Le Villaret CARRTEL2092 route des Diacquenods BP 51174370 ST MARTIN BELLEVUE 74203 THONON LES BAINS

A CAUDRON A CHAMPIGNEULLE JP VULLIET

Rapport SHL 237-2003 Deacutecembre 2003FDP740306

Etude reacutealiseacutee avec la participation financiegravere de

Service de lrsquoEnvironnementBP 244474041 ANNECY

Evaluation de lrsquoefficaciteacute du repeuplement et comparaison des caracteacuteristiques des truites (Salmo trutta L) sauvages et introduites dans les riviegraveres de

Haute-SavoieCampagne 2002

Etude du stade 0+ dans le Borne le Giffre le Foron du Reposoir la Filliegravere et le Foron de Fillinges

05mm

Le Villaret CARRTEL2092 route des Diacquenods BP 51174370 ST MARTIN BELLEVUE 74203 THONON LES BAINS

A CAUDRON A CHAMPIGNEULLE JP VULLIET

Reacutefeacuterence agrave citer CAUDRON A CHAMPIGNEULLE A JP VULLIET 2003 Evaluation de lrsquoefficaciteacute du repeuplement et comparaison des caracteacuteristiques des truites (Salmo trutta L) sauvages et introduites dans les riviegraveres de Haute-Savoie ndash Campagne 2002 eacutetude du stade 0+ dans la Filliegravere le Borne Le Giffre le Foron du reposoir et le Foron de Fillinges Rapport INRA Thonon SHL 237-2003 - FDP740306 42 pages + annexes

Evaluation de lrsquoefficaciteacute du repeuplement et comparaison des caracteacuteristiques des truites (Salmo trutta L) sauvages et introduites dans les riviegraveres de

Haute-Savoie

Campagne 2002Etude du stade 0+ dans le Borne le Giffre le Foron du Reposoir

la Filliegravere et le Foron de Fillinges

RESUME

Une eacutetude pilote agrave grande eacutechelle spatiale et temporelle de fluoromarquage agrave lrsquoalirarine redS des otolithes de lrsquoensemble des alevins de truites introduits dans les cours drsquoeau de Haute-Savoie a eacuteteacute entreprise

Le preacutesent rapport preacutesente les reacutesultats de la campagne de preacutelegravevements 2002 reacutealiseacutee au stade 0+ sur 5 riviegraveres le Borne le Giffre le Foron du Reposoir la Filliegravere et le Foron de FillingesLa deacutemarche globale de cette eacutetude ainsi que la technique de marquage et la meacutethodologie sont preacuteciseacutement expliciteacutees

Lrsquoeacutevaluation de lrsquoefficaciteacute des pratiques de repeuplement sur les riviegraveres eacutetudieacutees a permis de mettre en eacutevidence une forte variation interstation des contributions des 0+ marqueacutes dans la population en place Sur les riviegraveres principales lrsquoalevinage montre ses limites et semble peu efficace pour soutenir les populations preacutesentes ou installer de nouvelles populations Cependant certaines populations isoleacutees sont entiegraverement soutenues par lrsquoalevinage (100 de marqueacutes au stade 0+)Sur les 37 stations eacutetudieacutees - 52 montrent un taux de marqueacutes infeacuterieur agrave 40

- 8 preacutesentent un taux de marqueacutes entre 40 et 60- 40 montrent un taux de marqueacutes supeacuterieur agrave 60 au stade 0+

La comparaison des caracteacuteristiques morphologiques entre individus sauvages et introduits montre qursquoau stade 0+ les individus marqueacutes ont une taille moyenne supeacuterieure agrave celle des individus sauvages Par contre la taille moyenne des nageoires pectorales est toujours proportionnellement plus grande chez les 0+ sauvages que chez les 0+ marqueacutes

Les observations reacutealiseacutees sur lrsquoeacutetat sanitaire des poissons indiquent que plusieurs riviegraveres semblent infesteacutees par la maladie PKD Cette maladie touche preacutefeacuterentiellement les individus naturels bien que sur certaines stations des poissons marqueacutes preacutesentent eacutegalement des symptocircmes pathologiques

De nombreux poissons sur plusieurs riviegraveres preacutesentent des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes Ces symptocircmes semblent toucher majoritairement les poissons introduits

Lrsquoensemble des reacutesultats obtenus permet de preacuteconiser des premiegraveres orientations de gestion bassin par bassin et de proposer certaines investigations compleacutementaires

SOMMAIRE

1 Mateacuteriel et meacutethode1

11 Preacutesentation geacuteneacuterale de la technique de marquage 1

12 Description preacutecise de la technique de marquage 2

13 Donneacutees de repeuplement 4

14 Echantillonnage en milieu naturel 4

15 Reacutecolte et analyses des donneacutees en laboratoire 5151 Caracteacuteristiques morphologiques et morphomeacutetriques 5152 Preacutesentation des otolithes 6153 Extraction et lecture des otolithes 7

16 Symptocircmes pathologiques observeacutees 9161 La maladie reacutenale prolifeacuterative (PKD) 9162 Pathologies bacteacuteriennes 10

17 Utilisation du SIG de la feacutedeacuteration de Pecircche 11

2 Reacutesultats et discussions 12

21 Taux de marquage sexe ratio et pathologie 12211 Le Borne 12212 Le Giffre 16213 Le Foron du Reposoir 22214 La Filliegravere 24215 Le Foron de Fillinges 28

22 Caracteacuteristiques morphologiques 31221 Longueur totale des individus 31222 Taille des nageoires pectorales 33

3 Premiegraveres implications pour la gestion 37

31 Bassin de Borne 37

32 Bassin du Giffre 38

33 Le Foron du Reposoir 39

34 Bassin de la Filliegravere 39

35 Le Foron de Fillinges 40

4 Investigations suppleacutementaires41

Bibliographie42

Le Villaret CARRTEL2092 route des Diacquenods BP 51174370 ST MARTIN BELLEVUE 74203 THONON LES BAINS

A CAUDRON A CHAMPIGNEULLE JP VULLIET

Reacutefeacuterence agrave citer CAUDRON A CHAMPIGNEULLE A JP VULLIET 2003 Evaluation de lrsquoefficaciteacute du repeuplement et comparaison des caracteacuteristiques des truites (Salmo trutta L) sauvages et introduites dans les riviegraveres de Haute-Savoie ndash Campagne 2002 eacutetude du stade 0+ dans la Filliegravere le Borne Le Giffre le Foron du reposoir et le Foron de Fillinges Rapport INRA Thonon SHL 237-2003 - FDP740306 42 pages + annexes

Evaluation de lrsquoefficaciteacute du repeuplement et comparaison des caracteacuteristiques des truites (Salmo trutta L) sauvages et introduites dans les riviegraveres de

Haute-Savoie

Campagne 2002Etude du stade 0+ dans le Borne le Giffre le Foron du Reposoir

la Filliegravere et le Foron de Fillinges

RESUME

Une eacutetude pilote agrave grande eacutechelle spatiale et temporelle de fluoromarquage agrave lrsquoalirarine redS des otolithes de lrsquoensemble des alevins de truites introduits dans les cours drsquoeau de Haute-Savoie a eacuteteacute entreprise

Le preacutesent rapport preacutesente les reacutesultats de la campagne de preacutelegravevements 2002 reacutealiseacutee au stade 0+ sur 5 riviegraveres le Borne le Giffre le Foron du Reposoir la Filliegravere et le Foron de FillingesLa deacutemarche globale de cette eacutetude ainsi que la technique de marquage et la meacutethodologie sont preacuteciseacutement expliciteacutees

Lrsquoeacutevaluation de lrsquoefficaciteacute des pratiques de repeuplement sur les riviegraveres eacutetudieacutees a permis de mettre en eacutevidence une forte variation interstation des contributions des 0+ marqueacutes dans la population en place Sur les riviegraveres principales lrsquoalevinage montre ses limites et semble peu efficace pour soutenir les populations preacutesentes ou installer de nouvelles populations Cependant certaines populations isoleacutees sont entiegraverement soutenues par lrsquoalevinage (100 de marqueacutes au stade 0+)Sur les 37 stations eacutetudieacutees - 52 montrent un taux de marqueacutes infeacuterieur agrave 40

- 8 preacutesentent un taux de marqueacutes entre 40 et 60- 40 montrent un taux de marqueacutes supeacuterieur agrave 60 au stade 0+

La comparaison des caracteacuteristiques morphologiques entre individus sauvages et introduits montre qursquoau stade 0+ les individus marqueacutes ont une taille moyenne supeacuterieure agrave celle des individus sauvages Par contre la taille moyenne des nageoires pectorales est toujours proportionnellement plus grande chez les 0+ sauvages que chez les 0+ marqueacutes

Les observations reacutealiseacutees sur lrsquoeacutetat sanitaire des poissons indiquent que plusieurs riviegraveres semblent infesteacutees par la maladie PKD Cette maladie touche preacutefeacuterentiellement les individus naturels bien que sur certaines stations des poissons marqueacutes preacutesentent eacutegalement des symptocircmes pathologiques

De nombreux poissons sur plusieurs riviegraveres preacutesentent des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes Ces symptocircmes semblent toucher majoritairement les poissons introduits

Lrsquoensemble des reacutesultats obtenus permet de preacuteconiser des premiegraveres orientations de gestion bassin par bassin et de proposer certaines investigations compleacutementaires

SOMMAIRE

1 Mateacuteriel et meacutethode1

11 Preacutesentation geacuteneacuterale de la technique de marquage 1

12 Description preacutecise de la technique de marquage 2

13 Donneacutees de repeuplement 4

14 Echantillonnage en milieu naturel 4

15 Reacutecolte et analyses des donneacutees en laboratoire 5151 Caracteacuteristiques morphologiques et morphomeacutetriques 5152 Preacutesentation des otolithes 6153 Extraction et lecture des otolithes 7

16 Symptocircmes pathologiques observeacutees 9161 La maladie reacutenale prolifeacuterative (PKD) 9162 Pathologies bacteacuteriennes 10

17 Utilisation du SIG de la feacutedeacuteration de Pecircche 11

2 Reacutesultats et discussions 12

21 Taux de marquage sexe ratio et pathologie 12211 Le Borne 12212 Le Giffre 16213 Le Foron du Reposoir 22214 La Filliegravere 24215 Le Foron de Fillinges 28

22 Caracteacuteristiques morphologiques 31221 Longueur totale des individus 31222 Taille des nageoires pectorales 33

3 Premiegraveres implications pour la gestion 37

31 Bassin de Borne 37

32 Bassin du Giffre 38

33 Le Foron du Reposoir 39

34 Bassin de la Filliegravere 39

35 Le Foron de Fillinges 40

4 Investigations suppleacutementaires41

Bibliographie42

RESUME

Une eacutetude pilote agrave grande eacutechelle spatiale et temporelle de fluoromarquage agrave lrsquoalirarine redS des otolithes de lrsquoensemble des alevins de truites introduits dans les cours drsquoeau de Haute-Savoie a eacuteteacute entreprise

Le preacutesent rapport preacutesente les reacutesultats de la campagne de preacutelegravevements 2002 reacutealiseacutee au stade 0+ sur 5 riviegraveres le Borne le Giffre le Foron du Reposoir la Filliegravere et le Foron de FillingesLa deacutemarche globale de cette eacutetude ainsi que la technique de marquage et la meacutethodologie sont preacuteciseacutement expliciteacutees

Lrsquoeacutevaluation de lrsquoefficaciteacute des pratiques de repeuplement sur les riviegraveres eacutetudieacutees a permis de mettre en eacutevidence une forte variation interstation des contributions des 0+ marqueacutes dans la population en place Sur les riviegraveres principales lrsquoalevinage montre ses limites et semble peu efficace pour soutenir les populations preacutesentes ou installer de nouvelles populations Cependant certaines populations isoleacutees sont entiegraverement soutenues par lrsquoalevinage (100 de marqueacutes au stade 0+)Sur les 37 stations eacutetudieacutees - 52 montrent un taux de marqueacutes infeacuterieur agrave 40

- 8 preacutesentent un taux de marqueacutes entre 40 et 60- 40 montrent un taux de marqueacutes supeacuterieur agrave 60 au stade 0+

La comparaison des caracteacuteristiques morphologiques entre individus sauvages et introduits montre qursquoau stade 0+ les individus marqueacutes ont une taille moyenne supeacuterieure agrave celle des individus sauvages Par contre la taille moyenne des nageoires pectorales est toujours proportionnellement plus grande chez les 0+ sauvages que chez les 0+ marqueacutes

Les observations reacutealiseacutees sur lrsquoeacutetat sanitaire des poissons indiquent que plusieurs riviegraveres semblent infesteacutees par la maladie PKD Cette maladie touche preacutefeacuterentiellement les individus naturels bien que sur certaines stations des poissons marqueacutes preacutesentent eacutegalement des symptocircmes pathologiques

De nombreux poissons sur plusieurs riviegraveres preacutesentent des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes Ces symptocircmes semblent toucher majoritairement les poissons introduits

Lrsquoensemble des reacutesultats obtenus permet de preacuteconiser des premiegraveres orientations de gestion bassin par bassin et de proposer certaines investigations compleacutementaires

SOMMAIRE

1 Mateacuteriel et meacutethode1

11 Preacutesentation geacuteneacuterale de la technique de marquage 1

12 Description preacutecise de la technique de marquage 2

13 Donneacutees de repeuplement 4

14 Echantillonnage en milieu naturel 4

15 Reacutecolte et analyses des donneacutees en laboratoire 5151 Caracteacuteristiques morphologiques et morphomeacutetriques 5152 Preacutesentation des otolithes 6153 Extraction et lecture des otolithes 7

16 Symptocircmes pathologiques observeacutees 9161 La maladie reacutenale prolifeacuterative (PKD) 9162 Pathologies bacteacuteriennes 10

17 Utilisation du SIG de la feacutedeacuteration de Pecircche 11

2 Reacutesultats et discussions 12

21 Taux de marquage sexe ratio et pathologie 12211 Le Borne 12212 Le Giffre 16213 Le Foron du Reposoir 22214 La Filliegravere 24215 Le Foron de Fillinges 28

22 Caracteacuteristiques morphologiques 31221 Longueur totale des individus 31222 Taille des nageoires pectorales 33

3 Premiegraveres implications pour la gestion 37

31 Bassin de Borne 37

32 Bassin du Giffre 38

33 Le Foron du Reposoir 39

34 Bassin de la Filliegravere 39

35 Le Foron de Fillinges 40

4 Investigations suppleacutementaires41

Bibliographie42

SOMMAIRE

1 Mateacuteriel et meacutethode1

11 Preacutesentation geacuteneacuterale de la technique de marquage 1

12 Description preacutecise de la technique de marquage 2

13 Donneacutees de repeuplement 4

14 Echantillonnage en milieu naturel 4

15 Reacutecolte et analyses des donneacutees en laboratoire 5151 Caracteacuteristiques morphologiques et morphomeacutetriques 5152 Preacutesentation des otolithes 6153 Extraction et lecture des otolithes 7

16 Symptocircmes pathologiques observeacutees 9161 La maladie reacutenale prolifeacuterative (PKD) 9162 Pathologies bacteacuteriennes 10

17 Utilisation du SIG de la feacutedeacuteration de Pecircche 11

2 Reacutesultats et discussions 12

21 Taux de marquage sexe ratio et pathologie 12211 Le Borne 12212 Le Giffre 16213 Le Foron du Reposoir 22214 La Filliegravere 24215 Le Foron de Fillinges 28

22 Caracteacuteristiques morphologiques 31221 Longueur totale des individus 31222 Taille des nageoires pectorales 33

3 Premiegraveres implications pour la gestion 37

31 Bassin de Borne 37

32 Bassin du Giffre 38

33 Le Foron du Reposoir 39

34 Bassin de la Filliegravere 39

35 Le Foron de Fillinges 40

4 Investigations suppleacutementaires41

Bibliographie42

1

1 Mateacuteriel et meacutethode

Avertissement afin de diffuser la deacutemarche globale de cette eacutetude ainsi que la technique de marquage utiliseacutee un article scientifique a eacuteteacute eacutecrit et soumis au BFPPLe contenu de ce chapitre reprend en partie cet article

11Preacutesentation geacuteneacuterale de la technique de marquage

Une des seules techniques permettant de marquer rapidement de grandes quantiteacutes de truites agrave des stades preacutecoces (alevins veacutesiculeacutes) est le fluoromarquage des otolithes

La meacutethode deacutefinitive de marquage utiliseacutee est deacutecrite preacuteciseacutement ci-apregraves Elle a drsquoabord eacuteteacute inspireacutee agrave partir de plusieurs tests reacutecents reacutealiseacutes sur les salmonidae (NAGIEC et al 1995 JOURDAN 1995 CACHERA 1997 CHAMPIGNEULLE et ROJAS BELTRAN 2001) et a ensuite eacuteteacute optimiseacutee et adapteacutee (CHAMPIGNEULLE donneacutees non publieacutees) aux exigences de notre eacutetude suite agrave de nombreux essais

Le marquage consiste en une balneacuteation de 3 heures des alevins veacutesiculeacutes (fin de reacutesorption) dans un bain drsquoARS (Alizarine Red S) agrave une concentration de 100mglitre drsquoeau brute Dans ces conditions les mortaliteacutes post-marquage sont resteacutees infeacuterieures agrave 5permil et non significativement diffeacuterentes de celles observeacutees sur des lots comparables non marqueacutes De reacutecentes eacutetudes (CAUDRON et CHAMPIGNEULLE donneacutees non publieacutees) ont mis en eacutevidence un taux de marquage des alevins agrave 100 avec une peacuterenniteacute minimale des marques jusqursquoagrave 5 ans

Dans la preacutesente opeacuteration pilote le marquage est preacutevu durant trois anneacutees successives (2002-2003-2004) dans les six piscicultures associatives Ces derniegraveres utilisent deux pratiques de reacutesorption en clayettes ou directement dans des auges drsquoincubation en ciment Une visite preacutealable de ces piscicultures a permis de deacuteterminer pour chaque eacutetablissement les volumes des auges utiliseacutes et les quantiteacutes de poissons attendus et donc les quantiteacutes de colorant neacutecessaires Par site et pour chaque auge des fioles contenant exactement la quantiteacute drsquoARS neacutecessaire ont eacuteteacute preacutepareacutees en laboratoire et distribueacutees agrave chaque pisciculteur

Enfin sur chaque site une formation du pisciculteur a eacuteteacute reacutealiseacutee et le premier marquage a eacuteteacute effectueacute en preacutesence des personnes responsables et en indiquant le protocole et les preacutecautions drsquoemploi Cette eacutetape essentielle a permis de transmettre la technique de marquage aux pisciculteurs concerneacutes et de srsquoassurer de sa bonne compreacutehension et mise en pratique (preacutecautions de manipulation) pour les marquages suivants

Les teacutetracyclines ont dabord eacuteteacute utiliseacutees comme fluoromarqueur mais en raison de leur pouvoir antibiotique leur usage a eacuteteacute fortement reacuteglementeacute dans certains pays ces derniegraveres anneacutees (PANFILI et al 2002) Lrsquoutilisation de nouveaux fluoromarqueurs comme lrsquoalizarine complexone (TSUKAMOTO et al 1989a et b) et plus reacutecemment lrsquoalizarine Red S srsquoest deacuteveloppeacutee

Lrsquoalizarine Red S est un produit certifieacute par la Biological Stain Commission (USA) pour le marquage vital des petits verteacutebreacutes et pour diffeacuterencier os et cartilage chez les embryons de mammifegraveres Elle est retenue in vivo de faccedilon durable dans les tissus squelettiques Dans le cas des marquages de truites au stade alevin veacutesiculeacute lrsquoARS se fixe au

2

niveau des otolithes qui sont alors les seules parties calcifieacutees Un travail de MEUNIER et BOIVIN (1978) a montreacute qursquoil eacutetait possible de concilier un bon marquage des tissus osseux de la truite avec lrsquoalizarine sans affecter sa croissance Les effets toxicologiques et eacutecotoxicologiques restent encore agrave ecirctre davantage et plus largement eacutetudieacutes de mecircme que lrsquoexistence et la dynamique des eacuteventuels reacutesidus Une eacutetude approfondie est en cours en Allemagne en relation avec un tregraves important programme de marquage des larves de coreacutegone deacuteverseacutees dans le lac de Constance (RUHLE ECKMANN comm personn) Crsquoest pourquoi il faudra ecirctre attentif aux reacutesultats de cette eacutetude pour mieux preacuteciser dans le futur lrsquoensemble des conditions drsquoemploi de lARS dans le contexte du marquage agrave des stades preacutecoces des poissons de repeuplement en milieu naturel

Le marquage consiste en une balneacuteation de 3 heures des alevins veacutesiculeacutes (fin de reacutesorption) dans un bain drsquoAlizarine Red S agrave une concentration de 100mglitre drsquoeau le marquage est preacutevu durant trois anneacutees successives (2002-2003-2004) dans six piscicultures associatives

12Description preacutecise de la technique de marquage

Les marquages dans les six eacutetablissements concerneacutes ont eacuteteacute eacutetaleacutes sur la peacuteriode feacutevrier-avril 2002 agrave des tempeacuteratures allant de 2 agrave 10degC selon les lots ou les piscicultures Ils ont eacuteteacute reacutealiseacutes dans des auges drsquoincubation dont le volume drsquoeau a eacuteteacute geacuteneacuteralement de 100 agrave 300 litres drsquoeau brute

Dans un premier temps la poudre preacute-doseacutee en laboratoire contenu dans la fiole est dilueacutee dans un volume drsquoeau brute de 10 litres afin de preacuteparer la solution colorante

Le volume drsquoeau contenant les alevins agrave traiter est ajusteacute lrsquoalimentation en eau est coupeacutee et le systegraveme de vidange est totalement eacutetancheacuteifieacute

Un systegraveme drsquooxygeacutenation simple de lrsquoeau est mis en place pour eacuteviter les risques drsquoasphyxies Un systegraveme de circulation drsquoeau en circuit fermeacute agrave lrsquoaide drsquoune pompe peut eacutegalement ecirctre installeacute pour assurer une reacutepartition optimale de la solution colorante pendant toute la dureacutee de la balneacuteation

La solution colorante est ensuite introduite progressivement pour permettre une reacutepartition homogegravene du colorant

Apregraves 3 heures de balneacuteation la circulation normale de lrsquoeau est progressivement reacutetablie ce qui permet drsquoeacutevacuer lentement la coloration et son rejet et de retrouver une eau claire

Dans le cas drsquoune reacutesorption en clayettes il est aussi possible de reacuteserver une auge ou un bassin speacutecifiquement pour le marquage Cette solution permet par le simple deacuteplacement des clayettes de marquer plusieurs lots conseacutecutivement

La meacutethode de marquage peut ecirctre adapteacutee au mode de reacutesorption utiliseacute par le pisciculteur en clayette ou directement dans les auges

3

Fiole avec colorant en poudre Preacuteparation de la solution colorante

Vue de la solution colorante Introduction du colorant dans le bac de marquage

Bac de marquage Introduction des alevins en clayette dans le bac de marquage

Dans le cas de reacutesorption directement dans les auges en ciment

Bac contenant les alevins Introduction progressive du colorant dans lrsquoauge

4

13Donneacutees de repeuplement

Les donneacutees quantitatives concernant les pratiques de repeuplement ont eacuteteacute recueillies dans les plans drsquoalevinage reacutealiseacutes par les gardes professionnels des AAPPMA selon un modegravele type Chaque tronccedilon de riviegravere concerneacute par une introduction de truites a eacuteteacute reacutepertorieacute sur le plan drsquoalevinage Pour chaque tronccedilon sont noteacutees les limites amont et aval ainsi que la longueur totale et la largeur moyenne (eacutevaluation en cours)

Enfin le plan drsquoalevinage renseigne sur la quantiteacute de poissons alevineacutes lrsquoorigine des poissons utiliseacutes le stade de deacuteversement ainsi que la date drsquoalevinage

La majoriteacute des cours deau sont repeupleacutes depuis plusieurs deacutecennies par des truites de souche atlantique domestiqueacutee diffeacuterente de la souche meacutediterraneacuteenne autochtone (preacutesente agrave lorigine naturellement)

Dans le cas preacutesent seul le Foron du Reposoir a eacuteteacute alevineacute avec des individus de souche meacutediterraneacuteenne (souche Chazey-Bons sauvage) en vue dune reacutehabilitation de la population de truites de ce cours deau Le bassin versant du Borne de la Filliegravere et du Giffre ont fait lobjet dun alevinage par des truites dorigine atlantique (pisciculture Chauvey Chazey-Bons domestiques Vizille domestiques)

La majoriteacute des cours deau ont eacuteteacute repeupleacutes depuis plusieurs deacutecennies par des truites de souche atlantique domestiqueacutee diffeacuterente de la souche meacutediterraneacuteenne preacutesente naturellement Dans le cas preacutesent le Foron du Reposoir et le Foron de Fillinges ont eacuteteacute alevineacutes avec des individus de souche partiellement meacutediterraneacuteenne (souche Chazey-Bons et Pont de Gys)

14Echantillonnage en milieu naturel

En raison limportante eacutechelle spatiale de la preacutesente eacutetude il ne sera pas possible de suivre agrave toutes les classes drsquoacircge et sur tout le reacuteseau hydrographique la contribution des poissons marqueacutes dans la population en placeCependant deux types drsquoeacutechantillonnages principaux seront donc pratiqueacutes au stade 0+ dans la population en place et au stade adulte (agrave partir de 2+) dans la pecircche

Cette approche permettra de srsquoaffranchir des difficulteacutes rencontreacutees pour eacutechantillonner et sacrifier des poissons aux stades 1+ et 2+ dans les populations en place (quantiteacute repreacutesentativiteacute impact en cas de populations faibles agreacutement des gestionnaires)

Ceci nexclue pas la reacutealisation de preacutelegravevements aux stades intermeacutediaires dans des cas speacutecifiques bien cibleacutes

Pour les stades jeunes les eacutechantillonnages ont eacuteteacute reacutealiseacutes par pecircche eacutelectrique de sondage agrave lrsquoaide drsquoun appareil portable soit geacuteneacuteralement en automne soit en peacuteriode hivernale pour certains grands cours drsquoeau cas du cours principal du Giffre

Les eacutechantillonnages des 0+ des diffeacuterentes riviegraveres seront eacutetaleacutes sur trois ans (2002-2003-2004)

Pour les stades adultes des carnets seront distribueacutes agrave des pecirccheurs volontaires qui accepteront de reacutecolter des donneacutees sur leurs captures (date lieu mode de pecircche sexe maturiteacute sexuelle) et de faire des preacutelegravevements agrave domicile (eacutecailles et tecircte cette derniegravere eacutetant coupeacutee juste en arriegravere des pectorales et conserveacutee au congeacutelateur) Les carnets comportent une planche explicative reacutecapitulative des diffeacuterentes mesures et preacutelegravevements Les suivis dans la pecircche seront reacutealiseacutes au minimum dans la peacuteriode 2004-2006 durant laquelle des poissons captureacutes par les pecirccheurs seront susceptibles drsquoecirctre marqueacutes

5

Enfin une autre opportuniteacute drsquoeacutechantillonnage non preacutevisible mais utilisable est la reacutecupeacuteration de truites mortes suite agrave des pollutions

Deux types drsquoeacutechantillonnages principaux seront donc pratiqueacutes au stade 0+ dans la population en place et au stade adulte (agrave partir de 2+) dans la pecircche

15Reacutecolte et analyses des donneacutees en laboratoire

151 Caracteacuteristiques morphologiques et morphomegravetriques

Tous les juveacuteniles sont conserveacutes au congeacutelateur agrave ndash18degC Apregraves deacutecongeacutelation leur longueur totale est mesureacutee (au mm pregraves) ainsi que la longueur maximale de la pectorale gauche (agrave 01mm pregraves) La truite est peseacutee agrave 01g pregraves

Des preacutelegravevements drsquoeacutecailles sont reacutealiseacutes pour deacuteterminer lrsquoacircge de chaque individu Les lectures drsquoeacutecailles preacutealables permettent de seacutelectionner les individus faisant partie des cohortes susceptibles drsquoecirctre marqueacutees

La robe de la truite est observeacutee permettant de classer les truites selon leur pheacutenotype (type atlantique ou meacutediterraneacuteen)

La truite est ensuite disseacutequeacutee pour deacuteterminer le sexe Lrsquoeacutetat de maturiteacute sexuelle est eacutegalement noteacute

Lrsquoadipeuse est preacuteleveacutee et conserveacutee dans de lrsquoalcool absolu en tube laquo Eppendorf raquo de 15 ml pour des analyses geacuteneacutetiques

Des observations sont faites concernant lrsquoeacutetat sanitaire global apparent du poisson (preacutesence drsquoheacutemorragies visible exteacuterieurement gonflement des reins colorationhellip)

Mesure du poisson Peseacutee du poisson

6

Prise drsquoeacutecailles et lecture immeacutediate pour veacuterification de lrsquoacircge ici 0+

Deacutetermination du pheacutenotype Meacuted (haut) Atl (bas) Observation du sexe et de la maturiteacute sexuelle

Le coefficient de condition est calculeacute dapregraves la formule suivante K = (P100) (Lt10)3

K = coefficient de conditionP = poids en grammesLt = longueur totale du poisson en mm

De mecircme la longueur relative ((longueur de la nageoirelongueur totale du corps)100) des nageoires pectorales a eacuteteacute calculeacutee (BOSAKOWSKI et al 1993)

Ces renseignements notamment les caracteacuteristiques morphologiques permettent de reacutealiser des analyses comparatives entre poissons sauvages et introduits

Pour chaque poisson seacutelectionneacute il faut ensuite proceacuteder agrave lrsquoextraction la preacuteparation et lrsquoexamen des otolithes

152 Preacutesentation des otolithes

Les otolithes sont des piegraveces calcifieacutees preacutesentes dans loreille interne des poissons Ils se forment degraves le stade embryonnaire et suivent laccroissement de la truite Leur rocircle essentiel se situe au niveau du maintien de leacutequilibre du poisson

Il existe trois paires dotolithes dont la forme et la taille sont caracteacuteristiques dune espegravece

Les sagittaeIls sont logeacutes dans la partie ventro-posteacuterieure de la capsule auditive Des trois paires dotolithes les sagittae sont les plus utiliseacutes pour le fluoromarquage de masse comme dans la preacutesente eacutetude mais aussi pour des estimations de lacircge et de laccroissement des poissons Ceci se justifie par leur taille ce sont en effet les plus volumineux leur extraction sen trouve donc faciliteacutee

Les asterisciIls sont situeacutes agrave larriegravere des sagittae Comme ces derniers ils sont impliqueacutes dans la reacuteception des sons (PANFILI et al 2002)

Les lapilli

7

Ils se situent dans la zone anteacutero-dorsale de la capsule auditive et interviennent dans le maintien des postures et de leacutequilibre des poissons

Les sagittae plus volumineux et plus faciles agrave preacutelever ont donc eacuteteacute utiliseacutes pour mener agrave bien cette eacutetude

Lotolithe croit par apposition dun nouveau mateacuteriel sur sa surface Ce pheacutenomegravene cyclique fonction du meacutetabolisme du calcium et de la synthegravese des acides amineacutes conduit agrave la formation danneaux saisonniersLors du marquage agrave lalizarine Red S les truites ne sont acircgeacutees que de quelques semaines et de ce fait les otolithes sont de tregraves petite taille Le fluorochrome se fixe sur les structures en voie de mineacuteralisation (os dents cartilages calcifieacutes otolithes) Leur calcification se poursuit naturellement avec la croissance du poisson et ainsi seule la partie centrale de lotolithe correspondant agrave sa taille lors de la coloration est marqueacutee

Lalizarine Red S absorbe les rayons UV et eacutemet une fluorescence dans le spectre visible Cette proprieacuteteacute est utiliseacutee pour le repeacuterage du marqueur avec un microscope eacutequipeacute pour leacutepifluorescence

yeux

otolithes

cerveau

yeux

otolithes

cerveau

Photo et scheacutema de localisation des otolithes et du marquage

153 Extraction et lecture des otolithes

Les diffeacuterentes phases permettant la lecture des otolithes sont

Deacutecoupe et enlegravevement avec des ciseaux de la moitieacute infeacuterieure de la tecircte au-preacutealablement partiellement deacutecongeleacutee

Deacutecoupage en deux (plan sagittal) de la moitieacute supeacuterieure de la tecircte en faisant entrer la pointe infeacuterieure du ciseau dans le passage de la moelle eacutepiniegravere (canal rachidien) Ce mode de deacutecoupe seacutepare et sectionne les capsules olfactives contenant les sagittae qui apregraves que le cerveau a eacuteteacute enleveacute sont alors directement accessibles avec des pinces fines dans chaque demi-section de la partie supeacuterieure de la tecircte

Extraction des sagittae agrave lrsquoaide de pinces fines Apregraves avoir enleveacute les matiegraveres organiques reacutesiduelles sur un papier absorbant les otolithes sont placeacutes dans untube Eppendorf et stockeacutes agrave lrsquoabri de la lumiegravere

8

Collage de chaque otolithe (face convexe vers lrsquoexteacuterieur) sur une lame de verre mince agrave lrsquoaide drsquoune thermocolle (colle Crystalbonb Aremco ndeg 509) chauffeacutee agrave 120 degC Durant cette eacutetape il est important drsquoenlever les bulles drsquoair existantes celles-ci pouvant eacutemettre une fluororescence parasite

Polissage des otolithes sur des plaques de papiers abrasifs de granulomeacutetrie diffeacuterente (Escil PSA G 400 G 800 et G 1200) Lrsquoeacutevolution du polissage est suivi par plusieurs controcircles sous microscope afin drsquoatteindre et de ne pas deacutepasser le centre de lrsquootolithe

Lecture de lrsquootolithe sous un microscope eacutequipeacute pour lrsquoeacutepifluorescence car lrsquoARS est deacutetectable par la fluorescence qursquoil eacutemet lorsquil est irradieacute en lumiegravere ultraviolette La lecture est faite le jour mecircme du polissage car la lisibiliteacute de la marque diminue avec le temps impliquant alors la neacutecessiteacute drsquoun leacuteger repolissage

Lorsque lrsquootolithe a eacuteteacute marqueacute celui-ci montre en son centre un anneau ou un noyau (selon la preacutecociteacute du marquage etou positionnement du plan de polissage par rapport au nucleacuteus) apparaissant rouge fluorescent (jeu de filtres Zeiss ndeg15 BP 54612 FT 580 LP 590 ) ou jaune orangeacute (jeu de filtres Zeiss ndeg9 BP 450-490 FT 510 LP 520)

Lorsque lrsquootolithe a eacuteteacute marqueacute celui-ci montre en son centre un anneau fluorescent jaune orangeacute ou rouge fluorescent selon le filtre utiliseacute

Enlegravevement de la moitieacute infeacuterieure de la tecircte agrave lrsquoaide de ciseaux

Emplacement de lotolitheEmplacement de lotolithe

Tecircte apregraves dissection Localisation de lrsquootolithe

9

Extraction de lrsquootolithe Otolithes colleacutes sur lame mince Ponccedilage de lrsquootolithe

Observation de la lame mince au microscope

05mm 05mmVue au microscope drsquoun otolithe ponceacute Otolithe marqueacute (anneau fluo vert-jaune)

16Symptocircmes pathologiques observeacutes

161 La maladie reacutenale prolifeacuterative (MRP ou PKD ou teacutetracapsulose)

Selon ESCHER et al (Fischnetz-info mars et deacutecembre 2001) cette maladie est provoqueacutee par un seul parasite Tetracapsula bryosalmonae (myxosoaire) Chez les poissons on le rencontre chez les salmonideacutes et le brochet les truites eacutetant particuliegraverement toucheacutees Le taux de mortaliteacute peut ecirctre fort chez ces derniegraveres (10 agrave 100) surtout sur les estivaux

Pour que les symptocircmes (affaiblissement contraction dautres maladies) se deacuteveloppent la tempeacuterature de leau doit ecirctre supeacuterieure agrave 15degC De plus il semble que des facteurs tels quun faible taux doxygeacutenation ou une pollution chimique favoriseraient la maladie

10

Afin de savoir si la truite en preacutesence est infecteacutee il faut observer ses reins En effet un poisson ayant deacuteveloppeacute la maladie a des reins grossis et dune coloration inhabituelle

Le mode de propagation de la maladie et le cycle complet du parasite ne sont que partiellement connus Tetracapsula parasite les bryozoaires de petits organismes filtreurs qui forment des colonies de quelques centimegravetres de diamegravetre sur diffeacuterents types de substrats et que lon rencontre dans la plupart des lacs et cours deau

Les parasites se multiplient dans les bryozoaires ils ont alors une taille de 20 μm et se concentrent dans des sortes de grandes poches de 350 μm de diamegravetre Le parasite peacutenegravetre dans le poisson sous forme de petites spores agrave travers les cellules du mucilage de la peau et ce au cours de la premiegravere minute apregraves lentreacutee en contact avec lagent pathogegravene A laide de la circulation sanguine les parasites atteignent les reins ougrave ils forment diffeacuterents stades de deacuteveloppement et provoquent de violentes reacuteactions inflammatoires Il en reacutesulte les diffeacuterentssymptocircmes deacutecrits preacuteceacutedemment

Le parasite drsquoun diamegravetre de 5 agrave 20 microm a pu ecirctre observeacute dans les vaisseaux sanguins de presque tous les organes (sauf du cerveau de la moelle eacutepiniegravere et des yeux) Les spores sont libeacutereacutees dans lrsquoeau avec lrsquourine du poisson et sont probablement absorbeacutees de nouveau par les bryozoaires

Les truites qui survivent ou qui ont deacutejagrave eacuteteacute infecteacutees sans deacutevelopper la maladie sont en geacuteneacuteral immuniseacutees lanneacutee suivante

Poisson atteint pas la PKD (reins gonfleacutes et preacutesence de nodules)

La PKD provoque chez les jeunes truites une mortaliteacute variant de 10 agrave 100 des individus toucheacutesLe deacuteveloppement du parasite est favoriseacute en eacuteteacute lorsque la tempeacuterature de lrsquoeau atteint 15degC

162 Pathologies bacteacuteriennes

Des symptocircmes probablement dus agrave une pathologie bacteacuterienne ont eacuteteacute mis en eacutevidence lors de cette eacutetude En effet un pourcentage non neacutegligeable de truites eacutetait affecteacute par des rougeurs de type heacutemorragie agrave la base des nageoires

11

Selon MORAND (com pers) deux maladies bacteacuteriennes peuvent engendrer ces symptocircmes (la furonculose et la yerciniose) Ces deux maladies sont preacutesentes dans le monde entier et atteignent tout particuliegraverement les eacutelevages de salmonideacutes

Elles peuvent ecirctre favoriseacutees par des conditions particuliegraveres du milieu environnant tempeacuterature de leau eacuteleveacutee (supeacuterieure agrave 10 degC) une charge organique importante ou encore une pollution diminuant les deacutefenses immunitaires du poissonhellip

Selon la graviteacute de laffection ces pathologies peuvent entraicircner de lourds taux de mortaliteacute atteignant jusquagrave 70 dans certains cas (MOURRIERAS 1995)

Les heacutemorragies observeacutees agrave la base des nageoires sont la conseacutequence drsquoune infection bacteacuterienne pouvant provoquer drsquoimportantes mortaliteacutes

17Utilisation du SIG de la Feacutedeacuteration de pecircche de Haute-Savoie

Les donneacutees du programme pilote de marquage et du programme INTERREG sont inteacutegreacutees dans un SIG (Systegraveme dInformation Geacuteographique MapInfo) mis en place agrave la Feacutedeacuteration de pecircche de Haute-Savoie et agrave lINRA de Thonon

Ainsi toutes les informations relatives aux cours deau du deacutepartement seront consigneacutees dans cette base de donneacutees (pente longueur preacutesence de seuils infranchissables caracteacuteristiques physico-chimiques IBGN hydrologie occupation des bassins versantshellip) Il en sera de mecircme pour les donneacutees truites (repeuplement densiteacute biomasses croissance structure dacircge pathologie geacuteneacutetiquehellip)

Lapproche finale visera agrave rechercher les relations existant entre ces deux groupes de donneacutees spatialiseacutees Une toute premiegravere deacutemarche a eacuteteacute partiellement tenteacutee dans le cas du preacutesent rapport dont les donneacutees ont eacuteteacute inteacutegreacutees dans le SIG en cours de construction

12

2 Reacutesultats et discussions

Ce chapitre preacutesente les reacutesultats obtenus sur les bassins eacutetudieacutes lors de la campagne de preacutelegravevements 2002 agrave savoir

Le GiffreLe BorneLa FilliegravereLe Foron de ScionsiezLe Foron de Fillinges

Lors de la campagne 2002 1703 poissons au stade 0+ ont eacuteteacute eacutechantillonneacutes en milieu naturel et eacutetudieacutes en laboratoire

21Taux de marquage sexe ratio et pathologie

211 Le Borne

Sur le bassin du Borne 5 stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal et 3 sur des affluents Au total ce sont 392 poissons 0+ qui ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

Sur le cours principal

Les taux de marqueacutes varient fortement sur le cours principal du Borne (18 agrave 100) On observe un gradient amont-aval du taux de marqueacutes qui peut ecirctre mis en relation avec la preacutesence drsquoun obstacle partiellement infranchissable pour les geacuteniteurs au niveau drsquoEntremont

Ainsi deux grandes zones peuvent ecirctre distingueacutees sur le Borne

La zone amont du seuil drsquoEntremont ougrave la majoriteacute des juveacuteniles sont issus du repeuplement (90 agrave 100)

On observe sur ce secteur une tregraves faible reproduction naturelle en raison drsquoune quasi-absence de poissons adultes La situation de la population de truites est donc tregraves critique Si le repeuplement permet de drsquoobserver des 0+ il nrsquoa pas permis drsquoinstaller une population fonctionnelle

La zone aval du seuil drsquoEntremont ougrave la majoriteacute des individus preacutesents au stade 0+ sont des poissons naturels

En effet le taux de marqueacutes varie de 18 agrave 49 Les pecircches de sondage Interreg ont montreacute la preacutesence drsquoune importante population de truites sauvages drsquoorigine meacutediterraneacuteenne La population est eacutequilibreacutee et naturellement fonctionnelle puisqursquoon observe une forte reproduction naturelle et de nombreux geacuteniteurs

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Sur les Affluents

Sur les 3 affluents eacutetudieacutes la situation est tregraves simple En effet soit on observe 0 de marqueacutes soit 100

- Sur lrsquoOveacuteran aval aucun poisson marqueacute nrsquoa eacuteteacute trouveacute puisqursquoil nrsquoy a pas eu de repeuplement sur ce secteur en 2002 Le reacutesultat obtenu montre une importante reproduction naturelle des geacuteniteurs du Borne qui remontent sur lrsquoaval de ce cours drsquoeau

- Sur la Duche et le Chinaillon il y a absence totale de reproduction naturelle puisque 100 des 0+ eacutechantillonneacutes sont marqueacutes Pourtant on observe de nombreux poissons adultes sur ces secteurs susceptibles drsquoecirctre des geacuteniteurs ainsi que diffeacuterentes classes drsquoacircge Lrsquoeacutequilibre de ces populations est artificiellement maintenu par les alevinages

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

- Toutes les stations eacutetudieacutees ne sont pas concerneacutees par ces symptocircmes de maladies- Les maladies bacteacuteriennes semblent toucher majoritairement les poissons introduits- Cependant les 0+ de lrsquoOveacuteran aval tous naturels sont infecteacutes agrave 15 Ce reacutesultat

peut refleacuteter une contamination par deacutevalaison provenant drsquoindividus atteints situeacutes plus en amont de lrsquoOveacuteran ou une contamination naturelle par des agents pathogegravenes preacutesents dans le milieu

- Les poissons marqueacutes peuvent ecirctre contamineacutes agrave un taux non neacutegligeable pouvant atteindre plus de 30

Pourcentage dindividus preacutesentant des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

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Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

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Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Le sexe ratio est relativement eacutequilibreacute pour les marqueacutes comme pour les non marqueacutes Seule une station sur le Borne (Beffay) montre 85 de macircle dans la population de 0+

- Seules 2 stations montrent des macircles matures au stade 0+- Le pourcentage de macircles matures au stade 0+ est plus important chez les non

marqueacutes que chez les marqueacutes

Pourcentage de macircles au stade 0+

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Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Borne

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Pourcentage de macircles au stade 0+

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Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Borne

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

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212 Le Giffre

Sur le bassin du Giffre 6 stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal et 7 sur des affluents Au total ce sont 536 poissons 0+ qui ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

Sur le cours principal

La carte de synthegravese des reacutesultats met en eacutevidence des taux de marqueacutes tregraves contrasteacutes variant entre 0 et 100 Sauf deux cas particuliers la campagne de preacutelegravevements a permis de montrer qursquoune reproduction naturelle existait sur lrsquoensemble du Giffre

Il est possible de distinguer trois zones successives sur ce cours deau

La zone aval est composeacutee de la station Pont du Giffre ougrave le taux de marqueacutes est de 74 Cette station sur le Giffre doit ecirctre rapprocheacutee des stations eacutetudieacutees sur le Risse (station laquo Risse aval St Jeoire raquo) et le Hisson(laquo station La Pallud raquo) pour mieux comprendre le fonctionnement de la population

- Sur le Giffre aval la situation semble tregraves critique La station dite laquo Pont du Giffre raquosrsquoeacutetend de lrsquoamont de Marignier agrave lrsquousine du Pont du Giffre soit sur environ 25 km Sur cette distance seulement 31 0+ ont pu ecirctre captureacutes De plus les pecircches drsquoadultes dans le cadre drsquoInterreg montrent un deacuteficit inquieacutetant de geacuteniteurs sur ce secteur ainsi qursquoune surabondance de Chabot La situation du bas Giffre montre une population de truitetotalement deacuteseacutequilibreacutee loin du potentiel de la riviegravere et qui ne peut pas ecirctre reacutehabiliteacutee par le seul fait de lrsquoalevinage Cette situation peut ecirctre le reacutesultat du faible deacutebit reacuteserveacute qui appauvrit lrsquohabitat aquatique et provoque des eacuteleacutevations de tempeacuterature inquieacutetantes Les reacutesultats de pecircche drsquoinventaire dans la reacuteserve de Marignier montrent que les poissons sont concentreacutes agrave lrsquoaval immeacutediat des seuils ougrave lrsquoon note la preacutesence de fosses de tempeacuteratures plus faibles et drsquoune meilleure oxygeacutenation

La zone moyenne situeacutee entre le barrage de Mieussy et Samoeumlns qui est composeacutee des stations laquo aval barrage Taninges raquo laquo Theacuteziegraveres raquo et laquo Montessuit raquo Sur ce secteur les 0+ marqueacutes sont en minoriteacutes puisqursquoils repreacutesentent 11 agrave 38 du peuplement

- Sur le Giffre aval barrage de Taninges le secteur nrsquoest pas alevineacute il est donc normal que pregraves de 90 des poissons ne soient pas marqueacutes Les 0+ marqueacutes proviennent certainement du ruisseau de lrsquoEtroit Denteacute qui est fortement alevineacute et agrave partir duquel une deacutevalaison doit avoir lieu- Le secteur des laquo Theacuteziegraveres raquo et de laquo Montessuit raquo bien que reacuteguliegraverement alevineacute montre un taux important drsquoalevins naturels (62 agrave 77) Ce reacutesultat est tout agrave fait en accord avec le suivi de la reproduction naturelle et le recensement de frayegraveres reacutealiseacute par lrsquoAAPPMA du Faucigny et le CSP en 1999 En effet de nombreuses frayegraveres naturelles avaient eacuteteacute observeacutees sur ce site Le peuplement drsquoadultes nrsquoest pas tregraves important mais est en rapport avec les potentialiteacutes du milieu

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La zone amont caracteacuteriseacutee par les stations laquo Reveacute-Peacuteret raquo et laquo amont Tines raquo ougrave le taux de marqueacutes varie de 70 agrave 79

- Pour ces deux stations la population de juveacuteniles est faible et ils sont majoritairement marqueacutes Cependant au stade adulte les pecircches Interreg montrent une majoriteacute de poissons drsquoorigine meacutediterraneacuteenne La forte contribution de poissons introduits au stade 0+ ne semble pas se retrouver au stade adulte Les conditions de vie dans ce milieu sont tregraves difficiles et ne permettent pas drsquoatteindre des densiteacutes de poissons importantes

Sur les Affluents

Le Risse - Le Hisson montre une majoriteacute drsquoalevins naturels alors que les preacutelegravevements ont eacuteteacute reacutealiseacutes seulement deux mois apregraves le repeuplement Ce cours drsquoeau possegravede un fort potentiel de frai qui est utiliseacute notamment par les geacuteniteurs du Risse- Sur lrsquoaval du Risse le taux de marqueacutes est de 68 Il est le reflet drsquoun alevinage en quantiteacute importante sur le secteur (10 000 alevins) Les alevins naturels repreacutesentent tout de mecircme plus de 30 trois mois apregraves le repeuplement De plus les eacutechantillonnages drsquoadultes reacutealiseacutes sur ce secteur dans le cadre drsquoInterreg ont mis en eacutevidence une quantiteacute importante de geacuteniteurs sauvages La population sur ce secteur est agrave mettre en eacutevidence avec celle du Hisson puisque certains geacuteniteurs du Risse y migrent pour se reproduireLa population sur ce secteur est naturellement fonctionnelle

Le Foron de Mieussy - La station laquo Andelier raquo situeacutee en amont du Foron preacutesente 100 de marqueacutes Cette situation montre une absence totale de reproduction naturelle Le milieu est extrecircmement deacutefavorable agrave lrsquoinstallation drsquoune population fonctionnelle en raison du faible deacutebit de la riviegravere (assegravechement reacutegulier) Aucune classe drsquoacircge intermeacutediaire et aucun adulte nrsquoa eacuteteacute observeacute sur ce secteur Les poissons alevineacutes sont certainement victimes des assegravechements- La station laquo Trebiet raquo situeacutee plus en aval preacutesente au contraire 0 de marqueacutes alors que cette zone a eacuteteacute alevineacutee Ce reacutesultat montre la capaciteacute du Foron sur ce secteur a accueillir une population fonctionnelle Il existe une reproduction naturelle importante sur cette zone avec eacutegalement beaucoup de geacuteniteurs- Vers Sommand une pecircche de sondage a eacuteteacute reacutealiseacutee mais aucun alevin nrsquoa eacuteteacute preacuteleveacute puisque cette zone nrsquoa pas eacuteteacute alevineacutee en 2002 Cependant les reacutesultats de ce sondage mettent en eacutevidence une absence totale de reproduction naturelle (aucun alevin naturel nrsquoa eacuteteacute trouveacute) alors que la population semble eacutequilibreacutee (preacutesence drsquoadultes et de truitelles drsquoacircge intermeacutediaire)

LrsquoEtroit Denteacute Globalement le taux de marqueacutes sur les deux stations eacutetudieacutees est faible (11 agrave 33)- Sur la station laquo aval route raquo la majoriteacute des alevins est naturelle Cette zone montre un habitat tregraves favorable pour la reproduction des geacuteniteurs qui remontent du Giffre- Sur la station laquo amont route raquo une population fonctionnelle de pheacutenotype meacutediterraneacuteen est installeacutee De nombreux geacuteniteurs sont preacutesents et le recrutement naturel est important

19

Le Foron de Taninges - En amont (station Bonnavaz) le taux de marqueacutes est tregraves important (95) Il existe donc une reproduction naturelle mais insuffisante pour permettre lrsquoinstallation drsquoune population et maintenir une activiteacute halieutique Les alevinages passeacutes nrsquoont pas permis drsquoinstaller une population fonctionnelle dans cette zone apicale- Plus en aval sur les zones non alevineacutees les pecircches eacutelectriques drsquoinventaire et de sondage reacutealiseacutees ont montreacute la preacutesence drsquoune population eacutequilibreacutee de pheacutenotype meacutediterraneacuteen avec une importante reproduction naturelle

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

Les principales remarques concernant les pathologies observeacutees sur le bassin du Giffre sont

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

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Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Giffre

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

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Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

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Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

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Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Giffre

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

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Le Risse

20

- La PKD est preacutesente sur le cours du Giffre mais uniquement agrave lrsquoaval du barrage de Taninges Cette situation est agrave mettre en relation avec le deacutebit reacuteserveacute insuffisant qui entraicircne une augmentation de tempeacuterature pendant la peacuteriode estivale

- Sur les affluents la PKD a eacuteteacute observeacutee sur les secteurs preacutesentant des faibles deacutebits estivaux (aval du Risse et Foron de Mieussy Andelier) qui sont certainement responsables drsquoune augmentation de tempeacuterature

- La PKD atteint agrave la fois les poissons introduits que les poissons naturels- Le pourcentage drsquoindividus toucheacutes par la PKD varie drsquoun site agrave lrsquoautre mais peut

atteindre une valeur importante avec 50 sur certain secteur- Les maladies bacteacuteriennes sont plus freacutequentes chez les individus marqueacutes Soit ces

poissons sont plus fragiles que les poissons naturels et contractent les maladies plus facilement soit les maladies sont contracteacutees en pisciculture pendant lrsquoeacutelevage

- Le pourcentage drsquoindividus toucheacutes par des symptocircmes bacteacuteriens nrsquoest pas neacutegligeable puisqursquoil peut atteindre 20

- Lrsquoensemble des stations eacutetudieacutees est toucheacute par des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes ce qui laisse penser que lrsquoensemble du bassin peut ecirctre atteint

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

Pourcentage de macircles au stade 0+

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Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Giffre

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

21

- Le sexe ratio apparaicirct globalement eacutequilibreacute sur lrsquoensemble des stations du Giffre- On observe des diffeacuterences entre les poissons introduits et les poissons naturels sur

seulement 3 stations Ces diffeacuterences sont en faveur des poissons marqueacutes qui montrent un pourcentage de macircles plus important

- Une maturiteacute sexuelle preacutecoce des macircles existe sur certaines stations quelle que soit lrsquoorigine des poissons

- Cette maturiteacute peut ecirctre importante et concerner jusqursquoagrave 20 des 0+

22

213 Le Foron du Reposoir

Deux stations (La Touviegravere et Le Reposoir) ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le Foron du Reposoir Seulement 15 0+ ont eacuteteacute eacutetudieacutes en raison principalement de la difficulteacute drsquoeacutechantillonner des poissons de petite taille (6-7 cm) sur ces milieux torrentiels

Le taux de marqueacutes

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23

- Sur les deux stations eacutetudieacutees le taux de marqueacutes est de 100 Lrsquoensemble des 0+ mecircme si le nombre est faible est donc issu de lrsquoalevinage Ce cours drsquoeau fait lrsquoobjet actuellement drsquoun essai drsquoimplantation drsquoune population agrave partir de la souche Chazey-Bons Rhodanienne Cette souche provient de geacuteniteurs de la riviegravere Furan (Ain) Des analyses geacuteneacutetiques reacutecentes reacutealiseacutees par analyse de microsatellites diagnostic de lrsquoADN ont montreacute que ces poissons ont un pourcentage dallegraveles meacutediterraneacuteens voisin de 65

Ce reacutesultat montre que le cours deau avait un niveau de population tregraves faible avant le repeuplement par la souche Chazey-Bons sauvagesDe plus les pecircches drsquoinventaires du CSP et les pecircches de sondage Interreg montrent qursquoune population de truites se met progressivement en place En effet on observe chaque anneacutee despoissons agrave des stades de plus avanceacutes et les captures par pecircche agrave la ligne commencent agrave ecirctre effectivesLes pecircches eacutelectriques reacutealiseacutees agrave lrsquoautomne 2002 indique que le stock de geacuteniteurs est en cours de reconstitution mais que les truites femelles nrsquoont pas encore atteint le stade geacuteniteurIl nrsquoest donc pas encore possible de dire si lrsquohabitat et la population du Foron du Reposoir sont propices agrave lrsquoinstallation drsquoune population naturellement fonctionnelle

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

Aucun symptocircme reacutenal et heacutemorragique nrsquoapparaicirct sur les 0+ eacutechantillonneacutes sur ce cours deau

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Le sexe ratio est eacutequilibreacute puisqursquoil varie de 50 agrave 60- Il nrsquoy a aucun macircle mature au stade 0+ dans les eacutechantillons preacuteleveacutes sur ce cours

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La Touviegravere Le Reposoir

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

24

214 La Filliegravere

Cinq stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal de la Filliegravere ainsi que sept stations sur les trois affluents principaux (Flan Creacutenant et Daudens) Au total 582 poissons 0+ ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

Sur le cours principal

Pour les 5 stations eacutetudieacutees sur le cours principal le taux de 0+ marqueacutes varie de 4 agrave 56 il est donc de tregraves faible agrave moyen et montre une forte reproduction naturelle sur toute la riviegravere Il y a un gradient amont-aval du taux de marqueacutes avec un pourcentage de poissons marqueacutes plus important en amont Cependant sur lrsquoensemble de la Filliegravere le recrutement naturel est dominant et constitue lrsquoessentiel de la population de truite

De plus les pecircches de sondages pour Interreg ont montreacute la preacutesence de nombreux drsquoadultes drsquoorigine naturelle meacutediterraneacuteenne Ceci confirme que la population de truite de la riviegravere principale est naturellement fonctionnelle

Sur les affluents

Les reacutesultats sont diffeacuterents selon que lrsquoaffluent est en connexion ou non avec la riviegravere principale

- Sur le Flan on observe en zone aval et meacutediane (stations laquo D 55 raquo et laquo Bruchon raquo) des taux de marqueacutes faibles (38 et 27) qui mettent en eacutevidence la preacutesence drsquoune forte reproduction naturelle notamment de poissons migrants de la Filliegravere Les releveacutes de frayegraveres reacutealiseacutes par lrsquoAAPPMA avaient deacutejagrave permis drsquoobserver de nombreuses frayegraveres naturelles sur ce secteurEn zone plus amont station laquo Molliet raquo le taux de marqueacutes est plus important (73) il met en eacutevidence la preacutesence drsquoun recrutement naturel mais qui reste au stade 0+ minoritaire par rapport aux individus introduits

- Sur le Daudens les deux stations (laquo Le Plot raquo et Daudens raquo) montrent des taux de marqueacutes importants (86 et 92) La reproduction naturelle est donc tregraves faible et la population de truite ne semble pas fonctionnelle Lrsquoobstacle agrave lrsquoaval de la route deacutepartementale semble preacutejudiciable car il ne permet pas aux geacuteniteurs de la Filliegravere de remonter sur le Daudens et drsquoinstaller une population fiable

- Sur le Crenant Les deux stations eacutechantillonneacutees (laquo aval raquo et Disonche raquo) ne sont pas situeacutees sur des zones alevineacutees en 2002 et il est normal de trouver 0 de marqueacutes Cependant ces reacutesultats montrent qursquoil y a une forte reproduction naturelle sur ce cours drsquoeau mecircme en zone amont et que la population semble naturellement fonctionnelle Les alevins introduits sur le Crenant ne semblent pas avoir deacutevaleacutes sur pour coloniser lrsquoaval du Crenant

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Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

- La PKD semble quasiment absente du bassin de la Filliegravere sauf preacutesence anecdotique uniquement chez les non marqueacutes sur une station (laquo Millard raquo)

- Les individus marqueacutes ne sont pas toucheacutes par la PKD- Les maladies bacteacuteriennes sont preacutesentes sur lrsquoensemble du bassin mais touchent en

prioriteacute et majoritairement les individus marqueacutes

Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

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Dau

dens

Ava

l

Dis

onch

e

La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere Le Flan Le Flan Le Flan LeDaudens

LeDaudens

LeCrenant

LeCrenant

Pourcentage dindividus preacutesentant des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

0102030405060

Le J

ourd

il

Pisc

icul

ture

Milla

rd

Long

cham

ps

D55

Bru

chon

Mol

liet

Le

Plo

t

Dau

dens

Ava

l

Dis

onch

e

La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere Le Flan Le Flan Le Flan LeDaudens

LeDaudens

LeCrenant

LeCrenant

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

27

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Sur lrsquoensemble des stations le sexe ratio est eacutequilibreacute il montre une plus grande variation chez les individus marqueacutes

- Des macircles matures au stade 0+ ont eacuteteacute observeacutes sur trois stations uniquement chez les individus naturels

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

Pourcentage de macircles au stade 0+

0102030405060708090

Le J

ourd

il

Pis

cicu

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Milla

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Long

cham

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D55

Bruc

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Mol

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Le

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Ava

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LaFilliegravere

LaFilliegravere

LaFilliegravere

LaFilliegravere

Le Flan Le Flan Le Flan LeDaudens

LeDaudens

LeCrenant

LeCrenant

Pourcentage de macircles matures au stade 0+

01020304050

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FilliegravereLa

FilliegravereLa

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DaudensLe

DaudensLe

CrenantLe

Crenant

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

Pourcentage de macircles au stade 0+

0102030405060708090

Le J

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LaFilliegravere

LaFilliegravere

LaFilliegravere

LaFilliegravere

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LeCrenant

LeCrenant

Pourcentage de macircles matures au stade 0+

01020304050

Le J

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Pis

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FilliegravereLa

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Crenant

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

28

215 Le Foron de Fillinges

Trois stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal du Foron de Fillinges agrave savoir de lrsquoamont vers lrsquoaval laquo Bovet ndash Boex raquo laquo Pont de Fillinges raquo et laquo Couvette raquo Au total 178 poissons 0+ ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

Leacutege

nde

Mar

queacutes

Non

mar

queacutes

X

d

rsquoindi

vidu

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eacutes

Sec

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en

2002

Loca

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des

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31

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Boex

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31

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Boex

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31

29

Sur les 3 stations eacutetudieacutees les taux de marqueacutes sont faibles agrave tregraves faibles- Sur la station laquo Bovet ndash Boex raquo le taux de marqueacutes est de seulement 31- A lrsquoaval sur les stations laquo Pont de Fillinges raquo et laquo Couvette raquo les taux de marqueacutes

sont respectivement de 0 et 2

Les reacutesultats indiquent la preacutesence drsquoune importante reproduction naturelle sur lrsquoensemble du Foron de Fillinges Quelque soit la souche utiliseacutee pour lrsquoalevinage atlantique dans le secteur Faucigny ou Meacutediterraneacuteenne Pont de Gys dans le secteur Chablais les poissons introduits restent minoritaires

Cette situation traduit la preacutesence drsquoune population bien installeacutee et fonctionnelle sur cette riviegravere

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

0102030405060708090

100

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Pourcentage dindividus preacutesentant des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

05

101520253035404550

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

0102030405060708090

100

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Pourcentage dindividus preacutesentant des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

05

101520253035404550

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

30

- Sur lrsquoensemble des stations des individus 0+ sont atteints par la PKD le pourcentage drsquoindividus malades peut atteindre 35

- Seuls les individus sauvages semblent toucheacutes par la PKD cependant le nombre drsquoindividus introduits est trop faible pour permettre une comparaison

- Toutes les stations sont eacutegalement toucheacutees par les maladies bacteacuteriennes avec des taux de contamination variant de 15 agrave 30

- Les maladies bacteacuteriennes touchent agrave la fois les individus introduits et les individus naturels

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Le sexe ratio apparaicirct eacutequilibreacute sur lrsquoensemble des stations- On observe des macircles matures degraves le stade 0+ sur lrsquoensemble des stations- Le taux de macircles matures au stade 0+ peut atteindre 15

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

Pourcentage de macircles au stade 0+

0

102030405060

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Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Pourcentage de macircles matures au stade 0+

05

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Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

Pourcentage de macircles au stade 0+

0

102030405060

708090

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Pourcentage de macircles matures au stade 0+

05

101520253035404550

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

31

22Caracteacuteristiques morphologiques

221 Longueur totale des individus

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Giffre

0

20

40

60

80

100

120

140Am

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Tine

s

Rev

eacute-Peacute

ret

Mon

tess

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Theacutez

iegravere

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Aval

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Tani

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Aval

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e

Ande

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Treb

iet

La P

allu

d

Aval

St

Jeoi

re

LeGiffre

LeGiffre

LeGiffre

LeGiffre

LeGiffre

LeGiffre

Le FdeTaninges

LEtroitDenteacute

LEtroitDenteacute

Le F deMieussy

Le F deMieussy

LeHisson

Le Risse

Long

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tota

le e

n m

m

Taille moyenne des 0+ sur le Borne

0

20

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120

140

GrandBornand

Les Etroits Entremont Beffay St Pierre en F

Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Chinaillon La Duche LOveacuteran

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Taille moyenne des 0+ sur la Filliegravere

0

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

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Taille moyenne des 0+ sur le Giffre

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32

Sur la quasi-totaliteacute des stations eacutetudieacutees les individus marqueacutes preacutesentent une taillemoyenne supeacuterieure agrave celle des individus naturels Sur 18 stations ougrave les effectifs permettent des comparaisons statistiques la longueur totale des individus marqueacutes est significativement supeacuterieure agrave celle des truites sauvages pour 13 stations

Les 5 stations faisant exception sont laquo aval barrage Taninges raquo et laquo Pont du Giffre raquo sur le Giffre laquoAval St Jeoire raquo sur le Risse laquo Bonnavaz raquo sur le Foron de Taninges et laquo Couvette raquo sur le Foron de Fillinges Cependant sur ces stations les diffeacuterences ne sont pas significatives

Le fait que les marqueacutes aient une plus grande taille moyenne que les non marqueacutes au stade 0+ nrsquoimplique pas que cela soit systeacutematiquement le cas aux stades ulteacuterieurs En effet CAUDRON (1998) et CHAMPIGNEULLE et CACHERA (2003) ont montreacute respectivement sur le Doubs et le Fier que les diffeacuterences de tailles entre marqueacutes et non marqueacutes au stade 0+ sestompaient au stade 1+ et chez les adultes

Par ailleurs lrsquoexistence drsquoune plus grande taille au stade 0+ en automne pour les marqueacutes ne leur garantit pas un meilleur taux de seacutedentarisation En effet plusieurs eacutetudes dont celle de JONSSON et JONSSON (1993) indiquent que le taux de deacutevalaison peut ecirctre plus eacuteleveacute pour les individus agrave plus forte croissance au stade 0+ La deacutevalaison peut donc toucher preacutefeacuterentiellement les individus marqueacutes en raison de leur forte croissance

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Foron du Reposoir

0

20

40

60

80

100

120

140

La Touviegravere Le Reposoir

F du Reposoir F du Reposoir

Long

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mTaille moyenne des 0+ sur le Foron de Fillinges

0

20

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Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Foron du Reposoir

0

20

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100

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140

La Touviegravere Le Reposoir

F du Reposoir F du Reposoir

Long

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mTaille moyenne des 0+ sur le Foron de Fillinges

0

20

40

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140

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

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m

33

222 Taille des nageoires pectorales

La figure ci-dessus montre qursquoil existe une diffeacuterence entre marqueacutes et non marqueacutes du rapport entre la longueur de la nageoire pectorale et la longueur totale du poisson

Il a sembleacute important drsquoanalyser plus en deacutetail ce caractegravere morphologique car il peut preacutesager de lrsquoaptitude des truites agrave se maintenir dans nos riviegraveres de montagne

Relation entre la longueur de la nageoire pectorale et la longueur totale des individus marqueacutes et non marqueacutes

5

7

9

11

13

15

17

19

21

23

25

27

30 50 70 90 110 130 150 170Longueur totale en mm

Long

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nag

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le e

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mMarqueacuteNon marqueacute

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron du Reposoir

12

14

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18

20

La Touviegravere Le Reposoir

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Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron de Fillinges

12

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Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron du Reposoir

12

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La Touviegravere Le Reposoir

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Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron de Fillinges

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Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

34

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Giffre

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Taille relative moyenne des pectorales sur la Filliegravere

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GrandBornand

Les Etroits Entremont Beffay St Pierre en F

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Giffre

12

14

16

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Am

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Taille relative moyenne des pectorales sur la Filliegravere

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GrandBornand

Les Etroits Entremont Beffay St Pierre en F

Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Chinaillon La Duche LOveacuteran

35

Sur les 24 stations ougrave des individus marqueacutes et non marqueacutes coexistent la taille relative des nageoires pectorales est systeacutematiquement plus importante chez les individus naturelsLes truites issues du repeuplement preacutesentent donc des nageoires pectorales de longueur infeacuterieure agrave celle des truites sauvagesCette diffeacuterence morphologique est tregraves importante car le deacuteveloppement des nageoires est un eacuteleacutement deacuteterminant pour la survie du poisson dans son milieu notamment pour la stabiliteacute la reacutesistance au courant et la recherche de nourriture an action de chasse

Il semble donc possible que cette caracteacuteristique anatomique soit le reacutesultat drsquoune adaptation agrave la vie en torrent

BOSAKOWSKI et al (1993) ont eacutegalement observeacutes des reacutesultats comparables chez des truites arc-en-ciel et des truites brunes de plus grande taille entre poissons drsquoeacutelevage et poissons sauvages Dans cette eacutetude les poissons deacutelevage preacutesentaient des nageoires nettement plus courtes (10-50) que les poissons sauvages Selon les auteurs cette diffeacuterence semblait ecirctre causeacutee par les conditions de vie des poissons dans les bassins des piscicultures(agression intraspeacutecifique stress qualiteacute de leau et densiteacutes de poissons) qui provoquaient une eacuterosion des nageoires

Dans le cas preacutesent les poissons de repeuplement ont eacuteteacute introduits agrave des stades preacutecoces dans le milieu et ont eacuteteacute preacuteleveacutes 4 agrave 5 mois apregraves leur introduction En conseacutequence ils ont veacutecu peu de temps en pisciculture et ont par contre passeacute lessentiel de leur vie dans le mecircme milieu naturel que les poissons sauvages Ainsi il semble que ce dimorphisme de la nageoire entre poissons sauvages et introduits soit drsquoorigine geacuteneacutetique Une eacutetude de RIDDELL et al (1981) a montreacute chez le saumon que les diffeacuterences de deacuteveloppement de nageoires eacutetaient une adaptation des poissons agrave leur milieu qui preacutesentait une origine geacuteneacutetiqueIl est donc tout agrave fait probable qursquoun pheacutenomegravene similaire se rencontre chez la truite fario et que les truites sauvages soient mieux adapteacutees sur le plan morphologique (gracircce agrave des diffeacuterences geacuteneacutetiques) aux conditions du milieu que les poissons introduits mecircme agrave des stades preacutecoces

Outre lrsquoaspect purement geacuteneacutetique les facteurs environnants peuvent eacutegalement jouer un rocircle important En effet McLAUGHLIN et al (2002) ont montreacute que cette diffeacuterence au niveau des nageoires peut eacutegalement ecirctre due agrave des caracteacuteristiques du milieu environnant dans les premiegraveres semaines de vie des poissons En effet plusieurs lots drsquoune mecircme souche de saumon de fontaine soumis degraves lrsquoeacuteclosion agrave des conditions de vie diffeacuterentes montrent des diffeacuterences dans le deacuteveloppement des nageoires Ainsi degraves les premiegraveres semaines les poissons exposeacutes agrave un fort courant sont pourvus de nageoires plus longues

Il est donc possible que les alevins produits en pisciculture nrsquoeacutetant pas exposeacutes agrave des courants importants au cours de leurs premiegraveres semaines de vie deacuteveloppent des nageoires pectorales moins longues que les individus sauvages

Il y a probablement pour cette caracteacuteristique morphologique des interactions combinant geacuteneacutetique et conditions environnementales

Cette diffeacuterence morphologique peut eacutegalement avoir une importance dans la compeacutetition entre poissons sauvages et introduits notamment au stade juveacutenile En effet GIBSON (1973) a deacutemontreacute limportance des nageoires dans la compeacutetition interspeacutecifique

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entre le saumon atlantique (Salmo salar L) et le saumon de fontaine (Salvenius fontinalis) deux poissons consommant la mecircme nourriture Le fait de posseacuteder des nageoires pectorales plus deacutevelopper permet au saumon atlantique de se maintenir dans les courants pour se nourrir tout en deacutepensant moins drsquoeacutenergie

Dans le cas des torrents haut-savoyards une compeacutetition intraspeacutecifique entre truites sauvages et introduites comparable agrave leacutetude de GIBSON peut se deacutevelopper La diffeacuterence morphologique entre les truites sauvages et issues du repeuplement peut donc avoir une influence lors de la compeacutetition entre ces deux types dindividus

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3 Premiegraveres implications pour la gestion

En fonction des reacutesultats obtenus lors de la campagne de preacutelegravevements 2002 des orientations de gestion sont proposeacutees pour chaque riviegravere eacutetudieacutee Certaines propositions impliquent des changements relativement importants des pratiques actuelles de gestion

Lrsquoeacutetude de lrsquoefficaciteacute des repeuplements srsquoappuient sur une deacutemarche scientifique rigoureuse dans lrsquointeacuterecirct des gestionnaires directs (AAPPMA) puisqursquoelle permet agrave ces derniers de prendre des deacutecisions en srsquoappuyant sur des reacutesultats concrets et indiscutables Elle est conduite dans un souci drsquoeacutevaluer en toute objectiviteacute les pratiques drsquoalevinage dans le seul but drsquoameacuteliorer la gestion actuelle des populations et des milieux Concregravetement elle permet de connaicirctre rapidement les zones ougrave lrsquoalevinage en truite fario est inefficace et donc inutile et les zones ougrave celui-ci est efficace et donc neacutecessaire

En plus des reacutesultats obtenus gracircce aux marquages des juveacuteniles les propositions prennent en compte les premiers reacutesultats issus des pecircches de sondage drsquoadultes reacutealiseacutees pour le programme INTERREG (reacutedaction en cours) Lrsquointeacutegration des diffeacuterentes donneacutees (marquage juveacutenile + adultes) permet de faire des propositions coheacuterentes selon un diagnostic le plus complet possible de la population de truite preacutesente

31 Bassin du Borne

Sur les riviegraveres du bassin du Borne les orientations de gestion proposeacutees ci-apregraves restent conformes agrave celles deacutejagrave eacutevoqueacutes par CAUDRON et CHAMPIGNEULLE (2002)

Arrecirct du repeuplement selon les pratiques actuelles sur lrsquoensemble du cours principal Cette proposition est motiveacutee par deux principales raisons

- Lrsquoalevinage est inefficace agrave lrsquoamont du seuil drsquoEntremont car apregraves plus de 15 ans il nrsquoa pas permis drsquoinstaller une population en place eacutequilibreacutee

- Il semble impeacuteratif de preacuteserver lrsquoimportante population de truite sauvage preacutesente agrave lrsquoaval du seuil drsquoEntremont Les reacutesultats geacuteneacutetiques indiquent que la population preacutesente est une population sauvage qui nrsquoa pas eacuteteacuteimplanteacutee suite agrave lrsquoalevinage Elle preacutesente un degreacute de pureteacute geacuteneacutetique important Cette population repreacutesente un patrimoine unique dans le Faucigny Le but drsquoarrecircter les alevinages sur ce secteur est drsquoeacuteviter les hybridations qui peuvent entraicircner une perte de plasticiteacute geacuteneacutetique et une deacutegeacuteneacuterescence de la souche sauvage actuelle

Arrecirct du repeuplement sur lrsquoaval de lrsquoOveacuteran Ce secteur est utiliseacute comme zone de reproduction par les geacuteniteurs du Borne et la reproduction naturelle y est abondante Lrsquoalevinage nrsquoest donc pas neacutecessaire et risque comme sur le Borne de provoquer une hybridation de la population naturelle

Essayer drsquoinstaller une population naturelle agrave lrsquoamont du seuil drsquoEntremont par transferts de geacuteniteurs

Sur les autres affluents deux sceacutenarii de gestion peuvent ecirctre envisageacutes selon la volonteacute politique des gestionnaires directs

Sceacutenario ndeg1 vision patrimoniale

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- Arrecirct du repeuplement en truite drsquoorigine Atlantique pendant 3 anneacutees conseacutecutives pour diminuer leur preacutesence sur le bassin

- Puis reprise de lrsquoalevinage pendant uniquement 3 anneacutees agrave partir de poissons sauvages issus du Borne pour essayer drsquoinstaller une population naturelle

Sceacutenario ndeg2 vision halieutique- Maintien des pratiques drsquoalevinage en atlantique pour soutenir

artificiellement le stock de poissons dans un inteacuterecirct uniquement halieutique Attention cette pratique risque de provoquer par deacutevalaison des individus introduits une hybridation des poissons sauvages preacutesents dans le Borne

Eventuellement repeuplement en truites Arc en Ciel surdensitaires sur des secteurs preacutecis du Borne pendant la peacuteriode estivale afin de contenter une certaine cateacutegorie de pecirccheurs Les repeuplements en Arc en Ciel ne risquent pas de provoquer drsquohybridation de la souche fario locale Attention prendre des preacutecautions aupregraves des fournisseurs concernant la qualiteacute sanitaire des poissons

32 Bassin du Giffre

Les propositions sur le bassin du Giffre prennent en compte les reacutesultats du marquage mais eacutegalement la situation actuelle de la riviegravere suite agrave lrsquoeacuteboulement de Sixt Fer agrave Cheval

Ne pas aleviner le cours principal du Giffre en alevins de fario pendant 5 anneacutees conseacutecutives Cette proposition est motiveacutee par les raisons suivantes

- Il est impossible de savoir comment va eacutevoluer dans les prochains mois et les prochaines anneacutees le glissement agrave lrsquoamont de Sixt Il semble donc risqueacute drsquoentreprendre un alevinage pour installer une nouvelle population

- Les reacutesultats des marquages sur le Giffre sont tregraves contrasteacutes Sauf au niveau de Sixt ils montrent qursquoil existait avant le glissement une reproduction naturelle importante et capable de soutenir une population

- Les reacutesultats geacuteneacutetiques reacutecents indiquent que les populations en place sont en majoriteacute drsquoorigine atlantique mais qursquoil existe encore des individus meacutediterraneacuteens non hybrideacutes jusque dans les zones amont Ces reacutesultats prouvent qursquohistoriquement la souche meacutediterraneacuteenne eacutetait bien preacutesente sur lrsquoensemble du Giffre

- Il est envisageable que cette souche sauvage eacutegalement preacutesente sur les parties basses des affluents recolonise naturellement le Giffre

- Lrsquoexemple du Borne montre qursquoapregraves une catastrophe la riviegravere a eacuteteacute recoloniseacutee par une souche sauvage malgreacute des alevinages massifs Les reacutesultats obtenus sur cette riviegravere doivent servir de base de reacuteflexions pour la nouvelle gestion agrave entreprendre sur le Giffre

- Entre le Risse et Marignier la population de truites avant le glissement eacutetait deacutejagrave totalement deacuteseacutequilibreacutee et en quasi disparition (peu de juveacuteniles quasi absence de geacuteniteurs et absence de classes drsquoacircges intermeacutediaires) malgreacute les alevinages massifs sur ce secteur

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Reacutealiser un bilan de lrsquoimpact du glissement de terrain sur le peuplement piscicole

- Une eacutetude piscicole sera reacutealiseacutee tregraves prochainement (2004 ou 2005) sur le Giffre dans le cadre du contrat de riviegravere Cette eacutetude permettra de faire un premiereacutetat des lieux complet du peuplement piscicole suite au glissement

Accomplir un diagnostic de lrsquoeacutetat de recolonisation du Giffre par les populations naturelles

- En lrsquoabsence drsquoalevinage il sera possible de reacutealiser en 2008 un bilan des populations de truites installeacutees sur le Giffre

- A partir de lrsquoeacutetat de la population agrave cette eacutepoque un plan drsquoalevinage coheacuterent en truite fario pourra ecirctre eacutetabli pour permettre drsquoinstaller de nouvelles populations ou de soutenir des populations preacutesentes

Mettre en place des deacuteversements de truites Arc en Ciel pendant toute la peacuteriode drsquoarrecirct de lrsquoalevinage en fario Attention prendre des preacutecautions aupregraves des fournisseurs concernant la qualiteacute sanitaire des poissons

Reacuteintroduire lrsquoOmbre commun sur la plaine de Samoeumlns et agrave lrsquoaval de la confluence avec le Risse

Arrecirct de lrsquoalevinage sur lrsquoensemble du Risse sur lrsquoaval du Foron de Mieussy et sur lrsquoEtroit Denteacutee

- Sur ces riviegraveres le suivi du marquage a montreacute que lrsquoalevinage nrsquoeacutetait pas neacutecessaire pour soutenir les populations de truites preacutesentes

Maintenir lrsquoalevinage sur lrsquoamont du Foron de Mieussy (vers Sommand) et lrsquoamont du Foron de Taninges (Bonnavaz)

- Sur ces secteurs le suivi du marquage a montreacute que les juveacuteniles preacutesents dans le milieu naturel eacutetaient en majoriteacute des individus introduits

33 Le Foron du Reposoir

Les propositions de gestion sur le Foron du Reposoir sont

Maintenir les alevinages actuels avec la souche Chazey Bons Rhodanienne

Suivre lrsquoeacutevolution de la population pour savoir si cet alevinage permet drsquoinstaller une population fonctionnelle

- Ce suivi peut comprendre des pecircches de sondages en deacutebut de peacuteriode de reproduction pour voir si les poissons adultes deviennent matures des releveacutes de frayegraveres sur la riviegravere pour savoir si les poissons se reproduisent et de nouveaux preacutelegravevements de poissons pour suivre lrsquoeacutevolution du taux de marqueacutes dans la population

34 Bassin de la Filliegravere

Les orientations pour une gestion coheacuterente des populations de la Filliegravere sont les suivantes

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Arrecirct de lrsquoalevinage sur le cours principal de la Filliegravere sur le Crenant et sur lrsquoaval du Flan

- Sur ces 3 riviegraveres lrsquoalevinage nrsquoest pas neacutecessaire car il ne permet pas de soutenir les populations preacutesentes et de plus la reproduction naturelle est tregraves importante

- Sur la Filliegravere les pecircches drsquoadultes dans le cadre du programme INTERREG ont mis en eacutevidence la preacutesence drsquoune population sauvage drsquoorigine meacutediterraneacuteenne Il semble important drsquoentreprendre une mesure de conservation de cette souche en arrecirctant lrsquoalevinage pour eacuteviter lrsquohybridation

- Sur lrsquoamont du Flan il est neacutecessaire de continuer le suivi des poissons marqueacutes pour savoir si lrsquoalevinage doit ecirctre maintenu

Sur le Daudens deux sceacutenarii de gestion peuvent ecirctre envisageacutes selon la volonteacute politique des gestionnaires directs

Sceacutenario ndeg1 vision patrimoniale- Arrecirct du repeuplement en truite drsquoorigine Atlantique pendant 3 anneacutees

conseacutecutives pour diminuer leur preacutesence sur le bassin- Commencer les proceacutedures afin de rendre le seuil du Plot

franchissable pour les geacuteniteurs de la Filliegravere- Reacutealiser un bilan notamment deacutemographique de la population en place

apregraves lrsquoarrecirct de lrsquoalevinage- Puis reprise de lrsquoalevinage pendant uniquement 3 anneacutees agrave partir de

poissons sauvages issus de la Filliegravere pour essayer drsquoinstaller une population naturelle

Sceacutenario ndeg2 vision halieutique- Maintien des pratiques drsquoalevinage en atlantique pour soutenir

artificiellement le stock de poissons dans un inteacuterecirct uniquement halieutique Attention cette pratique risque de provoquer par deacutevalaison des individus introduits une hybridation des poissons sauvages preacutesents dans la Filliegravere

35 Le Foron de Fillinges

Les reacutesultats obtenus sur le Foron de Fillinges ont conduit agrave formuler les propositions de gestion suivantes

Arrecirct de lrsquoalevinage sur lrsquoensemble du Foron de Fillinges- Quelque soit la souche utiliseacutee et les quantiteacutes introduites les poissons

alevineacutes ne repreacutesentent qursquoune tregraves faible minoriteacute des poissons preacutesents dans le milieu Le Foron abrite une population naturelle fonctionnelle et eacutequilibreacutee

Suivi de la population suite agrave lrsquoarrecirct du repeuplement- Reacutealisation de 5 stations de pecircches eacutelectriques la derniegravere anneacutee de

lrsquoalevinage afin de reacutealiser un eacutetat des lieux preacutecis de la population de truites et du peuplement piscicole

- Reacutealisation drsquoun nouveau bilan de la population du Foron respectivement 3 ans puis 6 ans apregraves lrsquoarrecirct de lrsquoalevinage

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4 Investigations suppleacutementaires

Suite aux premiers reacutesultats obtenus lors de la campagne 2002 des investigations suppleacutementaires permettant de preacuteciser certains points seront reacutealiseacutees

Reacutealiser une analyse bacteacuteriologique des diffeacuterents lots de poissons alevineacutes qui ont transiteacutes dans les piscicultures associatives Cette recherche de pathologie permettra de savoir si les poissons issus de pisciculture sont porteurs drsquoune maladie bacteacuterienne avant drsquoecirctre introduits dans le milieu ou si ils contractent la maladie dans le milieu naturel

Rechercher les raisons pour lesquelles on nrsquoobserve pas drsquoalevins naturels sur certains secteurs Les causes drsquoune telle situation peuvent ecirctre

- Lrsquoabsence totale de geacuteniteurs dans la population Les poissons nrsquoont pas le temps de devenir adulte (3+) et sont captureacutes avant par les pecirccheurs

- La preacutesence drsquoadultes non matures Les poissons deviennent adultes mais sont immatures (eacutetat sanitaire des poissons souche geacuteneacutetiquement deacutegeacuteneacutereacutee)

- Survie nulle durant la phase de vie sous graviers Les poissons pondent mais les œufs nrsquoarrivent pas agrave se deacutevelopper et la mortaliteacute est totale

Sur les secteurs du Chinaillon de la Duche de lrsquoOveacuteran amont et du Foron de Mieussy amont (Sommand) les actions suivantes peuvent ecirctre entreprises

- Pecircches eacutelectriques de sondage en deacutebut de la peacuteriode de reproduction pour savoir si les poissons deviennent matures

- Releveacutes de frayegraveres permettant drsquoobserver ou non une activiteacute de reproduction- Mise en place drsquoincubateurs-tests contenant des œufs de truites pour connaicirctre le taux

de survie des œufs dans les frayegraveres

Reacutealiser des preacutelegravevements suppleacutementaires aux classes drsquoacircge supeacuterieures (1+ et 2+) sur certaines stations pour voir lrsquoeacutevolution du taux de marqueacutes au cours des anneacutees Ces recherches suppleacutementaires peuvent ecirctre effectueacutees sur 8 cours drsquoeau ougrave le taux de marqueacutes deacutepasse 60 au stade 0+

Le ruisseau de la Duche amontLe ruisseau du Chinaillon amontLe Foron du ReposoirLe Risse avalLe Foron de Taninges amont (Bonnavaz)Le Foron de Mieussy amont (Sommand)Le Daudens amont et avalLe Flan amont

Dans les eacutetudes preacuteceacutedentes reacutealiseacutees sur le Fier (CAUDRON et CHAMPIGNEULLE 2002) et sur le Doubs (CHAMPIGNEULLE et al 2002) les taux de marqueacutes aux stades 1+ et 2+ dans la population en place srsquoeffondraient et devenaient tregraves faibles ou nuls

Pour informations le graphique suivant montre lrsquoeacutevolution du taux de marqueacutes agrave diffeacuterents stades sur les stations ougrave le taux de 0+ marqueacutes eacutetait eacuteleveacute

42

Les reacutesultats montrent agrave part pour une station une chute importante des taux de marqueacutes entre les stades 0+ et 1+ Cette chute se poursuit eacutegalement au stade 2+Ces reacutesultats obtenus sur le Fier et le Doubs semblent laisser peu drsquoespoirs sur le devenir des poissons marqueacutes sur les bassins eacutetudieacutes en 2002

Reacutesultats sur leacutevolution du taux de m arqueacutes aux diffeacuterents stades obtenus lors des eacutetudes preacuteceacutedentes sur le Fier et le Doubs

0102030405060708090

100

0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 0+ 1+ 0+ 1+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+

Station A Station B Station C StationD

StationE

StationF

Station A Station B StationC

Stations et stades

Pou

rcen

tage

de

mar

queacutes

Le Fier Le Doubs

Reacutesultats sur leacutevolution du taux de m arqueacutes aux diffeacuterents stades obtenus lors des eacutetudes preacuteceacutedentes sur le Fier et le Doubs

0102030405060708090

100

0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 0+ 1+ 0+ 1+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+

Station A Station B Station C StationD

StationE

StationF

Station A Station B StationC

Stations et stades

Pou

rcen

tage

de

mar

queacutes

Le Fier Le Doubs

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2

niveau des otolithes qui sont alors les seules parties calcifieacutees Un travail de MEUNIER et BOIVIN (1978) a montreacute qursquoil eacutetait possible de concilier un bon marquage des tissus osseux de la truite avec lrsquoalizarine sans affecter sa croissance Les effets toxicologiques et eacutecotoxicologiques restent encore agrave ecirctre davantage et plus largement eacutetudieacutes de mecircme que lrsquoexistence et la dynamique des eacuteventuels reacutesidus Une eacutetude approfondie est en cours en Allemagne en relation avec un tregraves important programme de marquage des larves de coreacutegone deacuteverseacutees dans le lac de Constance (RUHLE ECKMANN comm personn) Crsquoest pourquoi il faudra ecirctre attentif aux reacutesultats de cette eacutetude pour mieux preacuteciser dans le futur lrsquoensemble des conditions drsquoemploi de lARS dans le contexte du marquage agrave des stades preacutecoces des poissons de repeuplement en milieu naturel

Le marquage consiste en une balneacuteation de 3 heures des alevins veacutesiculeacutes (fin de reacutesorption) dans un bain drsquoAlizarine Red S agrave une concentration de 100mglitre drsquoeau le marquage est preacutevu durant trois anneacutees successives (2002-2003-2004) dans six piscicultures associatives

12Description preacutecise de la technique de marquage

Les marquages dans les six eacutetablissements concerneacutes ont eacuteteacute eacutetaleacutes sur la peacuteriode feacutevrier-avril 2002 agrave des tempeacuteratures allant de 2 agrave 10degC selon les lots ou les piscicultures Ils ont eacuteteacute reacutealiseacutes dans des auges drsquoincubation dont le volume drsquoeau a eacuteteacute geacuteneacuteralement de 100 agrave 300 litres drsquoeau brute

Dans un premier temps la poudre preacute-doseacutee en laboratoire contenu dans la fiole est dilueacutee dans un volume drsquoeau brute de 10 litres afin de preacuteparer la solution colorante

Le volume drsquoeau contenant les alevins agrave traiter est ajusteacute lrsquoalimentation en eau est coupeacutee et le systegraveme de vidange est totalement eacutetancheacuteifieacute

Un systegraveme drsquooxygeacutenation simple de lrsquoeau est mis en place pour eacuteviter les risques drsquoasphyxies Un systegraveme de circulation drsquoeau en circuit fermeacute agrave lrsquoaide drsquoune pompe peut eacutegalement ecirctre installeacute pour assurer une reacutepartition optimale de la solution colorante pendant toute la dureacutee de la balneacuteation

La solution colorante est ensuite introduite progressivement pour permettre une reacutepartition homogegravene du colorant

Apregraves 3 heures de balneacuteation la circulation normale de lrsquoeau est progressivement reacutetablie ce qui permet drsquoeacutevacuer lentement la coloration et son rejet et de retrouver une eau claire

Dans le cas drsquoune reacutesorption en clayettes il est aussi possible de reacuteserver une auge ou un bassin speacutecifiquement pour le marquage Cette solution permet par le simple deacuteplacement des clayettes de marquer plusieurs lots conseacutecutivement

La meacutethode de marquage peut ecirctre adapteacutee au mode de reacutesorption utiliseacute par le pisciculteur en clayette ou directement dans les auges

3

Fiole avec colorant en poudre Preacuteparation de la solution colorante

Vue de la solution colorante Introduction du colorant dans le bac de marquage

Bac de marquage Introduction des alevins en clayette dans le bac de marquage

Dans le cas de reacutesorption directement dans les auges en ciment

Bac contenant les alevins Introduction progressive du colorant dans lrsquoauge

4

13Donneacutees de repeuplement

Les donneacutees quantitatives concernant les pratiques de repeuplement ont eacuteteacute recueillies dans les plans drsquoalevinage reacutealiseacutes par les gardes professionnels des AAPPMA selon un modegravele type Chaque tronccedilon de riviegravere concerneacute par une introduction de truites a eacuteteacute reacutepertorieacute sur le plan drsquoalevinage Pour chaque tronccedilon sont noteacutees les limites amont et aval ainsi que la longueur totale et la largeur moyenne (eacutevaluation en cours)

Enfin le plan drsquoalevinage renseigne sur la quantiteacute de poissons alevineacutes lrsquoorigine des poissons utiliseacutes le stade de deacuteversement ainsi que la date drsquoalevinage

La majoriteacute des cours deau sont repeupleacutes depuis plusieurs deacutecennies par des truites de souche atlantique domestiqueacutee diffeacuterente de la souche meacutediterraneacuteenne autochtone (preacutesente agrave lorigine naturellement)

Dans le cas preacutesent seul le Foron du Reposoir a eacuteteacute alevineacute avec des individus de souche meacutediterraneacuteenne (souche Chazey-Bons sauvage) en vue dune reacutehabilitation de la population de truites de ce cours deau Le bassin versant du Borne de la Filliegravere et du Giffre ont fait lobjet dun alevinage par des truites dorigine atlantique (pisciculture Chauvey Chazey-Bons domestiques Vizille domestiques)

