UM63 CNRS 7278 - IRD 198 INSERM U1095 Virus émergents et

Annuaire de la Recherche 2013 / 2014

Aix-Marseille Université – Faculté de Pharmacie – 27 bd Jean Moulin – CS 30064 - 13385 Marseille Cedex 05 - France - Tél. : +33 (0)4 91 83 55 00 - Fax : +33 (0)4 91 80 26 12

UM63

CNRS 7278 - IRD 198

INSERM U1095

Virus émergents

et pathologies humaines

Pr. Didier Raoult





1 / IDENTIFIANTS DE VOTRE UNITE/EQUIPE DE RECHERCHE

A partir du 1er

Janvier 2013

Intitulé de l’Unité :

URMITE CNRS UMR 7278 – IRD 198 – INSERM U1095

IHU Méditerranée Infection

http://www.mediterranee-infection.com/article.php?laref=1

Intitulé de l’Equipe : Responsable d’équipe « Mucoviscidose, microbiote et prise en

charge thérapeutique »

Localisation :

Marseille – UFR Médecine et de Pharmacie

Responsable :

Pr D. Raoult

Localisation :

UFR PHARMACIE – URMITE – IHU Méditerranée Infection

(10ème

étage Aile A & C)

Responsable :

Pr J-M. Rolain

Téléphone :

04 86 13 68 28

Adresse électronique :

[email protected]



2 / EFFECTIFS

A partir du 1er

Janvier 2013

Enseignants - Chercheurs : 5

Chercheurs :

Praticiens hospitaliers : 4

Ingénieurs (INSERM, CNRS, autres) :

Personnel Administratif et Technique Universitaire :

1

Personnel Administratif et Technique (INSERM,

CNRS, autre) :

Post-doc : 2

Etudiants en Thèse : 9

Etudiants en Master : 5

IDENTIFICATION DES PERSONNES

IMPLIQUEES DANS LA RECHERCHE

A partir du 1er

Janvier 2013

3 / THEMES DE RECHERCHE

A partir du 1er

Janvier 2013

(Résumé de votre projet de recherche AERES)

Projet 1 : Evaluation de la sensibilité et de la résistance aux agents anti-infectieux –

Mécanismes moléculaires de la résistance aux antibiotiques - Veille épidémiologique

•Identification génétique et étude des mécanismes moléculaires de résistance aux anti-

infectieux des pathogènes émergents et multirésistants au cours de la mucoviscidose

•Etude des transferts latéraux de gènes et de la résistance aux antibiotiques au cours de la

mucoviscidose.

•Analyse génomique de souches bactériennes épidémiques et/ou multirésistantes par

pyroséquençage à haut débit.

•Identification et biotypage des souches bactériennes par MALDI-TOF – Typage moléculaire

•Surveillance épidémiologique des bactéries multirésistantes – Mise au point de technique

moléculaire de détection des gènes de résistance aux antibiotiques

Nom Prénom Fonction HDR Téléphone e-mail

Rolain Jean-Marc PU-PH oui 04 86 13 68 28

Dubus JC PU-PH oui 04 91 32 43 00

Reynaud Martine PU-PH oui 04 91 38 43 06

Andrieu Véronique MCF Oui 04 91 83 56 39

Roux Véronique MCU-PH oui 04 91 83 55 60



Projet 2 : Détection et Identification de nouveaux agents responsables d’infections

pulmonaires – Caractérisation du microbiote respiratoire des patients atteints de

mucoviscidose

•Identification moléculaire et taxonomie bactérienne de nouveaux agents pathogènes

•Réalisation d’études de métagénomique virale et bactérienne sur les prélèvements

pulmonaires de patients atteints de mucoviscidose – Caractérisation du microbiote au cours de

la mucoviscidose.

•Recherche exhaustive, par prélèvements systématiques essentiellement des expectorations,

d’agents infectieux émergents et/ou multirésistants responsables de colonisations et

d’infections des voies respiratoires chez les patients atteints de mucoviscidose.

•Utilisation de techniques originales d’isolement et de culture, de détection et d’identification

moléculaire des agents infectieux au cours des infections pulmonaires.

Projet 3 : Nouvelles approches thérapeutiques et développement de nouvelles formes

galéniques d’administration des antibiotiques

•Développement de nouvelles formes galéniques vectrices de médicaments pour la voie

pulmonaire et optimisation des formes existantes (agents anti-infectieux et anti-

inflammatoires)

4 / PUBLICATIONS 2013-2014

Précisez les articles avec comité de lecture répertoriés par l’AERES ou dans les bases de

données internationales (ISI Web of Knowledge, Pub Med…) en séparant les publications

nationales, internationales et les brevets

1. S. Biswas, JM. Rolain. Use of MALDI-TOF mass spectrometry for identification of bacteria that are

difficult to culture. J. Microbiol. Methods. 2013, 92(1)14-24.

2. E. Angelakis, M. Million, F. D’Amato, L. Rouli, H. Richet, A. Stein, JM. Rolain, D. Raoult. Q fever

and pregnancy: disease, prevention, and strain specificity. Eur. J. Clin. Microbiol. Infect Dis. 2013.

32(3):361-8.

3. SM. Diene, B. Fall, M. Kempt, F. Fenollar, K. Sow, B. Niang, B. Wade, D. Raoult, JM Rolain.

Emergence of OXA-23 carbapenemase encoding gene in multidrug resistant Acinetobacter baumannii

clinical isolates from principal hospital of Dakar, Senegal. Int. J. Infect. Dis. 2013, 17(3):e209-10.

4. M. Kempf, JM Rolain, S. Azza, S. Diene, ML. Joly-Guillou, G. Dubourg, P. Colson, L. Papazian, H.

Richet , PE. Fournier, A. Ribeiro, D. Raoult. Investigation of Acinetobacter baumannii:resistance to

carbapenems in Marseille hospitals, south of France : a transition from an epidemic to an endemic

situation. Acta Pathol. Microbiol. Immunol. Scand. 2013, 121(1):64-71.

5. JM. Rolain, S. M. Diene, M. Kempf, G. Gimenez, C. Robert, D. Raoult. Real time sequencing to

decipher the molecular mechanism of resistance of a clinical pan-drug resistant Acinetobacter

baumannii, Marseille, France. Antimicrob. Agents Chemother. 2013, 57(1):592-6.

