Résultats de la première enquête pour la cartographie
de l’accessibilité aux tests moléculaires dans cinq
régions pilotes
Décembre 2014
Plateformes hospitalières de génétique moléculaire des cancers
� 28 plates-formes soutenues par l’INCa et la
DGOS
� Laboratoires regroupés dans plusieurs
établissements de santé (CHU/CLCC)
� Organisation régionale, voire interrégionale
� Multidisciplinarité pathologistes/ biologistes
Objectifs : • assurer une équité d’accès aux tests moléculaires innovants
• pour tous les patients de la région, quelque soit l’établissement où ils sont pris en charge
• assurer des tests de qualité
• hémopathies, tumeurs solides
Reims
Nancy Strasbourg-
Colmar-
Mulhouse
Lille
Dijon
Montpellier-
Nîmes
Grenoble
Besançon
St. Etienne
Lyon
Rouen
Nantes
Caen
LimogesPoitiers
Marseille
Bordeaux-
La Réunion
Clermont-
Ferrand
Angers
Nice
Rennes
Brest
Toulouse
Curie
Versailles
Paris - AP-HP
Gustave Roussy
Orléans-
Tours
Amiens
2
Quels tests à visée thérapeutique?
Translocation BCR-ABL Leucémie Myéloïde Chronique / Leucémie Aiguë Lymphoblastique
imatinib, nilotinib, dasatinib
Mutations de KIT et de PDGFRA
GIST imatinib, nilotinib et dasatinib
Amplification de HER2 Cancers du sein et de l’estomac trastuzumab, lapatinib (sein)
Mutations de KRAS Cancer colorectal cetuximab et panitumumab
Mutations d’EGFR Cancer du poumon Gefitinib, erlotinib, afatinib
Translocation d’ALK Cancer du poumon crizotinib
Mutation BRAF V600 Mélanome Vemurafenib, dabrafenib
3
Les enjeux de ce programme
� S’assurer que tous les patients qui en ont besoin ont un accès aux tests moléculaires
� Assurance qualité
� Etre en mesure d’effectuer le test pour un grand nombre de patients dès qu’une thérapie
ciblée est disponible
� Faire face à l’augmentation du nombre de biomarqueurs à tester
⇒ Pilotage du programme /collecte des données d’activité par l’INCa
⇒ Mise en place d’un programme spécifique d’assurance qualité
⇒ Anticiper l’arrivée de nouvelles thérapies ciblées : cibles/ localisations
tumorales
⇒ Implémentation de nouvelles technologies : séquençage de nouvelle
génération (NGS)
Enjeu : S’assurer que tous les patients ont effectivement accès aux tests moléculaires
⇒ Permet d’évaluer au niveau national l’adéquation avec les besoins
⇒ Insuffisant pour évaluer l’équité d’accès sur tout le territoire
⇒ Données parcellaires sur les délais de rendu des résultats
Données nationales établies à partir des données d’activité des plateformes de génétique moléculaire :
� Nombre de patients ayant bénéficié d’un test moléculaire
� % de prescriptions provenant d’établissements extérieurs
5
Action 6.2 Conforter l’accès aux tests moléculaires
Mise en œuvre de cette action
Lancement de deux enquêtes avec les ARS de 5 régions pilotes : Ile de France,Aquitaine, Languedoc-Roussillon, Provence Alpes Côte d’Azur et Rhône-Alpes
� Enquête 1 : Plateformes de génétique moléculaire :
• Environnement des plateformes : structures d’ACP, prescripteurs, patients
• Délais de réalisation des tests
� Enquête 2 : Etablissements autorisés à l’activité de chimiothérapie :
• Prescription des tests par les cliniciens
• Modalités de collaboration avec une plateforme définie
Focus sur trois pathologies :
� le cancer du poumon (test EGR)
� le cancer colorectal (test RAS)
� le mélanome (test BRAF)
7
10 plateformes de génétique moléculaire impliquées
� Région Aquitaine :- Bordeaux : CHU et CLCC + Ile de la Réunion : CHU
� Région Languedoc-Roussillon :- Montpellier : CHU et CLCC + Nîmes : CHU
� Région Rhônes-Alpes : 3 plateformes- Lyon : CHU et CLCC- Grenoble : CHU- Saint-Etienne : CHU
� Région PACA: 2 plateformes- Marseille : AP-HM et IPC- Nice : CHU et CLCC
