© Mémoris Mai 2010 Comité de suivi mercredi 16 juin 2010 Plateforme web du Pôle dInformation Flore-Habitat de Rhône-Alpes

© Mémoris Mai 2010

Comité de suivimercredi 16 juin 2010

Plateforme web du Pôle d’Information Flore-Habitat de Rhône-Alpes

Plateforme web du Pôle Flore-Habitat de Rhône-AlpesMémoris – 26 mai 2010

Ordre du jour

Point d’avancement sur le développement de la plateforme web du pôle flore-habitat

Proposition de format standard pour les données mutualisées du pôle Référentiels de la plateforme web du pôle flore-habitat Méthodologie et calendrier, période-test, choix et élaboration des référentiels définitifs

Procédures d’export, de synchronisation ou d’ETL

Calendrier des prochaines étapes du développement de la plateforme web du pôle flore-habitat


Point d’avancement

Plate-forme web du Pôle d’Information Flore-Habitat de Rhône-Alpes


Spécifications fonctionnelles

Architecture technique

Alimentation du portail

Organisation du site

Spécifications fonctionnelles de recherche et consultation

Spécifications fonctionnelles cartographiques

Spécifications fonctionnelles de mutualisation

Rappel des attentes vis-à-vis du Maître d’ouvrage


Architecture technique

Environnement LINUXBases de données

Base de données centralisée PostgreSQL 8.4.2Base de données temporaire PostGIS 1.5.1

Composant cartographiqueMoteur cartographique MapServer 5.6.3Framework OpenLayers ou OpenScales

Gestionnaire de contenuJoomla 1.5.17 + base de données MySQL

Outil de gestion bibliothécairePMB 3.3.6 + base de données MySQL

Langage de développementPHP 5


BD

MapServer

PHP

JavaScript

OpenLayers OpenScales

MSXML ActionScript

PMapper CartoWeb

GeoServer

Bases de données

Moteur cartographique

Framework cartographiqueCôté Serveur

Framework cartographiqueCôté Client

Composant cartographique


Gentiana

Asters

CPNS

CBNA CBNMCCHLORIS

Oracle

CBNMCCHLORIS Web

PostGre/PostGIS

export

export

Plateforme Web

PIFH

BD Temp

FTP

export

mutualisateur

Processus interne hors fonctionnement de la plateforme

Processus de transfert FTP

Processus de synchronisation

Processus de mutualisation – saisie en ligne

Alimentation du portail






L’accueil propose un triptyque Généralités / Plateforme web / Administration. les fonctions d’informations générales, les fonctions d’exploration des données les fonctions d’administration

Quel nom pour le Système d’Information de PIFH ?


Informations générales


Présentation du pôle


Présentation du SI


Téléchargement


Forum


Spécifications fonctionnelles de recherche et consultation



Gestion des profils et authentification d’un utilisateur

5 profils d’acteurs :grand public,

bureau d’études,

partenaire technique (y compris les associations),

partenaire institutionnel (y compris Conservatoires Botaniques Nationaux),

administrateur.


Demande d’un compte utilisateur


Création d’un compte utilisateur


Affectation des territoires


Modification d’un compte


Suppression d’un compte


Droits utilisateurs (1)