6. SM. Diene, V. Merhej, M. Henry, A. El Filali, V. Roux, C. Robert, S. Azza, F. Gavory, V. Barbe, B. La

Scola, D. Raoult, and JM Rolain; The rhizome of the multidrug-resistant Enterobacter aerogenes

genome reveals how new “killer bugs” are created because of a sympatric lifestyle. Mol. Biol. Evol..

2013, 30(2):369-83.

7. JC. Galán, F. González-Candelas, JM. Rolain and R. Cantón. Antibiotics as selectors and accelerators

of diversity in the mechanisms of resistance: From the resistome to genetic plasticity in the b-lactamases

world. Front. Microbiol. 2013. 4:9.

8. SM. Diene and JM. Rolain. Investigation of antibiotic resistance in the genomic era of multidrug-

resistant Gram-negative bacilli, especially Enterobacteriaceae, Pseudomonas and Acinetobacter. Expert

Review of Anti-infective. 2013. 11(3):277-96.

9. R. Drali, A. Boutellis, D. Raoult Didier, JM. Rolain and P. Brouqui. Distinguishing Body Lice from

Head Lice by Multiplex Real-time PCR Analysis of the Phum_PHUM540560 Gene. PLOS One. 2013,

8(2):e58088.



10. M. Touati, S. M Diene, M. Dekhil, A. Djahoudi, A. Racherache, JM. Rolain. Dissemination of class I

integron carrying VIM-2 carbapenemase gene in Pseudomonas aeruginosa clinical isolates from

intensive care unit of University Hospital of Annaba, Algeria.. Antimicrob. Agents Chemother. 2013,

575(5):2426-7.

11. A.O. Olaitan, M. Berrazeg, O.E. Fagade, O.O. Adelowo, J.A. Alli, JM. Rolain. Emergence of

multidrug-resistant Acinetobacter baumannii producing OXA-23 carbapenemase, Nigeria. Int. J.

Infect. Dis. 2013, 4:9.

12. F. Fenollar, J.C. Lagier, JM. Rolain, M. Célard, O. Bouchot, J.C. Eicher, H. Lepidi, D. Raoult.

Tropheryma whipplei endocarditis relapses after treatment with trimethoprim/sulfamethoxazole. Int. J.

Antimicrob Agents. 2013, 41(6):592-4.

13. JM. Rolain, M. Vayssier-Taussat, W. Saisongkorh, V. Merhej, G. Gimenez, C. Robert, D. Le Rhun, C.

Dehio, D. Raoult. Partial disruption of translational and post-translational machinery reshapes growth

rates of Bartonella birtlesii. mBIO. 2013, 23;(4):e00115-13.

14. M. Berrazeg, S. M. Diene, M. Drissi, M. Kempf, H. Richet, L. Landraud, JM Rolain. Biotyping of

multidrug-resistant Klebsiella pneuponiae clinical isolates from France and Algeria using MALDI-TOF

MS. PLOS One. 2013, 8(4):e61428.

15. S. Biswas, J.C. Dubus, M. Reynaud-Gaubert, N. Stremler, J.M. Rolain. Evaluation of colistin

susceptibility in multi-drug resitant clinical isolates from cystic fibrosis, France.Eur. J. Clin.

Microbiol. Infect. Dis. 2013, 32(11):1461-4.

16. T. Jiyipong, S. Morand, S. Jittapalapong, D. Raoult, JM. Rolain. Bordetella hinzii in rodents. Southeast

Asia. Emerg. Infect. Dis. 2013, 19(3) :502-3.

17. M. Berrazeg, M. Drissi, L. Medjahed, JM Rolain. Hierarchical clustering as a rapid tool for

surveillance of emerging antibiotic resistance phenotypes in Klebsiella pneumoniae strains. J. Med.

Microbiol. 2013, 62(6):864-74.

18. E. Mesli, M. Berrazeg, M. Drissi, SN. Bekhoucha, JM Rolain. Prevalence of carbapenemase encoding

genes including New Delhi Metallo-�-lactamase in Acinetobacter species, Algeria. Int. J. Infect. Dis.

2013, 17(9):e739-43.

19. T. Atieh, G. Audoly, S. Hraiech, H. Lepidi, A. Roch, JM. Rolain, D. Raoult, L. Papazian, F. Bregeon.

Evaluation of the diagnostic value of fluorescent in situ hybridization in a rat model of bacterial

pneumonia. Microb. Infect. Dis. 2013, 76(4):425-31.

20. P. Sharma, SM. Diene, S. Thibeaut, F. Bittar, V. Roux, C. Gomez, M. Reynaud-Gaubert and JM.

Rolain. Phenotypic and genotypic properties of Microbacterium yannicii, a recently described

multidrug resistant bacterium isolated from a lung transplanted patient with cystic fibrosis in France.

BMC Microbiology Feb. 2013, 13(1):97.

21. S. M. Diene, T. L’homme, S. Bellulo, N. Stremler, JC. Dubus, L. Mely, N. Degand, S. Leroy, JM.

Rolain. ISPa46, a novel insertion sequence in OprD porin gene of an imipenem-resistant Pseudomonas

aeruginosa isolate from a Cystic Fibrosis patient in Marseille, France. Int. J. Antimicrob. Agents.

2013, 42(3):268-71.

22. S. Bakour, A. Touati, F. Sahli, AA. Ameur, D. Haouchine, JM. Rolain. Antibiotic resistance

determinants of multidrug-resistant Acinetobacter baumannii clinical isolates in Algeria.Diag.

Microbiol. Infect. Dis. 2013, 76(4):529-31.

23. S. Hraiech, A. Roch, H. Lepidi, T. Atieh, G. Audoly, JM Rolain, D. Raoult, JM. Brunel, L. Papazian,

F. Brégeon. Impaired virulence and fitness of a colistin-resistant clinical isolated of Acinetobacter

baumannii in the rat model of pneumonia. PLOS One, 2013, 57(10):5120-21.

24. S. Edouard, M. Million, H. lepidi, JM. Rolain, PE. Fournier, B. La Scola, D. Grisoli, D. Raoult.

Persistence of DNA in cured patient and positive culture in cases with low antibody levels bring into

question diagnosis of Q fever endocarditis. 2013, J. Clin. Microbiol. 2013, 51(9):3012-17.

25. AS. Le Floch, N. Cassir, S. Hraiech, C. Guervilly, L. Papazian, JM Rolain. Haemophilus

parahaemolyticus Septic Shock after Aspiration Pneumonia, France. Emerg Infect Dis. 2013

Oct;19(10):1694-5.

