46, H 75018 PARIS - Bienvenue sur IMEA | IMEA · Etude Pharmacocinétique de la Rifabutine + ARV dans le Traitement de la Tuberculose-VIH à Ho Chi Minh City, Vietnam ... (Burkina

IMEA / Fondation Internationale Léon Mba Rapport d’Activités 2012

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46, RUE HENRI HUCHARD

75018 PARIS


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Table des Matières

ORGANIGRAMME ......................................................................................................................................................... 8

PRESENTATION DES ACTIVITES ..................................................................................................................................... 9

DEPARTEMENT DE FORMATION ..................................................................................................................................10

ACTIVITE ET ORGANISATION DU DEPARTEMENT ....................................................................................................................10 DU : COURS INTERNATIONAL SUR L’INFECTION VIH ET AUTRES IST DANS LES PAYS A RESSOURCES LIMITEES.........................................11

Promoteur : IMEA ............................................................................................................................................................ 11 Coordonnateur formation : Pr. Sophie Matheron ............................................................................................................. 11 Financement : Sidaction, Esther, CNLS Dakar, Solthis, SCAC des Ambassades de France .................................................... 11 Section analytique : 1992/93/94MATmba ........................................................................................................................ 11 Objectif ........................................................................................................................................................................... 11 Programme 2012 ............................................................................................................................................................. 11

PRISE EN CHARGE VIH/VHC AU SENEGAL : DAKAR FANN/HOPITAL SAINT-ANTOINE .....................................................................15 Promoteur : GIP ESTHER .................................................................................................................................................. 15 Coordonateur : Pr. Pierre Marie Girard ............................................................................................................................ 15 Financement : ESTHER ..................................................................................................................................................... 15 Section analytique : 7432/33/39/80PMGmba ................................................................................................................... 15 Objectif ........................................................................................................................................................................... 15 Programme 2012 ............................................................................................................................................................. 15

CONTRIBUTION A L’AMELIORATION DE LA PEC DES PVVIH AU BENIN ........................................................................................17 Promoteur : GIP ESTHER .................................................................................................................................................. 17 Coordonnateur : Pr Pierre Marie Girard ........................................................................................................................... 17 Financement : ESTHER ..................................................................................................................................................... 17 Section analytique : 7450/51/54/56/57/59BOUmba ......................................................................................................... 17 Objectif ........................................................................................................................................................................... 17 Programme 2010-12 ........................................................................................................................................................ 17

CONTINUITE ET RENFORCEMENT DE LA PEC DES PVVIH AU BURUNDI .......................................................................................18 Promoteur : GIP ESTHER .................................................................................................................................................. 18 Coordonnateur : Pr Olivier Bouchaud ............................................................................................................................... 18 Financement : ESTHER ..................................................................................................................................................... 18 Section analytique : 7450/51/54/56/57/59BOUmba ......................................................................................................... 18 Objectif ........................................................................................................................................................................... 18 Programme 2012 ............................................................................................................................................................. 18

DIU FRANCO-BURUNDAIS PEC MULTIDISCIPLINAIRE DES PERSONNES VIVANT AVEC LE VIH/SIDA .....................................................19 Promoteur : GIP ESTHER .................................................................................................................................................. 19 Coordonnateur : Pr Olivier Bouchaud ............................................................................................................................... 19 Financement : ESTHER ..................................................................................................................................................... 19 Section analytique : 7459BOUmba ................................................................................................................................... 19 Objectif ........................................................................................................................................................................... 19 Programme 2012 ............................................................................................................................................................. 19

POPULATIONS VULNERABLES EN REPUBLIQUE CENTRAFRICAINE ................................................................................................20 Promoteur : GIP ESTHER .................................................................................................................................................. 20 Coordonnateur : Christine Salomon anthropologue associée à l’Inserm U1018 .................................................................. 20 Financement : ESTHER ..................................................................................................................................................... 20 Section analytique : 3095SALmba .................................................................................................................................... 20 Objectif ........................................................................................................................................................................... 20 Programme 2012 ............................................................................................................................................................. 20

7EMES RENCONTRES NORD-SUD......................................................................................................................................21 Promoteur : IMEA & IRD .................................................................................................................................................. 21 Coordonateur : Pr. Pierre Marie Girard ............................................................................................................................ 21 Financement : Gilead, Janssen, Abbott & Bristol-Myers Squibb ......................................................................................... 21 Section analytique : 7422 PMGmba.................................................................................................................................. 21 Objectif : animation du réseau des investigateurs de l’IMEA et de ses partenaires ............................................................ 21 Programme 2012 ............................................................................................................................................................. 21

MEMENTO THERAPEUTIQUE : ANTIBIOTHERAPIE EN AFRIQUE SUBSAHARIENNE ............................................................................26 Promoteur : IMEA ............................................................................................................................................................ 26 Coordonnateurs : Prs Pierre Marie Girard, Serge Eholié .................................................................................................... 26 Financement : IMEA, SAPI, GSK ........................................................................................................................................ 26 Section analytique : 7212 PMGmba ................................................................................................................................. 26


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Objectifs.......................................................................................................................................................................... 26 Programme 2012 ............................................................................................................................................................. 26

DEPARTEMENT DE RECHERCHE CLINIQUE ....................................................................................................................29

ACTIVITE ET ORGANISATION DU DEPARTEMENT ....................................................................................................................29 RECHERCHE CLINIQUE : ESSAIS EN COURS ............................................................................................................................30

Essai DAYANA (Afrique) .......................................................................................................................................30 Promoteur : ANRS ........................................................................................................................................................... 30 Investigateurs : Dr Roland Landman, Pr. Sinata Koulla-Shiro, Pr. Papa Salif Sow................................................................. 30 Financement : ANRS, Abbott ............................................................................................................................................ 30 Section analytique : 7434/36/37LANmba ......................................................................................................................... 30 Objectif ........................................................................................................................................................................... 30 Calendrier : 2010-13 ........................................................................................................................................................ 30

Essai DREAM (France) .........................................................................................................................................31 Promoteur : ANRS ........................................................................................................................................................... 31 Investigateur coordonnateur : Dr Jean-Luc Meynard- Hôpital St Antoine-SMIT- Paris ........................................................ 31 Financement : ANRS, Abbott ............................................................................................................................................ 31 Section analytique : 1082/83LANmba .............................................................................................................................. 31 Objectif ........................................................................................................................................................................... 31 Calendrier : 2009-13 ........................................................................................................................................................ 31

Essai DYNA M-O (Afrique) ....................................................................................................................................32 Promoteur : ANRS ........................................................................................................................................................... 32 Investigateurs coordinateurs: Pr Jean-Christophe Plantier, CHU Rouen, Dr Charles Kouanfack, Hôp Central Yaoundé......... 32 Financement : ANRS ........................................................................................................................................................ 32 Section analytique : 1429PLAmba .................................................................................................................................... 32 Objectifs de la recherche ................................................................................................................................................. 32 Calendrier : 2011-13 ........................................................................................................................................................ 32

Etude ORIVAO (France)........................................................................................................................................33 Promoteur : CHU de Rouen .............................................................................................................................................. 33 Investigateur-coordinateur: Pr Jean-Christophe Plantier, lab. de Virologie, lab. associé au CNR du VIH, CHU de Rouen ...... 33 Financement : Sidaction .................................................................................................................................................. 33 Section analytique : 1435/36PLAmba ............................................................................................................................... 33 Objectifs de la recherche ................................................................................................................................................. 33 Calendrier : 2011-12 ........................................................................................................................................................ 34

Essai DATA (France).............................................................................................................................................35 Promoteur : IMEA ............................................................................................................................................................ 35 Investigateurs coordonnateurs Dr Laurence Slama, Dr Roland Landman .......................................................................... 35 Financement : BMS.......................................................................................................................................................... 35 Section analytique : 1083LANsas ...................................................................................................................................... 35 Objectif ........................................................................................................................................................................... 35 Calendrier : 2011-14 ........................................................................................................................................................ 35

Essai OLE (Europe) ...............................................................................................................................................36 Promoteur: FCRB, Barcelone, Esp ..................................................................................................................................... 36 Investigateur-coordinateur France : Karine Amat/ Dr. Roland Landman ............................................................................ 36 Financement : Abbott ...................................................................................................................................................... 36 Section analytique : 1084LANsas ...................................................................................................................................... 36 Objectif ........................................................................................................................................................................... 36 Calendrier : 2012-14 ........................................................................................................................................................ 36

Essai CESAR (France) ...........................................................................................................................................37 Promoteur : IMEA ............................................................................................................................................................ 37 Investigateurs : Pr Laurence Weiss/ Pr Pierre Marie Girard ............................................................................................... 37 Financement : Sidaction .................................................................................................................................................. 37 Section analytique : 1084LANmba .................................................................................................................................... 37 Objectif ........................................................................................................................................................................... 37 Calendrier : 2012-13 ........................................................................................................................................................ 37

Cohorte Post-Kalesolo (France) ............................................................................................................................38 Promoteur : IMEA ............................................................................................................................................................ 38 Investigateur coordonnateur : Dr. Jean-Luc Meynard ....................................................................................................... 38 Financement : Sidaction .................................................................................................................................................. 38 Section analytique : 1081LANmba .................................................................................................................................... 38 Objectif. .......................................................................................................................................................................... 38 Calendrier: 2012-13 ......................................................................................................................................................... 38


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Essai Matthis (France) .........................................................................................................................................39 Promoteur : IMEA ............................................................................................................................................................ 39 Investigateur coordonnateur Dr David Pommier, SMIT, Pr Patrick Yeni, Hopital Bichat ..................................................... 39 Financement : autofinancement ...................................................................................................................................... 39 Section analytique : 1YENmba ......................................................................................................................................... 39 Objectif principal ............................................................................................................................................................. 39 Calendrier prévisionnel : 2012-13 .................................................................................................................................... 40

Etude Optiscreen B (France) ................................................................................................................................41 Promoteur : ANRS ........................................................................................................................................................... 41 Investigateur Dr Julie Bottero .......................................................................................................................................... 41 Financement : ANRS ........................................................................................................................................................ 41 Section analytique : 1031LACmba .................................................................................................................................... 41 Objectif ........................................................................................................................................................................ 41 Calendrier : 2010-12 (non rapporté en 2011).................................................................................................................... 42

Etude VARBVA (Afrique) Variabilité génétique de l’HBV et co-infection par le VIH .................................................43 Promoteur : ANRS ........................................................................................................................................................... 43 Investigateurs Dr Karine Lacombe, Dr Raoul Moh ............................................................................................................. 43 Financement : ANRS10-429 IMEA .................................................................................................................................... 43 Section analytique : 1032LACmba .................................................................................................................................... 43 Objectif ........................................................................................................................................................................ 43 Calendrier : 2011-13 ........................................................................................................................................................ 44

Essai : devenir des patients infectés par le VIH et perdus de vue au Burundi (Afrique) ...........................................45 Promoteur : Centre national de référence en matière de VIH/SIDA au Burundi .................................................................. 45 Investigateurs-coordonateurs : Dr Marie Poupard, Dr Constantin Nyamuzangur, Dr Béatrice Nkurunziza ........................... 45 Financement : Global Fund, IeDEA-NIH, Esther ................................................................................................................. 45 Section analytique : 7455POU50 ...................................................................................................................................... 45 Objectif ........................................................................................................................................................................... 45 Calendrier : 2009-12 ........................................................................................................................................................ 45

Essai FLUCOCRYPTO (Afrique) ..............................................................................................................................46 Promoteur : Inserm-ANRS ................................................................................................................................................ 46 Investigateur-coordonateurs : Pr Olivier Bouchaud, Pr Théodore Niyongabo ..................................................................... 46 Financement : ANRS ........................................................................................................................................................ 46 Section analytique : 7461BOUmba ................................................................................................................................... 46 Objectif ........................................................................................................................................................................... 46 Calendrier : 2012-14 ........................................................................................................................................................ 47

Cohorte THILAO (Afrique) ....................................................................................................................................48 Promoteur : ANRS ........................................................................................................................................................... 48 Investigateurs coordonnateurs : Pr Serge Eholié, Dr. Roland Landman .............................................................................. 48 Financement : ANRS ........................................................................................................................................................ 48 Section analytique : 7711, -12, -13, -14, -15LANmba ......................................................................................................... 48 Objectif ........................................................................................................................................................................... 48 Calendrier : 2012-15 ........................................................................................................................................................ 49

VIH-VHC au Vietnam : Etude de faisabilité d’un traitement par bithérapie pégylée dans une cohorte de patients co-infectés VIH-VHC suivis à Ho Chi Minh Ville (Asie) ................................................................................................50

Promoteur : ANRS ........................................................................................................................................................... 50 Investigateurs coordonnateurs : Dr Maud Lemoine Dr Nguyen Van Vinh Chau, Pr Barre Sinoussi ....................................... 50 Financement : ANRS ........................................................................................................................................................ 50 Section analytique : 5010BARmba .................................................................................................................................... 50 Objectif ........................................................................................................................................................................... 50 Calendrier : 2011-12 ........................................................................................................................................................ 50

Etude Pharmacocinétique de la Rifabutine + ARV dans le Traitement de la Tuberculose-VIH à Ho Chi Minh City, Vietnam ..............................................................................................................................................................51

Promoteur : ANRS ........................................................................................................................................................... 51 Investigateurs coordonnateurs : Dr Maud Lemoine Dr Nguyen Van Vinh Chau .................................................................. 51 Financement : ANRS, Fondation Total .............................................................................................................................. 51 Section analytique : 5010BARmba .................................................................................................................................... 51 Objectif ........................................................................................................................................................................... 51 Calendrier : 2012-13 ........................................................................................................................................................ 51

Amélioration du diagnostic de la tuberculose chez les enfants infectés par le VIH en Asie (Cambodge, Vietnam) et en Afrique (Burkina Faso, Cameroun) ...................................................................................................................52

Promoteur : ANRS ........................................................................................................................................................... 52 Investigateurs Principaux Dr Ung Vibol, , Pr Barre Sinoussi ................................................................................................ 52


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Financement : ANRS, Fondation Total .............................................................................................................................. 52 Section analytique : 5010BARmba .................................................................................................................................... 52 Objectifs.......................................................................................................................................................................... 52 Calendrier : 2011-12 ........................................................................................................................................................ 52

RECHERCHE CLINIQUE: ESSAIS EN DEVELOPPEMENT ...............................................................................................................53 Cohorte ICCARRE (France)...................................................................................................................................53

Promoteur : ANRS ........................................................................................................................................................... 53 Investigateur coordonnateur Pr. Jean-Claude Melchior, Dr Pierre de Truchis..................................................................... 53 Financement : ANRS ........................................................................................................................................................ 53 Objectif ........................................................................................................................................................................... 53

Epidémiologie Clinique des Infections Bactériennes et données de résistance des entérobactéries en Afrique .......54

DEPARTEMENT DE SANTE PUBLIQUE ET SCIENCES SOCIALES .......................................................................................55

ACTIVITE ET ORGANISATION DU DEPARTEMENT ....................................................................................................................55 PROGRAMME DE COOPERATION SIDA/TUBERCULOSE AVEC LE BRESIL ........................................................................................56

Promoteur : ANRS ........................................................................................................................................................... 56 Investigateur Dr Bernard Larouzé ..................................................................................................................................... 56 Financement : ANRS ........................................................................................................................................................ 56 Section analytique : 5195LARmba .................................................................................................................................... 56 Objectif ........................................................................................................................................................................... 56 Calendrier : 2012 ............................................................................................................................................................. 56

PROGRAMME UDSEN : ENQUETE DE PREVALENCE ET DE PRATIQUES A RISQUE D’INFECTION CHEZ LES USAGERS DE DROGUES A DAKAR ......57 Promoteur : Inserm-ANRS ................................................................................................................................................ 57 Investigateurs-coordonateurs : Dr Annie Leprêtre, Dr Idrissa Ba ....................................................................................... 57 Financement : ANRS ........................................................................................................................................................ 57 Section analytique : 3091LEPmba..................................................................................................................................... 57 Objectif ........................................................................................................................................................................... 57 Calendrier : 2011-12 ........................................................................................................................................................ 57

ACCEPTABILITE DU DEPISTAGE DU VIH A POINTE NOIRE, CONGO ..............................................................................................60 Promoteur : INSERM........................................................................................................................................................ 60 Investigateur coordonateur : Christine Salomon ............................................................................................................... 60 Financement : ANRS, Sidaction ........................................................................................................................................ 60 Section analytique : 3093SALmba .................................................................................................................................... 60 Objectif ........................................................................................................................................................................... 60 Calendrier : 2010-12 ........................................................................................................................................................ 60

GENRE, DEPISTAGE DU VIH ET PEC A POINTE NOIRE, CONGO .................................................................................................61 Promoteur : INSERM........................................................................................................................................................ 61 Investigateur coordonateur : Christine Salomon ............................................................................................................... 61 Financement : ANRS projet n°12272 ................................................................................................................................ 61 Section analytique : 3096SALmba .................................................................................................................................... 61 Objectif ........................................................................................................................................................................... 61 Calendrier : 2010-12 ........................................................................................................................................................ 61

CHILDHOOD IMPORTED MALARIA : COULD WE HAVE SUPPRESSED RISK FACTORS IN SOME CHILDREN ? ................................................62 Promoteur : EHESP .......................................................................................................................................................... 62 Investigateur coordonateur : Dr Selva K Pillai ................................................................................................................... 62 Financement : Conseil Scientifique IMEA .......................................................................................................................... 62 Section analytique : 5LEB00 ............................................................................................................................................. 62 Objectif ........................................................................................................................................................................... 62 Calendrier : 2012 ............................................................................................................................................................. 62

A-P RESISTANCE AMONG TRAVELLERS WITH FALCIPARUM MALARIA TREATED IN FRANCE WITH MALARONE®, 2002-12. ..........................64

Promoteur : IMEA ............................................................................................................................................................ 64 Investigateur coordonateur : Dr Selva k Pillai.................................................................................................................... 64 Financement : OMS (phase 1) IMEA (phase2) ................................................................................................................... 64 Section analytique : 5216LEBsas ...................................................................................................................................... 64 Objectif ........................................................................................................................................................................... 64 Calendrier : 2012-13 ........................................................................................................................................................ 64

EFFICACY OF CEFTOBIPROLE ALONE OR COMBINED WITH RIFAMPIN IN A MODEL OF OSTEOMYELITIS DUE TO PVL-POSITIVE CA-MRSA .......65 Promoteur : Janssen-Cilag ................................................................................................................................................ 65 Investigateur coordonateur : Pr Anne-Claude Crémieux.................................................................................................... 65 Financement : Janssen-Cilag ............................................................................................................................................ 65 Section analytique : 4803CREmba .................................................................................................................................... 65 Objectif ........................................................................................................................................................................... 65


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Calendrier : 2010-12 (demande de prolongation pour l’aspect physiopathologique de l’infection) ..................................... 65 ETUDE SUR LA MUCOVISCIDOSE (CHU BICHAT-CLAUDE BERNARD) ...........................................................................................66

Promoteur : INSERM........................................................................................................................................................ 66 Investigateur coordonateur : Pr Jamel El-Benna ............................................................................................................... 66 Financement : Vaincre La Mucoviscidose ......................................................................................................................... 66 Section analytique : 4029/31ELBmba ............................................................................................................................... 66 Objectif ........................................................................................................................................................................... 66 Calendrier : 2003-13 ........................................................................................................................................................ 66

ROLE DES RECEPTEURS FC DANS L’ECHAPPEMENT BACTERIEN AU SYSTEME IMMUNITAIRE ................................................................67 Promoteur : IMEA ............................................................................................................................................................ 67 Investigateur coordonateur : Pr Renato Monteiro ........................................................................................................... 67 Financement : Conseil Scientifique IMEA .......................................................................................................................... 67 Section analytique : 4030MONmba .................................................................................................................................. 67 Objectif ........................................................................................................................................................................... 67 Calendrier : 2011-15 ........................................................................................................................................................ 67

DEPARTEMENT DE MICROBIOLOGIE DE REFERENCE ....................................................................................................68

ACTIVITE ET ORGANISATION DU DEPARTEMENT ....................................................................................................................68 ACTIVITE REFERENTE EN VIROLOGIE ...................................................................................................................................69

Activités BIOPANEL (chu Saint Louis) ....................................................................................................................69 Promoteur : CHU St Louis ................................................................................................................................................ 69 Investigateur : Pr François Simon ..................................................................................................................................... 69 Financement Abbott molecular ........................................................................................................................................ 69 Section analytique : 1823SIMsas ...................................................................................................................................... 69 Objectif : ......................................................................................................................................................................... 69 Calendrier : permanent, début en 2011 ............................................................................................................................ 69

Evaluation du test rapide unitaire antigene p24 IMaccess ....................................................................................69 Promoteur : IMACCESS .................................................................................................................................................... 69 Investigateur : Dr Marie Laure Néré, Pr François Simon .................................................................................................... 69 Financement : IMACCESS ................................................................................................................................................. 69 Section analytique : 1822SIMsas ...................................................................................................................................... 69 Objectif ........................................................................................................................................................................... 69 Calendrier : 2011-14 ........................................................................................................................................................ 70

Evaluation du test BioRad Genius / GENIUS TM HIV ½ ..........................................................................................71 Promoteur : bioRad ......................................................................................................................................................... 71 Investigateur : Dr René Nabias, Pr François Simon ............................................................................................................ 71 Financement : bioRad France ........................................................................................................................................... 71 Section analytique : 1823SIMsas ...................................................................................................................................... 71 Objectif ........................................................................................................................................................................... 71 Calendrier : 2012 ............................................................................................................................................................. 71

Résistance Herpes ...............................................................................................................................................71 Promoteur : CHU St Louis ................................................................................................................................................ 71 Investigateur : Dr Jérôme Le Goff ..................................................................................................................................... 71 Financement : Fondation de France ................................................................................................................................. 71 Section analytique : 1430LEGmba .................................................................................................................................... 71 Objectif ........................................................................................................................................................................... 71 Calendrier : 2010-12 ........................................................................................................................................................ 72

Bioplex, nouvelle technologie de dépistage VIH par Luminex ................................................................................72 Promoteur : CHU St Louis ................................................................................................................................................ 72 Investigateur : Dr Sarah Maylin, Pr François Simon ........................................................................................................... 72 Financement : bioRad ...................................................................................................................................................... 72 Section analytique : 1823SIMsas ...................................................................................................................................... 72 Objectif ........................................................................................................................................................................... 72 Calendrier : 2012 ............................................................................................................................................................. 73

Panel d’échantillon de différents virus pour mise en place d’une quantification VIH-1...........................................73 Promoteur : CHU St Louis ................................................................................................................................................ 73 Investigateur : Pr François Simon ..................................................................................................................................... 73 Financeument : GenProbe USA ........................................................................................................................................ 73 Section analytique : 1823SIMsas ...................................................................................................................................... 73 Objectif ........................................................................................................................................................................... 73 Calendrier : 2012 ............................................................................................................................................................. 73

Méthodes et Logiciels d’Exploitation des Données Génomiques............................................................................74


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Promoteur : ANRS ........................................................................................................................................................... 74 Investigateur : Pr Jean-François Zagury ............................................................................................................................ 74 Financement : ANRS ........................................................................................................................................................ 74 Section analytique : 1326ZAGmba.................................................................................................................................... 74 objectifs : ........................................................................................................................................................................ 74 Calendrier : 2011-12 ........................................................................................................................................................ 74

Identification des transcrits Ago2 et des miARN associés lors de l’infection par le VIH- .........................................75 Promoteur : Sidaction ...................................................................................................................................................... 75 Investigateur : Pr Jean-François Zagury ............................................................................................................................ 75 Financement : Sidaction .................................................................................................................................................. 75 Section analytique : 1327ZAGmba.................................................................................................................................... 75 objectifs du projet : ......................................................................................................................................................... 75 Calendrier : 2011-12 ........................................................................................................................................................ 75

ACTIVITE REFERENTE EN PARASITOLOGIE .............................................................................................................................76 Centre National de Référence du paludisme (chu bichat-claude bernard) .............................................................76

Promoteur : APHP Recherche clinique hôpitaux Paris Nord VDS ........................................................................................ 76 Investigateur coordonnateur : Pr Sandrine Houzé............................................................................................................. 76 Financement : Institut National de Veille Sanitaire ........................................................................................................... 76 Section analytique : ......................................................................................................................................................... 76 Objectif ........................................................................................................................................................................... 76 Calendrier : 2012-16 ........................................................................................................................................................ 76

Evaluation du test elisa malaria igg .....................................................................................................................79 Promoteur : Biorad .......................................................................................................................................................... 79 Investigateur : Pr Sandrine Houzé .................................................................................................................................... 79 Financement : Biorad....................................................................................................................................................... 79 Section analytique : 5319HOUsas ..................................................................................................................................... 79 Objectif ........................................................................................................................................................................... 79 Calendrier : 2012-13 ........................................................................................................................................................ 79

Réseau mondial de surveillance des résistances aux antipaludiques (wwarn) .......................................................80 Promoteur : Université Oxford, UK ................................................................................................................................... 80 Investigateurs : Pr Carol Sibley, Seattle, Pr Jacques Le Bras, Paris ...................................................................................... 80 Financement Fondation BMGF ......................................................................................................................................... 80 Section analytique : 5133LEBmba .................................................................................................................................... 80 Objectif ........................................................................................................................................................................... 80 Calendrier : 2009-13 ........................................................................................................................................................ 81


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ORGANIGRAMME

Directoire

1. M. le Pr. Jacques Le Bras, UMR 216, IRD-Univ. Paris V, Président du Directoire 2. M. le Dr Roland Landman, Président de la SAS IMEA Consulting, Directeur du Département de

Recherche Clinique

3. M. le Pr. Olivier Bouchaud, Univ. Paris XIII, Directeur du Département de Formation 4. M. le Pr. Marc Brodin, Univ. Paris VII, Directeur du département de Santé Publique

5. M. le Pr. Serge Paul Eholié, Univ. Abidjan, Directeur de la recherche en PED

Conseil de Surveillance

1. M. le Pr. Pierre Marie Girard, UMR 707, INSERM-Univ. Paris VI, Président du Conseil de Surveillance

2. Mme. ou M. le Ministre de la Santé, des Affaires sociales, de la Solidarité et de la Famille de la République du Gabon

3. Mme. ou M. l'Ambassadeur de la République du Gabon en France

4. Mme. ou M. le Ministre français des Affaires étrangères et européennes 5. Mme. ou M. le Ministre français de l'Intérieur, de l'Outre-Mer et des Collectivités territoriales

6. Mme. ou M. le Ministre français de la Santé, de la Jeunesse et des Sports

7. Mme. ou M. le Secrétaire Général de l'Assistance Publique - Hôpitaux de Paris

8. M. le Pr. Eric Delaporte, UMI 233, IRD-Univ. Montpellier-UCAD-Univ.Yaoundé, 9. M. le Pr. Patrick Yeni, Université Paris VII, Maladies Infectieuses et Tropicales

10. M. Jean-Michel Debrat, Conseiller financier, Agence française de Développement

11. M. le Pr. Jean-Pierre Coulaud, Président de l'association "Les amis de l'IMEA"

Conseil Scientifique

1. M. le Pr. Eric Delaporte, UMI 233, IRD-Univ. Montpellier-UCAD-Univ.Yaoundé, Président du Conseil

scientifique

2. M. le Pr. Olivier Bouchaud, Service des Maladies Infectieuses et tropicales, Hôpital Avicenne

3. M. le Pr. Michel Cot, UMR 216, IRD-Univ. Paris V, Paris 4. M. le Pr. Moïse Desvarieux, UMR 707, INSERM-Univ. Paris VI,, Paris

5. M. le Pr. Arnaud Fontanet, Institut Pasteur, Paris

6. M. le Pr. Pierre-Marie Girard, UMR 707, INSERM-Univ Paris VI, Hôpital Saint-Antoine 7. Mme. le Pr. Maryvonne Kombila, Faculté de Médecine de Libreville, Gabon

8. M. le Pr. Eric Pichard, Faculté de Médecine d'Angers

9. M. le Pr. François Simon, UMR 941 INSERM-Univ. Paris VII, Hôpital Saint-Louis

Cellule de Gestion et de Recherche Clinique

1. Mme. Catherine Gachet, Assistante de Direction, Tél. +33 (0)1 40 25 69 58 - Fax +33 (0)1 40 25 63 63,

Mel. [email protected]

2. Mme. Catherine Bourse, Comptable, Tél. +33 (0)1 40 25 87 80 - Mel. [email protected] 3. Mme. Aïda Benalycherif, Assistant de Recherches Cliniques, Mel. [email protected]

4. Mme. Karine Amat, Assistant de Recherches Cliniques, Mel. [email protected]

5. M. Babacar Sylla, Assistant de Recherches Cliniques, Mel. [email protected]

tel:%2B33%20%280%291%2040%2025%2069%2058

tel:%2B33%20%280%291%2040%2025%2063%2063

mailto:[email protected]

mailto:[email protected]


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PRESENTATION DES ACTIVITES

L'IMEA est une Fondation franco-africaine, reconnue d’utilité publique, qui développe des programmes de formation et de recherche appliquée sur les grandes endémies sévissant dans les pays en

développement et particulièrement en Afrique francophone. Depuis 45 ans, son directoire identifie des

questions sanitaires prioritaires nécessitant une recherche médicale dont le bénéfice est mesurable à court terme. En cela, son rôle est complémentaire des programmes publics et privés d’envergure et de d’aide

humanitaire. Ses partenaires sont des experts et des agences de moyens qui connaissent ses capacités à mettre

rapidement en œuvre des projets de taille moyenne avec une grande exigence de qualité, et une structure décisionnelle courte et réactive. L’IMEA, au fil des années, a constitué un réseau de compétences avec des

partenaires fidèles et l’a renforcé par des actions de formation. Son équipe de prévention des maladies

transmissibles s’est autonomisée, dans les années 90, pour former l’InVS. L’IMEA dispose de 900m2 de

bureaux et laboratoires, autonomes du CHU Bichat Claude Bernard mais qui bénéficient du support technique hospitalier par convention. Ses acteurs sont bénévoles et s’appuient sur cinq permanents : une assistante de

direction, une comptable et trois assistants de recherche clinique. La Fondation engage chaque année 10 à 20

médecins ou scientifiques pour une durée déterminée par les programmes financés par des agences de recherche ou des dons. Dans le cas des programmes financés directement par la Fondation, un Conseil

Scientifique indépendant se prononce sur leur pertinence.

