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AI | Assistant en techniques biologiques profil n° : AI07-GAP-4
emploi-type n°: A3B03
Avignon concours : AIA07
Lieu du concours : Sophia-Antipolis
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: FICHE DE PROFIL || CONCOURS EXTERNES INRA 2007 :::::::
L’assistant en techniques biologiques choisit, adapte et met en œuvre des techniques spécialisées pour l’obtention et l’étude d’échantillons biologiques.
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n°BAP : A | Sciences du Vivant
Département : Génétique et Amélioration des plantes
unité n° 1052 | Génétique et Amélioration des Fruits et Légumes
Lieu de travail (si différent) :
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personne(s) à contacter : Mme CAUSSE 04 32 72 27 01
M. MUÑOS 04 32 72 28 04
Environnement :
L'activité s'exerce dans l'Unité de Génétique et Amélioration des Fruits et Légumes au sein de l'équipe "Bases Génétiques et
Moléculaires de la qualité des Fruits" sous la responsabilité d'un ingénieur, en étroite relation avec les autres agents de
l’équipe et des personnels non-permanents (étudiants en thèse, post-doctorants, chercheurs contractuels). Il/elle participera
aux taches collectives du laboratoire (commandes, entretien courant du matériel expérimental de l’appareillage) et à la mise
en place de l'assurance qualité en recherches.
Travail en laboratoire (plateau de biologie moléculaire du centre de recherche d'Avignon).
Manipulation de produits chimiques et de radioéléments.
Activités :
Conduire, en adaptant les conditions d’expérience, un ensemble de techniques de biologie moléculaire et génétique
moléculaire (marquage moléculaire, clonage de gènes, analyses d'expression) pour la réalisation de programmes de
caractérisation de gènes impliqués dans la qualité des fruits.
Rechercher la documentation scientifique.
Suivre les évolutions techniques du domaine.
Tenir un cahier d’expériences, recueillir et mettre en forme les résultats pour les transmettre.
Appliquer et faire appliquer en situation de travail les réglementations d’hygiène et de sécurité.
Se former et former les utilisateurs et stagiaires à la mise en œuvre des techniques et des appareillages.
Compétences :
Avoir des connaissances générales dans les différents domaines de la biologie, notamment en génétique.
Connaître et maîtriser la mise en œuvre d’un ensemble de techniques de la biologie moléculaire.
Connaître le principe et maîtriser l’utilisation et l’entretien des appareils spécialisés du domaine.
Savoir utiliser l’outil informatique pour le traitement et la gestion des données et le pilotage d’expériences.
Avoir des bases d'analyse de séquences nucléotidiques.
Savoir communiquer et interagir avec son environnement professionnel.
Connaître et savoir mettre en œuvre les réglementations du domaine en hygiène et sécurité, OGM, produits à risques
(isotopes…).
Connaître l’anglais technique du domaine.
Capacités personnelles :
Page 1 of 2INRA-DRH | Concours externes 2007
2007 | conception et réalisation : DRH & PSI
Diplôme réglementaire minimum exigé : BTS, DUT, DEUST.
Formation recommandée : biologie moléculaire, biotechnologie…
Aptitude au travail en équipe.
Permis de conduire VL.
Page 2 of 2INRA-DRH | Concours externes 2007
AI | Assistant en techniques biologiques profil n° : AI07-SPE-6
emploi-type n°: A3B03
Sophia-Antipolis concours : AIA07
Lieu du concours : Sophia-Antipolis
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: FICHE DE PROFIL || CONCOURS EXTERNES INRA 2007 :::::::
L’assistant en techniques biologiques choisit, adapte et met en œuvre des techniques spécialisées pour l’obtention et l’étude d’échantillons biologiques.
.......................................................................................................................................................................................................
n°BAP : A | Sciences du Vivant
Département : Santé des Plantes et Environnement
unité n° 1064 | Interactions Plantes-Microorganismes et Santé végétale
Lieu de travail (si différent) :
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personne(s) à contacter : M. PANABIERES 04 92 38 65 18
M. ABAD 04 92 38 64 02
Environnement :
Au sein d’une Unité mixte de Recherche INRA-CNRS- Université de Nice-Sophia Antipolis, l'agent sera affecté dans l'équipe
Interactions Plantes-oomycètes (12 agents permanents dont 6 chercheurs et enseignants-chercheurs), sous la
responsabilité de l’animateur de l'équipe. Son activité s'intégrera dans les programmes d'étude des déterminants du pouvoir
pathogène de l’oomycète Phytophthora parasitica. L'agent sera amené à interagir avec les autres chercheurs et techniciens
de l'équipe, notamment dans le domaine de la génomique fonctionnelle de Phytophthora. Ses fonctions impliqueront la
manipulation de plantes, d'organismes phytopathogènes (oomycètes), d'organismes génétiquement modifiés (bactéries,
plantes) et de produits toxiques et/ou radioactifs.
