21
VPP: mécanismes réactionnels

Rappels biochimie tutorat paces université de la réunion

Embed Size (px)

DESCRIPTION

VPP + Krebs

Citation preview

Page 1: Rappels biochimie tutorat paces université de la réunion

VPP: mécanismes réactionnels

Page 2: Rappels biochimie tutorat paces université de la réunion

PHASE 1

Page 3: Rappels biochimie tutorat paces université de la réunion

Décarboxylation oxydative :-le 1er carbone est enlevé (attention: décarboxylation =/= élimination)-->effet mésomère (O- donneur)

-le carbone numéro 2 est oxydé=>oxydation alcool secondaire=cétone

Page 4: Rappels biochimie tutorat paces université de la réunion

Phase 2

Page 5: Rappels biochimie tutorat paces université de la réunion

Ribose-5-P + Xylulose-5-P

Page 6: Rappels biochimie tutorat paces université de la réunion

Cofacteur TPP:-Attaque d'un C nucléophile sur le C delta+ (groupement carbonyle:site électrophile)-Attaque de l'enzyme transcétolase qui est une base de Lewis (nucléophile) sur le H+=> une double liaison se crée entre O et C-La liaison se casse entre le 2eme et 3eme C, le 2eme C devient C-.

Page 7: Rappels biochimie tutorat paces université de la réunion
Page 8: Rappels biochimie tutorat paces université de la réunion

Libération du sédoheptulose-7-P par oxydation de la fonction alcool

Page 9: Rappels biochimie tutorat paces université de la réunion

Sédoheptulose-7-P + GA-3-P

Page 10: Rappels biochimie tutorat paces université de la réunion

-Attaque d'un azote nucléophile (base de Lewis) sur un site électrophile (C delta+) => création fonction imine C'est un mécanisme d'addition-élimination, le O étant éliminé sous forme de H2O: il s'agit d'une substitution.

-Une base d'un autre site actif s'empare du proton du groupement hydroxyle en C4.Les électrons gagnent et neutralisent le puits électrophile formé par l'imine, ce qui facilite la rupture de squelette carboné entre le C3 (énamine) et le C4(érythrose-4-P) du sédoheptulose 7-phosphate.

Page 11: Rappels biochimie tutorat paces université de la réunion
Page 12: Rappels biochimie tutorat paces université de la réunion

Le ribulose-5-P est alors libéré, reste alors un composé à 3 C qui va réagir avec le GA3P: attaque électrophile du C delta+ (centre de

prochiralité) sur un site nucléophile. On obtient un alcool D.

Page 13: Rappels biochimie tutorat paces université de la réunion

Une hydrolyse de la fonction imine libère le fructose 6-phosphate de l'enzyme (réaction

inverse du début => substitution par addition-élimination)

Page 14: Rappels biochimie tutorat paces université de la réunion

Cycle de Krebs.

Page 15: Rappels biochimie tutorat paces université de la réunion

Le 3ème C, carbone chiral type L, est le plus substitué=>élimination (Zaitsev) avec perte d'une molécule d'eau (déshydratation). Elimination de

type E2 avec position antipériplanaire (stéréospécifique).

Puis réaction d'addition (hydratation) sur le carbone une fois hydrogéné (ne suit pas

Markovnikov)=>formation d'un carbone chiral.

Page 16: Rappels biochimie tutorat paces université de la réunion

Réaction d'élimination type E2 => trans(oxydation)

Page 17: Rappels biochimie tutorat paces université de la réunion

Réaction d'addition sur face si => création d'un C chiral « L »

(hydratation)

Page 18: Rappels biochimie tutorat paces université de la réunion

Oxydation d'un alcool secondaire en cétone

Page 19: Rappels biochimie tutorat paces université de la réunion

Différence entre réarrangement et substitution?

Réarrangement = cas particulier de substitution où on obtient un isomère de position => si la

fonction à retirer était sur le C alpha, la nouvelle fonction se retrouvera sur le C bêta

Page 20: Rappels biochimie tutorat paces université de la réunion

Tautomérie: déplacement H en alpha et double liaison

Dans une solution, on a présence des 2 formes, les proportions dépendent des conditions du

milieu (solvant, température, pH,...)

Page 21: Rappels biochimie tutorat paces université de la réunion

Questions?