A la fin de l’année 2011, l’IMEA a structuré ses programmes en quatre départements selon le plan de

ce rapport et a rassemblé fin 2012 son équipe sur ses locaux hospitaliers. Le Département de Formation, coordonné par Olivier Bouchaud, a co-organisé la 36è session du

cours international sur le VIH-SIDA en assurant l’accueil de 9 stagiaires boursiers africains. Il a assuré la

gestion de 4 programmes de compagnonnage d’équipes de soins Nord et Sud ESTHER (formation, organisation de la prise en charge de patients et évaluation) au Sénégal, au Burundi et en Centre-Afrique. Il a

organisé les 7è rencontres Nord-Sud consacrées aux infections négligées et a édité son troisième mémento

pratique qui traite du bon usage des antibiotiques en Afrique. Une formation sur le diagnostic différentiel des maladies fébriles en Afrique est en cours de montage, à l’initiative de Serge Eholié.

Le Département de recherches Cliniques, coordonné par Roland Landman, a poursuivi la

réalisation de 9 études cliniques, a initié 7 nouvelles études et engagé le montage de 2 nouveaux projets.

Quatorze projets sont liés au VIH-SIDA un à la tuberculose et un aux hépatites. Six études sont en Afrique, sept en Europe. Une ouverture sur les affections bactériennes, souhaitée par le directoire, fait l’objet d’un

projet en cours de montage.

Le Département de Santé Publique et Sciences Sociales, coordonné par Marc Brodin, a poursuivi la réalisation de quatre programmes concernant l’acceptabilité de la prévention et des soins, au Brésil, au Congo,

au Sénégal et initié deux programmes sur le paludisme en Ile de France. Trois évaluations de traitements de

maladies inflammatoires et bactériennes en Ile de France sont rattachées à ce département. Il n’y a pas de nouveau projet de Santé Publique en préparation et nous recherchons toujours un partenaire en Sciences

Sociales susceptible d’initier, avec un investissement de la Fondation, un programme original.

Le Département de Microbiologie de Référence, coordonné par François Simon, a poursuivi la

réalisation de 7 projets d’amélioration du diagnostic des infections et de dépistage des résistances aux antiinfectieux, et a initié 3 nouvelles études en ces domaines. L’extension des activités du Centre National de

Référence du paludisme, qui traite désormais dans les laboratoires de l’IMEA tous les échantillons nationaux

à l’exception de la Guyane et de la région PACA sous la responsabilité de Sandrine Houzé, devrait amener à développer l’utilisation des laboratoires de la Fondation pour préparer et distribuer des réactifs de contrôle du

diagnostic, comme initié depuis 3 ans dans le domaine de la virologie.

Dans un contexte économique difficile, la Fondation et sa filiale SAS ont maintenu en 2012 un niveau d’activité élevé grâce à une équipe restreinte très motivée.

Jacques Le Bras

http://imea.fr/


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DEPARTEMENT DE FORMATION

ACTIVITE ET ORGANISATION DU DEPARTEMENT

Responsable : Pr Olivier Bouchaud

A côté de la recherche, la formation a toujours été un axe important des activités de l’IMEA soit en

partenariat avec des structures universitaires (notamment l’Université Paris 7 via le département de santé

tropicale, également les Universités Paris 6 et Paris 13), soit en promotion directe. Les champs couverts par

ces formations sont principalement le VIH-SIDA, principalement dans sa dimension tropicale, la santé tropicale et la médecine des voyages.


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DU : COURS INTERNATIONAL SUR L’INFECTION VIH ET AUTRES IST

DANS LES PAYS A RESSOURCES LIMITEES

XXXVIème

Cours International IMEA-FOURNIER Diplôme d’Université Paris 7 – Denis Diderot

« Cours International sur Infection VIH et autres IST dans les pays à ressources limitées » Département de Santé tropicale, Faculté Denis Diderot (site Bichat), Université Paris 7

et IMEA (accueil, organisation pratique et gestion des bourses Sidaction)

Paris, 5 novembre – 7 décembre 2012

Promoteur : IMEA

Coordonnateur formation : Pr. Sophie Matheron

Financement : Sidaction, Esther, CNLS Dakar, Solthis, SCAC des Ambassades de France

Section analytique : 1992/93/94MATmba

Objectif Prise en charge de l’infection VIH et des autres infections sexuellement transmissibles dans les pays à

ressources limitées Programme 2012

Programme 2012 Les séances d’enseignement théorique se sont déroulées tous les jours ouvrables jusqu’au 4 décembre. Elles

ont été suivies d’un module optionnel, stage de 2 jours et demi dans un service hospitalier ou du module IEC.

Cette formation s’est clôturée par un examen écrit de vérification des acquis ainsi que par une évaluation globale interactive de l’ensemble des cours par les participants.

Modules communs

Infection VIH/SIDA (69 heures) Infections sexuellement transmissibles hors VIH (27,5 heures)

IST et VIH : Santé de la mère et de l’enfant (16,5 heures)

Santé publique et prise en charge psychosociale du VIH (20,5 heures)

Suivi - Evaluation de projets (12 heures) Information – Education – Communication (9,5 heures)

Modules en option (2) : stage hospitalier ou formation I.E.C. (21 heures)

Séance de restitution/évaluation par les étudiants (3 heures)

Les participants ont présenté lors de l’ouverture du cours, un bref exposé de l’épidémie du VIH et de la façon

dont elle est prise en charge dans leurs pays respectifs. Les 7

èmes Rencontres Nord/Sud (IMEA, IRD, Département de Santé Tropicale Paris7) consacrées au thème

« VIH/ SIDA en Afrique : Stop aux tueurs négligés » ont eu lieu le 21 novembre à l’Auditorium de l’hôpital

Européen G. Pompidou : tous les étudiants y ont assisté et ont pris part aux débats.

Un atelier animé par le Groupe d’Etude sur le risque d’Exposition des Soignants sur la prévention et la prise en charge des accidents d’exposition au sang, s’est déroulé le 15 novembre et a duré 2 heures.

Les séminaires habituellement inclus dans le programme du cours, l’un par Sidaction, l’autre par ESTHER,

ont été cette année réuni en une seule séance, le 15 novembre de 10h30 à 16h30, co-organisée et co-animée par F. Thune et C. Michon et consacrée aux « Populations clés »

Le Module « Suivi/Evaluation de projets », soutenu par ONUSIDA et l’OMS, a eu lieu du 28 au 30 novembre,

avec la participation des mêmes enseignants qu’en 2011 (Françoise Dubois-Arber, et Jean-Pierre Gervasoni

de l’Institut Universitaire de Médecine Sociale et Préventive de la Faculté de Lausanne, ainsi que Brenda Spencer, Tobias Alfven, Amani Koffi, Léontine Gnassou, de l’OMS).

Les séances consacrées aux cas cliniques sur « Infections opportunistes » (10,5 heures) ont été animées par les

professeurs S. Eholié (CHU de Treichville, Abidjan) et S. Matheron, et articulées avec une séance dédiée à « l’Approche Syndromique des infections opportunistes et non opportunistes de l’adulte


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Antonio Ugidos, psychologue clinicien, a coordonné le Module Information/Education/Communi-cation. Une

première partie, destinée à l’ensemble des participants, a abordé les thèmes suivants : 1)Historique de la stratégie française de communication sur le VIH/sida 1986/2012 (L. Blauzat, INEPS), 2)Rôle des associations

de patients dans la lutte contre le VIH. Prévention, recherche, lobbying (A. Volny-Anne, Actions

Traitements), 3)La relation médecins/patients (J. Doussou Bessan)

Une deuxième partie de ce module, optionnelle, s’est déroulée sur 2,5 jours ; elle a développé les thèmes suivants : 1)Relation patient-soignant dans le cadre de l’ETP/soutien à l’observance/ prévention positive (A.

Certain, Bichat), 2)Femmes et VIH (K. Sow), 3)Counselling : le counseling, objectifs, attitudes, techniques et

outils (J. Manto, A. Ugidos), 4)L’annonce d’un diagnostic problématique. Mises en situation (A. Ugidos) Le programme s’est achevé par 2,5 jours dédiés soit à la partie optionnelle du module IEC, soit à un stage

hospitalier (en option de 2,5 jours). La liste des différents services d’accueil est jointe en annexe.

1. Documentation et supports pédagogiques :

Comme chaque année, un accès internet a été mis à la disposition des étudiants dans la bibliothèque du Département de Santé Tropicale à Bichat. Les supports pédagogiques utilisés par les enseignants ont été

envoyés chaque soir par mail aux étudiants en format PDF. Ils étaient également en libre accès sur les

ordinateurs de la bibliothèque du département, et le sont sur le site internet de l’Université Paris 7 , ainsi que sur le site internet de l’IMEA. Trois manuels ont été remis à chacun des participants : « VIH », PM Girard, C.

Katlama, G. Pialoux (Ed. Doin, 839 p, 2011), Mémento « VIH/SIDA en Afrique » (Ed. IMEA-Doin, 143 p,

2009), « Recommandations du groupe d’experts pour la prise en charge des personnes vivant avec le VIH »,

P. Yéni (Ed. La Documentation Française, 417 p, 2010)

2. Participants :

31 étudiants ont participé à la session 2012, dont 8 subventionnés par Sidaction. Il s’agissait d’acteurs

de terrain, 13 femmes et 18 hommes, 25 médecins, 5 infirmiers et une sage femme, impliqués dans la prise en

charge et le suivi clinico-biologique des patients infectés par le VIH, la mise à disposition et/ou prescription des antirétroviraux. A noter que depuis 2011, seuls les soignants titulaires d’un diplôme de médecin ou

personnel paramédical sont autorisés à s’inscrire. Leur pays d’origine était : RCA, Bénin, Côte d’Ivoire,

France, Gabon, Cameroun, Tchad (2), Haïti (3), Guinée (4), Sénégal (5), Congo (5), Burkina Faso (6). Le docteur Brédé Dizo Romuald, médecin en Côte d’Ivoire, s’est porté volontaire pour être le délégué des

étudiants de cette promotion. Il a joué un rôle très important dans le relais des informations.

Nous avons été confrontés cette année à des refus de délivrance de visa de la part des Ambassades et

Consulats de France de plusieurs pays d’Afrique notamment le Mali, le Cameroun, le Togo et le Burkina Faso. Cette situation est liée à une circulaire interministérielle DGOS du 31 août 2012 relative aux dispositifs

d’accueil d’étudiants et professionnels étrangers médicaux et paramédicaux. Les diplômes d’université sont

concernés. Un courrier a été adressé à chacun des participants préinscrits, destiné au consulat de leur pays, afin de préciser la courte durée de l’enseignement, le distinguant des formations organisées sur une année

universitaire, ainsi qu’une attestation de participation, d’hébergement, et des dates de validité des titres de

transport. Malgré toutes nos démarches auprès des ambassades, plusieurs participants préinscrits n’ont pu rejoindre le cours.

3. Enseignants

La liste des enseignants figure en annexe (3). Celle des responsables des terrains de stage pour le module

optionnel « stages hospitaliers » figure en annexe (4). Le Pr. S. Eholié, Service des Maladies Infectieuses, CHU Treichville) a animé avec le Pr. S Matheron, une journée d’enseignement sur le « Diagnostic et prise en

charge des Infections opportunistes et non opportunistes dont la tuberculose », sous forme de cas cliniques, et

d’exposés sur la prise en charge syndromique.

4. Evaluation

L’évaluation des acquis a été effectuée sous forme d’examen écrit le 3 décembre. Il comportait 40 QCM sur les différents thèmes et modules abordés lors de la formation. Le sujet et la grille de correction

figurent en annexe (5). Deux QCM étaient différenciés pour les participants médecins et non médecins. Les

notes varient entre 6/20 et 17,5/20. L’assiduité et la participation aux séances d’enseignement ont été prises en compte dans la note finale. Après délibération, le diplôme d’université a été délivré à 26 étudiants sur 31. Une

attestation de présence et de suivi de la formation à été remise aux autres participants. Les diplômes, signés

http://www.medecine.univ-paris-diderot.fr/


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par le Doyen de la faculté de médecine et le Président de l’Université Denis-Diderot, Paris 7 ont été remis aux

étudiants lors de la clôture de la session. L’évaluation des séances d’enseignement a été réalisée selon une grille évaluant 4 paramètres notés

de 1 à 5 et pris 2 à 2 (durée de la séance, adéquation du contenu de la séance par rapport aux objectifs

pédagogiques, qualité des supports pédagogiques et interactivité de la séance). Cette évaluation à été réalisée

pour chaque séance par chacun des participants, sur un support unique, permettant d’obtenir un nuage de points et une visualisation rapide des résultats. Elle a été envoyée pour information pour chaque séance aux

enseignants concernés.

L’évaluation globale de la formation à été réalisée avec les participants et les enseignants responsables de cette formation (JP. Coulaud, S. Matheron, A. Ugidos). L’appréciation générale pour la majorité des

étudiants, a été très satisfaisante.

- Points forts de l’évaluation a) Module « VIH » Les cas cliniques abordés lors des ateliers consacrés à la prise en charge des patients ont

inclus les diagnostics différentiels avec les infections communautaires à la fois sur le plan diagnostique et sur

le plan thérapeutique, à la grande satisfaction des participants, soulignant la pertinence d’une telle thématique dans le programme.

b) Module « Santé Publique » Plusieurs séances ont été dédiées à la prise en charge psychosociale des

PVVIH dans le cadre du module Santé Publique. Un séminaire sur le thème « population clés » a été coordonné et animé par Sidaction et Esther (F. Thune, C. Michon) le 15 novembre. Il a été consacré aux

projets de terrain, et a été particulièrement apprécié des étudiants.

c) Module « Information, Education, Communication » (IEC) Depuis 2011, Antonio Ugidos assure

l’organisation et la coordination de ce module, réorganisé en fonction des besoins des participants. Le module comporte un enseignement pour l’ensemble des participants et une partie en option avec des stages

hospitaliers, pendant 2 jours et demi (18 participants). L’ensemble des participants a souhaité, comme chaque

année, que plus de temps soit accordé à cette thématique, ce que ne permet pas la durée limitée du cours. d) Stages cliniques La liste des terrains de stage figure en annexe (4). 13 étudiants ont choisi cette option.

Les services d’accueil étaient des services de Maladies infectieuses et tropicales, de Médecine Interne avec

unité dédiée à la prise en charge des PVVIH, et de Gynécologie Obstétrique. Ce stage optionnel a été proposé aux étudiants à plein temps, pendant 2 jours et demi. Les participants ont restitué que la durée des stages ne

leur semblait pas assez longue. Ils restent néanmoins conscients que son allongement impliquerait un séjour

plus long en France, avec des charges financières plus lourdes à supporter par les partenaires impliqués en

particuliers pour leur permettre d’assister à des activités pluridisciplinaires, ce qui n’a pas été possible pour tous. Les participants retrouvent les difficultés de terrain qu’ils connaissent bien et prennent conscience

qu’elles ne sont pas totalement effacées par l’accessibilité des médicaments des moyens techniques. La

disponibilité et l’accueil des équipes soignantes, de recherche clinique et des laboratoires pour la prise en charge des stagiaires, a été souvent soulignée.

e) Module « Suivi et Evaluation » : programme en annexe (6) Ce module, décrit plus haut dans le chapitre

programme a été bien évalué par les participants. f) Organisation et logistique Comme les années précédentes, un accueil « secrétariat » était à la disposition

des participants de 8 heures à 18 heures tous les jours. Il a permis à l’ensemble des étudiants d’avoir des

réponses rapides à leurs interrogations sur le plan administratif, de l’enseignement et/ou sur les détails

logistiques de leur séjour.Des boissons (thé, café) ont été proposées pendant toute la durée du cours aux étudiants, et une carte d’accès au restaurant universitaire de la faculté leur a été remise, ce qui leur a permis de

déjeuner sur place. Le secrétariat de l’IMEA a assuré le règlement des per diem en espèces. Un photocopieur

et 2 ordinateurs avec connexion internet étaient également à la disposition des étudiants. Une période de temps libre pour la révision de l’examen final a été aménagée à leur demande la veille de l’examen. Les étudiants qui

ont eu un problème de santé pendant leur séjour ont été pris en charge aux urgences du service de maladies

infectieuses et tropicales de Bichat ou adressés dans les services ou les consultations adéquates. Plusieurs

participants ont regretté que le format papier des supports pédagogiques ne leur soit pas distribué avant ou pendant les séances d’enseignement. Cette possibilité est très limitée par le fait que les supports ne sont le plus

souvent transmis par les enseignants qu’au moment de leur séance, et que certains ne souhaitent pas diffuser

l’ensemble des informations présentées. L’une des participantes, bénéficiant d’une subvention autre que celle de Sidaction, a déploré les conditions peu confortables de l’hébergement, et le montant limité des per-diem.

Le montant des subventions accordées n’autorise pas un budget individuel d’hébergement et de per-diem plus


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élevé. Pour information, la somme retenue pour l’hébergement hôtelier est celle accordée pour les frais de

mission universitaires à Paris 7. Après l’évaluation globale du cours et la remise des diplômes, un déjeuner de clôture à été organisé avec tous les participants ainsi que l’équipe pédagogique. Les étudiants ont pris de

nombreuses photos et se sont échangé leur coordonnées.

g) Ambiance générale En 2012 comme en 2011, l’ambiance entre l’équipe pédagogique et les étudiants a été

très détendue, faite d’une multitude d’échanges constructifs. Des projets d’échanges entre les participants en matière d’activités sur le terrain ont été formulés pendant le cours et lors de la séance d’évaluation, ainsi que

le souhait de collaboration multicentrique en termes de recherche clinique. Plusieurs sujets ont été évoqués,

dont celui de la santé sexuelle chez les PVVIH.

5. Participants ayant bénéficié de la subvention de SIDACTION

Neuf personnes ont été sélectionnées pour bénéficier de la subvention Sidaction, mais 6 d’entre elles

seulement ont pu quitter leur pays d’origine en raison des difficultés d’obtention de leur visa (cf 2.c)). Nous

avons donc demandé à Sidaction, à la fin de la session, l’autorisation d’attribuer une partie du montant de la subvention non utilisée de ce fait, à deux personnes non subventionnées (une originaire du Congo Brazzaville

et l’autre du Burkina Faso) (dont une pour les frais d’hébergement consécutifs au délai d’obtention de son

visa). Aucun des participants Maliens préinscrits n’a finalement pu participer à l’enseignement. La subvention Sidaction a permis la prise en charge (hébergement, per diem, droits d’inscription) de 9 personnes, originaires

du Burkina Faso (7) et d’Haïti (2). Toutes exercent dans des structures associatives ou en lien avec elles.


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PRISE EN CHARGE VIH/VHC AU SENEGAL : DAKAR FANN/HOPITAL

SAINT-ANTOINE

Le Sénégal est un pays où l’épidémie de VIH est concentrée avec une prévalence de 0,7% (EDS 5, 2010-

2011) dans la population générale. En effet, la prévalence du VIH chez les femmes enceintes qui depuis plus d’une dizaine d’années est restée au-dessus de 1% (1,4% en 2006) est en 2009 de 0,7% (BE N°14). Les

résultats annuels du dépistage des femmes enceintes dans le cadre de la PTME ont confirmé des taux de

séropositivité de 0,71% en 2008 et 0,73% en 2009. Ces résultats, collectés à partir des sites de consultation prénatale à l’échelle nationale, confirment la prévalence faible et stable dans la population générale.

S’agissant des populations plus exposées au risque, la prévalence est de 18,5% chez les professionnelles du

sexe, de 21,8% chez les hommes ayant des relations sexuelles avec des hommes (MSM) et de 9,4% chez les

injecteurs de drogues intraveineuses (UDI). En ce qui concerne le lieu de résidence, il n’y a pas de différence entre le milieu urbain (0,7%) et le milieu rural (0,7%). Les régions de Kolda de Sédhiou et de Ziguinchor avec

les prévalences les plus élevées (entre 2 et 3%) sont les plus touchées par l’épidémie. Les régions de Louga de

Fatick et de Saint Louis, Diourbel sont celles où on observe les taux de prévalences les plus faibles. Selon le sexe, les femmes sont plus infectées que les hommes avec une tendance à la baisse du sex-ratio passant de

2,25 à 1,6.

Promoteur : GIP ESTHER

Coordonateur : Pr. Pierre Marie Girard Equipe : P Campa, PM Girard, S Perrot, V Lalande

Financement : ESTHER

Section analytique : 7432/33/39/80PMGmba

Objectif Les priorités du plan stratégique 2011-2015 s’articulent autour :

- du renforcement des acquis de prévention de prise en charge et de management des interventions dans la

perspective de l’accès universel aux services de prévention, de soins et de traitement et de soutien ; - du renforcement des interventions dans les groupes vulnérables et groupes clés exposés à un risque élevé, en

tenant compte du contexte et de la localisation géographique ;

-du passage à l’échelle des interventions « Prévention de la transmission sexuelle, CDV,PTME, Traitement ARV » ayant fait la preuve de leur efficacité ;

-du renforcement de la dimension genre et du respect des droits humains des groupes en contexte de

vulnérabilité et des groupes les plus exposées au risque ;

-de l’intégration et de l’optimisation des Actions VIH/sida/SR/TB ; -du renforcement du système communautaire et du renforcement du système de santé ;

-du partenariat sous régional.

Programme 2012

Les journées scientifiques du site ANRS Sénégal ont eu lieu le 30 et 31 Mai 2012 en présence du directeur de l’ANRS (Pr Jean François Delfraissy), des coordonnateurs Nord et Sud du site (Pr Pierre Marie Girard, Dr

IbraNdoye), du Ministre de la Santé et de l’Action Sociale (Pr Eva Marie CollSeck), de l’Ambassadeur de

France au Sénégal (Mr Nicolas Normand), du représentant régional de l’IRD (Mr Georges De Noni), du directeur du GIP ESTHER (Dr Gilles Raguin) et du directeur de l’unité mixte internationale 233 de l’IRD (Pr

Eric Delaporte). La journée du 30 Mai a été consacrée à la restitution communautaire des résultats permettant

de présenter et de discuter avec un langage non scientifique les activités de recherche avec la participation de

25 associations de personnes vivant avec le VIH. La journée scientifique du 31 mai a présenté à 120 chercheurs et associatifs les activités du site qui s’oriente actuellement vers :

la recherche épidémiologique, biomédicale, et en sciences humaines sur la problématique émergente

et innovante des usagers de drogues injectables et vers la recherche pédiatrique


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le développement des travaux de virologie clinique dans la perspective d’une optimisation de la prise

en charge clinique des patients et de l’adéquation des politiques de santé publique. L’accent a été mis

sur l’adaptation de techniques virologiques de suivi des patients à la fois dans les centres de références et dans le cadre de la décentralisation de la prise en charge.

les essais thérapeutiques des antirétroviraux : la nouvelle orientation de ce pôle important du site,

annoncée lors des précédentes journées est devenue réalité et un programme pionnier d’évaluation des

troisièmes lignes d’antirétroviraux débutera d’ici fin 2012.

Missions au centre de recherches cliniques de Fann (CRCF), partenariat IMEA/SIDAK)

Pr PM Girard, 04 au 07 Avril, coordination site et préparation Journées scientifiques, 29 mai-01 juin Journées

scientifiques et CA du CRCF, 10-12 oct. coordination site, CA CRCF, 28-30 nov. coordination site, Etude

Thilao, CA CRCF Dr Ibra Ndoye, 6-7 fév. réunion AC1211, 15 juin et 19-23 nov. coordination site


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CONTRIBUTION A L’AMELIORATION DE LA PEC DES PVVIH AU BENIN


Coordonnateur : Pr Pierre Marie Girard Partenaires :

NORD CHU St Antoine et Bichat Claude Bernard, APHP, Paris, France

SUD CHU national de Cotonou, hôp. D’instruction des armées, l’hôp. de zone de Suru-Léré, le lab. National de référence,


Section analytique : 7450/51/54/56/57/59BOUmba

Objectif Contribuer à réduire le taux de transmission du VIH de la mère à l'enfant en augmentant le nombre de femmes enceintes et d'enfants dépistés et pris en charge.

2tudier l’interaction du VIH-SIDA et du paludisme pendant la grossesse.

Contribuer à former les acteurs clés du projet à la PEC des adultes et des enfants atteints du VIH-SIDA sur les

sites de partenariat Mettre en place des mécanismes de suivi et d’évaluation permettant une PEC de qualité et une bonne

observance des traitements

Programme 2010-12

présentations et publications :

étude 1

étude 2

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23555035



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CONTINUITE ET RENFORCEMENT DE LA PEC DES PVVIH AU BURUNDI

Le GIP ESTHER est présent au Burundi depuis 2006 à la demande du gouvernement burundais. Ses interventions sont axées principalement sur le renforcement des capacités par la formation, l’expertise

médicale et l’échange d’expérience pour aboutir à des soins universels et de qualité.

Ce partenariat est entretenu par 3 hôpitaux universitaires français (Rennes, Avicenne et Nantes) au nord

et 14 structures au sud (hôpitaux et associations). Des missions de formation et de compagnonnage sont effectuées par les partenaires du nord (>30 par an) tandis que des professionnels du Burundi bénéficient de

stages de formation en France ou au sud (Rwanda) dans la prise en charge pédiatrique.

L’IMEA-Fondation Internationale Léon Mba intervient activement dans ce projet par la gestion d’une partie des fonds et surtout par un partenariat fonctionnel et un appui sur certains aspects du projet. A titre

d’exemple le Guide de prise en charge globale du VIH à destination des paramédicaux diffusé en 2011 est une

co-édition IMEA /ESTHER.