26. PE. Fournier , M. Drancourt, P. Colson P, JM Rolain, B. La Scola, D. Raoult. Modern clinical

microbiology: new challenges and solutions. Nat Rev Microbiol. 2013 Aug;11(8):574-85.

27. JM Rolain. Food and human gut as reservoirs of transferable antibiotic resistance encoding genes.

Front Microbiol. 2013, 4:173.

28. P. Seng, C.Abat, JM Rolain, P. Colson, JC. Lagier, F. Gouriet, PE. Fournier , M. Drancourt, B. La

Scola, D. Raoult. Identification of rare pathogenic bacteria in a clinical microbiology laboratory: impact



of matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry. J Clin Microbiol. 2013

Jul;51(7):2182-94.

29. JL. Burns, JM Rolain. Culture-based diagnostic microbiology in cystic fibrosis: Can we simplify the

complexity? J Cyst Fibros. 2013, 13(1):1-9.

30. L. Djouhri-Bouktab, JM Rolain, J.M. Brunel. Polyamines metabolism, toxicity and potent therapeutical

use. Anti-infective Agents Med. Chem. 2014, 12:95-103.

31. SK. Gupta, BR. Padmanabhan, SM. Diene, R. Lopez-Rojas, M. Kempf, L. Landraud, JM Rolain.

ARG-ANNOT (Antibiotic Resistance Gene-ANNOTation), a new bioinformatic tool to discover

antibiotic resistance genes in bacterial genomes. Antimicrob Agents Chemother. 2014,

58(1):212-20.

32. T. Kernif, H. Leulmi, C. Socolovschi, JM. Berenger, H. Lepidi, I. Bitam, JM. Rolain, D. Raoult, P.

Parola. Acquisition and Excretion of Bartonella quintana by the Cat Flea, Ctenocephalides felis felis.

Mol. Ecol. 2014, 23(5):1204-12.

33. Z. Ouchenane, A. Agabou, F. Smati, JM. Rolain , D. Raoult. Staphylococcal cassette chromosome mec

characterization of methicillin-resistant Staphylococcus aureus strains isolated at the military hospital of

Constantine/Algeria. Pathol Biol (Paris). 2014, 61(6):280-1.

34. P. Sharma, SP. Gupta, JM. Rolain. Whole genome sequencing of bacteria in cystic fibrosis as a model

for bacterial genome adaptation and evolution. Expert Rev. Anti. Infect. Ther. 2014. 12(3):343-

55.

35. S. Muhammed Ameen, JM. Rolain, MN. Le Poullain, V. Roux, D. Raoult, M. Drancourt. Serum

concentration of co-trimoxazole during a high-dosage regimen. J Antimicrob Chemother. 2014,

69(3):757-760

36. M. Berrazeg, S. M. Diene, L. Medjahed, P. Parola, M. drissi, D. Raoult and JM Rolain. New Delhi

metallo-ß-lactamase the world : An eReview using Google Maps. 2002. Eurosurveillance, 2014, in

press

37. I. Sefraoui, M. Berrazeg, M. Drissi, JM. Rolain. Molecular epidemiology of carbapenenem-resistant

pseudomonas aeruginosa clinical strains isolated from western Algeria between 2009 and 2012.

Microbial Drug Resistance. 2014, in press

38. R. Rafei, M. Eveillard, M. Hamze, F. Dabboussii, F. Mokadem, H. Mallat, JM. Rolain, ML. Joly-

Guillou, M. Kempf. First report of blaNDM-1 producing Acinetobacter baumannii isolated in Lebanon

civilians wounded during the Syrian war. 2014. Int. J. Infec. Dis. 2014, in press

39. Z. Belbel, H. Chettibi, M. Dekhil, A. Ladjama, S. Nedjai, JM Rolain. Outbreak of an armA

Methyltransferase-Producing ST39 Klebsiella pneumoniae Clone in a Pediatric Algerian Hospital.

Microb. Drug Resist. 2014, in press

40. A. Labid, D. Gacemi-Kirane, M. Timinouni, K. Amoura and JM Rolain. High prevalence of extended

spectrum beta-lactamase (ESBL) producers in fatal cases of pediatric septicemia among the

Enterobacteriaceae in the pediatric hospital of Annaba, Algeria. Af. J. Microb. Res. 2014, in press

41. S. Kokcha, F. Bittar, M. Reynaud-Gaubert, L. Mely, C. Gomez, JY. Gaubert, P. Thomas and JM.

Rolain. Pandoraea pulmonicola chronic colonization in a cystic fibrosis patient, France New Microb

New Infect. 2014, in press

42. S. M. Diene, F. Fenollar, B. Fall, K. Sow, B. Niang, P. Samba Ba, B. Wade, D. Raoult and JM. Rolain.

CTX-M-15-producing Morganella morganii from Hôpital Principal de Dakar, Senegal. New Microb

New Infect. 2014, in press

43. T. Jiyipong, S. Jittapalapong, S. Morand, JM Rolain. Bartonella species in small mammals and their

potential vectors in Asia. Asian Pacific Journal of Tropical Biomedicine 2014, in press

44. R. López-Rojas, SM Diene, M. Enrique Jiménez-Mejías, J. Pachón, and JM Rolain. Acquired

resistance to colistin alters the antibiotic resistance profile of Acinetobacter baumannii: a genomic

perspective. J. Antimicrob. Chemother. En revue

45. L. Loucif, E. Bendjama, D. Gacemi-Kirane and JM Rolain. Rapid identification of Streptomyces

isolates by MALDI-TOF MS. Microb. Research En revue

46. P. Sharma, S. Kumar Gupta, SM Diene, and JM Rolain. Whole-genome sequence of Chryseobacterium

oranimense, a new multidrug-resistant bacterium from a cystic fibrosis patient in France. J.

Antimicrob. Chemother. En revue

47. F. Brégeon, G. Brioude, F. De Dominicis, T. Atieh, X. Benoit D'journo, C. Flaudrops, JM Rolain, D.

Raoult, PA Thomas. MALDI-ToF mass spectrometry for the rapid diagnostic of cancerous lung

nodules. PLOS One revision



48. S. Bakour, A. Touati, T. Bachiri, F. Sahli, D. Tiouit, M. Naim, M. Azouaou, JM Rolain. Emergence of

NDM-1 and 16S rRNA methylase armA producing Acinetobacter baumannii in Algeria. Eur. J. Clin.

