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AnalysejourparjourdelapandémiedeCovid-19(coronavirusSARS-CoV-2)Misàjour:2020-09-1805:23:12(heuredeParis).

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AvertissementCesanalysessontproduitesentempsréelàpartirdessourcesdedonnéesofficiellesouvertesàtoussurlapandémiedeCovid-19liéeaucoronavirusSARS-CoV-2en2019-2020.Elless’appuientsurWorldometer(https://www.worldometers.info/coronavirus/),santépubliqueFrance(https://www.data.gouv.fr/fr/datasets/donnees-relatives-a-lepidemie-du-covid-19/)etcovid19-fr(https://github.com/bzg/covid19-fr.git).Enaucuncaslesanalysesnedoiventêtreprisescommedesencouragementsànepasrespecterlesinjonctionsgouvernementales:lasantépubliqueestuneaffairederéactioncoordonnée,personnenepeutsepermettrederéagirenfonctiondesapetiteinterprétation.

Plusgénéralement,lescommentairesn’engagentquemoi(CorentinBarbu(https://www.linkedin.com/in/corentin-barbu-a6787020/?originalSubdomain=fr)),etencore.Lescodessontdisponiblessurbitbucket(https://bitbucket.org/cmbce/covid19/)etlescorrectionsetsuggestionssontbienvenuessurcetteplateforme.Dansunsoucisdetransparence,lesanciennesversionsdecedocumentsontdisponibles(archives/).

ChiffresinternationauxVoirlescourbespourtouslespaysdumonded’aprèslecentreeuropéendecontrôledesmaladies(overallECDC.html)

NombredemortsAvantconfinement(pointssurlacourbe)lacroissancedunombredemortsestàpeuprèsunedroiteenéchelleexponentielle(lesrondsindiquentlesdatesdeconfinement):

Double-cliquersurunpayspourlevoirseulCliquersurunpayspourl’ajouter/leretirer

Enéchellelogarithmique,lacroissanceestaudébutunedroite.Letauxdecroissanceaudépartdel’épidémie(Nombredecasaujourd’huidiviséparlenombredecashier)estdel’ordrede1.2parjour,soitunemultiplicationpar6descas(oudesmorts,aumoinsendébutd’épidémie)en10jours.

Comparerdifférentspaysestunpréalablenécessairepouridentifierdebonsexemplesàsuivreetavoiruneidéedurisqueencouru.Pourcela,ilfautd’abordprendreencomptelatailledelapopulation.Onpeutdoncrapporterlenombredemortsàlatailledelapopulation,cequisecorrigefacilement:

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Txmortalité(pos)CoréeduSudTxmortalitépop.DiamondPrincessTxmortalitépop.LombardieAustraliaAustriaBelgiumBrazilCanadaChinaHubeiWuhanColombiaDenmarkFranceGermanyIndiaIranIrelandItalyMexicoNetherlandsNorwayPortugalRussiaSKoreaSpainSwedenSwitzerlandTurkeyUKUSA

Ratiodemortsdanslapopulationdechaquepays

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Chiffresinternationaux

Ilestaussinécessairedeprendreencomptelemomentoùl’épidémieadémarrée(arbitrairementici,dépassementd’unefractiondemortsdanslapopulation):

Enfin,ilfautprendreencomptel’effetdelastructured’âge(pyramidedesages)desdifférentespayscarletauxdemortalitéesttrèsdifférentsuivantl’âge(https://blogs.mediapart.fr/corentin-barbu/blog/090420/covid-19-la-grande-disparite-du-risque-lie-lage-suivant-les-pays).Pourcela,onrapportelenombredemortsàlapopulationtotalemultipliéeparlefacteurderisqueliéàl’age(https://blogs.mediapart.fr/corentin-barbu/blog/090420/covid-19-la-grande-disparite-du-risque-lie-lage-suivant-les-pays).

Onobserveunregroupementtrèsfortdespaysautour,ouendessous,delacourbedemortalitéobservéeàlavilledeWuhan.Plusonyregardedeprès,plusleschiffreschinoisressemblentàceuxdurestedumonde!

RisquesansconfinementCelapermetaussideréfléchiraunombredutauxdemortalitéetdoncdunombrededécèspouvantêtreatteintdansunpays.

Pouravoiruneidéeduplafondsansconfinement,onpeutrapporterlenombredemortsàlatailledelapopulation(tauxdemortalitéinduitpourunepopulation)etcomparerautauxdemortalitéinduitsurleDiamondPrincess(https://en.wikipedia.org/wiki/2020_coronavirus_pandemic_on_cruise_ships#Diamond_Princess)(0.003),bateauoù3711personnesontétémaintenusjusqu’àcequel’épidémies’achève(lesindiquéssontceuxdonnésau22mars).C’estunexempleoùilyaeuconfinementdanslesespacesprivés(cabines),maissurunbateaudoncdansunespaceoùlesépidémiessepropagentnormalementtrèsfacilement.

Unautrepointderéférencequipeutêtreprispourestimerletauxdemortalitéfinalpourl’ensembled’unepopulationestletauxdemortalitéparmilesgensdiagnostiquésenCoréedusudpuisqu’ilsontfaitunsuivitrèsétroitdelapopulation,danscecasonregardebienuntauxdemortalitéchezlesgensquidéveloppentlevirus,c’estdoncunmaximumsansconfinement(1.7%).Demanièresimilaire,onpeutregarderletauxdemortalitéparmilesgenstestéspositifssurleDiamondPrincess,soit11sur696cequidonneuntauxdemortsparmislestestéspositifsde1.6%,engardantentêtequelapopulationduDiamondPrincessétaitparticulièrementagéeetdoncparticulièrementsensibleparrapportàlapopulationdepays.

L’applicationdecesdeuxdernierstauxdemortalitécorrespondenvironà800000mortspourlaFrance.Cependantilestpeuprobablequeceniveausoitatteintenraison1)del’immunitédespopulations(pluslevirusatteintdegens,plusilyadepersonnesguériesquinepeuventpasretombermalades)2)dufaitquetoutlemonde,àprioriexposé,necontractepaslevirus,commesurleDiamondprincess(19%seulementsontdevenuspositifs)et3)desmesuresdeprotectionsprisesparlespays.IlparaîtplusraisonnabledeprendrecommemargehauteletauxdemortalitéglobalsurleDiamondPrincesscequidiminuel’estiméà198598soitdéjà19foisplusqueles10000mortsdelagrippe(https://www.cnews.fr/france/2020-03-18/la-grippe-saisonniere-est-elle-plus-dangereuse-que-le-coronavirus-932222)enmoyenneenFrancechaqueannée,àcompareraussiàlamortalitéenFrance,toutescausesconfondues(609648en2018(https://fr.wikipedia.org/wiki/Mortalit%C3%A9_en_France)).Lesmesuresdeconfinementdansdebonneconditions(passurunbateau)peuventcependantencorelargementaméliorercebilan.

RisqueavecconfinementLacourbedelaChineestunbonexempledel’effetduconfinement.LaChineainstaurétrèstôtàl’échelledupaysunconfinementtotaldelaprovinced’Hubei(58millionsd’habitants,soitl’équivalentdelaFrance)oùl’épidémieavaitéténégligéeaudépartdanslavilledeWuhan(11millionsd’habitants,soitl’équivalentdelarégionparisienne).L’isolementdeWuhanetpluslargementdeHubeidurestedupays,associéàbeaucoupdetestssuivisdequarantainesstrictesendehorsdelaprovincedeHubeiasauvélepays(pourl’instant).