Coordonnateur : Pr Olivier Bouchaud Partenaires :

NORD CHU Bobigny/Avicenne-APHP/Université Paris 13 - CHU Rennes - CHU Nantes SUD CHU Kamenge - Hôpital Prince Régent Charles - CMC Buyenzi - SWAA Burundi (prison)

Collectif associatif : ANSS, Apecos, FVS, Nouvelle Espérance, RBP+, SWAA.


Section analytique : 7450/51/54/56/57/59BOUmba

Objectif Contribuer à réduire le taux de transmission du VIH de la mère à l'enfant en augmentant le nombre de femmes

enceintes et d'enfants dépistés et pris en charge.

Augmenter le nombre d'adultes dépistés, pris en charge précocement sous TARV et accompagner le passage

sous 2éme ligne et diagnostic de la TB Consolider le niveau de la PEC VIH de la prison centrale de MPIMBA afin d’en faire un centre de référence

nationale de PEC VIH et accompagner le renforcement de la prise en charge des autres prisons par une mise

en réseau des acteurs Accompagner la sécurisation des soins dans les structures hospitalières d’intervention ESTHER

Programme 2012 Actuellement, ESTHER intervient sur les deux grands hôpitaux du Burundi (HPRC et CHUK), où il a

initié la PEC des PVVIH dans des structures appelées CPAMP, qui suivent plus de 6 000 patients.

ESTHER s’occupe également des personnes les plus vulnérables (Prisonniers et OEV), dans son projet avec la SWAA à la prison centrale de Mpimba. Cependant, malgré tout ce système mis en place, le chemin à

parcourir reste long en matière de VIH au Burundi ; peu de dépistages sont réalisés, et souvent tardivement

d’où une prise en charge des PVVIH tardive ayant pour conséquence une morbi mortalité importante. Les

ruptures de stocks de consommables sont répétitives (ARV, IO, réactifs). La PTME est le maillon faible de cette prise en charge avec moins de 15 % de couverture nationale, mais les résultats d’intervention en PTME

sont encourageants au CMC Buyenzi qui est le centre pilote de la PTME au Burundi et le partenaire

d’ESTHER, avec moins de 1% de PCR1 positive pour le premier semestre de 2010.Quant aux personnes vulnérables, (prisonniers), le dépistage n’est pas systématique pour les nouveaux entrants et un centre

d’accueil médical est nécessaire dans le quartier des femmes de la prison de Mpimba.

Le programme 2012 finance : - les médicaments ARV, IO, consommables et réactifs sont couverts par le Round 8,

- les activités d’appui à l’hygiène hospitalière (cofinancement APPS/ OMS, projet Patient safety)

- la prison Mpimba (cofinancement de la Région Pays de la Loire)

- le PTME auprès du CMC Buyenzi (cofinancement avec la Fondation GSK)


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DIU FRANCO-BURUNDAIS PEC MULTIDISCIPLINAIRE DES PERSONNES

VIVANT AVEC LE VIH/SIDA

Promoteur : GIP ESTHER Coordonnateur : Pr Olivier Bouchaud Partenaires : Pr Théodore NIYONGABO Faculté de Médecine de Bujumbura, Université du Burundi, CNR du

Burundi en matière de VIH, Bujumbura, Burundi. Pr Olivier BOUCHAUD, Dr Johann CAILHOL. Faculté de

Médecine de Bobigny, Université Paris 13, France en coopération avec la Faculté de Médecine de Rennes, l’Association ReMeD, ESTHER et l’IMEA

Financement : ESTHER Section analytique : 7459BOUmba Objectif

- former l’ensemble des intervenants à une prise en charge globale et multidisciplinaire des personnes atteintes par le VIH-sida dans le contexte Burundais et de la région des Grands Lacs.

- apporter aux professionnels de santé les outils nécessaires pour la prise en charge du VIH/sida dans un

cadre de santé publique et dans l’optique d’une décentralisation: définition des lignes de traitement, de suivi standardisés et de conduite à tenir dans les situations les plus courantes

- apporter aux professionnels de santé les outils nécessaires pour la mise en place de structures

d’observance

- sensibiliser les professionnels formés à la recherche opérationnelle et à la formation

Organisation générale

- durée : 2 ans, 5 modules d’une semaine répartis sur 4 sessions

- enseignement théorique : 160 heures (tronc commun et modules spécifiques), acquisition des connaissances en 3 temps : lecture par les étudiants d’un document de référence fourni (temps de

travail individuel inclus dans le temps formation), cours théorique reprenant les points importants ou

nécessitant des clarifications, atelier inter-actif de renforcement des connaissances, basé sur des situations cliniques

o stage pratique (20 heures minimum): présence à des séances de discussion thérapeutique ou à

des consultations dans des sites de prise en charge de PvVIHs partenaires du DIU

o module supplémentaire « circuit et gestion du médicament » pour les pharmaciens

Programme 2012 - Session 1 (modules 1 et 2). Epidémiologie générale: mondiale, régionale et nationale.

Physiopathologie et histoire naturelle de l’infection VIH. Diagnostic et marqueurs d’évolution

biologiques. Dépistage et annonce du diagnostic de séropositivité. Prévention de la transmission sexuelle. VIH et grossesse. Diagnostic et prise en charge thérapeutique des infections opportunistes et

cancers associés à l’infection VIH dans le contexte africain, Approche syndromique de la prise en

charge des infections opportunistes et des infections liées au VIH/sida dans le contexte africain. Suivi

des personnes infectées par le VIH-sida, ne recevant pas de traitement antirétroviral (TARV). Stratégies, règles de prescription et effets indésirables des TARV. Adaptation des stratégies de prise

en charge au contexte africain. Suivis clinique et paraclinique des patients sous TARV. Observance

thérapeutique : mise en place et rôle d’une « équipe d’observance »

- Décentralisation

- Sessions 2 Formation continue et approfondissement (diagnostic, traitement et suivi des infections opportunistes; traitement et suivi par TARV en pratique; PTME). VIH et grossesse. VIH pédiatrique.

Exposition professionnelle au VIH. Prise en charge sociale et psychoaffective. Prise en charge de la

douleur et soins palliatifs. Organisation de la lutte contre le VIH/SIDA au Burundi

- Session 3 Formation continue (rappels des sessions 1, 2 et 3), initiation à la pédagogie. Organisation, gestion et contrôle de la filière du médicament : de l’approvisionnement à la dispensation. Initiation à

la pédagogie pour l’enseignement de la prise en charge du VIH-sida aux professionnels de santé et

aux volontaires du monde communautaire


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POPULATIONS VULNERABLES EN REPUBLIQUE CENTRAFRICAINE


Coordonnateur : Christine Salomon anthropologue associée à l’Inserm U1018 Partenaires :

NORD INSERM U1018

SUD Bangui


Section analytique : 3095SALmba

Objectif Bangui : Appui à deux projets de recherche opérationnelle menés à Bangui (RCA) avec un volet qualitatif,

l’un sur les travailleuses du sexe (TS), l’autre sur les hommes ayant des relations avec des hommes (HSH)

Programme 2012 Début de l’étude : septembre 2012 Deux missions ont été effectuées.

La première du 12 au 20/09/2012 avait pour objectifs :

- de renforcer les capacités des équipes en RCA sur la méthode qualitative

- de les renforcer sur l’approche genre

- d’évaluer l’avancement du volet quantitatif de l’étude TS, - de former des enquêteurs pour mener l’enquête qualitative TS

La seconde du 28/11 au 6/12/2012 avait pour objectifs :

- de valider l’enquête par entretiens réalisés auprès de femmes identifiées comme

travailleuses du sexe

- de mener quelques entretiens « de contrôle »

- de discuter les premiers résultats avec l’équipe

- de faire le point de l’avancement des deux projets

Il s’est donc agi d’un appui ponctuel apporté au second semestre 2012 qui a permis de faire

reprendre la saisie et l’analyse des données quantitatives de l’étude TS et qui a préparé puis validé

l’enquête par entretiens correspondant au volet qualitatif de cette étude. Les données qualitatives

recueillies seront analysées ultérieurement.


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7EMES RENCONTRES NORD-SUD

La faisabilité et l’efficacité des traitements antirétroviraux dans les pays à ressources limitées ont été démontrées. Pour autant, ces succès ne doivent pas occulter les graves préoccupations sur la pérennité des

financements dans les pays à ressources faibles ou intermédiaires ; la moitié des patients perdus de vue est en

réalité décédée. Les données de cohorte indiquent qu’en Afrique subsaharienne, la mortalité chez les adultes

sous traitement ARV varie entre 7 et 30%. Cette mortalité est maximale au cours des 12 premiers mois suivant l’instauration du traitement antirétroviral témoignant de l’initiation encore bien trop tardive de ce dernier.

Cette mortalité élevée à court et moyen terme, est directement imputable aux infections opportunistes, aux

maladies bactériennes invasives et aux complications hépatiques associées aux virus des hépatites B et C. En dehors de la tuberculose réputée comme la première infection opportuniste dans les régions tropicales, les

maladies bactériennes invasives, la cryptococcose neuro-méningée et les co-infections par les virus des

hépatites virales B et C sont les principales causes de morbi-mortalité. La mobilisation encore seulement balbutiante des grandes institutions, des bailleurs de fond et des acteurs de la lutte contre le Sida face à ces

tueurs négligés n’est pas admissible. Ces affections sont insuffisamment documentées. Leur repérage clinique

et les outils diagnostiques de base sont encore très insuffisamment implantés sur le terrain. Il est urgent

d’étendre l’accès aux outils diagnostiques et aux traitements de ces affections ; alors même que les tests diagnostiques et les médicaments anti-infectieux sont souvent peu coûteux.

Pierre-Marie GIRARD, Serge EHOLIE

Promoteur : IMEA & IRD

Coordonateur : Pr. Pierre Marie Girard

Financement : Gilead, Janssen, Abbott & Bristol-Myers Squibb

Section analytique : 7422 PMGmba

Objectif : animation du réseau des investigateurs de l’IMEA et de ses partenaires

Programme 2012


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VIH/SIDA en Afrique : stop aux tueurs négligés ! »

9 H 00 – 9 h 30 Accueil des participants 9 h 30 – 10 H Ouverture Eric DELAPORTE, IRD UMI 233 ; Pierre-Marie GIRARD, IMEA/CHU St Antoine

Session I : Hépatites liées aux VHB et VHC

Modérateurs : Stanislas POL (AP-HP Cochin) Jean-François ETARD (Epicentre)

10 h – 10 h 20 Epidémiologie génétique du VHB

Anders BOYD (INSERM U707, Paris)

10 h 20 – 10 h 40 Outils diagnostiques des hépatites virales dans le contexte des pays à ressources limitées

Avelin AGOKHENG (IMPM, Yaoundé)

10 h 40 – 11 h Marqueurs de progression des hépatopathies en Afrique

Appolinaire SAWADOGO (CHU, Ouagadougou)

11 h – 11 h 20 Questions-réponses

Modérateurs : Sinata KOULLA-SHIRO (Hôpital Central, Yaoundé) Gilles RAGUIN (ESTHER, Paris)

11 h 20 – 11 h 40 Traitement de la co-infection VIH/VHB

Maud LEMOINE (MRC, Banjul)

11 h 40 – 12 h Représentation sociale des hépatites chroniques B et C

Annabel DESGREE DU LOU (IRD, Paris)

12 h – 12 h 20 Virus de l’hépatite C : quelle prise en charge dans les pays à ressources limitées ?

Arnaud FONTANET (Institut Pasteur, Paris)

12 h 20 – 12 h 40 Le Plaidoyer de MSF pour le diagnostic et le traitement des hépatites dans les pays à ressources

limitées Isabelle MEYER-ANDRIEUX (MSF, Genève)

12 h 40 – 13 h Questions-réponses

13 h – 14 h Déjeuner sur place

Session II : Infections bactériennes

Modérateurs : Antoine ANDREMONT (AP-HP Bichat) Emmanuel MORTIER (AP-HP Louis Mourier)

14 h – 14 h 20 Morbidités bactériennes sévères au cours de l’infection VIH en Afrique sub-saharienne

Xavier ANGLARET (INSERM Centre 897, Bordeaux ; PACCI, Abidjan)

14 h 20 – 14 h 40 Résistances bactériennes en Afrique sub-saharienne : l’exemple inquiétant des Lactamases à

Spectre Etendu Antoine ANDREMONT (AP-HP Bichat-Claude Bernard)

14 h 40 – 15 h Questions-réponses

15 h –16 h 15 Table ronde et débat sur le renforcement des laboratoires de microbiologie clinique au service

des patients avec Christophe MICHON (ESTHER, Paris)

Programme de Monrovia Jean-Marc CHAPPLAIN (CHU, Rennes)

Programme de Bamako Chetaou MAHAZA (CHU, Angers)

Compagnonage des Technniciens de labo à Atakpame (Togo) et Moundou (Tchad) Gérard LETURNIER (Entraides Santé 92)

Genexpert et TB : A quel niveau de la pyramide sanitaire ? Pierre HENRY (Montpellier)

Session III : Cryptococcoses

Modérateurs : Eric CAUMES (AP-HP Pitié Salpétrière) Sophie MATHERON (AP-HP Bichat)

16 h 35 – 16 h 55 Traitement de la cryptococcose : quelles nouvelles perspectives à moyen terme ?

Olivier BOUCHAUD, Amélie CHABROL (AP-HP Avicenne)

16 h 55 – 17 h 15 Quand faut-il débuter le traitement antirétroviral lors d’une cryptococcose ?

Serge EHOLIE (CHU de Treichville, Abidjan ; IMEA, Paris) 17h30 CONCLUSIONS : Ibra NDOYE (CNLS, Dakar), Serge EHOLIE (CHU d’Abidjan ; IMEA, Paris)


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Hépatites liées aux VHB et VHC chez les patients infectés par le VIH

Anders BOYD (Inserm U707, Paris) rappelle la répartition géographique des sous-types du VHB : on

rencontre surtout les sous-types A et G en Europe, le E en Afrique de l’Ouest, le A dans le Sud de l’Afrique, les

sous-types B et C en Asie et les Esquimaux sont concernés par le sous type F. L’impact clinique de cette variabilité

génétique n’est pas encore connu. L’acquisition de mutations de résistance à la lamivudine survient dans 70 à 90%

des cas en monothérapie à 5 ans de traitement ; En revanche, même après 8 ans, la prise efficace de tenofovir n’est

pas associée à des résistances. Certains variants sélectionnés par le tenofovir pourraient échapper à la protection

vaccinale actuelle anti-VHB. La variabilité génétique du VHB peut moduler l’activité antivirales des traitements

Anti VHB actuellement disponibles. Il semblerait que le sous-type G ou les espèces minoritaires virales présentes

après un traitement par lamivudine seule, soient des facteurs prédictifs de moindre réponse à un traitement par

tenofovir associé à l’emtricitabine. En cas d’échec de traitement sous monothérapie de lamivudine, l’ajout du

tenofovir à la lamivudine n’est pas intéressant, en revanche le switch pour le tenofovir seul apporte un réel

bénéfice. Deux particularités se dessinent dans la population co-infectée par VIH/VHB : le délai de décroissance de

la charge virale jusqu’à l’indétectabilité est allongé, et peut atteindre 60 mois, et la possible persistance à bas bruit

d’une réplication virale VHB sous tenofovir sans que n’apparaisse de mutation de résistance.

Avelin AGOKHENG (IMPM, Yaoundé) a rappelé que les tests mis à disposition en Afrique sont des

« tests rapides » pour le dépistage de l’Ag HBs, utilisables en périphérie et au niveau de la région, des tests Elisa

pour le dépistage de l’Ag HBs et des Anticorps anti HBc, utilisés essentiellement en région et en laboratoires

spécialisés dans le cadre de la sécurité transfusionnelle. La détection de l’ADN VHB est très peu utilisée.

Néanmoins, le dépistage des infections VHB et VHC n’est pas systématique dans les banques du sang (parfois

jusqu’à plus de 40 % des lots ne sont pas testés), bien que dans certaines populations en Afrique la prévalence de

VHB (Ag HBs) et/ou VHC soit supérieure à 20%. Le dépistage VHB/VHC systématique chez les populations

séropositives VIH est encore balbutiant au gré des infrastructures locales, des approvisionnements en réactifs et

souvent aussi des capacités à payer des patients. La promotion de tests de dépistage fiables et à moindre coûts, en

cours de qualification par l’OMS, est un préalable indispensable à une réelle politique de santé de prévention et de

prise en charge thérapeutique des infections par le VHB et le VH.

Appolinaire SAWADOGO (CHU, Ouagadougou) estime qu’un score spécifique africain d’évaluation des

fibroses des hépatopathies chroniques doit être élaboré face à la précarité des moyens techniques et/ou financiers,

des spécificités climatiques qui ne permettent pas aisément le transport et la conservation des tests et des

prélèvements. Ces scores doivent tenir compte des co-morbidités locales notamment du paludisme et de la

drépanocytose. Il semblerait que le score « Fib 4 », utilisant l’âge, la numération des plaquettes, et le taux des

transaminases soit fiable (bien corrélée aux critères histologiques de fibroses) et d’accès facile. Appolinnaire

SAWADOGO a mentionné l’initiative panafricaine de la lutte contre les hépatites avec la Déclaration de Dakar de

Juillet 2011.

Maud LEMOINE (MRC, Banjul) rappelle que 350 à 400 millions de personnes sont infectées par le VHB

et 150 millions par le VHC dans le monde (OMS). Le Carcinome hépato cellulaire (CHC), cinquième cancer au

monde par sa fréquence, est lié au VHB dans les deux tiers des cas. La prévalence de l’Ag HBs en Afrique varie de

7 à 25% selon les zones géographiques. La transmission du VHB est principalement verticale en Asie alors qu’elle

est horizontale (avant 5 ans) en Afrique. Ainsi la transmission du VHB survient en règle bien avant celle du VIH.

Malgré l’efficacité supérieure à 95% de la vaccination anti VHB, la couverture vaccinale demeure insuffisante. La

coinfection VIH/VHB est péjorative : l’évolution de l’hépatopathie chronique due au VHB est aggravée et associée

à une surmortalité de l’ordre de 36 %. Comme mentionné par l’orateur précédent, le dépistage est très déficient y

compris chez les patients infectés par le VIH. Cela est d’autant plus préjudiciable que la lamivudine est quasi

systématiquement incluse dans les multithérapies antirétrovirales. Ainsi les patients reçoivent une monothérapie

anti-VHB alors même que le risque d’acquisition de résistance à la lamivudine est très élevé de l’ordre de 60 % à 2

ans. Les hépatites virales chroniques sont les grandes oubliées des politiques de santé. Maud Lemoine a relaté le

dispositif « Prolifica » (MRC, Grande Bretagne), vaste programme de recherche qu’elle coordonne en Gambie et au

Sénégal et qui vise à démontrer la faisabilité de la prévention et de la prise en charge de l’infection par le VHB en

Afrique de l’Ouest.

Annabel DESGREES du LOU (IRD, Paris) a abordé la complexité des représentations sociales des

infections chroniques par les virus des hépatites B et C chez les migrants subsahariens vivant en France. Ces

personnes ne sentent généralement pas concernées par le VHB et à l’instar de la population autochtone confondent


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les modes de transmission des différents virus des hépatites. La transmission sexuelle du virus de l’hépatite B est en

règle ignorée. Les facteurs de risque de contamination les plus souvent mentionnées sont le manque d’hygiène et la

pauvreté, volontiers associés à la vie africaine, donc ne concernant pas la vie en France. Les défauts de

communication entre soignants et soignés ne favorisent pas l’amélioration des connaissances, et indirectement

entretiennent l’auto-stigmatisation des patients atteints d’hépatites chroniques VHB ou VHC trop souvent reliées, à

tort, aux excès type alcool, pauvreté, addictions aux substances illicites. L’intérêt de la prise en charge médicale de

ces maladies longtemps asymptomatiques n’est en règle pas perçu. Un effort de communication et de pédagogie sur

la question des hépatites chroniques virales est clairement indispensable.

Arnaud FONTANET (Institut Pasteur, Paris) a rappelé les caractéristiques épidémiologiques de

l’infection par le VHC : on considère que 120 à 170 millions de personnes sont chroniquement infectées par le

VHC dans le monde. Globalement la prévalence est plus élevée dans les pays du Sud que dans ceux du Nord mais

les disparités géographiques et selon les populations sont très importantes dans les deux hémisphères. Les enjeux

sont de taille : diagnostic encore très insuffisant, indications thérapeutiques mal définies, prise en charge complexe

nécessitant de plateaux techniques performants et une expertise médicale, traitements non disponibles et/ou trop

coûteux et enfin volonté politique encore très insuffisante. L’arrivée des nouveaux traitements anti-VHC plus

simples à administrer (voie orale, bonne tolérance) et d’efficacité apporte une note certaine d’optimisme. A.

Fontanet participe au programme de prise en charge des hépatites C en Egypte dans des régions hyper endémique

où la prévalence de VHC dans la population adulte peut atteindre 50% chez les hommes et 30% chez les femmes.

Un interféron dit « bio-similaire » a été développé. Accessible à moindre coût, il a été utilisé avec succès dans le

cadre de programmes de recherche thérapeutique chez des patients monoinfectés VHC. Le traitement des adultes

dont la maladie hépatique était évolutive s’est révélé cout-efficace.

Isabelle MEYER-ANDRIEUX (MSF, Genève) rappelle que la co-infection VIH/VHB concerne 2 à 4

millions de personnes et la co infection VIH/VHC 4 à 5 millions dans le monde. Or les conditions sanitaires des

pays à ressources limitées favorisent les transmissions (matériel non stérile, dons transfusionnels non sécurisés,

programmes vaccinaux limités). MSF ne dispose pas de tests diagnostics, seulement de tests de dépistages

sérologiques. Depuis 2012, MSF peut utiliser des tests rapides de PCR VHC, mais dont la fiabilité chez les co-

infectés VIH/VHC n’est pas connue. Des tests rapides fiables, peu coûteux de PCR sont donc nécessaires pour

diagnostiquer et suivre les porteurs actifs d’hépatites virales. Ensuite, la détermination précise de la fibrose

hépatique doit être précisée, à moindre coût, sensible et reproductible. Concernant les traitements, les processus

pour prouver l’équivalence aux traitements princeps, des traitements bio-similaires ne sont pas standardisés et non

encore réglementés par l’OMS. De plus, les négociations des prix sont différentes selon les stratégies des firmes et

des pays concernés. Une volonté politique internationale est nécessaire pour régulariser cela. En attendant que les

traitements anti VHC per os soient accessibles, il faut traiter les patients avec état de fibrose F3/F4. De plus, le

traitement anti VHB en monothérapie doit bénéficier du travail déjà fait par les réseaux du VIH pour être admis par

les autorités politiques.

Infections bactériennes sévères au cours de l’infection VIH

Xavier ANGLARET (INSERM 897, Bordeaux), se référant à plusieurs études menées en Côte d’Ivoire,

Nigeria, Ouganda et Afrique du Sud, démontre que les pathologies bactériennes, y compris celles dites « non-

classantes SIDA » sont plus fréquentes et plus graves chez les patients infectés par le VIH y compris lorsque le taux

de CD4 est relativement conservé (200-400/mm3. Il ne faut notamment pas négliger les sinusites, les prostatites, les

bactériémies isolées, les pneumonies ou les infections à pyogènes associées au paludisme ou à la tuberculose. Ces

maladies bactériennes sont identifiables dès lors qu’une démarche diagnostique avec prélèvement bactériologiques

est mise en place dans des infrastructures équipées et approvisionnées en matériel et consommables de cultures et

réactifs pour antibiogramme.

Antoine ANDREMONT (Hôpital Bichat, Paris) relate l’augmentation nette des bactéries porteuse de bêta

lactamases à spectre étendu (BLSE) depuis 2004. Malgré les mesures d’hygiène hospitalières, ces bactéries BLSE

colonisent la flore commensale, condition idéale aux échanges génétiques inter-bactériens. Une étude conduite au

Niger en 2012 démontre l’apparition de bactéries BLSE après injection systématique de céphalosporines de

troisième génération aux enfants dénutris accueillis dans des centres de renutrition. Deux études (Guyane et

Sénégal) conduites dans des environnements très isolés avec notamment très peu de contacts avec la population occidentale, révèlent aussi l’apparition et la persistance dans la flore intestinale de bactéries BLSE y compris en

l’absence de pression de sélection récente par antibiotique. Peu de données sont à ce jour disponibles sur les


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interactions entre infection par le VIH et prévalence du portage ou des infections actives liées aux bactéries BLSE

en Afrique sub-saharienne. L’impact écologique des prophylaxies par le cotrimoxazole n’a pas été étudié à

l’échelle populationnelle.

Pierre HENRY (Montpellier) rappelle les principes de la technique Genexpert dans le diagnostic rapide de

la tuberculose: en 2 heures, le bacille peut être confirmé de type tuberculosis, avec présence ou non de résistance à

la rifampicine (celle-ci est reliée dans 90% des cas à celle à l’isoniazide). La sensibilité du test est de 98% et sa

spécificité de 99% lorsque la bacilloscopie est positive dans l’expectoration. Le coût de chaque cartouche (une

cartouche = un test) est de l’ordre de 10 euros. Une calibration informatique annuelle est nécessaire évaluée à 1400

dollars, on espère en abaisser le coût.

Cryptococcose

Aurélie CHABROL (hôpital Avicenne, Bobigny) rappelle que 720 000 cas par an de cryptococcose sont

déclarés en Afrique sub-saharienne et elle y est grevée de 70% de mortalité à 3 mois ; c’est la seconde infection

opportuniste chez les patients infectés par le VIH. En Asie du Sud-Est, 120 000 cas sont déclarés avec une mortalité

estimée à 55% à trois mois. En Europe, 8 300 cas sont déclarés par an grevés de 9% de mortalité à trois mois. Dans

les pays d’Afrique à forte prévalence de VIH, malgré la montée en puissance des HAART (6 millions de patients

ont débuté le traitement depuis le début des années 2000), l’incidence de la cryptococcose ne semble pas diminuer.

Le traitement est scindé en une phase d’induction (Amphotéricine B + 5 Fluoro-Uracile) puis de consolidation

(fluconazole) et enfin de prophylaxie secondaire (fluconazole) jusqu’à restauration immunitaire suffisante. Les

recommandations OMS tiennent compte des difficultés d’accès au 5FU et proposent des alternatives intéressantes

selon les conditions locales de prise en charge. Attention à la moins bonne tolérance hépatique du fluconazole

prescrit à plus de 1200 mg/jour. Il semblerait qu’il y ait peu de résistance primitive au fluconazole. A. Chabrol a

insisté sur le bénéfice de la ponction lombaire évacuatrice, étant donné que plus de 50% des patients avec

cryptococcose présentent une hypertension intra cérébrale. Le moment le plus opportun pour débuter les

antirétroviraux a fait l’objet de nombreux débats car les essais cliniques sont rares et contradictoires. Une attention

particulière doit être portée sur les interactions entre la névirapine et le fluconazole, contre indiquant cette dernière

association. La technique LFA de diagnostic rapide de l’antigène cryptocoque à moindre coût a une sensibilité

supérieure à 95% et une concordance avec le test Elisa de 92%. Elle offre un dépistage dans le LCR des sujets

asymptomatiques, ayant moins de 100 CD4). Le traitement ainsi préemptif permet de réduire la mortalité chez les

patients fortement immunodéprimés.

Serge EHOLIE (CHU de Treichville, Abidjan) a présenté une revue de la littérature sur les syndromes de

restauration immunitaire (IRIS) en Afrique, et notamment dans le cas des cryptococcoses méningées : L’incidence

des IRIS est estimée à 20% des cas traités sous ARVs. Son pronostic peut être très sévère. Les recommandations en

vigueur suggèrent de retarder la mise en route des ARVs à plus de 4 semaines après le début du traitement de la

cryptococcose, en cas de méningo-encéphalite, de traitement antifongique suboptimal selon les normes OMS, de

pression intracrânienne supérieure à 200 mm Hg, d’impossibilité d’évaluer la clairance de l’antigène cryptocoque,

d’un taux d’antigène cryptocoque dans le LCR initial supérieur ou égal à 1/4000 et peut être d’un taux de CD4

supérieur ou égal à 100/mm3. Dans le cas inverse, le début des ARVs pourrait se faire dès deux semaines après

celui du traitement antifongique.