Microb. Infect. Dis. En revue

49. S. Bakour, SA Alsharapy, A. Touati, JM Rolain. Characterization of Acinetobacter baumannii clinical

isolates 1 carrying OXA-23 carbapenemase and 16S rRNA methylase armA in Yemen. Microb. Drug

Resist. Révision

50. A. Sassi, L. Loucif, SK Gupta, M. Dekhil, H. Chettibi, JM Rolain. NDM-5 carbapenemase-encoding

gene in multidrug-resistant clinical isolates of Escherichia coli, Algeria. Antimicrob. Agents

Chemother. En revue

51. C. Al Bayssari, SM Diene, L. Loucif, SK. Gupta, F. Dabboussi, H. Mallat, M. Hamze, and JM Rolain.

Emergence of VIM-2 and IMP-15 carbapenemases and inactivation of oprD gene in carbapenem-

resistant Pseudomonas aeruginosa clinical isolates from Lebanon. Antimicrob. Agents Chemother.

Révision

52. AO Olaitan, SM Diene, M. Kempf, M. Berrazeg, S. Bakour, SKumar Gupta, B. Thongmalayvong, K.

Akkhavong, S. Somphavong, P. Paboriboune, K. Chaisiri, C. Komalamisra, OO Adelowo, OE Fagade,

OA Banjo, AJ Oke, A. Adler, MV Assous, S. Morand, D. Raoult, and JM Rolain. Worldwide

emergence of colistin resistance in Klebsiella pneumoniae from healthy humans and patients in Lao

PDR, Thailand, Israel, Nigeria, and France due to inactivation of the PhoP/PhoQ mgrB regulator : an

epidemiological and molecular study. J. Antimicrob. Chemother. En revue

53. E. Bendjama, L. Loucif, SM Diene, C. Michelle, D. Gacemi-Kirane, JM Rolain. Non-contiguous

finished genome sequence and description of Paucisalibacillus massilioalgeriensis sp. nov. Stand.

Genomic Sci. En revue

54. E. Bendjama, L. Loucif, SM Diene, C. Michelle, D. Gacemi-Kirane, JM Rolain. Non-contiguous

finished genome sequence and description of Bacillus massilioalgeriensis sp. nov. Stand. Genomic Sci.

En revue

55. S. Hraiech, J. Hiblot, J. Lafleur, L. Papazian, JM Rolain, D. Raoult, M. Silby, F. Bregeon, E.

Chabriere, M. Elias. Quorum quenching lactonase inhibits Pseudomonas aeruginosa virulence and

reduces lethality. PLOS Pathogens En revue

56. C. Abat, G. Desboves, AO Olaitan, H. Chaudet, N. Roattino, PE Fournier, P. Colson, D. Raoult, JM

Rolain. Increasing burden of infections due to intrinsic colistin-resistant bacteria linked to increased

colistin consumption in hospitals in Marseille, France. J. Antimicrob. Chemother. En revue

Brevets

1. D. Raoult, M. Maurin and JM Rolain. Méthode de détermination de l’activité bactériostatique ou

bactéricide des agents antibiotiques par PCR quantitative. 12.03.02 – n° Brevet 01.13573

2. J.M. Brunel, JM Rolain, D. Raoult. Composés aminostéroïdiens pour une application topique locale

pour la décolonisation cutanéo-muqueuse de Staphylococcus aureus. 2/12/2009 – n° Brevet 09.58575.

Brevet licencié par la société Virbac avec un contrat de collaboration de 250 k€ sur 3 ans.

3. J.M. Brunel, J.M. Rolain, D. Raoult. Utilisation de squalamine ou analogue comme agent desinfectant.

12/01/2012. n° Brevet 12.50312.

4. F. Bregeon, D. Raoult, J.M. Rolain, X.B. D’journo, C. Flaudrops. : Méthode de détermination de la

nature tumorale ou non tumorale ou du type de tumeur d’un fragment d'organe solide humain ou animal.

Brevet déposé le 03/04/2012.



5 / THESES D’UNIVERSITE et HDR 2013-2014

Liste des thèses

Nom – Prénom

du Doctorant Titre de la thèse

Date Devenir du

Doctorant Inscription Soutenance

Tawisa

JiyipongInfections à Bartonella en Asie 2011 En cours

Collaboration

avec S. Morand

Meryem

Berrazeg

Epidémiologie et mécanisme

moléculaires de la résistance aux

antibiotiques de Klebsiella

pneumoniae, Algérie et France

2011 2013 Cotutelle

AVERROES

Poonam

SharmaPathogènes émergents et

mucoviscidose 2010 2013

Sami Hraiech

Evaluation de stratégies

thérapeutiques dans des modèles de

pneumopathies infectieuses chez

l'animal

2010 En cours

Rezak Drali Etude phénotypique des poux 2011 En cours

Cedric Abat

Mise en place d’outils informatiques

pour la surveillance en temps réel

des évènements basés sur des

données de laboratoires

2012 En cours

Abiola OlaitanEtude phénotypique et moléculaire

des bactéries multirésistantes en

Asie

2012 En cours Collaboration

avec S. Morand

Charbel Al

Bayssari

Etude des mécanismes moléculaires

de la résistance aux antibiotiques

dans le bassin méditerranéen

2012 En cours

Asma Sassi

Caractérisation des souches

d’Escherichia coli résistantes aux

antibiotiques isolées au CHU

d’Annaba - Algérie

2013 En cours Cotutelle

Meriem

Touati

Epidémiologie et mécanisme

moléculaires de la résistance aux

antibiotiques de Pseudomonas

aeruginosa, Algérie

2011 2013 Cotutelle

Asma Labib

Prevalence of ESBL-producers in

fatal cases of pediatric septicemia

among the Enterobacteriaceae in the

pediatric hospital of Annaba,

Algeria

2011 En cours Cotutelle

Thomgpan

Leangapichart

ETUDE PHENOTYPIQUE ET

GENOMIQUE DU PORTAGE

DIGESTIF DE BACTERIES

MULTI-RESISTANTES CHEZ

LES VOYAGEURS

2014 En cours



6 / Liste des contrats 2010-2014

JM Rolain Intitulé Organisme

de financement

(ANR, ANRS, PHRC,

Fondation, associations

caritatives, privé…)

Date

de

début

Date

de

fin

JM Rolain Responsable de la plateforme

robotisation des isolements et cultures

bactériennes : 1.5 M€

Infectiologie

(investigateur associé)

CPER / FEDER

2010 2013

JM Rolain Fondation de Coopération

scientifique “Infectiopole Sud » –

2011-2012.