Leconfinementàl’intérieurdeWuhanaaussiénormémentlimitélapropagationdanslaprovince,aupointque96%desmortsenChineétaientenfaitàHubei(https://www.aa.com.tr/en/asia-pacific/china-covid-19-deaths-continue-amid-slowing-spread/1768619),etprobablementàWuhanquiconcentredel’odrede75%desmortsdeChine(https://www.france24.com/en/20200305-china-wuhan-coronavirus-epidemic-hubei-quarantine-covid19).Pourcetteraison,surcegraphique,lesnombresdemortsdansHubeietWuhanlargementinconnus,sontapproximésparlenombredemortsenChine,cequiestaumoinsjustifiésil’onchercheàestimerunmaximumdutauxdemortalité.LetauxdemortalitéliéauvirusainsiestimépourlapopulationdelavilledeWuhanestbeaucoupplusélevéquepourlaChinemaisinférieurà3pour10000,soit100foismoinsquelesquelques%demortalitéparmilespositifsauSARS-CoV-2et10foismoinsquelamortalitésurleDiamondPrincess.

Nousavonsmisenplaceleconfinementuntoutpetitpeuplustôtquel’Italieentermesdeprogressiondel’épidémiedanslapopulation(parrapportàl’Italie:2joursou1.8foismoinsdemorts)maisàunstadesimilaireàceluidelavilledeWuhan(voirgraphiquedesratiosdunombredemorts).Vul’évolutionchinoisesurlemoyenterme,ondoitnéanmoinss’attendreàuneévolutionsimilaire.Enappliquantletauxdemortalitéestiméci-dessuspourlapopulationdeWuhanàlaFranceonobtient23565soit8à47foismoinsquesansconfinementd’aprèsnosestimésprécédents.Cetteestimationpourraitêtreaugmentéesileconfinementoulessoinsapportésauxmaladessontmoinsbonqu’enChinemaisdiminuésparcequeleconfinementacommencéunpeuplustôtparrapportaudéveloppementdel’épidémie.

Confinementfrançaisefficace?

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Morts/Popmettantladateà0pour5e-07morts/pop

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Morts/(Pop*risqueliéàl'age)mettantladateà0pour5e-07morts/pop

Joursaprès5e-07morts/pop

morts/(ta

illede

lapop

ulation*risq

ueliéàl'age

)

L’effetduconfinement,estclairementvisibleenFrance(https://blogs.mediapart.fr/corentin-barbu/blog/020420/leffet-du-confinement-est-detectable),voirci-dessous,d’unepartilyaretarddupic(rougepleinpicplustardetplusbasquerougepointillé)etlespointsdescendentnettementendessousdelacourbepointillée.Onnoteaussile“raccrochage”surlacourbeinitialementestiméelorsqueleschiffresdesEHPADontétéincorporés(2avril2020~jourépidémique64ci-dessous).Attentionsurcettecourbe,lesestimésdenombresdemortssansconfinementsnetiennentpasencomptequeleshopitauxauraientéténettementplusdébordésqu’ilsnel’ontété.Unesur-mortalitéimportante(25%?50%)auraitprobablementétéobservé,creusantbeaucoupladifférencedemortalitéavecetsansconfinement.Ilestaussipossiblequelenombredemortssansconfinementsoitlargementsous-estimé:ilestdifficiledeprédirelefutur,maisparfoisencoreplusdifficiledesavoir“cequiseseraitpassési”.

ProjectionsEnplusdeprendreencomptelesmortalitésobservéesenChineetenItalie,lemodèlebasique(SIR)ci-dessousprendencompteladifférencedestructured’ageentrelespaysquiauneffetmajeursurlamortalité(https://blogs.mediapart.fr/corentin-barbu/blog/090420/covid-19-la-grande-disparite-du-risque-lie-lage-suivant-les-pays)cequiaugmented’àpeuprès50%lamortalitéestiméedanslespayseuropéensparrapportàcequiétaitestimédanslaversionprécédentedumodèle.Onrestenéanmoinsdanslemêmeordredegrandeurparrapportaux500000mortspréditsparcertains.

Attention,lemodèleestencoretrès(trop?)simple,ilcolleremarquablementbienauxdonnéesmaisilneprendpasencomptedenombreuxparamètres:laprédictionestunartdifficile,surtoutquandelleconcernelefutur:-/

Attentionsuplémentaire,l’estimationneprendspasencompteuneaugmentationdelamortalitésiilyadépassementdescapacitésdusystèmedesanté.Encoreunefois,c’esttoutl’objectifduconfinement:ralentirlefluxdansleshopitaux,limiterl’excèsdemortalitéliéaudébordementdusystèmedesanté.Respectezlesconsiquesgouvernementalesetpourlespersonnesagéeséviterdefairelescourses(sansvousaffamer!).

Note,sivousvoulezcomprendrelemodèleSIR,vouspouvezjoueravecici(http://mpechaud.fr/scripts/SIR/SIR.html#simul).

Lagrandestabilitédescourbesaudelàde10morts(lignehorizontalegrise)estunargumentsupplémentairepouraffirmerquec’estlamanifestationd’unnombred’infectésbeaucouppluslarge.Letauxdemortalitéestiméestenvironde4.2pour10000danslapopulationtotaleàWuhan,cequiimplique2à3foisplusenEuropeétantdonnélastructured’âge(https://blogs.mediapart.fr/corentin-barbu/blog/060420/deconfinement-pas-de-panique)(làencore,àconfirmer,surtoutsileschiffresexcluentlapopulationlaplusàrisquedesEHPADetmaisonsderetraites!).Unpremierbrouillond’article,enanglais,estdisponible(https://ecosys.versailles-grignon.inra.fr/SpatialAgronomy/publications/Covid19-1/)ainsiqu’unarticledeblogmediapart(https://blogs.mediapart.fr/corentin-barbu/blog/310320/covid-19-il-faut-prendre-les-chinois-au-serieux-0?utm_source=twitter&utm_medium=social&utm_campaign=Sharing&xtor=CS3-67).

Cetauxestparailleursencontradictionflagranteavecleschiffresdesdernièrespublicationsscientifiques(https://www.thelancet.com/pdfs/journals/laninf/PIIS1473-3099(20)30243-7.pdf)d’aprèslesquellesletauxdemortalitégénéralestdel’ordrede0.657%à1,5%soit15,6foisplus!N’enconcluezpasquej’appuiedesthéoriesducomplot,ilyaprobablementdestrousdanslesrapportsdunombredemorts(etdesdifficultéesd’attribuerlesmortsdemanièrecertaineaucovid19)maispeuprobablementde1560%etsurtoutpasdemanièrecoordonnéesentrelesdifférentspays.Ilyaprobablementencoredeschosesàcomprendresurleschangementsd’échellesentrelessituationsdetransmissionétudiéesdanslesarticlesscientifiquesetlestransmissionsàl’échelled’unpays.

