain G., 2004. Modélisation biophysique pour la prévision du recrutement. Couplage stochastique d'un modèle

individu-centré de croissance larvaire avec un modèle hydrodynamique 3D pour développer un indice de recrutement de l'anchois dans le golfe de Gascogne. Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Rennes, Nantes. Thèse Doctorale Vie-Agro-Santé. 184 p.

P2 - Blanchard F., J. Boucher & J.-C. Poulard, 2004a. The effects of fishing and climate warming on the fish community in the Bay of Biscay during the last 3 decades : The answer of some indicators. Poster. Symposium Quantitative ecosystem indicators for fisheries management SCOR-Unesco.

P2 - Blanchard F., J. Boucher & J.-C. Poulard, 2004b. Comparative analysis of fishing and climate effects on the fish community structure of the Bay of Biscay. ICES Symposium on "The Influence of Climate Change on North Atlantic Fish Stocks".

P2 - Blanchard F., J. Boucher, J.-C. Poulard, C. Hily & F. Leloc'h, 2004c. Effects of climate and fishing: the necessity to take regime shifts into account in fisheries management objectives. Poster. Fourth World Fisheries Congress. Vancouver, BC, Canada.

P2 - Léauté J.-P., J.-C. Poulard & A. Forest, 2004. Variations spatio-temporelles des rendements mensuels des chalutiers, dans le golfe de Gascogne, entre 1990 et 1998. Poster. IX ème Colloque International d'Océanographie du Golfe de Gascogne.

P2 - Poulard J.-C. & F. Blanchard, 2004a. Impact of climate change on the fish community structure of the eastern continental shelf of the Bay of Biscay. ICES Symposium on "The Influence of Climate Change on North Atlantic Fish Stocks".

P2 - Poulard J.-C. & F. Blanchard, 2004b. Spatio-temporal distribution of hake in the Bay of Biscay. BECAUSE Meeting, Athens, 1 - 4 November 2004. Poster p.

P2 - Rochet M.-J., V.M. Trenkel, J. Bertrand, R. Bellail, F. Coppin, O. Le Pape, J.-C. Mahé, J. Morin, J.-C. Poulard, I. Schlaich, A. Souplet & Y. Vérin, 2004. Is the impact of fishing on the fish communities around France increasing ? Poster. Symposium "Quantitative ecosystem indicators for fisheries management".



Q2 - Planque B., 2004b. Programme National Environnement Côtier. Proposition pour une Action Transversale. Couplage hydrodynamique et écologie: modèles et méthodes. Réponse à l'appel d'offre 2004. Ifremer, Nantes. Réponse à un appel d'offres. 46 p.

X - Planque B., E. Bellier & P. Lazure, 2004c. Modelling potential spawning habitat of sardine (Sardina pilchardus) and anchovy (Engraulis encrasicolus) in the Bay of Biscay. 25 + annexes.

Liste des travaux du laboratoire Maerha diffusés en 2004

A - Amand M., D. Pelletier, J. Ferraris, & M. Kulbicki. 2004. A step toward the definition of ecological indicators of the impact of fishing in the Abore reef reserve (New Caledonia). Aquat. Liv. Resour. 17, 139-149.A - Beliaeff B., G. Bocquéné, 2004. Exploratory data analysis of the Mediterranean component of the BEEP programme. Marine Environmental Research 58, 239-244.A - Benoît E., Rochet, M.J., 2004. A continuous model of biomass size spectra governed by predation, and the effects of fishing on them. Journal of Theoretical Biology, 226, 9-21.A - Claudet J., D. Pelletier. 2004. Marine protected areas and artificial reefs: A review of the interactions between management and scientific studies. Aquat. Living Resour. 17, 129-138.A - Ferraris, J., D. Pelletier, M. Kulbicki, C. Chauvet. Assessing the impact of removing reserve status on the Abore Reef fish assemblage, New Caledonia. Mar. Ecol. Progr. Ser. (sous presse).Fichez R., Adjeroud M., Beliaeff B., Bozec YM., Breau L., Chancerelle Y., Chevillon C., Douillet P., Frouin P., Kulbicki M., Moreton B., Ouillon S., Payri C., Perez T., Sasal P., Thébault J. Selected indicators of anthropogenic inputs of particles, nutrients and metals in coral reef lagoon systems. Aquat. Liv. Resour. 18 (sous presse).

A - Kell L.T., G. Pilling, G. Kirkwood, M. Pastoors, B. Mesnil, K. Korsbrekke, P. Abaunza, R. Aps, A. Biseau, P. Kunzlik, C. Needle, B. Roel, C. Ulrich-Rescan (Accepté). An evaluation of the implicit management procedure used for some ICES roundfish stocks. ICES J. Mar. Sci. (collaboration dans projet EU MATES).A - Mahévas S. , Y. Sandon and A. Biseau, 2004. Quantification of annual variations in fishing power and explanation of differences in efficiency by technical characteristics: an application to the bottom-trawlers of South-Brittany targeting anglerfish from 1983 to 1998. ICES Journal of Marine Science Vol 61/1 pp 71-83.A - Mahévas, S., & D. Pelletier, 2004. ISIS-Fish, a generic and spatially-explicit simulation tool for evaluating the impact of management measures on fisheries dynamics. Ecol. Modell. 171, 65-84.

A - Pelletier D., J. García-Charton, J. Ferraris, G. David, O. Thébaud, Y. Letourneur, J. Claudet, M. Amand, M. Kulbicki, R. Galzin. Designing indicators for evaluating the effects of Marine Protected Areas on coral reef ecosystems : a multidisciplinary standpoint. Aquat. Liv. Resour. 18 (sous presse).A - Trenkel V.M., Pinnegar J.K., Rochet M.-J., Rackham B., 2004. Different survey designs provide similar pictures of community structure but not of individual fish populations. ICES Journal of Marine Science 61, 351-362.A - Trenkel V. M., Lorance P., Mahévas S., 2004. Do visual transects provide true population density estimates for deep-water fish? ICES Journal of Marine Science 61, 1050-1056.A - Trenkel V.M., Francis, R.I.C.C., Lorance P., Mahévas S., Rochet M.-J., Tracey D.M., 2004. Factors for differences in availability of deep-water fish to trawling and visual observation from an ROV. Marine Ecology Progress Series 284, 293-303.D - Cadiou, J.F., Trenkel, V., Rochet M.J., J.M. 2004. Comparison of several methods for in situ size measurements of

moving animals. Proceedings of the fourteenth international offshore and polar engineering conference, Toulon, France, 438-444.

D - Claudet, J., G. Criquet, D. Pelletier, J.Y. Jouvenel, & F. Bachet, 2004. Multispecies-based indicators to assess the effectiveness of marine protected areas on rocky fish assemblages : an application to a northwestern Mediterranean case study. ICES CM 2004/Y:12.

D - Pelletier, D. 2004. Développement d'outils diagnostics et exploratoires d'aide à la décision pour évaluer la performance d’Aires Marines Protégées. Colloque Liteau, Paris, 18 novembre 2004.

D - Forest A. 2004. L'épuisement des ressources : mythe ou réalité ? Communication au Colloque pêche et aquaculture « Pour une exploitation durable des ressources vivantes de la mer et du littoral », Nantes, 21-23 janvier 2004, 12 p

D - Marchal P., Andersen B., Bromley D., Iriondo A., Mahévas S., Quirijns F., Rackham B.,Santurtun M., Tien N. and Ulrich C., (2004) Linking fishing effort and fishing mortality in a mixed-fisheries context. ICES CM /FF:27



D - Mesnil B., 2004. A crash test of Catch-Survey Analysis (CSA) using the NRC simulated data. Working Document to the ICES Working Group on Methods of Fish Stock Assessment, Lisbonne, 2004, 17 p.D - Mesnil B., 2004. Tests of Catch-Survey Analysis (CSA), an example of simple method. Contribution to EASE WP3 Workshop, Funchal, November 2004, 6 p.

D - Pelletier, D., L. Benedetti-Cecchi, J.A. García-Charton, J. Ferraris, J. Claudet, & P. Cury. Indicators for evaluating ecological and fisheries-related effects of Marine Protected Areas: Current status and perspectives. Symposium « Ecosystem and fisheries-related indicators », Paris, 31 mars-2 avril.

D -Rice, J. & Rochet, M.J., 2004. A framework for selecting a suite of indicators for fisheries management. Quantitative ecosystem indicators for fisheries management, Paris 31 mars – 3 avril.

D - Rochet, M.J. & Rice, J., 2004. Testing an Objective Framework for Selecting Indicators. Quantitative ecosystem indicators for fisheries management, Paris 31 mars – 3 avril.

D -Shin, Y.-J., Rochet, M.-J., Jennings, S., Field, J., & Gislason, H., 2004. Using size-based indicators to evaluate the ecosystem effects of fishing. Quantitative ecosystem indicators for fisheries management, Paris 31 mars – 3 avril.

D - Trenkel, V.M., Godø, O.R., Handegard, N.O., Patel, R., 2004. Studying the relationship between spatial fish distributions and trawl catches. ICES Annual Science Conference, Vigo, Spain ICES CM 2004/R:26.

D - Trenkel, V., Rochet, M.J., Sari,T., 2004. A new class of predator prey models with interactions described by thresholds. ICES Annual Science Conference, Vigo, Spain. ICES CM 2004/FF:04.

D - Trenkel, V. M., Pinnegar, J.K. Blanchard, J.L., Tidd, A.N., 2004. Can multispecies models be expected to provide better assessments for Celtic sea groundfish stocks? ICES Annual Science Conference, Vigo, Spain. ICES CM 2004/FF:05.

D - Verdoit-Jarraya, M., J.L. Gouzé, D. Pelletier, 2004. Modelling the spatial and aseasonal dynamics of the whiting population in the Celtic Sea. ICES CM 2004/Y:13.

D - Vigneau, J. and S. Mahevas, 2004. Precision in catch at age data with regard to sampling design. Workshop on Sampling and Calculation Methodology for Fisheries Data, 26-30 January Nantes .

P2 - Amand, M., D. Pelletier, J. Ferraris, & M. Kulbicki. 2004. Ecosystemic indicators for monitoring marine reserve performance : the case of the Abore reef (New Caledonia). 4 th World Fisheries Congress, May 2-6, Vancouver, Canada.

P2 - Claudet, J., P. Lenfant, D. Pelletier, J.A. Garcia-Charton, J.Y. Jouvenel, & M.L. Licari, 2004. The need of implying habitats for the assessment of the effectiveness of marine protected areas on temperate rocky fish assemblages. ICES CM 2004/Y:20.

P2 - Claudet, J., D. Pelletier, J.A. Garcia-Charton, J.Y. Jouvenel, & M.L. Licari, 2004. Assessment methods and indicators to study the effectiveness of Marine Protected Areas. Symposium « Ecosystem and fisheries-related indicators », Paris, 31 mars-2 avril.

P2 - Drouineau H., Mahévas S., Pelletier D., Beliaeff B.(2004). Assessing the impact of marine protected areas on the Hake-Nephrops fishery of the bay of Biscay using ISIS-Fish.ICES CM /Y:09

P2 - Mahévas S, Trenkel V., Rochet M-J (2004).Proposal and evaluation of quantitative indicators for the state and dynamics of fishing activities. In QuantitativeEcosystem Indicators For Fisheries Management' International Symposium, 31March - 3 April, 2004, Paris, France.

P2 - Pelletier, D., & S. Mahévas, 2004. Evaluating the dynamics of mixed fisheries in response to policy options: Match and mismatch between data resolution, model requirements and model objectives. 4 th World Fisheries Congress, May 2-6, Vancouver, Canada.

P2 - Pelletier, D., J. Ferraris, & M. Amand, 2004. Evaluating the impact of marine reserves on fish communities : a holistic approach based on statistical models. 4th World Fisheries Congress, May 2-6, Vancouver, Canada.

P2 - Rochet, M.J., Bertrand, J.A., Coppin, F., Le Pape, O., Morin, J., Poulard, J.-C., Schlaich, I., Trenkel, V., Vérin, Y., 2004. Is the impact of fishing on the fish community around France increasing ? Quantitative ecosystem indicators for fisheries management, Paris 31 mars – 3 avril, poster.

P2 - Trenkel, V. & Skaug, H., 2004. Modelling trawl catchability using random effects models. Seminar onstatistical models with latent structure for phenomena and data in ecology, Rosendal 4-7 mai 2004, Norvège.P2 - Léauté, J.P., J.C. Poulard & A. Forest, 2004. Variations spatio-temporelles des rendements mensuels des chalutiers, dans le golfe de Gascogne, entre 1990 et 1998. Poster présenté au IXeme Colloque international d'océanographie du golfe de Gascogne, Pau, juin 2004P2 - Mesnil B., 2004. Explications sur la démarche d'évaluation de stocks. Notes pour FR3 "C'est pas sorcier", mai 2004, 6

p.P2 -Forest A. 2004. Réunion de "l'Advisory Committee on Fishery Management" (ACFM, 28 mai-3 juin 2004). Principaux

résultats intéressant les pêches françaises., 4 p



G - Mesnil B., 2004. Quelques remarques complémentaires sur les QIT. Note pour le Séminaire DPMA-Ifremer "Alternatives de gestion", février 2004, 4 p.G - D ickey-Collas, M. and Rochet, M.-J., 2004. Review of the Defra MF04 Research Programme 'Pre-recruitment population processes of marine finfish". Evaluators' Report, 14 p.G - Forest A. 2004. Résultats ACFM mai 2004. (Présentation power point pour CNPMEM et DPMA).G - Pelletier, D., & O. Thébaud. 2004. Les zones fermées à la pêche. Présentation au séminaire DPMA-Ifremer "Alternatives de gestion", février 2004.Documents référencés par le Département (ou la Direction Opérationnelle ?)

I - Bertrand, J.A., Coppin, F., Le Pape, O., Morin, J., Poulard, J.-C., Rochet, M.-J., Schlaich, I., Trenkel, V., Vérin, Y., 2004. L'état des communautées exploitées au large des côtes de France. Application d'indicateurs à l'évaluation de l'impact de la pêche. DRV/RH/RS/04-00. 170 pp.DT : Documents Techniques

I - Rochet, M.J., Lazure, P., & Le Pape, O., 2004. Atelier Modélisation du Défi Golfe de Gascogne. IFREMER Nantes, le 14 octobre 2003, Rep. No. DRV/RH/DT/04-02. IFREMER, Nantes.RD-labo : autres rapports et documents référencés par les laboratoires ou les projets

J1 - Rochet, M.-J., Rapport de mission au CEFAS (Lowestoft, UK) pour la revue d'un programme du DEFRA, du 12 au 14 juillet 2004

J 1 - Forest, A. & M. Héral. 2004a. Quatre-vingt douzième réunion statutaire du Conseil International pour l'Exploration de la Mer (CIEM). Vigo (Espagne), 20-29 septembre 2004. Rapport de participation. Ifremer, 33 p.

J1 - Forest, A. & M. Héral. 2004b. Quatre-vingt onzième réunion statutaire du Conseil International pour l'Exploration de la Mer (CIEM). Tallinn (Estonie), 22 septembre - 1er octobre 2003. Rapport de participation. Ifremer, 28 p.

Liste des travaux du département EMH diffusés en 2005

A - Clua E., B. Beliaeff, C. Chauvet, G. David, J. Ferraris, M. Kronen, M. Kulbicki, P. Labrosse, Y. Letourneur, D. Pelletier, O. Thébaud & M. Léopold, 2005. Towards multidisciplinary indicator dashboards for coral reef fisheries management. Aquat. Living Resour. 18: 199-213.