Compte rendu du Dr Pauline CAMPA, Maladies Infectieuses et Tropicales, Hôpital St Antoine, Paris


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MEMENTO THERAPEUTIQUE : ANTIBIOTHERAPIE EN AFRIQUE

SUBSAHARIENNE Promoteur : IMEA

Coordonnateurs : Prs Pierre Marie Girard, Serge Eholié Partenaires : Prs Adèle Kacou-Ndouba, Emmanuel Bissagnéné, Serge Paul Eholié, Université d’Abidjan, Côte d’Ivoire.

Prs Aminata Gassana Sow, Bernard Marcel Diop, Université Cheick Anta Diop de Dakar, Sénégal.

Pr Pierre Marie Girard, Université P et M Curie, Paris, Prs Anne Claude Crémieux, Olivier Bouchaud,

Université Sorbonne Paris Cité.

Financement : IMEA, SAPI, GSK

Section analytique : 7212 PMGmba

Objectifs Améliorer le diagnostic et la prise en charge des affections bactériennes, rappeler les bonnes pratiques d’usage des antibiotiques dans la prise en charge thérapeutique et la prévention des pathologies bactériennes par le

moyen d’un Mémento thérapeutique adapté aux conditions locales de travail.

Programme 2012 1) Recenser et rapporter toutes les recommandations consensuelles formulées en Afrique subsaharienne en

matière d’antibiothérapie

2) Décrire les différentes antibiotiques disponibles en Afrique subsaharienne (spécialités, génériques); 3) Présenter les différentes stratégies diagnostiques et thérapeutiques utilisées dans le traitement des

affections bactériennes en zone tropicale africaine.

Cibles : médecins cliniciens, pharmaciens, biologistes, internes des hôpitaux, chercheurs et infirmiers. Moyens de diffusion : l’IMEA, la SAPI, et le réseau des laboratoires Glaxo-Smith-Kline

L’actualisation de l’ouvrage se fera tous les deux ans,

Calendrier : 2011-12

Préface de l’ouvrage :

Les infections bactériennes constituent l’une des principales causes de morbi-mortalité en Afrique sub-

saharienne. Elles sont en partie liées aux conditions d’hygiène alimentaire, hydrique, corporelle, à la paupérisation des populations et au climat tropical qui favorisent l’émergence d’endémies et d’épidémies

bactériennes.

Le bon usage des antibiotiques est un objectif essentiel dans la pratique quotidienne des médecins, infirmiers

et sages-femmes. Une antibiothérapie de qualité est un gage de succès thérapeutique.. Elle est aussi indispensable au maintien

de l’efficacité des antibiotiques dont disposent les praticiens, problème d’autant plus crucial dans les pays à

revenus faibles où l’offre thérapeutique est limitée. Depuis l’initiative de Bamako, l’accès aux antibiotiques a été facilité, mais au prix d’un relâchement du

contrôle de leur prescription. La surconsommation d’antibiotiques accroît la pression de sélection sur

l’environnement microbien, avec pour conséquence une augmentation exponentielle de la résistance

bactérienne aux antibiotiques tant en milieu hospitalier que dans la communauté. Bien prescrire un antibiotique n’est pas simple. De nombreux paramètres doivent guider le choix du

traitement : écologie bactérienne locale, localisation de l’infection, contre-indications et tolérance du

traitement, connaissance et habitudes du prescripteur. Les stratégies de bon usage des antibiotiques imposent la formation des prescripteurs, mais aussi l’évaluation des pratiques et le contrôle de certaines prescriptions.

Le Mémento du bon usage des antibiotiques en Afrique sub-saharienne a bénéficié de la riche expérience de

l’ouvrage collectif Du bon usage des Antibiotiques dont la cinquième édition destinée aux médecins français a été publiée en 2012 sous la coordination d’Anne-Claude Crémieux. Nous remercions tout particulièrement

son comité de rédaction qui a été enthousiaste à l’idée de préparer une version dédiée aux pays d’Afrique ainsi

qu’aux experts qui ont bien voulu relire le manuscrit. Olivier Bouchaud, Pierre de Truchis et Jérôme

Pacanowski ont tout particulièrement contribué à l’actualisation des données.


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Ce mémento a l’ambition de contribuer au renforcement des compétences des prestataires de soins en

antibiothérapie quels que soient leurs modalités d’exercice et leur environnement médico-technique. Nous avons souhaité couvrir un large éventail d’indications mais tous les sujets n’ont pu être traités et nous sommes

conscients que nous ne pourrons pas satisfaire l’ensemble des attentes.

Après un rappel des présentations cliniques, des critères diagnostiques et des enjeux de la résistance, l’accent

est mis pour chacune des pathologies sur la prise en charge thérapeutique des infections bactériennes communautaires et nosocomiales.

« Tout le monde se veut prescripteur d’antibiotiques, tout prestataire de soins devrait être bon prescripteur

d'antibiotiques". Puisse cet ouvrage être utile dans votre pratique quotidienne.

Serge-Paul Eholié – Abidjan, Côte d’Ivoire Emmauel Bissagnéné – Abidjan, Côte d’Ivoire

Anne-Claude Crémieux – Paris, France

Pierre Marie Girard – Paris, France


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DEPARTEMENT DE RECHERCHE CLINIQUE


Responsable : Dr Roland LANDMAN Coordonnateurs : Mme Aïda BENALYCHERIF/Mme Karine AMAT/M. Babacar SYLLA

L’équipe a pour mission de mettre en place des essais thérapeutiques en France et en Afrique en partenariat

avec les institutions type ANRS, NIH, industrie pharmaceutique, Sidaction et des projets de recherche propres à l’IMEA.

Elle assure un rôle de promotion et d’organisation des projets.

La coordination intervient alors à plusieurs niveaux, à savoir :

- finalisation de la rédaction du protocole,

- budgétisation,

- création des cahiers de suivis patients,

- prise de contact avec les centres investigateurs potentiels (directeurs des hôpitaux et investigateurs),

- procédures administratives (CCP, CNIL, ANSM, CCTIR, CNOM …),

- intervention du chef de projet pour le financement et la rédaction des contrats avec les partenaires,

- mise en place des essais dans les différents centres investigateurs,

- organisation de réunions d’investigateurs, rédaction de newsletters,

- monitoring, échanges réguliers avec les investigateurs durant l’essai,

- analyse des résultats,

- articulation avec les différents intervenants de l’essai (cliniciens, pharmacologues, virologues,

méthodologistes, etc.)

Par ailleurs, les acteurs de la recherche clinique sont amenés à présenter les essais et les résultats dans des

articles, posters et communications orales lors de différents congrès ou conférences internationaux et nationaux. Nous apportons une aide à la rédaction et à la soumission des résultats.


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RECHERCHE CLINIQUE : ESSAIS EN COURS

ESSAI DAYANA (AFRIQUE)

Promoteur : ANRS

Investigateurs : Dr Roland Landman, Pr. Sinata Koulla-Shiro, Pr. Papa Salif Sow IMEA, Hôp. Bichat, Paris, Hôpital Central – Service des Maladies Infectieuses – BP 81 – Yaoundé –

Cameroun, Centre hospitalier de Fann – Service des Maladies Infectieuses – BP 5035 Dakar – Sénégal.

Financement : ANRS, Abbott

Section analytique : 7434/36/37LANmba

Objectif Pharmacologie des antirétroviraux- exposition au tenofovir et diminution de la clairance de la créatinine.

Recueil des données de Pk et de la créatinémie à S4 et S48 des patients recevant du tenofovir dans l’essai DAYANA

L’analyse des dosages des antirétroviraux a confirmé de la bonne observance des patients aux différentes

études. L’exposition au tenofovir est corrélé à une baisse de la clairance de la créatinine en particulier en cas d’association avec le lopinavir. Ces données ont été présentées lors du CS en mai 2012 à Dakar et a été

accepté aux conférences INTEREST 2013 (Dakar-Sénégal) et IAS 2013(Kuala-Lampur -Malaisie)



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ESSAI DREAM (FRANCE)

Promoteur : ANRS

Investigateur coordonnateur : Dr Jean-Luc Meynard- Hôpital St Antoine-SMIT- Paris responsable scientifique : Dr Roland Landman

Financement : ANRS, Abbott

Section analytique : 1082/83LANmba

Objectif Comparer l’efficacité propre de deux stratégies thérapeutiques de maintenance sur une durée de 2 ans : une monothérapie par lopinavir/ritonavir ou une trithérapie fixée par éfavirenz/emtricitabine/ténofovir chez des

patients infectés par le VIH-1 dont la mesure d’ARN VIH-1 plasmatique est inférieure à 50 copies/mL.

• Objectifs secondaires : 1) Comparer les deux groupes de S00 à S96 sur :

- la réponse virologique et sa durabilité à un seuil de 50 et de 400 cp/mL

- l’évolution des lymphocytes T CD4+ - la tolérance clinique et biologique

- survenue d’un ARN VIH-1 plasmatique ≥ 400 cp/mL confirmé sur 2 mesures et de mutations de résistance

du VIH-1 en cas d’ARN VIH-1 ≥ 400 cp/mL confirmé sur 2 mesures - la proportion de patients présentant un syndrome lipodystrophique ou un syndrome métabolique

- l’observance mesurée par auto-questionnaire

- l’évolution de la qualité de vie

- la prévalence des déficits cognitifs légers et des troubles cognitifs modérés - le coût des traitements et de la surveillance

2) Etudier les déterminants de la durabilité de la réponse virologique en fonction des principales

caractéristiques immuno-virologiques avant l’instauration du premier traitement antirétroviral et au moment de l’instauration du traitement de l’essai

3) Etudier les relations entre pharmacocinétique et pharmacodynamie et/ou pharmacogénétique en fonction

des résultats de l’essai (fera l’objet de sous-études éventuelles)

• Traitements de l’essai :

Groupe lopinavir/r : Lopinavir/ritonavir à la posologie de 800/200 mg/jour, soit 4 comprimés en 2 prises par

jour, par voie orale, pendant 98 semaines

Groupe EFV/FTC/TDF : éfavirenz/emtricitabine/ténofovir à la posologie de 600/200/245 mg/jour respectivement, soit 1 comprimé en 1 prise par jour, par voie orale, pendant 98 semaines

• Taille prévue de l’essai :

420 patients, soit 210 dans chaque groupe Les ouvertures de centres ont commencé en septembre 2009 et se sont se poursuivie en 2010. 42 centres sont actuellement ouverts. La première inclusion a eu lieu le 12

novembre 2009 et la dernière le 30 juin 2011. A ce jour, 225 patients ont été pré-inclus et 197 inclus dans 35

centres actifs.

Calendrier : 2009-13 Le recueil des données est en cours et le dernier suivi patient devrait durer jusqu’en juillet 2013.

Le gel de la base est programmé pour le troisième trimestre 2013.

La fermeture des centres se fera à partir du mois de septembre 2013.


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ESSAI DYNA M-O (AFRIQUE)

Titre : Diversité moléculaire de VIH-1 gr-O et prise en charge thérapeutique au Cameroun

Promoteur : ANRS

Investigateurs coordinateurs: Pr Jean-Christophe Plantier, CHU Rouen, Dr Charles Kouanfack, Hôp Central Yaoundé.

Financement : ANRS

Section analytique : 1429PLAmba

Objectifs de la recherche

L’objectif principal de l’étude est de comparer sur une période de 24 mois les réponses cliniques, virologiques

et immunologiques à un traitement par Duovir® (AZT+3TC génériques) + Aluvia® (LOPINAVIR + RITONAVIR thermorésistant) de patients naïfs de tout traitement antirétroviral infectés par un VIH-O et

appariés sur la classe d’âge, de CD4, le sexe, le taux d’hémoglobine et le statut VHB à des patients naïfs

infectés par un VIH-M. Pour les sujets anémiés (taux d’hémoglobine < 8 g/l) et pour les sujets co-infectés HIV-HBV, l’AZT est remplacée par le TDF.

Les objectifs secondaires sont de caractériser les réponses au traitement des souches VIH-O en

fonction de leurs positions phylogénétiques et de leurs profils de résistance naturelle avant traitement et de comparer les cinétiques d’apparition des résistances lors du traitement entre VIH-O et VIH-M.

Etat d’avancement du projet

Au total 56 pré-inclusions ont été réalisées. 22 patients VIH-O et 34 patients VIH-M appariés sont pris en

charge par cet essai clinique à ce jour. Parmi les 94 patients saisis dans la base le 3 décembre 2012, la

médiane des CD4 à l’inclusion étaient de 227 (147-289)/mm3 chez les 33 patients infectés par un VIH-O et

202 (151-267)/mm3 chez les 61 patients infectés par un VIH-M. La médiane de CV à l’inclusion était de

4,2 (3,7-4,6) Log copies/mL chez les patients VIH-O et de 5,1 (4,8-5,8) Log copies/mL chez les patients

VIH-M. La charge virale était indétectable pour 52 des 58 patients (90%) suivis à M6, pour 47 des 51 (92%) à M9, 100% des 35 patients suivis à M15 et pour 11 patients sur 13 (85%) à M24.

Perspectives

Étudier l’évolution à long terme sous traitement des patients VIH-1 groupe O.

Valeurs ajoutées

Permettre d’établir des recommandations concernant la prise en charge des patients infectés par un VIH-1

groupe O dans le cadre de la PTME et de la mise en place de techniques de dépistage approprié pour les

nouveaux- nés.



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ETUDE ORIVAO (FRANCE)

Titre : Réponse Immuno-virologique aux antirétroviraux des patients infectés par un VIH-O

L’infection à VIH-O est essentiellement retrouvée au Cameroun, où elle représente actuellement 1% des infections à VIH. Du fait de la rareté des données cliniques, l'histoire naturelle des infections par VIH-O et

leur prise en charge thérapeutique restent largement méconnues. De même, aucun algorithme d’interprétation

génotypique de résistance n’est élaboré spécifiquement pour ces variants.

Promoteur : CHU de Rouen

Investigateur-coordinateur: Pr Jean-Christophe Plantier, lab. de Virologie, lab. associé au CNR du VIH, CHU de Rouen

Financement : Sidaction

Section analytique : 1435/36PLAmba

Objectifs de la recherche

L'objectif principal du projet est de mesurer la réponse immuno-virologique et la durée du

succès thérapeutique, chez tous les patients infectés par le VIH-O identifiés en France. Les objectifs secondaires sont de décrire les mutations de résistance sélectionnées lors de l'échec et d’analyser

la réponse virologique en fonction de la diversité génétique des variants.

Méthodologie

Il s’agit d’une étude observationnelle non comparative multicentrique, comprenant 50 centres situés sur tout le

territoire français avec inclusion de 100 patients.

Suivi, traitement et recueil des données

La prise en charge s'effectue selon les recommandations habituelles définies pour l'infection à VIH. Un cahier

d’inclusion et un cahier de suivi sont attribués à chaque patient. Cela concerne les données de charge virale (quantification de la réplication virale), de CD4 et les informations thérapeutiques et cliniques.

Analyses virologiques et méthodes utilisées

Le diagnostic de l'infection à VIH-O est réalisé par sérotypage. Il est ensuite confirmé par biologie moleculaire, c’est-à-dire amplification et séquençage nucléotidique du génome viral (régions Gag, Pol ou

Env) suivis d’une analyse phylogénétique.

Le suivi virologique par charge virale est réalisé selon les recommandations nationales, par une technique

spécifique mise au point par le laboratoire de Rouen. Enfin, un séquençage et une analyse des mutations de résistance avant traitement (confirmation moléculaire et

état mutationnel de base) et lors de l'échec sont effectués pour

chaque patient.

Analyse statistique

Il s’agit d’une étude observationnelle non comparative. Sont évalués le pourcentage de patients en échec

virologique à différents temps depuis l’initiation du traitement ainsi que l’évolution du génotype viral en cas d’échec virologique.

Etat d’avancement du projet

Notre analyse rétro-prospective a permis de confirmer l’infection pour 121 patients infectés par un VIH-O

depuis 1992. Nous avons confirmé ce statut VIH-O par séquençage moléculaire et analyse phylogénétique. La

population était composée de 82 femmes (68%) et 39 hommes (32%), avec un âge médian à l’inclusion de 45 ans (18-71 ans). Au total, 112 patients sont ou ont été traités par ARV et 9 n’ont jamais reçu de traitement.

Réponse virologique des patients infectés par un VIH-O

Parmi les 112 patients traités, 54 (48%) ont reçu au moins une ligne de traitement ARV qui était correctement documentée, 8 patients sont décédés durant leur suivi et 50 (45%) ont été

exclus pour « perte de suivi ». L’analyse actuelle des données porte uniquement sur les premières lignes de

traitement : celles-ci ont pu être correctement évaluées pour 43 patients.


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A l’initiation des premières lignes, la charge virale médiane était de 4,1 log copies/mL (2,75 à 6,04) et la

médiane des CD4, disponible pour 34 patients, de 199/mm3 (6 à 1096). A 34 mois de l’initiation, 28 patients (65%) présentaient un succès virologique (indétectabilité de la charge virale).

Concernant le suivi de ces patients, 16 sur 43 (37%) n’ont pas changé de ligne, avec une durée médiane de

traitement de 4 ans (3 mois à 7 ans), 21 (49%) ont initié une seconde ligne et 4 (14%) ont été perdus de vue

après la première ligne. Statut virologique et thérapeutique des patients infectés par un VIH-O suivis actuellement

Un suivi précis était disponible pour 39 patients. La durée médiane de suivi de ces patients était de 7 ans (3

mois à 16 ans). Le traitement de ces patients en 2009 avait été initié entre 2002 et 2006 pour 18 patients (46%) et entre 2007 et 2009 pour 21 (54%). En outre, ils recevaient pour 36% d’entre eux (n=14) une première ligne,

pour 21% (n=8) une seconde ligne et pour 43% (n=17) une troisième ligne ou une ligne ultérieure, et tous sauf

un étaient en succès virologique (97%). Ces résultats ont été soumis pour communication affichée à l’ICAAC 2012.

Perspectives

Les perspectives correspondent au recueil exhaustif de tous les traitements et résultats biologiques pour chaque patient quel que soit le site, et quel que soit le nombre de lignes utilisées, afin de pouvoir :

- juger de l'efficacité des différentes lignes de traitement utilisées,

- analyser la réponse en fonction des molécules utilisées, - analyser la réponse virologique en fonction de l'année d'instauration du traitement,

- évaluer l’impact du polymorphisme observé des VIH-O sur les traitements ARV.



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ESSAI DATA (FRANCE)

Titre : Etude multicentrique, randomisée, en ouvert, phase IV, évaluant à 48 semaines : l’efficacité et la tolérance de

l’atazanavir/ritonavir ou du darunavir/ritonavir en combinaison avec l’association fixe de deux analogues de la

transcriptase inverse ; ténofovir-emtricitabine chez des patients infectés par le VIH ayant des CD4 inférieurs à 200

cellules/µL et naïfs de traitement antirétroviral

Promoteur : IMEA

Investigateurs coordonnateurs Dr Laurence Slama, Dr Roland Landman Hôpital TENON, Maladies Infectieuses et Tropicales, 4, rue de la Chine 75020 PARIS

IMEA, C.H.U. Bichat – Claude Bernard - 46 rue Henri Huchard 75018 PARIS

Financement : BMS

Section analytique : 1083LANsas

Objectif Evaluer, chez des patients infectés par le VIH-1 ayant un taux de CD4 < 200/µL et naïfs de traitement

antirétroviral, l’efficacité virologique définie comme une charge virale VIH-1<50 copies/ml à 48 sem. et la tolérance de deux combinaisons d’antirétroviraux comportant atazanavir/r (ATZ/r, 300/100 mg) ou darunavir

/r (DRV/r, 800/100 mg) en une prise par jour en association fixe de deux analogues nucléosi(ti)diques de la

transcriptase inverse.

Principaux objectifs secondaires : - Evaluer 1) la proportion de patients ayant une charge virale inférieure à 50 copies/ml à S24 ; 2) la proportion

de patients en échec virologique, l’échec étant défini par une charge virale supérieure à 50 copies/ml,

confirmée par un deuxième prélèvement espacé d’au moins quatorze jours à compter de S24 de traitement. Evaluer la réponse immunologique par une mesure standard du taux de lymphocyte CD4, différentiation et

activation des lymphocytes à S-4, S2, S4, S12, S24 et S48 ; 3) les concentrations plasmatiques résiduelles

(Cmin) des ARVs à S4, S24 et S48 ; 4) les concentrations des antirétroviraux dans le liquide séminal à S4 et

S48, évaluer les paramètres glucido-lipidiques ; 5) la tolérance clinique et biologique de chaque bras de traitement ; 6) l’observance aux traitements à S2, S24 et S48.

- Quantifier la charge virale VIH dans le liquide séminal à S0, S4 et S48

- Décrire 1) la corrélation entre Cmin d’ATV et DRV et la réponse virologique dans le plasma et le liquide séminal à S4 et S48; 2) les comportements sexuels (sous étude comportementale) à S0, S24 et S48.

Déterminer les fractions libres et totales de l’ATV et du DRV dans le plasma et dans le liquide séminal

- Comparer la diffusion des analogues nucléos(t)idiques dans le liquide séminal. - Etudier la relation entre l’évolution de la bilirubinémie et les Cmin plasmatiques d’ATV.

Traitements de l’essai :

Groupe 1 : ATV + TDF/FTC (ou Abacavir/Lamivudine, [ABC/3TC], en cas de contre indication au

TDF/FTC) l’atazanavir/ritonavir à la posologie de 300/100mg/jour et TDF/FTC à la posologie de 245 /200 mg jour, soit 3 comprimés en une prise par jour, par voie orale pendant 48 semaines au cours d’un repas

Groupe 2 : DRV+ TDF/FTC (ou ABC/3TC en cas de contre indication au TDF/FTC)

darunavir/ritonavir à la posologie de 800/100mg/jour et TDF/FTC à la posologie de 245 /200 mg jour, soit 4

comprimés en une prise par jour, par voie orale pendant 48 semaines au cours d’un repas

Critère principal de jugement

Proportion de patients ayant une charge virale VIH-1 inférieure à 50 copies/ml à la semaine 48 de traitement.

Nombre de sujets attendus : 120 patient

Les inclusions de patients dans l’essai DATA ont débuté fin mars 2011. Nous avons sollicité 32 centres à

participer à cette étude. En date du 7 janvier 2013 (date de fermeture des inclusions), 120 patients étaient inclus dans l’étude principale et 12 patients dans la sous-étude sperme. La sous-étude immuno a inclus la

totalité des patients attendus soit 31 patients. Le dernier conseil scientifique (CS n°4) a eu lieu le 30 janvier

2013. Le recueil des données est en cours et le dernier suivi du patient est prévu le 07 janvier 2014. Le prochain conseil scientifique (CS n°5) est fixé pour le 9 juillet 2013.



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Essai OLE (Europe)

Titre : essai clinique contrôlé, ouvert et randomisé de 48 semaines comparant la tolérance et la durabilité de la

suppression virologique chez des patients infectés par le VIH sous trithérapie par LPV/r, 3TC ou FTC et un INTI,

randomisés dans l’un des groupes suivants : Poursuite du traitement par LPV/r + 3TC/FTC + INTI ou simplification par

une bithérapie LPV/r + 3TC.

Promoteur: FCRB, Barcelone, Esp Fundació Clínic per a la Recerca Biomèdica – CIF : G59319681 - C/ Villarroel, 170 -Barcelone 08036

Investigateurs Principaux: Dr. Josep Maria Gatell Artigas – Hospital Clínic de Barcelone

Dr. José Ramón Arribas – Hospital Universitário La Paz

Investigateur-coordinateur France : Karine Amat/ Dr. Roland Landman

Financement : Abbott

Section analytique : 1084LANsas

Objectif Objectif principal : démontrer que l’efficacité clinique de la bithérapie est non inférieure à celle du bras de

contrôle (trithérapie) dans le cadre d’un traitement de 48 semaines chez des patients infectés par le VIH ayant

une charge virale (ARN VIH) inférieure aux seuils de détection (toujours <50 copies/ml). Deuxième objectif : démontrer que l’activité antivirale de la bithérapie est non inférieure à celle du bras de

contrôle (trithérapie) après 48 semaines de traitement.

Troisième objectif : démontrer que la tolérance et la sécurité de la bithérapie sont supérieures à celles du bras

de contrôle.

Schéma et durée de l’étude

Essai clinique randomisé, multicentrique, international, de phase III, prospectif, avec administration aléatoire,

sans insu sur le traitement, en deux groupes parallèles. La phase de traitement sera de 48 semaines.

La durée totale de l’étude sera d’environ 72 semaines. La phase d’inclusion sera de 24 semaines et celle de suivi, de 48 semaines.

Population à l’étude et nombre total de patients

L’étude sera menée chez des patients infectés par le VIH-1 en situation de suppression virologique.

Elle inclura 336 patients au total (dont 50 patients en France), soit 168 par groupe de traitement.

Critère de jugement principal

Proportion de patients sans échec thérapeutique à 48 semaines, défini par deux mesures consécutives de la

charge virale >50 copies/ml à au moins 2 semaines d’intervalle, décès du patient, développement d’une

nouvelle maladie caractéristique du SIDA, patient perdu de vue ou changement/interruption définitive de l’un des traitements antirétroviraux à l'étude.


Déroulement de l'étude

Au total, 336 patients infectés par le VIH-1 sous HAART (highly active antiretroviral therapy, traitement

antirétroviral hautement actif) par lopinavir/ritonavir, emtricitabine (FTC) ou lamivudine (3TC) et un INTI

pendant au moins les 2 mois précédant leur randomisation dans la présente étude, ayant une charge virale de <50 copies/ml pendant au moins les 6 derniers mois, seront inclus dans l’étude. Les patients éligibles seront

répartis de manière aléatoire (1:1) dans l’un des bras suivants :1.- poursuite du traitement en cours ; 2.-

simplification par une bithérapie associant LPV/r + 3TC. La phase de traitement sera de 48 semaines. Les patients devront se rendre aux visites de pré-inclusion et de randomisation, ainsi qu’aux visites des

semaines 4,12, 24, 36 et 48, pour effectuer les contrôles et tests indiqués dans le calendrier de l’étude

En France, 11 centres ont été ouverts et ont été actifs, 37 patients ont été randomisés dans l’essai. La fin des inclusions a été prolongée au 28 février 2013. Au total, 250 patients ont été randomisés entre

l’Espagne et la France. La fin du suivi du dernier patient inclus est prévue pour le mois de mars 2014.


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ESSAI CESAR (FRANCE)

Titre : Essai pilote ouvert multicentrique de l’effet, chez des patients infectés par le VIH sous traitement antirétroviral

efficace CESAR (Crestor En Sus des AntiRétroviraux),

Promoteur : IMEA

Investigateurs : Pr Laurence Weiss/ Pr Pierre Marie Girard

Coordination méthodologique : Pr D Costagliolla Unité INSERM U943 et UMPC Paris Univ 06,


Section analytique : 1084LANmba

Objectif Objectif principal : Essai pilote ouvert multicentrique de l’effet, chez des patients infectés par le VIH sous traitement

antirétroviral efficace CESAR (Crestor En Sus des AntiRétroviraux), de l’administration de Rosuvastatine à

la dose de 20 mg/jour durant 3 mois puis suivis 3 mois supplémentaires après arrêt de la Rosuvastatine sur

l’activation lymphocytaire T CD8 mesurée par la proportion de lymphocytes T CD8 qui co-expriment les marqueurs d’activation CD38 et HLA-DR.