D’ailleurs,lesestimésdemortalitéparmilescaslorsqu’ilyadestestsbeaucoupplussystématiquessontdel’ordrede0.7%(0.7%àMarseille(https://www.mediterranee-infection.com/point-sur-lepidemie-de-covid-19-a-marseille/),0.6%enCoréedusuddanslespremiersjoursdel’épidémie).

Leconfinementdoitdurerjusqu’àcequelesystèmedesantésoitdenouveauàmêmedegérerlesnouveauxcas,ycomprissiilyarecrudescence.Entoutcas,leconfinementnepeutpasdurermoinslongtempsqueladuréenécessairepourquel’épidémies’éteigned’ellemêmesansaucunemesuredeprévention.Celareprésentedel’ordrede25joursàpartirdu23mars2020,soitle17avril2020encomptant1)untauxdecroissancestablejusqu’àlafin,et2)unnombredecontaminéréel20foissupérieuràceluiobservéau23mars2020).L’épidémienepeutsecalmeravantle17avril2020enFrance.

L’exempledelalevéeduconfinementàWuhansuggèrequ’unconfinementde2mois,suivid’undéconfinementprogressifestfaisable,cequilaissepenserqueledéconfinementàpartirdu11maienFranceétaitraisonnable,toutendevantêtreprogressivepouréviterunesecondevague(https://www.futura-sciences.com/sante/actualites/coronavirus-covid-19-retarder-seconde-vague-epidemie-80258/#xtor%3DRSS-8).

ConclusionMêmesilaCoréedusudaréussisansconfinementens’yprenanttrèsbienettrèstôt,nousn’avionspluslechoixàmi-marspourcontenirl’épidémie,etilfallaitfaireaussibienentermesdeconfinementquelaChine,cequenousavonsfait.Danstouslescasetquellequesoitl’évolutiondanslessemainesetlesmoisquiviennent,nousauronsunemortalitéannuelleliéeaux“virusd’hivers”(grippesetcoronavirus:ilyenad’autresencirculation)plusieursfoisplusélevéequed’habitude.

Chiffresnationaux(France)Pourlesnombresdenouveauxcas/morts/hospitalisations/réanimations,lescroixindiquentleschiffresdujour,leslignesbleuesindiquentlesmoyennesglissantessur7jours.Lesdroitespointilléesgrisesindiquentleconfinementetledéconfinement.

Note:Pourdesraisonsmathématiques(logarithmede0estinfinimentpetit)leséchelleslogarithmiquessontenfaitenlog(x+1):ilfautdoncajouter1auchiffredel’axeverticalpourtrouverlechiffrecorrect(1estenfait0,10estenfait9,1000estenfait999,etc.)

Franceentièrechiffresofficiels

ChiffresofficielsdestestsPCR

Chiffreshospitaliers##Warninginxy.coords(x,y,xlabel,ylabel,log):1yvalue<=0omittedfrom##logarithmicplot

Chiffresrégionaux(France)Lesdifférentesrégionsfrançaisesontdesniveauxd’infectionencoretrèsvariés,quecesoitennombreabsoluouenpourcentagedelapopulation.

LesnombresdemortsLadynamiquepourlenombredemortsparrégionestdisponibleseulementdepuisle18mars(etconcerneuniquementleshopitaux)maismontrelà-encoreunedynamiquesimilaireentrerégions.LeGrand-Estadépasséle23marslamortalitéobservéepourlapopulationpourl’ensembledeHubei,enrevanche,onvoitquelacourbes’amortitens’approchantdelamortalitédeWuhan,commeonpeuts’yattendred’aprèsl’analyseprésentéeplushaut.

Ceschiffresontparfoisunpeuderetard(jusqu’à72h),jelesmetsenligneslorsqu’ilssontdisponibles.Vouspouveznéanmoinslesvisualiserd’autresmanièressurhttps://www.gouvernement.fr/info-coronavirus/carte-et-donnees(https://www.gouvernement.fr/info-coronavirus/carte-et-donnees).

GraphiquesdesnombresdemortsL’indicateurretenupourlapremièrecourbeestlenombrededécèsparrapportaunombrededécéspotentiels,lenombrededécèspotentielsestlenombred’habitantsmultipliéparletauxdemortalitésitoutelapopulationaucontactduvirus,d’aprèsunarticlescientifiquedécrivantlamortalitéparclassed’age(https://www.thelancet.com/pdfs/journals/laninf/PIIS1473-3099(20)30243-7.pdf).

Lenombrededécèspourlespaysestlenombreofficielcommuniquéparlespays.Lenombrededécèsofficielparrégionn’estpasconnu,lenombrededécèsparrégionprésentéicicorrespondsoitaunombreofficieldedécèsenFrancedistribuéentrelesrégionsproportionellementàleurnombrededécèsenhopitaux(premiergraphique)soitaunombrededécèsenhopitaux(graphiquessuivants).

Plusieurspayssontmisàdispositionpourfaciliterlacomparaison.OnvoitainsiquelaBelgiqueconsidéréecommecatastrophiqueestenfaitmoinstouchéeparrapportàsonpotentielépidémiquequeleGrand-Estetsurtoutquel’Ile-de-France.

Parcontre,l’AllemagnedontlapresseaimeàchanterleslouangesaenfaitlamêmecourbequelaNouvelle-Aquitaine:touteslesdeuxtouchéesplustardellesontcommencéleurconfinementplustôtdansl’avancéedel’épidémieetontainsibeaucoupmieuxcontrolél’épidémie,c’esttout…

LaSuède,touchéetrèstardarejointetdépassébonnombrederégionsfrançaises:normalellenepratiquepasleconfinement.

Enfin,onpeutvérifierquesicertainesrégionsfrançaisesetlaBelgiquefontpirequeWuhan,cen’estnilecasdelamajoritédesrégionsfrançaisesnilecasdelamajoritédespays(l’Italiefaitnettementmieux).

Interprétation

Cumulés/décèspotentiels Cumulés/habitants Cumulés quotidien/habitants(lissage3jours) quotidien(lissage3jours)

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AuvergneRhoneAlpesBourgogneFrancheComteBretagneCentreValdeLoire

GrandEst

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NormandieNouvelleAquitaineOccitaniePaysdelaLoireProvenceAlpesCotedAzur

France

Ratiodécès/décèspotentiels

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poten

tiels

Lesrégionsfrançaisessuiventtoutesdesdynamiquesépidémiquesimilaires(courbesparallèles),àl’exceptiondelaGuyaneetdesîlescommelaCorse,laRéunion,laGuadeloupenotamment.L’IledeFrances’estaussidistinguéeenayantunecroissancebeaucoupplusrapidequirappellecelledelaBelgique,elleaussitrèsdensémentpeupléeetcomparableennombred’habitants.

Historiquementdevantennombredecascommeennombredemorts,leGrand-Estmarquemaintenantclairementunralentissement.Leconfinementapermisderalentirfortementlacroissancedanstouteslesrégions.OnnotecependantquelesrégionsPACAetCentre-ValdeLoire,initialementtrèspeutouchésparrapportàleurnombred’habitantsontrattrapéetdépasséesdenombreusesrégions.Loind’avoirpasséesleurpicépidémiqueellessontlespremièresdontlenombredemortsdevraitexploserencasdedéconfinementtroprapide.