La majoriteacute des cours deau ont eacuteteacute repeupleacutes depuis plusieurs deacutecennies par des truites de souche atlantique domestiqueacutee diffeacuterente de la souche meacutediterraneacuteenne preacutesente naturellement Dans le cas preacutesent le Foron du Reposoir et le Foron de Fillinges ont eacuteteacute alevineacutes avec des individus de souche partiellement meacutediterraneacuteenne (souche Chazey-Bons et Pont de Gys)

14Echantillonnage en milieu naturel

En raison limportante eacutechelle spatiale de la preacutesente eacutetude il ne sera pas possible de suivre agrave toutes les classes drsquoacircge et sur tout le reacuteseau hydrographique la contribution des poissons marqueacutes dans la population en placeCependant deux types drsquoeacutechantillonnages principaux seront donc pratiqueacutes au stade 0+ dans la population en place et au stade adulte (agrave partir de 2+) dans la pecircche

Cette approche permettra de srsquoaffranchir des difficulteacutes rencontreacutees pour eacutechantillonner et sacrifier des poissons aux stades 1+ et 2+ dans les populations en place (quantiteacute repreacutesentativiteacute impact en cas de populations faibles agreacutement des gestionnaires)

Ceci nexclue pas la reacutealisation de preacutelegravevements aux stades intermeacutediaires dans des cas speacutecifiques bien cibleacutes

Pour les stades jeunes les eacutechantillonnages ont eacuteteacute reacutealiseacutes par pecircche eacutelectrique de sondage agrave lrsquoaide drsquoun appareil portable soit geacuteneacuteralement en automne soit en peacuteriode hivernale pour certains grands cours drsquoeau cas du cours principal du Giffre

Les eacutechantillonnages des 0+ des diffeacuterentes riviegraveres seront eacutetaleacutes sur trois ans (2002-2003-2004)

Pour les stades adultes des carnets seront distribueacutes agrave des pecirccheurs volontaires qui accepteront de reacutecolter des donneacutees sur leurs captures (date lieu mode de pecircche sexe maturiteacute sexuelle) et de faire des preacutelegravevements agrave domicile (eacutecailles et tecircte cette derniegravere eacutetant coupeacutee juste en arriegravere des pectorales et conserveacutee au congeacutelateur) Les carnets comportent une planche explicative reacutecapitulative des diffeacuterentes mesures et preacutelegravevements Les suivis dans la pecircche seront reacutealiseacutes au minimum dans la peacuteriode 2004-2006 durant laquelle des poissons captureacutes par les pecirccheurs seront susceptibles drsquoecirctre marqueacutes

5

Enfin une autre opportuniteacute drsquoeacutechantillonnage non preacutevisible mais utilisable est la reacutecupeacuteration de truites mortes suite agrave des pollutions

Deux types drsquoeacutechantillonnages principaux seront donc pratiqueacutes au stade 0+ dans la population en place et au stade adulte (agrave partir de 2+) dans la pecircche

15Reacutecolte et analyses des donneacutees en laboratoire

151 Caracteacuteristiques morphologiques et morphomegravetriques

Tous les juveacuteniles sont conserveacutes au congeacutelateur agrave ndash18degC Apregraves deacutecongeacutelation leur longueur totale est mesureacutee (au mm pregraves) ainsi que la longueur maximale de la pectorale gauche (agrave 01mm pregraves) La truite est peseacutee agrave 01g pregraves

Des preacutelegravevements drsquoeacutecailles sont reacutealiseacutes pour deacuteterminer lrsquoacircge de chaque individu Les lectures drsquoeacutecailles preacutealables permettent de seacutelectionner les individus faisant partie des cohortes susceptibles drsquoecirctre marqueacutees

La robe de la truite est observeacutee permettant de classer les truites selon leur pheacutenotype (type atlantique ou meacutediterraneacuteen)

La truite est ensuite disseacutequeacutee pour deacuteterminer le sexe Lrsquoeacutetat de maturiteacute sexuelle est eacutegalement noteacute

Lrsquoadipeuse est preacuteleveacutee et conserveacutee dans de lrsquoalcool absolu en tube laquo Eppendorf raquo de 15 ml pour des analyses geacuteneacutetiques

Des observations sont faites concernant lrsquoeacutetat sanitaire global apparent du poisson (preacutesence drsquoheacutemorragies visible exteacuterieurement gonflement des reins colorationhellip)

Mesure du poisson Peseacutee du poisson

6

Prise drsquoeacutecailles et lecture immeacutediate pour veacuterification de lrsquoacircge ici 0+

Deacutetermination du pheacutenotype Meacuted (haut) Atl (bas) Observation du sexe et de la maturiteacute sexuelle

Le coefficient de condition est calculeacute dapregraves la formule suivante K = (P100) (Lt10)3

K = coefficient de conditionP = poids en grammesLt = longueur totale du poisson en mm

De mecircme la longueur relative ((longueur de la nageoirelongueur totale du corps)100) des nageoires pectorales a eacuteteacute calculeacutee (BOSAKOWSKI et al 1993)

Ces renseignements notamment les caracteacuteristiques morphologiques permettent de reacutealiser des analyses comparatives entre poissons sauvages et introduits

Pour chaque poisson seacutelectionneacute il faut ensuite proceacuteder agrave lrsquoextraction la preacuteparation et lrsquoexamen des otolithes

152 Preacutesentation des otolithes

Les otolithes sont des piegraveces calcifieacutees preacutesentes dans loreille interne des poissons Ils se forment degraves le stade embryonnaire et suivent laccroissement de la truite Leur rocircle essentiel se situe au niveau du maintien de leacutequilibre du poisson

Il existe trois paires dotolithes dont la forme et la taille sont caracteacuteristiques dune espegravece

Les sagittaeIls sont logeacutes dans la partie ventro-posteacuterieure de la capsule auditive Des trois paires dotolithes les sagittae sont les plus utiliseacutes pour le fluoromarquage de masse comme dans la preacutesente eacutetude mais aussi pour des estimations de lacircge et de laccroissement des poissons Ceci se justifie par leur taille ce sont en effet les plus volumineux leur extraction sen trouve donc faciliteacutee

Les asterisciIls sont situeacutes agrave larriegravere des sagittae Comme ces derniers ils sont impliqueacutes dans la reacuteception des sons (PANFILI et al 2002)

Les lapilli

7

Ils se situent dans la zone anteacutero-dorsale de la capsule auditive et interviennent dans le maintien des postures et de leacutequilibre des poissons

Les sagittae plus volumineux et plus faciles agrave preacutelever ont donc eacuteteacute utiliseacutes pour mener agrave bien cette eacutetude

Lotolithe croit par apposition dun nouveau mateacuteriel sur sa surface Ce pheacutenomegravene cyclique fonction du meacutetabolisme du calcium et de la synthegravese des acides amineacutes conduit agrave la formation danneaux saisonniersLors du marquage agrave lalizarine Red S les truites ne sont acircgeacutees que de quelques semaines et de ce fait les otolithes sont de tregraves petite taille Le fluorochrome se fixe sur les structures en voie de mineacuteralisation (os dents cartilages calcifieacutes otolithes) Leur calcification se poursuit naturellement avec la croissance du poisson et ainsi seule la partie centrale de lotolithe correspondant agrave sa taille lors de la coloration est marqueacutee

Lalizarine Red S absorbe les rayons UV et eacutemet une fluorescence dans le spectre visible Cette proprieacuteteacute est utiliseacutee pour le repeacuterage du marqueur avec un microscope eacutequipeacute pour leacutepifluorescence

yeux

otolithes

cerveau

yeux

otolithes

cerveau

Photo et scheacutema de localisation des otolithes et du marquage

153 Extraction et lecture des otolithes

Les diffeacuterentes phases permettant la lecture des otolithes sont

Deacutecoupe et enlegravevement avec des ciseaux de la moitieacute infeacuterieure de la tecircte au-preacutealablement partiellement deacutecongeleacutee

Deacutecoupage en deux (plan sagittal) de la moitieacute supeacuterieure de la tecircte en faisant entrer la pointe infeacuterieure du ciseau dans le passage de la moelle eacutepiniegravere (canal rachidien) Ce mode de deacutecoupe seacutepare et sectionne les capsules olfactives contenant les sagittae qui apregraves que le cerveau a eacuteteacute enleveacute sont alors directement accessibles avec des pinces fines dans chaque demi-section de la partie supeacuterieure de la tecircte

Extraction des sagittae agrave lrsquoaide de pinces fines Apregraves avoir enleveacute les matiegraveres organiques reacutesiduelles sur un papier absorbant les otolithes sont placeacutes dans untube Eppendorf et stockeacutes agrave lrsquoabri de la lumiegravere

8

Collage de chaque otolithe (face convexe vers lrsquoexteacuterieur) sur une lame de verre mince agrave lrsquoaide drsquoune thermocolle (colle Crystalbonb Aremco ndeg 509) chauffeacutee agrave 120 degC Durant cette eacutetape il est important drsquoenlever les bulles drsquoair existantes celles-ci pouvant eacutemettre une fluororescence parasite

Polissage des otolithes sur des plaques de papiers abrasifs de granulomeacutetrie diffeacuterente (Escil PSA G 400 G 800 et G 1200) Lrsquoeacutevolution du polissage est suivi par plusieurs controcircles sous microscope afin drsquoatteindre et de ne pas deacutepasser le centre de lrsquootolithe

Lecture de lrsquootolithe sous un microscope eacutequipeacute pour lrsquoeacutepifluorescence car lrsquoARS est deacutetectable par la fluorescence qursquoil eacutemet lorsquil est irradieacute en lumiegravere ultraviolette La lecture est faite le jour mecircme du polissage car la lisibiliteacute de la marque diminue avec le temps impliquant alors la neacutecessiteacute drsquoun leacuteger repolissage

Lorsque lrsquootolithe a eacuteteacute marqueacute celui-ci montre en son centre un anneau ou un noyau (selon la preacutecociteacute du marquage etou positionnement du plan de polissage par rapport au nucleacuteus) apparaissant rouge fluorescent (jeu de filtres Zeiss ndeg15 BP 54612 FT 580 LP 590 ) ou jaune orangeacute (jeu de filtres Zeiss ndeg9 BP 450-490 FT 510 LP 520)

Lorsque lrsquootolithe a eacuteteacute marqueacute celui-ci montre en son centre un anneau fluorescent jaune orangeacute ou rouge fluorescent selon le filtre utiliseacute

Enlegravevement de la moitieacute infeacuterieure de la tecircte agrave lrsquoaide de ciseaux

Emplacement de lotolitheEmplacement de lotolithe

Tecircte apregraves dissection Localisation de lrsquootolithe

9

Extraction de lrsquootolithe Otolithes colleacutes sur lame mince Ponccedilage de lrsquootolithe

Observation de la lame mince au microscope

05mm 05mmVue au microscope drsquoun otolithe ponceacute Otolithe marqueacute (anneau fluo vert-jaune)

16Symptocircmes pathologiques observeacutes

161 La maladie reacutenale prolifeacuterative (MRP ou PKD ou teacutetracapsulose)

Selon ESCHER et al (Fischnetz-info mars et deacutecembre 2001) cette maladie est provoqueacutee par un seul parasite Tetracapsula bryosalmonae (myxosoaire) Chez les poissons on le rencontre chez les salmonideacutes et le brochet les truites eacutetant particuliegraverement toucheacutees Le taux de mortaliteacute peut ecirctre fort chez ces derniegraveres (10 agrave 100) surtout sur les estivaux

Pour que les symptocircmes (affaiblissement contraction dautres maladies) se deacuteveloppent la tempeacuterature de leau doit ecirctre supeacuterieure agrave 15degC De plus il semble que des facteurs tels quun faible taux doxygeacutenation ou une pollution chimique favoriseraient la maladie

10

Afin de savoir si la truite en preacutesence est infecteacutee il faut observer ses reins En effet un poisson ayant deacuteveloppeacute la maladie a des reins grossis et dune coloration inhabituelle

Le mode de propagation de la maladie et le cycle complet du parasite ne sont que partiellement connus Tetracapsula parasite les bryozoaires de petits organismes filtreurs qui forment des colonies de quelques centimegravetres de diamegravetre sur diffeacuterents types de substrats et que lon rencontre dans la plupart des lacs et cours deau

Les parasites se multiplient dans les bryozoaires ils ont alors une taille de 20 μm et se concentrent dans des sortes de grandes poches de 350 μm de diamegravetre Le parasite peacutenegravetre dans le poisson sous forme de petites spores agrave travers les cellules du mucilage de la peau et ce au cours de la premiegravere minute apregraves lentreacutee en contact avec lagent pathogegravene A laide de la circulation sanguine les parasites atteignent les reins ougrave ils forment diffeacuterents stades de deacuteveloppement et provoquent de violentes reacuteactions inflammatoires Il en reacutesulte les diffeacuterentssymptocircmes deacutecrits preacuteceacutedemment

Le parasite drsquoun diamegravetre de 5 agrave 20 microm a pu ecirctre observeacute dans les vaisseaux sanguins de presque tous les organes (sauf du cerveau de la moelle eacutepiniegravere et des yeux) Les spores sont libeacutereacutees dans lrsquoeau avec lrsquourine du poisson et sont probablement absorbeacutees de nouveau par les bryozoaires

Les truites qui survivent ou qui ont deacutejagrave eacuteteacute infecteacutees sans deacutevelopper la maladie sont en geacuteneacuteral immuniseacutees lanneacutee suivante

Poisson atteint pas la PKD (reins gonfleacutes et preacutesence de nodules)

La PKD provoque chez les jeunes truites une mortaliteacute variant de 10 agrave 100 des individus toucheacutesLe deacuteveloppement du parasite est favoriseacute en eacuteteacute lorsque la tempeacuterature de lrsquoeau atteint 15degC

162 Pathologies bacteacuteriennes

Des symptocircmes probablement dus agrave une pathologie bacteacuterienne ont eacuteteacute mis en eacutevidence lors de cette eacutetude En effet un pourcentage non neacutegligeable de truites eacutetait affecteacute par des rougeurs de type heacutemorragie agrave la base des nageoires

11

Selon MORAND (com pers) deux maladies bacteacuteriennes peuvent engendrer ces symptocircmes (la furonculose et la yerciniose) Ces deux maladies sont preacutesentes dans le monde entier et atteignent tout particuliegraverement les eacutelevages de salmonideacutes

Elles peuvent ecirctre favoriseacutees par des conditions particuliegraveres du milieu environnant tempeacuterature de leau eacuteleveacutee (supeacuterieure agrave 10 degC) une charge organique importante ou encore une pollution diminuant les deacutefenses immunitaires du poissonhellip

Selon la graviteacute de laffection ces pathologies peuvent entraicircner de lourds taux de mortaliteacute atteignant jusquagrave 70 dans certains cas (MOURRIERAS 1995)

Les heacutemorragies observeacutees agrave la base des nageoires sont la conseacutequence drsquoune infection bacteacuterienne pouvant provoquer drsquoimportantes mortaliteacutes

17Utilisation du SIG de la Feacutedeacuteration de pecircche de Haute-Savoie

Les donneacutees du programme pilote de marquage et du programme INTERREG sont inteacutegreacutees dans un SIG (Systegraveme dInformation Geacuteographique MapInfo) mis en place agrave la Feacutedeacuteration de pecircche de Haute-Savoie et agrave lINRA de Thonon

Ainsi toutes les informations relatives aux cours deau du deacutepartement seront consigneacutees dans cette base de donneacutees (pente longueur preacutesence de seuils infranchissables caracteacuteristiques physico-chimiques IBGN hydrologie occupation des bassins versantshellip) Il en sera de mecircme pour les donneacutees truites (repeuplement densiteacute biomasses croissance structure dacircge pathologie geacuteneacutetiquehellip)

Lapproche finale visera agrave rechercher les relations existant entre ces deux groupes de donneacutees spatialiseacutees Une toute premiegravere deacutemarche a eacuteteacute partiellement tenteacutee dans le cas du preacutesent rapport dont les donneacutees ont eacuteteacute inteacutegreacutees dans le SIG en cours de construction

12

2 Reacutesultats et discussions

Ce chapitre preacutesente les reacutesultats obtenus sur les bassins eacutetudieacutes lors de la campagne de preacutelegravevements 2002 agrave savoir

Le GiffreLe BorneLa FilliegravereLe Foron de ScionsiezLe Foron de Fillinges

Lors de la campagne 2002 1703 poissons au stade 0+ ont eacuteteacute eacutechantillonneacutes en milieu naturel et eacutetudieacutes en laboratoire

21Taux de marquage sexe ratio et pathologie

211 Le Borne

Sur le bassin du Borne 5 stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal et 3 sur des affluents Au total ce sont 392 poissons 0+ qui ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

Sur le cours principal

Les taux de marqueacutes varient fortement sur le cours principal du Borne (18 agrave 100) On observe un gradient amont-aval du taux de marqueacutes qui peut ecirctre mis en relation avec la preacutesence drsquoun obstacle partiellement infranchissable pour les geacuteniteurs au niveau drsquoEntremont

Ainsi deux grandes zones peuvent ecirctre distingueacutees sur le Borne

La zone amont du seuil drsquoEntremont ougrave la majoriteacute des juveacuteniles sont issus du repeuplement (90 agrave 100)

On observe sur ce secteur une tregraves faible reproduction naturelle en raison drsquoune quasi-absence de poissons adultes La situation de la population de truites est donc tregraves critique Si le repeuplement permet de drsquoobserver des 0+ il nrsquoa pas permis drsquoinstaller une population fonctionnelle

La zone aval du seuil drsquoEntremont ougrave la majoriteacute des individus preacutesents au stade 0+ sont des poissons naturels

En effet le taux de marqueacutes varie de 18 agrave 49 Les pecircches de sondage Interreg ont montreacute la preacutesence drsquoune importante population de truites sauvages drsquoorigine meacutediterraneacuteenne La population est eacutequilibreacutee et naturellement fonctionnelle puisqursquoon observe une forte reproduction naturelle et de nombreux geacuteniteurs

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Sur les Affluents

Sur les 3 affluents eacutetudieacutes la situation est tregraves simple En effet soit on observe 0 de marqueacutes soit 100

- Sur lrsquoOveacuteran aval aucun poisson marqueacute nrsquoa eacuteteacute trouveacute puisqursquoil nrsquoy a pas eu de repeuplement sur ce secteur en 2002 Le reacutesultat obtenu montre une importante reproduction naturelle des geacuteniteurs du Borne qui remontent sur lrsquoaval de ce cours drsquoeau

- Sur la Duche et le Chinaillon il y a absence totale de reproduction naturelle puisque 100 des 0+ eacutechantillonneacutes sont marqueacutes Pourtant on observe de nombreux poissons adultes sur ces secteurs susceptibles drsquoecirctre des geacuteniteurs ainsi que diffeacuterentes classes drsquoacircge Lrsquoeacutequilibre de ces populations est artificiellement maintenu par les alevinages

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

- Toutes les stations eacutetudieacutees ne sont pas concerneacutees par ces symptocircmes de maladies- Les maladies bacteacuteriennes semblent toucher majoritairement les poissons introduits- Cependant les 0+ de lrsquoOveacuteran aval tous naturels sont infecteacutes agrave 15 Ce reacutesultat

peut refleacuteter une contamination par deacutevalaison provenant drsquoindividus atteints situeacutes plus en amont de lrsquoOveacuteran ou une contamination naturelle par des agents pathogegravenes preacutesents dans le milieu

- Les poissons marqueacutes peuvent ecirctre contamineacutes agrave un taux non neacutegligeable pouvant atteindre plus de 30

Pourcentage dindividus preacutesentant des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

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Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

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Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Le sexe ratio est relativement eacutequilibreacute pour les marqueacutes comme pour les non marqueacutes Seule une station sur le Borne (Beffay) montre 85 de macircle dans la population de 0+

- Seules 2 stations montrent des macircles matures au stade 0+- Le pourcentage de macircles matures au stade 0+ est plus important chez les non

marqueacutes que chez les marqueacutes

Pourcentage de macircles au stade 0+

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Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Borne

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Pourcentage de macircles au stade 0+

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Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Borne

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

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212 Le Giffre

Sur le bassin du Giffre 6 stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal et 7 sur des affluents Au total ce sont 536 poissons 0+ qui ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

Sur le cours principal

La carte de synthegravese des reacutesultats met en eacutevidence des taux de marqueacutes tregraves contrasteacutes variant entre 0 et 100 Sauf deux cas particuliers la campagne de preacutelegravevements a permis de montrer qursquoune reproduction naturelle existait sur lrsquoensemble du Giffre

Il est possible de distinguer trois zones successives sur ce cours deau

La zone aval est composeacutee de la station Pont du Giffre ougrave le taux de marqueacutes est de 74 Cette station sur le Giffre doit ecirctre rapprocheacutee des stations eacutetudieacutees sur le Risse (station laquo Risse aval St Jeoire raquo) et le Hisson(laquo station La Pallud raquo) pour mieux comprendre le fonctionnement de la population

- Sur le Giffre aval la situation semble tregraves critique La station dite laquo Pont du Giffre raquosrsquoeacutetend de lrsquoamont de Marignier agrave lrsquousine du Pont du Giffre soit sur environ 25 km Sur cette distance seulement 31 0+ ont pu ecirctre captureacutes De plus les pecircches drsquoadultes dans le cadre drsquoInterreg montrent un deacuteficit inquieacutetant de geacuteniteurs sur ce secteur ainsi qursquoune surabondance de Chabot La situation du bas Giffre montre une population de truitetotalement deacuteseacutequilibreacutee loin du potentiel de la riviegravere et qui ne peut pas ecirctre reacutehabiliteacutee par le seul fait de lrsquoalevinage Cette situation peut ecirctre le reacutesultat du faible deacutebit reacuteserveacute qui appauvrit lrsquohabitat aquatique et provoque des eacuteleacutevations de tempeacuterature inquieacutetantes Les reacutesultats de pecircche drsquoinventaire dans la reacuteserve de Marignier montrent que les poissons sont concentreacutes agrave lrsquoaval immeacutediat des seuils ougrave lrsquoon note la preacutesence de fosses de tempeacuteratures plus faibles et drsquoune meilleure oxygeacutenation

La zone moyenne situeacutee entre le barrage de Mieussy et Samoeumlns qui est composeacutee des stations laquo aval barrage Taninges raquo laquo Theacuteziegraveres raquo et laquo Montessuit raquo Sur ce secteur les 0+ marqueacutes sont en minoriteacutes puisqursquoils repreacutesentent 11 agrave 38 du peuplement

- Sur le Giffre aval barrage de Taninges le secteur nrsquoest pas alevineacute il est donc normal que pregraves de 90 des poissons ne soient pas marqueacutes Les 0+ marqueacutes proviennent certainement du ruisseau de lrsquoEtroit Denteacute qui est fortement alevineacute et agrave partir duquel une deacutevalaison doit avoir lieu- Le secteur des laquo Theacuteziegraveres raquo et de laquo Montessuit raquo bien que reacuteguliegraverement alevineacute montre un taux important drsquoalevins naturels (62 agrave 77) Ce reacutesultat est tout agrave fait en accord avec le suivi de la reproduction naturelle et le recensement de frayegraveres reacutealiseacute par lrsquoAAPPMA du Faucigny et le CSP en 1999 En effet de nombreuses frayegraveres naturelles avaient eacuteteacute observeacutees sur ce site Le peuplement drsquoadultes nrsquoest pas tregraves important mais est en rapport avec les potentialiteacutes du milieu

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18

La zone amont caracteacuteriseacutee par les stations laquo Reveacute-Peacuteret raquo et laquo amont Tines raquo ougrave le taux de marqueacutes varie de 70 agrave 79

- Pour ces deux stations la population de juveacuteniles est faible et ils sont majoritairement marqueacutes Cependant au stade adulte les pecircches Interreg montrent une majoriteacute de poissons drsquoorigine meacutediterraneacuteenne La forte contribution de poissons introduits au stade 0+ ne semble pas se retrouver au stade adulte Les conditions de vie dans ce milieu sont tregraves difficiles et ne permettent pas drsquoatteindre des densiteacutes de poissons importantes

Sur les Affluents

Le Risse - Le Hisson montre une majoriteacute drsquoalevins naturels alors que les preacutelegravevements ont eacuteteacute reacutealiseacutes seulement deux mois apregraves le repeuplement Ce cours drsquoeau possegravede un fort potentiel de frai qui est utiliseacute notamment par les geacuteniteurs du Risse- Sur lrsquoaval du Risse le taux de marqueacutes est de 68 Il est le reflet drsquoun alevinage en quantiteacute importante sur le secteur (10 000 alevins) Les alevins naturels repreacutesentent tout de mecircme plus de 30 trois mois apregraves le repeuplement De plus les eacutechantillonnages drsquoadultes reacutealiseacutes sur ce secteur dans le cadre drsquoInterreg ont mis en eacutevidence une quantiteacute importante de geacuteniteurs sauvages La population sur ce secteur est agrave mettre en eacutevidence avec celle du Hisson puisque certains geacuteniteurs du Risse y migrent pour se reproduireLa population sur ce secteur est naturellement fonctionnelle

Le Foron de Mieussy - La station laquo Andelier raquo situeacutee en amont du Foron preacutesente 100 de marqueacutes Cette situation montre une absence totale de reproduction naturelle Le milieu est extrecircmement deacutefavorable agrave lrsquoinstallation drsquoune population fonctionnelle en raison du faible deacutebit de la riviegravere (assegravechement reacutegulier) Aucune classe drsquoacircge intermeacutediaire et aucun adulte nrsquoa eacuteteacute observeacute sur ce secteur Les poissons alevineacutes sont certainement victimes des assegravechements- La station laquo Trebiet raquo situeacutee plus en aval preacutesente au contraire 0 de marqueacutes alors que cette zone a eacuteteacute alevineacutee Ce reacutesultat montre la capaciteacute du Foron sur ce secteur a accueillir une population fonctionnelle Il existe une reproduction naturelle importante sur cette zone avec eacutegalement beaucoup de geacuteniteurs- Vers Sommand une pecircche de sondage a eacuteteacute reacutealiseacutee mais aucun alevin nrsquoa eacuteteacute preacuteleveacute puisque cette zone nrsquoa pas eacuteteacute alevineacutee en 2002 Cependant les reacutesultats de ce sondage mettent en eacutevidence une absence totale de reproduction naturelle (aucun alevin naturel nrsquoa eacuteteacute trouveacute) alors que la population semble eacutequilibreacutee (preacutesence drsquoadultes et de truitelles drsquoacircge intermeacutediaire)

LrsquoEtroit Denteacute Globalement le taux de marqueacutes sur les deux stations eacutetudieacutees est faible (11 agrave 33)- Sur la station laquo aval route raquo la majoriteacute des alevins est naturelle Cette zone montre un habitat tregraves favorable pour la reproduction des geacuteniteurs qui remontent du Giffre- Sur la station laquo amont route raquo une population fonctionnelle de pheacutenotype meacutediterraneacuteen est installeacutee De nombreux geacuteniteurs sont preacutesents et le recrutement naturel est important

19

Le Foron de Taninges - En amont (station Bonnavaz) le taux de marqueacutes est tregraves important (95) Il existe donc une reproduction naturelle mais insuffisante pour permettre lrsquoinstallation drsquoune population et maintenir une activiteacute halieutique Les alevinages passeacutes nrsquoont pas permis drsquoinstaller une population fonctionnelle dans cette zone apicale- Plus en aval sur les zones non alevineacutees les pecircches eacutelectriques drsquoinventaire et de sondage reacutealiseacutees ont montreacute la preacutesence drsquoune population eacutequilibreacutee de pheacutenotype meacutediterraneacuteen avec une importante reproduction naturelle

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

Les principales remarques concernant les pathologies observeacutees sur le bassin du Giffre sont

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

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20

- La PKD est preacutesente sur le cours du Giffre mais uniquement agrave lrsquoaval du barrage de Taninges Cette situation est agrave mettre en relation avec le deacutebit reacuteserveacute insuffisant qui entraicircne une augmentation de tempeacuterature pendant la peacuteriode estivale

- Sur les affluents la PKD a eacuteteacute observeacutee sur les secteurs preacutesentant des faibles deacutebits estivaux (aval du Risse et Foron de Mieussy Andelier) qui sont certainement responsables drsquoune augmentation de tempeacuterature

- La PKD atteint agrave la fois les poissons introduits que les poissons naturels- Le pourcentage drsquoindividus toucheacutes par la PKD varie drsquoun site agrave lrsquoautre mais peut

atteindre une valeur importante avec 50 sur certain secteur- Les maladies bacteacuteriennes sont plus freacutequentes chez les individus marqueacutes Soit ces

poissons sont plus fragiles que les poissons naturels et contractent les maladies plus facilement soit les maladies sont contracteacutees en pisciculture pendant lrsquoeacutelevage

- Le pourcentage drsquoindividus toucheacutes par des symptocircmes bacteacuteriens nrsquoest pas neacutegligeable puisqursquoil peut atteindre 20

- Lrsquoensemble des stations eacutetudieacutees est toucheacute par des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes ce qui laisse penser que lrsquoensemble du bassin peut ecirctre atteint

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

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21

- Le sexe ratio apparaicirct globalement eacutequilibreacute sur lrsquoensemble des stations du Giffre- On observe des diffeacuterences entre les poissons introduits et les poissons naturels sur

seulement 3 stations Ces diffeacuterences sont en faveur des poissons marqueacutes qui montrent un pourcentage de macircles plus important

- Une maturiteacute sexuelle preacutecoce des macircles existe sur certaines stations quelle que soit lrsquoorigine des poissons

- Cette maturiteacute peut ecirctre importante et concerner jusqursquoagrave 20 des 0+

22

213 Le Foron du Reposoir

Deux stations (La Touviegravere et Le Reposoir) ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le Foron du Reposoir Seulement 15 0+ ont eacuteteacute eacutetudieacutes en raison principalement de la difficulteacute drsquoeacutechantillonner des poissons de petite taille (6-7 cm) sur ces milieux torrentiels

Le taux de marqueacutes

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23

- Sur les deux stations eacutetudieacutees le taux de marqueacutes est de 100 Lrsquoensemble des 0+ mecircme si le nombre est faible est donc issu de lrsquoalevinage Ce cours drsquoeau fait lrsquoobjet actuellement drsquoun essai drsquoimplantation drsquoune population agrave partir de la souche Chazey-Bons Rhodanienne Cette souche provient de geacuteniteurs de la riviegravere Furan (Ain) Des analyses geacuteneacutetiques reacutecentes reacutealiseacutees par analyse de microsatellites diagnostic de lrsquoADN ont montreacute que ces poissons ont un pourcentage dallegraveles meacutediterraneacuteens voisin de 65

Ce reacutesultat montre que le cours deau avait un niveau de population tregraves faible avant le repeuplement par la souche Chazey-Bons sauvagesDe plus les pecircches drsquoinventaires du CSP et les pecircches de sondage Interreg montrent qursquoune population de truites se met progressivement en place En effet on observe chaque anneacutee despoissons agrave des stades de plus avanceacutes et les captures par pecircche agrave la ligne commencent agrave ecirctre effectivesLes pecircches eacutelectriques reacutealiseacutees agrave lrsquoautomne 2002 indique que le stock de geacuteniteurs est en cours de reconstitution mais que les truites femelles nrsquoont pas encore atteint le stade geacuteniteurIl nrsquoest donc pas encore possible de dire si lrsquohabitat et la population du Foron du Reposoir sont propices agrave lrsquoinstallation drsquoune population naturellement fonctionnelle

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

Aucun symptocircme reacutenal et heacutemorragique nrsquoapparaicirct sur les 0+ eacutechantillonneacutes sur ce cours deau

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Le sexe ratio est eacutequilibreacute puisqursquoil varie de 50 agrave 60- Il nrsquoy a aucun macircle mature au stade 0+ dans les eacutechantillons preacuteleveacutes sur ce cours

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Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

24

214 La Filliegravere

Cinq stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal de la Filliegravere ainsi que sept stations sur les trois affluents principaux (Flan Creacutenant et Daudens) Au total 582 poissons 0+ ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

Sur le cours principal

Pour les 5 stations eacutetudieacutees sur le cours principal le taux de 0+ marqueacutes varie de 4 agrave 56 il est donc de tregraves faible agrave moyen et montre une forte reproduction naturelle sur toute la riviegravere Il y a un gradient amont-aval du taux de marqueacutes avec un pourcentage de poissons marqueacutes plus important en amont Cependant sur lrsquoensemble de la Filliegravere le recrutement naturel est dominant et constitue lrsquoessentiel de la population de truite

De plus les pecircches de sondages pour Interreg ont montreacute la preacutesence de nombreux drsquoadultes drsquoorigine naturelle meacutediterraneacuteenne Ceci confirme que la population de truite de la riviegravere principale est naturellement fonctionnelle

Sur les affluents

Les reacutesultats sont diffeacuterents selon que lrsquoaffluent est en connexion ou non avec la riviegravere principale

- Sur le Flan on observe en zone aval et meacutediane (stations laquo D 55 raquo et laquo Bruchon raquo) des taux de marqueacutes faibles (38 et 27) qui mettent en eacutevidence la preacutesence drsquoune forte reproduction naturelle notamment de poissons migrants de la Filliegravere Les releveacutes de frayegraveres reacutealiseacutes par lrsquoAAPPMA avaient deacutejagrave permis drsquoobserver de nombreuses frayegraveres naturelles sur ce secteurEn zone plus amont station laquo Molliet raquo le taux de marqueacutes est plus important (73) il met en eacutevidence la preacutesence drsquoun recrutement naturel mais qui reste au stade 0+ minoritaire par rapport aux individus introduits

- Sur le Daudens les deux stations (laquo Le Plot raquo et Daudens raquo) montrent des taux de marqueacutes importants (86 et 92) La reproduction naturelle est donc tregraves faible et la population de truite ne semble pas fonctionnelle Lrsquoobstacle agrave lrsquoaval de la route deacutepartementale semble preacutejudiciable car il ne permet pas aux geacuteniteurs de la Filliegravere de remonter sur le Daudens et drsquoinstaller une population fiable

- Sur le Crenant Les deux stations eacutechantillonneacutees (laquo aval raquo et Disonche raquo) ne sont pas situeacutees sur des zones alevineacutees en 2002 et il est normal de trouver 0 de marqueacutes Cependant ces reacutesultats montrent qursquoil y a une forte reproduction naturelle sur ce cours drsquoeau mecircme en zone amont et que la population semble naturellement fonctionnelle Les alevins introduits sur le Crenant ne semblent pas avoir deacutevaleacutes sur pour coloniser lrsquoaval du Crenant

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56

40

38

27

73

4

92

86

14 0

0

26

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

- La PKD semble quasiment absente du bassin de la Filliegravere sauf preacutesence anecdotique uniquement chez les non marqueacutes sur une station (laquo Millard raquo)

- Les individus marqueacutes ne sont pas toucheacutes par la PKD- Les maladies bacteacuteriennes sont preacutesentes sur lrsquoensemble du bassin mais touchent en

prioriteacute et majoritairement les individus marqueacutes

Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

0102030405060708090

100

Le J

ourd

il

Pis

cicu

lture

Milla

rd

Long

cham

ps

D55

Bru

chon

Mol

liet

Le

Plo

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Dau

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Ava

l

Dis

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e

La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere Le Flan Le Flan Le Flan LeDaudens

LeDaudens

LeCrenant

LeCrenant

Pourcentage dindividus preacutesentant des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

0102030405060

Le J

ourd

il

Pisc

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Long

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LeDaudens

LeCrenant

LeCrenant

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

0102030405060708090

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Pourcentage dindividus preacutesentant des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

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La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere Le Flan Le Flan Le Flan LeDaudens

LeDaudens

LeCrenant

LeCrenant

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

27

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Sur lrsquoensemble des stations le sexe ratio est eacutequilibreacute il montre une plus grande variation chez les individus marqueacutes

- Des macircles matures au stade 0+ ont eacuteteacute observeacutes sur trois stations uniquement chez les individus naturels

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

Pourcentage de macircles au stade 0+

0102030405060708090

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LaFilliegravere

LaFilliegravere

LaFilliegravere

LaFilliegravere

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LeDaudens

LeCrenant

LeCrenant

Pourcentage de macircles matures au stade 0+

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FilliegravereLa

FilliegravereLa

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DaudensLe

DaudensLe

CrenantLe

Crenant

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

Pourcentage de macircles au stade 0+

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Pourcentage de macircles matures au stade 0+

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DaudensLe

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

28

215 Le Foron de Fillinges

Trois stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal du Foron de Fillinges agrave savoir de lrsquoamont vers lrsquoaval laquo Bovet ndash Boex raquo laquo Pont de Fillinges raquo et laquo Couvette raquo Au total 178 poissons 0+ ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

Leacutege

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Mar

queacutes

Non

mar

queacutes

X

d

rsquoindi

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eacutes

Sec

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en

2002

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des

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ur le

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31

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31

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31

29

Sur les 3 stations eacutetudieacutees les taux de marqueacutes sont faibles agrave tregraves faibles- Sur la station laquo Bovet ndash Boex raquo le taux de marqueacutes est de seulement 31- A lrsquoaval sur les stations laquo Pont de Fillinges raquo et laquo Couvette raquo les taux de marqueacutes

sont respectivement de 0 et 2

Les reacutesultats indiquent la preacutesence drsquoune importante reproduction naturelle sur lrsquoensemble du Foron de Fillinges Quelque soit la souche utiliseacutee pour lrsquoalevinage atlantique dans le secteur Faucigny ou Meacutediterraneacuteenne Pont de Gys dans le secteur Chablais les poissons introduits restent minoritaires

Cette situation traduit la preacutesence drsquoune population bien installeacutee et fonctionnelle sur cette riviegravere

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

0102030405060708090

100

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Pourcentage dindividus preacutesentant des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

05

101520253035404550

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

0102030405060708090

100

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Pourcentage dindividus preacutesentant des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

05

101520253035404550

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

30

- Sur lrsquoensemble des stations des individus 0+ sont atteints par la PKD le pourcentage drsquoindividus malades peut atteindre 35

- Seuls les individus sauvages semblent toucheacutes par la PKD cependant le nombre drsquoindividus introduits est trop faible pour permettre une comparaison

- Toutes les stations sont eacutegalement toucheacutees par les maladies bacteacuteriennes avec des taux de contamination variant de 15 agrave 30

- Les maladies bacteacuteriennes touchent agrave la fois les individus introduits et les individus naturels

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Le sexe ratio apparaicirct eacutequilibreacute sur lrsquoensemble des stations- On observe des macircles matures degraves le stade 0+ sur lrsquoensemble des stations- Le taux de macircles matures au stade 0+ peut atteindre 15

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

Pourcentage de macircles au stade 0+

0

102030405060

708090

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Pourcentage de macircles matures au stade 0+

05

101520253035404550

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

Pourcentage de macircles au stade 0+

0

102030405060

708090

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Pourcentage de macircles matures au stade 0+

05

101520253035404550

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

31

22Caracteacuteristiques morphologiques

221 Longueur totale des individus

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Giffre

0

20

40

60

80

100

120

140Am

ont

Tine

s

Rev

eacute-Peacute

ret

Mon

tess

uit

Theacutez

iegravere

s

Aval

barr

age

Tani

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tro

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Aval

rout

e

Ande

lier

Treb

iet

La P

allu

d

Aval

St

Jeoi

re

LeGiffre

LeGiffre

LeGiffre

LeGiffre

LeGiffre

LeGiffre

Le FdeTaninges

LEtroitDenteacute

LEtroitDenteacute

Le F deMieussy

Le F deMieussy

LeHisson

Le Risse

Long

ueur

tota

le e

n m

m

Taille moyenne des 0+ sur le Borne

0

20

40

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80

100

120

140

GrandBornand

Les Etroits Entremont Beffay St Pierre en F

Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Chinaillon La Duche LOveacuteran

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Taille moyenne des 0+ sur la Filliegravere

0

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Giffre

0

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32

Sur la quasi-totaliteacute des stations eacutetudieacutees les individus marqueacutes preacutesentent une taillemoyenne supeacuterieure agrave celle des individus naturels Sur 18 stations ougrave les effectifs permettent des comparaisons statistiques la longueur totale des individus marqueacutes est significativement supeacuterieure agrave celle des truites sauvages pour 13 stations

Les 5 stations faisant exception sont laquo aval barrage Taninges raquo et laquo Pont du Giffre raquo sur le Giffre laquoAval St Jeoire raquo sur le Risse laquo Bonnavaz raquo sur le Foron de Taninges et laquo Couvette raquo sur le Foron de Fillinges Cependant sur ces stations les diffeacuterences ne sont pas significatives

Le fait que les marqueacutes aient une plus grande taille moyenne que les non marqueacutes au stade 0+ nrsquoimplique pas que cela soit systeacutematiquement le cas aux stades ulteacuterieurs En effet CAUDRON (1998) et CHAMPIGNEULLE et CACHERA (2003) ont montreacute respectivement sur le Doubs et le Fier que les diffeacuterences de tailles entre marqueacutes et non marqueacutes au stade 0+ sestompaient au stade 1+ et chez les adultes

Par ailleurs lrsquoexistence drsquoune plus grande taille au stade 0+ en automne pour les marqueacutes ne leur garantit pas un meilleur taux de seacutedentarisation En effet plusieurs eacutetudes dont celle de JONSSON et JONSSON (1993) indiquent que le taux de deacutevalaison peut ecirctre plus eacuteleveacute pour les individus agrave plus forte croissance au stade 0+ La deacutevalaison peut donc toucher preacutefeacuterentiellement les individus marqueacutes en raison de leur forte croissance

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Foron du Reposoir

0

20

40

60

80

100

120

140

La Touviegravere Le Reposoir

F du Reposoir F du Reposoir

Long

ueur

tota

le e

n m

mTaille moyenne des 0+ sur le Foron de Fillinges

0

20

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Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Foron du Reposoir

0

20

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La Touviegravere Le Reposoir

F du Reposoir F du Reposoir

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0

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Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

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m

33

222 Taille des nageoires pectorales

La figure ci-dessus montre qursquoil existe une diffeacuterence entre marqueacutes et non marqueacutes du rapport entre la longueur de la nageoire pectorale et la longueur totale du poisson

Il a sembleacute important drsquoanalyser plus en deacutetail ce caractegravere morphologique car il peut preacutesager de lrsquoaptitude des truites agrave se maintenir dans nos riviegraveres de montagne

Relation entre la longueur de la nageoire pectorale et la longueur totale des individus marqueacutes et non marqueacutes

5

7

9

11

13

15

17

19

21

23

25

27

30 50 70 90 110 130 150 170Longueur totale en mm

Long

ueur

nag

eoire

pec

tora

le e

n m

mMarqueacuteNon marqueacute

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron du Reposoir

12

14

16

18

20

La Touviegravere Le Reposoir

F du Reposoir F du Reposoir

Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron de Fillinges

12

14

16

18

20

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron du Reposoir

12

14

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20

La Touviegravere Le Reposoir

F du Reposoir F du Reposoir

Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron de Fillinges

12

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20

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

34

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Giffre

12

14

16

18

20

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Taille relative moyenne des pectorales sur le Borne

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GrandBornand

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Giffre

12

14

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Taille relative moyenne des pectorales sur la Filliegravere

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La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere Le Flan Le Flan Le Flan LeDaudens

LeDaudens

LeCrenant

LeCrenant

Taille relative moyenne des pectorales sur le Borne

12

14

16

18

20

GrandBornand

Les Etroits Entremont Beffay St Pierre en F

Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Chinaillon La Duche LOveacuteran

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Sur les 24 stations ougrave des individus marqueacutes et non marqueacutes coexistent la taille relative des nageoires pectorales est systeacutematiquement plus importante chez les individus naturelsLes truites issues du repeuplement preacutesentent donc des nageoires pectorales de longueur infeacuterieure agrave celle des truites sauvagesCette diffeacuterence morphologique est tregraves importante car le deacuteveloppement des nageoires est un eacuteleacutement deacuteterminant pour la survie du poisson dans son milieu notamment pour la stabiliteacute la reacutesistance au courant et la recherche de nourriture an action de chasse

Il semble donc possible que cette caracteacuteristique anatomique soit le reacutesultat drsquoune adaptation agrave la vie en torrent

BOSAKOWSKI et al (1993) ont eacutegalement observeacutes des reacutesultats comparables chez des truites arc-en-ciel et des truites brunes de plus grande taille entre poissons drsquoeacutelevage et poissons sauvages Dans cette eacutetude les poissons deacutelevage preacutesentaient des nageoires nettement plus courtes (10-50) que les poissons sauvages Selon les auteurs cette diffeacuterence semblait ecirctre causeacutee par les conditions de vie des poissons dans les bassins des piscicultures(agression intraspeacutecifique stress qualiteacute de leau et densiteacutes de poissons) qui provoquaient une eacuterosion des nageoires

Dans le cas preacutesent les poissons de repeuplement ont eacuteteacute introduits agrave des stades preacutecoces dans le milieu et ont eacuteteacute preacuteleveacutes 4 agrave 5 mois apregraves leur introduction En conseacutequence ils ont veacutecu peu de temps en pisciculture et ont par contre passeacute lessentiel de leur vie dans le mecircme milieu naturel que les poissons sauvages Ainsi il semble que ce dimorphisme de la nageoire entre poissons sauvages et introduits soit drsquoorigine geacuteneacutetique Une eacutetude de RIDDELL et al (1981) a montreacute chez le saumon que les diffeacuterences de deacuteveloppement de nageoires eacutetaient une adaptation des poissons agrave leur milieu qui preacutesentait une origine geacuteneacutetiqueIl est donc tout agrave fait probable qursquoun pheacutenomegravene similaire se rencontre chez la truite fario et que les truites sauvages soient mieux adapteacutees sur le plan morphologique (gracircce agrave des diffeacuterences geacuteneacutetiques) aux conditions du milieu que les poissons introduits mecircme agrave des stades preacutecoces

Outre lrsquoaspect purement geacuteneacutetique les facteurs environnants peuvent eacutegalement jouer un rocircle important En effet McLAUGHLIN et al (2002) ont montreacute que cette diffeacuterence au niveau des nageoires peut eacutegalement ecirctre due agrave des caracteacuteristiques du milieu environnant dans les premiegraveres semaines de vie des poissons En effet plusieurs lots drsquoune mecircme souche de saumon de fontaine soumis degraves lrsquoeacuteclosion agrave des conditions de vie diffeacuterentes montrent des diffeacuterences dans le deacuteveloppement des nageoires Ainsi degraves les premiegraveres semaines les poissons exposeacutes agrave un fort courant sont pourvus de nageoires plus longues

Il est donc possible que les alevins produits en pisciculture nrsquoeacutetant pas exposeacutes agrave des courants importants au cours de leurs premiegraveres semaines de vie deacuteveloppent des nageoires pectorales moins longues que les individus sauvages

Il y a probablement pour cette caracteacuteristique morphologique des interactions combinant geacuteneacutetique et conditions environnementales

Cette diffeacuterence morphologique peut eacutegalement avoir une importance dans la compeacutetition entre poissons sauvages et introduits notamment au stade juveacutenile En effet GIBSON (1973) a deacutemontreacute limportance des nageoires dans la compeacutetition interspeacutecifique

36

entre le saumon atlantique (Salmo salar L) et le saumon de fontaine (Salvenius fontinalis) deux poissons consommant la mecircme nourriture Le fait de posseacuteder des nageoires pectorales plus deacutevelopper permet au saumon atlantique de se maintenir dans les courants pour se nourrir tout en deacutepensant moins drsquoeacutenergie

Dans le cas des torrents haut-savoyards une compeacutetition intraspeacutecifique entre truites sauvages et introduites comparable agrave leacutetude de GIBSON peut se deacutevelopper La diffeacuterence morphologique entre les truites sauvages et issues du repeuplement peut donc avoir une influence lors de la compeacutetition entre ces deux types dindividus

37

3 Premiegraveres implications pour la gestion

En fonction des reacutesultats obtenus lors de la campagne de preacutelegravevements 2002 des orientations de gestion sont proposeacutees pour chaque riviegravere eacutetudieacutee Certaines propositions impliquent des changements relativement importants des pratiques actuelles de gestion

Lrsquoeacutetude de lrsquoefficaciteacute des repeuplements srsquoappuient sur une deacutemarche scientifique rigoureuse dans lrsquointeacuterecirct des gestionnaires directs (AAPPMA) puisqursquoelle permet agrave ces derniers de prendre des deacutecisions en srsquoappuyant sur des reacutesultats concrets et indiscutables Elle est conduite dans un souci drsquoeacutevaluer en toute objectiviteacute les pratiques drsquoalevinage dans le seul but drsquoameacuteliorer la gestion actuelle des populations et des milieux Concregravetement elle permet de connaicirctre rapidement les zones ougrave lrsquoalevinage en truite fario est inefficace et donc inutile et les zones ougrave celui-ci est efficace et donc neacutecessaire

En plus des reacutesultats obtenus gracircce aux marquages des juveacuteniles les propositions prennent en compte les premiers reacutesultats issus des pecircches de sondage drsquoadultes reacutealiseacutees pour le programme INTERREG (reacutedaction en cours) Lrsquointeacutegration des diffeacuterentes donneacutees (marquage juveacutenile + adultes) permet de faire des propositions coheacuterentes selon un diagnostic le plus complet possible de la population de truite preacutesente

31 Bassin du Borne

Sur les riviegraveres du bassin du Borne les orientations de gestion proposeacutees ci-apregraves restent conformes agrave celles deacutejagrave eacutevoqueacutes par CAUDRON et CHAMPIGNEULLE (2002)

Arrecirct du repeuplement selon les pratiques actuelles sur lrsquoensemble du cours principal Cette proposition est motiveacutee par deux principales raisons

- Lrsquoalevinage est inefficace agrave lrsquoamont du seuil drsquoEntremont car apregraves plus de 15 ans il nrsquoa pas permis drsquoinstaller une population en place eacutequilibreacutee

- Il semble impeacuteratif de preacuteserver lrsquoimportante population de truite sauvage preacutesente agrave lrsquoaval du seuil drsquoEntremont Les reacutesultats geacuteneacutetiques indiquent que la population preacutesente est une population sauvage qui nrsquoa pas eacuteteacuteimplanteacutee suite agrave lrsquoalevinage Elle preacutesente un degreacute de pureteacute geacuteneacutetique important Cette population repreacutesente un patrimoine unique dans le Faucigny Le but drsquoarrecircter les alevinages sur ce secteur est drsquoeacuteviter les hybridations qui peuvent entraicircner une perte de plasticiteacute geacuteneacutetique et une deacutegeacuteneacuterescence de la souche sauvage actuelle

Arrecirct du repeuplement sur lrsquoaval de lrsquoOveacuteran Ce secteur est utiliseacute comme zone de reproduction par les geacuteniteurs du Borne et la reproduction naturelle y est abondante Lrsquoalevinage nrsquoest donc pas neacutecessaire et risque comme sur le Borne de provoquer une hybridation de la population naturelle

Essayer drsquoinstaller une population naturelle agrave lrsquoamont du seuil drsquoEntremont par transferts de geacuteniteurs

Sur les autres affluents deux sceacutenarii de gestion peuvent ecirctre envisageacutes selon la volonteacute politique des gestionnaires directs

Sceacutenario ndeg1 vision patrimoniale

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- Arrecirct du repeuplement en truite drsquoorigine Atlantique pendant 3 anneacutees conseacutecutives pour diminuer leur preacutesence sur le bassin

- Puis reprise de lrsquoalevinage pendant uniquement 3 anneacutees agrave partir de poissons sauvages issus du Borne pour essayer drsquoinstaller une population naturelle

Sceacutenario ndeg2 vision halieutique- Maintien des pratiques drsquoalevinage en atlantique pour soutenir

artificiellement le stock de poissons dans un inteacuterecirct uniquement halieutique Attention cette pratique risque de provoquer par deacutevalaison des individus introduits une hybridation des poissons sauvages preacutesents dans le Borne

Eventuellement repeuplement en truites Arc en Ciel surdensitaires sur des secteurs preacutecis du Borne pendant la peacuteriode estivale afin de contenter une certaine cateacutegorie de pecirccheurs Les repeuplements en Arc en Ciel ne risquent pas de provoquer drsquohybridation de la souche fario locale Attention prendre des preacutecautions aupregraves des fournisseurs concernant la qualiteacute sanitaire des poissons

32 Bassin du Giffre

Les propositions sur le bassin du Giffre prennent en compte les reacutesultats du marquage mais eacutegalement la situation actuelle de la riviegravere suite agrave lrsquoeacuteboulement de Sixt Fer agrave Cheval

Ne pas aleviner le cours principal du Giffre en alevins de fario pendant 5 anneacutees conseacutecutives Cette proposition est motiveacutee par les raisons suivantes

- Il est impossible de savoir comment va eacutevoluer dans les prochains mois et les prochaines anneacutees le glissement agrave lrsquoamont de Sixt Il semble donc risqueacute drsquoentreprendre un alevinage pour installer une nouvelle population

- Les reacutesultats des marquages sur le Giffre sont tregraves contrasteacutes Sauf au niveau de Sixt ils montrent qursquoil existait avant le glissement une reproduction naturelle importante et capable de soutenir une population

- Les reacutesultats geacuteneacutetiques reacutecents indiquent que les populations en place sont en majoriteacute drsquoorigine atlantique mais qursquoil existe encore des individus meacutediterraneacuteens non hybrideacutes jusque dans les zones amont Ces reacutesultats prouvent qursquohistoriquement la souche meacutediterraneacuteenne eacutetait bien preacutesente sur lrsquoensemble du Giffre

- Il est envisageable que cette souche sauvage eacutegalement preacutesente sur les parties basses des affluents recolonise naturellement le Giffre

- Lrsquoexemple du Borne montre qursquoapregraves une catastrophe la riviegravere a eacuteteacute recoloniseacutee par une souche sauvage malgreacute des alevinages massifs Les reacutesultats obtenus sur cette riviegravere doivent servir de base de reacuteflexions pour la nouvelle gestion agrave entreprendre sur le Giffre

- Entre le Risse et Marignier la population de truites avant le glissement eacutetait deacutejagrave totalement deacuteseacutequilibreacutee et en quasi disparition (peu de juveacuteniles quasi absence de geacuteniteurs et absence de classes drsquoacircges intermeacutediaires) malgreacute les alevinages massifs sur ce secteur

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Reacutealiser un bilan de lrsquoimpact du glissement de terrain sur le peuplement piscicole

- Une eacutetude piscicole sera reacutealiseacutee tregraves prochainement (2004 ou 2005) sur le Giffre dans le cadre du contrat de riviegravere Cette eacutetude permettra de faire un premiereacutetat des lieux complet du peuplement piscicole suite au glissement

Accomplir un diagnostic de lrsquoeacutetat de recolonisation du Giffre par les populations naturelles

- En lrsquoabsence drsquoalevinage il sera possible de reacutealiser en 2008 un bilan des populations de truites installeacutees sur le Giffre

- A partir de lrsquoeacutetat de la population agrave cette eacutepoque un plan drsquoalevinage coheacuterent en truite fario pourra ecirctre eacutetabli pour permettre drsquoinstaller de nouvelles populations ou de soutenir des populations preacutesentes

Mettre en place des deacuteversements de truites Arc en Ciel pendant toute la peacuteriode drsquoarrecirct de lrsquoalevinage en fario Attention prendre des preacutecautions aupregraves des fournisseurs concernant la qualiteacute sanitaire des poissons

Reacuteintroduire lrsquoOmbre commun sur la plaine de Samoeumlns et agrave lrsquoaval de la confluence avec le Risse

Arrecirct de lrsquoalevinage sur lrsquoensemble du Risse sur lrsquoaval du Foron de Mieussy et sur lrsquoEtroit Denteacutee

- Sur ces riviegraveres le suivi du marquage a montreacute que lrsquoalevinage nrsquoeacutetait pas neacutecessaire pour soutenir les populations de truites preacutesentes

Maintenir lrsquoalevinage sur lrsquoamont du Foron de Mieussy (vers Sommand) et lrsquoamont du Foron de Taninges (Bonnavaz)

- Sur ces secteurs le suivi du marquage a montreacute que les juveacuteniles preacutesents dans le milieu naturel eacutetaient en majoriteacute des individus introduits

33 Le Foron du Reposoir

Les propositions de gestion sur le Foron du Reposoir sont

Maintenir les alevinages actuels avec la souche Chazey Bons Rhodanienne

Suivre lrsquoeacutevolution de la population pour savoir si cet alevinage permet drsquoinstaller une population fonctionnelle

- Ce suivi peut comprendre des pecircches de sondages en deacutebut de peacuteriode de reproduction pour voir si les poissons adultes deviennent matures des releveacutes de frayegraveres sur la riviegravere pour savoir si les poissons se reproduisent et de nouveaux preacutelegravevements de poissons pour suivre lrsquoeacutevolution du taux de marqueacutes dans la population

34 Bassin de la Filliegravere

Les orientations pour une gestion coheacuterente des populations de la Filliegravere sont les suivantes

40

Arrecirct de lrsquoalevinage sur le cours principal de la Filliegravere sur le Crenant et sur lrsquoaval du Flan

- Sur ces 3 riviegraveres lrsquoalevinage nrsquoest pas neacutecessaire car il ne permet pas de soutenir les populations preacutesentes et de plus la reproduction naturelle est tregraves importante

- Sur la Filliegravere les pecircches drsquoadultes dans le cadre du programme INTERREG ont mis en eacutevidence la preacutesence drsquoune population sauvage drsquoorigine meacutediterraneacuteenne Il semble important drsquoentreprendre une mesure de conservation de cette souche en arrecirctant lrsquoalevinage pour eacuteviter lrsquohybridation

- Sur lrsquoamont du Flan il est neacutecessaire de continuer le suivi des poissons marqueacutes pour savoir si lrsquoalevinage doit ecirctre maintenu

Sur le Daudens deux sceacutenarii de gestion peuvent ecirctre envisageacutes selon la volonteacute politique des gestionnaires directs

Sceacutenario ndeg1 vision patrimoniale- Arrecirct du repeuplement en truite drsquoorigine Atlantique pendant 3 anneacutees

conseacutecutives pour diminuer leur preacutesence sur le bassin- Commencer les proceacutedures afin de rendre le seuil du Plot

franchissable pour les geacuteniteurs de la Filliegravere- Reacutealiser un bilan notamment deacutemographique de la population en place

apregraves lrsquoarrecirct de lrsquoalevinage- Puis reprise de lrsquoalevinage pendant uniquement 3 anneacutees agrave partir de

poissons sauvages issus de la Filliegravere pour essayer drsquoinstaller une population naturelle

Sceacutenario ndeg2 vision halieutique- Maintien des pratiques drsquoalevinage en atlantique pour soutenir

artificiellement le stock de poissons dans un inteacuterecirct uniquement halieutique Attention cette pratique risque de provoquer par deacutevalaison des individus introduits une hybridation des poissons sauvages preacutesents dans la Filliegravere

35 Le Foron de Fillinges

Les reacutesultats obtenus sur le Foron de Fillinges ont conduit agrave formuler les propositions de gestion suivantes

Arrecirct de lrsquoalevinage sur lrsquoensemble du Foron de Fillinges- Quelque soit la souche utiliseacutee et les quantiteacutes introduites les poissons

alevineacutes ne repreacutesentent qursquoune tregraves faible minoriteacute des poissons preacutesents dans le milieu Le Foron abrite une population naturelle fonctionnelle et eacutequilibreacutee

Suivi de la population suite agrave lrsquoarrecirct du repeuplement- Reacutealisation de 5 stations de pecircches eacutelectriques la derniegravere anneacutee de

lrsquoalevinage afin de reacutealiser un eacutetat des lieux preacutecis de la population de truites et du peuplement piscicole

- Reacutealisation drsquoun nouveau bilan de la population du Foron respectivement 3 ans puis 6 ans apregraves lrsquoarrecirct de lrsquoalevinage

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4 Investigations suppleacutementaires

Suite aux premiers reacutesultats obtenus lors de la campagne 2002 des investigations suppleacutementaires permettant de preacuteciser certains points seront reacutealiseacutees

Reacutealiser une analyse bacteacuteriologique des diffeacuterents lots de poissons alevineacutes qui ont transiteacutes dans les piscicultures associatives Cette recherche de pathologie permettra de savoir si les poissons issus de pisciculture sont porteurs drsquoune maladie bacteacuterienne avant drsquoecirctre introduits dans le milieu ou si ils contractent la maladie dans le milieu naturel

Rechercher les raisons pour lesquelles on nrsquoobserve pas drsquoalevins naturels sur certains secteurs Les causes drsquoune telle situation peuvent ecirctre

- Lrsquoabsence totale de geacuteniteurs dans la population Les poissons nrsquoont pas le temps de devenir adulte (3+) et sont captureacutes avant par les pecirccheurs

- La preacutesence drsquoadultes non matures Les poissons deviennent adultes mais sont immatures (eacutetat sanitaire des poissons souche geacuteneacutetiquement deacutegeacuteneacutereacutee)

- Survie nulle durant la phase de vie sous graviers Les poissons pondent mais les œufs nrsquoarrivent pas agrave se deacutevelopper et la mortaliteacute est totale

Sur les secteurs du Chinaillon de la Duche de lrsquoOveacuteran amont et du Foron de Mieussy amont (Sommand) les actions suivantes peuvent ecirctre entreprises

- Pecircches eacutelectriques de sondage en deacutebut de la peacuteriode de reproduction pour savoir si les poissons deviennent matures

- Releveacutes de frayegraveres permettant drsquoobserver ou non une activiteacute de reproduction- Mise en place drsquoincubateurs-tests contenant des œufs de truites pour connaicirctre le taux

de survie des œufs dans les frayegraveres

Reacutealiser des preacutelegravevements suppleacutementaires aux classes drsquoacircge supeacuterieures (1+ et 2+) sur certaines stations pour voir lrsquoeacutevolution du taux de marqueacutes au cours des anneacutees Ces recherches suppleacutementaires peuvent ecirctre effectueacutees sur 8 cours drsquoeau ougrave le taux de marqueacutes deacutepasse 60 au stade 0+

Le ruisseau de la Duche amontLe ruisseau du Chinaillon amontLe Foron du ReposoirLe Risse avalLe Foron de Taninges amont (Bonnavaz)Le Foron de Mieussy amont (Sommand)Le Daudens amont et avalLe Flan amont

Dans les eacutetudes preacuteceacutedentes reacutealiseacutees sur le Fier (CAUDRON et CHAMPIGNEULLE 2002) et sur le Doubs (CHAMPIGNEULLE et al 2002) les taux de marqueacutes aux stades 1+ et 2+ dans la population en place srsquoeffondraient et devenaient tregraves faibles ou nuls

Pour informations le graphique suivant montre lrsquoeacutevolution du taux de marqueacutes agrave diffeacuterents stades sur les stations ougrave le taux de 0+ marqueacutes eacutetait eacuteleveacute

42

Les reacutesultats montrent agrave part pour une station une chute importante des taux de marqueacutes entre les stades 0+ et 1+ Cette chute se poursuit eacutegalement au stade 2+Ces reacutesultats obtenus sur le Fier et le Doubs semblent laisser peu drsquoespoirs sur le devenir des poissons marqueacutes sur les bassins eacutetudieacutes en 2002

Reacutesultats sur leacutevolution du taux de m arqueacutes aux diffeacuterents stades obtenus lors des eacutetudes preacuteceacutedentes sur le Fier et le Doubs

0102030405060708090

100

0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 0+ 1+ 0+ 1+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+

Station A Station B Station C StationD

StationE

StationF

Station A Station B StationC

Stations et stades

Pou

rcen

tage

de

mar

queacutes

Le Fier Le Doubs

Reacutesultats sur leacutevolution du taux de m arqueacutes aux diffeacuterents stades obtenus lors des eacutetudes preacuteceacutedentes sur le Fier et le Doubs

0102030405060708090

100

0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 0+ 1+ 0+ 1+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+

Station A Station B Station C StationD

StationE

StationF

Station A Station B StationC

Stations et stades

Pou

rcen

tage

de

mar

queacutes

Le Fier Le Doubs

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3

Fiole avec colorant en poudre Preacuteparation de la solution colorante

Vue de la solution colorante Introduction du colorant dans le bac de marquage

Bac de marquage Introduction des alevins en clayette dans le bac de marquage

Dans le cas de reacutesorption directement dans les auges en ciment

Bac contenant les alevins Introduction progressive du colorant dans lrsquoauge

4

13Donneacutees de repeuplement

Les donneacutees quantitatives concernant les pratiques de repeuplement ont eacuteteacute recueillies dans les plans drsquoalevinage reacutealiseacutes par les gardes professionnels des AAPPMA selon un modegravele type Chaque tronccedilon de riviegravere concerneacute par une introduction de truites a eacuteteacute reacutepertorieacute sur le plan drsquoalevinage Pour chaque tronccedilon sont noteacutees les limites amont et aval ainsi que la longueur totale et la largeur moyenne (eacutevaluation en cours)

Enfin le plan drsquoalevinage renseigne sur la quantiteacute de poissons alevineacutes lrsquoorigine des poissons utiliseacutes le stade de deacuteversement ainsi que la date drsquoalevinage

La majoriteacute des cours deau sont repeupleacutes depuis plusieurs deacutecennies par des truites de souche atlantique domestiqueacutee diffeacuterente de la souche meacutediterraneacuteenne autochtone (preacutesente agrave lorigine naturellement)

Dans le cas preacutesent seul le Foron du Reposoir a eacuteteacute alevineacute avec des individus de souche meacutediterraneacuteenne (souche Chazey-Bons sauvage) en vue dune reacutehabilitation de la population de truites de ce cours deau Le bassin versant du Borne de la Filliegravere et du Giffre ont fait lobjet dun alevinage par des truites dorigine atlantique (pisciculture Chauvey Chazey-Bons domestiques Vizille domestiques)

La majoriteacute des cours deau ont eacuteteacute repeupleacutes depuis plusieurs deacutecennies par des truites de souche atlantique domestiqueacutee diffeacuterente de la souche meacutediterraneacuteenne preacutesente naturellement Dans le cas preacutesent le Foron du Reposoir et le Foron de Fillinges ont eacuteteacute alevineacutes avec des individus de souche partiellement meacutediterraneacuteenne (souche Chazey-Bons et Pont de Gys)

14Echantillonnage en milieu naturel

En raison limportante eacutechelle spatiale de la preacutesente eacutetude il ne sera pas possible de suivre agrave toutes les classes drsquoacircge et sur tout le reacuteseau hydrographique la contribution des poissons marqueacutes dans la population en placeCependant deux types drsquoeacutechantillonnages principaux seront donc pratiqueacutes au stade 0+ dans la population en place et au stade adulte (agrave partir de 2+) dans la pecircche

Cette approche permettra de srsquoaffranchir des difficulteacutes rencontreacutees pour eacutechantillonner et sacrifier des poissons aux stades 1+ et 2+ dans les populations en place (quantiteacute repreacutesentativiteacute impact en cas de populations faibles agreacutement des gestionnaires)

Ceci nexclue pas la reacutealisation de preacutelegravevements aux stades intermeacutediaires dans des cas speacutecifiques bien cibleacutes

Pour les stades jeunes les eacutechantillonnages ont eacuteteacute reacutealiseacutes par pecircche eacutelectrique de sondage agrave lrsquoaide drsquoun appareil portable soit geacuteneacuteralement en automne soit en peacuteriode hivernale pour certains grands cours drsquoeau cas du cours principal du Giffre

Les eacutechantillonnages des 0+ des diffeacuterentes riviegraveres seront eacutetaleacutes sur trois ans (2002-2003-2004)

Pour les stades adultes des carnets seront distribueacutes agrave des pecirccheurs volontaires qui accepteront de reacutecolter des donneacutees sur leurs captures (date lieu mode de pecircche sexe maturiteacute sexuelle) et de faire des preacutelegravevements agrave domicile (eacutecailles et tecircte cette derniegravere eacutetant coupeacutee juste en arriegravere des pectorales et conserveacutee au congeacutelateur) Les carnets comportent une planche explicative reacutecapitulative des diffeacuterentes mesures et preacutelegravevements Les suivis dans la pecircche seront reacutealiseacutes au minimum dans la peacuteriode 2004-2006 durant laquelle des poissons captureacutes par les pecirccheurs seront susceptibles drsquoecirctre marqueacutes

5

Enfin une autre opportuniteacute drsquoeacutechantillonnage non preacutevisible mais utilisable est la reacutecupeacuteration de truites mortes suite agrave des pollutions

Deux types drsquoeacutechantillonnages principaux seront donc pratiqueacutes au stade 0+ dans la population en place et au stade adulte (agrave partir de 2+) dans la pecircche

15Reacutecolte et analyses des donneacutees en laboratoire

151 Caracteacuteristiques morphologiques et morphomegravetriques

Tous les juveacuteniles sont conserveacutes au congeacutelateur agrave ndash18degC Apregraves deacutecongeacutelation leur longueur totale est mesureacutee (au mm pregraves) ainsi que la longueur maximale de la pectorale gauche (agrave 01mm pregraves) La truite est peseacutee agrave 01g pregraves

Des preacutelegravevements drsquoeacutecailles sont reacutealiseacutes pour deacuteterminer lrsquoacircge de chaque individu Les lectures drsquoeacutecailles preacutealables permettent de seacutelectionner les individus faisant partie des cohortes susceptibles drsquoecirctre marqueacutees

La robe de la truite est observeacutee permettant de classer les truites selon leur pheacutenotype (type atlantique ou meacutediterraneacuteen)

La truite est ensuite disseacutequeacutee pour deacuteterminer le sexe Lrsquoeacutetat de maturiteacute sexuelle est eacutegalement noteacute

Lrsquoadipeuse est preacuteleveacutee et conserveacutee dans de lrsquoalcool absolu en tube laquo Eppendorf raquo de 15 ml pour des analyses geacuteneacutetiques

Des observations sont faites concernant lrsquoeacutetat sanitaire global apparent du poisson (preacutesence drsquoheacutemorragies visible exteacuterieurement gonflement des reins colorationhellip)

Mesure du poisson Peseacutee du poisson

6

Prise drsquoeacutecailles et lecture immeacutediate pour veacuterification de lrsquoacircge ici 0+

Deacutetermination du pheacutenotype Meacuted (haut) Atl (bas) Observation du sexe et de la maturiteacute sexuelle

Le coefficient de condition est calculeacute dapregraves la formule suivante K = (P100) (Lt10)3

K = coefficient de conditionP = poids en grammesLt = longueur totale du poisson en mm

De mecircme la longueur relative ((longueur de la nageoirelongueur totale du corps)100) des nageoires pectorales a eacuteteacute calculeacutee (BOSAKOWSKI et al 1993)

Ces renseignements notamment les caracteacuteristiques morphologiques permettent de reacutealiser des analyses comparatives entre poissons sauvages et introduits

Pour chaque poisson seacutelectionneacute il faut ensuite proceacuteder agrave lrsquoextraction la preacuteparation et lrsquoexamen des otolithes

152 Preacutesentation des otolithes

Les otolithes sont des piegraveces calcifieacutees preacutesentes dans loreille interne des poissons Ils se forment degraves le stade embryonnaire et suivent laccroissement de la truite Leur rocircle essentiel se situe au niveau du maintien de leacutequilibre du poisson

Il existe trois paires dotolithes dont la forme et la taille sont caracteacuteristiques dune espegravece

Les sagittaeIls sont logeacutes dans la partie ventro-posteacuterieure de la capsule auditive Des trois paires dotolithes les sagittae sont les plus utiliseacutes pour le fluoromarquage de masse comme dans la preacutesente eacutetude mais aussi pour des estimations de lacircge et de laccroissement des poissons Ceci se justifie par leur taille ce sont en effet les plus volumineux leur extraction sen trouve donc faciliteacutee

Les asterisciIls sont situeacutes agrave larriegravere des sagittae Comme ces derniers ils sont impliqueacutes dans la reacuteception des sons (PANFILI et al 2002)

Les lapilli

7

Ils se situent dans la zone anteacutero-dorsale de la capsule auditive et interviennent dans le maintien des postures et de leacutequilibre des poissons

Les sagittae plus volumineux et plus faciles agrave preacutelever ont donc eacuteteacute utiliseacutes pour mener agrave bien cette eacutetude

Lotolithe croit par apposition dun nouveau mateacuteriel sur sa surface Ce pheacutenomegravene cyclique fonction du meacutetabolisme du calcium et de la synthegravese des acides amineacutes conduit agrave la formation danneaux saisonniersLors du marquage agrave lalizarine Red S les truites ne sont acircgeacutees que de quelques semaines et de ce fait les otolithes sont de tregraves petite taille Le fluorochrome se fixe sur les structures en voie de mineacuteralisation (os dents cartilages calcifieacutes otolithes) Leur calcification se poursuit naturellement avec la croissance du poisson et ainsi seule la partie centrale de lotolithe correspondant agrave sa taille lors de la coloration est marqueacutee

Lalizarine Red S absorbe les rayons UV et eacutemet une fluorescence dans le spectre visible Cette proprieacuteteacute est utiliseacutee pour le repeacuterage du marqueur avec un microscope eacutequipeacute pour leacutepifluorescence

yeux

otolithes

cerveau

yeux

otolithes

cerveau

Photo et scheacutema de localisation des otolithes et du marquage

153 Extraction et lecture des otolithes

Les diffeacuterentes phases permettant la lecture des otolithes sont

Deacutecoupe et enlegravevement avec des ciseaux de la moitieacute infeacuterieure de la tecircte au-preacutealablement partiellement deacutecongeleacutee

Deacutecoupage en deux (plan sagittal) de la moitieacute supeacuterieure de la tecircte en faisant entrer la pointe infeacuterieure du ciseau dans le passage de la moelle eacutepiniegravere (canal rachidien) Ce mode de deacutecoupe seacutepare et sectionne les capsules olfactives contenant les sagittae qui apregraves que le cerveau a eacuteteacute enleveacute sont alors directement accessibles avec des pinces fines dans chaque demi-section de la partie supeacuterieure de la tecircte

Extraction des sagittae agrave lrsquoaide de pinces fines Apregraves avoir enleveacute les matiegraveres organiques reacutesiduelles sur un papier absorbant les otolithes sont placeacutes dans untube Eppendorf et stockeacutes agrave lrsquoabri de la lumiegravere

8

Collage de chaque otolithe (face convexe vers lrsquoexteacuterieur) sur une lame de verre mince agrave lrsquoaide drsquoune thermocolle (colle Crystalbonb Aremco ndeg 509) chauffeacutee agrave 120 degC Durant cette eacutetape il est important drsquoenlever les bulles drsquoair existantes celles-ci pouvant eacutemettre une fluororescence parasite

Polissage des otolithes sur des plaques de papiers abrasifs de granulomeacutetrie diffeacuterente (Escil PSA G 400 G 800 et G 1200) Lrsquoeacutevolution du polissage est suivi par plusieurs controcircles sous microscope afin drsquoatteindre et de ne pas deacutepasser le centre de lrsquootolithe

Lecture de lrsquootolithe sous un microscope eacutequipeacute pour lrsquoeacutepifluorescence car lrsquoARS est deacutetectable par la fluorescence qursquoil eacutemet lorsquil est irradieacute en lumiegravere ultraviolette La lecture est faite le jour mecircme du polissage car la lisibiliteacute de la marque diminue avec le temps impliquant alors la neacutecessiteacute drsquoun leacuteger repolissage

Lorsque lrsquootolithe a eacuteteacute marqueacute celui-ci montre en son centre un anneau ou un noyau (selon la preacutecociteacute du marquage etou positionnement du plan de polissage par rapport au nucleacuteus) apparaissant rouge fluorescent (jeu de filtres Zeiss ndeg15 BP 54612 FT 580 LP 590 ) ou jaune orangeacute (jeu de filtres Zeiss ndeg9 BP 450-490 FT 510 LP 520)

Lorsque lrsquootolithe a eacuteteacute marqueacute celui-ci montre en son centre un anneau fluorescent jaune orangeacute ou rouge fluorescent selon le filtre utiliseacute

Enlegravevement de la moitieacute infeacuterieure de la tecircte agrave lrsquoaide de ciseaux

Emplacement de lotolitheEmplacement de lotolithe

Tecircte apregraves dissection Localisation de lrsquootolithe

9

Extraction de lrsquootolithe Otolithes colleacutes sur lame mince Ponccedilage de lrsquootolithe

Observation de la lame mince au microscope

05mm 05mmVue au microscope drsquoun otolithe ponceacute Otolithe marqueacute (anneau fluo vert-jaune)

16Symptocircmes pathologiques observeacutes

161 La maladie reacutenale prolifeacuterative (MRP ou PKD ou teacutetracapsulose)

Selon ESCHER et al (Fischnetz-info mars et deacutecembre 2001) cette maladie est provoqueacutee par un seul parasite Tetracapsula bryosalmonae (myxosoaire) Chez les poissons on le rencontre chez les salmonideacutes et le brochet les truites eacutetant particuliegraverement toucheacutees Le taux de mortaliteacute peut ecirctre fort chez ces derniegraveres (10 agrave 100) surtout sur les estivaux

Pour que les symptocircmes (affaiblissement contraction dautres maladies) se deacuteveloppent la tempeacuterature de leau doit ecirctre supeacuterieure agrave 15degC De plus il semble que des facteurs tels quun faible taux doxygeacutenation ou une pollution chimique favoriseraient la maladie

10

Afin de savoir si la truite en preacutesence est infecteacutee il faut observer ses reins En effet un poisson ayant deacuteveloppeacute la maladie a des reins grossis et dune coloration inhabituelle

Le mode de propagation de la maladie et le cycle complet du parasite ne sont que partiellement connus Tetracapsula parasite les bryozoaires de petits organismes filtreurs qui forment des colonies de quelques centimegravetres de diamegravetre sur diffeacuterents types de substrats et que lon rencontre dans la plupart des lacs et cours deau

Les parasites se multiplient dans les bryozoaires ils ont alors une taille de 20 μm et se concentrent dans des sortes de grandes poches de 350 μm de diamegravetre Le parasite peacutenegravetre dans le poisson sous forme de petites spores agrave travers les cellules du mucilage de la peau et ce au cours de la premiegravere minute apregraves lentreacutee en contact avec lagent pathogegravene A laide de la circulation sanguine les parasites atteignent les reins ougrave ils forment diffeacuterents stades de deacuteveloppement et provoquent de violentes reacuteactions inflammatoires Il en reacutesulte les diffeacuterentssymptocircmes deacutecrits preacuteceacutedemment

Le parasite drsquoun diamegravetre de 5 agrave 20 microm a pu ecirctre observeacute dans les vaisseaux sanguins de presque tous les organes (sauf du cerveau de la moelle eacutepiniegravere et des yeux) Les spores sont libeacutereacutees dans lrsquoeau avec lrsquourine du poisson et sont probablement absorbeacutees de nouveau par les bryozoaires

Les truites qui survivent ou qui ont deacutejagrave eacuteteacute infecteacutees sans deacutevelopper la maladie sont en geacuteneacuteral immuniseacutees lanneacutee suivante

Poisson atteint pas la PKD (reins gonfleacutes et preacutesence de nodules)

La PKD provoque chez les jeunes truites une mortaliteacute variant de 10 agrave 100 des individus toucheacutesLe deacuteveloppement du parasite est favoriseacute en eacuteteacute lorsque la tempeacuterature de lrsquoeau atteint 15degC

162 Pathologies bacteacuteriennes

Des symptocircmes probablement dus agrave une pathologie bacteacuterienne ont eacuteteacute mis en eacutevidence lors de cette eacutetude En effet un pourcentage non neacutegligeable de truites eacutetait affecteacute par des rougeurs de type heacutemorragie agrave la base des nageoires

11

Selon MORAND (com pers) deux maladies bacteacuteriennes peuvent engendrer ces symptocircmes (la furonculose et la yerciniose) Ces deux maladies sont preacutesentes dans le monde entier et atteignent tout particuliegraverement les eacutelevages de salmonideacutes

Elles peuvent ecirctre favoriseacutees par des conditions particuliegraveres du milieu environnant tempeacuterature de leau eacuteleveacutee (supeacuterieure agrave 10 degC) une charge organique importante ou encore une pollution diminuant les deacutefenses immunitaires du poissonhellip

Selon la graviteacute de laffection ces pathologies peuvent entraicircner de lourds taux de mortaliteacute atteignant jusquagrave 70 dans certains cas (MOURRIERAS 1995)

Les heacutemorragies observeacutees agrave la base des nageoires sont la conseacutequence drsquoune infection bacteacuterienne pouvant provoquer drsquoimportantes mortaliteacutes

17Utilisation du SIG de la Feacutedeacuteration de pecircche de Haute-Savoie

Les donneacutees du programme pilote de marquage et du programme INTERREG sont inteacutegreacutees dans un SIG (Systegraveme dInformation Geacuteographique MapInfo) mis en place agrave la Feacutedeacuteration de pecircche de Haute-Savoie et agrave lINRA de Thonon

Ainsi toutes les informations relatives aux cours deau du deacutepartement seront consigneacutees dans cette base de donneacutees (pente longueur preacutesence de seuils infranchissables caracteacuteristiques physico-chimiques IBGN hydrologie occupation des bassins versantshellip) Il en sera de mecircme pour les donneacutees truites (repeuplement densiteacute biomasses croissance structure dacircge pathologie geacuteneacutetiquehellip)

Lapproche finale visera agrave rechercher les relations existant entre ces deux groupes de donneacutees spatialiseacutees Une toute premiegravere deacutemarche a eacuteteacute partiellement tenteacutee dans le cas du preacutesent rapport dont les donneacutees ont eacuteteacute inteacutegreacutees dans le SIG en cours de construction

12

2 Reacutesultats et discussions

Ce chapitre preacutesente les reacutesultats obtenus sur les bassins eacutetudieacutes lors de la campagne de preacutelegravevements 2002 agrave savoir

Le GiffreLe BorneLa FilliegravereLe Foron de ScionsiezLe Foron de Fillinges

Lors de la campagne 2002 1703 poissons au stade 0+ ont eacuteteacute eacutechantillonneacutes en milieu naturel et eacutetudieacutes en laboratoire

21Taux de marquage sexe ratio et pathologie

211 Le Borne

Sur le bassin du Borne 5 stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal et 3 sur des affluents Au total ce sont 392 poissons 0+ qui ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

Sur le cours principal

Les taux de marqueacutes varient fortement sur le cours principal du Borne (18 agrave 100) On observe un gradient amont-aval du taux de marqueacutes qui peut ecirctre mis en relation avec la preacutesence drsquoun obstacle partiellement infranchissable pour les geacuteniteurs au niveau drsquoEntremont

Ainsi deux grandes zones peuvent ecirctre distingueacutees sur le Borne

La zone amont du seuil drsquoEntremont ougrave la majoriteacute des juveacuteniles sont issus du repeuplement (90 agrave 100)

On observe sur ce secteur une tregraves faible reproduction naturelle en raison drsquoune quasi-absence de poissons adultes La situation de la population de truites est donc tregraves critique Si le repeuplement permet de drsquoobserver des 0+ il nrsquoa pas permis drsquoinstaller une population fonctionnelle

La zone aval du seuil drsquoEntremont ougrave la majoriteacute des individus preacutesents au stade 0+ sont des poissons naturels

En effet le taux de marqueacutes varie de 18 agrave 49 Les pecircches de sondage Interreg ont montreacute la preacutesence drsquoune importante population de truites sauvages drsquoorigine meacutediterraneacuteenne La population est eacutequilibreacutee et naturellement fonctionnelle puisqursquoon observe une forte reproduction naturelle et de nombreux geacuteniteurs

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Sur les Affluents

Sur les 3 affluents eacutetudieacutes la situation est tregraves simple En effet soit on observe 0 de marqueacutes soit 100

- Sur lrsquoOveacuteran aval aucun poisson marqueacute nrsquoa eacuteteacute trouveacute puisqursquoil nrsquoy a pas eu de repeuplement sur ce secteur en 2002 Le reacutesultat obtenu montre une importante reproduction naturelle des geacuteniteurs du Borne qui remontent sur lrsquoaval de ce cours drsquoeau

- Sur la Duche et le Chinaillon il y a absence totale de reproduction naturelle puisque 100 des 0+ eacutechantillonneacutes sont marqueacutes Pourtant on observe de nombreux poissons adultes sur ces secteurs susceptibles drsquoecirctre des geacuteniteurs ainsi que diffeacuterentes classes drsquoacircge Lrsquoeacutequilibre de ces populations est artificiellement maintenu par les alevinages

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

- Toutes les stations eacutetudieacutees ne sont pas concerneacutees par ces symptocircmes de maladies- Les maladies bacteacuteriennes semblent toucher majoritairement les poissons introduits- Cependant les 0+ de lrsquoOveacuteran aval tous naturels sont infecteacutes agrave 15 Ce reacutesultat

peut refleacuteter une contamination par deacutevalaison provenant drsquoindividus atteints situeacutes plus en amont de lrsquoOveacuteran ou une contamination naturelle par des agents pathogegravenes preacutesents dans le milieu

- Les poissons marqueacutes peuvent ecirctre contamineacutes agrave un taux non neacutegligeable pouvant atteindre plus de 30

Pourcentage dindividus preacutesentant des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

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Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Chinaillon La Duche LOveacuteran

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

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Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

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Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Le sexe ratio est relativement eacutequilibreacute pour les marqueacutes comme pour les non marqueacutes Seule une station sur le Borne (Beffay) montre 85 de macircle dans la population de 0+

- Seules 2 stations montrent des macircles matures au stade 0+- Le pourcentage de macircles matures au stade 0+ est plus important chez les non

marqueacutes que chez les marqueacutes

Pourcentage de macircles au stade 0+

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Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Borne

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Pourcentage de macircles au stade 0+

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Pourcentage de macircles matures au stade 0+

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Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Borne

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

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212 Le Giffre

Sur le bassin du Giffre 6 stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal et 7 sur des affluents Au total ce sont 536 poissons 0+ qui ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

Sur le cours principal

La carte de synthegravese des reacutesultats met en eacutevidence des taux de marqueacutes tregraves contrasteacutes variant entre 0 et 100 Sauf deux cas particuliers la campagne de preacutelegravevements a permis de montrer qursquoune reproduction naturelle existait sur lrsquoensemble du Giffre

Il est possible de distinguer trois zones successives sur ce cours deau

La zone aval est composeacutee de la station Pont du Giffre ougrave le taux de marqueacutes est de 74 Cette station sur le Giffre doit ecirctre rapprocheacutee des stations eacutetudieacutees sur le Risse (station laquo Risse aval St Jeoire raquo) et le Hisson(laquo station La Pallud raquo) pour mieux comprendre le fonctionnement de la population

- Sur le Giffre aval la situation semble tregraves critique La station dite laquo Pont du Giffre raquosrsquoeacutetend de lrsquoamont de Marignier agrave lrsquousine du Pont du Giffre soit sur environ 25 km Sur cette distance seulement 31 0+ ont pu ecirctre captureacutes De plus les pecircches drsquoadultes dans le cadre drsquoInterreg montrent un deacuteficit inquieacutetant de geacuteniteurs sur ce secteur ainsi qursquoune surabondance de Chabot La situation du bas Giffre montre une population de truitetotalement deacuteseacutequilibreacutee loin du potentiel de la riviegravere et qui ne peut pas ecirctre reacutehabiliteacutee par le seul fait de lrsquoalevinage Cette situation peut ecirctre le reacutesultat du faible deacutebit reacuteserveacute qui appauvrit lrsquohabitat aquatique et provoque des eacuteleacutevations de tempeacuterature inquieacutetantes Les reacutesultats de pecircche drsquoinventaire dans la reacuteserve de Marignier montrent que les poissons sont concentreacutes agrave lrsquoaval immeacutediat des seuils ougrave lrsquoon note la preacutesence de fosses de tempeacuteratures plus faibles et drsquoune meilleure oxygeacutenation

La zone moyenne situeacutee entre le barrage de Mieussy et Samoeumlns qui est composeacutee des stations laquo aval barrage Taninges raquo laquo Theacuteziegraveres raquo et laquo Montessuit raquo Sur ce secteur les 0+ marqueacutes sont en minoriteacutes puisqursquoils repreacutesentent 11 agrave 38 du peuplement

- Sur le Giffre aval barrage de Taninges le secteur nrsquoest pas alevineacute il est donc normal que pregraves de 90 des poissons ne soient pas marqueacutes Les 0+ marqueacutes proviennent certainement du ruisseau de lrsquoEtroit Denteacute qui est fortement alevineacute et agrave partir duquel une deacutevalaison doit avoir lieu- Le secteur des laquo Theacuteziegraveres raquo et de laquo Montessuit raquo bien que reacuteguliegraverement alevineacute montre un taux important drsquoalevins naturels (62 agrave 77) Ce reacutesultat est tout agrave fait en accord avec le suivi de la reproduction naturelle et le recensement de frayegraveres reacutealiseacute par lrsquoAAPPMA du Faucigny et le CSP en 1999 En effet de nombreuses frayegraveres naturelles avaient eacuteteacute observeacutees sur ce site Le peuplement drsquoadultes nrsquoest pas tregraves important mais est en rapport avec les potentialiteacutes du milieu

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18

La zone amont caracteacuteriseacutee par les stations laquo Reveacute-Peacuteret raquo et laquo amont Tines raquo ougrave le taux de marqueacutes varie de 70 agrave 79

- Pour ces deux stations la population de juveacuteniles est faible et ils sont majoritairement marqueacutes Cependant au stade adulte les pecircches Interreg montrent une majoriteacute de poissons drsquoorigine meacutediterraneacuteenne La forte contribution de poissons introduits au stade 0+ ne semble pas se retrouver au stade adulte Les conditions de vie dans ce milieu sont tregraves difficiles et ne permettent pas drsquoatteindre des densiteacutes de poissons importantes

Sur les Affluents

Le Risse - Le Hisson montre une majoriteacute drsquoalevins naturels alors que les preacutelegravevements ont eacuteteacute reacutealiseacutes seulement deux mois apregraves le repeuplement Ce cours drsquoeau possegravede un fort potentiel de frai qui est utiliseacute notamment par les geacuteniteurs du Risse- Sur lrsquoaval du Risse le taux de marqueacutes est de 68 Il est le reflet drsquoun alevinage en quantiteacute importante sur le secteur (10 000 alevins) Les alevins naturels repreacutesentent tout de mecircme plus de 30 trois mois apregraves le repeuplement De plus les eacutechantillonnages drsquoadultes reacutealiseacutes sur ce secteur dans le cadre drsquoInterreg ont mis en eacutevidence une quantiteacute importante de geacuteniteurs sauvages La population sur ce secteur est agrave mettre en eacutevidence avec celle du Hisson puisque certains geacuteniteurs du Risse y migrent pour se reproduireLa population sur ce secteur est naturellement fonctionnelle

Le Foron de Mieussy - La station laquo Andelier raquo situeacutee en amont du Foron preacutesente 100 de marqueacutes Cette situation montre une absence totale de reproduction naturelle Le milieu est extrecircmement deacutefavorable agrave lrsquoinstallation drsquoune population fonctionnelle en raison du faible deacutebit de la riviegravere (assegravechement reacutegulier) Aucune classe drsquoacircge intermeacutediaire et aucun adulte nrsquoa eacuteteacute observeacute sur ce secteur Les poissons alevineacutes sont certainement victimes des assegravechements- La station laquo Trebiet raquo situeacutee plus en aval preacutesente au contraire 0 de marqueacutes alors que cette zone a eacuteteacute alevineacutee Ce reacutesultat montre la capaciteacute du Foron sur ce secteur a accueillir une population fonctionnelle Il existe une reproduction naturelle importante sur cette zone avec eacutegalement beaucoup de geacuteniteurs- Vers Sommand une pecircche de sondage a eacuteteacute reacutealiseacutee mais aucun alevin nrsquoa eacuteteacute preacuteleveacute puisque cette zone nrsquoa pas eacuteteacute alevineacutee en 2002 Cependant les reacutesultats de ce sondage mettent en eacutevidence une absence totale de reproduction naturelle (aucun alevin naturel nrsquoa eacuteteacute trouveacute) alors que la population semble eacutequilibreacutee (preacutesence drsquoadultes et de truitelles drsquoacircge intermeacutediaire)

LrsquoEtroit Denteacute Globalement le taux de marqueacutes sur les deux stations eacutetudieacutees est faible (11 agrave 33)- Sur la station laquo aval route raquo la majoriteacute des alevins est naturelle Cette zone montre un habitat tregraves favorable pour la reproduction des geacuteniteurs qui remontent du Giffre- Sur la station laquo amont route raquo une population fonctionnelle de pheacutenotype meacutediterraneacuteen est installeacutee De nombreux geacuteniteurs sont preacutesents et le recrutement naturel est important

19

Le Foron de Taninges - En amont (station Bonnavaz) le taux de marqueacutes est tregraves important (95) Il existe donc une reproduction naturelle mais insuffisante pour permettre lrsquoinstallation drsquoune population et maintenir une activiteacute halieutique Les alevinages passeacutes nrsquoont pas permis drsquoinstaller une population fonctionnelle dans cette zone apicale- Plus en aval sur les zones non alevineacutees les pecircches eacutelectriques drsquoinventaire et de sondage reacutealiseacutees ont montreacute la preacutesence drsquoune population eacutequilibreacutee de pheacutenotype meacutediterraneacuteen avec une importante reproduction naturelle

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

Les principales remarques concernant les pathologies observeacutees sur le bassin du Giffre sont

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

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- La PKD est preacutesente sur le cours du Giffre mais uniquement agrave lrsquoaval du barrage de Taninges Cette situation est agrave mettre en relation avec le deacutebit reacuteserveacute insuffisant qui entraicircne une augmentation de tempeacuterature pendant la peacuteriode estivale

- Sur les affluents la PKD a eacuteteacute observeacutee sur les secteurs preacutesentant des faibles deacutebits estivaux (aval du Risse et Foron de Mieussy Andelier) qui sont certainement responsables drsquoune augmentation de tempeacuterature