Objectifs secondaires :

Evaluer l’effet de l’administration de Rosuvastatine sur l’activation lymphocytaire résiduelle T CD4 et T CD8 Evaluer l’effet de l’administration de Rosuvastatine sur les principaux biomarqueurs solubles (CRP US, D-

dimères, IL-6 et CD14s) et subcellulaires (microparticules (MP) totales, leucocytaires, plaquettaires et

endothéliales) d’activation des cellules du système immunitaire ou des cellules endothéliales

Evaluer l’effet de l’administration de Rosuvastatine sur l’évolution des marqueurs de sénescence (prélamine A, p53, p21

WAF-1, p16

INK-4)

Evaluer l’effet de l’administration de Rosuvastatine sur le chiffre de lymphocytes CD4 par mm3 et sur le

rapport CD4/CD8 Etudier la relation entre activation du système immunitaire (marqueurs cellulaires et solubles) et réplication

résiduelle (ARN-VIH plasmatique ultrasensible)

Evaluer l’effet de l’administration de Rosuvastatine sur les paramètres lipidiques et la corrélation entre le taux de HDL cholestérol et le rapport CD4/CD8

Evaluer la tolérance de la Rosuvastatine à la dose de 20 mg/jour

Nombre de patients

L’inclusion de 40 patients est prévue.

La durée d'inclusion sera de 6 mois.

La durée de participation à l’étude est de 6 mois, le critère principal de jugement étant évalué à 3 mois.


Deux centres investigateurs (HEGP et St Antoine) participent à cet essai, les ouvertures des centres ont lieu en

mars 2012. La première inclusion a eu lieu le 04 avril 2012, la date théorique de fin des inclusions était le 03

avril 2013. Au 15 mars 2013, 65 patients ont été pré-inclus et 47 patients sont inclus.


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COHORTE POST-KALESOLO (FRANCE)

Titre : Etude ancillaire sur cohorte observationnelle prospective de suivi prolongé à 96 semaines des patients inclus

dans l’essai KALESOLO

Promoteur : IMEA

Investigateur coordonnateur : Dr. Jean-Luc Meynard


Section analytique : 1081LANmba

Objectif. 158 patients ont été suivis dans cette cohorte (soit près de 85% des patients inclus dans Kalesolo). Le suivi post-essai des patients s’est déroulé de janvier 2007 à décembre 2008.

Il a été décidé de faire une analyse supplémentaire de l’ADN proviral ainsi que sur les marqueurs de

l’inflammation sur tous les patients.

Pour ce faire une demande de réaffectation des fonds a été faite auprès du financeur du projet (Sidaction).

Tous les échantillons de l’étude principale Kalesolo et une partie de celle de la cohorte ont été rapatriés dans

le laboratoire du Pr Izopet (Toulouse) qui est en charge de cette analyse.

Calendrier: 2012-13


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ESSAI MATTHIS (FRANCE)

Parmi les personnes infectées par le VIH les patients transgenres représentent une population particulière et

complexe avec une prise en charge difficile. Leurs spécificités proviennent à la fois de leur origine géographique, d’un parcours de transition sexuelle sans encadrement médical et d’une situation sociale

complexe du fait de leur marginalisation. Il est justifié de mieux comprendre ces spécificités afin de pouvoir

mieux dépister leurs conséquences, mieux informer les patients et ainsi améliorer leur prise en charge. La Haute Autorité de Santé (HAS) souligne un manque de connaissance dans ce domaine et la nécessité de

renforcer la recherche. Elle insiste sur la forte prédominance de l’infection par le VIH au sein de la population

transgenre et le peu de connaissance disponible sur l’association des antirétroviraux et des hormones

oestroprogestatives.

Titre : Approfondir certaines connaissances au sein de la population transgenre infectée par le VIH suivie à l’Hôpital

Bichat, qui représente environ 150 patients.

Promoteur : IMEA Le démarrage de cette étude a pris du retard, compte tenu des différentes remarques soulignées par les

autorités de santé. Les avis favorables de l’ANSM et du CPP de St Germain en Laye ont été obtenus le 29

novembre et le 17 décembre 2012 respectivement.

Investigateur coordonnateur Dr David Pommier, SMIT, Pr Patrick Yeni, Hopital Bichat Méthodologie : Dr Cédric Laouénan, Service de Biostatistiques, Hôpital Bichat - Université Paris Diderot INSERM UMR-S 738 Gestion et Monitorage : Mme Sylvie Legac, SMIT, Hôpital Bichat

Financement : autofinancement

Section analytique : 1YENmba

Objectif principal Mesurer la fréquence du syndrome métabolique au sein d’une population de patients transgenres infectés par

le VIH-1 suivie à l’Hôpital Bichat et la comparer à une population témoin infectée par le VIH-1 suivie dans le

même service.

Objectifs secondaires

Mesurer les fréquences des troubles hormonaux (hypothyroïdies frustes et dysfonctionnements cortico-

surrénaliens) au sein de la population transgenre infectée par le VIH-1 et comparer ces fréquences à une

population témoin masculine non transgenre infectée par le VIH-1, suivie dans le même service. Mesurer la fréquence des hyperprolactinémies au sein de la population transgenre infectée par le VIH-1.

Mesurer la fréquence de l’infection tuberculeuse latente au sein de la population transgenre infectée par le

VIH-1 de l’Hôpital Bichat.

Décrire les concentrations des hormones oestroprogestatives et des antirétroviraux chez les patients transgenres infectés par le VIH-1.

Méthodes

Étude monocentrique cas-témoin comparant les patients transgenres de sexe biologique masculin infectés par

le VIH-1 suivi au SMIT de l’Hôpital Bichat à des patients non transgenres masculins suivis dans le même service qui seront appareillés sur l’âge et le type de traitement antirétroviral.

Populations étudiées et critères d’inclusion

Population transgenre

L’ensemble de la population transgenre infectée par le VIH-1 suivie dans le SMIT à l’Hôpital Bichat pourra être incluse. Nous appelons transgenre toute personne dont l’identité de genre l’expression et/ou le

comportement sont en inadéquation avec leur sexe biologique d’origine. Cette population a déjà été recensée

par les médecins qui s’en occupent, elle compte environ 150 patients et il s’agit exclusivement de patients transgenres masculins-féminins. L’objectif est d’inclure deux tiers de la population soit 100 patients.

Les critères d’inclusions sont les suivants :

- Avoir plus de 18 ans - Être de sexe biologique masculin


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- Être infecté par le VIH-1

- Avoir déjà pris des hormones oestroprogestatives (ou anti androgènes), et/ou réalisé des interventions chirurgicales esthétiques dans le but de se rapprocher physiquement du sexe

opposé au sexe biologique de naissance

- Avoir donné son accord en signant le formulaire consentement.

Les critères de non inclusions sont les suivants :

- Hypersensibilité à l’un des constituants du Synacthene®

- Troubles de la coagulation en cas d’injections intra musculaires

Population témoin :

Ensemble de la population masculine non transgenre infectée par le VIH-1 suivie au SMIT de l’Hôpital Bichat

qui se présentera au service des prélèvements pour son suivi pour l’infection par le VIH-1 pendant la durée

d’inclusion des patients transgenres. L’objectif est d’inclure 2 témoins pour 1 cas soit 200 patients qui seront appareillés sur l’âge et sur le schéma de traitement antirétroviral (aucun traitement, avec ou sans inhibiteur de

protéase [IP]).

Les critères d’inclusions sont les suivants :

- Avoir plus de 18 ans

- Être de sexe biologique masculin

- Être infecté par le VIH-1 - Avoir donné votre son accord en signant le formulaire consentement.

- Etre affilié à un régime de sécurité social

Les critères de non inclusions sont les suivants :

- Hypersensibilité à l’un des constituants du Synacthene®

- Troubles de la coagulation en cas d’injections intra musculaires

Calendrier prévisionnel : 2012-13 Le premier patient était inclus le 19 mars 2013 avec 4 cas témoins et 11 cas transgenre. La date théorique de la

fin des inclusions est prévue pour septembre 2013.


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ETUDE OPTISCREEN B (FRANCE)

Titre : L’application d’algorithmes de décision et l’utilisation de tests rapides permettent-elles d’optimiser le dépistage

et la prévention de l’hépatite B ?

Promoteur : ANRS

Investigateur Dr Julie Bottero Inserm UMR-S707, Paris, France, SMIT, Hôpital Saint-Antoine, Paris, France. Responsable scientifique Dr

Karine Lacombe, Hôpital Saint-Antoine, Paris, France. Chef de Projet Hayette Rougier

Financement : ANRS

Section analytique : 1031LACmba Objectif

Documenter l’intérêt de l’utilisation d’algorithmes de dépistage et de tests rapides pour optimiser le

diagnostic, la prise en charge et la prévention de l’hépatite B. Objectifs secondaires : 1) évaluation de l’état clinique des patients dépistés porteurs chroniques de l’hépatite B,

2) évaluation de la couverture vaccinale des patients non immunisés contre l’hépatite B,

3) évaluation du statut virologique et clinique des personnes porteuses d’un anticorps anti-HBc isolé,

4) évaluation médico-économique des stratégies de dépistage de l’hépatite B.

Résultats de l’étude

a. Inclusions/ recueil de données

Au total 4000 patients on été inclus de fin sept. 2010 à fin août 2011 pendant la phase I et 1000 (500 par bras)

de fin fév. 2012 à début juil. 2012 pendant la phase II. L’ensemble des données ont été recueillies.

b. Description de la population d’étude vis-à-vis du statut VHB

Parmi les 4000 personnes incluses, 85 personnes (2.1%) étaient infectées par l’hépatite B soit 3 fois plus que

la prévalence nationale (0.65%), 514 personnes (12.8%) étaient guéries d’une hépatite B antérieure et 128 (3.3%) présentaient des anticorps anti-HBc isolés. Au total 730 patients soit 18.2% des patients inclus dans

l’étude ont donc été exposés au VHB. En outre, 1694 personnes (42.3%) étaient vaccinées et 1470 personnes

(36.7%) étaient non immunisées. Parmi les 85 personnes dépistées positives en Ag HBs, la majorité était

originaire de pays de forte endémie et/ou en situation de précarité sociale. En outre 13% d’entre elles avaient une indication à un traitement antiviral.

c. Analyse des pratiques de dépistage

Seuls 198 patients (5.0%) connaissaient leur statut exact avant leur inclusion dans l‘étude alors que 1217 patients (30.4%) rapportaient un antécédent de dépistage VHB, 2665 (66.8%) étaient éligibles au dépistage

d’après les médecins des centres et 2798 (70.0%) avaient un critère CDC de dépistage. La comparaison des

facteurs associés au portage de l’AgHBs, aux antécédents de dépistage et à l’éligibilité au dépistage met en évidence une sous-estimation, pour le dépistage de l’AgHBs, de l’impact du pays de naissance et une

surestimation de l’impact de la sexualité (nombre de partenaires, type de sexualité). Au total, l’analyse des

performances de l’algorithme CDC et des pratiques de dépistage déclarées atteste une supériorité de

l’algorithme CDC (p=0.007) lequel, recommandant le dépistage dans 70% des cas, a, pour le dépistage de l’AgHBs, une sensibilité optimale (100%) mais une spécificité faible (31%).

d. Performances des tests rapides

Avec des valeurs supérieures à 99%, les tests rapides de détection de l’antigène HBs ont tous une excellente spécificité. En terme de sensibilité les valeurs sont bonnes mais moins élevées : de 90.5% pour le test Ag

Lumiquick® à 96.5% pour le test Biomérieux®. La comparaison deux à deux des aires sous courbe ROC des

trois tests atteste d’une moindre performance diagnostique du test Lumiquick® comparé au test sérologique et aux tests Biomérieux® et Determine®. Les faux négatifs concernent essentiellement patients à titre AgHBs et

CV VHB faibles, au stade de portage chronique inactif. Les taux de discordances inter-lecteurs sont très

faibles, compris entre 0.15 et 0.36%. L’analyse des performances du test Lumiquick®, seul test de détection

des anticorps anti-HBs ayant pu être disponible pour l’étude et ayant donc pu être évalué, atteste une faible


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sensibilité de celui-ci (Se= 58.3%) sans corrélation entre faux négatifs et titre des anticorps anti-HBs (titre

médian 58 [IQR: 24-157, min 10, max 1000]). Cette faible sensibilité est en partie contrebalancée par une excellente spécificité (Sp= 97.8%). Dès lors si la valeur prédictive négative est franchement médiocre, la

valeur prédictive positive du test est très satisfaisante et les résultats du test pourraient alors être considérés

comme fiables dans les seuls cas où le test est positif.

Evaluation de l’état d’avancement de la maladie hépatique des patients infectés

Sur 85 personnes dépistées AgHBs(+) lors de la phase I, 10 (13%) ont été perdues de vue malgré les

nombreuses relances réalisées. Parmi les 75 personnes ayant eu une bénéficié d’une évaluation médicale

complète, un patient (1.4%) a été dépisté au stade de carcinome hépatocellulaire (CHC), 11 (15.1%) ont une hépatite B chronique active avec fibrose significative ou comorbidité hépatique, 5 (6.8%) étaient des

immunotolérants à charge virale très élevée (dont une femme enceinte). un retard majeur au dépistage a été

objectivé pour 4 patients (5.3%) au stade de fibrose avancée ou cirrhose dont un CHC. Au total, dix personnes (13%) ont été mise sous un traitement antiviral dans les quelques mois suivant leur dépistage.

e. Statut des personnes ayant des anticorps anti-HBc isolés

Parmi les 128 personnes porteuses d’anticorps anti-HBc isolé, 100% avaient une charge virale VHB

indétectable. Ces personnes ont donc été considérées comme probablement guéries d’une hépatite B ancienne.

f. Pratiques de vaccination post-dépistage

Sur 4924 personnes ayant eu une sérologie complète lors des phases I et II, 1898 (38%) étaient non

immunisées malgré une indication à la vaccination dans 87% (N=1645) cas. Sur les 1120 personnes non immunisées appelées, 838 (75%) ont été jointes. Parmi elles, seuls 97 (12%) personnes avaient entamé une

vaccination. Les taux d’amorce de vaccination variaient de 0% à 56% selon le lieu du dépistage. L’absence

d’initiation de vaccination s’expliquait dans 181 cas (24%) par l’absence de proposition médicale, dans 253 cas (34%) par un retard à la réalisation, dans 99 cas (13%) par la non-récupération des résultats sérologiques

et par un refus de vaccination VHB dans 222 cas (30%).Suite à un dépistage les occasions manquées de

vaccination sont très fréquentes et le plus souvent liées à l’inertie globale du système. Une réorganisation des

procédures post-dépistage pourrait augmenter la couverture vaccinale des populations à risque.

Conclusions et perspectives

L’ensemble des données ont été recueillies et en partie analysé : caractéristiques socio-démographiques et

médicales de la population cible du dépistage, pratiques actuelles de dépistage, performances des algorithmes

de dépistage actuellement disponibles, performances des tests rapides AgHBs et AcHBs, statut VHB des personnes ayant des AcHBc isolés, pratiques de vaccination post-dépistage. Restent toutefois à réaliser une

sous-étude évaluant notamment les connaissances des personnes dépistées et l’analyse médico-économique

des différentes stratégies de dépistage (Recommandations CDC, pratiques actuelles, dépistage universel et l’algorithme InVS - toujours en cours de développement début 2013-). Du fait de sa qualification par l’ANSM

comme recherche biomédicale, nous n’avons pas pu inclure des personnes sans couverture sociale ou avec une

AME dans la seconde phase. Dès lors, la prévalence du portage de l’AgHBs a été inférieure à nos prévisions.

Ceci, couplé à la trop faible sensibilité des test rapides AcHBs empêchant une communication simple et immédiate de leurs résultats, ne nous a pas permis d’avoir la puissance suffisante dans la phase II pour évaluer

l’impact en pratique de l’utilisation des tests rapides sur la juste prise en charge des personnes pouvant

directement bénéficier d’un dépistage à savoir les sujets infectés et les personnes non immunisées à risque. Forts de cette expérience, il nous a semblé capital de pouvoir mieux documenter, dans une sous-population à

risque, l’intérêt des tests rapides AgHBs pour améliorer la prise en charge des personnes infectées. Ce projet,

couplé au constat établissant le manque d’études françaises évaluant l’intérêt de l’ensemble des tests de dépistage rapides, y compris des tests VIH, en population précaire migrante nous a conduit à réfléchir à une

prolongation du projet Optiscreen B vers l’étude pilote Optiscreen III.

Publications

Bottero J et al. Performance of rapid tests for detection of HBsAg and anti-HBsAb in a large cohort, France. J Hepatol. 2013 Mar;58(3):473-8.

Calendrier : 2010-12 (non rapporté en 2011)




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ETUDE VARBVA (AFRIQUE) VARIABILITÉ GÉNÉTIQUE DE L’HBV ET CO-INFECTION PAR LE VIH

L’accès de plus en plus large aux antirétroviraux des patients infectés par le VIH dans les pays du sud

va être associé à l’émergence de co-morbidités en particulier chroniques en premier lieu l’hépatite B chronique, cause d’hépatotoxicité. Les recommandations officielles préconisent de traiter les patients co-

infectés VIH-VHB par des antirétroviraux ayant une activité anti VIH et antiVHB comme la lamivudine.

Cependant, l’échappement virologique est quasi constant après quelques années d’exposition à cette molécule par apparition de mutations sur le gène pol, plus fréquent et plus rapide chez les patients co-infectés VIH-

VHB. D’autres molécules sont actuellement utilisées, comme l’adéfovir, l’entécavir, la telbivudine ou encore

le ténofovir et toutes s’accompagnent d’un risque de non réponse ou d’échappement virologique, avec la

plupart du temps, l’émergence de mutations sur le gène pol.

L’impact de ces mutations est double. Ces mutations induisent la plupart du temps une résistance

croisée aux autres antiviraux antiVHB, ce qui réduit d’autant les opportunités thérapeutiques, et leur

apparition s’accompagne parfois d’hépatite aigue qui peut entraîner le décès du patient concerné. D’autre part, la configuration du génome du VHB est telle qu’il existe une superposition des régions codantes pour le gène

pol et le gène S, impliqué dans la synthèse de l’antigène HBs. Les mutations du gène S peuvent avoir des

implications de santé publique majeure, puisqu’elles entraînent soit un échec de dépistage de l’hépatite B par les tests ELISA standard, soit une émergence de souches ayant le pouvoir d’infecter des personnes vaccinées

(souches dites « vaccine escape »). Nos travaux menés dans la Cohorte Française VIH-VHB Paris-Lyon ont

montré que la prévalence et l’incidence de ces mutations chez des patients déjà largement prétraités par

lamivudine et exposés au ténofovir étaient élevées et particulièrement liées à l’exposition aux molécules à activité duale dans un contexte de réplication persistante du VHB. Dans les pays à plus forte endémie VIH-

VHB dans lesquels les patients sont en général traités à un stade d’immunodépression avancée, l’impact

clinique et de santé publique de l’émergence de telles souches VHB mutées n’ont à ce jour pas été appréhendées.

Titre : Etude de l’impact des antirétroviraux sur la variabilité génétique du virus de l’hépatite

Promoteur : ANRS

Investigateurs Dr Karine Lacombe, Dr Raoul Moh - UMR-S707 INSERM-UPMC, Paris, France, SMIT, Hôpital Saint-Antoine, Paris, France (responsable

scientifique Pr PM Girard) & Programme PAC-CI, SMIT, CHU de Treichville, Abidjan, Côte d’Ivoire

- Coordinateurs virologiques Prs Fabien Zoulim et Paul Dény, Inserm U1052 Hépatologie, Hospices Civils de Lyon, France (responsable Pr Zoulim) ; coordinateur biostatistique Anders Boyd, UMR-S707

Financement : ANRS10-429 IMEA

Section analytique : 1032LACmba

Objectif Etude de l’impact des antirétroviraux sur la variabilité génétique du virus de l’hépatite B (VHB), dont

l’émergence de mutations des gènes pol, S et C, dans un contexte de haute endémie de co-infection VIH-VHB


1) caractérisation complète du génome du VHB et analyse de son évolution dans le temps ;

2) rôle de l’immunodépression dans l’émergence des souches VHB mutées ;

3) déterminants socio-démographiques, cliniques, biologiques et virologiques de l’émergence des souches mutantes S, C et pol ;

4) impact clinico-biologique de l’émergence des souches mutantes S, C et pol (en particulier en matière de

réponse thérapeutique aux antiviraux).

Résumé de l’étude

Etude de l’incidence des mutations des gènes pol et S, de leurs déterminants, de leur impact clinique et

des conséquences en terme de prise en charge thérapeutique dans 3 groupes de patients : (i) patients sans

indication de traitement anti VIH (permettant l’étude de l’histoire naturelle virologique et clinique de la co-infection), (ii) patients naïfs de traitement et débutant un traitement par lamivudine ou (iii) tenofovir /


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emtricitabine. Pour ce faire, nous utiliserons les données cliniques et biologiques issues de plusieurs cohortes

de patients co-infectés VIH-VHB suivis en Côte d’Ivoire, soit un total de 262 patients avec un suivi médian de 3 ans. Les analyses biologiques (biochimie, sérologies, séquençage direct, pyroséquençage pour les souches

d’intérêt) ont été effectuées grâce au soutien de l’ANRS (ANRS 12240).

La disponibilité d’un suivi longitudinal de plusieurs années avec des points d’analyse tous les 6 mois

permettra d’obtenir des données de qualité sur la dynamique virale du VHB en contexte d’immunodépression liée au VIH, au cours de l’histoire naturelle du VHB ou sous pression de sélection exercée par les antiviraux.

L’impact clinique de l’apparition de mutations du VHB, ainsi que leurs conséquences en terme de prise en

charge thérapeutique ultérieure permettront de mieux comprendre les enjeux à venir quant au traitement à long terme des patients co-infectés VIH-VHB dans les pays du Sud.

Techniques biologiques réalisées en 2012 ;

- Charges virales du VHB. Quantifiées pour tous les patients, elles nous permettaient 1) d’étudier le temps

pour atteindre une charge virale indétectable lorsqu’un patient était sous un traitement anti-VHB (lamivudine ou ténofovir), 2) d’étudier les courbes de réplication au cours de l’histoire naturelle ou sous traitement.

- Séquençages du gène Pol complets. Pour tous les échantillons ayant une charge virale >1000 copies/mL, les

mutations du gène Pol ont été déterminées et validées entre les positons rt107 et rt385. Ces données ont été incorporées dans la base de données analytique.

- Séquençages du gène PréC/C et PreS/S complets. Nous avons pris les mêmes échantillons des séquençages

du gène Pol pour faire les séquençages du gène PréC/C et PréS/S complets (en attente de validation).

Les analyses détaillées sont actuellement en cours pour les patients n’ayant pas reçu de traitement et ceux traités par LAM ou TDF. Nous envisageons à soumettre deux abstracts pour le congrès international de

l’American Associataion for the Study of Liver Diseases (AASLD) au début juin. Quelques résultats

concernant la population d’étude traitée sont présentés ci-dessous.

Probabilité cumulée d’atteindre une charge virale du VHB indétectable entre les 2 groupes de traitt VHB

En attente :

- Quantification de l’Ag HBs et HBe par l’équipe de virologie de l’Hôpital Saint-Louis (Drs. Sarah Maylin et Constance Delaugerre) sur le système Architect (résultats attendus août 2013).



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ESSAI : DEVENIR DES PATIENTS INFECTÉS PAR LE VIH ET PERDUS DE VUE AU BURUNDI (AFRIQUE)

Promoteur : Centre national de référence en matière de VIH/SIDA au Burundi

Investigateurs-coordonateurs : Dr Marie Poupard, Dr Constantin Nyamuzangur, Dr Béatrice Nkurunziza

Hôpital Avicenne, Service des Maladies Infectieuses, 125 rue de Stalingrad - 93 000 Bobigny

CHU Kamenge, Service de Medecine Interne et Maladies Infectieuses BP 1020 Bujumbura – BURUNDI

Directeurs scientifiques : Pr Olivier Bouchaud, Pr Théodore Niyongabo, Pr Robert Ryder

Financement : Global Fund, IeDEA-NIH, Esther

Section analytique : 7455POU50

Objectif L'objectif principal pour les personnes VIH/Sida mises sous traitement est d’assurer l'observance de ces

traitements « à vie » qui impliquent un suivi médical régulier et spécialisé. Le risque d'échec thérapeutique est

important pour les patients perdus de vue (PDV), qui sont les plus vulnérables. Peu d'études ont été effectuées encore sur le devenir de ces patients et les causes de rupture de suivi.

Le Burundi a la chance de disposer d’un réseau associatif dense, bien organisé et efficace. Le cadre dans

lequel nous nous proposons de faire l’étude est un programme de prise en charge globale de l’infection à VIH

dans le contexte d’un partenariat nord/sud soutenu par le GIP ESTHER. Ce programme est localisé sur 2 sites, le CHU Kamenge et l’hôpital Prince Régent Charles, et donc totalement intégré dans le tissu sanitaire local

avec du personnel médical et paramédical burundais. De plus, il existe une collaboration dans un des sites,

celui du CHU Kamenge, avec le National Institute of Health (INH) des Etats-Unis dans le cadre du programme International Epidemiologic Databases To Evaluate AIDS (IeDEA) surtout en rapport avec la

collecte des données.

La prise en charge globale est possible grâce à l’appui des fonds du Global Fund et à un partenariat étroit avec

un collectif de 5 associations locales. La file active est actuellement de 4800 patients (respectivement 3000 et 1800) dont 2550 sont sous antirétroviraux (respectivement 1600 et 950). Certains patients ont une partie de

leur suivi décentralisé dans des dispensaires périphériques. Les principales données démographiques,

cliniques, biologiques et de suivi sont saisies dans une base de données informatique dans le cadre du programme national.

D’autres centres de prise en charge seront intégrés à l’étude ce qui permettra d’approfondir des causes de perte

de vue liée au système de soin et de prise en charge qui sont parfois différents entre les structures associatives et les CPAMP. Il s’agit de l’ANSS à Bujumbura et de la SWAA à Gitega.



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ESSAI FLUCOCRYPTO (AFRIQUE)

Promoteur : Inserm-ANRS

Investigateur-coordonateurs : Pr Olivier Bouchaud, Pr Théodore Niyongabo Hôpital Avicenne, Service des Maladies Infectieuses, 125 rue de Stalingrad - 93 000 Bobigny

CHU Kamenge, Service de Medecine Interne et Maladies Infectieuses BP 1020 Bujumbura – BURUNDI

Investigateurs Dr Christophe Padoin pharmacologie Avicenne.

Coordinateur général de l’étude Dr Amélie Chabrol, SMI, Hôpital Avicenne Centre de monitoring et de Gestion / IMEA : Babacar Sylla, Dr Roland Landman, IMEA

Financement : ANRS

Section analytique : 7461BOUmba

Objectif Etude pilote d’évaluation d’une prise en charge standardisée de la cryptococcose méningée chez des patients

séropositifs VIH dans des conditions de ressources limitées par : fluconazole (1600 mg/j) + flucytosine (100 mg/kg/j) par voie orale pendant 2 semaines, puis consolidation par

fluconazole 800 mg/j pendant 8 semaines

traitement associé à des ponctions lombaires évacuatrices standardisées en cas d’hypertension intracrânienne et introduction du traitement antirétroviral à J15, sous réserve d’une amélioration clinique.

L’objectif principal de l’étude est d’obtenir un taux de mortalité à 10 semaines < 40%.


Déterminer 1) le taux de mortalité en fin de traitement d’induction (J14), et à la fin de l’étude (S24) ; 2) le nombre de rechutes pendant toute la durée de l’étude ; 3) le nombre de syndromes inflammatoires de

restauration immune (SIRI) pendant toute la durée de l’étude et déterminer des facteurs de risque ;

Evaluer le délai de stérilisation du liquide céphalo-rachidien avec ce traitement ;

Mesurer la concentration des antifongiques utilisés aux différentes phases de traitement, dans le sang et le LCR des patients, ainsi que celle d’efavirenz à l’état d’équilibre.