Activités :
Conduire, en adaptant les conditions d'expérience, un ensemble de techniques de biologie moléculaire.
Rechercher la documentation scientifique et suivre les évolutions technologiques du domaine.
Tenir un cahier d'expériences, recueillir et mettre en forme les résultats pour les transmettre.
Appliquer et faire appliquer en situation de travail les réglementations d'hygiène et de sécurité du domaine.
Se former et former les utilisateurs à la mise en œuvre des techniques et des appareillages.
Compétences :
Avoir des connaissances générales dans les domaines de la biologie.
Connaître la problématique scientifique du laboratoire.
Connaître et maîtriser la mise en œuvre d'un ensemble de techniques de biologie moléculaire.
Connaître le principe et maîtriser l'utilisation et l'entretien des appareils spécialisés du domaine.
Savoir rédiger ses résultats, synthétiser un compte-rendu d’expériences, dégager les conclusions.
Savoir utiliser l'outil informatique pour le traitement des données et le pilotage d'expérience.
Connaître l'anglais technique du domaine.
Capacités personnelles :
Diplôme réglementaire minimum exigé : DEUST, DUT, BTS.
Formation recommandée : biologie cellulaire et moléculaire.
Expérience souhaitée dans la mise en place d’interactions plantes-microorganismes (entretien du matériel végétal, rigueur
dans la mise en place des essais, sens de l’observation de symptômes).
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2007 | conception et réalisation : DRH & PSI
Connaissances générales en microbiologie et phytophathologie appréciées.
Forte capacité d'interaction avec des partenaires multiples (chercheurs, étudiants, techniciens).
Bon sens de l'organisation et autonomie.
Intérêt pour le développement des techniques récentes.
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CONCOURS AIA07
ASSISTANT EN TECHNIQUES BI0LOGIQUES
JUIN 2007
EPREUVE ECRITE
Durée 3 heures
Coefficient 3
Note aux candidats
L’usage des calculatrices n’est pas autorisé.
Aucun document n’est admis.
Répondre directement sur le questionnaire dans les espaces prévus à cet effet.
L’épreuve, notée sur 120 points, est composée de :
A. 12 questions à choix multiples [6 pts]
B. 15 questions appelant des réponses courtes [30 pts]
C. 8 problèmes et exercices [44 pts]
D. L’analyse d’un article [30 pts]
E. Une partie rédactionnelle [10 pts]
Attention : Afin de respecter l’anonymat, ne porter aucun signe distinctif (nom, prénom, etc)
sur les éléments rendus en correction, sous peine d’annulation de votre copie. A la fin de
l’épreuve, insérez votre questionnaire dans la copie d’examen qui porte votre nom cacheté.
A. Questions à choix multiples [6 pts]
Entourez la ou les lettre(s) correspondant à votre réponse. Plusieurs réponses par question
sont possibles.
1. [0,5 pt] L’obtention de protoplastes nécessite :
a. des enzymes de digestion du matériel pariétal
b. une agitation à 200 RPM
c. une solution hypo-osmotique
2. [0,5 pt] Une bactérie a un temps de génération de 30 min à 37°C. Partant d’une culture
contenant 106 bactéries/ml, quelle sera la concentration en bactéries/ml après 2 h ?
a. 1,6.107
b. 2.106
c. 4.106
d. 8.106
3. [0,5 pt] La Taq polymérase classique que l’on utilise lors d’une amplification PCR :
a. est fonctionnelle à 68°C
b. introduit environ une erreur toutes les 100 bases
c. introduit environ une erreur toutes les 1000 bases
d. ajoute une adenine à l’extrémité 3’ des fragments
4. [0,5 pt] La séquence nucléique GGATCC reconnue par l’enzyme de restriction BamHI est
présente dans le génome avec une fréquence statistique de :
a. 1/64
b. 46
c. 64
d. 1/46
e. qui dépend de la taille du génome considéré
5. [0,5 pt] Les isoschizomères sont des enzymes de restriction :
a. qui peuvent reconnaître les mêmes sites spécifiques
b. produites par une même bactérie
c. qui produisent uniquement des extrémités cohésives
d. qui clivent uniquement au niveau de sites de restrictions méthylés
6. [0,5 pt] Le numéro CAS d'un produit chimique correspond à :
a. son type de toxicité
b. sa nature chimique (acide, base, alcool,...)
