Mycologie-1er Doctorat Bernard Mignon bmignon@ulg.ac.be Université de Liège Faculté de Médecine...

Mycologie-1er DoctoratMycologie-1er Doctorat

Bernard Mignon

bmignon@ulg.ac.be

Université de Liège

Faculté de Médecine vétérinaire

Département des Maladies infectieuses et parasitaires

Service de Parasitologie et Pathologie des Maladies parasitaires

MYCOLOGIE VETERINAIREMYCOLOGIE VETERINAIRE

• Mycoses

• Allergies fongiques

• Mycétisme

• Mycotoxicoses

• Mycoses

• Allergies fongiques

• Mycétisme

• Mycotoxicoses

LES CHAMPIGNONSCARACTERISTIQUES GENERALES

• Eucaryotes• Paroi complexe (chitine)• Structure syncytiale ou unicellulaire• Immobiles• Hétérotrophes• Nutrition par absorption• Aérobies• Reproduction par des spores

LES CHAMPIGNONSMORPHOLOGIE GENERALE

• Moisissures (champignons filamenteux)- mycélium = thalle constitué des hyphes ou filaments mycéliens- cloisons transversales = septa

• Levures

• Spores

• Notion de dimorphisme, pléomorphisme

• Moisissures (champignons filamenteux)- mycélium = thalle constitué des hyphes ou filaments mycéliens- cloisons transversales = septa

• Levures

• Spores

• Notion de dimorphisme, pléomorphisme

REPRODUCTIONREPRODUCTION

1. Spores sexuées (méiotiques) (indirectes)< reproduction sexuéeforme téléomorphe du champignon

2. Spores asexuées (mitotiques) (directes)< reproduction asexuéeforme anamorphe du champignon

1. Spores sexuées (méiotiques) (indirectes)< reproduction sexuéeforme téléomorphe du champignon

2. Spores asexuées (mitotiques) (directes)< reproduction asexuéeforme anamorphe du champignon

IMPORTANTE…

REPRODUCTION SEXUEE…

POUR LA CLASSIFICATIONPOUR LA CLASSIFICATION

CLASSIFICATION DES CHAMPIGNONS

Nomenclature :

Embranchement … mycotaSous-embranchement … mycotina

Classe … myceteOrdre … ale

Famille … aceaeGenre

EspèceVariété

Nomenclature :

Embranchement … mycotaSous-embranchement … mycotina

Classe … myceteOrdre … ale

Famille … aceaeGenre

EspèceVariété

Règne des Fungi (Eumycota)Règne des Fungi (Eumycota)

ExempleExemple

Kingdom: EUMYCOTA (FUNGI)

Phylum: Dikaryomycota

Subphylum: Basidiomycotina

Class: Holobasidiomycetes

Order: Agaricales

Family: Agaricaceae

Genus: Agaricus

Species: Agaricus brunnescens

the edible (supermarket) mushroom

LES CHAMPIGNONS – CLASSIFICATION SIMPLIFIEE

• Regnum fungorum (Fungi, Eumycota)

• Chytridiomycota• Zygomycota• Ascomycota• Basidiomycota• Champignons mitosporiques (ex

Deuteromycota ou Fungi imperfecti)

• Regnum Straminipila (Chromista)SaprolegniaPythium

• Regnum fungorum (Fungi, Eumycota)

• Chytridiomycota• Zygomycota• Ascomycota• Basidiomycota• Champignons mitosporiques (ex

Deuteromycota ou Fungi imperfecti)

• Regnum Straminipila (Chromista)SaprolegniaPythium

ZYGOMYCOTINAZygomycetes

EntomophtoralesMucorales

Agents de mucormycoses :Absidia spp.Mucor spp.Rhizomucor spp.Rhizopus spp.

Filaments larges, rarement septés, à contours irréguliers ; embranchements à angle droit

ZYGOMYCOTINAZygomycetes

EntomophtoralesMucorales

Agents de mucormycoses :Absidia spp.Mucor spp.Rhizomucor spp.Rhizopus spp.