Décrire : 1) la tolérance des traitements testés ; 2) la prise en charge de l’hyperpression intracrânienne dans les

deux premières semaines de traitement ; 3) la réponse immuno-virologique sous traitement antirétroviral ; 4) la sensibilité des souches au fluconazole en cas d’échec ou de rechute ; 5) la sensibilité de l’antigène

cryptocoque par bandelette LFA sur les urines, dans le plasma et dans le LCR, pour le diagnostic de

cryptococcose méningée.

Méthodologie

Essai pilote non comparatif, multicentrique, national, évaluant une stratégie de prise en charge de la

cryptococcose méningée au Burundi.

Critères de jugement Le critère de jugement principal est la mesure du taux de mortalité à la 10

e semaine (S10).

Critères secondaires :

Taux de mortalité à J14 et à S24 avec étiologie principale du décès ;

Pourcentage de patients présentant une culture de liquide céphalo-rachidien négative à 2 semaines de traitement antifungique (J14) et à 10 semaines de traitement (S10) ;

Nombre de rechute de cryptococcose pendant toute la période de suivi (S24) ;

Nombre de syndrome inflammatoire de restauration immune paradoxal lié à la cryptococcose pendant toute la période de suivi (S24) Le syndrome de restauration immune paradoxal est défini par les critères habituels (28)

Nombre et gravité des effets indésirables survenus dans chacun des bras (rénaux, ioniques, hépatiques,

hématologiques, et d’autre nature). La classification des effets indésirables cliniques et biologique est réalisée grâce à l’échelle de l’ANRS ;

Pression du LCR initiale et au cours du suivi, nombre de ponctions évacuatrices réalisées, volume total évacué

Pourcentage de patients ayant une charge virale indétectable à S24 ;

Numération des CD4 à S24 ; CMI au fluconazole des souches de cryptocoque en cas de pousse sur le LCR de J28 ou S10 ou en cas de

rechute prouvée microbiologiquement.


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Concentration de fluconazole et de flucytosine dans le plasma et le LCR des patients en phase d’attaque,

concentration de fluconazole dans le plasma en phase de consolidation et de prophylaxie secondaire, concentration d’efavirenz à l’état d’équilibre.

Sensibilité de l’antigène cryptocoque par méthode bandelette LFA sur urines, plasma, LCR et sang total sur

prélèvement capillaire, sur le bilan initial, par rapport à l’examen direct du LCR, la culture du LCR et à

l’antigène cryptocoque dans le plasma et le LCR par méthode ELISA.

Population de l’essai / la recherche

Critères d’inclusion :

61 sujets d’age ≥ 18 ans ; Infection par le VIH documentée par deux tests rapides positifs, confirmée soit par une sérologie ELISA

positive, soit par une charge virale VIH détectable.

Patient naïf de traitement antirétroviral. Un antécédent de traitement de PTME est toléré. Premier épisode de cryptococcose méningée, prouvée par :

examen direct du liquide céphalorachidien à l’encre de chine positif, montrant des levures encapsulées ;

ou bien antigène cryptocoque par méthode bandelette LFA positif sur liquide céphalo-rachidien. Absence de trouble sévère de la vigilance : Glasgow ≥ 9 après la ponction lombaire déplétive initiale.

Absence de déficit focal périphérique au niveau des membres (les déficits des paires crâniennes sont tolérés) ;

Patient acceptant de participer à l’étude.

Critères de non inclusion : Taux d’hémoglobine < 7,5 g/dl ;

Taux de Polynucléaires neutrophiles < 500/mm3 ;

Taux de plaquettes < 50 000/mm3 ; Transaminases > 5 fois la limite supérieure de la normale ;

Troubles sévères de la vigilance avec Glasgow < 9 (Annexe 5) après la ponction lombaire déplétive initiale ;

Déficit neurologique focal au niveau des membres ;

Grossesse ou allaitement en cours ; Traitement antirétroviral en cours ;

Traitement antifongique par voie générale en cours ;

Antécédent de cryptococcose méningée ; Sujet participant à une autre étude avec risque d’interférence réciproque sur l’interprétation des résultats.

Intervention

Stratégie de prise en charge des patients en trois volets : Traitement d’attaque avec fluconazole à fortes doses (1600 mg/jour) associé à la flucytosine à 100 mg/kg/jour

pendant 2 semaines, puis traitement d’entretien par fluconazole à 800 mg/jour pendant 8 semaine

Réalisation de ponctions lombaires déplétives, selon un algorithme adapté des recommandations de l’IDSA.

Introduction à J15 du traitement antirétroviral, sous réserve d’une amélioration clinique. Méthodes d’analyse statistique

Estimation du taux de mortalité à S10 et de son intervalle de confiance à 95%.

Sous les hypothèses suivantes (taux de mortalité attendu = 25%, beta = 20%, test unilatéral), il faudra 61 sujets pour que la borne supérieure de l’intervalle de confiance reste inférieure à 40%.

Etude ancillaire

Etude pharmacocinétique de l’efavirenz associé au fluconazole 800 mg/j. Nombre de sujets : 10.


Etat d’avancement en dec.2012

début de l’essai : premier trimestre 2012

Durée des inclusions : 18 mois

Durée de participation par sujet : 6 mois


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COHORTE THILAO (AFRIQUE)

Titre : L’étude Thilao est une cohorte thérapeutique née de l’essai SAVELINC et de l’essai MALIBU. Essai

Renforcement de l’observance et traitement à base de darunavir/r et raltegravir chez des adultes infectés par le VIH-1

en échec virologique de deuxième ligne de traitement antirétroviral en Afrique sub-Saharienne

Promoteur : ANRS

Investigateurs coordonnateurs : Pr Serge Eholié, Dr. Roland Landman

Financement : ANRS

Section analytique : 7711, -12, -13, -14, -15LANmba

Objectif Estimer, chez des personnes adultes infectés par le VIH-1 en échec de deux lignes de traitement antirétroviral ayant reçu une première ligne à base d’inhibiteur non nucléosidique de la transcriptase inverse puis une

seconde ligne à base d’inhibiteur de la protéase boostée par le ritonavir dans des pays d’Afrique sub-

Saharienne : L’efficacité d’une phase de renforcement d’observance de 3 mois sur le contrôle virologique, et les facteurs

associés au succès de ce renforcement ;

Chez les patients chez qui le renforcement aura été efficace : le maintien de cette efficacité à 16 mois, et les

facteurs associés à ce maintien ; Chez les patients chez qui le renforcement n’aura pas été efficace : l’efficacité à 12 mois d’un traitement

antirétroviral de troisième ligne à base de raltégravir et de darunavir/r, et les facteurs associés à cette

efficacité


Évaluer la tolérance des traitements de troisième ligne contenant au moins raltégravir et de darunavir/r.

Evaluer l’observance aux traitements de troisième ligne contenant au moins raltégravir et de darunavir/r.

Evaluer les profils de résistances aux antirétroviraux chez les personnes en échec virologique de seconde ligne, chez les personnes toujours en échec après 3 mois de renforcement de l’observance, et chez les

personnes toujours en échec après 12 mois de traitement de 3ème ligne.

Estimer le rapport coût-efficacité des régimes de troisième ligne.

Mesurer les concentrations plasmatiques d’antirétroviraux, et étudier leur association avec la réponse virologique, la survenue des effets indésirables, et l’observance aux traitements.

Type d’étude

Cohorte prospective thérapeutique, multicentrique, multipays. Des adultes infectés par le VIH-1 en échec

virologique de traitement antirétroviral de seconde ligne seront recrutés, puis suivis en deux phases : Pendant la phase 1 (3 mois), les participants bénéficieront d’un renforcement de l’observance, puis d’un

contrôle de l’efficacité virologique, pour répondre à l’objectif N°1 ;

Pendant la phase 2 (12 mois) : en cas de succès virologique à l’issue de la première phase, les participants continueront à être suivis sous leur

traitement de seconde ligne initial, pour répondre à l’objectif N°2 ;

en cas d’échec virologique persistant à l’issue de la première phase, les participants recevront un traitement

de 3eme ligne à base de darunavir/r et raltégravir, pour répondre à l’objectif N°3.

Nombre de participants : 200

Critères de jugement principaux :

A la fin de la phase 1 : Proportion de patients ayant une charge virale plasmatique inférieure à 400 copies /ml

à 3 mois, et/ou une baisse de la charge virale plasmatique supérieure à 2 log10copies/ml entre l’inclusion et le 3ème mois (M3);

A la fin de la phase 2 :

Pour les personnes toujours en deuxième ligne : Proportion de patients ayant une charge virale plasmatique inférieure à 50 copies/ml 16 mois après l’inclusion ;


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Pour les personnes en troisième ligne : Proportion de patients ayant une charge virale plasmatique inférieure à

50 copies /ml après 12 mois de traitement antirétroviral de troisième ligne. Critères de jugement secondaires :

Gain en CD4/mm3 à la fin de chaque phase (M3 et M16), en comparaison avec le chiffre initial dans la phase

(J0 et M3).

Profils de mutations de résistance chez les personnes en échec de 2ème ligne (inclusion), chez les personnes ayant une CV détectable après renforcement de l’observance (M3) et chez les personnes ayant une CV

détectable après 12 mois de traitement de 3ème ligne (M16).

Morbidité sévère, définie comme toute pathologie classant au stade SIDA, tumorale non SIDA, bactérienne invasive non SIDA, classant aux grades 3 ou 4 selon l’échelle de l’ANRS, ou entraînant le décès.

Observance aux traitements antirétroviraux.

Rapport coût-efficacité des stratégies de traitements. Intervention

Pendant la phase 1, le renforcement de l’observance se fera au cours de consultations spécialisées au

minimum mensuelles, avec évaluation de la compréhension du traitement, évaluation des obstacles à une

bonne observance, et conseil renforcé. Des mesures spécifiques telles que le soutien associatif à domicile, la DOT par l’entourage, et le soutien par téléphone ou SMS, pourront être décidées en étroite collaboration entre

le personnel soignant et la personne participant à l’étude et avec son plein accord ;

Les traitements de seconde ligne reçus pendant la phase 1 (pour tout le monde) et la phase 2 (pour les personnes en succès à M3) seront ceux en cours au moment de l’inclusion (traitements à base de deux INTIs

et d’un IP boostée autre que Darunavir ;

Les traitements de 3ème ligne reçus pendant la phase 2 pour les personnes en échec à M3 seront à base de darunavir (600 mg x 2/jour)/ritonavir (100 mg x 2/jour) + raltégravir (400 mg x 2/jour) + une ou deux INTIs

laissé au choix de l’investigateur.

Calendrier : 2012-15 Les avis du CE ont été obtenus le 17 octobre 2012 pour le centre Burkina-Faso, le 20 juillet 2012 pour le

centre Côte d’Ivoire et le 17 aout 2012 pour le Sénégal. Concernant le Mali, l’avis favorable est toujours en

attente. Les ouvertures des centres pour la Cote d’Ivoire et le Burkina Faso ont eu lieu en février 2013 et avril 2013

respectivement. En ce qui concerne le Sénégal, la date d’ouverture du centre est fixée pour le 23 et 24 Mai

2013. Le premier patient a été inclus en Côte d’Ivoire début mars 2013.


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VIH-VHC AU VIETNAM : ETUDE DE FAISABILITÉ D’UN TRAITEMENT PAR BITHÉRAPIE PÉGYLÉE DANS

UNE COHORTE DE PATIENTS CO-INFECTÉS VIH-VHC SUIVIS À HO CHI MINH VILLE (ASIE)

Promoteur : ANRS

Investigateurs coordonnateurs : Dr Maud Lemoine Dr Nguyen Van Vinh Chau, Pr Barre Sinoussi Medical Research Council, The Gambia Unit, Gambia Hôpital des Maladies Tropicales Ho Chi Minh Ville, Vietnam, ANRS Viet-Nam Equipes partenaires Dr Stéphanie Dominguez Hôpital Henri-Mondor Créteil, France Dr Karine LacombeHôpital Saint Antoine, Paris, France Pr Truong Thi Xuan Lien Institut Pasteur Ho Chi Minh City, Vietnam

Financement : ANRS

Section analytique : 5010BARmba

Objectif

Principal: Décrire les caractéristiques épidémiologiques, cliniques et virologiques d’un groupe de patients co-infectés par le VIH et le VHC, suivis à l’l’hôpital des Maladies Tropicales et potentiellement éligibles pour un traitement avec du Peg-Interferon et de la ribavirine

1. Identifier les besoins locaux pour la prise en charge et le traitement de l’hépatite C des patients infectés par le VIH à HCMV (cf projet pilote “FIBRHIVIET”) 2. Consolider les partenariats locaux incluant les cliniciens, les virologues et les autorités vietnamiennes 3. Elaborer avec les partenaires locaux des guidelines cliniques et thérapeutiques communs pour s’assurer de la faisabilité d’un essai clinique future sur le traitement de l’hépatite C chez les patients infectés par le VIH. Secondaires:

1. Déterminer la proportion de patients avec une infection à VHC active 2. Déterminer la distribution génotypique de l’infection par VHC 3. Evaluer la sévérité de la fibrose hépatique 4. Etudier les facteurs de risques associés à la fibrose hépatique


Etat d’avancement du projet au 31/12/2012

Contrat d’initiation stoppé par l’ANRS en novembre 2012, le partenaire local n’acceptant plus les conditions initiales du projet

Perspectives

Evaluer la possibilité de réaliser le projet pilote avec un autre partenaire à Hai Phong, Vietnam


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ETUDE PHARMACOCINÉTIQUE DE LA RIFABUTINE + ARV DANS LE TRAITEMENT DE LA TUBERCULOSE-VIH À HO CHI MINH CITY, VIETNAM

Promoteur : ANRS

Investigateurs coordonnateurs : Dr Maud Lemoine Dr Nguyen Van Vinh Chau

Investigateurs Principaux Pr Anthony Harries, Dr Nguyen Huy Dung, Pr Barre Sinoussi The International Union Against Tuberculosis and Lung Diseases, hop. Pham Ngoc Thach Ho Chi Minh City, Vietnam, coordination ANRS Viet-Nam Equipes partenaires IUATLD) Truong Thi Xuan Lien Anne-Marie Taburet Nguyen Huy Dung Institut Pasteur Ho Chi Minh City, Vietnam Hôpital Pham Ngoc Thach Ho Chi Minh City, Vietnam Service de Pharmacie, hôpital Kremlin-Bicêtre, Paris

Financement : ANRS, Fondation Total


Objectif

Principal : Déterminer la pharmacocinétique de la Rifabutine (RBT) en combinaison avec les médicaments anti-rétroviraux (ARV) chez le patient tuberculeux infecté par le VIH à un stade avancé au Vietnam.

Secondaires : 1. Comparer la biodisponibilité de deux doses différentes de RBT en combinaison avec Lopinavir

"boosté" (LPV/r), avec la biodisponibilité de RBT sans ARV; 2. Déterminer la biodisponibilité de LPV/r en combinaison avec RBT; 3. Déterminer l’efficacité du traitement de la tuberculose 4. Déterminer la sécurité et la toxicité de la RBT combinée aux ARV durant la phase initiale du

traitement de la tuberculose (TB). 5. Evaluer les différences génétiques pouvant influencer les réponses aux traitements antirétroviraux et

antituberculeux)


Etat d’avancement du projet au 31/12/2012

Fin du suivi des 33 patients inclus et des dosages pharmacologiques de rifabutine et de lopinavir en octobre 2012

Analyses des données en cours Perspectives

Soumission d’un abstract pour IAS 2013 Soumission de 2-3 articles en 2013


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AMÉLIORATION DU DIAGNOSTIC DE LA TUBERCULOSE CHEZ LES ENFANTS INFECTÉS PAR LE VIH EN

ASIE (CAMBODGE, VIETNAM) ET EN AFRIQUE (BURKINA FASO, CAMEROUN) PAANTHER 01 ANRS 12229 (Pediatric Asian African Network for Tuberculosis and HIV Research) Dr Olivier Marcy

Promoteur : ANRS

Investigateurs Principaux Dr Ung Vibol, , Pr Barre Sinoussi Hôpital National Pédiatrique Phnom Penh, Cambodge Institut Pasteur du Cambodge, ANRS Viet-Nam Equipes partenaires Dr Ung Vibol Hôpital National Pédiatrique Phnom Penh, Cambodge Dr Nguyen Huy Dung Hôpital Pham Ngoc Thach Ho Chi Minh City, Vietnam Dr Boubacar Nacro CHU Sourô Sanou, Bobo-Dioulasso, Burkina Faso Dr Mathurin Tejiokem Centre Pasteur du Cameroun, Yaoundé

Financement : ANRS, Fondation Total


Objectifs

Principal : Développer un algorithme pour améliorer le diagnostic de la tuberculose (TB) chez les enfants infectés par le VIH dans les pays en développement à forte endémie tuberculeuse.

Secondaires : 1. Evaluer la sensibilité, spécificité, valeurs prédictives positives et négatives d’un test Lymphocyte T

Inferferon Gamma (IGRA): le QuantiFERON®-TB Gold In-Tube, pour le diagnostic de la TB chez les enfants infectés par le VIH; Comparer les performances de deux IGRA : le QuantiFERON®-TB Gold In-Tube et le T.SPOT-TB® pour le diagnostic de la TB dans un sous-groupe d’enfants infectés par le VIH;

2. Evaluer la performance et la faisabilité de méthodes alternatives de prélèvement bactériologique pour la détection et la culture du mycobacterium tuberculosis (MTB) telles que le String Test, l’aspiration naso-pharyngée et l’analyse de selles par rapport aux techniques de référence;

3. Evaluer la sensibilité, spécificité, valeurs prédictives positives et négatives du GeneXpert MTB/RIF pour le diagnostic de la TB chez les enfants infectés par le VIH; Evaluer la valeur ajoutée du GeneXpert MTB/RIF dans l’algorithme stratégique de diagnostic ; Evaluer la valeur diagnostique du GeneXpert pour la détection du MTB par rapport au standard de référence (culture MGIT/Lowenstein sur les prélèvements gastriques et crachats) ; Evaluer la performance du GeneXpert pour détecter le MTB sur les échantillons collectés par String Test, aspiration naso-pharyngée et selles par rapport aux méthodes de référence

4. Evaluer la morbidité (IRIS, toxicité médicamenteuse, maladies opportunistes) et la mortalité à 6 mois des enfants co-infectés par le VIH et la TB;

5. Etablir un réseau pédiatrique VIH/TB et améliorer les capacités cliniques et de laboratoire des sites en vue de développer de futurs projets de recherche


Début du projet : Avril 2011 Fin du projet : Septembre 2014

Etat d’avancement du projet au 31/12/2012 et Perspectives

o 91, 40,18 et 4 enfants inclus au Cambodge, Cameroun, Vietnam et Burkina Faso respectivement. o Poursuite des inclusions


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RECHERCHE CLINIQUE: ESSAIS EN DEVELOPPEMENT

COHORTE ICCARRE (FRANCE)

Titre : Etude en ouvert multicentrique évaluant la capacité à maintenir le succès virologique à 48 semaines, d’une

stratégie de prise du traitement anti rétroviral 4 jours consécutifs sur 7, chez des patients infectés par le VIH-1 en

traitement de suite d’un succès virologique depuis au moins 12 mois.

Promoteur : ANRS Coordinateurs scientifiques : Dr Jacques LEIBOWITCH, Immuno-hématologie, Hôpital Raymond Poincaré, 92380 Garches ; Pr Christian PERRONNE, médecine aiguë spécialisée, Hôpital Raymond Poincaré

Investigateur coordonnateur Pr. Jean-Claude Melchior, Dr Pierre de Truchis médecine aiguë spécialisée, Hôpital Raymond Poincaré , 92380 Garches

Chef de projet : Dr Damien Le Du

Coordination Méthodologique : Mme Dominique Costagliola- Université Pierre et Marie Curie –Unité INSERM 943

Centre de gestion et de Monitorage : Dr Roland Landman, Aïda Benalycherif, Karine Amat, Babacar Sylla-

IMEA

Financement : ANRS

Objectif Évaluer à 48 semaines, la capacité à maintenir le succès virologique, c’est-à-dire l’absence d’échec

virologique défini par la survenue de deux valeurs successives de charge virale (CV) > 50 copies/ml dans un délai de 2 à 4 semaines d’intervalle ou d’une charge virale > 500 copies/mL, d’une stratégie d’un traitement

antirétroviral 4 jours consécutifs sur 7 jours, chez des patients infectés par le VIH-1 ayant une charge virale

indétectable depuis au moins 12 mois, en traitement de suite d'un même traitement pris depuis au moins 4 mois.

Objectif Secondaire

Seront évalués : l’observance au protocole, la qualité de vie des patients, l’évolution des lymphocytes CD4 de

J0 à S48, le profil des mutations de résistance apparues au cours de l’essai en cas d’échec virologique, le délai

d’apparition d’un échec virologique, le nombre de « blips », l’efficacité comparative des combinaisons antivirales choisies (INNTI versus IP/r), l’incidence des effets indésirables cliniques et biologiques, les

dosages pharmacologiques des antiviraux plasmatiques en résiduel, l’évolution des paramètres glucido-

lipidique de J0 à S48, l’évolution des marqueurs d’activation immunitaire et d’inflammation, l’évolution de l’ADN-proviral, la recherche de facteurs prédictifs du succès.

Traitements de l’essai

Une association d’au moins 2 INTI associés à 1 INNTI ou 1 IP/r, à choisir entre :

INTI = tenofovir, emtricitabine, abacavir, lamivudine, INNTI = efavirenz, rilpivirine, ou etravirine

IP boostée = lopinavir/r, darunavir/r, atazanavir/r

Le traitement ne doit pas avoir été modifié depuis 4 mois lors de la visite de pré-inclusion et la charge virale VIH-1 doit être indétectable (inférieure à 50 copies/ml) depuis au moins 12 mois.

Nombre de sujet : Suite aux différentes discussions avec les équipes investigatrices et conceptrices de ce

projet , il a été retenu que ICCARRE serait finalement une étude monobras, pilote sur 100 patients au total

contrairement à ce qu’il avait été décidé en 2011Calendrier prévisionnel : 2013-16 La durée de recrutement s’étendra sur 12 mois. La durée d’étude s’étend sur 48 semaines pour chaque patient

inclus dans l’étude, La durée totale de l’étude sera donc de 2 ans environ.


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EPIDÉMIOLOGIE CLINIQUE DES INFECTIONS BACTÉRIENNES ET DONNÉES DE RÉSISTANCE DES

ENTÉROBACTÉRIES EN AFRIQUE

La morbidité et mortalité importantes des infections bactériennes imposent une antibiothérapie adaptée. Les

bactéries résistantes sont augmentation mondiale, en particulier les entérobactéries productrices de β-

lactamase à spectre étendu (BLSE), y compris en infections communautaire, où la diffusion est plus difficile à contrôler qu’à l’hôpital. Inadaptation des antibiothérapies empiriques prescrites avec retard au traitement

efficace. En Afrique les caractéristiques des infections bactériennes (démographiques, cliniques) sont mal

connues : nécessité d’un état des lieux avec données de résistance (part des BLSE), d’adaptation des

protocoles d’antibiothérapie empirique, de définition de la place des tests de diagnostics rapides BLSE.

Partenaires Nord

Pr Antoine Andremont, Dr Laurence Armand-Lefèvre, Service de bactériologie, Hôpital Bichat, Paris,

Université Paris VII Pr Pierre-Marie Girard, Service des maladies infectieuses et tropicales, Hôpital Saint Antoine, Paris,

Université Paris VI, INSERM U 707, IMEA

Dr Roland Landman, Service des maladies infectieuses et tropicales, Hôpital Bichat, Paris, IMEA Dr Laure Surgers, Service des maladies infectieuses et tropicales, Hôpital Saint Antoine, Paris, Université

Paris VI

Partenaires Sud

Pr Serge Eholie, CHU de Treichville, Abidjan, IMEA

Données générales

Une méta-analyse publiée en 2010 sur les bactériémies communautaires en Afrique, retrouve que 41 % d’entre elles sont dues à des entérobactéries et 12 % à des entérobactéries non Salmonella.

Lieu de l’étude Abidjan, Bamako, Dakar

Population de l’étude

a) Populations vulnérables

Femmes enceintes : immunodépression de la grossesse, nécessité de documenter et traiter les bactériuries

asymptomatiques, augmentation fréquence des infections urinaires, morbidité et mortalité pour mère ET

fœtus, pas de donnée en Afrique Enfants : morbidité et mortalité importante dues aux infections bactériennes

Séropositifs pour le VIH : augmentation de l’incidence des infections bactériennes, exposition augmentée aux

antibiotiques (en particulier cotrimoxazole) b) Consultation pour fièvre et/ou signes fonctionnels urinaires

Données recueillies

a) Cliniques Antécédents : Si VIH (CD4, charge virale, traitement, cotrimoxazole)

Si femme enceinte (terme de grossesse)

Lieu de vie (rural/citadin)

Exposition récente à des antibiotiques Hospitalisation dans l’année

Symptômes

b) Bactériologie Hémoculture / Examen cyto-bactériologique des urines (ECBU) / Coproculture (colonisation à entérobactérie

BLSE)

Antibiogramme, y compris non β-lactamines (co-résistances)

Caractérisation des BLSE Eliminer les paludismes par test de diagnostic rapide (attention aux co-infections), proposer une sérologie VIH


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DEPARTEMENT DE SANTE PUBLIQUE ET SCIENCES

SOCIALES


Responsable : Pr. Marc Brodin

Présentation en attente


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PROGRAMME DE COOPERATION SIDA/TUBERCULOSE AVEC LE BRESIL

Promoteur : ANRS

Investigateur Dr Bernard Larouzé

Financement : ANRS

Section analytique : 5195LARmba

Objectif

Le programme associant l’ANRS au Departamento DST/AIDS e hepatites virais (ministère Brésilien

de la Santé) a pour objectif de promouvoir et financer la réalisation de projets de recherche d’intérêt

commun pour les deux institutions.

Calendrier : 2012

L’année 2012 a été marquée, notamment, par l’achèvement d’un très important essai thérapeutique,

REFLATE-I, concernant le traitement de la co-infection HIV-tuberculose. Il s’agissait d’un essai

multicentrique coordonné en France par l’équipe de Jean Michel Molina (hôpital Saint Louis, Paris)

et au Brésil par l’Institut de Recherche Clinique de la Fondation Oswaldo Cruz et associant des

équipes de Paris, Rio de Janeiro, Novo Iguachu, Bahia, São Paulo et Porto Alegre. Les programmes

concernant la propriété intellectuelle en matière d’anti-rétroviraux et d’outils de suivi de l’infection

VIH, l’accès au dépistage des populations vulnérables, les prises de décision en matière de

circoncision comme moyen de prévention et la prise en charge des adolescents infectés par le VIH se

sont poursuivis avec la contribution d’équipes américaines et canadienne. De nouveaux programmes

ont effectivement débuté, concernant l’épidémiologie moléculaire des hépatites B et D en Amazonie

et les processus immunitaires en cause dans le cadre de la co-infection tuberculose-VIH de l’adulte.

A noter la publication prévue en 2013 des versions française et portugaise de l’ouvrage « Accès aux

antirétroviraux dans les pays du sud » publié dans la collection Sciences sociales et sida de l’ANRS.


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PROGRAMME UDSEN : ENQUETE DE PREVALENCE ET DE PRATIQUES A

RISQUE D’INFECTION CHEZ LES USAGERS DE DROGUES A DAKAR

Cette enquête s’inscrit dans une démarche de recherche opérationnelle : elle vise à permettre la mise en place d’interventions de santé publique, à savoir des actions de réduction des risques pour les usagers de

cocaïne/crack et/ou d’héroïne : programmes d’outreach (aide à la réduction des risques), de distribution de

seringues et d’accès à des traitements de substitution pour les usagers dépendants à l’héroïne. Pour cela une enquête de la taille de la population d’usagers d’héroïne et/ou de cocaïne/crack dans la région de Dakar a

également été réalisée sur la même période grâce à un financement du Fond Mondial/CNLS.

et ses premiers résultats ont été présentés

Promoteur : Inserm-ANRS Agence Nationale de Recherche sur le SIDA et les hépatites virales (ANRS, France), Institut de Médecine et d’Epidémiologie Appliquée (IMEA, France), Fond Mondial

Investigateurs-coordonateurs : Dr Annie Leprêtre, Dr Idrissa Ba Hôpital Bichat Claude Bernard, IMEA, Paris (France)

CHNU de Thiaroye et IREP, UCAD, Dakar (Sénégal)

Financement : ANRS

Section analytique : 3091LEPmba

Objectif Evaluer l’ampleur de l’usage des drogues injectables, à savoir, l’héroïne et la cocaïne/crack, quelque

soit le mode d’usage, dans la région de Dakar et d’estimer la séroprévalence VIH, VHC et VHB chez les

usagers.

