Vancouver&zotero l3ss 2012

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Prsenter votre bibliographie avec la norme Vancouver et Zotero

L3 Sanitaire et SocialSCD UBO novembre 2012Sandrine Nicolas-Guihot & Perrine Helly

Avant toute formation,

- vrifier que tous les postes de la salle de formation sont quips de la dernire version de Firefox (3.5) et d'Open Office (3.1)- vrifier que le module d'import Zotero dans Open Office est bien install sur tous les postes- vrifier que Zotero est bien dsinstall sur tous les postes, sauf celui du formateur.

Bibliographie

Le but dune bibliographie :

viter le plagiat

Vrifier que le contenu a un fondement rel dans la littrature scientifique et universitaire .

Permet aux lecteurs de retrouver facilement linformation originale

Bibliographie : Vancouver

Les atouts de la norme Vancouver :

Facile lire

Gain de place

Norme utilise dans les sciences mdicales lUBO .

Un article de revue

Modle

Nom de l'auteur Initiale(s) du (des) prnom(s). Titre de l'article dans la langue originale. Titre de la revue. Anne;volume(fascicule):pages de dbut et de fin de l'article (spares par un tiret).

Exemple

Kiessling WR. Thyroid function in 44 patients with amyotrophic lateral sclerosis. Arch Neurol. 1982;39(4):241-242.

Payne DK, Sullivan MD, Massie MJ. Womens psychological reactions to breast cancer. Semin Oncol. 1996;(1 suppl 2):89-97.

Un ouvrage

Modle

Nom de l'auteur Initiale(s) du (des) prnom(s). Titre de l'ouvrage : sous-titre. Numro de l'dition partir de la 2me. Ville d'dition : Nom de lditeur; anne de parution: nombre de pages. (Nom de la collection ; n)

Exemple

Bach JF. Trait d'immunologie. Paris : Flammarion Mdecine Sciences; 1993:1205 p.

Chapitre dun ouvrage

Modle

Nom de l'auteur du chapitre Initiale du prnom. Titre du chapitre. In : Nom de lauteur de louvrage Initiale du prnom. Titre de louvrage. Numro de l'dition partir de la seconde. Ville d'dition : Editeur; anne de l'dition: pages de dbut et de fin du chapitre (spares par un tiret).

Exemple

Phillips SJ, Whisnant JP. Hypertension and stroke. In : Laragh JH, Brenner BM, editors. Hypertension : pathophysiology, diagnosis, and management. 2nd ed. New-York : Raven Press; 1995: 465-78.

Une thse un mmoire

Modle

Nom de l'auteur Initiale(s) du (des) prnom(s). Titre de la thse. Nature du document et discipline. Universit de soutenance;anne :pages.

Exemple

Hebert S. Mningites haemophilius influenzae chez l'enfant en Polynsie Franaise. Thse de mdecine. Universit Paris XI; 1997: 219 p.

Article, ouvrage ou thse en ligne

Modle

Pour les articles, ouvrages et thses en ligne, faire suivre la rfrence par

[En ligne]. Lien URL. Consult le date de consultation

ExemplePiro LD, Carrera CJ, Carson DA, Beutler E. Lasting remissions in Hairy-Cell Leukemia Induced by a Single Infusion of Chlorodeoxyadenosine. N. Engl. J. Med. 1990;322(16):1117-1121. [En ligne]. http://content.nejm.org/cgi/content/abstract/322/16/1117 Consult le 13 novembre 2012

Site internet

Modle

Pour les documents extraits dun site web.

Organisme ou Auteur. Titre du site ou de la page. [En ligne]. Lien URL. Consult le date de consultation.

Exemple

OMS:Organisation Mondiale de la Sant. Rapport sur la sant dans le monde 2008. [En ligne]. http://www.who.int/whr/2008/fr/index.html. Consult le 13 novembre 2012.

Bibliographie : Vancouver

Il faut citer et numroter les rfrences bibliographiques selon leur ordre dapparition dans le texte .

Les rfrences sont notes sous forme de n entre parenthses ou dexposant.

Bibliographie : Vancouver

A retenir :

Respecter la ponctuation.

Respecter la forme abrge du titre de la revue.( Pubmed ou Sudoc)

Si une rfrence est cite plusieurs fois, elle conserve toujours le mme numro .

Suivre le mme type de prsentation tout au long de la bibliographie .

Pour gagner du temps : Zotero

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Le principe est d'abord de montrer rapidement l'avantage du logiciel et son intrt, avant de le faire installer puis de faire travailler les stagiaires sur une srie d'exercices.