Internaute

AdministrateurGrand public

Bureau d'études

Partenaire technique

Partenaire institutionnel

Gestion des utilisateurs

Authentification X X X

Demande de compte X X X

Récupération du mot de passe X X X

Listing des utilisateurs X

Création d'un utilisateur X

Modification d'un utilisateur X

Suppression d'un utilisateur X

Affectation des territoires X

Paramétrage

période des cartes de répartition X




Bureau d'études



Recherche par plante

Recherche par plante "simple" X X X X X

Recherche par plante "avancée" X X X X X

Résultat sous forme de liste (tableau) X X X X X

Impression du tableau X X X X X

Export Excel du tableau X X X X X

Monographie X X X X X

Impression de la monographie X X X X X

Export PDF de la monographie X X X X X

Impression de la carte de répartition X X X X X

Export Jpeg de la carte de répartition X X X X X

Accès cartographie détaillée des observations - espèce non sensible X X X X

Accès cartographie détaillée des observations - espèce sensible X X* X*




Bureau d'études



Recherche par thème

Recherche par thème "simple" X X X X X

Recherche par thème "avancée" X X X X X

Résultat synthétique X X X X X

Résultat détaillé X X X X X

Résultat graphique X X X X X

Impression du résultat X X X X X

Export Excel du résultat X X X X X

Recherche par commune

Recherche par commune "simple" X X X X X

Recherche par commune "avancée" X X X X X

Résultat Synthèse X X X X X

Résultat détaillé X X X X X

Détail sources X X X X X

Impression du résultat X X X X X

Export Excel du résultat X X X X X



Bureau d'études



Recherche par sites

Recherche par sites "simple" X X X X X

Recherche par sites "avancée" X X X X X

Recherche cartographique

Sélection graphique d'un site existant X X X X

dessin d'un polygone X X X X

import d'un polygone d'une couche externe X X X

Recherche bibliographique

Recherche bibliographique "simple" X X X X X

Recherche bibliographique "avancée" X X X X X

Résultat synthétique X X X X X

Résultat liste bibliographique X X X X X

Informations bibliographiques détaillées X X X X X

Impression liste bibliographique X X X X X





Bureau d'études



Fonctions cartographiques

Navigation (zoom +, zoom - , déplacement…) X X X X

Légende (Afficher / Masquer les couches) X X X X

Outils de mesure X X X X

Outil d'interrogation X X X X

Outil de sélection X X X X

Outil d'import X X X

Outil d'export X X X

Mutualisation

Saisie relevé floristique X X X X X

Saisie en ligne X X X X


Recherche par plante


Recherche par plante « simple »


Recherche par plante « avancée »


Résultat Recherche par plante

Espèce Infrataxon sans synonyme avec synonyme

Exemple pour « sol nig »








Monographie


Recherche par thème


Recherche par thème « simple »


Résultat synthétique

Exemple pour Plantes indigènes


Résultat détaillé


Résultat graphique

Plantes indigènes

accidentel

amphinaturalisé

cité par erreur

cryptogène

cultivé

exotique

indigène

naturalisé

persistant

sténonaturalisé

établi


Recherche par commune


Recherche par commune « simple »


Résultat synthétique

le nombre de données répondant aux critères sur la commune ;le nombre d’informations floristiques sur la commune ;le nombre de plantes observées sur la commune ;le nombre de plantes à statut sur la commune ;le nombre de plantes exotiques sur la commune ;


Résultat détaillé

Résultats détaillés espèces observées ;espèces protégées ;espèces invasives ;espèces spontanées ;

Chaque tableau comprend les informations le nom botanique ;le nom français standard ;le nom vernaculaire ;les statuts indigénat ; les statuts patrimoniaux de menace ; les statuts patrimoniaux de protection ; le statut invasibilité ;le nombre d’observations ;la dernière année d’observation ;la source

Au niveau de l’affichage, l’utilisateur peut demander un regroupementtaxonespècesous espèce


Résultat détaillé (2)


Recherche par site


Recherche bibliographique


Résultat


Recherches cartographiques

3 modes sélection graphique d’un site existant (ZNIEFF1, ZNIEFF2, Natura2000,…)

dessin d’un polygone libre. L’utilisateur ajoute les nœuds les uns après les autres puis double clic pour clôturer le polygone.

import d’une couche MapInfo (*.TAB) ou Shapefile ESRI (*.SHP) contenant un polygone.


Recherche par sélection d’un zonage existant

sélection par clic

sélection par dessin d’une zone


Résultat


Recherche par sélection directe des observations visibles

sélection par clic

sélection par dessin d’une zone


Résultat


Recherche par importation d’un polygone d’une couche externe


Résultat


Autres fonctionnalités carto

Outils de navigation

Outils de légende

Outils de mesure


Autres fonctionnalités carto

Outils de sélection

Outils d’import/export

Outils d’interrogation

Les informations affichées sont les suivantes :code observation

taxon

observateur

date

« fournisseur de la données » (Gentiana, Asters, …)


Légende

Couches de zonage ZNIEFF 1

ZNIEFF 2

Réserves Naturelles

RNR

RBD

Sites Natura 2000

ENS

Parcs Nationaux

Parcs Naturels régionaux

Découpages administratifsEPCI

Pays

Communes

Départements

Région Rhône-Alpes

Fonds IGN Scan 25 noir et blanc ou couleur

Orthophotos

Fonds thématiques Altitude et relief

Climat

Bioclimat

Biogéographie

Géologie

Géomorphologie

Géographie

Administration Conservatoire

ObservationsPolygone

Centroid


Spécifications fonctionnelles de mutualisation de données



Renseignement de fiches floristiques

2 possibilités Télécharger la fiche (format pdf), la renseigner et renvoyer au pole par courrier ou mail,

Saisir directement sur une page web de type formulaire.

