DE L’ADN A LA PROTEINE
BA OusmaneLaboratoire de Parasitologie et Mycologie MédicaleInstitut Nationale de Recherches en Santé publique
Atelier paludisme 2006
EVALUATION
par les FACILITATEURS
Plan
�Introduction
�Génome du Plasmodium falciparum
�Transcription
�Protéines
�Conclusion
Introduction
Génome du Plasmodium falciparum
� Trois types de génomes: nucléaire, mitochondrial, apicoplaste
� Taille: 25 méga base� 14 chromosomes(séquençage terminé en octobre
2002)� 5279 gènes identifiés, 60% de fonction inconnue� Composition en A-T: 80%(90% dans les introns),
différence P. vivax(67%)� Polymorphisme élevé
Transcription (1)
Transcription (2)
�Transcriptome: ensemble des ARNm issu de l’expression d’une partie du génome d’une cellule
�Intérêt: identifier gènes actifs, mécanisme de régulation d’expression des gènes, définir les réseaux d’expression des gènes
�Environ 40% des gènes du Plasmodium falciparum sont transcrits
Transcription (3)
�P. falciparum: transcription en fonction de la demande
�Suivant les trois phases du cycle chez l’Homme: protéines intervenants dans les stades : trophozoïtes, hypnozoïtes (sauf Pf), gamétocytes
�Actif aussi chez le moustique: production des sporozoïtes
Protéines (1)
Protéines (2)�PfEMP1( Erythrocyte Membrane Protein 1 )
�Exprimée/parasite et transporté à la surface des globules rouges grâce au réseau tubulovésiculaire (Synthèse revues,M/S n°5, vol21,Mai 2005:523-9)
�Quasi-totalité de l’adhésion
�Production sans cesse de nouveau variants
�Rôle: agglutination, variation antigénique, immunorégulation.
Protéine (3)
�Variation Tropisme (répartition récepteur endothéliaux non homogène)
�CS (Circum Sporozoïtes)
� Adhésion des sporozoïtes aux hépatocytes
� Développement du parasite dans le moustique
� Formation des sporozoïtes dans les oocystes
Conclusion (1)
�Application thérapeutique: CQrésistance
�Etude du polymorphisme de séquences répétées associées aux mutations:origine de la chloroquino-résistance
�PfCRT, sur chx7, proximité de PfCG2, mutations ponctuelles retrouvées dans échecs thérapeutiques de la chloroquine .
�PfMDR1, gène, sur chx5, mutations ponctuelles sont liées à la chloroquino-résistance
Conclusion (2)
�Moitié des protéines du P. falciparum ont une fonction inconnue
�Et sont spécifiques du parasite
�Donc ces protéines peuvent représenter des cibles thérapeutiques originales
Bibliographie (1)� Anonyme, visite le 07 Mars 2006http://ludwig-sun1.unil.ch/~vjongene/molbio/chapt_1.htm
� Berthier A.L. (1997). A la découverte du gène.Agro Performances, Hors série oct. 97, 8-9.http://www.gnis-pedagogie.org/pages/classbio/biblio.htm
� Francoise Baunaure, Gordon Langsley. Trafic protéique dans le globule rouge infecté par Plasmodium
Synthèse revues,M/S n°5, vol21,Mai 2005:523-9http://disc.vjf.inserm.fr/basismedsci/2005/ms_5_2005/BAUNAURE_p523_529.pdf
� K. G. Le Roch, J. R. Johnson, L. Florens, Y. Zhou, A. Santrosyan, M. Grainger, S. F. Yan, K. C. Williamson, A. A. Holder, D. J. Carucci, J. R. Yates III, and E. A. Winzeler
Global analysis of transcript and protein levels across the Plasmodium falciparum life cycleGenome Res., November 1, 2004; 14(11): 2308 – 2318
http://www.ajtmh.org/cgi/content/abstract/67/3/233
� L. H. Freitas-Junior, E. Bottius, L. A. Pirrit, K. W. Deitsch, C. Scheidig, F. Guinet, U. Nehrbass, T. E. Wellems and A. Scherf. Frequent ectopic recombination of virulence factor genes in telomeric chromosome clusters of P. falciparum. Nature. vol. 407, october 2000, pp. 1018-1022.
http://www.cnrs.fr/Cnrspresse/n390/html/n390a09.htm
Bibliographie (2)� MCINTOSH MT, SRIVASTAVA R & VAIDYA AB- Divergent evolutionaryconstraints on mitochondrial and nuclear genomes ofmalaria parasites. Mol Biochem Parasitol, 1998,
95 , 69-80.http://www.pathexo.fr/pdf/1999n4/Lebras.pdf
� P. Collet, V.Derozier, G. Dray, F. Trousset, P. Poncelet, M. Crampes. Tendances dans les expressions de
gènes : Application à l’analyse du transcriptome de Plasmodium Falciparum. Actes du Congrès EGC 2005, Paris,
janvier 2005. Editions Cepaduès. ISBN : 2-85428-683-9.http://pbil.univ-lyon1.fr/events/jobim2005/proceedings/P60Collet.pdf
� R. MénardApproche génétique de l’étudedu cycle sporogonique de Plasmodium.Manuscrit n°1963/PLS12. Journée IP en hommage à Paul-Louis SIMOND.http://www.pathexo.fr/pdf/1999n5b/Menard.pdf
� SU XZ, KIRKMAN LA, FUJIOKA H & WELLEMS TE - Complexpolymorphism’s in a 330-kDa protein are linked to chloroquineresistantP. falciparum in Southeast Asia and Africa. Cell, 1997.91, 593-603.http://www.pathexo.fr/pdf/1999n4/Lebras.pdf
� WATERS AP, THOMAS AW, VANDIJK MR & JANSE CJTransfectionof malaria parasites. Methods, 1997, 13, 134-147.http://www.pathexo.fr/pdf/1999n4/Lebras.pdf
DE L’ADN A LA PROTEINE
BA OusmaneLaboratoire de Parasitologie et Mycologie MédicaleInstitut Nationale de Recherches en Santé publique
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