A - Eymard S., E. Carcouët, M.-J. Rochet, J. Dumay, C. Chopin & C. Genot, 2005. Development of lipid oxidation during manufacturing of horse mackerel surimii. Journal of the Science of Food and Agriculture 85: 1750-1756.

A - Ferraris J., D. Pelletier, M. Kulbicki & C. Chauvet, 2005. Assessing the impact of removing reserve status on the Abore Reef fish assemblage inNew Caledonia. Mar. Ecol. Prog. Ser. 292: 271-286.

A - Gaertner J.C., J.A. Bertrand, L. Gil de Sola, J.-P. Durbec, E. Ferrandis & A. Souplet, 2005a. Large spatial scale variation of demersal fish assemblage structure on the continental shelf of the NW Mediterranean Sea. Marine Ecology Progress Series 297: 245-257.

A - Gaertner J.C., J.A. Bertrand, D. Samani & A. Souplet, 2005b. Spatio-temporal organization patterns of demersal assemblages of the east coast of Corsica (Mediterranean Sea). Vie Milieu 55 (2): 81-89.

A - Hammond T.R. & V. Trenkel, 2005. Censored catch data in fisheries stock assessment. ICES Journal of Marine Science 62: 1118-1130.

A - Kell L.T., G.M. Pilling, G.P. Kirkwood, M. Pastoors, B. Mesnil, K. Kosbrekke, R. Aps, P. Abaunza, A. Biseau, P. Kunzlik, C. Needle, B.A. Roel & C. Ulrich-Rescan, 2005. An evaluation of the implicit management procedure used for some ICES roundfish stocks. ICES Journal of Marine Science 62: 750-759.

A - Mesnil B., 2005a. Sensitivy of, and Bias in, Catch-Survey Analysis (CSA) Estimates of Stock Abundance. Fisheries Assesment and Management in Data-Limited Situations AK - SG.

A - Pelletier D., J.A. Garcia-Charton, J. Ferraris, G. David, O. Thébaud, Y. Letourneur, J. Claudet, M. Amand, M. Kulbicki & R. Galzin, 2005a. Designing indicators for assessing the effects of marine protected areas on coral reef ecosystems: A multidisciplinary standpoint. Aquat. Living Resour. 18: 15-33.

A - Pelletier D. & S. Mahévas, 2005a. Spatially explicit fisheries simulation models for policy evaluation. Fish and Fisheries 6: 307-349.

A - Pelletier D. & S. Mahévas, 2005b. Fisheries simulation models for evaluating the impact of management policies, with emphasis on marine protected areas. Fish and Fisheries 6: 307-349.

A - Poulard J.-C. & F. Blanchard, 2005. The impact of climate change on the fish community structure of the eastern continental shelf of the Bay of Biscay. ICES J. Mar. Sci. 62: 1436-1443.



A - Poulard J.-C., F. Blanchard, J. Boucher & S. Souissi, 2005. Variability in the demersal fish assemblages of Bay of Biscay during the 1990s. ICES J. Mar. Sci.

A - Rice J. & M.J. Rochet, 2005. A framework for selecting a suite of indicators for fisheries management. ICES Jounal of Marine Science 62: 516-527.

A - Rochet M.-J. & J. Rice, 2005. Do explicit criteria help selecting indicators for Ecosystem-based fisheries management ? An experimental test. ICES Journal of marine Science 62 (3): 528-539.

A - Rochet M.-J. & V.M. Trenkel, 2005. Factors for the variability of discards: theory and field evidence. Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences 62 (1): 224-235.

A - Rochet M.J., V.M. Trenkel, R. Bellail, F. Coppin, O. Le Pape, J.-C. Mahé, A. Morin, J.-C. Poulard, I. Schlaich, A. Souplet, Y. Vérin & J.A. Bertrand, 2005. Combining indicator trends to assess ongoing changes in exploited fish communities: diagnostic of communities off the coasts of France. ICES Journal of Marine Science 62: 1647-1664.

A - Roos D., D. Pelletier, S. Ciccione, M. Taquet & G. Hughes, 2005. Aerial and snorkelling census techniques for estimating green turtle abundance on foraging areas: A pilot study in Mayotte Island (Indian Ocean). Aquat. Living Resour. 18: 193-198.

A - Shin Y.-J., M.-J. Rochet, S. Jennings, J. Field & H. Gislason, 2005. Using size-based indicators to evaluate the ecosystem effects of fishing. ICES Jounal of Marine Science 62: 384-396.

A - Suquet M., M.-J. Rochet & J.-L. Gaignon, 2005. Experimental ecology: A key to understanding fish biology in the wild. Aquat. Living Resour. 18: 251-259.

A - Trenkel V., J. Pinnegar, W.A. Dawson, M.-H. du Buit & A.N. Tidd, 2005a. Spatial and temporal structure of predator-prey relationships in the Celtic Sea fish community. Marine Ecology Progress Series 299: 257-268.

A - Trenkel V. & H.J. Skaug, 2005. Disentangling the effects of capture efficiency and population abundance on catch data using random effects models. ICES J. Mar. Sci. 62: 1543-1555.

A - Woehrling D., A. Lefebvre, G. Le Fèvre-Lehoërff & R. Delesmont, 2005. Seasonal and longer term trends in sea temperature along the French North Sea coast, 1975 to 2002. J. Mar. Biol. Assoc. U.K. 85 (4769): 1-10.

C - Désaunay Y. & D. Guérault, 2005. Impacts écologiques à long terme sur les nourriceries côtières. In Espace et territoires. e. Les conséquences du naufrage de l'Erika. Risques, société, réhabilitation ed. Presses universitaires de Rennes, Rennes: 63-86.

D - Doray M., P. Petitgas, E. Josse & S. Mahévas, 2005. A geostatistical method for assessing biomass of tuna aggreagations around moored Fish Aggregating Device with star acoustic surveys. ICES CM 2005/U:15. 15 p.

D - Lorance P. & V.M. Trenkel, 2005. Natural and reaction behaviour of mid-slope fish species. In 40th European Marine Biology Symposium, Vienne, Autriche.

D - Mahé J.C. & J.-C. Poulard, 2005. Spatial distribution and abundance trends of main elasmobranches species in the Bay of Biscay and Celtic Sea from bottom trawl surveys. ICES CM 2005/N:04. 27 p.

D - Mahévas S., M. Bertignac, A. Fertin, H. Drouineau & A. Vettoretti, 2005a. Preliminary studies for the development and fitting of a statistic spatial length-based model for the European hake, Copenhagen. Study Group on Age-length Structured Assessment Models. 7 p.

D - Mahévas S., D. Pelletier, P. Marchal, O. Guyader, P. Prellezo & M. Santurtún, 2005b. Simulating with ISIS-Fish V2.0 the dynamics of a North-East Atlantic mixed fishery subject to spatial closures. In Communication in the North American Association of Fisheries Economists Conference Vancouver, Canada.

D - Mesnil B., 2005b. Can mean size in survey catches inform on fishing intensity ? An exploration by simulation. In Working Document for the Autumn 2005 meeting of the FISBOAT Project, Rhodes: 12.

D - Pecquerie L., P. Petitgas, M. Huret & A. Menesguen, 2005. Modelling anchovy growth according to environmental conditions. ICES CM 2005/O:21. 11 p.

D - Petitgas P., P. Lazure, P. Grellier & F. Dumas, 2005a. Validation of a biophysical larvae drift, growth and survival model on anchovy in Biscay with a framework for its operational use. ICES CM 2005/O:34. 8 p.

D - Petitgas P., P. Lenfant, C. Gonzalez & P. Grellier, 2005b. Tracking individual variability in Bay of Biscay anchovy population using genetics and otolith analysis to understand the mechanisms of population maintenance. ICES CM 2005/T:09. 12 p.

D - Petitgas P. & S. Vaz, 2005. Investigating the interaction between population spatial organisation and population dynamics using an age-structured multi-site matrix model on anchovy in Biscay. ICES CM 2005/L:23. 10 p.

D - Poulard J.-C. & V. Trenkel, 2005a. Relationship between survey abundance and weight indices, survey design and wind conditions: the French groundfish survey in Bay of Biscay. ICES CM 2005/Z: 02. 17 p.



D - Talidec C., M.-J. Rochet, M. Bertignac & C. Macher, 2005. Discards estimates of nephrops and hake in the Nephrops trawl fishery of the Bay of Biscay: Methodology and preliminary results for 2003 and 2004, Lisbon, Portugal. Working Document for the ICES Working Group on the Assessment of Southern Shelf Stocks of Hake, Monk and Megrim, WGHMM.

D - Trenkel V. & M.-J. Rochet, 2005a. Vers des indicateurs de changement de dynamique pour l'évaluation des ressources halieutiques. Ifremer, Nantes. 1 p.

D - Trenkel V.M., F. Le Loc'h, P. Lorance, S. Mahévas & M.-J. Rochet, 2005b. Small scale relationship between Norway lobster, juvenile hake and associated macro fauna in the Bay of Biscay. In 40th European Marine Biology Symposium, Vienne, Autriche.

D - Vigneau J. & S. Mahévas, 2005. A new statistic for sampling design investigation: an application to length-structured landings sampling. In ICES annual conference, Abeerdeen.

D - Woillez M., P. Petitgas, J. Rivoirard, J.-C. Poulard & N. Bez, 2005. Indices for capturing spatial pattern and change across years of fish population: an application on European hake (Merluccius merluccius) in the Bay of Biscay. CM 2005/L:16. 14 p.

F - Désaunay Y., 2005a. ECTOPHY - Nourriceries. Ecologie, toxicologie et physiologie des poissons exposés à la marée noire de l'Erika. Ifremer, Nantes. Rapport final. Projet n° 9 du programme "suivi des conséquences écologiques et toxicologiques de la marée noire "Erika". Contrat MATE-INTERIS-IFREMER. 112 p.

F - Jacq J., O. Le Pape, Y. Désaunay & B. Trouillet, 2005. Les nourriceries de sole entre Quiberon et le sud de l'île d'Yeu : écologie et réglementations. SMIDAP - Ifremer - Agrocampus - Géolittomer, Nantes - Rennes. 44 p.

G - Massé J., P. Petitgas, E. Duhamel & A. Biseau, 2005. Note brève sur la situation de l'anchois dans le golfe de Gascogne en 2005 à l'issue de la campagne PELGAS05 de l'Ifremer. Ifremer, Nantes. 6 p.

I - Drévès L., L. Lampert, J. Martin, C. Abernot-Le Gac, F. Dumas, F. Dagault, I. Schlaich, D. Latrouite & D. Woehrling, 2005a. Synthèse hydrobiologique du site électronucléaire de Flamanville. Ifremer, Plouzané. DOP/LER/05.06. 364 p.

I - Drévès L., L. Lampert, J. Martin, C. Abernot Le Gac, F. Dagault, J.D. Gaffet & I. Schlaich, 2005b. Surveillance écologique et halieutique du site électronucléaire de Flamanville, année 2004. Ifremer, Plouzané. DOP/LER/05.02. 194 p.

I - Halgand D., M.-L. Cochard, J. Huet, L. Lampert & F. Dagault, 2005. Surveillance écologique et halieutique du site électronucléaire de Penly : année 2004. Ifremer, Nantes. IFREMER/CN/EMH-05.11. 177 p.

J3 - Capoulade M., 2005. Gestion de la population de sar commun (Diplodus sargus, L. 1758) des pêcheries catalanes : paramétrage du logiciel ISIS-Fish. Master professionnel. Environnement marin et développement durable. Option fonctionnement et gestion des milieux aquatiques et marins. Université de Perpignan, Nantes. 35 p.

J3 - Delaunay D., 2005. Evolution de la population de sardines (Sardina pilchardus) dans le golfe de Gascogne au travers de cinq campagnes printanières (2000-2004). Ifremer, Nantes. 22 + annexes p.

J3 - Dupont N., 2005. Etude de la Dynamique de la Structure en taille du plancton du golfe de Gascogne à l'aide du Laser Optical Plankton Counter. Ifremer, Nantes. Mémoire de Master "Mention Sciences de l'Univers, Environnement, Ecologie", "Spécialité Océanographie et Environnements Marins" Année 2. 41 p.

J3 - Jarry E., 2005. Utilisation d'indicateurs pour le suivi des populations de poissons pélagiques dans le golfe de Gascogne. Ifremer - Institut de Biologie et d'Ecologie Appliquée, Nantes - Angers. 55 p.

J3 - Laasri A., 2005. Analyse et modélisation statistique de l'effet d'une réserve marine sur les peuplements de poissons coralliens. Master 2. Ingénierie mathématique : statistiques et probabilités. Faculté des sciences et techniques, Université de Nantes, Nantes. 69 p.

J3 - Lorec A., 2005. Mise en place d'un protocole expérimental pour la validation d'un modèle de distribution verticale d'œufs de poissons pélagiques. Ifremer - Université Bordeaux 1, Nantes. 13 p.

J3 - Preuss B., 2005. Gestion de la pêcherie démerso-benthique du plateau Celtique: Paramétrage du logiciel ISIS-Fish. Master 1. Ecologie et biologie de l'évolution. ENS Ulm, Nantes. 39 p.

J3 - Reydel J., 2005a. Distribution printanière du zooplancton dans le golfe de Gascogne (1967-1972 et 2002-2004). Ifremer - Université de Nantes, Nantes. Mémoire de Master année 1 mention Sciences biologiques et médicales. Parcours Bioproduction et écosystèmes aquatiques et terrestres. 20 + annexes p.

J3 - Reydel J., 2005b. Atlas des différents Paramètres Indicateurs de Biomasse et Dynamique Planctonique dans le golfe de Gascogne récoltées lors des campagnes Pelgas. Ifremer, Nantes.

J4 - Massé J. & P. Petitgas, 2005. Note brève sur la situation de l'anchois dans le golfe de Gascogne en 2005 à l'issue de la campagne PELGAS05 de l'IFREMER. Ifremer, Nantes. 6 p.



J4 - Ollitraut A. & J. Massé, 2005. Campagne automnale d'observation des juvéniles d'anchois dans le golfe de Gascogne: Volet professionnel - 2005. CNPMEM. Ifremer. Rapport réalisé par le CNPMEM en partenariat avec Ifremer. 43 p.

L - Guyomard D., 2005. Modélisation du comportement migratoire de l'espadon par l'approche de la vie artificielle. Thesis: ENSAR. 211 p.

L - Laurent V., 2005. Description de la structure génétique des populations de sardines européenne, Sardina pilchardus, dans un contexte d'évolution de l'espèce. Université de Perpignan, EPHE-CNRS, Perpignan. 211 p.

L - Le Pape O., 2005. Les habitats halieutiques essentiels en milieu côtier. Les identifier, comprendre leur fonctionnement et suivre leur qualité pour mieux gérer et pérenniser les ressources marines exploitées. L'exemple des nourriceries côtières de poissons plats. Ifremer, Rennes. Mémoire d'habilitation à diriger des recherches. 78 p.

P2 - Le Pape O., Baulier L., Cloarec A., Martin J., Désaunay Y., 2005. Habitat suitability for the juvenile common sole (Solea solea, L.) in the Bay of Biscay (France): a quantitative description using indicators based on benthic fauna. Oral communication. 6th International Symposium on Faltfish Ecology. Habitats in relation to recruitment variability, Kyoto, Japan, october 2005.

P2 - Gilliers C., Le Pape O., Désaunay Y., Morin J., Loizeau V., Guinand B., Amara R., 2005. Description of juvenile fish habitat quality, the question of the spatial scale. Oral communication. 6 th International Symposium on Faltfish Ecology. Habitats in relation to recruitment variability, Kyoto, Japan, october 2005.