- La PKD atteint agrave la fois les poissons introduits que les poissons naturels- Le pourcentage drsquoindividus toucheacutes par la PKD varie drsquoun site agrave lrsquoautre mais peut

atteindre une valeur importante avec 50 sur certain secteur- Les maladies bacteacuteriennes sont plus freacutequentes chez les individus marqueacutes Soit ces

poissons sont plus fragiles que les poissons naturels et contractent les maladies plus facilement soit les maladies sont contracteacutees en pisciculture pendant lrsquoeacutelevage

- Le pourcentage drsquoindividus toucheacutes par des symptocircmes bacteacuteriens nrsquoest pas neacutegligeable puisqursquoil peut atteindre 20

- Lrsquoensemble des stations eacutetudieacutees est toucheacute par des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes ce qui laisse penser que lrsquoensemble du bassin peut ecirctre atteint

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

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21

- Le sexe ratio apparaicirct globalement eacutequilibreacute sur lrsquoensemble des stations du Giffre- On observe des diffeacuterences entre les poissons introduits et les poissons naturels sur

seulement 3 stations Ces diffeacuterences sont en faveur des poissons marqueacutes qui montrent un pourcentage de macircles plus important

- Une maturiteacute sexuelle preacutecoce des macircles existe sur certaines stations quelle que soit lrsquoorigine des poissons

- Cette maturiteacute peut ecirctre importante et concerner jusqursquoagrave 20 des 0+

22

213 Le Foron du Reposoir

Deux stations (La Touviegravere et Le Reposoir) ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le Foron du Reposoir Seulement 15 0+ ont eacuteteacute eacutetudieacutes en raison principalement de la difficulteacute drsquoeacutechantillonner des poissons de petite taille (6-7 cm) sur ces milieux torrentiels

Le taux de marqueacutes

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23

- Sur les deux stations eacutetudieacutees le taux de marqueacutes est de 100 Lrsquoensemble des 0+ mecircme si le nombre est faible est donc issu de lrsquoalevinage Ce cours drsquoeau fait lrsquoobjet actuellement drsquoun essai drsquoimplantation drsquoune population agrave partir de la souche Chazey-Bons Rhodanienne Cette souche provient de geacuteniteurs de la riviegravere Furan (Ain) Des analyses geacuteneacutetiques reacutecentes reacutealiseacutees par analyse de microsatellites diagnostic de lrsquoADN ont montreacute que ces poissons ont un pourcentage dallegraveles meacutediterraneacuteens voisin de 65

Ce reacutesultat montre que le cours deau avait un niveau de population tregraves faible avant le repeuplement par la souche Chazey-Bons sauvagesDe plus les pecircches drsquoinventaires du CSP et les pecircches de sondage Interreg montrent qursquoune population de truites se met progressivement en place En effet on observe chaque anneacutee despoissons agrave des stades de plus avanceacutes et les captures par pecircche agrave la ligne commencent agrave ecirctre effectivesLes pecircches eacutelectriques reacutealiseacutees agrave lrsquoautomne 2002 indique que le stock de geacuteniteurs est en cours de reconstitution mais que les truites femelles nrsquoont pas encore atteint le stade geacuteniteurIl nrsquoest donc pas encore possible de dire si lrsquohabitat et la population du Foron du Reposoir sont propices agrave lrsquoinstallation drsquoune population naturellement fonctionnelle

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

Aucun symptocircme reacutenal et heacutemorragique nrsquoapparaicirct sur les 0+ eacutechantillonneacutes sur ce cours deau

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Le sexe ratio est eacutequilibreacute puisqursquoil varie de 50 agrave 60- Il nrsquoy a aucun macircle mature au stade 0+ dans les eacutechantillons preacuteleveacutes sur ce cours

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La Touviegravere Le Reposoir

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Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

24

214 La Filliegravere

Cinq stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal de la Filliegravere ainsi que sept stations sur les trois affluents principaux (Flan Creacutenant et Daudens) Au total 582 poissons 0+ ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

Sur le cours principal

Pour les 5 stations eacutetudieacutees sur le cours principal le taux de 0+ marqueacutes varie de 4 agrave 56 il est donc de tregraves faible agrave moyen et montre une forte reproduction naturelle sur toute la riviegravere Il y a un gradient amont-aval du taux de marqueacutes avec un pourcentage de poissons marqueacutes plus important en amont Cependant sur lrsquoensemble de la Filliegravere le recrutement naturel est dominant et constitue lrsquoessentiel de la population de truite

De plus les pecircches de sondages pour Interreg ont montreacute la preacutesence de nombreux drsquoadultes drsquoorigine naturelle meacutediterraneacuteenne Ceci confirme que la population de truite de la riviegravere principale est naturellement fonctionnelle

Sur les affluents

Les reacutesultats sont diffeacuterents selon que lrsquoaffluent est en connexion ou non avec la riviegravere principale

- Sur le Flan on observe en zone aval et meacutediane (stations laquo D 55 raquo et laquo Bruchon raquo) des taux de marqueacutes faibles (38 et 27) qui mettent en eacutevidence la preacutesence drsquoune forte reproduction naturelle notamment de poissons migrants de la Filliegravere Les releveacutes de frayegraveres reacutealiseacutes par lrsquoAAPPMA avaient deacutejagrave permis drsquoobserver de nombreuses frayegraveres naturelles sur ce secteurEn zone plus amont station laquo Molliet raquo le taux de marqueacutes est plus important (73) il met en eacutevidence la preacutesence drsquoun recrutement naturel mais qui reste au stade 0+ minoritaire par rapport aux individus introduits

- Sur le Daudens les deux stations (laquo Le Plot raquo et Daudens raquo) montrent des taux de marqueacutes importants (86 et 92) La reproduction naturelle est donc tregraves faible et la population de truite ne semble pas fonctionnelle Lrsquoobstacle agrave lrsquoaval de la route deacutepartementale semble preacutejudiciable car il ne permet pas aux geacuteniteurs de la Filliegravere de remonter sur le Daudens et drsquoinstaller une population fiable

- Sur le Crenant Les deux stations eacutechantillonneacutees (laquo aval raquo et Disonche raquo) ne sont pas situeacutees sur des zones alevineacutees en 2002 et il est normal de trouver 0 de marqueacutes Cependant ces reacutesultats montrent qursquoil y a une forte reproduction naturelle sur ce cours drsquoeau mecircme en zone amont et que la population semble naturellement fonctionnelle Les alevins introduits sur le Crenant ne semblent pas avoir deacutevaleacutes sur pour coloniser lrsquoaval du Crenant

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Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

- La PKD semble quasiment absente du bassin de la Filliegravere sauf preacutesence anecdotique uniquement chez les non marqueacutes sur une station (laquo Millard raquo)

- Les individus marqueacutes ne sont pas toucheacutes par la PKD- Les maladies bacteacuteriennes sont preacutesentes sur lrsquoensemble du bassin mais touchent en

prioriteacute et majoritairement les individus marqueacutes

Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

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D55

Bru

chon

Mol

liet

Le

Plo

t

Dau

dens

Ava

l

Dis

onch

e

La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere Le Flan Le Flan Le Flan LeDaudens

LeDaudens

LeCrenant

LeCrenant

Pourcentage dindividus preacutesentant des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

0102030405060

Le J

ourd

il

Pisc

icul

ture

Milla

rd

Long

cham

ps

D55

Bru

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Mol

liet

Le

Plo

t

Dau

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l

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e

La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere Le Flan Le Flan Le Flan LeDaudens

LeDaudens

LeCrenant

LeCrenant

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

0102030405060708090

100

Le J

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il

Pis

cicu

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Milla

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D55

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Mol

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Le

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La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere Le Flan Le Flan Le Flan LeDaudens

LeDaudens

LeCrenant

LeCrenant

Pourcentage dindividus preacutesentant des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

0102030405060

Le J

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Pisc

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Long

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D55

Bru

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Le

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Ava

l

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e

La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere Le Flan Le Flan Le Flan LeDaudens

LeDaudens

LeCrenant

LeCrenant

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

27

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Sur lrsquoensemble des stations le sexe ratio est eacutequilibreacute il montre une plus grande variation chez les individus marqueacutes

- Des macircles matures au stade 0+ ont eacuteteacute observeacutes sur trois stations uniquement chez les individus naturels

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

Pourcentage de macircles au stade 0+

0102030405060708090

Le J

ourd

il

Pis

cicu

lture

Milla

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Long

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D55

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LaFilliegravere

LaFilliegravere

LaFilliegravere

LaFilliegravere

Le Flan Le Flan Le Flan LeDaudens

LeDaudens

LeCrenant

LeCrenant

Pourcentage de macircles matures au stade 0+

01020304050

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FilliegravereLa

FilliegravereLa

FilliegravereLe Flan Le Flan Le Flan Le

DaudensLe

DaudensLe

CrenantLe

Crenant

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

Pourcentage de macircles au stade 0+

0102030405060708090

Le J

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LaFilliegravere

LaFilliegravere

LaFilliegravere

LaFilliegravere

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LeCrenant

LeCrenant

Pourcentage de macircles matures au stade 0+

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FilliegravereLa

FilliegravereLa

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DaudensLe

DaudensLe

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Crenant

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

28

215 Le Foron de Fillinges

Trois stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal du Foron de Fillinges agrave savoir de lrsquoamont vers lrsquoaval laquo Bovet ndash Boex raquo laquo Pont de Fillinges raquo et laquo Couvette raquo Au total 178 poissons 0+ ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

Leacutege

nde

Mar

queacutes

Non

mar

queacutes

X

d

rsquoindi

vidu

s m

arqu

eacutes

Sec

teur

ale

vineacute

en

2002

Loca

lisat

ion

des

stat

ions

drsquoeacute

tude

et t

aux

de m

arqu

eacutes s

ur le

bas

sin

du F

oron

de F

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ges

laquo C

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2

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0

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Boex

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31

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Boex

raquo

31

laquo Bo

vet ndash

Boex

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31

29

Sur les 3 stations eacutetudieacutees les taux de marqueacutes sont faibles agrave tregraves faibles- Sur la station laquo Bovet ndash Boex raquo le taux de marqueacutes est de seulement 31- A lrsquoaval sur les stations laquo Pont de Fillinges raquo et laquo Couvette raquo les taux de marqueacutes

sont respectivement de 0 et 2

Les reacutesultats indiquent la preacutesence drsquoune importante reproduction naturelle sur lrsquoensemble du Foron de Fillinges Quelque soit la souche utiliseacutee pour lrsquoalevinage atlantique dans le secteur Faucigny ou Meacutediterraneacuteenne Pont de Gys dans le secteur Chablais les poissons introduits restent minoritaires

Cette situation traduit la preacutesence drsquoune population bien installeacutee et fonctionnelle sur cette riviegravere

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

0102030405060708090

100

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Pourcentage dindividus preacutesentant des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

05

101520253035404550

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

0102030405060708090

100

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Pourcentage dindividus preacutesentant des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

05

101520253035404550

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

30

- Sur lrsquoensemble des stations des individus 0+ sont atteints par la PKD le pourcentage drsquoindividus malades peut atteindre 35

- Seuls les individus sauvages semblent toucheacutes par la PKD cependant le nombre drsquoindividus introduits est trop faible pour permettre une comparaison

- Toutes les stations sont eacutegalement toucheacutees par les maladies bacteacuteriennes avec des taux de contamination variant de 15 agrave 30

- Les maladies bacteacuteriennes touchent agrave la fois les individus introduits et les individus naturels

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Le sexe ratio apparaicirct eacutequilibreacute sur lrsquoensemble des stations- On observe des macircles matures degraves le stade 0+ sur lrsquoensemble des stations- Le taux de macircles matures au stade 0+ peut atteindre 15

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

Pourcentage de macircles au stade 0+

0

102030405060

708090

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Pourcentage de macircles matures au stade 0+

05

101520253035404550

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

Pourcentage de macircles au stade 0+

0

102030405060

708090

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Pourcentage de macircles matures au stade 0+

05

101520253035404550

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

31

22Caracteacuteristiques morphologiques

221 Longueur totale des individus

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Giffre

0

20

40

60

80

100

120

140Am

ont

Tine

s

Rev

eacute-Peacute

ret

Mon

tess

uit

Theacutez

iegravere

s

Aval

barr

age

Tani

nges

Pont

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Ris

se

Bonn

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Amon

tro

ute

Aval

rout

e

Ande

lier

Treb

iet

La P

allu

d

Aval

St

Jeoi

re

LeGiffre

LeGiffre

LeGiffre

LeGiffre

LeGiffre

LeGiffre

Le FdeTaninges

LEtroitDenteacute

LEtroitDenteacute

Le F deMieussy

Le F deMieussy

LeHisson

Le Risse

Long

ueur

tota

le e

n m

m

Taille moyenne des 0+ sur le Borne

0

20

40

60

80

100

120

140

GrandBornand

Les Etroits Entremont Beffay St Pierre en F

Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Chinaillon La Duche LOveacuteran

Long

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Taille moyenne des 0+ sur la Filliegravere

0

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Giffre

0

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Le F deMieussy

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Taille moyenne des 0+ sur le Borne

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GrandBornand

Les Etroits Entremont Beffay St Pierre en F

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Taille moyenne des 0+ sur la Filliegravere

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LeCrenant

LeCrenant

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m

32

Sur la quasi-totaliteacute des stations eacutetudieacutees les individus marqueacutes preacutesentent une taillemoyenne supeacuterieure agrave celle des individus naturels Sur 18 stations ougrave les effectifs permettent des comparaisons statistiques la longueur totale des individus marqueacutes est significativement supeacuterieure agrave celle des truites sauvages pour 13 stations

Les 5 stations faisant exception sont laquo aval barrage Taninges raquo et laquo Pont du Giffre raquo sur le Giffre laquoAval St Jeoire raquo sur le Risse laquo Bonnavaz raquo sur le Foron de Taninges et laquo Couvette raquo sur le Foron de Fillinges Cependant sur ces stations les diffeacuterences ne sont pas significatives

Le fait que les marqueacutes aient une plus grande taille moyenne que les non marqueacutes au stade 0+ nrsquoimplique pas que cela soit systeacutematiquement le cas aux stades ulteacuterieurs En effet CAUDRON (1998) et CHAMPIGNEULLE et CACHERA (2003) ont montreacute respectivement sur le Doubs et le Fier que les diffeacuterences de tailles entre marqueacutes et non marqueacutes au stade 0+ sestompaient au stade 1+ et chez les adultes

Par ailleurs lrsquoexistence drsquoune plus grande taille au stade 0+ en automne pour les marqueacutes ne leur garantit pas un meilleur taux de seacutedentarisation En effet plusieurs eacutetudes dont celle de JONSSON et JONSSON (1993) indiquent que le taux de deacutevalaison peut ecirctre plus eacuteleveacute pour les individus agrave plus forte croissance au stade 0+ La deacutevalaison peut donc toucher preacutefeacuterentiellement les individus marqueacutes en raison de leur forte croissance

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Foron du Reposoir

0

20

40

60

80

100

120

140

La Touviegravere Le Reposoir

F du Reposoir F du Reposoir

Long

ueur

tota

le e

n m

mTaille moyenne des 0+ sur le Foron de Fillinges

0

20

40

60

80

100

120

140

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Long

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tota

le e

n m

m

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Foron du Reposoir

0

20

40

60

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100

120

140

La Touviegravere Le Reposoir

F du Reposoir F du Reposoir

Long

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mTaille moyenne des 0+ sur le Foron de Fillinges

0

20

40

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100

120

140

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Long

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tota

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n m

m

33

222 Taille des nageoires pectorales

La figure ci-dessus montre qursquoil existe une diffeacuterence entre marqueacutes et non marqueacutes du rapport entre la longueur de la nageoire pectorale et la longueur totale du poisson

Il a sembleacute important drsquoanalyser plus en deacutetail ce caractegravere morphologique car il peut preacutesager de lrsquoaptitude des truites agrave se maintenir dans nos riviegraveres de montagne

Relation entre la longueur de la nageoire pectorale et la longueur totale des individus marqueacutes et non marqueacutes

5

7

9

11

13

15

17

19

21

23

25

27

30 50 70 90 110 130 150 170Longueur totale en mm

Long

ueur

nag

eoire

pec

tora

le e

n m

mMarqueacuteNon marqueacute

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron du Reposoir

12

14

16

18

20

La Touviegravere Le Reposoir

F du Reposoir F du Reposoir

Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron de Fillinges

12

14

16

18

20

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron du Reposoir

12

14

16

18

20

La Touviegravere Le Reposoir

F du Reposoir F du Reposoir

Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron de Fillinges

12

14

16

18

20

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

34

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Giffre

12

14

16

18

20

Am

ont

Tine

s

Rev

eacute-P

eacuteret

Mon

tess

uit

Theacute

ziegraver

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Am

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lier

Tre

biet

Ava

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re

Le Giffre Le Giffre Le Giffre Le Giffre Le Giffre Le Giffre Le FdeTaninges

LEtroitDenteacute

LEtroitDenteacute

Le F deMieussy

Le F deMieussy

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Taille relative moyenne des pectorales sur la Filliegravere

12

14

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18

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e

La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere Le Flan Le Flan Le Flan LeDaudens

LeDaudens

LeCrenant

LeCrenant

Taille relative moyenne des pectorales sur le Borne

12

14

16

18

20

GrandBornand

Les Etroits Entremont Beffay St Pierre en F

Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Chinaillon La Duche LOveacuteran

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Giffre

12

14

16

18

20

Am

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Tine

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Le F deMieussy

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Taille relative moyenne des pectorales sur la Filliegravere

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Taille relative moyenne des pectorales sur le Borne

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GrandBornand

Les Etroits Entremont Beffay St Pierre en F

Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Chinaillon La Duche LOveacuteran

35

Sur les 24 stations ougrave des individus marqueacutes et non marqueacutes coexistent la taille relative des nageoires pectorales est systeacutematiquement plus importante chez les individus naturelsLes truites issues du repeuplement preacutesentent donc des nageoires pectorales de longueur infeacuterieure agrave celle des truites sauvagesCette diffeacuterence morphologique est tregraves importante car le deacuteveloppement des nageoires est un eacuteleacutement deacuteterminant pour la survie du poisson dans son milieu notamment pour la stabiliteacute la reacutesistance au courant et la recherche de nourriture an action de chasse

Il semble donc possible que cette caracteacuteristique anatomique soit le reacutesultat drsquoune adaptation agrave la vie en torrent

BOSAKOWSKI et al (1993) ont eacutegalement observeacutes des reacutesultats comparables chez des truites arc-en-ciel et des truites brunes de plus grande taille entre poissons drsquoeacutelevage et poissons sauvages Dans cette eacutetude les poissons deacutelevage preacutesentaient des nageoires nettement plus courtes (10-50) que les poissons sauvages Selon les auteurs cette diffeacuterence semblait ecirctre causeacutee par les conditions de vie des poissons dans les bassins des piscicultures(agression intraspeacutecifique stress qualiteacute de leau et densiteacutes de poissons) qui provoquaient une eacuterosion des nageoires

Dans le cas preacutesent les poissons de repeuplement ont eacuteteacute introduits agrave des stades preacutecoces dans le milieu et ont eacuteteacute preacuteleveacutes 4 agrave 5 mois apregraves leur introduction En conseacutequence ils ont veacutecu peu de temps en pisciculture et ont par contre passeacute lessentiel de leur vie dans le mecircme milieu naturel que les poissons sauvages Ainsi il semble que ce dimorphisme de la nageoire entre poissons sauvages et introduits soit drsquoorigine geacuteneacutetique Une eacutetude de RIDDELL et al (1981) a montreacute chez le saumon que les diffeacuterences de deacuteveloppement de nageoires eacutetaient une adaptation des poissons agrave leur milieu qui preacutesentait une origine geacuteneacutetiqueIl est donc tout agrave fait probable qursquoun pheacutenomegravene similaire se rencontre chez la truite fario et que les truites sauvages soient mieux adapteacutees sur le plan morphologique (gracircce agrave des diffeacuterences geacuteneacutetiques) aux conditions du milieu que les poissons introduits mecircme agrave des stades preacutecoces

Outre lrsquoaspect purement geacuteneacutetique les facteurs environnants peuvent eacutegalement jouer un rocircle important En effet McLAUGHLIN et al (2002) ont montreacute que cette diffeacuterence au niveau des nageoires peut eacutegalement ecirctre due agrave des caracteacuteristiques du milieu environnant dans les premiegraveres semaines de vie des poissons En effet plusieurs lots drsquoune mecircme souche de saumon de fontaine soumis degraves lrsquoeacuteclosion agrave des conditions de vie diffeacuterentes montrent des diffeacuterences dans le deacuteveloppement des nageoires Ainsi degraves les premiegraveres semaines les poissons exposeacutes agrave un fort courant sont pourvus de nageoires plus longues

Il est donc possible que les alevins produits en pisciculture nrsquoeacutetant pas exposeacutes agrave des courants importants au cours de leurs premiegraveres semaines de vie deacuteveloppent des nageoires pectorales moins longues que les individus sauvages

Il y a probablement pour cette caracteacuteristique morphologique des interactions combinant geacuteneacutetique et conditions environnementales

Cette diffeacuterence morphologique peut eacutegalement avoir une importance dans la compeacutetition entre poissons sauvages et introduits notamment au stade juveacutenile En effet GIBSON (1973) a deacutemontreacute limportance des nageoires dans la compeacutetition interspeacutecifique

36

entre le saumon atlantique (Salmo salar L) et le saumon de fontaine (Salvenius fontinalis) deux poissons consommant la mecircme nourriture Le fait de posseacuteder des nageoires pectorales plus deacutevelopper permet au saumon atlantique de se maintenir dans les courants pour se nourrir tout en deacutepensant moins drsquoeacutenergie

Dans le cas des torrents haut-savoyards une compeacutetition intraspeacutecifique entre truites sauvages et introduites comparable agrave leacutetude de GIBSON peut se deacutevelopper La diffeacuterence morphologique entre les truites sauvages et issues du repeuplement peut donc avoir une influence lors de la compeacutetition entre ces deux types dindividus

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3 Premiegraveres implications pour la gestion

En fonction des reacutesultats obtenus lors de la campagne de preacutelegravevements 2002 des orientations de gestion sont proposeacutees pour chaque riviegravere eacutetudieacutee Certaines propositions impliquent des changements relativement importants des pratiques actuelles de gestion

Lrsquoeacutetude de lrsquoefficaciteacute des repeuplements srsquoappuient sur une deacutemarche scientifique rigoureuse dans lrsquointeacuterecirct des gestionnaires directs (AAPPMA) puisqursquoelle permet agrave ces derniers de prendre des deacutecisions en srsquoappuyant sur des reacutesultats concrets et indiscutables Elle est conduite dans un souci drsquoeacutevaluer en toute objectiviteacute les pratiques drsquoalevinage dans le seul but drsquoameacuteliorer la gestion actuelle des populations et des milieux Concregravetement elle permet de connaicirctre rapidement les zones ougrave lrsquoalevinage en truite fario est inefficace et donc inutile et les zones ougrave celui-ci est efficace et donc neacutecessaire

En plus des reacutesultats obtenus gracircce aux marquages des juveacuteniles les propositions prennent en compte les premiers reacutesultats issus des pecircches de sondage drsquoadultes reacutealiseacutees pour le programme INTERREG (reacutedaction en cours) Lrsquointeacutegration des diffeacuterentes donneacutees (marquage juveacutenile + adultes) permet de faire des propositions coheacuterentes selon un diagnostic le plus complet possible de la population de truite preacutesente

31 Bassin du Borne

Sur les riviegraveres du bassin du Borne les orientations de gestion proposeacutees ci-apregraves restent conformes agrave celles deacutejagrave eacutevoqueacutes par CAUDRON et CHAMPIGNEULLE (2002)

Arrecirct du repeuplement selon les pratiques actuelles sur lrsquoensemble du cours principal Cette proposition est motiveacutee par deux principales raisons

- Lrsquoalevinage est inefficace agrave lrsquoamont du seuil drsquoEntremont car apregraves plus de 15 ans il nrsquoa pas permis drsquoinstaller une population en place eacutequilibreacutee

- Il semble impeacuteratif de preacuteserver lrsquoimportante population de truite sauvage preacutesente agrave lrsquoaval du seuil drsquoEntremont Les reacutesultats geacuteneacutetiques indiquent que la population preacutesente est une population sauvage qui nrsquoa pas eacuteteacuteimplanteacutee suite agrave lrsquoalevinage Elle preacutesente un degreacute de pureteacute geacuteneacutetique important Cette population repreacutesente un patrimoine unique dans le Faucigny Le but drsquoarrecircter les alevinages sur ce secteur est drsquoeacuteviter les hybridations qui peuvent entraicircner une perte de plasticiteacute geacuteneacutetique et une deacutegeacuteneacuterescence de la souche sauvage actuelle

Arrecirct du repeuplement sur lrsquoaval de lrsquoOveacuteran Ce secteur est utiliseacute comme zone de reproduction par les geacuteniteurs du Borne et la reproduction naturelle y est abondante Lrsquoalevinage nrsquoest donc pas neacutecessaire et risque comme sur le Borne de provoquer une hybridation de la population naturelle

Essayer drsquoinstaller une population naturelle agrave lrsquoamont du seuil drsquoEntremont par transferts de geacuteniteurs

Sur les autres affluents deux sceacutenarii de gestion peuvent ecirctre envisageacutes selon la volonteacute politique des gestionnaires directs

Sceacutenario ndeg1 vision patrimoniale

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- Arrecirct du repeuplement en truite drsquoorigine Atlantique pendant 3 anneacutees conseacutecutives pour diminuer leur preacutesence sur le bassin

- Puis reprise de lrsquoalevinage pendant uniquement 3 anneacutees agrave partir de poissons sauvages issus du Borne pour essayer drsquoinstaller une population naturelle

Sceacutenario ndeg2 vision halieutique- Maintien des pratiques drsquoalevinage en atlantique pour soutenir

artificiellement le stock de poissons dans un inteacuterecirct uniquement halieutique Attention cette pratique risque de provoquer par deacutevalaison des individus introduits une hybridation des poissons sauvages preacutesents dans le Borne

Eventuellement repeuplement en truites Arc en Ciel surdensitaires sur des secteurs preacutecis du Borne pendant la peacuteriode estivale afin de contenter une certaine cateacutegorie de pecirccheurs Les repeuplements en Arc en Ciel ne risquent pas de provoquer drsquohybridation de la souche fario locale Attention prendre des preacutecautions aupregraves des fournisseurs concernant la qualiteacute sanitaire des poissons

32 Bassin du Giffre

Les propositions sur le bassin du Giffre prennent en compte les reacutesultats du marquage mais eacutegalement la situation actuelle de la riviegravere suite agrave lrsquoeacuteboulement de Sixt Fer agrave Cheval

Ne pas aleviner le cours principal du Giffre en alevins de fario pendant 5 anneacutees conseacutecutives Cette proposition est motiveacutee par les raisons suivantes

- Il est impossible de savoir comment va eacutevoluer dans les prochains mois et les prochaines anneacutees le glissement agrave lrsquoamont de Sixt Il semble donc risqueacute drsquoentreprendre un alevinage pour installer une nouvelle population

- Les reacutesultats des marquages sur le Giffre sont tregraves contrasteacutes Sauf au niveau de Sixt ils montrent qursquoil existait avant le glissement une reproduction naturelle importante et capable de soutenir une population

- Les reacutesultats geacuteneacutetiques reacutecents indiquent que les populations en place sont en majoriteacute drsquoorigine atlantique mais qursquoil existe encore des individus meacutediterraneacuteens non hybrideacutes jusque dans les zones amont Ces reacutesultats prouvent qursquohistoriquement la souche meacutediterraneacuteenne eacutetait bien preacutesente sur lrsquoensemble du Giffre

- Il est envisageable que cette souche sauvage eacutegalement preacutesente sur les parties basses des affluents recolonise naturellement le Giffre

- Lrsquoexemple du Borne montre qursquoapregraves une catastrophe la riviegravere a eacuteteacute recoloniseacutee par une souche sauvage malgreacute des alevinages massifs Les reacutesultats obtenus sur cette riviegravere doivent servir de base de reacuteflexions pour la nouvelle gestion agrave entreprendre sur le Giffre

- Entre le Risse et Marignier la population de truites avant le glissement eacutetait deacutejagrave totalement deacuteseacutequilibreacutee et en quasi disparition (peu de juveacuteniles quasi absence de geacuteniteurs et absence de classes drsquoacircges intermeacutediaires) malgreacute les alevinages massifs sur ce secteur

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Reacutealiser un bilan de lrsquoimpact du glissement de terrain sur le peuplement piscicole

- Une eacutetude piscicole sera reacutealiseacutee tregraves prochainement (2004 ou 2005) sur le Giffre dans le cadre du contrat de riviegravere Cette eacutetude permettra de faire un premiereacutetat des lieux complet du peuplement piscicole suite au glissement

Accomplir un diagnostic de lrsquoeacutetat de recolonisation du Giffre par les populations naturelles

- En lrsquoabsence drsquoalevinage il sera possible de reacutealiser en 2008 un bilan des populations de truites installeacutees sur le Giffre

- A partir de lrsquoeacutetat de la population agrave cette eacutepoque un plan drsquoalevinage coheacuterent en truite fario pourra ecirctre eacutetabli pour permettre drsquoinstaller de nouvelles populations ou de soutenir des populations preacutesentes

Mettre en place des deacuteversements de truites Arc en Ciel pendant toute la peacuteriode drsquoarrecirct de lrsquoalevinage en fario Attention prendre des preacutecautions aupregraves des fournisseurs concernant la qualiteacute sanitaire des poissons

Reacuteintroduire lrsquoOmbre commun sur la plaine de Samoeumlns et agrave lrsquoaval de la confluence avec le Risse

Arrecirct de lrsquoalevinage sur lrsquoensemble du Risse sur lrsquoaval du Foron de Mieussy et sur lrsquoEtroit Denteacutee

- Sur ces riviegraveres le suivi du marquage a montreacute que lrsquoalevinage nrsquoeacutetait pas neacutecessaire pour soutenir les populations de truites preacutesentes

Maintenir lrsquoalevinage sur lrsquoamont du Foron de Mieussy (vers Sommand) et lrsquoamont du Foron de Taninges (Bonnavaz)

- Sur ces secteurs le suivi du marquage a montreacute que les juveacuteniles preacutesents dans le milieu naturel eacutetaient en majoriteacute des individus introduits

33 Le Foron du Reposoir

Les propositions de gestion sur le Foron du Reposoir sont

Maintenir les alevinages actuels avec la souche Chazey Bons Rhodanienne

Suivre lrsquoeacutevolution de la population pour savoir si cet alevinage permet drsquoinstaller une population fonctionnelle

- Ce suivi peut comprendre des pecircches de sondages en deacutebut de peacuteriode de reproduction pour voir si les poissons adultes deviennent matures des releveacutes de frayegraveres sur la riviegravere pour savoir si les poissons se reproduisent et de nouveaux preacutelegravevements de poissons pour suivre lrsquoeacutevolution du taux de marqueacutes dans la population

34 Bassin de la Filliegravere

Les orientations pour une gestion coheacuterente des populations de la Filliegravere sont les suivantes

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Arrecirct de lrsquoalevinage sur le cours principal de la Filliegravere sur le Crenant et sur lrsquoaval du Flan

- Sur ces 3 riviegraveres lrsquoalevinage nrsquoest pas neacutecessaire car il ne permet pas de soutenir les populations preacutesentes et de plus la reproduction naturelle est tregraves importante

- Sur la Filliegravere les pecircches drsquoadultes dans le cadre du programme INTERREG ont mis en eacutevidence la preacutesence drsquoune population sauvage drsquoorigine meacutediterraneacuteenne Il semble important drsquoentreprendre une mesure de conservation de cette souche en arrecirctant lrsquoalevinage pour eacuteviter lrsquohybridation

- Sur lrsquoamont du Flan il est neacutecessaire de continuer le suivi des poissons marqueacutes pour savoir si lrsquoalevinage doit ecirctre maintenu

Sur le Daudens deux sceacutenarii de gestion peuvent ecirctre envisageacutes selon la volonteacute politique des gestionnaires directs

Sceacutenario ndeg1 vision patrimoniale- Arrecirct du repeuplement en truite drsquoorigine Atlantique pendant 3 anneacutees

conseacutecutives pour diminuer leur preacutesence sur le bassin- Commencer les proceacutedures afin de rendre le seuil du Plot

franchissable pour les geacuteniteurs de la Filliegravere- Reacutealiser un bilan notamment deacutemographique de la population en place

apregraves lrsquoarrecirct de lrsquoalevinage- Puis reprise de lrsquoalevinage pendant uniquement 3 anneacutees agrave partir de

poissons sauvages issus de la Filliegravere pour essayer drsquoinstaller une population naturelle

Sceacutenario ndeg2 vision halieutique- Maintien des pratiques drsquoalevinage en atlantique pour soutenir

artificiellement le stock de poissons dans un inteacuterecirct uniquement halieutique Attention cette pratique risque de provoquer par deacutevalaison des individus introduits une hybridation des poissons sauvages preacutesents dans la Filliegravere

35 Le Foron de Fillinges

Les reacutesultats obtenus sur le Foron de Fillinges ont conduit agrave formuler les propositions de gestion suivantes

Arrecirct de lrsquoalevinage sur lrsquoensemble du Foron de Fillinges- Quelque soit la souche utiliseacutee et les quantiteacutes introduites les poissons

alevineacutes ne repreacutesentent qursquoune tregraves faible minoriteacute des poissons preacutesents dans le milieu Le Foron abrite une population naturelle fonctionnelle et eacutequilibreacutee

Suivi de la population suite agrave lrsquoarrecirct du repeuplement- Reacutealisation de 5 stations de pecircches eacutelectriques la derniegravere anneacutee de

lrsquoalevinage afin de reacutealiser un eacutetat des lieux preacutecis de la population de truites et du peuplement piscicole

- Reacutealisation drsquoun nouveau bilan de la population du Foron respectivement 3 ans puis 6 ans apregraves lrsquoarrecirct de lrsquoalevinage

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4 Investigations suppleacutementaires

Suite aux premiers reacutesultats obtenus lors de la campagne 2002 des investigations suppleacutementaires permettant de preacuteciser certains points seront reacutealiseacutees

Reacutealiser une analyse bacteacuteriologique des diffeacuterents lots de poissons alevineacutes qui ont transiteacutes dans les piscicultures associatives Cette recherche de pathologie permettra de savoir si les poissons issus de pisciculture sont porteurs drsquoune maladie bacteacuterienne avant drsquoecirctre introduits dans le milieu ou si ils contractent la maladie dans le milieu naturel

Rechercher les raisons pour lesquelles on nrsquoobserve pas drsquoalevins naturels sur certains secteurs Les causes drsquoune telle situation peuvent ecirctre

- Lrsquoabsence totale de geacuteniteurs dans la population Les poissons nrsquoont pas le temps de devenir adulte (3+) et sont captureacutes avant par les pecirccheurs

- La preacutesence drsquoadultes non matures Les poissons deviennent adultes mais sont immatures (eacutetat sanitaire des poissons souche geacuteneacutetiquement deacutegeacuteneacutereacutee)

- Survie nulle durant la phase de vie sous graviers Les poissons pondent mais les œufs nrsquoarrivent pas agrave se deacutevelopper et la mortaliteacute est totale

Sur les secteurs du Chinaillon de la Duche de lrsquoOveacuteran amont et du Foron de Mieussy amont (Sommand) les actions suivantes peuvent ecirctre entreprises

- Pecircches eacutelectriques de sondage en deacutebut de la peacuteriode de reproduction pour savoir si les poissons deviennent matures

- Releveacutes de frayegraveres permettant drsquoobserver ou non une activiteacute de reproduction- Mise en place drsquoincubateurs-tests contenant des œufs de truites pour connaicirctre le taux

de survie des œufs dans les frayegraveres

Reacutealiser des preacutelegravevements suppleacutementaires aux classes drsquoacircge supeacuterieures (1+ et 2+) sur certaines stations pour voir lrsquoeacutevolution du taux de marqueacutes au cours des anneacutees Ces recherches suppleacutementaires peuvent ecirctre effectueacutees sur 8 cours drsquoeau ougrave le taux de marqueacutes deacutepasse 60 au stade 0+

Le ruisseau de la Duche amontLe ruisseau du Chinaillon amontLe Foron du ReposoirLe Risse avalLe Foron de Taninges amont (Bonnavaz)Le Foron de Mieussy amont (Sommand)Le Daudens amont et avalLe Flan amont

Dans les eacutetudes preacuteceacutedentes reacutealiseacutees sur le Fier (CAUDRON et CHAMPIGNEULLE 2002) et sur le Doubs (CHAMPIGNEULLE et al 2002) les taux de marqueacutes aux stades 1+ et 2+ dans la population en place srsquoeffondraient et devenaient tregraves faibles ou nuls

Pour informations le graphique suivant montre lrsquoeacutevolution du taux de marqueacutes agrave diffeacuterents stades sur les stations ougrave le taux de 0+ marqueacutes eacutetait eacuteleveacute

42

Les reacutesultats montrent agrave part pour une station une chute importante des taux de marqueacutes entre les stades 0+ et 1+ Cette chute se poursuit eacutegalement au stade 2+Ces reacutesultats obtenus sur le Fier et le Doubs semblent laisser peu drsquoespoirs sur le devenir des poissons marqueacutes sur les bassins eacutetudieacutes en 2002

Reacutesultats sur leacutevolution du taux de m arqueacutes aux diffeacuterents stades obtenus lors des eacutetudes preacuteceacutedentes sur le Fier et le Doubs

0102030405060708090

100

0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 0+ 1+ 0+ 1+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+

Station A Station B Station C StationD

StationE

StationF

Station A Station B StationC

Stations et stades

Pou

rcen

tage

de

mar

queacutes

Le Fier Le Doubs

Reacutesultats sur leacutevolution du taux de m arqueacutes aux diffeacuterents stades obtenus lors des eacutetudes preacuteceacutedentes sur le Fier et le Doubs

0102030405060708090

100

0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 0+ 1+ 0+ 1+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+

Station A Station B Station C StationD

StationE

StationF

Station A Station B StationC

Stations et stades

Pou

rcen

tage

de

mar

queacutes

Le Fier Le Doubs

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4

13Donneacutees de repeuplement

Les donneacutees quantitatives concernant les pratiques de repeuplement ont eacuteteacute recueillies dans les plans drsquoalevinage reacutealiseacutes par les gardes professionnels des AAPPMA selon un modegravele type Chaque tronccedilon de riviegravere concerneacute par une introduction de truites a eacuteteacute reacutepertorieacute sur le plan drsquoalevinage Pour chaque tronccedilon sont noteacutees les limites amont et aval ainsi que la longueur totale et la largeur moyenne (eacutevaluation en cours)

Enfin le plan drsquoalevinage renseigne sur la quantiteacute de poissons alevineacutes lrsquoorigine des poissons utiliseacutes le stade de deacuteversement ainsi que la date drsquoalevinage

La majoriteacute des cours deau sont repeupleacutes depuis plusieurs deacutecennies par des truites de souche atlantique domestiqueacutee diffeacuterente de la souche meacutediterraneacuteenne autochtone (preacutesente agrave lorigine naturellement)

Dans le cas preacutesent seul le Foron du Reposoir a eacuteteacute alevineacute avec des individus de souche meacutediterraneacuteenne (souche Chazey-Bons sauvage) en vue dune reacutehabilitation de la population de truites de ce cours deau Le bassin versant du Borne de la Filliegravere et du Giffre ont fait lobjet dun alevinage par des truites dorigine atlantique (pisciculture Chauvey Chazey-Bons domestiques Vizille domestiques)

La majoriteacute des cours deau ont eacuteteacute repeupleacutes depuis plusieurs deacutecennies par des truites de souche atlantique domestiqueacutee diffeacuterente de la souche meacutediterraneacuteenne preacutesente naturellement Dans le cas preacutesent le Foron du Reposoir et le Foron de Fillinges ont eacuteteacute alevineacutes avec des individus de souche partiellement meacutediterraneacuteenne (souche Chazey-Bons et Pont de Gys)

14Echantillonnage en milieu naturel

En raison limportante eacutechelle spatiale de la preacutesente eacutetude il ne sera pas possible de suivre agrave toutes les classes drsquoacircge et sur tout le reacuteseau hydrographique la contribution des poissons marqueacutes dans la population en placeCependant deux types drsquoeacutechantillonnages principaux seront donc pratiqueacutes au stade 0+ dans la population en place et au stade adulte (agrave partir de 2+) dans la pecircche

Cette approche permettra de srsquoaffranchir des difficulteacutes rencontreacutees pour eacutechantillonner et sacrifier des poissons aux stades 1+ et 2+ dans les populations en place (quantiteacute repreacutesentativiteacute impact en cas de populations faibles agreacutement des gestionnaires)

Ceci nexclue pas la reacutealisation de preacutelegravevements aux stades intermeacutediaires dans des cas speacutecifiques bien cibleacutes

Pour les stades jeunes les eacutechantillonnages ont eacuteteacute reacutealiseacutes par pecircche eacutelectrique de sondage agrave lrsquoaide drsquoun appareil portable soit geacuteneacuteralement en automne soit en peacuteriode hivernale pour certains grands cours drsquoeau cas du cours principal du Giffre

Les eacutechantillonnages des 0+ des diffeacuterentes riviegraveres seront eacutetaleacutes sur trois ans (2002-2003-2004)

Pour les stades adultes des carnets seront distribueacutes agrave des pecirccheurs volontaires qui accepteront de reacutecolter des donneacutees sur leurs captures (date lieu mode de pecircche sexe maturiteacute sexuelle) et de faire des preacutelegravevements agrave domicile (eacutecailles et tecircte cette derniegravere eacutetant coupeacutee juste en arriegravere des pectorales et conserveacutee au congeacutelateur) Les carnets comportent une planche explicative reacutecapitulative des diffeacuterentes mesures et preacutelegravevements Les suivis dans la pecircche seront reacutealiseacutes au minimum dans la peacuteriode 2004-2006 durant laquelle des poissons captureacutes par les pecirccheurs seront susceptibles drsquoecirctre marqueacutes

5

Enfin une autre opportuniteacute drsquoeacutechantillonnage non preacutevisible mais utilisable est la reacutecupeacuteration de truites mortes suite agrave des pollutions

Deux types drsquoeacutechantillonnages principaux seront donc pratiqueacutes au stade 0+ dans la population en place et au stade adulte (agrave partir de 2+) dans la pecircche

15Reacutecolte et analyses des donneacutees en laboratoire

151 Caracteacuteristiques morphologiques et morphomegravetriques

Tous les juveacuteniles sont conserveacutes au congeacutelateur agrave ndash18degC Apregraves deacutecongeacutelation leur longueur totale est mesureacutee (au mm pregraves) ainsi que la longueur maximale de la pectorale gauche (agrave 01mm pregraves) La truite est peseacutee agrave 01g pregraves

Des preacutelegravevements drsquoeacutecailles sont reacutealiseacutes pour deacuteterminer lrsquoacircge de chaque individu Les lectures drsquoeacutecailles preacutealables permettent de seacutelectionner les individus faisant partie des cohortes susceptibles drsquoecirctre marqueacutees

La robe de la truite est observeacutee permettant de classer les truites selon leur pheacutenotype (type atlantique ou meacutediterraneacuteen)

La truite est ensuite disseacutequeacutee pour deacuteterminer le sexe Lrsquoeacutetat de maturiteacute sexuelle est eacutegalement noteacute

Lrsquoadipeuse est preacuteleveacutee et conserveacutee dans de lrsquoalcool absolu en tube laquo Eppendorf raquo de 15 ml pour des analyses geacuteneacutetiques

Des observations sont faites concernant lrsquoeacutetat sanitaire global apparent du poisson (preacutesence drsquoheacutemorragies visible exteacuterieurement gonflement des reins colorationhellip)

Mesure du poisson Peseacutee du poisson

6

Prise drsquoeacutecailles et lecture immeacutediate pour veacuterification de lrsquoacircge ici 0+

Deacutetermination du pheacutenotype Meacuted (haut) Atl (bas) Observation du sexe et de la maturiteacute sexuelle

Le coefficient de condition est calculeacute dapregraves la formule suivante K = (P100) (Lt10)3

K = coefficient de conditionP = poids en grammesLt = longueur totale du poisson en mm

De mecircme la longueur relative ((longueur de la nageoirelongueur totale du corps)100) des nageoires pectorales a eacuteteacute calculeacutee (BOSAKOWSKI et al 1993)

Ces renseignements notamment les caracteacuteristiques morphologiques permettent de reacutealiser des analyses comparatives entre poissons sauvages et introduits

Pour chaque poisson seacutelectionneacute il faut ensuite proceacuteder agrave lrsquoextraction la preacuteparation et lrsquoexamen des otolithes

152 Preacutesentation des otolithes

Les otolithes sont des piegraveces calcifieacutees preacutesentes dans loreille interne des poissons Ils se forment degraves le stade embryonnaire et suivent laccroissement de la truite Leur rocircle essentiel se situe au niveau du maintien de leacutequilibre du poisson

Il existe trois paires dotolithes dont la forme et la taille sont caracteacuteristiques dune espegravece

Les sagittaeIls sont logeacutes dans la partie ventro-posteacuterieure de la capsule auditive Des trois paires dotolithes les sagittae sont les plus utiliseacutes pour le fluoromarquage de masse comme dans la preacutesente eacutetude mais aussi pour des estimations de lacircge et de laccroissement des poissons Ceci se justifie par leur taille ce sont en effet les plus volumineux leur extraction sen trouve donc faciliteacutee

Les asterisciIls sont situeacutes agrave larriegravere des sagittae Comme ces derniers ils sont impliqueacutes dans la reacuteception des sons (PANFILI et al 2002)

Les lapilli

7

Ils se situent dans la zone anteacutero-dorsale de la capsule auditive et interviennent dans le maintien des postures et de leacutequilibre des poissons

Les sagittae plus volumineux et plus faciles agrave preacutelever ont donc eacuteteacute utiliseacutes pour mener agrave bien cette eacutetude

Lotolithe croit par apposition dun nouveau mateacuteriel sur sa surface Ce pheacutenomegravene cyclique fonction du meacutetabolisme du calcium et de la synthegravese des acides amineacutes conduit agrave la formation danneaux saisonniersLors du marquage agrave lalizarine Red S les truites ne sont acircgeacutees que de quelques semaines et de ce fait les otolithes sont de tregraves petite taille Le fluorochrome se fixe sur les structures en voie de mineacuteralisation (os dents cartilages calcifieacutes otolithes) Leur calcification se poursuit naturellement avec la croissance du poisson et ainsi seule la partie centrale de lotolithe correspondant agrave sa taille lors de la coloration est marqueacutee

Lalizarine Red S absorbe les rayons UV et eacutemet une fluorescence dans le spectre visible Cette proprieacuteteacute est utiliseacutee pour le repeacuterage du marqueur avec un microscope eacutequipeacute pour leacutepifluorescence

yeux

otolithes

cerveau

yeux

otolithes

cerveau

Photo et scheacutema de localisation des otolithes et du marquage

153 Extraction et lecture des otolithes

Les diffeacuterentes phases permettant la lecture des otolithes sont

Deacutecoupe et enlegravevement avec des ciseaux de la moitieacute infeacuterieure de la tecircte au-preacutealablement partiellement deacutecongeleacutee

Deacutecoupage en deux (plan sagittal) de la moitieacute supeacuterieure de la tecircte en faisant entrer la pointe infeacuterieure du ciseau dans le passage de la moelle eacutepiniegravere (canal rachidien) Ce mode de deacutecoupe seacutepare et sectionne les capsules olfactives contenant les sagittae qui apregraves que le cerveau a eacuteteacute enleveacute sont alors directement accessibles avec des pinces fines dans chaque demi-section de la partie supeacuterieure de la tecircte

Extraction des sagittae agrave lrsquoaide de pinces fines Apregraves avoir enleveacute les matiegraveres organiques reacutesiduelles sur un papier absorbant les otolithes sont placeacutes dans untube Eppendorf et stockeacutes agrave lrsquoabri de la lumiegravere

8

Collage de chaque otolithe (face convexe vers lrsquoexteacuterieur) sur une lame de verre mince agrave lrsquoaide drsquoune thermocolle (colle Crystalbonb Aremco ndeg 509) chauffeacutee agrave 120 degC Durant cette eacutetape il est important drsquoenlever les bulles drsquoair existantes celles-ci pouvant eacutemettre une fluororescence parasite

Polissage des otolithes sur des plaques de papiers abrasifs de granulomeacutetrie diffeacuterente (Escil PSA G 400 G 800 et G 1200) Lrsquoeacutevolution du polissage est suivi par plusieurs controcircles sous microscope afin drsquoatteindre et de ne pas deacutepasser le centre de lrsquootolithe

Lecture de lrsquootolithe sous un microscope eacutequipeacute pour lrsquoeacutepifluorescence car lrsquoARS est deacutetectable par la fluorescence qursquoil eacutemet lorsquil est irradieacute en lumiegravere ultraviolette La lecture est faite le jour mecircme du polissage car la lisibiliteacute de la marque diminue avec le temps impliquant alors la neacutecessiteacute drsquoun leacuteger repolissage

Lorsque lrsquootolithe a eacuteteacute marqueacute celui-ci montre en son centre un anneau ou un noyau (selon la preacutecociteacute du marquage etou positionnement du plan de polissage par rapport au nucleacuteus) apparaissant rouge fluorescent (jeu de filtres Zeiss ndeg15 BP 54612 FT 580 LP 590 ) ou jaune orangeacute (jeu de filtres Zeiss ndeg9 BP 450-490 FT 510 LP 520)

Lorsque lrsquootolithe a eacuteteacute marqueacute celui-ci montre en son centre un anneau fluorescent jaune orangeacute ou rouge fluorescent selon le filtre utiliseacute

Enlegravevement de la moitieacute infeacuterieure de la tecircte agrave lrsquoaide de ciseaux

Emplacement de lotolitheEmplacement de lotolithe

Tecircte apregraves dissection Localisation de lrsquootolithe

9

Extraction de lrsquootolithe Otolithes colleacutes sur lame mince Ponccedilage de lrsquootolithe

Observation de la lame mince au microscope

05mm 05mmVue au microscope drsquoun otolithe ponceacute Otolithe marqueacute (anneau fluo vert-jaune)

16Symptocircmes pathologiques observeacutes

161 La maladie reacutenale prolifeacuterative (MRP ou PKD ou teacutetracapsulose)

Selon ESCHER et al (Fischnetz-info mars et deacutecembre 2001) cette maladie est provoqueacutee par un seul parasite Tetracapsula bryosalmonae (myxosoaire) Chez les poissons on le rencontre chez les salmonideacutes et le brochet les truites eacutetant particuliegraverement toucheacutees Le taux de mortaliteacute peut ecirctre fort chez ces derniegraveres (10 agrave 100) surtout sur les estivaux

Pour que les symptocircmes (affaiblissement contraction dautres maladies) se deacuteveloppent la tempeacuterature de leau doit ecirctre supeacuterieure agrave 15degC De plus il semble que des facteurs tels quun faible taux doxygeacutenation ou une pollution chimique favoriseraient la maladie

10

Afin de savoir si la truite en preacutesence est infecteacutee il faut observer ses reins En effet un poisson ayant deacuteveloppeacute la maladie a des reins grossis et dune coloration inhabituelle

Le mode de propagation de la maladie et le cycle complet du parasite ne sont que partiellement connus Tetracapsula parasite les bryozoaires de petits organismes filtreurs qui forment des colonies de quelques centimegravetres de diamegravetre sur diffeacuterents types de substrats et que lon rencontre dans la plupart des lacs et cours deau

Les parasites se multiplient dans les bryozoaires ils ont alors une taille de 20 μm et se concentrent dans des sortes de grandes poches de 350 μm de diamegravetre Le parasite peacutenegravetre dans le poisson sous forme de petites spores agrave travers les cellules du mucilage de la peau et ce au cours de la premiegravere minute apregraves lentreacutee en contact avec lagent pathogegravene A laide de la circulation sanguine les parasites atteignent les reins ougrave ils forment diffeacuterents stades de deacuteveloppement et provoquent de violentes reacuteactions inflammatoires Il en reacutesulte les diffeacuterentssymptocircmes deacutecrits preacuteceacutedemment

Le parasite drsquoun diamegravetre de 5 agrave 20 microm a pu ecirctre observeacute dans les vaisseaux sanguins de presque tous les organes (sauf du cerveau de la moelle eacutepiniegravere et des yeux) Les spores sont libeacutereacutees dans lrsquoeau avec lrsquourine du poisson et sont probablement absorbeacutees de nouveau par les bryozoaires

Les truites qui survivent ou qui ont deacutejagrave eacuteteacute infecteacutees sans deacutevelopper la maladie sont en geacuteneacuteral immuniseacutees lanneacutee suivante

Poisson atteint pas la PKD (reins gonfleacutes et preacutesence de nodules)

La PKD provoque chez les jeunes truites une mortaliteacute variant de 10 agrave 100 des individus toucheacutesLe deacuteveloppement du parasite est favoriseacute en eacuteteacute lorsque la tempeacuterature de lrsquoeau atteint 15degC

162 Pathologies bacteacuteriennes

Des symptocircmes probablement dus agrave une pathologie bacteacuterienne ont eacuteteacute mis en eacutevidence lors de cette eacutetude En effet un pourcentage non neacutegligeable de truites eacutetait affecteacute par des rougeurs de type heacutemorragie agrave la base des nageoires

11

Selon MORAND (com pers) deux maladies bacteacuteriennes peuvent engendrer ces symptocircmes (la furonculose et la yerciniose) Ces deux maladies sont preacutesentes dans le monde entier et atteignent tout particuliegraverement les eacutelevages de salmonideacutes

Elles peuvent ecirctre favoriseacutees par des conditions particuliegraveres du milieu environnant tempeacuterature de leau eacuteleveacutee (supeacuterieure agrave 10 degC) une charge organique importante ou encore une pollution diminuant les deacutefenses immunitaires du poissonhellip

Selon la graviteacute de laffection ces pathologies peuvent entraicircner de lourds taux de mortaliteacute atteignant jusquagrave 70 dans certains cas (MOURRIERAS 1995)

Les heacutemorragies observeacutees agrave la base des nageoires sont la conseacutequence drsquoune infection bacteacuterienne pouvant provoquer drsquoimportantes mortaliteacutes

17Utilisation du SIG de la Feacutedeacuteration de pecircche de Haute-Savoie

Les donneacutees du programme pilote de marquage et du programme INTERREG sont inteacutegreacutees dans un SIG (Systegraveme dInformation Geacuteographique MapInfo) mis en place agrave la Feacutedeacuteration de pecircche de Haute-Savoie et agrave lINRA de Thonon

Ainsi toutes les informations relatives aux cours deau du deacutepartement seront consigneacutees dans cette base de donneacutees (pente longueur preacutesence de seuils infranchissables caracteacuteristiques physico-chimiques IBGN hydrologie occupation des bassins versantshellip) Il en sera de mecircme pour les donneacutees truites (repeuplement densiteacute biomasses croissance structure dacircge pathologie geacuteneacutetiquehellip)

Lapproche finale visera agrave rechercher les relations existant entre ces deux groupes de donneacutees spatialiseacutees Une toute premiegravere deacutemarche a eacuteteacute partiellement tenteacutee dans le cas du preacutesent rapport dont les donneacutees ont eacuteteacute inteacutegreacutees dans le SIG en cours de construction

12

2 Reacutesultats et discussions

Ce chapitre preacutesente les reacutesultats obtenus sur les bassins eacutetudieacutes lors de la campagne de preacutelegravevements 2002 agrave savoir

Le GiffreLe BorneLa FilliegravereLe Foron de ScionsiezLe Foron de Fillinges

Lors de la campagne 2002 1703 poissons au stade 0+ ont eacuteteacute eacutechantillonneacutes en milieu naturel et eacutetudieacutes en laboratoire

21Taux de marquage sexe ratio et pathologie

211 Le Borne

Sur le bassin du Borne 5 stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal et 3 sur des affluents Au total ce sont 392 poissons 0+ qui ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

Sur le cours principal

Les taux de marqueacutes varient fortement sur le cours principal du Borne (18 agrave 100) On observe un gradient amont-aval du taux de marqueacutes qui peut ecirctre mis en relation avec la preacutesence drsquoun obstacle partiellement infranchissable pour les geacuteniteurs au niveau drsquoEntremont

Ainsi deux grandes zones peuvent ecirctre distingueacutees sur le Borne

La zone amont du seuil drsquoEntremont ougrave la majoriteacute des juveacuteniles sont issus du repeuplement (90 agrave 100)

On observe sur ce secteur une tregraves faible reproduction naturelle en raison drsquoune quasi-absence de poissons adultes La situation de la population de truites est donc tregraves critique Si le repeuplement permet de drsquoobserver des 0+ il nrsquoa pas permis drsquoinstaller une population fonctionnelle

La zone aval du seuil drsquoEntremont ougrave la majoriteacute des individus preacutesents au stade 0+ sont des poissons naturels

En effet le taux de marqueacutes varie de 18 agrave 49 Les pecircches de sondage Interreg ont montreacute la preacutesence drsquoune importante population de truites sauvages drsquoorigine meacutediterraneacuteenne La population est eacutequilibreacutee et naturellement fonctionnelle puisqursquoon observe une forte reproduction naturelle et de nombreux geacuteniteurs

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Sur les Affluents

Sur les 3 affluents eacutetudieacutes la situation est tregraves simple En effet soit on observe 0 de marqueacutes soit 100

- Sur lrsquoOveacuteran aval aucun poisson marqueacute nrsquoa eacuteteacute trouveacute puisqursquoil nrsquoy a pas eu de repeuplement sur ce secteur en 2002 Le reacutesultat obtenu montre une importante reproduction naturelle des geacuteniteurs du Borne qui remontent sur lrsquoaval de ce cours drsquoeau

- Sur la Duche et le Chinaillon il y a absence totale de reproduction naturelle puisque 100 des 0+ eacutechantillonneacutes sont marqueacutes Pourtant on observe de nombreux poissons adultes sur ces secteurs susceptibles drsquoecirctre des geacuteniteurs ainsi que diffeacuterentes classes drsquoacircge Lrsquoeacutequilibre de ces populations est artificiellement maintenu par les alevinages

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

- Toutes les stations eacutetudieacutees ne sont pas concerneacutees par ces symptocircmes de maladies- Les maladies bacteacuteriennes semblent toucher majoritairement les poissons introduits- Cependant les 0+ de lrsquoOveacuteran aval tous naturels sont infecteacutes agrave 15 Ce reacutesultat

peut refleacuteter une contamination par deacutevalaison provenant drsquoindividus atteints situeacutes plus en amont de lrsquoOveacuteran ou une contamination naturelle par des agents pathogegravenes preacutesents dans le milieu

- Les poissons marqueacutes peuvent ecirctre contamineacutes agrave un taux non neacutegligeable pouvant atteindre plus de 30

Pourcentage dindividus preacutesentant des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

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Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

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Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Le sexe ratio est relativement eacutequilibreacute pour les marqueacutes comme pour les non marqueacutes Seule une station sur le Borne (Beffay) montre 85 de macircle dans la population de 0+

- Seules 2 stations montrent des macircles matures au stade 0+- Le pourcentage de macircles matures au stade 0+ est plus important chez les non

marqueacutes que chez les marqueacutes

Pourcentage de macircles au stade 0+

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Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Borne

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Pourcentage de macircles au stade 0+

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Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Borne

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

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212 Le Giffre

Sur le bassin du Giffre 6 stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal et 7 sur des affluents Au total ce sont 536 poissons 0+ qui ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

Sur le cours principal

La carte de synthegravese des reacutesultats met en eacutevidence des taux de marqueacutes tregraves contrasteacutes variant entre 0 et 100 Sauf deux cas particuliers la campagne de preacutelegravevements a permis de montrer qursquoune reproduction naturelle existait sur lrsquoensemble du Giffre

Il est possible de distinguer trois zones successives sur ce cours deau

La zone aval est composeacutee de la station Pont du Giffre ougrave le taux de marqueacutes est de 74 Cette station sur le Giffre doit ecirctre rapprocheacutee des stations eacutetudieacutees sur le Risse (station laquo Risse aval St Jeoire raquo) et le Hisson(laquo station La Pallud raquo) pour mieux comprendre le fonctionnement de la population

- Sur le Giffre aval la situation semble tregraves critique La station dite laquo Pont du Giffre raquosrsquoeacutetend de lrsquoamont de Marignier agrave lrsquousine du Pont du Giffre soit sur environ 25 km Sur cette distance seulement 31 0+ ont pu ecirctre captureacutes De plus les pecircches drsquoadultes dans le cadre drsquoInterreg montrent un deacuteficit inquieacutetant de geacuteniteurs sur ce secteur ainsi qursquoune surabondance de Chabot La situation du bas Giffre montre une population de truitetotalement deacuteseacutequilibreacutee loin du potentiel de la riviegravere et qui ne peut pas ecirctre reacutehabiliteacutee par le seul fait de lrsquoalevinage Cette situation peut ecirctre le reacutesultat du faible deacutebit reacuteserveacute qui appauvrit lrsquohabitat aquatique et provoque des eacuteleacutevations de tempeacuterature inquieacutetantes Les reacutesultats de pecircche drsquoinventaire dans la reacuteserve de Marignier montrent que les poissons sont concentreacutes agrave lrsquoaval immeacutediat des seuils ougrave lrsquoon note la preacutesence de fosses de tempeacuteratures plus faibles et drsquoune meilleure oxygeacutenation

La zone moyenne situeacutee entre le barrage de Mieussy et Samoeumlns qui est composeacutee des stations laquo aval barrage Taninges raquo laquo Theacuteziegraveres raquo et laquo Montessuit raquo Sur ce secteur les 0+ marqueacutes sont en minoriteacutes puisqursquoils repreacutesentent 11 agrave 38 du peuplement

- Sur le Giffre aval barrage de Taninges le secteur nrsquoest pas alevineacute il est donc normal que pregraves de 90 des poissons ne soient pas marqueacutes Les 0+ marqueacutes proviennent certainement du ruisseau de lrsquoEtroit Denteacute qui est fortement alevineacute et agrave partir duquel une deacutevalaison doit avoir lieu- Le secteur des laquo Theacuteziegraveres raquo et de laquo Montessuit raquo bien que reacuteguliegraverement alevineacute montre un taux important drsquoalevins naturels (62 agrave 77) Ce reacutesultat est tout agrave fait en accord avec le suivi de la reproduction naturelle et le recensement de frayegraveres reacutealiseacute par lrsquoAAPPMA du Faucigny et le CSP en 1999 En effet de nombreuses frayegraveres naturelles avaient eacuteteacute observeacutees sur ce site Le peuplement drsquoadultes nrsquoest pas tregraves important mais est en rapport avec les potentialiteacutes du milieu

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18

La zone amont caracteacuteriseacutee par les stations laquo Reveacute-Peacuteret raquo et laquo amont Tines raquo ougrave le taux de marqueacutes varie de 70 agrave 79

- Pour ces deux stations la population de juveacuteniles est faible et ils sont majoritairement marqueacutes Cependant au stade adulte les pecircches Interreg montrent une majoriteacute de poissons drsquoorigine meacutediterraneacuteenne La forte contribution de poissons introduits au stade 0+ ne semble pas se retrouver au stade adulte Les conditions de vie dans ce milieu sont tregraves difficiles et ne permettent pas drsquoatteindre des densiteacutes de poissons importantes

Sur les Affluents

Le Risse - Le Hisson montre une majoriteacute drsquoalevins naturels alors que les preacutelegravevements ont eacuteteacute reacutealiseacutes seulement deux mois apregraves le repeuplement Ce cours drsquoeau possegravede un fort potentiel de frai qui est utiliseacute notamment par les geacuteniteurs du Risse- Sur lrsquoaval du Risse le taux de marqueacutes est de 68 Il est le reflet drsquoun alevinage en quantiteacute importante sur le secteur (10 000 alevins) Les alevins naturels repreacutesentent tout de mecircme plus de 30 trois mois apregraves le repeuplement De plus les eacutechantillonnages drsquoadultes reacutealiseacutes sur ce secteur dans le cadre drsquoInterreg ont mis en eacutevidence une quantiteacute importante de geacuteniteurs sauvages La population sur ce secteur est agrave mettre en eacutevidence avec celle du Hisson puisque certains geacuteniteurs du Risse y migrent pour se reproduireLa population sur ce secteur est naturellement fonctionnelle

Le Foron de Mieussy - La station laquo Andelier raquo situeacutee en amont du Foron preacutesente 100 de marqueacutes Cette situation montre une absence totale de reproduction naturelle Le milieu est extrecircmement deacutefavorable agrave lrsquoinstallation drsquoune population fonctionnelle en raison du faible deacutebit de la riviegravere (assegravechement reacutegulier) Aucune classe drsquoacircge intermeacutediaire et aucun adulte nrsquoa eacuteteacute observeacute sur ce secteur Les poissons alevineacutes sont certainement victimes des assegravechements- La station laquo Trebiet raquo situeacutee plus en aval preacutesente au contraire 0 de marqueacutes alors que cette zone a eacuteteacute alevineacutee Ce reacutesultat montre la capaciteacute du Foron sur ce secteur a accueillir une population fonctionnelle Il existe une reproduction naturelle importante sur cette zone avec eacutegalement beaucoup de geacuteniteurs- Vers Sommand une pecircche de sondage a eacuteteacute reacutealiseacutee mais aucun alevin nrsquoa eacuteteacute preacuteleveacute puisque cette zone nrsquoa pas eacuteteacute alevineacutee en 2002 Cependant les reacutesultats de ce sondage mettent en eacutevidence une absence totale de reproduction naturelle (aucun alevin naturel nrsquoa eacuteteacute trouveacute) alors que la population semble eacutequilibreacutee (preacutesence drsquoadultes et de truitelles drsquoacircge intermeacutediaire)

LrsquoEtroit Denteacute Globalement le taux de marqueacutes sur les deux stations eacutetudieacutees est faible (11 agrave 33)- Sur la station laquo aval route raquo la majoriteacute des alevins est naturelle Cette zone montre un habitat tregraves favorable pour la reproduction des geacuteniteurs qui remontent du Giffre- Sur la station laquo amont route raquo une population fonctionnelle de pheacutenotype meacutediterraneacuteen est installeacutee De nombreux geacuteniteurs sont preacutesents et le recrutement naturel est important

19

Le Foron de Taninges - En amont (station Bonnavaz) le taux de marqueacutes est tregraves important (95) Il existe donc une reproduction naturelle mais insuffisante pour permettre lrsquoinstallation drsquoune population et maintenir une activiteacute halieutique Les alevinages passeacutes nrsquoont pas permis drsquoinstaller une population fonctionnelle dans cette zone apicale- Plus en aval sur les zones non alevineacutees les pecircches eacutelectriques drsquoinventaire et de sondage reacutealiseacutees ont montreacute la preacutesence drsquoune population eacutequilibreacutee de pheacutenotype meacutediterraneacuteen avec une importante reproduction naturelle

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

Les principales remarques concernant les pathologies observeacutees sur le bassin du Giffre sont

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

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Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Giffre

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Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Giffre

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

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20

- La PKD est preacutesente sur le cours du Giffre mais uniquement agrave lrsquoaval du barrage de Taninges Cette situation est agrave mettre en relation avec le deacutebit reacuteserveacute insuffisant qui entraicircne une augmentation de tempeacuterature pendant la peacuteriode estivale

- Sur les affluents la PKD a eacuteteacute observeacutee sur les secteurs preacutesentant des faibles deacutebits estivaux (aval du Risse et Foron de Mieussy Andelier) qui sont certainement responsables drsquoune augmentation de tempeacuterature

- La PKD atteint agrave la fois les poissons introduits que les poissons naturels- Le pourcentage drsquoindividus toucheacutes par la PKD varie drsquoun site agrave lrsquoautre mais peut

atteindre une valeur importante avec 50 sur certain secteur- Les maladies bacteacuteriennes sont plus freacutequentes chez les individus marqueacutes Soit ces

poissons sont plus fragiles que les poissons naturels et contractent les maladies plus facilement soit les maladies sont contracteacutees en pisciculture pendant lrsquoeacutelevage

- Le pourcentage drsquoindividus toucheacutes par des symptocircmes bacteacuteriens nrsquoest pas neacutegligeable puisqursquoil peut atteindre 20

- Lrsquoensemble des stations eacutetudieacutees est toucheacute par des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes ce qui laisse penser que lrsquoensemble du bassin peut ecirctre atteint

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

21

- Le sexe ratio apparaicirct globalement eacutequilibreacute sur lrsquoensemble des stations du Giffre- On observe des diffeacuterences entre les poissons introduits et les poissons naturels sur

seulement 3 stations Ces diffeacuterences sont en faveur des poissons marqueacutes qui montrent un pourcentage de macircles plus important

- Une maturiteacute sexuelle preacutecoce des macircles existe sur certaines stations quelle que soit lrsquoorigine des poissons

- Cette maturiteacute peut ecirctre importante et concerner jusqursquoagrave 20 des 0+

22

213 Le Foron du Reposoir

Deux stations (La Touviegravere et Le Reposoir) ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le Foron du Reposoir Seulement 15 0+ ont eacuteteacute eacutetudieacutes en raison principalement de la difficulteacute drsquoeacutechantillonner des poissons de petite taille (6-7 cm) sur ces milieux torrentiels

Le taux de marqueacutes

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23

- Sur les deux stations eacutetudieacutees le taux de marqueacutes est de 100 Lrsquoensemble des 0+ mecircme si le nombre est faible est donc issu de lrsquoalevinage Ce cours drsquoeau fait lrsquoobjet actuellement drsquoun essai drsquoimplantation drsquoune population agrave partir de la souche Chazey-Bons Rhodanienne Cette souche provient de geacuteniteurs de la riviegravere Furan (Ain) Des analyses geacuteneacutetiques reacutecentes reacutealiseacutees par analyse de microsatellites diagnostic de lrsquoADN ont montreacute que ces poissons ont un pourcentage dallegraveles meacutediterraneacuteens voisin de 65

Ce reacutesultat montre que le cours deau avait un niveau de population tregraves faible avant le repeuplement par la souche Chazey-Bons sauvagesDe plus les pecircches drsquoinventaires du CSP et les pecircches de sondage Interreg montrent qursquoune population de truites se met progressivement en place En effet on observe chaque anneacutee despoissons agrave des stades de plus avanceacutes et les captures par pecircche agrave la ligne commencent agrave ecirctre effectivesLes pecircches eacutelectriques reacutealiseacutees agrave lrsquoautomne 2002 indique que le stock de geacuteniteurs est en cours de reconstitution mais que les truites femelles nrsquoont pas encore atteint le stade geacuteniteurIl nrsquoest donc pas encore possible de dire si lrsquohabitat et la population du Foron du Reposoir sont propices agrave lrsquoinstallation drsquoune population naturellement fonctionnelle

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

Aucun symptocircme reacutenal et heacutemorragique nrsquoapparaicirct sur les 0+ eacutechantillonneacutes sur ce cours deau

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Le sexe ratio est eacutequilibreacute puisqursquoil varie de 50 agrave 60- Il nrsquoy a aucun macircle mature au stade 0+ dans les eacutechantillons preacuteleveacutes sur ce cours

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La Touviegravere Le Reposoir

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Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

24

214 La Filliegravere

Cinq stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal de la Filliegravere ainsi que sept stations sur les trois affluents principaux (Flan Creacutenant et Daudens) Au total 582 poissons 0+ ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

Sur le cours principal

Pour les 5 stations eacutetudieacutees sur le cours principal le taux de 0+ marqueacutes varie de 4 agrave 56 il est donc de tregraves faible agrave moyen et montre une forte reproduction naturelle sur toute la riviegravere Il y a un gradient amont-aval du taux de marqueacutes avec un pourcentage de poissons marqueacutes plus important en amont Cependant sur lrsquoensemble de la Filliegravere le recrutement naturel est dominant et constitue lrsquoessentiel de la population de truite

De plus les pecircches de sondages pour Interreg ont montreacute la preacutesence de nombreux drsquoadultes drsquoorigine naturelle meacutediterraneacuteenne Ceci confirme que la population de truite de la riviegravere principale est naturellement fonctionnelle

Sur les affluents

Les reacutesultats sont diffeacuterents selon que lrsquoaffluent est en connexion ou non avec la riviegravere principale

- Sur le Flan on observe en zone aval et meacutediane (stations laquo D 55 raquo et laquo Bruchon raquo) des taux de marqueacutes faibles (38 et 27) qui mettent en eacutevidence la preacutesence drsquoune forte reproduction naturelle notamment de poissons migrants de la Filliegravere Les releveacutes de frayegraveres reacutealiseacutes par lrsquoAAPPMA avaient deacutejagrave permis drsquoobserver de nombreuses frayegraveres naturelles sur ce secteurEn zone plus amont station laquo Molliet raquo le taux de marqueacutes est plus important (73) il met en eacutevidence la preacutesence drsquoun recrutement naturel mais qui reste au stade 0+ minoritaire par rapport aux individus introduits

- Sur le Daudens les deux stations (laquo Le Plot raquo et Daudens raquo) montrent des taux de marqueacutes importants (86 et 92) La reproduction naturelle est donc tregraves faible et la population de truite ne semble pas fonctionnelle Lrsquoobstacle agrave lrsquoaval de la route deacutepartementale semble preacutejudiciable car il ne permet pas aux geacuteniteurs de la Filliegravere de remonter sur le Daudens et drsquoinstaller une population fiable

- Sur le Crenant Les deux stations eacutechantillonneacutees (laquo aval raquo et Disonche raquo) ne sont pas situeacutees sur des zones alevineacutees en 2002 et il est normal de trouver 0 de marqueacutes Cependant ces reacutesultats montrent qursquoil y a une forte reproduction naturelle sur ce cours drsquoeau mecircme en zone amont et que la population semble naturellement fonctionnelle Les alevins introduits sur le Crenant ne semblent pas avoir deacutevaleacutes sur pour coloniser lrsquoaval du Crenant

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Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

- La PKD semble quasiment absente du bassin de la Filliegravere sauf preacutesence anecdotique uniquement chez les non marqueacutes sur une station (laquo Millard raquo)

- Les individus marqueacutes ne sont pas toucheacutes par la PKD- Les maladies bacteacuteriennes sont preacutesentes sur lrsquoensemble du bassin mais touchent en

prioriteacute et majoritairement les individus marqueacutes

Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

0102030405060708090

100

Le J

ourd

il

Pis

cicu

lture

Milla

rd

Long

cham

ps

D55

Bru

chon

Mol

liet

Le

Plo

t

Dau

dens

Ava

l

Dis

onch

e

La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere Le Flan Le Flan Le Flan LeDaudens

LeDaudens

LeCrenant

LeCrenant

Pourcentage dindividus preacutesentant des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

0102030405060

Le J

ourd

il

Pisc

icul

ture

Milla

rd

Long

cham

ps

D55

Bru

chon

Mol

liet

Le

Plo

t

Dau

dens

Ava

l

Dis

onch

e

La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere Le Flan Le Flan Le Flan LeDaudens

LeDaudens

LeCrenant

LeCrenant

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

27

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Sur lrsquoensemble des stations le sexe ratio est eacutequilibreacute il montre une plus grande variation chez les individus marqueacutes

- Des macircles matures au stade 0+ ont eacuteteacute observeacutes sur trois stations uniquement chez les individus naturels

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

Pourcentage de macircles au stade 0+

0102030405060708090

Le J

ourd

il

Pis

cicu

lture

Milla

rd

Long

cham

ps

D55

Bruc

hon

Mol

liet

Le

Plo

t

Dau

dens

Ava

l

Dis

onch

e

LaFilliegravere

LaFilliegravere

LaFilliegravere

LaFilliegravere

Le Flan Le Flan Le Flan LeDaudens

LeDaudens

LeCrenant

LeCrenant

Pourcentage de macircles matures au stade 0+

01020304050

Le J

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Pis

cicu

lture

Milla

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Long

cham

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D55

Bruc

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Mol

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Ava

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Dis

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FilliegravereLa

FilliegravereLa

FilliegravereLa

FilliegravereLe Flan Le Flan Le Flan Le

DaudensLe

DaudensLe

CrenantLe

Crenant

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

Pourcentage de macircles au stade 0+

0102030405060708090

Le J

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Pis

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lture

Milla

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Long

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D55

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Mol

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Ava

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LaFilliegravere

LaFilliegravere

LaFilliegravere

LaFilliegravere

Le Flan Le Flan Le Flan LeDaudens

LeDaudens

LeCrenant

LeCrenant

Pourcentage de macircles matures au stade 0+

01020304050

Le J

ourd

il

Pis

cicu

lture

Milla

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Long

cham

ps

D55

Bruc

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Mol

liet

Le

Plo

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Ava

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Dis

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FilliegravereLa

FilliegravereLa

FilliegravereLa

FilliegravereLe Flan Le Flan Le Flan Le

DaudensLe

DaudensLe

CrenantLe

Crenant

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

28

215 Le Foron de Fillinges

Trois stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal du Foron de Fillinges agrave savoir de lrsquoamont vers lrsquoaval laquo Bovet ndash Boex raquo laquo Pont de Fillinges raquo et laquo Couvette raquo Au total 178 poissons 0+ ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

Leacutege

nde

Mar

queacutes

Non

mar

queacutes

X

d

rsquoindi

vidu

s m

arqu

eacutes

Sec

teur

ale

vineacute

en

2002

Loca

lisat

ion

des

stat

ions

drsquoeacute

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et t

aux

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arqu

eacutes s

ur le

bas

sin

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oron

de F

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ges

laquo C

ouve

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2

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0

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Boex

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31

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2002

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laquo Bo

vet ndash

Boex

raquo

31

laquo Bo

vet ndash

Boex

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31

29

Sur les 3 stations eacutetudieacutees les taux de marqueacutes sont faibles agrave tregraves faibles- Sur la station laquo Bovet ndash Boex raquo le taux de marqueacutes est de seulement 31- A lrsquoaval sur les stations laquo Pont de Fillinges raquo et laquo Couvette raquo les taux de marqueacutes

sont respectivement de 0 et 2

Les reacutesultats indiquent la preacutesence drsquoune importante reproduction naturelle sur lrsquoensemble du Foron de Fillinges Quelque soit la souche utiliseacutee pour lrsquoalevinage atlantique dans le secteur Faucigny ou Meacutediterraneacuteenne Pont de Gys dans le secteur Chablais les poissons introduits restent minoritaires

Cette situation traduit la preacutesence drsquoune population bien installeacutee et fonctionnelle sur cette riviegravere

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

0102030405060708090

100

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Pourcentage dindividus preacutesentant des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

05

101520253035404550

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

0102030405060708090

100

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Pourcentage dindividus preacutesentant des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

05

101520253035404550

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

30

- Sur lrsquoensemble des stations des individus 0+ sont atteints par la PKD le pourcentage drsquoindividus malades peut atteindre 35

- Seuls les individus sauvages semblent toucheacutes par la PKD cependant le nombre drsquoindividus introduits est trop faible pour permettre une comparaison

- Toutes les stations sont eacutegalement toucheacutees par les maladies bacteacuteriennes avec des taux de contamination variant de 15 agrave 30

- Les maladies bacteacuteriennes touchent agrave la fois les individus introduits et les individus naturels

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Le sexe ratio apparaicirct eacutequilibreacute sur lrsquoensemble des stations- On observe des macircles matures degraves le stade 0+ sur lrsquoensemble des stations- Le taux de macircles matures au stade 0+ peut atteindre 15

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

Pourcentage de macircles au stade 0+

0

102030405060

708090

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Pourcentage de macircles matures au stade 0+

05

101520253035404550

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

Pourcentage de macircles au stade 0+

0

102030405060

708090

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Pourcentage de macircles matures au stade 0+

05

101520253035404550

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

31

22Caracteacuteristiques morphologiques

221 Longueur totale des individus

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Giffre

0

20

40

60

80

100

120

140Am

ont

Tine

s

Rev

eacute-Peacute

ret

Mon

tess

uit

Theacutez

iegravere

s

Aval

barr

age

Tani

nges

Pont

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Ris

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Bonn

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tro

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Aval

rout

e

Ande

lier

Treb

iet

La P

allu

d

Aval

St

Jeoi

re

LeGiffre

LeGiffre

LeGiffre

LeGiffre

LeGiffre

LeGiffre

Le FdeTaninges

LEtroitDenteacute

LEtroitDenteacute

Le F deMieussy

Le F deMieussy

LeHisson

Le Risse

Long

ueur

tota

le e

n m

m

Taille moyenne des 0+ sur le Borne

0

20

40

60

80

100

120

140

GrandBornand

Les Etroits Entremont Beffay St Pierre en F

Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Chinaillon La Duche LOveacuteran

Long

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Taille moyenne des 0+ sur la Filliegravere

0

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LeCrenant

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Giffre

0

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140Am

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Le FdeTaninges

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Le F deMieussy

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Taille moyenne des 0+ sur le Borne

0

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GrandBornand

Les Etroits Entremont Beffay St Pierre en F

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Taille moyenne des 0+ sur la Filliegravere

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LeCrenant

LeCrenant

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tota

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m

32

Sur la quasi-totaliteacute des stations eacutetudieacutees les individus marqueacutes preacutesentent une taillemoyenne supeacuterieure agrave celle des individus naturels Sur 18 stations ougrave les effectifs permettent des comparaisons statistiques la longueur totale des individus marqueacutes est significativement supeacuterieure agrave celle des truites sauvages pour 13 stations

Les 5 stations faisant exception sont laquo aval barrage Taninges raquo et laquo Pont du Giffre raquo sur le Giffre laquoAval St Jeoire raquo sur le Risse laquo Bonnavaz raquo sur le Foron de Taninges et laquo Couvette raquo sur le Foron de Fillinges Cependant sur ces stations les diffeacuterences ne sont pas significatives

Le fait que les marqueacutes aient une plus grande taille moyenne que les non marqueacutes au stade 0+ nrsquoimplique pas que cela soit systeacutematiquement le cas aux stades ulteacuterieurs En effet CAUDRON (1998) et CHAMPIGNEULLE et CACHERA (2003) ont montreacute respectivement sur le Doubs et le Fier que les diffeacuterences de tailles entre marqueacutes et non marqueacutes au stade 0+ sestompaient au stade 1+ et chez les adultes

Par ailleurs lrsquoexistence drsquoune plus grande taille au stade 0+ en automne pour les marqueacutes ne leur garantit pas un meilleur taux de seacutedentarisation En effet plusieurs eacutetudes dont celle de JONSSON et JONSSON (1993) indiquent que le taux de deacutevalaison peut ecirctre plus eacuteleveacute pour les individus agrave plus forte croissance au stade 0+ La deacutevalaison peut donc toucher preacutefeacuterentiellement les individus marqueacutes en raison de leur forte croissance

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Foron du Reposoir

0

20

40

60

80

100

120

140

La Touviegravere Le Reposoir

F du Reposoir F du Reposoir

Long

ueur

tota

le e

n m

mTaille moyenne des 0+ sur le Foron de Fillinges

0

20

40

60

80

100

120

140

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Long

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tota

le e

n m

m

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Foron du Reposoir

0

20

40

60

80

100

120

140

La Touviegravere Le Reposoir

F du Reposoir F du Reposoir

Long

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tota

le e

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mTaille moyenne des 0+ sur le Foron de Fillinges

0

20

40

60

80

100

120

140

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Long

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tota

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n m

m

33

222 Taille des nageoires pectorales

La figure ci-dessus montre qursquoil existe une diffeacuterence entre marqueacutes et non marqueacutes du rapport entre la longueur de la nageoire pectorale et la longueur totale du poisson

Il a sembleacute important drsquoanalyser plus en deacutetail ce caractegravere morphologique car il peut preacutesager de lrsquoaptitude des truites agrave se maintenir dans nos riviegraveres de montagne

Relation entre la longueur de la nageoire pectorale et la longueur totale des individus marqueacutes et non marqueacutes

5

7

9

11

13

15

17

19

21

23

25

27

30 50 70 90 110 130 150 170Longueur totale en mm

Long

ueur

nag

eoire

pec

tora

le e

n m

mMarqueacuteNon marqueacute

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron du Reposoir

12

14

16

18

20

La Touviegravere Le Reposoir

F du Reposoir F du Reposoir

Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron de Fillinges

12

14

16

18

20

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron du Reposoir

12

14

16

18

20

La Touviegravere Le Reposoir

F du Reposoir F du Reposoir

Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron de Fillinges

12

14

16

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Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

34

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Giffre

12

14

16

18

20

Am

ont

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s

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eacuteret

Mon

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uit

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Le Giffre Le Giffre Le Giffre Le Giffre Le Giffre Le Giffre Le FdeTaninges

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LEtroitDenteacute

Le F deMieussy

Le F deMieussy

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Taille relative moyenne des pectorales sur la Filliegravere

12

14

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La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere Le Flan Le Flan Le Flan LeDaudens

LeDaudens

LeCrenant

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Taille relative moyenne des pectorales sur le Borne

12

14

16

18

20

GrandBornand

Les Etroits Entremont Beffay St Pierre en F

Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Chinaillon La Duche LOveacuteran

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Giffre

12

14

16

18

20

Am

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Tine

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Le F deMieussy

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Taille relative moyenne des pectorales sur la Filliegravere

12

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Le J

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Taille relative moyenne des pectorales sur le Borne

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18

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GrandBornand

Les Etroits Entremont Beffay St Pierre en F

Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Chinaillon La Duche LOveacuteran

35

Sur les 24 stations ougrave des individus marqueacutes et non marqueacutes coexistent la taille relative des nageoires pectorales est systeacutematiquement plus importante chez les individus naturelsLes truites issues du repeuplement preacutesentent donc des nageoires pectorales de longueur infeacuterieure agrave celle des truites sauvagesCette diffeacuterence morphologique est tregraves importante car le deacuteveloppement des nageoires est un eacuteleacutement deacuteterminant pour la survie du poisson dans son milieu notamment pour la stabiliteacute la reacutesistance au courant et la recherche de nourriture an action de chasse

Il semble donc possible que cette caracteacuteristique anatomique soit le reacutesultat drsquoune adaptation agrave la vie en torrent

BOSAKOWSKI et al (1993) ont eacutegalement observeacutes des reacutesultats comparables chez des truites arc-en-ciel et des truites brunes de plus grande taille entre poissons drsquoeacutelevage et poissons sauvages Dans cette eacutetude les poissons deacutelevage preacutesentaient des nageoires nettement plus courtes (10-50) que les poissons sauvages Selon les auteurs cette diffeacuterence semblait ecirctre causeacutee par les conditions de vie des poissons dans les bassins des piscicultures(agression intraspeacutecifique stress qualiteacute de leau et densiteacutes de poissons) qui provoquaient une eacuterosion des nageoires

Dans le cas preacutesent les poissons de repeuplement ont eacuteteacute introduits agrave des stades preacutecoces dans le milieu et ont eacuteteacute preacuteleveacutes 4 agrave 5 mois apregraves leur introduction En conseacutequence ils ont veacutecu peu de temps en pisciculture et ont par contre passeacute lessentiel de leur vie dans le mecircme milieu naturel que les poissons sauvages Ainsi il semble que ce dimorphisme de la nageoire entre poissons sauvages et introduits soit drsquoorigine geacuteneacutetique Une eacutetude de RIDDELL et al (1981) a montreacute chez le saumon que les diffeacuterences de deacuteveloppement de nageoires eacutetaient une adaptation des poissons agrave leur milieu qui preacutesentait une origine geacuteneacutetiqueIl est donc tout agrave fait probable qursquoun pheacutenomegravene similaire se rencontre chez la truite fario et que les truites sauvages soient mieux adapteacutees sur le plan morphologique (gracircce agrave des diffeacuterences geacuteneacutetiques) aux conditions du milieu que les poissons introduits mecircme agrave des stades preacutecoces

Outre lrsquoaspect purement geacuteneacutetique les facteurs environnants peuvent eacutegalement jouer un rocircle important En effet McLAUGHLIN et al (2002) ont montreacute que cette diffeacuterence au niveau des nageoires peut eacutegalement ecirctre due agrave des caracteacuteristiques du milieu environnant dans les premiegraveres semaines de vie des poissons En effet plusieurs lots drsquoune mecircme souche de saumon de fontaine soumis degraves lrsquoeacuteclosion agrave des conditions de vie diffeacuterentes montrent des diffeacuterences dans le deacuteveloppement des nageoires Ainsi degraves les premiegraveres semaines les poissons exposeacutes agrave un fort courant sont pourvus de nageoires plus longues

Il est donc possible que les alevins produits en pisciculture nrsquoeacutetant pas exposeacutes agrave des courants importants au cours de leurs premiegraveres semaines de vie deacuteveloppent des nageoires pectorales moins longues que les individus sauvages

Il y a probablement pour cette caracteacuteristique morphologique des interactions combinant geacuteneacutetique et conditions environnementales

Cette diffeacuterence morphologique peut eacutegalement avoir une importance dans la compeacutetition entre poissons sauvages et introduits notamment au stade juveacutenile En effet GIBSON (1973) a deacutemontreacute limportance des nageoires dans la compeacutetition interspeacutecifique

36

entre le saumon atlantique (Salmo salar L) et le saumon de fontaine (Salvenius fontinalis) deux poissons consommant la mecircme nourriture Le fait de posseacuteder des nageoires pectorales plus deacutevelopper permet au saumon atlantique de se maintenir dans les courants pour se nourrir tout en deacutepensant moins drsquoeacutenergie

Dans le cas des torrents haut-savoyards une compeacutetition intraspeacutecifique entre truites sauvages et introduites comparable agrave leacutetude de GIBSON peut se deacutevelopper La diffeacuterence morphologique entre les truites sauvages et issues du repeuplement peut donc avoir une influence lors de la compeacutetition entre ces deux types dindividus

37

3 Premiegraveres implications pour la gestion

En fonction des reacutesultats obtenus lors de la campagne de preacutelegravevements 2002 des orientations de gestion sont proposeacutees pour chaque riviegravere eacutetudieacutee Certaines propositions impliquent des changements relativement importants des pratiques actuelles de gestion

Lrsquoeacutetude de lrsquoefficaciteacute des repeuplements srsquoappuient sur une deacutemarche scientifique rigoureuse dans lrsquointeacuterecirct des gestionnaires directs (AAPPMA) puisqursquoelle permet agrave ces derniers de prendre des deacutecisions en srsquoappuyant sur des reacutesultats concrets et indiscutables Elle est conduite dans un souci drsquoeacutevaluer en toute objectiviteacute les pratiques drsquoalevinage dans le seul but drsquoameacuteliorer la gestion actuelle des populations et des milieux Concregravetement elle permet de connaicirctre rapidement les zones ougrave lrsquoalevinage en truite fario est inefficace et donc inutile et les zones ougrave celui-ci est efficace et donc neacutecessaire

En plus des reacutesultats obtenus gracircce aux marquages des juveacuteniles les propositions prennent en compte les premiers reacutesultats issus des pecircches de sondage drsquoadultes reacutealiseacutees pour le programme INTERREG (reacutedaction en cours) Lrsquointeacutegration des diffeacuterentes donneacutees (marquage juveacutenile + adultes) permet de faire des propositions coheacuterentes selon un diagnostic le plus complet possible de la population de truite preacutesente

31 Bassin du Borne

Sur les riviegraveres du bassin du Borne les orientations de gestion proposeacutees ci-apregraves restent conformes agrave celles deacutejagrave eacutevoqueacutes par CAUDRON et CHAMPIGNEULLE (2002)

Arrecirct du repeuplement selon les pratiques actuelles sur lrsquoensemble du cours principal Cette proposition est motiveacutee par deux principales raisons

- Lrsquoalevinage est inefficace agrave lrsquoamont du seuil drsquoEntremont car apregraves plus de 15 ans il nrsquoa pas permis drsquoinstaller une population en place eacutequilibreacutee

- Il semble impeacuteratif de preacuteserver lrsquoimportante population de truite sauvage preacutesente agrave lrsquoaval du seuil drsquoEntremont Les reacutesultats geacuteneacutetiques indiquent que la population preacutesente est une population sauvage qui nrsquoa pas eacuteteacuteimplanteacutee suite agrave lrsquoalevinage Elle preacutesente un degreacute de pureteacute geacuteneacutetique important Cette population repreacutesente un patrimoine unique dans le Faucigny Le but drsquoarrecircter les alevinages sur ce secteur est drsquoeacuteviter les hybridations qui peuvent entraicircner une perte de plasticiteacute geacuteneacutetique et une deacutegeacuteneacuterescence de la souche sauvage actuelle

Arrecirct du repeuplement sur lrsquoaval de lrsquoOveacuteran Ce secteur est utiliseacute comme zone de reproduction par les geacuteniteurs du Borne et la reproduction naturelle y est abondante Lrsquoalevinage nrsquoest donc pas neacutecessaire et risque comme sur le Borne de provoquer une hybridation de la population naturelle

Essayer drsquoinstaller une population naturelle agrave lrsquoamont du seuil drsquoEntremont par transferts de geacuteniteurs

Sur les autres affluents deux sceacutenarii de gestion peuvent ecirctre envisageacutes selon la volonteacute politique des gestionnaires directs

Sceacutenario ndeg1 vision patrimoniale

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- Arrecirct du repeuplement en truite drsquoorigine Atlantique pendant 3 anneacutees conseacutecutives pour diminuer leur preacutesence sur le bassin

- Puis reprise de lrsquoalevinage pendant uniquement 3 anneacutees agrave partir de poissons sauvages issus du Borne pour essayer drsquoinstaller une population naturelle