3 types de relevé Relevé floristique et phytosociologique

Relevé bryologique

Relevé taxon rare ou menacé


fiches floristiques


Saisie en ligne

Saisie de ses informations :

Identification du mutualisateur Nom de l’observateur (texte libre)

Organisme d’appartenance (texte libre)

Cadre de l’observation (à titre personnel, étude,…) (texte libre)

Adresse mail pour le suivi

Description de l’observationchoix du taxon

date précise

localisationcommune

coordonnées X,Y

description textuelle

saisie carto

altitude


Pré-validation

Lors de la validation de la saisie, fiche d’auto-contrôle avec caractéristiques de l’espèce identifiée.

critère d’auto-évaluation (sûr, incertain, demande validation,…)

S’il a renseigné, une commune, une coordonnée ou une saisie carto, 1er contrôle effectué par le système en comparaison avec l’aire connue de

l’espèce. Si l’espèce n’est pas dans l’aire, une alerte est envoyée à l’utilisateur

2ème critère d’auto-évaluation (sûr, incertain, demande validation,…)

S’il a renseigné l’altitude, 2ème contrôle effectué par le système en comparaison avec l’altitude

minimum et l’altitude maximum de l’espèce. Si l’espèce n’est pas dans la plage altitudinale, une alerte est envoyée à l’utilisateur

3ème critère d’auto-évaluation (sûr, incertain, demande validation,…).


Validation

Après tous ces contrôles, si le mutualisateur confirme la validation de sa donnée :La donnée est enregistrée dans BD TempUn mail est envoyé à l’administrateur du poleUn mail est envoyé au mutualisateur avec la confirmation de sa saisie et un fichier Excel avec ses informations saisiesSelon le département concerné, la donnée est « transmise » au CBN intéressé pour validationLorsque le CBN valide la donnée avec ou sans modification, un mail est envoyé au mutualisateur l’informant que sa donnée est maintenant disponible dans PIFH avec un export Excel de la donnée intégrée


Rappels des attentes vis-à-vis du Maître d’ouvrage



Fourniture de données

Couches de zonage (ZNIEFF, Natura 2000, Réserves naturelles,…)

Couches de découpages administratifs (EPCI, pays, …)

Fonds thématiques (géologie, climat, altitude,…)

Fonds de référence (communes, mailles UTM)

Fonds IGN (Scan 25, orthophotos)

Éléments d’autocontrôle (aire connue de chaque espèce, altitudes mini et maxi)


Administration du portail

Définition de la charte graphique du site

Administration du site via le gestionnaire de contenu Joomla

Définition des rubriques / sous-rubriques

Gestion du forum

Gestion des fichiers de téléchargement

Alimentation des textes des articles

Administration du site via le gestionnaire de contenu Joomla

Administration de l’outil de Bibliographie PMBParamétrage de l’interface de recherche

Paramétrage de l’interface de résultat

Alimentation de la base de données depuis Alexandrie


Point d’avancement

Format standard pour les données mutualisées du pôle


Format standard de données

Standards de données :Standard simple d’agglomération des données d’observation de flore (data flore) Standard simple d’information sur les taxons de flore (taxa flore)

Démarche du PIFH s’inscrivant dans un protocole national d’agglomération de données dans le cadre de la Fédération des CBN

Commande du MEEDDMPilotage par le CBN Massif centralAppui sur un groupe inter-CBN de travail d’informaticiens, géomaticiens et experts de données, auquel le PIFH est invité Adaptation du format national au cas du PIFH (versions nationale / version PIFH)Transmission régulière de la version PIFH aux partenaires de la plateforme PIFH pour validationPremier groupe de travail à Montreuil-sous-Bois le 07 juin 2010

Étapes du processusCycle national inter-CBNAdaptation PIFH et cycle PIFHIntégration au format mondial ABCD (Access to Biological Collection Data) du TDWG


Standard simple d’agglomération de données d’observation flore

Version Date 1.0 Mai 2010 Proposition CBNMC (V. BOULLET) 1.1 Mai 2010 Proposition complétée CBNMC (V. BOULLET) 1.2 03 juin 2010 Proposition complétée CBNMC (V. BOULLET) 1.3 14 juin 2010 Révision GT « Format standard de données »

Version Date 1.0 15 juin 2010 Proposition CBNMC (V. BOULLET)

Standard simple d’agglomération de données d’observation flore

Standard simple d’information sur les taxons de flore (taxa flore)


Planning prévisionnel



Planning prévisionnel

26 mai: Réunion partenariale

15 juin : Retours des partenaires sur les spécifications

Fin juin : Livraison version définitive des spécifications par Mémoris

Fin juin : Validation du format standard des données mutualisées du pôle par les partenaires

Fin juin : Validation des référentiels de la plateforme web par les partenaires

Fin juin : Remise des éléments attendus par Maitre d’Ouvrage

Juillet / Aout / Septembre : Développement par Mémoris

Mi-septembre : Livraison de la plateforme pour tests

Septembre : Mobilisation de l’animateur du pole et du CBNMC pour les tests


Merci de votre attention


Documents

© Mémoris Mai 2010 Comité de suivi mercredi 16 juin 2010 Plateforme web du Pôle dInformation Flore-Habitat de Rhône-Alpes