P2 - Gilliers C., Galois R., Le Pape O. , Désaunay Y., Claireaux G., Delalande C., Guérault D., 2005. The effect of oil exposure on survival, recent growth, lipid contents and body condition of 0-group juvenile soles (Solea solea) : an experimental study. Oral communication. 6th International Symposium on Faltfish Ecology. Habitats in relation to recruitment variability, Kyoto, Japan, october 2005.

P2 - Désaunay Y., 2005. Les ressources accessibles au chalutage côtier de Quiberon à Noirmoutier : état des ressources et des habitats. Communication orale présenté au Comité Scientifique et Technique du SMIDAP, restitution des travaux 2004, Bouin, mars 2005.

P2 - Désaunay Y., 2005. Campagnes d’écologie halieutique côtière Golfe de Gascogne 2001-2004 du laboratoire d’écologie halieutique (Ifremer, Nantes). Communication orale au Colloque quadriennal du CIRMAT, Université de Rouen, décembre 2005.

P2 - Marchal P., B. Andersen, D. Bromley, A. Iriondo, S. Mahévas, F. Quirijns, B. Rackham, M. Santurtún, N. Tien & C. Ulrich, 2005. La prise en compte des tactiques et stratégies de pêche peut elle améliorer la définition de l’effort de pêche ? In Forum de l’Association Française d’Halieumétrie, Nantes.

P2 - Martin J., 2005. Onset of hatching of Spider crab (Maja brachydactyla Balss, 1922). In English Channel according to seawater temperature, Sixth International Crustacean Congress, Glasgow.

P2 - Pelletier D. & S. Mahévas, 2005c. Présentation du logiciel ISIS-FISH version 1.5. In colloque final du défi Golfe de Gascogne. Ifremer, Brest, mars 2005.

P2 - Pelletier D., S. Mahévas, M. Jarraya, M. Capoulade, H. Drouineau, Y. Vermard & F. Bastardie, 2005b. Investigating the consequences of Marine Protected Areas upon fish populations and fisheries through ISIS-Fish, a generic simulation tool. In Communication at the First International Congress on Marine Protected Areas, Geelong.

P2 - Poulard J.-C. & V. Trenkel, 2005b. General year effect on survey catchability. In Fisboat meeting, Fontainebleau, 31/01-04/02/05.

P2 - Poulard J.-C. & V. Trenkel, 2005c. Relationship between survey indices and survey conditions: Bay of Biscay groundfish survey. In ICES Annual Science Conference. Ifremer, Aberdeen: 17.

P2 - Trenkel V., 2005. Spatial and temporal structure of predator-prey relationships in the Celtic Sea fish community. University of Southampton, UK. Poster.

P2 - Trenkel V., J.-F. Cadiou, F. Le Loc'h, S. Mahévas & M.-J. Rochet, 2005c. Bilan de l'utilisation des méthodes visuelles en halieutique. Ifremer, Nantes. 1 p.

P2 - Trenkel V., F. Le Loc'h, J.-F. Cadiou, M.-J. Rochet, A.-G. Allais, Y. Denis, J.-L. Michel, A. Ollitraut, A. Przybicin & X. Saint-Laurent, 2005d. Résultats de la campagne Mertail, 26/07/04 - 04/08/04. Ifremer, UBO Brest, Rouen. Poster.

P2 - Trenkel V. & M.-J. Rochet, 2005b. Comment détecter des changements dans la dynamique des indicateurs ? In Conférence de l'AFH, Nantes, juin 2005.

P2 - Trenkel V.M., C.F. Cadiou, P. Le Loc'h, P. Lorance, S. Mahévas & M.-J. Rochet, 2005e. Bilan de l'utilisation des méthodes visuelles halieutiques. Colloque défi golfe de Gascogne, 22-24 mars 2005, Brest, France.




A - Battaglia A., V. Trenkel & M.J. Rochet, 2006. Estimating end effects in trawl catches. ICES J. Mar. Sci. 63: 956-959.A - Bergeron J.P., 2006. Small-scale variability of zooplankton pyruvate kinase activity in the Gironde Estuary plume

(Atlantic French Coast): A case study under unusually low freshwater discharge. Estuar. Coast. Shelf Sci. 69: 662-666.A - Désaunay Y., D. Guérault, O. Le Pape & J.-C. Poulard, 2006a. Changes in occurrence and abundance of northern /

southern flattfishes over a 20-year period in a coastal nusery area (Bay of Vilaine) and the eastern continental shelf of the Bay of Biscay. Sci. Mar. 70 (S1): 193-200.

A - Drouineau H., S. Mahévas, D. Pelletier & B. Beliaeff, 2006. Assessing the impact of different management options using ISIS-Fish : the French Merluccius merluccius - Nephrops norvegicus mixed fishery of the Bay of Biscay. Aquat. Living Resour. 19: 15-29.

A - Gilliers C., O. Le Pape, Y. Désaunay, J.P. Bergeron, N. Schreiber, D. Guérault & R. Amara, 2006. Growth and condition of juvenile sole (Solea solea L.) as indicators of habitat quality in coastal and estuarine nurseries in the Bay of Biscay with a focus on sites exposed to the Erika oil spill. Sci. Mar. 70 (S1): 183-192.

A - Kell L., G.M. Pilling, G.P. Kirkwood, M. Pastoors, B. Mesnil, K. Korsbrekke, P. Abaunza, R. Aps, A. Biseau, P. Kunzlik, C. Needle, B.A. Roel & C. Ulrich, 2006. An evaluation of multi-annual management strategies for ICES roundfish stocks. ICES J. Mar. Sci. 63: 12-24.

A - Lavin A., L. Valdes, F. Sanchez, P. Abaunza, A. Forest, J. Boucher, P. Lazure & A.M. Jégou, 2006. The Bay of Biscay : the encountering of the ocean and the shelf. In The sea. The global coastal ocean. Interdisciplinary regional studies ans synthese. A.R. Robinson & K.H. Brink eds. Harvard University Press, Cambridge, MA Vol. 14, part B: 935-1002.

A - Lobry J., M. Lepage & E. Rochard, 2006. From seasonal patterns to a reference situation in an estuarine environment: Example of the small fish and shrimp fauna of the Gironde estuary (SW France). Estuarine, Coastal and Shelf Science 70: 239-250.

A - Lorance P. & V. Trenkel, 2006. Variability of natural and reaction behaviours of mid-slope fish species. Journal of Marine Experimental Biology and Ecology 332: 106-119.

A - Martin J. & B. Planque, 2006. Variability in the onset of hatching of spider crab ( Maja brachydactyla Balss, 1922) in the English Channel in relation to sea temperature. Invertebrate Reproduction and Development 49 (3): 143-150.

A - Petitgas P., S. Magri & P. Lazure, 2006a. One-dimensional biophysical modelling of fish egg vertical distributions in shelf seas. Fish. Oceanogr. 15 (5): 413-428.

A - Petitgas P., J. Massé, P. Bourriau, P. Beillois, J.P. Bergeron, D. Delmas, A. Herbland, N. Koueta, J.M. Froidefond & E. Santos, 2006b. Hydro-plankton characteristics and their relationship with sardine and anchovy distributions on the French shelf of the Bay of Biscay. Sci. Mar. 70 (S1): 161-172.

A - Planque B., P. Lazure & A.-M. Jegou, 2006. Typology of hydrological structures modelled and observed over the Bay of Biscay shelf. Sci. Mar. 70 (S1): 43-50.

A - Rochet M.-J., J.-F. Cadiou & V. Trenkel, 2006a. Precision and accuracy of fish length measurements obtained with two visual underwater methods. Fishery Bulletin 104 (1): 1-9.

B - Forest A., 2006a. L'épuisement des ressources : mythe ou réalité ? In Pêche et aquaculture. Pour une exploitation durable des ressources vivantes de la mer et du littoral. Espace et territoires. J. Chaussade & J. Guillaume eds. Presses Universitaires de Rennes: 89-100.

C - Moran X.A.G., J.M. Rodriguez & P. Petitgas eds, 2006. Oceanography of the bay of Biscay. Scientia Marina. Vol. 70 (suppl. 1). Ifremer: 209 p.

D - Buffaz L. & B. Planque, 2006. Applications of Operational Oceanography to fisheries management : the case of the anchovy in the Bay of Biscay. CM 2006/E:02. 11 p.

D - Lehuta S., P. Petitgas & S. Mahévas, 2006. Assessing the potential effect of management scenarios for Anchovy (Engraulis encrasicolus) fishery of the Bay of Biscay using ISIS-Fish simulation tool. ICES CM 2006/R:10. 26 p.

D - Marquis E., P. Petitgas, N. Niquil & C. Dupuy, 2006. Influence of the small pelagic fish on the structure and functioning of the planktonic foof web on the continental shelf on the Bay of Biscay ICES CM 2006/F:09. 24 p.



D - Mesnil B., 2006. Changing the nature of fisheries management advice. Working document to the ICES Working Group on Fisheries Systems, Charlottenlund, April 2006. ICES CM 2006/RMC:05, Annex 5. 57-66 p.

D - Petitgas P., D. Reid, B. Planque, E. Nogueira, B. O'Hea & U. Cotano, 2006c. The entrainment hypothesis: an explanation for the persistence and innovation in spawning migrations and life cycle spatial patterns. ICES CM2006/B:07. 9 p.

D - Planque B., 2006. Tackling the appropriate processes, temporal and spatial scales for fisheries operational oceanography. ICES CM 2006/E:01. 9 p.

D - Poulard J.C. & V. Trenkel, 2006. Spatial pattern indices and fish population abundance. ICES Working Group on Methods on Fish Ecology. 16 p.

D - Rochet M.J., 2006a. An overview of evolutionary effects of fishing on populations, and their implications for management. ICES CM2006/H:06. 1 p.

D - Rochet M.J., V. Trenkel & A. Battaglia, 2006b. Estimating end effect in trawl catches. ICES CM 2006/I:05.D - Trenkel V., F. Le Loc'h & M.J. Rochet, 2006a. Interactions between Norway lobster diel activity variations and the

fishing strategy of Nephrops trawlers in the Bay of Biscay CM 2006/K:12. 10 p.D - Trenkel V.M., 2006a. Combining acoustic and DEPM survey indices in the biomass random effects model for stock

assessment. Working document for WGACEGG 2006. 11 p.D - Woillez M., P. Petitgas, J. Rivoirard, A. Fernandez, R.t. Hoftstede, K. Korsbrekke, A. Orlowski, M.-T. Spedicato & C.Y.

Politou, 2006. Relationships between population spatial occupation and population dynamics. CM 2006/O:05. 19 p.F - Anon., 2006. Fisboat. Activity report after 18 months. Appendices for WPs 2A, 2B, 3, 4, 5 and 6. Tables & figures for

WPs 1, 2A, 2B. Fisheries independent survey-based operational assessment tools. Ifremer, Nantes. Project no. 502572. Ind. p.

F - Désaunay Y., P. Laffargue & J. Lobry, 2006b. Caractérisation halieutique et benthique de l'estuaire et de la baie de la Vilaine. Ifremer, Nantes. Convention n°06/5 210 600/F. 101 p.

F - Désaunay Y., J. Lobry & E. Brugale, 2006c. Ressources halieutiques et granulats marins: les sites du Grand Charpentier et du Pilier, dans l'estuaire externe de la Loire. Ifremer, Nantes. Convention n°06/5 210 566/F. 56 p.

F - Désaunay Y., J.L. Martin, J. Lobry & P. Laffargue, 2006d. Restriction des habitats de nourriceries par les espèces invasives et/ou proliférantes : vasières à Haploops et fonds à crépidules. Ifremer, Nantes. 43 p.

F - Lobry J. & Y. Désaunay, 2006. Les ressources bentho-démersales côtières du golfe de Gascogne. Etat comparatif des pêcheries côtières et de leur contexte environnemental entre les années 1980 et 2000 Ifremer, Nantes. Rapport d'étude : arrêté 2005 06986 du 25 juillet 2005. 81 p.

F - Moumouni K., 2006a. Estimation de la capturabilité des chalutiers professionnels ciblant le merlu en mer Celtique et dans le golfe de Gascogne, Nantes, Rennes. Contrat Ifremer-Université Rennes II N° 2006 5 50911127. Rapport d'avancement des travaux. 84 p.

G - Han Ching L., C. Cahu, F. Médale, J.P. Baud, A. Forest, C. Knockaert, P. Lassus & P. Paquotte eds, 2006. Groupe "Produits alimentaires d'origine aquatique". Rapport d'experts préalable au rapport de l'Académie des technologies. Progrès technologiques au sein des industries alimentaires. Impact sur la qualité des produits: 108 p.

I - Drévès L., L. Lampert, C. Abernot-Le Gac, J. Martin, P. Arzel, F. Dumas, I. Schlaich, D. Latrouite & D. Woehrling, 2006a. Synthèse hydrobiologique du site électronucléaire de Flamanville. Ifremer, Plouzané. DOP/LER/06.03. 386 p.

I - Drévès L., L. Lampert, J. Martin, C. Abernot Le Gac, J.-M. Brylinski, D. Vincent, J.D. Gaffet & I. Schlaich, 2006b. Surveillance écologique et halieutique du site électronucléaire de Flamanville, année 2005. Ifremer, Plouzané. DOP/LER/06.02. 202 p.

I - Halgand D., J.-M. Brylinski, M.-L. Cochard, F. Dagault, J. Huet, L. Lampert & D. Vincent, 2006. Surveillance écologique et halieutique du site électronucléaire de Penly : année 2005. Ifremer, Nantes. IFREMER/CN/EMH-06-01. 195 p.

J1 - Bertrand A., 2006a. Development of an Integrated Management System to support the sustainability of Greek Fisheries resources - IMAS-Fish. 8 p.

J1 - Forest A. & M. Heral, 2006. Quatre-vingt-treizième réunion statutaire du Conseil International pour l’Exploration de la Mer (CIEM). Aberdeen (Royaume Unis), 18 - 27 septembre 2005 et Copenhague (Danemark), 19 - 20 octobre 2005. Ifremer. Rapport de participation à la réunion statutaire 2005 du CIEM. 38 p.

J1 - Mellon C., B. Liorzou, J.-L. Bigot, A. Jadaud, H. Farrugio & J. Bertrand, 2006. Compte rendu de mission au SCSA de la CGPM, Rome. 9 p.

J1 - Rochet M.J., 2006b. Rapport de mission au Symposium du CIEM 'Fisheries Management Strategies', Galway 2p.



J1 - Rochet M.J. & L. Borges, 2006. K Theme session on Discarding: quantities, causes and consequences. Rapport de la session K de la réunion annuelle du CIEM. 3 p.

J3 - Barbey C., 2006. Etude des facteurs influençant la répartition verticale du zooplancton dans le golfe de Gascogne. Ifremer, Université Pierre et Marie Curie, Nantes. Mémoire de Master "Sciences de l'Univers, Environnement, Ecologie", spécialité "Océanographie et Environnements Marins", année 1. 23 + annexes p.

J3 - Brugale E., 2006. Comparaison des peuplements halieutiques à long terme sur deux sites d'extraction de granulats dans l'estuaire externe de la Loire. Université de Nantes, IFREMER, Nantes. 67 p.

J3 - Buffaz L., 2006. Indices hydroclimatiques dans le golfe de Gascogne. Liens avec le recrutement d'anchois. Ifremer, Université Pierre et Marie Curie, Nantes. Mémoire de Master "Sciences de l'Univers, Environnement, Ecologie", spécialité "Océanographie et Environnements Marins", année 2. 92 p.

J3 - Kostecki C., 2006. Analyse par acoustique multi-fréquentielle des petits poissons pélagiques du golfe de Gascogne durant la campagne PELGAS 06. Ifremer, Université de La Rochelle, Nantes, La Rochelle. Rapport de stage de Master 1 « Environnement et Espaces Littoraux ». 22 p.