Les comptences acqurir sont les suivantes :- comprendre l'intrt du logiciel Zotero- savoir l'installer sur son propre poste- savoir importer une rfrence- savoir ajouter une note une rfrence- savoir grer ses rfrences dans des dossiers ou avec des mots-clefs- savoir exporter une ou plusieurs rfrences sous forme de bibliographie dans un document texte- savoir sauvegarder sa bibliothque Zotero pour la rimporter ventuellement plus tard.

1. Dcouverte

Dmonstration en direct ou visionnage de la vido.

En fonction du temps disponible, choisir de montrer soi-mme un exemple d'importation puis d'exportation de rfrence ou bien montrer la vido (3 minutes).

Problme : si le son ne marche pas, il faudra commenter soi-mme la vido.

La dmonstration peut se faire en deux temps :- import d'une rfrence d'ouvrage depuis le sudoc- depuis un document Open Office texte, crire citation et montrer un ajout de note de bas de page avec lien vers l'ouvrage prcdemment import.

Comment a marche?

Zotero rcupre les donnes bibliographiques sur internet et les enregistre dans un format de description bibliographique (Zotero RDF).

Il peut ensuite les rexporter en format texte en respectant plusieurs styles de prsentation prparamtrs.

Les logiciels pour diter des bibliographies

Prsentation du logiciel

Une extension de Firefox, gratuite

Existe aussi en logiciel indpendant Zotero StandAlone (compatible avec les navigateurs Chrome et Safari)

La question de la gratuit conduit tout droit aux avantages et inconvnients de Zotero.

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Exercice

Installer Zotero sur Firefox

L'installation de Zotero correspond une installation classique de module complmentaire sur Firefox.

Ceux qui connaissent dj cet outil iront trs vite pour l'installer, tandis que d'autres peuvent tre un peu dboussols par cette interface qu'il ne connaissent pas du tout (surtout s'ils ont l'habitude de travailler avec Explorer).

Installer Zotero

http://www.zotero.org

Installation termine!

2e tape de l'installation

Crez votre compte personnel sur http://www.zotero.org[register]

Exercice

Affichez puis masquez Zotero dans votre navigateur.

Zotero affich

Zotero masqu

Zotero en pleine page

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Importation de rfrences bibliographiques depuis le web

Exercice

http://portail-scd.univ-brest.fr

Trouvez dans le catalogue des BU de Brest la notice de l'ouvrage suivant

Huas D, Rueff B. Abord clinique des malades de l'alcool en mdecine gnrale. Paris: Springer; 2005.

Cette tape permet de vrifier que les stagiaires connaissent le Sudoc et sinon, de le leur faire dcouvrir.

Ne pas hsiter si le catalogue leur est totalement inconnu faire un petit appart sur le rebond localisation qui permet de savoir si l'ouvrage est disponible dans les bilbiothques de l'enseignement suprieur de France...

Et rappeler que depuis une requte Google Books, on peut rebondir dans Amazon mais aussi dans le Sudoc.

Exercice

Importez cette notice dans votre liste de rfrences Zotero.

Correction

Correction (suite)

Exercice 3

Trouvez et importez depuis le catalogue Sudoc trois rfrences d'ouvrages sur le sevrage tabagique.

Correction (2)

On peut importer dans sa bibliothque Zotero une liste de plusieurs ouvrages la fois.

Correction (3)

Correction (4)

Cochez les trois ouvrages que vous souhaitez importer...

Astuce : pour que vos rfrences aillent directement dans votre dossier Sevrage tabagique, il vous suffit de crer le dossier d'abord et de le slctionner avant d'importer vos rfrences.

Les rfrences sont alors automatiquement importes dans le dossier qui est dj ouvert par Zotero.

Correction (5)

Remarque : dans cet exemple, une des rfrences importes est une thseLes thses sont reprsentes par une icne spcifique

Exercice

Trouvez puis importez depuis la base PubMed la rfrence suivante

Dubar G. et al. French Experience of 2009 A/H1N1v Influenza in Pregnant Women. PLoS One [En ligne]. 2010, Vol. 5, n10.

.

Correction

Quand on importe un article, l'icne droite de la barre d'adresse est cette fois non pas un livre, mais une petite feuille.

Exercice : import d'une page web

Importez dans votre bibliothque Zotero l'article de blog suivant

Flahaut, Antoine. Grippe, la France Sentinelle de l'Europe? in Le Blog d'Antoine Flahaut, 24 septembre 2009.

Correction

Mme sans icne dans la barre d'adresse, il est toujours possible de capturer une page web

Correction

Ici, il faudra cependant corriger la notice importe pour indiquer qu'il s'agit d'un billet de blog et non pas d'une page web classique

Nota Bene

Il est toujours possible dans Zotero de crer manuellement une notice.