Lesnombresdecas(archive)Lesnombresdecasayantétélespremierschiffrescommuniqués,cesontceuxsurlesquelsnousavonsleplusdereculàl’échellerégionale,enrevancheilsnesontplusdisponiblesdepuisle26mars2020,ilnesontdoncplusprésentésiciqu’àtitrehistorique.

DétailpardépartementChiffreshospitaliersetrésultatsofficielsdetestsPCRpardépartement(depIncid.html).

FAQCettesectionestnotammentalimentéeparlesquestionsdemesprochesoucellesreçuesparemail.Lesréponseslesplusrécentessontmisesenhaut:àconsulterrégulièrement:-)

Puis-jeêtreprotégésansavoird’anticorpsdétectés?Oui,biensûr.Lesanticorpssontcommelesballeslancéesparleslymphocytes.Cen’estpasparcequelesballesnesontpasvisiblesquevousn’avezpasleslymphocytescapablesdelancercesballes.Aprèsuneinfection,leslymphocytessélectionnéslorsdel’infectiondeviennentbeaucoupmoinsnombreuxmaisrestentprésentsetpourrontsemultiplierencasdebesoin(https://www.lesechos.fr/idees-debats/sciences-prospective/coronavirus-un-nouvel-espoir-pour-limmunite-a-long-terme-1234366).

Parailleurs,iln’yapasquelesanticorpsspécifiquespourcedéfendre,ilpeutyavoirdesanticorpsefficacesquiontétésélectionnéssurd’autrescoronavirus(parexempleledernierrhumequevousavezeu…)etl’immunitéinnée,quinefaitpasintervenird’anticorpspeutaussiêtretrèsefficace!

Lachargeinfectieusefait-elleunedifférence?Oui,àlafoissurlaprobabilitéd’êtreinfectéetsurlagravitédelamaladie.

Lachargeinfectieuseestlaquantitédevirusquel’onreçoitaumomentdel’infection.Lachargeinfectieusesuffisantepourinfecterquelqu’unvariesuivantlesvirusetlespersonnesmaisilestsûrquepluslachargeinfectieuseestimportantepluslaprobabilitédedevenirmaladeestimportante.

Deplusunechargeinfectieuseplusgrandeaugmentelerisquededévelopperuneformegrâvedelamaladie.Celaaétédémontrésurplusieursautrescoronavirusetautresviruspulmonairesetcommenceàl’êtrepourleSARS-CoV-2,cequiamèneplusieursexpertsàpenserquec’estaussilecaspourcevirus(https://www.sciencemediacentre.org/expert-reaction-to-questions-about-covid-19-and-viral-load/).

Lesmoyensdeprotectionpersonnelsetlesgestesbarrèresnonseulementréduisentlaprobabilitédetombermalademaisréduiraientdonclagravitédelamaladiesionl’attrape.C’estaussiimportantauniveaudel’immunitédelapopulationcarlagénéralisationdesmoyensdeprotectionaprèsledéconfinementréduiraitlenombredemaladiesgravesdonclesrisquesdesaturationdeshopitauxtoutenfavorisantlaconstitutiond’uneimmunitéàl’échelledelapopulation.Lespersonnessymptomatiquesayantdeschargesviralesplusimportantes,elles,devraientdanscecasresterconfinéespouréviterd’infecterd’autrespersonnesavecdefortesdoses.

Aquoiserventlesmasques?Ilyamaintenantdeplusenplusd’indicationsdelaprotectionapportéesnotammentparlesmasquespourréduireàlafoislavitessedelapropagationetlagravitédelamaladie(https://theconversation.com/masques-et-protection-inhaler-moins-de-coronavirus-signifie-tomber-moins-gravement-malade-144915).

Ilssontdescomplémentsimportantsdesgestesbarrières.Jedétailleetargumentelaréponsesurlabased’articlesscientifiquesici(https://blogs.mediapart.fr/corentin-barbu/blog/270420/quel-est-linteret-du-masque-artisanal-et-quel-cahier-des-charges):mêmeslesmasquesartisanauxsonttrèsutilescarilslimitentunpeul’inhalation,beaucouplatransmissiondepostillonsmaisaussiévitentdesegratterlenez!Unaspectimportantlorsquelessurfacesrestentinfectéesdesdizainesd’heures(https://www.sciencemediacentre.org/expert-reaction-to-questions-about-covid-19-and-viral-load/),àconditionbiensûrqu’ilsoitretiréavecprécaution(sanstouchernil’intérieurnil’extérieurdelasurfacefiltranteetenselavantsoigneusementlesmainsensuite).

Leportdumasque(aumoinsentissu,facilementréalisableàlamaison)estdoncàlafoisungesteciviqueprotégeantlesautresetunemesuredeprotectionindividuelle,uncomplémentprobablementutiledesgestesbarrièresindispensables:éternuerdanssoncoudeetselaverrégulièrementlesmains.Lemasquealternatifentissu,fait“maison”estutileaussimaisildoitêtrechangéetlavérégulièrement,enfaisanttrèsattentionenleretirantetlelavant(https://www.la-croix.com/Sciences-et-ethique/Sante/coronavirus-efficacite-masques-alternatifs-2020-04-16-1201089757?utm_source=newsletter&utm_medium=email&utm_content=20200421&utm_campaign=NEWSLETTER__CRX_SCIENCE_ETHIQUE_EDITO&PMID=70ad8cc5edf77b710c1a54d110d938e6&_ope=eyJndWlkIjoiNzBhZDhjYzVlZGY3N2I3MTBjMWE1NGQxMTBkOTM4ZTYifQ%3D%3D)

Risquedeséquellessurplusieursmois?Oui,ilyaunrisque,ycomprispourlespersonnesquin’ontpasétéhospitalisées.VoirlebilanpubliéparleVIDAL(covid_19_quelles_sequelles_a_long_terme_l_experience_du_sras_et_du_mers)surlesassociationsdemaladesdelaCovid-19etsurlesséquellesdesvirusproches(SRASetMERS),gardertoutdemêmeentêtequelessymptômesetlamortalitésétaientnettementplusimportantspourcesvirus.

Ya-t-ildesraisonsd’êtreoptimistesquandàlanon-arrivéed’unedeuxièmevague(8août)?Oui.Ilyaungrandnombredetenantsetd’aboutissantsquirendentuneréponsethéoriquedifficile(https://theconversation.com/covid-19-ce-qui-va-se-passer-a-lautomne-dependra-grandement-de-ce-que-lon-fait-aujourdhui-144914).Cependant,sil’onregardeleschiffresmondiaux(https://blogs.mediapart.fr/corentin-barbu/blog/070820/covid-les-tres-bonnes-raisons-detre-optimistes)unedeuxièmevaguedetaillecomparableàlapremièreàl’échelledupaysestassezpeuprobablesiilyaunminimumdemaintiendesgestesbarrièresetd’évitementdesgrandsrassemblements.

Peut-onvoirlescourbesdépartementales?Oui,maisseulementpourleschiffreshospitaliers(depIncid.html).

