Nombre de sujets nécessaires en recherche clinique FRT C8

Nombre de sujets nécessaires

en recherche clinique

FRT C8

Types d’études

• Problème d’estimation– Nombre de sujets pour une précision de

l’estimation

• Problème de comparaison :– Nombre de sujets pour une puissance suffisante

pour montrer une différente attendue

• Problème de prédiction– Nombre de sujets pour mettre en évidence un

niveau de risque attendu

Problème d’estimation• Etude d’un échantillon représentatif de n

sujets pour extrapoler les résultats observés à la population entière dont est issu l’échantillon



• Estimation sur l’échantillon de la mesure– Évènement en terme de fréquence pobservé avec

son écart-type pq/n (1)– Mesure d’une variable quantitative sous forme

de moyenne avec son écart-type sem (s²/n)(2)



• Estimation sur l’échantillon de la mesure– Évènement en terme de fréquence pobservé avec son

écart-type pq/n (1)– Mesure d’une variable quantitative sous forme de

moyenne avec son écart-type sem (s²/n)(2)

• On montre que la mesure dans la population a 95 % de chances de se situer dans l’intervalle– (1) po poqo/n

– (2) m s/n = 1,96 pour =5%

Précision d’une estimation

• Soit i la précision i correspond à l’intervalle autour de

l’estimation ponctuelle : pq/n ou sn – Pour une fréquence :

• i = pq/n, en montant tout au carré i² = ² p q /n

• n = ²p q / i²

– Pour une moyenne :• i = s/n, en montant tout au carré i² = ²s² /n

• n = ²s² / i²

Exemples

• Observatoire de malades traités pour hépatite C : estimer le % d’adéquation à l’AMM– Hypothèse : 80 %, précision 5 % au risque 5% n = (1,96² x 0,80 x 0,20)/ 0,05²= 246– Hypothèse : 60 %, précision 3 % au risque 5% n = (1,96² x 0,60 x 0,40)/ 0,03²= 1025

. Estimer le nombre de CD4 des malades sous HAART. une petite étude préliminaire a montré une variance de 4900 (s = 70)- précision de la moyenne à 20 au risque 5% n = (1,96² x 4900)/ 20² = 48

- précision de la moyenne à 15 au risque 2% n = (2,326² x 4900)/ 15² = 118

Etude adequation

• Nombre de patients nécessaires :• La méthode de sélection des médecins enquêteurs et le calcul du nombre de patients

nécessaires ont été établis pour atteindre l’objectif principal avec une précision désirée de 4%.

• L’échantillon minimum de patients requis pour estimer le pourcentage de patients traités selon les recommandations de la conférence de consensus a été établi selon les hypothèses suivantes :

• Variance maximum : pq = 0,25 (p = 0,50, q = 0,50)• Précision : i = 0,04• Risque : α = 0,05• Calcul du nombre de patients nécessaires:• n = 600 patients évaluables• En prenant 15 % de perdus de vue en compte :• N = 600 x 1,15 = 690 • Nombre de patients à inclure : 700• Nombre maximal de patients par médecin enquêteur :• Chaque médecin enquêteur pourra inclure un maximum de 15 patients. Pour éviter

tout biais de sélection, les patients répondant aux critères de sélection seront inclus de façon consécutive.

Problème de comparaison (1) de moyennes

• Rappel sur le principe des tests


• Rappel sur le principe des tests– Formuler les hypothèses :

H0 : µ1 = µ2

H1 : µ1 ≠ µ2 formulation bilatérale



H0 : µ1 = µ2


– Calculer la probabilité des observations sous H0, connaissant la loi de distribution de la différence m1-m2



H0 : µ1 = µ2



– Choisir la règle de décision : on rejette ou non H0 avec un certain risque d’erreur, càd pour une valeur seuil L telle que ll > L



H0 : µ1 = µ2



– Choisir la règle de décision : on rejette ou non H0 avec un certain risque d’erreur, càd pour une valeur seuil L telle que ll > L

• Les 2 risques d’erreur– De 1ère espèce : = P(rejet H0 si H0 vraie) = P(ll > seuil L si H0

vraie)

– De 2ème espèce : = P(non rejet H0 si H1 vraie) = P(ll < seuil L si

H1 vraie). 1- = puissance d’un test = P(rejet H0 si H1 vraie)

Comparaison (1) de moyennes

• On ne peut pas calculer exactement car on ne connaît pas la valeur exacte de = µ1- µ2

• H1 est une hypothèse composite : il faut spécifier une hypothèse particulière. Il y a une valeur de pour chaque valeur de µ1- µ2

Réalité Conclusion du testvaleur de rejet de H0 non rejet de H0

H0 est vraie = 0 1-

H1 est vraie H1 1 -

’H1 1 - ’ ’

Comparaison de 2 moyennes

• Distribution de la différence observée = m1-m2 selon que H0 est vraie ou H1 est vraie en supposant même ²