c. son numéro d'identification
7. [0,5 pt] Qu'est-ce qu'un EPI :
a. un Equipement de Protection et d'Intervention
b. un Equipement Professionnel et Industriel
c. un Equipement de Protection Individuelle
d. un Equipement Personnel d'Intervention
8. [0,5 pt] La valeur de la densité optique de 50 µl d’une solution d’ARNm diluée 50 fois est
de 0,25. Quelle est la concentration de l’échantillon initial? :
a. 0,625 µg/µl
b. 500 ng/µl
c. 625 ng/µl
d. 5 µg/ml
9. [0,5 pt] Vous recevez un oligonucléotide sous forme lyophilisé. Le volume d’eau à rajouter
pour obtenir une solution à 100 µM est de 500 µl. Vous voulez cependant que la concentration
soit à 200 picomoles par microlitre. Le volume d’eau à rajouter pour mettre l’oligonucléotide
lyophilisé en solution à cette concentration est de :
a. 250 µl
b. 25 µl
c. 1 ml
d. ce n’est pas possible
10. [0,5 pt] Pour la manipulation de l’élément radioactif 32P, il faut utiliser :
a. une protection en plexiglas
b. une protection en plomb
c. une protection en aluminium
d. aucune protection
11. [0,5 pt] La tomate cultivée a un génome nucléaire dont la taille est de l’ordre de :
a. 150 Mb
b. 3000 Mb
c. 10000 kb
d. 1000 Mb
12. [0,5 pt] Parmi ces organismes unicellulaires, citez les eucaryotes :
a. Algues
b. Streptococcus aureus
c. Amibes
d. Echerichia coli
e. Saccharomyces cerevisiae
B. Questions appelant des réponses courtes [30 pts] Répondez à la suite des questions dans les emplacements prévus à cet effet.
B-1. [1 pt] Quels sont les critères de sélection d’un couple d’amorces pour une expérience de
PCR ?
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B-2. [3 pts] Vous avez à disposition les solutions stock suivantes :
Primer A à 10 µM
Primer B à 10 µM
ADNg à 10 ng/µl
dNTPs 4mM
Tampon réactionnel 10X
MgCl2 à 50 mM
Taq Polymerase 5U/µl
Pour chaque solution, indiquez les volumes à prélever pour réaliser une PCR dans les
conditions suivantes (volume final : 25 µl):
200 nM de Primer A : ……………………
200 nM de Primer B : ……………………
25 ng d’ADNg : ……………………
dNTPs à 200 µM : ……………………
Tampon réactionnel 1X : ……………………
2 mM de MgCl2 : ……………………
1U de Taq Polymérase : ……………………
H2O : ……………………
B-3. [2 pts] Les enzymes de restriction sont extraites de bactéries. Pourquoi ces enzymes ne
coupent-elles pas l'ADN de ces bactéries ?
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B-4. [2 pts] Quel est l’intérêt d’utiliser du formaldéhyde dans les gels utilisés pour faire
migrer les ARN ?
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B-5. [3 pts] Sachant que le génome d’Arabidopsis thaliana à une taille de 135 Méga bases,
déterminez le nombre de clones d’une banque BAC (taille moyenne des inserts : 135 kb)
nécessaire pour obtenir une couverture du génome de 10X :
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Combien de gènes (approximativement) codant des protéines ont été identifiés grâce au
séquençage du génome de Arabidopsis thaliana ?
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B-6. [3 pts] Vous désirez exprimer une protéine d’origine végétale dans un système bactérien.
Décrivez brièvement les principaux avantages et inconvénients de ce système d’expression.
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B-7. [3 pts] Qu’est ce qu’un marqueur moléculaire en génétique ? Citez deux exemples
d’expériences dans lesquelles on a recours à ce type de marqueur :
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B-8. [1 pt] Qu’est ce qu’un centimorgan ?
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B-9. [2 pts] Qu’est-ce qu’un pathosystème ? Citez trois exemples :
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B-10. [2 pts] Explicitez la différence entre un milieu de culture complexe et un milieu de
culture synthétique en microbiologie ?