� Région Ile de France :- AP-HP � activité répartie dans 11 hôpitaux - Institut Curie : CLCC- Gustave Roussy : CLCC
• Groupe de travail avec les 5 ARS et l’INCa
• Enquête prospective dans les 10 plateformes des 5 régions pendant une période de 4 semaines
• Focus sur trois pathologies : cancer du poumon, cancer colorectal et mélanome
• Enquête débutée en juin 2014
• Recueil des données sur un questionnaire en ligne
• ARS Ile-de-France :� mise en œuvre et gestion de l’enquête� Extraction des données� Analyse des données en collaboration avec l’INCa
Première enquête : méthode
Les données de 2 836 patients ont été récoltées, soit 11 % de
l’activité annuelle des plateformes
1218
1284
334
Cancer colorectal
Cancer du poumon
Mélanome
Données générales
Répartition de
l’activité annuelle
Répartition des données par plateforme
AP-HP; 1222
Bordeaux; 346
Marseille; 251
Lyon; 250
Montpellier-
Nîmes; 224
Nice; 166
Gustave
Roussy; 152
Grenoble; 95Institut Curie;
84 Saint-Etienne;
46
Information renseignée pour 2 784 patients / 2 836
66,6%
17,1%
16,3%
clinicien
préleveur
Pathologiste
Qui sont les prescripteurs des tests moléculaires?
Qui sont les prescripteurs?Ile de France
National
69%13%
18%
AP-HP
(1195/1222)43%
20%
37%
Institut Curie
(81/84)
clinicien
préleveur
pathologiste
61%39%
00
Gustave Roussy
(152/152)
Qui sont les prescripteurs?Aquitaine
National
clinicien
préleveur
pathologiste
19%
70%
11%
Bordeaux
(342/346)
Qui sont les prescripteurs?Languedoc-Roussillon
National
clinicien
préleveur
pathologiste
77%
4%
18%
Montpellier-Nîmes
(224/224)
Qui sont les prescripteurs?Rhône-Alpes
National
clinicien
préleveur
pathologiste
69%
11%
20%
Saint-Etienne
(45/46)
87%
5%9%
Lyon
(244/250)
97%
1% 2%
Grenoble
(94/95)
Qui sont les prescripteurs?PACA
National
clinicien
préleveur
pathologiste
77%
12%11%
Marseille
(247/251)
89%
4%8%
Nice
(160/166)
8%
92%prescriptions
extra-régionales
prescriptions
régionales
62%38%
prescriptions
hors PF
prescriptions
internes
Origine des prescriptions
Information renseignée pour 2 511 patients / 2 836
⇒ Cohérent avec les données
nationales colligées par l’INCa
⇒ Logique régionale respectée pour
ces tests fréquents
Localisation des établissements prescripteurs
52%48%
AP-HP
(1104/1222)
63%
37%
Institut Curie
(80/84)
Prescriptions internes
Prescriptions hors plateforme
44%
56%
Gustave Roussy
(152/152)
Origine des prescriptions : Ile de France
National
93 % des prescriptions sont issues d’établissements de la région
Prescriptions internes
Prescriptions hors plateforme
Origine des prescriptions :Aquitaine
National
80%
20%
Bordeaux
(343/346)
75 % des prescriptions sont issues d’établissements de la région Aquitaine
Prescriptions internes
Prescriptions hors plateforme
Origine des prescriptions : Languedoc-Roussillon
National
63%
37%
Montpellier-Nîmes
(224/224)
95 % des prescriptions sont issues d’établissements de la région
Prescriptions internes
Prescriptions hors plateforme
Origine des prescriptions : Rhône-Alpes
National
54%46%
Saint-Etienne
(46/46)
85%
15%
Lyon
(247/250)
75%
25%
Grenoble
(95/95)
99 % des prescriptions sont issues d’établissements de la région
Prescriptions internes
Prescriptions hors plateforme
Origine des prescriptions :PACA
National
77%
23%
Marseille
(248/251)
83%
17%
Nice
(161/166)
94% des prescriptions sont issues d’établissements de la région
� 251 structures d’ACP ont envoyé des
prélèvements
� Les grosses structures d’ACP (> 10
prescriptions pendant la période de
l’enquête) représentent :
• 2/3 des prescriptions
• 66 prescripteurs, soit 26% des
structures
Plateforme Nb. de labos d’ACP > 10
prescriptions pendant
l’enquête
APHP 25
BORDEAUX 7
CURIE 2
GRENOBLE 4
LYON 6
MARSEILLE 7
MONTPELLIER 8
NICE 4
SAINT-ETIENNE 1
GUSTAVE ROUSSY 2
TOTAL 66
Qui adresse les prélèvements?