Filaments larges, rarement septés, à contours irréguliers ; embranchements à angle droit

ASCOMYCOTINAAscomycetes

OnygenalesArthrodermataceae Arthroderma

(téléomorphes des dermatophytes)

Onygenaceae Ajellomyces

(téléomorphes d’Histoplasma et Blastomyces)

Eurotiales Trichocomaceae

(téléomorphes d’Aspergillus et Penicillium)

Ophiostomatales(téléomorphe de Sporothrix schenckii)

ASCOMYCOTINAAscomycetes

OnygenalesArthrodermataceae Arthroderma

(téléomorphes des dermatophytes)

Onygenaceae Ajellomyces

(téléomorphes d’Histoplasma et Blastomyces)

Eurotiales Trichocomaceae

(téléomorphes d’Aspergillus et Penicillium)

Ophiostomatales(téléomorphe de Sporothrix schenckii)

BASIDIOMYCOTINA

HymenomycetesFilobasidiales

(téléomorphe de Crytococcus neoformans)

Agaricalesdifférents champignons à chapeau

UstilaginomycetesMalasseziales

(téléomorphes de Malassezia spp.)

BASIDIOMYCOTINA

HymenomycetesFilobasidiales

(téléomorphe de Crytococcus neoformans)

Agaricalesdifférents champignons à chapeau

UstilaginomycetesMalasseziales

(téléomorphes de Malassezia spp.)

CHAMPIGNONS MITOSPORIQUES

Champignons qui n’ont pas de stade téléomorphe connu (groupe d’anamorphes ou Fungi imperfecti)[Ex Deuteromycota]

Un groupe très hétérogène…

Champignons qui n’ont pas de stade téléomorphe connu (groupe d’anamorphes ou Fungi imperfecti)[Ex Deuteromycota]

Un groupe très hétérogène…

HyphomycetesDematiaceae agents de phaeohyphomycose AlternariaMoniliaceae Microsporum, Trichophyton, Epidermophyton, Histoplasma, Blastomyces, Coccidioides, Paracoccidioides, Aspergillus, Penicillium,…

Coelomycetes

Blastomycetes: anamorphes de levures

HyphomycetesDematiaceae agents de phaeohyphomycose AlternariaMoniliaceae Microsporum, Trichophyton, Epidermophyton, Histoplasma, Blastomyces, Coccidioides, Paracoccidioides, Aspergillus, Penicillium,…

Coelomycetes

Blastomycetes: anamorphes de levures

LES CHAMPIGNONS – CLASSIFICATION PAS SIMPLE

• Double classification…• Progrès en biologie moléculaire• Classements incertains

Pneumocystis cariniiRhinosporidium seeberii

• Double classification…• Progrès en biologie moléculaire• Classements incertains

Pneumocystis cariniiRhinosporidium seeberii

IMPORTANTE POUR LA CLASSIFICATION

REPRODUCTION ASEXUEE…

IMPORTANTE POUR L’IDENTIFICATION

REPRODUCTION ASEXUEE…IMPORTANTE POUR

L’IDENTIFICATION

Spores asexuées…quelques types

1. Spores internes (endospores)2. Spores thalliques

1. Arthroconidies2. Micro(aleurio)conidies et

macro(aleurio)conidies des dermatophytes

1. Spores internes (endospores)2. Spores thalliques

1. Arthroconidies2. Micro(aleurio)conidies et

macro(aleurio)conidies des dermatophytes

L’IDENTIFICATION

1. Spores internes (endospores)2. Spores thalliques3. Spores non thalliques

1. Blastoconidies et pseudo-mycélium2. Annelloconidies3. Phialoconidies4. Poroconidies

1. Spores internes (endospores)2. Spores thalliques3. Spores non thalliques

1. Blastoconidies et pseudo-mycélium2. Annelloconidies3. Phialoconidies4. Poroconidies

IMPORTANTE POUR LA CLASSIFICATION

REPRODUCTION ASEXUEE…

IMPORTANTE POUR L’IDENTIFICATION

SAPROBIOSE / PARASITISME des champignons agents de mycoseSAPROBIOSE / PARASITISME des champignons agents de mycose

SAPROPHYTES C Parasites

T facultatifs

SAPROPHYTES C Parasites

T facultatifs

SAPROBIOSE / PARASITISME des champignons agents de mycoseSAPROBIOSE / PARASITISME des champignons agents de mycose

Exosaprophytes Aspergillus fumigatusCryptococcus

neoformans

Endosaprophytes Candida albicans

Episaprophytes Malassezia pachydermatis

Exosaprophytes Aspergillus fumigatusCryptococcus

neoformans

Endosaprophytes Candida albicans

Episaprophytes Malassezia pachydermatis

LES MYCOSES NE SONT PAS CONTAGIEUSES

Exception : les dermatophytoses (teignes)

LES MYCOSES NE SONT PAS CONTAGIEUSES

Exception : les dermatophytoses (teignes)

