DE L’ADN A LA PROTEINE

BA OusmaneLaboratoire de Parasitologie et Mycologie MédicaleInstitut Nationale de Recherches en Santé publique

Atelier paludisme 2006

EVALUATION

par les FACILITATEURS

Plan

�Introduction

�Génome du Plasmodium falciparum

�Transcription

�Protéines

�Conclusion

Introduction

Génome du Plasmodium falciparum

� Trois types de génomes: nucléaire, mitochondrial, apicoplaste

� Taille: 25 méga base� 14 chromosomes(séquençage terminé en octobre

2002)� 5279 gènes identifiés, 60% de fonction inconnue� Composition en A-T: 80%(90% dans les introns),

différence P. vivax(67%)� Polymorphisme élevé

Transcription (1)

Transcription (2)

�Transcriptome: ensemble des ARNm issu de l’expression d’une partie du génome d’une cellule

�Intérêt: identifier gènes actifs, mécanisme de régulation d’expression des gènes, définir les réseaux d’expression des gènes

�Environ 40% des gènes du Plasmodium falciparum sont transcrits

Transcription (3)

�P. falciparum: transcription en fonction de la demande

�Suivant les trois phases du cycle chez l’Homme: protéines intervenants dans les stades : trophozoïtes, hypnozoïtes (sauf Pf), gamétocytes

�Actif aussi chez le moustique: production des sporozoïtes

Protéines (1)

Protéines (2)�PfEMP1( Erythrocyte Membrane Protein 1 )

�Exprimée/parasite et transporté à la surface des globules rouges grâce au réseau tubulovésiculaire (Synthèse revues,M/S n°5, vol21,Mai 2005:523-9)

�Quasi-totalité de l’adhésion

�Production sans cesse de nouveau variants

�Rôle: agglutination, variation antigénique, immunorégulation.

Protéine (3)

�Variation Tropisme (répartition récepteur endothéliaux non homogène)

�CS (Circum Sporozoïtes)

� Adhésion des sporozoïtes aux hépatocytes

� Développement du parasite dans le moustique

� Formation des sporozoïtes dans les oocystes

Conclusion (1)

�Application thérapeutique: CQrésistance

�Etude du polymorphisme de séquences répétées associées aux mutations:origine de la chloroquino-résistance

�PfCRT, sur chx7, proximité de PfCG2, mutations ponctuelles retrouvées dans échecs thérapeutiques de la chloroquine .

�PfMDR1, gène, sur chx5, mutations ponctuelles sont liées à la chloroquino-résistance

Conclusion (2)

�Moitié des protéines du P. falciparum ont une fonction inconnue

�Et sont spécifiques du parasite

�Donc ces protéines peuvent représenter des cibles thérapeutiques originales

Bibliographie (1)� Anonyme, visite le 07 Mars 2006http://ludwig-sun1.unil.ch/~vjongene/molbio/chapt_1.htm

� Berthier A.L. (1997). A la découverte du gène.Agro Performances, Hors série oct. 97, 8-9.http://www.gnis-pedagogie.org/pages/classbio/biblio.htm

� Francoise Baunaure, Gordon Langsley. Trafic protéique dans le globule rouge infecté par Plasmodium

Synthèse revues,M/S n°5, vol21,Mai 2005:523-9http://disc.vjf.inserm.fr/basismedsci/2005/ms_5_2005/BAUNAURE_p523_529.pdf

� K. G. Le Roch, J. R. Johnson, L. Florens, Y. Zhou, A. Santrosyan, M. Grainger, S. F. Yan, K. C. Williamson, A. A. Holder, D. J. Carucci, J. R. Yates III, and E. A. Winzeler

Global analysis of transcript and protein levels across the Plasmodium falciparum life cycleGenome Res., November 1, 2004; 14(11): 2308 – 2318

http://www.ajtmh.org/cgi/content/abstract/67/3/233

� L. H. Freitas-Junior, E. Bottius, L. A. Pirrit, K. W. Deitsch, C. Scheidig, F. Guinet, U. Nehrbass, T. E. Wellems and A. Scherf. Frequent ectopic recombination of virulence factor genes in telomeric chromosome clusters of P. falciparum. Nature. vol. 407, october 2000, pp. 1018-1022.

http://www.cnrs.fr/Cnrspresse/n390/html/n390a09.htm

Bibliographie (2)� MCINTOSH MT, SRIVASTAVA R & VAIDYA AB- Divergent evolutionaryconstraints on mitochondrial and nuclear genomes ofmalaria parasites. Mol Biochem Parasitol, 1998,

95 , 69-80.http://www.pathexo.fr/pdf/1999n4/Lebras.pdf

� P. Collet, V.Derozier, G. Dray, F. Trousset, P. Poncelet, M. Crampes. Tendances dans les expressions de

gènes : Application à l’analyse du transcriptome de Plasmodium Falciparum. Actes du Congrès EGC 2005, Paris,

janvier 2005. Editions Cepaduès. ISBN : 2-85428-683-9.http://pbil.univ-lyon1.fr/events/jobim2005/proceedings/P60Collet.pdf

� R. MénardApproche génétique de l’étudedu cycle sporogonique de Plasmodium.Manuscrit n°1963/PLS12. Journée IP en hommage à Paul-Louis SIMOND.http://www.pathexo.fr/pdf/1999n5b/Menard.pdf

� SU XZ, KIRKMAN LA, FUJIOKA H & WELLEMS TE - Complexpolymorphism’s in a 330-kDa protein are linked to chloroquineresistantP. falciparum in Southeast Asia and Africa. Cell, 1997.91, 593-603.http://www.pathexo.fr/pdf/1999n4/Lebras.pdf

� WATERS AP, THOMAS AW, VANDIJK MR & JANSE CJTransfectionof malaria parasites. Methods, 1997, 13, 134-147.http://www.pathexo.fr/pdf/1999n4/Lebras.pdf

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