Sceacutenario ndeg2 vision halieutique- Maintien des pratiques drsquoalevinage en atlantique pour soutenir

artificiellement le stock de poissons dans un inteacuterecirct uniquement halieutique Attention cette pratique risque de provoquer par deacutevalaison des individus introduits une hybridation des poissons sauvages preacutesents dans le Borne

Eventuellement repeuplement en truites Arc en Ciel surdensitaires sur des secteurs preacutecis du Borne pendant la peacuteriode estivale afin de contenter une certaine cateacutegorie de pecirccheurs Les repeuplements en Arc en Ciel ne risquent pas de provoquer drsquohybridation de la souche fario locale Attention prendre des preacutecautions aupregraves des fournisseurs concernant la qualiteacute sanitaire des poissons

32 Bassin du Giffre

Les propositions sur le bassin du Giffre prennent en compte les reacutesultats du marquage mais eacutegalement la situation actuelle de la riviegravere suite agrave lrsquoeacuteboulement de Sixt Fer agrave Cheval

Ne pas aleviner le cours principal du Giffre en alevins de fario pendant 5 anneacutees conseacutecutives Cette proposition est motiveacutee par les raisons suivantes

- Il est impossible de savoir comment va eacutevoluer dans les prochains mois et les prochaines anneacutees le glissement agrave lrsquoamont de Sixt Il semble donc risqueacute drsquoentreprendre un alevinage pour installer une nouvelle population

- Les reacutesultats des marquages sur le Giffre sont tregraves contrasteacutes Sauf au niveau de Sixt ils montrent qursquoil existait avant le glissement une reproduction naturelle importante et capable de soutenir une population

- Les reacutesultats geacuteneacutetiques reacutecents indiquent que les populations en place sont en majoriteacute drsquoorigine atlantique mais qursquoil existe encore des individus meacutediterraneacuteens non hybrideacutes jusque dans les zones amont Ces reacutesultats prouvent qursquohistoriquement la souche meacutediterraneacuteenne eacutetait bien preacutesente sur lrsquoensemble du Giffre

- Il est envisageable que cette souche sauvage eacutegalement preacutesente sur les parties basses des affluents recolonise naturellement le Giffre

- Lrsquoexemple du Borne montre qursquoapregraves une catastrophe la riviegravere a eacuteteacute recoloniseacutee par une souche sauvage malgreacute des alevinages massifs Les reacutesultats obtenus sur cette riviegravere doivent servir de base de reacuteflexions pour la nouvelle gestion agrave entreprendre sur le Giffre

- Entre le Risse et Marignier la population de truites avant le glissement eacutetait deacutejagrave totalement deacuteseacutequilibreacutee et en quasi disparition (peu de juveacuteniles quasi absence de geacuteniteurs et absence de classes drsquoacircges intermeacutediaires) malgreacute les alevinages massifs sur ce secteur

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Reacutealiser un bilan de lrsquoimpact du glissement de terrain sur le peuplement piscicole

- Une eacutetude piscicole sera reacutealiseacutee tregraves prochainement (2004 ou 2005) sur le Giffre dans le cadre du contrat de riviegravere Cette eacutetude permettra de faire un premiereacutetat des lieux complet du peuplement piscicole suite au glissement

Accomplir un diagnostic de lrsquoeacutetat de recolonisation du Giffre par les populations naturelles

- En lrsquoabsence drsquoalevinage il sera possible de reacutealiser en 2008 un bilan des populations de truites installeacutees sur le Giffre

- A partir de lrsquoeacutetat de la population agrave cette eacutepoque un plan drsquoalevinage coheacuterent en truite fario pourra ecirctre eacutetabli pour permettre drsquoinstaller de nouvelles populations ou de soutenir des populations preacutesentes

Mettre en place des deacuteversements de truites Arc en Ciel pendant toute la peacuteriode drsquoarrecirct de lrsquoalevinage en fario Attention prendre des preacutecautions aupregraves des fournisseurs concernant la qualiteacute sanitaire des poissons

Reacuteintroduire lrsquoOmbre commun sur la plaine de Samoeumlns et agrave lrsquoaval de la confluence avec le Risse

Arrecirct de lrsquoalevinage sur lrsquoensemble du Risse sur lrsquoaval du Foron de Mieussy et sur lrsquoEtroit Denteacutee

- Sur ces riviegraveres le suivi du marquage a montreacute que lrsquoalevinage nrsquoeacutetait pas neacutecessaire pour soutenir les populations de truites preacutesentes

Maintenir lrsquoalevinage sur lrsquoamont du Foron de Mieussy (vers Sommand) et lrsquoamont du Foron de Taninges (Bonnavaz)

- Sur ces secteurs le suivi du marquage a montreacute que les juveacuteniles preacutesents dans le milieu naturel eacutetaient en majoriteacute des individus introduits

33 Le Foron du Reposoir

Les propositions de gestion sur le Foron du Reposoir sont

Maintenir les alevinages actuels avec la souche Chazey Bons Rhodanienne

Suivre lrsquoeacutevolution de la population pour savoir si cet alevinage permet drsquoinstaller une population fonctionnelle

- Ce suivi peut comprendre des pecircches de sondages en deacutebut de peacuteriode de reproduction pour voir si les poissons adultes deviennent matures des releveacutes de frayegraveres sur la riviegravere pour savoir si les poissons se reproduisent et de nouveaux preacutelegravevements de poissons pour suivre lrsquoeacutevolution du taux de marqueacutes dans la population

34 Bassin de la Filliegravere

Les orientations pour une gestion coheacuterente des populations de la Filliegravere sont les suivantes

40

Arrecirct de lrsquoalevinage sur le cours principal de la Filliegravere sur le Crenant et sur lrsquoaval du Flan

- Sur ces 3 riviegraveres lrsquoalevinage nrsquoest pas neacutecessaire car il ne permet pas de soutenir les populations preacutesentes et de plus la reproduction naturelle est tregraves importante

- Sur la Filliegravere les pecircches drsquoadultes dans le cadre du programme INTERREG ont mis en eacutevidence la preacutesence drsquoune population sauvage drsquoorigine meacutediterraneacuteenne Il semble important drsquoentreprendre une mesure de conservation de cette souche en arrecirctant lrsquoalevinage pour eacuteviter lrsquohybridation

- Sur lrsquoamont du Flan il est neacutecessaire de continuer le suivi des poissons marqueacutes pour savoir si lrsquoalevinage doit ecirctre maintenu

Sur le Daudens deux sceacutenarii de gestion peuvent ecirctre envisageacutes selon la volonteacute politique des gestionnaires directs

Sceacutenario ndeg1 vision patrimoniale- Arrecirct du repeuplement en truite drsquoorigine Atlantique pendant 3 anneacutees

conseacutecutives pour diminuer leur preacutesence sur le bassin- Commencer les proceacutedures afin de rendre le seuil du Plot

franchissable pour les geacuteniteurs de la Filliegravere- Reacutealiser un bilan notamment deacutemographique de la population en place

apregraves lrsquoarrecirct de lrsquoalevinage- Puis reprise de lrsquoalevinage pendant uniquement 3 anneacutees agrave partir de

poissons sauvages issus de la Filliegravere pour essayer drsquoinstaller une population naturelle

Sceacutenario ndeg2 vision halieutique- Maintien des pratiques drsquoalevinage en atlantique pour soutenir

artificiellement le stock de poissons dans un inteacuterecirct uniquement halieutique Attention cette pratique risque de provoquer par deacutevalaison des individus introduits une hybridation des poissons sauvages preacutesents dans la Filliegravere

35 Le Foron de Fillinges

Les reacutesultats obtenus sur le Foron de Fillinges ont conduit agrave formuler les propositions de gestion suivantes

Arrecirct de lrsquoalevinage sur lrsquoensemble du Foron de Fillinges- Quelque soit la souche utiliseacutee et les quantiteacutes introduites les poissons

alevineacutes ne repreacutesentent qursquoune tregraves faible minoriteacute des poissons preacutesents dans le milieu Le Foron abrite une population naturelle fonctionnelle et eacutequilibreacutee

Suivi de la population suite agrave lrsquoarrecirct du repeuplement- Reacutealisation de 5 stations de pecircches eacutelectriques la derniegravere anneacutee de

lrsquoalevinage afin de reacutealiser un eacutetat des lieux preacutecis de la population de truites et du peuplement piscicole

- Reacutealisation drsquoun nouveau bilan de la population du Foron respectivement 3 ans puis 6 ans apregraves lrsquoarrecirct de lrsquoalevinage

41

4 Investigations suppleacutementaires

Suite aux premiers reacutesultats obtenus lors de la campagne 2002 des investigations suppleacutementaires permettant de preacuteciser certains points seront reacutealiseacutees

Reacutealiser une analyse bacteacuteriologique des diffeacuterents lots de poissons alevineacutes qui ont transiteacutes dans les piscicultures associatives Cette recherche de pathologie permettra de savoir si les poissons issus de pisciculture sont porteurs drsquoune maladie bacteacuterienne avant drsquoecirctre introduits dans le milieu ou si ils contractent la maladie dans le milieu naturel

Rechercher les raisons pour lesquelles on nrsquoobserve pas drsquoalevins naturels sur certains secteurs Les causes drsquoune telle situation peuvent ecirctre

- Lrsquoabsence totale de geacuteniteurs dans la population Les poissons nrsquoont pas le temps de devenir adulte (3+) et sont captureacutes avant par les pecirccheurs

- La preacutesence drsquoadultes non matures Les poissons deviennent adultes mais sont immatures (eacutetat sanitaire des poissons souche geacuteneacutetiquement deacutegeacuteneacutereacutee)

- Survie nulle durant la phase de vie sous graviers Les poissons pondent mais les œufs nrsquoarrivent pas agrave se deacutevelopper et la mortaliteacute est totale

Sur les secteurs du Chinaillon de la Duche de lrsquoOveacuteran amont et du Foron de Mieussy amont (Sommand) les actions suivantes peuvent ecirctre entreprises

- Pecircches eacutelectriques de sondage en deacutebut de la peacuteriode de reproduction pour savoir si les poissons deviennent matures

- Releveacutes de frayegraveres permettant drsquoobserver ou non une activiteacute de reproduction- Mise en place drsquoincubateurs-tests contenant des œufs de truites pour connaicirctre le taux

de survie des œufs dans les frayegraveres

Reacutealiser des preacutelegravevements suppleacutementaires aux classes drsquoacircge supeacuterieures (1+ et 2+) sur certaines stations pour voir lrsquoeacutevolution du taux de marqueacutes au cours des anneacutees Ces recherches suppleacutementaires peuvent ecirctre effectueacutees sur 8 cours drsquoeau ougrave le taux de marqueacutes deacutepasse 60 au stade 0+

Le ruisseau de la Duche amontLe ruisseau du Chinaillon amontLe Foron du ReposoirLe Risse avalLe Foron de Taninges amont (Bonnavaz)Le Foron de Mieussy amont (Sommand)Le Daudens amont et avalLe Flan amont

Dans les eacutetudes preacuteceacutedentes reacutealiseacutees sur le Fier (CAUDRON et CHAMPIGNEULLE 2002) et sur le Doubs (CHAMPIGNEULLE et al 2002) les taux de marqueacutes aux stades 1+ et 2+ dans la population en place srsquoeffondraient et devenaient tregraves faibles ou nuls

Pour informations le graphique suivant montre lrsquoeacutevolution du taux de marqueacutes agrave diffeacuterents stades sur les stations ougrave le taux de 0+ marqueacutes eacutetait eacuteleveacute

42

Les reacutesultats montrent agrave part pour une station une chute importante des taux de marqueacutes entre les stades 0+ et 1+ Cette chute se poursuit eacutegalement au stade 2+Ces reacutesultats obtenus sur le Fier et le Doubs semblent laisser peu drsquoespoirs sur le devenir des poissons marqueacutes sur les bassins eacutetudieacutes en 2002

Reacutesultats sur leacutevolution du taux de m arqueacutes aux diffeacuterents stades obtenus lors des eacutetudes preacuteceacutedentes sur le Fier et le Doubs

0102030405060708090

100

0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 0+ 1+ 0+ 1+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+

Station A Station B Station C StationD

StationE

StationF

Station A Station B StationC

Stations et stades

Pou

rcen

tage

de

mar

queacutes

Le Fier Le Doubs

Reacutesultats sur leacutevolution du taux de m arqueacutes aux diffeacuterents stades obtenus lors des eacutetudes preacuteceacutedentes sur le Fier et le Doubs

0102030405060708090

100

0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 0+ 1+ 0+ 1+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+

Station A Station B Station C StationD

StationE

StationF

Station A Station B StationC

Stations et stades

Pou

rcen

tage

de

mar

queacutes

Le Fier Le Doubs

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5

Enfin une autre opportuniteacute drsquoeacutechantillonnage non preacutevisible mais utilisable est la reacutecupeacuteration de truites mortes suite agrave des pollutions

Deux types drsquoeacutechantillonnages principaux seront donc pratiqueacutes au stade 0+ dans la population en place et au stade adulte (agrave partir de 2+) dans la pecircche

15Reacutecolte et analyses des donneacutees en laboratoire

151 Caracteacuteristiques morphologiques et morphomegravetriques

Tous les juveacuteniles sont conserveacutes au congeacutelateur agrave ndash18degC Apregraves deacutecongeacutelation leur longueur totale est mesureacutee (au mm pregraves) ainsi que la longueur maximale de la pectorale gauche (agrave 01mm pregraves) La truite est peseacutee agrave 01g pregraves

Des preacutelegravevements drsquoeacutecailles sont reacutealiseacutes pour deacuteterminer lrsquoacircge de chaque individu Les lectures drsquoeacutecailles preacutealables permettent de seacutelectionner les individus faisant partie des cohortes susceptibles drsquoecirctre marqueacutees

La robe de la truite est observeacutee permettant de classer les truites selon leur pheacutenotype (type atlantique ou meacutediterraneacuteen)

La truite est ensuite disseacutequeacutee pour deacuteterminer le sexe Lrsquoeacutetat de maturiteacute sexuelle est eacutegalement noteacute

Lrsquoadipeuse est preacuteleveacutee et conserveacutee dans de lrsquoalcool absolu en tube laquo Eppendorf raquo de 15 ml pour des analyses geacuteneacutetiques

Des observations sont faites concernant lrsquoeacutetat sanitaire global apparent du poisson (preacutesence drsquoheacutemorragies visible exteacuterieurement gonflement des reins colorationhellip)

Mesure du poisson Peseacutee du poisson

6

Prise drsquoeacutecailles et lecture immeacutediate pour veacuterification de lrsquoacircge ici 0+

Deacutetermination du pheacutenotype Meacuted (haut) Atl (bas) Observation du sexe et de la maturiteacute sexuelle

Le coefficient de condition est calculeacute dapregraves la formule suivante K = (P100) (Lt10)3

K = coefficient de conditionP = poids en grammesLt = longueur totale du poisson en mm

De mecircme la longueur relative ((longueur de la nageoirelongueur totale du corps)100) des nageoires pectorales a eacuteteacute calculeacutee (BOSAKOWSKI et al 1993)

Ces renseignements notamment les caracteacuteristiques morphologiques permettent de reacutealiser des analyses comparatives entre poissons sauvages et introduits

Pour chaque poisson seacutelectionneacute il faut ensuite proceacuteder agrave lrsquoextraction la preacuteparation et lrsquoexamen des otolithes

152 Preacutesentation des otolithes

Les otolithes sont des piegraveces calcifieacutees preacutesentes dans loreille interne des poissons Ils se forment degraves le stade embryonnaire et suivent laccroissement de la truite Leur rocircle essentiel se situe au niveau du maintien de leacutequilibre du poisson

Il existe trois paires dotolithes dont la forme et la taille sont caracteacuteristiques dune espegravece

Les sagittaeIls sont logeacutes dans la partie ventro-posteacuterieure de la capsule auditive Des trois paires dotolithes les sagittae sont les plus utiliseacutes pour le fluoromarquage de masse comme dans la preacutesente eacutetude mais aussi pour des estimations de lacircge et de laccroissement des poissons Ceci se justifie par leur taille ce sont en effet les plus volumineux leur extraction sen trouve donc faciliteacutee

Les asterisciIls sont situeacutes agrave larriegravere des sagittae Comme ces derniers ils sont impliqueacutes dans la reacuteception des sons (PANFILI et al 2002)

Les lapilli

7

Ils se situent dans la zone anteacutero-dorsale de la capsule auditive et interviennent dans le maintien des postures et de leacutequilibre des poissons

Les sagittae plus volumineux et plus faciles agrave preacutelever ont donc eacuteteacute utiliseacutes pour mener agrave bien cette eacutetude

Lotolithe croit par apposition dun nouveau mateacuteriel sur sa surface Ce pheacutenomegravene cyclique fonction du meacutetabolisme du calcium et de la synthegravese des acides amineacutes conduit agrave la formation danneaux saisonniersLors du marquage agrave lalizarine Red S les truites ne sont acircgeacutees que de quelques semaines et de ce fait les otolithes sont de tregraves petite taille Le fluorochrome se fixe sur les structures en voie de mineacuteralisation (os dents cartilages calcifieacutes otolithes) Leur calcification se poursuit naturellement avec la croissance du poisson et ainsi seule la partie centrale de lotolithe correspondant agrave sa taille lors de la coloration est marqueacutee

Lalizarine Red S absorbe les rayons UV et eacutemet une fluorescence dans le spectre visible Cette proprieacuteteacute est utiliseacutee pour le repeacuterage du marqueur avec un microscope eacutequipeacute pour leacutepifluorescence

yeux

otolithes

cerveau

yeux

otolithes

cerveau

Photo et scheacutema de localisation des otolithes et du marquage

153 Extraction et lecture des otolithes

Les diffeacuterentes phases permettant la lecture des otolithes sont

Deacutecoupe et enlegravevement avec des ciseaux de la moitieacute infeacuterieure de la tecircte au-preacutealablement partiellement deacutecongeleacutee

Deacutecoupage en deux (plan sagittal) de la moitieacute supeacuterieure de la tecircte en faisant entrer la pointe infeacuterieure du ciseau dans le passage de la moelle eacutepiniegravere (canal rachidien) Ce mode de deacutecoupe seacutepare et sectionne les capsules olfactives contenant les sagittae qui apregraves que le cerveau a eacuteteacute enleveacute sont alors directement accessibles avec des pinces fines dans chaque demi-section de la partie supeacuterieure de la tecircte

Extraction des sagittae agrave lrsquoaide de pinces fines Apregraves avoir enleveacute les matiegraveres organiques reacutesiduelles sur un papier absorbant les otolithes sont placeacutes dans untube Eppendorf et stockeacutes agrave lrsquoabri de la lumiegravere

8

Collage de chaque otolithe (face convexe vers lrsquoexteacuterieur) sur une lame de verre mince agrave lrsquoaide drsquoune thermocolle (colle Crystalbonb Aremco ndeg 509) chauffeacutee agrave 120 degC Durant cette eacutetape il est important drsquoenlever les bulles drsquoair existantes celles-ci pouvant eacutemettre une fluororescence parasite

Polissage des otolithes sur des plaques de papiers abrasifs de granulomeacutetrie diffeacuterente (Escil PSA G 400 G 800 et G 1200) Lrsquoeacutevolution du polissage est suivi par plusieurs controcircles sous microscope afin drsquoatteindre et de ne pas deacutepasser le centre de lrsquootolithe

Lecture de lrsquootolithe sous un microscope eacutequipeacute pour lrsquoeacutepifluorescence car lrsquoARS est deacutetectable par la fluorescence qursquoil eacutemet lorsquil est irradieacute en lumiegravere ultraviolette La lecture est faite le jour mecircme du polissage car la lisibiliteacute de la marque diminue avec le temps impliquant alors la neacutecessiteacute drsquoun leacuteger repolissage

Lorsque lrsquootolithe a eacuteteacute marqueacute celui-ci montre en son centre un anneau ou un noyau (selon la preacutecociteacute du marquage etou positionnement du plan de polissage par rapport au nucleacuteus) apparaissant rouge fluorescent (jeu de filtres Zeiss ndeg15 BP 54612 FT 580 LP 590 ) ou jaune orangeacute (jeu de filtres Zeiss ndeg9 BP 450-490 FT 510 LP 520)

Lorsque lrsquootolithe a eacuteteacute marqueacute celui-ci montre en son centre un anneau fluorescent jaune orangeacute ou rouge fluorescent selon le filtre utiliseacute

Enlegravevement de la moitieacute infeacuterieure de la tecircte agrave lrsquoaide de ciseaux

Emplacement de lotolitheEmplacement de lotolithe

Tecircte apregraves dissection Localisation de lrsquootolithe

9

Extraction de lrsquootolithe Otolithes colleacutes sur lame mince Ponccedilage de lrsquootolithe

Observation de la lame mince au microscope

05mm 05mmVue au microscope drsquoun otolithe ponceacute Otolithe marqueacute (anneau fluo vert-jaune)

16Symptocircmes pathologiques observeacutes

161 La maladie reacutenale prolifeacuterative (MRP ou PKD ou teacutetracapsulose)

Selon ESCHER et al (Fischnetz-info mars et deacutecembre 2001) cette maladie est provoqueacutee par un seul parasite Tetracapsula bryosalmonae (myxosoaire) Chez les poissons on le rencontre chez les salmonideacutes et le brochet les truites eacutetant particuliegraverement toucheacutees Le taux de mortaliteacute peut ecirctre fort chez ces derniegraveres (10 agrave 100) surtout sur les estivaux

Pour que les symptocircmes (affaiblissement contraction dautres maladies) se deacuteveloppent la tempeacuterature de leau doit ecirctre supeacuterieure agrave 15degC De plus il semble que des facteurs tels quun faible taux doxygeacutenation ou une pollution chimique favoriseraient la maladie

10

Afin de savoir si la truite en preacutesence est infecteacutee il faut observer ses reins En effet un poisson ayant deacuteveloppeacute la maladie a des reins grossis et dune coloration inhabituelle

Le mode de propagation de la maladie et le cycle complet du parasite ne sont que partiellement connus Tetracapsula parasite les bryozoaires de petits organismes filtreurs qui forment des colonies de quelques centimegravetres de diamegravetre sur diffeacuterents types de substrats et que lon rencontre dans la plupart des lacs et cours deau

Les parasites se multiplient dans les bryozoaires ils ont alors une taille de 20 μm et se concentrent dans des sortes de grandes poches de 350 μm de diamegravetre Le parasite peacutenegravetre dans le poisson sous forme de petites spores agrave travers les cellules du mucilage de la peau et ce au cours de la premiegravere minute apregraves lentreacutee en contact avec lagent pathogegravene A laide de la circulation sanguine les parasites atteignent les reins ougrave ils forment diffeacuterents stades de deacuteveloppement et provoquent de violentes reacuteactions inflammatoires Il en reacutesulte les diffeacuterentssymptocircmes deacutecrits preacuteceacutedemment

Le parasite drsquoun diamegravetre de 5 agrave 20 microm a pu ecirctre observeacute dans les vaisseaux sanguins de presque tous les organes (sauf du cerveau de la moelle eacutepiniegravere et des yeux) Les spores sont libeacutereacutees dans lrsquoeau avec lrsquourine du poisson et sont probablement absorbeacutees de nouveau par les bryozoaires

Les truites qui survivent ou qui ont deacutejagrave eacuteteacute infecteacutees sans deacutevelopper la maladie sont en geacuteneacuteral immuniseacutees lanneacutee suivante

Poisson atteint pas la PKD (reins gonfleacutes et preacutesence de nodules)

La PKD provoque chez les jeunes truites une mortaliteacute variant de 10 agrave 100 des individus toucheacutesLe deacuteveloppement du parasite est favoriseacute en eacuteteacute lorsque la tempeacuterature de lrsquoeau atteint 15degC

162 Pathologies bacteacuteriennes

Des symptocircmes probablement dus agrave une pathologie bacteacuterienne ont eacuteteacute mis en eacutevidence lors de cette eacutetude En effet un pourcentage non neacutegligeable de truites eacutetait affecteacute par des rougeurs de type heacutemorragie agrave la base des nageoires

11

Selon MORAND (com pers) deux maladies bacteacuteriennes peuvent engendrer ces symptocircmes (la furonculose et la yerciniose) Ces deux maladies sont preacutesentes dans le monde entier et atteignent tout particuliegraverement les eacutelevages de salmonideacutes

Elles peuvent ecirctre favoriseacutees par des conditions particuliegraveres du milieu environnant tempeacuterature de leau eacuteleveacutee (supeacuterieure agrave 10 degC) une charge organique importante ou encore une pollution diminuant les deacutefenses immunitaires du poissonhellip

Selon la graviteacute de laffection ces pathologies peuvent entraicircner de lourds taux de mortaliteacute atteignant jusquagrave 70 dans certains cas (MOURRIERAS 1995)

Les heacutemorragies observeacutees agrave la base des nageoires sont la conseacutequence drsquoune infection bacteacuterienne pouvant provoquer drsquoimportantes mortaliteacutes

17Utilisation du SIG de la Feacutedeacuteration de pecircche de Haute-Savoie

Les donneacutees du programme pilote de marquage et du programme INTERREG sont inteacutegreacutees dans un SIG (Systegraveme dInformation Geacuteographique MapInfo) mis en place agrave la Feacutedeacuteration de pecircche de Haute-Savoie et agrave lINRA de Thonon

Ainsi toutes les informations relatives aux cours deau du deacutepartement seront consigneacutees dans cette base de donneacutees (pente longueur preacutesence de seuils infranchissables caracteacuteristiques physico-chimiques IBGN hydrologie occupation des bassins versantshellip) Il en sera de mecircme pour les donneacutees truites (repeuplement densiteacute biomasses croissance structure dacircge pathologie geacuteneacutetiquehellip)

Lapproche finale visera agrave rechercher les relations existant entre ces deux groupes de donneacutees spatialiseacutees Une toute premiegravere deacutemarche a eacuteteacute partiellement tenteacutee dans le cas du preacutesent rapport dont les donneacutees ont eacuteteacute inteacutegreacutees dans le SIG en cours de construction

12

2 Reacutesultats et discussions

Ce chapitre preacutesente les reacutesultats obtenus sur les bassins eacutetudieacutes lors de la campagne de preacutelegravevements 2002 agrave savoir

Le GiffreLe BorneLa FilliegravereLe Foron de ScionsiezLe Foron de Fillinges

Lors de la campagne 2002 1703 poissons au stade 0+ ont eacuteteacute eacutechantillonneacutes en milieu naturel et eacutetudieacutes en laboratoire

21Taux de marquage sexe ratio et pathologie

211 Le Borne

Sur le bassin du Borne 5 stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal et 3 sur des affluents Au total ce sont 392 poissons 0+ qui ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

Sur le cours principal

Les taux de marqueacutes varient fortement sur le cours principal du Borne (18 agrave 100) On observe un gradient amont-aval du taux de marqueacutes qui peut ecirctre mis en relation avec la preacutesence drsquoun obstacle partiellement infranchissable pour les geacuteniteurs au niveau drsquoEntremont

Ainsi deux grandes zones peuvent ecirctre distingueacutees sur le Borne

La zone amont du seuil drsquoEntremont ougrave la majoriteacute des juveacuteniles sont issus du repeuplement (90 agrave 100)

On observe sur ce secteur une tregraves faible reproduction naturelle en raison drsquoune quasi-absence de poissons adultes La situation de la population de truites est donc tregraves critique Si le repeuplement permet de drsquoobserver des 0+ il nrsquoa pas permis drsquoinstaller une population fonctionnelle

La zone aval du seuil drsquoEntremont ougrave la majoriteacute des individus preacutesents au stade 0+ sont des poissons naturels

En effet le taux de marqueacutes varie de 18 agrave 49 Les pecircches de sondage Interreg ont montreacute la preacutesence drsquoune importante population de truites sauvages drsquoorigine meacutediterraneacuteenne La population est eacutequilibreacutee et naturellement fonctionnelle puisqursquoon observe une forte reproduction naturelle et de nombreux geacuteniteurs

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Sur les Affluents

Sur les 3 affluents eacutetudieacutes la situation est tregraves simple En effet soit on observe 0 de marqueacutes soit 100

- Sur lrsquoOveacuteran aval aucun poisson marqueacute nrsquoa eacuteteacute trouveacute puisqursquoil nrsquoy a pas eu de repeuplement sur ce secteur en 2002 Le reacutesultat obtenu montre une importante reproduction naturelle des geacuteniteurs du Borne qui remontent sur lrsquoaval de ce cours drsquoeau

- Sur la Duche et le Chinaillon il y a absence totale de reproduction naturelle puisque 100 des 0+ eacutechantillonneacutes sont marqueacutes Pourtant on observe de nombreux poissons adultes sur ces secteurs susceptibles drsquoecirctre des geacuteniteurs ainsi que diffeacuterentes classes drsquoacircge Lrsquoeacutequilibre de ces populations est artificiellement maintenu par les alevinages

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

- Toutes les stations eacutetudieacutees ne sont pas concerneacutees par ces symptocircmes de maladies- Les maladies bacteacuteriennes semblent toucher majoritairement les poissons introduits- Cependant les 0+ de lrsquoOveacuteran aval tous naturels sont infecteacutes agrave 15 Ce reacutesultat

peut refleacuteter une contamination par deacutevalaison provenant drsquoindividus atteints situeacutes plus en amont de lrsquoOveacuteran ou une contamination naturelle par des agents pathogegravenes preacutesents dans le milieu

- Les poissons marqueacutes peuvent ecirctre contamineacutes agrave un taux non neacutegligeable pouvant atteindre plus de 30

Pourcentage dindividus preacutesentant des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

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Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Le sexe ratio est relativement eacutequilibreacute pour les marqueacutes comme pour les non marqueacutes Seule une station sur le Borne (Beffay) montre 85 de macircle dans la population de 0+

- Seules 2 stations montrent des macircles matures au stade 0+- Le pourcentage de macircles matures au stade 0+ est plus important chez les non

marqueacutes que chez les marqueacutes

Pourcentage de macircles au stade 0+

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Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Borne

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Pourcentage de macircles au stade 0+

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Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Borne

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

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212 Le Giffre

Sur le bassin du Giffre 6 stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal et 7 sur des affluents Au total ce sont 536 poissons 0+ qui ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

Sur le cours principal

La carte de synthegravese des reacutesultats met en eacutevidence des taux de marqueacutes tregraves contrasteacutes variant entre 0 et 100 Sauf deux cas particuliers la campagne de preacutelegravevements a permis de montrer qursquoune reproduction naturelle existait sur lrsquoensemble du Giffre

Il est possible de distinguer trois zones successives sur ce cours deau

La zone aval est composeacutee de la station Pont du Giffre ougrave le taux de marqueacutes est de 74 Cette station sur le Giffre doit ecirctre rapprocheacutee des stations eacutetudieacutees sur le Risse (station laquo Risse aval St Jeoire raquo) et le Hisson(laquo station La Pallud raquo) pour mieux comprendre le fonctionnement de la population

- Sur le Giffre aval la situation semble tregraves critique La station dite laquo Pont du Giffre raquosrsquoeacutetend de lrsquoamont de Marignier agrave lrsquousine du Pont du Giffre soit sur environ 25 km Sur cette distance seulement 31 0+ ont pu ecirctre captureacutes De plus les pecircches drsquoadultes dans le cadre drsquoInterreg montrent un deacuteficit inquieacutetant de geacuteniteurs sur ce secteur ainsi qursquoune surabondance de Chabot La situation du bas Giffre montre une population de truitetotalement deacuteseacutequilibreacutee loin du potentiel de la riviegravere et qui ne peut pas ecirctre reacutehabiliteacutee par le seul fait de lrsquoalevinage Cette situation peut ecirctre le reacutesultat du faible deacutebit reacuteserveacute qui appauvrit lrsquohabitat aquatique et provoque des eacuteleacutevations de tempeacuterature inquieacutetantes Les reacutesultats de pecircche drsquoinventaire dans la reacuteserve de Marignier montrent que les poissons sont concentreacutes agrave lrsquoaval immeacutediat des seuils ougrave lrsquoon note la preacutesence de fosses de tempeacuteratures plus faibles et drsquoune meilleure oxygeacutenation

La zone moyenne situeacutee entre le barrage de Mieussy et Samoeumlns qui est composeacutee des stations laquo aval barrage Taninges raquo laquo Theacuteziegraveres raquo et laquo Montessuit raquo Sur ce secteur les 0+ marqueacutes sont en minoriteacutes puisqursquoils repreacutesentent 11 agrave 38 du peuplement

- Sur le Giffre aval barrage de Taninges le secteur nrsquoest pas alevineacute il est donc normal que pregraves de 90 des poissons ne soient pas marqueacutes Les 0+ marqueacutes proviennent certainement du ruisseau de lrsquoEtroit Denteacute qui est fortement alevineacute et agrave partir duquel une deacutevalaison doit avoir lieu- Le secteur des laquo Theacuteziegraveres raquo et de laquo Montessuit raquo bien que reacuteguliegraverement alevineacute montre un taux important drsquoalevins naturels (62 agrave 77) Ce reacutesultat est tout agrave fait en accord avec le suivi de la reproduction naturelle et le recensement de frayegraveres reacutealiseacute par lrsquoAAPPMA du Faucigny et le CSP en 1999 En effet de nombreuses frayegraveres naturelles avaient eacuteteacute observeacutees sur ce site Le peuplement drsquoadultes nrsquoest pas tregraves important mais est en rapport avec les potentialiteacutes du milieu

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La zone amont caracteacuteriseacutee par les stations laquo Reveacute-Peacuteret raquo et laquo amont Tines raquo ougrave le taux de marqueacutes varie de 70 agrave 79

- Pour ces deux stations la population de juveacuteniles est faible et ils sont majoritairement marqueacutes Cependant au stade adulte les pecircches Interreg montrent une majoriteacute de poissons drsquoorigine meacutediterraneacuteenne La forte contribution de poissons introduits au stade 0+ ne semble pas se retrouver au stade adulte Les conditions de vie dans ce milieu sont tregraves difficiles et ne permettent pas drsquoatteindre des densiteacutes de poissons importantes

Sur les Affluents

Le Risse - Le Hisson montre une majoriteacute drsquoalevins naturels alors que les preacutelegravevements ont eacuteteacute reacutealiseacutes seulement deux mois apregraves le repeuplement Ce cours drsquoeau possegravede un fort potentiel de frai qui est utiliseacute notamment par les geacuteniteurs du Risse- Sur lrsquoaval du Risse le taux de marqueacutes est de 68 Il est le reflet drsquoun alevinage en quantiteacute importante sur le secteur (10 000 alevins) Les alevins naturels repreacutesentent tout de mecircme plus de 30 trois mois apregraves le repeuplement De plus les eacutechantillonnages drsquoadultes reacutealiseacutes sur ce secteur dans le cadre drsquoInterreg ont mis en eacutevidence une quantiteacute importante de geacuteniteurs sauvages La population sur ce secteur est agrave mettre en eacutevidence avec celle du Hisson puisque certains geacuteniteurs du Risse y migrent pour se reproduireLa population sur ce secteur est naturellement fonctionnelle

Le Foron de Mieussy - La station laquo Andelier raquo situeacutee en amont du Foron preacutesente 100 de marqueacutes Cette situation montre une absence totale de reproduction naturelle Le milieu est extrecircmement deacutefavorable agrave lrsquoinstallation drsquoune population fonctionnelle en raison du faible deacutebit de la riviegravere (assegravechement reacutegulier) Aucune classe drsquoacircge intermeacutediaire et aucun adulte nrsquoa eacuteteacute observeacute sur ce secteur Les poissons alevineacutes sont certainement victimes des assegravechements- La station laquo Trebiet raquo situeacutee plus en aval preacutesente au contraire 0 de marqueacutes alors que cette zone a eacuteteacute alevineacutee Ce reacutesultat montre la capaciteacute du Foron sur ce secteur a accueillir une population fonctionnelle Il existe une reproduction naturelle importante sur cette zone avec eacutegalement beaucoup de geacuteniteurs- Vers Sommand une pecircche de sondage a eacuteteacute reacutealiseacutee mais aucun alevin nrsquoa eacuteteacute preacuteleveacute puisque cette zone nrsquoa pas eacuteteacute alevineacutee en 2002 Cependant les reacutesultats de ce sondage mettent en eacutevidence une absence totale de reproduction naturelle (aucun alevin naturel nrsquoa eacuteteacute trouveacute) alors que la population semble eacutequilibreacutee (preacutesence drsquoadultes et de truitelles drsquoacircge intermeacutediaire)

LrsquoEtroit Denteacute Globalement le taux de marqueacutes sur les deux stations eacutetudieacutees est faible (11 agrave 33)- Sur la station laquo aval route raquo la majoriteacute des alevins est naturelle Cette zone montre un habitat tregraves favorable pour la reproduction des geacuteniteurs qui remontent du Giffre- Sur la station laquo amont route raquo une population fonctionnelle de pheacutenotype meacutediterraneacuteen est installeacutee De nombreux geacuteniteurs sont preacutesents et le recrutement naturel est important

19

Le Foron de Taninges - En amont (station Bonnavaz) le taux de marqueacutes est tregraves important (95) Il existe donc une reproduction naturelle mais insuffisante pour permettre lrsquoinstallation drsquoune population et maintenir une activiteacute halieutique Les alevinages passeacutes nrsquoont pas permis drsquoinstaller une population fonctionnelle dans cette zone apicale- Plus en aval sur les zones non alevineacutees les pecircches eacutelectriques drsquoinventaire et de sondage reacutealiseacutees ont montreacute la preacutesence drsquoune population eacutequilibreacutee de pheacutenotype meacutediterraneacuteen avec une importante reproduction naturelle

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

Les principales remarques concernant les pathologies observeacutees sur le bassin du Giffre sont

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

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Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Giffre

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

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Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

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Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

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Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Giffre

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

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20

- La PKD est preacutesente sur le cours du Giffre mais uniquement agrave lrsquoaval du barrage de Taninges Cette situation est agrave mettre en relation avec le deacutebit reacuteserveacute insuffisant qui entraicircne une augmentation de tempeacuterature pendant la peacuteriode estivale

- Sur les affluents la PKD a eacuteteacute observeacutee sur les secteurs preacutesentant des faibles deacutebits estivaux (aval du Risse et Foron de Mieussy Andelier) qui sont certainement responsables drsquoune augmentation de tempeacuterature

- La PKD atteint agrave la fois les poissons introduits que les poissons naturels- Le pourcentage drsquoindividus toucheacutes par la PKD varie drsquoun site agrave lrsquoautre mais peut

atteindre une valeur importante avec 50 sur certain secteur- Les maladies bacteacuteriennes sont plus freacutequentes chez les individus marqueacutes Soit ces

poissons sont plus fragiles que les poissons naturels et contractent les maladies plus facilement soit les maladies sont contracteacutees en pisciculture pendant lrsquoeacutelevage

- Le pourcentage drsquoindividus toucheacutes par des symptocircmes bacteacuteriens nrsquoest pas neacutegligeable puisqursquoil peut atteindre 20

- Lrsquoensemble des stations eacutetudieacutees est toucheacute par des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes ce qui laisse penser que lrsquoensemble du bassin peut ecirctre atteint

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

Pourcentage de macircles au stade 0+

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Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Giffre

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

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Pourcentage de macircles au stade 0+

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

21

- Le sexe ratio apparaicirct globalement eacutequilibreacute sur lrsquoensemble des stations du Giffre- On observe des diffeacuterences entre les poissons introduits et les poissons naturels sur

seulement 3 stations Ces diffeacuterences sont en faveur des poissons marqueacutes qui montrent un pourcentage de macircles plus important

- Une maturiteacute sexuelle preacutecoce des macircles existe sur certaines stations quelle que soit lrsquoorigine des poissons

- Cette maturiteacute peut ecirctre importante et concerner jusqursquoagrave 20 des 0+

22

213 Le Foron du Reposoir

Deux stations (La Touviegravere et Le Reposoir) ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le Foron du Reposoir Seulement 15 0+ ont eacuteteacute eacutetudieacutes en raison principalement de la difficulteacute drsquoeacutechantillonner des poissons de petite taille (6-7 cm) sur ces milieux torrentiels

Le taux de marqueacutes

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23

- Sur les deux stations eacutetudieacutees le taux de marqueacutes est de 100 Lrsquoensemble des 0+ mecircme si le nombre est faible est donc issu de lrsquoalevinage Ce cours drsquoeau fait lrsquoobjet actuellement drsquoun essai drsquoimplantation drsquoune population agrave partir de la souche Chazey-Bons Rhodanienne Cette souche provient de geacuteniteurs de la riviegravere Furan (Ain) Des analyses geacuteneacutetiques reacutecentes reacutealiseacutees par analyse de microsatellites diagnostic de lrsquoADN ont montreacute que ces poissons ont un pourcentage dallegraveles meacutediterraneacuteens voisin de 65

Ce reacutesultat montre que le cours deau avait un niveau de population tregraves faible avant le repeuplement par la souche Chazey-Bons sauvagesDe plus les pecircches drsquoinventaires du CSP et les pecircches de sondage Interreg montrent qursquoune population de truites se met progressivement en place En effet on observe chaque anneacutee despoissons agrave des stades de plus avanceacutes et les captures par pecircche agrave la ligne commencent agrave ecirctre effectivesLes pecircches eacutelectriques reacutealiseacutees agrave lrsquoautomne 2002 indique que le stock de geacuteniteurs est en cours de reconstitution mais que les truites femelles nrsquoont pas encore atteint le stade geacuteniteurIl nrsquoest donc pas encore possible de dire si lrsquohabitat et la population du Foron du Reposoir sont propices agrave lrsquoinstallation drsquoune population naturellement fonctionnelle

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

Aucun symptocircme reacutenal et heacutemorragique nrsquoapparaicirct sur les 0+ eacutechantillonneacutes sur ce cours deau

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Le sexe ratio est eacutequilibreacute puisqursquoil varie de 50 agrave 60- Il nrsquoy a aucun macircle mature au stade 0+ dans les eacutechantillons preacuteleveacutes sur ce cours

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La Touviegravere Le Reposoir

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

24

214 La Filliegravere

Cinq stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal de la Filliegravere ainsi que sept stations sur les trois affluents principaux (Flan Creacutenant et Daudens) Au total 582 poissons 0+ ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

Sur le cours principal

Pour les 5 stations eacutetudieacutees sur le cours principal le taux de 0+ marqueacutes varie de 4 agrave 56 il est donc de tregraves faible agrave moyen et montre une forte reproduction naturelle sur toute la riviegravere Il y a un gradient amont-aval du taux de marqueacutes avec un pourcentage de poissons marqueacutes plus important en amont Cependant sur lrsquoensemble de la Filliegravere le recrutement naturel est dominant et constitue lrsquoessentiel de la population de truite

De plus les pecircches de sondages pour Interreg ont montreacute la preacutesence de nombreux drsquoadultes drsquoorigine naturelle meacutediterraneacuteenne Ceci confirme que la population de truite de la riviegravere principale est naturellement fonctionnelle

Sur les affluents

Les reacutesultats sont diffeacuterents selon que lrsquoaffluent est en connexion ou non avec la riviegravere principale

- Sur le Flan on observe en zone aval et meacutediane (stations laquo D 55 raquo et laquo Bruchon raquo) des taux de marqueacutes faibles (38 et 27) qui mettent en eacutevidence la preacutesence drsquoune forte reproduction naturelle notamment de poissons migrants de la Filliegravere Les releveacutes de frayegraveres reacutealiseacutes par lrsquoAAPPMA avaient deacutejagrave permis drsquoobserver de nombreuses frayegraveres naturelles sur ce secteurEn zone plus amont station laquo Molliet raquo le taux de marqueacutes est plus important (73) il met en eacutevidence la preacutesence drsquoun recrutement naturel mais qui reste au stade 0+ minoritaire par rapport aux individus introduits

- Sur le Daudens les deux stations (laquo Le Plot raquo et Daudens raquo) montrent des taux de marqueacutes importants (86 et 92) La reproduction naturelle est donc tregraves faible et la population de truite ne semble pas fonctionnelle Lrsquoobstacle agrave lrsquoaval de la route deacutepartementale semble preacutejudiciable car il ne permet pas aux geacuteniteurs de la Filliegravere de remonter sur le Daudens et drsquoinstaller une population fiable

- Sur le Crenant Les deux stations eacutechantillonneacutees (laquo aval raquo et Disonche raquo) ne sont pas situeacutees sur des zones alevineacutees en 2002 et il est normal de trouver 0 de marqueacutes Cependant ces reacutesultats montrent qursquoil y a une forte reproduction naturelle sur ce cours drsquoeau mecircme en zone amont et que la population semble naturellement fonctionnelle Les alevins introduits sur le Crenant ne semblent pas avoir deacutevaleacutes sur pour coloniser lrsquoaval du Crenant

25

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Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

- La PKD semble quasiment absente du bassin de la Filliegravere sauf preacutesence anecdotique uniquement chez les non marqueacutes sur une station (laquo Millard raquo)

- Les individus marqueacutes ne sont pas toucheacutes par la PKD- Les maladies bacteacuteriennes sont preacutesentes sur lrsquoensemble du bassin mais touchent en

prioriteacute et majoritairement les individus marqueacutes

Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

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27

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Sur lrsquoensemble des stations le sexe ratio est eacutequilibreacute il montre une plus grande variation chez les individus marqueacutes

- Des macircles matures au stade 0+ ont eacuteteacute observeacutes sur trois stations uniquement chez les individus naturels

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

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FilliegravereLe Flan Le Flan Le Flan Le

DaudensLe

DaudensLe

CrenantLe

Crenant

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

Pourcentage de macircles au stade 0+

0102030405060708090

Le J

ourd

il

Pis

cicu

lture

Milla

rd

Long

cham

ps

D55

Bruc

hon

Mol

liet

Le

Plo

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Dau

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Ava

l

Dis

onch

e

LaFilliegravere

LaFilliegravere

LaFilliegravere

LaFilliegravere

Le Flan Le Flan Le Flan LeDaudens

LeDaudens

LeCrenant

LeCrenant

Pourcentage de macircles matures au stade 0+

01020304050

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FilliegravereLa

FilliegravereLa

FilliegravereLa

FilliegravereLe Flan Le Flan Le Flan Le

DaudensLe

DaudensLe

CrenantLe

Crenant

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

28

215 Le Foron de Fillinges

Trois stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal du Foron de Fillinges agrave savoir de lrsquoamont vers lrsquoaval laquo Bovet ndash Boex raquo laquo Pont de Fillinges raquo et laquo Couvette raquo Au total 178 poissons 0+ ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

Leacutege

nde

Mar

queacutes

Non

mar

queacutes

X

d

rsquoindi

vidu

s m

arqu

eacutes

Sec

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en

2002

Loca

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des

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31

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Boex

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31

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Boex

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31

29

Sur les 3 stations eacutetudieacutees les taux de marqueacutes sont faibles agrave tregraves faibles- Sur la station laquo Bovet ndash Boex raquo le taux de marqueacutes est de seulement 31- A lrsquoaval sur les stations laquo Pont de Fillinges raquo et laquo Couvette raquo les taux de marqueacutes

sont respectivement de 0 et 2

Les reacutesultats indiquent la preacutesence drsquoune importante reproduction naturelle sur lrsquoensemble du Foron de Fillinges Quelque soit la souche utiliseacutee pour lrsquoalevinage atlantique dans le secteur Faucigny ou Meacutediterraneacuteenne Pont de Gys dans le secteur Chablais les poissons introduits restent minoritaires

Cette situation traduit la preacutesence drsquoune population bien installeacutee et fonctionnelle sur cette riviegravere

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

0102030405060708090

100

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Pourcentage dindividus preacutesentant des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

05

101520253035404550

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

0102030405060708090

100

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Pourcentage dindividus preacutesentant des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

05

101520253035404550

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

30

- Sur lrsquoensemble des stations des individus 0+ sont atteints par la PKD le pourcentage drsquoindividus malades peut atteindre 35

- Seuls les individus sauvages semblent toucheacutes par la PKD cependant le nombre drsquoindividus introduits est trop faible pour permettre une comparaison

- Toutes les stations sont eacutegalement toucheacutees par les maladies bacteacuteriennes avec des taux de contamination variant de 15 agrave 30

- Les maladies bacteacuteriennes touchent agrave la fois les individus introduits et les individus naturels

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Le sexe ratio apparaicirct eacutequilibreacute sur lrsquoensemble des stations- On observe des macircles matures degraves le stade 0+ sur lrsquoensemble des stations- Le taux de macircles matures au stade 0+ peut atteindre 15

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

Pourcentage de macircles au stade 0+

0

102030405060

708090

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Pourcentage de macircles matures au stade 0+

05

101520253035404550

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

Pourcentage de macircles au stade 0+

0

102030405060

708090

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Pourcentage de macircles matures au stade 0+

05

101520253035404550

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

31

22Caracteacuteristiques morphologiques

221 Longueur totale des individus

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Giffre

0

20

40

60

80

100

120

140Am

ont

Tine

s

Rev

eacute-Peacute

ret

Mon

tess

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Theacutez

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Aval

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Ande

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Treb

iet

La P

allu

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Aval

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LeGiffre

LeGiffre

LeGiffre

LeGiffre

LeGiffre

LeGiffre

Le FdeTaninges

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LEtroitDenteacute

Le F deMieussy

Le F deMieussy

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Le Risse

Long

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tota

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n m

m

Taille moyenne des 0+ sur le Borne

0

20

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120

140

GrandBornand

Les Etroits Entremont Beffay St Pierre en F

Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Chinaillon La Duche LOveacuteran

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Taille moyenne des 0+ sur la Filliegravere

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Giffre

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32

Sur la quasi-totaliteacute des stations eacutetudieacutees les individus marqueacutes preacutesentent une taillemoyenne supeacuterieure agrave celle des individus naturels Sur 18 stations ougrave les effectifs permettent des comparaisons statistiques la longueur totale des individus marqueacutes est significativement supeacuterieure agrave celle des truites sauvages pour 13 stations

Les 5 stations faisant exception sont laquo aval barrage Taninges raquo et laquo Pont du Giffre raquo sur le Giffre laquoAval St Jeoire raquo sur le Risse laquo Bonnavaz raquo sur le Foron de Taninges et laquo Couvette raquo sur le Foron de Fillinges Cependant sur ces stations les diffeacuterences ne sont pas significatives

Le fait que les marqueacutes aient une plus grande taille moyenne que les non marqueacutes au stade 0+ nrsquoimplique pas que cela soit systeacutematiquement le cas aux stades ulteacuterieurs En effet CAUDRON (1998) et CHAMPIGNEULLE et CACHERA (2003) ont montreacute respectivement sur le Doubs et le Fier que les diffeacuterences de tailles entre marqueacutes et non marqueacutes au stade 0+ sestompaient au stade 1+ et chez les adultes

Par ailleurs lrsquoexistence drsquoune plus grande taille au stade 0+ en automne pour les marqueacutes ne leur garantit pas un meilleur taux de seacutedentarisation En effet plusieurs eacutetudes dont celle de JONSSON et JONSSON (1993) indiquent que le taux de deacutevalaison peut ecirctre plus eacuteleveacute pour les individus agrave plus forte croissance au stade 0+ La deacutevalaison peut donc toucher preacutefeacuterentiellement les individus marqueacutes en raison de leur forte croissance

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Foron du Reposoir

0

20

40

60

80

100

120

140

La Touviegravere Le Reposoir

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Long

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Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Foron du Reposoir

0

20

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140

La Touviegravere Le Reposoir

F du Reposoir F du Reposoir

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Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

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m

33

222 Taille des nageoires pectorales

La figure ci-dessus montre qursquoil existe une diffeacuterence entre marqueacutes et non marqueacutes du rapport entre la longueur de la nageoire pectorale et la longueur totale du poisson

Il a sembleacute important drsquoanalyser plus en deacutetail ce caractegravere morphologique car il peut preacutesager de lrsquoaptitude des truites agrave se maintenir dans nos riviegraveres de montagne

Relation entre la longueur de la nageoire pectorale et la longueur totale des individus marqueacutes et non marqueacutes

5

7

9

11

13

15

17

19

21

23

25

27

30 50 70 90 110 130 150 170Longueur totale en mm

Long

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le e

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mMarqueacuteNon marqueacute

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron du Reposoir

12

14

16

18

20

La Touviegravere Le Reposoir

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Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron de Fillinges

12

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20

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron du Reposoir

12

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La Touviegravere Le Reposoir

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Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron de Fillinges

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Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

34

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Giffre

12

14

16

18

20

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Taille relative moyenne des pectorales sur la Filliegravere

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Taille relative moyenne des pectorales sur le Borne

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Les Etroits Entremont Beffay St Pierre en F

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Giffre

12

14

16

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20

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Le F deMieussy

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Taille relative moyenne des pectorales sur la Filliegravere

12

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Le J

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Taille relative moyenne des pectorales sur le Borne

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GrandBornand

Les Etroits Entremont Beffay St Pierre en F

Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Chinaillon La Duche LOveacuteran

35

Sur les 24 stations ougrave des individus marqueacutes et non marqueacutes coexistent la taille relative des nageoires pectorales est systeacutematiquement plus importante chez les individus naturelsLes truites issues du repeuplement preacutesentent donc des nageoires pectorales de longueur infeacuterieure agrave celle des truites sauvagesCette diffeacuterence morphologique est tregraves importante car le deacuteveloppement des nageoires est un eacuteleacutement deacuteterminant pour la survie du poisson dans son milieu notamment pour la stabiliteacute la reacutesistance au courant et la recherche de nourriture an action de chasse

Il semble donc possible que cette caracteacuteristique anatomique soit le reacutesultat drsquoune adaptation agrave la vie en torrent

BOSAKOWSKI et al (1993) ont eacutegalement observeacutes des reacutesultats comparables chez des truites arc-en-ciel et des truites brunes de plus grande taille entre poissons drsquoeacutelevage et poissons sauvages Dans cette eacutetude les poissons deacutelevage preacutesentaient des nageoires nettement plus courtes (10-50) que les poissons sauvages Selon les auteurs cette diffeacuterence semblait ecirctre causeacutee par les conditions de vie des poissons dans les bassins des piscicultures(agression intraspeacutecifique stress qualiteacute de leau et densiteacutes de poissons) qui provoquaient une eacuterosion des nageoires

Dans le cas preacutesent les poissons de repeuplement ont eacuteteacute introduits agrave des stades preacutecoces dans le milieu et ont eacuteteacute preacuteleveacutes 4 agrave 5 mois apregraves leur introduction En conseacutequence ils ont veacutecu peu de temps en pisciculture et ont par contre passeacute lessentiel de leur vie dans le mecircme milieu naturel que les poissons sauvages Ainsi il semble que ce dimorphisme de la nageoire entre poissons sauvages et introduits soit drsquoorigine geacuteneacutetique Une eacutetude de RIDDELL et al (1981) a montreacute chez le saumon que les diffeacuterences de deacuteveloppement de nageoires eacutetaient une adaptation des poissons agrave leur milieu qui preacutesentait une origine geacuteneacutetiqueIl est donc tout agrave fait probable qursquoun pheacutenomegravene similaire se rencontre chez la truite fario et que les truites sauvages soient mieux adapteacutees sur le plan morphologique (gracircce agrave des diffeacuterences geacuteneacutetiques) aux conditions du milieu que les poissons introduits mecircme agrave des stades preacutecoces

Outre lrsquoaspect purement geacuteneacutetique les facteurs environnants peuvent eacutegalement jouer un rocircle important En effet McLAUGHLIN et al (2002) ont montreacute que cette diffeacuterence au niveau des nageoires peut eacutegalement ecirctre due agrave des caracteacuteristiques du milieu environnant dans les premiegraveres semaines de vie des poissons En effet plusieurs lots drsquoune mecircme souche de saumon de fontaine soumis degraves lrsquoeacuteclosion agrave des conditions de vie diffeacuterentes montrent des diffeacuterences dans le deacuteveloppement des nageoires Ainsi degraves les premiegraveres semaines les poissons exposeacutes agrave un fort courant sont pourvus de nageoires plus longues

Il est donc possible que les alevins produits en pisciculture nrsquoeacutetant pas exposeacutes agrave des courants importants au cours de leurs premiegraveres semaines de vie deacuteveloppent des nageoires pectorales moins longues que les individus sauvages

Il y a probablement pour cette caracteacuteristique morphologique des interactions combinant geacuteneacutetique et conditions environnementales

Cette diffeacuterence morphologique peut eacutegalement avoir une importance dans la compeacutetition entre poissons sauvages et introduits notamment au stade juveacutenile En effet GIBSON (1973) a deacutemontreacute limportance des nageoires dans la compeacutetition interspeacutecifique

36

entre le saumon atlantique (Salmo salar L) et le saumon de fontaine (Salvenius fontinalis) deux poissons consommant la mecircme nourriture Le fait de posseacuteder des nageoires pectorales plus deacutevelopper permet au saumon atlantique de se maintenir dans les courants pour se nourrir tout en deacutepensant moins drsquoeacutenergie

Dans le cas des torrents haut-savoyards une compeacutetition intraspeacutecifique entre truites sauvages et introduites comparable agrave leacutetude de GIBSON peut se deacutevelopper La diffeacuterence morphologique entre les truites sauvages et issues du repeuplement peut donc avoir une influence lors de la compeacutetition entre ces deux types dindividus

37

3 Premiegraveres implications pour la gestion

En fonction des reacutesultats obtenus lors de la campagne de preacutelegravevements 2002 des orientations de gestion sont proposeacutees pour chaque riviegravere eacutetudieacutee Certaines propositions impliquent des changements relativement importants des pratiques actuelles de gestion

Lrsquoeacutetude de lrsquoefficaciteacute des repeuplements srsquoappuient sur une deacutemarche scientifique rigoureuse dans lrsquointeacuterecirct des gestionnaires directs (AAPPMA) puisqursquoelle permet agrave ces derniers de prendre des deacutecisions en srsquoappuyant sur des reacutesultats concrets et indiscutables Elle est conduite dans un souci drsquoeacutevaluer en toute objectiviteacute les pratiques drsquoalevinage dans le seul but drsquoameacuteliorer la gestion actuelle des populations et des milieux Concregravetement elle permet de connaicirctre rapidement les zones ougrave lrsquoalevinage en truite fario est inefficace et donc inutile et les zones ougrave celui-ci est efficace et donc neacutecessaire

En plus des reacutesultats obtenus gracircce aux marquages des juveacuteniles les propositions prennent en compte les premiers reacutesultats issus des pecircches de sondage drsquoadultes reacutealiseacutees pour le programme INTERREG (reacutedaction en cours) Lrsquointeacutegration des diffeacuterentes donneacutees (marquage juveacutenile + adultes) permet de faire des propositions coheacuterentes selon un diagnostic le plus complet possible de la population de truite preacutesente

31 Bassin du Borne

Sur les riviegraveres du bassin du Borne les orientations de gestion proposeacutees ci-apregraves restent conformes agrave celles deacutejagrave eacutevoqueacutes par CAUDRON et CHAMPIGNEULLE (2002)

Arrecirct du repeuplement selon les pratiques actuelles sur lrsquoensemble du cours principal Cette proposition est motiveacutee par deux principales raisons

- Lrsquoalevinage est inefficace agrave lrsquoamont du seuil drsquoEntremont car apregraves plus de 15 ans il nrsquoa pas permis drsquoinstaller une population en place eacutequilibreacutee

- Il semble impeacuteratif de preacuteserver lrsquoimportante population de truite sauvage preacutesente agrave lrsquoaval du seuil drsquoEntremont Les reacutesultats geacuteneacutetiques indiquent que la population preacutesente est une population sauvage qui nrsquoa pas eacuteteacuteimplanteacutee suite agrave lrsquoalevinage Elle preacutesente un degreacute de pureteacute geacuteneacutetique important Cette population repreacutesente un patrimoine unique dans le Faucigny Le but drsquoarrecircter les alevinages sur ce secteur est drsquoeacuteviter les hybridations qui peuvent entraicircner une perte de plasticiteacute geacuteneacutetique et une deacutegeacuteneacuterescence de la souche sauvage actuelle

Arrecirct du repeuplement sur lrsquoaval de lrsquoOveacuteran Ce secteur est utiliseacute comme zone de reproduction par les geacuteniteurs du Borne et la reproduction naturelle y est abondante Lrsquoalevinage nrsquoest donc pas neacutecessaire et risque comme sur le Borne de provoquer une hybridation de la population naturelle

Essayer drsquoinstaller une population naturelle agrave lrsquoamont du seuil drsquoEntremont par transferts de geacuteniteurs

Sur les autres affluents deux sceacutenarii de gestion peuvent ecirctre envisageacutes selon la volonteacute politique des gestionnaires directs

Sceacutenario ndeg1 vision patrimoniale

38

- Arrecirct du repeuplement en truite drsquoorigine Atlantique pendant 3 anneacutees conseacutecutives pour diminuer leur preacutesence sur le bassin

- Puis reprise de lrsquoalevinage pendant uniquement 3 anneacutees agrave partir de poissons sauvages issus du Borne pour essayer drsquoinstaller une population naturelle

Sceacutenario ndeg2 vision halieutique- Maintien des pratiques drsquoalevinage en atlantique pour soutenir

artificiellement le stock de poissons dans un inteacuterecirct uniquement halieutique Attention cette pratique risque de provoquer par deacutevalaison des individus introduits une hybridation des poissons sauvages preacutesents dans le Borne

Eventuellement repeuplement en truites Arc en Ciel surdensitaires sur des secteurs preacutecis du Borne pendant la peacuteriode estivale afin de contenter une certaine cateacutegorie de pecirccheurs Les repeuplements en Arc en Ciel ne risquent pas de provoquer drsquohybridation de la souche fario locale Attention prendre des preacutecautions aupregraves des fournisseurs concernant la qualiteacute sanitaire des poissons

32 Bassin du Giffre

Les propositions sur le bassin du Giffre prennent en compte les reacutesultats du marquage mais eacutegalement la situation actuelle de la riviegravere suite agrave lrsquoeacuteboulement de Sixt Fer agrave Cheval

Ne pas aleviner le cours principal du Giffre en alevins de fario pendant 5 anneacutees conseacutecutives Cette proposition est motiveacutee par les raisons suivantes

- Il est impossible de savoir comment va eacutevoluer dans les prochains mois et les prochaines anneacutees le glissement agrave lrsquoamont de Sixt Il semble donc risqueacute drsquoentreprendre un alevinage pour installer une nouvelle population

- Les reacutesultats des marquages sur le Giffre sont tregraves contrasteacutes Sauf au niveau de Sixt ils montrent qursquoil existait avant le glissement une reproduction naturelle importante et capable de soutenir une population

- Les reacutesultats geacuteneacutetiques reacutecents indiquent que les populations en place sont en majoriteacute drsquoorigine atlantique mais qursquoil existe encore des individus meacutediterraneacuteens non hybrideacutes jusque dans les zones amont Ces reacutesultats prouvent qursquohistoriquement la souche meacutediterraneacuteenne eacutetait bien preacutesente sur lrsquoensemble du Giffre

- Il est envisageable que cette souche sauvage eacutegalement preacutesente sur les parties basses des affluents recolonise naturellement le Giffre

- Lrsquoexemple du Borne montre qursquoapregraves une catastrophe la riviegravere a eacuteteacute recoloniseacutee par une souche sauvage malgreacute des alevinages massifs Les reacutesultats obtenus sur cette riviegravere doivent servir de base de reacuteflexions pour la nouvelle gestion agrave entreprendre sur le Giffre

- Entre le Risse et Marignier la population de truites avant le glissement eacutetait deacutejagrave totalement deacuteseacutequilibreacutee et en quasi disparition (peu de juveacuteniles quasi absence de geacuteniteurs et absence de classes drsquoacircges intermeacutediaires) malgreacute les alevinages massifs sur ce secteur

39

Reacutealiser un bilan de lrsquoimpact du glissement de terrain sur le peuplement piscicole

- Une eacutetude piscicole sera reacutealiseacutee tregraves prochainement (2004 ou 2005) sur le Giffre dans le cadre du contrat de riviegravere Cette eacutetude permettra de faire un premiereacutetat des lieux complet du peuplement piscicole suite au glissement

Accomplir un diagnostic de lrsquoeacutetat de recolonisation du Giffre par les populations naturelles

- En lrsquoabsence drsquoalevinage il sera possible de reacutealiser en 2008 un bilan des populations de truites installeacutees sur le Giffre

- A partir de lrsquoeacutetat de la population agrave cette eacutepoque un plan drsquoalevinage coheacuterent en truite fario pourra ecirctre eacutetabli pour permettre drsquoinstaller de nouvelles populations ou de soutenir des populations preacutesentes

Mettre en place des deacuteversements de truites Arc en Ciel pendant toute la peacuteriode drsquoarrecirct de lrsquoalevinage en fario Attention prendre des preacutecautions aupregraves des fournisseurs concernant la qualiteacute sanitaire des poissons

Reacuteintroduire lrsquoOmbre commun sur la plaine de Samoeumlns et agrave lrsquoaval de la confluence avec le Risse

Arrecirct de lrsquoalevinage sur lrsquoensemble du Risse sur lrsquoaval du Foron de Mieussy et sur lrsquoEtroit Denteacutee

- Sur ces riviegraveres le suivi du marquage a montreacute que lrsquoalevinage nrsquoeacutetait pas neacutecessaire pour soutenir les populations de truites preacutesentes

Maintenir lrsquoalevinage sur lrsquoamont du Foron de Mieussy (vers Sommand) et lrsquoamont du Foron de Taninges (Bonnavaz)

- Sur ces secteurs le suivi du marquage a montreacute que les juveacuteniles preacutesents dans le milieu naturel eacutetaient en majoriteacute des individus introduits

33 Le Foron du Reposoir

Les propositions de gestion sur le Foron du Reposoir sont

Maintenir les alevinages actuels avec la souche Chazey Bons Rhodanienne

Suivre lrsquoeacutevolution de la population pour savoir si cet alevinage permet drsquoinstaller une population fonctionnelle

- Ce suivi peut comprendre des pecircches de sondages en deacutebut de peacuteriode de reproduction pour voir si les poissons adultes deviennent matures des releveacutes de frayegraveres sur la riviegravere pour savoir si les poissons se reproduisent et de nouveaux preacutelegravevements de poissons pour suivre lrsquoeacutevolution du taux de marqueacutes dans la population

34 Bassin de la Filliegravere

Les orientations pour une gestion coheacuterente des populations de la Filliegravere sont les suivantes

40

Arrecirct de lrsquoalevinage sur le cours principal de la Filliegravere sur le Crenant et sur lrsquoaval du Flan

- Sur ces 3 riviegraveres lrsquoalevinage nrsquoest pas neacutecessaire car il ne permet pas de soutenir les populations preacutesentes et de plus la reproduction naturelle est tregraves importante

- Sur la Filliegravere les pecircches drsquoadultes dans le cadre du programme INTERREG ont mis en eacutevidence la preacutesence drsquoune population sauvage drsquoorigine meacutediterraneacuteenne Il semble important drsquoentreprendre une mesure de conservation de cette souche en arrecirctant lrsquoalevinage pour eacuteviter lrsquohybridation

- Sur lrsquoamont du Flan il est neacutecessaire de continuer le suivi des poissons marqueacutes pour savoir si lrsquoalevinage doit ecirctre maintenu

Sur le Daudens deux sceacutenarii de gestion peuvent ecirctre envisageacutes selon la volonteacute politique des gestionnaires directs

Sceacutenario ndeg1 vision patrimoniale- Arrecirct du repeuplement en truite drsquoorigine Atlantique pendant 3 anneacutees

conseacutecutives pour diminuer leur preacutesence sur le bassin- Commencer les proceacutedures afin de rendre le seuil du Plot

franchissable pour les geacuteniteurs de la Filliegravere- Reacutealiser un bilan notamment deacutemographique de la population en place

apregraves lrsquoarrecirct de lrsquoalevinage- Puis reprise de lrsquoalevinage pendant uniquement 3 anneacutees agrave partir de

poissons sauvages issus de la Filliegravere pour essayer drsquoinstaller une population naturelle

Sceacutenario ndeg2 vision halieutique- Maintien des pratiques drsquoalevinage en atlantique pour soutenir

artificiellement le stock de poissons dans un inteacuterecirct uniquement halieutique Attention cette pratique risque de provoquer par deacutevalaison des individus introduits une hybridation des poissons sauvages preacutesents dans la Filliegravere

35 Le Foron de Fillinges

Les reacutesultats obtenus sur le Foron de Fillinges ont conduit agrave formuler les propositions de gestion suivantes

Arrecirct de lrsquoalevinage sur lrsquoensemble du Foron de Fillinges- Quelque soit la souche utiliseacutee et les quantiteacutes introduites les poissons

alevineacutes ne repreacutesentent qursquoune tregraves faible minoriteacute des poissons preacutesents dans le milieu Le Foron abrite une population naturelle fonctionnelle et eacutequilibreacutee

Suivi de la population suite agrave lrsquoarrecirct du repeuplement- Reacutealisation de 5 stations de pecircches eacutelectriques la derniegravere anneacutee de

lrsquoalevinage afin de reacutealiser un eacutetat des lieux preacutecis de la population de truites et du peuplement piscicole

- Reacutealisation drsquoun nouveau bilan de la population du Foron respectivement 3 ans puis 6 ans apregraves lrsquoarrecirct de lrsquoalevinage

41

4 Investigations suppleacutementaires

Suite aux premiers reacutesultats obtenus lors de la campagne 2002 des investigations suppleacutementaires permettant de preacuteciser certains points seront reacutealiseacutees

Reacutealiser une analyse bacteacuteriologique des diffeacuterents lots de poissons alevineacutes qui ont transiteacutes dans les piscicultures associatives Cette recherche de pathologie permettra de savoir si les poissons issus de pisciculture sont porteurs drsquoune maladie bacteacuterienne avant drsquoecirctre introduits dans le milieu ou si ils contractent la maladie dans le milieu naturel

Rechercher les raisons pour lesquelles on nrsquoobserve pas drsquoalevins naturels sur certains secteurs Les causes drsquoune telle situation peuvent ecirctre

- Lrsquoabsence totale de geacuteniteurs dans la population Les poissons nrsquoont pas le temps de devenir adulte (3+) et sont captureacutes avant par les pecirccheurs

- La preacutesence drsquoadultes non matures Les poissons deviennent adultes mais sont immatures (eacutetat sanitaire des poissons souche geacuteneacutetiquement deacutegeacuteneacutereacutee)

- Survie nulle durant la phase de vie sous graviers Les poissons pondent mais les œufs nrsquoarrivent pas agrave se deacutevelopper et la mortaliteacute est totale

Sur les secteurs du Chinaillon de la Duche de lrsquoOveacuteran amont et du Foron de Mieussy amont (Sommand) les actions suivantes peuvent ecirctre entreprises

- Pecircches eacutelectriques de sondage en deacutebut de la peacuteriode de reproduction pour savoir si les poissons deviennent matures

- Releveacutes de frayegraveres permettant drsquoobserver ou non une activiteacute de reproduction- Mise en place drsquoincubateurs-tests contenant des œufs de truites pour connaicirctre le taux

de survie des œufs dans les frayegraveres

Reacutealiser des preacutelegravevements suppleacutementaires aux classes drsquoacircge supeacuterieures (1+ et 2+) sur certaines stations pour voir lrsquoeacutevolution du taux de marqueacutes au cours des anneacutees Ces recherches suppleacutementaires peuvent ecirctre effectueacutees sur 8 cours drsquoeau ougrave le taux de marqueacutes deacutepasse 60 au stade 0+

Le ruisseau de la Duche amontLe ruisseau du Chinaillon amontLe Foron du ReposoirLe Risse avalLe Foron de Taninges amont (Bonnavaz)Le Foron de Mieussy amont (Sommand)Le Daudens amont et avalLe Flan amont

Dans les eacutetudes preacuteceacutedentes reacutealiseacutees sur le Fier (CAUDRON et CHAMPIGNEULLE 2002) et sur le Doubs (CHAMPIGNEULLE et al 2002) les taux de marqueacutes aux stades 1+ et 2+ dans la population en place srsquoeffondraient et devenaient tregraves faibles ou nuls

Pour informations le graphique suivant montre lrsquoeacutevolution du taux de marqueacutes agrave diffeacuterents stades sur les stations ougrave le taux de 0+ marqueacutes eacutetait eacuteleveacute

42

Les reacutesultats montrent agrave part pour une station une chute importante des taux de marqueacutes entre les stades 0+ et 1+ Cette chute se poursuit eacutegalement au stade 2+Ces reacutesultats obtenus sur le Fier et le Doubs semblent laisser peu drsquoespoirs sur le devenir des poissons marqueacutes sur les bassins eacutetudieacutes en 2002

Reacutesultats sur leacutevolution du taux de m arqueacutes aux diffeacuterents stades obtenus lors des eacutetudes preacuteceacutedentes sur le Fier et le Doubs

0102030405060708090

100

0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 0+ 1+ 0+ 1+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+

Station A Station B Station C StationD

StationE

StationF

Station A Station B StationC

Stations et stades

Pou

rcen

tage

de

mar

queacutes

Le Fier Le Doubs

Reacutesultats sur leacutevolution du taux de m arqueacutes aux diffeacuterents stades obtenus lors des eacutetudes preacuteceacutedentes sur le Fier et le Doubs

0102030405060708090

100

0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 0+ 1+ 0+ 1+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+

Station A Station B Station C StationD

StationE

StationF

Station A Station B StationC

Stations et stades

Pou

rcen

tage

de

mar

queacutes

Le Fier Le Doubs

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BIBLIOGRAPHIE

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6

Prise drsquoeacutecailles et lecture immeacutediate pour veacuterification de lrsquoacircge ici 0+

Deacutetermination du pheacutenotype Meacuted (haut) Atl (bas) Observation du sexe et de la maturiteacute sexuelle

Le coefficient de condition est calculeacute dapregraves la formule suivante K = (P100) (Lt10)3

K = coefficient de conditionP = poids en grammesLt = longueur totale du poisson en mm

De mecircme la longueur relative ((longueur de la nageoirelongueur totale du corps)100) des nageoires pectorales a eacuteteacute calculeacutee (BOSAKOWSKI et al 1993)

Ces renseignements notamment les caracteacuteristiques morphologiques permettent de reacutealiser des analyses comparatives entre poissons sauvages et introduits

Pour chaque poisson seacutelectionneacute il faut ensuite proceacuteder agrave lrsquoextraction la preacuteparation et lrsquoexamen des otolithes

152 Preacutesentation des otolithes

Les otolithes sont des piegraveces calcifieacutees preacutesentes dans loreille interne des poissons Ils se forment degraves le stade embryonnaire et suivent laccroissement de la truite Leur rocircle essentiel se situe au niveau du maintien de leacutequilibre du poisson

Il existe trois paires dotolithes dont la forme et la taille sont caracteacuteristiques dune espegravece

Les sagittaeIls sont logeacutes dans la partie ventro-posteacuterieure de la capsule auditive Des trois paires dotolithes les sagittae sont les plus utiliseacutes pour le fluoromarquage de masse comme dans la preacutesente eacutetude mais aussi pour des estimations de lacircge et de laccroissement des poissons Ceci se justifie par leur taille ce sont en effet les plus volumineux leur extraction sen trouve donc faciliteacutee

Les asterisciIls sont situeacutes agrave larriegravere des sagittae Comme ces derniers ils sont impliqueacutes dans la reacuteception des sons (PANFILI et al 2002)

Les lapilli

7

Ils se situent dans la zone anteacutero-dorsale de la capsule auditive et interviennent dans le maintien des postures et de leacutequilibre des poissons

Les sagittae plus volumineux et plus faciles agrave preacutelever ont donc eacuteteacute utiliseacutes pour mener agrave bien cette eacutetude

Lotolithe croit par apposition dun nouveau mateacuteriel sur sa surface Ce pheacutenomegravene cyclique fonction du meacutetabolisme du calcium et de la synthegravese des acides amineacutes conduit agrave la formation danneaux saisonniersLors du marquage agrave lalizarine Red S les truites ne sont acircgeacutees que de quelques semaines et de ce fait les otolithes sont de tregraves petite taille Le fluorochrome se fixe sur les structures en voie de mineacuteralisation (os dents cartilages calcifieacutes otolithes) Leur calcification se poursuit naturellement avec la croissance du poisson et ainsi seule la partie centrale de lotolithe correspondant agrave sa taille lors de la coloration est marqueacutee

Lalizarine Red S absorbe les rayons UV et eacutemet une fluorescence dans le spectre visible Cette proprieacuteteacute est utiliseacutee pour le repeacuterage du marqueur avec un microscope eacutequipeacute pour leacutepifluorescence

yeux

otolithes

cerveau

yeux

otolithes

cerveau

Photo et scheacutema de localisation des otolithes et du marquage

153 Extraction et lecture des otolithes

Les diffeacuterentes phases permettant la lecture des otolithes sont

Deacutecoupe et enlegravevement avec des ciseaux de la moitieacute infeacuterieure de la tecircte au-preacutealablement partiellement deacutecongeleacutee

Deacutecoupage en deux (plan sagittal) de la moitieacute supeacuterieure de la tecircte en faisant entrer la pointe infeacuterieure du ciseau dans le passage de la moelle eacutepiniegravere (canal rachidien) Ce mode de deacutecoupe seacutepare et sectionne les capsules olfactives contenant les sagittae qui apregraves que le cerveau a eacuteteacute enleveacute sont alors directement accessibles avec des pinces fines dans chaque demi-section de la partie supeacuterieure de la tecircte

Extraction des sagittae agrave lrsquoaide de pinces fines Apregraves avoir enleveacute les matiegraveres organiques reacutesiduelles sur un papier absorbant les otolithes sont placeacutes dans untube Eppendorf et stockeacutes agrave lrsquoabri de la lumiegravere

8

Collage de chaque otolithe (face convexe vers lrsquoexteacuterieur) sur une lame de verre mince agrave lrsquoaide drsquoune thermocolle (colle Crystalbonb Aremco ndeg 509) chauffeacutee agrave 120 degC Durant cette eacutetape il est important drsquoenlever les bulles drsquoair existantes celles-ci pouvant eacutemettre une fluororescence parasite

Polissage des otolithes sur des plaques de papiers abrasifs de granulomeacutetrie diffeacuterente (Escil PSA G 400 G 800 et G 1200) Lrsquoeacutevolution du polissage est suivi par plusieurs controcircles sous microscope afin drsquoatteindre et de ne pas deacutepasser le centre de lrsquootolithe

Lecture de lrsquootolithe sous un microscope eacutequipeacute pour lrsquoeacutepifluorescence car lrsquoARS est deacutetectable par la fluorescence qursquoil eacutemet lorsquil est irradieacute en lumiegravere ultraviolette La lecture est faite le jour mecircme du polissage car la lisibiliteacute de la marque diminue avec le temps impliquant alors la neacutecessiteacute drsquoun leacuteger repolissage

Lorsque lrsquootolithe a eacuteteacute marqueacute celui-ci montre en son centre un anneau ou un noyau (selon la preacutecociteacute du marquage etou positionnement du plan de polissage par rapport au nucleacuteus) apparaissant rouge fluorescent (jeu de filtres Zeiss ndeg15 BP 54612 FT 580 LP 590 ) ou jaune orangeacute (jeu de filtres Zeiss ndeg9 BP 450-490 FT 510 LP 520)

Lorsque lrsquootolithe a eacuteteacute marqueacute celui-ci montre en son centre un anneau fluorescent jaune orangeacute ou rouge fluorescent selon le filtre utiliseacute

Enlegravevement de la moitieacute infeacuterieure de la tecircte agrave lrsquoaide de ciseaux

Emplacement de lotolitheEmplacement de lotolithe

Tecircte apregraves dissection Localisation de lrsquootolithe

9

Extraction de lrsquootolithe Otolithes colleacutes sur lame mince Ponccedilage de lrsquootolithe

Observation de la lame mince au microscope

05mm 05mmVue au microscope drsquoun otolithe ponceacute Otolithe marqueacute (anneau fluo vert-jaune)

16Symptocircmes pathologiques observeacutes

161 La maladie reacutenale prolifeacuterative (MRP ou PKD ou teacutetracapsulose)

Selon ESCHER et al (Fischnetz-info mars et deacutecembre 2001) cette maladie est provoqueacutee par un seul parasite Tetracapsula bryosalmonae (myxosoaire) Chez les poissons on le rencontre chez les salmonideacutes et le brochet les truites eacutetant particuliegraverement toucheacutees Le taux de mortaliteacute peut ecirctre fort chez ces derniegraveres (10 agrave 100) surtout sur les estivaux

Pour que les symptocircmes (affaiblissement contraction dautres maladies) se deacuteveloppent la tempeacuterature de leau doit ecirctre supeacuterieure agrave 15degC De plus il semble que des facteurs tels quun faible taux doxygeacutenation ou une pollution chimique favoriseraient la maladie

10

Afin de savoir si la truite en preacutesence est infecteacutee il faut observer ses reins En effet un poisson ayant deacuteveloppeacute la maladie a des reins grossis et dune coloration inhabituelle

Le mode de propagation de la maladie et le cycle complet du parasite ne sont que partiellement connus Tetracapsula parasite les bryozoaires de petits organismes filtreurs qui forment des colonies de quelques centimegravetres de diamegravetre sur diffeacuterents types de substrats et que lon rencontre dans la plupart des lacs et cours deau

Les parasites se multiplient dans les bryozoaires ils ont alors une taille de 20 μm et se concentrent dans des sortes de grandes poches de 350 μm de diamegravetre Le parasite peacutenegravetre dans le poisson sous forme de petites spores agrave travers les cellules du mucilage de la peau et ce au cours de la premiegravere minute apregraves lentreacutee en contact avec lagent pathogegravene A laide de la circulation sanguine les parasites atteignent les reins ougrave ils forment diffeacuterents stades de deacuteveloppement et provoquent de violentes reacuteactions inflammatoires Il en reacutesulte les diffeacuterentssymptocircmes deacutecrits preacuteceacutedemment

Le parasite drsquoun diamegravetre de 5 agrave 20 microm a pu ecirctre observeacute dans les vaisseaux sanguins de presque tous les organes (sauf du cerveau de la moelle eacutepiniegravere et des yeux) Les spores sont libeacutereacutees dans lrsquoeau avec lrsquourine du poisson et sont probablement absorbeacutees de nouveau par les bryozoaires

Les truites qui survivent ou qui ont deacutejagrave eacuteteacute infecteacutees sans deacutevelopper la maladie sont en geacuteneacuteral immuniseacutees lanneacutee suivante

Poisson atteint pas la PKD (reins gonfleacutes et preacutesence de nodules)

La PKD provoque chez les jeunes truites une mortaliteacute variant de 10 agrave 100 des individus toucheacutesLe deacuteveloppement du parasite est favoriseacute en eacuteteacute lorsque la tempeacuterature de lrsquoeau atteint 15degC

162 Pathologies bacteacuteriennes

Des symptocircmes probablement dus agrave une pathologie bacteacuterienne ont eacuteteacute mis en eacutevidence lors de cette eacutetude En effet un pourcentage non neacutegligeable de truites eacutetait affecteacute par des rougeurs de type heacutemorragie agrave la base des nageoires

11

Selon MORAND (com pers) deux maladies bacteacuteriennes peuvent engendrer ces symptocircmes (la furonculose et la yerciniose) Ces deux maladies sont preacutesentes dans le monde entier et atteignent tout particuliegraverement les eacutelevages de salmonideacutes

Elles peuvent ecirctre favoriseacutees par des conditions particuliegraveres du milieu environnant tempeacuterature de leau eacuteleveacutee (supeacuterieure agrave 10 degC) une charge organique importante ou encore une pollution diminuant les deacutefenses immunitaires du poissonhellip

Selon la graviteacute de laffection ces pathologies peuvent entraicircner de lourds taux de mortaliteacute atteignant jusquagrave 70 dans certains cas (MOURRIERAS 1995)

Les heacutemorragies observeacutees agrave la base des nageoires sont la conseacutequence drsquoune infection bacteacuterienne pouvant provoquer drsquoimportantes mortaliteacutes

17Utilisation du SIG de la Feacutedeacuteration de pecircche de Haute-Savoie

Les donneacutees du programme pilote de marquage et du programme INTERREG sont inteacutegreacutees dans un SIG (Systegraveme dInformation Geacuteographique MapInfo) mis en place agrave la Feacutedeacuteration de pecircche de Haute-Savoie et agrave lINRA de Thonon

Ainsi toutes les informations relatives aux cours deau du deacutepartement seront consigneacutees dans cette base de donneacutees (pente longueur preacutesence de seuils infranchissables caracteacuteristiques physico-chimiques IBGN hydrologie occupation des bassins versantshellip) Il en sera de mecircme pour les donneacutees truites (repeuplement densiteacute biomasses croissance structure dacircge pathologie geacuteneacutetiquehellip)

Lapproche finale visera agrave rechercher les relations existant entre ces deux groupes de donneacutees spatialiseacutees Une toute premiegravere deacutemarche a eacuteteacute partiellement tenteacutee dans le cas du preacutesent rapport dont les donneacutees ont eacuteteacute inteacutegreacutees dans le SIG en cours de construction

12

2 Reacutesultats et discussions

Ce chapitre preacutesente les reacutesultats obtenus sur les bassins eacutetudieacutes lors de la campagne de preacutelegravevements 2002 agrave savoir

Le GiffreLe BorneLa FilliegravereLe Foron de ScionsiezLe Foron de Fillinges

Lors de la campagne 2002 1703 poissons au stade 0+ ont eacuteteacute eacutechantillonneacutes en milieu naturel et eacutetudieacutes en laboratoire

21Taux de marquage sexe ratio et pathologie

211 Le Borne

Sur le bassin du Borne 5 stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal et 3 sur des affluents Au total ce sont 392 poissons 0+ qui ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

Sur le cours principal

Les taux de marqueacutes varient fortement sur le cours principal du Borne (18 agrave 100) On observe un gradient amont-aval du taux de marqueacutes qui peut ecirctre mis en relation avec la preacutesence drsquoun obstacle partiellement infranchissable pour les geacuteniteurs au niveau drsquoEntremont

Ainsi deux grandes zones peuvent ecirctre distingueacutees sur le Borne

La zone amont du seuil drsquoEntremont ougrave la majoriteacute des juveacuteniles sont issus du repeuplement (90 agrave 100)

On observe sur ce secteur une tregraves faible reproduction naturelle en raison drsquoune quasi-absence de poissons adultes La situation de la population de truites est donc tregraves critique Si le repeuplement permet de drsquoobserver des 0+ il nrsquoa pas permis drsquoinstaller une population fonctionnelle

La zone aval du seuil drsquoEntremont ougrave la majoriteacute des individus preacutesents au stade 0+ sont des poissons naturels

En effet le taux de marqueacutes varie de 18 agrave 49 Les pecircches de sondage Interreg ont montreacute la preacutesence drsquoune importante population de truites sauvages drsquoorigine meacutediterraneacuteenne La population est eacutequilibreacutee et naturellement fonctionnelle puisqursquoon observe une forte reproduction naturelle et de nombreux geacuteniteurs

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Sur les Affluents

Sur les 3 affluents eacutetudieacutes la situation est tregraves simple En effet soit on observe 0 de marqueacutes soit 100

- Sur lrsquoOveacuteran aval aucun poisson marqueacute nrsquoa eacuteteacute trouveacute puisqursquoil nrsquoy a pas eu de repeuplement sur ce secteur en 2002 Le reacutesultat obtenu montre une importante reproduction naturelle des geacuteniteurs du Borne qui remontent sur lrsquoaval de ce cours drsquoeau

- Sur la Duche et le Chinaillon il y a absence totale de reproduction naturelle puisque 100 des 0+ eacutechantillonneacutes sont marqueacutes Pourtant on observe de nombreux poissons adultes sur ces secteurs susceptibles drsquoecirctre des geacuteniteurs ainsi que diffeacuterentes classes drsquoacircge Lrsquoeacutequilibre de ces populations est artificiellement maintenu par les alevinages

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

- Toutes les stations eacutetudieacutees ne sont pas concerneacutees par ces symptocircmes de maladies- Les maladies bacteacuteriennes semblent toucher majoritairement les poissons introduits- Cependant les 0+ de lrsquoOveacuteran aval tous naturels sont infecteacutes agrave 15 Ce reacutesultat

peut refleacuteter une contamination par deacutevalaison provenant drsquoindividus atteints situeacutes plus en amont de lrsquoOveacuteran ou une contamination naturelle par des agents pathogegravenes preacutesents dans le milieu

- Les poissons marqueacutes peuvent ecirctre contamineacutes agrave un taux non neacutegligeable pouvant atteindre plus de 30

Pourcentage dindividus preacutesentant des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

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Les Etroits Entremont Beffay St Pierre enF

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

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Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Le sexe ratio est relativement eacutequilibreacute pour les marqueacutes comme pour les non marqueacutes Seule une station sur le Borne (Beffay) montre 85 de macircle dans la population de 0+

- Seules 2 stations montrent des macircles matures au stade 0+- Le pourcentage de macircles matures au stade 0+ est plus important chez les non

marqueacutes que chez les marqueacutes

Pourcentage de macircles au stade 0+

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Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Borne

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Pourcentage de macircles au stade 0+

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Les Etroits Entremont Beffay St Pierre enF

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Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Borne

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

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212 Le Giffre

Sur le bassin du Giffre 6 stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal et 7 sur des affluents Au total ce sont 536 poissons 0+ qui ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

Sur le cours principal

La carte de synthegravese des reacutesultats met en eacutevidence des taux de marqueacutes tregraves contrasteacutes variant entre 0 et 100 Sauf deux cas particuliers la campagne de preacutelegravevements a permis de montrer qursquoune reproduction naturelle existait sur lrsquoensemble du Giffre

Il est possible de distinguer trois zones successives sur ce cours deau

La zone aval est composeacutee de la station Pont du Giffre ougrave le taux de marqueacutes est de 74 Cette station sur le Giffre doit ecirctre rapprocheacutee des stations eacutetudieacutees sur le Risse (station laquo Risse aval St Jeoire raquo) et le Hisson(laquo station La Pallud raquo) pour mieux comprendre le fonctionnement de la population

- Sur le Giffre aval la situation semble tregraves critique La station dite laquo Pont du Giffre raquosrsquoeacutetend de lrsquoamont de Marignier agrave lrsquousine du Pont du Giffre soit sur environ 25 km Sur cette distance seulement 31 0+ ont pu ecirctre captureacutes De plus les pecircches drsquoadultes dans le cadre drsquoInterreg montrent un deacuteficit inquieacutetant de geacuteniteurs sur ce secteur ainsi qursquoune surabondance de Chabot La situation du bas Giffre montre une population de truitetotalement deacuteseacutequilibreacutee loin du potentiel de la riviegravere et qui ne peut pas ecirctre reacutehabiliteacutee par le seul fait de lrsquoalevinage Cette situation peut ecirctre le reacutesultat du faible deacutebit reacuteserveacute qui appauvrit lrsquohabitat aquatique et provoque des eacuteleacutevations de tempeacuterature inquieacutetantes Les reacutesultats de pecircche drsquoinventaire dans la reacuteserve de Marignier montrent que les poissons sont concentreacutes agrave lrsquoaval immeacutediat des seuils ougrave lrsquoon note la preacutesence de fosses de tempeacuteratures plus faibles et drsquoune meilleure oxygeacutenation

La zone moyenne situeacutee entre le barrage de Mieussy et Samoeumlns qui est composeacutee des stations laquo aval barrage Taninges raquo laquo Theacuteziegraveres raquo et laquo Montessuit raquo Sur ce secteur les 0+ marqueacutes sont en minoriteacutes puisqursquoils repreacutesentent 11 agrave 38 du peuplement

- Sur le Giffre aval barrage de Taninges le secteur nrsquoest pas alevineacute il est donc normal que pregraves de 90 des poissons ne soient pas marqueacutes Les 0+ marqueacutes proviennent certainement du ruisseau de lrsquoEtroit Denteacute qui est fortement alevineacute et agrave partir duquel une deacutevalaison doit avoir lieu- Le secteur des laquo Theacuteziegraveres raquo et de laquo Montessuit raquo bien que reacuteguliegraverement alevineacute montre un taux important drsquoalevins naturels (62 agrave 77) Ce reacutesultat est tout agrave fait en accord avec le suivi de la reproduction naturelle et le recensement de frayegraveres reacutealiseacute par lrsquoAAPPMA du Faucigny et le CSP en 1999 En effet de nombreuses frayegraveres naturelles avaient eacuteteacute observeacutees sur ce site Le peuplement drsquoadultes nrsquoest pas tregraves important mais est en rapport avec les potentialiteacutes du milieu

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La zone amont caracteacuteriseacutee par les stations laquo Reveacute-Peacuteret raquo et laquo amont Tines raquo ougrave le taux de marqueacutes varie de 70 agrave 79

- Pour ces deux stations la population de juveacuteniles est faible et ils sont majoritairement marqueacutes Cependant au stade adulte les pecircches Interreg montrent une majoriteacute de poissons drsquoorigine meacutediterraneacuteenne La forte contribution de poissons introduits au stade 0+ ne semble pas se retrouver au stade adulte Les conditions de vie dans ce milieu sont tregraves difficiles et ne permettent pas drsquoatteindre des densiteacutes de poissons importantes