Calendrier : 2011-12 La durée de l’étude a été de 24 mois, de janvier 2011 à décembre 2012. L’enquête a été réalisée en 2011

Résultats

Les principaux résultats de l’enquête sont :

Estimation de taille de la population d’UDI précaires de la région de Dakar : 1324 (IC95% 1281-1367).

L’estimation des prévalences dans la population d’usagers de drogues injectables a été la suivante: VIH : 5, 2% [IC(α =0,25)] :(0,038-0,063)

VHB: 7,9% [IC (alpha=0.25) ]:( 0,052-0,111)

VHC : 23,3% [IC(α =0,25)] :(0,212-0,252) La prévalence du VIH varie en fonction du mode de consommation des drogues et du sexe (données issues de

l’échantillon des 506 UDI enquêtés):

- Prévalence du VIH chez les injecteurs vs non injecteurs = 9,4 % vs 2, 5% (p=0.001). - Prévalence du VIH chez les femmes vs les hommes = 13% vs 3% (p= 0,001)

- Prévalence VIH chez les femmes injectrices vs les hommes injecteurs = 21,1 % vs 7,5% (p= 0,0001).

La prévalence du VHC varie également en fonction du mode de consommation des drogues:

- Prévalence du VHC chez les injecteurs vs non injecteurs = 38,85 % vs 18% (p=0.0001)

En 2012 :

a) Analyse complète des résultats et leur validation. b) Restitution finale des résultats à l’équipe de recherche et à l’ANRS, aux acteurs de santé de Dakar (journée

des associations du site ANRS de Dakar du 30 mai 201, salon de la Santé et du matériel médical de Dakar du

05 au 08 juillet 2012), à la population des usagers de drogues de la région de Dakar (20 avril 25 personnes, 28

juin 33, 06 octobre 25 personnes) et aux autorités de santé publique (remis du fait du changement de gouvernement sénégalais survenu en 2012).

c) Formations technique ESTHER/UDSEN des personnels du CEPIAD sur usage de drogues et risques

infectieux de mars-avril et octobre 2012. d) rédaction d’un article en cours.


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Perspectives 2013

- Remise du rapport final de l’étude à l’ANRS pour fin juillet et soumission d’un article

- Poursuite de la participation au programme de formation UDSEN /ESTHER et de l’appui au projet CEPIAD

poursuite de l’appui pour la promotion d’actions de RDR et de traitements de substitution pour les UDI de la région de Dakar (financement CNLS depuis début 2013).

- Promotion d’actions de réduction des risques liés à l’usage de drogues coordonnée par les Drs Ba et Maynart

par 4 équipes de 2 binômes (personnel d’enquête + associatifs), à raison de 2 sorties par semaine : 4000 rencontres avec des consommateurs d’héroïne et/ou de cocaïne dont 434 nouveaux par rapport à 2011. Un

peu plus de 8000 seringues et 9000 préservatifs ont été distribuées.

- Traitements de substitution : un centre méthadone financé par le CNLS via le Fond Mondial et la mairie de

Paris devrait commencer à fonctionner début 2013.

Publications

Communications à la Journée scientifique du site ANRS de Dakar du 31 mai 2012

au 16éme ICASA (Addis 4-8 déc. 2011) :

au 4ème Salon International de la Santé et du Matériel Médical de Dakar (SISDAK), du 05 au 08 juillet

2012 :

à la conférence AIDS 22- 27 juillet 2012, Washington :

http://www.anrs.fr/VIH-SIDA/Pays-en-developpement/Actualites


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ACCEPTABILITE DU DEPISTAGE DU VIH A POINTE NOIRE, CONGO En République du Congo, le dépistage du VIH et le traitement par les ARV sont gratuits depuis 2007. La

stratégie nationale de lutte contre le VIH/sida vise à doubler d’ici 2013 la proportion de personnes dépistées

dans la population afin que celles qui sont infectées puissent être traitées pour améliorer leur survie et réduire

la transmission du virus.

Promoteur : INSERM

Investigateur coordonateur : Christine Salomon France Lert (INSERM U1018), Catherine Enel (CHU Dijon), Patrice Yengo (CEA-EHESS)

Financement : ANRS, Sidaction ANRS, projet n° 12230 (1

er AO 2010). Sidaction (A021 -2010)


Objectif Structure de l’offre et acceptabilité du dépistage VIH en lien avec l’accès au traitement dans différents

contextes à Pointe Noire, République du Congo.

Il s’agit d’une étude socio-anthropologique observationnelle, financée par l’ANRS et Sidaction, menée sur

deux ans, qui s'inscrit dans le questionnement scientifique sur l’extension du dépistage pour augmenter la proportion des personnes infectées traitées par ARV de façon à améliorer leur survie et réduire la transmission

du virus.

L’analyse s’est centrée sur la description et l’examen d’un certain nombre de problèmes structurels liés à l’effondrement du service public qui hypothèquent la prévention et l’intégration du dépistage du VIH aux

autres activités.

Calendrier : 2010-12 Elle a démarré en 2010 après acceptation par le comité d’éthique du Congo. Une première phase de l’enquête

de terrain s’est déroulée entre janvier et février 2011 et une seconde phase en août 2011. L’analyse des données recueillies (observations et entretiens) s’est faite entre le second semestre 2011 et le premier semestre

2012.

Avancement:

Une mission de restitution des premiers résultats aux partenaires congolais de l’étude à Brazzaville (au SEP-CNLS du Congo) et à Pointe Noire (aux structures enquêtées et aux associations impliquées dans la lutte

contre le VIH) a eu lieu en avril 2012. L’étude est depuis terminée.

Publications

- présentation au séminaire scientifique de l’équipe 11 de l’Inserm U 11018 (C. Salomon et C. Enel) le 8 mars

2012, - présentation intitulée « Observation d’une opération de dépistage mobile à Pointe Noire, République du

Congo » à AFRAVIH Genève le 28 mars 2012 (auteurs C. Salomon, C. Enel, F. Lert, MF Puruehnce, G.

Loubaki, JP Nkpouendolo) - un article soumis à la revue Anthropologie et Santé intitulé « Quatre jours de dépistage mobile à Base Agip,

un quartier de Pointe-Noire » (auteurs C. Salomon, F. Lert, C. Enel, G. Loubaki).


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GENRE, DEPISTAGE DU VIH ET PEC A POINTE NOIRE, CONGO

Rapports de genre et de génération et transformations sociales : retentissements sur le dépistage et la prise en

charge du VIH à Pointe Noire

Promoteur : INSERM

Investigateur coordonateur : Christine Salomon France Lert (INSERM U1018)

Financement : ANRS projet n°12272


Objectif Il s’agit d’une analyse complémentaire. La précédente étude avait en effet également mis en lumière la fragilité prononcée des liens sociaux au sein des couples et au sein des familles, fragilité elle-même liée aux

fortes inégalités sociales et économiques en défaveur des femmes qui caractérisent cette métropole urbaine.

Ceci joue bien évidemment également un rôle important dans la problématique du dépistage et de la prise en charge : isolement des personnes infectées, choix de ne pas annoncer sa séropositivité aux partenaires, parfois

refus du test et interruption de traitement chez les femmes enceintes.

L’analyse complémentaire vise à approfondir l’étude des matériaux recueillis sur ces questions en les

articulant à leur contexte économique, social, historique et politique ainsi qu’à la littérature scientifique, aux travaux universitaires locaux et aux productions de fiction – dans le roman, le cinéma ou la chanson populaire

- qui illustrent les transformations sociales qui nous intéressent.

Elle s’inscrit dans une perspective d’anthropologie du genre qui implique un point de vue comparatif et répond au souci d’étendre nos résultats aux contextes urbains des pays voisins d’Afrique centrale. Dans cette

optique, nous comptons nous intéresser plus particulièrement aux associations de femmes libres (que les

programmes de lutte contre le VIH appellent professionnelles ou travailleuses du sexe) dont les bailleurs

internationaux encouragent la formation afin d’éclairer leur engagement dans un mouvement surdéterminé par les impératifs globalisés de la lutte contre le sida, happé par un niveau international qui leur demeure

inaccessible, mais qui est néanmoins construit comme un recours par rapport au mépris de la société locale et

à une dépendance clientéliste vis-à-vis des programmes de lutte contre le sida.

Calendrier : 2010-12 Elle a démarré en juillet 2012 ; date de fin prévue : décembre 2013.

Avancement:

Une mission de restitution des premiers résultats aux partenaires congolais de l’étude à Brazzaville (au SEP-

CNLS du Congo) et à Pointe Noire (aux structures enquêtées et aux associations impliquées dans la lutte contre le VIH) a eu lieu en avril 2012. L’étude est depuis terminée.

Publications

- présentation au séminaire scientifique de l’équipe 11 de l’Inserm U 11018 (C. Salomon et C. Enel) le 8 mars

2012, - présentation intitulée « Observation d’une opération de dépistage mobile à Pointe Noire, République du

Congo » à AFRAVIH Genève le 28 mars 2012 (auteurs C. Salomon, C. Enel, F. Lert, MF Puruehnce, G.

Loubaki, JP Nkpouendolo) - un article soumis à la revue Anthropologie et Santé intitulé « Quatre jours de dépistage mobile à Base Agip,

un quartier de Pointe-Noire » (auteurs C. Salomon, F. Lert, C. Enel, G. Loubaki).


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CHILDHOOD IMPORTED MALARIA : COULD WE HAVE SUPPRESSED RISK

FACTORS IN SOME CHILDREN ?

Malaria infection among child travellers need special attention as it rarely occurs in non endemic countries.

Most studies dealt with risks in the paediatric population, but there is a need to justify age class choices and its direct implication of analysis for severity risk factors

Promoteur : EHESP

Investigateur coordonateur : Dr Selva K Pillai Equipe : Dr. JY Siriez, CHU R Debré, Paris, Pr. J le Bras, Dr. E Kendjo, Dr. S Houzé, CNR Paludisme,

APHP, InVS, Paris France

Financement : Conseil Scientifique IMEA

Section analytique : 5LEB00

Objectif To identify severity risk factors for severe malaria in children below 18yrs travelling to Africa.

Materials and Methods

Data collected from reported malaria cases of 2,357 children below 18 years old, from 2006-2011 to Centre

National de Référence du Paludisme, throughout Metropolitan France were analysed for historically related travel habits, demography, practices and access to medical services. Multivariate logistic regression model

with best maximum likelihood and Goodness of Fit were used to assess severity outcome risks within three

separate groups (0-18 years as a single population, <12 years and those <5 years). Data was analysed using

STATA 11.0.

Results

In this study we demonstrated that analysing the multi factorial and caregiver dependent feedbacks for children <12 and <5 years old influenced their respective severity risk factors, that was not seen when

analysed as a single continuous <18 years population. Almost 97% (n=2287) travelled the African continent,

of which 94% (n=2216) to African countries historically-linked with France. There were 101 severe cases with a case fatality ratio of 0.17% over the study period. The 0-18 years group analysis revealed children of

expats/residents >6months had severity risks of OR 3.4 (95% CI: 1.39-8.30) and being born in endemic

countries confirmed a protective factor against severity in all 3 groups analysed. However, evaluation of <12

years old, surfaced the risk of severity associated with declaration of chemoprophylaxis intake with OR 3.08 (95%CI: 1.31-7.24), thus not fulfilling its protective role. Declaration of inappropriate doxycycline use <12

years old was also detected. Being <5 years old and being born in France conferred a protective effect of OR

0.15 (95% CI: 0.02-0.97) were both reassuring and a new contribution in understanding imported childhood malaria. Medical services were promptly used by caregivers in France with diagnostic services and treatment

initiated within the same day (mean 0.07 days, 95% CI: 0.05-0.95). Caregivers’ response accuracy of

providing date of symptoms onset, were validated through an innovative approach.

Publication

Pillai S, Siriez JY, Kendjo E, Houze S, Guérin P, Le Bras J.. Childhood imported malaria: could we have

suppressed risk factors in some children ? Challenges in malaria research, Basel, Oct 10, 2012. in: Malar J. v.11(Suppl 1); 2012 , P53. Published online 2012 October 15.

Calendrier : 2012 Elle a démarré en 2010 après acceptation par le comité d’éthique du Congo. Une première phase de l’enquête

de terrain s’est déroulée entre janvier et février 2011 et une seconde phase en août 2011. L’analyse des

données recueillies (observations et entretiens) s’est faite entre le second semestre 2011 et le premier semestre 2012.

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3474312/

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3474312/


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A-P RESISTANCE AMONG TRAVELLERS WITH FALCIPARUM MALARIA

TREATED IN FRANCE WITH MALARONE®, 2002-12.

Increasing reports of drug resistant Plasmodium falciparum throughout the world have forced changes in both

chemoprevention and treatment. There is an urgent need to identify antimalarial treatment regimes that best maximize the therapeutically useful life span of a drug, which would certainly be facilitated through a better

understanding of how resistance to drugs emerges. The current drug studied in this project, atovaquone-

proguanil (Malarone®), is particularly of great scientific interest as it is not only the first line prophylaxis for

travellers, but also one of the first line treatment regimes for uncomplicated Plasmodium falciparum in almost

most industrialised countries, while being scarcely used by populations in endemic areas. This unique position

for an antimalarial drug makes it possible, before drug resistance has spread widely, to assess the contributing

factors that lead to atovaquone-proguanil treatment failure.among infected patients returning to France. Such an analysis will be easier to conduct in those non- or little-immune patients because the lack of antimalarial

immunity eliminates a major confounding factor of the therapeutic response. The historical relationships

between several African countries and France have resulted in a large and steady influx of malaria cases being brought back to France from different parts of Africa, in particular. In addition, France is the only

industrialised country which has implemented a nation-wide and systematic data acquisition system for

epidemiological, biological and genetic parameters relevant to atovaquone-proguanil therapeutic response. As the number of available and efficient antimalarial drugs is shrinking, atovaquone-proguanil could prove a

valuable, ready-to-use alternative treatment option in endemic settings (van Vugt 2002, McGready 2005,

Hoyer 2012). We believe that clarifying the determinants of the therapeutic response to atovaquone-proguanil

will help to best manage its use and maximize its therapeutically useful life span.

Promoteur : IMEA

Investigateur coordonateur : Dr Selva k Pillai Equipe : Jérôme Clain, Véronique Hubert, Jacques le Bras, CNR Paludisme, APHP, InVS, France

Financement : OMS (phase 1) IMEA (phase2)

Section analytique : 5216LEBsas

Objectif There are a total of almost 7,000 patients treated with atovaquone-proguanil in this study population,

associated with 80 cases of late treatment failure or slow parasite clearance. There has not been any reported data of such magnitude within the malarial scientific research circle, and

these study findings will add new information and trend of antimalarial drug resistance. Knowledge of how

drug resistance emerges is crucial in planning new drugs or modifying both drug content and use, at a clinical

setting. Research questions that would be useful and would potentially explain the occurrence of atovaquone-proguanil treatment failures in France are divided into 4 areas: a) presence of Pfcytb268 plus Pfdhfr108+51/59 gene

mutations as a specific predictor of treatment failure associated with atovaquone-proguanil ; b)épidemiology

of the use of atovaquone-proguanil among travellers and health practitioners from the French experience, 2002-2012 ; c) risk factors (from the host and parasite) that influence late treatment failures with atovaquone-

proguanil – The French experience 2002- 2012 ; d) risk factors (from the host and parasite) that influence

slow parasite clearance with atovaquone-proguanil – The French experience 2002-2012 ; e) case report series of treatment failure associated with atovaquone-proguanil in France.

Calendrier : 2012-13 We started the project in mid November 2012 and we are now into data verification and detailed assessments

of both epidemiological, clinical parasite follow up and genetic data phase. We have progressed very well and

had made a substantial way to set the research questions in a systematic and coordinated manner.

2013 WHO funding will be used to ensure that all database framework, sample analysis (and verification) and data interpretation takes off well and results to be translated into formal research articles for peer review.


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EFFICACY OF CEFTOBIPROLE ALONE OR COMBINED WITH RIFAMPIN IN

A MODEL OF OSTEOMYELITIS DUE TO PVL-POSITIVE CA-MRSA

Promoteur : Janssen-Cilag

Investigateur coordonateur : Pr Anne-Claude Crémieux Equipe : A Saleh-Mghir, AC Crémieux (Responsable du projet), EA 3647 Université Versailles St Quentin,

Hôpital Raymond Poincaré, Garches

Gérard Lina, François Vandenesch, Jérôme Etienne INSERM, U851, Université Lyon 1, Centre, National de référence des Staphylocoques, Faculté Laennec, Lyon, F-69008 France

Financement : Janssen-Cilag

Section analytique : 4803CREmba

Objectif

Calendrier : 2010-12 (demande de prolongation pour l’aspect physiopathologique de l’infection)

Etat d’avancement déc. 2012

Etapes

- étude in vitro (CMI, études pharmacocinétiques) : fait - études thérapeutiques expérimentales : fait

- validation des résultats in vivo et recherche de mutants résistants dans les prélèvements osseux : en cours

- publication d’abstract à un congrès (ECMID 2011)

- rapport final : 2012

- publication scientifique d’une partie du travail dans une revue internationale :

Saleh-Mghir A, Dumitrescu O, Dinh A, Boutrad Y, Massias L, Martin E, Vandenesch F, Etienne J, Lina G, Crémieux AC.Ceftobiprole efficacy in vitro against Panton-Valentine leukocidin production and in vivo

against community-associated methicillin-resistant Staphylococcus aureus osteomyelitis in rabbits. Antimicrob

Agents Chemother. 2012 Dec;56(12):6291-7. Abstract: Community-associated methicillin-resistant Staphylococcus aureus (CA-MRSA) can cause osteomyelitis with severe sepsis and/or local complications in

which a Panton-Valentine leukocidin (PVL) role is suspected. In vitro sub-MIC antibiotic effects on growth

and PVL production by 11 PVL(+) MRSA strains, including the major CA-MRSA clones (USA300, including

the LAC strain; USA400; and USA1000), and 11 PVL(+) methicillin-susceptible S. aureus (MSSA) strains were tested in microplate culture. Time-kill analyses with ceftobiprole at its MIC were also run with LAC.

Efficacies of ceftobiprole (40 mg/kg of body weight subcutaneously [s.c.] four times a day [q.i.d.]) or

vancomycin (60 mg/kg intramuscularly [i.m.] twice a day [b.i.d.]) alone or combined with rifampin (10 mg/kg b.i.d.) against rabbit CA-MRSA osteomyelitis, induced by tibial injection of 3.4 × 10(7) CFU of LAC, were

compared. Treatment, started 14 days postinoculation, lasted 14 days. In vitro, 6/11 strains cultured with sub-

MICs of ceftobiprole produced 1.6- to 4.8-fold more PVL than did the controls, with no link to specific

clones. Rifampin decreased PVL production by all tested strains. In time-kill analyses at the LAC MIC (0.75 mg/liter), PVL production rose transiently at 6 and 8 h and then declined 2-fold at 16 h, concomitant with a 2-

log(10)-CFU-count decrease. In vivo, the mean log(10) CFU/g of bone for ceftobiprole (1.44 ± 0.40) was

significantly lower than that for vancomycin (2.37 ± 1.22) (P = 0.034), with 7/10 versus 5/11 bones sterilized, respectively. Combination with rifampin enhanced ceftobiprole (1.16 ± 0.04 CFU/g of bone [P = 0.056],

11/11 sterile bones) and vancomycin (1.23 ± 0.06 CFU/g [P = 0.011], 11/11 sterile bones) efficacies.

Ceftobiprole bactericidal activity and the rifampin anti-PVL effect could play a role in these findings, which should be of interest for treating CA-MRSA osteomyelitis.

- travaux en cours sur l’aspect physiopathologique de l’infection : publication prévue fin 2013 ou 1er

trimestre 2014.




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ETUDE SUR LA MUCOVISCIDOSE (CHU BICHAT-CLAUDE BERNARD)

Parmi les facteurs impliqués dans la physiopathologie des lésions pulmonaires de la mucoviscidose, un processus inflammatoire mal contrôlé est au premier plan, constitué d’une infiltration massive par des

polynucléaires neutrophiles (PN), un taux élevé d’élastase et un déséquilibre entre cytokines pro et anti-

inflammatoires. Un des mécanismes jouant un rôle majeur dans la bactéricidie médiée par les PN est la

production massive de formes réactives de l’oxygène (FRO) par la NADPH oxydase phagocytaire. Cependant, ces molécules bactéricides participent à la physiopathologie des maladies inflammatoires lorsqu’elles sont

produites de façon excessive. La régulation de leur production est donc un aspect essentiel du contrôle de la

réponse inflammatoire. Nous avons étudiés comme agents "inflammatoires" modulateurs du PN, 2 médiateurs majeurs de l'inflammation associée à la mucoviscidose, l'IL-8 et le LPS de Pseudomonas aeruginosa.

Promoteur : INSERM

Investigateur coordonateur : Pr Jamel El-Benna Phagocytes, cellules épithéliales et NADPH oxydases dans l’immunité innée et l’inflammation CRB3 (Pr MA Pocidalo) INSERM U773, Faculté de Médecine Xavier Bichat 16 Rue Henri Huchard 75018, Paris

Financement : Vaincre La Mucoviscidose

Section analytique : 4029/31ELBmba

Objectif Le but de notre projet était de décrypter les voies de signalisation impliquées dans les mécanismes de priming et/ou d'activation par l’IL-8 et le LPS de P. aeruginosa en relation avec les mécanismes de survie du

neutrophile soumis aux médiateurs de l’inflammation pulmonaire dans la mucoviscidose. Notre projet a porté

sur les neutrophiles de donneurs sains pour les analyses fonctionnelles in vitro puis sur les neutrophiles dans les poumons de patients atteints de mucoviscidose pour les marquages de PCNA en immunohistochimie.

Résultats obtenus :

1) le traitement des neutrophiles de donneurs sains par l'interleukine-8 (IL-8) induit un effet « primant » ou

potentialisateur de la stimulation de la production des FRO par le peptide d’origine bactérienne fMLP. Nous avons montré que cet effet de l’IL-8 est associé avec son effet sur la phosphorylation de la protéine p47phox

sur la Ser345. Nous avons aussi montré que le traitement des neutrophiles sains par le LPS de P. aeruginosa

seul induit une stimulation de la production des FRO de façon dose dépendante, alors que le LPS d’E. Coli n’a

pas d’effet direct sur la production des FRO. Le LPS de P. aeruginosa induit la phosphorylation de la protéine p47phox sur plusieurs sérines impliquées dans l’activation de la NADPH oxydase.

2) l'interleukine-8 a un effet inhibiteur de l'apoptose des neutrophiles alors que le LPS de P. aeruginosa ne

module pas cette survie; nous avons ensuite montré que cette survie des neutrophiles induite par l'interleukine 8 pouvait être inhibée par la roscovitine (inhibiteur des cyline-dépendante kinases) mais également par des

inhibiteurs des kinases ERK

3) qu'en incubant les neutrophiles avec de la xanthine et de la xanthine oxydase système acellulaire permettant

la génération d'anion superoxyde, la survie induite par inhibition de la NADPH oxydase était reversée, suggérant que l'anion superoxyde est responsable de cette induction d'apoptose sans nécrose.

4) une activation significative de la NADPH oxydase dont l'intensité était proportionnelle à la concentration

du peptide, mais 1000 fois inférieure à celle induite par le zymosan opsonisé ou le PMA. En conclusion, il existe une association fonctionnelle entre PCNA cytosolique et activation du

neutrophile sain modulable par l'IL-8 et le LPS de P.aeruginosa. Ce travail a permis d'identifier plusieurs

partenaires protéiques de PCNA, en particulier des protéines impliquées dans la défense anti-oxydante, en accord avec l'association PCNA/NADPH oxydase.


Publication :

Debbabi M, Kroviarski Y, Bournier O, Gougerot-Pocidalo MA, El-Benna J, Dang PM NOXO1

phosphorylation on serine 154 is critical for optimal NADPH oxidase 1 assembly and activation. FASEB J.

2013 Apr;27(4):1733-48. doi: 10.1096/fj.12-216432. Epub 2013 Jan 15.

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=Debbabi%20M%5BAuthor%5D&cauthor=true&cauthor_uid=23322165

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=Kroviarski%20Y%5BAuthor%5D&cauthor=true&cauthor_uid=23322165

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=Bournier%20O%5BAuthor%5D&cauthor=true&cauthor_uid=23322165

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=Dang%20PM%5BAuthor%5D&cauthor=true&cauthor_uid=23322165





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ROLE DES RECEPTEURS FC DANS L’ECHAPPEMENT BACTERIEN AU

SYSTEME IMMUNITAIRE

Promoteur : IMEA

Investigateur coordonateur : Pr Renato Monteiro Equipe : Renato Monteiro - PU-PH Immunologie Hôpital Bichat <[email protected]>

Sanae Ben Mkaddem - post doc, Nicholas Heming - médecin reanimateur - étudiant en thèse (financé par la

FRM), Lovely Perelus - secrétaire UNITE U699 INSERM – 16 rue H HUCHARD 75018 PARIS

Financement : Conseil Scientifique IMEA

Section analytique : 4030MONmba

Objectif 1) Caractériser l’interaction entre le S. pneumoniae et le CD89 ainsi que les conséquences de cette interaction sur :

- l’induction des voies de signalisation ITAM ou ITAMi en utilisant des souris transgénique pour le récepteur

CD89 humain. - l’invasion bactériennes ainsi que le retentissement sur les paramètres inflammatoires dan un model de

pneumopathie chez des souris transgénique pour le récepteur CD89 humain

2) D’identifier les différents motifs bactériennes susceptible d’interagir avec le CD89 afin de développer de

nouvelles thérapies pour la prise en charge du sepsis, soit en bloquant l’interaction bactérie-récepteur, soit en bloquant directement la voie de signalisation ITAMi.


Date de début 01/11/2011 ; date de fin prévue 01/11/2015

Résumé de l’état d’avancement au 31/12/2012 :

Nos résultats préliminaires montrent que les souris transgénique pour le CD89 sont protégées contre la

pneumopathie à S. pneumoniae, comparant avec les souris wild-type. Cet effet est associé à une

pneumopathie moins sévère sur le plan histologique et moins d’expression d’ARNm de cytokines pro-inflammatoires. En parallèle, les études in vitro montrent aussi que le S. pneumoniae est capable de lier

directement le CD89 (en absence de ligand spécifique pour le CD89). Par ailleurs, le S. pneumoniae ne se lie

pas à une protéine contrôle (Beta-synucléine). Nous montrons aussi que cette interaction directe induit une réponse inflammatoire indépendamment des récepteurs de l’immunité innée.

L’ensemble de ces résultats, nous permettent d’envisager des perspectives et des objectifs à court et à moyen

terme:

- déterminer d’une manière approfondie les différentes voies de signalisation (ITAM/ITAMi) induites par l’interaction CD89/bactérie ;

- confirmer les résultats concernant le rôle de CD89 dans l’induction de la réponse inflammatoire in vivo et in

vitro ; - identifier les différents motifs bactériens susceptibles d’interagir avec le CD89 en collaboration avec le

laboratoire de Pr. I. Velasco au Brésil.


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DEPARTEMENT DE MICROBIOLOGIE DE REFERENCE

.