(Coinvestigateur avec le Dr

Landraud, Nice)

Obtention d’une bourse postdoctorale

de deux ans : 36 K€

Fondation de

Coopération

scientifique

“Infectiopole

Sud »

(Coinvestigateur avec

le Dr Landraud, Nice)

2012 2014

Porteur de

projet : Pr

Martine

Reynaud-

Gaubert

« Evolution clinique et modifications

du microbiote respiratoire en fonction

du traitement antibiotique chez les

patients atteints de mucoviscidose » :

150 K€

PHRC Inter Régional

– 2011 (Investigateur

associé)

2012 2014

Porteur de

projet : Dr

Xavier

Benoît

D’JOURNO

« Intérêt de la décontamination oro-

pharyngée et du naso-pharynx par

Chlorhexidine Glu-conate contre

placebo dans la prévention des infec-

tions nosocomia-les en chirurgie

d’exé-rèse pulmonaire: étude

multicentrique, prospec-tive et

randomisée » 280 K€

PHRC National –

(Investigateur

associé)

2012 2014

Porteur de

projet : Didier

Raoult

IHU – Méditerranée Infection,

72.300.000 €

Investigateur associé

Pr JM Rolain

2011 2021

Fondation Méditerranée Infection

36 K€ Bourse doctorale –

Collaboration avec S. Morand –

Montpellier

2012 2015

Contrat de collaboration - 250

K€ Licence Brevet 09.58575 –

Société Virbac

2012 2014

Projet PathoDivSEA

Bio Asie – 40 K€

Porteur du Projet : Dr Serge Morand

(Montpellier

Investigateur

Associé : JM Rolain

2013 2014

Fondation de Coopé-ration

scientifique « Infectiopole Sud »

36 K€

Bourse doctorale – 3 ans

En collaboration avec

A. Sotto - Nimes

2014 2016



Fondation de Coopé-ration

scientifique « Infectiopole Sud »

36 K€

Bourse Post-doctorale - 2 ans

En collaboration avec

E. Delaporte -

Montpellier

2014 2015


27 K€

Financement

ingénieur 6 mois

sur projet

d’excellence

2014


12 K€

Financement

technicien 4 mois

sur projet

d’excellence

2014

IHU Méditerranée Infection –

2014 - 36 K€

Bourse doctorale

36 mois sur projet

d’excellence

2014



1 / IDENTIFIANTS DE VOTRE UNITE/EQUIPE DE RECHERCHE

au 1er

Janvier 2013

Intitulé de l’Unité : URMITE CNRS-IRD-INSERM UMR 7278

Intitulé de l’Equipe : Equipe 4 : Virus émergents de l’environnement et de

l’immunodéprimé

2 / EFFECTIFS 2013-2014

Enseignants - Chercheurs : 3

Etudiants en Thèse : 13

IDENTIFICATION DES PERSONNES

IMPLIQUEES DANS LA RECHERCHE 2013-2014

Localisation :

Facultés de Médecine et de Pharmacie

Responsable :

Professeur Didier RAOULT

Localisation :

Facultés de Médecine et de Pharmacie

Responsable :

Professeur Bernard LA SCOLA

Téléphone :

+33491 32 43 75

Adresse électronique :

[email protected]

Nom Prénom Fonction HDR Téléphone e-mail

COLSON Philippe PU-PH oui 0491835560 Philippe.colson@univ-

amu.fr

PAGNIER Isabelle MCH non 0491835560 Fadi.bittar@univ-

amu.fr

BITTAR Fadi MCU Chair

IRD

non 0491835560 Isabelle.pagnier@univ-

amu.fr



3 / THEMES DE RECHERCHE

Philippe COLSON :

- Génomique des virus géants associés aux amibes

- Rôle en pathologie humaine des virus des plantes

- Epidémiologie, diversité, variabilité, et résistance aux antiviraux des virus des hépatites et

virus émergents

Isabelle PAGNIER :

Le travail de cette équipe se concentre sur l’analyse de nouveaux virus géants dans

l’environnement, et les produits alimentaires, de leur écologie à leur étude génétique et leur

implication potentielle en pathologie humaine. En marge de ce travail, l’équipe travaille

également sur la recherche et l’analyse de nouveaux agents viraux chez des personnes

immunodéprimées.

Les analyses sont faites selon 4 axes de recherche principaux: rechercher des virus géants et

des bactéries intracellulaires, analyser leurs génomes, leur implication potentielle en

pathologie humaine, et enfin rechercher des virus émergents en pathologie humaine chez des

patients immunodéprimés.

Fadi BITTAR : Pathogènes émergents dans les pays du Sud

4 / PUBLICATIONS 2013-2014

PUBLICATIONS INTERNATIONALES

In press:

Aherfi S, Boughalmi M, Pagnier I, Fournous G, La Scola B, Raoult D, Colson P. Complete

genome sequence of Tunis virus, a new member of the proposed family Marseilleviridae.

Accepted in Archiv Virol.

Yoosuf N, Pagnier I, Fournous G, Robert C, Raoult D, La Scola B, Colson P. Draft genome

sequences of Terra1 and Terra2 viruses, new members of the family Mimiviridae isolated

from soil. Accepted in Virology.

Dans PubMed:

1: Moal V, Ferretti A, Devichi P, Colson P. Genome sequence of a hepatitis e

virus of genotype 3e from a chronically infected kidney transplant recipient.

Genome Announc. 2014 Jan 30;2(1). pii: e01156-13. doi: 10.1128/genomeA.01156-13.

PubMed PMID: 24482510; PubMed Central PMCID: PMC3907725.

2: Doudier B, Vencatassin H, Aherfi S, Colson P. Fatal fulminant hepatitis E

associated with autoimmune hepatitis and excessive paracetamol intake,

southeastern France. J Clin Microbiol. 2014 Jan 29. [Epub ahead of print] PubMed

PMID: 24478416.

3: Aherfi S, Borentain P, Raissouni F, Le Goffic A, Guisset M, Renou C, Grimaud



JC, Hardwigsen J, Garcia S, Botta-Fridlund D, Nafati C, Motte A, Le Treut YP,

Colson P, Gerolami R. Liver transplantation for acute liver failure related to

autochthonous genotype 3 hepatitis E virus infection. Clin Res Hepatol

Gastroenterol. 2014 Feb;38(1):24-31. doi: 10.1016/j.clinre.2013.05.013. Epub 2014

Jan 23. PubMed PMID: 24462173.