J3 - Moumouni K., 2006b. Estimation de la capturabilité des chalutiers professionnels ciblant le merlu en mer Celtique et dans le golfe de Gascogne, Nantes, Rennes. Contrat Ifremer-Université Rennes II N° 2006 5 50911127. Rapport final. 89 p.

J4 - Bertrand A., 2006b. Séminaire GIZC. Ifremer, Nantes. Note interne n06-09_gizc.doc. 3 p.J4 - Bertrand A., 2006c. Des orientations pour le département EMH au titre de la période 2007-2010. Ifremer, Nantes. 3 p.J4 - EMH, 2006. Rapport d'activités 2005 du Département Ecologie et Modèles pour l'Halieutique (EMH). Ifremer, Nantes.

52 p.J4 - Lurton X. & L. Antoine, 2006. Analyse des risques pour les mammifères marins liés à l'emploi des méthodes

acoustiques en océanographie. Ifremer, Nantes. 60 p.J4 - Massé J., 2006. Proposition de campagne à la mer. N/O Thalassa. Pelgas 07. Ifremer, Nantes. Ifremer - IPEV - IRD. 37

p.J4 - Petitgas P., 2006. Protocole pour la mesure de la densité des œufs de poissons avec une colonne de densité. IFREMER

Nantes. Note interne. 2 p.L - Trenkel V., 2006b. Méthodes d’évaluation des ressources marines vivantes pour une exploitation durable. Ifremer-

Université de Montpellier. Mémoire d'HDR.P2 - Cotter A.J.R., V.M. Trenkel & M.J. Rochet, 2006. Hello length-based management of marine fisheries (Poster). ICES

Symposium on Fisheries Management Strategies Galway, Ireland, 27-30 June 2006.P2 - Désaunay Y., 2006. Restriction des habitats de nourriceries par les espèces invasives et/ou proliférantes: vasières à

Haploops et fonds à Crépidules. Ifremer, Nantes. 21 p.P2 - Forest A., 2006b. Les ressources halieutiques et leur exploitation dans le golfe de Gascogne et la Manche Ouest (zones

VIII et VIIe du CIEM). In Atelier international : Régulation de l'accès aux ressources marines vivantes dans la zone côtière : expérience internationale et perspectives pour la Bretagne, Brest, Institut Universitaire Européen de la Mer, 20-21 janvier 2006.

P2 - Forest A., 2006c. Approche scientifique de la gestion de la ressource. L'exemple des pêcheries de l'Atlantique du nord-est. In Assemblée générale Confédération des Industries de Traitement des Produits des Pêches Maritimes, Paris, 20 juin 2006: 26.

P2 - Guilbaud T., M.J. Rochet, L. Doyen & M. De Lara, 2006. Is a management strategy based on SSB indicators and reference points sustainable ? , Galway, Ireland. ICES Symposium on Fisheries Management Strategies Galway, Ireland, 27-30 June 2006. 13 p.

P2 - Lobry J., 2006. Comparatif des pêcheries côtières et de leur contexte environnemental à l'échelle d'un quart de siècle. Ifremer, Nantes. Comité Scientifique et Technique du SMIDAP. Suivi des travaux de l'année 2005. 12 p.

P2 - Massé J., V. Trenkel, C. Kostecky & S. Mehault, 2006. An attempt to reduce species misidentification in acoustic assessments by using school descriptors, including multi-frequency indices, Maastricht, Hollande. ICES Annual Science Conference.

P2 - Rochet M.J., M. Bertignac, S. Fifas, O. Gaudou & A. Talidec, 2006c. Estimating discards in the French Nephrops fishery in the Bay of Biscay. Ifremer, Nantes, Lorient, Brest. ICES CM 2006 / K: 24 Poster.

P2 - Trenkel V., V. Mazauric & L. Berger, 2006b. First results with the new Multibeam Echo Sounder ME70, Japan, Hawaii. 4th Joint Meeting of the Acoustical Society of America and the Acoustical Society of Japan, Hawaii, 28 novembre - 2 décembre 2006.



P2 - Trenkel V.M., M.-J. Rochet & B. Mesnil, 2006c. From model-based prescriptive advice to indicator-based interactive advice, Galway, Irelande. Communication au ICES Symposium on Management Strategies: "Case Studies of Innovation".


A - Allain, G., P. Petitgas & P. Lazure. 2007a. The influence of environment and spawning distribution on the survival of anchovy (Engraulis encrasicolus) larvae in the Bay of Biscay (NE Atlantic) investigated by biophysical simulations. Fisheries Oceanography 16, 6: 506-514.

A - Allain, G., P. Petitgas, P. Lazure & P. Grellier. 2007b. Biophysical modelling of larval drift, growth and survival for the prediction of anchovy (Engraulis encrasicolus) recruitment in the Bay of Biscay (NE Atlantic). Fisheries Oceanography 16, 6: 489-505.

A - Bellier, E., B. Planque & P. Petitgas. 2007. Historical fluctuations of spawning area of anchovy (Engraulis encrasicolus) and sardine (Sardina pilchardus) in the Bay of Biscay during 1967-73 end 2000-2004. Fish. Oceanogr. 16, 1: 1-15.

A - Certain, G., E. Bellier, B. Planque & V. Bretagnolle. 2007. Characterising the temporal variability of the spatial distribution of animals: an application to seabirds at sea. Ecography 30: 695-708.

A - Cotter, A.J.R., B. Mesnil & G.J. Piet. 2007a. Estimating stock parameters from trawl cpue-at-age series using year-class curves. ICES J. Mar. Sci. 64, 2: 234-247.

A - De Lara, M., L. Doyen, T. Guilbaud & M.-J. Rochet. 2007a. Monotonicity properties for the viable control of discrete-time systems. Systems & Control Letters 56, 4: 296-302.

A - De Lara, M., L. Doyen, T. Guilbaud & M.-J. Rochet. 2007b. Is a management framework based on spawning-stock biomass indicators sustainable ? A viability approach. ICES J. Mar. Sci. 64, 761-767.

A - Gallego, A., E. North & P. Petitgas. 2007. Advances in modelling physical-biological interactions in fish early life history. Marine Ecology Progress Series 347: 121-126.

A - Goarant, A., P. Petitgas & P. Bourriau. 2007. Anchovy (Engraulis encrasicolus) egg density measurements in the Bay of Biscay: evidence for the spatial variation in egg density with sea surface salinity. Mar. Biol. 151, 5: 1907-1915.

A - Huret, M., F. Gohin, D. Delmas, M. Lunven & V. Garçon. 2007a. Use of Sea WiFS data for light availability and parameter estimation of a phytoplankton production model of the Bay of Biscay. Journal of Marine Systems 65: 509-531.

A - Huret, M., J.A. Runge, C.-S. Chen, G. Cowles, Q. Xu & J.M. Pringle. 2007b. Dispersal modeling of fish early life stages: sensitivity with application to Atlantic cod in the western Gulf of maine. Mar Ecol Prog Ser 347: 261-274.

A - Le Pape, O., L. Baulier, A. Cloarec, J. Martin, F. Le Loc'h & Y. Désaunay. 2007a. Habitat suitability for the juvenile common sole (Solea solea, L.) in the Bay of Biscay (France): a quantitative description using indicators based on epibenthic fauna. Journal of Sea Research 57: 126-136.

A - Le Pape, O., C. Gilliers, P. Riou, J. Morin, R. Amara & Y. Désaunay. 2007b. Convergent signs of degradation in both the capacity and the quality of an essential fish habitat: state of the Seine Estuary (France) flatfish nurseries. Hydrobiologia 588, 1: 225-229.



A - Leroy, C., C. Delbarre-Ladrat, F. Ghillebaert, M.-J. Rochet, C. Compère & D. Combes. 2007. A marine bacterial adhesion microplate test using the DAPI fluorescent dye: a new method to sceen antifouling agents. The Society for Applied Microbiology 44: 372-378.

A - Nicolas, D., F. Le Loc’h, Y. Désaunay, D. Hamon, A. Blanchet & O. Le Pape. 2007. Relationships between benthic marcrofauna and habitat suitability for juvenile common sole (Solea solea, L.) in the Vilaine estuary (Bay of Biscay, France) nursery ground. Estuar. Coast. Mar. Sci. 73: 639-650.

A - Pasquaud, S., J. Lobry & P. Elie. 2007. Facing the necessity of describing estuarine ecosystems: a review of food web ecology study techniques. Hydrobiologia 588: 159-172.

A - Planque, B., E. Bellier & P. Lazure. 2007. Modelling potential spawning habitat of sardine ( Sardina pilchardus) and anchovy (Engraulis encrasicolus) in the Bay of Biscay. Fish. Oceanogr. 16, 1: 16-30.

A - Poulard, J.-C. & V.M. Trenkel. 2007. Do survey design and wind conditions influence survey indices ? Can. J. Fish. Aquat. Sci. , 64: 1551-1562.

A - Trenkel, V.-M., F. Le Loc'h & M.-J. Rochet. 2007a. Small scale spatial and temporal interactions among benthic crustaceans and one fish species in the Bay of Biscay. Mar. Biol. 151: 2207-2215.

A - Trenkel, V.-M., M.-J. Rochet & B. Mesnil. 2007b. From model-based prescriptive advice to indicator-based interactive advice. ICES J. Mar. Sci. 64: 768-774.

A - Vigneau, J. & S. Mahévas. 2007. Detecting sampling outliers and sampling heterogeneity when catch-at-length is estimated using the ratio estimator. ICES J. Mar. Sci. 64: 1028-1032.

A - Woillez, M., J.-C. Poulard, J. Rivoirard, P. Petitgas & N. Bez. 2007a. Indices for capturing spatial patterns and their evolution in time, with application to European hake (Merluccius merluccius) in the Bay of Biscay. ICES J. Mar. Sci. 64: 537-550.

D - Brind’Amour, A. 2007. Functional diversity: a study on the Bay of Biscay nursery habitats. ICES CM2007/E19, 17 p.

D - Cotter, J., R. Fryer, B. Mesnil, C. Needle, D. Skagen, M.-T. Spedicato & V. Trenkel. 2007b. A review of fishery-independent assessment models, and initial evaluation based on simulated data. ICES CM 2007/O:04, 30 p.

D - Cotter, J., P. Petitgas, B. Mesnil, V. Trenkel, M.-J. Rochet, M. Woillez, J. Rivoirard, H. Bogaards, M.-T. Spedicato, G. Lembo, A. Uriarte & P. Witthames. 2007c. Manual of indicators and methods for assessing fish stocks using only fishery-independent survey-based information. ICES CM 2007/O:27, 140 p.

D - Dintheer, C. 2007a. Systèmes d'informations halieutiques. L'observatoire des ressources et des usages de l'Ifremer et intégration à la dynamique européenne de suivi des pêcheries. COMHAFAT, 49 p.

D - Drouineau, H., M. Bertignac & S. Mahévas. 2007a. A length-structured model for the European hake. Working document to ICES WGHMM, 45 p.

D - Huret, M. & P. Petitgas. 2007. Anchovy recruitment forecasting and environment. Working Document to ICES WGMHSA07, 6 p.

D - Huret, M., P. Petitgas, B. Schrum & B. Planque. 2007c. Linking anchovy and sprat distributions with bio-physical oceanographic features: a Bay of Biscay - North Sea comparison. ICES CM 2007/G: 14, 12 p.

D - Longo, C.S., M.J. Rochet, F. Colloca, G.J. Pierce, F. Serena & R. Greenstreet. 2007. Fishing effects on fish species diversity in different environmental scenarios: a comparison of case-studies in Scottish, French and Italian waters. ICES CM 2007/D:19, 9 p.

D - MacKenzie, B. & P. Lorance. 2007. MarFish: Causes and consequences of changing marine biodiversity, a fish and fisheries perspectivemaz. ICES CM 2007/E:25, 10 p.

D - Massé, J., P. Beillois, E. Duhamel, M. Huret, B. Planque, P. Petitgas & A. Biseau. 2007a. Direct assessment of anchovy by the PELGAS07 acoustic survey. Working Document to STECF Ispra, 23 p.



D - Massé, J., P. Beillois, E. Duhamel, M. Huret, B. Planque, P. Petitgas & A. Biseau. 2007b. Direct assessment of pelagic species by the PELGAS07 acoustic survey and consort commercial vessels. Working Document to ICES WGHMSA, 30 p.

D - Persohn, C., P. Lorance & V. Trenkel. 2007. Habitat preferences of selected demersal species in the Bay of Biscay and the Celtic Sea. ICES CM 2007/G:16, 20 p.

D - Petitgas, P., J.-C. Poulard, K. Radtke, M.-T. Spedicato, L. Ibaibarriaga, C.-Y. Politou, K. Korsbrekke, C. Deernberg & P. Fernandes. 2007. Comprehensive indicator-based diagnostics of fish stocks using fishery-independant survey data : the FISHBOAT report on case studies. ICES CM 2007/O:16, 33 p.

D - Prigent, M., M.-J. Rochet, J.A. Bertrand, A. Carpentier, F. Coppin, J.-P. Delpech, G. Fontenelle, E. Foucher, K. Mahé, E. Rostiaux & V. Trenkel. 2007. Comparing fishers perceptions and scientific descriptions of recent trends in the Eastern Channel ecosystem and fisheries. ICES CM 2007 / O:05, 18 p.

D - Rochet, M.-J., V. Trenkel, A. Forest, P. Lorance & B. Mesnil. 2007a. How could indicators be used in an ecosystem approach to fisheries management? ICES CM 2007/ R: 05, 15 p.

D - Rochet, M.-J., V. Trenkel, L. Gil de Sola, C.-Y. Politou, G. Tserpes & A. Bertrand. 2007b. Do population and community metrics tell the same story about recent changes in Northern Mediterranean fish communities? ICES CM 2007 / D:16, 16 p.

D - Spedicato, M.T., M. Woillez, J. Rivoirard, P. Petitgas, P.-L. Carbonara & G. Lembo. 2007. Usefulness of the spatial indices to define the distribution pattern of key life stages: an application to the red mullet ( Mullus barbatus) population in the south Thyrrhenian sea. ICES CM 2007/O:10, 15 p.

D - Trenkel, V. 2007a. A biomass random effects model (BREM) for fish stock assessment and management with application to Bay of Biscay anchovy. ICES CM 2007 /0:03, 14 p.

D - Woillez, M., J. Rivoirard, P. Petitgas & C. Deerenberg. 2007b. Selecting and combining survey-based indices of fish stocks using their correlation in time to make diagnostics of their status. ICES CM 2007/O:07, 19 p.

E - Villamor, B., P. Abaunza, P. Petitgas, J. Massé & A. Uriarte. 2007. Bay of Biscay anchovy: a resource in crisis. ICES Insight, n° 44: 16-19.

F - Dintheer, C. 2007b. La pêche de loisir en mer au cabillaud sur la façade septentrionale de la France (Manche - Mer du Nord - Zones CIEM VIIde, IVc). Rapport de l'étude pilote menée dans le cadre du règlement (CE) n° 1581/2004 34 p.

I - Bertrand, J.A., M.L. Cochard, F. Coppin, J.P. Léauté, C. Lobry, J.C. Mahé, J. Morin , J.C. Poulard, M.J. Rochet, I. Schlaich, A. Souplet, V. Trenkel & Y. Vérin. 2007. Poissons et invertébrés au large des côtes de France. Indicateurs issus des pêches scientifiques. Bilan 2004. Ifremer EMH : 07-001, 84 p.