AP-HP
(331/1222)
Institut Curie
(56/84)Gustave Roussy
(115/152)
1-2
3-5
6-11
≥12
Origine géographique des patients : Ile de France
81% des patients sont originaires de la région
Bordeaux
(259/346)
Origine géographique des patients : Aquitaine
1-3
4-18
19-26
≥27
71% des patients sont originaires de la région Aquitaine
12 % des patients originaires des DOM
Montpellier-Nîmes
(157/224)
Origine géographique des patients : Languedoc-Roussillon
1
2-4
5-20
≥21
Pour la corse, les deux
départements ne sont
pas séparés et les
données
correspondent à la
région dans son
ensemble
77% des patients sont originaires de la région
Lyon
(98/250)
Saint-Etienne
(32/46)Grenoble
(53/95)
Origine géographique des patients : Rhône-Alpes
1
2-4
5-10
≥10
93 % des patients sont originaires de la région
Marseille
(56/84)Nice
(115/152)
Origine géographique des patients : PACA
1
2-5
6-40
≥41
Pour la corse, les deux départements ne sont pas séparés et les données correspondent à la région dans
son ensemble
90% des patients sont originaires de la région
8% des patients sont originaires de Corse
Délai entre la prescription du test et la réception du prélèvement
par le laboratoire
Délai de réalisation des tests
Médiane Nb. > 14j Nb. de
dossiers
4 j 163 (7,5%) 2166/2836
0%
10%
20%
30%
40%Délai prescripion -
réception
Délai entre la réception du prélèvement et l’envoi du compte-rendu
Délai de réalisation des tests
Médiane Nb. > 21j Nb. > 30j Nb. de
dossiers
10 j 126 (4,5%) 45 (1,6%) 2817/2836
0%
10%
20%
30%
40%
50%
60%Délai réception - compte-
rendu
Délai total entre la prescription et l’envoi du compte-rendu
Délai de réalisation des tests
Médiane Nb. > 21j Nb. > 30j Nb. de
dossiers
14j 409 (18,3%) 131 (5,9%) 2235/2836
0%
10%
20%
30%
40%
50%Délai total
Délai entre la prescription du test et la réception du prélèvement
par le laboratoire
Délai de réalisation des testsDétail par pathologie
Médiane Nb. > 14j Nb. de
dossiers
Colon 4 j 78 (8,2%) 947/1218
poumon 4 j 55 (5,8%) 955/1284
mélanome 4 j 30 (11,4%) 263/334
0%
10%
20%
30%
40%Cancer colorectal
0%
10%
20%
30%
40%Mélanome
0%
10%
20%
30%
40%Cancer du poumon
Délai entre la réception du prélèvement et l’envoi du compte-rendu
Délai de réalisation des testsDétail par pathologie
Médiane Nb. > 21j Nb. > 30j Nb. de
dossiers
Colon 11 j 69 (5,7%) 24 (2,0%) 1206/1218
poumon 9 j 39 (3,0%) 13 (1,0%) 1281/1284
mélanome 10 j 18 (5,4%) 8 (2,4%) 332/334
0%
10%
20%
30%
40%Mélanome
0%
10%
20%
30%
40%
50%
60%Cancer colorectal
0%
10%
20%
30%
40%
Cancer du poumon
Délai total entre la prescription et l’envoi du compte-rendu
Délai de réalisation des testsDétail par pathologie
Médiane Nb. > 21j Nb. > 30j Nb. de
dossiers
Colon 15j 220 (22,5%) 74 (7,6%) 977/1218
poumon 14 j 135 (13,8%) 33 (3,4%) 980/1284
mélanome 14j 54 (19,3%) 24 (8,6%) 280/334
0%
10%
20%
30%
40%Cancer colorectal
0%
10%
20%
30%
40%Mélanome
0%
10%
20%
30%
40%
Cancer du poumon
Délai entre la prescription du test et la réception du prélèvement