Mar12020

Mar8 Mar15 Mar221μ

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0.01AuvergneRhoneAlpesBourgogneFrancheComteBretagneCentreValdeLoireCorseGrandEstHautsdeFranceIledeFranceNormandieNouvelleAquitaineOccitaniePaysdelaLoireProvenceAlpesCotedAzurGuadeloupeGuyaneMartiniqueLaReunionSaintBarthelemyMayotteSaintMartin

Ratiocas/pop(échellelogarithmique)desrégionsfrançaises

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L’épidémien’est-ellepasentrainderedémarreravecuntauxd’hospitalisationsenhausse(30juillet2020)?Non,outrèsmarginalement.Ilyabienunelégèreaugmentationdeshospitalisationsparjourdepuismi-juillet,enplusdel’augmentationtrèsfranchedunombredecasdepuisfinmaimaiscettehausses’accompagneessentiellementd’uneaugmentationdunombrederetoursàdomicilesetnond’entréesenréanimation(etencoremoinsdedécèsquieuxcontinuentdedécroitre,saufpeut-êtredansle92ouàParisoùilyaunehaussetrèslente(depIncid.html)).

Est-cequel’épidémievaredémarrerenFrancemétropolitaine(7juillet2020)?Pasderedémarragedegrandeampleurauniveaunational,probablementlocalementdanslesrégionslesmoinstouchées.Parcontre,laGuyaneestactuellementarrivantàsonmaximumdetransmission.

Touslespaysourégionsdanslesquelsl’épidémiearedémarrersontdespaystrèspeutouchésparl’épidémie.Pourmémoire,laNorvègeest,au7juillet,15foismoinstouchéequelaBelgique,l’Allemagne7foismoins,lePortugal5foismoins(enproportiondelapopulationagée).Calaissedelamargepourredémarrerunenouvelleépidémie.Parcontre,laFranceaétémoinsde2foismoinstouchéquelaBelgiqueetl’Ile-de-FranceaétébeaucoupplustouchéequelaBelgique.LaSuèdequin’apasréalisédeconfinementmaisseulementétablidesgestesbarrièresestàpeuprèsaussitouchéequelaFrance(36%decasenplus)etvoitaussil’épidémiesérieusementralentir.

Danstouslespaysquiontététouchésprécocemmentetdoncpourquileconfinementn’aeuqu’uneffettardif(ralentissantsanséteindre),l’épidémiesemblelargements’êtrearrétéed’elle-mêmefautedepersonnessensiblesetledéconfinementn’aeuaucuneffetdiscernablesurlamortalitéoulesadmissionsenhopitaux.

EnFrance,laré-augmentationdunombredecas,trèsliéeàl’augmentationdunombredetestsnes’estabsolumentpastraduitenipardenouvellesmortsnipardenouvelleshospitalisations.

Uneattitudeprudenteetlemaintiendesgestesbarrièresentreinconnussejustifiepleinementmaissansverserdanslapsychosed’unenouvelleépidémiequiencombreraitnoshopitaux.Celanedoitpasfairenégligerlerisqueindividueldetombermaladesil’onvoyageàl’étranger(latransmissionestàsonpicdébutjuilletdansplusieurspaysdumondeetlespicsapprochentdansplusieursautres).Cependant,mêmesilenombredecasparjourn’ajamaisétéaussihautetaugmentechaquesemaineauniveaumondial,lenombredemortsnevoitluiqu’unrebondtrèsmodeste,35%inférieurauxmaximumsatteintslorsquel’Europeétaitencrise.Ouidetrèsgrandspays(Mexique,Brésil,Inde,…)sontaumaximumdeleurphaseépidémiquemaisilssontgénéralementmoinsdensémentpeuplés(moinsdetransmissiondoncmoinsdemalades)etleurpopulationestmoinsagée(doncmoinsdedécèsparmilesmalades).RestelagrandeinconnuedelaChinequipourl’instantalargementcontenuel’épidémiemaisdanslaquelleellegardeparconséquenttoutsonpotentiel…

DernierpointdevigilancepourlaFrancecependant:legrandchassécroisédesvacancesoùdesrégionspeudensesetdonctouchéesjusqu’àmaintenantvontvoirleursdensitésdepopulationexploser,favorisantgrandementlatransmission.Mêmedanscecas,lerisquerestecependantlimitéétantdonnéquelesestivantssonteuxdansunelargemesureenprovenancedecentreurbainsdéjàdurementtouchésetdonclargementimmunisés.

Cetteréponses’appliquepleinementpourcetteformeduvirus.Danslecas,peuprobable(voirplusbas)d’unemutationquirendraittoutlemondesensibledenouveau,lamaladiepourraitrevenir,voirdevenirendémique(revenirrégulièrement),maisc’estuneautrehistoireetçaresteaujourd’huiassezpeuprobable.

Commentest-ilpossiblequel’épidémies’essouffleavecsipeudepersonnespositivesautest?Probablementparcequedenombreusespersonnesnesontpassensiblesauvirus.Lesétudessérologiquesfontétatde10à20%depersonnesayanteulevirusenFrance.C’esttrèsinsuffisantpourarrêterunvirusaussicontagieux.C’estuncoronavirusparmidenombreuxautresetilyatrèsprobablementuneimmunitécroiséeimportante(voirplusbas):desgenssontaucontactduvirusmaisneledéveloppentpascarilsontdéjàdesanticorpscontreunautrevirusquilesprotègent,ilsnedéveloppentnilevirusnidesanticorpsspécifiques.Voirpouruneprésentationplusdétailléeetlescitationsd’étudesscientifiquescetarticledeOuestFrance(https://www.ouest-france.fr/sante/virus/coronavirus/coronavirus-une-immunite-basee-sur-d-autres-mecanismes-que-les-anticorps-serait-elle-la-cle-6929804)oucelui-ciparSciencesetAvenir(https://www.sciencesetavenir.fr/sante/immunite-croisee-le-rhume-pourrait-nous-proteger-du-covid-19_146550).

Quelimpactsurlamortalitégénérale?Lamortalitéaaugmentéauniveaunational,etdemanièredifférentesuivantlesclassesd’âges.Avec2niveauxprincipauxdemultiplicationdelamortalité:les45-69ansà+30%parjouraupicetles70-99ansà+60%parjouraupic,voirlescourbes(https://info.spatcontrol.net/covid19/overallECDC.html#surMortClasseAge)(lepicnedurantque2semaines).

Quelenjeupourledéconfinement?D’unecentaineàquelquescentainesdedécèsetplusieurscentainesdemilliersd’hospitalisations.(https://blogs.mediapart.fr/corentin-barbu/blog/260420/covid-19-deconfinement-quel-enjeu-de-sante-publique-en-france).

Ya-t-ilunmoyenpascherdesavoirlaproportiondelapopulationatteinteparlevirus?Oui,àpeuprès(https://www.insee.fr/fr/information/4470857#tableau-figure1_radio1).Ilsuffitdefaireunsondageendemandant“Avez-vousperdul’odoratoulegoûtoul’odoratdemanièretemporairedepuisle1erjanvier?”.Lespersonnesrépondantouionttrèsprobablementcontactélevirus.Parcontreseulement1/3despersonnesayantlevirusdéveloppecessymptômes.Doncilsuffitdemultiplierpar3lepourcentagedepersonnesrépondantouiàlapremièrequestionetonalepourcentagedepersonnesayantdéveloppélevirus(à15%près).