Sur les Affluents

Le Risse - Le Hisson montre une majoriteacute drsquoalevins naturels alors que les preacutelegravevements ont eacuteteacute reacutealiseacutes seulement deux mois apregraves le repeuplement Ce cours drsquoeau possegravede un fort potentiel de frai qui est utiliseacute notamment par les geacuteniteurs du Risse- Sur lrsquoaval du Risse le taux de marqueacutes est de 68 Il est le reflet drsquoun alevinage en quantiteacute importante sur le secteur (10 000 alevins) Les alevins naturels repreacutesentent tout de mecircme plus de 30 trois mois apregraves le repeuplement De plus les eacutechantillonnages drsquoadultes reacutealiseacutes sur ce secteur dans le cadre drsquoInterreg ont mis en eacutevidence une quantiteacute importante de geacuteniteurs sauvages La population sur ce secteur est agrave mettre en eacutevidence avec celle du Hisson puisque certains geacuteniteurs du Risse y migrent pour se reproduireLa population sur ce secteur est naturellement fonctionnelle

Le Foron de Mieussy - La station laquo Andelier raquo situeacutee en amont du Foron preacutesente 100 de marqueacutes Cette situation montre une absence totale de reproduction naturelle Le milieu est extrecircmement deacutefavorable agrave lrsquoinstallation drsquoune population fonctionnelle en raison du faible deacutebit de la riviegravere (assegravechement reacutegulier) Aucune classe drsquoacircge intermeacutediaire et aucun adulte nrsquoa eacuteteacute observeacute sur ce secteur Les poissons alevineacutes sont certainement victimes des assegravechements- La station laquo Trebiet raquo situeacutee plus en aval preacutesente au contraire 0 de marqueacutes alors que cette zone a eacuteteacute alevineacutee Ce reacutesultat montre la capaciteacute du Foron sur ce secteur a accueillir une population fonctionnelle Il existe une reproduction naturelle importante sur cette zone avec eacutegalement beaucoup de geacuteniteurs- Vers Sommand une pecircche de sondage a eacuteteacute reacutealiseacutee mais aucun alevin nrsquoa eacuteteacute preacuteleveacute puisque cette zone nrsquoa pas eacuteteacute alevineacutee en 2002 Cependant les reacutesultats de ce sondage mettent en eacutevidence une absence totale de reproduction naturelle (aucun alevin naturel nrsquoa eacuteteacute trouveacute) alors que la population semble eacutequilibreacutee (preacutesence drsquoadultes et de truitelles drsquoacircge intermeacutediaire)

LrsquoEtroit Denteacute Globalement le taux de marqueacutes sur les deux stations eacutetudieacutees est faible (11 agrave 33)- Sur la station laquo aval route raquo la majoriteacute des alevins est naturelle Cette zone montre un habitat tregraves favorable pour la reproduction des geacuteniteurs qui remontent du Giffre- Sur la station laquo amont route raquo une population fonctionnelle de pheacutenotype meacutediterraneacuteen est installeacutee De nombreux geacuteniteurs sont preacutesents et le recrutement naturel est important

19

Le Foron de Taninges - En amont (station Bonnavaz) le taux de marqueacutes est tregraves important (95) Il existe donc une reproduction naturelle mais insuffisante pour permettre lrsquoinstallation drsquoune population et maintenir une activiteacute halieutique Les alevinages passeacutes nrsquoont pas permis drsquoinstaller une population fonctionnelle dans cette zone apicale- Plus en aval sur les zones non alevineacutees les pecircches eacutelectriques drsquoinventaire et de sondage reacutealiseacutees ont montreacute la preacutesence drsquoune population eacutequilibreacutee de pheacutenotype meacutediterraneacuteen avec une importante reproduction naturelle

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

Les principales remarques concernant les pathologies observeacutees sur le bassin du Giffre sont

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

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Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Giffre

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- La PKD est preacutesente sur le cours du Giffre mais uniquement agrave lrsquoaval du barrage de Taninges Cette situation est agrave mettre en relation avec le deacutebit reacuteserveacute insuffisant qui entraicircne une augmentation de tempeacuterature pendant la peacuteriode estivale

- Sur les affluents la PKD a eacuteteacute observeacutee sur les secteurs preacutesentant des faibles deacutebits estivaux (aval du Risse et Foron de Mieussy Andelier) qui sont certainement responsables drsquoune augmentation de tempeacuterature

- La PKD atteint agrave la fois les poissons introduits que les poissons naturels- Le pourcentage drsquoindividus toucheacutes par la PKD varie drsquoun site agrave lrsquoautre mais peut

atteindre une valeur importante avec 50 sur certain secteur- Les maladies bacteacuteriennes sont plus freacutequentes chez les individus marqueacutes Soit ces

poissons sont plus fragiles que les poissons naturels et contractent les maladies plus facilement soit les maladies sont contracteacutees en pisciculture pendant lrsquoeacutelevage

- Le pourcentage drsquoindividus toucheacutes par des symptocircmes bacteacuteriens nrsquoest pas neacutegligeable puisqursquoil peut atteindre 20

- Lrsquoensemble des stations eacutetudieacutees est toucheacute par des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes ce qui laisse penser que lrsquoensemble du bassin peut ecirctre atteint

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

Pourcentage de macircles au stade 0+

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Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Giffre

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Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

21

- Le sexe ratio apparaicirct globalement eacutequilibreacute sur lrsquoensemble des stations du Giffre- On observe des diffeacuterences entre les poissons introduits et les poissons naturels sur

seulement 3 stations Ces diffeacuterences sont en faveur des poissons marqueacutes qui montrent un pourcentage de macircles plus important

- Une maturiteacute sexuelle preacutecoce des macircles existe sur certaines stations quelle que soit lrsquoorigine des poissons

- Cette maturiteacute peut ecirctre importante et concerner jusqursquoagrave 20 des 0+

22

213 Le Foron du Reposoir

Deux stations (La Touviegravere et Le Reposoir) ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le Foron du Reposoir Seulement 15 0+ ont eacuteteacute eacutetudieacutes en raison principalement de la difficulteacute drsquoeacutechantillonner des poissons de petite taille (6-7 cm) sur ces milieux torrentiels

Le taux de marqueacutes

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23

- Sur les deux stations eacutetudieacutees le taux de marqueacutes est de 100 Lrsquoensemble des 0+ mecircme si le nombre est faible est donc issu de lrsquoalevinage Ce cours drsquoeau fait lrsquoobjet actuellement drsquoun essai drsquoimplantation drsquoune population agrave partir de la souche Chazey-Bons Rhodanienne Cette souche provient de geacuteniteurs de la riviegravere Furan (Ain) Des analyses geacuteneacutetiques reacutecentes reacutealiseacutees par analyse de microsatellites diagnostic de lrsquoADN ont montreacute que ces poissons ont un pourcentage dallegraveles meacutediterraneacuteens voisin de 65

Ce reacutesultat montre que le cours deau avait un niveau de population tregraves faible avant le repeuplement par la souche Chazey-Bons sauvagesDe plus les pecircches drsquoinventaires du CSP et les pecircches de sondage Interreg montrent qursquoune population de truites se met progressivement en place En effet on observe chaque anneacutee despoissons agrave des stades de plus avanceacutes et les captures par pecircche agrave la ligne commencent agrave ecirctre effectivesLes pecircches eacutelectriques reacutealiseacutees agrave lrsquoautomne 2002 indique que le stock de geacuteniteurs est en cours de reconstitution mais que les truites femelles nrsquoont pas encore atteint le stade geacuteniteurIl nrsquoest donc pas encore possible de dire si lrsquohabitat et la population du Foron du Reposoir sont propices agrave lrsquoinstallation drsquoune population naturellement fonctionnelle

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

Aucun symptocircme reacutenal et heacutemorragique nrsquoapparaicirct sur les 0+ eacutechantillonneacutes sur ce cours deau

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Le sexe ratio est eacutequilibreacute puisqursquoil varie de 50 agrave 60- Il nrsquoy a aucun macircle mature au stade 0+ dans les eacutechantillons preacuteleveacutes sur ce cours

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Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

24

214 La Filliegravere

Cinq stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal de la Filliegravere ainsi que sept stations sur les trois affluents principaux (Flan Creacutenant et Daudens) Au total 582 poissons 0+ ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

Sur le cours principal

Pour les 5 stations eacutetudieacutees sur le cours principal le taux de 0+ marqueacutes varie de 4 agrave 56 il est donc de tregraves faible agrave moyen et montre une forte reproduction naturelle sur toute la riviegravere Il y a un gradient amont-aval du taux de marqueacutes avec un pourcentage de poissons marqueacutes plus important en amont Cependant sur lrsquoensemble de la Filliegravere le recrutement naturel est dominant et constitue lrsquoessentiel de la population de truite

De plus les pecircches de sondages pour Interreg ont montreacute la preacutesence de nombreux drsquoadultes drsquoorigine naturelle meacutediterraneacuteenne Ceci confirme que la population de truite de la riviegravere principale est naturellement fonctionnelle

Sur les affluents

Les reacutesultats sont diffeacuterents selon que lrsquoaffluent est en connexion ou non avec la riviegravere principale

- Sur le Flan on observe en zone aval et meacutediane (stations laquo D 55 raquo et laquo Bruchon raquo) des taux de marqueacutes faibles (38 et 27) qui mettent en eacutevidence la preacutesence drsquoune forte reproduction naturelle notamment de poissons migrants de la Filliegravere Les releveacutes de frayegraveres reacutealiseacutes par lrsquoAAPPMA avaient deacutejagrave permis drsquoobserver de nombreuses frayegraveres naturelles sur ce secteurEn zone plus amont station laquo Molliet raquo le taux de marqueacutes est plus important (73) il met en eacutevidence la preacutesence drsquoun recrutement naturel mais qui reste au stade 0+ minoritaire par rapport aux individus introduits

- Sur le Daudens les deux stations (laquo Le Plot raquo et Daudens raquo) montrent des taux de marqueacutes importants (86 et 92) La reproduction naturelle est donc tregraves faible et la population de truite ne semble pas fonctionnelle Lrsquoobstacle agrave lrsquoaval de la route deacutepartementale semble preacutejudiciable car il ne permet pas aux geacuteniteurs de la Filliegravere de remonter sur le Daudens et drsquoinstaller une population fiable

- Sur le Crenant Les deux stations eacutechantillonneacutees (laquo aval raquo et Disonche raquo) ne sont pas situeacutees sur des zones alevineacutees en 2002 et il est normal de trouver 0 de marqueacutes Cependant ces reacutesultats montrent qursquoil y a une forte reproduction naturelle sur ce cours drsquoeau mecircme en zone amont et que la population semble naturellement fonctionnelle Les alevins introduits sur le Crenant ne semblent pas avoir deacutevaleacutes sur pour coloniser lrsquoaval du Crenant

25

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26

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

- La PKD semble quasiment absente du bassin de la Filliegravere sauf preacutesence anecdotique uniquement chez les non marqueacutes sur une station (laquo Millard raquo)

- Les individus marqueacutes ne sont pas toucheacutes par la PKD- Les maladies bacteacuteriennes sont preacutesentes sur lrsquoensemble du bassin mais touchent en

prioriteacute et majoritairement les individus marqueacutes

Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

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Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

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27

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Sur lrsquoensemble des stations le sexe ratio est eacutequilibreacute il montre une plus grande variation chez les individus marqueacutes

- Des macircles matures au stade 0+ ont eacuteteacute observeacutes sur trois stations uniquement chez les individus naturels

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

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Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

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28

215 Le Foron de Fillinges

Trois stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal du Foron de Fillinges agrave savoir de lrsquoamont vers lrsquoaval laquo Bovet ndash Boex raquo laquo Pont de Fillinges raquo et laquo Couvette raquo Au total 178 poissons 0+ ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

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29

Sur les 3 stations eacutetudieacutees les taux de marqueacutes sont faibles agrave tregraves faibles- Sur la station laquo Bovet ndash Boex raquo le taux de marqueacutes est de seulement 31- A lrsquoaval sur les stations laquo Pont de Fillinges raquo et laquo Couvette raquo les taux de marqueacutes

sont respectivement de 0 et 2

Les reacutesultats indiquent la preacutesence drsquoune importante reproduction naturelle sur lrsquoensemble du Foron de Fillinges Quelque soit la souche utiliseacutee pour lrsquoalevinage atlantique dans le secteur Faucigny ou Meacutediterraneacuteenne Pont de Gys dans le secteur Chablais les poissons introduits restent minoritaires

Cette situation traduit la preacutesence drsquoune population bien installeacutee et fonctionnelle sur cette riviegravere

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

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Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

0102030405060708090

100

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Pourcentage dindividus preacutesentant des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

05

101520253035404550

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

30

- Sur lrsquoensemble des stations des individus 0+ sont atteints par la PKD le pourcentage drsquoindividus malades peut atteindre 35

- Seuls les individus sauvages semblent toucheacutes par la PKD cependant le nombre drsquoindividus introduits est trop faible pour permettre une comparaison

- Toutes les stations sont eacutegalement toucheacutees par les maladies bacteacuteriennes avec des taux de contamination variant de 15 agrave 30

- Les maladies bacteacuteriennes touchent agrave la fois les individus introduits et les individus naturels

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Le sexe ratio apparaicirct eacutequilibreacute sur lrsquoensemble des stations- On observe des macircles matures degraves le stade 0+ sur lrsquoensemble des stations- Le taux de macircles matures au stade 0+ peut atteindre 15

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

Pourcentage de macircles au stade 0+

0

102030405060

708090

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Pourcentage de macircles matures au stade 0+

05

101520253035404550

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

Pourcentage de macircles au stade 0+

0

102030405060

708090

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Pourcentage de macircles matures au stade 0+

05

101520253035404550

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

31

22Caracteacuteristiques morphologiques

221 Longueur totale des individus

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Giffre

0

20

40

60

80

100

120

140Am

ont

Tine

s

Rev

eacute-Peacute

ret

Mon

tess

uit

Theacutez

iegravere

s

Aval

barr

age

Tani

nges

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se

Bonn

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Amon

tro

ute

Aval

rout

e

Ande

lier

Treb

iet

La P

allu

d

Aval

St

Jeoi

re

LeGiffre

LeGiffre

LeGiffre

LeGiffre

LeGiffre

LeGiffre

Le FdeTaninges

LEtroitDenteacute

LEtroitDenteacute

Le F deMieussy

Le F deMieussy

LeHisson

Le Risse

Long

ueur

tota

le e

n m

m

Taille moyenne des 0+ sur le Borne

0

20

40

60

80

100

120

140

GrandBornand

Les Etroits Entremont Beffay St Pierre en F

Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Chinaillon La Duche LOveacuteran

Long

ueur

tota

le e

n m

m

Taille moyenne des 0+ sur la Filliegravere

0

20

40

60

80

100

120

140

Le J

ourd

il

Pisc

icul

ture

Milla

rd

Long

cham

ps

D55

Bruc

hon

Mol

liet

Le

Plot

Dau

dens

Aval

Dis

onch

e

La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere Le Flan Le Flan Le Flan LeDaudens

LeDaudens

LeCrenant

LeCrenant

Long

ueur

tota

le e

n m

m

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Giffre

0

20

40

60

80

100

120

140Am

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Tine

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ret

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LeGiffre

LeGiffre

LeGiffre

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LeGiffre

Le FdeTaninges

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Le F deMieussy

Le F deMieussy

LeHisson

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Taille moyenne des 0+ sur le Borne

0

20

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GrandBornand

Les Etroits Entremont Beffay St Pierre en F

Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Chinaillon La Duche LOveacuteran

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Taille moyenne des 0+ sur la Filliegravere

0

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La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere Le Flan Le Flan Le Flan LeDaudens

LeDaudens

LeCrenant

LeCrenant

Long

ueur

tota

le e

n m

m

32

Sur la quasi-totaliteacute des stations eacutetudieacutees les individus marqueacutes preacutesentent une taillemoyenne supeacuterieure agrave celle des individus naturels Sur 18 stations ougrave les effectifs permettent des comparaisons statistiques la longueur totale des individus marqueacutes est significativement supeacuterieure agrave celle des truites sauvages pour 13 stations

Les 5 stations faisant exception sont laquo aval barrage Taninges raquo et laquo Pont du Giffre raquo sur le Giffre laquoAval St Jeoire raquo sur le Risse laquo Bonnavaz raquo sur le Foron de Taninges et laquo Couvette raquo sur le Foron de Fillinges Cependant sur ces stations les diffeacuterences ne sont pas significatives

Le fait que les marqueacutes aient une plus grande taille moyenne que les non marqueacutes au stade 0+ nrsquoimplique pas que cela soit systeacutematiquement le cas aux stades ulteacuterieurs En effet CAUDRON (1998) et CHAMPIGNEULLE et CACHERA (2003) ont montreacute respectivement sur le Doubs et le Fier que les diffeacuterences de tailles entre marqueacutes et non marqueacutes au stade 0+ sestompaient au stade 1+ et chez les adultes

Par ailleurs lrsquoexistence drsquoune plus grande taille au stade 0+ en automne pour les marqueacutes ne leur garantit pas un meilleur taux de seacutedentarisation En effet plusieurs eacutetudes dont celle de JONSSON et JONSSON (1993) indiquent que le taux de deacutevalaison peut ecirctre plus eacuteleveacute pour les individus agrave plus forte croissance au stade 0+ La deacutevalaison peut donc toucher preacutefeacuterentiellement les individus marqueacutes en raison de leur forte croissance

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Foron du Reposoir

0

20

40

60

80

100

120

140

La Touviegravere Le Reposoir

F du Reposoir F du Reposoir

Long

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tota

le e

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mTaille moyenne des 0+ sur le Foron de Fillinges

0

20

40

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140

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Long

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tota

le e

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m

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Foron du Reposoir

0

20

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140

La Touviegravere Le Reposoir

F du Reposoir F du Reposoir

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le e

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mTaille moyenne des 0+ sur le Foron de Fillinges

0

20

40

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120

140

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Long

ueur

tota

le e

n m

m

33

222 Taille des nageoires pectorales

La figure ci-dessus montre qursquoil existe une diffeacuterence entre marqueacutes et non marqueacutes du rapport entre la longueur de la nageoire pectorale et la longueur totale du poisson

Il a sembleacute important drsquoanalyser plus en deacutetail ce caractegravere morphologique car il peut preacutesager de lrsquoaptitude des truites agrave se maintenir dans nos riviegraveres de montagne

Relation entre la longueur de la nageoire pectorale et la longueur totale des individus marqueacutes et non marqueacutes

5

7

9

11

13

15

17

19

21

23

25

27

30 50 70 90 110 130 150 170Longueur totale en mm

Long

ueur

nag

eoire

pec

tora

le e

n m

mMarqueacuteNon marqueacute

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron du Reposoir

12

14

16

18

20

La Touviegravere Le Reposoir

F du Reposoir F du Reposoir

Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron de Fillinges

12

14

16

18

20

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron du Reposoir

12

14

16

18

20

La Touviegravere Le Reposoir

F du Reposoir F du Reposoir

Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron de Fillinges

12

14

16

18

20

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

34

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Giffre

12

14

16

18

20

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s

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Le Giffre Le Giffre Le Giffre Le Giffre Le Giffre Le Giffre Le FdeTaninges

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LEtroitDenteacute

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Le F deMieussy

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Taille relative moyenne des pectorales sur la Filliegravere

12

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16

18

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Taille relative moyenne des pectorales sur le Borne

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Les Etroits Entremont Beffay St Pierre en F

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Giffre

12

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Le Giffre Le Giffre Le Giffre Le Giffre Le Giffre Le Giffre Le FdeTaninges

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LEtroitDenteacute

Le F deMieussy

Le F deMieussy

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Taille relative moyenne des pectorales sur la Filliegravere

12

14

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18

20

Le J

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LeCrenant

Taille relative moyenne des pectorales sur le Borne

12

14

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18

20

GrandBornand

Les Etroits Entremont Beffay St Pierre en F

Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Chinaillon La Duche LOveacuteran

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Sur les 24 stations ougrave des individus marqueacutes et non marqueacutes coexistent la taille relative des nageoires pectorales est systeacutematiquement plus importante chez les individus naturelsLes truites issues du repeuplement preacutesentent donc des nageoires pectorales de longueur infeacuterieure agrave celle des truites sauvagesCette diffeacuterence morphologique est tregraves importante car le deacuteveloppement des nageoires est un eacuteleacutement deacuteterminant pour la survie du poisson dans son milieu notamment pour la stabiliteacute la reacutesistance au courant et la recherche de nourriture an action de chasse

Il semble donc possible que cette caracteacuteristique anatomique soit le reacutesultat drsquoune adaptation agrave la vie en torrent

BOSAKOWSKI et al (1993) ont eacutegalement observeacutes des reacutesultats comparables chez des truites arc-en-ciel et des truites brunes de plus grande taille entre poissons drsquoeacutelevage et poissons sauvages Dans cette eacutetude les poissons deacutelevage preacutesentaient des nageoires nettement plus courtes (10-50) que les poissons sauvages Selon les auteurs cette diffeacuterence semblait ecirctre causeacutee par les conditions de vie des poissons dans les bassins des piscicultures(agression intraspeacutecifique stress qualiteacute de leau et densiteacutes de poissons) qui provoquaient une eacuterosion des nageoires

Dans le cas preacutesent les poissons de repeuplement ont eacuteteacute introduits agrave des stades preacutecoces dans le milieu et ont eacuteteacute preacuteleveacutes 4 agrave 5 mois apregraves leur introduction En conseacutequence ils ont veacutecu peu de temps en pisciculture et ont par contre passeacute lessentiel de leur vie dans le mecircme milieu naturel que les poissons sauvages Ainsi il semble que ce dimorphisme de la nageoire entre poissons sauvages et introduits soit drsquoorigine geacuteneacutetique Une eacutetude de RIDDELL et al (1981) a montreacute chez le saumon que les diffeacuterences de deacuteveloppement de nageoires eacutetaient une adaptation des poissons agrave leur milieu qui preacutesentait une origine geacuteneacutetiqueIl est donc tout agrave fait probable qursquoun pheacutenomegravene similaire se rencontre chez la truite fario et que les truites sauvages soient mieux adapteacutees sur le plan morphologique (gracircce agrave des diffeacuterences geacuteneacutetiques) aux conditions du milieu que les poissons introduits mecircme agrave des stades preacutecoces

Outre lrsquoaspect purement geacuteneacutetique les facteurs environnants peuvent eacutegalement jouer un rocircle important En effet McLAUGHLIN et al (2002) ont montreacute que cette diffeacuterence au niveau des nageoires peut eacutegalement ecirctre due agrave des caracteacuteristiques du milieu environnant dans les premiegraveres semaines de vie des poissons En effet plusieurs lots drsquoune mecircme souche de saumon de fontaine soumis degraves lrsquoeacuteclosion agrave des conditions de vie diffeacuterentes montrent des diffeacuterences dans le deacuteveloppement des nageoires Ainsi degraves les premiegraveres semaines les poissons exposeacutes agrave un fort courant sont pourvus de nageoires plus longues

Il est donc possible que les alevins produits en pisciculture nrsquoeacutetant pas exposeacutes agrave des courants importants au cours de leurs premiegraveres semaines de vie deacuteveloppent des nageoires pectorales moins longues que les individus sauvages

Il y a probablement pour cette caracteacuteristique morphologique des interactions combinant geacuteneacutetique et conditions environnementales

Cette diffeacuterence morphologique peut eacutegalement avoir une importance dans la compeacutetition entre poissons sauvages et introduits notamment au stade juveacutenile En effet GIBSON (1973) a deacutemontreacute limportance des nageoires dans la compeacutetition interspeacutecifique

36

entre le saumon atlantique (Salmo salar L) et le saumon de fontaine (Salvenius fontinalis) deux poissons consommant la mecircme nourriture Le fait de posseacuteder des nageoires pectorales plus deacutevelopper permet au saumon atlantique de se maintenir dans les courants pour se nourrir tout en deacutepensant moins drsquoeacutenergie

Dans le cas des torrents haut-savoyards une compeacutetition intraspeacutecifique entre truites sauvages et introduites comparable agrave leacutetude de GIBSON peut se deacutevelopper La diffeacuterence morphologique entre les truites sauvages et issues du repeuplement peut donc avoir une influence lors de la compeacutetition entre ces deux types dindividus

37

3 Premiegraveres implications pour la gestion

En fonction des reacutesultats obtenus lors de la campagne de preacutelegravevements 2002 des orientations de gestion sont proposeacutees pour chaque riviegravere eacutetudieacutee Certaines propositions impliquent des changements relativement importants des pratiques actuelles de gestion

Lrsquoeacutetude de lrsquoefficaciteacute des repeuplements srsquoappuient sur une deacutemarche scientifique rigoureuse dans lrsquointeacuterecirct des gestionnaires directs (AAPPMA) puisqursquoelle permet agrave ces derniers de prendre des deacutecisions en srsquoappuyant sur des reacutesultats concrets et indiscutables Elle est conduite dans un souci drsquoeacutevaluer en toute objectiviteacute les pratiques drsquoalevinage dans le seul but drsquoameacuteliorer la gestion actuelle des populations et des milieux Concregravetement elle permet de connaicirctre rapidement les zones ougrave lrsquoalevinage en truite fario est inefficace et donc inutile et les zones ougrave celui-ci est efficace et donc neacutecessaire

En plus des reacutesultats obtenus gracircce aux marquages des juveacuteniles les propositions prennent en compte les premiers reacutesultats issus des pecircches de sondage drsquoadultes reacutealiseacutees pour le programme INTERREG (reacutedaction en cours) Lrsquointeacutegration des diffeacuterentes donneacutees (marquage juveacutenile + adultes) permet de faire des propositions coheacuterentes selon un diagnostic le plus complet possible de la population de truite preacutesente

31 Bassin du Borne

Sur les riviegraveres du bassin du Borne les orientations de gestion proposeacutees ci-apregraves restent conformes agrave celles deacutejagrave eacutevoqueacutes par CAUDRON et CHAMPIGNEULLE (2002)

Arrecirct du repeuplement selon les pratiques actuelles sur lrsquoensemble du cours principal Cette proposition est motiveacutee par deux principales raisons

- Lrsquoalevinage est inefficace agrave lrsquoamont du seuil drsquoEntremont car apregraves plus de 15 ans il nrsquoa pas permis drsquoinstaller une population en place eacutequilibreacutee

- Il semble impeacuteratif de preacuteserver lrsquoimportante population de truite sauvage preacutesente agrave lrsquoaval du seuil drsquoEntremont Les reacutesultats geacuteneacutetiques indiquent que la population preacutesente est une population sauvage qui nrsquoa pas eacuteteacuteimplanteacutee suite agrave lrsquoalevinage Elle preacutesente un degreacute de pureteacute geacuteneacutetique important Cette population repreacutesente un patrimoine unique dans le Faucigny Le but drsquoarrecircter les alevinages sur ce secteur est drsquoeacuteviter les hybridations qui peuvent entraicircner une perte de plasticiteacute geacuteneacutetique et une deacutegeacuteneacuterescence de la souche sauvage actuelle

Arrecirct du repeuplement sur lrsquoaval de lrsquoOveacuteran Ce secteur est utiliseacute comme zone de reproduction par les geacuteniteurs du Borne et la reproduction naturelle y est abondante Lrsquoalevinage nrsquoest donc pas neacutecessaire et risque comme sur le Borne de provoquer une hybridation de la population naturelle

Essayer drsquoinstaller une population naturelle agrave lrsquoamont du seuil drsquoEntremont par transferts de geacuteniteurs

Sur les autres affluents deux sceacutenarii de gestion peuvent ecirctre envisageacutes selon la volonteacute politique des gestionnaires directs

Sceacutenario ndeg1 vision patrimoniale

38

- Arrecirct du repeuplement en truite drsquoorigine Atlantique pendant 3 anneacutees conseacutecutives pour diminuer leur preacutesence sur le bassin

- Puis reprise de lrsquoalevinage pendant uniquement 3 anneacutees agrave partir de poissons sauvages issus du Borne pour essayer drsquoinstaller une population naturelle

Sceacutenario ndeg2 vision halieutique- Maintien des pratiques drsquoalevinage en atlantique pour soutenir

artificiellement le stock de poissons dans un inteacuterecirct uniquement halieutique Attention cette pratique risque de provoquer par deacutevalaison des individus introduits une hybridation des poissons sauvages preacutesents dans le Borne

Eventuellement repeuplement en truites Arc en Ciel surdensitaires sur des secteurs preacutecis du Borne pendant la peacuteriode estivale afin de contenter une certaine cateacutegorie de pecirccheurs Les repeuplements en Arc en Ciel ne risquent pas de provoquer drsquohybridation de la souche fario locale Attention prendre des preacutecautions aupregraves des fournisseurs concernant la qualiteacute sanitaire des poissons

32 Bassin du Giffre

Les propositions sur le bassin du Giffre prennent en compte les reacutesultats du marquage mais eacutegalement la situation actuelle de la riviegravere suite agrave lrsquoeacuteboulement de Sixt Fer agrave Cheval

Ne pas aleviner le cours principal du Giffre en alevins de fario pendant 5 anneacutees conseacutecutives Cette proposition est motiveacutee par les raisons suivantes

- Il est impossible de savoir comment va eacutevoluer dans les prochains mois et les prochaines anneacutees le glissement agrave lrsquoamont de Sixt Il semble donc risqueacute drsquoentreprendre un alevinage pour installer une nouvelle population

- Les reacutesultats des marquages sur le Giffre sont tregraves contrasteacutes Sauf au niveau de Sixt ils montrent qursquoil existait avant le glissement une reproduction naturelle importante et capable de soutenir une population

- Les reacutesultats geacuteneacutetiques reacutecents indiquent que les populations en place sont en majoriteacute drsquoorigine atlantique mais qursquoil existe encore des individus meacutediterraneacuteens non hybrideacutes jusque dans les zones amont Ces reacutesultats prouvent qursquohistoriquement la souche meacutediterraneacuteenne eacutetait bien preacutesente sur lrsquoensemble du Giffre

- Il est envisageable que cette souche sauvage eacutegalement preacutesente sur les parties basses des affluents recolonise naturellement le Giffre

- Lrsquoexemple du Borne montre qursquoapregraves une catastrophe la riviegravere a eacuteteacute recoloniseacutee par une souche sauvage malgreacute des alevinages massifs Les reacutesultats obtenus sur cette riviegravere doivent servir de base de reacuteflexions pour la nouvelle gestion agrave entreprendre sur le Giffre

- Entre le Risse et Marignier la population de truites avant le glissement eacutetait deacutejagrave totalement deacuteseacutequilibreacutee et en quasi disparition (peu de juveacuteniles quasi absence de geacuteniteurs et absence de classes drsquoacircges intermeacutediaires) malgreacute les alevinages massifs sur ce secteur

39

Reacutealiser un bilan de lrsquoimpact du glissement de terrain sur le peuplement piscicole

- Une eacutetude piscicole sera reacutealiseacutee tregraves prochainement (2004 ou 2005) sur le Giffre dans le cadre du contrat de riviegravere Cette eacutetude permettra de faire un premiereacutetat des lieux complet du peuplement piscicole suite au glissement

Accomplir un diagnostic de lrsquoeacutetat de recolonisation du Giffre par les populations naturelles

- En lrsquoabsence drsquoalevinage il sera possible de reacutealiser en 2008 un bilan des populations de truites installeacutees sur le Giffre

- A partir de lrsquoeacutetat de la population agrave cette eacutepoque un plan drsquoalevinage coheacuterent en truite fario pourra ecirctre eacutetabli pour permettre drsquoinstaller de nouvelles populations ou de soutenir des populations preacutesentes

Mettre en place des deacuteversements de truites Arc en Ciel pendant toute la peacuteriode drsquoarrecirct de lrsquoalevinage en fario Attention prendre des preacutecautions aupregraves des fournisseurs concernant la qualiteacute sanitaire des poissons

Reacuteintroduire lrsquoOmbre commun sur la plaine de Samoeumlns et agrave lrsquoaval de la confluence avec le Risse

Arrecirct de lrsquoalevinage sur lrsquoensemble du Risse sur lrsquoaval du Foron de Mieussy et sur lrsquoEtroit Denteacutee

- Sur ces riviegraveres le suivi du marquage a montreacute que lrsquoalevinage nrsquoeacutetait pas neacutecessaire pour soutenir les populations de truites preacutesentes

Maintenir lrsquoalevinage sur lrsquoamont du Foron de Mieussy (vers Sommand) et lrsquoamont du Foron de Taninges (Bonnavaz)

- Sur ces secteurs le suivi du marquage a montreacute que les juveacuteniles preacutesents dans le milieu naturel eacutetaient en majoriteacute des individus introduits

33 Le Foron du Reposoir

Les propositions de gestion sur le Foron du Reposoir sont

Maintenir les alevinages actuels avec la souche Chazey Bons Rhodanienne

Suivre lrsquoeacutevolution de la population pour savoir si cet alevinage permet drsquoinstaller une population fonctionnelle

- Ce suivi peut comprendre des pecircches de sondages en deacutebut de peacuteriode de reproduction pour voir si les poissons adultes deviennent matures des releveacutes de frayegraveres sur la riviegravere pour savoir si les poissons se reproduisent et de nouveaux preacutelegravevements de poissons pour suivre lrsquoeacutevolution du taux de marqueacutes dans la population

34 Bassin de la Filliegravere

Les orientations pour une gestion coheacuterente des populations de la Filliegravere sont les suivantes

40

Arrecirct de lrsquoalevinage sur le cours principal de la Filliegravere sur le Crenant et sur lrsquoaval du Flan

- Sur ces 3 riviegraveres lrsquoalevinage nrsquoest pas neacutecessaire car il ne permet pas de soutenir les populations preacutesentes et de plus la reproduction naturelle est tregraves importante

- Sur la Filliegravere les pecircches drsquoadultes dans le cadre du programme INTERREG ont mis en eacutevidence la preacutesence drsquoune population sauvage drsquoorigine meacutediterraneacuteenne Il semble important drsquoentreprendre une mesure de conservation de cette souche en arrecirctant lrsquoalevinage pour eacuteviter lrsquohybridation

- Sur lrsquoamont du Flan il est neacutecessaire de continuer le suivi des poissons marqueacutes pour savoir si lrsquoalevinage doit ecirctre maintenu

Sur le Daudens deux sceacutenarii de gestion peuvent ecirctre envisageacutes selon la volonteacute politique des gestionnaires directs

Sceacutenario ndeg1 vision patrimoniale- Arrecirct du repeuplement en truite drsquoorigine Atlantique pendant 3 anneacutees

conseacutecutives pour diminuer leur preacutesence sur le bassin- Commencer les proceacutedures afin de rendre le seuil du Plot

franchissable pour les geacuteniteurs de la Filliegravere- Reacutealiser un bilan notamment deacutemographique de la population en place

apregraves lrsquoarrecirct de lrsquoalevinage- Puis reprise de lrsquoalevinage pendant uniquement 3 anneacutees agrave partir de

poissons sauvages issus de la Filliegravere pour essayer drsquoinstaller une population naturelle

Sceacutenario ndeg2 vision halieutique- Maintien des pratiques drsquoalevinage en atlantique pour soutenir

artificiellement le stock de poissons dans un inteacuterecirct uniquement halieutique Attention cette pratique risque de provoquer par deacutevalaison des individus introduits une hybridation des poissons sauvages preacutesents dans la Filliegravere

35 Le Foron de Fillinges

Les reacutesultats obtenus sur le Foron de Fillinges ont conduit agrave formuler les propositions de gestion suivantes

Arrecirct de lrsquoalevinage sur lrsquoensemble du Foron de Fillinges- Quelque soit la souche utiliseacutee et les quantiteacutes introduites les poissons

alevineacutes ne repreacutesentent qursquoune tregraves faible minoriteacute des poissons preacutesents dans le milieu Le Foron abrite une population naturelle fonctionnelle et eacutequilibreacutee

Suivi de la population suite agrave lrsquoarrecirct du repeuplement- Reacutealisation de 5 stations de pecircches eacutelectriques la derniegravere anneacutee de

lrsquoalevinage afin de reacutealiser un eacutetat des lieux preacutecis de la population de truites et du peuplement piscicole

- Reacutealisation drsquoun nouveau bilan de la population du Foron respectivement 3 ans puis 6 ans apregraves lrsquoarrecirct de lrsquoalevinage

41

4 Investigations suppleacutementaires

Suite aux premiers reacutesultats obtenus lors de la campagne 2002 des investigations suppleacutementaires permettant de preacuteciser certains points seront reacutealiseacutees

Reacutealiser une analyse bacteacuteriologique des diffeacuterents lots de poissons alevineacutes qui ont transiteacutes dans les piscicultures associatives Cette recherche de pathologie permettra de savoir si les poissons issus de pisciculture sont porteurs drsquoune maladie bacteacuterienne avant drsquoecirctre introduits dans le milieu ou si ils contractent la maladie dans le milieu naturel

Rechercher les raisons pour lesquelles on nrsquoobserve pas drsquoalevins naturels sur certains secteurs Les causes drsquoune telle situation peuvent ecirctre

- Lrsquoabsence totale de geacuteniteurs dans la population Les poissons nrsquoont pas le temps de devenir adulte (3+) et sont captureacutes avant par les pecirccheurs

- La preacutesence drsquoadultes non matures Les poissons deviennent adultes mais sont immatures (eacutetat sanitaire des poissons souche geacuteneacutetiquement deacutegeacuteneacutereacutee)

- Survie nulle durant la phase de vie sous graviers Les poissons pondent mais les œufs nrsquoarrivent pas agrave se deacutevelopper et la mortaliteacute est totale

Sur les secteurs du Chinaillon de la Duche de lrsquoOveacuteran amont et du Foron de Mieussy amont (Sommand) les actions suivantes peuvent ecirctre entreprises

- Pecircches eacutelectriques de sondage en deacutebut de la peacuteriode de reproduction pour savoir si les poissons deviennent matures

- Releveacutes de frayegraveres permettant drsquoobserver ou non une activiteacute de reproduction- Mise en place drsquoincubateurs-tests contenant des œufs de truites pour connaicirctre le taux

de survie des œufs dans les frayegraveres

Reacutealiser des preacutelegravevements suppleacutementaires aux classes drsquoacircge supeacuterieures (1+ et 2+) sur certaines stations pour voir lrsquoeacutevolution du taux de marqueacutes au cours des anneacutees Ces recherches suppleacutementaires peuvent ecirctre effectueacutees sur 8 cours drsquoeau ougrave le taux de marqueacutes deacutepasse 60 au stade 0+

Le ruisseau de la Duche amontLe ruisseau du Chinaillon amontLe Foron du ReposoirLe Risse avalLe Foron de Taninges amont (Bonnavaz)Le Foron de Mieussy amont (Sommand)Le Daudens amont et avalLe Flan amont

Dans les eacutetudes preacuteceacutedentes reacutealiseacutees sur le Fier (CAUDRON et CHAMPIGNEULLE 2002) et sur le Doubs (CHAMPIGNEULLE et al 2002) les taux de marqueacutes aux stades 1+ et 2+ dans la population en place srsquoeffondraient et devenaient tregraves faibles ou nuls

Pour informations le graphique suivant montre lrsquoeacutevolution du taux de marqueacutes agrave diffeacuterents stades sur les stations ougrave le taux de 0+ marqueacutes eacutetait eacuteleveacute

42

Les reacutesultats montrent agrave part pour une station une chute importante des taux de marqueacutes entre les stades 0+ et 1+ Cette chute se poursuit eacutegalement au stade 2+Ces reacutesultats obtenus sur le Fier et le Doubs semblent laisser peu drsquoespoirs sur le devenir des poissons marqueacutes sur les bassins eacutetudieacutes en 2002

Reacutesultats sur leacutevolution du taux de m arqueacutes aux diffeacuterents stades obtenus lors des eacutetudes preacuteceacutedentes sur le Fier et le Doubs

0102030405060708090

100

0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 0+ 1+ 0+ 1+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+

Station A Station B Station C StationD

StationE

StationF

Station A Station B StationC

Stations et stades

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Le Fier Le Doubs

Reacutesultats sur leacutevolution du taux de m arqueacutes aux diffeacuterents stades obtenus lors des eacutetudes preacuteceacutedentes sur le Fier et le Doubs

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Le Fier Le Doubs

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7

Ils se situent dans la zone anteacutero-dorsale de la capsule auditive et interviennent dans le maintien des postures et de leacutequilibre des poissons

Les sagittae plus volumineux et plus faciles agrave preacutelever ont donc eacuteteacute utiliseacutes pour mener agrave bien cette eacutetude

Lotolithe croit par apposition dun nouveau mateacuteriel sur sa surface Ce pheacutenomegravene cyclique fonction du meacutetabolisme du calcium et de la synthegravese des acides amineacutes conduit agrave la formation danneaux saisonniersLors du marquage agrave lalizarine Red S les truites ne sont acircgeacutees que de quelques semaines et de ce fait les otolithes sont de tregraves petite taille Le fluorochrome se fixe sur les structures en voie de mineacuteralisation (os dents cartilages calcifieacutes otolithes) Leur calcification se poursuit naturellement avec la croissance du poisson et ainsi seule la partie centrale de lotolithe correspondant agrave sa taille lors de la coloration est marqueacutee

Lalizarine Red S absorbe les rayons UV et eacutemet une fluorescence dans le spectre visible Cette proprieacuteteacute est utiliseacutee pour le repeacuterage du marqueur avec un microscope eacutequipeacute pour leacutepifluorescence

yeux

otolithes

cerveau

yeux

otolithes

cerveau

Photo et scheacutema de localisation des otolithes et du marquage

153 Extraction et lecture des otolithes

Les diffeacuterentes phases permettant la lecture des otolithes sont

Deacutecoupe et enlegravevement avec des ciseaux de la moitieacute infeacuterieure de la tecircte au-preacutealablement partiellement deacutecongeleacutee

Deacutecoupage en deux (plan sagittal) de la moitieacute supeacuterieure de la tecircte en faisant entrer la pointe infeacuterieure du ciseau dans le passage de la moelle eacutepiniegravere (canal rachidien) Ce mode de deacutecoupe seacutepare et sectionne les capsules olfactives contenant les sagittae qui apregraves que le cerveau a eacuteteacute enleveacute sont alors directement accessibles avec des pinces fines dans chaque demi-section de la partie supeacuterieure de la tecircte

Extraction des sagittae agrave lrsquoaide de pinces fines Apregraves avoir enleveacute les matiegraveres organiques reacutesiduelles sur un papier absorbant les otolithes sont placeacutes dans untube Eppendorf et stockeacutes agrave lrsquoabri de la lumiegravere

8

Collage de chaque otolithe (face convexe vers lrsquoexteacuterieur) sur une lame de verre mince agrave lrsquoaide drsquoune thermocolle (colle Crystalbonb Aremco ndeg 509) chauffeacutee agrave 120 degC Durant cette eacutetape il est important drsquoenlever les bulles drsquoair existantes celles-ci pouvant eacutemettre une fluororescence parasite

Polissage des otolithes sur des plaques de papiers abrasifs de granulomeacutetrie diffeacuterente (Escil PSA G 400 G 800 et G 1200) Lrsquoeacutevolution du polissage est suivi par plusieurs controcircles sous microscope afin drsquoatteindre et de ne pas deacutepasser le centre de lrsquootolithe

Lecture de lrsquootolithe sous un microscope eacutequipeacute pour lrsquoeacutepifluorescence car lrsquoARS est deacutetectable par la fluorescence qursquoil eacutemet lorsquil est irradieacute en lumiegravere ultraviolette La lecture est faite le jour mecircme du polissage car la lisibiliteacute de la marque diminue avec le temps impliquant alors la neacutecessiteacute drsquoun leacuteger repolissage

Lorsque lrsquootolithe a eacuteteacute marqueacute celui-ci montre en son centre un anneau ou un noyau (selon la preacutecociteacute du marquage etou positionnement du plan de polissage par rapport au nucleacuteus) apparaissant rouge fluorescent (jeu de filtres Zeiss ndeg15 BP 54612 FT 580 LP 590 ) ou jaune orangeacute (jeu de filtres Zeiss ndeg9 BP 450-490 FT 510 LP 520)

Lorsque lrsquootolithe a eacuteteacute marqueacute celui-ci montre en son centre un anneau fluorescent jaune orangeacute ou rouge fluorescent selon le filtre utiliseacute

Enlegravevement de la moitieacute infeacuterieure de la tecircte agrave lrsquoaide de ciseaux

Emplacement de lotolitheEmplacement de lotolithe

Tecircte apregraves dissection Localisation de lrsquootolithe

9

Extraction de lrsquootolithe Otolithes colleacutes sur lame mince Ponccedilage de lrsquootolithe

Observation de la lame mince au microscope

05mm 05mmVue au microscope drsquoun otolithe ponceacute Otolithe marqueacute (anneau fluo vert-jaune)

16Symptocircmes pathologiques observeacutes

161 La maladie reacutenale prolifeacuterative (MRP ou PKD ou teacutetracapsulose)

Selon ESCHER et al (Fischnetz-info mars et deacutecembre 2001) cette maladie est provoqueacutee par un seul parasite Tetracapsula bryosalmonae (myxosoaire) Chez les poissons on le rencontre chez les salmonideacutes et le brochet les truites eacutetant particuliegraverement toucheacutees Le taux de mortaliteacute peut ecirctre fort chez ces derniegraveres (10 agrave 100) surtout sur les estivaux

Pour que les symptocircmes (affaiblissement contraction dautres maladies) se deacuteveloppent la tempeacuterature de leau doit ecirctre supeacuterieure agrave 15degC De plus il semble que des facteurs tels quun faible taux doxygeacutenation ou une pollution chimique favoriseraient la maladie

10

Afin de savoir si la truite en preacutesence est infecteacutee il faut observer ses reins En effet un poisson ayant deacuteveloppeacute la maladie a des reins grossis et dune coloration inhabituelle

Le mode de propagation de la maladie et le cycle complet du parasite ne sont que partiellement connus Tetracapsula parasite les bryozoaires de petits organismes filtreurs qui forment des colonies de quelques centimegravetres de diamegravetre sur diffeacuterents types de substrats et que lon rencontre dans la plupart des lacs et cours deau

Les parasites se multiplient dans les bryozoaires ils ont alors une taille de 20 μm et se concentrent dans des sortes de grandes poches de 350 μm de diamegravetre Le parasite peacutenegravetre dans le poisson sous forme de petites spores agrave travers les cellules du mucilage de la peau et ce au cours de la premiegravere minute apregraves lentreacutee en contact avec lagent pathogegravene A laide de la circulation sanguine les parasites atteignent les reins ougrave ils forment diffeacuterents stades de deacuteveloppement et provoquent de violentes reacuteactions inflammatoires Il en reacutesulte les diffeacuterentssymptocircmes deacutecrits preacuteceacutedemment

Le parasite drsquoun diamegravetre de 5 agrave 20 microm a pu ecirctre observeacute dans les vaisseaux sanguins de presque tous les organes (sauf du cerveau de la moelle eacutepiniegravere et des yeux) Les spores sont libeacutereacutees dans lrsquoeau avec lrsquourine du poisson et sont probablement absorbeacutees de nouveau par les bryozoaires

Les truites qui survivent ou qui ont deacutejagrave eacuteteacute infecteacutees sans deacutevelopper la maladie sont en geacuteneacuteral immuniseacutees lanneacutee suivante

Poisson atteint pas la PKD (reins gonfleacutes et preacutesence de nodules)

La PKD provoque chez les jeunes truites une mortaliteacute variant de 10 agrave 100 des individus toucheacutesLe deacuteveloppement du parasite est favoriseacute en eacuteteacute lorsque la tempeacuterature de lrsquoeau atteint 15degC

162 Pathologies bacteacuteriennes

Des symptocircmes probablement dus agrave une pathologie bacteacuterienne ont eacuteteacute mis en eacutevidence lors de cette eacutetude En effet un pourcentage non neacutegligeable de truites eacutetait affecteacute par des rougeurs de type heacutemorragie agrave la base des nageoires

11

Selon MORAND (com pers) deux maladies bacteacuteriennes peuvent engendrer ces symptocircmes (la furonculose et la yerciniose) Ces deux maladies sont preacutesentes dans le monde entier et atteignent tout particuliegraverement les eacutelevages de salmonideacutes

Elles peuvent ecirctre favoriseacutees par des conditions particuliegraveres du milieu environnant tempeacuterature de leau eacuteleveacutee (supeacuterieure agrave 10 degC) une charge organique importante ou encore une pollution diminuant les deacutefenses immunitaires du poissonhellip

Selon la graviteacute de laffection ces pathologies peuvent entraicircner de lourds taux de mortaliteacute atteignant jusquagrave 70 dans certains cas (MOURRIERAS 1995)

Les heacutemorragies observeacutees agrave la base des nageoires sont la conseacutequence drsquoune infection bacteacuterienne pouvant provoquer drsquoimportantes mortaliteacutes

17Utilisation du SIG de la Feacutedeacuteration de pecircche de Haute-Savoie

Les donneacutees du programme pilote de marquage et du programme INTERREG sont inteacutegreacutees dans un SIG (Systegraveme dInformation Geacuteographique MapInfo) mis en place agrave la Feacutedeacuteration de pecircche de Haute-Savoie et agrave lINRA de Thonon

Ainsi toutes les informations relatives aux cours deau du deacutepartement seront consigneacutees dans cette base de donneacutees (pente longueur preacutesence de seuils infranchissables caracteacuteristiques physico-chimiques IBGN hydrologie occupation des bassins versantshellip) Il en sera de mecircme pour les donneacutees truites (repeuplement densiteacute biomasses croissance structure dacircge pathologie geacuteneacutetiquehellip)

Lapproche finale visera agrave rechercher les relations existant entre ces deux groupes de donneacutees spatialiseacutees Une toute premiegravere deacutemarche a eacuteteacute partiellement tenteacutee dans le cas du preacutesent rapport dont les donneacutees ont eacuteteacute inteacutegreacutees dans le SIG en cours de construction

12

2 Reacutesultats et discussions

Ce chapitre preacutesente les reacutesultats obtenus sur les bassins eacutetudieacutes lors de la campagne de preacutelegravevements 2002 agrave savoir

Le GiffreLe BorneLa FilliegravereLe Foron de ScionsiezLe Foron de Fillinges

Lors de la campagne 2002 1703 poissons au stade 0+ ont eacuteteacute eacutechantillonneacutes en milieu naturel et eacutetudieacutes en laboratoire

21Taux de marquage sexe ratio et pathologie

211 Le Borne

Sur le bassin du Borne 5 stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal et 3 sur des affluents Au total ce sont 392 poissons 0+ qui ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

Sur le cours principal

Les taux de marqueacutes varient fortement sur le cours principal du Borne (18 agrave 100) On observe un gradient amont-aval du taux de marqueacutes qui peut ecirctre mis en relation avec la preacutesence drsquoun obstacle partiellement infranchissable pour les geacuteniteurs au niveau drsquoEntremont

Ainsi deux grandes zones peuvent ecirctre distingueacutees sur le Borne

La zone amont du seuil drsquoEntremont ougrave la majoriteacute des juveacuteniles sont issus du repeuplement (90 agrave 100)

On observe sur ce secteur une tregraves faible reproduction naturelle en raison drsquoune quasi-absence de poissons adultes La situation de la population de truites est donc tregraves critique Si le repeuplement permet de drsquoobserver des 0+ il nrsquoa pas permis drsquoinstaller une population fonctionnelle

La zone aval du seuil drsquoEntremont ougrave la majoriteacute des individus preacutesents au stade 0+ sont des poissons naturels

En effet le taux de marqueacutes varie de 18 agrave 49 Les pecircches de sondage Interreg ont montreacute la preacutesence drsquoune importante population de truites sauvages drsquoorigine meacutediterraneacuteenne La population est eacutequilibreacutee et naturellement fonctionnelle puisqursquoon observe une forte reproduction naturelle et de nombreux geacuteniteurs

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Sur les Affluents

Sur les 3 affluents eacutetudieacutes la situation est tregraves simple En effet soit on observe 0 de marqueacutes soit 100

- Sur lrsquoOveacuteran aval aucun poisson marqueacute nrsquoa eacuteteacute trouveacute puisqursquoil nrsquoy a pas eu de repeuplement sur ce secteur en 2002 Le reacutesultat obtenu montre une importante reproduction naturelle des geacuteniteurs du Borne qui remontent sur lrsquoaval de ce cours drsquoeau

- Sur la Duche et le Chinaillon il y a absence totale de reproduction naturelle puisque 100 des 0+ eacutechantillonneacutes sont marqueacutes Pourtant on observe de nombreux poissons adultes sur ces secteurs susceptibles drsquoecirctre des geacuteniteurs ainsi que diffeacuterentes classes drsquoacircge Lrsquoeacutequilibre de ces populations est artificiellement maintenu par les alevinages

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

- Toutes les stations eacutetudieacutees ne sont pas concerneacutees par ces symptocircmes de maladies- Les maladies bacteacuteriennes semblent toucher majoritairement les poissons introduits- Cependant les 0+ de lrsquoOveacuteran aval tous naturels sont infecteacutes agrave 15 Ce reacutesultat

peut refleacuteter une contamination par deacutevalaison provenant drsquoindividus atteints situeacutes plus en amont de lrsquoOveacuteran ou une contamination naturelle par des agents pathogegravenes preacutesents dans le milieu

- Les poissons marqueacutes peuvent ecirctre contamineacutes agrave un taux non neacutegligeable pouvant atteindre plus de 30

Pourcentage dindividus preacutesentant des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

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Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Le sexe ratio est relativement eacutequilibreacute pour les marqueacutes comme pour les non marqueacutes Seule une station sur le Borne (Beffay) montre 85 de macircle dans la population de 0+

- Seules 2 stations montrent des macircles matures au stade 0+- Le pourcentage de macircles matures au stade 0+ est plus important chez les non

marqueacutes que chez les marqueacutes

Pourcentage de macircles au stade 0+

0102030405060708090

GrandBornand

Les Etroits Entremont Beffay St Pierre enF

Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Chinaillon La Duche LOveacuteran

Pourcentage de macircles matures au stade 0+

0

10

20

30

40

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GrandBornand

Les Etroits Entremont Beffay St Pierre enF

Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Chinaillon La Duche LOveacuteran

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Borne

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Pourcentage de macircles au stade 0+

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GrandBornand

Les Etroits Entremont Beffay St Pierre enF

Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Chinaillon La Duche LOveacuteran

Pourcentage de macircles matures au stade 0+

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GrandBornand

Les Etroits Entremont Beffay St Pierre enF

Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Chinaillon La Duche LOveacuteran

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Borne

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

16

212 Le Giffre

Sur le bassin du Giffre 6 stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal et 7 sur des affluents Au total ce sont 536 poissons 0+ qui ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

Sur le cours principal

La carte de synthegravese des reacutesultats met en eacutevidence des taux de marqueacutes tregraves contrasteacutes variant entre 0 et 100 Sauf deux cas particuliers la campagne de preacutelegravevements a permis de montrer qursquoune reproduction naturelle existait sur lrsquoensemble du Giffre

Il est possible de distinguer trois zones successives sur ce cours deau

La zone aval est composeacutee de la station Pont du Giffre ougrave le taux de marqueacutes est de 74 Cette station sur le Giffre doit ecirctre rapprocheacutee des stations eacutetudieacutees sur le Risse (station laquo Risse aval St Jeoire raquo) et le Hisson(laquo station La Pallud raquo) pour mieux comprendre le fonctionnement de la population

- Sur le Giffre aval la situation semble tregraves critique La station dite laquo Pont du Giffre raquosrsquoeacutetend de lrsquoamont de Marignier agrave lrsquousine du Pont du Giffre soit sur environ 25 km Sur cette distance seulement 31 0+ ont pu ecirctre captureacutes De plus les pecircches drsquoadultes dans le cadre drsquoInterreg montrent un deacuteficit inquieacutetant de geacuteniteurs sur ce secteur ainsi qursquoune surabondance de Chabot La situation du bas Giffre montre une population de truitetotalement deacuteseacutequilibreacutee loin du potentiel de la riviegravere et qui ne peut pas ecirctre reacutehabiliteacutee par le seul fait de lrsquoalevinage Cette situation peut ecirctre le reacutesultat du faible deacutebit reacuteserveacute qui appauvrit lrsquohabitat aquatique et provoque des eacuteleacutevations de tempeacuterature inquieacutetantes Les reacutesultats de pecircche drsquoinventaire dans la reacuteserve de Marignier montrent que les poissons sont concentreacutes agrave lrsquoaval immeacutediat des seuils ougrave lrsquoon note la preacutesence de fosses de tempeacuteratures plus faibles et drsquoune meilleure oxygeacutenation

La zone moyenne situeacutee entre le barrage de Mieussy et Samoeumlns qui est composeacutee des stations laquo aval barrage Taninges raquo laquo Theacuteziegraveres raquo et laquo Montessuit raquo Sur ce secteur les 0+ marqueacutes sont en minoriteacutes puisqursquoils repreacutesentent 11 agrave 38 du peuplement

- Sur le Giffre aval barrage de Taninges le secteur nrsquoest pas alevineacute il est donc normal que pregraves de 90 des poissons ne soient pas marqueacutes Les 0+ marqueacutes proviennent certainement du ruisseau de lrsquoEtroit Denteacute qui est fortement alevineacute et agrave partir duquel une deacutevalaison doit avoir lieu- Le secteur des laquo Theacuteziegraveres raquo et de laquo Montessuit raquo bien que reacuteguliegraverement alevineacute montre un taux important drsquoalevins naturels (62 agrave 77) Ce reacutesultat est tout agrave fait en accord avec le suivi de la reproduction naturelle et le recensement de frayegraveres reacutealiseacute par lrsquoAAPPMA du Faucigny et le CSP en 1999 En effet de nombreuses frayegraveres naturelles avaient eacuteteacute observeacutees sur ce site Le peuplement drsquoadultes nrsquoest pas tregraves important mais est en rapport avec les potentialiteacutes du milieu

17

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18

La zone amont caracteacuteriseacutee par les stations laquo Reveacute-Peacuteret raquo et laquo amont Tines raquo ougrave le taux de marqueacutes varie de 70 agrave 79

- Pour ces deux stations la population de juveacuteniles est faible et ils sont majoritairement marqueacutes Cependant au stade adulte les pecircches Interreg montrent une majoriteacute de poissons drsquoorigine meacutediterraneacuteenne La forte contribution de poissons introduits au stade 0+ ne semble pas se retrouver au stade adulte Les conditions de vie dans ce milieu sont tregraves difficiles et ne permettent pas drsquoatteindre des densiteacutes de poissons importantes

Sur les Affluents

Le Risse - Le Hisson montre une majoriteacute drsquoalevins naturels alors que les preacutelegravevements ont eacuteteacute reacutealiseacutes seulement deux mois apregraves le repeuplement Ce cours drsquoeau possegravede un fort potentiel de frai qui est utiliseacute notamment par les geacuteniteurs du Risse- Sur lrsquoaval du Risse le taux de marqueacutes est de 68 Il est le reflet drsquoun alevinage en quantiteacute importante sur le secteur (10 000 alevins) Les alevins naturels repreacutesentent tout de mecircme plus de 30 trois mois apregraves le repeuplement De plus les eacutechantillonnages drsquoadultes reacutealiseacutes sur ce secteur dans le cadre drsquoInterreg ont mis en eacutevidence une quantiteacute importante de geacuteniteurs sauvages La population sur ce secteur est agrave mettre en eacutevidence avec celle du Hisson puisque certains geacuteniteurs du Risse y migrent pour se reproduireLa population sur ce secteur est naturellement fonctionnelle

Le Foron de Mieussy - La station laquo Andelier raquo situeacutee en amont du Foron preacutesente 100 de marqueacutes Cette situation montre une absence totale de reproduction naturelle Le milieu est extrecircmement deacutefavorable agrave lrsquoinstallation drsquoune population fonctionnelle en raison du faible deacutebit de la riviegravere (assegravechement reacutegulier) Aucune classe drsquoacircge intermeacutediaire et aucun adulte nrsquoa eacuteteacute observeacute sur ce secteur Les poissons alevineacutes sont certainement victimes des assegravechements- La station laquo Trebiet raquo situeacutee plus en aval preacutesente au contraire 0 de marqueacutes alors que cette zone a eacuteteacute alevineacutee Ce reacutesultat montre la capaciteacute du Foron sur ce secteur a accueillir une population fonctionnelle Il existe une reproduction naturelle importante sur cette zone avec eacutegalement beaucoup de geacuteniteurs- Vers Sommand une pecircche de sondage a eacuteteacute reacutealiseacutee mais aucun alevin nrsquoa eacuteteacute preacuteleveacute puisque cette zone nrsquoa pas eacuteteacute alevineacutee en 2002 Cependant les reacutesultats de ce sondage mettent en eacutevidence une absence totale de reproduction naturelle (aucun alevin naturel nrsquoa eacuteteacute trouveacute) alors que la population semble eacutequilibreacutee (preacutesence drsquoadultes et de truitelles drsquoacircge intermeacutediaire)

LrsquoEtroit Denteacute Globalement le taux de marqueacutes sur les deux stations eacutetudieacutees est faible (11 agrave 33)- Sur la station laquo aval route raquo la majoriteacute des alevins est naturelle Cette zone montre un habitat tregraves favorable pour la reproduction des geacuteniteurs qui remontent du Giffre- Sur la station laquo amont route raquo une population fonctionnelle de pheacutenotype meacutediterraneacuteen est installeacutee De nombreux geacuteniteurs sont preacutesents et le recrutement naturel est important

19

Le Foron de Taninges - En amont (station Bonnavaz) le taux de marqueacutes est tregraves important (95) Il existe donc une reproduction naturelle mais insuffisante pour permettre lrsquoinstallation drsquoune population et maintenir une activiteacute halieutique Les alevinages passeacutes nrsquoont pas permis drsquoinstaller une population fonctionnelle dans cette zone apicale- Plus en aval sur les zones non alevineacutees les pecircches eacutelectriques drsquoinventaire et de sondage reacutealiseacutees ont montreacute la preacutesence drsquoune population eacutequilibreacutee de pheacutenotype meacutediterraneacuteen avec une importante reproduction naturelle

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

Les principales remarques concernant les pathologies observeacutees sur le bassin du Giffre sont

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

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Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Giffre

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Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

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Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Giffre

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

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- La PKD est preacutesente sur le cours du Giffre mais uniquement agrave lrsquoaval du barrage de Taninges Cette situation est agrave mettre en relation avec le deacutebit reacuteserveacute insuffisant qui entraicircne une augmentation de tempeacuterature pendant la peacuteriode estivale

- Sur les affluents la PKD a eacuteteacute observeacutee sur les secteurs preacutesentant des faibles deacutebits estivaux (aval du Risse et Foron de Mieussy Andelier) qui sont certainement responsables drsquoune augmentation de tempeacuterature

- La PKD atteint agrave la fois les poissons introduits que les poissons naturels- Le pourcentage drsquoindividus toucheacutes par la PKD varie drsquoun site agrave lrsquoautre mais peut

atteindre une valeur importante avec 50 sur certain secteur- Les maladies bacteacuteriennes sont plus freacutequentes chez les individus marqueacutes Soit ces

poissons sont plus fragiles que les poissons naturels et contractent les maladies plus facilement soit les maladies sont contracteacutees en pisciculture pendant lrsquoeacutelevage

- Le pourcentage drsquoindividus toucheacutes par des symptocircmes bacteacuteriens nrsquoest pas neacutegligeable puisqursquoil peut atteindre 20

- Lrsquoensemble des stations eacutetudieacutees est toucheacute par des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes ce qui laisse penser que lrsquoensemble du bassin peut ecirctre atteint

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

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Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Giffre

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Pourcentage de macircles au stade 0+

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

21

- Le sexe ratio apparaicirct globalement eacutequilibreacute sur lrsquoensemble des stations du Giffre- On observe des diffeacuterences entre les poissons introduits et les poissons naturels sur

seulement 3 stations Ces diffeacuterences sont en faveur des poissons marqueacutes qui montrent un pourcentage de macircles plus important

- Une maturiteacute sexuelle preacutecoce des macircles existe sur certaines stations quelle que soit lrsquoorigine des poissons

- Cette maturiteacute peut ecirctre importante et concerner jusqursquoagrave 20 des 0+

22

213 Le Foron du Reposoir

Deux stations (La Touviegravere et Le Reposoir) ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le Foron du Reposoir Seulement 15 0+ ont eacuteteacute eacutetudieacutes en raison principalement de la difficulteacute drsquoeacutechantillonner des poissons de petite taille (6-7 cm) sur ces milieux torrentiels

Le taux de marqueacutes

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23

- Sur les deux stations eacutetudieacutees le taux de marqueacutes est de 100 Lrsquoensemble des 0+ mecircme si le nombre est faible est donc issu de lrsquoalevinage Ce cours drsquoeau fait lrsquoobjet actuellement drsquoun essai drsquoimplantation drsquoune population agrave partir de la souche Chazey-Bons Rhodanienne Cette souche provient de geacuteniteurs de la riviegravere Furan (Ain) Des analyses geacuteneacutetiques reacutecentes reacutealiseacutees par analyse de microsatellites diagnostic de lrsquoADN ont montreacute que ces poissons ont un pourcentage dallegraveles meacutediterraneacuteens voisin de 65

Ce reacutesultat montre que le cours deau avait un niveau de population tregraves faible avant le repeuplement par la souche Chazey-Bons sauvagesDe plus les pecircches drsquoinventaires du CSP et les pecircches de sondage Interreg montrent qursquoune population de truites se met progressivement en place En effet on observe chaque anneacutee despoissons agrave des stades de plus avanceacutes et les captures par pecircche agrave la ligne commencent agrave ecirctre effectivesLes pecircches eacutelectriques reacutealiseacutees agrave lrsquoautomne 2002 indique que le stock de geacuteniteurs est en cours de reconstitution mais que les truites femelles nrsquoont pas encore atteint le stade geacuteniteurIl nrsquoest donc pas encore possible de dire si lrsquohabitat et la population du Foron du Reposoir sont propices agrave lrsquoinstallation drsquoune population naturellement fonctionnelle

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

Aucun symptocircme reacutenal et heacutemorragique nrsquoapparaicirct sur les 0+ eacutechantillonneacutes sur ce cours deau

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Le sexe ratio est eacutequilibreacute puisqursquoil varie de 50 agrave 60- Il nrsquoy a aucun macircle mature au stade 0+ dans les eacutechantillons preacuteleveacutes sur ce cours

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Pourcentage de m acircles au stade 0+

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La Touviegravere Le Reposoir

F du Reposoir F du Reposoir

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

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Pourcentage de m acircles au stade 0+

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La Touviegravere Le Reposoir

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

24

214 La Filliegravere

Cinq stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal de la Filliegravere ainsi que sept stations sur les trois affluents principaux (Flan Creacutenant et Daudens) Au total 582 poissons 0+ ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

Sur le cours principal

Pour les 5 stations eacutetudieacutees sur le cours principal le taux de 0+ marqueacutes varie de 4 agrave 56 il est donc de tregraves faible agrave moyen et montre une forte reproduction naturelle sur toute la riviegravere Il y a un gradient amont-aval du taux de marqueacutes avec un pourcentage de poissons marqueacutes plus important en amont Cependant sur lrsquoensemble de la Filliegravere le recrutement naturel est dominant et constitue lrsquoessentiel de la population de truite

De plus les pecircches de sondages pour Interreg ont montreacute la preacutesence de nombreux drsquoadultes drsquoorigine naturelle meacutediterraneacuteenne Ceci confirme que la population de truite de la riviegravere principale est naturellement fonctionnelle

Sur les affluents

Les reacutesultats sont diffeacuterents selon que lrsquoaffluent est en connexion ou non avec la riviegravere principale

- Sur le Flan on observe en zone aval et meacutediane (stations laquo D 55 raquo et laquo Bruchon raquo) des taux de marqueacutes faibles (38 et 27) qui mettent en eacutevidence la preacutesence drsquoune forte reproduction naturelle notamment de poissons migrants de la Filliegravere Les releveacutes de frayegraveres reacutealiseacutes par lrsquoAAPPMA avaient deacutejagrave permis drsquoobserver de nombreuses frayegraveres naturelles sur ce secteurEn zone plus amont station laquo Molliet raquo le taux de marqueacutes est plus important (73) il met en eacutevidence la preacutesence drsquoun recrutement naturel mais qui reste au stade 0+ minoritaire par rapport aux individus introduits

- Sur le Daudens les deux stations (laquo Le Plot raquo et Daudens raquo) montrent des taux de marqueacutes importants (86 et 92) La reproduction naturelle est donc tregraves faible et la population de truite ne semble pas fonctionnelle Lrsquoobstacle agrave lrsquoaval de la route deacutepartementale semble preacutejudiciable car il ne permet pas aux geacuteniteurs de la Filliegravere de remonter sur le Daudens et drsquoinstaller une population fiable

- Sur le Crenant Les deux stations eacutechantillonneacutees (laquo aval raquo et Disonche raquo) ne sont pas situeacutees sur des zones alevineacutees en 2002 et il est normal de trouver 0 de marqueacutes Cependant ces reacutesultats montrent qursquoil y a une forte reproduction naturelle sur ce cours drsquoeau mecircme en zone amont et que la population semble naturellement fonctionnelle Les alevins introduits sur le Crenant ne semblent pas avoir deacutevaleacutes sur pour coloniser lrsquoaval du Crenant

25

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26

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

- La PKD semble quasiment absente du bassin de la Filliegravere sauf preacutesence anecdotique uniquement chez les non marqueacutes sur une station (laquo Millard raquo)

- Les individus marqueacutes ne sont pas toucheacutes par la PKD- Les maladies bacteacuteriennes sont preacutesentes sur lrsquoensemble du bassin mais touchent en

prioriteacute et majoritairement les individus marqueacutes

Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

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Pourcentage dindividus preacutesentant des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

27

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Sur lrsquoensemble des stations le sexe ratio est eacutequilibreacute il montre une plus grande variation chez les individus marqueacutes

- Des macircles matures au stade 0+ ont eacuteteacute observeacutes sur trois stations uniquement chez les individus naturels

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

Pourcentage de macircles au stade 0+

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

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Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

28

215 Le Foron de Fillinges

Trois stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal du Foron de Fillinges agrave savoir de lrsquoamont vers lrsquoaval laquo Bovet ndash Boex raquo laquo Pont de Fillinges raquo et laquo Couvette raquo Au total 178 poissons 0+ ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

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29

Sur les 3 stations eacutetudieacutees les taux de marqueacutes sont faibles agrave tregraves faibles- Sur la station laquo Bovet ndash Boex raquo le taux de marqueacutes est de seulement 31- A lrsquoaval sur les stations laquo Pont de Fillinges raquo et laquo Couvette raquo les taux de marqueacutes

sont respectivement de 0 et 2

Les reacutesultats indiquent la preacutesence drsquoune importante reproduction naturelle sur lrsquoensemble du Foron de Fillinges Quelque soit la souche utiliseacutee pour lrsquoalevinage atlantique dans le secteur Faucigny ou Meacutediterraneacuteenne Pont de Gys dans le secteur Chablais les poissons introduits restent minoritaires

Cette situation traduit la preacutesence drsquoune population bien installeacutee et fonctionnelle sur cette riviegravere

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

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Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

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Pourcentage dindividus preacutesentant des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

30

- Sur lrsquoensemble des stations des individus 0+ sont atteints par la PKD le pourcentage drsquoindividus malades peut atteindre 35

- Seuls les individus sauvages semblent toucheacutes par la PKD cependant le nombre drsquoindividus introduits est trop faible pour permettre une comparaison

- Toutes les stations sont eacutegalement toucheacutees par les maladies bacteacuteriennes avec des taux de contamination variant de 15 agrave 30

- Les maladies bacteacuteriennes touchent agrave la fois les individus introduits et les individus naturels

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Le sexe ratio apparaicirct eacutequilibreacute sur lrsquoensemble des stations- On observe des macircles matures degraves le stade 0+ sur lrsquoensemble des stations- Le taux de macircles matures au stade 0+ peut atteindre 15

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

Pourcentage de macircles au stade 0+

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

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Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

Pourcentage de macircles au stade 0+

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Pourcentage de macircles matures au stade 0+

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

31

22Caracteacuteristiques morphologiques

221 Longueur totale des individus

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Giffre

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

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Taille moyenne des 0+ sur le Giffre

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m

32

Sur la quasi-totaliteacute des stations eacutetudieacutees les individus marqueacutes preacutesentent une taillemoyenne supeacuterieure agrave celle des individus naturels Sur 18 stations ougrave les effectifs permettent des comparaisons statistiques la longueur totale des individus marqueacutes est significativement supeacuterieure agrave celle des truites sauvages pour 13 stations

Les 5 stations faisant exception sont laquo aval barrage Taninges raquo et laquo Pont du Giffre raquo sur le Giffre laquoAval St Jeoire raquo sur le Risse laquo Bonnavaz raquo sur le Foron de Taninges et laquo Couvette raquo sur le Foron de Fillinges Cependant sur ces stations les diffeacuterences ne sont pas significatives

Le fait que les marqueacutes aient une plus grande taille moyenne que les non marqueacutes au stade 0+ nrsquoimplique pas que cela soit systeacutematiquement le cas aux stades ulteacuterieurs En effet CAUDRON (1998) et CHAMPIGNEULLE et CACHERA (2003) ont montreacute respectivement sur le Doubs et le Fier que les diffeacuterences de tailles entre marqueacutes et non marqueacutes au stade 0+ sestompaient au stade 1+ et chez les adultes

Par ailleurs lrsquoexistence drsquoune plus grande taille au stade 0+ en automne pour les marqueacutes ne leur garantit pas un meilleur taux de seacutedentarisation En effet plusieurs eacutetudes dont celle de JONSSON et JONSSON (1993) indiquent que le taux de deacutevalaison peut ecirctre plus eacuteleveacute pour les individus agrave plus forte croissance au stade 0+ La deacutevalaison peut donc toucher preacutefeacuterentiellement les individus marqueacutes en raison de leur forte croissance

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Foron du Reposoir

0

20

40

60

80

100

120

140

La Touviegravere Le Reposoir

F du Reposoir F du Reposoir

Long

ueur

tota

le e

n m

mTaille moyenne des 0+ sur le Foron de Fillinges

0

20

40

60

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100

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140

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Long

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le e

n m

m

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Foron du Reposoir

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La Touviegravere Le Reposoir

F du Reposoir F du Reposoir

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mTaille moyenne des 0+ sur le Foron de Fillinges

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Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Long

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tota

le e

n m

m

33

222 Taille des nageoires pectorales

La figure ci-dessus montre qursquoil existe une diffeacuterence entre marqueacutes et non marqueacutes du rapport entre la longueur de la nageoire pectorale et la longueur totale du poisson

Il a sembleacute important drsquoanalyser plus en deacutetail ce caractegravere morphologique car il peut preacutesager de lrsquoaptitude des truites agrave se maintenir dans nos riviegraveres de montagne

Relation entre la longueur de la nageoire pectorale et la longueur totale des individus marqueacutes et non marqueacutes

5

7

9

11

13

15

17

19

21

23

25

27

30 50 70 90 110 130 150 170Longueur totale en mm

Long

ueur

nag

eoire

pec

tora

le e

n m

mMarqueacuteNon marqueacute

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron du Reposoir

12

14

16

18

20

La Touviegravere Le Reposoir

F du Reposoir F du Reposoir

Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron de Fillinges

12

14

16

18

20

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron du Reposoir

12

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La Touviegravere Le Reposoir

F du Reposoir F du Reposoir

Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron de Fillinges

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Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Giffre

12

14

16

18

20

Am

ont

Tine

s

Rev

eacute-P

eacuteret

Mon

tess

uit

Theacute

ziegraver

es

Ava

lba

rrag

eT

anin

ges

Pon

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Ris

se

Bon

nava

z

Am

ont

rout

e

Ava

l rou

te

Ande

lier

Tre

biet

Ava

l St

Jeoi

re

Le Giffre Le Giffre Le Giffre Le Giffre Le Giffre Le Giffre Le FdeTaninges

LEtroitDenteacute

LEtroitDenteacute

Le F deMieussy

Le F deMieussy

Le Risse

Taille relative moyenne des pectorales sur la Filliegravere

12

14

16

18

20

Le J

ourd

il

Pis

cicu

lture

Milla

rd

Long

cham

ps

D55

Bru

chon

Mol

liet

Le

Plo

t

Dau

dens

Ava

l

Dis

onch

e

La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere Le Flan Le Flan Le Flan LeDaudens

LeDaudens

LeCrenant

LeCrenant

Taille relative moyenne des pectorales sur le Borne

12

14

16

18

20

GrandBornand

Les Etroits Entremont Beffay St Pierre en F

Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Chinaillon La Duche LOveacuteran

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Giffre

12

14

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18

20

Am

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Le Giffre Le Giffre Le Giffre Le Giffre Le Giffre Le Giffre Le FdeTaninges

LEtroitDenteacute

LEtroitDenteacute

Le F deMieussy

Le F deMieussy

Le Risse

Taille relative moyenne des pectorales sur la Filliegravere

12

14

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Le J

ourd

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Pis

cicu

lture

Milla

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Long

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Bru

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Mol

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La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere Le Flan Le Flan Le Flan LeDaudens

LeDaudens

LeCrenant

LeCrenant

Taille relative moyenne des pectorales sur le Borne

12

14

16

18

20

GrandBornand

Les Etroits Entremont Beffay St Pierre en F

Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Chinaillon La Duche LOveacuteran

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Sur les 24 stations ougrave des individus marqueacutes et non marqueacutes coexistent la taille relative des nageoires pectorales est systeacutematiquement plus importante chez les individus naturelsLes truites issues du repeuplement preacutesentent donc des nageoires pectorales de longueur infeacuterieure agrave celle des truites sauvagesCette diffeacuterence morphologique est tregraves importante car le deacuteveloppement des nageoires est un eacuteleacutement deacuteterminant pour la survie du poisson dans son milieu notamment pour la stabiliteacute la reacutesistance au courant et la recherche de nourriture an action de chasse

Il semble donc possible que cette caracteacuteristique anatomique soit le reacutesultat drsquoune adaptation agrave la vie en torrent

BOSAKOWSKI et al (1993) ont eacutegalement observeacutes des reacutesultats comparables chez des truites arc-en-ciel et des truites brunes de plus grande taille entre poissons drsquoeacutelevage et poissons sauvages Dans cette eacutetude les poissons deacutelevage preacutesentaient des nageoires nettement plus courtes (10-50) que les poissons sauvages Selon les auteurs cette diffeacuterence semblait ecirctre causeacutee par les conditions de vie des poissons dans les bassins des piscicultures(agression intraspeacutecifique stress qualiteacute de leau et densiteacutes de poissons) qui provoquaient une eacuterosion des nageoires

Dans le cas preacutesent les poissons de repeuplement ont eacuteteacute introduits agrave des stades preacutecoces dans le milieu et ont eacuteteacute preacuteleveacutes 4 agrave 5 mois apregraves leur introduction En conseacutequence ils ont veacutecu peu de temps en pisciculture et ont par contre passeacute lessentiel de leur vie dans le mecircme milieu naturel que les poissons sauvages Ainsi il semble que ce dimorphisme de la nageoire entre poissons sauvages et introduits soit drsquoorigine geacuteneacutetique Une eacutetude de RIDDELL et al (1981) a montreacute chez le saumon que les diffeacuterences de deacuteveloppement de nageoires eacutetaient une adaptation des poissons agrave leur milieu qui preacutesentait une origine geacuteneacutetiqueIl est donc tout agrave fait probable qursquoun pheacutenomegravene similaire se rencontre chez la truite fario et que les truites sauvages soient mieux adapteacutees sur le plan morphologique (gracircce agrave des diffeacuterences geacuteneacutetiques) aux conditions du milieu que les poissons introduits mecircme agrave des stades preacutecoces

Outre lrsquoaspect purement geacuteneacutetique les facteurs environnants peuvent eacutegalement jouer un rocircle important En effet McLAUGHLIN et al (2002) ont montreacute que cette diffeacuterence au niveau des nageoires peut eacutegalement ecirctre due agrave des caracteacuteristiques du milieu environnant dans les premiegraveres semaines de vie des poissons En effet plusieurs lots drsquoune mecircme souche de saumon de fontaine soumis degraves lrsquoeacuteclosion agrave des conditions de vie diffeacuterentes montrent des diffeacuterences dans le deacuteveloppement des nageoires Ainsi degraves les premiegraveres semaines les poissons exposeacutes agrave un fort courant sont pourvus de nageoires plus longues

Il est donc possible que les alevins produits en pisciculture nrsquoeacutetant pas exposeacutes agrave des courants importants au cours de leurs premiegraveres semaines de vie deacuteveloppent des nageoires pectorales moins longues que les individus sauvages

Il y a probablement pour cette caracteacuteristique morphologique des interactions combinant geacuteneacutetique et conditions environnementales

Cette diffeacuterence morphologique peut eacutegalement avoir une importance dans la compeacutetition entre poissons sauvages et introduits notamment au stade juveacutenile En effet GIBSON (1973) a deacutemontreacute limportance des nageoires dans la compeacutetition interspeacutecifique

36

entre le saumon atlantique (Salmo salar L) et le saumon de fontaine (Salvenius fontinalis) deux poissons consommant la mecircme nourriture Le fait de posseacuteder des nageoires pectorales plus deacutevelopper permet au saumon atlantique de se maintenir dans les courants pour se nourrir tout en deacutepensant moins drsquoeacutenergie

Dans le cas des torrents haut-savoyards une compeacutetition intraspeacutecifique entre truites sauvages et introduites comparable agrave leacutetude de GIBSON peut se deacutevelopper La diffeacuterence morphologique entre les truites sauvages et issues du repeuplement peut donc avoir une influence lors de la compeacutetition entre ces deux types dindividus

37

3 Premiegraveres implications pour la gestion

En fonction des reacutesultats obtenus lors de la campagne de preacutelegravevements 2002 des orientations de gestion sont proposeacutees pour chaque riviegravere eacutetudieacutee Certaines propositions impliquent des changements relativement importants des pratiques actuelles de gestion

Lrsquoeacutetude de lrsquoefficaciteacute des repeuplements srsquoappuient sur une deacutemarche scientifique rigoureuse dans lrsquointeacuterecirct des gestionnaires directs (AAPPMA) puisqursquoelle permet agrave ces derniers de prendre des deacutecisions en srsquoappuyant sur des reacutesultats concrets et indiscutables Elle est conduite dans un souci drsquoeacutevaluer en toute objectiviteacute les pratiques drsquoalevinage dans le seul but drsquoameacuteliorer la gestion actuelle des populations et des milieux Concregravetement elle permet de connaicirctre rapidement les zones ougrave lrsquoalevinage en truite fario est inefficace et donc inutile et les zones ougrave celui-ci est efficace et donc neacutecessaire

En plus des reacutesultats obtenus gracircce aux marquages des juveacuteniles les propositions prennent en compte les premiers reacutesultats issus des pecircches de sondage drsquoadultes reacutealiseacutees pour le programme INTERREG (reacutedaction en cours) Lrsquointeacutegration des diffeacuterentes donneacutees (marquage juveacutenile + adultes) permet de faire des propositions coheacuterentes selon un diagnostic le plus complet possible de la population de truite preacutesente

31 Bassin du Borne

Sur les riviegraveres du bassin du Borne les orientations de gestion proposeacutees ci-apregraves restent conformes agrave celles deacutejagrave eacutevoqueacutes par CAUDRON et CHAMPIGNEULLE (2002)

Arrecirct du repeuplement selon les pratiques actuelles sur lrsquoensemble du cours principal Cette proposition est motiveacutee par deux principales raisons

- Lrsquoalevinage est inefficace agrave lrsquoamont du seuil drsquoEntremont car apregraves plus de 15 ans il nrsquoa pas permis drsquoinstaller une population en place eacutequilibreacutee

- Il semble impeacuteratif de preacuteserver lrsquoimportante population de truite sauvage preacutesente agrave lrsquoaval du seuil drsquoEntremont Les reacutesultats geacuteneacutetiques indiquent que la population preacutesente est une population sauvage qui nrsquoa pas eacuteteacuteimplanteacutee suite agrave lrsquoalevinage Elle preacutesente un degreacute de pureteacute geacuteneacutetique important Cette population repreacutesente un patrimoine unique dans le Faucigny Le but drsquoarrecircter les alevinages sur ce secteur est drsquoeacuteviter les hybridations qui peuvent entraicircner une perte de plasticiteacute geacuteneacutetique et une deacutegeacuteneacuterescence de la souche sauvage actuelle

Arrecirct du repeuplement sur lrsquoaval de lrsquoOveacuteran Ce secteur est utiliseacute comme zone de reproduction par les geacuteniteurs du Borne et la reproduction naturelle y est abondante Lrsquoalevinage nrsquoest donc pas neacutecessaire et risque comme sur le Borne de provoquer une hybridation de la population naturelle

Essayer drsquoinstaller une population naturelle agrave lrsquoamont du seuil drsquoEntremont par transferts de geacuteniteurs

Sur les autres affluents deux sceacutenarii de gestion peuvent ecirctre envisageacutes selon la volonteacute politique des gestionnaires directs

Sceacutenario ndeg1 vision patrimoniale

38

- Arrecirct du repeuplement en truite drsquoorigine Atlantique pendant 3 anneacutees conseacutecutives pour diminuer leur preacutesence sur le bassin

- Puis reprise de lrsquoalevinage pendant uniquement 3 anneacutees agrave partir de poissons sauvages issus du Borne pour essayer drsquoinstaller une population naturelle

Sceacutenario ndeg2 vision halieutique- Maintien des pratiques drsquoalevinage en atlantique pour soutenir

artificiellement le stock de poissons dans un inteacuterecirct uniquement halieutique Attention cette pratique risque de provoquer par deacutevalaison des individus introduits une hybridation des poissons sauvages preacutesents dans le Borne

Eventuellement repeuplement en truites Arc en Ciel surdensitaires sur des secteurs preacutecis du Borne pendant la peacuteriode estivale afin de contenter une certaine cateacutegorie de pecirccheurs Les repeuplements en Arc en Ciel ne risquent pas de provoquer drsquohybridation de la souche fario locale Attention prendre des preacutecautions aupregraves des fournisseurs concernant la qualiteacute sanitaire des poissons

32 Bassin du Giffre

Les propositions sur le bassin du Giffre prennent en compte les reacutesultats du marquage mais eacutegalement la situation actuelle de la riviegravere suite agrave lrsquoeacuteboulement de Sixt Fer agrave Cheval

Ne pas aleviner le cours principal du Giffre en alevins de fario pendant 5 anneacutees conseacutecutives Cette proposition est motiveacutee par les raisons suivantes

- Il est impossible de savoir comment va eacutevoluer dans les prochains mois et les prochaines anneacutees le glissement agrave lrsquoamont de Sixt Il semble donc risqueacute drsquoentreprendre un alevinage pour installer une nouvelle population

- Les reacutesultats des marquages sur le Giffre sont tregraves contrasteacutes Sauf au niveau de Sixt ils montrent qursquoil existait avant le glissement une reproduction naturelle importante et capable de soutenir une population

- Les reacutesultats geacuteneacutetiques reacutecents indiquent que les populations en place sont en majoriteacute drsquoorigine atlantique mais qursquoil existe encore des individus meacutediterraneacuteens non hybrideacutes jusque dans les zones amont Ces reacutesultats prouvent qursquohistoriquement la souche meacutediterraneacuteenne eacutetait bien preacutesente sur lrsquoensemble du Giffre

- Il est envisageable que cette souche sauvage eacutegalement preacutesente sur les parties basses des affluents recolonise naturellement le Giffre

- Lrsquoexemple du Borne montre qursquoapregraves une catastrophe la riviegravere a eacuteteacute recoloniseacutee par une souche sauvage malgreacute des alevinages massifs Les reacutesultats obtenus sur cette riviegravere doivent servir de base de reacuteflexions pour la nouvelle gestion agrave entreprendre sur le Giffre

- Entre le Risse et Marignier la population de truites avant le glissement eacutetait deacutejagrave totalement deacuteseacutequilibreacutee et en quasi disparition (peu de juveacuteniles quasi absence de geacuteniteurs et absence de classes drsquoacircges intermeacutediaires) malgreacute les alevinages massifs sur ce secteur

39

Reacutealiser un bilan de lrsquoimpact du glissement de terrain sur le peuplement piscicole

- Une eacutetude piscicole sera reacutealiseacutee tregraves prochainement (2004 ou 2005) sur le Giffre dans le cadre du contrat de riviegravere Cette eacutetude permettra de faire un premiereacutetat des lieux complet du peuplement piscicole suite au glissement

Accomplir un diagnostic de lrsquoeacutetat de recolonisation du Giffre par les populations naturelles

- En lrsquoabsence drsquoalevinage il sera possible de reacutealiser en 2008 un bilan des populations de truites installeacutees sur le Giffre

- A partir de lrsquoeacutetat de la population agrave cette eacutepoque un plan drsquoalevinage coheacuterent en truite fario pourra ecirctre eacutetabli pour permettre drsquoinstaller de nouvelles populations ou de soutenir des populations preacutesentes

Mettre en place des deacuteversements de truites Arc en Ciel pendant toute la peacuteriode drsquoarrecirct de lrsquoalevinage en fario Attention prendre des preacutecautions aupregraves des fournisseurs concernant la qualiteacute sanitaire des poissons

Reacuteintroduire lrsquoOmbre commun sur la plaine de Samoeumlns et agrave lrsquoaval de la confluence avec le Risse

Arrecirct de lrsquoalevinage sur lrsquoensemble du Risse sur lrsquoaval du Foron de Mieussy et sur lrsquoEtroit Denteacutee

- Sur ces riviegraveres le suivi du marquage a montreacute que lrsquoalevinage nrsquoeacutetait pas neacutecessaire pour soutenir les populations de truites preacutesentes

Maintenir lrsquoalevinage sur lrsquoamont du Foron de Mieussy (vers Sommand) et lrsquoamont du Foron de Taninges (Bonnavaz)

- Sur ces secteurs le suivi du marquage a montreacute que les juveacuteniles preacutesents dans le milieu naturel eacutetaient en majoriteacute des individus introduits

33 Le Foron du Reposoir

Les propositions de gestion sur le Foron du Reposoir sont

Maintenir les alevinages actuels avec la souche Chazey Bons Rhodanienne

Suivre lrsquoeacutevolution de la population pour savoir si cet alevinage permet drsquoinstaller une population fonctionnelle

- Ce suivi peut comprendre des pecircches de sondages en deacutebut de peacuteriode de reproduction pour voir si les poissons adultes deviennent matures des releveacutes de frayegraveres sur la riviegravere pour savoir si les poissons se reproduisent et de nouveaux preacutelegravevements de poissons pour suivre lrsquoeacutevolution du taux de marqueacutes dans la population

34 Bassin de la Filliegravere

Les orientations pour une gestion coheacuterente des populations de la Filliegravere sont les suivantes

40

Arrecirct de lrsquoalevinage sur le cours principal de la Filliegravere sur le Crenant et sur lrsquoaval du Flan

- Sur ces 3 riviegraveres lrsquoalevinage nrsquoest pas neacutecessaire car il ne permet pas de soutenir les populations preacutesentes et de plus la reproduction naturelle est tregraves importante

- Sur la Filliegravere les pecircches drsquoadultes dans le cadre du programme INTERREG ont mis en eacutevidence la preacutesence drsquoune population sauvage drsquoorigine meacutediterraneacuteenne Il semble important drsquoentreprendre une mesure de conservation de cette souche en arrecirctant lrsquoalevinage pour eacuteviter lrsquohybridation

- Sur lrsquoamont du Flan il est neacutecessaire de continuer le suivi des poissons marqueacutes pour savoir si lrsquoalevinage doit ecirctre maintenu

Sur le Daudens deux sceacutenarii de gestion peuvent ecirctre envisageacutes selon la volonteacute politique des gestionnaires directs

Sceacutenario ndeg1 vision patrimoniale- Arrecirct du repeuplement en truite drsquoorigine Atlantique pendant 3 anneacutees

conseacutecutives pour diminuer leur preacutesence sur le bassin- Commencer les proceacutedures afin de rendre le seuil du Plot

franchissable pour les geacuteniteurs de la Filliegravere- Reacutealiser un bilan notamment deacutemographique de la population en place

apregraves lrsquoarrecirct de lrsquoalevinage- Puis reprise de lrsquoalevinage pendant uniquement 3 anneacutees agrave partir de

poissons sauvages issus de la Filliegravere pour essayer drsquoinstaller une population naturelle

Sceacutenario ndeg2 vision halieutique- Maintien des pratiques drsquoalevinage en atlantique pour soutenir

artificiellement le stock de poissons dans un inteacuterecirct uniquement halieutique Attention cette pratique risque de provoquer par deacutevalaison des individus introduits une hybridation des poissons sauvages preacutesents dans la Filliegravere

35 Le Foron de Fillinges

Les reacutesultats obtenus sur le Foron de Fillinges ont conduit agrave formuler les propositions de gestion suivantes

Arrecirct de lrsquoalevinage sur lrsquoensemble du Foron de Fillinges- Quelque soit la souche utiliseacutee et les quantiteacutes introduites les poissons

alevineacutes ne repreacutesentent qursquoune tregraves faible minoriteacute des poissons preacutesents dans le milieu Le Foron abrite une population naturelle fonctionnelle et eacutequilibreacutee

Suivi de la population suite agrave lrsquoarrecirct du repeuplement- Reacutealisation de 5 stations de pecircches eacutelectriques la derniegravere anneacutee de

lrsquoalevinage afin de reacutealiser un eacutetat des lieux preacutecis de la population de truites et du peuplement piscicole

- Reacutealisation drsquoun nouveau bilan de la population du Foron respectivement 3 ans puis 6 ans apregraves lrsquoarrecirct de lrsquoalevinage

41

4 Investigations suppleacutementaires

Suite aux premiers reacutesultats obtenus lors de la campagne 2002 des investigations suppleacutementaires permettant de preacuteciser certains points seront reacutealiseacutees