DIAGNOSTIC DE LABORATOIREDES MYCOSES

1. Examen direct

2. Culture

3. Examen histologique

4. Sérologie

5. Méthodes moléculaires

1. Examen direct

2. Culture

3. Examen histologique

4. Sérologie

5. Méthodes moléculaires

CULTURE DES CHAMPIGNONSIN VITRO

• Milieu de SabouraudPeptone 10gGlucose 20gAgar 20gEau 1l

• Antibactériens• Cycloheximide• 25°C à 30°C en général• 2 jours à 3 semaines

• Milieu de SabouraudPeptone 10gGlucose 20gAgar 20gEau 1l

• Antibactériens• Cycloheximide• 25°C à 30°C en général• 2 jours à 3 semaines

CLASSIFICATION SIMPLIFIEE DES MYCOSES (1)

1. Mycoses superficielles

2. Mycoses sous-cutanées

3. Mycoses profondes

1. Mycoses superficielles

2. Mycoses sous-cutanées

3. Mycoses profondes

Mycoses superficielles les plus fréquentes

1. Dermatophytoses

2. Dermatites à Malassezia

3. Candidoses superficielles

4. Divers : onychomycoses, kératomycoses,

otomycoses

Mycoses superficielles les plus fréquentes

1. Dermatophytoses

2. Dermatites à Malassezia

3. Candidoses superficielles

4. Divers : onychomycoses, kératomycoses,

otomycoses

Mycoses sous-cutanées les plus fréquentes

1. Mycétomes fongiques

2. Phaeohyphomycoses

3. Sporotrichose

Mycoses sous-cutanées les plus fréquentes

1. Mycétomes fongiques

2. Phaeohyphomycoses

3. Sporotrichose

Mycoses profondes les plus fréquentes

Cosmopolites

1. Candidoses profondes2. Cryptococcose3. Aspergilloses4. Mucormycoses

Cosmopolites

1. Candidoses profondes2. Cryptococcose3. Aspergilloses4. Mucormycoses

Exotiques

1. Blastomycose2. Histoplasmose3. Coccidioidomycose4. Paracoccidioidomycose

Exotiques

1. Blastomycose2. Histoplasmose3. Coccidioidomycose4. Paracoccidioidomycose

LES DERMATOPHYTOSES (ringworm)

Agents : les dermatophytes, 3 genres

• Microsporum• Trichophyton• Epidermophyton

(Microïdes)(Keratinomyces)

Agents : les dermatophytes, 3 genres

• Microsporum• Trichophyton• Epidermophyton

(Microïdes)(Keratinomyces)

DERMATOPHYTESDERMATOPHYTES

• Caractéristiques physiologiques

• Caractéristiques morphologiques différentes in vivo et in vitro

• Caractéristiques physiologiques

• Caractéristiques morphologiques différentes in vivo et in vitro

DERMATOPHYTOSES - EPIDEMIOLOGIE

• Agents zoophiles, anthropophiles, géophiles

• Vie parasitaire / saprophytique …(presque) toujours contagieuses

• Facteurs prédisposants

• Agents zoophiles, anthropophiles, géophiles

• Vie parasitaire / saprophytique …(presque) toujours contagieuses

• Facteurs prédisposants

Dermatophyte Principalesespècesaffectées

Autres espèces animales

Passage aux

humains

Microsporum M. canisM. equinumM. persicolorM. gypseumM. nanum

Chien, chatCheval

Campagnols(sol)(sol)

Lapin, etc.Chien, chat, etc.Chien, cheval…

Trichophyton T. mentagrophytesT. erinaceiT. quinckeanumT. simiiT. verrucosumT. equinumT. gallinae

Rats, sourisHérisson

SourisSinges, volailles

BovinsCheval

Volailles

Toutes espècesChien, etc.

Chat, rongeurs...Chien, etc.

Mouton, etc.

Principaux Dermatophytesagents de teigne des animaux domestiques

DERMATOPHYTOSES - PATHOGENESE

• Adhérence des arthroconidies aux cornéocytes

• Germination

• Invasion du follicule pileux

• Enzymes kératinolytiques

• Immunité non spécifique

• Immunité spécifique

• Adhérence des arthroconidies aux cornéocytes

• Germination

• Invasion du follicule pileux

• Enzymes kératinolytiques

• Immunité non spécifique

• Immunité spécifique

DERMATITES A MALASSEZIAEtiologie

Agent: Malassezia pachydermatis(= Pityrosporum canis = P. pachydermatis)