Leschiffresfrançaissont-ilsfiables?Oui,àpeudechosesprès.Pourlamortalitéd’uneépidémie,lejugedepaixestlasur-mortalitétellequ’ellepeutêtreévaluéeàpartirdeschiffresdel’étatcivil,compilésenFranceparl’INSEE.Ilssontsansappel,aprèssemble-t-ilunpetitretardàl’allumagelescomptagesnationauxsontenlignesavecleschiffresINSEE:

Voirl’articlecompletsurleblogmédiapart(https://blogs.mediapart.fr/corentin-barbu/blog/210420/covid-19-coherence-des-chiffres-francais-officiels-totaux-

hopitaux-et-insee).

LesgensquionteuleCovid-19sont-ilsimmunisés?Oui,trèsprobablement.Biensûrilpeutyavoirdesexceptionsavecdesgensquiretombentmalades,commepourtouteslesmaladies,cependant,les“amortissement”dunombredemortsquel’onobserveàl’échelledesdifférentespopulationssontsansappels:mêmesiilyadesconfinementspartoutilnepourraitpasyavoirceplafonnementsiiln’yavaitpasunelargeimmunisationdespersonnesquisonttombéesmalades.Deplus,levirusnesemblepourl’instantpasmutertantqueça,ilestdoncprobable(maispascertain)quel’immunisationdureuncertaintemps,sansdouteplusquepourlagrippe(https://www.livescience.com/coronavirus-mutation-rate.html).Encoreunefois,ontrouveratoujoursdescontre-exemplesavecdesgensquiretombentmalades,onparledebiologie,maisstatistiquementetàl’échelledelapopulation,ouiilyatrèslargementimmunisation,notezcependantlesdoutesduprésidentducomitéscientifiquenationalsurlesujet(https://www.la-croix.com/France/Covid-19-peut-etre-infecte-deux-fois-2020-04-20-1201090193?utm_source=newsletter&utm_medium=email&utm_content=20200421&utm_campaign=NEWSLETTER__CRX_SCIENCE_ETHIQUE_EDITO&PMID=70ad8cc5edf77b710c1a54d110d938e6&_ope=eyJndWlkIjoiNzBhZDhjYzVlZGY3N2I3MTBjMWE1NGQxMTBkOTM4ZTYifQ%3D%3D)

Ya-t-ilbeaucoupàespérerd’unvaccin?Non(entoutcaspasàcourtterme).Lesujetestbiendétailléparailleurs(https://www.mesvaccins.net/web/news/15315-covid-19-un-vaccin-va-t-il-nous-sortir-d-affaire).Enquelquesmotsletempsdedéveloppementd’unnouveauvaccinesttroplongetl’efficacitéencoursdepandémietropfaible(ilfautl’appliquertrèstôtdansl’épidémie).Desvaccinspourraientcependantêtreutilesencasde2ème(3ème)vaguesiellesn’arrivaientpastroprapidemment.

Ledéconfinementest-ilnécessairementdangereux?Initialementmaréponseétaitnoncarlapopulationauraitpuêtrelargementimmunisésil’onavaitattendusuffisamment(https://blogs.mediapart.fr/corentin-barbu/blog/060420/deconfinement-pas-de-panique).Maisvularepriseau11mail’immunisationquiprogressetrèslentementilvafalloirfairetrèsattentioncarletsunamiestpotentiellementdevant(https://blogs.mediapart.fr/corentin-barbu/blog/260420/covid-19-deconfinement-quel-enjeu-de-sante-publique-en-france).

Pourquoilespouvoirspublicsonteudumalàdimensionnerleurréaction?Fondamentalementparcequelesestimationsdemortalitévariaienténormément!Voircebillet(https://blogs.mediapart.fr/corentin-barbu/blog/030420/covid-19-le-difficile-dimensionnement-de-la-reponse).

Pourquoiest-cesidifficiled’avoiruncomptagedesmortsliésauCovid-19?Fondamentalementpourdeuxraisons:1)cevirusesttrèscontagieuxdoncunetrèslargefractiondelapopulationestinfectéeàdesniveauxdivers2)lamortalitéliéeauvirusresterelativementfaibleparrapportàlamortalitéliéeàd’autrescauses.

Cevirusesttrèscontagieux:del’ordrede50à80%delapopulation,danstouslespaysdumonde,devraitêtreinfectéeenquelquesmois(https://www.thelancet.com/pdfs/journals/laninf/PIIS1473-3099(20)30243-7.pdf).Auplusfortdel’épidémie,ilyadoncunefractionnonnégligeabledesmourantsquisontpositifsauvirusmêmesiilsmeurentd’autrechose.D’aprèslemodèleSIRprésentéci-dessus,laproportiondelapopulationinfectieusepourlevirusendébutavrilestdel’ordrede15%(Attention,cen’estqu’unordredegrandeurdansunmodèle!).Lesmourants,pourd’autresraisonsqueleCovid-19,ontdonceuxaussiuneprobabilitéde15%d’êtreinfectésauCovid-19.Leurprobabilitéestmêmeplushautecarilssontfragilesdoncpluspropiceàdévelopperdesinfectionsplusfortesetpluslongues,deplusilssontdansdeshabitatscollectifs(hopitaux)favorisantlatransmission.

LamortalitéannuelleenFranceestdel’ordrede600000personnesparan,soit11500parsemainesavecdesvariationssaisonnièrespouvantallerjusqu’à30%(https://statistiques.public.lu/catalogue-publications/regards/2016/PDF-12-2016.pdf).Enappliquantchaquejourlaprobabilitéd’êtreinfectédanslapopulationd’aprèslemodèleaunombredemourant“d’autreschoses”,onobtientqu’aumoins25%desgensmourantavecleCovid-19sontenfaitmortsd’autrechose.Cechiffreatoutesleschancesd’êtreunesous-estimation:1)lespersonnesmourantessontplusfaiblesimmunitairementetontplusdechancesdedévelopperlevirus2)lespersonnesmeurentsouventenhopital,unlieuoùlatransmissionestfacilitée.

IlyadonctoutesleschancesquelaproportiondepersonnesCovid+maismourantpourd’autresraisonssoitbeaucoupplusimportanteque25%.

Commentfaireletri?Encroisantleschiffresetnotammentenregardantl’augmentationgénéraledelamortalitéparrapportàlamortalitéhabituelleàcettesaison.C’estcequ’atrèsbienprésentéJérômeSalomon,ledirecteurgénéraldelasantéenFrancedanssonpointdu2avril2020.Enremontantentempsréelleschiffresdemortalitédel’Etatcivililindiqueainsipourlasemaine13unesurmortalitéde14%(~1610personnes)etpourlasemaine14unesurmortalitéde19%(~2185personnes),cequicollerelativementbienavecleschiffresprésentésparsantépubliquefrancepourlamortalitécessemaines,respectivement712et2164.Biensûr,pourlasemaine13ilyaunfossémaislesordresdegrandeursontlesbons,ilsontrattrapélecoupensemaine14ethonnêtementilsfontuntravailtrèsdifficile,ilfautunearméedegensquidoiventfairebienleurboulotdansdesconditionstrèsdifficilespourqueceschiffressoientprécis,encoreunefois,enépidémiologieentempsréelunfacteur2doitêtretoléré,surtoutmomentanément!Leschiffresdel’INSEEsontaussimaintenantdisponiblesentempsréel(https://www.insee.fr/fr/information/4470857#tableau-figure1_radio1).