I - Halgand, D., J.-M. Brylinski, M.-L. Cochard, F. Dagault, J. Huet, L. Lampert & D. Vincent. 2007. Surveillance écologique et halieutique du site électronucléaire de Penly : année 2006. Ifremer IFREMER/CN/EMH-07-01, 199 p.

J1 - Chene, E. & C. Dintheer. 2007. Approximation and implementation of the legislation - CAP and CFP mechanisms. Project code: TWINNING PROJECT BG 04/IB/AG/02 8p.

J1 - Dintheer, C. 2007c. 7ème session de la COMHAFAT. Compte rendu de mission. Ifremer, 13 p.

J1 - Forest, A. & M. Heral. 2007. Quatre-vingt-quatorzième réunion statutaire du Conseil International pour l’Exploration de la Mer (CIEM). Maastrich (Pays-Bas), 18 - 23 septembre 2006 et Copenhague (Danemark), 25 - 27 octobre 2006. Rapport de participation. Ifremer, 39 p.

J1 - Rochet, M.-J. 2007a. Rapport de mission au Symposium ‘The Future of fishery science in North America'. 2 p.

J3 - Lehuta, S. 2007. Evaluation de l'efficacité d'aires marines protégées pour restaurer la population d'Anchois (Engraulis encrasicolus) du Golfe de Gascogne à l'aide d'un modèle spatialisé. Diplôme d'ingénieur d'agroparistech, cursus ingénieur agronome et diplôme national de master recherche, Agro Paris Tech, 36 p.



J3 - Pau, C. 2007. Situation hydrologique printanière du golfe de Gascogne. Influence possible sur la distribution des oeufs d'anchois et de sardines lors des campagnes PELGAS 2006 et 2007. Rapport de stage de Master 1 de Biologie des Populations et des Ecosystèmes, Ifremer, 33 + annexes p.

J3 - Preuss, B. 2007. Analyse et modélisation de l’effet de réserves marines sur des peuplements de poissons coralliens. Mémoire de stage de Master 2, Ecologie de biologie de l'évolution, Ecole Normale Supérieure d'Ulm, 32 p. + annexes p.

J3 - Samedy, V. 2007. Evolution de l'organisation spatiale des petits pélagiques dans le golfe de Gascogne telle qu'observée par acoustique de 1991 à nos jours. Ifremer, 29 + annexes p.

J3 - Simon, M. 2007. Classification de cartes de peuplements: application au petits pélagiques du golfe de Gascogne. Mémoire de fin d'études, Agrocampus. Ifremer, 28 + annexes p.

J3 - Van Zyl, S. 2007. The impact of conditions at sea on the acoustic evaluation of fish abundance. Mémoire de fin d'études, Ecole centrale Nantes, 35 p.

J4 - De Laleu, C. 2007. Evolution du Bulletin des indicateurs des campagnes scientifiques. Synthèse des entretiens Ifremer/EMH/SIH, 30 p.

J4 - Fromentin, J.-M., B. Planque & O. Thébaud. 2007. L'approche écosystèmique des pêches : quelles priorités pour la recherche ? Ifremer, 39 p.

J4 - Mesnil, B. & P. Petitgas. 2007. Statistical process control (SPC) schemes for indicator-based assessments. Manuel pour les projets FISBOAT et IMAGE. 30 p.

J4 - Pelletier, D. & S. Mahévas. 2007. Rapport d’avancement du projet Isis-Fish. 33 p.

L - Lorance, P. 2007. Ecologie des poissons profonds, des individus aux peuplements. Doct. UBO, Océanol. biol., Ecole doctorale des Sciences de la Mer, Université de Bretagne Occidentale, 129 p +annexes p.

L - Pecquerie, L. 2007. Modélisation bioénergétique de la croissance, du développement et de la reproduction d'un petit pélagique : l'anchois du golfe de Gascogne. Doct. Agrocampus Rennes, mention : Halieutique, Agrocampus Rennes/Ifremer, 235 p.

P1 - Trenkel, V. 2007b. Organisation du groupe de travail CIEM Fish Ecology.

P2 - Berger, A., V. Mazauric & V. Trenkel. 2007. Description of the new acoustic platform of FRV “Thalassa” to address the challenges of biomass estimate of the mixed pelagic community in the bay of Biscay. ICES WGFAST,

P2 - Drouineau, H., S. Mahévas & M. Bertignac. 2007b. A length-structured and spatialised assessment model for the Northern stock of European hake (Merluccius merluccius). ICES CM 2007 / O26,

P2 - Drouineau, H., D. Pelletier, S. Mahévas & M. Bertignac. 2007c. A length-structured and spatialised model - application to the Northern stock of hake. Paper presented to the ICES Annual Science Conference 2007, Helsinki 11

P2 - Forest, A. 2007. Présentation résultats ACFM mai 2007 - CNPMEM. Ifremer/CIEM,

P2 - Hermant, M., Y. Désaunay, C. Lobry, J.-C. Poulard & O. Le Pape. 2007. Influence de la variabilité climatique et du réchauffement global sur les populations ichtyologiques dans le Golfe de Gascogne. Paper presented to the 8 ème

forum Association Française d' Halieumétrie, La Rochelle, 19-21 juin 2007,

P2 - Kraus, G., D. Pelletier, J. Dubreuil, C. Moellmann, H.H. Hinrichsen & Y. Vermard. 2007. A model-based evaluation of the performance of Marine Protected Areas as a fishery management measure for a stock facing strong environmental variability - the example of Eastern Baltic cod (Gadus morhua callarias). Paper presented to the European Symposium on Marine Protected Areas as a Tool for Fisheries Management and Ecosystem Conservation, Murcia, 25-28th September,



P2 - Le Floc'h, P., J.-C. Poulard, O. Thébaud, F. Blanchard, J. Bihel & F. Steinmetz. 2007. Analyzing the potential economic impacts of long-term changes in marine fish communities: the case of French fisheries in the Bay of Biscay. In 8ème forum Association Française d'Halieumètrie. La Rochelle, 19-21 juin 2007.

P2 - Lehuta, S., S. Mahévas & P. Petitgas. 2007a. Evaluation de l’effet d’aires marines protégées pour restaurer la population d’Anchois (Engraulis encrasicolus) du Golfe de Gascogne à l’aide d’un modèle spatialisé. Paper presented to the 8ième forum Association Française d'Halieumètrie, La Rochelle, 19-21 juin 2007,

P2 - Lehuta, S., S. Mahévas, P. Petitgas & D. Pelletier. 2007b. Investigating the impact of MPA on the Bay of Biscay Anchovy fishery. Paper presented to the European Symposium on Marine Protected Areas as a Tool for Fisheries Management and Ecosystem Conservation, Murcia, 25-28th September 2007,

P2 - Lobry, J., F. Le Loc’h & N. Niquil. 2007. Les compartiments-clés et les compartiments structurants du Golfe de Gascogne. Une approche par modélisation trophique. Paper presented to the 8 ième forum Association Française d'Halieumétrie, La Rochelle, 19-21 juin 2007,

P2 - Lorance, P. & B.R. MacKenzie. 2007. Causes and consequences of changing marine biodiversity, a fish and fisheries perspective. Paper presented to the MarBEF General Assembly, Sopot, Pologne, 14-16 Mai 2007,

P2 - Mahévas, S. 2007. Analyse de sensibilité et plan d’expérience pour proposer un diagnostic d’impact d’Aires Marines Protégées avec ISIS-Fish. . Paper presented to the Journées de la modélisation du CEMAGREF, Clermond-Ferrand, 27-28 novembre 2007,

P2 - Mahévas, S. & D. Pelletier. 2007. Elaborating reliable quantitative diagnostics of the impact of Marine Protected Areas on fisheries using ISIS-Fish. Paper presented to the European Symposium on Marine Protected Areas as a Tool for Fisheries Management and Ecosystem Conservation, Murcia, 25-28th September,

P2 - Mazauric, V., L. Berger & V. Trenkel. 2007. Preliminary results with the acoustic platform of FRV “Thalassa” combining single vertical echo-sounders and the new scientific multibeam echo-sounder ME70. ICES WGFAST,

P2 - Pascal, N., F. Maynou, D. Pelletier, S. Mahévas & J. Ferraris. 2007. A bioeconomic approach to assess the design and impacts of small size marine protected areas using the ISIS-Fish model: the case of Solea vulgaris and Lithognathus mormyrus artisanal fisheries in Garraf (Spain, NW Mediterranean). Paper presented to the European Symposium on Marine Protected Areas as a Tool for Fisheries Management and Ecosystem Conservation, Murcia, 25-28th September,

P2 - Perry, R.I., B. Planque, S. Jennings, K.M. Brander, P. Cury & C. Möellmann. 2007. Sensitivity of marine systems to climate change and fishing: concepts, issues and management responses. Paper presented to the PICES Annual Meeting, Victoria, BC (Canada), 26 oct.-5 nov.,

P2 - Rochet, M.-J. 2007. Why and how could indicators be used in an ecosystem approach to fisheries management? In AIFRB 50th Anniversary Symposium "The Future of Fishery Science in North America". Seattle, USA, February 2007.

P2 - Rochet, M.J. 2007. Evolution et plasticité des traits démographiques dans les populations exploitées: avons-nous franchi le point de non-retour? . Paper presented to the 8 ième forum Association Française d'Halieumètrie, La Rochelle, 19-21 juin 2007,

P2 - Rochette, S., J. Lobry, M. Lepage & P. Boet. 2007. Inverse matrix: an alternative of Ecopath With Ecosim to test interactions between species in the Gironde estuary (France). Paper presented to the The 6th European Conference on Ecological Modelling "Challenges for ecological modelling in a changing world: Global Changes, Sustainability and Ecosystem Based Management", Trieste, Italy,

P2 - Rocklin, D., D. Mouillot, J.M. Culioli, M.C. Santoni, J.A. Tomasini & D. Pelletier. 2007. Changes in the functional structure of landings reveal bottlenose dolphin’s (Tursiops truncatus) impact on artisanal fisheries in the Bonifacio Strait Natural Reserve (Corsica, France), (Poster). Paper presented to the European Symposium on Marine Protected Areas as a Tool for Fisheries Management and Ecosystem Conservation, Murcia, 25-28th September,

P2 - Trenkel, V.-M. & M.-J. Rochet. 2007. Une approche non-paramétrique pour caractériser les changements récents dans les séries temporelles d'indices de population. Paper presented to the 8 ième forum Association Française d'Halieumètrie, La Rochelle, 19-21 juin 2007,



P2 - Trenkel, V., C. Scalabrin, L. Berger & V. Mazauric. 2007. Impact of beam angle on shoal structure and energy measurements: comparison of simulation results with data from new multibeam echosounder (ME70). ICES WGFAST, 17 p.

P2 - Uiblein, F. & P. Lorance. 2007. Deep-sea fish behavioral responses to disturbance by underwater vehicles. Paper presented to the Oceans 2007, Vancouver, Canada, 29 septembre - 4 octobre 2007,

Q1 - Anonyme (dontP. Lorance). 2007. Réponse à AO 7ème PCRD, Activity 6.2. Sustainable management of resources Sub-activity 6.2.2. Management of marine environments, Topic: ENV.2007.2.2.1.3. Habitat-marine species interactions in view of ecosystem based management in the deep-sea.

Q2 - Trenkel, V. 2007. Proposition de projet ANR: Diversité marine, changements spatio-temporels sous pressions anthropiques et environnementales et détectabilité des espèces (ESDIVHAL).



ANNE XES DU RAPPORT D’EVAL UAT ION

Annexe 1 : Personnels Ifremer : Cadres en 2004 avant réorganisation 2005

Annexe 2 : Personnels Ifremer : Cadres de 2005 à 2007 après réorganisation 2005

Annexe 3 : Personnels Ifremer : Techniciens, Administratifs en 2004, avant réorganisation 2005

Annexe 4 : Personnels Ifremer : Techniciens, Administratifs de 2005 à 2007 après réorganisation 2005

Annexe 5 : Accueil de personnels permanents d’autres organismes

Annexe 6 : Personnels titulaires d’un contrat Ifremer à durée déterminée(Techniciens, Administratifs, Cadres)

Annexe 7 : Doctorants

Annexe 8 : Post-Doctorants

Annexe 9 : Stagiaires

Annexe 10 : Infrastructure - Equipements

Annexe 11 : Campagnes / essais à la mer, essais en bassins, embarquements

Annexe 12 : Formations données (cours magistraux, TP / TD, etc.)

Annexe 13 : Formations non « diplômantes » suivies par les membres des unités et services.


Rapport d'Evaluation des Unités Thématiques en 2008- Annexe 1 -

Personnels Ifremer : Cadres en 2004 - ECOHAL

Nom de l’unité en 2004 : ECOHAL

1. Effectifs (au 31/12/2004)

Nombre : 11

Compétences - Activité principale

Nom/Prénom Age Dernier diplôme - année(DEA, Thèse, HDR, autres)

Chercheur Ingénieur

BERGERON Jean-Pierre 56 DEA (1973) océanologie - biochimie

BERTRAND Jacques 54 DEA (1977) écologie halieutique

DESAUNAY Yves 57 DEA (1971) écologie halieutique

HALGAND Daniel 56 Maîtrise sciences naturelles (1977) biologie (50 %)*

LE PAPE Olivier 37 Doctorat (1996) écologie halieutique

MARTIN Jocelyne 52 Ingénieur (1974) biologie - systématique

MASSE Jacques 53 Bac maths sciences naturelles (1970) écologie halieutique

PETITGAS Pierre 42 Doctorat (1991) géostatistiquesécologie halieutique

PLANQUE Benjamin 35 Doctorat (1996) océanologie (91,43 %)écologie halieutique

POULARD Jean-Charles 56 Maîtrise de sciences (1978) écologie halieutique

WOEHRLING Daniel 57 Maîtrise biologie animale (1972) écologie halieutique

* 50% Ecohal, 50 % délégations du personnel



Personnels Ifremer : Cadres en 2004 - MAERHA

Nom de l’unité en 2004 : MAERHA

1. Effectifs (au 31/12/2004)

Nombre : 7


Nom/Prénom Age Dernier diplôme - année(DEA, Thèse, HDR, autres)


BELIAEFF Benoît 43 Doctorat (1992) sciences de l’environnement biostatistiques

FOREST André 57 Doctorat (1974) halieutique

MAHEVAS Stéphanie 33 Doctorat (1997) mathématiques modélisation (91,43 %)

MESNIL Benoît 55 DEA (1973) Halieutique - modélisation

PELLETIER Dominique 40 Doctorat (1991) halieutique - biostatistiques modélisation (80 % jusqu’au 12.11.200491,43 % à/c du 13.11.2004

ROCHET Marie Joëlle 41 Doctorat (1991) écologie – modélisation(91,43 %)

TRENKEL Verena 37 Doctorat (1998) écologie biostatistiques modélisation



Personnels Ifremer : Cadres de 2005 à 2007

Nom de l’unité : (après la réorganisation de janvier 2005) : Département Ecologie et Modèles pour l’Halieutique

Effectifs au 31/12/2007 :

Nombre : 16


Nom/Prénom Age Dernier diplôme - année (DEA, Thèse, HDR,

autres)


BERGERON Jean-Pierre 59 DEA (1973) océanologie - biochimie

BRIND’AMOUR Anik 35 Doctorat (2005) biologie

DINTHEER Christian 53 Ingénieur (1977) halieutique

FOREST André 60 Doctorat (1974) halieutique

HALGAND Daniel 59 Maîtrise (1977) biologie (50 %)

HURET Martin 30 Doctorat (2005) océanographie

LORANCE Pascal 50 Doctorat (2007) écologie halieutique

MAHEVAS Stéphanie 36 Doctorat (1977) mathématiques modélisation (91,43 %)