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B-11. [1 pt] Qu’appelle-t-on CMI pour un antibiotique ?
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B-12. [2 pts] A quelle fin utilise-t-on les outils bioinformatiques suivants ?
TBLASTN : ……………………………………………………………………………………..
PubMed : ………………………………………………………………………………………..
B-13. [1 pt] Qu’appelle t-on « demi-vie » d’un isotope radioactif ?
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B-14. [2 pts] A quoi correspondent les sigles « Xi » « F» « Xn » « T+ » mentionnés sur les
étiquettes de certains produits chimiques ?
Xi : ……………………………………..…….F : …………………………………….
Xn : ……………………………………..……T+ : …………………………………….
B-15. [2 pts] Citez trois éléments mis en place dans la démarche « Assurance Qualité
Recherche » au laboratoire :
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C. Exercices [44 pts]
Exercice C-1 [5 pts] :
Vous disposez d’un alignement de cinq séquences de peroxydases exprimées chez une plante,
ainsi que des amorces indiquées (flèches A, B, ..., H) choisies d’après la séquence P2.
. . . .10 . . . .20 . . . .30 . . . .40 . . . .50 . . . .60 . . . .70 . . . .80 . . . .90 . . . 100
P2 ACGTTGTTTGGCAC.TAATAAATATTTATTGAGCACAGAGGCGAGGCATGCAAGCTGGGGCTGAAGATAGTGCTGGACTTTGTGCCGAACCATACGAGCA: 99
P5 .CGGAGTTTGGAACATATTAAATACTGATTGTGCACAGACGCGAGGCCTGTGCAGAGGGGCTCAAGCTAATCCTGGACTTTGTTCCGAACCACAGCAGCG: 99
P7 .CAGAGTATGGCACCATATCAGAATGCGATGAGCACAGAGGCGAGGCACGCGATTTGAATATGGAGGTAATTTTGGACTTCGTGCCCAATCACACCAGCG: 99
P8 .AGGAGTTTGGAACGATGGCAGTCTATAATGAGCACAGACGCGAGGCACTCGGGCTCGGCCTGAAGGTGATCATGGACTTTGTGCCGAACCATTCGAGCA: 99
P4 .CGGAGTACGGGACGTAAGAGAACTTTATTGAGCACAGAGGCGAGGCGTAGCGGCTCGGCATCAAGATCATCCTGGACTTTGTGCCCAATCACACGAGCG: 99
. . . 110 . . . 120 . . . 130 . . . 140 . . . 150 . . . 160 . . . 170 . . . 180 . . . 190 . . . 200
P2 ACAAGCACCAGAATTGGCAATCGGTGTTTTATGTCGCGAGGCGGGAGTGGGAGCGAGCTGCGCGGCG.GTACGTGGTGCACCAGGTCCCCAAAGAGCTGC:198
P5 ATGAAAGTGAGAACTGGGTGAGTGTCTTCCGTGTCGCAAGTCGGGAGTGGGA.CGACGTGCGGAAGGAGTACGTGGTGCACCAGGTCCTGGTTAAGCTGC:198
G7 ATGAGCACGAAAACTGGGTTAGCTTTTTCCGCGTCGCGAGACGGGAGTGGGG.CAAGACACGCAAGGAGTACGTGGTGCACCAGGTCCCGGTGGAGCGGC:198
G8 ATCTGCACGAGAATTGGGTAT...CCTTCCGTGTCGCGAGACGGGAGTGGGG.TGATCAGCGGCAACAGTACGTGGTGCACCAGGTCCCCGCCGAGCGAC:195
G4 ACCAGTGCGAAAATTGGGTAA....GTTTGGCGTCGCAAGGCGGGAGTGGGA.GGGCCGAGAAAAAAAGTACGTGGTGCACCAGGTCCC.ACCAAGCGAC:193
. . . 210 . . . 220 . . . 230 . . . 240 . . . 250 . . . 260 . . . 270 . . . 280 . . . 290 . . . 300
P2 GCGATCTGAACTATCGCAATCCGGCCGTCGTCGCCGAGTTCGACGATGTGCTGCGGTACTGGATGGAGCGCGGAGTGATGTTGTTAGACCTGGACGCGAT:298
P5 CCGATCAGAACTATCGCAATCCCGCGCTCGTACAAGAAATGAAAGACGTGATGACGTTCTGGCTTGGCAAAGGAGTGATGCTGTTAGGCCTGGTAGCCGT:298