Reacutealiser une analyse bacteacuteriologique des diffeacuterents lots de poissons alevineacutes qui ont transiteacutes dans les piscicultures associatives Cette recherche de pathologie permettra de savoir si les poissons issus de pisciculture sont porteurs drsquoune maladie bacteacuterienne avant drsquoecirctre introduits dans le milieu ou si ils contractent la maladie dans le milieu naturel

Rechercher les raisons pour lesquelles on nrsquoobserve pas drsquoalevins naturels sur certains secteurs Les causes drsquoune telle situation peuvent ecirctre

- Lrsquoabsence totale de geacuteniteurs dans la population Les poissons nrsquoont pas le temps de devenir adulte (3+) et sont captureacutes avant par les pecirccheurs

- La preacutesence drsquoadultes non matures Les poissons deviennent adultes mais sont immatures (eacutetat sanitaire des poissons souche geacuteneacutetiquement deacutegeacuteneacutereacutee)

- Survie nulle durant la phase de vie sous graviers Les poissons pondent mais les œufs nrsquoarrivent pas agrave se deacutevelopper et la mortaliteacute est totale

Sur les secteurs du Chinaillon de la Duche de lrsquoOveacuteran amont et du Foron de Mieussy amont (Sommand) les actions suivantes peuvent ecirctre entreprises

- Pecircches eacutelectriques de sondage en deacutebut de la peacuteriode de reproduction pour savoir si les poissons deviennent matures

- Releveacutes de frayegraveres permettant drsquoobserver ou non une activiteacute de reproduction- Mise en place drsquoincubateurs-tests contenant des œufs de truites pour connaicirctre le taux

de survie des œufs dans les frayegraveres

Reacutealiser des preacutelegravevements suppleacutementaires aux classes drsquoacircge supeacuterieures (1+ et 2+) sur certaines stations pour voir lrsquoeacutevolution du taux de marqueacutes au cours des anneacutees Ces recherches suppleacutementaires peuvent ecirctre effectueacutees sur 8 cours drsquoeau ougrave le taux de marqueacutes deacutepasse 60 au stade 0+

Le ruisseau de la Duche amontLe ruisseau du Chinaillon amontLe Foron du ReposoirLe Risse avalLe Foron de Taninges amont (Bonnavaz)Le Foron de Mieussy amont (Sommand)Le Daudens amont et avalLe Flan amont

Dans les eacutetudes preacuteceacutedentes reacutealiseacutees sur le Fier (CAUDRON et CHAMPIGNEULLE 2002) et sur le Doubs (CHAMPIGNEULLE et al 2002) les taux de marqueacutes aux stades 1+ et 2+ dans la population en place srsquoeffondraient et devenaient tregraves faibles ou nuls

Pour informations le graphique suivant montre lrsquoeacutevolution du taux de marqueacutes agrave diffeacuterents stades sur les stations ougrave le taux de 0+ marqueacutes eacutetait eacuteleveacute

42

Les reacutesultats montrent agrave part pour une station une chute importante des taux de marqueacutes entre les stades 0+ et 1+ Cette chute se poursuit eacutegalement au stade 2+Ces reacutesultats obtenus sur le Fier et le Doubs semblent laisser peu drsquoespoirs sur le devenir des poissons marqueacutes sur les bassins eacutetudieacutes en 2002

Reacutesultats sur leacutevolution du taux de m arqueacutes aux diffeacuterents stades obtenus lors des eacutetudes preacuteceacutedentes sur le Fier et le Doubs

0102030405060708090

100

0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 0+ 1+ 0+ 1+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+

Station A Station B Station C StationD

StationE

StationF

Station A Station B StationC

Stations et stades

Pou

rcen

tage

de

mar

queacutes

Le Fier Le Doubs

Reacutesultats sur leacutevolution du taux de m arqueacutes aux diffeacuterents stades obtenus lors des eacutetudes preacuteceacutedentes sur le Fier et le Doubs

0102030405060708090

100

0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 0+ 1+ 0+ 1+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+

Station A Station B Station C StationD

StationE

StationF

Station A Station B StationC

Stations et stades

Pou

rcen

tage

de

mar

queacutes

Le Fier Le Doubs

43

BIBLIOGRAPHIE

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8

Collage de chaque otolithe (face convexe vers lrsquoexteacuterieur) sur une lame de verre mince agrave lrsquoaide drsquoune thermocolle (colle Crystalbonb Aremco ndeg 509) chauffeacutee agrave 120 degC Durant cette eacutetape il est important drsquoenlever les bulles drsquoair existantes celles-ci pouvant eacutemettre une fluororescence parasite

Polissage des otolithes sur des plaques de papiers abrasifs de granulomeacutetrie diffeacuterente (Escil PSA G 400 G 800 et G 1200) Lrsquoeacutevolution du polissage est suivi par plusieurs controcircles sous microscope afin drsquoatteindre et de ne pas deacutepasser le centre de lrsquootolithe

Lecture de lrsquootolithe sous un microscope eacutequipeacute pour lrsquoeacutepifluorescence car lrsquoARS est deacutetectable par la fluorescence qursquoil eacutemet lorsquil est irradieacute en lumiegravere ultraviolette La lecture est faite le jour mecircme du polissage car la lisibiliteacute de la marque diminue avec le temps impliquant alors la neacutecessiteacute drsquoun leacuteger repolissage

Lorsque lrsquootolithe a eacuteteacute marqueacute celui-ci montre en son centre un anneau ou un noyau (selon la preacutecociteacute du marquage etou positionnement du plan de polissage par rapport au nucleacuteus) apparaissant rouge fluorescent (jeu de filtres Zeiss ndeg15 BP 54612 FT 580 LP 590 ) ou jaune orangeacute (jeu de filtres Zeiss ndeg9 BP 450-490 FT 510 LP 520)

Lorsque lrsquootolithe a eacuteteacute marqueacute celui-ci montre en son centre un anneau fluorescent jaune orangeacute ou rouge fluorescent selon le filtre utiliseacute

Enlegravevement de la moitieacute infeacuterieure de la tecircte agrave lrsquoaide de ciseaux

Emplacement de lotolitheEmplacement de lotolithe

Tecircte apregraves dissection Localisation de lrsquootolithe

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Extraction de lrsquootolithe Otolithes colleacutes sur lame mince Ponccedilage de lrsquootolithe

Observation de la lame mince au microscope

05mm 05mmVue au microscope drsquoun otolithe ponceacute Otolithe marqueacute (anneau fluo vert-jaune)

16Symptocircmes pathologiques observeacutes

161 La maladie reacutenale prolifeacuterative (MRP ou PKD ou teacutetracapsulose)

Selon ESCHER et al (Fischnetz-info mars et deacutecembre 2001) cette maladie est provoqueacutee par un seul parasite Tetracapsula bryosalmonae (myxosoaire) Chez les poissons on le rencontre chez les salmonideacutes et le brochet les truites eacutetant particuliegraverement toucheacutees Le taux de mortaliteacute peut ecirctre fort chez ces derniegraveres (10 agrave 100) surtout sur les estivaux

Pour que les symptocircmes (affaiblissement contraction dautres maladies) se deacuteveloppent la tempeacuterature de leau doit ecirctre supeacuterieure agrave 15degC De plus il semble que des facteurs tels quun faible taux doxygeacutenation ou une pollution chimique favoriseraient la maladie

10

Afin de savoir si la truite en preacutesence est infecteacutee il faut observer ses reins En effet un poisson ayant deacuteveloppeacute la maladie a des reins grossis et dune coloration inhabituelle

Le mode de propagation de la maladie et le cycle complet du parasite ne sont que partiellement connus Tetracapsula parasite les bryozoaires de petits organismes filtreurs qui forment des colonies de quelques centimegravetres de diamegravetre sur diffeacuterents types de substrats et que lon rencontre dans la plupart des lacs et cours deau

Les parasites se multiplient dans les bryozoaires ils ont alors une taille de 20 μm et se concentrent dans des sortes de grandes poches de 350 μm de diamegravetre Le parasite peacutenegravetre dans le poisson sous forme de petites spores agrave travers les cellules du mucilage de la peau et ce au cours de la premiegravere minute apregraves lentreacutee en contact avec lagent pathogegravene A laide de la circulation sanguine les parasites atteignent les reins ougrave ils forment diffeacuterents stades de deacuteveloppement et provoquent de violentes reacuteactions inflammatoires Il en reacutesulte les diffeacuterentssymptocircmes deacutecrits preacuteceacutedemment

Le parasite drsquoun diamegravetre de 5 agrave 20 microm a pu ecirctre observeacute dans les vaisseaux sanguins de presque tous les organes (sauf du cerveau de la moelle eacutepiniegravere et des yeux) Les spores sont libeacutereacutees dans lrsquoeau avec lrsquourine du poisson et sont probablement absorbeacutees de nouveau par les bryozoaires

Les truites qui survivent ou qui ont deacutejagrave eacuteteacute infecteacutees sans deacutevelopper la maladie sont en geacuteneacuteral immuniseacutees lanneacutee suivante

Poisson atteint pas la PKD (reins gonfleacutes et preacutesence de nodules)

La PKD provoque chez les jeunes truites une mortaliteacute variant de 10 agrave 100 des individus toucheacutesLe deacuteveloppement du parasite est favoriseacute en eacuteteacute lorsque la tempeacuterature de lrsquoeau atteint 15degC

162 Pathologies bacteacuteriennes

Des symptocircmes probablement dus agrave une pathologie bacteacuterienne ont eacuteteacute mis en eacutevidence lors de cette eacutetude En effet un pourcentage non neacutegligeable de truites eacutetait affecteacute par des rougeurs de type heacutemorragie agrave la base des nageoires

11

Selon MORAND (com pers) deux maladies bacteacuteriennes peuvent engendrer ces symptocircmes (la furonculose et la yerciniose) Ces deux maladies sont preacutesentes dans le monde entier et atteignent tout particuliegraverement les eacutelevages de salmonideacutes

Elles peuvent ecirctre favoriseacutees par des conditions particuliegraveres du milieu environnant tempeacuterature de leau eacuteleveacutee (supeacuterieure agrave 10 degC) une charge organique importante ou encore une pollution diminuant les deacutefenses immunitaires du poissonhellip

Selon la graviteacute de laffection ces pathologies peuvent entraicircner de lourds taux de mortaliteacute atteignant jusquagrave 70 dans certains cas (MOURRIERAS 1995)

Les heacutemorragies observeacutees agrave la base des nageoires sont la conseacutequence drsquoune infection bacteacuterienne pouvant provoquer drsquoimportantes mortaliteacutes

17Utilisation du SIG de la Feacutedeacuteration de pecircche de Haute-Savoie

Les donneacutees du programme pilote de marquage et du programme INTERREG sont inteacutegreacutees dans un SIG (Systegraveme dInformation Geacuteographique MapInfo) mis en place agrave la Feacutedeacuteration de pecircche de Haute-Savoie et agrave lINRA de Thonon

Ainsi toutes les informations relatives aux cours deau du deacutepartement seront consigneacutees dans cette base de donneacutees (pente longueur preacutesence de seuils infranchissables caracteacuteristiques physico-chimiques IBGN hydrologie occupation des bassins versantshellip) Il en sera de mecircme pour les donneacutees truites (repeuplement densiteacute biomasses croissance structure dacircge pathologie geacuteneacutetiquehellip)

Lapproche finale visera agrave rechercher les relations existant entre ces deux groupes de donneacutees spatialiseacutees Une toute premiegravere deacutemarche a eacuteteacute partiellement tenteacutee dans le cas du preacutesent rapport dont les donneacutees ont eacuteteacute inteacutegreacutees dans le SIG en cours de construction

12

2 Reacutesultats et discussions

Ce chapitre preacutesente les reacutesultats obtenus sur les bassins eacutetudieacutes lors de la campagne de preacutelegravevements 2002 agrave savoir

Le GiffreLe BorneLa FilliegravereLe Foron de ScionsiezLe Foron de Fillinges

Lors de la campagne 2002 1703 poissons au stade 0+ ont eacuteteacute eacutechantillonneacutes en milieu naturel et eacutetudieacutes en laboratoire

21Taux de marquage sexe ratio et pathologie

211 Le Borne

Sur le bassin du Borne 5 stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal et 3 sur des affluents Au total ce sont 392 poissons 0+ qui ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

Sur le cours principal

Les taux de marqueacutes varient fortement sur le cours principal du Borne (18 agrave 100) On observe un gradient amont-aval du taux de marqueacutes qui peut ecirctre mis en relation avec la preacutesence drsquoun obstacle partiellement infranchissable pour les geacuteniteurs au niveau drsquoEntremont

Ainsi deux grandes zones peuvent ecirctre distingueacutees sur le Borne

La zone amont du seuil drsquoEntremont ougrave la majoriteacute des juveacuteniles sont issus du repeuplement (90 agrave 100)

On observe sur ce secteur une tregraves faible reproduction naturelle en raison drsquoune quasi-absence de poissons adultes La situation de la population de truites est donc tregraves critique Si le repeuplement permet de drsquoobserver des 0+ il nrsquoa pas permis drsquoinstaller une population fonctionnelle

La zone aval du seuil drsquoEntremont ougrave la majoriteacute des individus preacutesents au stade 0+ sont des poissons naturels

En effet le taux de marqueacutes varie de 18 agrave 49 Les pecircches de sondage Interreg ont montreacute la preacutesence drsquoune importante population de truites sauvages drsquoorigine meacutediterraneacuteenne La population est eacutequilibreacutee et naturellement fonctionnelle puisqursquoon observe une forte reproduction naturelle et de nombreux geacuteniteurs

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Sur les Affluents

Sur les 3 affluents eacutetudieacutes la situation est tregraves simple En effet soit on observe 0 de marqueacutes soit 100

- Sur lrsquoOveacuteran aval aucun poisson marqueacute nrsquoa eacuteteacute trouveacute puisqursquoil nrsquoy a pas eu de repeuplement sur ce secteur en 2002 Le reacutesultat obtenu montre une importante reproduction naturelle des geacuteniteurs du Borne qui remontent sur lrsquoaval de ce cours drsquoeau

- Sur la Duche et le Chinaillon il y a absence totale de reproduction naturelle puisque 100 des 0+ eacutechantillonneacutes sont marqueacutes Pourtant on observe de nombreux poissons adultes sur ces secteurs susceptibles drsquoecirctre des geacuteniteurs ainsi que diffeacuterentes classes drsquoacircge Lrsquoeacutequilibre de ces populations est artificiellement maintenu par les alevinages

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

- Toutes les stations eacutetudieacutees ne sont pas concerneacutees par ces symptocircmes de maladies- Les maladies bacteacuteriennes semblent toucher majoritairement les poissons introduits- Cependant les 0+ de lrsquoOveacuteran aval tous naturels sont infecteacutes agrave 15 Ce reacutesultat

peut refleacuteter une contamination par deacutevalaison provenant drsquoindividus atteints situeacutes plus en amont de lrsquoOveacuteran ou une contamination naturelle par des agents pathogegravenes preacutesents dans le milieu

- Les poissons marqueacutes peuvent ecirctre contamineacutes agrave un taux non neacutegligeable pouvant atteindre plus de 30

Pourcentage dindividus preacutesentant des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

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Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Le sexe ratio est relativement eacutequilibreacute pour les marqueacutes comme pour les non marqueacutes Seule une station sur le Borne (Beffay) montre 85 de macircle dans la population de 0+

- Seules 2 stations montrent des macircles matures au stade 0+- Le pourcentage de macircles matures au stade 0+ est plus important chez les non

marqueacutes que chez les marqueacutes

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Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Borne

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Pourcentage de macircles au stade 0+

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Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Borne

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

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212 Le Giffre

Sur le bassin du Giffre 6 stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal et 7 sur des affluents Au total ce sont 536 poissons 0+ qui ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

Sur le cours principal

La carte de synthegravese des reacutesultats met en eacutevidence des taux de marqueacutes tregraves contrasteacutes variant entre 0 et 100 Sauf deux cas particuliers la campagne de preacutelegravevements a permis de montrer qursquoune reproduction naturelle existait sur lrsquoensemble du Giffre

Il est possible de distinguer trois zones successives sur ce cours deau

La zone aval est composeacutee de la station Pont du Giffre ougrave le taux de marqueacutes est de 74 Cette station sur le Giffre doit ecirctre rapprocheacutee des stations eacutetudieacutees sur le Risse (station laquo Risse aval St Jeoire raquo) et le Hisson(laquo station La Pallud raquo) pour mieux comprendre le fonctionnement de la population

- Sur le Giffre aval la situation semble tregraves critique La station dite laquo Pont du Giffre raquosrsquoeacutetend de lrsquoamont de Marignier agrave lrsquousine du Pont du Giffre soit sur environ 25 km Sur cette distance seulement 31 0+ ont pu ecirctre captureacutes De plus les pecircches drsquoadultes dans le cadre drsquoInterreg montrent un deacuteficit inquieacutetant de geacuteniteurs sur ce secteur ainsi qursquoune surabondance de Chabot La situation du bas Giffre montre une population de truitetotalement deacuteseacutequilibreacutee loin du potentiel de la riviegravere et qui ne peut pas ecirctre reacutehabiliteacutee par le seul fait de lrsquoalevinage Cette situation peut ecirctre le reacutesultat du faible deacutebit reacuteserveacute qui appauvrit lrsquohabitat aquatique et provoque des eacuteleacutevations de tempeacuterature inquieacutetantes Les reacutesultats de pecircche drsquoinventaire dans la reacuteserve de Marignier montrent que les poissons sont concentreacutes agrave lrsquoaval immeacutediat des seuils ougrave lrsquoon note la preacutesence de fosses de tempeacuteratures plus faibles et drsquoune meilleure oxygeacutenation

La zone moyenne situeacutee entre le barrage de Mieussy et Samoeumlns qui est composeacutee des stations laquo aval barrage Taninges raquo laquo Theacuteziegraveres raquo et laquo Montessuit raquo Sur ce secteur les 0+ marqueacutes sont en minoriteacutes puisqursquoils repreacutesentent 11 agrave 38 du peuplement

- Sur le Giffre aval barrage de Taninges le secteur nrsquoest pas alevineacute il est donc normal que pregraves de 90 des poissons ne soient pas marqueacutes Les 0+ marqueacutes proviennent certainement du ruisseau de lrsquoEtroit Denteacute qui est fortement alevineacute et agrave partir duquel une deacutevalaison doit avoir lieu- Le secteur des laquo Theacuteziegraveres raquo et de laquo Montessuit raquo bien que reacuteguliegraverement alevineacute montre un taux important drsquoalevins naturels (62 agrave 77) Ce reacutesultat est tout agrave fait en accord avec le suivi de la reproduction naturelle et le recensement de frayegraveres reacutealiseacute par lrsquoAAPPMA du Faucigny et le CSP en 1999 En effet de nombreuses frayegraveres naturelles avaient eacuteteacute observeacutees sur ce site Le peuplement drsquoadultes nrsquoest pas tregraves important mais est en rapport avec les potentialiteacutes du milieu

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18

La zone amont caracteacuteriseacutee par les stations laquo Reveacute-Peacuteret raquo et laquo amont Tines raquo ougrave le taux de marqueacutes varie de 70 agrave 79

- Pour ces deux stations la population de juveacuteniles est faible et ils sont majoritairement marqueacutes Cependant au stade adulte les pecircches Interreg montrent une majoriteacute de poissons drsquoorigine meacutediterraneacuteenne La forte contribution de poissons introduits au stade 0+ ne semble pas se retrouver au stade adulte Les conditions de vie dans ce milieu sont tregraves difficiles et ne permettent pas drsquoatteindre des densiteacutes de poissons importantes

Sur les Affluents

Le Risse - Le Hisson montre une majoriteacute drsquoalevins naturels alors que les preacutelegravevements ont eacuteteacute reacutealiseacutes seulement deux mois apregraves le repeuplement Ce cours drsquoeau possegravede un fort potentiel de frai qui est utiliseacute notamment par les geacuteniteurs du Risse- Sur lrsquoaval du Risse le taux de marqueacutes est de 68 Il est le reflet drsquoun alevinage en quantiteacute importante sur le secteur (10 000 alevins) Les alevins naturels repreacutesentent tout de mecircme plus de 30 trois mois apregraves le repeuplement De plus les eacutechantillonnages drsquoadultes reacutealiseacutes sur ce secteur dans le cadre drsquoInterreg ont mis en eacutevidence une quantiteacute importante de geacuteniteurs sauvages La population sur ce secteur est agrave mettre en eacutevidence avec celle du Hisson puisque certains geacuteniteurs du Risse y migrent pour se reproduireLa population sur ce secteur est naturellement fonctionnelle

Le Foron de Mieussy - La station laquo Andelier raquo situeacutee en amont du Foron preacutesente 100 de marqueacutes Cette situation montre une absence totale de reproduction naturelle Le milieu est extrecircmement deacutefavorable agrave lrsquoinstallation drsquoune population fonctionnelle en raison du faible deacutebit de la riviegravere (assegravechement reacutegulier) Aucune classe drsquoacircge intermeacutediaire et aucun adulte nrsquoa eacuteteacute observeacute sur ce secteur Les poissons alevineacutes sont certainement victimes des assegravechements- La station laquo Trebiet raquo situeacutee plus en aval preacutesente au contraire 0 de marqueacutes alors que cette zone a eacuteteacute alevineacutee Ce reacutesultat montre la capaciteacute du Foron sur ce secteur a accueillir une population fonctionnelle Il existe une reproduction naturelle importante sur cette zone avec eacutegalement beaucoup de geacuteniteurs- Vers Sommand une pecircche de sondage a eacuteteacute reacutealiseacutee mais aucun alevin nrsquoa eacuteteacute preacuteleveacute puisque cette zone nrsquoa pas eacuteteacute alevineacutee en 2002 Cependant les reacutesultats de ce sondage mettent en eacutevidence une absence totale de reproduction naturelle (aucun alevin naturel nrsquoa eacuteteacute trouveacute) alors que la population semble eacutequilibreacutee (preacutesence drsquoadultes et de truitelles drsquoacircge intermeacutediaire)

LrsquoEtroit Denteacute Globalement le taux de marqueacutes sur les deux stations eacutetudieacutees est faible (11 agrave 33)- Sur la station laquo aval route raquo la majoriteacute des alevins est naturelle Cette zone montre un habitat tregraves favorable pour la reproduction des geacuteniteurs qui remontent du Giffre- Sur la station laquo amont route raquo une population fonctionnelle de pheacutenotype meacutediterraneacuteen est installeacutee De nombreux geacuteniteurs sont preacutesents et le recrutement naturel est important

19

Le Foron de Taninges - En amont (station Bonnavaz) le taux de marqueacutes est tregraves important (95) Il existe donc une reproduction naturelle mais insuffisante pour permettre lrsquoinstallation drsquoune population et maintenir une activiteacute halieutique Les alevinages passeacutes nrsquoont pas permis drsquoinstaller une population fonctionnelle dans cette zone apicale- Plus en aval sur les zones non alevineacutees les pecircches eacutelectriques drsquoinventaire et de sondage reacutealiseacutees ont montreacute la preacutesence drsquoune population eacutequilibreacutee de pheacutenotype meacutediterraneacuteen avec une importante reproduction naturelle

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

Les principales remarques concernant les pathologies observeacutees sur le bassin du Giffre sont

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

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Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Giffre

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- La PKD est preacutesente sur le cours du Giffre mais uniquement agrave lrsquoaval du barrage de Taninges Cette situation est agrave mettre en relation avec le deacutebit reacuteserveacute insuffisant qui entraicircne une augmentation de tempeacuterature pendant la peacuteriode estivale

- Sur les affluents la PKD a eacuteteacute observeacutee sur les secteurs preacutesentant des faibles deacutebits estivaux (aval du Risse et Foron de Mieussy Andelier) qui sont certainement responsables drsquoune augmentation de tempeacuterature

- La PKD atteint agrave la fois les poissons introduits que les poissons naturels- Le pourcentage drsquoindividus toucheacutes par la PKD varie drsquoun site agrave lrsquoautre mais peut

atteindre une valeur importante avec 50 sur certain secteur- Les maladies bacteacuteriennes sont plus freacutequentes chez les individus marqueacutes Soit ces

poissons sont plus fragiles que les poissons naturels et contractent les maladies plus facilement soit les maladies sont contracteacutees en pisciculture pendant lrsquoeacutelevage

- Le pourcentage drsquoindividus toucheacutes par des symptocircmes bacteacuteriens nrsquoest pas neacutegligeable puisqursquoil peut atteindre 20

- Lrsquoensemble des stations eacutetudieacutees est toucheacute par des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes ce qui laisse penser que lrsquoensemble du bassin peut ecirctre atteint

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

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21

- Le sexe ratio apparaicirct globalement eacutequilibreacute sur lrsquoensemble des stations du Giffre- On observe des diffeacuterences entre les poissons introduits et les poissons naturels sur

seulement 3 stations Ces diffeacuterences sont en faveur des poissons marqueacutes qui montrent un pourcentage de macircles plus important

- Une maturiteacute sexuelle preacutecoce des macircles existe sur certaines stations quelle que soit lrsquoorigine des poissons

- Cette maturiteacute peut ecirctre importante et concerner jusqursquoagrave 20 des 0+

22

213 Le Foron du Reposoir

Deux stations (La Touviegravere et Le Reposoir) ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le Foron du Reposoir Seulement 15 0+ ont eacuteteacute eacutetudieacutes en raison principalement de la difficulteacute drsquoeacutechantillonner des poissons de petite taille (6-7 cm) sur ces milieux torrentiels

Le taux de marqueacutes

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23

- Sur les deux stations eacutetudieacutees le taux de marqueacutes est de 100 Lrsquoensemble des 0+ mecircme si le nombre est faible est donc issu de lrsquoalevinage Ce cours drsquoeau fait lrsquoobjet actuellement drsquoun essai drsquoimplantation drsquoune population agrave partir de la souche Chazey-Bons Rhodanienne Cette souche provient de geacuteniteurs de la riviegravere Furan (Ain) Des analyses geacuteneacutetiques reacutecentes reacutealiseacutees par analyse de microsatellites diagnostic de lrsquoADN ont montreacute que ces poissons ont un pourcentage dallegraveles meacutediterraneacuteens voisin de 65

Ce reacutesultat montre que le cours deau avait un niveau de population tregraves faible avant le repeuplement par la souche Chazey-Bons sauvagesDe plus les pecircches drsquoinventaires du CSP et les pecircches de sondage Interreg montrent qursquoune population de truites se met progressivement en place En effet on observe chaque anneacutee despoissons agrave des stades de plus avanceacutes et les captures par pecircche agrave la ligne commencent agrave ecirctre effectivesLes pecircches eacutelectriques reacutealiseacutees agrave lrsquoautomne 2002 indique que le stock de geacuteniteurs est en cours de reconstitution mais que les truites femelles nrsquoont pas encore atteint le stade geacuteniteurIl nrsquoest donc pas encore possible de dire si lrsquohabitat et la population du Foron du Reposoir sont propices agrave lrsquoinstallation drsquoune population naturellement fonctionnelle

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

Aucun symptocircme reacutenal et heacutemorragique nrsquoapparaicirct sur les 0+ eacutechantillonneacutes sur ce cours deau

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Le sexe ratio est eacutequilibreacute puisqursquoil varie de 50 agrave 60- Il nrsquoy a aucun macircle mature au stade 0+ dans les eacutechantillons preacuteleveacutes sur ce cours

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La Touviegravere Le Reposoir

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Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

24

214 La Filliegravere

Cinq stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal de la Filliegravere ainsi que sept stations sur les trois affluents principaux (Flan Creacutenant et Daudens) Au total 582 poissons 0+ ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

Sur le cours principal

Pour les 5 stations eacutetudieacutees sur le cours principal le taux de 0+ marqueacutes varie de 4 agrave 56 il est donc de tregraves faible agrave moyen et montre une forte reproduction naturelle sur toute la riviegravere Il y a un gradient amont-aval du taux de marqueacutes avec un pourcentage de poissons marqueacutes plus important en amont Cependant sur lrsquoensemble de la Filliegravere le recrutement naturel est dominant et constitue lrsquoessentiel de la population de truite

De plus les pecircches de sondages pour Interreg ont montreacute la preacutesence de nombreux drsquoadultes drsquoorigine naturelle meacutediterraneacuteenne Ceci confirme que la population de truite de la riviegravere principale est naturellement fonctionnelle

Sur les affluents

Les reacutesultats sont diffeacuterents selon que lrsquoaffluent est en connexion ou non avec la riviegravere principale

- Sur le Flan on observe en zone aval et meacutediane (stations laquo D 55 raquo et laquo Bruchon raquo) des taux de marqueacutes faibles (38 et 27) qui mettent en eacutevidence la preacutesence drsquoune forte reproduction naturelle notamment de poissons migrants de la Filliegravere Les releveacutes de frayegraveres reacutealiseacutes par lrsquoAAPPMA avaient deacutejagrave permis drsquoobserver de nombreuses frayegraveres naturelles sur ce secteurEn zone plus amont station laquo Molliet raquo le taux de marqueacutes est plus important (73) il met en eacutevidence la preacutesence drsquoun recrutement naturel mais qui reste au stade 0+ minoritaire par rapport aux individus introduits

- Sur le Daudens les deux stations (laquo Le Plot raquo et Daudens raquo) montrent des taux de marqueacutes importants (86 et 92) La reproduction naturelle est donc tregraves faible et la population de truite ne semble pas fonctionnelle Lrsquoobstacle agrave lrsquoaval de la route deacutepartementale semble preacutejudiciable car il ne permet pas aux geacuteniteurs de la Filliegravere de remonter sur le Daudens et drsquoinstaller une population fiable

- Sur le Crenant Les deux stations eacutechantillonneacutees (laquo aval raquo et Disonche raquo) ne sont pas situeacutees sur des zones alevineacutees en 2002 et il est normal de trouver 0 de marqueacutes Cependant ces reacutesultats montrent qursquoil y a une forte reproduction naturelle sur ce cours drsquoeau mecircme en zone amont et que la population semble naturellement fonctionnelle Les alevins introduits sur le Crenant ne semblent pas avoir deacutevaleacutes sur pour coloniser lrsquoaval du Crenant

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Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

- La PKD semble quasiment absente du bassin de la Filliegravere sauf preacutesence anecdotique uniquement chez les non marqueacutes sur une station (laquo Millard raquo)

- Les individus marqueacutes ne sont pas toucheacutes par la PKD- Les maladies bacteacuteriennes sont preacutesentes sur lrsquoensemble du bassin mais touchent en

prioriteacute et majoritairement les individus marqueacutes

Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

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LeCrenant

LeCrenant

Pourcentage dindividus preacutesentant des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

0102030405060

Le J

ourd

il

Pisc

icul

ture

Milla

rd

Long

cham

ps

D55

Bru

chon

Mol

liet

Le

Plo

t

Dau

dens

Ava

l

Dis

onch

e

La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere Le Flan Le Flan Le Flan LeDaudens

LeDaudens

LeCrenant

LeCrenant

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

0102030405060708090

100

Le J

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il

Pis

cicu

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Milla

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Long

cham

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D55

Bru

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Mol

liet

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Plo

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Ava

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La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere Le Flan Le Flan Le Flan LeDaudens

LeDaudens

LeCrenant

LeCrenant

Pourcentage dindividus preacutesentant des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

0102030405060

Le J

ourd

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Pisc

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Milla

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Long

cham

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D55

Bru

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Mol

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Le

Plo

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Dau

dens

Ava

l

Dis

onch

e

La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere Le Flan Le Flan Le Flan LeDaudens

LeDaudens

LeCrenant

LeCrenant

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

27

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Sur lrsquoensemble des stations le sexe ratio est eacutequilibreacute il montre une plus grande variation chez les individus marqueacutes

- Des macircles matures au stade 0+ ont eacuteteacute observeacutes sur trois stations uniquement chez les individus naturels

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

Pourcentage de macircles au stade 0+

0102030405060708090

Le J

ourd

il

Pis

cicu

lture

Milla

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Long

cham

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D55

Bruc

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Mol

liet

Le

Plo

t

Dau

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Ava

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Dis

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e

LaFilliegravere

LaFilliegravere

LaFilliegravere

LaFilliegravere

Le Flan Le Flan Le Flan LeDaudens

LeDaudens

LeCrenant

LeCrenant

Pourcentage de macircles matures au stade 0+

01020304050

Le J

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Milla

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Long

cham

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Bruc

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Mol

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FilliegravereLa

FilliegravereLa

FilliegravereLe Flan Le Flan Le Flan Le

DaudensLe

DaudensLe

CrenantLe

Crenant

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

Pourcentage de macircles au stade 0+

0102030405060708090

Le J

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LaFilliegravere

LaFilliegravere

LaFilliegravere

LaFilliegravere

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LeCrenant

LeCrenant

Pourcentage de macircles matures au stade 0+

01020304050

Le J

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FilliegravereLa

FilliegravereLa

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DaudensLe

DaudensLe

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Crenant

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

28

215 Le Foron de Fillinges

Trois stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal du Foron de Fillinges agrave savoir de lrsquoamont vers lrsquoaval laquo Bovet ndash Boex raquo laquo Pont de Fillinges raquo et laquo Couvette raquo Au total 178 poissons 0+ ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

Leacutege

nde

Mar

queacutes

Non

mar

queacutes

X

d

rsquoindi

vidu

s m

arqu

eacutes

Sec

teur

ale

vineacute

en

2002

Loca

lisat

ion

des

stat

ions

drsquoeacute

tude

et t

aux

de m

arqu

eacutes s

ur le

bas

sin

du F

oron

de F

illin

ges

laquo C

ouve

tteraquo

2

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0

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Boex

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31

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Boex

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31

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Boex

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31

29

Sur les 3 stations eacutetudieacutees les taux de marqueacutes sont faibles agrave tregraves faibles- Sur la station laquo Bovet ndash Boex raquo le taux de marqueacutes est de seulement 31- A lrsquoaval sur les stations laquo Pont de Fillinges raquo et laquo Couvette raquo les taux de marqueacutes

sont respectivement de 0 et 2

Les reacutesultats indiquent la preacutesence drsquoune importante reproduction naturelle sur lrsquoensemble du Foron de Fillinges Quelque soit la souche utiliseacutee pour lrsquoalevinage atlantique dans le secteur Faucigny ou Meacutediterraneacuteenne Pont de Gys dans le secteur Chablais les poissons introduits restent minoritaires

Cette situation traduit la preacutesence drsquoune population bien installeacutee et fonctionnelle sur cette riviegravere

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

0102030405060708090

100

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Pourcentage dindividus preacutesentant des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

05

101520253035404550

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

0102030405060708090

100

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Pourcentage dindividus preacutesentant des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

05

101520253035404550

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

30

- Sur lrsquoensemble des stations des individus 0+ sont atteints par la PKD le pourcentage drsquoindividus malades peut atteindre 35

- Seuls les individus sauvages semblent toucheacutes par la PKD cependant le nombre drsquoindividus introduits est trop faible pour permettre une comparaison

- Toutes les stations sont eacutegalement toucheacutees par les maladies bacteacuteriennes avec des taux de contamination variant de 15 agrave 30

- Les maladies bacteacuteriennes touchent agrave la fois les individus introduits et les individus naturels

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Le sexe ratio apparaicirct eacutequilibreacute sur lrsquoensemble des stations- On observe des macircles matures degraves le stade 0+ sur lrsquoensemble des stations- Le taux de macircles matures au stade 0+ peut atteindre 15

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

Pourcentage de macircles au stade 0+

0

102030405060

708090

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Pourcentage de macircles matures au stade 0+

05

101520253035404550

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

Pourcentage de macircles au stade 0+

0

102030405060

708090

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Pourcentage de macircles matures au stade 0+

05

101520253035404550

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

31

22Caracteacuteristiques morphologiques

221 Longueur totale des individus

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Giffre

0

20

40

60

80

100

120

140Am

ont

Tine

s

Rev

eacute-Peacute

ret

Mon

tess

uit

Theacutez

iegravere

s

Aval

barr

age

Tani

nges

Pont

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Ris

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Bonn

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Amon

tro

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Aval

rout

e

Ande

lier

Treb

iet

La P

allu

d

Aval

St

Jeoi

re

LeGiffre

LeGiffre

LeGiffre

LeGiffre

LeGiffre

LeGiffre

Le FdeTaninges

LEtroitDenteacute

LEtroitDenteacute

Le F deMieussy

Le F deMieussy

LeHisson

Le Risse

Long

ueur

tota

le e

n m

m

Taille moyenne des 0+ sur le Borne

0

20

40

60

80

100

120

140

GrandBornand

Les Etroits Entremont Beffay St Pierre en F

Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Chinaillon La Duche LOveacuteran

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Taille moyenne des 0+ sur la Filliegravere

0

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Giffre

0

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Le F deMieussy

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Les Etroits Entremont Beffay St Pierre en F

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LeCrenant

LeCrenant

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m

32

Sur la quasi-totaliteacute des stations eacutetudieacutees les individus marqueacutes preacutesentent une taillemoyenne supeacuterieure agrave celle des individus naturels Sur 18 stations ougrave les effectifs permettent des comparaisons statistiques la longueur totale des individus marqueacutes est significativement supeacuterieure agrave celle des truites sauvages pour 13 stations

Les 5 stations faisant exception sont laquo aval barrage Taninges raquo et laquo Pont du Giffre raquo sur le Giffre laquoAval St Jeoire raquo sur le Risse laquo Bonnavaz raquo sur le Foron de Taninges et laquo Couvette raquo sur le Foron de Fillinges Cependant sur ces stations les diffeacuterences ne sont pas significatives

Le fait que les marqueacutes aient une plus grande taille moyenne que les non marqueacutes au stade 0+ nrsquoimplique pas que cela soit systeacutematiquement le cas aux stades ulteacuterieurs En effet CAUDRON (1998) et CHAMPIGNEULLE et CACHERA (2003) ont montreacute respectivement sur le Doubs et le Fier que les diffeacuterences de tailles entre marqueacutes et non marqueacutes au stade 0+ sestompaient au stade 1+ et chez les adultes

Par ailleurs lrsquoexistence drsquoune plus grande taille au stade 0+ en automne pour les marqueacutes ne leur garantit pas un meilleur taux de seacutedentarisation En effet plusieurs eacutetudes dont celle de JONSSON et JONSSON (1993) indiquent que le taux de deacutevalaison peut ecirctre plus eacuteleveacute pour les individus agrave plus forte croissance au stade 0+ La deacutevalaison peut donc toucher preacutefeacuterentiellement les individus marqueacutes en raison de leur forte croissance

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Foron du Reposoir

0

20

40

60

80

100

120

140

La Touviegravere Le Reposoir

F du Reposoir F du Reposoir

Long

ueur

tota

le e

n m

mTaille moyenne des 0+ sur le Foron de Fillinges

0

20

40

60

80

100

120

140

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Long

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tota

le e

n m

m

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Foron du Reposoir

0

20

40

60

80

100

120

140

La Touviegravere Le Reposoir

F du Reposoir F du Reposoir

Long

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mTaille moyenne des 0+ sur le Foron de Fillinges

0

20

40

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100

120

140

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Long

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tota

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n m

m

33

222 Taille des nageoires pectorales

La figure ci-dessus montre qursquoil existe une diffeacuterence entre marqueacutes et non marqueacutes du rapport entre la longueur de la nageoire pectorale et la longueur totale du poisson

Il a sembleacute important drsquoanalyser plus en deacutetail ce caractegravere morphologique car il peut preacutesager de lrsquoaptitude des truites agrave se maintenir dans nos riviegraveres de montagne

Relation entre la longueur de la nageoire pectorale et la longueur totale des individus marqueacutes et non marqueacutes

5

7

9

11

13

15

17

19

21

23

25

27

30 50 70 90 110 130 150 170Longueur totale en mm

Long

ueur

nag

eoire

pec

tora

le e

n m

mMarqueacuteNon marqueacute

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron du Reposoir

12

14

16

18

20

La Touviegravere Le Reposoir

F du Reposoir F du Reposoir

Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron de Fillinges

12

14

16

18

20

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron du Reposoir

12

14

16

18

20

La Touviegravere Le Reposoir

F du Reposoir F du Reposoir

Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron de Fillinges

12

14

16

18

20

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

34

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Giffre

12

14

16

18

20

Am

ont

Tine

s

Rev

eacute-P

eacuteret

Mon

tess

uit

Theacute

ziegraver

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Am

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biet

Ava

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Le Giffre Le Giffre Le Giffre Le Giffre Le Giffre Le Giffre Le FdeTaninges

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LEtroitDenteacute

Le F deMieussy

Le F deMieussy

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Taille relative moyenne des pectorales sur la Filliegravere

12

14

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18

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l

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La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere Le Flan Le Flan Le Flan LeDaudens

LeDaudens

LeCrenant

LeCrenant

Taille relative moyenne des pectorales sur le Borne

12

14

16

18

20

GrandBornand

Les Etroits Entremont Beffay St Pierre en F

Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Chinaillon La Duche LOveacuteran

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Giffre

12

14

16

18

20

Am

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Tine

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Le F deMieussy

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Taille relative moyenne des pectorales sur la Filliegravere

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Taille relative moyenne des pectorales sur le Borne

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GrandBornand

Les Etroits Entremont Beffay St Pierre en F

Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Chinaillon La Duche LOveacuteran

35

Sur les 24 stations ougrave des individus marqueacutes et non marqueacutes coexistent la taille relative des nageoires pectorales est systeacutematiquement plus importante chez les individus naturelsLes truites issues du repeuplement preacutesentent donc des nageoires pectorales de longueur infeacuterieure agrave celle des truites sauvagesCette diffeacuterence morphologique est tregraves importante car le deacuteveloppement des nageoires est un eacuteleacutement deacuteterminant pour la survie du poisson dans son milieu notamment pour la stabiliteacute la reacutesistance au courant et la recherche de nourriture an action de chasse

Il semble donc possible que cette caracteacuteristique anatomique soit le reacutesultat drsquoune adaptation agrave la vie en torrent

BOSAKOWSKI et al (1993) ont eacutegalement observeacutes des reacutesultats comparables chez des truites arc-en-ciel et des truites brunes de plus grande taille entre poissons drsquoeacutelevage et poissons sauvages Dans cette eacutetude les poissons deacutelevage preacutesentaient des nageoires nettement plus courtes (10-50) que les poissons sauvages Selon les auteurs cette diffeacuterence semblait ecirctre causeacutee par les conditions de vie des poissons dans les bassins des piscicultures(agression intraspeacutecifique stress qualiteacute de leau et densiteacutes de poissons) qui provoquaient une eacuterosion des nageoires

Dans le cas preacutesent les poissons de repeuplement ont eacuteteacute introduits agrave des stades preacutecoces dans le milieu et ont eacuteteacute preacuteleveacutes 4 agrave 5 mois apregraves leur introduction En conseacutequence ils ont veacutecu peu de temps en pisciculture et ont par contre passeacute lessentiel de leur vie dans le mecircme milieu naturel que les poissons sauvages Ainsi il semble que ce dimorphisme de la nageoire entre poissons sauvages et introduits soit drsquoorigine geacuteneacutetique Une eacutetude de RIDDELL et al (1981) a montreacute chez le saumon que les diffeacuterences de deacuteveloppement de nageoires eacutetaient une adaptation des poissons agrave leur milieu qui preacutesentait une origine geacuteneacutetiqueIl est donc tout agrave fait probable qursquoun pheacutenomegravene similaire se rencontre chez la truite fario et que les truites sauvages soient mieux adapteacutees sur le plan morphologique (gracircce agrave des diffeacuterences geacuteneacutetiques) aux conditions du milieu que les poissons introduits mecircme agrave des stades preacutecoces

Outre lrsquoaspect purement geacuteneacutetique les facteurs environnants peuvent eacutegalement jouer un rocircle important En effet McLAUGHLIN et al (2002) ont montreacute que cette diffeacuterence au niveau des nageoires peut eacutegalement ecirctre due agrave des caracteacuteristiques du milieu environnant dans les premiegraveres semaines de vie des poissons En effet plusieurs lots drsquoune mecircme souche de saumon de fontaine soumis degraves lrsquoeacuteclosion agrave des conditions de vie diffeacuterentes montrent des diffeacuterences dans le deacuteveloppement des nageoires Ainsi degraves les premiegraveres semaines les poissons exposeacutes agrave un fort courant sont pourvus de nageoires plus longues

Il est donc possible que les alevins produits en pisciculture nrsquoeacutetant pas exposeacutes agrave des courants importants au cours de leurs premiegraveres semaines de vie deacuteveloppent des nageoires pectorales moins longues que les individus sauvages

Il y a probablement pour cette caracteacuteristique morphologique des interactions combinant geacuteneacutetique et conditions environnementales

Cette diffeacuterence morphologique peut eacutegalement avoir une importance dans la compeacutetition entre poissons sauvages et introduits notamment au stade juveacutenile En effet GIBSON (1973) a deacutemontreacute limportance des nageoires dans la compeacutetition interspeacutecifique

36

entre le saumon atlantique (Salmo salar L) et le saumon de fontaine (Salvenius fontinalis) deux poissons consommant la mecircme nourriture Le fait de posseacuteder des nageoires pectorales plus deacutevelopper permet au saumon atlantique de se maintenir dans les courants pour se nourrir tout en deacutepensant moins drsquoeacutenergie

Dans le cas des torrents haut-savoyards une compeacutetition intraspeacutecifique entre truites sauvages et introduites comparable agrave leacutetude de GIBSON peut se deacutevelopper La diffeacuterence morphologique entre les truites sauvages et issues du repeuplement peut donc avoir une influence lors de la compeacutetition entre ces deux types dindividus

37

3 Premiegraveres implications pour la gestion

En fonction des reacutesultats obtenus lors de la campagne de preacutelegravevements 2002 des orientations de gestion sont proposeacutees pour chaque riviegravere eacutetudieacutee Certaines propositions impliquent des changements relativement importants des pratiques actuelles de gestion

Lrsquoeacutetude de lrsquoefficaciteacute des repeuplements srsquoappuient sur une deacutemarche scientifique rigoureuse dans lrsquointeacuterecirct des gestionnaires directs (AAPPMA) puisqursquoelle permet agrave ces derniers de prendre des deacutecisions en srsquoappuyant sur des reacutesultats concrets et indiscutables Elle est conduite dans un souci drsquoeacutevaluer en toute objectiviteacute les pratiques drsquoalevinage dans le seul but drsquoameacuteliorer la gestion actuelle des populations et des milieux Concregravetement elle permet de connaicirctre rapidement les zones ougrave lrsquoalevinage en truite fario est inefficace et donc inutile et les zones ougrave celui-ci est efficace et donc neacutecessaire

En plus des reacutesultats obtenus gracircce aux marquages des juveacuteniles les propositions prennent en compte les premiers reacutesultats issus des pecircches de sondage drsquoadultes reacutealiseacutees pour le programme INTERREG (reacutedaction en cours) Lrsquointeacutegration des diffeacuterentes donneacutees (marquage juveacutenile + adultes) permet de faire des propositions coheacuterentes selon un diagnostic le plus complet possible de la population de truite preacutesente

31 Bassin du Borne

Sur les riviegraveres du bassin du Borne les orientations de gestion proposeacutees ci-apregraves restent conformes agrave celles deacutejagrave eacutevoqueacutes par CAUDRON et CHAMPIGNEULLE (2002)

Arrecirct du repeuplement selon les pratiques actuelles sur lrsquoensemble du cours principal Cette proposition est motiveacutee par deux principales raisons

- Lrsquoalevinage est inefficace agrave lrsquoamont du seuil drsquoEntremont car apregraves plus de 15 ans il nrsquoa pas permis drsquoinstaller une population en place eacutequilibreacutee

- Il semble impeacuteratif de preacuteserver lrsquoimportante population de truite sauvage preacutesente agrave lrsquoaval du seuil drsquoEntremont Les reacutesultats geacuteneacutetiques indiquent que la population preacutesente est une population sauvage qui nrsquoa pas eacuteteacuteimplanteacutee suite agrave lrsquoalevinage Elle preacutesente un degreacute de pureteacute geacuteneacutetique important Cette population repreacutesente un patrimoine unique dans le Faucigny Le but drsquoarrecircter les alevinages sur ce secteur est drsquoeacuteviter les hybridations qui peuvent entraicircner une perte de plasticiteacute geacuteneacutetique et une deacutegeacuteneacuterescence de la souche sauvage actuelle

Arrecirct du repeuplement sur lrsquoaval de lrsquoOveacuteran Ce secteur est utiliseacute comme zone de reproduction par les geacuteniteurs du Borne et la reproduction naturelle y est abondante Lrsquoalevinage nrsquoest donc pas neacutecessaire et risque comme sur le Borne de provoquer une hybridation de la population naturelle

Essayer drsquoinstaller une population naturelle agrave lrsquoamont du seuil drsquoEntremont par transferts de geacuteniteurs

Sur les autres affluents deux sceacutenarii de gestion peuvent ecirctre envisageacutes selon la volonteacute politique des gestionnaires directs

Sceacutenario ndeg1 vision patrimoniale

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- Arrecirct du repeuplement en truite drsquoorigine Atlantique pendant 3 anneacutees conseacutecutives pour diminuer leur preacutesence sur le bassin

- Puis reprise de lrsquoalevinage pendant uniquement 3 anneacutees agrave partir de poissons sauvages issus du Borne pour essayer drsquoinstaller une population naturelle

Sceacutenario ndeg2 vision halieutique- Maintien des pratiques drsquoalevinage en atlantique pour soutenir

artificiellement le stock de poissons dans un inteacuterecirct uniquement halieutique Attention cette pratique risque de provoquer par deacutevalaison des individus introduits une hybridation des poissons sauvages preacutesents dans le Borne

Eventuellement repeuplement en truites Arc en Ciel surdensitaires sur des secteurs preacutecis du Borne pendant la peacuteriode estivale afin de contenter une certaine cateacutegorie de pecirccheurs Les repeuplements en Arc en Ciel ne risquent pas de provoquer drsquohybridation de la souche fario locale Attention prendre des preacutecautions aupregraves des fournisseurs concernant la qualiteacute sanitaire des poissons

32 Bassin du Giffre

Les propositions sur le bassin du Giffre prennent en compte les reacutesultats du marquage mais eacutegalement la situation actuelle de la riviegravere suite agrave lrsquoeacuteboulement de Sixt Fer agrave Cheval

Ne pas aleviner le cours principal du Giffre en alevins de fario pendant 5 anneacutees conseacutecutives Cette proposition est motiveacutee par les raisons suivantes

- Il est impossible de savoir comment va eacutevoluer dans les prochains mois et les prochaines anneacutees le glissement agrave lrsquoamont de Sixt Il semble donc risqueacute drsquoentreprendre un alevinage pour installer une nouvelle population

- Les reacutesultats des marquages sur le Giffre sont tregraves contrasteacutes Sauf au niveau de Sixt ils montrent qursquoil existait avant le glissement une reproduction naturelle importante et capable de soutenir une population

- Les reacutesultats geacuteneacutetiques reacutecents indiquent que les populations en place sont en majoriteacute drsquoorigine atlantique mais qursquoil existe encore des individus meacutediterraneacuteens non hybrideacutes jusque dans les zones amont Ces reacutesultats prouvent qursquohistoriquement la souche meacutediterraneacuteenne eacutetait bien preacutesente sur lrsquoensemble du Giffre

- Il est envisageable que cette souche sauvage eacutegalement preacutesente sur les parties basses des affluents recolonise naturellement le Giffre

- Lrsquoexemple du Borne montre qursquoapregraves une catastrophe la riviegravere a eacuteteacute recoloniseacutee par une souche sauvage malgreacute des alevinages massifs Les reacutesultats obtenus sur cette riviegravere doivent servir de base de reacuteflexions pour la nouvelle gestion agrave entreprendre sur le Giffre

- Entre le Risse et Marignier la population de truites avant le glissement eacutetait deacutejagrave totalement deacuteseacutequilibreacutee et en quasi disparition (peu de juveacuteniles quasi absence de geacuteniteurs et absence de classes drsquoacircges intermeacutediaires) malgreacute les alevinages massifs sur ce secteur

39

Reacutealiser un bilan de lrsquoimpact du glissement de terrain sur le peuplement piscicole

- Une eacutetude piscicole sera reacutealiseacutee tregraves prochainement (2004 ou 2005) sur le Giffre dans le cadre du contrat de riviegravere Cette eacutetude permettra de faire un premiereacutetat des lieux complet du peuplement piscicole suite au glissement

Accomplir un diagnostic de lrsquoeacutetat de recolonisation du Giffre par les populations naturelles

- En lrsquoabsence drsquoalevinage il sera possible de reacutealiser en 2008 un bilan des populations de truites installeacutees sur le Giffre

- A partir de lrsquoeacutetat de la population agrave cette eacutepoque un plan drsquoalevinage coheacuterent en truite fario pourra ecirctre eacutetabli pour permettre drsquoinstaller de nouvelles populations ou de soutenir des populations preacutesentes

Mettre en place des deacuteversements de truites Arc en Ciel pendant toute la peacuteriode drsquoarrecirct de lrsquoalevinage en fario Attention prendre des preacutecautions aupregraves des fournisseurs concernant la qualiteacute sanitaire des poissons

Reacuteintroduire lrsquoOmbre commun sur la plaine de Samoeumlns et agrave lrsquoaval de la confluence avec le Risse

Arrecirct de lrsquoalevinage sur lrsquoensemble du Risse sur lrsquoaval du Foron de Mieussy et sur lrsquoEtroit Denteacutee

- Sur ces riviegraveres le suivi du marquage a montreacute que lrsquoalevinage nrsquoeacutetait pas neacutecessaire pour soutenir les populations de truites preacutesentes

Maintenir lrsquoalevinage sur lrsquoamont du Foron de Mieussy (vers Sommand) et lrsquoamont du Foron de Taninges (Bonnavaz)

- Sur ces secteurs le suivi du marquage a montreacute que les juveacuteniles preacutesents dans le milieu naturel eacutetaient en majoriteacute des individus introduits

33 Le Foron du Reposoir

Les propositions de gestion sur le Foron du Reposoir sont

Maintenir les alevinages actuels avec la souche Chazey Bons Rhodanienne

Suivre lrsquoeacutevolution de la population pour savoir si cet alevinage permet drsquoinstaller une population fonctionnelle

- Ce suivi peut comprendre des pecircches de sondages en deacutebut de peacuteriode de reproduction pour voir si les poissons adultes deviennent matures des releveacutes de frayegraveres sur la riviegravere pour savoir si les poissons se reproduisent et de nouveaux preacutelegravevements de poissons pour suivre lrsquoeacutevolution du taux de marqueacutes dans la population

34 Bassin de la Filliegravere

Les orientations pour une gestion coheacuterente des populations de la Filliegravere sont les suivantes

40

Arrecirct de lrsquoalevinage sur le cours principal de la Filliegravere sur le Crenant et sur lrsquoaval du Flan

- Sur ces 3 riviegraveres lrsquoalevinage nrsquoest pas neacutecessaire car il ne permet pas de soutenir les populations preacutesentes et de plus la reproduction naturelle est tregraves importante

- Sur la Filliegravere les pecircches drsquoadultes dans le cadre du programme INTERREG ont mis en eacutevidence la preacutesence drsquoune population sauvage drsquoorigine meacutediterraneacuteenne Il semble important drsquoentreprendre une mesure de conservation de cette souche en arrecirctant lrsquoalevinage pour eacuteviter lrsquohybridation

- Sur lrsquoamont du Flan il est neacutecessaire de continuer le suivi des poissons marqueacutes pour savoir si lrsquoalevinage doit ecirctre maintenu

Sur le Daudens deux sceacutenarii de gestion peuvent ecirctre envisageacutes selon la volonteacute politique des gestionnaires directs

Sceacutenario ndeg1 vision patrimoniale- Arrecirct du repeuplement en truite drsquoorigine Atlantique pendant 3 anneacutees

conseacutecutives pour diminuer leur preacutesence sur le bassin- Commencer les proceacutedures afin de rendre le seuil du Plot

franchissable pour les geacuteniteurs de la Filliegravere- Reacutealiser un bilan notamment deacutemographique de la population en place

apregraves lrsquoarrecirct de lrsquoalevinage- Puis reprise de lrsquoalevinage pendant uniquement 3 anneacutees agrave partir de

poissons sauvages issus de la Filliegravere pour essayer drsquoinstaller une population naturelle

Sceacutenario ndeg2 vision halieutique- Maintien des pratiques drsquoalevinage en atlantique pour soutenir

artificiellement le stock de poissons dans un inteacuterecirct uniquement halieutique Attention cette pratique risque de provoquer par deacutevalaison des individus introduits une hybridation des poissons sauvages preacutesents dans la Filliegravere

35 Le Foron de Fillinges

Les reacutesultats obtenus sur le Foron de Fillinges ont conduit agrave formuler les propositions de gestion suivantes

Arrecirct de lrsquoalevinage sur lrsquoensemble du Foron de Fillinges- Quelque soit la souche utiliseacutee et les quantiteacutes introduites les poissons

alevineacutes ne repreacutesentent qursquoune tregraves faible minoriteacute des poissons preacutesents dans le milieu Le Foron abrite une population naturelle fonctionnelle et eacutequilibreacutee

Suivi de la population suite agrave lrsquoarrecirct du repeuplement- Reacutealisation de 5 stations de pecircches eacutelectriques la derniegravere anneacutee de

lrsquoalevinage afin de reacutealiser un eacutetat des lieux preacutecis de la population de truites et du peuplement piscicole

- Reacutealisation drsquoun nouveau bilan de la population du Foron respectivement 3 ans puis 6 ans apregraves lrsquoarrecirct de lrsquoalevinage

41

4 Investigations suppleacutementaires

Suite aux premiers reacutesultats obtenus lors de la campagne 2002 des investigations suppleacutementaires permettant de preacuteciser certains points seront reacutealiseacutees

Reacutealiser une analyse bacteacuteriologique des diffeacuterents lots de poissons alevineacutes qui ont transiteacutes dans les piscicultures associatives Cette recherche de pathologie permettra de savoir si les poissons issus de pisciculture sont porteurs drsquoune maladie bacteacuterienne avant drsquoecirctre introduits dans le milieu ou si ils contractent la maladie dans le milieu naturel

Rechercher les raisons pour lesquelles on nrsquoobserve pas drsquoalevins naturels sur certains secteurs Les causes drsquoune telle situation peuvent ecirctre

- Lrsquoabsence totale de geacuteniteurs dans la population Les poissons nrsquoont pas le temps de devenir adulte (3+) et sont captureacutes avant par les pecirccheurs

- La preacutesence drsquoadultes non matures Les poissons deviennent adultes mais sont immatures (eacutetat sanitaire des poissons souche geacuteneacutetiquement deacutegeacuteneacutereacutee)

- Survie nulle durant la phase de vie sous graviers Les poissons pondent mais les œufs nrsquoarrivent pas agrave se deacutevelopper et la mortaliteacute est totale

Sur les secteurs du Chinaillon de la Duche de lrsquoOveacuteran amont et du Foron de Mieussy amont (Sommand) les actions suivantes peuvent ecirctre entreprises

- Pecircches eacutelectriques de sondage en deacutebut de la peacuteriode de reproduction pour savoir si les poissons deviennent matures

- Releveacutes de frayegraveres permettant drsquoobserver ou non une activiteacute de reproduction- Mise en place drsquoincubateurs-tests contenant des œufs de truites pour connaicirctre le taux

de survie des œufs dans les frayegraveres

Reacutealiser des preacutelegravevements suppleacutementaires aux classes drsquoacircge supeacuterieures (1+ et 2+) sur certaines stations pour voir lrsquoeacutevolution du taux de marqueacutes au cours des anneacutees Ces recherches suppleacutementaires peuvent ecirctre effectueacutees sur 8 cours drsquoeau ougrave le taux de marqueacutes deacutepasse 60 au stade 0+

Le ruisseau de la Duche amontLe ruisseau du Chinaillon amontLe Foron du ReposoirLe Risse avalLe Foron de Taninges amont (Bonnavaz)Le Foron de Mieussy amont (Sommand)Le Daudens amont et avalLe Flan amont

Dans les eacutetudes preacuteceacutedentes reacutealiseacutees sur le Fier (CAUDRON et CHAMPIGNEULLE 2002) et sur le Doubs (CHAMPIGNEULLE et al 2002) les taux de marqueacutes aux stades 1+ et 2+ dans la population en place srsquoeffondraient et devenaient tregraves faibles ou nuls

Pour informations le graphique suivant montre lrsquoeacutevolution du taux de marqueacutes agrave diffeacuterents stades sur les stations ougrave le taux de 0+ marqueacutes eacutetait eacuteleveacute

42

Les reacutesultats montrent agrave part pour une station une chute importante des taux de marqueacutes entre les stades 0+ et 1+ Cette chute se poursuit eacutegalement au stade 2+Ces reacutesultats obtenus sur le Fier et le Doubs semblent laisser peu drsquoespoirs sur le devenir des poissons marqueacutes sur les bassins eacutetudieacutes en 2002

Reacutesultats sur leacutevolution du taux de m arqueacutes aux diffeacuterents stades obtenus lors des eacutetudes preacuteceacutedentes sur le Fier et le Doubs

0102030405060708090

100

0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 0+ 1+ 0+ 1+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+

Station A Station B Station C StationD

StationE

StationF

Station A Station B StationC

Stations et stades

Pou

rcen

tage

de

mar

queacutes

Le Fier Le Doubs

Reacutesultats sur leacutevolution du taux de m arqueacutes aux diffeacuterents stades obtenus lors des eacutetudes preacuteceacutedentes sur le Fier et le Doubs

0102030405060708090

100

0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 0+ 1+ 0+ 1+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+

Station A Station B Station C StationD

StationE

StationF

Station A Station B StationC

Stations et stades

Pou

rcen

tage

de

mar

queacutes

Le Fier Le Doubs

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9

Extraction de lrsquootolithe Otolithes colleacutes sur lame mince Ponccedilage de lrsquootolithe

Observation de la lame mince au microscope

05mm 05mmVue au microscope drsquoun otolithe ponceacute Otolithe marqueacute (anneau fluo vert-jaune)

16Symptocircmes pathologiques observeacutes

161 La maladie reacutenale prolifeacuterative (MRP ou PKD ou teacutetracapsulose)

Selon ESCHER et al (Fischnetz-info mars et deacutecembre 2001) cette maladie est provoqueacutee par un seul parasite Tetracapsula bryosalmonae (myxosoaire) Chez les poissons on le rencontre chez les salmonideacutes et le brochet les truites eacutetant particuliegraverement toucheacutees Le taux de mortaliteacute peut ecirctre fort chez ces derniegraveres (10 agrave 100) surtout sur les estivaux

Pour que les symptocircmes (affaiblissement contraction dautres maladies) se deacuteveloppent la tempeacuterature de leau doit ecirctre supeacuterieure agrave 15degC De plus il semble que des facteurs tels quun faible taux doxygeacutenation ou une pollution chimique favoriseraient la maladie

10

Afin de savoir si la truite en preacutesence est infecteacutee il faut observer ses reins En effet un poisson ayant deacuteveloppeacute la maladie a des reins grossis et dune coloration inhabituelle

Le mode de propagation de la maladie et le cycle complet du parasite ne sont que partiellement connus Tetracapsula parasite les bryozoaires de petits organismes filtreurs qui forment des colonies de quelques centimegravetres de diamegravetre sur diffeacuterents types de substrats et que lon rencontre dans la plupart des lacs et cours deau

Les parasites se multiplient dans les bryozoaires ils ont alors une taille de 20 μm et se concentrent dans des sortes de grandes poches de 350 μm de diamegravetre Le parasite peacutenegravetre dans le poisson sous forme de petites spores agrave travers les cellules du mucilage de la peau et ce au cours de la premiegravere minute apregraves lentreacutee en contact avec lagent pathogegravene A laide de la circulation sanguine les parasites atteignent les reins ougrave ils forment diffeacuterents stades de deacuteveloppement et provoquent de violentes reacuteactions inflammatoires Il en reacutesulte les diffeacuterentssymptocircmes deacutecrits preacuteceacutedemment

Le parasite drsquoun diamegravetre de 5 agrave 20 microm a pu ecirctre observeacute dans les vaisseaux sanguins de presque tous les organes (sauf du cerveau de la moelle eacutepiniegravere et des yeux) Les spores sont libeacutereacutees dans lrsquoeau avec lrsquourine du poisson et sont probablement absorbeacutees de nouveau par les bryozoaires

Les truites qui survivent ou qui ont deacutejagrave eacuteteacute infecteacutees sans deacutevelopper la maladie sont en geacuteneacuteral immuniseacutees lanneacutee suivante

Poisson atteint pas la PKD (reins gonfleacutes et preacutesence de nodules)

La PKD provoque chez les jeunes truites une mortaliteacute variant de 10 agrave 100 des individus toucheacutesLe deacuteveloppement du parasite est favoriseacute en eacuteteacute lorsque la tempeacuterature de lrsquoeau atteint 15degC

162 Pathologies bacteacuteriennes

Des symptocircmes probablement dus agrave une pathologie bacteacuterienne ont eacuteteacute mis en eacutevidence lors de cette eacutetude En effet un pourcentage non neacutegligeable de truites eacutetait affecteacute par des rougeurs de type heacutemorragie agrave la base des nageoires

11

Selon MORAND (com pers) deux maladies bacteacuteriennes peuvent engendrer ces symptocircmes (la furonculose et la yerciniose) Ces deux maladies sont preacutesentes dans le monde entier et atteignent tout particuliegraverement les eacutelevages de salmonideacutes

Elles peuvent ecirctre favoriseacutees par des conditions particuliegraveres du milieu environnant tempeacuterature de leau eacuteleveacutee (supeacuterieure agrave 10 degC) une charge organique importante ou encore une pollution diminuant les deacutefenses immunitaires du poissonhellip

Selon la graviteacute de laffection ces pathologies peuvent entraicircner de lourds taux de mortaliteacute atteignant jusquagrave 70 dans certains cas (MOURRIERAS 1995)

Les heacutemorragies observeacutees agrave la base des nageoires sont la conseacutequence drsquoune infection bacteacuterienne pouvant provoquer drsquoimportantes mortaliteacutes

17Utilisation du SIG de la Feacutedeacuteration de pecircche de Haute-Savoie

Les donneacutees du programme pilote de marquage et du programme INTERREG sont inteacutegreacutees dans un SIG (Systegraveme dInformation Geacuteographique MapInfo) mis en place agrave la Feacutedeacuteration de pecircche de Haute-Savoie et agrave lINRA de Thonon

Ainsi toutes les informations relatives aux cours deau du deacutepartement seront consigneacutees dans cette base de donneacutees (pente longueur preacutesence de seuils infranchissables caracteacuteristiques physico-chimiques IBGN hydrologie occupation des bassins versantshellip) Il en sera de mecircme pour les donneacutees truites (repeuplement densiteacute biomasses croissance structure dacircge pathologie geacuteneacutetiquehellip)

Lapproche finale visera agrave rechercher les relations existant entre ces deux groupes de donneacutees spatialiseacutees Une toute premiegravere deacutemarche a eacuteteacute partiellement tenteacutee dans le cas du preacutesent rapport dont les donneacutees ont eacuteteacute inteacutegreacutees dans le SIG en cours de construction

12

2 Reacutesultats et discussions

Ce chapitre preacutesente les reacutesultats obtenus sur les bassins eacutetudieacutes lors de la campagne de preacutelegravevements 2002 agrave savoir

Le GiffreLe BorneLa FilliegravereLe Foron de ScionsiezLe Foron de Fillinges

Lors de la campagne 2002 1703 poissons au stade 0+ ont eacuteteacute eacutechantillonneacutes en milieu naturel et eacutetudieacutes en laboratoire

21Taux de marquage sexe ratio et pathologie

211 Le Borne

Sur le bassin du Borne 5 stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal et 3 sur des affluents Au total ce sont 392 poissons 0+ qui ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

Sur le cours principal

Les taux de marqueacutes varient fortement sur le cours principal du Borne (18 agrave 100) On observe un gradient amont-aval du taux de marqueacutes qui peut ecirctre mis en relation avec la preacutesence drsquoun obstacle partiellement infranchissable pour les geacuteniteurs au niveau drsquoEntremont

Ainsi deux grandes zones peuvent ecirctre distingueacutees sur le Borne

La zone amont du seuil drsquoEntremont ougrave la majoriteacute des juveacuteniles sont issus du repeuplement (90 agrave 100)

On observe sur ce secteur une tregraves faible reproduction naturelle en raison drsquoune quasi-absence de poissons adultes La situation de la population de truites est donc tregraves critique Si le repeuplement permet de drsquoobserver des 0+ il nrsquoa pas permis drsquoinstaller une population fonctionnelle

La zone aval du seuil drsquoEntremont ougrave la majoriteacute des individus preacutesents au stade 0+ sont des poissons naturels

En effet le taux de marqueacutes varie de 18 agrave 49 Les pecircches de sondage Interreg ont montreacute la preacutesence drsquoune importante population de truites sauvages drsquoorigine meacutediterraneacuteenne La population est eacutequilibreacutee et naturellement fonctionnelle puisqursquoon observe une forte reproduction naturelle et de nombreux geacuteniteurs

13

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14

Sur les Affluents

Sur les 3 affluents eacutetudieacutes la situation est tregraves simple En effet soit on observe 0 de marqueacutes soit 100

- Sur lrsquoOveacuteran aval aucun poisson marqueacute nrsquoa eacuteteacute trouveacute puisqursquoil nrsquoy a pas eu de repeuplement sur ce secteur en 2002 Le reacutesultat obtenu montre une importante reproduction naturelle des geacuteniteurs du Borne qui remontent sur lrsquoaval de ce cours drsquoeau

- Sur la Duche et le Chinaillon il y a absence totale de reproduction naturelle puisque 100 des 0+ eacutechantillonneacutes sont marqueacutes Pourtant on observe de nombreux poissons adultes sur ces secteurs susceptibles drsquoecirctre des geacuteniteurs ainsi que diffeacuterentes classes drsquoacircge Lrsquoeacutequilibre de ces populations est artificiellement maintenu par les alevinages

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

- Toutes les stations eacutetudieacutees ne sont pas concerneacutees par ces symptocircmes de maladies- Les maladies bacteacuteriennes semblent toucher majoritairement les poissons introduits- Cependant les 0+ de lrsquoOveacuteran aval tous naturels sont infecteacutes agrave 15 Ce reacutesultat

peut refleacuteter une contamination par deacutevalaison provenant drsquoindividus atteints situeacutes plus en amont de lrsquoOveacuteran ou une contamination naturelle par des agents pathogegravenes preacutesents dans le milieu

- Les poissons marqueacutes peuvent ecirctre contamineacutes agrave un taux non neacutegligeable pouvant atteindre plus de 30

Pourcentage dindividus preacutesentant des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

15

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Le sexe ratio est relativement eacutequilibreacute pour les marqueacutes comme pour les non marqueacutes Seule une station sur le Borne (Beffay) montre 85 de macircle dans la population de 0+

- Seules 2 stations montrent des macircles matures au stade 0+- Le pourcentage de macircles matures au stade 0+ est plus important chez les non

marqueacutes que chez les marqueacutes

Pourcentage de macircles au stade 0+

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Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Borne

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Pourcentage de macircles au stade 0+

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Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Borne

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

16

212 Le Giffre

Sur le bassin du Giffre 6 stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal et 7 sur des affluents Au total ce sont 536 poissons 0+ qui ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

Sur le cours principal

La carte de synthegravese des reacutesultats met en eacutevidence des taux de marqueacutes tregraves contrasteacutes variant entre 0 et 100 Sauf deux cas particuliers la campagne de preacutelegravevements a permis de montrer qursquoune reproduction naturelle existait sur lrsquoensemble du Giffre

Il est possible de distinguer trois zones successives sur ce cours deau

La zone aval est composeacutee de la station Pont du Giffre ougrave le taux de marqueacutes est de 74 Cette station sur le Giffre doit ecirctre rapprocheacutee des stations eacutetudieacutees sur le Risse (station laquo Risse aval St Jeoire raquo) et le Hisson(laquo station La Pallud raquo) pour mieux comprendre le fonctionnement de la population

- Sur le Giffre aval la situation semble tregraves critique La station dite laquo Pont du Giffre raquosrsquoeacutetend de lrsquoamont de Marignier agrave lrsquousine du Pont du Giffre soit sur environ 25 km Sur cette distance seulement 31 0+ ont pu ecirctre captureacutes De plus les pecircches drsquoadultes dans le cadre drsquoInterreg montrent un deacuteficit inquieacutetant de geacuteniteurs sur ce secteur ainsi qursquoune surabondance de Chabot La situation du bas Giffre montre une population de truitetotalement deacuteseacutequilibreacutee loin du potentiel de la riviegravere et qui ne peut pas ecirctre reacutehabiliteacutee par le seul fait de lrsquoalevinage Cette situation peut ecirctre le reacutesultat du faible deacutebit reacuteserveacute qui appauvrit lrsquohabitat aquatique et provoque des eacuteleacutevations de tempeacuterature inquieacutetantes Les reacutesultats de pecircche drsquoinventaire dans la reacuteserve de Marignier montrent que les poissons sont concentreacutes agrave lrsquoaval immeacutediat des seuils ougrave lrsquoon note la preacutesence de fosses de tempeacuteratures plus faibles et drsquoune meilleure oxygeacutenation

La zone moyenne situeacutee entre le barrage de Mieussy et Samoeumlns qui est composeacutee des stations laquo aval barrage Taninges raquo laquo Theacuteziegraveres raquo et laquo Montessuit raquo Sur ce secteur les 0+ marqueacutes sont en minoriteacutes puisqursquoils repreacutesentent 11 agrave 38 du peuplement

- Sur le Giffre aval barrage de Taninges le secteur nrsquoest pas alevineacute il est donc normal que pregraves de 90 des poissons ne soient pas marqueacutes Les 0+ marqueacutes proviennent certainement du ruisseau de lrsquoEtroit Denteacute qui est fortement alevineacute et agrave partir duquel une deacutevalaison doit avoir lieu- Le secteur des laquo Theacuteziegraveres raquo et de laquo Montessuit raquo bien que reacuteguliegraverement alevineacute montre un taux important drsquoalevins naturels (62 agrave 77) Ce reacutesultat est tout agrave fait en accord avec le suivi de la reproduction naturelle et le recensement de frayegraveres reacutealiseacute par lrsquoAAPPMA du Faucigny et le CSP en 1999 En effet de nombreuses frayegraveres naturelles avaient eacuteteacute observeacutees sur ce site Le peuplement drsquoadultes nrsquoest pas tregraves important mais est en rapport avec les potentialiteacutes du milieu

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La zone amont caracteacuteriseacutee par les stations laquo Reveacute-Peacuteret raquo et laquo amont Tines raquo ougrave le taux de marqueacutes varie de 70 agrave 79

- Pour ces deux stations la population de juveacuteniles est faible et ils sont majoritairement marqueacutes Cependant au stade adulte les pecircches Interreg montrent une majoriteacute de poissons drsquoorigine meacutediterraneacuteenne La forte contribution de poissons introduits au stade 0+ ne semble pas se retrouver au stade adulte Les conditions de vie dans ce milieu sont tregraves difficiles et ne permettent pas drsquoatteindre des densiteacutes de poissons importantes

Sur les Affluents

Le Risse - Le Hisson montre une majoriteacute drsquoalevins naturels alors que les preacutelegravevements ont eacuteteacute reacutealiseacutes seulement deux mois apregraves le repeuplement Ce cours drsquoeau possegravede un fort potentiel de frai qui est utiliseacute notamment par les geacuteniteurs du Risse- Sur lrsquoaval du Risse le taux de marqueacutes est de 68 Il est le reflet drsquoun alevinage en quantiteacute importante sur le secteur (10 000 alevins) Les alevins naturels repreacutesentent tout de mecircme plus de 30 trois mois apregraves le repeuplement De plus les eacutechantillonnages drsquoadultes reacutealiseacutes sur ce secteur dans le cadre drsquoInterreg ont mis en eacutevidence une quantiteacute importante de geacuteniteurs sauvages La population sur ce secteur est agrave mettre en eacutevidence avec celle du Hisson puisque certains geacuteniteurs du Risse y migrent pour se reproduireLa population sur ce secteur est naturellement fonctionnelle

Le Foron de Mieussy - La station laquo Andelier raquo situeacutee en amont du Foron preacutesente 100 de marqueacutes Cette situation montre une absence totale de reproduction naturelle Le milieu est extrecircmement deacutefavorable agrave lrsquoinstallation drsquoune population fonctionnelle en raison du faible deacutebit de la riviegravere (assegravechement reacutegulier) Aucune classe drsquoacircge intermeacutediaire et aucun adulte nrsquoa eacuteteacute observeacute sur ce secteur Les poissons alevineacutes sont certainement victimes des assegravechements- La station laquo Trebiet raquo situeacutee plus en aval preacutesente au contraire 0 de marqueacutes alors que cette zone a eacuteteacute alevineacutee Ce reacutesultat montre la capaciteacute du Foron sur ce secteur a accueillir une population fonctionnelle Il existe une reproduction naturelle importante sur cette zone avec eacutegalement beaucoup de geacuteniteurs- Vers Sommand une pecircche de sondage a eacuteteacute reacutealiseacutee mais aucun alevin nrsquoa eacuteteacute preacuteleveacute puisque cette zone nrsquoa pas eacuteteacute alevineacutee en 2002 Cependant les reacutesultats de ce sondage mettent en eacutevidence une absence totale de reproduction naturelle (aucun alevin naturel nrsquoa eacuteteacute trouveacute) alors que la population semble eacutequilibreacutee (preacutesence drsquoadultes et de truitelles drsquoacircge intermeacutediaire)

LrsquoEtroit Denteacute Globalement le taux de marqueacutes sur les deux stations eacutetudieacutees est faible (11 agrave 33)- Sur la station laquo aval route raquo la majoriteacute des alevins est naturelle Cette zone montre un habitat tregraves favorable pour la reproduction des geacuteniteurs qui remontent du Giffre- Sur la station laquo amont route raquo une population fonctionnelle de pheacutenotype meacutediterraneacuteen est installeacutee De nombreux geacuteniteurs sont preacutesents et le recrutement naturel est important

19

Le Foron de Taninges - En amont (station Bonnavaz) le taux de marqueacutes est tregraves important (95) Il existe donc une reproduction naturelle mais insuffisante pour permettre lrsquoinstallation drsquoune population et maintenir une activiteacute halieutique Les alevinages passeacutes nrsquoont pas permis drsquoinstaller une population fonctionnelle dans cette zone apicale- Plus en aval sur les zones non alevineacutees les pecircches eacutelectriques drsquoinventaire et de sondage reacutealiseacutees ont montreacute la preacutesence drsquoune population eacutequilibreacutee de pheacutenotype meacutediterraneacuteen avec une importante reproduction naturelle

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

Les principales remarques concernant les pathologies observeacutees sur le bassin du Giffre sont

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

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Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Giffre

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

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Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

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Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Giffre

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

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- La PKD est preacutesente sur le cours du Giffre mais uniquement agrave lrsquoaval du barrage de Taninges Cette situation est agrave mettre en relation avec le deacutebit reacuteserveacute insuffisant qui entraicircne une augmentation de tempeacuterature pendant la peacuteriode estivale

- Sur les affluents la PKD a eacuteteacute observeacutee sur les secteurs preacutesentant des faibles deacutebits estivaux (aval du Risse et Foron de Mieussy Andelier) qui sont certainement responsables drsquoune augmentation de tempeacuterature

- La PKD atteint agrave la fois les poissons introduits que les poissons naturels- Le pourcentage drsquoindividus toucheacutes par la PKD varie drsquoun site agrave lrsquoautre mais peut

atteindre une valeur importante avec 50 sur certain secteur- Les maladies bacteacuteriennes sont plus freacutequentes chez les individus marqueacutes Soit ces

poissons sont plus fragiles que les poissons naturels et contractent les maladies plus facilement soit les maladies sont contracteacutees en pisciculture pendant lrsquoeacutelevage

- Le pourcentage drsquoindividus toucheacutes par des symptocircmes bacteacuteriens nrsquoest pas neacutegligeable puisqursquoil peut atteindre 20

- Lrsquoensemble des stations eacutetudieacutees est toucheacute par des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes ce qui laisse penser que lrsquoensemble du bassin peut ecirctre atteint

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

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Le FdeTaninges

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Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Giffre

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Pourcentage de macircles au stade 0+

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Le FdeTaninges

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Le Risse

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Giffre

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

21

- Le sexe ratio apparaicirct globalement eacutequilibreacute sur lrsquoensemble des stations du Giffre- On observe des diffeacuterences entre les poissons introduits et les poissons naturels sur

seulement 3 stations Ces diffeacuterences sont en faveur des poissons marqueacutes qui montrent un pourcentage de macircles plus important

- Une maturiteacute sexuelle preacutecoce des macircles existe sur certaines stations quelle que soit lrsquoorigine des poissons

- Cette maturiteacute peut ecirctre importante et concerner jusqursquoagrave 20 des 0+

22

213 Le Foron du Reposoir

Deux stations (La Touviegravere et Le Reposoir) ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le Foron du Reposoir Seulement 15 0+ ont eacuteteacute eacutetudieacutes en raison principalement de la difficulteacute drsquoeacutechantillonner des poissons de petite taille (6-7 cm) sur ces milieux torrentiels

Le taux de marqueacutes

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23

- Sur les deux stations eacutetudieacutees le taux de marqueacutes est de 100 Lrsquoensemble des 0+ mecircme si le nombre est faible est donc issu de lrsquoalevinage Ce cours drsquoeau fait lrsquoobjet actuellement drsquoun essai drsquoimplantation drsquoune population agrave partir de la souche Chazey-Bons Rhodanienne Cette souche provient de geacuteniteurs de la riviegravere Furan (Ain) Des analyses geacuteneacutetiques reacutecentes reacutealiseacutees par analyse de microsatellites diagnostic de lrsquoADN ont montreacute que ces poissons ont un pourcentage dallegraveles meacutediterraneacuteens voisin de 65

Ce reacutesultat montre que le cours deau avait un niveau de population tregraves faible avant le repeuplement par la souche Chazey-Bons sauvagesDe plus les pecircches drsquoinventaires du CSP et les pecircches de sondage Interreg montrent qursquoune population de truites se met progressivement en place En effet on observe chaque anneacutee despoissons agrave des stades de plus avanceacutes et les captures par pecircche agrave la ligne commencent agrave ecirctre effectivesLes pecircches eacutelectriques reacutealiseacutees agrave lrsquoautomne 2002 indique que le stock de geacuteniteurs est en cours de reconstitution mais que les truites femelles nrsquoont pas encore atteint le stade geacuteniteurIl nrsquoest donc pas encore possible de dire si lrsquohabitat et la population du Foron du Reposoir sont propices agrave lrsquoinstallation drsquoune population naturellement fonctionnelle

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

Aucun symptocircme reacutenal et heacutemorragique nrsquoapparaicirct sur les 0+ eacutechantillonneacutes sur ce cours deau

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Le sexe ratio est eacutequilibreacute puisqursquoil varie de 50 agrave 60- Il nrsquoy a aucun macircle mature au stade 0+ dans les eacutechantillons preacuteleveacutes sur ce cours

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

24

214 La Filliegravere

Cinq stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal de la Filliegravere ainsi que sept stations sur les trois affluents principaux (Flan Creacutenant et Daudens) Au total 582 poissons 0+ ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

Sur le cours principal

Pour les 5 stations eacutetudieacutees sur le cours principal le taux de 0+ marqueacutes varie de 4 agrave 56 il est donc de tregraves faible agrave moyen et montre une forte reproduction naturelle sur toute la riviegravere Il y a un gradient amont-aval du taux de marqueacutes avec un pourcentage de poissons marqueacutes plus important en amont Cependant sur lrsquoensemble de la Filliegravere le recrutement naturel est dominant et constitue lrsquoessentiel de la population de truite

De plus les pecircches de sondages pour Interreg ont montreacute la preacutesence de nombreux drsquoadultes drsquoorigine naturelle meacutediterraneacuteenne Ceci confirme que la population de truite de la riviegravere principale est naturellement fonctionnelle

Sur les affluents

Les reacutesultats sont diffeacuterents selon que lrsquoaffluent est en connexion ou non avec la riviegravere principale

- Sur le Flan on observe en zone aval et meacutediane (stations laquo D 55 raquo et laquo Bruchon raquo) des taux de marqueacutes faibles (38 et 27) qui mettent en eacutevidence la preacutesence drsquoune forte reproduction naturelle notamment de poissons migrants de la Filliegravere Les releveacutes de frayegraveres reacutealiseacutes par lrsquoAAPPMA avaient deacutejagrave permis drsquoobserver de nombreuses frayegraveres naturelles sur ce secteurEn zone plus amont station laquo Molliet raquo le taux de marqueacutes est plus important (73) il met en eacutevidence la preacutesence drsquoun recrutement naturel mais qui reste au stade 0+ minoritaire par rapport aux individus introduits

- Sur le Daudens les deux stations (laquo Le Plot raquo et Daudens raquo) montrent des taux de marqueacutes importants (86 et 92) La reproduction naturelle est donc tregraves faible et la population de truite ne semble pas fonctionnelle Lrsquoobstacle agrave lrsquoaval de la route deacutepartementale semble preacutejudiciable car il ne permet pas aux geacuteniteurs de la Filliegravere de remonter sur le Daudens et drsquoinstaller une population fiable

- Sur le Crenant Les deux stations eacutechantillonneacutees (laquo aval raquo et Disonche raquo) ne sont pas situeacutees sur des zones alevineacutees en 2002 et il est normal de trouver 0 de marqueacutes Cependant ces reacutesultats montrent qursquoil y a une forte reproduction naturelle sur ce cours drsquoeau mecircme en zone amont et que la population semble naturellement fonctionnelle Les alevins introduits sur le Crenant ne semblent pas avoir deacutevaleacutes sur pour coloniser lrsquoaval du Crenant

25

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26

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

- La PKD semble quasiment absente du bassin de la Filliegravere sauf preacutesence anecdotique uniquement chez les non marqueacutes sur une station (laquo Millard raquo)

- Les individus marqueacutes ne sont pas toucheacutes par la PKD- Les maladies bacteacuteriennes sont preacutesentes sur lrsquoensemble du bassin mais touchent en

prioriteacute et majoritairement les individus marqueacutes

Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

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Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

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Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

27

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Sur lrsquoensemble des stations le sexe ratio est eacutequilibreacute il montre une plus grande variation chez les individus marqueacutes

- Des macircles matures au stade 0+ ont eacuteteacute observeacutes sur trois stations uniquement chez les individus naturels

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

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Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

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Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

28

215 Le Foron de Fillinges

Trois stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal du Foron de Fillinges agrave savoir de lrsquoamont vers lrsquoaval laquo Bovet ndash Boex raquo laquo Pont de Fillinges raquo et laquo Couvette raquo Au total 178 poissons 0+ ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

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29

Sur les 3 stations eacutetudieacutees les taux de marqueacutes sont faibles agrave tregraves faibles- Sur la station laquo Bovet ndash Boex raquo le taux de marqueacutes est de seulement 31- A lrsquoaval sur les stations laquo Pont de Fillinges raquo et laquo Couvette raquo les taux de marqueacutes

sont respectivement de 0 et 2

Les reacutesultats indiquent la preacutesence drsquoune importante reproduction naturelle sur lrsquoensemble du Foron de Fillinges Quelque soit la souche utiliseacutee pour lrsquoalevinage atlantique dans le secteur Faucigny ou Meacutediterraneacuteenne Pont de Gys dans le secteur Chablais les poissons introduits restent minoritaires

Cette situation traduit la preacutesence drsquoune population bien installeacutee et fonctionnelle sur cette riviegravere

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

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30

- Sur lrsquoensemble des stations des individus 0+ sont atteints par la PKD le pourcentage drsquoindividus malades peut atteindre 35

- Seuls les individus sauvages semblent toucheacutes par la PKD cependant le nombre drsquoindividus introduits est trop faible pour permettre une comparaison

- Toutes les stations sont eacutegalement toucheacutees par les maladies bacteacuteriennes avec des taux de contamination variant de 15 agrave 30

- Les maladies bacteacuteriennes touchent agrave la fois les individus introduits et les individus naturels

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Le sexe ratio apparaicirct eacutequilibreacute sur lrsquoensemble des stations- On observe des macircles matures degraves le stade 0+ sur lrsquoensemble des stations- Le taux de macircles matures au stade 0+ peut atteindre 15

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

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Pourcentage de macircles matures au stade 0+

05

101520253035404550

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

Pourcentage de macircles au stade 0+

0

102030405060

708090

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Pourcentage de macircles matures au stade 0+

05

101520253035404550

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

31

22Caracteacuteristiques morphologiques

221 Longueur totale des individus

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Giffre

0

20

40

60

80

100

120

140Am

ont

Tine

s

Rev

eacute-Peacute

ret

Mon

tess

uit

Theacutez

iegravere

s

Aval

barr

age

Tani

nges

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Bonn

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tro

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Aval

rout

e

Ande

lier

Treb

iet

La P

allu

d

Aval

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Jeoi

re

LeGiffre

LeGiffre

LeGiffre

LeGiffre

LeGiffre

LeGiffre

Le FdeTaninges

LEtroitDenteacute

LEtroitDenteacute

Le F deMieussy

Le F deMieussy

LeHisson

Le Risse

Long

ueur

tota

le e

n m

m

Taille moyenne des 0+ sur le Borne

0

20

40

60

80

100

120

140

GrandBornand

Les Etroits Entremont Beffay St Pierre en F

Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Chinaillon La Duche LOveacuteran

Long

ueur

tota

le e

n m

m

Taille moyenne des 0+ sur la Filliegravere

0

20

40

60

80

100

120

140

Le J

ourd

il

Pisc

icul

ture

Milla

rd

Long

cham

ps

D55

Bruc

hon

Mol

liet

Le

Plot

Dau

dens

Aval

Dis

onch

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La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere Le Flan Le Flan Le Flan LeDaudens

LeDaudens

LeCrenant

LeCrenant

Long

ueur

tota

le e

n m

m

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Giffre

0

20

40

60

80

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140Am

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Tine

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LeGiffre

LeGiffre

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LeGiffre

LeGiffre

Le FdeTaninges

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Le F deMieussy

Le F deMieussy

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Taille moyenne des 0+ sur le Borne

0

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GrandBornand

Les Etroits Entremont Beffay St Pierre en F

Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Chinaillon La Duche LOveacuteran

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Taille moyenne des 0+ sur la Filliegravere

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LeDaudens

LeCrenant

LeCrenant

Long

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tota

le e

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m

32

Sur la quasi-totaliteacute des stations eacutetudieacutees les individus marqueacutes preacutesentent une taillemoyenne supeacuterieure agrave celle des individus naturels Sur 18 stations ougrave les effectifs permettent des comparaisons statistiques la longueur totale des individus marqueacutes est significativement supeacuterieure agrave celle des truites sauvages pour 13 stations

Les 5 stations faisant exception sont laquo aval barrage Taninges raquo et laquo Pont du Giffre raquo sur le Giffre laquoAval St Jeoire raquo sur le Risse laquo Bonnavaz raquo sur le Foron de Taninges et laquo Couvette raquo sur le Foron de Fillinges Cependant sur ces stations les diffeacuterences ne sont pas significatives

Le fait que les marqueacutes aient une plus grande taille moyenne que les non marqueacutes au stade 0+ nrsquoimplique pas que cela soit systeacutematiquement le cas aux stades ulteacuterieurs En effet CAUDRON (1998) et CHAMPIGNEULLE et CACHERA (2003) ont montreacute respectivement sur le Doubs et le Fier que les diffeacuterences de tailles entre marqueacutes et non marqueacutes au stade 0+ sestompaient au stade 1+ et chez les adultes

Par ailleurs lrsquoexistence drsquoune plus grande taille au stade 0+ en automne pour les marqueacutes ne leur garantit pas un meilleur taux de seacutedentarisation En effet plusieurs eacutetudes dont celle de JONSSON et JONSSON (1993) indiquent que le taux de deacutevalaison peut ecirctre plus eacuteleveacute pour les individus agrave plus forte croissance au stade 0+ La deacutevalaison peut donc toucher preacutefeacuterentiellement les individus marqueacutes en raison de leur forte croissance

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Foron du Reposoir

0

20

40

60

80

100

120

140

La Touviegravere Le Reposoir

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mTaille moyenne des 0+ sur le Foron de Fillinges

0

20

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Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Long

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Foron du Reposoir

0

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La Touviegravere Le Reposoir

F du Reposoir F du Reposoir

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mTaille moyenne des 0+ sur le Foron de Fillinges

0

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Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Long

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tota

le e

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m

33

222 Taille des nageoires pectorales

La figure ci-dessus montre qursquoil existe une diffeacuterence entre marqueacutes et non marqueacutes du rapport entre la longueur de la nageoire pectorale et la longueur totale du poisson

Il a sembleacute important drsquoanalyser plus en deacutetail ce caractegravere morphologique car il peut preacutesager de lrsquoaptitude des truites agrave se maintenir dans nos riviegraveres de montagne

Relation entre la longueur de la nageoire pectorale et la longueur totale des individus marqueacutes et non marqueacutes

5

7

9

11

13

15

17

19

21

23

25

27

30 50 70 90 110 130 150 170Longueur totale en mm

Long

ueur

nag

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pec

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le e

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mMarqueacuteNon marqueacute

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron du Reposoir

12

14

16

18

20

La Touviegravere Le Reposoir

F du Reposoir F du Reposoir

Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron de Fillinges

12

14

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20

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron du Reposoir

12

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La Touviegravere Le Reposoir

F du Reposoir F du Reposoir

Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron de Fillinges

12

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Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