MARTIN Jocelyne 55 Ingénieur (1974) biologie - systématique

MASSE Jacques 56 Bac maths et sciences de la nature (1970)

écologie halieutique

MESNIL Benoît 58 DEA (1973) halieutique - modélisation

PETITGAS Pierre 45 Doctorat (1991) géostatistiquesécologie halieutique




Nom/Prénom Age Dernier diplôme - année (DEA, Thèse, HDR,

autres)


PLANQUE Benjamin 38 Doctorat (1996) océanologie – biologie (91,43 % jusqu’au 30.11.2005)

POULARD Jean-Charles 59 Maîtrise de sciences (1978) sciences

ROCHET Marie-Joëlle 44 HDR (2007) écologie-modélisation (91,43 %)

TRENKEL Verena 40 HDR (2007) écologie - biostatistiques modélisation

2. Mouvements (entre 2004 et 2007) : recrutement et mobilité interne

Dates Arrivées Dates Départs Nom/Prénom Age

03.07.2006 ANTOINE Loïc 58

01.01.2005 BELIAEFF Benoît 43

11.09.2007 BERTRAND Jacques 57

01.01.2007 BRIND’AMOUR Anik 35

05.12.2007 DESAUNAY Yves 60

01.01.2005 DINTHEER Christian 53

01.12.2006 HURET Martin 30

01.12.2004 LE PAPE Olivier 40

03.07.2006 LORANCE Pascal 50

01.09.2006 PELLETIER Dominique 43

31.12.2007 PLANQUE Benjamin 38

30.11.2007 WOEHRLING Daniel 60



Personnels Ifremer : Techniciens, Administratifs en 2004 - ECOHAL

1. Effectifs au 31/12/2004

Nombre : 5

Compétences - Activité

Nom/Prénom Age Dernier diplôme - année Technicien Administratif

BEILLOIS Pierre 56 BAC D (1968) acoustique

BOURRIAU Paul 45 DUT (1980) biologie

DEJOUY Cathy 33 BAC PRO (1977) gestion de données(91,43 %)

GEFFROY Isabelle 41 BEP (1980) secrétariat (80%)

GRELLIER Patrick 45 BEP agriculture (1977) otolithométrie larvaire



Personnels Ifremer : Techniciens, Administratifs en 2004 - MAERHA

1. Effectifs au 31/12/2004

Nombre : 2


Nom/Prénom Age Dernier diplôme - année Technicien Administratif

BERTHELE Olivier 34 BTS informatique industrielle (1996)

informatique (91,43 %)

MAISONNEUVE Christine 39 BAC B (1984) secrétariat (91,43 %)



Personnels Ifremer : Techniciens, Administratifs de 2005 à 2007

Effectifs (après la réorganisation de janvier 2005) au 31/12/2007 :

Nombre : 8


Nom/Prénom Age dernier diplôme - année Technicien Administratif

BEILLOIS Pierre 59 BAC D (1968) acoustique

BERTHELE Olivier 37 BTS (1996) informatique (91,43 %)

BOURRIAU Paul 47 DUT (1980) biologie

COMTE Anne 54 CAP (1970) gestion administration

DEJOUY Cathy 36 BAC PRO (1977) traitements de données(91,43 %)

GEFFROY Isabelle 44 BEP (1980) gestion administration(80 %)

GRELLIER Patrick 48 BEP (1977) otolithométrie larvaire

VENEREAU Christine 41 BAC PRO (1992) gestion administration (91,43 %)

2. Mouvements (entre 2004 et 2007) : recrutement et mobilité interne

Dates arrivées Dates départs Nom/Prénom Age

18.10.2004 CASSOU Yvette 52

01.01.2005 COMTE Anne 54

01.01.2005 MAISONNEUVE Christine 42

01.01.2005 VENEREAU Christine 41


Rapport d'Evaluation des Unités Thématiques en 2008- Annexe 5-

Accueil de personnels permanents d'autres organismes (y compris étrangers) au cours de la période évaluée (2004 – 2007)

Nombre : 0

Nom/Prénom Age Diplôme Année

Date d'entrée Date de sortie Organisme d'origine Nature de l'activité Convention*

Observations : n’ont pas été comptabilisées les visites de courte durée de chercheurs étrangers

* Préciser s’il y a, ou non, une convention liant l’organisme d’origine du chercheur et l’Ifremer et la nature de la convention.Ifremer / CST Janvier 2008 66


Personnels ti tulaires d’un contrat Ifremer à durée déterminée(Techniciens, Administratifs , Cadres) (2004 – 2007)

Nombre : 24

Nom/Prénom Age Statut(Préciser : T, A,

Cadre)

Date début et fin de séjour

Origine du financement du

contrat(Ifremer,

extérieur :à préciser)

Objet du contrat

HOLLEY Jean-François 28 cadre 01.06.2004 au 31.08.2004

Ifremer Remplacement Stéphanie MAHEVAS pendant son congé maternité

LOBRY Jérémy 30 Cadre 01.03.2005 au 31.12.2007

Ifremer remplacement Olivier LE PAPE en congé sans solde

BROUSMICHE Estelle 29 Technicien 24.10.2005 au 31.12.2005

Ifremer surcroît d’activité

LAFFARGUE Pascal 31 Cadre 01.10.2005 au 31.12.2005


MEHAULT Sonia 26 Cadre 19.10.2005 au 31.12.2005


OLLITRAUT Anthony 33 Technicien 17.10.2005 au 23.12.2005

Extérieur CNPMEM

surcroît d’activité

VERMARD Youen 27 Cadre 16.05.2005 au 13.07.2005


VERMARD Youen 27 Cadre 19.09.2005 au 17.04.2006



Cadre)



contrat

Objet du contrat



(Ifremer, extérieur :à préciser)

BADTS Vincent 33 Cadre 06.11.2006 au 31.12.2007


GOARANT Anne 23 Cadre 27.01.2006 au 26.06.2006


GOARANT Anne 23 Cadre 11.09.2006 au 22.03.2007


LAFFARGUE Pascal 32 Cadre 13.03.2006 au 29.06.2006


MEHAULT Sonia 27 Cadre 24.04.2006 au 23.06.2006


MERZEREAUD Mathieu 23 Cadre 02.11.2006 au 28.02.2007

Extérieur surcroît d’activité

MOUMOUNI Kairou 30 Cadre 01.04.2006 au31.07.2006


BASTARDIE François 30 Cadre 16.04.2007 au 15.06.2007


CASTAGNE Laurent 30 Cadre 01.06.2007 au 30.11.2007


DE LALEU Célia 40 Technicien 05.03.2007 au 13.07.2007


DE LALEU Célia 40 Technicien 05.11.2007 au 07.12.2007

Ifremer : Intérimaire



Cadre)



contrat(Ifremer,

extérieur :à préciser)

Objet du contrat

DEMAY Jessica 21 Administratif 22.10.2007 au 30.11.2007

Ifremer : intérimaire




DUBREUIL Julien 26 Cadre 15.01.2007 au 15.07.2007


DUBREUIL Julien 26 Cadre 01.10.2007 au 31.01.2008


LEHUTA Sigrid 24 Cadre 01.08.2007 au 31.10.2007



PECQUERIE Laure 29 Cadre 12.11.2007 au 22.12.2007


Surcroît d’activité



Doctorants

Nombre de doctorants au 01/01/2008)

4

Nom/Prénom Age Dates de début et fin de séjour à

l’Ifremer

Sources de financements éventuelles

(Ifremer : 100%, 50% - Autres : préciser) Statut (Ifremer,

autres)

Co-Encadrant Ifremer

Directeur de la Thèse

Sujet de thèse

(mots-clés)

Ecole doctorale française de

rattachement

ThèsesCo-tutelle

REECHT Yves 29 03.11.2005 au 02.11.2008

100% Eur-Oceans V. TRENKEL M.J. ROCHET Indicateurs de l’effet de la pêche sur la structure et la dynamique des réseaux trophiques marins

UBO Brest CEFASLowestoft , Suffolk NR33 OHT UK

PERSOHN Cécile

26 02.11.2006 au 01.11.2010

50 % Région Pays de la Loire50 % Ifremer

P. LORANCE V. TRENKEL Sensibilité des populations de poissons démersaux à la pêche et au changement climatique en fonction des stratégies vitales des espèces

UBO Brest

ROCKLIN Delphine

26 02.11.2006 au 01.11.2010

50 % Office de l’Environnement de la Corse

D. PELLETIERD. MOUILLOT (Université Montpellier 2)

Des modèles et des indicateurs pour évaluer les performances d’Aires Marines Protégées pour la gestion des écosystèmes côtiers : application à la réserve naturelle des Bouches de Bonifacio

Université de Montpellier II

Université Montpellier 2co-responsableJ.M. CULIOLI (Corse)




l’Ifremer

Sources de financements éventuelles

(Ifremer : 100%, 50% - Autres : préciser) Statut (Ifremer,

autres)



Sujet de thèse

(mots-clés)

Ecole doctorale française de

rattachement

ThèsesCo-tutelle

LEHUTA Sigrid 25 01.11.2007 au 31.10.2010

50 % Région Pays de La Loire50 % UE-Uncover

S. MAHEVASP. PETITGAS

D. PELLETIER Evaluation de l'impact d'aires marines protégées sur la dynamique de pêcheries mixtes : développement d'indicateurs et application à la pêcherie pélagique du golfe de Gascogne

Agrocampus Rennes

Néant

Nombre de Doctorants ayant soutenu entre 2004 et 2007

4




l’Ifremer -------

Date de soutenance

Sources de financements

éventuelles(Ifremer : 100%, 50%

- Autres : préciser) Statut (Ifremer,

autres)



Ecole doctorale de rattachement

Sujet de thèse

(mots-clés)

Devenir du Doctorant après la

soutenance

ThèsesCo-tutelle

VILLALOBOS Hector (Mexicain)

1.10.2002. au 30.08.2006soutenance février 2008

Bourse mexicaine, En accueil à Ifremer/EMH

Jacques MASSE

E. Josse, IRDEcole doctorale des Sciences de la mer /Brest

Evolution de l’écosystème pélagique du golfe de Gascogne, conséquences sur la capturabilité des espèces

Enseignant chercheur au Mexique

CLAUDET Joachim

29 15.11.2002 au 28.02.2006soutenance janvier 2006

CNRSRégion Languedoc-RoussillonEn accueil à Ifremer/Maerha et EMH

Dominique PELLETIER

Serges PLANESUniversité de Perpignan

Développement de méthodes statistiques et d’indicateurs pour évaluer l’impact de récifs artificiels et de zones marines protégées sur les peuplements de poissons

Post-doc en Italie, Université du Salento

GUYOMARD David

33 01.11.200415.04.2005soutenance mars 2005

Palangre La Réunion

Dominique PELLETIER

Analyse de la pêcherie à l’espadon à l’Ile de la Réunion

PECQUERIE Laure

29 01.12.2004 au 30.11.2007soutenance le 17.12.2007

1/3 Ifremer1/3 Fisboat1/3 Région Pays de la Loire

Pierre PETITGAS

Cédric BACHER

Agrocampus Rennes

Modélisation bioénergétique de la croissance, du développement et de la reproduction d’un petit pélagique : l’anchois du golfe de Gascogne

Post-doct Université Californie Santa-Barbara UC SB



Post-Doctorants accueil l is entre le 01/01/2004 et le 31/12/2007

Nombre : 4

Nom/Prénom Age Diplôme -Année

Date de début et fin de séjour à

l’Ifremer

Origine du financement

(Ifremer, autre)

Statut (Ifremer, autre)

Nature de l'activité Convention*

GUILBAUD Thérèse 30 Doctorat (2002) 01.11.2004 au 30.10.2005

50% Ifremer50 % Pays de la Loire

Ifremer Optimisation multicritère pour la gestion des pêches

Région Pays de la Loire

LE LOCH François 30 Doctorat (2004) 02.12.2004 au 31.07.2005

50 % Ifremer50 % Pays de la Loire

Ifremer Relation entre panache fluvial et nourriceries de poisson

Région Pays de la Loire

BASTARDIE François 30 Doctorat (2004) 22.09.2005 au 21.03.2007

100 % Efimas Ifremer Analyses de scénarii de gestions pour la pêche démerso benthique du plateau celtique du Golfe de Gascogne

PEYRONNET Arnaud 33 03.01.2006 au 30.06.2007

50 % Ifremer50 % CAFE

Ifremer Analyse de scénarios de gestion pour la pêcherie démerso benthique du plateau celtique et du golfe de Gascogne

Observations :

* Préciser s’il y a, ou non, une convention liant Ifremer à un autre organisme.Ifremer / CST Janvier 2008 73


Stagiairesaccueillis entre le 01/01/2004 et le 31/12/2007

Nombre : 38

Nom/Prénom Age Dates début et fin de séjour Sources de financement

éventuelle

(Ifremer : 100%, 50% - Autres : préciser)

Encadrant Ifremer

Diplôme préparé Thème du stage Ecole, Université, Autres (Préciser)

VETTORETTI Alice

25 01.02.2004 au 30.06.2004

Ifremer S. MAHEVAS DEA océanobiologie

Estimation des para-mètres d’un modèle de dynamique de population structuré en longueur

Université Paris VI Pierre et Marie Curie

BELLIER Edwige

26 02.02.2004 au 13.08.2004

Ifremer B. PLANQUE DESS sciences naturelles

Fluctuations historiques de l’ichthyoplancton dans le golfe de Gascogne : étude des distributions d’anchois et de sardine de 1967 à nos jours

UniversitéBordeaux I

BOUJU Vincent 26 10.05.2004 au 18.06.2004

Ifremer D. HALGANDB. PLANQUE

Maîtrise biologie Régime alimentaire des espèces côtoyant l’anchois. Interactions entre les poissons présents dans l’écosystème pélagique du Golfe de Gascogne

UniversitéLa Rochelle




éventuelle


Encadrant Ifremer


DELALANDE Chloé

21 26.04.2004 au 30.09.2004

Ifremer J. MASSE DUT génie biologie Caractérisation des bancs de poissons pélagiques par acoustique : classification à partir de paramètres descripteurs morphologiques, bathymétriques et énergétiques

Intechmer Cherbourg

HEYDEMULLER Béatrice

23 03.05.2004 au 18.06.2004

Ifremer P. PETITGAS J. MASSE

Maîtrise Les modèles écosystémiques applicables en halieutique : synthèse bibliographique de modèles existants et leurs applications actuelles. Applicabilités dans le cadre des campagnes PELGAS

Université Paris VI Pierre et Marie Curie

LEBRETON Benoît

22 10.05.2004 au 18.06.2004

Ifremer J. MASSE Maîtrise biologie Régime alimentaire des espèces côtoyant l’anchois. Interactions entre les poissons présents dans l’écosystème pélagique du Golfe de Gascogne


MARTIN Séverine

21 05.04.2004 au 18.06.2004

Ifremer Y. DESAUNAY DUT génie biologique

Evolution des communautés halieutiques de la partie côtière du golfe de Gascogne au cours des 25 dernières années

IUTLa Roche sur Yon

BOCQUENE Anaïs

20 20.06.2005 au 24.06.2005

Ifremer S. MAHEVAS DEUG biologie Echelle d’analyse et de gestion des pêches.

Université Nantes


éventuelleEncadrant

IfremerDiplôme préparé Thème du stage Ecole, Université,

Autres (Préciser)




DELAUNAY Damien

23 04.04.2005 au 31.05.2005

Ifremer J. MASSE Licence Structure démographique et maturité sexuelle de la sardine au printemps dans le Golfe de Gascogne. Etude bibliographique et observations au cours de la campagne d’écho-intégration PEGAS 05 à bord du N/O « Thalassa ».

