23 févier 2007 Myo doc Réunion réseau doc/Evry/13-02-2007 Myobase : la base de données bibliographiques de la myologie Le contexte : LAFM Présentation

23 févier 2007

Myodoc

Réunion réseau doc/Evry/13-02-2007

Myobase : la base de données bibliographiques de la myologie

Le contexte :

L’AFM

Présentation rapide du service documentation, Myodoc La base de données Myobase

Historique

Contenu

Les interfaces web

Les perspectives

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Le contexte :

L’AFM : missions

http://www.afm-france.org• aider :

– médecine : amélioration diagnostic, prise en charge médicale efficace (70 consultations MNM)

– vie autonome : aides techniques innovantes, aides humaines

– Vie sociale : rompre isolement, aide aux projets de vie• guérir :

– recherche étendue à l’ensemble des maladies génétiques rares

» Développement de thérapies : génique, cellulaire, pharmacologie

» Comprendre l’origine des maladies génétiques» Mieux comprendre le fonctionnement du muscle

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Le contexte :

Généthon : http://www.genethon.fr

Thérapie génique, vecteurs, essais cliniques• 2004, GenoSafe : sécurité des produits de transfert de

gènes (vecteurs) – aide porteur de projet th. génique

L’AIM (Institut de Myologie, créé par l’AFM en 1997)

http://www.institut-myologie.org• la recherche fondamentale et clinique• la prise en charge médicale, avec une consultation

pluridisciplinaire sur les maladies neuromusculaires• l'enseignement de la myologie.

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Myodoc : service documentation de l’AFM 2 sites

Evry : service documentation interne• Réseau AFM

– siège Evry : salariés – en région : services régionaux, délégations,

coordinations

Paris AIM : bibliothèque ouverte au public– malades et leur famille– médecins du centre de référence, chercheurs,

psychologues– étudiants des DU accompagnement des personnes

atteintes de maladies génétiques et de leur famille, DIU myologie

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Les missions de Myodoc

Collecter, traiter et diffuser la documentation sur la myologie • Les maladies neuromusculaires

– Clinique, diagnostic, prise en charge, recherches médicale et scientifique, génétique, thérapeutique

• Tout ce qui a trait aux problèmes du handicap moteur• Rééducation, intégration, droit, aides techniques• La psychologie des maladies neuromusculaires et

génétiques • La bioéthique • L’étude du muscle sain

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Bref historique

Service documentation créé en 1988• Banque de données interne littérature et images

– dBase III au début– Archis Doc, repris par Alexandrie en 1994

• Thésaurus créé en 1996 à partir de celui de Medline• Base de données interne -> 2003• Mise en ligne de Myobase :

– sur intranet : 2003– sur ToutAFM : oct. 2004, version définitive mai

2005– sur le site internet IDM : sept 2006

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Acquisition des documents : près de 30 000

Dépouillement de toutes les revues (centrale d’achats – 120 abonnements)

Veille bibliographique scientifique à partir de base de données extérieures

(Pubmed)• « Profil » maladies neuromusculaires • Choix articles avec équipe Myoinfo• Bibliographies ponctuelles

Veille internet : législation, rapports…

-> 180 documents nouveaux par mois

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Contenu de Myobase : tout le fonds documentaire

Références bibliographiques : • Résumés :

– livres, thèses récentes, sélection d’articles généraux, « brèves » des articles scientifiques

• Texte intégral (module GEIDE)– Publications libres de droit : publications AFM,

rapports publiques, textes de loi

• Liens vers des page web– Ex : lien vers le résumé pubmed– Ex : lien vers le texte des articles du VLM (droits

d’auteur)

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Thésaurus

Refonte depuis mars 2006• Plus de 6 000 termes• Santé, biologie terminées

– Encore 4 mois de travail : social, psychologie…• But : mise en ligne – spécifique maladies

neuromusculaires, mais incomplet dans autres domaines

• démonstration

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Critères d’accessibilité des documents sur internet

Limites techniques : • niveau autorisation 0• Choix des types de documents

– Différents sur ToutAFM (intranet) et sur myobase.org (internet)

Limites loi pour le texte intégral (GEIDE)• Droits d’auteurs

– Ex : lien vers résumés pubmeb (articles scientifiques)

– Ex : liens vers textes des articles du VLM sur le site AFM (droits auteur journalistes)

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Développement informatique

Interface Web développée en partie en interne, et surtout par GB Concept

2 versions : • ToutAFM : charte graphique de l’intranet

• Myobase.org : – charte graphique du site de l’Institut de Myologie– Nom de domaine myobase.org, .fr, .net, .com

• Perspectives : Version 6 d’alexandrie– Développement à refaire– Charte propre à myobase

• Synchronisation entre le serveur Alexandrie et le serveur web : difficultés de mise en place, contrôle

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Myobase toutAFM (intranet)

Mise en ligne version définitive : mai 2005

Formation de tous les services régionaux (25) et des salariés du siège

Tout le fonds documentaire est accessible et ouvert à l’emprunt à tout le

réseau AFM : – Sauf fonds ancien (8 000 articles, livres…) à trier et

indexer– Sauf documents confidentiels (niveau

d’autorisation>0 –> mot de passe)» Ex : CR de réunions : que pour les participants

(en cours)

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Myobase.org

En ligne depuis septembre 2006

Accessible à tous sans mot de passe

AFM ne fournit pas les documents• Documents cités

– se trouvent dans bibliothèque universitaire– en texte intégral : publications AFM, rapports

publiques, textes de loi– liens vers internet quand possible

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Spécificité du contenu de Myobase

Articles scientifiques, livres : saisie et indexation à jour

Législation : textes de loi, réponses à des questions par les juristes AFM

Littérature grise : • Thèses• Rapports publics• Compte rendu de colloques

– Abstracts de toutes les communications de myologie 2005 (AFM)

– Compte rendu rédigés par scientifiques AFM

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La recherche dans Myobase

• Recherche simple sur tous les champs– FSH– Fsh & thérapie génique

• Recherche avancée : choix du champ, des limites• Sauvegarde : le panier• Affiner la recherche• Visualisation

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Statistiques d’utilisation : xiti

Nombre de pages vues

Nombre de visites

Nombre de visiteurs

Origine des visites

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Perspectives

Techniques • prochaine version alexandrie V6

– Nouvelle charte graphique propre à Myobase

– Facilité de saisie : exportation des références de pubmed

– Fils RSS, alertes…

Promotion• Communication dans revues, listes de diffusion,

présentation, stands colloques…