4: Yoosuf N, Pagnier I, Fournous G, Robert C, La Scola B, Raoult D, Colson P.

Complete genome sequence of Courdo11 virus, a member of the family Mimiviridae.

Virus Genes. 2013 Dec 1. [Epub ahead of print] PubMed PMID: 24293219.

5: Boughalmi M, Pagnier I, Aherfi S, Colson P, Raoult D, La Scola B. First

isolation of a giant virus from wild Hirudo medicinalis leech: Mimiviridae

isolation in Hirudo medicinalis. Viruses. 2013 Nov 27;5(12):2920-30. doi:

10.3390/v5122920. PubMed PMID: 24287596.

6: Abat C, Chaudet H, Raoult D, Colson P. Increasing trend of invasive group B

streptococcal infections, marseille, france. Clin Infect Dis. 2014

Mar;58(5):750-1. doi: 10.1093/cid/cit777. Epub 2013 Nov 26. PubMed PMID:

24280092.

7: Motte A, Franques J, Weitten T, Colson P. Hepatitis E-associated

Parsonage-Turner syndrome, France. Clin Res Hepatol Gastroenterol. 2014

Feb;38(1):e11-4. doi: 10.1016/j.clinre.2013.08.011. Epub 2013 Nov 15. PubMed

PMID: 24246798.

8: Lagier JC, Dubourg G, Cassir N, Fournier PE, Colson P, Richet H, Brouqui P,

Raoult D. Clostridium difficile 027 emerging outbreak in Marseille, France.

Infect Control Hosp Epidemiol. 2013 Dec;34(12):1339-41. doi: 10.1086/673995.

PubMed PMID: 24225631.

9: Popgeorgiev N, Colson P, Thuret I, Chiarioni J, Gallian P, Raoult D, Desnues

C. Marseillevirus prevalence in multitransfused patients suggests blood

transmission. J Clin Virol. 2013 Dec;58(4):722-5. doi: 10.1016/j.jcv.2013.10.001.

Epub 2013 Oct 15. PubMed PMID: 24183312.

10: Haldeda M, Baume J, Tamalet C, Bizhga M, Colson P. Hepatitis C virus

genotypes in Tirana, Albania. Int J Infect Dis. 2014 Jan;18:90-3. doi:

10.1016/j.ijid.2013.08.015. Epub 2013 Oct 2. PubMed PMID: 24169401.

11: Saadi H, Reteno DG, Colson P, Aherfi S, Minodier P, Pagnier I, Raoult D, La

Scola B. Shan virus: a new mimivirus isolated from the stool of a Tunisian

patient with pneumonia. Intervirology. 2013;56(6):424-9. doi: 10.1159/000354564.

Epub 2013 Oct 17. PubMed PMID: 24157888.

12: Ngounga T, Pagnier I, Reteno DG, Raoult D, La Scola B, Colson P. Real-time

PCR systems targeting giant viruses of amoebae and their virophages.

Intervirology. 2013;56(6):413-23. doi: 10.1159/000354563. Epub 2013 Oct 17.


13: Boughalmi M, Pagnier I, Aherfi S, Colson P, Raoult D, La Scola B. First

isolation of a Marseillevirus in the Diptera Syrphidae Eristalis tenax.

Intervirology. 2013;56(6):386-94. doi: 10.1159/000354560. Epub 2013 Oct 17.


14: Colson P, La Scola B, Raoult D. Giant viruses of amoebae as potential human

pathogens. Intervirology. 2013;56(6):376-85. doi: 10.1159/000354558. Epub 2013

Oct 17. PubMed PMID: 24157884.



15: Colson P, Fournous G, Diene SM, Raoult D. Codon usage, amino acid usage,

transfer RNA and amino-acyl-tRNA synthetases in Mimiviruses. Intervirology.

2013;56(6):364-75. doi: 10.1159/000354557. Epub 2013 Oct 17. PubMed PMID:

24157883.

16: Pagnier I, Reteno DG, Saadi H, Boughalmi M, Gaia M, Slimani M, Ngounga T,

Bekliz M, Colson P, Raoult D, La Scola B. A decade of improvements in Mimiviridae

and Marseilleviridae isolation from amoeba. Intervirology. 2013;56(6):354-63.

doi: 10.1159/000354556. Epub 2013 Oct 17. PubMed PMID: 24157882.

17: Bouamra Y, Gérolami R, Arzouni JP, Grimaud JC, Lafforgue P, Nelli M, Tivoli

N, Ferretti A, Motte A, Colson P. Emergence of autochthonous infections with

hepatitis E virus of genotype 4 in Europe. Intervirology. 2014;57(1):43-8. doi:

10.1159/000354801. Epub 2013 Oct 22. PubMed PMID: 24157452.

18: Fournier PE, Drancourt M, Colson P, Rolain JM, La Scola B, Raoult D. Modern

clinical microbiology: new challenges and solutions. Nat Rev Microbiol. 2013

Aug;11(8):574-85. Review. PubMed PMID: 24020074.

19: Vernier M, Rossi-Tamisier M, Richet H, Brouqui P, Parola P, Bouamri Y, Colson

P, Gautret P. Anti-hepatitis E virus antibody prevalence in French expatriate

workers. Int J Infect Dis. 2013 Nov;17(11):e1082-4. doi:

10.1016/j.ijid.2013.06.013. Epub 2013 Aug 14. PubMed PMID: 23953700.

20: Aherfi S, Pagnier I, Fournous G, Raoult D, La Scola B, Colson P. Complete

genome sequence of Cannes 8 virus, a new member of the proposed family

"Marseilleviridae". Virus Genes. 2013 Dec;47(3):550-5. doi:

10.1007/s11262-013-0965-4. Epub 2013 Aug 4. PubMed PMID: 23912978.

21: Colson P, De Lamballerie X, Yutin N, Asgari S, Bigot Y, Bideshi DK, Cheng XW,

Federici BA, Van Etten JL, Koonin EV, La Scola B, Raoult D. "Megavirales", a

proposed new order for eukaryotic nucleocytoplasmic large DNA viruses. Arch

Virol. 2013 Dec;158(12):2517-21. doi: 10.1007/s00705-013-1768-6. Epub 2013 Jun

29. PubMed PMID: 23812617.

22: Colson P, Bregigeon S, Tourres C, Solas C, Poizot-Martin I, Tamalet C.

