15
DETECTION DES ALLELES POLYMORPHIQUES OU DES ALLELES D’ ANTIGENES VARIANTS PAR PCR Présenté par Hassane Moussa Hadiza CERMES- NIGER

Détection des allèles polymorphiques ou des allèles d'antigène variant par PCR

Embed Size (px)

DESCRIPTION

Détection des allèles polymorphiques ou des allèles d'antigène variant par PCR - Présentation de la 3e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - HASSANE MOUSSA Hadiza - CERMES - Niger BP 10887, NIAMEY, Niger - Etudiante en thèse des sciences dans l'unité de Parasitologie au Centre de Recherches Médicales et Sanitaires - [email protected]

Citation preview

Page 1: Détection des allèles polymorphiques ou des allèles d'antigène variant par PCR

���������

DETECTION DES ALLELES POLYMORPHIQUES OU DES

ALLELES D’ ANTIGENES VARIANTSPAR PCR

Présenté parHassane Moussa Hadiza

CERMES- NIGER

Page 2: Détection des allèles polymorphiques ou des allèles d'antigène variant par PCR

���������

I Définition- Allèle- PCR- Polymorphisme

II Principes de la PCR

III Marqueurs du polymorphismeExemple: msp1 & msp2

IV Antigènes variants: Gène varV Conclusion

����

Page 3: Détection des allèles polymorphiques ou des allèles d'antigène variant par PCR

���������

������� ����������������� ����� ��������������������� � �������������������� ��������������������������� ������ �

��������� � ��������������������

��� ���������� ��������������� ���������������������������������������� ������������������ ���� ����!"#$��%����

��������&������������� ���������� ������������������ �

���� �'� ��

������ ��� ��������������������� �����������(������� ���� ������ ��� �������� ��� ����������������������

Page 4: Détection des allèles polymorphiques ou des allèles d'antigène variant par PCR

���������

PRINCIPE DE LA PCR (1)

Page 5: Détection des allèles polymorphiques ou des allèles d'antigène variant par PCR

���������

Technique de détection (1)

Source: DEA Hadiza 2003 (2)

Page 6: Détection des allèles polymorphiques ou des allèles d'antigène variant par PCR

���������

Technique de détection (2)

Source: Bischoff Thèse 2001 (3)

Page 7: Détection des allèles polymorphiques ou des allèles d'antigène variant par PCR

���������

Analyse du gène msp1 de P. falciparum àpartir des isolats prélevés à Cotonou (4)

�� ������

����������

�������� �������

Page 8: Détection des allèles polymorphiques ou des allèles d'antigène variant par PCR

���������

Analyse du gène msp2 de P. falciparumà partir d’isolats prélevés à Cotonou (4)

������

����������

�������� �������

Page 9: Détection des allèles polymorphiques ou des allèles d'antigène variant par PCR

���������

8 enfants asymptomatiques 2 semaines

pendant 4 mois et 3 5 jours pendant 1 mois

- Extraction de l’ARN & RT-PCR

-Clonage et séquençage des amplicons

-Analyse des séquences

Page 10: Détection des allèles polymorphiques ou des allèles d'antigène variant par PCR

���������

Antigènes variants (5)

Page 11: Détection des allèles polymorphiques ou des allèles d'antigène variant par PCR

���������

Source (5)

Page 12: Détection des allèles polymorphiques ou des allèles d'antigène variant par PCR

���������

�������������������������

�����������

���������������

������������������ !�

"�

#�

$�

%�

&�

������'( �

")*+�,�

#+*&�,�

#"*%�,�

"-*)�,�

$*&�,�

�������'�

".�,�

%#*&�,�

$#*)�,�

.*+�,�

"*)�,�

������'( �

$&*)�,�

$#*"�,�

"#*&�,�

"*)�,�

-�,�

�������'�

&.*/�,�

$/*.�,�

$*%�,�

-�,�

-�,�

��� ���������������������������������� ��� ������ ��������������������� !���� ��������������������"��!������ ������������������������!

Page 13: Détection des allèles polymorphiques ou des allèles d'antigène variant par PCR

���������

)!*�+�������������������� ���������,���)���*�����

����--...��'�� ���� ���-�������- '�-������-����� -

�������-�������� -���-�����

0#1� ����������/%0�1��2�3445�6�0/�-�������

0$17� ��%�� �����344!

���������������-���-���3����

0%18 ����������� 344!�� ��&��������������� � ������

��� �� �����������&9����� ������� � �����������(��� ���

����'�� ��� ������������ ���������� ���� �: ��������� �

: ��������);����*

Références bibliographiques

Page 14: Détection des allèles polymorphiques ou des allèles d'antigène variant par PCR

���������

0&1�� �������� 344<��+����������� � �����������

������ ������������� ������������=�������

��������� �������������������������=�.�

>������?8/��!#"

0.1=����������� 344!����������� ���������������

����� ��@3������ ������������������� � :

�������&��������� � ����� ��&����� ������

0)1A�����������B�!""$�7��� ������������ �����

������� ��������� �� ���'����������������� �������

��������C�5#�)!*��3$@$D�

Page 15: Détection des allèles polymorphiques ou des allèles d'antigène variant par PCR

���������

Fitia mifamaly mahatsara fihavanana