• Levure lipophile

• Morphologie typique en cacahuète, liée au

mode de reproduction asexuée :

bourgeonnement répétitif unipolaire sur

base large (blastoconidies 2 à 7 µm)

Agent: Malassezia pachydermatis(= Pityrosporum canis = P. pachydermatis)

• Levure lipophile

• Morphologie typique en cacahuète, liée au

mode de reproduction asexuée :

bourgeonnement répétitif unipolaire sur

base large (blastoconidies 2 à 7 µm)

MALASSEZIA PACHYDERMATISMALASSEZIA PACHYDERMATIS

• Classification : - Fungi imperfecti (blastomycetes)

- Basidiomycota

• Episaprophyte strict, non lipodépendant (C.A.E., peau, muqueuses)

• Autres espèces lipodépendantes

• Classification : - Fungi imperfecti (blastomycetes)

- Basidiomycota

• Episaprophyte strict, non lipodépendant (C.A.E., peau, muqueuses)

• Autres espèces lipodépendantes

DERMATITES A MALASSEZIADERMATITES A MALASSEZIA

7 espèces de Malassezia actuellement décrites

1. M. pachydermatis

2. M. furfur ( = P. ovale, cf. pityriasis capitis, dermatite

sébborrhéique)

( = P. orbiculare, cf. pityriasis versicolor)

3. M. sympodialis (chat)

4. M. globosa (chat)

5. M. obtusa

6. M. restricta

7. M. slooffiae

7 espèces de Malassezia actuellement décrites

1. M. pachydermatis

2. M. furfur ( = P. ovale, cf. pityriasis capitis, dermatite

sébborrhéique)

( = P. orbiculare, cf. pityriasis versicolor)

3. M. sympodialis (chat)

4. M. globosa (chat)

5. M. obtusa

6. M. restricta

7. M. slooffiae

DERMATITES A MALASSEZIA Epidémiologie

• Prévalence du portage sain élevée !

• Sporadique, NON CONTAGIEUX

• Malassezia : pathogène opportuniste

• Les facteurs permettant le passage à l’état pathogène sont mal compris

• Prévalence du portage sain élevée !

• Sporadique, NON CONTAGIEUX

• Malassezia : pathogène opportuniste

• Les facteurs permettant le passage à l’état pathogène sont mal compris

Pourcentage de chiens porteurssains de M. pachydermatis sur la

peau et les muqueuses

Pourcentage de chiens porteurssains de M. pachydermatis sur la

peau et les muqueuses C.A.E. 7 55 %

Muqueuse anale 50 54 %

Babines 75 91 %

Cavité buccale 30 92 %

Pattes (partie distale) 47 60 %

Espaces interdigités 20 37 %

Ars 74 100 %

Aine / abdomen 30 68 %

Dos 40 60 %

1. Facteurs favorisants• Production excessive de sébum / cérumen• Humidité excessive• Plis cutanés• Diminution des mécanismes de défense

cutanés : corticothérapie, FIV, « Dysplasie

épidermique » du WHWT• Antibiothérapie ?• Maladies sous-jacentes ?

1. Facteurs favorisants• Production excessive de sébum / cérumen• Humidité excessive• Plis cutanés• Diminution des mécanismes de défense

cutanés : corticothérapie, FIV, « Dysplasie

épidermique » du WHWT• Antibiothérapie ?• Maladies sous-jacentes ?

2. Maladies concomitantes ( EKS)

• Hypersensibilités (DHPP, dermatite atopique,

allergie / intolérance alimentaire,…)

• Ectoparasitoses (démodécie, …)

• Pyodermites

• Dysendocrinies

• Troubles de la kératinisation primaires

3. Age, sexe, saison sans importance

4. Races prédisposées

2. Maladies concomitantes ( EKS)

• Hypersensibilités (DHPP, dermatite atopique,

allergie / intolérance alimentaire,…)

• Ectoparasitoses (démodécie, …)

• Pyodermites

• Dysendocrinies

• Troubles de la kératinisation primaires

3. Age, sexe, saison sans importance

4. Races prédisposées

DERMATITES A MALASSEZIA Pathogenèse

• Spéculative

• Adhérence aux cornéocytes

• Sécrétion d’enzymes proinflammatoires

• Hypersensibilité de type I ?

• Spéculative

• Adhérence aux cornéocytes

• Sécrétion d’enzymes proinflammatoires

• Hypersensibilité de type I ?

1. Cytologie- Scotch test- Calque par impression- Raclage cutané étalé sur lame- Ecouvillon roulé sur lame

2. Culture

3. Histologie

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