Relapse of hepatitis C virus after 14 months of sustained virological response

following pegylated-interferon alpha plus ribavirin therapy in a human

immunodeficiency virus type 1 infected patient. J Clin Virol. 2013

Sep;58(1):309-14. doi: 10.1016/j.jcv.2013.05.009. Epub 2013 Jun 28. PubMed PMID:

23810614.

23: Saadi H, Pagnier I, Colson P, Cherif JK, Beji M, Boughalmi M, Azza S,

Armstrong N, Robert C, Fournous G, La Scola B, Raoult D. First isolation of

Mimivirus in a patient with pneumonia. Clin Infect Dis. 2013 Aug;57(4):e127-34.

doi: 10.1093/cid/cit354. Epub 2013 May 24. PubMed PMID: 23709652.

24: Colson P, Fancello L, Gimenez G, Armougom F, Desnues C, Fournous G, Yoosuf N,

Million M, La Scola B, Raoult D. Evidence of the megavirome in humans. J Clin

Virol. 2013 Jul;57(3):191-200. doi: 10.1016/j.jcv.2013.03.018. Epub 2013 May 8.


25: Seng P, Abat C, Rolain JM, Colson P, Lagier JC, Gouriet F, Fournier PE,

Drancourt M, La Scola B, Raoult D. Identification of rare pathogenic bacteria in

a clinical microbiology laboratory: impact of matrix-assisted laser desorption

ionization-time of flight mass spectrometry. J Clin Microbiol. 2013



Jul;51(7):2182-94. doi: 10.1128/JCM.00492-13. Epub 2013 May 1. PubMed PMID:

23637301; PubMed Central PMCID: PMC3697718.

26: Moal V, Motte A, Kaba M, Gerolami R, Berland Y, Colson P. Hepatitis E virus

serological testing in kidney transplant recipients with elevated liver enzymes

in 2007-2011 in southeastern France. Diagn Microbiol Infect Dis. 2013

May;76(1):116-8. doi: 10.1016/j.diagmicrobio.2013.02.017. PubMed PMID: 23608351.

27: Yutin N, Colson P, Raoult D, Koonin EV. Mimiviridae: clusters of orthologous

genes, reconstruction of gene repertoire evolution and proposed expansion of the

giant virus family. Virol J. 2013 Apr 4;10:106. doi: 10.1186/1743-422X-10-106.

PubMed PMID: 23557328; PubMed Central PMCID: PMC3620924.

28: Hajji H, Gérolami R, Solas C, Moreau J, Colson P. Chronic hepatitis E

resolution in a human immunodeficiency virus (HIV)-infected patient treated with

ribavirin. Int J Antimicrob Agents. 2013 Jun;41(6):595-7. doi:

10.1016/j.ijantimicag.2013.02.005. Epub 2013 Mar 15. PubMed PMID: 23507411.

29: Thibault V, Gaudy-Graffin C, Colson P, Gozlan J, Schnepf N, Trimoulet P,

Pallier C, Saune K, Branger M, Coste M, Thoraval FR; ANRS Multivir-HBV group.

Epidemiological, virological and clinical characteristics of HBV infection in 223

HIV co-infected patients: a French multi-centre collaborative study. Virol J.

2013 Mar 15;10:87. doi: 10.1186/1743-422X-10-87. PubMed PMID: 23497042; PubMed

Central PMCID: PMC3602101.

30: Colson P, Gouriet F, Badiaga S, Tamalet C, Stein A, Raoult D. Real-time

laboratory surveillance of sexually-transmissible infections in Marseille

University hospitals reveals rise of gonorrhoea, syphilis and human

immunodeficiency virus seroconversions in 2012. Euro Surveill. 2013 Feb

14;18(7):4. PubMed PMID: 23449184.

31: Vallet S, Larrat S, Laperche S, Le Guillou-Guillemette H, Legrand-Abravanel

F, Bouchardeau F, Pivert A, Henquell C, Mirand A, André-Garnier E, Giordanengo V,

Lagathu G, Thibault V, Scholtes C, Schvoerer E, Gaudy-Graffin C, Maylin S,

Trimoulet P, Brochot E, Hantz S, Gozlan J, Roque-Afonso AM, Soussan P, Plantier

JC, Charpentier C, Chevaliez S, Colson P, Mackiewicz V, Aguilera L, Rosec S,

Gouriou S, Magnat N, Lunel-Fabiani F, Izopet J, Morand P, Payan C, Pawlotsky JM.

Multicenter quality control of hepatitis C virus protease inhibitor resistance

genotyping. J Clin Microbiol. 2013 May;51(5):1428-33. doi: 10.1128/JCM.03032-12.

Epub 2013 Feb 20. PubMed PMID: 23426922; PubMed Central PMCID: PMC3647889.

32: Balique F, Colson P, Barry AO, Nappez C, Ferretti A, Moussawi KA, Ngounga T,

Lepidi H, Ghigo E, Mege JL, Lecoq H, Raoult D. Tobacco mosaic virus in the lungs

of mice following intra-tracheal inoculation. PLoS One. 2013;8(1):e54993. doi:

10.1371/journal.pone.0054993. Epub 2013 Jan 30. PubMed PMID: 23383021; PubMed

Central PMCID: PMC3559775.

33: Kaba M, Moal V, Gérolami R, Colson P. Epidemiology of mammalian hepatitis E

virus infection. Intervirology. 2013;56(2):67-83. doi: 10.1159/000342301. Epub

2013 Jan 22. Review. PubMed PMID: 23343760.



34: Bouamra Y, Benali S, Tissot-Dupont H, Tamalet C, Colson P. Hepatitis B and E

co-primary infections in an HIV-1-infected patient. J Clin Microbiol. 2013

Mar;51(3):1052-6. doi: 10.1128/JCM.02630-12. Epub 2013 Jan 9. PubMed PMID:

23303497; PubMed Central PMCID: PMC3592074.

35: Boughalmi M, Saadi H, Pagnier I, Colson P, Fournous G, Raoult D, La Scola B.

High-throughput isolation of giant viruses of the Mimiviridae and

Marseilleviridae families in the Tunisian environment. Environ Microbiol. 2013

Jul;15(7):2000-7. doi: 10.1111/1462-2920.12068. Epub 2013 Jan 9. PubMed PMID:

23298151.