• Sous H0, µ1- µ2 suit une loi Normale de moyenne 0 et on rejettera H0 si m1-m2 > L

– P[(m1-m2)>lLl/H0] = L-0 =

L = 1/n1+1/n2 ²1/n1+1/n2

• Sous H1 on attend une différence µ1- µ2 = , différence minimale que l’on souhaite montrer; on ne rejettera pas H0 si m1-m2 < L’,– P[(m1-m2)<L’/H1] = L’ - =-2 si <50%

L’ = -21/n1+1/n2 ²1/n1+1/n2

• Si on fait correspondre L et L’ on obtient 1/n1+1/n2 = - 21/n1+1/n2


n1n2 = ²(+2)² et si n1=n2 alors n1n2/ n1+n2 = n/2

n1+n2 ² n = 2 ²(+2)²

²

Si on inclut dans chaque échantillon un nombre n’<n, on peut calculer a posteriori la puissance qu’avait l’étude de montrer la différence attendue :

2= n ² - 1,96 d’où on tire en lisant dans la table

2 ² la valeur de 2 puis la puissance 1-

Ex : 2= 1,0 2 ≈ 0,32, ≈ 0,16, d’où une puissance de 0,84

Problème de comparaison (2) de pourcentages

• Les hypothèses s’écrivent : H0 : P1=P2 H1 : P1≠P2

• On observe p1 et p2. On ne peut pas faire l’hypothèse d’égalité des variances, P1Q1/n étant forcément différent de P2Q2/n si H1 est vraie changement de variable : p y = Arcsinusp (Arcsinus est la fonction inverse de la fonction sinus : p = sin(y))

• Cette transformation angulaire permet :– Y suit une distribution proche de la Normale– Var(Y) tant vers une constante 1/4n dès que n > 20

• Dans la formule de comparaison de moyennes, on remplace ² par ¼ par (Arcsinusp1 - Arcsinusp2)

Comparaison de 2 pourcentages

• Pour un test bilatéral :n (+2)²

2(Arcsinusp1 - Arcsinusp2)²

et 2 = 2n(Arcsinusp1 - Arcsinusp2) – 1,96

=

Table d’Arcsinus

Cas des effectifs inégaux

• Essai thérapeutique : 2 fois plus de malades dans le groupe nouveau Ttt que dans le groupe placebo

• Étude épidémiologique : 2 témoins pour un cas en partant de 1/n1 + 1/n2 = 2/n en cas d’effectifs égaux

Pour n2/n1 = 2 on obtient : n1 = n/2 (1+1/2) et n2 = n/2(1+2)

Et de façon plus générale, pour n2/n1 =

n1 = n/2 (1+1/ ) et n2 = n/2(1+ )

• On calcule d’abord n, effectifs égaux, puis n1 et n2 en fonction de

• n1 + n2 est toujours supérieur à 2n

Problème de prédictionM+ M-

E+ a b a+b R1 risque de maladie chez E+

E- c d c+d R0 risque de maladie chez E-P 1-P

Pour quantifier l’association entre exposition et maladie :– Risque relatif RR = R1 / R0 a/a+b / c/c+d– Odds ratio OR R1 / (1 - R1) estimé par ad/bc

R0 / (1 - R0)En l’absence d’association RR et OR = 1En cas d’association positive RR et OR > 1

Principe : calculer le nombre de sujets nécessaires E+ et E- pour montrer un OR choisi, avec une puissance définie, connaissant la fréquence de la maladie (R0) chez les E-

=

Exemples numériques

• Evaluation du risque de cancer du foie sur cirrhose chez les sujets atteints d’hémochromatose – Hypothèse : le risque de cancer du foie chez les cirrhotiques

non hémochromatosiques est de 5 % – Combien de malades pour montrer un risque 3 fois plus grand

avec une puissance de 80 %

• Résolution– E- = cirrhoses sans hémochromatose– E+ = cirrhoses sur hémochromatose

– R0 = 0,05, OR attendu = 3– On lit dans des tables : il faut inclure 168 malades par groupe

Si l’on craint des PDV ou sujets non évaluables, il faut majorer d’un % dépendant du problème. Ici 10 %, il faut donc 185 sujets/groupe


• Essai thérapeutique pour tester 2 somnifères S1 et S2

– Soit par la durée de sommeil l1 - 2l = 1 heure en supposant les variances égales de valeur 1,5²quel nombre de sujets pour montrer 1 ≠ 2 avec = 5 %, = 10 % et n1 = n2

– Soit par le % de sujets ayant une durée de sommeil d’au moins 6 heures. Avec S1 on sait que ce taux est de 30 %, on désire qu’il soit d’au moins 50 % avec S2 avec = 5 %, = 10 % et n1 = n2


