Jour 3 : La numérisation des données sur la biodiversité

Jour 3 : Jour 3 :

La numérisation des La numérisation des données sur la biodiversitédonnées sur la biodiversité

Sommaire

L’infrastructure informatique du GBIF

Rôle et importance des nœuds GBIF (Mélianie)

Présentation du nœud français

Qui suis-je?

Delphine Gasc (gasc@gbif.fr)

Ingénieur Bio-informatique

Au GBIF depuis avril 2009

L’infrastructure L’infrastructure informatique du informatique du GBIFGBIF

Base de donnéesCollection

Observation

DiG

IR / B

ioCA

Se / T

AP

IR/ IP

T

occurrence record

taxon concept

indexing DB

raw occurrence record

extraction

occurrence record

taxon concept

portal DB working copy

raw occurrence record

processingharvesting

metadata

logs

Darwin Core

ABCD

UDDInames

copy

occurrence record

taxon concept

portal DB live system

raw occurrence record

swap

Data Portal UI

web services

registration

Provider domain Internet

Internet / public

GBIF / non-public

MapServer

status until summer 2009

Normaliser les données

GBIF : Réseau mondial

Besoin d’un langage commun à toutes les données

Adapter l’information au réseau Wrappers (IPT, Biocase, …) Standards (ABCD, Darwin Core)

Connecter les données

Index : Annuaire des données

Récupère les informations générales

Connexion directe aux données

Diffuser les données

Portail international

Publication des données

Géoréférencement

http://data.gbif.org/

Le Portail GBIFLe Portail GBIF

Quelles informations?Quelles informations?

Données sur la présence d’espèces (spécimens ou observations)

Noms Noms scientifiques & classification Noms vernaculaires

Recherche filtrée

Autre exemple :répartition géographique de Hirundo rustica (hirondelle de cheminée) à différentes périodes de l'année

Quelle utilisation? Prédire la distribution d’espèces selon divers

scénarios de changement climatique, écologique, etc.

Prévoir des sites pour la protection de la biodiversité, etc.

Anticiper les régions nécessitant des actions précises (combattre les espèces invasives, mettre

en place des mesures sanitaires, etc)

Le nœud GBIF Le nœud GBIF FranceFrance

Sommaire

Historique

Présentation de l’équipe

Objectifs

Difficultés

Nœud GBIF France

Mis en place en 2006

Situé au Musée d’Histoire Naturelle de Paris

3ème fournisseur en nombre d’occurrences du GBIF

L’équipe du GBIF France

Responsables :

Eric Chenin et Régine Vignes

Communication :

Anne-Sophie Archambeau

Technique et développement informatique :

Delphine Gasc et Michael Akbaraly

Objectifs

Connecter les données

Identifier et contacter les fournisseurs de données du pays

Développer des outils utiles à la communauté GBIF

Portail GBIF FrancePortail GBIF France