36: Moal V, Legris T, Burtey S, Morange S, Purgus R, Dussol B, Garcia S, Motte A,

Gérolami R, Berland Y, Colson P. Infection with hepatitis E virus in kidney

transplant recipients in southeastern France. J Med Virol. 2013 Mar;85(3):462-71.

doi: 10.1002/jmv.23469. Epub 2012 Dec 12. PubMed PMID: 23239466.

37: Colson P, Pagnier I, Yoosuf N, Fournous G, La Scola B, Raoult D.

"Marseilleviridae", a new family of giant viruses infecting amoebae. Arch Virol.

2013 Apr;158(4):915-20. doi: 10.1007/s00705-012-1537-y. Epub 2012 Nov 29. PubMed

PMID: 23188494.

38: Moal V, Zandotti C, Colson P. Emerging viral diseases in kidney transplant

recipients. Rev Med Virol. 2013 Jan;23(1):50-69. doi: 10.1002/rmv.1732. Epub 2012

Nov 7. Review. PubMed PMID: 23132728.

39: Rossi-Tamisier M, Moal V, Gerolami R, Colson P. Discrepancy between

anti-hepatitis E virus immunoglobulin G prevalence assessed by two assays in

kidney and liver transplant recipients. J Clin Virol. 2013 Jan;56(1):62-4. doi:

10.1016/j.jcv.2012.09.010. Epub 2012 Oct 23. PubMed PMID: 23089569.

40: Moal V, Textoris J, Ben Amara A, Mehraj V, Berland Y, Colson P, Mege JL.

Chronic hepatitis E virus infection is specifically associated with an

interferon-related transcriptional program. J Infect Dis. 2013 Jan

1;207(1):125-32. doi: 10.1093/infdis/jis632. Epub 2012 Oct 16. PubMed PMID:

23072754.

41: Kempf M, Rolain JM, Azza S, Diene S, Joly-Guillou ML, Dubourg G, Colson P,

Papazian L, Richet H, Fournier PE, Ribeiro A, Raoult D. Investigation of

Acinetobacter baumannii resistance to carbapenems in Marseille hospitals, south

of France: a transition from an epidemic to an endemic situation. APMIS. 2013

Jan;121(1):64-71. doi: 10.1111/j.1600-0463.2012.02935.x. Epub 2012 Jun 28. PubMed

PMID: 23030740.

42: Keita MB, Diene SM, Robert C, Raoult D, Fournier PE, Bittar F. Non-contiguous

finished genome sequence and description of Bacillus massiliogorillae sp. nov. Stand

Genomic Sci. 2013.

43: Sharma P, Diene SM, Thibeaut S, Bittar F, Roux V, Gomez C, Reynaud-Gaubert M,

Rolain JM. Phenotypic and genotypic properties of Microbacterium yannicii, a recently

described multidrug resistant bacterium isolated from a lung transplanted patient with cystic

fibrosis in France.. BMC Microbiol. 2013.



44: F. Bittar, M. Reynaud-Gaubert, L. Mely, C. Gomez, J.-Y. Gaubert, P. Thomas and J.-M.

Rolain. Pandoraea pulmonicola chronic colonization in a cystic fibrosis patient, France. S.

Kokcha, NMNI. 2013.

45: Pagnier, I; Croce, O; Robert, C ; Raoult, D ; La Scola, B Non-contiguous finished genome

sequence and description of Anaerococcus pacaensis sp nov., a new species of anaerobic bacterium.

Standards In Genomic Sciences. 8(3) 548-560. IF: 2.01046 :

Slimani M, Pagnier I, Boughalmi M, Raoult D, La Scola B. Alcohol disinfection procedure for

isolating giant viruses from contaminated samples. Intervirology. 2013;56(6):434-40. IF: 1.889

Suárez C, Welsch S, Chlanda P, Hagen W, Hoppe S, Kolovou A, Pagnier I, Raoult D, Locker JK.

OPEN membrane-intermediates are the precursors for assembly of large DNA viruses. Cell Microbiol.

2013 Jun 11. IF : 4.811

47 :Barreau M, Pagnier I, La Scola B. Improving the identification of anaerobes in the clinical

microbiology laboratory through MALDI-TOF mass spectrometry. Anaerobe. 2013 Apr 29. IF : 2,327

Gaia M, Pagnier I, Campocasso A, Fournous G, Raoult D, La Scola B. Broad spectrum of

mimiviridae virophage allows its isolation using a mimivirus reporter. PLoS One. 2013 Apr

15;8(4):e61912. IF : 3.730

48 :Slimani M, Pagnier I, Raoult D, La Scola B. Amoebae as battlefields for bacteria, giant viruses,

and virophages. J Virol. 2013 Apr;87(8):4783-5. IF : 5,076



5 / THESES D’UNIVERSITE et HDR 2013-2014

Liste des thèses

Nom – Prénom

du Doctorant Titre de la thèse

Date Devenir du

Doctorant Inscription Soutenance

Niyaz

YOOSUF Genomes of mimiviruses of amoeba 2010 Dec 2013

Post-doc, Institut

Gustave Roussy,

Paris, France

Fanny

BALIQUE

Détection et impact potentiel des

tobamovirus chez l’homme 2010 Juillet 2013

Institut Pasteur

Dakar, Sénégal

Tatsiana

NGOUNGA

Detection and identification of giant

viruses of amoeba in clinical

specimens

2011 2014 En cours

Haitham

SOBHY

Bioinformatics analysis and

characterization of proteins

associated to fibrils among giant

viruses of amoebae

2011 2014 En cours

Cédric ABAT

Development of epidemiological

tools for the real-time surveillance

of abnormal events based on clinical

microbiology laboratory data

2012 2015 En cours

Liste des HDR

Nom – Prénom Titre de l’HDR

Date de

soutenance

Valérie MOAL - Mars 2014

�

6 / LISTE DES CONTRATS 2013-2014

(Nationaux, européens et ou internationaux en cours ou nouvellement obtenus)

Responsable

Scientifique

Intitulé Organisme

de financement

(ANR, ANRS, PHRC,

Fondation, Associations

caritatives, privé…)

Date de

début

Date de

fin

Pr Bernard LA

SCOLA

Etude des infections par les

virus géants

associés aux amibes chez les

enfants présentant une gastro-

entérite

PHRC 2011 2013



Documents

UM63 CNRS 7278 - IRD 198 INSERM U1095 Virus émergents et