• Essai thérapeutique pour tester 2somnifères S1 et S2

– Soit par la durée de sommeil l1 - 2l = 1 heure en supposant les variances égales de valeur 1,5²quel nombre de sujets pour montrer 1 ≠ 2 avec = 5 %, = 10 % et n1 = n2

• Résolution– Test bilatéral de comparaison de moyennes

– n = (2 x 1,5²)/1² x (1,96 + 1,282)² = 47,3 soit n = 48 sujets/groupe

Si l’on craint des PDV ou sujets non évaluables, il faut majorer d’un % dépendant du problème. Ici 10 %, il faut donc 53 sujets/groupe


• Essai thérapeutique pour tester 2somnifères S1 et S2

– Soit par le % de sujets ayant une durée de sommeil d’au moins 6 heures. Avec S1 on sait que ce taux est de 30 %, on désire qu’il soit d’au moins 50 % avec S2 avec = 5 %, = 10 % et n1 = n2

• Résolution– Test unilatéral de comparaison de pourcentages– n = (1,645 + 1,282)²/2x(0,785 – 0,580)² = 101,9

donc 102 sujets /groupe– En majorant de 10 % pour les sujets non évaluables il faut 113 sujets par groupe

Même problème, critère de jugement différent, il faut 2 fois plus de malades pour montrer une différence de 20% que d’1 heure

Ex : Calcul prévu dans le protocole

– Calcul de la taille d’etude• Dans cet essai, les patients sont randomisés en 2 groupes de stratégie différente:• groupe de stratégie A : le traitement anti-viral est débuté en même temps ou au

maximum 10 jours après le début du sevrage• groupe de stratégie B : le traitement anti-viral est débuté après une période de

sevrage complet d’une durée d’au moins 3 mois (référence). • La comparaison des groupes porte sur le pourcentage de patients ayant poursuivi le traitement

aux doses prescrites jusqu’à son terme (selon la définition du paragraphe 8.1). L’essai est un essai de supériorité (test bilatéral).

• Hypothèses : • - stratégie A : la mise en route du traitement anti-viral de façon concomitante du sevrage

permettra de débuter le traitement chez 100 % des malades éligibles, mais avec un abandon de traitement et/ou rechute alcoolique en raison d’un sevrage non consolidé, dans 40 à 50 % des cas

• - stratégie B : pendant le délai d’attente d’au moins 3 mois, le risque de rechute alcoolique est estimé à 50 %, ne permettant pas l’institution du traitement ; en revanche, une fois le traitement débuté chez un sujet sevré, le taux de rechute ou d’abandon de traitement pourrait être de 10 à 30 % soit un total de 60 à 80 %

• - la différence entre les 2 groupes étant au minimum de 20 %, et en privilégiant l’hypothèse 40 vs 70 %

• - ainsi, pour un risque alpha à 5 %, un risque beta à 10 % en test bilatéral, le nombre de sujets à inclure varie, par groupe, de 30 à 130 en fonction des hypothèses

• % d’échecs : stratégie A 40 40 40 50 50stratégie B 60 70 80 70 80

• nombre de sujets par groupe 130 56 30 124 52

Statistical Analysis

We estimated that the incidence rate of hepatitis E would be 1.6%

during a 1-year period. Assuming a vaccine efficacy of 80%, a two-

group continuity-corrected chi-square test with a one-sided significance

level of 0.05 would have a power of 80% to detect a difference in the

incidence of hepatitis E with 866 subjects per group, as calculated by

nQuery Advisor, version 5.0 (Statistical Solutions). To compensate for

dropouts, 1000 subjects per group were needed.

Safety and Efficacy of a Recombinant Hepatitis E Vaccine (N Eng J Med, 2007; 356:895-903)


• En fait, le nombre de malades recrutés est plus faible que prévu et seuls sont analysables n1=n2=30– On observe : m1 = 5,8 (s = 1,6) p1 = 0,30

m2 = 6,5 (s = 1,7) p2 = 0,53

le test = 1,64, non rejet H0 le test ² = 3,36, non rejet H0

• Quelle était la puissance pour montrer les différences attendues sous les mêmes hypothèses ?1. 2= n ² - 1,96 2 = 0,622 2 0,51 0,255

2 ² et la puissance 1- = 0,745

2. 2 = 2n(Arcsinusp1 - Arcsinusp2) – 1,645 = 0,175 2 0,86 0,43 et la puissance 1- = 0,57

Ce qu’il ne faut pas faire

• Un essai thérapeutique est mis en place sur 3 centres. Le nombre de sujets prévu est de 98 par groupe pour montrer une différence de 20% (60 vs 40) en test bilatéral, avec 5% et 20%

• Un des 3 centres inclut la moitié soit 50 malades par groupe et observe 58 vs 40 % de bons résultats.

• Il décide d’analyser et de publier lui-même ses propres résultats ² = 3,24, p = 0,072, NS

• L’ensemble des résultats sur les 3 centres montre des taux de réponses de 57 vs 41% ² = 5,23, p < 0,03

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