Bras courts des acrocentriques : attention aux pièges ! XXIVe colloque ATC 10 septembre 2014 Pierre...

Bras courts des acrocentriques : attention aux pièges !

XXIVe colloque ATC

10 septembre 2014 Pierre Serra

Laboratoire de Cytogénétique Constitutionnelle de Lyon

Structure des bras courts des acrocentriques

_« Satellite », ADN satellite type I_« Tige » = NOR : organisateurs nucléolaires (plusieurs copies par chromosome), ARNr_Bras court proximal, ADN satellite β et type III

_Centromère : ADN a-satellite

p13

p12

p11.2

p11.1q11.1

q11.2

q12

Bras long

Séquences communes à tous les acrocentriques Taille des bras courts des acrocentriques comparable à

celle d’un 18p de la même métaphase (Verma et al. 1977)

Polymorphismes de taille des acrocentriques

Variations de taille Fréquemment observées Potentiellement importantes Le plus souvent non pathologiques Non signalées sur le compte-rendu

Polymorphismes de taille des acrocentriques

Ils sont dûs : À des gains de nombre de copies au sein du

bras court allongé À des réarrangements avec d’autres bras

courts des acrocentriques (crossing over inégal lors de la méiose) voire avec Yq12 Translocations Insertions

Doivent leur bénignité À la grande pauvreté en gènes de ces régions Au caractère redondant dans le génome de ces

régions au caractère non dose-dépendant des régions

concernées par ces remaniements

La taille normale d’un acrocentrique ne garantit pas l’absence d’anomalie

Risque de confondre des dérivés de translocations pathologiques avec ces polymorphismes

Polymorphismes de taille des acrocentriques

Quatre cas d’anomalies des bras courts

1)Cas de diagnostic pré-natal

Patiente de 18 ans 1e grossesse Risque séquentiel intégré au 2e trimestre : 1/10 000 Échographie fœtale : agénésie du corps calleux

Cas 1

Caryotype fœtal à 21 SA

Bandes G

Bandes R

Bandes R

Bandes R

Cas 1

ACPADuplication en 20q13.2q13.33 de 8,3 Mb

Courbe rouge : Patient en Cy5 – Témoin 1 en Cy3Courbe verte : Témoin 2 en Cy5 – Patient en Cy3

Cas 1

Sondes20pter Vert20qter Rouge

46,XY,der(14)t(14;20)(p11q13)

Trisomie 20qter par dérivé 14 d’une t(14;20) responsable d’une trisomie 20qter pure.

FISH

Chr 20 normaux

Dérivé

Cas 1

Caryotype fœtal à 21 SA

Bandes G

Bandes R

Bandes R

Bandes R

Cas 1

2)Cas d’une fille de 7 ans

Difficultés d’apprentissage avec troubles de l’attention Dilatation aortique Retard de croissance FISH 7q11.23 normale (sd Williams-Beuren)

Cas 2

Caryotype

Bandes G

Bandes G

Bandes R

Bandes R

Bandes R

Cas 2

ACPADuplication en 22q13.31q13.33 de 5.5 Mb

Courbe rouge : Patient en Cy5 – Témoin 1 en Cy3Courbe verte : Témoin 2 en Cy5 – Patient en Cy3

Cas 2

FISH

SondesN25 22q11.2SHANK3 22q13.3Acro p-arm (NOR)

46,XX,der(22)(qter->q13.31::p11.2->qter).ish der(22)(NOR-,SHANK3+,N25+,SHANK3+)

Signal vert sur le bras court du 22Absence de signal orange (acrop-arm) sur ce même 22

dérivé

Chr 22 normal

Cas 2

Caryotype

Bandes G

Bandes G

Bandes R

Bandes R

Bandes R

Cas 2

3)Cas d’un garçon de 4 mois

Dysmorphie faciale modérée Hypotonie Malformations des organes génitaux externes

Cas 3

Caryotype

Bandes G

Bandes G

Bandes R

Bandes R

Bandes R

Cas 3

ACPADuplication en 3p26.3-p24.3 de 21,3Mb

Courbe rouge : Patient en Cy5 – Témoin 1 en Cy3Courbe verte : Témoin 2 en Cy5 – Patient en Cy3

Cas 3

FISH

Sondes3pterAcro p arm (NOR)13qter

Chr. 3 normal

Chr. 3 normal

Dérivé du chromosome 13 avec translocation distale par rapport aux NOR

46,XY,t(3;13)(p24.3;p13)

Chr 13 normal

Cas 3

Interprétation des sondes acrop-arm

Chez ce patient : Confusion en FISH d’un chromosome 15 avec un

chromosome 13 due à des NOR volumineux sur un chromosome 15

Risque d’erreur d’identification du dérivé (ici un chromosome 13)

Par ailleurs, perte des NOR possible sur un chromosome

Nécessité d’associer des sondes spécifiques de chromosome pour certifier la nature du dérivé

Cas 3

Caryotype

Bandes G

Bandes G

Bandes R

Bandes R

Bandes R

Cas 3

4) Cas d’un garçon de 3 mois

Retour veineux pulmonaire anormal Dysmorphie faciale Imperforation anale Chez sa mère : cardiopathie et colobome

Suspicion de cat-eye syndrome

Cas 4

Caryotype

Bandes G

Bandes R

Bandes R

Bandes R

Cas 4

ACPATriplication en 22q11.1q11.21 de 2,5Mb

Courbe rouge : Patient en Cy5 – Témoin 1 en Cy3Courbe verte : Témoin 2 en Cy5 – Patient en Cy3

Cas 4

FISH

Sondes 22qter22q11.1

46,XY,trp(22)(q11.1;q11.21)Triplication homogène du segment proximal du chromosome 22

dérivé

Chr 22 normal

Cas 4

FISH

A

CTD-3144O3 (22q11)Cen 14/22 (Kreatech)NORs

A

CTD-3144O3 (22q11)Cen 14/22 (Kreatech)NORs

CC

B

der 22

chr 22

B

der 22

chr 22

46,XY,trp(22)(q11.1;q11.21)

Diapo Sarra Dimassi

Cas 4

caryotype

Bandes G

Bandes R

Bandes R

Bandes R

Cas 4

Conclusions

Nombreux polymorphismes de taille des bras courts des acrocentriques

Remaniements pathologiques bien plus rares Remaniements pathologiques semblant plus

faciles à détecter en bandes R ? Techniques ordinaires (Giemsa) et/ou

rechercher des associations Nécessitent une expérience Pas toujours suffisants

Conclusions

Intérêt de l’ACPA : identifier l’origine du matériel supplémentaire

Intérêt de la FISH : reconnaître le dérivé et donc le mécanisme (impossible avec l’ACPA seule, ou la qPCR)

Intérêt en FISH des sondes des NOR Mais nécessité d’y associer des sondes spécifiques

pour reconnaître le dérivé étudié (perte des NOR possible)

Remerciements

Techniciennes/ingénieures Eudelyne Alix, Christelle Angei, Emmanuelle

Banquart, Chantal Beche, Christine Bel, Anne Fautrelle, Hélène Guilbert, Catherine Hempel, Brigitte Jelassi, Sylvie Josue, Audrey Labalme, Chantal Lavert, Jessica Michel, Isabelle Morin, Caroline Perbet, Christine Valex

Secrétaires : Laurence Caine, Michelle Martin

Médecins : Dr Rafat, Pr Sanlaville, Dr Schluth-Bolard, Dr Till