P7 TGGTTTTAAACTACCGCAATCCAGCCGTCGTGGAAGCAATGAAAGACGTAATGCGATTTTGGCTGGGACGCGGAGTTATGTTGTTAGACCTGGAGGCGGT:298
P8 CGGACTTAAACTACCGAAATCCGACGGTCGTTCAGGAGATGAAAGATGTGCTGCTGTTCTGGCTGGGCAAGGGAGTGATGTTGTTAGGCCTGGCCGCCGT:295
P4 CGATCCAAAACTCCAGCAATCGGACAC.CGT.............GGTATTCTACGGTTCCGCCTGGACAGCGGAGTTATGTTGTTAGACCTGGGTGCGGT:267
. . . 310 . . . 320 . . . 330 . . . 340 . . . 350 . . . 360 . . . 370 . . . 380 . . . 390 . . . 400
P2 CAACCACATGTTCGAGC...ATCCGGACTTTATCG............ACGAGCGCGTTCTGTGGTTACATTCG.GATCCGAACAGCTACGGCTACCCGCG:382
P5 GCCGTATCTTTTTGAAT...CGCTGCCCGTTAATGGCGTGTATCCGGACGAGCGCGTTCTGTGGTTACATTTACGACCCAGACAATCCGACGTAGCTGGC:395
P7 GCCGACCTTGTTCGAAGTAGCGCCTGATGCCGATGGCCAGTACCCGGATGAGCGCGTTCTGTGGTTACATT.ATGACCCGGACGACCCTGGCTATCTGGT:397
P8 GCCGACGCTGTACGAAG...ATACGCAGCTGCGCG............ACGAGCGCGTTCTGTGGTTACATT.ATGATCCCGAAGATACCAGCTACCTGCG:379
P4 GGTAACTTTAAGCGCGC.................G................GCGCCTTCTGTGGTTACATTGATGTTTCTTGCAACTACTTCCAGCTCGA:334
. . . 410 . . . 420 . . . 430 . . . .
P2 CCACATCTACACGGCGGATCTGCCGGAAACGTACGAC.:419
P5 TCACCAGCACACAGCGAATCTAGATGAAACGTTCGAC.:432
P7 GCACATCTATACAGCGGATCGAAACGAAACGCTTGAT.:434
P8 CCACATCTACACGGCGGATCTGCCAGAAACGGTCGAG.:416
P4 AGACAACGCCAGAGCGTACCAGTGGCGAGCGCTGCTGG:372
Vous disposez des informations suivantes :
Amorce Nombre de
nucléotides Tm %GC Orientation
A 22 54,1 54,5 SENS
B 24 53,9 62,5 ANTISENS
C 23 56,5 47,8 ANTISENS
D 20 46,6 50 ANTISENS
E 22 59,2 68,2 ANTISENS
F 21 54,8 61,9 SENS
G 23 59,4 65,2 SENS
H 21 45,3 23,8 SENS
H A
G
F
B
E
C
D
1. Quel couple d’amorce vous semble le plus approprié pour amplifier au cours d’une
expérience de PCR l’ensemble de ces fragments, en vue de leur clonage ? Justifiez votre
choix.
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2. Ecrivez la séquence de l’amorce D comme vous le feriez pour en passer la commande :
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Exercice C-2 [6 pts] :
Phytopthora parasitica est un oomycète filamenteux pathogène d’un grand nombre d’espèces
de plantes cultivées (tomate, tabac,..). Vous étudiez les mécanismes permettant à P. parasitica
d’infecter son hôte et vous vous intéressez en particulier au gène JO1. Avant de démarrer une
étude détaillée de la fonction de JO1, vous souhaitez vérifier le profil d’expression de ce gène
afin de vérifier s’il est bien exprimé au cours de l’infection de la plante hôte. Vous optez pour
une analyse par northern blot.
1- Rappelez le principe de l’analyse par Northern blot. Quelle(s) précaution(s) devez-
vous prendre pour choisir votre sonde ?
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2- La figure C-2A montre les résultats de l’analyse après hybridation. Expliquez à quoi
sert l’utilisation de la sonde correspondant à l’ARN 28S de P. parasitica?