UBS Vannes

DENT Jennifer 23 09.05.2005 au30.08.2005

Ifremer V. TRENKEL Master 1ère année Analyse des données – campagne « VITAL »

University of York, United Kingdom

DUPONT Nicolas

25 01.02.2005 au 31.07.2005

Ifremer B. PLANQUE Master 2ème année Etude de la structure en taille de la communauté du Golfe de Gascogne à l’aide d’un capteur laser de particules in-situ

Université Paris VI

GOARANT Anne

25 11.05.2005 au30.12.2005

ENSAT P. PETITGAS Ingénieur Distribution 3D de la ponte des anchois et sardines dans le Golfe de Gascogne.

ENSAT

JARRY Etienne 23 17.05.2005 au 13.07.2005

Ifremer J. MASSE Master 1ère année Campagne PELGAS – Evolution du peuplement de poissons pélagiques (sardine, anchois, chinchard, sprat) du Golfe de Gascogne au printemps de 2000 à 2005.

UCO Angers

LAASRI Adam 01.04.2005 au30.09.2005

IRD Perpignan D. PELLETIER Master 2ème année Analyse de données IRD Perpignan


éventuelle


Encadrant Ifremer


LOREC Amélie 24 01.05.2005 au 31.07.2005

Ifremer P. PETITGAS Distribution 3D de la ponte des anchois et sardines dans le

Université Bordeaux I



Golfe de Gascogne estimée en combinaison des données et un modèle.

NASSIET Cécile

23 11.04.2005 au 20.05.2005

Ifremer Y. DESAUNAY Licence Documentation sur l’état et l’évolution des pêcheries côtières


PREUSS Bastien

01.02.2005 au30.06.2005

IRD Perpignan D. PELLETIER Master 1ère année Modélisation de la dynamique des ressources de mer Celtique.

IRD Perpignan

REYDEL JULIEN

26 11.01.2005 au 25.02.200513.06.2005 au 01.07.2005

Ifremer B. PLANQUE Master 1ère année Analyse de la distribution spatiale du meso-zooplancton en sub-surface dans le Golfe de Gascogne.

Université Nantes

REYDEL JULIEN

26 03.05.2005 au 17.05.2005

Ifremer J. MASSE Master 1ère année Campagne à la mer Université de Nantes

TUFFERY CHRISTOPHE

40 21.11.2005 au 29.09.2006

IHT Nantes S. MAHEVAS J.P. BERTHOME

Formation MARPEQ

Conception et mise en oeuvre d’un système de management de la qualité pour le réseau d’observation des ressources halieutiques.

IHT Nantes

BARBEYCAROLINE

24 15.04.2006 au30.05.2006

Ifremer B. PLANQUE Master 1 Structure spatiale des communautés zooplanctoniques du Golfe de Gascogne.



éventuelle


Encadrant Ifremer


BOURDEIX JEAN-HERVÉ

27 24.04.2006 au 5.09.2006

Ifremer S. MAHEVAS DUT Lien entre la taille, l’âge, la maturité sexuelle de la sardine et de l’anchois et leur organisation spatiale.

Intechmer Cherbourg

BRUGALEELSA

21 10.04.2006 au17.06.2006

Ifremer M.J. ROCHET DUT Comparaison des peuplements halieutiques à

IUTLa Roche sur Yon



long terme sur deux sites ponctuels qui sont des zones d’extraction de granulats dans l’estuaire externe de La Loire.

BUFFAZ LAURE

26 01.02.2006 au31.07.2006

Ifremer J. MASSE Master 2 Indices hydroclimatiques à méso-échelle dans le Golfe de Gascogne, liens avec le recrutement de l’anchois.


CAVE Magali

24 14.03.2006 au01.10.2006

Agrocampus Rennes S. MAHEVASD. PELLETIER

Ingénieur Isis/langoustine Agrocampus Rennes

CREVONMarianne

23 01.02.2006 au30.06.2006

INSA Lyon J. MASSE Ingénieur Elaboration d’un outil pour calcul d’indicateurs d’impact de la pêche à partir de la base de données des campagnes de pêches scientifiques.

INSA Lyon

DELAUNAYDamien

23 29.04.2006 au16.06.2006

Ifremer P. PETITGAS Master 1 Etude du régime alimentaire de 3 espèces proches de petits poissons pélagiques dans le Golfe de Gascogne : anchois, sardine et sprat, à partir des observations réalisées au cours de la campagne PELGAS06 du N/O Thalassa.



éventuelle


Encadrant Ifremer


FARGIERLuc

30 06.02.2006 au30.07.2006

IRD Montpellier P. PETITGAS Master 2 Modélisation de la pêcherie de sar dans la réserve de Bonifacio

IRD Montpellier

KOSTECKI Caroline

25 24.04.2006 au 30.06.2006

Ifremer J. MASSE Master 1 Caractérisation par acoustique multi-fréquences des communautés de petits pois-sons pélagiques dans le golfe de Gascogne.


LEHUTA 22 09.01.2006 au Ifremer P. PETITGAS Ingénieur Simuler la dynamique de la INA P-G



Sigrid 31.07.2006 pêcherie pélagique anchois du Golfe de Gascogne avec ISI-FISH2.0

Paris-Grignon

MOUCANVanessa

22 12.12.2005 au15.06.2006

UFR Tours P. PETITGAS Master 2 Rôle des vieux adultes dans le maintien des populations marines et la colonisation de nouveaux habitats.

UFR Tours

SAVEVirginie

25 02.02.2006 au30.06.2006

IRD Montpellier D. PELLETIER Master 2 Evaluation de scénarios de restauration de la langouste en mer d’Iroise

IRD Montpellier

LEHUTA Sigrid 25 08.01.2007au 07.07.2007

INAPG Paris-Grignon S. MAHEVAS Ingénieur Développement d’une méthode d’analyse comparative de scénarios de gestion pour la pêche de l’anchois du Golfe de Gascogne

INAPGParis-Grignon




éventuelle


Encadrant Ifremer


PAU Cédric 23 23.04.2007au 31.07.2007

Ifremer M .HURET Master 1 Situation hydrologique printanière du golfe de Gascogne. Influence possible sur la distribution des oeufs d'anchois et de sardines lors des campagnes PELGAS 2006 et 2007

Université Angers

SAMEDY Valérie

22 16.04.2007 au15.09.2007

Ifremer J. MASSEP. PETITGAS

Master 1 Evolution de l’organisation spatiale du chinchard dans le golfe de Gascogne telle qu’observée par acoustique de 1990 à nos jours

UBO Brest

SIMON Maxilien

22 01.03.2007 au 31.08.2007

Ifremer P. PETITGASJ. MASSE

Ingénieur Cartographie des habitats de poissons pélagiques et liens avec l’environnement.

ENSAR Rennes

VAN ZYL Stéphane

24 02.04.2007 au30.06.2007

Ifremer V. TRENKEL Ingénieur Etude de l’impact des conditions de mer sur l’évaluation de la biomasse des poissons par méthode acoustique

Ecole Centrale Nantes



Infrastructures - Equipements

dont dispose l’Unité*

Type d'infrastructures et d’équipements Annéede construction

d'acquisition

Coût

> 50 000 euros

Taux d'utilisation Partage avec d'autres équipes

3 serveurs Sun sous Unix

1 serveur Sun sous Linux

PC et portables

Logiciels d’analyses statistiques (S+, R, MathLab,Mathematica, SPAD, SAS, …

Logiciels spécifiques : MOVIES (gestion et analyse d’image acoustique)

2 bathysondes

1 sondeur acoustique portable

2 filets à plancton

1 filet multinet

1 chalut à perche

1 colonne de densité

annexes auxquelles les experts devront se reporter pour chaque point important.

* Indiquer uniquement les infrastructures spécifiques (bassins, bâtiments d'expérimentations, ...) et les principaux équipements. Un descriptif détaillé n'est pas nécessaire, car les experts visiteront les installations et évalueront alors la nature et l'importance de ces infrastructures.



Campagnes / essais à la mer, essais en bassins, embarquements *

Légende : =Chef de missionPGB01 : Dynamique et santé des écosystèmes côtiers et estuariens PGB03 : Surveillance et evaluation de la qualité et de la biodiversité des milieux et des eaux côtières PGD01 : Systèmes d’information, économie et diagnostic de l’exploitation et de l’évolution des ressources et de leur usagePGD02 : Démarche écosystémique pour une gestion intégrée des ressources halieutiques

Campagnes ou essais

2004

Programme Noms Dates Zone géographique Navires et ou Equipements et ou engins concernés

Thème(s) d’étude(s)

MERTAIL PGD02/Approche intégrée G. de Gascogne

V. Trenkel, M.-J. Rochet S. Mahévas

10j26 juillet au 4 août

Grande Vasière du golfe de Gascogne

Navires professionnelsCôte de la Manche et Gwenvidik

Tester de nouveaux outils d'observation visuelle pour une évaluation directe de la taille des animaux et de leur abondance. Espèce cible : la langoustine.

- Organisée par l’IMR Bergen Norvège

V. Trenkel 13-24 avril 2004 Mer du Nord G.O. Sars Dans le cadre de son séjour au laboratoire "Observation methodology" de l'IMR Bergen (Norvège) 1 février au 30 juin 2004 financé par l'Ifremer.

PELGAS PGD01 J. Masse 26j 27/4-25/5

Golfe de Gascogne N/o Thalassa Etude du système pélagique Gascogne ; évaluation biomasses d’anchois et de sardines par acoustique et chalutages pélagiques associés.

SIMFAMIProgramme européen

PGD02/Approche intégrée G. de Gascogne

J. Masse 6j 26/5-2/6

Golfe de Gascogne N/o Thalassa Méthodes d’identification des espèces par acoustique multifréquence

NURVIL PGD02/Approche intégrée G. de Gascogne

Y. Desaunay 10j 13-23/9

Baie de la Vilaine N/o Gwen Drez Suivi fonction nourriceries Etude relations trohiques entre benthos et poissons juvéniles espèce cible : la sole . Description de l’ichtyofaune

PECOS PGD02/Approche intégrée G. de

Y. Desaunay O. Le Pape

10 j Baie de la VilaineBaie de Quiberon

N/o Gwen Drez Etat des ressources halieutiques côtières

* Préciser la durée, le programme et l'intitulé de la campagne et des essais, le nombre d'homme/mois par campagne, le chef de mission, l'exploitation qui a été faite des données collectées lors de la campagne et des essais (en référence aux critères de production scientifique cités au §3) – Joindre une fiche.



Gascogne 20/4-6/5 Mer des Pertuis (Breton Antioche)

IGA

PGB03Contrat EDF

D. HalgandJ. Martin

6 X 1j6 X 1

Penly MancheFlamanville Manche

Navire professionnel Impact des Grands Aménagements

Campagnes 2005

Programme Noms Dates Zone géographique Navires et ou Equipements et ou engins concernés


PELGAS PGD01 J. Masse 30j2-31/5

Golfe de Gascogne N/o Thalassa Etude du système pélagique Gascogne ; évaluation biomasses d’anchois et de sardines par acoustique et chalutages pélagiques associés.

JUVAGA PGD02 P. Petitgas 15j Golfe de Gascogne N/o Thalassa Variabilité du recrutement anchois

PECOS PGD02 Y. Desaunay 13j18-4/1-5

Mor-Braz Pertuis d’Antioche

N/o Gwen Drez Fonctionnement des habitats de nourriceriesEvolution à moyen terme des ressources côtières

NURVIL PGB01 Y. Desaunay 6j14-19/9

Baie de Vilaine N/o Gwen Drez Suivi de la nourriecerie, espèce cible : la sole

IGAContrat EDF

PGB03Contrat EDF

J.Martin 6 X 1j Flamanville Manche Navire professionnel Impact des Grands Aménagements Suivi du zooplancton au large des centrales nucléaires



Campagnes 2006

Programme Nom Dates Zone géographique Navires et ou Equipements et ou engins concernés


PELGAS PGD01 MasseGrellier-Halgand-Mehault-Kostecki-Bourdeix-Delaunay Lehuta-Vermard-Dejouy Buffaz-Beillois Goarant Petitgas Planque

32j29-4/31-5

2-18/5

18-31/5

Golfe de Gascogne N/o Thalassa Etude du système pélagique Gascogne ; évaluation biomasses d’anchois et de sardines par acoustique et chalutages pélagiques associés

CREBOUR PGB03Contrat SMIDAP

Y. DésaunayBeilloisGrellierLobry

6j21-25/2

Baie de Bourgneuf N/o Gwen Drez Interactions entre crépidules et nourriceries de sole

PECOS PGD02 Y. DésaunayLobry-Martin LaffarguePoulard

19j 25-4/13-51-13/58-13/525-4/6-5

Pertuis d’Antioche N/o Gwen Drez Fonctionnement des nourriceries - Evolution à moyen terme des ressources côtières

PELACUS Campagne menée par l’Institut Espagnol Océanographique de Gijon

Beillois-Halgand Halgand Masse-Petitgas-Planque

28j 22-9/19-108-19/1029-3-15/48-17/10

ZEE espagnoles, portugaises, françaises

N/o Thalassa Etudier la distribution et l’évaluation des populations d’anchois et de sardines du sud de l’Europe au golfe de Cadiz à la mer Celtique par la méthode d’écho-intégration acoustique

IBTS PGD01 HalgandMartinGuilbaudAntoine

1-10/2

26-1-12/2

Mer du Nord N/o Thalassa Calcul annuel des indices d’adondance des principales espèces de poissons exploitées en mer du Nord

SMFH Survey Trawlessais

PGD01 Trenkel 24-2/4-3 MancheBaie de Douarnenez

N/o Thalassa Essais techniques pour l’amélioration des outils d’évaluation de la ressource et maintien du potentiel du navire Thalassa en matière de détection



halieutique par acoustique

PELMED Beillois 15-28/7 Golfe du Lion N/o Europe Estimation des ressources en petits poissons pélagiques par acoustique

EVHOE PGD01 DintheerLongoReecht Lorance

18-11/4-12

4-18/11

Golf de GascogneMer Celtique

N/o Thalassa Evaluation des resources halieutiques de l’Ouest Europe.Estimation d’indices d’abondance des principales espèces commerciales.

CHAPAUV co-financée par l’IFOP Trenkel

Mesnil Peyronnet-Mahevas

V. TrenkelBastardieLoranceMahevas

12j14-26/516-19/5

16-21/5

3-6/7

Grande Vasière-Large Belle-Ile

N/o ThaliaNavires professionnels

Description de la distribution spatiale à petite échelle des poissons par détection et suivi acoustique avec l'AUV, estimation des distributions spatiales individuelles avec le sondeur embarqué (N/o Thalia), comparaison avec résultats de chalutages (navires professionnels)

Marquage MERLU

Drouineau 20-30/6 Golfe du Lion N/o Europe Etude de la croissance et des migrations du merlu

Campagnes 2007

Programme Nom Dates Zone géographique Navires et ou Equipements et ou engins concernés


IBTS PGD01 DesaunayMartin

2-23/210-23/2

Mer du Nord N/o Thalassa Calcul annuel des indices d’adondance des principales espèces de poissons exploitées en Mer du Nord

SMFH-EXCHA07essais

PGD01 BeilloisTrenkel

26-2/5-3 MancheBaie de Douarnenez

N/o Thalassa Essais techniques pour l’amélioration des outils d’évaluation de la ressource et le maintien à niveau du potentiel du nvaire Thalassa en matière de détection halieutique par acoustique

PELGAS PGD01 MasseGrellierHalgandHuretPetitgas

24-4/27-5

12-27/412-19/4

Golfe de Gascogne N/o Thalassa Etude du système pélagique Gascogne ; évaluation biomasses d’anchois et de sardines par acoustique et chalutages pélagiques associés



PlanqueBourriauDejouyBertheléBeillois

21-4/27-512-27/512-19/524-4/19-5

EVHOE PGD01 Brind’amourTrenkel

18-31/1018-25/10

Mer du Nord N/o Thalassa Evaluation des resources halieutiques de l’Ouest Europe.Estimation d’indices d’abondance des principales espèces commerciales.

