Contexte scientifique CO 2 Capture du Carbone Organique Particulaire dans les abysses Réseau...

Contexte scientifique

CO2

Capture du Carbone Organique Particulaire dans les abysses

Réseau trophique

planctonique

De la vision à la modélisation, genèse d’une innovation

Observation in situ

Capture

MAIS,- Temps bateau important- Faible couverture spatiale- Analyse longue -zooplancton et flux de matière mal représentés dans les modèles

Automatiser l’acquisition et le

traitement des données en mer et en laboratoire

grâce à l’imagerie.

VISION in-situ : Profileur de VisionEtude haute fréquence de la biodiversité et des flux de matière.

FUTURE INTEGRATION EOL, CETO

Plateformes multicapteurs

PVM6, <0.5 kg

Réseaux ARGO et BioARGO

VISION laboratoire : ZOOSCANAnalyse d’‘échantillons de plancton

35 instituts équipés dans le monde

de 1997 à 2010

FORMATION-20 Masters-7 thèses-3 post docs

PUBLICATION-30 de rang A

VALORISATION-Un BREVET-Un contrat de valorisation-Deux LICENCES-Un concours scientifique-Deux Stages internationaux de formation

Des développements instrumentaux cohérents, importance de la vision

PVM4 1997, 300 kg PVM5 2008, 30 kg

Application: Suivi en temps réel du zooplancton à Villefranche depuis 1966

http://www.obs-vlfr.fr/Rade/RadeZoo/

Application: Application: Biogéographie mondiale des Biogéographie mondiale des océans profonds océans profonds

200 profiles UVP9 régions océaniques

21 taxa

Stemmann et al., 2008a and b

Perspectives: réseau mondial de surveillance

Réseau d’observation - Flotteurs équipés de système d’imagerie.- Stations fixes

Centres de réception et d’analyse- Serveur d’images pour la validation en réseau

Carbone Organique Particulaire

ZooplanctonAssimilation dans des modèles - biogéochimique- halieutique

UVP principles

Camera

Light

Volumetric image

PVMThe UVP 4 is based on :1. Camera2. Specially design lighting system3. Computer4. Software

A CTD is associated on the frame

New 2007 version :o 30 Kgo Red light systemo Increased autonomyo Real time processingo Optional telemetryo 6000 m rangeo Rosette-AUV-adaptable

The UVP 4 was a real innovative system but it is heavy and limited to 1000 m.

Size spectra / depth Organisms identification CTD

MATLAB routines

UVP in-situ Image

Measurements

Threshold

Large objects

Large Aggregates - Zooplankton

Large Particulate MaterSize Calibration

ESD ( > 60µm)

All objects

UVP Image process

1987

2001 2001

2003

2005

From silhouette to Zooscan

Silhouette photography (Ortner et al., 1979)

The Zooscan system was constructed to allow the construction of a homogenous, permanent and secure digital image data bank allowing global comparison of zooplankton series. => Zooplankton Data standardization through networks or collaborations (50 Zooscans)

1979

IMAGE ANALYSIS

Basic stats and graphs

Object Separation

Visualisation

Manual measurements

Calibration

Vignettes (thumbnail images)

Basic stats and graphs

Object Separation

Visualisation

Manual measurements

Calibration

Vignette extraction for :

- Training sets for recognition

- Manual identification

- Semi automatic identification