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- Analysez les résultats obtenus et concluez quand au profil d’expression du gène
JO1 :
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Exercice C-3 [6 pts] :
Vous travaillez sur la tomate et essayez de comprendre les mécanismes moléculaires
aboutissant au développement du fruit. Des analyses menées chez Arabidopsis thaliana ont
montré l’intervention des gènes CARP1 et CARP2 dans la mise en place du carpelle et vous
souhaitez vérifier si les résultats sont transposables à la tomate.
Vous démarrez votre étude par une analyse détaillée du profil d’expression des deux gènes
spécifiques de la tomate, CARP1 et CARP2 que vous avez préalablement clonés et séquencés.
Vous recherchez leur expression dans différents tissus et au cours du développement du fruit.
Figure C-2A : Analyse par Northern blot de l’expression du gène JO1.
Le Northern blot a été réalisé à partir d’ARN isolés de plants de tomate récoltés 0, 2 ou 4 jours
après inoculation avec P. parasitica (j0, j2, j4) ou de mycélium de P. parasitica cultivé sur milieu
complet V8, sur milieu complet T16 ou sur milieu complet T16 contenant des exsudats racinaires de
tomate (T16Tm).
L’hybridation a été réalisée avec une sonde correspondant soit à l’ARN ribosomique 28S de P.
parasitica (1) soit à un fragment du gène JO1 (2).
1 2
1- L’analyse par Northern blot n’a pas permis de détecter les transcrits correspondant
aux deux gènes. Formulez des hypothèses pour expliquer ce résultat.
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2- Vous réalisez une analyse par RT-PCR. Rappelez brièvement le principe de cette
technique et son intérêt dans le cas présent.
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3- La figure E3-A montre la position des oligonucléotides utilisés pour l’étude. La
figure E3-B schématise les résultats de la migration sur gel d’agarose des
fragments nucléiques obtenus par RT-PCR. Commentez les résultats.
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Figures E3-A et E3-B
Figure E3 : Analyse par RT-PCR des gènes CARP1 et CARP2.
A : Structure schématique des gènes CARP1 et CARP2. A, B, C, et D représentent les
oligonucléotides utilisés pour l’étude de l’expression par RT-PCR.
B : Les expériences de RT-PCR ont été réalisées avec les couples d’oligonuléotides
(A + B) ou (C + D).
Dans l’expérience (C + D), la PCR a été effectuée sur des échantillons ayant été soumis (+) ou
non (-) à une transcription reverse.
(1) Fleurs de tomate
(2) Pistils non fécondés
(3) Etamines
(4) Pistils 24h après fécondation
(5) Fruits 15 jours après fécondation.
1 2 3 4 5
A + B
200
400
500
600
700
800
900
1000
1200
pb
+ + +
C + D
- - -
1 2 3 4 5
+ - + -
200
400
500
600
700
800
900
1000
1200
pb
I1 I2 A
B
C
D Gène CARP1 Gène CARP2
200 pb I: intron
A
B
Exercice C-4 [10 pts] :
Vous travaillez chez un sélectionneur de semences de maïs et vous avez identifié parmi les
lignées dont vous disposez un génotype (Lignée 1) associé à la résistance au pathogène
Ustilago maïdis, un champignon qui entraîne des pertes de rendement importantes. Cette
résistance s’avérant particulièrement efficace et durable, vous décidez d’essayer d’identifier la
composante génétique de ce caractère.
1- Dans un premier temps vous devez analyser le déterminisme génétique de la
résistance portée par la lignée. Quelle procédure allez-vous employer ? Décrivez
les différentes étapes ainsi que les modes opératoires.
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2- Après croisement de la lignée 1 avec une lignée sensible, vous obtenez les résultats
suivants : Génération F1 : 986 descendants résistants.
Génération F2 : 762 descendants résistants, 264 descendants sensibles.
Quelle information ce type de données vous apporte sur le déterminisme génétique de
la résistance à U. maydis ?
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3- Vous recherchez des marqueurs moléculaires polymorphes entre les deux parents
(sensible et résistant), liés au gène de la résistance, à l’aide d’une technique faisant
appel à la PCR. La figure suivante schématise les résultats obtenus après migration
des fragments amplifiés sur gel d’agarose.
A B C D E F G
(R= lignée résistante ; S= lignée sensible)
Analysez les résultats :
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4- Vous étudiez en particulier les marqueurs B, C et G en analysant le profil de 200
descendants F2 qui présentent le phénotype sensible.