Miseàjour2020-04-06:lesdonnéesINSEEsontmaintenantdisponiblesavecundécalaged’environunesemaine.Parailleurs,laLombardiequineplafonnetoujourspascomplétementatteintmaintenant8500morts,cequirapportéàlapopulationdelaLombardieetappliquéàlapopulationfrançaisecorrespondàplusde50000mortspourlaFrance.

Lesmesuresdesantépubliquessont-ellesefficaces?Enprenantuneapprocheunpeudifférenteetsurtoutenessayantdecomparerleseffetsdesdifférentestratégies,descollèguesdel’ImperialCollegeàLondres,montrentquecesmesuresontdéjàuneffetdétectable(https://www.imperial.ac.uk/media/imperial-college/medicine/sph/ide/gida-fellowships/Imperial-College-COVID19-Europe-estimates-and-NPI-impact-30-03-2020.pdf).

Faut-ilcroireleschiffreschinois?Oui,dumoinsenordredegrandeurautantqueleschiffresoccidentaux(https://blogs.mediapart.fr/corentin-barbu/blog/310320/covid-19-il-faut-prendre-les-chinois-au-serieux-0?utm_source=twitter&utm_medium=social&utm_campaign=Sharing&xtor=CS3-67)

Combiendepersonnesatteintesautotal?Cettequestionestimportantepourlaprédictiondelatrajectoiredel’épidémie.Eneffet,lespersonnesatteintes,mêmesaines,développentuneimmunitécontrelamaladie.Fautedepersonnesàinfecter,l’épidémievaainsis’éteindre,unjouroul’autre.Plusilyauradepersonnesatteintessainespourunmort,moinsilyaurademorts.

Lesdiagnosticssontfiablesmaisseuleunepetitepartiedesgensinfectéssonttestés,surtoutdanslespaysentrésenphase3quisedéfinitentreautreparl’arrêtdutestsystématique.Cependant,onpeutregarderdespaysquiontfaituntrèsgrandnombredetestsetregarderleurnombredepositifsparrapportaunombredemorts.LaCoréedusudmaintientactuellement(25mars2020)unnombredemortsetdecasparjoursstabledepuisplusieurssemainesetainvestitmassivementdanslediagnostique.Leurnombredecas(9332)est67foisplusélevéquelenombredemorts(139).Enconsidérantquelesnouveauxcasmettentenmoyenne15joursàmourir,ilfautcomparerlenombredemortsaunombredecasilya15jours(7869)cequidonne56.6foisplusdepositifsquedemorts.C’estaussicequel’onobtientpourlaNorvège(x57.1)quiaaussibeaucoupdiagnostiquéenfaisantlemêmecalcul.

Enutilisantceratio,onpeutestimerqu’ilyavaitenFranceilya15jours96672cas(1696x57)etnon2876.Ilya15joursnousnevoyonsdoncqu’uncassur33.6.Enappliquantbrutalementcenouveauratioaudécompted’aujourd’hui(29155cas)onobtient0.98millionsoupresque1personnesur60enFrance.C’estprobablementpluscarlacapacitédetestdevraitavoirbaisséavecl’avancementdanslaphase3.

D’autresélémentsvontdanscesens:onserendcomptequel’épidémieaprèsd’unmoisdeplusquelepremiercasofficiel(https://www.lemonde.fr/blog/huet/2020/03/26/le-coronavirus-en-italie-des-le-1er-janvier-2020/),d’aprèsuneétudeitalienne(https://arxiv.org/ftp/arxiv/papers/2003/2003.09320.pdf%),cequisuggèreaussiunetrèslargefractiondecasasymptomatiques,dumoinschezlapopulationjeuneetenbonnesanté.

Saturerlesystèmedesantéc’estgrave?(aquoisertleconfinement)Audelàdu“ouibiensûr”,laréponsemérited’êtrechiffrée.Unepersonneenréanimationatoutesleschancesdemourirsiellen’apasdeplace.PourchaquepersonneSARS-COV-2positivequimeureenréanimationilyaaumoinsunepersonnequin’ymourrapassielleestbientraitée.Saturergravementlesplacesenréanimationadonclepotentieldedoublerlenombredemorts.Pire,siles15-18%depositifsquin’ontpasbesoind’entrerenréanimationnesontpasbientraités,leursituationpouraitdégénérer,augmentantlesbesoinsdeplacesenréanimation.Parailleurs,ladésorganisationgénéraledel’hôpital,lesmaladieschezlessoignants,peuventaugmenterlamortalitécheztouslesautrespatientsdel’hôpital.

Leconfinementn’apaspourobjectifd’empêcherlesgensd’avoiruncontactaveclevirusmaisd’empécherd’avoircecontacttousenmêmetemps,pourl’instantc’estletourdespositifs“pré-confinements”,dessoignants,despersonnesdansl’alimentaireetlalogistique.Autraversd’euxilyaaussiunlienàleursfamillesetc.

AssezdeplacesenréanimationenFrance?Miseàjourdu10avril2020:Probablementàl’échelledelaFrancecarnoussommesentraind’atteindrelepicdemortalité(maxle14).Cettesituationdecontrôlen’estpermisqueparleconfinementquiadiminuélepicdel’ordrede75%,leconfinementdoitêtrepréservéaumoinsquelquesjoursdansleGrand-Estetjusqu’àfinavrildanslaplupartdesrégionspouréviterdespicsrégionauxdifficilementsupportablesparlesystèmedesanté(réponseprécédente:probablementnon(https://ecosys.versailles-grignon.inra.fr/SpatialAgronomy/covid19/archives/summary_2020-04-06_22-20-24.html#assez_de_places_en_r%C3%A9animation_en_france_)).

Risquedepénuriealimentaire?Réponsecourte:Onnerisquepasdemourirdefaim,parcontre,pourralentirlamaladieespacezaumaximumlessortiesaumagasin(avoir2-4semainesderéservesàlamaisonpourentoutcasnepassortirsivousêtesmalades).Lesagésnedevraientplussortirpourfairelescourses.

Réponselongue:Lenombredemaladesnedevraitenaucuncasdépasser10%delapopulationàunmomentdonné.Capeutinduireunesurchargedetravailpourlesautresmaisnormalementpasdedifficultésmajeuresd’approvisionnementd’unpointdevuelogistique.Lesagriculteurspeuventcontinueràexercer.Laseuledifficultéquejevoisestlarécoltepourlesproduitsfraisdesaison(voirlesappelsdugouvernement(https://www.lefigaro.fr/societes/le-gouvernement-appelle-ceux-qui-n-ont-plus-d-activite-a-rejoindre-l-armee-de-l-agriculture-20200324)),problèmeinduitparlafermeturedesfrontièresetnonparlenombredemalades.Ilpeutyavoirdesdifficultésd’approvisionnementceprintempspourlesproduitsfrais,plusgénéralementilpeutyavoirdesdifficultésavecdesproduitsd’importationmaislerestenedevraitpasposerproblème.

Parcontre,lescaissierssontdes“noeuds”classiquesdecontagionenépidémiologie.Ilfautdoncquevouslimitiezlespassagesaumagasin,pourvotrepropresantéetpourralentirl’épidémie.Etantdonnélerisqueimportantpourlespersonneslesplusagées(plusde65ansetsurtoutplusde80ans(https://urgences-serveur.fr/mise-au-point-quotidienne-sur-le-covid-19.html?lang=fr)),cespersonnesnedevraientplusfaireleurscourseselle-mêmesaujourd’hui.