par le laboratoire
Délai de réalisation des testsIle-de-France
Médiane Nb. > 14j Nb. de dossiers
AP-HP 5 j 108 (11,7%) 920/1222
Institut Curie 5 j 2 (2,5%) 79/84
Gustave Roussy 3 j 14 (9,3%) 150/152
0%
10%
20%
30%AP-HP
0%
10%
20%
30%
40%Gustave Roussy
0%
10%
20%
30%
40%Institut Curie
0%
10%
20%
30%
40%Gustave Roussy
Délai entre la réception du prélèvement et l’envoi du compte-rendu
Délai de réalisation des testsIle-de-France
Médiane Nb. > 21j Nb. > 30j Nb. de dossiers
AP-HP 9 j 41 (4,5 %) 32 (2,7%) 1200/1222
Institut Curie 7 j 2 (2,4%) 2 (2,4%) 84/84
Gustave Roussy 11 j 4 (2,6%) 1 (0,7%) 151/152
0%
10%
20%
30%
40%
50%AP-HP
0%
10%
20%
30%
40%Institut Curie
Délai de réalisation des testsIle-de-France
Médiane Nb. > 21j Nb. > 30j Nb. de dossiers
AP-HP 15 j 223 (23,2%) 81 (8,4%) 963/1222
Institut Curie 11 j 5 (6%) 1 (1,2%) 83/84
Gustave Roussy 11 j 26 (17,3%) 17 (11,3%) 150/152
0%
10%
20%
30%
40%AP-HP
0%
10%
20%
30%
40%Gustave Roussy
0%
10%
20%
30%
40%Institut Curie
Délai total entre la prescription et l’envoi du compte-rendu
Délai entre la prescription du test et la réception du prélèvement
par le laboratoire
Délai de réalisation des testsAquitaine
0%
10%
20%
30%
40%Bordeaux
Médiane Nb. > 14j Nb. de dossiers
Bordeaux 4 j 14 (4,1%) 344/346
Délai entre la réception du prélèvement et l’envoi du compte-rendu
Délai de réalisation des testsAquitaine
0%
10%
20%
30%
40%Bordeaux
Médiane Nb. > 21j Nb. > 30j Nb. de dossiers
Bordeaux 10 j 7 (2,0%) 0 (0%) 346/346
Délai total entre la prescription et l’envoi du compte-rendu
Délai de réalisation des testsAquitaine
Médiane Nb. > 21j Nb. > 30j Nb. de
dossiers
Bordeaux 14 j 54 (15,7%) 12 (3,5%) 344/346
0%
10%
20%
30%
40%
50%Bordeaux
Délai entre la prescription du test et la réception du prélèvement
par le laboratoire
Délai de réalisation des testsLanguedoc-Roussillon
0%
10%
20%
30%
40%
50%Montpellier-Nimes
Médiane Nb. > 14j Nb. de dossiers
Montpellier-
Nîmes
2 j 3 (1,5%) 204/224
Délai entre la réception du prélèvement et l’envoi du compte-rendu
Délai de réalisation des testsLanguedoc-Roussillon
Médiane Nb. > 21j Nb. > 30j Nb. de dossiers
Montpellier-
Nîmes
10 j 0 (0%) 0 (0%) 224/224
0%
10%
20%
30%
40%Montpellier-Nimes
Délai total entre la prescription et l’envoi du compte-rendu
Délai de réalisation des testsLanguedoc-Roussillon
Médiane Nb. > 21j Nb. > 30j Nb. de
dossiers
Montpellier-
Nîmes
12j 9 (4,4%) 0 (0%) 204/224
0%
10%
20%
30%
40%
50%
60%
70%Montpellier-Nimes
Délai entre la prescription du test et la réception du prélèvement
par le laboratoire
Délai de réalisation des testsRhône-Alpes
0%
10%
20%
30%
40%
50%
60%
70%Saint-Etienne
0%
10%
20%
30%
40%Lyon
0%
10%
20%
30%
40%Grenoble
Médiane Nb. > 14j Nb. de dossiers
Saint-Etienne 0,5 j 0 (0%) 39/46
Lyon 4 j 2 (3,3%) 61/250
Grenoble 3 j 4 (4,2%) 95/95
Délai entre la réception du prélèvement et l’envoi du compte-rendu
Délai de réalisation des testsRhône-Alpes
Médiane Nb. > 21j Nb. > 30j Nb. de dossiers