PELACUS Campagne menée par l’Institut Espagnol Océanographique de Gijon

Beillois-DubreuilGrellierPetitgasPlanque

4-15/10

9-24/4 et 18-25/10

ZEE espagnoles, portugaises françaises

N/o Thalassa Etudier la distribution et l’évaluation des populations d’anchois et de sardines du sud de l’Europe au golfe de Cadiz à la mer Celtique par la méthode d’écho-intégration acoustique

MEDITS PGD01 MartinPersohn

9-17/619-30/6

Est CorseGolfe du Lion

N/o Europe Evaluation des ressources halieutiques de Méditerranée. Estimation d’indices d’abondance des principales espèces commerciales

PELMED PGD01 Beillois 09/07-08/815-28/7

Golfe du Lion N/o Europe Evaluation des stocks de petits pélagiques par échointégration et chalutages d'identification


Rapport d'Evaluation des Unités Thématiques en 2008 - Annexe 12 -

Activi tés de formations données *

(cours magistraux, TP/TD, etc. )

2004Nom du formateur Niveau de la formation Etablissement d'enseignement Contenu de l'enseignement DuréeTrenkel DESS MASI Université de Bretagne Sud 3Rochet M-J DEA Ecologie Université de Paris INA-PG 3Rochet M-J DAA halieutique ENSA Rennes 3Forest A. Troisième année Ecole vétérinaire de Nantes Evaluation des ressources

halieutique2

Forest A. Capitaine de pêche Ecole Nantes Evaluation des stocks, processus de décision

2

Mahévas S. DAA Halieutique ENSA Rennes 3Mahévas S. DESS MASI Université de Bretagne Sud 3Massé J. DAA halieutique ENSA Rennes Acoustique halieutique 14Le Pape O. DAA halieutique ENSA Rennes 7

2005Nom du formateur Niveau de la formation Etablissement d'enseignement Contenu de l'enseignement DuréeDintheer Ch. Formation continue Université Paris I/ISST 4Forest A. DAA Halieutique Agrocampus Rennes Evaluation des stocks, processus de

décision4

Forest A. Formation continue Université de Nantes Etat des ressources, processus de décision

2

Forest A. Troisième année Ecole vétérinaire de Nantes Evaluation des ressources halieutique

3

Rochet M-J DAA halieutique Agrocampus Rennes 6Rochet M-J. DEA Ecologie Université de Paris INA-PG 3Trenkel V. DAA halieutique Agrocampus Rennes 3Massé J. DAA halieutique Agrocampus Rennes Acoustique halieutique 7Mahévas S. DAA halieutique Agrocampus Rennes 7

- Annexe 12 – (suite)

* Cette rubrique ne concerne que la formation dispensée par les membres des unités et services. Préciser si l'action est récurrente ou occasionnelle. L'objectif est d'avoir un ordre de grandeur de cette activité et de son évolution.



2006Nom du formateur Niveau de la formation Etablissement d'enseignement Contenu de l'enseignement DuréeRochet M-J Master 2 Agrocampus Rennes 3Rochet M-J Master 2 Université de Paris INA-PG 3Massé J. DAA halieutique Agrocampus Rennes Acoustique halieutique 7Mahévas S. DAA halieutique Agrocampus Rennes 8

2007Nom du formateur Niveau de la formation Etablissement d'enseignement Contenu de l'enseignement Durée

Planque B. Chercheur IPIMAR Lisbonne Ecole d’été Habitat modelling of marine populations

Rochet M.J. Master professionnel Agrocampus Rennes 3 TP 6 Cours 9Rochet M.J. Master EBE AgroParisTech Acoustique halieutique 3 TP 3 cours 6Masse J. Master SHA Agrocampus Rennes Cours 7Forest A. Master SHA Agrocampus Rennes Cours Evaluation des stocks,

processus de décision6

Bourriau P. 3e collège Nantes 12


Rapport d'Evaluation des Unités Thématiques en 2008 - Annexe 13 -

Formations* suivies par les membres des Unités

Nom de l'agent Intitulé de la formation Organisme Lieu Date début Date fin Duréeh

2004

FOREST André communication/relations avec les medias Media science formation Fabrice Papillon Issy-les-Moulineaux 09/12/2004 10/12/2004 15

ANTOINE Loïc communication/relations avec les medias Media science formation Fabrice Papillon Issy-les-Moulineaux 09/12/2004 10/12/2004 15

FOREST André accompagnement et formation des responsables de thèmes & programmes Collège de polytechnique Nantes 07/07/2004 07/07/2004 8

ANTOINE Loïc accompagnement et formation des responsables de thèmes & programmes Collège de polytechnique Nantes 07/07/2004 07/07/2004 8

DINTHEER Christian anglais 2004/2005 Conservatoire national des arts et métiers Nantes 15/11/2004 15/02/2005 6

DINTHEER Christian droit de l'environnement Université de Nantes Nantes 03/02/2004 12/03/2004 30ANTOINE Loïc droit de l'environnement Université de Nantes Nantes 03/02/2004 12/03/2004 30TRENKEL Verena matlab ML01 The mathworks Sèvres 04/11/2004 05/11/2004 14

MAHEVAS Stéphanie anglais action individualisée à la carte 2004/2005

Conservatoire national des arts et métiers Nantes 16/12/2004 30/05/2005 1

PELLETIER Dominique analysing mixed effects odels with S-plus Insightful s-plus Toulouse 13/04/2004 15/04/2004 20

PLANQUE Benjamin analysing mixed effects odels with S-plus Insightful s-plus Toulouse 13/04/2004 15/04/2004 21

2005GRELLIER Patrick traitement numerique des piéces calcifiees

(tnpc) Ifremer centre de Brest Brest 27/09/2005 29/09/2005 19

COMTE Anne anglais/coaching individuel (suite année 2004)

Conservatoire national des arts et métiers Nantes 01/01/2005 30/06/2005 21

MARTIN Jocelyne arcview niveau i Nasca géosystèmes Brest 10/10/2005 12/10/2005 23MARTIN Jocelyne formation powerpoint Ifremer Nantes Nantes 17/05/2005 18/05/2005 11

MESNIL Benoît droit de l'environnement du littoral Université de Nantes Ifremer Nantes 07/12/2005 15/12/2005 30




MESNIL Benoît formation g.a.m. - modèles généralisés et additifs. University of Bath (UK) Nantes 21/11/2005 25/11/2005 38

MESNIL Benoît développer en c++ Cogitec Orvault 09/05/2005 13/05/2005 40

ROCHET Marie-Joëlle formation g.a.m. - modèles généralisés et additifs. University of Bath (UK) Nantes 21/11/2005 25/11/2005 38

BOURRIAU Paul recyclage sst - Nantes Service santé travail région nantaise sstrn Nantes 05/04/2005 05/04/2005 4

FOREST André droit de l'environnement du littoral Université de Nantes Ifremer Nantes 07/12/2005 15/12/2005 30

DINTHEER Christian anglais (suite 2004) Conservatoire national des arts et métiers Nantes 01/01/2005 15/02/2005 46

POULARD Jean-Charles arcview niveau i Nasca géosystèmes Brest 03/10/2005 05/10/2005 23

POULARD Jean-Charles typographie et mise en pages Ifremer Nantes Nantes 20/05/2005 20/05/2005 8

TRENKEL Verena formation g.a.m. - modèles généralisés et additifs. University of Bath (UK) Nantes 21/11/2005 25/11/2005 38

MAHEVAS Stéphanie formation g.a.m. - modèles généralisés et additifs. University of Bath (UK) Nantes 21/11/2005 25/11/2005 38

PELLETIER Stéphanie formation g.a.m. - modèles généralisés et additifs. University of Bath (UK) Nantes 21/11/2005 25/11/2005 39

MAHEVAS Stéphanie anglais 2004/2005 Conservatoire national des arts et métiers Nantes 16/12/2004 30/05/2005 3

PLANQUE Benjaminméteo (météo générale +prévision + climatologie, changt climat + potentiel éolien + instrumentation)

Météo France Toulouse 21/11/2005 25/11/2005 40

PECQUERIE Laure deb stella - modelisation ecophysiologie mollusques Ifremer Nantes Brest 14/06/2005 16/06/2005 11

DROUINEAU Hilaire formation g.a.m. - modèles généralisés et additifs. University of Bath (UK) Nantes 21/11/2005 25/11/2005 38

LOBRY Jérémy formation access initiation Ifremer Nantes Nantes 23/05/2005 25/05/2005 23VENEREAU Christine typographie et mise en pages Ifremer Nantes Nantes 20/05/2005 20/05/2005 8VENEREAU Christine formation word perfectionnement Ifremer Nantes Nantes 19/05/2005 19/05/2005 8ANTOINE Loïc web Ifremer Brest Nantes 10/03/2005 10/03/2005 8




ANTOINE Loïc frontpage Ifremer Nantes Nantes 18/03/2005 18/03/2005 82006COMTE Anne word perfectionnement Ifremer nantes Nantes 08/06/2006 09/06/2006 11COMTE Anne excel perfectionnement Ifremer nantes Nantes 06/06/2006 07/06/2006 11GEFFROY Isabelle excel perfectionnement Ifremer nantes Nantes 06/06/2006 07/06/2006 11

MASSE Jacques communication medias Média science formation Fabrice Papillon Issy-les-Moulineaux 28/09/2006 29/09/2006 15

MESNIL Benoît access initiation ifremer Nantes Nantes 05/12/2006 07/12/2006 23

MESNIL Benoît formation au logiciel R Université de Mons (Belgique) Nantes 09/01/2006 13/01/2006 19

BOURRIAU Paul excel perfectionnement Ifremer Nantes Nantes 06/06/2006 07/06/2006 11BOURRIAU Paul access initiation Ifremer Nantes Nantes 05/12/2006 07/12/2006 23

DINTHEER Christian la version 2006 du code des marches publics mpf - marchés publics france Roissy 07/12/2006 07/12/2006 7

POULARD Jean-Charles formation au logiciel R Université de Mons (Belgique) Nantes 09/01/2006 13/01/2006 15

BERTHELE Olivier formation au logiciel R Université de Mons (Belgique) Nantes 09/01/2006 13/01/2006 30

MAHEVAS Stéphanie plans d'experiences et optimisation Expérimentique Orléans 14/06/2006 15/06/2006 15

MAHEVAS Stéphanie formation au logiciel R Université de Mons (Belgique) Nantes 09/01/2006 13/01/2006 38

DROUINEAU Hilaire formation au logiciel R Université de Mons (Belgique) Nantes 09/01/2006 13/01/2006 38

VERMARD Youen formation au logiciel R Université de Mons (Belgique) Nantes 09/01/2006 13/01/2006 34

BASTARDIE François programmation logiciel R Université de Mons (Belgique) Nantes 18/12/2006 22/12/2006 21

BASTARDIE François formation au logiciel R Université de Mons (Belgique) Nantes 09/01/2006 13/01/2006 38

REECHT Yves formation au logiciel R Université de Mons (Belgique) Nantes 09/01/2006 13/01/2006 19




PEYRONNET Arnaud formation au logiciel R Université de Mons (Belgique) Nantes 09/01/2006 13/01/2006 38

PELLETIER Dominique formation au logiciel R Université de Mons (Belgique) Nantes 09/01/2006 13/01/2006 38

BADTS Vincent Journ2es auditeurs-diagnostiqueurs qualité interne 2006 Ifremer Brest Nantes 28/11/2006 29/11/2006 3,8

BADTS Vincent programmation logiciel R Université de Mons (Belgique) Nantes 18/12/2006 22/12/2006 30

BERTRAND Jacques programmation logiciel R Université de Mons (Belgique) Nantes 18/12/2006 22/12/2006 35

VENEREAU Christine excel perfectionnement Ifremer Nantes Nantes 06/06/2006 07/06/2006 112007

GRELLIER Patrick alphataxinomie Iuseum national d'histoire naturelle Concarneau 26/03/2007 29/03/2007 30

GEFFROY Isabelle imago - profil projet - Nantes Ifremer Brest Nantes 05/06/2007 05/06/2007 8

BERTRAND Jacques Logiciel imago Ifremer Brest Nantes 05/06/2007 05/06/2007 4

MARTIN Jocelyne rédaction d'ecrits scientifiques Danae sciences Nantes 05/03/2007 07/03/2007 21BERTRAND Jacques rédaction d'ecrits scientifiques Danae sciences Nantes 05/03/2007 07/03/2007 7

MARTIN Jocelyne alphataxinomie Museum national d'histoire naturelle Concarneau 26/03/2007 29/03/2007 30

MARTIN Jocelyne éthique et nature : biodiversité et evolution - Nantes Ifremer Nantes Nantes 21/05/2007 21/05/2007 8

BERTRAND Jacques ethique et nature : biodiversité et evolution - nantes Ifremer Nantes Nantes 21/05/2007 21/05/2007 8

WOEHRLING Daniel typographie et mise en pages Ifremer Nantes Nantes 13/11/2007 13/11/2007 8

DINTHEER Christian imago - profil projet Ifremer Brest Nantes 05/06/2007 05/06/2007 8

DINTHEER Christian typographie et mise en pages Ifremer Nantes Nantes 13/11/2007 13/11/2007 8POULARD Jean-Charles redaction d'ecrits scientifiques Danae sciences Nantes 05/03/2007 07/03/2007 21




POULARD Jean-Charles ethique et nature : biodiversite et evolution Ifremer Nantes Nantes 21/05/2007 21/05/2007 8

BERTHELE Olivier web eziweb nantes ifremer Nantes Nantes 16/10/2007 17/10/2007 6BERTHELE Olivier sauveteurs secouristes du travail Croix rouge francaise Nantes 05/06/2007 07/06/2007 14HURET Martin séminaire nouveaux embauchés Ifremer Nantes Nantes 22/01/2007 24/01/2007 23BRIND'AMOUR Anik séminaire nouveaux embauchés Ifremer Nantes Nantes 22/01/2007 24/01/2007 23

BRIND'AMOUR Anik alphataxinomie Museum national d'histoire naturelle Concarneau 26/03/2007 29/03/2007 30

PERSOHN Cécile statistiques - plans d'expériences Enitiaa Nantes 23/05/2007 25/05/2007 19

PERSOHN Cécile bases en statistiques, estimation, test et modeles statistiques Enitiaa Nantes 28/03/2007 30/03/2007 24

PERSOHN Cécile access initiation Ifremer Nantes Nantes 24/04/2007 26/04/2007 23

LEHUTA Sigrid statistiques : l'analyse multidimensionnelle des données - approfondissement Enitiaa Nantes 11/09/2007 12/09/2007 15

BADTS Vincent logiciel birt s q l i Ifremer Lorient 26/11/2007 27/11/2007 15

BADTS Vincent web eziweb Nantes Ifremer Brest Nantes 22/05/2007 22/05/2007 8

VENEREAU Christine web eziweb Nantes Ifremer Nantes Nantes 16/10/2007 17/10/2007 6VENEREAU Christine frontpage Ifremer Nantes Nantes 02/03/2007 02/03/2007 8VENEREAU Christine typographie et mise en pages Ifremer Nantes Nantes 13/11/2007 13/11/2007 8

* durée en heures