C'est la premire option qui est la plus intressante, condition d'avoir la place sur son disque dur ou sa clef USB de stocker une copie de ces fichiers;

Rcapitulatif des icnes d'importation

Importation d'une rfrence d'ouvrage

Importation simultane d'une liste de rfrences d'ouvrages ou d'articles

Importation d'une rfrence d'article

Importation d'une page web

Importation d'une rfrence de thse

Rappel : si aucune icne n'apparat, il faut alors entrer manuellement la notice ou bien importer la page web en se servant de la barre d'outil.

___________________________________

Dans le cas d'un titre de chapitre, il faut tlcharger la rfrence du livre, puis changer ensuite le type de notice dans le menu droulant de l'onglet info pour choisir chapitre de livre.

Puis il faudra corriger pour ajouter le titre et l'auteur du chapitre.

Quelques sites Zotero-compatibles

http://www.zotero.org/translators

Sites compatiblesCatalogue UBO

Sudoc

Pubmed

EbscoHost (Pascal)

Science Direct

CAIRN

HAL (archives ouvertes CNRS)

etc

Incompatible Cismef

Partiellement compatiblesUbodoc

Partiellement compatiblesUbodoc

BDSP

Cochrane

Rappeler aux stagiaires qu'il faut dans tous les cas vrifier que la rfrence importe est bien complte (auteur, titre, date, au minimum).> sinon, la modifier.

Import par ISBN, DOI ou PMID

La barre d'outils

Crer un dossier ou un sous-dossierImporter, exporter une bibliothque, rglage des prfrences etc...Annoter votre bibliothque ou vos dossiers ou sous-dossiers

Faire une recherche dans les lments de votre bibliothqueSaisir manuellement une notice

Joindre un fichier une rfrence

Crer une notice partir de la page web en cours

Importer par numro (ISBN, DOI, PMID...)

Crer un groupe ou une bibliothque partagePrsentation de la barre d'outil qui se trouve au-dessus des trois colonnes.

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6. Partager

Interface : les trois panneaux1 : La bibliothque (possibilit dorganiser en dossiers et sous-dossier,2 : Liste des notices du dossier slectionn,3 : La fiche de llment (article, ouvrage, page Internet etc.) slectionn.Source : Mathieu Poujol

Prsenter successivement les 3 colonnes

1) colonne de classementClasser les rfrences dans des collections facilite le travail. Il est possible de renommer les collections, les dplacer (pour les transformer en sous-dossier). Attention, les sous-collections ne sont pas prise en compte lors de la cration de bibliographie partir du dossier parent.

Ma bibliothque contient lensemble des rfrences rparties dans les collections ainsi que les rfrences non classes.

2) Colonne de liste des rfrencesOn voit dans cette colonne, en fonction du dossier slectionn, la liste des rfrences avec leur titre et une icne qui prcise le type de rfrence.

3) Colonne de description d'une rfrenceLa colonne de droite propose plusieurs onglets dlivrant des dtails sur llment slectionn dans la colonne du milieu et permettant dy associer des informations complmentaires.

Organiser sa bibliothque

Par collections/dossiers

Par marqueurs/mots-clefs

Source : Mathieu Poujol

Il y a deux faons possibles d'organiser sa bibliothque- par dossiers et sous-dossiers (conseill)- par mots-clefs (marqueurs ou tags) : attention, sur de nombreux sites des mots-clefs sont imports en mme temps que la notice.

Exercice

Enregistrez vos rfrences sur le sevrage tabagique dans- un sous-dossier intitul sevrage tabagique- qui se trouvera lui-mme dans un nouveau dossier de la bibliothque intitul : Tabacologie.

Correction

Correction (2)

Correction (3)

Associer un fichier une rfrence

Pour garder sous la main le pdf d'un article ou d'une thse

2 tapes

1) on tlcharge la rfrence

2) on associe le document pdf la rfrence

Exercice

http://hal.archives-ouvertes.fr

Dans l'archive ouverte HAL, trouvez et importez dans Zotero la rfrence de la thse suivante

Abtey, Catherine. La confiance chez les femmes primipares de la grossesse au post-partum. [Thse] Universit de Nantes, 2008.

Les mdecins auront normalement abord HAL durant le cours prcdent avec Catherine Bertignac.

Exercice (suite)

Associez la rfrence importe le fichier PDF du document (texte intgral de la thse version 1).

Correction

1. On slectionne la rfrence d'abord

2. On enregistre le pdf qui est affich dans Firefox

Correction

Il sera possible, mme sans connexion internet, de retrouver et de lire ce fichier.

Astuce : cette thse n'est pas encore rfrence dans le Sudoc (elle n'a sans doute pas encore t soutenue et corrige).