Saint-Etienne 11 j 3 (6,5%) 0 (0%) 46/46
Lyon 8 j 12 (4,9%) 4 (1,6%) 245/250
Grenoble 12 j 2 (2,1 %) 1 (1,1%) 95/95
0%
10%
20%
30%
40%Saint-Etienne
0%
10%
20%
30%
40%Lyon
0%
10%
20%
30%
40%Grenoble
Délai total entre la prescription et l’envoi du compte-rendu
Délai de réalisation des testsRhône-Alpes
Médiane Nb. > 21j Nb. > 30j Nb. de
dossiers
Saint-Etienne 13 j 3 (7,7%) 1 (2,6%) 39/46
Lyon 12 j 8 (14,3%) 2 (3,6%) 56/250
Grenoble 14 j 16 (16,7%) 1 (1,1%) 95/95
0%
10%
20%
30%
40%
50%Saint-Etienne
0%
10%
20%
30%
40%
50%Lyon
0%
10%
20%
30%
40%
50%Grenoble
Délai entre la prescription du test et la réception du prélèvement
par le laboratoire
Délai de réalisation des testsPACA
0%
10%
20%
30%
40%
50%Marseille
0%
10%
20%
30%
40%
50%Nice
Médiane Nb. > 14j Nb. de dossiers
Marseille 5 j 11 (9,8%) 112/251
Nice 4 j 5 (3,1%) 162/166
Délai entre la réception du prélèvement et l’envoi du compte-rendu
Délai de réalisation des testsPACA
Médiane Nb. > 21j Nb. > 30j Nb. de dossiers
Marseille 13 j 18 (7,2%) 5 (2,0%) 251/251
Nice 8 j 5 (3,1%) 1 (0,6%) 162/166
0%
10%
20%
30%
40%Marseille
0%
10%
20%
30%
40%Nice
Délai total entre la prescription et l’envoi du compte-rendu
Délai de réalisation des testsPACA
Médiane Nb. > 21j Nb. > 30j Nb. de
dossiers
Marseille 20 j 49 (43%) 14 (12,3%) 114/251
Nice 13 j 12 (7,3%) 0 (0%) 165/166
0%
10%
20%
30%
40%
50%
60%Marseille
0%
10%
20%
30%
40%
50%
60%Nice
Conclusions et perspectives
Résultats de la première enquête auprès des plateformes de génétique moléculaire:
• Taux de réponse très satisfaisant
• Résultats cohérents avec les données obtenues au niveau national
• Premières données mesurées sur les délais de rendu des résultats :
� Conformes aux recommandations mais :
� 10 % de patients avec un délai d’acheminement > 14 jours
� 20% de patients pour lesquels les délais > 21 jours
Deuxième enquête en cours auprès des cliniciens prescripteurs de tests moléculaires :
• S’assurer que tous les patients ont bien accès aux tests moléculaires, quel que soit leur lieu de
prise en charge
• Identifier les difficultés rencontrées par les cliniciens
• Retour des résultats pour le 1er semestre 2015
⇒ Evaluer l’équité d’accès au dispositif et identifier des axes d’optimisation
⇒ Constituer un socle solide sur lequel appuyer les évolutions technologiques, scientifiques et
médicales de ce dispositif
Etienne Lonchamp
Frédérique Nowak
Contributeurs
Ile de France
Danièle Legrand
Marie-Laure Neveux
Annick Morvan
Aquitaine
Marie-Pauline Benetier
Cécile Jomotte
Charlotte Tauzin
Languedoc-Roussillon
Philippe Vagner
PACA
Béatrice Jacqueme
Marie-Paule Rovello
Rhône-Alpes
Catherine Malbos
Annick Galvin
Plateformes de génétique moléculaire
Anne Barlier
Ivan Bièche
Lydia Campos
Olivier Delattre
Jean Gabert
Pierre Laurent-Puig
Dominique Leroux
Michel Marty
Thierry Maudelonde
Jean-Philippe Merlio
Thierry Molina
Florence Pedeutour
Nathalie Rheims
Jean-Yves Scoazec
Olivier Tembo
Alexandra Traverse-Glehen
+ les collaborateurs