34

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Giffre

12

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18

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Le F deMieussy

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Taille relative moyenne des pectorales sur la Filliegravere

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Taille relative moyenne des pectorales sur le Borne

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Les Etroits Entremont Beffay St Pierre en F

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Giffre

12

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Le F deMieussy

Le F deMieussy

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Taille relative moyenne des pectorales sur la Filliegravere

12

14

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Le J

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La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere Le Flan Le Flan Le Flan LeDaudens

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Taille relative moyenne des pectorales sur le Borne

12

14

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GrandBornand

Les Etroits Entremont Beffay St Pierre en F

Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Chinaillon La Duche LOveacuteran

35

Sur les 24 stations ougrave des individus marqueacutes et non marqueacutes coexistent la taille relative des nageoires pectorales est systeacutematiquement plus importante chez les individus naturelsLes truites issues du repeuplement preacutesentent donc des nageoires pectorales de longueur infeacuterieure agrave celle des truites sauvagesCette diffeacuterence morphologique est tregraves importante car le deacuteveloppement des nageoires est un eacuteleacutement deacuteterminant pour la survie du poisson dans son milieu notamment pour la stabiliteacute la reacutesistance au courant et la recherche de nourriture an action de chasse

Il semble donc possible que cette caracteacuteristique anatomique soit le reacutesultat drsquoune adaptation agrave la vie en torrent

BOSAKOWSKI et al (1993) ont eacutegalement observeacutes des reacutesultats comparables chez des truites arc-en-ciel et des truites brunes de plus grande taille entre poissons drsquoeacutelevage et poissons sauvages Dans cette eacutetude les poissons deacutelevage preacutesentaient des nageoires nettement plus courtes (10-50) que les poissons sauvages Selon les auteurs cette diffeacuterence semblait ecirctre causeacutee par les conditions de vie des poissons dans les bassins des piscicultures(agression intraspeacutecifique stress qualiteacute de leau et densiteacutes de poissons) qui provoquaient une eacuterosion des nageoires

Dans le cas preacutesent les poissons de repeuplement ont eacuteteacute introduits agrave des stades preacutecoces dans le milieu et ont eacuteteacute preacuteleveacutes 4 agrave 5 mois apregraves leur introduction En conseacutequence ils ont veacutecu peu de temps en pisciculture et ont par contre passeacute lessentiel de leur vie dans le mecircme milieu naturel que les poissons sauvages Ainsi il semble que ce dimorphisme de la nageoire entre poissons sauvages et introduits soit drsquoorigine geacuteneacutetique Une eacutetude de RIDDELL et al (1981) a montreacute chez le saumon que les diffeacuterences de deacuteveloppement de nageoires eacutetaient une adaptation des poissons agrave leur milieu qui preacutesentait une origine geacuteneacutetiqueIl est donc tout agrave fait probable qursquoun pheacutenomegravene similaire se rencontre chez la truite fario et que les truites sauvages soient mieux adapteacutees sur le plan morphologique (gracircce agrave des diffeacuterences geacuteneacutetiques) aux conditions du milieu que les poissons introduits mecircme agrave des stades preacutecoces

Outre lrsquoaspect purement geacuteneacutetique les facteurs environnants peuvent eacutegalement jouer un rocircle important En effet McLAUGHLIN et al (2002) ont montreacute que cette diffeacuterence au niveau des nageoires peut eacutegalement ecirctre due agrave des caracteacuteristiques du milieu environnant dans les premiegraveres semaines de vie des poissons En effet plusieurs lots drsquoune mecircme souche de saumon de fontaine soumis degraves lrsquoeacuteclosion agrave des conditions de vie diffeacuterentes montrent des diffeacuterences dans le deacuteveloppement des nageoires Ainsi degraves les premiegraveres semaines les poissons exposeacutes agrave un fort courant sont pourvus de nageoires plus longues

Il est donc possible que les alevins produits en pisciculture nrsquoeacutetant pas exposeacutes agrave des courants importants au cours de leurs premiegraveres semaines de vie deacuteveloppent des nageoires pectorales moins longues que les individus sauvages

Il y a probablement pour cette caracteacuteristique morphologique des interactions combinant geacuteneacutetique et conditions environnementales

Cette diffeacuterence morphologique peut eacutegalement avoir une importance dans la compeacutetition entre poissons sauvages et introduits notamment au stade juveacutenile En effet GIBSON (1973) a deacutemontreacute limportance des nageoires dans la compeacutetition interspeacutecifique

36

entre le saumon atlantique (Salmo salar L) et le saumon de fontaine (Salvenius fontinalis) deux poissons consommant la mecircme nourriture Le fait de posseacuteder des nageoires pectorales plus deacutevelopper permet au saumon atlantique de se maintenir dans les courants pour se nourrir tout en deacutepensant moins drsquoeacutenergie

Dans le cas des torrents haut-savoyards une compeacutetition intraspeacutecifique entre truites sauvages et introduites comparable agrave leacutetude de GIBSON peut se deacutevelopper La diffeacuterence morphologique entre les truites sauvages et issues du repeuplement peut donc avoir une influence lors de la compeacutetition entre ces deux types dindividus

37

3 Premiegraveres implications pour la gestion

En fonction des reacutesultats obtenus lors de la campagne de preacutelegravevements 2002 des orientations de gestion sont proposeacutees pour chaque riviegravere eacutetudieacutee Certaines propositions impliquent des changements relativement importants des pratiques actuelles de gestion

Lrsquoeacutetude de lrsquoefficaciteacute des repeuplements srsquoappuient sur une deacutemarche scientifique rigoureuse dans lrsquointeacuterecirct des gestionnaires directs (AAPPMA) puisqursquoelle permet agrave ces derniers de prendre des deacutecisions en srsquoappuyant sur des reacutesultats concrets et indiscutables Elle est conduite dans un souci drsquoeacutevaluer en toute objectiviteacute les pratiques drsquoalevinage dans le seul but drsquoameacuteliorer la gestion actuelle des populations et des milieux Concregravetement elle permet de connaicirctre rapidement les zones ougrave lrsquoalevinage en truite fario est inefficace et donc inutile et les zones ougrave celui-ci est efficace et donc neacutecessaire

En plus des reacutesultats obtenus gracircce aux marquages des juveacuteniles les propositions prennent en compte les premiers reacutesultats issus des pecircches de sondage drsquoadultes reacutealiseacutees pour le programme INTERREG (reacutedaction en cours) Lrsquointeacutegration des diffeacuterentes donneacutees (marquage juveacutenile + adultes) permet de faire des propositions coheacuterentes selon un diagnostic le plus complet possible de la population de truite preacutesente

31 Bassin du Borne

Sur les riviegraveres du bassin du Borne les orientations de gestion proposeacutees ci-apregraves restent conformes agrave celles deacutejagrave eacutevoqueacutes par CAUDRON et CHAMPIGNEULLE (2002)

Arrecirct du repeuplement selon les pratiques actuelles sur lrsquoensemble du cours principal Cette proposition est motiveacutee par deux principales raisons

- Lrsquoalevinage est inefficace agrave lrsquoamont du seuil drsquoEntremont car apregraves plus de 15 ans il nrsquoa pas permis drsquoinstaller une population en place eacutequilibreacutee

- Il semble impeacuteratif de preacuteserver lrsquoimportante population de truite sauvage preacutesente agrave lrsquoaval du seuil drsquoEntremont Les reacutesultats geacuteneacutetiques indiquent que la population preacutesente est une population sauvage qui nrsquoa pas eacuteteacuteimplanteacutee suite agrave lrsquoalevinage Elle preacutesente un degreacute de pureteacute geacuteneacutetique important Cette population repreacutesente un patrimoine unique dans le Faucigny Le but drsquoarrecircter les alevinages sur ce secteur est drsquoeacuteviter les hybridations qui peuvent entraicircner une perte de plasticiteacute geacuteneacutetique et une deacutegeacuteneacuterescence de la souche sauvage actuelle

Arrecirct du repeuplement sur lrsquoaval de lrsquoOveacuteran Ce secteur est utiliseacute comme zone de reproduction par les geacuteniteurs du Borne et la reproduction naturelle y est abondante Lrsquoalevinage nrsquoest donc pas neacutecessaire et risque comme sur le Borne de provoquer une hybridation de la population naturelle

Essayer drsquoinstaller une population naturelle agrave lrsquoamont du seuil drsquoEntremont par transferts de geacuteniteurs

Sur les autres affluents deux sceacutenarii de gestion peuvent ecirctre envisageacutes selon la volonteacute politique des gestionnaires directs

Sceacutenario ndeg1 vision patrimoniale

38

- Arrecirct du repeuplement en truite drsquoorigine Atlantique pendant 3 anneacutees conseacutecutives pour diminuer leur preacutesence sur le bassin

- Puis reprise de lrsquoalevinage pendant uniquement 3 anneacutees agrave partir de poissons sauvages issus du Borne pour essayer drsquoinstaller une population naturelle

Sceacutenario ndeg2 vision halieutique- Maintien des pratiques drsquoalevinage en atlantique pour soutenir

artificiellement le stock de poissons dans un inteacuterecirct uniquement halieutique Attention cette pratique risque de provoquer par deacutevalaison des individus introduits une hybridation des poissons sauvages preacutesents dans le Borne

Eventuellement repeuplement en truites Arc en Ciel surdensitaires sur des secteurs preacutecis du Borne pendant la peacuteriode estivale afin de contenter une certaine cateacutegorie de pecirccheurs Les repeuplements en Arc en Ciel ne risquent pas de provoquer drsquohybridation de la souche fario locale Attention prendre des preacutecautions aupregraves des fournisseurs concernant la qualiteacute sanitaire des poissons

32 Bassin du Giffre

Les propositions sur le bassin du Giffre prennent en compte les reacutesultats du marquage mais eacutegalement la situation actuelle de la riviegravere suite agrave lrsquoeacuteboulement de Sixt Fer agrave Cheval

Ne pas aleviner le cours principal du Giffre en alevins de fario pendant 5 anneacutees conseacutecutives Cette proposition est motiveacutee par les raisons suivantes

- Il est impossible de savoir comment va eacutevoluer dans les prochains mois et les prochaines anneacutees le glissement agrave lrsquoamont de Sixt Il semble donc risqueacute drsquoentreprendre un alevinage pour installer une nouvelle population

- Les reacutesultats des marquages sur le Giffre sont tregraves contrasteacutes Sauf au niveau de Sixt ils montrent qursquoil existait avant le glissement une reproduction naturelle importante et capable de soutenir une population

- Les reacutesultats geacuteneacutetiques reacutecents indiquent que les populations en place sont en majoriteacute drsquoorigine atlantique mais qursquoil existe encore des individus meacutediterraneacuteens non hybrideacutes jusque dans les zones amont Ces reacutesultats prouvent qursquohistoriquement la souche meacutediterraneacuteenne eacutetait bien preacutesente sur lrsquoensemble du Giffre

- Il est envisageable que cette souche sauvage eacutegalement preacutesente sur les parties basses des affluents recolonise naturellement le Giffre

- Lrsquoexemple du Borne montre qursquoapregraves une catastrophe la riviegravere a eacuteteacute recoloniseacutee par une souche sauvage malgreacute des alevinages massifs Les reacutesultats obtenus sur cette riviegravere doivent servir de base de reacuteflexions pour la nouvelle gestion agrave entreprendre sur le Giffre

- Entre le Risse et Marignier la population de truites avant le glissement eacutetait deacutejagrave totalement deacuteseacutequilibreacutee et en quasi disparition (peu de juveacuteniles quasi absence de geacuteniteurs et absence de classes drsquoacircges intermeacutediaires) malgreacute les alevinages massifs sur ce secteur

39

Reacutealiser un bilan de lrsquoimpact du glissement de terrain sur le peuplement piscicole

- Une eacutetude piscicole sera reacutealiseacutee tregraves prochainement (2004 ou 2005) sur le Giffre dans le cadre du contrat de riviegravere Cette eacutetude permettra de faire un premiereacutetat des lieux complet du peuplement piscicole suite au glissement

Accomplir un diagnostic de lrsquoeacutetat de recolonisation du Giffre par les populations naturelles

- En lrsquoabsence drsquoalevinage il sera possible de reacutealiser en 2008 un bilan des populations de truites installeacutees sur le Giffre

- A partir de lrsquoeacutetat de la population agrave cette eacutepoque un plan drsquoalevinage coheacuterent en truite fario pourra ecirctre eacutetabli pour permettre drsquoinstaller de nouvelles populations ou de soutenir des populations preacutesentes

Mettre en place des deacuteversements de truites Arc en Ciel pendant toute la peacuteriode drsquoarrecirct de lrsquoalevinage en fario Attention prendre des preacutecautions aupregraves des fournisseurs concernant la qualiteacute sanitaire des poissons

Reacuteintroduire lrsquoOmbre commun sur la plaine de Samoeumlns et agrave lrsquoaval de la confluence avec le Risse

Arrecirct de lrsquoalevinage sur lrsquoensemble du Risse sur lrsquoaval du Foron de Mieussy et sur lrsquoEtroit Denteacutee

- Sur ces riviegraveres le suivi du marquage a montreacute que lrsquoalevinage nrsquoeacutetait pas neacutecessaire pour soutenir les populations de truites preacutesentes

Maintenir lrsquoalevinage sur lrsquoamont du Foron de Mieussy (vers Sommand) et lrsquoamont du Foron de Taninges (Bonnavaz)

- Sur ces secteurs le suivi du marquage a montreacute que les juveacuteniles preacutesents dans le milieu naturel eacutetaient en majoriteacute des individus introduits

33 Le Foron du Reposoir

Les propositions de gestion sur le Foron du Reposoir sont

Maintenir les alevinages actuels avec la souche Chazey Bons Rhodanienne

Suivre lrsquoeacutevolution de la population pour savoir si cet alevinage permet drsquoinstaller une population fonctionnelle

- Ce suivi peut comprendre des pecircches de sondages en deacutebut de peacuteriode de reproduction pour voir si les poissons adultes deviennent matures des releveacutes de frayegraveres sur la riviegravere pour savoir si les poissons se reproduisent et de nouveaux preacutelegravevements de poissons pour suivre lrsquoeacutevolution du taux de marqueacutes dans la population

34 Bassin de la Filliegravere

Les orientations pour une gestion coheacuterente des populations de la Filliegravere sont les suivantes

40

Arrecirct de lrsquoalevinage sur le cours principal de la Filliegravere sur le Crenant et sur lrsquoaval du Flan

- Sur ces 3 riviegraveres lrsquoalevinage nrsquoest pas neacutecessaire car il ne permet pas de soutenir les populations preacutesentes et de plus la reproduction naturelle est tregraves importante

- Sur la Filliegravere les pecircches drsquoadultes dans le cadre du programme INTERREG ont mis en eacutevidence la preacutesence drsquoune population sauvage drsquoorigine meacutediterraneacuteenne Il semble important drsquoentreprendre une mesure de conservation de cette souche en arrecirctant lrsquoalevinage pour eacuteviter lrsquohybridation

- Sur lrsquoamont du Flan il est neacutecessaire de continuer le suivi des poissons marqueacutes pour savoir si lrsquoalevinage doit ecirctre maintenu

Sur le Daudens deux sceacutenarii de gestion peuvent ecirctre envisageacutes selon la volonteacute politique des gestionnaires directs

Sceacutenario ndeg1 vision patrimoniale- Arrecirct du repeuplement en truite drsquoorigine Atlantique pendant 3 anneacutees

conseacutecutives pour diminuer leur preacutesence sur le bassin- Commencer les proceacutedures afin de rendre le seuil du Plot

franchissable pour les geacuteniteurs de la Filliegravere- Reacutealiser un bilan notamment deacutemographique de la population en place

apregraves lrsquoarrecirct de lrsquoalevinage- Puis reprise de lrsquoalevinage pendant uniquement 3 anneacutees agrave partir de

poissons sauvages issus de la Filliegravere pour essayer drsquoinstaller une population naturelle

Sceacutenario ndeg2 vision halieutique- Maintien des pratiques drsquoalevinage en atlantique pour soutenir

artificiellement le stock de poissons dans un inteacuterecirct uniquement halieutique Attention cette pratique risque de provoquer par deacutevalaison des individus introduits une hybridation des poissons sauvages preacutesents dans la Filliegravere

35 Le Foron de Fillinges

Les reacutesultats obtenus sur le Foron de Fillinges ont conduit agrave formuler les propositions de gestion suivantes

Arrecirct de lrsquoalevinage sur lrsquoensemble du Foron de Fillinges- Quelque soit la souche utiliseacutee et les quantiteacutes introduites les poissons

alevineacutes ne repreacutesentent qursquoune tregraves faible minoriteacute des poissons preacutesents dans le milieu Le Foron abrite une population naturelle fonctionnelle et eacutequilibreacutee

Suivi de la population suite agrave lrsquoarrecirct du repeuplement- Reacutealisation de 5 stations de pecircches eacutelectriques la derniegravere anneacutee de

lrsquoalevinage afin de reacutealiser un eacutetat des lieux preacutecis de la population de truites et du peuplement piscicole

- Reacutealisation drsquoun nouveau bilan de la population du Foron respectivement 3 ans puis 6 ans apregraves lrsquoarrecirct de lrsquoalevinage

41

4 Investigations suppleacutementaires

Suite aux premiers reacutesultats obtenus lors de la campagne 2002 des investigations suppleacutementaires permettant de preacuteciser certains points seront reacutealiseacutees

Reacutealiser une analyse bacteacuteriologique des diffeacuterents lots de poissons alevineacutes qui ont transiteacutes dans les piscicultures associatives Cette recherche de pathologie permettra de savoir si les poissons issus de pisciculture sont porteurs drsquoune maladie bacteacuterienne avant drsquoecirctre introduits dans le milieu ou si ils contractent la maladie dans le milieu naturel

Rechercher les raisons pour lesquelles on nrsquoobserve pas drsquoalevins naturels sur certains secteurs Les causes drsquoune telle situation peuvent ecirctre

- Lrsquoabsence totale de geacuteniteurs dans la population Les poissons nrsquoont pas le temps de devenir adulte (3+) et sont captureacutes avant par les pecirccheurs

- La preacutesence drsquoadultes non matures Les poissons deviennent adultes mais sont immatures (eacutetat sanitaire des poissons souche geacuteneacutetiquement deacutegeacuteneacutereacutee)

- Survie nulle durant la phase de vie sous graviers Les poissons pondent mais les œufs nrsquoarrivent pas agrave se deacutevelopper et la mortaliteacute est totale

Sur les secteurs du Chinaillon de la Duche de lrsquoOveacuteran amont et du Foron de Mieussy amont (Sommand) les actions suivantes peuvent ecirctre entreprises

- Pecircches eacutelectriques de sondage en deacutebut de la peacuteriode de reproduction pour savoir si les poissons deviennent matures

- Releveacutes de frayegraveres permettant drsquoobserver ou non une activiteacute de reproduction- Mise en place drsquoincubateurs-tests contenant des œufs de truites pour connaicirctre le taux

de survie des œufs dans les frayegraveres

Reacutealiser des preacutelegravevements suppleacutementaires aux classes drsquoacircge supeacuterieures (1+ et 2+) sur certaines stations pour voir lrsquoeacutevolution du taux de marqueacutes au cours des anneacutees Ces recherches suppleacutementaires peuvent ecirctre effectueacutees sur 8 cours drsquoeau ougrave le taux de marqueacutes deacutepasse 60 au stade 0+

Le ruisseau de la Duche amontLe ruisseau du Chinaillon amontLe Foron du ReposoirLe Risse avalLe Foron de Taninges amont (Bonnavaz)Le Foron de Mieussy amont (Sommand)Le Daudens amont et avalLe Flan amont

Dans les eacutetudes preacuteceacutedentes reacutealiseacutees sur le Fier (CAUDRON et CHAMPIGNEULLE 2002) et sur le Doubs (CHAMPIGNEULLE et al 2002) les taux de marqueacutes aux stades 1+ et 2+ dans la population en place srsquoeffondraient et devenaient tregraves faibles ou nuls

Pour informations le graphique suivant montre lrsquoeacutevolution du taux de marqueacutes agrave diffeacuterents stades sur les stations ougrave le taux de 0+ marqueacutes eacutetait eacuteleveacute

42

Les reacutesultats montrent agrave part pour une station une chute importante des taux de marqueacutes entre les stades 0+ et 1+ Cette chute se poursuit eacutegalement au stade 2+Ces reacutesultats obtenus sur le Fier et le Doubs semblent laisser peu drsquoespoirs sur le devenir des poissons marqueacutes sur les bassins eacutetudieacutes en 2002

Reacutesultats sur leacutevolution du taux de m arqueacutes aux diffeacuterents stades obtenus lors des eacutetudes preacuteceacutedentes sur le Fier et le Doubs

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Le Fier Le Doubs

Reacutesultats sur leacutevolution du taux de m arqueacutes aux diffeacuterents stades obtenus lors des eacutetudes preacuteceacutedentes sur le Fier et le Doubs

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10

Afin de savoir si la truite en preacutesence est infecteacutee il faut observer ses reins En effet un poisson ayant deacuteveloppeacute la maladie a des reins grossis et dune coloration inhabituelle

Le mode de propagation de la maladie et le cycle complet du parasite ne sont que partiellement connus Tetracapsula parasite les bryozoaires de petits organismes filtreurs qui forment des colonies de quelques centimegravetres de diamegravetre sur diffeacuterents types de substrats et que lon rencontre dans la plupart des lacs et cours deau

Les parasites se multiplient dans les bryozoaires ils ont alors une taille de 20 μm et se concentrent dans des sortes de grandes poches de 350 μm de diamegravetre Le parasite peacutenegravetre dans le poisson sous forme de petites spores agrave travers les cellules du mucilage de la peau et ce au cours de la premiegravere minute apregraves lentreacutee en contact avec lagent pathogegravene A laide de la circulation sanguine les parasites atteignent les reins ougrave ils forment diffeacuterents stades de deacuteveloppement et provoquent de violentes reacuteactions inflammatoires Il en reacutesulte les diffeacuterentssymptocircmes deacutecrits preacuteceacutedemment

Le parasite drsquoun diamegravetre de 5 agrave 20 microm a pu ecirctre observeacute dans les vaisseaux sanguins de presque tous les organes (sauf du cerveau de la moelle eacutepiniegravere et des yeux) Les spores sont libeacutereacutees dans lrsquoeau avec lrsquourine du poisson et sont probablement absorbeacutees de nouveau par les bryozoaires

Les truites qui survivent ou qui ont deacutejagrave eacuteteacute infecteacutees sans deacutevelopper la maladie sont en geacuteneacuteral immuniseacutees lanneacutee suivante

Poisson atteint pas la PKD (reins gonfleacutes et preacutesence de nodules)

La PKD provoque chez les jeunes truites une mortaliteacute variant de 10 agrave 100 des individus toucheacutesLe deacuteveloppement du parasite est favoriseacute en eacuteteacute lorsque la tempeacuterature de lrsquoeau atteint 15degC

162 Pathologies bacteacuteriennes

Des symptocircmes probablement dus agrave une pathologie bacteacuterienne ont eacuteteacute mis en eacutevidence lors de cette eacutetude En effet un pourcentage non neacutegligeable de truites eacutetait affecteacute par des rougeurs de type heacutemorragie agrave la base des nageoires

11

Selon MORAND (com pers) deux maladies bacteacuteriennes peuvent engendrer ces symptocircmes (la furonculose et la yerciniose) Ces deux maladies sont preacutesentes dans le monde entier et atteignent tout particuliegraverement les eacutelevages de salmonideacutes

Elles peuvent ecirctre favoriseacutees par des conditions particuliegraveres du milieu environnant tempeacuterature de leau eacuteleveacutee (supeacuterieure agrave 10 degC) une charge organique importante ou encore une pollution diminuant les deacutefenses immunitaires du poissonhellip

Selon la graviteacute de laffection ces pathologies peuvent entraicircner de lourds taux de mortaliteacute atteignant jusquagrave 70 dans certains cas (MOURRIERAS 1995)

Les heacutemorragies observeacutees agrave la base des nageoires sont la conseacutequence drsquoune infection bacteacuterienne pouvant provoquer drsquoimportantes mortaliteacutes

17Utilisation du SIG de la Feacutedeacuteration de pecircche de Haute-Savoie

Les donneacutees du programme pilote de marquage et du programme INTERREG sont inteacutegreacutees dans un SIG (Systegraveme dInformation Geacuteographique MapInfo) mis en place agrave la Feacutedeacuteration de pecircche de Haute-Savoie et agrave lINRA de Thonon

Ainsi toutes les informations relatives aux cours deau du deacutepartement seront consigneacutees dans cette base de donneacutees (pente longueur preacutesence de seuils infranchissables caracteacuteristiques physico-chimiques IBGN hydrologie occupation des bassins versantshellip) Il en sera de mecircme pour les donneacutees truites (repeuplement densiteacute biomasses croissance structure dacircge pathologie geacuteneacutetiquehellip)

Lapproche finale visera agrave rechercher les relations existant entre ces deux groupes de donneacutees spatialiseacutees Une toute premiegravere deacutemarche a eacuteteacute partiellement tenteacutee dans le cas du preacutesent rapport dont les donneacutees ont eacuteteacute inteacutegreacutees dans le SIG en cours de construction

12

2 Reacutesultats et discussions

Ce chapitre preacutesente les reacutesultats obtenus sur les bassins eacutetudieacutes lors de la campagne de preacutelegravevements 2002 agrave savoir

Le GiffreLe BorneLa FilliegravereLe Foron de ScionsiezLe Foron de Fillinges

Lors de la campagne 2002 1703 poissons au stade 0+ ont eacuteteacute eacutechantillonneacutes en milieu naturel et eacutetudieacutes en laboratoire

21Taux de marquage sexe ratio et pathologie

211 Le Borne

Sur le bassin du Borne 5 stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal et 3 sur des affluents Au total ce sont 392 poissons 0+ qui ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

Sur le cours principal

Les taux de marqueacutes varient fortement sur le cours principal du Borne (18 agrave 100) On observe un gradient amont-aval du taux de marqueacutes qui peut ecirctre mis en relation avec la preacutesence drsquoun obstacle partiellement infranchissable pour les geacuteniteurs au niveau drsquoEntremont

Ainsi deux grandes zones peuvent ecirctre distingueacutees sur le Borne

La zone amont du seuil drsquoEntremont ougrave la majoriteacute des juveacuteniles sont issus du repeuplement (90 agrave 100)

On observe sur ce secteur une tregraves faible reproduction naturelle en raison drsquoune quasi-absence de poissons adultes La situation de la population de truites est donc tregraves critique Si le repeuplement permet de drsquoobserver des 0+ il nrsquoa pas permis drsquoinstaller une population fonctionnelle

La zone aval du seuil drsquoEntremont ougrave la majoriteacute des individus preacutesents au stade 0+ sont des poissons naturels

En effet le taux de marqueacutes varie de 18 agrave 49 Les pecircches de sondage Interreg ont montreacute la preacutesence drsquoune importante population de truites sauvages drsquoorigine meacutediterraneacuteenne La population est eacutequilibreacutee et naturellement fonctionnelle puisqursquoon observe une forte reproduction naturelle et de nombreux geacuteniteurs

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Sur les Affluents

Sur les 3 affluents eacutetudieacutes la situation est tregraves simple En effet soit on observe 0 de marqueacutes soit 100

- Sur lrsquoOveacuteran aval aucun poisson marqueacute nrsquoa eacuteteacute trouveacute puisqursquoil nrsquoy a pas eu de repeuplement sur ce secteur en 2002 Le reacutesultat obtenu montre une importante reproduction naturelle des geacuteniteurs du Borne qui remontent sur lrsquoaval de ce cours drsquoeau

- Sur la Duche et le Chinaillon il y a absence totale de reproduction naturelle puisque 100 des 0+ eacutechantillonneacutes sont marqueacutes Pourtant on observe de nombreux poissons adultes sur ces secteurs susceptibles drsquoecirctre des geacuteniteurs ainsi que diffeacuterentes classes drsquoacircge Lrsquoeacutequilibre de ces populations est artificiellement maintenu par les alevinages

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

- Toutes les stations eacutetudieacutees ne sont pas concerneacutees par ces symptocircmes de maladies- Les maladies bacteacuteriennes semblent toucher majoritairement les poissons introduits- Cependant les 0+ de lrsquoOveacuteran aval tous naturels sont infecteacutes agrave 15 Ce reacutesultat

peut refleacuteter une contamination par deacutevalaison provenant drsquoindividus atteints situeacutes plus en amont de lrsquoOveacuteran ou une contamination naturelle par des agents pathogegravenes preacutesents dans le milieu

- Les poissons marqueacutes peuvent ecirctre contamineacutes agrave un taux non neacutegligeable pouvant atteindre plus de 30

Pourcentage dindividus preacutesentant des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

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Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

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Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Le sexe ratio est relativement eacutequilibreacute pour les marqueacutes comme pour les non marqueacutes Seule une station sur le Borne (Beffay) montre 85 de macircle dans la population de 0+

- Seules 2 stations montrent des macircles matures au stade 0+- Le pourcentage de macircles matures au stade 0+ est plus important chez les non

marqueacutes que chez les marqueacutes

Pourcentage de macircles au stade 0+

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Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Borne

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Pourcentage de macircles au stade 0+

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Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Borne

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

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212 Le Giffre

Sur le bassin du Giffre 6 stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal et 7 sur des affluents Au total ce sont 536 poissons 0+ qui ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

Sur le cours principal

La carte de synthegravese des reacutesultats met en eacutevidence des taux de marqueacutes tregraves contrasteacutes variant entre 0 et 100 Sauf deux cas particuliers la campagne de preacutelegravevements a permis de montrer qursquoune reproduction naturelle existait sur lrsquoensemble du Giffre

Il est possible de distinguer trois zones successives sur ce cours deau

La zone aval est composeacutee de la station Pont du Giffre ougrave le taux de marqueacutes est de 74 Cette station sur le Giffre doit ecirctre rapprocheacutee des stations eacutetudieacutees sur le Risse (station laquo Risse aval St Jeoire raquo) et le Hisson(laquo station La Pallud raquo) pour mieux comprendre le fonctionnement de la population

- Sur le Giffre aval la situation semble tregraves critique La station dite laquo Pont du Giffre raquosrsquoeacutetend de lrsquoamont de Marignier agrave lrsquousine du Pont du Giffre soit sur environ 25 km Sur cette distance seulement 31 0+ ont pu ecirctre captureacutes De plus les pecircches drsquoadultes dans le cadre drsquoInterreg montrent un deacuteficit inquieacutetant de geacuteniteurs sur ce secteur ainsi qursquoune surabondance de Chabot La situation du bas Giffre montre une population de truitetotalement deacuteseacutequilibreacutee loin du potentiel de la riviegravere et qui ne peut pas ecirctre reacutehabiliteacutee par le seul fait de lrsquoalevinage Cette situation peut ecirctre le reacutesultat du faible deacutebit reacuteserveacute qui appauvrit lrsquohabitat aquatique et provoque des eacuteleacutevations de tempeacuterature inquieacutetantes Les reacutesultats de pecircche drsquoinventaire dans la reacuteserve de Marignier montrent que les poissons sont concentreacutes agrave lrsquoaval immeacutediat des seuils ougrave lrsquoon note la preacutesence de fosses de tempeacuteratures plus faibles et drsquoune meilleure oxygeacutenation

La zone moyenne situeacutee entre le barrage de Mieussy et Samoeumlns qui est composeacutee des stations laquo aval barrage Taninges raquo laquo Theacuteziegraveres raquo et laquo Montessuit raquo Sur ce secteur les 0+ marqueacutes sont en minoriteacutes puisqursquoils repreacutesentent 11 agrave 38 du peuplement

- Sur le Giffre aval barrage de Taninges le secteur nrsquoest pas alevineacute il est donc normal que pregraves de 90 des poissons ne soient pas marqueacutes Les 0+ marqueacutes proviennent certainement du ruisseau de lrsquoEtroit Denteacute qui est fortement alevineacute et agrave partir duquel une deacutevalaison doit avoir lieu- Le secteur des laquo Theacuteziegraveres raquo et de laquo Montessuit raquo bien que reacuteguliegraverement alevineacute montre un taux important drsquoalevins naturels (62 agrave 77) Ce reacutesultat est tout agrave fait en accord avec le suivi de la reproduction naturelle et le recensement de frayegraveres reacutealiseacute par lrsquoAAPPMA du Faucigny et le CSP en 1999 En effet de nombreuses frayegraveres naturelles avaient eacuteteacute observeacutees sur ce site Le peuplement drsquoadultes nrsquoest pas tregraves important mais est en rapport avec les potentialiteacutes du milieu

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18

La zone amont caracteacuteriseacutee par les stations laquo Reveacute-Peacuteret raquo et laquo amont Tines raquo ougrave le taux de marqueacutes varie de 70 agrave 79

- Pour ces deux stations la population de juveacuteniles est faible et ils sont majoritairement marqueacutes Cependant au stade adulte les pecircches Interreg montrent une majoriteacute de poissons drsquoorigine meacutediterraneacuteenne La forte contribution de poissons introduits au stade 0+ ne semble pas se retrouver au stade adulte Les conditions de vie dans ce milieu sont tregraves difficiles et ne permettent pas drsquoatteindre des densiteacutes de poissons importantes

Sur les Affluents

Le Risse - Le Hisson montre une majoriteacute drsquoalevins naturels alors que les preacutelegravevements ont eacuteteacute reacutealiseacutes seulement deux mois apregraves le repeuplement Ce cours drsquoeau possegravede un fort potentiel de frai qui est utiliseacute notamment par les geacuteniteurs du Risse- Sur lrsquoaval du Risse le taux de marqueacutes est de 68 Il est le reflet drsquoun alevinage en quantiteacute importante sur le secteur (10 000 alevins) Les alevins naturels repreacutesentent tout de mecircme plus de 30 trois mois apregraves le repeuplement De plus les eacutechantillonnages drsquoadultes reacutealiseacutes sur ce secteur dans le cadre drsquoInterreg ont mis en eacutevidence une quantiteacute importante de geacuteniteurs sauvages La population sur ce secteur est agrave mettre en eacutevidence avec celle du Hisson puisque certains geacuteniteurs du Risse y migrent pour se reproduireLa population sur ce secteur est naturellement fonctionnelle

Le Foron de Mieussy - La station laquo Andelier raquo situeacutee en amont du Foron preacutesente 100 de marqueacutes Cette situation montre une absence totale de reproduction naturelle Le milieu est extrecircmement deacutefavorable agrave lrsquoinstallation drsquoune population fonctionnelle en raison du faible deacutebit de la riviegravere (assegravechement reacutegulier) Aucune classe drsquoacircge intermeacutediaire et aucun adulte nrsquoa eacuteteacute observeacute sur ce secteur Les poissons alevineacutes sont certainement victimes des assegravechements- La station laquo Trebiet raquo situeacutee plus en aval preacutesente au contraire 0 de marqueacutes alors que cette zone a eacuteteacute alevineacutee Ce reacutesultat montre la capaciteacute du Foron sur ce secteur a accueillir une population fonctionnelle Il existe une reproduction naturelle importante sur cette zone avec eacutegalement beaucoup de geacuteniteurs- Vers Sommand une pecircche de sondage a eacuteteacute reacutealiseacutee mais aucun alevin nrsquoa eacuteteacute preacuteleveacute puisque cette zone nrsquoa pas eacuteteacute alevineacutee en 2002 Cependant les reacutesultats de ce sondage mettent en eacutevidence une absence totale de reproduction naturelle (aucun alevin naturel nrsquoa eacuteteacute trouveacute) alors que la population semble eacutequilibreacutee (preacutesence drsquoadultes et de truitelles drsquoacircge intermeacutediaire)

LrsquoEtroit Denteacute Globalement le taux de marqueacutes sur les deux stations eacutetudieacutees est faible (11 agrave 33)- Sur la station laquo aval route raquo la majoriteacute des alevins est naturelle Cette zone montre un habitat tregraves favorable pour la reproduction des geacuteniteurs qui remontent du Giffre- Sur la station laquo amont route raquo une population fonctionnelle de pheacutenotype meacutediterraneacuteen est installeacutee De nombreux geacuteniteurs sont preacutesents et le recrutement naturel est important

19

Le Foron de Taninges - En amont (station Bonnavaz) le taux de marqueacutes est tregraves important (95) Il existe donc une reproduction naturelle mais insuffisante pour permettre lrsquoinstallation drsquoune population et maintenir une activiteacute halieutique Les alevinages passeacutes nrsquoont pas permis drsquoinstaller une population fonctionnelle dans cette zone apicale- Plus en aval sur les zones non alevineacutees les pecircches eacutelectriques drsquoinventaire et de sondage reacutealiseacutees ont montreacute la preacutesence drsquoune population eacutequilibreacutee de pheacutenotype meacutediterraneacuteen avec une importante reproduction naturelle

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

Les principales remarques concernant les pathologies observeacutees sur le bassin du Giffre sont

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

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- La PKD est preacutesente sur le cours du Giffre mais uniquement agrave lrsquoaval du barrage de Taninges Cette situation est agrave mettre en relation avec le deacutebit reacuteserveacute insuffisant qui entraicircne une augmentation de tempeacuterature pendant la peacuteriode estivale

- Sur les affluents la PKD a eacuteteacute observeacutee sur les secteurs preacutesentant des faibles deacutebits estivaux (aval du Risse et Foron de Mieussy Andelier) qui sont certainement responsables drsquoune augmentation de tempeacuterature

- La PKD atteint agrave la fois les poissons introduits que les poissons naturels- Le pourcentage drsquoindividus toucheacutes par la PKD varie drsquoun site agrave lrsquoautre mais peut

atteindre une valeur importante avec 50 sur certain secteur- Les maladies bacteacuteriennes sont plus freacutequentes chez les individus marqueacutes Soit ces

poissons sont plus fragiles que les poissons naturels et contractent les maladies plus facilement soit les maladies sont contracteacutees en pisciculture pendant lrsquoeacutelevage

- Le pourcentage drsquoindividus toucheacutes par des symptocircmes bacteacuteriens nrsquoest pas neacutegligeable puisqursquoil peut atteindre 20

- Lrsquoensemble des stations eacutetudieacutees est toucheacute par des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes ce qui laisse penser que lrsquoensemble du bassin peut ecirctre atteint

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

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21

- Le sexe ratio apparaicirct globalement eacutequilibreacute sur lrsquoensemble des stations du Giffre- On observe des diffeacuterences entre les poissons introduits et les poissons naturels sur

seulement 3 stations Ces diffeacuterences sont en faveur des poissons marqueacutes qui montrent un pourcentage de macircles plus important

- Une maturiteacute sexuelle preacutecoce des macircles existe sur certaines stations quelle que soit lrsquoorigine des poissons

- Cette maturiteacute peut ecirctre importante et concerner jusqursquoagrave 20 des 0+

22

213 Le Foron du Reposoir

Deux stations (La Touviegravere et Le Reposoir) ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le Foron du Reposoir Seulement 15 0+ ont eacuteteacute eacutetudieacutes en raison principalement de la difficulteacute drsquoeacutechantillonner des poissons de petite taille (6-7 cm) sur ces milieux torrentiels

Le taux de marqueacutes

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- Sur les deux stations eacutetudieacutees le taux de marqueacutes est de 100 Lrsquoensemble des 0+ mecircme si le nombre est faible est donc issu de lrsquoalevinage Ce cours drsquoeau fait lrsquoobjet actuellement drsquoun essai drsquoimplantation drsquoune population agrave partir de la souche Chazey-Bons Rhodanienne Cette souche provient de geacuteniteurs de la riviegravere Furan (Ain) Des analyses geacuteneacutetiques reacutecentes reacutealiseacutees par analyse de microsatellites diagnostic de lrsquoADN ont montreacute que ces poissons ont un pourcentage dallegraveles meacutediterraneacuteens voisin de 65

Ce reacutesultat montre que le cours deau avait un niveau de population tregraves faible avant le repeuplement par la souche Chazey-Bons sauvagesDe plus les pecircches drsquoinventaires du CSP et les pecircches de sondage Interreg montrent qursquoune population de truites se met progressivement en place En effet on observe chaque anneacutee despoissons agrave des stades de plus avanceacutes et les captures par pecircche agrave la ligne commencent agrave ecirctre effectivesLes pecircches eacutelectriques reacutealiseacutees agrave lrsquoautomne 2002 indique que le stock de geacuteniteurs est en cours de reconstitution mais que les truites femelles nrsquoont pas encore atteint le stade geacuteniteurIl nrsquoest donc pas encore possible de dire si lrsquohabitat et la population du Foron du Reposoir sont propices agrave lrsquoinstallation drsquoune population naturellement fonctionnelle

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

Aucun symptocircme reacutenal et heacutemorragique nrsquoapparaicirct sur les 0+ eacutechantillonneacutes sur ce cours deau

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Le sexe ratio est eacutequilibreacute puisqursquoil varie de 50 agrave 60- Il nrsquoy a aucun macircle mature au stade 0+ dans les eacutechantillons preacuteleveacutes sur ce cours

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Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

24

214 La Filliegravere

Cinq stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal de la Filliegravere ainsi que sept stations sur les trois affluents principaux (Flan Creacutenant et Daudens) Au total 582 poissons 0+ ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

Sur le cours principal

Pour les 5 stations eacutetudieacutees sur le cours principal le taux de 0+ marqueacutes varie de 4 agrave 56 il est donc de tregraves faible agrave moyen et montre une forte reproduction naturelle sur toute la riviegravere Il y a un gradient amont-aval du taux de marqueacutes avec un pourcentage de poissons marqueacutes plus important en amont Cependant sur lrsquoensemble de la Filliegravere le recrutement naturel est dominant et constitue lrsquoessentiel de la population de truite

De plus les pecircches de sondages pour Interreg ont montreacute la preacutesence de nombreux drsquoadultes drsquoorigine naturelle meacutediterraneacuteenne Ceci confirme que la population de truite de la riviegravere principale est naturellement fonctionnelle

Sur les affluents

Les reacutesultats sont diffeacuterents selon que lrsquoaffluent est en connexion ou non avec la riviegravere principale

- Sur le Flan on observe en zone aval et meacutediane (stations laquo D 55 raquo et laquo Bruchon raquo) des taux de marqueacutes faibles (38 et 27) qui mettent en eacutevidence la preacutesence drsquoune forte reproduction naturelle notamment de poissons migrants de la Filliegravere Les releveacutes de frayegraveres reacutealiseacutes par lrsquoAAPPMA avaient deacutejagrave permis drsquoobserver de nombreuses frayegraveres naturelles sur ce secteurEn zone plus amont station laquo Molliet raquo le taux de marqueacutes est plus important (73) il met en eacutevidence la preacutesence drsquoun recrutement naturel mais qui reste au stade 0+ minoritaire par rapport aux individus introduits

- Sur le Daudens les deux stations (laquo Le Plot raquo et Daudens raquo) montrent des taux de marqueacutes importants (86 et 92) La reproduction naturelle est donc tregraves faible et la population de truite ne semble pas fonctionnelle Lrsquoobstacle agrave lrsquoaval de la route deacutepartementale semble preacutejudiciable car il ne permet pas aux geacuteniteurs de la Filliegravere de remonter sur le Daudens et drsquoinstaller une population fiable

- Sur le Crenant Les deux stations eacutechantillonneacutees (laquo aval raquo et Disonche raquo) ne sont pas situeacutees sur des zones alevineacutees en 2002 et il est normal de trouver 0 de marqueacutes Cependant ces reacutesultats montrent qursquoil y a une forte reproduction naturelle sur ce cours drsquoeau mecircme en zone amont et que la population semble naturellement fonctionnelle Les alevins introduits sur le Crenant ne semblent pas avoir deacutevaleacutes sur pour coloniser lrsquoaval du Crenant

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40

38

27

73

4

92

86

14 0

0

26

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

- La PKD semble quasiment absente du bassin de la Filliegravere sauf preacutesence anecdotique uniquement chez les non marqueacutes sur une station (laquo Millard raquo)

- Les individus marqueacutes ne sont pas toucheacutes par la PKD- Les maladies bacteacuteriennes sont preacutesentes sur lrsquoensemble du bassin mais touchent en

prioriteacute et majoritairement les individus marqueacutes

Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

0102030405060708090

100

Le J

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LeDaudens

LeCrenant

LeCrenant

Pourcentage dindividus preacutesentant des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

0102030405060

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LeDaudens

LeCrenant

LeCrenant

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

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Pourcentage dindividus preacutesentant des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

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LeDaudens

LeCrenant

LeCrenant

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

27

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Sur lrsquoensemble des stations le sexe ratio est eacutequilibreacute il montre une plus grande variation chez les individus marqueacutes

- Des macircles matures au stade 0+ ont eacuteteacute observeacutes sur trois stations uniquement chez les individus naturels

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

Pourcentage de macircles au stade 0+

0102030405060708090

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LaFilliegravere

LaFilliegravere

LaFilliegravere

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LeDaudens

LeCrenant

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Pourcentage de macircles matures au stade 0+

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DaudensLe

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Crenant

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

Pourcentage de macircles au stade 0+

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Pourcentage de macircles matures au stade 0+

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

28

215 Le Foron de Fillinges

Trois stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal du Foron de Fillinges agrave savoir de lrsquoamont vers lrsquoaval laquo Bovet ndash Boex raquo laquo Pont de Fillinges raquo et laquo Couvette raquo Au total 178 poissons 0+ ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

Leacutege

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Mar

queacutes

Non

mar

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2002

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31

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31

29

Sur les 3 stations eacutetudieacutees les taux de marqueacutes sont faibles agrave tregraves faibles- Sur la station laquo Bovet ndash Boex raquo le taux de marqueacutes est de seulement 31- A lrsquoaval sur les stations laquo Pont de Fillinges raquo et laquo Couvette raquo les taux de marqueacutes

sont respectivement de 0 et 2

Les reacutesultats indiquent la preacutesence drsquoune importante reproduction naturelle sur lrsquoensemble du Foron de Fillinges Quelque soit la souche utiliseacutee pour lrsquoalevinage atlantique dans le secteur Faucigny ou Meacutediterraneacuteenne Pont de Gys dans le secteur Chablais les poissons introduits restent minoritaires

Cette situation traduit la preacutesence drsquoune population bien installeacutee et fonctionnelle sur cette riviegravere

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

0102030405060708090

100

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Pourcentage dindividus preacutesentant des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

05

101520253035404550

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

0102030405060708090

100

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Pourcentage dindividus preacutesentant des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

05

101520253035404550

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

30

- Sur lrsquoensemble des stations des individus 0+ sont atteints par la PKD le pourcentage drsquoindividus malades peut atteindre 35

- Seuls les individus sauvages semblent toucheacutes par la PKD cependant le nombre drsquoindividus introduits est trop faible pour permettre une comparaison

- Toutes les stations sont eacutegalement toucheacutees par les maladies bacteacuteriennes avec des taux de contamination variant de 15 agrave 30

- Les maladies bacteacuteriennes touchent agrave la fois les individus introduits et les individus naturels

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Le sexe ratio apparaicirct eacutequilibreacute sur lrsquoensemble des stations- On observe des macircles matures degraves le stade 0+ sur lrsquoensemble des stations- Le taux de macircles matures au stade 0+ peut atteindre 15

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

Pourcentage de macircles au stade 0+

0

102030405060

708090

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Pourcentage de macircles matures au stade 0+

05

101520253035404550

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

Pourcentage de macircles au stade 0+

0

102030405060

708090

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Pourcentage de macircles matures au stade 0+

05

101520253035404550

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

31

22Caracteacuteristiques morphologiques

221 Longueur totale des individus

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Giffre

0

20

40

60

80

100

120

140Am

ont

Tine

s

Rev

eacute-Peacute

ret

Mon

tess

uit

Theacutez

iegravere

s

Aval

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Tani

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Aval

rout

e

Ande

lier

Treb

iet

La P

allu

d

Aval

St

Jeoi

re

LeGiffre

LeGiffre

LeGiffre

LeGiffre

LeGiffre

LeGiffre

Le FdeTaninges

LEtroitDenteacute

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Le F deMieussy

Le F deMieussy

LeHisson

Le Risse

Long

ueur

tota

le e

n m

m

Taille moyenne des 0+ sur le Borne

0

20

40

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80

100

120

140

GrandBornand

Les Etroits Entremont Beffay St Pierre en F

Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Chinaillon La Duche LOveacuteran

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Taille moyenne des 0+ sur la Filliegravere

0

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Giffre

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32

Sur la quasi-totaliteacute des stations eacutetudieacutees les individus marqueacutes preacutesentent une taillemoyenne supeacuterieure agrave celle des individus naturels Sur 18 stations ougrave les effectifs permettent des comparaisons statistiques la longueur totale des individus marqueacutes est significativement supeacuterieure agrave celle des truites sauvages pour 13 stations

Les 5 stations faisant exception sont laquo aval barrage Taninges raquo et laquo Pont du Giffre raquo sur le Giffre laquoAval St Jeoire raquo sur le Risse laquo Bonnavaz raquo sur le Foron de Taninges et laquo Couvette raquo sur le Foron de Fillinges Cependant sur ces stations les diffeacuterences ne sont pas significatives

Le fait que les marqueacutes aient une plus grande taille moyenne que les non marqueacutes au stade 0+ nrsquoimplique pas que cela soit systeacutematiquement le cas aux stades ulteacuterieurs En effet CAUDRON (1998) et CHAMPIGNEULLE et CACHERA (2003) ont montreacute respectivement sur le Doubs et le Fier que les diffeacuterences de tailles entre marqueacutes et non marqueacutes au stade 0+ sestompaient au stade 1+ et chez les adultes

Par ailleurs lrsquoexistence drsquoune plus grande taille au stade 0+ en automne pour les marqueacutes ne leur garantit pas un meilleur taux de seacutedentarisation En effet plusieurs eacutetudes dont celle de JONSSON et JONSSON (1993) indiquent que le taux de deacutevalaison peut ecirctre plus eacuteleveacute pour les individus agrave plus forte croissance au stade 0+ La deacutevalaison peut donc toucher preacutefeacuterentiellement les individus marqueacutes en raison de leur forte croissance

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Foron du Reposoir

0

20

40

60

80

100

120

140

La Touviegravere Le Reposoir

F du Reposoir F du Reposoir

Long

ueur

tota

le e

n m

mTaille moyenne des 0+ sur le Foron de Fillinges

0

20

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Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Foron du Reposoir

0

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140

La Touviegravere Le Reposoir

F du Reposoir F du Reposoir

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0

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Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

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m

33

222 Taille des nageoires pectorales

La figure ci-dessus montre qursquoil existe une diffeacuterence entre marqueacutes et non marqueacutes du rapport entre la longueur de la nageoire pectorale et la longueur totale du poisson

Il a sembleacute important drsquoanalyser plus en deacutetail ce caractegravere morphologique car il peut preacutesager de lrsquoaptitude des truites agrave se maintenir dans nos riviegraveres de montagne

Relation entre la longueur de la nageoire pectorale et la longueur totale des individus marqueacutes et non marqueacutes

5

7

9

11

13

15

17

19

21

23

25

27

30 50 70 90 110 130 150 170Longueur totale en mm

Long

ueur

nag

eoire

pec

tora

le e

n m

mMarqueacuteNon marqueacute

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron du Reposoir

12

14

16

18

20

La Touviegravere Le Reposoir

F du Reposoir F du Reposoir

Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron de Fillinges

12

14

16

18

20

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron du Reposoir

12

14

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20

La Touviegravere Le Reposoir

F du Reposoir F du Reposoir

Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron de Fillinges

12

14

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18

20

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

34

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Giffre

12

14

16

18

20

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La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere Le Flan Le Flan Le Flan LeDaudens

LeDaudens

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LeCrenant

Taille relative moyenne des pectorales sur le Borne

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18

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GrandBornand

Les Etroits Entremont Beffay St Pierre en F

Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Chinaillon La Duche LOveacuteran

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Giffre

12

14

16

18

20

Am

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Le Giffre Le Giffre Le Giffre Le Giffre Le Giffre Le Giffre Le FdeTaninges

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Le F deMieussy

Le Risse

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La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere Le Flan Le Flan Le Flan LeDaudens

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LeCrenant

Taille relative moyenne des pectorales sur le Borne

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GrandBornand

Les Etroits Entremont Beffay St Pierre en F

Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Chinaillon La Duche LOveacuteran

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Sur les 24 stations ougrave des individus marqueacutes et non marqueacutes coexistent la taille relative des nageoires pectorales est systeacutematiquement plus importante chez les individus naturelsLes truites issues du repeuplement preacutesentent donc des nageoires pectorales de longueur infeacuterieure agrave celle des truites sauvagesCette diffeacuterence morphologique est tregraves importante car le deacuteveloppement des nageoires est un eacuteleacutement deacuteterminant pour la survie du poisson dans son milieu notamment pour la stabiliteacute la reacutesistance au courant et la recherche de nourriture an action de chasse

Il semble donc possible que cette caracteacuteristique anatomique soit le reacutesultat drsquoune adaptation agrave la vie en torrent

BOSAKOWSKI et al (1993) ont eacutegalement observeacutes des reacutesultats comparables chez des truites arc-en-ciel et des truites brunes de plus grande taille entre poissons drsquoeacutelevage et poissons sauvages Dans cette eacutetude les poissons deacutelevage preacutesentaient des nageoires nettement plus courtes (10-50) que les poissons sauvages Selon les auteurs cette diffeacuterence semblait ecirctre causeacutee par les conditions de vie des poissons dans les bassins des piscicultures(agression intraspeacutecifique stress qualiteacute de leau et densiteacutes de poissons) qui provoquaient une eacuterosion des nageoires

Dans le cas preacutesent les poissons de repeuplement ont eacuteteacute introduits agrave des stades preacutecoces dans le milieu et ont eacuteteacute preacuteleveacutes 4 agrave 5 mois apregraves leur introduction En conseacutequence ils ont veacutecu peu de temps en pisciculture et ont par contre passeacute lessentiel de leur vie dans le mecircme milieu naturel que les poissons sauvages Ainsi il semble que ce dimorphisme de la nageoire entre poissons sauvages et introduits soit drsquoorigine geacuteneacutetique Une eacutetude de RIDDELL et al (1981) a montreacute chez le saumon que les diffeacuterences de deacuteveloppement de nageoires eacutetaient une adaptation des poissons agrave leur milieu qui preacutesentait une origine geacuteneacutetiqueIl est donc tout agrave fait probable qursquoun pheacutenomegravene similaire se rencontre chez la truite fario et que les truites sauvages soient mieux adapteacutees sur le plan morphologique (gracircce agrave des diffeacuterences geacuteneacutetiques) aux conditions du milieu que les poissons introduits mecircme agrave des stades preacutecoces

Outre lrsquoaspect purement geacuteneacutetique les facteurs environnants peuvent eacutegalement jouer un rocircle important En effet McLAUGHLIN et al (2002) ont montreacute que cette diffeacuterence au niveau des nageoires peut eacutegalement ecirctre due agrave des caracteacuteristiques du milieu environnant dans les premiegraveres semaines de vie des poissons En effet plusieurs lots drsquoune mecircme souche de saumon de fontaine soumis degraves lrsquoeacuteclosion agrave des conditions de vie diffeacuterentes montrent des diffeacuterences dans le deacuteveloppement des nageoires Ainsi degraves les premiegraveres semaines les poissons exposeacutes agrave un fort courant sont pourvus de nageoires plus longues

Il est donc possible que les alevins produits en pisciculture nrsquoeacutetant pas exposeacutes agrave des courants importants au cours de leurs premiegraveres semaines de vie deacuteveloppent des nageoires pectorales moins longues que les individus sauvages

Il y a probablement pour cette caracteacuteristique morphologique des interactions combinant geacuteneacutetique et conditions environnementales

Cette diffeacuterence morphologique peut eacutegalement avoir une importance dans la compeacutetition entre poissons sauvages et introduits notamment au stade juveacutenile En effet GIBSON (1973) a deacutemontreacute limportance des nageoires dans la compeacutetition interspeacutecifique

36

entre le saumon atlantique (Salmo salar L) et le saumon de fontaine (Salvenius fontinalis) deux poissons consommant la mecircme nourriture Le fait de posseacuteder des nageoires pectorales plus deacutevelopper permet au saumon atlantique de se maintenir dans les courants pour se nourrir tout en deacutepensant moins drsquoeacutenergie

Dans le cas des torrents haut-savoyards une compeacutetition intraspeacutecifique entre truites sauvages et introduites comparable agrave leacutetude de GIBSON peut se deacutevelopper La diffeacuterence morphologique entre les truites sauvages et issues du repeuplement peut donc avoir une influence lors de la compeacutetition entre ces deux types dindividus

37

3 Premiegraveres implications pour la gestion

En fonction des reacutesultats obtenus lors de la campagne de preacutelegravevements 2002 des orientations de gestion sont proposeacutees pour chaque riviegravere eacutetudieacutee Certaines propositions impliquent des changements relativement importants des pratiques actuelles de gestion

Lrsquoeacutetude de lrsquoefficaciteacute des repeuplements srsquoappuient sur une deacutemarche scientifique rigoureuse dans lrsquointeacuterecirct des gestionnaires directs (AAPPMA) puisqursquoelle permet agrave ces derniers de prendre des deacutecisions en srsquoappuyant sur des reacutesultats concrets et indiscutables Elle est conduite dans un souci drsquoeacutevaluer en toute objectiviteacute les pratiques drsquoalevinage dans le seul but drsquoameacuteliorer la gestion actuelle des populations et des milieux Concregravetement elle permet de connaicirctre rapidement les zones ougrave lrsquoalevinage en truite fario est inefficace et donc inutile et les zones ougrave celui-ci est efficace et donc neacutecessaire

En plus des reacutesultats obtenus gracircce aux marquages des juveacuteniles les propositions prennent en compte les premiers reacutesultats issus des pecircches de sondage drsquoadultes reacutealiseacutees pour le programme INTERREG (reacutedaction en cours) Lrsquointeacutegration des diffeacuterentes donneacutees (marquage juveacutenile + adultes) permet de faire des propositions coheacuterentes selon un diagnostic le plus complet possible de la population de truite preacutesente

31 Bassin du Borne

Sur les riviegraveres du bassin du Borne les orientations de gestion proposeacutees ci-apregraves restent conformes agrave celles deacutejagrave eacutevoqueacutes par CAUDRON et CHAMPIGNEULLE (2002)

Arrecirct du repeuplement selon les pratiques actuelles sur lrsquoensemble du cours principal Cette proposition est motiveacutee par deux principales raisons

- Lrsquoalevinage est inefficace agrave lrsquoamont du seuil drsquoEntremont car apregraves plus de 15 ans il nrsquoa pas permis drsquoinstaller une population en place eacutequilibreacutee

- Il semble impeacuteratif de preacuteserver lrsquoimportante population de truite sauvage preacutesente agrave lrsquoaval du seuil drsquoEntremont Les reacutesultats geacuteneacutetiques indiquent que la population preacutesente est une population sauvage qui nrsquoa pas eacuteteacuteimplanteacutee suite agrave lrsquoalevinage Elle preacutesente un degreacute de pureteacute geacuteneacutetique important Cette population repreacutesente un patrimoine unique dans le Faucigny Le but drsquoarrecircter les alevinages sur ce secteur est drsquoeacuteviter les hybridations qui peuvent entraicircner une perte de plasticiteacute geacuteneacutetique et une deacutegeacuteneacuterescence de la souche sauvage actuelle

Arrecirct du repeuplement sur lrsquoaval de lrsquoOveacuteran Ce secteur est utiliseacute comme zone de reproduction par les geacuteniteurs du Borne et la reproduction naturelle y est abondante Lrsquoalevinage nrsquoest donc pas neacutecessaire et risque comme sur le Borne de provoquer une hybridation de la population naturelle

Essayer drsquoinstaller une population naturelle agrave lrsquoamont du seuil drsquoEntremont par transferts de geacuteniteurs

Sur les autres affluents deux sceacutenarii de gestion peuvent ecirctre envisageacutes selon la volonteacute politique des gestionnaires directs

Sceacutenario ndeg1 vision patrimoniale

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- Arrecirct du repeuplement en truite drsquoorigine Atlantique pendant 3 anneacutees conseacutecutives pour diminuer leur preacutesence sur le bassin

- Puis reprise de lrsquoalevinage pendant uniquement 3 anneacutees agrave partir de poissons sauvages issus du Borne pour essayer drsquoinstaller une population naturelle

Sceacutenario ndeg2 vision halieutique- Maintien des pratiques drsquoalevinage en atlantique pour soutenir

artificiellement le stock de poissons dans un inteacuterecirct uniquement halieutique Attention cette pratique risque de provoquer par deacutevalaison des individus introduits une hybridation des poissons sauvages preacutesents dans le Borne

Eventuellement repeuplement en truites Arc en Ciel surdensitaires sur des secteurs preacutecis du Borne pendant la peacuteriode estivale afin de contenter une certaine cateacutegorie de pecirccheurs Les repeuplements en Arc en Ciel ne risquent pas de provoquer drsquohybridation de la souche fario locale Attention prendre des preacutecautions aupregraves des fournisseurs concernant la qualiteacute sanitaire des poissons

32 Bassin du Giffre

Les propositions sur le bassin du Giffre prennent en compte les reacutesultats du marquage mais eacutegalement la situation actuelle de la riviegravere suite agrave lrsquoeacuteboulement de Sixt Fer agrave Cheval

Ne pas aleviner le cours principal du Giffre en alevins de fario pendant 5 anneacutees conseacutecutives Cette proposition est motiveacutee par les raisons suivantes

- Il est impossible de savoir comment va eacutevoluer dans les prochains mois et les prochaines anneacutees le glissement agrave lrsquoamont de Sixt Il semble donc risqueacute drsquoentreprendre un alevinage pour installer une nouvelle population

- Les reacutesultats des marquages sur le Giffre sont tregraves contrasteacutes Sauf au niveau de Sixt ils montrent qursquoil existait avant le glissement une reproduction naturelle importante et capable de soutenir une population

- Les reacutesultats geacuteneacutetiques reacutecents indiquent que les populations en place sont en majoriteacute drsquoorigine atlantique mais qursquoil existe encore des individus meacutediterraneacuteens non hybrideacutes jusque dans les zones amont Ces reacutesultats prouvent qursquohistoriquement la souche meacutediterraneacuteenne eacutetait bien preacutesente sur lrsquoensemble du Giffre

- Il est envisageable que cette souche sauvage eacutegalement preacutesente sur les parties basses des affluents recolonise naturellement le Giffre

- Lrsquoexemple du Borne montre qursquoapregraves une catastrophe la riviegravere a eacuteteacute recoloniseacutee par une souche sauvage malgreacute des alevinages massifs Les reacutesultats obtenus sur cette riviegravere doivent servir de base de reacuteflexions pour la nouvelle gestion agrave entreprendre sur le Giffre

- Entre le Risse et Marignier la population de truites avant le glissement eacutetait deacutejagrave totalement deacuteseacutequilibreacutee et en quasi disparition (peu de juveacuteniles quasi absence de geacuteniteurs et absence de classes drsquoacircges intermeacutediaires) malgreacute les alevinages massifs sur ce secteur

39

Reacutealiser un bilan de lrsquoimpact du glissement de terrain sur le peuplement piscicole

- Une eacutetude piscicole sera reacutealiseacutee tregraves prochainement (2004 ou 2005) sur le Giffre dans le cadre du contrat de riviegravere Cette eacutetude permettra de faire un premiereacutetat des lieux complet du peuplement piscicole suite au glissement

Accomplir un diagnostic de lrsquoeacutetat de recolonisation du Giffre par les populations naturelles

- En lrsquoabsence drsquoalevinage il sera possible de reacutealiser en 2008 un bilan des populations de truites installeacutees sur le Giffre

- A partir de lrsquoeacutetat de la population agrave cette eacutepoque un plan drsquoalevinage coheacuterent en truite fario pourra ecirctre eacutetabli pour permettre drsquoinstaller de nouvelles populations ou de soutenir des populations preacutesentes

Mettre en place des deacuteversements de truites Arc en Ciel pendant toute la peacuteriode drsquoarrecirct de lrsquoalevinage en fario Attention prendre des preacutecautions aupregraves des fournisseurs concernant la qualiteacute sanitaire des poissons

Reacuteintroduire lrsquoOmbre commun sur la plaine de Samoeumlns et agrave lrsquoaval de la confluence avec le Risse

Arrecirct de lrsquoalevinage sur lrsquoensemble du Risse sur lrsquoaval du Foron de Mieussy et sur lrsquoEtroit Denteacutee

- Sur ces riviegraveres le suivi du marquage a montreacute que lrsquoalevinage nrsquoeacutetait pas neacutecessaire pour soutenir les populations de truites preacutesentes

Maintenir lrsquoalevinage sur lrsquoamont du Foron de Mieussy (vers Sommand) et lrsquoamont du Foron de Taninges (Bonnavaz)

- Sur ces secteurs le suivi du marquage a montreacute que les juveacuteniles preacutesents dans le milieu naturel eacutetaient en majoriteacute des individus introduits

33 Le Foron du Reposoir

Les propositions de gestion sur le Foron du Reposoir sont

Maintenir les alevinages actuels avec la souche Chazey Bons Rhodanienne

Suivre lrsquoeacutevolution de la population pour savoir si cet alevinage permet drsquoinstaller une population fonctionnelle

- Ce suivi peut comprendre des pecircches de sondages en deacutebut de peacuteriode de reproduction pour voir si les poissons adultes deviennent matures des releveacutes de frayegraveres sur la riviegravere pour savoir si les poissons se reproduisent et de nouveaux preacutelegravevements de poissons pour suivre lrsquoeacutevolution du taux de marqueacutes dans la population

34 Bassin de la Filliegravere

Les orientations pour une gestion coheacuterente des populations de la Filliegravere sont les suivantes

40

Arrecirct de lrsquoalevinage sur le cours principal de la Filliegravere sur le Crenant et sur lrsquoaval du Flan

- Sur ces 3 riviegraveres lrsquoalevinage nrsquoest pas neacutecessaire car il ne permet pas de soutenir les populations preacutesentes et de plus la reproduction naturelle est tregraves importante

- Sur la Filliegravere les pecircches drsquoadultes dans le cadre du programme INTERREG ont mis en eacutevidence la preacutesence drsquoune population sauvage drsquoorigine meacutediterraneacuteenne Il semble important drsquoentreprendre une mesure de conservation de cette souche en arrecirctant lrsquoalevinage pour eacuteviter lrsquohybridation

- Sur lrsquoamont du Flan il est neacutecessaire de continuer le suivi des poissons marqueacutes pour savoir si lrsquoalevinage doit ecirctre maintenu

Sur le Daudens deux sceacutenarii de gestion peuvent ecirctre envisageacutes selon la volonteacute politique des gestionnaires directs

Sceacutenario ndeg1 vision patrimoniale- Arrecirct du repeuplement en truite drsquoorigine Atlantique pendant 3 anneacutees

conseacutecutives pour diminuer leur preacutesence sur le bassin- Commencer les proceacutedures afin de rendre le seuil du Plot

franchissable pour les geacuteniteurs de la Filliegravere- Reacutealiser un bilan notamment deacutemographique de la population en place

apregraves lrsquoarrecirct de lrsquoalevinage- Puis reprise de lrsquoalevinage pendant uniquement 3 anneacutees agrave partir de

poissons sauvages issus de la Filliegravere pour essayer drsquoinstaller une population naturelle

Sceacutenario ndeg2 vision halieutique- Maintien des pratiques drsquoalevinage en atlantique pour soutenir

artificiellement le stock de poissons dans un inteacuterecirct uniquement halieutique Attention cette pratique risque de provoquer par deacutevalaison des individus introduits une hybridation des poissons sauvages preacutesents dans la Filliegravere

35 Le Foron de Fillinges

Les reacutesultats obtenus sur le Foron de Fillinges ont conduit agrave formuler les propositions de gestion suivantes

Arrecirct de lrsquoalevinage sur lrsquoensemble du Foron de Fillinges- Quelque soit la souche utiliseacutee et les quantiteacutes introduites les poissons

alevineacutes ne repreacutesentent qursquoune tregraves faible minoriteacute des poissons preacutesents dans le milieu Le Foron abrite une population naturelle fonctionnelle et eacutequilibreacutee

Suivi de la population suite agrave lrsquoarrecirct du repeuplement- Reacutealisation de 5 stations de pecircches eacutelectriques la derniegravere anneacutee de

lrsquoalevinage afin de reacutealiser un eacutetat des lieux preacutecis de la population de truites et du peuplement piscicole

- Reacutealisation drsquoun nouveau bilan de la population du Foron respectivement 3 ans puis 6 ans apregraves lrsquoarrecirct de lrsquoalevinage

41

4 Investigations suppleacutementaires

Suite aux premiers reacutesultats obtenus lors de la campagne 2002 des investigations suppleacutementaires permettant de preacuteciser certains points seront reacutealiseacutees

Reacutealiser une analyse bacteacuteriologique des diffeacuterents lots de poissons alevineacutes qui ont transiteacutes dans les piscicultures associatives Cette recherche de pathologie permettra de savoir si les poissons issus de pisciculture sont porteurs drsquoune maladie bacteacuterienne avant drsquoecirctre introduits dans le milieu ou si ils contractent la maladie dans le milieu naturel

Rechercher les raisons pour lesquelles on nrsquoobserve pas drsquoalevins naturels sur certains secteurs Les causes drsquoune telle situation peuvent ecirctre

- Lrsquoabsence totale de geacuteniteurs dans la population Les poissons nrsquoont pas le temps de devenir adulte (3+) et sont captureacutes avant par les pecirccheurs

- La preacutesence drsquoadultes non matures Les poissons deviennent adultes mais sont immatures (eacutetat sanitaire des poissons souche geacuteneacutetiquement deacutegeacuteneacutereacutee)

- Survie nulle durant la phase de vie sous graviers Les poissons pondent mais les œufs nrsquoarrivent pas agrave se deacutevelopper et la mortaliteacute est totale

Sur les secteurs du Chinaillon de la Duche de lrsquoOveacuteran amont et du Foron de Mieussy amont (Sommand) les actions suivantes peuvent ecirctre entreprises

- Pecircches eacutelectriques de sondage en deacutebut de la peacuteriode de reproduction pour savoir si les poissons deviennent matures

- Releveacutes de frayegraveres permettant drsquoobserver ou non une activiteacute de reproduction- Mise en place drsquoincubateurs-tests contenant des œufs de truites pour connaicirctre le taux

de survie des œufs dans les frayegraveres

Reacutealiser des preacutelegravevements suppleacutementaires aux classes drsquoacircge supeacuterieures (1+ et 2+) sur certaines stations pour voir lrsquoeacutevolution du taux de marqueacutes au cours des anneacutees Ces recherches suppleacutementaires peuvent ecirctre effectueacutees sur 8 cours drsquoeau ougrave le taux de marqueacutes deacutepasse 60 au stade 0+

Le ruisseau de la Duche amontLe ruisseau du Chinaillon amontLe Foron du ReposoirLe Risse avalLe Foron de Taninges amont (Bonnavaz)Le Foron de Mieussy amont (Sommand)Le Daudens amont et avalLe Flan amont

Dans les eacutetudes preacuteceacutedentes reacutealiseacutees sur le Fier (CAUDRON et CHAMPIGNEULLE 2002) et sur le Doubs (CHAMPIGNEULLE et al 2002) les taux de marqueacutes aux stades 1+ et 2+ dans la population en place srsquoeffondraient et devenaient tregraves faibles ou nuls

Pour informations le graphique suivant montre lrsquoeacutevolution du taux de marqueacutes agrave diffeacuterents stades sur les stations ougrave le taux de 0+ marqueacutes eacutetait eacuteleveacute

42

Les reacutesultats montrent agrave part pour une station une chute importante des taux de marqueacutes entre les stades 0+ et 1+ Cette chute se poursuit eacutegalement au stade 2+Ces reacutesultats obtenus sur le Fier et le Doubs semblent laisser peu drsquoespoirs sur le devenir des poissons marqueacutes sur les bassins eacutetudieacutes en 2002

Reacutesultats sur leacutevolution du taux de m arqueacutes aux diffeacuterents stades obtenus lors des eacutetudes preacuteceacutedentes sur le Fier et le Doubs

0102030405060708090

100

0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 0+ 1+ 0+ 1+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+

Station A Station B Station C StationD

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Station A Station B StationC

Stations et stades

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Le Fier Le Doubs

Reacutesultats sur leacutevolution du taux de m arqueacutes aux diffeacuterents stades obtenus lors des eacutetudes preacuteceacutedentes sur le Fier et le Doubs

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100

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Station A Station B Station C StationD

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StationF

Station A Station B StationC

Stations et stades

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Le Fier Le Doubs

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11

Selon MORAND (com pers) deux maladies bacteacuteriennes peuvent engendrer ces symptocircmes (la furonculose et la yerciniose) Ces deux maladies sont preacutesentes dans le monde entier et atteignent tout particuliegraverement les eacutelevages de salmonideacutes

Elles peuvent ecirctre favoriseacutees par des conditions particuliegraveres du milieu environnant tempeacuterature de leau eacuteleveacutee (supeacuterieure agrave 10 degC) une charge organique importante ou encore une pollution diminuant les deacutefenses immunitaires du poissonhellip

Selon la graviteacute de laffection ces pathologies peuvent entraicircner de lourds taux de mortaliteacute atteignant jusquagrave 70 dans certains cas (MOURRIERAS 1995)

Les heacutemorragies observeacutees agrave la base des nageoires sont la conseacutequence drsquoune infection bacteacuterienne pouvant provoquer drsquoimportantes mortaliteacutes

17Utilisation du SIG de la Feacutedeacuteration de pecircche de Haute-Savoie

Les donneacutees du programme pilote de marquage et du programme INTERREG sont inteacutegreacutees dans un SIG (Systegraveme dInformation Geacuteographique MapInfo) mis en place agrave la Feacutedeacuteration de pecircche de Haute-Savoie et agrave lINRA de Thonon

Ainsi toutes les informations relatives aux cours deau du deacutepartement seront consigneacutees dans cette base de donneacutees (pente longueur preacutesence de seuils infranchissables caracteacuteristiques physico-chimiques IBGN hydrologie occupation des bassins versantshellip) Il en sera de mecircme pour les donneacutees truites (repeuplement densiteacute biomasses croissance structure dacircge pathologie geacuteneacutetiquehellip)

Lapproche finale visera agrave rechercher les relations existant entre ces deux groupes de donneacutees spatialiseacutees Une toute premiegravere deacutemarche a eacuteteacute partiellement tenteacutee dans le cas du preacutesent rapport dont les donneacutees ont eacuteteacute inteacutegreacutees dans le SIG en cours de construction

12

2 Reacutesultats et discussions

Ce chapitre preacutesente les reacutesultats obtenus sur les bassins eacutetudieacutes lors de la campagne de preacutelegravevements 2002 agrave savoir

Le GiffreLe BorneLa FilliegravereLe Foron de ScionsiezLe Foron de Fillinges

Lors de la campagne 2002 1703 poissons au stade 0+ ont eacuteteacute eacutechantillonneacutes en milieu naturel et eacutetudieacutes en laboratoire

21Taux de marquage sexe ratio et pathologie

211 Le Borne

Sur le bassin du Borne 5 stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal et 3 sur des affluents Au total ce sont 392 poissons 0+ qui ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

Sur le cours principal

Les taux de marqueacutes varient fortement sur le cours principal du Borne (18 agrave 100) On observe un gradient amont-aval du taux de marqueacutes qui peut ecirctre mis en relation avec la preacutesence drsquoun obstacle partiellement infranchissable pour les geacuteniteurs au niveau drsquoEntremont

Ainsi deux grandes zones peuvent ecirctre distingueacutees sur le Borne

La zone amont du seuil drsquoEntremont ougrave la majoriteacute des juveacuteniles sont issus du repeuplement (90 agrave 100)

On observe sur ce secteur une tregraves faible reproduction naturelle en raison drsquoune quasi-absence de poissons adultes La situation de la population de truites est donc tregraves critique Si le repeuplement permet de drsquoobserver des 0+ il nrsquoa pas permis drsquoinstaller une population fonctionnelle

La zone aval du seuil drsquoEntremont ougrave la majoriteacute des individus preacutesents au stade 0+ sont des poissons naturels

En effet le taux de marqueacutes varie de 18 agrave 49 Les pecircches de sondage Interreg ont montreacute la preacutesence drsquoune importante population de truites sauvages drsquoorigine meacutediterraneacuteenne La population est eacutequilibreacutee et naturellement fonctionnelle puisqursquoon observe une forte reproduction naturelle et de nombreux geacuteniteurs

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14

Sur les Affluents

Sur les 3 affluents eacutetudieacutes la situation est tregraves simple En effet soit on observe 0 de marqueacutes soit 100

- Sur lrsquoOveacuteran aval aucun poisson marqueacute nrsquoa eacuteteacute trouveacute puisqursquoil nrsquoy a pas eu de repeuplement sur ce secteur en 2002 Le reacutesultat obtenu montre une importante reproduction naturelle des geacuteniteurs du Borne qui remontent sur lrsquoaval de ce cours drsquoeau

- Sur la Duche et le Chinaillon il y a absence totale de reproduction naturelle puisque 100 des 0+ eacutechantillonneacutes sont marqueacutes Pourtant on observe de nombreux poissons adultes sur ces secteurs susceptibles drsquoecirctre des geacuteniteurs ainsi que diffeacuterentes classes drsquoacircge Lrsquoeacutequilibre de ces populations est artificiellement maintenu par les alevinages

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

- Toutes les stations eacutetudieacutees ne sont pas concerneacutees par ces symptocircmes de maladies- Les maladies bacteacuteriennes semblent toucher majoritairement les poissons introduits- Cependant les 0+ de lrsquoOveacuteran aval tous naturels sont infecteacutes agrave 15 Ce reacutesultat

peut refleacuteter une contamination par deacutevalaison provenant drsquoindividus atteints situeacutes plus en amont de lrsquoOveacuteran ou une contamination naturelle par des agents pathogegravenes preacutesents dans le milieu

- Les poissons marqueacutes peuvent ecirctre contamineacutes agrave un taux non neacutegligeable pouvant atteindre plus de 30

Pourcentage dindividus preacutesentant des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

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GrandBornand

Les Etroits Entremont Beffay St Pierre enF

Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Chinaillon La Duche LOveacuteran

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

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Pourcentage dindividus preacutesentant des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

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Les Etroits Entremont Beffay St Pierre enF

Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Chinaillon La Duche LOveacuteran

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

15

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Le sexe ratio est relativement eacutequilibreacute pour les marqueacutes comme pour les non marqueacutes Seule une station sur le Borne (Beffay) montre 85 de macircle dans la population de 0+

- Seules 2 stations montrent des macircles matures au stade 0+- Le pourcentage de macircles matures au stade 0+ est plus important chez les non

marqueacutes que chez les marqueacutes

Pourcentage de macircles au stade 0+

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Les Etroits Entremont Beffay St Pierre enF

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Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Borne

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Pourcentage de macircles au stade 0+

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Les Etroits Entremont Beffay St Pierre enF

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Pourcentage de macircles matures au stade 0+

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Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Borne

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

16

212 Le Giffre

Sur le bassin du Giffre 6 stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal et 7 sur des affluents Au total ce sont 536 poissons 0+ qui ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

Sur le cours principal

La carte de synthegravese des reacutesultats met en eacutevidence des taux de marqueacutes tregraves contrasteacutes variant entre 0 et 100 Sauf deux cas particuliers la campagne de preacutelegravevements a permis de montrer qursquoune reproduction naturelle existait sur lrsquoensemble du Giffre

Il est possible de distinguer trois zones successives sur ce cours deau

La zone aval est composeacutee de la station Pont du Giffre ougrave le taux de marqueacutes est de 74 Cette station sur le Giffre doit ecirctre rapprocheacutee des stations eacutetudieacutees sur le Risse (station laquo Risse aval St Jeoire raquo) et le Hisson(laquo station La Pallud raquo) pour mieux comprendre le fonctionnement de la population

- Sur le Giffre aval la situation semble tregraves critique La station dite laquo Pont du Giffre raquosrsquoeacutetend de lrsquoamont de Marignier agrave lrsquousine du Pont du Giffre soit sur environ 25 km Sur cette distance seulement 31 0+ ont pu ecirctre captureacutes De plus les pecircches drsquoadultes dans le cadre drsquoInterreg montrent un deacuteficit inquieacutetant de geacuteniteurs sur ce secteur ainsi qursquoune surabondance de Chabot La situation du bas Giffre montre une population de truitetotalement deacuteseacutequilibreacutee loin du potentiel de la riviegravere et qui ne peut pas ecirctre reacutehabiliteacutee par le seul fait de lrsquoalevinage Cette situation peut ecirctre le reacutesultat du faible deacutebit reacuteserveacute qui appauvrit lrsquohabitat aquatique et provoque des eacuteleacutevations de tempeacuterature inquieacutetantes Les reacutesultats de pecircche drsquoinventaire dans la reacuteserve de Marignier montrent que les poissons sont concentreacutes agrave lrsquoaval immeacutediat des seuils ougrave lrsquoon note la preacutesence de fosses de tempeacuteratures plus faibles et drsquoune meilleure oxygeacutenation

La zone moyenne situeacutee entre le barrage de Mieussy et Samoeumlns qui est composeacutee des stations laquo aval barrage Taninges raquo laquo Theacuteziegraveres raquo et laquo Montessuit raquo Sur ce secteur les 0+ marqueacutes sont en minoriteacutes puisqursquoils repreacutesentent 11 agrave 38 du peuplement

- Sur le Giffre aval barrage de Taninges le secteur nrsquoest pas alevineacute il est donc normal que pregraves de 90 des poissons ne soient pas marqueacutes Les 0+ marqueacutes proviennent certainement du ruisseau de lrsquoEtroit Denteacute qui est fortement alevineacute et agrave partir duquel une deacutevalaison doit avoir lieu- Le secteur des laquo Theacuteziegraveres raquo et de laquo Montessuit raquo bien que reacuteguliegraverement alevineacute montre un taux important drsquoalevins naturels (62 agrave 77) Ce reacutesultat est tout agrave fait en accord avec le suivi de la reproduction naturelle et le recensement de frayegraveres reacutealiseacute par lrsquoAAPPMA du Faucigny et le CSP en 1999 En effet de nombreuses frayegraveres naturelles avaient eacuteteacute observeacutees sur ce site Le peuplement drsquoadultes nrsquoest pas tregraves important mais est en rapport avec les potentialiteacutes du milieu

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La zone amont caracteacuteriseacutee par les stations laquo Reveacute-Peacuteret raquo et laquo amont Tines raquo ougrave le taux de marqueacutes varie de 70 agrave 79

- Pour ces deux stations la population de juveacuteniles est faible et ils sont majoritairement marqueacutes Cependant au stade adulte les pecircches Interreg montrent une majoriteacute de poissons drsquoorigine meacutediterraneacuteenne La forte contribution de poissons introduits au stade 0+ ne semble pas se retrouver au stade adulte Les conditions de vie dans ce milieu sont tregraves difficiles et ne permettent pas drsquoatteindre des densiteacutes de poissons importantes

Sur les Affluents

Le Risse - Le Hisson montre une majoriteacute drsquoalevins naturels alors que les preacutelegravevements ont eacuteteacute reacutealiseacutes seulement deux mois apregraves le repeuplement Ce cours drsquoeau possegravede un fort potentiel de frai qui est utiliseacute notamment par les geacuteniteurs du Risse- Sur lrsquoaval du Risse le taux de marqueacutes est de 68 Il est le reflet drsquoun alevinage en quantiteacute importante sur le secteur (10 000 alevins) Les alevins naturels repreacutesentent tout de mecircme plus de 30 trois mois apregraves le repeuplement De plus les eacutechantillonnages drsquoadultes reacutealiseacutes sur ce secteur dans le cadre drsquoInterreg ont mis en eacutevidence une quantiteacute importante de geacuteniteurs sauvages La population sur ce secteur est agrave mettre en eacutevidence avec celle du Hisson puisque certains geacuteniteurs du Risse y migrent pour se reproduireLa population sur ce secteur est naturellement fonctionnelle

Le Foron de Mieussy - La station laquo Andelier raquo situeacutee en amont du Foron preacutesente 100 de marqueacutes Cette situation montre une absence totale de reproduction naturelle Le milieu est extrecircmement deacutefavorable agrave lrsquoinstallation drsquoune population fonctionnelle en raison du faible deacutebit de la riviegravere (assegravechement reacutegulier) Aucune classe drsquoacircge intermeacutediaire et aucun adulte nrsquoa eacuteteacute observeacute sur ce secteur Les poissons alevineacutes sont certainement victimes des assegravechements- La station laquo Trebiet raquo situeacutee plus en aval preacutesente au contraire 0 de marqueacutes alors que cette zone a eacuteteacute alevineacutee Ce reacutesultat montre la capaciteacute du Foron sur ce secteur a accueillir une population fonctionnelle Il existe une reproduction naturelle importante sur cette zone avec eacutegalement beaucoup de geacuteniteurs- Vers Sommand une pecircche de sondage a eacuteteacute reacutealiseacutee mais aucun alevin nrsquoa eacuteteacute preacuteleveacute puisque cette zone nrsquoa pas eacuteteacute alevineacutee en 2002 Cependant les reacutesultats de ce sondage mettent en eacutevidence une absence totale de reproduction naturelle (aucun alevin naturel nrsquoa eacuteteacute trouveacute) alors que la population semble eacutequilibreacutee (preacutesence drsquoadultes et de truitelles drsquoacircge intermeacutediaire)

LrsquoEtroit Denteacute Globalement le taux de marqueacutes sur les deux stations eacutetudieacutees est faible (11 agrave 33)- Sur la station laquo aval route raquo la majoriteacute des alevins est naturelle Cette zone montre un habitat tregraves favorable pour la reproduction des geacuteniteurs qui remontent du Giffre- Sur la station laquo amont route raquo une population fonctionnelle de pheacutenotype meacutediterraneacuteen est installeacutee De nombreux geacuteniteurs sont preacutesents et le recrutement naturel est important

19

Le Foron de Taninges - En amont (station Bonnavaz) le taux de marqueacutes est tregraves important (95) Il existe donc une reproduction naturelle mais insuffisante pour permettre lrsquoinstallation drsquoune population et maintenir une activiteacute halieutique Les alevinages passeacutes nrsquoont pas permis drsquoinstaller une population fonctionnelle dans cette zone apicale- Plus en aval sur les zones non alevineacutees les pecircches eacutelectriques drsquoinventaire et de sondage reacutealiseacutees ont montreacute la preacutesence drsquoune population eacutequilibreacutee de pheacutenotype meacutediterraneacuteen avec une importante reproduction naturelle

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

Les principales remarques concernant les pathologies observeacutees sur le bassin du Giffre sont

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

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Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Giffre

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20

- La PKD est preacutesente sur le cours du Giffre mais uniquement agrave lrsquoaval du barrage de Taninges Cette situation est agrave mettre en relation avec le deacutebit reacuteserveacute insuffisant qui entraicircne une augmentation de tempeacuterature pendant la peacuteriode estivale

- Sur les affluents la PKD a eacuteteacute observeacutee sur les secteurs preacutesentant des faibles deacutebits estivaux (aval du Risse et Foron de Mieussy Andelier) qui sont certainement responsables drsquoune augmentation de tempeacuterature

- La PKD atteint agrave la fois les poissons introduits que les poissons naturels- Le pourcentage drsquoindividus toucheacutes par la PKD varie drsquoun site agrave lrsquoautre mais peut

atteindre une valeur importante avec 50 sur certain secteur- Les maladies bacteacuteriennes sont plus freacutequentes chez les individus marqueacutes Soit ces

poissons sont plus fragiles que les poissons naturels et contractent les maladies plus facilement soit les maladies sont contracteacutees en pisciculture pendant lrsquoeacutelevage

- Le pourcentage drsquoindividus toucheacutes par des symptocircmes bacteacuteriens nrsquoest pas neacutegligeable puisqursquoil peut atteindre 20

- Lrsquoensemble des stations eacutetudieacutees est toucheacute par des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes ce qui laisse penser que lrsquoensemble du bassin peut ecirctre atteint

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LEtroitDenteacute

Le F deMieussy

Le F deMieussy

Le Risse

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Giffre

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

21

- Le sexe ratio apparaicirct globalement eacutequilibreacute sur lrsquoensemble des stations du Giffre- On observe des diffeacuterences entre les poissons introduits et les poissons naturels sur

seulement 3 stations Ces diffeacuterences sont en faveur des poissons marqueacutes qui montrent un pourcentage de macircles plus important

- Une maturiteacute sexuelle preacutecoce des macircles existe sur certaines stations quelle que soit lrsquoorigine des poissons

- Cette maturiteacute peut ecirctre importante et concerner jusqursquoagrave 20 des 0+

22

213 Le Foron du Reposoir

Deux stations (La Touviegravere et Le Reposoir) ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le Foron du Reposoir Seulement 15 0+ ont eacuteteacute eacutetudieacutes en raison principalement de la difficulteacute drsquoeacutechantillonner des poissons de petite taille (6-7 cm) sur ces milieux torrentiels

Le taux de marqueacutes

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23

- Sur les deux stations eacutetudieacutees le taux de marqueacutes est de 100 Lrsquoensemble des 0+ mecircme si le nombre est faible est donc issu de lrsquoalevinage Ce cours drsquoeau fait lrsquoobjet actuellement drsquoun essai drsquoimplantation drsquoune population agrave partir de la souche Chazey-Bons Rhodanienne Cette souche provient de geacuteniteurs de la riviegravere Furan (Ain) Des analyses geacuteneacutetiques reacutecentes reacutealiseacutees par analyse de microsatellites diagnostic de lrsquoADN ont montreacute que ces poissons ont un pourcentage dallegraveles meacutediterraneacuteens voisin de 65

Ce reacutesultat montre que le cours deau avait un niveau de population tregraves faible avant le repeuplement par la souche Chazey-Bons sauvagesDe plus les pecircches drsquoinventaires du CSP et les pecircches de sondage Interreg montrent qursquoune population de truites se met progressivement en place En effet on observe chaque anneacutee despoissons agrave des stades de plus avanceacutes et les captures par pecircche agrave la ligne commencent agrave ecirctre effectivesLes pecircches eacutelectriques reacutealiseacutees agrave lrsquoautomne 2002 indique que le stock de geacuteniteurs est en cours de reconstitution mais que les truites femelles nrsquoont pas encore atteint le stade geacuteniteurIl nrsquoest donc pas encore possible de dire si lrsquohabitat et la population du Foron du Reposoir sont propices agrave lrsquoinstallation drsquoune population naturellement fonctionnelle

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

Aucun symptocircme reacutenal et heacutemorragique nrsquoapparaicirct sur les 0+ eacutechantillonneacutes sur ce cours deau

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Le sexe ratio est eacutequilibreacute puisqursquoil varie de 50 agrave 60- Il nrsquoy a aucun macircle mature au stade 0+ dans les eacutechantillons preacuteleveacutes sur ce cours

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

24

214 La Filliegravere

Cinq stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal de la Filliegravere ainsi que sept stations sur les trois affluents principaux (Flan Creacutenant et Daudens) Au total 582 poissons 0+ ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

Sur le cours principal

Pour les 5 stations eacutetudieacutees sur le cours principal le taux de 0+ marqueacutes varie de 4 agrave 56 il est donc de tregraves faible agrave moyen et montre une forte reproduction naturelle sur toute la riviegravere Il y a un gradient amont-aval du taux de marqueacutes avec un pourcentage de poissons marqueacutes plus important en amont Cependant sur lrsquoensemble de la Filliegravere le recrutement naturel est dominant et constitue lrsquoessentiel de la population de truite

De plus les pecircches de sondages pour Interreg ont montreacute la preacutesence de nombreux drsquoadultes drsquoorigine naturelle meacutediterraneacuteenne Ceci confirme que la population de truite de la riviegravere principale est naturellement fonctionnelle

Sur les affluents

Les reacutesultats sont diffeacuterents selon que lrsquoaffluent est en connexion ou non avec la riviegravere principale

- Sur le Flan on observe en zone aval et meacutediane (stations laquo D 55 raquo et laquo Bruchon raquo) des taux de marqueacutes faibles (38 et 27) qui mettent en eacutevidence la preacutesence drsquoune forte reproduction naturelle notamment de poissons migrants de la Filliegravere Les releveacutes de frayegraveres reacutealiseacutes par lrsquoAAPPMA avaient deacutejagrave permis drsquoobserver de nombreuses frayegraveres naturelles sur ce secteurEn zone plus amont station laquo Molliet raquo le taux de marqueacutes est plus important (73) il met en eacutevidence la preacutesence drsquoun recrutement naturel mais qui reste au stade 0+ minoritaire par rapport aux individus introduits

- Sur le Daudens les deux stations (laquo Le Plot raquo et Daudens raquo) montrent des taux de marqueacutes importants (86 et 92) La reproduction naturelle est donc tregraves faible et la population de truite ne semble pas fonctionnelle Lrsquoobstacle agrave lrsquoaval de la route deacutepartementale semble preacutejudiciable car il ne permet pas aux geacuteniteurs de la Filliegravere de remonter sur le Daudens et drsquoinstaller une population fiable

- Sur le Crenant Les deux stations eacutechantillonneacutees (laquo aval raquo et Disonche raquo) ne sont pas situeacutees sur des zones alevineacutees en 2002 et il est normal de trouver 0 de marqueacutes Cependant ces reacutesultats montrent qursquoil y a une forte reproduction naturelle sur ce cours drsquoeau mecircme en zone amont et que la population semble naturellement fonctionnelle Les alevins introduits sur le Crenant ne semblent pas avoir deacutevaleacutes sur pour coloniser lrsquoaval du Crenant