L’étévaarrêterl’épidémie?Est-cequelestempératuresquiremontentpourraientfreinerl’épidémie?Pouravoiruneidéedel’impactdelatempératureonpeutregarder:

1. Lespaystropicaux:peudedonnéesencoredanslespaystropicaux,parcontreilyenadanslesrégionsfrançaised’outre-mer(Guyane,Guadeloupe,Martinique,laRéunion)etlescourbessemblenttrèssimilairesàcellesdesrégionsfrançaisesdemétropole.

2. Lespaysdansl’hémisphèresud:L’Australiecommenceaavoirdesmorts,pluslentementqued’autrespaysoccidentauxmaisc’estencoreletoutdébutdel’épidémiec’estpeufiable.

3. LespayspluschaudsenEurope:vuladynamiquedel’Italieetdel’Espagne,ilnesemblepasqueleurclimatpluschaudleursoitd’unegrandeaide.L’hétérogénéitédesréponses(faible)nesembleabsolumentpasliéeauclimat.

Conclusion:vul’évolutiondanslesrégionsd’outre-merilnefautpastropcomptersuruneaméliorationdelasituationaveclahaussedetempératures.Ilyacependantunarticlescientifiqueencoursdeparutionquimontrequelestempératuresetl’humiditéplusélevéespourraientaiderunpeu(https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0048969720322956).

Hommesàrisque?Oui,au25mars2019,enFrancedanslesdonnéeshospitalières,desantépubliqueleshommesreprésentent58.4%desmorts(2361/4040),ledéséquilibresemblecependantmoindrequecequiapuêtreobservéailleurs(https://www.sciencesetavenir.fr/sante/coronavirus-pourquoi-les-femmes-y-sont-moins-sensibles-que-les-hommes_142734).

Personnesagéesàrisque?Oui,principalementetcelainduitdesdifférencesimpressionantesdefacteurderisqueliéàl’agesuivantlespays(https://blogs.mediapart.fr/corentin-barbu/blog/090420/covid-19-la-grande-disparite-du-risque-lie-lage-suivant-les-pays)Lamortalitédépasse1%àpartirde60anspouratteindre10à20%audelàde80ans(https://twitter.com/AndyBiotech/status/1241741127205572609).Letauxdemortalitéestde0,2%chezlespatientsdemoinsde45ans,etlestrèsrarespersonnesdécédéesjeunessansautrefacteurderisqueavaientprobablementunautrefacteurderisqueinconnumalheureusementrévéléparlamaladie(http://theconversation.com/covid-19-qui-sont-les-plus-vulnerables-134412).Lesmeilleursestimésquejeconnaisse,parâgesontpubliésrécemmentdansunarticlescientifique(https://www.thelancet.com/pdfs/journals/laninf/PIIS1473-3099(20)30243-7.pdf).

Voiraussilessur-mortalitésparclassed’âgecalculésàpartirdesdonnéesfrançaises(https://info.spatcontrol.net/covid19/overallECDC.html#surMortClasseAge).

D’oùvientl’épidémie?DeChine,laquestionnedevraitpasseposermaislaChines’estlancédansunegrandeopérationdecommunicationpourminimiserpuis“exporter”l’affaireallantjusqu’àaccuserlesEtats-Unisd’êtreàl’originedel’infectionenChine.Cetteopérationdecommunicationnedoittromperpersonne(https://www.sciencesetavenir.fr/sante/coronavirus-comment-rumeurs-et-theories-du-complot-se-sont-mises-en-place-en-chine-une-chronologie-des-evenements_142502).

SurcettepageFréquencedemiseàjour?Leschiffressontmisàjouràminimalemercredisoir(jourpicdesmortalités)etlesvendredisoùleschiffresINSEEsontpubliés.Sivouslaconsultezlematinvousaureztoujourslaversionlaplusàjourdeschiffresdisponibles.

Parailleurs,lapagepeutêtreéditéeplusieursfoisparsemainepourajouterdesgraphiques,corrigerletexte,répondreàdesquestions(FAQ).

PourquoicettepageJ’aientendutellementde“onnesaitpas”,quejevoulaisfairelepointsurcequel’onsaitetmontrerquesil’onaaucunecertitudeonanéanmoinsunetrèsbonneidéedecequel’ontraverse.Entantquechercheurenépidémiologie(végétaleactuellementetnonspécialisédanslesmaladiesvirales)jeleprendscommeuneparticipationàl’effortd’informationdugrandpublic.

Commentparticiper?D’abordvouspouvezpartagerl’adressedelapagesurlesréseauxsociauxpourfaireavancerl’informationetreculerladésinformation.Ensuite,lescorrections,suggestionsetpropositionssontbienvenuessurbitbucket(https://bitbucket.org/cmbce/covid19/).Sivousêtesfamilieraveclaprogrammation(notammentR),vouspouvezvisualiserlescodessurcettemêmeplateforme(https://bitbucket.org/cmbce/covid19/)etproposervoscontributionsviadespull-requests.Destraductionspeuventaussiêtreenvisagées.

Sivousavezlapossibilitéd’hébergerlapagesurunserveuràfortebandepassantejesuisaussipreneur.Lespossibilitésdetraductionsserontaussiconsidérées.

PresseCitationsparAuroreMalvaldeNiceMatin(https://www.nicematin.com/sante/coronavirus-la-region-paca-est-elle-en-train-de-suivre-la-meme-courbe-epidemique-que-le-grand-est-489772)InterviewenespagnolpouruncanalYouTubemexicain:

MiprofedeRI:¿CÓMOCONTUVOELCORONAVIRUSEUROPA?(https://www.youtube.com/watch?v=uhT5Uu7eOu8)MiprofedeRI:ELCOVID-19ENEUROPA:COMPARACIÓNDEMODELOSEUROPEOSDELUCHACONTRAELCORONAVIRUS(https://www.youtube.com/watch?v=LBykmLII6Uo&lc=Ugz8tSkA672yC7k2cDR4AaABAg)MiprofedeRI:JAVIERALATORREDEBERÁCARGARCONMILESDEMUERTESENSUCONCIENCIA(https://youtu.be/4kmYI4W2VgY)ELCOVID-19DESDELAPERSPECTIVAFRANCESA,ENTREVISTACONELDR.CORENTINBARBU(1/2)(https://www.youtube.com/watch?v=nV7EPueiT4U&feature=share)IMPACTODELCOVID-19ENFRANCIA,EntrevistaalDr.CorentinBarbu(2/2)(https://www.youtube.com/watch?v=zjbSsApQquA)

Autressitesd’information

Quelquessitesoùilyadesinformations(souventdéjàcitésci-dessus):

Unsupersitedéveloppantlesdifférentespossibilitésetstratégiespossibles(français(https://catheu.tech/covid-19/),anglais(https://ncase.me/covid-19/))Décomptesparunsitechinois(http://ncov.dxy.cn/ncovh5/view/en_pneumonia?link=&share=&source=dxys)Worldometer(https://www.worldometers.info/coronavirus/)VisualisationspourlaFranceréaliséesparladirectioninterministérielledunumérique(https://dashboard.covid19.data.gouv.fr/)Modélisationsparuneéquipeuniversitairemontpelliéraine(http://covid-ete.ouvaton.org)