Dans le cas o la thse est prsente dans le Sudoc, il vaut mieux importer la rfrence depuis le sudoc avant d'y ajouter le fichier pdf tlcharg dans HAL

Le bouton afficer le fichier de gauche permet de lire le fichier dans son navigateur Firefox.

Le bouton afficher le fichier de droite permet de voir le fichier dans son contexte / emplacement sur l'ordinateur.

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Exportation d'une bibliographie dans un document texte

Par copier-coller

Avec la barre de citation

(dans Word)

OU BIEN

Exercice

Exportez l'ensemble de vos rfrences traitant du sevrage tabagique sous forme de bibliographie dans un document texte avec le style Vancouver

Par copier - coller

Correction

Par copier - coller

Correction (2)

Par copier - coller

Correction (3)

Coller le presse-papier dans un document texte.

1. Tanguy C. Addiction et sevrage tabagique. 2008 ;1 vol. (125 f.-X-10l.en coul.

2. Metzger-Flock A. Particularits de l'aide au sevrage tabagique en mdecine gnrale : propos d'une enqute ralise auprs des mdecins gnralistes de la rgion mulhousienne. 2005 ;89 f.

3. Perriot J., Llorca P., Boussiron D, Schwan R. Tabacologie et sevrage tabagique. Montrouge: J. Libbey Eurotext; 2003.

Installer la barre de citation

Quitter Word d'abord

Installer la barre de citation Zotero pour Word depuis l'adresse suivante

http://bit.ly/RWfAJO

Avec la barre de citation

O trouver la barre de citation dans Word?

La barre de citation Word/LibreOffice/OpenOffice

Source : Daniel Bourrion

Barre de citation : 2 tapes

Insrer des citations rfrences

Insrer la bibliographie complte

Exercice

Dans un nouveau document Word, insrez trois rfrences de votre bibliothque Zotero sous forme de citations avec le style Vancouver

Insrer des citations rfrences

Il faudra trouver une adresse plus courte pour que l'import du document soit plus facile.

Correction

Insrer des citations rfrences

Dans le cas du style Vancouver, l'insertion d'une rfrence dans un texte en cours de rdaction se fait en deux tapes1) insertion du numro de la rfrence2) insertion, la fin du document, de la bibliographie complte.

L'tudiant est dans ce cas invit diter sa bibliographie seulement la toute fin de son travail.

La barre de citation
Word / Libre Office /Open Office

Source : Daniel Bourrion

Exercice

Insrer la bibliographie complte des rfrences dj ajoutes en citation.

Insrer la bibliographie complte

Exercice

Ajouter cette bibliographie une rfrence qui ne fait pas partie des citations du document.

Insrer la bibliographie complte

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Sauvegarde de donnes

On peut sauvegarder manuellement sa bibliothque Zotero sur un disque dur

Pour l'utiliser plus tard sur un autre ordinateur avec Zotero

Pour l'importer dans un autre logiciel de gestion bibliographique si on dcide d'en changer : EndNote, Mendeley etc

Sauvegarde de donnes (2)

Il est aussi possible de sauvegarder sa bibliothque Zotero automatiquement par synchronisation avec son compte Zotero en ligne.

Exercice

Depuis votre bote mail, activez votre compte personnel Zotero en ligne (cr en dbut de sance)

Exercice (suite)

Dans les prfrences de Zotero, entrez les paramtres de votre compte Zotero pour la synchronisation de vos rfrences avec votre compte en ligne

Correction

Correction

Exercice

Synchronisez votre Zotero local avec votre profil Zotero en ligne

Correction

Vous avez dornavant 2 bibliothques Zotero

Une bibliothque locale

Une bibliothque en ligne

Ces 2 bibliothques sont synchronises.

Ma bibliothque Zotero (Library) en ligne

Ma bibliothque Zotero locale

Synchronisation

Exercice

- Connectez vous sur le site de Zotero (login) afin de pouvoir visualiser et grer votre bibliothque Zotero en ligne.

- Modifiez les paramtres de visibilit de votre page selon votre convenance

Paramtres de confidentialit : un exemple

Possibilit de travailler en groupe sur des bibliographies partages

Groupes privs

Groupes publics accs plus ou moins restreints

Groups publics avec bibliographie partage publiquecf. childhood obesity

Crer son groupe

Merci de votre attention !http://formation.scd.univ-brest.fr

Perrine HellySandrine Nicolas-Guihot

Pour nous contacter:

[email protected]

02.98.01.64.77

Crdits photographiques

Nasa Images

Pdimension.net

Boris sur Flickr

Xtof sur Flickr

Pascal Lemaire sur Picasa

Caroline & Laurent sur Picasa

Universit de Bretagne Occidentale Service Commun de documentation

Mj novembre 2012