B C G
Nb d’individus présentant 104 96 1 199 9 191
chaque profil
Profils
- Analysez les résultats. Qu’en déduisez-vous pour la suite de votre étude ?
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R S R S R S R S R S R S R S
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5- Vous décidez d’utiliser le marqueur le plus proche de votre gène d’intérêt pour
identifier les séquences génomiques correspondantes. Comment allez-vous
procéder ?
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6- Afin de déterminer si le clone génomique que vous avez identifié contient votre
gène d’intérêt vous allez devoir effectuer un test de complémentation fonctionnelle.
Comment allez-vous procéder ?
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Exercice C-5 [ 5 pts] :
On souhaite étudier un marqueur moléculaire dont la séquence est :
AGGCTGACATATGGATAGCG
a. Ecrire la séquence inverse-complémentaire :
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b. L’enzyme de restriction NdeI reconnaît le palindrome CATATG et clive le brin
d’ADN après la première base A de la séquence. Ecrire les séquences des deux fragments
d’ADN bicaténaire issus de la digestion enzymatique par NdeI.
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c. On a séquencé la même région d’ADN chez un nouvel individu et obtenu la
séquence suivante : AGGCTGACAAATGGATAGCG
Définissez ce qu’est une mutation de type SNP. Identifiez-la (par une flèche) sur la séquence.
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Quel type de marqueur moléculaire permettrait de réaliser le génotypage rapide de cette
mutation ? Décrire brièvement les étapes.
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d. Ce marqueur moléculaire est-il dominant ou co-dominant ? Quel est l’avantage ?
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Exercice C-6 [3 pts] :
Vous avez préparé l’ADN génomique de 10 individus. La mesure de la concentration d’ADN
montre que neuf solutions sont à 500 ng/µl et une solution est à 250 ng/µl.
a. Citez 3 méthodes de dosage d’ADN.
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b. Comment feriez-vous pour que toutes les solutions d’ADN soient à la même
concentration ?
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c. Comment feriez-vous pour que toutes les solutions d’ADN soient à 500 ng/µl ?
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Exercice C-7 [5 pts] :
Vous disposez d’un flacon d’acide sulfurique (H2SO4) dont l’étiquette contient les
renseignements suivants :
densité : 1,83
solution à 95 %
MM = 98 g/mol
Quelle quantité doit-on prélever pour préparer 1L de solution 0,5 N ? Détaillez votre
raisonnement.
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Exercice C-8 [4 pts] :
Vous devez réaliser une électrophorèse sur gel de polyacrylamide pour séparer des fragments
d’ADN de 100 à 150 pb. Le résultat sera photographié sous UV. Quelles sont les précautions
à prendre en matière d’Hygiène et Sécurité et d’Assurance Qualité ?
Vous disposez des informations suivantes :
- Composition du gel de polyacrylamide :
Acryl/Bisacryl 40 %
TBE (Tris-Borate-EDTA)1X
APS (Ammonium Persulfate)
TEMED
- Migration à 400 V / 250 mA pendant 2 heures.
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D. Analyse d’un article [30 pts]
A partir de l’article proposé en Annexe 1 *, répondez aux questions suivantes :
1. Quel est l’objectif de cette étude ? [7 pts]:
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2. Quel est le but de l’expérience présentée sur la figure 1 ? Que peut-on en conclure ? [6 pts]
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3. Quel est le but de l’expérience décrite sur la figure 2 ? [7 pts]:
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* Non disponible
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4. Quel est le but de l’expérience présentée sur la figure 3 ? Quel en est le résultat ? [7 pts]:
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5. Quel est l’intérêt d’utiliser Arabidopsis thaliana dans cette étude? [3 pts]:
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E. Partie rédactionnelle [10 pts]
D’après vous, qu’apporte l’exploitation des données issues du séquençage des génomes dans
la compréhension des processus biologiques ? Argumentez (1 page maximum).
Le jury tiendra compte du fond, de la forme et de l’orthographe.
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COUCOURS AIA07 : ASSISTANT EN TECHNIQUES BIOLOGIQUES
EPREUVE ORALE
Temps de préparation : 15 minutes
Durée : 25 minutes ; coefficient 3
Question à préparer par les candidats :
Comment envisagez-vous votre travail au sein de l’équipe de recherche que vous souhaitez
intégrer ?
Vous justifierez également votre priorité ou absence de priorité sur un profil.
Temps de l’exposé devant le jury : 5 minutes (inclus dans les 25 minutes)