ACTIVITE ET ORGANISATION DU DEPARTEMENT Responsable : Pr. François Simon Le Département à comme objectifs de promouvoir les activités inter-laboratoires Nord et Sud, particulièrement pour les évaluations des nouvelles technologies appliquées aux diagnostics microbiologiques

et de promouvoir les différentes procédures d’assurance qualité adaptées aux critères régionaux.

En parallèle avec leurs activités de recherche essentiellement translationnelles, les membres du département

de Microbiologie de référence assurent :

- L’évaluation de nouvelles technologies de type NGS et spectrométrie pour le diagnostic

microbiologique, - La mise en place des éléments de collecte et d’analyse pour la surveillance épidémiologique des

maladies infectieuses,

- La préparation des panels de références comme souches bactériennes, virales, parasitaires,

- La promotion de réactifs adaptés aux questions spécifiques des pays du Sud,

- La promotion de l’assurance qualité et de la formation aux nouvelles technologies, aux contrôles

microbiologiques et à la qualité. L’existence de laboratoires dont un L3, sont des atouts majeurs pour le département pour la formation et le

développement des activités spécialisées.

Deux structures sont hébergées par le département de microbiologie de référence de l’IMEA :

- le Centre National de Référence du Paludisme, par convention avec l’APHP, Hôpitaux Paris Nord VDS,

- le programme de surveillance mondiale de l’efficacité des antipaludiques WWARN, antenne de

l’Université d’Oxford, UK.

Par ailleurs, le laboratoire de microbiologie du CHU Saint Louis, en partenariat avec l’IMEA, prépare et distribue des souches et du matériel moléculaire de référence.

http://imea.fr/imea-recherche/imea-rba-chimiosenspalu.php

http://www.wwarn.org/


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ACTIVITE REFERENTE EN VIROLOGIE

ACTIVITÉS BIOPANEL (CHU SAINT LOUIS)

Promoteur : CHU St Louis

Investigateur : Pr François Simon

Financement Abbott molecular

Section analytique : 1823SIMsas

Objectif :

Production de réactif de laboratoire pour la détection des charges virales du Cytomégalovirus

Calendrier : permanent, début en 2011

Publication :

Fully automated quantification of cytomegalovirus in whole blood with the new sensitive Abbott RealTime CMV assay in the era of the CMV international standard.

Schnepf N, Scieux C, Resche-Riggon M, Feghoul L, Xhaard A, Galien S, Molina JM, Gérard Socié5, Glotz

D, Simon F, Mazeron MC, LeGoff

J.

Abstract: Fully standardized reproducible and sensitive quantification assays for Cytomegalovirus (CMV) are

needed to better define thresholds for antiviral therapy initiation and interruption. We evaluated the new

released Abbott RealTime CMV assay for CMV quantification on whole blood that includes automated

extraction and amplification (m2000 RealTime system). Sensitivity, accuracy, linearity and intra- and inter-assay variability were validated in whole blood matrix using quality control panels (QCMD) and the WHO

international standard (IS). Intra- and inter-assay coefficients of variation were respectively 1.37% and 2.09%

at 5 log10 copies/ml and 2.41% and 3.80% at 3 log10 copies/ml. According to QCMD and Abbott expected values the lower limit of quantification was respectively 104 and below 50 copies/ml. The conversion factor

between international unit and copies (2.18) determined from serial dilutions of the WHO IS in whole blood

was significantly different from the factor provided by the manufacturer (1.56) (p=0.001). Results from 302 clinical samples were compared to the Qiagen/artus CMV assay run on the same m2000 RealTime system.

The two assays provided highly concordant results (concordance correlation coefficient=0.92), but Abbott

assay had a significant better sensitivity with an increase of 23% and 50% of samples detected and quantified

respectively. The sensitivity and reproducibility results along with automation fulfill quality requirements to implement Abbott RealTime CMV assay in clinical settings. Our results stress out the need for careful

validation of conversion factors of the WHO standard in whole blood provided by manufacturers to allow

future comparison of results obtained with different assays.

EVALUATION DU TEST RAPIDE UNITAIRE ANTIGENE P24 IMACCESS

Promoteur : IMACCESS

Investigateur : Dr Marie Laure Néré, Pr François Simon

Financement : IMACCESS


Objectif Mise en place d’un test p24 de détection de l’antigène du VIH-1 adapté à l’Afrique et la pédiatrie en PED.

Avec la société IMaccess nous avons mis en place une étude de sensibilité de la détection des antigènes VIH


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avant et après décomplexation des liaisons antigène–anticorps sur un test unitaire rapide (Figure 12). Cette

évaluation originale repose sur l’utilisation d’anticorps recombinants produits

Etat d’avancement au 31/12/2012

Le travail initié en 2011 se base sur la détectabilité de l’antigène P24 sur des surnageants de culture de

différents sous-types du groupe majeur et du groupe O ainsi que sur des sérums de primo-infection de patients du CHU Saint Louis. La sensibilité du test est excellente sur les surnageant mais insuffisante sur les sérums.

La mise au point doit se poursuivre en 2013-2014 avec le soutien de IM Acces.

Tableaux de réactivités des surnageants de culture sur le test et de réactivités des sérums de primo infection VIH:

Vidas p24

SAMPLES Abott Roche pg p24/ml 15 min 30 min

1/10 256,6 L7 L8

1/100 31,3 L3/4 L4

1/1000 707 279 330420 < 3 L1 L3

1/2000 < 3 L1 L1

1/4000 < 3 L1 L1

1/10 log 8 log 7 301,9 L7/8 L9

1/100 log 7 log 6 35,8 L4 L5/6

1/1000 1 456 883 378536 < 3 L1 L3

1/2000 < 3 L1 L1

1/4000 < 3 L1 L1

1/10 log 8 log 8 > 400 L8/9 L10

1/100 log 7 log 7 65,9 L4/5 L5

1/1000 2 020 315 1 162 241

1/10 log 8 log 7 > 400 L8 L9

1/100 log 7 log 6 85,8 L4 L4/5

1/1000 2 236 604 279 399

YBF 16 - Group O (1/10 dilution in PBS, 1/100 dilution in HNS from 1/10 dilution)

BCF 178 - Group O (dilution in PBS)

BCF 003 - Group O (1/10 dilution in PBS, 1/100 dilution in HNS from 1/10 dilution)

Viral Load RDT 120411MB02

BCF 002 - Group O (dilution in PBS)

log 5

log 6


Bandelette détection Ag P24 RDT IM-Access


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EVALUATION DU TEST BIORAD GENIUS / GENIUS TM HIV ½

Promoteur : bioRad

Investigateur : Dr René Nabias, Pr François Simon

Financement : bioRad France


Objectif Evaluation du test « Geenius™ HIV 1/2 Confirmatory » (Geenius™) a été réalisée au laboratoire de virologie du CHU Saint-Louis de Paris les mois de juillet et août 2012 sur des prélèvements frais de routine et sur des

prélèvements congelés.

L’évaluation du « Geenius™ HIV 1/2 Confirmatory » montre la très bonne spécificité de ce test avec d’excellentes performances pour la confirmation et la différenciation des infections VIH 1 y compris le variant

groupe O et des infections VIH-2 à la fois sur le plasma et sur le sang total. L’utilisation du test Geenius™

combiné avec des examens moléculaires permet également d’entrevoir de nouveaux algorithmes pour la confirmation des VIH. Couplé à une charge virale sensible CE IVD*, le test Geenius™ couvre l’ensemble des

cas de figure rencontrés lors des infections par VIH et contourne les difficultés du dépistage liées à la primo

infection et aux variants. L’analyse par un lecteur avec capture d’image et interprétation automatique par le logiciel permet une bonne traçabilité et une interprétation simplifiée.

TABLEAU 100 ECHANTILLONS DE ROUTINE TESTES PAR GEENIUS™

Calendrier : 2012

RÉSISTANCE HERPES

Résistance a l’acyclovir du virus herpes simplex de type 2 après traitement court et prolongé chez les patients

infectés par le VIH en Afrique subsaharienne


Investigateur : Dr Jérôme Le Goff

Financement : Fondation de France

Section analytique : 1430LEGmba

Objectif

Objectif primaire


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Evaluer l’incidence des mutations de résistance à l’acyclovir des souches d’Herpes simplex virus de type 2

(HSV-2) chez des individus séropositifs pour le VIH après traitement court (« épisodique ») ou traitement prolongé (3 mois) (« suppressif ») par l’acyclovir ou sa pro-drogue le valacyclovir en Afrique subsaharienne.


- Identifier les facteurs associés à la sélection de mutations de résistance à l’acyclovir des souches HSV-

2, tels que l'antiviral utilisé, la posologie, la durée de traitement ou le niveau d'immunodépression. - Déterminer les profils de mutation de résistance à l’acyclovir des souches HSV-2 dans des populations

d’Afrique subsaharienne.

- Créer une base de données génotypiques qui servira à interpréter les mutations associées à la résistance des souches HSV-2

Calendrier : 2010-12 - Préparation et envoi des échantillons : nov 2010 – jan 2011

- Analyse des séquences du gène de la thymidine kinase : Dec 2010- Avril 2011 mois - Transfert de technologie aux partenaires en Afrique du Sud : Dec 2010

- Analyse des résultats : Mars – juin 2011

- Mise au point du logiciel d’analyse des résistances génotypiques avec la société Smartgene : Nov 2010 – Avril 2011

- Atelier de synthèse avec les principaux investigateurs : juin 2011

- Rapport final 2012

- Publication : courant 2013

Publication :

LeGoff J, Cherot J, Scieux C, Simon F. Détection et différenciation rapides de 22 pathogènes respiratoires par

le test SmartFinder. 30th RICAI 2010, Paris, France (oral).

BIOPLEX, NOUVELLE TECHNOLOGIE DE DÉPISTAGE VIH PAR LUMINEX


Investigateur : Dr Sarah Maylin, Pr François Simon

Financement : bioRad


Objectif Dans le cadre du marquage CE-IVD nous avons évalué en sérums et plasma humains, le système Bioplex

2200 HIV AG-AB-ASSAY permettant la détection simultanée qualitative et quantitative avec différenciation

de l’antigène P 24 d’une part , des anticorps HIV 1 (groupe M et groupe 0) et des anticorps HIV 2 d(autre

part. Les principaux résultats montrent d’excellentes performances. La première partie de l’étude prospective portait sur ses sérums frais dans le cadre du diagnostic VIH de

routine: 1505 échantillons frais ont été testés en Bioplex 2200 HIV AG-AB-ASSAY versus le test Architect

HIV /AB COMBO 4ème

génération en test de référence. La spécificité indique que parmi les 1470 sérums négatifs, seuls 7 ont été faussement réactifs répétable sur la phase HIV-1 anticorps et 1 sur la phase antigène P

24. Cinq de ces sept échantillons étaient également trouvés initialement réactifs sur le test Architect avec des

valeurs de réflectance très similaires. Les valeurs de ces fausses réactivités sont notoirement basse. L’ensemble des résultats indique une spécificité de 99.5% du Bioplex 2200 HIV AG-AB-ASSAY sur des

sérums frais de routine hospitalière. La sensibilité du Bioplex 2200 HIV AG-AB-ASSAY comparée par

rapport au test de référence est donc de 100%

Dans une autre étude , 420 sérums référencés comme HIV 1 positif de différents sous-types ont tous été reconnus par Bioplex 2200 HIV AG-AB. Différents sous-types « africains » sont représentés


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particulièrement les formes recombinantes majeures, souches très divergentes observées désormais en

région parisienne , infectant majoritairement des patients d’origine africaine. Huit plasmas de patients infectés par le VIH 1 groupe 0 ont tous été détectés. Ce panel de sérums pleinement réactif indique que le

test Bioplex 2200 HIV AG-AB-ASSAY montre une grande capacité de reconnaissance des différents sous

type VIH-1 y compris les plus distants. Les VIH-0 représentent les souches les plus distantes connues en

VIH-1. Le Bioplex 2200 HIV AG-AB-ASSAY sur sa phase VIH-O a reconnu ces 8 sérums , un sérum restant totalement négatif sur la phase M montrant l’importance d’inclure dans le test des peptides VIH-O

spécifiques. On note aussi une plus faible réflectance globale pour ces sérums que celles habituellement

observée pour les sérums du groupe Majeur ; 86 sérums appartenant à des patients infectés par VIH 2 et conservés à – 80° ont été testés et 78 sont fortement réactifs sur la phase VIH 2 exclusivement.

En conclusion, on soulignera la très bonne spécificité du test Bioplex, son excellente sensibilité égale à celle

de la référence Architect Abbott avec en plus l’intérêt de pouvoir différencier d’emblée la phase antigène P 24 des anticorps lors de la primo-infection.Un article est en cours de soumission.

Calendrier : 2012

PANEL D’ÉCHANTILLON DE DIFFÉRENTS VIRUS POUR MISE EN PLACE D’UNE QUANTIFICATION VIH-1


Investigateur : Pr François Simon

Financeument : GenProbe USA


Objectif Préparation d’un panel de virus de différents sous types VIH-1 pour la mise au point d’une nouvelle

technique de quantification VIH.

Deux cents échantillons ont été quantifiés, génotypés et calibrés selon le tableau en exemple ci-dessous.

Calendrier : 2012


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MÉTHODES ET LOGICIELS D’EXPLOITATION DES DONNÉES GÉNOMIQUES .

Promoteur : ANRS

Investigateur : Pr Jean-François Zagury

Equipe : Pierre Rucart, laboratoire génomique, bioinformatique et applications, CNAM (EA4627).

Financement : ANRS

Section analytique : 1326ZAGmba

objectifs : Pierre Rucart travaille sur 2 projets de génomique du SIDA: -le projet GRIV basé sur une cohorte de patients à profils extrêmes du SIDA (non progresseurs et progresseurs

rapides) dont les données de génoptypage haut-débi sont disponibles au Laboratoire.

-le projet IHAC qui est une méta-analyse de toutes les études génétiques d’association faites sur puces de génotypage dans le SIDA, pour trouver des gènes impliqués dans l’infection par le VIH-1.

En accord avec l’ANRS, Pierre Rucart a pris le relais d’Olivier Delaneau qui était initialement affecté à ces

projets.

Calendrier : 2011-12 1

er Janvier 2012, fin prévue le 31 Mars 2013.

Résumé de l’état d’avancement :

Au cours de la période du 1er

Janvier 2012 au 31 décembre 2012, Pierre a ré-analysé les données GRIV en utilisant des banques de données eQTL pour identifier des signaux enfouis parmi les résultats d’association

trouvés sur la cohorte GRIV. De nouvelels associations ont ainsi pu être identifiées.

Pierre a participé à l’analyse des données du projet IHAC qui a comparé les variants génétiques de 7000 sujets

séropositifs et de 10000 sujets contrôles, génotypés sur des plateformes Illumina ou Affymetrix.

Pour chacun de ces projets, une publication a été écrite. Une publication va ainsi être soumise dans Plos

Genetics, et l’autre est en cours d’évaluation dans Plos Pathogens.


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Identification des transcrits Ago2 et des miARN associés lors de l’infection par le VIH-

Promoteur : Sidaction

Investigateur : Pr Jean-François Zagury

Equipe : laboratoire génomique, bioinformatique et applications, CNAM (EA4627). Collaboration avec l’équipe INSERM U1016/CNRS UMR8104, Université Paris Descartes : Dr Stéphane EMILIANI , Dr

Sarah GALLOIS-MONTBRUN, et Dr Agathe ECKENFELDER.


Section analytique : 1327ZAGmba

objectifs du projet :

Identification des transcrits viraux et cellulaires pris en charge par Ago2 et des miARN associés lors de l’infection par le VIH. Damien Ulveling avait pour objectif de traiter les données issues du séquençage

Clip-Séq pour : 1- Identifier les miRNA mobilisés lors de l’infection par le VIH-1

2- Identifier leurs cibles et comprendre les voies touchées 3- Identifier les miRNA possiblement viraux et leurs cibles

Calendrier : 2011-12 du 1

er Octobre 2011 au 30 Septembre 2012.

Résumé de l’état d’avancement :

4 expériences indépendantes de HITS-CLIP d’Ago2 ont été réalisées dans des cellules 293T infectées ou non par le virus VIH-1 NL4.3. Les témoins des expériences correspondent à des extraits cellulaires totaux avant

immunopurification. Ces échantillons biologiques ont été envoyés pour séquençage par la plateforme

Genomix Montpellier, par la technologie Illumina (GA IIX). Le centre de séquençage nous a ensuite renvoyé

les séquences obtenues pour traitement bioinformatique. 70 millions de séquences ont été obtenues au total pour les 4 expériences de CLIP en conditions d’infection et

la même chose en l’absence d’infection. Pour les extraits cellulaires totaux ,avec ou sans infection, 90 millions

des séquences sont récupérées. Après nettoyage des séquences et alignement sur les génomes de références (Human hg19 et VIH pNL4.3),

nous avons obtenu:

1. pour les expériences non infectées (CLIP et INPUT) entre 70 et 80 % de séquences spécifique au génome humain (0,001 % sur le génome du HIV correspondant à des séquences non spécifique).

2. pour les expériences infectées (CLIP et INPUT) entre 70 et 75 % de séquences spécifique au génome

humain. Pour le génome viral, pour les INPUT entre 0,1 et 0,5 % de spécifiques alors que pour le CLIP entre

3 % et 5 %. Cela confirme un enrichissement des séquences virales entre les INPUT et les CLIP. Les séquences alignées sans ambiguïtés sur le génome humain sont annotées. Nous avons obtenu 20 % d'ARN

messager, 3 % de miRNA, et 5 % d’ARN divers. Entre 25 et 50 % correspondaient à de la contamination

fongique et bactérienne pour les expériences de CLIP, ce qui est courant (1 % pour les INPUT). A l'inverse, l'immunopurification permet d'enlever les séquences d'ARN ribosomique et de transfert (50 % des INPUT

contre 6 % des CLIP).

Les listes d'ARNm et miRNA doivent maintenant être intégrées et interprétées par l’équipe des biologistes de Cochin afin de répondre aux questions posées.


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ACTIVITE REFERENTE EN PARASITOLOGIE

CENTRE NATIONAL DE RÉFÉRENCE DU PALUDISME (CHU BICHAT-CLAUDE BERNARD)

Le Centre National de Référence du Paludisme (CNRPAlu) a été créé en 2006, par le regroupement du CNREPIA (Centre National de Référence de l’Epidémiologie du Paludisme d’Importation et Autochtone, créé

en 1985 par l’Université Pari6) et du CNRCP (Centre National de Référence de la Chimiosensibilité du

Paludisme, créé en 1984 par l’IMEA). L’IMEA est redevenu partenaire du CNR palu en 2009, par mise à sa

disposition de la moitié de la superficie de ses laboratoires. Le CNR paludisme analyse les déclarations des cas observés dans un réseau d’hôpitaux volontaires au

moyen d’un cahier d’observation informatique sur réseau internet sécurisé renseigné en temps réel. La plupart

des correspondants transmettent les souches du diagnostic et des cas d’échec au laboratoire du CNRpalu où sont réalisés les antipaludogrammes, les génotypages et les conservations en biothèques.

Promoteur : APHP Recherche clinique hôpitaux Paris Nord VDS

Investigateur coordonnateur : Pr Sandrine Houzé

Financement : Institut National de Veille Sanitaire

Section analytique : Le CNRpalu n’est pas en gestion IMEA mais bénéficie d’une mise à disposition par l’IMEA de 300m

2 de

laboratoires et bureaux

Objectif Les missions définies par l’InVS sont :

- assurer simultanément les missions de surveillance épidémiologique du paludisme d’importation,

d’appui à l’investigation des cas autochtones en France métropolitaine et d’évaluation de la chimiosensibilité des isolats de Plasmodium falciparum (P. falciparum) importés ;

- assurer un rôle d’alerte en cas d’émergence de situations inhabituelles ou nouvelles au plan

épidémiologique ou biologique ; - participer à l’expertise de nouveaux dispositifs médicaux de diagnostic du paludisme ;

- conseiller les autorités chargées de la Santé Publique sur les mesures de prévention et de traitement du

paludisme d’importation ;

- concevoir et mettre en œuvre, avec le soutien administratif et logistique de l’Institut de Veille Sanitaire et l’appui de sociétés savantes (Soc Pathol Infect LF, Soc Méd Voy, Soc Réanim LF, etc.), des

enquêtes ponctuelles permettant l'étude des facteurs de morbidité du paludisme d'importation (paludisme

grave, asymptomatique et/ou chronique, etc.).

Rapports d’activités

Les rapports d’activité des années 2001-10 sont consultables sur le site IMEA.fr


Publications 2012 :

Nationales

http://imea.fr/imea-recherche/imea-rba-chimiosenspalu.php


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Internationales :


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EVALUATION DU TEST ELISA MALARIA IGG

Promoteur : Biorad

Investigateur : Pr Sandrine Houzé

Financement : Biorad

Section analytique : 5319HOUsas

Objectif La sécurité transfusionnel du don du sang vis à vis du risque de paludisme transfusionnel est assurée par

l’interrogatoire des donneurs, l’éviction des donneurs voyageurs moins de 4 mois après leur retour de zone

d’endémie et la recherche d’anticorps anti-plasmodium dont la détection empêche la qualification du don. L’Etablissement de Transfusion Sanguine (EFS) recherche ces anticorps par une technique ELISA, avec un

réactif commercialisé par Biorad. La société Biorad qui commercialisait un coffret ELISA produit par la

société DIAMED, a dû trouver un autre partenaire quand la productrion de la société DIAMED a été stoppée.

La société BIORAD commercialise pour la recherche des anticorps anti-plasmodium un coffret ELISA produit par la société LAB 21 (UK). La société BIORAD nous a demandé d’évaluer la sensibilité et la

spécificité de ce nouveau test dans la déctection des anticorps anti-plasmodium sur plasmas ou sérums de

patients ayant fait un accès palustre avéré.

Etat d’avancement au 31/12/2012

La sensibilité et la spécificité du réactif a été évaluée sur des plasmas de patients ayant déclaré un accès

palustre à P. falciparum, P. vivax, P. ovale ou P. malariae. Les prélèvements inclus dans l’étude étaient contemporains du diagnostic de l’accès palustre ou prélevés sous traitement pour évaluer le délai de

séroconversion en cas de dépistage négatif sur le prélèvement contemporain du diagnostic.

Le réactif LAB 21 a été comparé au réactif précédemment commercialisé par Biorad, et à l’immunofluorescence indirecte sur antigènes de P. falciparum.

Les premiers résultats ont justifié la poursuite de l’étude sur des prélèvements de donneurs sains qui sera

terminée en 2013.

Les résultats sont confidentiels et ne peuvent être présentés dans ce rapport.



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RÉSEAU MONDIAL DE SURVEILLANCE DES RÉSISTANCES AUX ANTIPALUDIQUES (WWARN)

La résistance aux antipaludiques entrave le contrôle efficace du paludisme. L’émergence d’une

résistance à l’artémisinine en Asie du Sud-est impose de préserver les bi-thérapies à base d’artémisinine (ACTs) du paludisme à Plasmodium falciparum. Le Worldwide Antimalarial Resistance Network (WWARN)

travaille en collaboration avec le Programme mondial de lutte antipaludique de l’OMS sur un projet de 4 ans.

Promoteur : Université Oxford, UK

Investigateurs : Pr Carol Sibley, Seattle, Pr Jacques Le Bras, Paris

Financement Fondation BMGF

Section analytique : 5133LEBmba

Objectif Recueillir des renseignements et de les rendre accessibles à la communauté travaillant sur le

paludisme : optimiser le transfert de données, l’échange d’informations et développer des outils qui facilitent la surveillance de l’efficacité des traitements antipaludiques et de la résistance.Le premier outil, WWARN

Explorer, est un site qui permet de visualiser les données disponibles de manière simple et interactive

(http://www.wwarn.org/). La base de données sera en mesure de relier les quatre composants : clinique, in vitro, pharmacologie, marqueurs moléculaires.

Programme WWARN-IVT, IMEA

Nous développons des outils d’analyse statistique pour les mesures in vitro à l’IMEA et à Oxford en

partenariat avec l’INSERM (Pr F Mentré, http://www.antimalarial-icestimator.net/). La sensibilité du parasite P. falciparum aux médicaments peut être évaluée par des tests in vitro.

Déterminer la croissance du parasite hors de l’hôte humain permet d’éliminer les facteurs interférant

potentiellement avec la réponse clinique tels que le métabolisme et l’immunité du patient.

Les rôles importants du module in vitro sont :

- aider la communauté des chercheurs à harmoniser les méthodes de tests in vitro,

- créer des outils d’analyse et de téléchargement des données vers la banque de données WWARN,

- consolider les informations sur la sensibilité In vitro des parasites Plasmodium falciparum aux

différents traitements antipaludiques dans les isolats de patients,

- fournir des informations récapitulatives à jour au niveau régional et national,

- aider les chercheurs à produire des données de qualité permettant des comparaisons croisées,

- mettre à disposition des procédures opératoires standardisées, des tests de réactifs et des clones de référence pour servir de témoins,

- améliorer la communication entre les chercheurs, les programmes de lutte et les décideurs politiques.

- valider les données in vitro de la banque de données du réseau WWARN.

Le module In vitro est actuellement engagé dans un projet en collaboration qui entreprend la

surveillance vis-à-vis des cas de paludisme importés en Europe (France, Royaume-Uni et réseaux tropicaux européens) et Amérique du Nord (États-Unis et Canada). L’objectif est de déterminer si ces données de

surveillance peuvent contribuer à la détection de l’émergence de la résistance aux antipaludiques dans les

régions où la maladie est endémique et où des informations précises ne sont pas disponibles autrement.

L’IMEA héberge dans ses laboratoires le programme WWARN pour sa composante in vitro. En mai 2009 et juin 2011, le réseau WWARN a réuni le Comité consultatif technique (CCT) in vitro à l’IMEA à

Paris. Cette réunion a mis en évidence un besoin évident de se concentrer sur les contrôles de la qualité et

l’assurance de la qualité en interne. En réponse, le module In vitro a tenu un atelier technique visant à harmoniser les méthodes des différents laboratoires d’étude in vitro, en particulier en encourageant

l’utilisation du clone adapté en culture 3D7 comme témoin commun. Avec des paramètres clés communs pour

les tests in vitro et des mesures correspondantes de contrôle qualité, par exemple des clones de référence standard, il est possible de comparer les sensibilités in vitro obtenues dans différents laboratoires et dans un

même laboratoire au cours du temps. Les résultats contribueront à la compréhension de la résistance des

parasites et de ses profils géographiques et temporels.

En 2012, un logiciel de traitement des données en ligne a été finalisé grâce à un partenariat avec l’UMR S739 P7-INSERM et l’Université d’Oxford : IVART

http://www.wwarn.org/

http://www.antimalarial-icestimator.net/

http://www.wwarn.org/about-us/news/vitro-analysis-reporting-tool-ready-beta-testing


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Publications :

Gharbi M, Pillai DR, Lau R, Hubert V, Khairnar K, Existe A, Kendjo E, Dahlström S, Guerin PJ, Le Bras J.

Chloroquine-resistant Plasmodium falciparum malaria in travellers from Haiti after the 2010 earthquake. Emerg Infect Dis. 2012 Aug;18(8):1346-9.

Gharbi M, Flegg J, Hubert V, Kendjo E, Metcalf JE, Bertaux L, Guérin PJ, Le Bras J. Longitudinal study

assessing the return of chloroquine susceptibility of Plasmodium falciparum in isolates from travellers returning from West and Central Africa, 2000-2011. Malar J. 2013 Jan 25;12(1):35.

Woodrow C, Dahlström S, Cooksey R, Flegg J, Le Nagard H, Mentre F, Murillo C, Menard D, Nosten F,

Sripawat K, Musset L, Quashie N, Lim P, Fairhurst R, Nsobya S, Sinou V, Noedl H, Pradines B, Johnson J, Guerin P, Sibley C, and Le Bras J. High-throughput analysis of antimalarial susceptibility data by the

WWARN In Vitro Analysis and Reporting Tool (IVART). Antimicr Ag Chemother, 2013 Apr 22







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