25

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26

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

- La PKD semble quasiment absente du bassin de la Filliegravere sauf preacutesence anecdotique uniquement chez les non marqueacutes sur une station (laquo Millard raquo)

- Les individus marqueacutes ne sont pas toucheacutes par la PKD- Les maladies bacteacuteriennes sont preacutesentes sur lrsquoensemble du bassin mais touchent en

prioriteacute et majoritairement les individus marqueacutes

Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

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Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

27

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Sur lrsquoensemble des stations le sexe ratio est eacutequilibreacute il montre une plus grande variation chez les individus marqueacutes

- Des macircles matures au stade 0+ ont eacuteteacute observeacutes sur trois stations uniquement chez les individus naturels

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

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Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

28

215 Le Foron de Fillinges

Trois stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal du Foron de Fillinges agrave savoir de lrsquoamont vers lrsquoaval laquo Bovet ndash Boex raquo laquo Pont de Fillinges raquo et laquo Couvette raquo Au total 178 poissons 0+ ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

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29

Sur les 3 stations eacutetudieacutees les taux de marqueacutes sont faibles agrave tregraves faibles- Sur la station laquo Bovet ndash Boex raquo le taux de marqueacutes est de seulement 31- A lrsquoaval sur les stations laquo Pont de Fillinges raquo et laquo Couvette raquo les taux de marqueacutes

sont respectivement de 0 et 2

Les reacutesultats indiquent la preacutesence drsquoune importante reproduction naturelle sur lrsquoensemble du Foron de Fillinges Quelque soit la souche utiliseacutee pour lrsquoalevinage atlantique dans le secteur Faucigny ou Meacutediterraneacuteenne Pont de Gys dans le secteur Chablais les poissons introduits restent minoritaires

Cette situation traduit la preacutesence drsquoune population bien installeacutee et fonctionnelle sur cette riviegravere

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

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Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

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Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

30

- Sur lrsquoensemble des stations des individus 0+ sont atteints par la PKD le pourcentage drsquoindividus malades peut atteindre 35

- Seuls les individus sauvages semblent toucheacutes par la PKD cependant le nombre drsquoindividus introduits est trop faible pour permettre une comparaison

- Toutes les stations sont eacutegalement toucheacutees par les maladies bacteacuteriennes avec des taux de contamination variant de 15 agrave 30

- Les maladies bacteacuteriennes touchent agrave la fois les individus introduits et les individus naturels

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Le sexe ratio apparaicirct eacutequilibreacute sur lrsquoensemble des stations- On observe des macircles matures degraves le stade 0+ sur lrsquoensemble des stations- Le taux de macircles matures au stade 0+ peut atteindre 15

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

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Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

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Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

Pourcentage de macircles au stade 0+

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31

22Caracteacuteristiques morphologiques

221 Longueur totale des individus

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

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Taille moyenne des 0+ sur le Giffre

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Les Etroits Entremont Beffay St Pierre en F

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Giffre

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32

Sur la quasi-totaliteacute des stations eacutetudieacutees les individus marqueacutes preacutesentent une taillemoyenne supeacuterieure agrave celle des individus naturels Sur 18 stations ougrave les effectifs permettent des comparaisons statistiques la longueur totale des individus marqueacutes est significativement supeacuterieure agrave celle des truites sauvages pour 13 stations

Les 5 stations faisant exception sont laquo aval barrage Taninges raquo et laquo Pont du Giffre raquo sur le Giffre laquoAval St Jeoire raquo sur le Risse laquo Bonnavaz raquo sur le Foron de Taninges et laquo Couvette raquo sur le Foron de Fillinges Cependant sur ces stations les diffeacuterences ne sont pas significatives

Le fait que les marqueacutes aient une plus grande taille moyenne que les non marqueacutes au stade 0+ nrsquoimplique pas que cela soit systeacutematiquement le cas aux stades ulteacuterieurs En effet CAUDRON (1998) et CHAMPIGNEULLE et CACHERA (2003) ont montreacute respectivement sur le Doubs et le Fier que les diffeacuterences de tailles entre marqueacutes et non marqueacutes au stade 0+ sestompaient au stade 1+ et chez les adultes

Par ailleurs lrsquoexistence drsquoune plus grande taille au stade 0+ en automne pour les marqueacutes ne leur garantit pas un meilleur taux de seacutedentarisation En effet plusieurs eacutetudes dont celle de JONSSON et JONSSON (1993) indiquent que le taux de deacutevalaison peut ecirctre plus eacuteleveacute pour les individus agrave plus forte croissance au stade 0+ La deacutevalaison peut donc toucher preacutefeacuterentiellement les individus marqueacutes en raison de leur forte croissance

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Foron du Reposoir

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Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Foron du Reposoir

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La Touviegravere Le Reposoir

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Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

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33

222 Taille des nageoires pectorales

La figure ci-dessus montre qursquoil existe une diffeacuterence entre marqueacutes et non marqueacutes du rapport entre la longueur de la nageoire pectorale et la longueur totale du poisson

Il a sembleacute important drsquoanalyser plus en deacutetail ce caractegravere morphologique car il peut preacutesager de lrsquoaptitude des truites agrave se maintenir dans nos riviegraveres de montagne

Relation entre la longueur de la nageoire pectorale et la longueur totale des individus marqueacutes et non marqueacutes

5

7

9

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15

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21

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30 50 70 90 110 130 150 170Longueur totale en mm

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron du Reposoir

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La Touviegravere Le Reposoir

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Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron de Fillinges

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Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron du Reposoir

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La Touviegravere Le Reposoir

F du Reposoir F du Reposoir

Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron de Fillinges

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Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Giffre

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

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Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

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Les Etroits Entremont Beffay St Pierre en F

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Sur les 24 stations ougrave des individus marqueacutes et non marqueacutes coexistent la taille relative des nageoires pectorales est systeacutematiquement plus importante chez les individus naturelsLes truites issues du repeuplement preacutesentent donc des nageoires pectorales de longueur infeacuterieure agrave celle des truites sauvagesCette diffeacuterence morphologique est tregraves importante car le deacuteveloppement des nageoires est un eacuteleacutement deacuteterminant pour la survie du poisson dans son milieu notamment pour la stabiliteacute la reacutesistance au courant et la recherche de nourriture an action de chasse

Il semble donc possible que cette caracteacuteristique anatomique soit le reacutesultat drsquoune adaptation agrave la vie en torrent

BOSAKOWSKI et al (1993) ont eacutegalement observeacutes des reacutesultats comparables chez des truites arc-en-ciel et des truites brunes de plus grande taille entre poissons drsquoeacutelevage et poissons sauvages Dans cette eacutetude les poissons deacutelevage preacutesentaient des nageoires nettement plus courtes (10-50) que les poissons sauvages Selon les auteurs cette diffeacuterence semblait ecirctre causeacutee par les conditions de vie des poissons dans les bassins des piscicultures(agression intraspeacutecifique stress qualiteacute de leau et densiteacutes de poissons) qui provoquaient une eacuterosion des nageoires

Dans le cas preacutesent les poissons de repeuplement ont eacuteteacute introduits agrave des stades preacutecoces dans le milieu et ont eacuteteacute preacuteleveacutes 4 agrave 5 mois apregraves leur introduction En conseacutequence ils ont veacutecu peu de temps en pisciculture et ont par contre passeacute lessentiel de leur vie dans le mecircme milieu naturel que les poissons sauvages Ainsi il semble que ce dimorphisme de la nageoire entre poissons sauvages et introduits soit drsquoorigine geacuteneacutetique Une eacutetude de RIDDELL et al (1981) a montreacute chez le saumon que les diffeacuterences de deacuteveloppement de nageoires eacutetaient une adaptation des poissons agrave leur milieu qui preacutesentait une origine geacuteneacutetiqueIl est donc tout agrave fait probable qursquoun pheacutenomegravene similaire se rencontre chez la truite fario et que les truites sauvages soient mieux adapteacutees sur le plan morphologique (gracircce agrave des diffeacuterences geacuteneacutetiques) aux conditions du milieu que les poissons introduits mecircme agrave des stades preacutecoces

Outre lrsquoaspect purement geacuteneacutetique les facteurs environnants peuvent eacutegalement jouer un rocircle important En effet McLAUGHLIN et al (2002) ont montreacute que cette diffeacuterence au niveau des nageoires peut eacutegalement ecirctre due agrave des caracteacuteristiques du milieu environnant dans les premiegraveres semaines de vie des poissons En effet plusieurs lots drsquoune mecircme souche de saumon de fontaine soumis degraves lrsquoeacuteclosion agrave des conditions de vie diffeacuterentes montrent des diffeacuterences dans le deacuteveloppement des nageoires Ainsi degraves les premiegraveres semaines les poissons exposeacutes agrave un fort courant sont pourvus de nageoires plus longues

Il est donc possible que les alevins produits en pisciculture nrsquoeacutetant pas exposeacutes agrave des courants importants au cours de leurs premiegraveres semaines de vie deacuteveloppent des nageoires pectorales moins longues que les individus sauvages

Il y a probablement pour cette caracteacuteristique morphologique des interactions combinant geacuteneacutetique et conditions environnementales

Cette diffeacuterence morphologique peut eacutegalement avoir une importance dans la compeacutetition entre poissons sauvages et introduits notamment au stade juveacutenile En effet GIBSON (1973) a deacutemontreacute limportance des nageoires dans la compeacutetition interspeacutecifique

36

entre le saumon atlantique (Salmo salar L) et le saumon de fontaine (Salvenius fontinalis) deux poissons consommant la mecircme nourriture Le fait de posseacuteder des nageoires pectorales plus deacutevelopper permet au saumon atlantique de se maintenir dans les courants pour se nourrir tout en deacutepensant moins drsquoeacutenergie

Dans le cas des torrents haut-savoyards une compeacutetition intraspeacutecifique entre truites sauvages et introduites comparable agrave leacutetude de GIBSON peut se deacutevelopper La diffeacuterence morphologique entre les truites sauvages et issues du repeuplement peut donc avoir une influence lors de la compeacutetition entre ces deux types dindividus

37

3 Premiegraveres implications pour la gestion

En fonction des reacutesultats obtenus lors de la campagne de preacutelegravevements 2002 des orientations de gestion sont proposeacutees pour chaque riviegravere eacutetudieacutee Certaines propositions impliquent des changements relativement importants des pratiques actuelles de gestion

Lrsquoeacutetude de lrsquoefficaciteacute des repeuplements srsquoappuient sur une deacutemarche scientifique rigoureuse dans lrsquointeacuterecirct des gestionnaires directs (AAPPMA) puisqursquoelle permet agrave ces derniers de prendre des deacutecisions en srsquoappuyant sur des reacutesultats concrets et indiscutables Elle est conduite dans un souci drsquoeacutevaluer en toute objectiviteacute les pratiques drsquoalevinage dans le seul but drsquoameacuteliorer la gestion actuelle des populations et des milieux Concregravetement elle permet de connaicirctre rapidement les zones ougrave lrsquoalevinage en truite fario est inefficace et donc inutile et les zones ougrave celui-ci est efficace et donc neacutecessaire

En plus des reacutesultats obtenus gracircce aux marquages des juveacuteniles les propositions prennent en compte les premiers reacutesultats issus des pecircches de sondage drsquoadultes reacutealiseacutees pour le programme INTERREG (reacutedaction en cours) Lrsquointeacutegration des diffeacuterentes donneacutees (marquage juveacutenile + adultes) permet de faire des propositions coheacuterentes selon un diagnostic le plus complet possible de la population de truite preacutesente

31 Bassin du Borne

Sur les riviegraveres du bassin du Borne les orientations de gestion proposeacutees ci-apregraves restent conformes agrave celles deacutejagrave eacutevoqueacutes par CAUDRON et CHAMPIGNEULLE (2002)

Arrecirct du repeuplement selon les pratiques actuelles sur lrsquoensemble du cours principal Cette proposition est motiveacutee par deux principales raisons

- Lrsquoalevinage est inefficace agrave lrsquoamont du seuil drsquoEntremont car apregraves plus de 15 ans il nrsquoa pas permis drsquoinstaller une population en place eacutequilibreacutee

- Il semble impeacuteratif de preacuteserver lrsquoimportante population de truite sauvage preacutesente agrave lrsquoaval du seuil drsquoEntremont Les reacutesultats geacuteneacutetiques indiquent que la population preacutesente est une population sauvage qui nrsquoa pas eacuteteacuteimplanteacutee suite agrave lrsquoalevinage Elle preacutesente un degreacute de pureteacute geacuteneacutetique important Cette population repreacutesente un patrimoine unique dans le Faucigny Le but drsquoarrecircter les alevinages sur ce secteur est drsquoeacuteviter les hybridations qui peuvent entraicircner une perte de plasticiteacute geacuteneacutetique et une deacutegeacuteneacuterescence de la souche sauvage actuelle

Arrecirct du repeuplement sur lrsquoaval de lrsquoOveacuteran Ce secteur est utiliseacute comme zone de reproduction par les geacuteniteurs du Borne et la reproduction naturelle y est abondante Lrsquoalevinage nrsquoest donc pas neacutecessaire et risque comme sur le Borne de provoquer une hybridation de la population naturelle

Essayer drsquoinstaller une population naturelle agrave lrsquoamont du seuil drsquoEntremont par transferts de geacuteniteurs

Sur les autres affluents deux sceacutenarii de gestion peuvent ecirctre envisageacutes selon la volonteacute politique des gestionnaires directs

Sceacutenario ndeg1 vision patrimoniale

38

- Arrecirct du repeuplement en truite drsquoorigine Atlantique pendant 3 anneacutees conseacutecutives pour diminuer leur preacutesence sur le bassin

- Puis reprise de lrsquoalevinage pendant uniquement 3 anneacutees agrave partir de poissons sauvages issus du Borne pour essayer drsquoinstaller une population naturelle

Sceacutenario ndeg2 vision halieutique- Maintien des pratiques drsquoalevinage en atlantique pour soutenir

artificiellement le stock de poissons dans un inteacuterecirct uniquement halieutique Attention cette pratique risque de provoquer par deacutevalaison des individus introduits une hybridation des poissons sauvages preacutesents dans le Borne

Eventuellement repeuplement en truites Arc en Ciel surdensitaires sur des secteurs preacutecis du Borne pendant la peacuteriode estivale afin de contenter une certaine cateacutegorie de pecirccheurs Les repeuplements en Arc en Ciel ne risquent pas de provoquer drsquohybridation de la souche fario locale Attention prendre des preacutecautions aupregraves des fournisseurs concernant la qualiteacute sanitaire des poissons

32 Bassin du Giffre

Les propositions sur le bassin du Giffre prennent en compte les reacutesultats du marquage mais eacutegalement la situation actuelle de la riviegravere suite agrave lrsquoeacuteboulement de Sixt Fer agrave Cheval

Ne pas aleviner le cours principal du Giffre en alevins de fario pendant 5 anneacutees conseacutecutives Cette proposition est motiveacutee par les raisons suivantes

- Il est impossible de savoir comment va eacutevoluer dans les prochains mois et les prochaines anneacutees le glissement agrave lrsquoamont de Sixt Il semble donc risqueacute drsquoentreprendre un alevinage pour installer une nouvelle population

- Les reacutesultats des marquages sur le Giffre sont tregraves contrasteacutes Sauf au niveau de Sixt ils montrent qursquoil existait avant le glissement une reproduction naturelle importante et capable de soutenir une population

- Les reacutesultats geacuteneacutetiques reacutecents indiquent que les populations en place sont en majoriteacute drsquoorigine atlantique mais qursquoil existe encore des individus meacutediterraneacuteens non hybrideacutes jusque dans les zones amont Ces reacutesultats prouvent qursquohistoriquement la souche meacutediterraneacuteenne eacutetait bien preacutesente sur lrsquoensemble du Giffre

- Il est envisageable que cette souche sauvage eacutegalement preacutesente sur les parties basses des affluents recolonise naturellement le Giffre

- Lrsquoexemple du Borne montre qursquoapregraves une catastrophe la riviegravere a eacuteteacute recoloniseacutee par une souche sauvage malgreacute des alevinages massifs Les reacutesultats obtenus sur cette riviegravere doivent servir de base de reacuteflexions pour la nouvelle gestion agrave entreprendre sur le Giffre

- Entre le Risse et Marignier la population de truites avant le glissement eacutetait deacutejagrave totalement deacuteseacutequilibreacutee et en quasi disparition (peu de juveacuteniles quasi absence de geacuteniteurs et absence de classes drsquoacircges intermeacutediaires) malgreacute les alevinages massifs sur ce secteur

39

Reacutealiser un bilan de lrsquoimpact du glissement de terrain sur le peuplement piscicole

- Une eacutetude piscicole sera reacutealiseacutee tregraves prochainement (2004 ou 2005) sur le Giffre dans le cadre du contrat de riviegravere Cette eacutetude permettra de faire un premiereacutetat des lieux complet du peuplement piscicole suite au glissement

Accomplir un diagnostic de lrsquoeacutetat de recolonisation du Giffre par les populations naturelles

- En lrsquoabsence drsquoalevinage il sera possible de reacutealiser en 2008 un bilan des populations de truites installeacutees sur le Giffre

- A partir de lrsquoeacutetat de la population agrave cette eacutepoque un plan drsquoalevinage coheacuterent en truite fario pourra ecirctre eacutetabli pour permettre drsquoinstaller de nouvelles populations ou de soutenir des populations preacutesentes

Mettre en place des deacuteversements de truites Arc en Ciel pendant toute la peacuteriode drsquoarrecirct de lrsquoalevinage en fario Attention prendre des preacutecautions aupregraves des fournisseurs concernant la qualiteacute sanitaire des poissons

Reacuteintroduire lrsquoOmbre commun sur la plaine de Samoeumlns et agrave lrsquoaval de la confluence avec le Risse

Arrecirct de lrsquoalevinage sur lrsquoensemble du Risse sur lrsquoaval du Foron de Mieussy et sur lrsquoEtroit Denteacutee

- Sur ces riviegraveres le suivi du marquage a montreacute que lrsquoalevinage nrsquoeacutetait pas neacutecessaire pour soutenir les populations de truites preacutesentes

Maintenir lrsquoalevinage sur lrsquoamont du Foron de Mieussy (vers Sommand) et lrsquoamont du Foron de Taninges (Bonnavaz)

- Sur ces secteurs le suivi du marquage a montreacute que les juveacuteniles preacutesents dans le milieu naturel eacutetaient en majoriteacute des individus introduits

33 Le Foron du Reposoir

Les propositions de gestion sur le Foron du Reposoir sont

Maintenir les alevinages actuels avec la souche Chazey Bons Rhodanienne

Suivre lrsquoeacutevolution de la population pour savoir si cet alevinage permet drsquoinstaller une population fonctionnelle

- Ce suivi peut comprendre des pecircches de sondages en deacutebut de peacuteriode de reproduction pour voir si les poissons adultes deviennent matures des releveacutes de frayegraveres sur la riviegravere pour savoir si les poissons se reproduisent et de nouveaux preacutelegravevements de poissons pour suivre lrsquoeacutevolution du taux de marqueacutes dans la population

34 Bassin de la Filliegravere

Les orientations pour une gestion coheacuterente des populations de la Filliegravere sont les suivantes

40

Arrecirct de lrsquoalevinage sur le cours principal de la Filliegravere sur le Crenant et sur lrsquoaval du Flan

- Sur ces 3 riviegraveres lrsquoalevinage nrsquoest pas neacutecessaire car il ne permet pas de soutenir les populations preacutesentes et de plus la reproduction naturelle est tregraves importante

- Sur la Filliegravere les pecircches drsquoadultes dans le cadre du programme INTERREG ont mis en eacutevidence la preacutesence drsquoune population sauvage drsquoorigine meacutediterraneacuteenne Il semble important drsquoentreprendre une mesure de conservation de cette souche en arrecirctant lrsquoalevinage pour eacuteviter lrsquohybridation

- Sur lrsquoamont du Flan il est neacutecessaire de continuer le suivi des poissons marqueacutes pour savoir si lrsquoalevinage doit ecirctre maintenu

Sur le Daudens deux sceacutenarii de gestion peuvent ecirctre envisageacutes selon la volonteacute politique des gestionnaires directs

Sceacutenario ndeg1 vision patrimoniale- Arrecirct du repeuplement en truite drsquoorigine Atlantique pendant 3 anneacutees

conseacutecutives pour diminuer leur preacutesence sur le bassin- Commencer les proceacutedures afin de rendre le seuil du Plot

franchissable pour les geacuteniteurs de la Filliegravere- Reacutealiser un bilan notamment deacutemographique de la population en place

apregraves lrsquoarrecirct de lrsquoalevinage- Puis reprise de lrsquoalevinage pendant uniquement 3 anneacutees agrave partir de

poissons sauvages issus de la Filliegravere pour essayer drsquoinstaller une population naturelle

Sceacutenario ndeg2 vision halieutique- Maintien des pratiques drsquoalevinage en atlantique pour soutenir

artificiellement le stock de poissons dans un inteacuterecirct uniquement halieutique Attention cette pratique risque de provoquer par deacutevalaison des individus introduits une hybridation des poissons sauvages preacutesents dans la Filliegravere

35 Le Foron de Fillinges

Les reacutesultats obtenus sur le Foron de Fillinges ont conduit agrave formuler les propositions de gestion suivantes

Arrecirct de lrsquoalevinage sur lrsquoensemble du Foron de Fillinges- Quelque soit la souche utiliseacutee et les quantiteacutes introduites les poissons

alevineacutes ne repreacutesentent qursquoune tregraves faible minoriteacute des poissons preacutesents dans le milieu Le Foron abrite une population naturelle fonctionnelle et eacutequilibreacutee

Suivi de la population suite agrave lrsquoarrecirct du repeuplement- Reacutealisation de 5 stations de pecircches eacutelectriques la derniegravere anneacutee de

lrsquoalevinage afin de reacutealiser un eacutetat des lieux preacutecis de la population de truites et du peuplement piscicole

- Reacutealisation drsquoun nouveau bilan de la population du Foron respectivement 3 ans puis 6 ans apregraves lrsquoarrecirct de lrsquoalevinage

41

4 Investigations suppleacutementaires

Suite aux premiers reacutesultats obtenus lors de la campagne 2002 des investigations suppleacutementaires permettant de preacuteciser certains points seront reacutealiseacutees

Reacutealiser une analyse bacteacuteriologique des diffeacuterents lots de poissons alevineacutes qui ont transiteacutes dans les piscicultures associatives Cette recherche de pathologie permettra de savoir si les poissons issus de pisciculture sont porteurs drsquoune maladie bacteacuterienne avant drsquoecirctre introduits dans le milieu ou si ils contractent la maladie dans le milieu naturel

Rechercher les raisons pour lesquelles on nrsquoobserve pas drsquoalevins naturels sur certains secteurs Les causes drsquoune telle situation peuvent ecirctre

- Lrsquoabsence totale de geacuteniteurs dans la population Les poissons nrsquoont pas le temps de devenir adulte (3+) et sont captureacutes avant par les pecirccheurs

- La preacutesence drsquoadultes non matures Les poissons deviennent adultes mais sont immatures (eacutetat sanitaire des poissons souche geacuteneacutetiquement deacutegeacuteneacutereacutee)

- Survie nulle durant la phase de vie sous graviers Les poissons pondent mais les œufs nrsquoarrivent pas agrave se deacutevelopper et la mortaliteacute est totale

Sur les secteurs du Chinaillon de la Duche de lrsquoOveacuteran amont et du Foron de Mieussy amont (Sommand) les actions suivantes peuvent ecirctre entreprises

- Pecircches eacutelectriques de sondage en deacutebut de la peacuteriode de reproduction pour savoir si les poissons deviennent matures

- Releveacutes de frayegraveres permettant drsquoobserver ou non une activiteacute de reproduction- Mise en place drsquoincubateurs-tests contenant des œufs de truites pour connaicirctre le taux

de survie des œufs dans les frayegraveres

Reacutealiser des preacutelegravevements suppleacutementaires aux classes drsquoacircge supeacuterieures (1+ et 2+) sur certaines stations pour voir lrsquoeacutevolution du taux de marqueacutes au cours des anneacutees Ces recherches suppleacutementaires peuvent ecirctre effectueacutees sur 8 cours drsquoeau ougrave le taux de marqueacutes deacutepasse 60 au stade 0+

Le ruisseau de la Duche amontLe ruisseau du Chinaillon amontLe Foron du ReposoirLe Risse avalLe Foron de Taninges amont (Bonnavaz)Le Foron de Mieussy amont (Sommand)Le Daudens amont et avalLe Flan amont

Dans les eacutetudes preacuteceacutedentes reacutealiseacutees sur le Fier (CAUDRON et CHAMPIGNEULLE 2002) et sur le Doubs (CHAMPIGNEULLE et al 2002) les taux de marqueacutes aux stades 1+ et 2+ dans la population en place srsquoeffondraient et devenaient tregraves faibles ou nuls

Pour informations le graphique suivant montre lrsquoeacutevolution du taux de marqueacutes agrave diffeacuterents stades sur les stations ougrave le taux de 0+ marqueacutes eacutetait eacuteleveacute

42

Les reacutesultats montrent agrave part pour une station une chute importante des taux de marqueacutes entre les stades 0+ et 1+ Cette chute se poursuit eacutegalement au stade 2+Ces reacutesultats obtenus sur le Fier et le Doubs semblent laisser peu drsquoespoirs sur le devenir des poissons marqueacutes sur les bassins eacutetudieacutes en 2002

Reacutesultats sur leacutevolution du taux de m arqueacutes aux diffeacuterents stades obtenus lors des eacutetudes preacuteceacutedentes sur le Fier et le Doubs

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Le Fier Le Doubs

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12

2 Reacutesultats et discussions

Ce chapitre preacutesente les reacutesultats obtenus sur les bassins eacutetudieacutes lors de la campagne de preacutelegravevements 2002 agrave savoir

Le GiffreLe BorneLa FilliegravereLe Foron de ScionsiezLe Foron de Fillinges

Lors de la campagne 2002 1703 poissons au stade 0+ ont eacuteteacute eacutechantillonneacutes en milieu naturel et eacutetudieacutes en laboratoire

21Taux de marquage sexe ratio et pathologie

211 Le Borne

Sur le bassin du Borne 5 stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal et 3 sur des affluents Au total ce sont 392 poissons 0+ qui ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

Sur le cours principal

Les taux de marqueacutes varient fortement sur le cours principal du Borne (18 agrave 100) On observe un gradient amont-aval du taux de marqueacutes qui peut ecirctre mis en relation avec la preacutesence drsquoun obstacle partiellement infranchissable pour les geacuteniteurs au niveau drsquoEntremont

Ainsi deux grandes zones peuvent ecirctre distingueacutees sur le Borne

La zone amont du seuil drsquoEntremont ougrave la majoriteacute des juveacuteniles sont issus du repeuplement (90 agrave 100)

On observe sur ce secteur une tregraves faible reproduction naturelle en raison drsquoune quasi-absence de poissons adultes La situation de la population de truites est donc tregraves critique Si le repeuplement permet de drsquoobserver des 0+ il nrsquoa pas permis drsquoinstaller une population fonctionnelle

La zone aval du seuil drsquoEntremont ougrave la majoriteacute des individus preacutesents au stade 0+ sont des poissons naturels

En effet le taux de marqueacutes varie de 18 agrave 49 Les pecircches de sondage Interreg ont montreacute la preacutesence drsquoune importante population de truites sauvages drsquoorigine meacutediterraneacuteenne La population est eacutequilibreacutee et naturellement fonctionnelle puisqursquoon observe une forte reproduction naturelle et de nombreux geacuteniteurs

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Sur les Affluents

Sur les 3 affluents eacutetudieacutes la situation est tregraves simple En effet soit on observe 0 de marqueacutes soit 100

- Sur lrsquoOveacuteran aval aucun poisson marqueacute nrsquoa eacuteteacute trouveacute puisqursquoil nrsquoy a pas eu de repeuplement sur ce secteur en 2002 Le reacutesultat obtenu montre une importante reproduction naturelle des geacuteniteurs du Borne qui remontent sur lrsquoaval de ce cours drsquoeau

- Sur la Duche et le Chinaillon il y a absence totale de reproduction naturelle puisque 100 des 0+ eacutechantillonneacutes sont marqueacutes Pourtant on observe de nombreux poissons adultes sur ces secteurs susceptibles drsquoecirctre des geacuteniteurs ainsi que diffeacuterentes classes drsquoacircge Lrsquoeacutequilibre de ces populations est artificiellement maintenu par les alevinages

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

- Toutes les stations eacutetudieacutees ne sont pas concerneacutees par ces symptocircmes de maladies- Les maladies bacteacuteriennes semblent toucher majoritairement les poissons introduits- Cependant les 0+ de lrsquoOveacuteran aval tous naturels sont infecteacutes agrave 15 Ce reacutesultat

peut refleacuteter une contamination par deacutevalaison provenant drsquoindividus atteints situeacutes plus en amont de lrsquoOveacuteran ou une contamination naturelle par des agents pathogegravenes preacutesents dans le milieu

- Les poissons marqueacutes peuvent ecirctre contamineacutes agrave un taux non neacutegligeable pouvant atteindre plus de 30

Pourcentage dindividus preacutesentant des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

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Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Le sexe ratio est relativement eacutequilibreacute pour les marqueacutes comme pour les non marqueacutes Seule une station sur le Borne (Beffay) montre 85 de macircle dans la population de 0+

- Seules 2 stations montrent des macircles matures au stade 0+- Le pourcentage de macircles matures au stade 0+ est plus important chez les non

marqueacutes que chez les marqueacutes

Pourcentage de macircles au stade 0+

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Pourcentage de macircles au stade 0+

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

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212 Le Giffre

Sur le bassin du Giffre 6 stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal et 7 sur des affluents Au total ce sont 536 poissons 0+ qui ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

Sur le cours principal

La carte de synthegravese des reacutesultats met en eacutevidence des taux de marqueacutes tregraves contrasteacutes variant entre 0 et 100 Sauf deux cas particuliers la campagne de preacutelegravevements a permis de montrer qursquoune reproduction naturelle existait sur lrsquoensemble du Giffre

Il est possible de distinguer trois zones successives sur ce cours deau

La zone aval est composeacutee de la station Pont du Giffre ougrave le taux de marqueacutes est de 74 Cette station sur le Giffre doit ecirctre rapprocheacutee des stations eacutetudieacutees sur le Risse (station laquo Risse aval St Jeoire raquo) et le Hisson(laquo station La Pallud raquo) pour mieux comprendre le fonctionnement de la population

- Sur le Giffre aval la situation semble tregraves critique La station dite laquo Pont du Giffre raquosrsquoeacutetend de lrsquoamont de Marignier agrave lrsquousine du Pont du Giffre soit sur environ 25 km Sur cette distance seulement 31 0+ ont pu ecirctre captureacutes De plus les pecircches drsquoadultes dans le cadre drsquoInterreg montrent un deacuteficit inquieacutetant de geacuteniteurs sur ce secteur ainsi qursquoune surabondance de Chabot La situation du bas Giffre montre une population de truitetotalement deacuteseacutequilibreacutee loin du potentiel de la riviegravere et qui ne peut pas ecirctre reacutehabiliteacutee par le seul fait de lrsquoalevinage Cette situation peut ecirctre le reacutesultat du faible deacutebit reacuteserveacute qui appauvrit lrsquohabitat aquatique et provoque des eacuteleacutevations de tempeacuterature inquieacutetantes Les reacutesultats de pecircche drsquoinventaire dans la reacuteserve de Marignier montrent que les poissons sont concentreacutes agrave lrsquoaval immeacutediat des seuils ougrave lrsquoon note la preacutesence de fosses de tempeacuteratures plus faibles et drsquoune meilleure oxygeacutenation

La zone moyenne situeacutee entre le barrage de Mieussy et Samoeumlns qui est composeacutee des stations laquo aval barrage Taninges raquo laquo Theacuteziegraveres raquo et laquo Montessuit raquo Sur ce secteur les 0+ marqueacutes sont en minoriteacutes puisqursquoils repreacutesentent 11 agrave 38 du peuplement

- Sur le Giffre aval barrage de Taninges le secteur nrsquoest pas alevineacute il est donc normal que pregraves de 90 des poissons ne soient pas marqueacutes Les 0+ marqueacutes proviennent certainement du ruisseau de lrsquoEtroit Denteacute qui est fortement alevineacute et agrave partir duquel une deacutevalaison doit avoir lieu- Le secteur des laquo Theacuteziegraveres raquo et de laquo Montessuit raquo bien que reacuteguliegraverement alevineacute montre un taux important drsquoalevins naturels (62 agrave 77) Ce reacutesultat est tout agrave fait en accord avec le suivi de la reproduction naturelle et le recensement de frayegraveres reacutealiseacute par lrsquoAAPPMA du Faucigny et le CSP en 1999 En effet de nombreuses frayegraveres naturelles avaient eacuteteacute observeacutees sur ce site Le peuplement drsquoadultes nrsquoest pas tregraves important mais est en rapport avec les potentialiteacutes du milieu

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La zone amont caracteacuteriseacutee par les stations laquo Reveacute-Peacuteret raquo et laquo amont Tines raquo ougrave le taux de marqueacutes varie de 70 agrave 79

- Pour ces deux stations la population de juveacuteniles est faible et ils sont majoritairement marqueacutes Cependant au stade adulte les pecircches Interreg montrent une majoriteacute de poissons drsquoorigine meacutediterraneacuteenne La forte contribution de poissons introduits au stade 0+ ne semble pas se retrouver au stade adulte Les conditions de vie dans ce milieu sont tregraves difficiles et ne permettent pas drsquoatteindre des densiteacutes de poissons importantes

Sur les Affluents

Le Risse - Le Hisson montre une majoriteacute drsquoalevins naturels alors que les preacutelegravevements ont eacuteteacute reacutealiseacutes seulement deux mois apregraves le repeuplement Ce cours drsquoeau possegravede un fort potentiel de frai qui est utiliseacute notamment par les geacuteniteurs du Risse- Sur lrsquoaval du Risse le taux de marqueacutes est de 68 Il est le reflet drsquoun alevinage en quantiteacute importante sur le secteur (10 000 alevins) Les alevins naturels repreacutesentent tout de mecircme plus de 30 trois mois apregraves le repeuplement De plus les eacutechantillonnages drsquoadultes reacutealiseacutes sur ce secteur dans le cadre drsquoInterreg ont mis en eacutevidence une quantiteacute importante de geacuteniteurs sauvages La population sur ce secteur est agrave mettre en eacutevidence avec celle du Hisson puisque certains geacuteniteurs du Risse y migrent pour se reproduireLa population sur ce secteur est naturellement fonctionnelle

Le Foron de Mieussy - La station laquo Andelier raquo situeacutee en amont du Foron preacutesente 100 de marqueacutes Cette situation montre une absence totale de reproduction naturelle Le milieu est extrecircmement deacutefavorable agrave lrsquoinstallation drsquoune population fonctionnelle en raison du faible deacutebit de la riviegravere (assegravechement reacutegulier) Aucune classe drsquoacircge intermeacutediaire et aucun adulte nrsquoa eacuteteacute observeacute sur ce secteur Les poissons alevineacutes sont certainement victimes des assegravechements- La station laquo Trebiet raquo situeacutee plus en aval preacutesente au contraire 0 de marqueacutes alors que cette zone a eacuteteacute alevineacutee Ce reacutesultat montre la capaciteacute du Foron sur ce secteur a accueillir une population fonctionnelle Il existe une reproduction naturelle importante sur cette zone avec eacutegalement beaucoup de geacuteniteurs- Vers Sommand une pecircche de sondage a eacuteteacute reacutealiseacutee mais aucun alevin nrsquoa eacuteteacute preacuteleveacute puisque cette zone nrsquoa pas eacuteteacute alevineacutee en 2002 Cependant les reacutesultats de ce sondage mettent en eacutevidence une absence totale de reproduction naturelle (aucun alevin naturel nrsquoa eacuteteacute trouveacute) alors que la population semble eacutequilibreacutee (preacutesence drsquoadultes et de truitelles drsquoacircge intermeacutediaire)

LrsquoEtroit Denteacute Globalement le taux de marqueacutes sur les deux stations eacutetudieacutees est faible (11 agrave 33)- Sur la station laquo aval route raquo la majoriteacute des alevins est naturelle Cette zone montre un habitat tregraves favorable pour la reproduction des geacuteniteurs qui remontent du Giffre- Sur la station laquo amont route raquo une population fonctionnelle de pheacutenotype meacutediterraneacuteen est installeacutee De nombreux geacuteniteurs sont preacutesents et le recrutement naturel est important

19

Le Foron de Taninges - En amont (station Bonnavaz) le taux de marqueacutes est tregraves important (95) Il existe donc une reproduction naturelle mais insuffisante pour permettre lrsquoinstallation drsquoune population et maintenir une activiteacute halieutique Les alevinages passeacutes nrsquoont pas permis drsquoinstaller une population fonctionnelle dans cette zone apicale- Plus en aval sur les zones non alevineacutees les pecircches eacutelectriques drsquoinventaire et de sondage reacutealiseacutees ont montreacute la preacutesence drsquoune population eacutequilibreacutee de pheacutenotype meacutediterraneacuteen avec une importante reproduction naturelle

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

Les principales remarques concernant les pathologies observeacutees sur le bassin du Giffre sont

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

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Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Giffre

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

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Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

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Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Giffre

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

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20

- La PKD est preacutesente sur le cours du Giffre mais uniquement agrave lrsquoaval du barrage de Taninges Cette situation est agrave mettre en relation avec le deacutebit reacuteserveacute insuffisant qui entraicircne une augmentation de tempeacuterature pendant la peacuteriode estivale

- Sur les affluents la PKD a eacuteteacute observeacutee sur les secteurs preacutesentant des faibles deacutebits estivaux (aval du Risse et Foron de Mieussy Andelier) qui sont certainement responsables drsquoune augmentation de tempeacuterature

- La PKD atteint agrave la fois les poissons introduits que les poissons naturels- Le pourcentage drsquoindividus toucheacutes par la PKD varie drsquoun site agrave lrsquoautre mais peut

atteindre une valeur importante avec 50 sur certain secteur- Les maladies bacteacuteriennes sont plus freacutequentes chez les individus marqueacutes Soit ces

poissons sont plus fragiles que les poissons naturels et contractent les maladies plus facilement soit les maladies sont contracteacutees en pisciculture pendant lrsquoeacutelevage

- Le pourcentage drsquoindividus toucheacutes par des symptocircmes bacteacuteriens nrsquoest pas neacutegligeable puisqursquoil peut atteindre 20

- Lrsquoensemble des stations eacutetudieacutees est toucheacute par des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes ce qui laisse penser que lrsquoensemble du bassin peut ecirctre atteint

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

Pourcentage de macircles au stade 0+

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Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Giffre

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

21

- Le sexe ratio apparaicirct globalement eacutequilibreacute sur lrsquoensemble des stations du Giffre- On observe des diffeacuterences entre les poissons introduits et les poissons naturels sur

seulement 3 stations Ces diffeacuterences sont en faveur des poissons marqueacutes qui montrent un pourcentage de macircles plus important

- Une maturiteacute sexuelle preacutecoce des macircles existe sur certaines stations quelle que soit lrsquoorigine des poissons

- Cette maturiteacute peut ecirctre importante et concerner jusqursquoagrave 20 des 0+

22

213 Le Foron du Reposoir

Deux stations (La Touviegravere et Le Reposoir) ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le Foron du Reposoir Seulement 15 0+ ont eacuteteacute eacutetudieacutes en raison principalement de la difficulteacute drsquoeacutechantillonner des poissons de petite taille (6-7 cm) sur ces milieux torrentiels

Le taux de marqueacutes

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23

- Sur les deux stations eacutetudieacutees le taux de marqueacutes est de 100 Lrsquoensemble des 0+ mecircme si le nombre est faible est donc issu de lrsquoalevinage Ce cours drsquoeau fait lrsquoobjet actuellement drsquoun essai drsquoimplantation drsquoune population agrave partir de la souche Chazey-Bons Rhodanienne Cette souche provient de geacuteniteurs de la riviegravere Furan (Ain) Des analyses geacuteneacutetiques reacutecentes reacutealiseacutees par analyse de microsatellites diagnostic de lrsquoADN ont montreacute que ces poissons ont un pourcentage dallegraveles meacutediterraneacuteens voisin de 65

Ce reacutesultat montre que le cours deau avait un niveau de population tregraves faible avant le repeuplement par la souche Chazey-Bons sauvagesDe plus les pecircches drsquoinventaires du CSP et les pecircches de sondage Interreg montrent qursquoune population de truites se met progressivement en place En effet on observe chaque anneacutee despoissons agrave des stades de plus avanceacutes et les captures par pecircche agrave la ligne commencent agrave ecirctre effectivesLes pecircches eacutelectriques reacutealiseacutees agrave lrsquoautomne 2002 indique que le stock de geacuteniteurs est en cours de reconstitution mais que les truites femelles nrsquoont pas encore atteint le stade geacuteniteurIl nrsquoest donc pas encore possible de dire si lrsquohabitat et la population du Foron du Reposoir sont propices agrave lrsquoinstallation drsquoune population naturellement fonctionnelle

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

Aucun symptocircme reacutenal et heacutemorragique nrsquoapparaicirct sur les 0+ eacutechantillonneacutes sur ce cours deau

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Le sexe ratio est eacutequilibreacute puisqursquoil varie de 50 agrave 60- Il nrsquoy a aucun macircle mature au stade 0+ dans les eacutechantillons preacuteleveacutes sur ce cours

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La Touviegravere Le Reposoir

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

24

214 La Filliegravere

Cinq stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal de la Filliegravere ainsi que sept stations sur les trois affluents principaux (Flan Creacutenant et Daudens) Au total 582 poissons 0+ ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

Sur le cours principal

Pour les 5 stations eacutetudieacutees sur le cours principal le taux de 0+ marqueacutes varie de 4 agrave 56 il est donc de tregraves faible agrave moyen et montre une forte reproduction naturelle sur toute la riviegravere Il y a un gradient amont-aval du taux de marqueacutes avec un pourcentage de poissons marqueacutes plus important en amont Cependant sur lrsquoensemble de la Filliegravere le recrutement naturel est dominant et constitue lrsquoessentiel de la population de truite

De plus les pecircches de sondages pour Interreg ont montreacute la preacutesence de nombreux drsquoadultes drsquoorigine naturelle meacutediterraneacuteenne Ceci confirme que la population de truite de la riviegravere principale est naturellement fonctionnelle

Sur les affluents

Les reacutesultats sont diffeacuterents selon que lrsquoaffluent est en connexion ou non avec la riviegravere principale

- Sur le Flan on observe en zone aval et meacutediane (stations laquo D 55 raquo et laquo Bruchon raquo) des taux de marqueacutes faibles (38 et 27) qui mettent en eacutevidence la preacutesence drsquoune forte reproduction naturelle notamment de poissons migrants de la Filliegravere Les releveacutes de frayegraveres reacutealiseacutes par lrsquoAAPPMA avaient deacutejagrave permis drsquoobserver de nombreuses frayegraveres naturelles sur ce secteurEn zone plus amont station laquo Molliet raquo le taux de marqueacutes est plus important (73) il met en eacutevidence la preacutesence drsquoun recrutement naturel mais qui reste au stade 0+ minoritaire par rapport aux individus introduits

- Sur le Daudens les deux stations (laquo Le Plot raquo et Daudens raquo) montrent des taux de marqueacutes importants (86 et 92) La reproduction naturelle est donc tregraves faible et la population de truite ne semble pas fonctionnelle Lrsquoobstacle agrave lrsquoaval de la route deacutepartementale semble preacutejudiciable car il ne permet pas aux geacuteniteurs de la Filliegravere de remonter sur le Daudens et drsquoinstaller une population fiable

- Sur le Crenant Les deux stations eacutechantillonneacutees (laquo aval raquo et Disonche raquo) ne sont pas situeacutees sur des zones alevineacutees en 2002 et il est normal de trouver 0 de marqueacutes Cependant ces reacutesultats montrent qursquoil y a une forte reproduction naturelle sur ce cours drsquoeau mecircme en zone amont et que la population semble naturellement fonctionnelle Les alevins introduits sur le Crenant ne semblent pas avoir deacutevaleacutes sur pour coloniser lrsquoaval du Crenant

25

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Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

- La PKD semble quasiment absente du bassin de la Filliegravere sauf preacutesence anecdotique uniquement chez les non marqueacutes sur une station (laquo Millard raquo)

- Les individus marqueacutes ne sont pas toucheacutes par la PKD- Les maladies bacteacuteriennes sont preacutesentes sur lrsquoensemble du bassin mais touchent en

prioriteacute et majoritairement les individus marqueacutes

Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

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La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere Le Flan Le Flan Le Flan LeDaudens

LeDaudens

LeCrenant

LeCrenant

Pourcentage dindividus preacutesentant des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

0102030405060

Le J

ourd

il

Pisc

icul

ture

Milla

rd

Long

cham

ps

D55

Bru

chon

Mol

liet

Le

Plo

t

Dau

dens

Ava

l

Dis

onch

e

La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere Le Flan Le Flan Le Flan LeDaudens

LeDaudens

LeCrenant

LeCrenant

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

27

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Sur lrsquoensemble des stations le sexe ratio est eacutequilibreacute il montre une plus grande variation chez les individus marqueacutes

- Des macircles matures au stade 0+ ont eacuteteacute observeacutes sur trois stations uniquement chez les individus naturels

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

Pourcentage de macircles au stade 0+

0102030405060708090

Le J

ourd

il

Pis

cicu

lture

Milla

rd

Long

cham

ps

D55

Bruc

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Mol

liet

Le

Plo

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dens

Ava

l

Dis

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e

LaFilliegravere

LaFilliegravere

LaFilliegravere

LaFilliegravere

Le Flan Le Flan Le Flan LeDaudens

LeDaudens

LeCrenant

LeCrenant

Pourcentage de macircles matures au stade 0+

01020304050

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FilliegravereLa

FilliegravereLa

FilliegravereLe Flan Le Flan Le Flan Le

DaudensLe

DaudensLe

CrenantLe

Crenant

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

Pourcentage de macircles au stade 0+

0102030405060708090

Le J

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LaFilliegravere

LaFilliegravere

LaFilliegravere

LaFilliegravere

Le Flan Le Flan Le Flan LeDaudens

LeDaudens

LeCrenant

LeCrenant

Pourcentage de macircles matures au stade 0+

01020304050

Le J

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Pis

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D55

Bruc

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Mol

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FilliegravereLa

FilliegravereLa

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DaudensLe

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Crenant

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

28

215 Le Foron de Fillinges

Trois stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal du Foron de Fillinges agrave savoir de lrsquoamont vers lrsquoaval laquo Bovet ndash Boex raquo laquo Pont de Fillinges raquo et laquo Couvette raquo Au total 178 poissons 0+ ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

Leacutege

nde

Mar

queacutes

Non

mar

queacutes

X

d

rsquoindi

vidu

s m

arqu

eacutes

Sec

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vineacute

en

2002

Loca

lisat

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des

stat

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2

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Boex

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31

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Boex

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31

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Boex

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31

29

Sur les 3 stations eacutetudieacutees les taux de marqueacutes sont faibles agrave tregraves faibles- Sur la station laquo Bovet ndash Boex raquo le taux de marqueacutes est de seulement 31- A lrsquoaval sur les stations laquo Pont de Fillinges raquo et laquo Couvette raquo les taux de marqueacutes

sont respectivement de 0 et 2

Les reacutesultats indiquent la preacutesence drsquoune importante reproduction naturelle sur lrsquoensemble du Foron de Fillinges Quelque soit la souche utiliseacutee pour lrsquoalevinage atlantique dans le secteur Faucigny ou Meacutediterraneacuteenne Pont de Gys dans le secteur Chablais les poissons introduits restent minoritaires

Cette situation traduit la preacutesence drsquoune population bien installeacutee et fonctionnelle sur cette riviegravere

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

0102030405060708090

100

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Pourcentage dindividus preacutesentant des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

05

101520253035404550

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

0102030405060708090

100

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Pourcentage dindividus preacutesentant des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

05

101520253035404550

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

30

- Sur lrsquoensemble des stations des individus 0+ sont atteints par la PKD le pourcentage drsquoindividus malades peut atteindre 35

- Seuls les individus sauvages semblent toucheacutes par la PKD cependant le nombre drsquoindividus introduits est trop faible pour permettre une comparaison

- Toutes les stations sont eacutegalement toucheacutees par les maladies bacteacuteriennes avec des taux de contamination variant de 15 agrave 30

- Les maladies bacteacuteriennes touchent agrave la fois les individus introduits et les individus naturels

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Le sexe ratio apparaicirct eacutequilibreacute sur lrsquoensemble des stations- On observe des macircles matures degraves le stade 0+ sur lrsquoensemble des stations- Le taux de macircles matures au stade 0+ peut atteindre 15

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

Pourcentage de macircles au stade 0+

0

102030405060

708090

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Pourcentage de macircles matures au stade 0+

05

101520253035404550

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

Pourcentage de macircles au stade 0+

0

102030405060

708090

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Pourcentage de macircles matures au stade 0+

05

101520253035404550

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

31

22Caracteacuteristiques morphologiques

221 Longueur totale des individus

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Giffre

0

20

40

60

80

100

120

140Am

ont

Tine

s

Rev

eacute-Peacute

ret

Mon

tess

uit

Theacutez

iegravere

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Aval

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Tani

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tro

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Aval

rout

e

Ande

lier

Treb

iet

La P

allu

d

Aval

St

Jeoi

re

LeGiffre

LeGiffre

LeGiffre

LeGiffre

LeGiffre

LeGiffre

Le FdeTaninges

LEtroitDenteacute

LEtroitDenteacute

Le F deMieussy

Le F deMieussy

LeHisson

Le Risse

Long

ueur

tota

le e

n m

m

Taille moyenne des 0+ sur le Borne

0

20

40

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120

140

GrandBornand

Les Etroits Entremont Beffay St Pierre en F

Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Chinaillon La Duche LOveacuteran

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Taille moyenne des 0+ sur la Filliegravere

0

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Giffre

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Le F deMieussy

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32

Sur la quasi-totaliteacute des stations eacutetudieacutees les individus marqueacutes preacutesentent une taillemoyenne supeacuterieure agrave celle des individus naturels Sur 18 stations ougrave les effectifs permettent des comparaisons statistiques la longueur totale des individus marqueacutes est significativement supeacuterieure agrave celle des truites sauvages pour 13 stations

Les 5 stations faisant exception sont laquo aval barrage Taninges raquo et laquo Pont du Giffre raquo sur le Giffre laquoAval St Jeoire raquo sur le Risse laquo Bonnavaz raquo sur le Foron de Taninges et laquo Couvette raquo sur le Foron de Fillinges Cependant sur ces stations les diffeacuterences ne sont pas significatives

Le fait que les marqueacutes aient une plus grande taille moyenne que les non marqueacutes au stade 0+ nrsquoimplique pas que cela soit systeacutematiquement le cas aux stades ulteacuterieurs En effet CAUDRON (1998) et CHAMPIGNEULLE et CACHERA (2003) ont montreacute respectivement sur le Doubs et le Fier que les diffeacuterences de tailles entre marqueacutes et non marqueacutes au stade 0+ sestompaient au stade 1+ et chez les adultes

Par ailleurs lrsquoexistence drsquoune plus grande taille au stade 0+ en automne pour les marqueacutes ne leur garantit pas un meilleur taux de seacutedentarisation En effet plusieurs eacutetudes dont celle de JONSSON et JONSSON (1993) indiquent que le taux de deacutevalaison peut ecirctre plus eacuteleveacute pour les individus agrave plus forte croissance au stade 0+ La deacutevalaison peut donc toucher preacutefeacuterentiellement les individus marqueacutes en raison de leur forte croissance

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Foron du Reposoir

0

20

40

60

80

100

120

140

La Touviegravere Le Reposoir

F du Reposoir F du Reposoir

Long

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tota

le e

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mTaille moyenne des 0+ sur le Foron de Fillinges

0

20

40

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140

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Long

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le e

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Foron du Reposoir

0

20

40

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100

120

140

La Touviegravere Le Reposoir

F du Reposoir F du Reposoir

Long

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mTaille moyenne des 0+ sur le Foron de Fillinges

0

20

40

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100

120

140

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Long

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tota

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m

33

222 Taille des nageoires pectorales

La figure ci-dessus montre qursquoil existe une diffeacuterence entre marqueacutes et non marqueacutes du rapport entre la longueur de la nageoire pectorale et la longueur totale du poisson

Il a sembleacute important drsquoanalyser plus en deacutetail ce caractegravere morphologique car il peut preacutesager de lrsquoaptitude des truites agrave se maintenir dans nos riviegraveres de montagne

Relation entre la longueur de la nageoire pectorale et la longueur totale des individus marqueacutes et non marqueacutes

5

7

9

11

13

15

17

19

21

23

25

27

30 50 70 90 110 130 150 170Longueur totale en mm

Long

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nag

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le e

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mMarqueacuteNon marqueacute

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron du Reposoir

12

14

16

18

20

La Touviegravere Le Reposoir

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Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron de Fillinges

12

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18

20

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron du Reposoir

12

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La Touviegravere Le Reposoir

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Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron de Fillinges

12

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Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

34

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Giffre

12

14

16

18

20

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LEtroitDenteacute

Le F deMieussy

Le F deMieussy

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Taille relative moyenne des pectorales sur la Filliegravere

12

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Taille relative moyenne des pectorales sur le Borne

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GrandBornand

Les Etroits Entremont Beffay St Pierre en F

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Giffre

12

14

16

18

20

Am

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Le F deMieussy

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Taille relative moyenne des pectorales sur la Filliegravere

12

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Taille relative moyenne des pectorales sur le Borne

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GrandBornand

Les Etroits Entremont Beffay St Pierre en F

Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Chinaillon La Duche LOveacuteran

35

Sur les 24 stations ougrave des individus marqueacutes et non marqueacutes coexistent la taille relative des nageoires pectorales est systeacutematiquement plus importante chez les individus naturelsLes truites issues du repeuplement preacutesentent donc des nageoires pectorales de longueur infeacuterieure agrave celle des truites sauvagesCette diffeacuterence morphologique est tregraves importante car le deacuteveloppement des nageoires est un eacuteleacutement deacuteterminant pour la survie du poisson dans son milieu notamment pour la stabiliteacute la reacutesistance au courant et la recherche de nourriture an action de chasse

Il semble donc possible que cette caracteacuteristique anatomique soit le reacutesultat drsquoune adaptation agrave la vie en torrent

BOSAKOWSKI et al (1993) ont eacutegalement observeacutes des reacutesultats comparables chez des truites arc-en-ciel et des truites brunes de plus grande taille entre poissons drsquoeacutelevage et poissons sauvages Dans cette eacutetude les poissons deacutelevage preacutesentaient des nageoires nettement plus courtes (10-50) que les poissons sauvages Selon les auteurs cette diffeacuterence semblait ecirctre causeacutee par les conditions de vie des poissons dans les bassins des piscicultures(agression intraspeacutecifique stress qualiteacute de leau et densiteacutes de poissons) qui provoquaient une eacuterosion des nageoires

Dans le cas preacutesent les poissons de repeuplement ont eacuteteacute introduits agrave des stades preacutecoces dans le milieu et ont eacuteteacute preacuteleveacutes 4 agrave 5 mois apregraves leur introduction En conseacutequence ils ont veacutecu peu de temps en pisciculture et ont par contre passeacute lessentiel de leur vie dans le mecircme milieu naturel que les poissons sauvages Ainsi il semble que ce dimorphisme de la nageoire entre poissons sauvages et introduits soit drsquoorigine geacuteneacutetique Une eacutetude de RIDDELL et al (1981) a montreacute chez le saumon que les diffeacuterences de deacuteveloppement de nageoires eacutetaient une adaptation des poissons agrave leur milieu qui preacutesentait une origine geacuteneacutetiqueIl est donc tout agrave fait probable qursquoun pheacutenomegravene similaire se rencontre chez la truite fario et que les truites sauvages soient mieux adapteacutees sur le plan morphologique (gracircce agrave des diffeacuterences geacuteneacutetiques) aux conditions du milieu que les poissons introduits mecircme agrave des stades preacutecoces

Outre lrsquoaspect purement geacuteneacutetique les facteurs environnants peuvent eacutegalement jouer un rocircle important En effet McLAUGHLIN et al (2002) ont montreacute que cette diffeacuterence au niveau des nageoires peut eacutegalement ecirctre due agrave des caracteacuteristiques du milieu environnant dans les premiegraveres semaines de vie des poissons En effet plusieurs lots drsquoune mecircme souche de saumon de fontaine soumis degraves lrsquoeacuteclosion agrave des conditions de vie diffeacuterentes montrent des diffeacuterences dans le deacuteveloppement des nageoires Ainsi degraves les premiegraveres semaines les poissons exposeacutes agrave un fort courant sont pourvus de nageoires plus longues

Il est donc possible que les alevins produits en pisciculture nrsquoeacutetant pas exposeacutes agrave des courants importants au cours de leurs premiegraveres semaines de vie deacuteveloppent des nageoires pectorales moins longues que les individus sauvages

Il y a probablement pour cette caracteacuteristique morphologique des interactions combinant geacuteneacutetique et conditions environnementales

Cette diffeacuterence morphologique peut eacutegalement avoir une importance dans la compeacutetition entre poissons sauvages et introduits notamment au stade juveacutenile En effet GIBSON (1973) a deacutemontreacute limportance des nageoires dans la compeacutetition interspeacutecifique

36

entre le saumon atlantique (Salmo salar L) et le saumon de fontaine (Salvenius fontinalis) deux poissons consommant la mecircme nourriture Le fait de posseacuteder des nageoires pectorales plus deacutevelopper permet au saumon atlantique de se maintenir dans les courants pour se nourrir tout en deacutepensant moins drsquoeacutenergie

Dans le cas des torrents haut-savoyards une compeacutetition intraspeacutecifique entre truites sauvages et introduites comparable agrave leacutetude de GIBSON peut se deacutevelopper La diffeacuterence morphologique entre les truites sauvages et issues du repeuplement peut donc avoir une influence lors de la compeacutetition entre ces deux types dindividus

37

3 Premiegraveres implications pour la gestion

En fonction des reacutesultats obtenus lors de la campagne de preacutelegravevements 2002 des orientations de gestion sont proposeacutees pour chaque riviegravere eacutetudieacutee Certaines propositions impliquent des changements relativement importants des pratiques actuelles de gestion

Lrsquoeacutetude de lrsquoefficaciteacute des repeuplements srsquoappuient sur une deacutemarche scientifique rigoureuse dans lrsquointeacuterecirct des gestionnaires directs (AAPPMA) puisqursquoelle permet agrave ces derniers de prendre des deacutecisions en srsquoappuyant sur des reacutesultats concrets et indiscutables Elle est conduite dans un souci drsquoeacutevaluer en toute objectiviteacute les pratiques drsquoalevinage dans le seul but drsquoameacuteliorer la gestion actuelle des populations et des milieux Concregravetement elle permet de connaicirctre rapidement les zones ougrave lrsquoalevinage en truite fario est inefficace et donc inutile et les zones ougrave celui-ci est efficace et donc neacutecessaire

En plus des reacutesultats obtenus gracircce aux marquages des juveacuteniles les propositions prennent en compte les premiers reacutesultats issus des pecircches de sondage drsquoadultes reacutealiseacutees pour le programme INTERREG (reacutedaction en cours) Lrsquointeacutegration des diffeacuterentes donneacutees (marquage juveacutenile + adultes) permet de faire des propositions coheacuterentes selon un diagnostic le plus complet possible de la population de truite preacutesente

31 Bassin du Borne

Sur les riviegraveres du bassin du Borne les orientations de gestion proposeacutees ci-apregraves restent conformes agrave celles deacutejagrave eacutevoqueacutes par CAUDRON et CHAMPIGNEULLE (2002)

Arrecirct du repeuplement selon les pratiques actuelles sur lrsquoensemble du cours principal Cette proposition est motiveacutee par deux principales raisons

- Lrsquoalevinage est inefficace agrave lrsquoamont du seuil drsquoEntremont car apregraves plus de 15 ans il nrsquoa pas permis drsquoinstaller une population en place eacutequilibreacutee

- Il semble impeacuteratif de preacuteserver lrsquoimportante population de truite sauvage preacutesente agrave lrsquoaval du seuil drsquoEntremont Les reacutesultats geacuteneacutetiques indiquent que la population preacutesente est une population sauvage qui nrsquoa pas eacuteteacuteimplanteacutee suite agrave lrsquoalevinage Elle preacutesente un degreacute de pureteacute geacuteneacutetique important Cette population repreacutesente un patrimoine unique dans le Faucigny Le but drsquoarrecircter les alevinages sur ce secteur est drsquoeacuteviter les hybridations qui peuvent entraicircner une perte de plasticiteacute geacuteneacutetique et une deacutegeacuteneacuterescence de la souche sauvage actuelle

Arrecirct du repeuplement sur lrsquoaval de lrsquoOveacuteran Ce secteur est utiliseacute comme zone de reproduction par les geacuteniteurs du Borne et la reproduction naturelle y est abondante Lrsquoalevinage nrsquoest donc pas neacutecessaire et risque comme sur le Borne de provoquer une hybridation de la population naturelle

Essayer drsquoinstaller une population naturelle agrave lrsquoamont du seuil drsquoEntremont par transferts de geacuteniteurs

Sur les autres affluents deux sceacutenarii de gestion peuvent ecirctre envisageacutes selon la volonteacute politique des gestionnaires directs

Sceacutenario ndeg1 vision patrimoniale

38

- Arrecirct du repeuplement en truite drsquoorigine Atlantique pendant 3 anneacutees conseacutecutives pour diminuer leur preacutesence sur le bassin

- Puis reprise de lrsquoalevinage pendant uniquement 3 anneacutees agrave partir de poissons sauvages issus du Borne pour essayer drsquoinstaller une population naturelle

Sceacutenario ndeg2 vision halieutique- Maintien des pratiques drsquoalevinage en atlantique pour soutenir

artificiellement le stock de poissons dans un inteacuterecirct uniquement halieutique Attention cette pratique risque de provoquer par deacutevalaison des individus introduits une hybridation des poissons sauvages preacutesents dans le Borne

Eventuellement repeuplement en truites Arc en Ciel surdensitaires sur des secteurs preacutecis du Borne pendant la peacuteriode estivale afin de contenter une certaine cateacutegorie de pecirccheurs Les repeuplements en Arc en Ciel ne risquent pas de provoquer drsquohybridation de la souche fario locale Attention prendre des preacutecautions aupregraves des fournisseurs concernant la qualiteacute sanitaire des poissons

32 Bassin du Giffre

Les propositions sur le bassin du Giffre prennent en compte les reacutesultats du marquage mais eacutegalement la situation actuelle de la riviegravere suite agrave lrsquoeacuteboulement de Sixt Fer agrave Cheval

Ne pas aleviner le cours principal du Giffre en alevins de fario pendant 5 anneacutees conseacutecutives Cette proposition est motiveacutee par les raisons suivantes

- Il est impossible de savoir comment va eacutevoluer dans les prochains mois et les prochaines anneacutees le glissement agrave lrsquoamont de Sixt Il semble donc risqueacute drsquoentreprendre un alevinage pour installer une nouvelle population

- Les reacutesultats des marquages sur le Giffre sont tregraves contrasteacutes Sauf au niveau de Sixt ils montrent qursquoil existait avant le glissement une reproduction naturelle importante et capable de soutenir une population

- Les reacutesultats geacuteneacutetiques reacutecents indiquent que les populations en place sont en majoriteacute drsquoorigine atlantique mais qursquoil existe encore des individus meacutediterraneacuteens non hybrideacutes jusque dans les zones amont Ces reacutesultats prouvent qursquohistoriquement la souche meacutediterraneacuteenne eacutetait bien preacutesente sur lrsquoensemble du Giffre

- Il est envisageable que cette souche sauvage eacutegalement preacutesente sur les parties basses des affluents recolonise naturellement le Giffre

- Lrsquoexemple du Borne montre qursquoapregraves une catastrophe la riviegravere a eacuteteacute recoloniseacutee par une souche sauvage malgreacute des alevinages massifs Les reacutesultats obtenus sur cette riviegravere doivent servir de base de reacuteflexions pour la nouvelle gestion agrave entreprendre sur le Giffre

- Entre le Risse et Marignier la population de truites avant le glissement eacutetait deacutejagrave totalement deacuteseacutequilibreacutee et en quasi disparition (peu de juveacuteniles quasi absence de geacuteniteurs et absence de classes drsquoacircges intermeacutediaires) malgreacute les alevinages massifs sur ce secteur

39

Reacutealiser un bilan de lrsquoimpact du glissement de terrain sur le peuplement piscicole

- Une eacutetude piscicole sera reacutealiseacutee tregraves prochainement (2004 ou 2005) sur le Giffre dans le cadre du contrat de riviegravere Cette eacutetude permettra de faire un premiereacutetat des lieux complet du peuplement piscicole suite au glissement

Accomplir un diagnostic de lrsquoeacutetat de recolonisation du Giffre par les populations naturelles

- En lrsquoabsence drsquoalevinage il sera possible de reacutealiser en 2008 un bilan des populations de truites installeacutees sur le Giffre

- A partir de lrsquoeacutetat de la population agrave cette eacutepoque un plan drsquoalevinage coheacuterent en truite fario pourra ecirctre eacutetabli pour permettre drsquoinstaller de nouvelles populations ou de soutenir des populations preacutesentes

Mettre en place des deacuteversements de truites Arc en Ciel pendant toute la peacuteriode drsquoarrecirct de lrsquoalevinage en fario Attention prendre des preacutecautions aupregraves des fournisseurs concernant la qualiteacute sanitaire des poissons

Reacuteintroduire lrsquoOmbre commun sur la plaine de Samoeumlns et agrave lrsquoaval de la confluence avec le Risse

Arrecirct de lrsquoalevinage sur lrsquoensemble du Risse sur lrsquoaval du Foron de Mieussy et sur lrsquoEtroit Denteacutee

- Sur ces riviegraveres le suivi du marquage a montreacute que lrsquoalevinage nrsquoeacutetait pas neacutecessaire pour soutenir les populations de truites preacutesentes

Maintenir lrsquoalevinage sur lrsquoamont du Foron de Mieussy (vers Sommand) et lrsquoamont du Foron de Taninges (Bonnavaz)

- Sur ces secteurs le suivi du marquage a montreacute que les juveacuteniles preacutesents dans le milieu naturel eacutetaient en majoriteacute des individus introduits

33 Le Foron du Reposoir

Les propositions de gestion sur le Foron du Reposoir sont

Maintenir les alevinages actuels avec la souche Chazey Bons Rhodanienne

Suivre lrsquoeacutevolution de la population pour savoir si cet alevinage permet drsquoinstaller une population fonctionnelle

- Ce suivi peut comprendre des pecircches de sondages en deacutebut de peacuteriode de reproduction pour voir si les poissons adultes deviennent matures des releveacutes de frayegraveres sur la riviegravere pour savoir si les poissons se reproduisent et de nouveaux preacutelegravevements de poissons pour suivre lrsquoeacutevolution du taux de marqueacutes dans la population

34 Bassin de la Filliegravere

Les orientations pour une gestion coheacuterente des populations de la Filliegravere sont les suivantes

40

Arrecirct de lrsquoalevinage sur le cours principal de la Filliegravere sur le Crenant et sur lrsquoaval du Flan

- Sur ces 3 riviegraveres lrsquoalevinage nrsquoest pas neacutecessaire car il ne permet pas de soutenir les populations preacutesentes et de plus la reproduction naturelle est tregraves importante

- Sur la Filliegravere les pecircches drsquoadultes dans le cadre du programme INTERREG ont mis en eacutevidence la preacutesence drsquoune population sauvage drsquoorigine meacutediterraneacuteenne Il semble important drsquoentreprendre une mesure de conservation de cette souche en arrecirctant lrsquoalevinage pour eacuteviter lrsquohybridation

- Sur lrsquoamont du Flan il est neacutecessaire de continuer le suivi des poissons marqueacutes pour savoir si lrsquoalevinage doit ecirctre maintenu

Sur le Daudens deux sceacutenarii de gestion peuvent ecirctre envisageacutes selon la volonteacute politique des gestionnaires directs

Sceacutenario ndeg1 vision patrimoniale- Arrecirct du repeuplement en truite drsquoorigine Atlantique pendant 3 anneacutees

conseacutecutives pour diminuer leur preacutesence sur le bassin- Commencer les proceacutedures afin de rendre le seuil du Plot

franchissable pour les geacuteniteurs de la Filliegravere- Reacutealiser un bilan notamment deacutemographique de la population en place

apregraves lrsquoarrecirct de lrsquoalevinage- Puis reprise de lrsquoalevinage pendant uniquement 3 anneacutees agrave partir de

poissons sauvages issus de la Filliegravere pour essayer drsquoinstaller une population naturelle

Sceacutenario ndeg2 vision halieutique- Maintien des pratiques drsquoalevinage en atlantique pour soutenir

artificiellement le stock de poissons dans un inteacuterecirct uniquement halieutique Attention cette pratique risque de provoquer par deacutevalaison des individus introduits une hybridation des poissons sauvages preacutesents dans la Filliegravere

35 Le Foron de Fillinges

Les reacutesultats obtenus sur le Foron de Fillinges ont conduit agrave formuler les propositions de gestion suivantes

Arrecirct de lrsquoalevinage sur lrsquoensemble du Foron de Fillinges- Quelque soit la souche utiliseacutee et les quantiteacutes introduites les poissons

alevineacutes ne repreacutesentent qursquoune tregraves faible minoriteacute des poissons preacutesents dans le milieu Le Foron abrite une population naturelle fonctionnelle et eacutequilibreacutee

Suivi de la population suite agrave lrsquoarrecirct du repeuplement- Reacutealisation de 5 stations de pecircches eacutelectriques la derniegravere anneacutee de

lrsquoalevinage afin de reacutealiser un eacutetat des lieux preacutecis de la population de truites et du peuplement piscicole

- Reacutealisation drsquoun nouveau bilan de la population du Foron respectivement 3 ans puis 6 ans apregraves lrsquoarrecirct de lrsquoalevinage

41

4 Investigations suppleacutementaires

Suite aux premiers reacutesultats obtenus lors de la campagne 2002 des investigations suppleacutementaires permettant de preacuteciser certains points seront reacutealiseacutees

Reacutealiser une analyse bacteacuteriologique des diffeacuterents lots de poissons alevineacutes qui ont transiteacutes dans les piscicultures associatives Cette recherche de pathologie permettra de savoir si les poissons issus de pisciculture sont porteurs drsquoune maladie bacteacuterienne avant drsquoecirctre introduits dans le milieu ou si ils contractent la maladie dans le milieu naturel

Rechercher les raisons pour lesquelles on nrsquoobserve pas drsquoalevins naturels sur certains secteurs Les causes drsquoune telle situation peuvent ecirctre

- Lrsquoabsence totale de geacuteniteurs dans la population Les poissons nrsquoont pas le temps de devenir adulte (3+) et sont captureacutes avant par les pecirccheurs

- La preacutesence drsquoadultes non matures Les poissons deviennent adultes mais sont immatures (eacutetat sanitaire des poissons souche geacuteneacutetiquement deacutegeacuteneacutereacutee)

- Survie nulle durant la phase de vie sous graviers Les poissons pondent mais les œufs nrsquoarrivent pas agrave se deacutevelopper et la mortaliteacute est totale

Sur les secteurs du Chinaillon de la Duche de lrsquoOveacuteran amont et du Foron de Mieussy amont (Sommand) les actions suivantes peuvent ecirctre entreprises

- Pecircches eacutelectriques de sondage en deacutebut de la peacuteriode de reproduction pour savoir si les poissons deviennent matures

- Releveacutes de frayegraveres permettant drsquoobserver ou non une activiteacute de reproduction- Mise en place drsquoincubateurs-tests contenant des œufs de truites pour connaicirctre le taux

de survie des œufs dans les frayegraveres

Reacutealiser des preacutelegravevements suppleacutementaires aux classes drsquoacircge supeacuterieures (1+ et 2+) sur certaines stations pour voir lrsquoeacutevolution du taux de marqueacutes au cours des anneacutees Ces recherches suppleacutementaires peuvent ecirctre effectueacutees sur 8 cours drsquoeau ougrave le taux de marqueacutes deacutepasse 60 au stade 0+

Le ruisseau de la Duche amontLe ruisseau du Chinaillon amontLe Foron du ReposoirLe Risse avalLe Foron de Taninges amont (Bonnavaz)Le Foron de Mieussy amont (Sommand)Le Daudens amont et avalLe Flan amont

Dans les eacutetudes preacuteceacutedentes reacutealiseacutees sur le Fier (CAUDRON et CHAMPIGNEULLE 2002) et sur le Doubs (CHAMPIGNEULLE et al 2002) les taux de marqueacutes aux stades 1+ et 2+ dans la population en place srsquoeffondraient et devenaient tregraves faibles ou nuls

Pour informations le graphique suivant montre lrsquoeacutevolution du taux de marqueacutes agrave diffeacuterents stades sur les stations ougrave le taux de 0+ marqueacutes eacutetait eacuteleveacute

42

Les reacutesultats montrent agrave part pour une station une chute importante des taux de marqueacutes entre les stades 0+ et 1+ Cette chute se poursuit eacutegalement au stade 2+Ces reacutesultats obtenus sur le Fier et le Doubs semblent laisser peu drsquoespoirs sur le devenir des poissons marqueacutes sur les bassins eacutetudieacutes en 2002

Reacutesultats sur leacutevolution du taux de m arqueacutes aux diffeacuterents stades obtenus lors des eacutetudes preacuteceacutedentes sur le Fier et le Doubs

0102030405060708090

100

0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 0+ 1+ 0+ 1+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+

Station A Station B Station C StationD

StationE

StationF

Station A Station B StationC

Stations et stades

Pou

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tage

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mar

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Le Fier Le Doubs

Reacutesultats sur leacutevolution du taux de m arqueacutes aux diffeacuterents stades obtenus lors des eacutetudes preacuteceacutedentes sur le Fier et le Doubs

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Station A Station B Station C StationD

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Station A Station B StationC

Stations et stades

Pou

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Le Fier Le Doubs

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13

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Gd

Born

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Sur les Affluents

Sur les 3 affluents eacutetudieacutes la situation est tregraves simple En effet soit on observe 0 de marqueacutes soit 100

- Sur lrsquoOveacuteran aval aucun poisson marqueacute nrsquoa eacuteteacute trouveacute puisqursquoil nrsquoy a pas eu de repeuplement sur ce secteur en 2002 Le reacutesultat obtenu montre une importante reproduction naturelle des geacuteniteurs du Borne qui remontent sur lrsquoaval de ce cours drsquoeau

- Sur la Duche et le Chinaillon il y a absence totale de reproduction naturelle puisque 100 des 0+ eacutechantillonneacutes sont marqueacutes Pourtant on observe de nombreux poissons adultes sur ces secteurs susceptibles drsquoecirctre des geacuteniteurs ainsi que diffeacuterentes classes drsquoacircge Lrsquoeacutequilibre de ces populations est artificiellement maintenu par les alevinages

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

- Toutes les stations eacutetudieacutees ne sont pas concerneacutees par ces symptocircmes de maladies- Les maladies bacteacuteriennes semblent toucher majoritairement les poissons introduits- Cependant les 0+ de lrsquoOveacuteran aval tous naturels sont infecteacutes agrave 15 Ce reacutesultat

peut refleacuteter une contamination par deacutevalaison provenant drsquoindividus atteints situeacutes plus en amont de lrsquoOveacuteran ou une contamination naturelle par des agents pathogegravenes preacutesents dans le milieu

- Les poissons marqueacutes peuvent ecirctre contamineacutes agrave un taux non neacutegligeable pouvant atteindre plus de 30

Pourcentage dindividus preacutesentant des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

0

10

20

30

40

50

GrandBornand

Les Etroits Entremont Beffay St Pierre enF

Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Chinaillon La Duche LOveacuteran

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

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Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Le sexe ratio est relativement eacutequilibreacute pour les marqueacutes comme pour les non marqueacutes Seule une station sur le Borne (Beffay) montre 85 de macircle dans la population de 0+

- Seules 2 stations montrent des macircles matures au stade 0+- Le pourcentage de macircles matures au stade 0+ est plus important chez les non

marqueacutes que chez les marqueacutes

Pourcentage de macircles au stade 0+

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GrandBornand

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GrandBornand

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Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Chinaillon La Duche LOveacuteran

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Borne

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Pourcentage de macircles au stade 0+

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GrandBornand

Les Etroits Entremont Beffay St Pierre enF

Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Chinaillon La Duche LOveacuteran

Pourcentage de macircles matures au stade 0+

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GrandBornand

Les Etroits Entremont Beffay St Pierre enF

Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Chinaillon La Duche LOveacuteran

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Borne

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

16

212 Le Giffre

Sur le bassin du Giffre 6 stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal et 7 sur des affluents Au total ce sont 536 poissons 0+ qui ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

Sur le cours principal

La carte de synthegravese des reacutesultats met en eacutevidence des taux de marqueacutes tregraves contrasteacutes variant entre 0 et 100 Sauf deux cas particuliers la campagne de preacutelegravevements a permis de montrer qursquoune reproduction naturelle existait sur lrsquoensemble du Giffre

Il est possible de distinguer trois zones successives sur ce cours deau

La zone aval est composeacutee de la station Pont du Giffre ougrave le taux de marqueacutes est de 74 Cette station sur le Giffre doit ecirctre rapprocheacutee des stations eacutetudieacutees sur le Risse (station laquo Risse aval St Jeoire raquo) et le Hisson(laquo station La Pallud raquo) pour mieux comprendre le fonctionnement de la population

- Sur le Giffre aval la situation semble tregraves critique La station dite laquo Pont du Giffre raquosrsquoeacutetend de lrsquoamont de Marignier agrave lrsquousine du Pont du Giffre soit sur environ 25 km Sur cette distance seulement 31 0+ ont pu ecirctre captureacutes De plus les pecircches drsquoadultes dans le cadre drsquoInterreg montrent un deacuteficit inquieacutetant de geacuteniteurs sur ce secteur ainsi qursquoune surabondance de Chabot La situation du bas Giffre montre une population de truitetotalement deacuteseacutequilibreacutee loin du potentiel de la riviegravere et qui ne peut pas ecirctre reacutehabiliteacutee par le seul fait de lrsquoalevinage Cette situation peut ecirctre le reacutesultat du faible deacutebit reacuteserveacute qui appauvrit lrsquohabitat aquatique et provoque des eacuteleacutevations de tempeacuterature inquieacutetantes Les reacutesultats de pecircche drsquoinventaire dans la reacuteserve de Marignier montrent que les poissons sont concentreacutes agrave lrsquoaval immeacutediat des seuils ougrave lrsquoon note la preacutesence de fosses de tempeacuteratures plus faibles et drsquoune meilleure oxygeacutenation

La zone moyenne situeacutee entre le barrage de Mieussy et Samoeumlns qui est composeacutee des stations laquo aval barrage Taninges raquo laquo Theacuteziegraveres raquo et laquo Montessuit raquo Sur ce secteur les 0+ marqueacutes sont en minoriteacutes puisqursquoils repreacutesentent 11 agrave 38 du peuplement

- Sur le Giffre aval barrage de Taninges le secteur nrsquoest pas alevineacute il est donc normal que pregraves de 90 des poissons ne soient pas marqueacutes Les 0+ marqueacutes proviennent certainement du ruisseau de lrsquoEtroit Denteacute qui est fortement alevineacute et agrave partir duquel une deacutevalaison doit avoir lieu- Le secteur des laquo Theacuteziegraveres raquo et de laquo Montessuit raquo bien que reacuteguliegraverement alevineacute montre un taux important drsquoalevins naturels (62 agrave 77) Ce reacutesultat est tout agrave fait en accord avec le suivi de la reproduction naturelle et le recensement de frayegraveres reacutealiseacute par lrsquoAAPPMA du Faucigny et le CSP en 1999 En effet de nombreuses frayegraveres naturelles avaient eacuteteacute observeacutees sur ce site Le peuplement drsquoadultes nrsquoest pas tregraves important mais est en rapport avec les potentialiteacutes du milieu

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La zone amont caracteacuteriseacutee par les stations laquo Reveacute-Peacuteret raquo et laquo amont Tines raquo ougrave le taux de marqueacutes varie de 70 agrave 79

- Pour ces deux stations la population de juveacuteniles est faible et ils sont majoritairement marqueacutes Cependant au stade adulte les pecircches Interreg montrent une majoriteacute de poissons drsquoorigine meacutediterraneacuteenne La forte contribution de poissons introduits au stade 0+ ne semble pas se retrouver au stade adulte Les conditions de vie dans ce milieu sont tregraves difficiles et ne permettent pas drsquoatteindre des densiteacutes de poissons importantes

Sur les Affluents

Le Risse - Le Hisson montre une majoriteacute drsquoalevins naturels alors que les preacutelegravevements ont eacuteteacute reacutealiseacutes seulement deux mois apregraves le repeuplement Ce cours drsquoeau possegravede un fort potentiel de frai qui est utiliseacute notamment par les geacuteniteurs du Risse- Sur lrsquoaval du Risse le taux de marqueacutes est de 68 Il est le reflet drsquoun alevinage en quantiteacute importante sur le secteur (10 000 alevins) Les alevins naturels repreacutesentent tout de mecircme plus de 30 trois mois apregraves le repeuplement De plus les eacutechantillonnages drsquoadultes reacutealiseacutes sur ce secteur dans le cadre drsquoInterreg ont mis en eacutevidence une quantiteacute importante de geacuteniteurs sauvages La population sur ce secteur est agrave mettre en eacutevidence avec celle du Hisson puisque certains geacuteniteurs du Risse y migrent pour se reproduireLa population sur ce secteur est naturellement fonctionnelle

Le Foron de Mieussy - La station laquo Andelier raquo situeacutee en amont du Foron preacutesente 100 de marqueacutes Cette situation montre une absence totale de reproduction naturelle Le milieu est extrecircmement deacutefavorable agrave lrsquoinstallation drsquoune population fonctionnelle en raison du faible deacutebit de la riviegravere (assegravechement reacutegulier) Aucune classe drsquoacircge intermeacutediaire et aucun adulte nrsquoa eacuteteacute observeacute sur ce secteur Les poissons alevineacutes sont certainement victimes des assegravechements- La station laquo Trebiet raquo situeacutee plus en aval preacutesente au contraire 0 de marqueacutes alors que cette zone a eacuteteacute alevineacutee Ce reacutesultat montre la capaciteacute du Foron sur ce secteur a accueillir une population fonctionnelle Il existe une reproduction naturelle importante sur cette zone avec eacutegalement beaucoup de geacuteniteurs- Vers Sommand une pecircche de sondage a eacuteteacute reacutealiseacutee mais aucun alevin nrsquoa eacuteteacute preacuteleveacute puisque cette zone nrsquoa pas eacuteteacute alevineacutee en 2002 Cependant les reacutesultats de ce sondage mettent en eacutevidence une absence totale de reproduction naturelle (aucun alevin naturel nrsquoa eacuteteacute trouveacute) alors que la population semble eacutequilibreacutee (preacutesence drsquoadultes et de truitelles drsquoacircge intermeacutediaire)

LrsquoEtroit Denteacute Globalement le taux de marqueacutes sur les deux stations eacutetudieacutees est faible (11 agrave 33)- Sur la station laquo aval route raquo la majoriteacute des alevins est naturelle Cette zone montre un habitat tregraves favorable pour la reproduction des geacuteniteurs qui remontent du Giffre- Sur la station laquo amont route raquo une population fonctionnelle de pheacutenotype meacutediterraneacuteen est installeacutee De nombreux geacuteniteurs sont preacutesents et le recrutement naturel est important

19

Le Foron de Taninges - En amont (station Bonnavaz) le taux de marqueacutes est tregraves important (95) Il existe donc une reproduction naturelle mais insuffisante pour permettre lrsquoinstallation drsquoune population et maintenir une activiteacute halieutique Les alevinages passeacutes nrsquoont pas permis drsquoinstaller une population fonctionnelle dans cette zone apicale- Plus en aval sur les zones non alevineacutees les pecircches eacutelectriques drsquoinventaire et de sondage reacutealiseacutees ont montreacute la preacutesence drsquoune population eacutequilibreacutee de pheacutenotype meacutediterraneacuteen avec une importante reproduction naturelle

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

Les principales remarques concernant les pathologies observeacutees sur le bassin du Giffre sont

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

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Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Giffre

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

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Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

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Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Giffre

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

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- La PKD est preacutesente sur le cours du Giffre mais uniquement agrave lrsquoaval du barrage de Taninges Cette situation est agrave mettre en relation avec le deacutebit reacuteserveacute insuffisant qui entraicircne une augmentation de tempeacuterature pendant la peacuteriode estivale

- Sur les affluents la PKD a eacuteteacute observeacutee sur les secteurs preacutesentant des faibles deacutebits estivaux (aval du Risse et Foron de Mieussy Andelier) qui sont certainement responsables drsquoune augmentation de tempeacuterature

- La PKD atteint agrave la fois les poissons introduits que les poissons naturels- Le pourcentage drsquoindividus toucheacutes par la PKD varie drsquoun site agrave lrsquoautre mais peut

atteindre une valeur importante avec 50 sur certain secteur- Les maladies bacteacuteriennes sont plus freacutequentes chez les individus marqueacutes Soit ces

poissons sont plus fragiles que les poissons naturels et contractent les maladies plus facilement soit les maladies sont contracteacutees en pisciculture pendant lrsquoeacutelevage

- Le pourcentage drsquoindividus toucheacutes par des symptocircmes bacteacuteriens nrsquoest pas neacutegligeable puisqursquoil peut atteindre 20

- Lrsquoensemble des stations eacutetudieacutees est toucheacute par des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes ce qui laisse penser que lrsquoensemble du bassin peut ecirctre atteint

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

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Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Giffre

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Pourcentage de macircles au stade 0+

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Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Giffre

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

21

- Le sexe ratio apparaicirct globalement eacutequilibreacute sur lrsquoensemble des stations du Giffre- On observe des diffeacuterences entre les poissons introduits et les poissons naturels sur

seulement 3 stations Ces diffeacuterences sont en faveur des poissons marqueacutes qui montrent un pourcentage de macircles plus important

- Une maturiteacute sexuelle preacutecoce des macircles existe sur certaines stations quelle que soit lrsquoorigine des poissons

- Cette maturiteacute peut ecirctre importante et concerner jusqursquoagrave 20 des 0+

22

213 Le Foron du Reposoir

Deux stations (La Touviegravere et Le Reposoir) ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le Foron du Reposoir Seulement 15 0+ ont eacuteteacute eacutetudieacutes en raison principalement de la difficulteacute drsquoeacutechantillonner des poissons de petite taille (6-7 cm) sur ces milieux torrentiels

Le taux de marqueacutes

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- Sur les deux stations eacutetudieacutees le taux de marqueacutes est de 100 Lrsquoensemble des 0+ mecircme si le nombre est faible est donc issu de lrsquoalevinage Ce cours drsquoeau fait lrsquoobjet actuellement drsquoun essai drsquoimplantation drsquoune population agrave partir de la souche Chazey-Bons Rhodanienne Cette souche provient de geacuteniteurs de la riviegravere Furan (Ain) Des analyses geacuteneacutetiques reacutecentes reacutealiseacutees par analyse de microsatellites diagnostic de lrsquoADN ont montreacute que ces poissons ont un pourcentage dallegraveles meacutediterraneacuteens voisin de 65

Ce reacutesultat montre que le cours deau avait un niveau de population tregraves faible avant le repeuplement par la souche Chazey-Bons sauvagesDe plus les pecircches drsquoinventaires du CSP et les pecircches de sondage Interreg montrent qursquoune population de truites se met progressivement en place En effet on observe chaque anneacutee despoissons agrave des stades de plus avanceacutes et les captures par pecircche agrave la ligne commencent agrave ecirctre effectivesLes pecircches eacutelectriques reacutealiseacutees agrave lrsquoautomne 2002 indique que le stock de geacuteniteurs est en cours de reconstitution mais que les truites femelles nrsquoont pas encore atteint le stade geacuteniteurIl nrsquoest donc pas encore possible de dire si lrsquohabitat et la population du Foron du Reposoir sont propices agrave lrsquoinstallation drsquoune population naturellement fonctionnelle

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

Aucun symptocircme reacutenal et heacutemorragique nrsquoapparaicirct sur les 0+ eacutechantillonneacutes sur ce cours deau

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Le sexe ratio est eacutequilibreacute puisqursquoil varie de 50 agrave 60- Il nrsquoy a aucun macircle mature au stade 0+ dans les eacutechantillons preacuteleveacutes sur ce cours

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Pourcentage de m acircles au stade 0+

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La Touviegravere Le Reposoir

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

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Pourcentage de m acircles au stade 0+

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La Touviegravere Le Reposoir

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

24

214 La Filliegravere

Cinq stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal de la Filliegravere ainsi que sept stations sur les trois affluents principaux (Flan Creacutenant et Daudens) Au total 582 poissons 0+ ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

Sur le cours principal

Pour les 5 stations eacutetudieacutees sur le cours principal le taux de 0+ marqueacutes varie de 4 agrave 56 il est donc de tregraves faible agrave moyen et montre une forte reproduction naturelle sur toute la riviegravere Il y a un gradient amont-aval du taux de marqueacutes avec un pourcentage de poissons marqueacutes plus important en amont Cependant sur lrsquoensemble de la Filliegravere le recrutement naturel est dominant et constitue lrsquoessentiel de la population de truite

De plus les pecircches de sondages pour Interreg ont montreacute la preacutesence de nombreux drsquoadultes drsquoorigine naturelle meacutediterraneacuteenne Ceci confirme que la population de truite de la riviegravere principale est naturellement fonctionnelle

Sur les affluents

Les reacutesultats sont diffeacuterents selon que lrsquoaffluent est en connexion ou non avec la riviegravere principale

- Sur le Flan on observe en zone aval et meacutediane (stations laquo D 55 raquo et laquo Bruchon raquo) des taux de marqueacutes faibles (38 et 27) qui mettent en eacutevidence la preacutesence drsquoune forte reproduction naturelle notamment de poissons migrants de la Filliegravere Les releveacutes de frayegraveres reacutealiseacutes par lrsquoAAPPMA avaient deacutejagrave permis drsquoobserver de nombreuses frayegraveres naturelles sur ce secteurEn zone plus amont station laquo Molliet raquo le taux de marqueacutes est plus important (73) il met en eacutevidence la preacutesence drsquoun recrutement naturel mais qui reste au stade 0+ minoritaire par rapport aux individus introduits

- Sur le Daudens les deux stations (laquo Le Plot raquo et Daudens raquo) montrent des taux de marqueacutes importants (86 et 92) La reproduction naturelle est donc tregraves faible et la population de truite ne semble pas fonctionnelle Lrsquoobstacle agrave lrsquoaval de la route deacutepartementale semble preacutejudiciable car il ne permet pas aux geacuteniteurs de la Filliegravere de remonter sur le Daudens et drsquoinstaller une population fiable

- Sur le Crenant Les deux stations eacutechantillonneacutees (laquo aval raquo et Disonche raquo) ne sont pas situeacutees sur des zones alevineacutees en 2002 et il est normal de trouver 0 de marqueacutes Cependant ces reacutesultats montrent qursquoil y a une forte reproduction naturelle sur ce cours drsquoeau mecircme en zone amont et que la population semble naturellement fonctionnelle Les alevins introduits sur le Crenant ne semblent pas avoir deacutevaleacutes sur pour coloniser lrsquoaval du Crenant

25

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26

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

- La PKD semble quasiment absente du bassin de la Filliegravere sauf preacutesence anecdotique uniquement chez les non marqueacutes sur une station (laquo Millard raquo)

- Les individus marqueacutes ne sont pas toucheacutes par la PKD- Les maladies bacteacuteriennes sont preacutesentes sur lrsquoensemble du bassin mais touchent en

prioriteacute et majoritairement les individus marqueacutes

Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

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Pourcentage dindividus preacutesentant des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

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Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

27

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Sur lrsquoensemble des stations le sexe ratio est eacutequilibreacute il montre une plus grande variation chez les individus marqueacutes

- Des macircles matures au stade 0+ ont eacuteteacute observeacutes sur trois stations uniquement chez les individus naturels

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

Pourcentage de macircles au stade 0+

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

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Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

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Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

28

215 Le Foron de Fillinges

Trois stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal du Foron de Fillinges agrave savoir de lrsquoamont vers lrsquoaval laquo Bovet ndash Boex raquo laquo Pont de Fillinges raquo et laquo Couvette raquo Au total 178 poissons 0+ ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

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29

Sur les 3 stations eacutetudieacutees les taux de marqueacutes sont faibles agrave tregraves faibles- Sur la station laquo Bovet ndash Boex raquo le taux de marqueacutes est de seulement 31- A lrsquoaval sur les stations laquo Pont de Fillinges raquo et laquo Couvette raquo les taux de marqueacutes

sont respectivement de 0 et 2

Les reacutesultats indiquent la preacutesence drsquoune importante reproduction naturelle sur lrsquoensemble du Foron de Fillinges Quelque soit la souche utiliseacutee pour lrsquoalevinage atlantique dans le secteur Faucigny ou Meacutediterraneacuteenne Pont de Gys dans le secteur Chablais les poissons introduits restent minoritaires

Cette situation traduit la preacutesence drsquoune population bien installeacutee et fonctionnelle sur cette riviegravere

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

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Pourcentage dindividus preacutesentant des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

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Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

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Pourcentage dindividus preacutesentant des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

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Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

30

- Sur lrsquoensemble des stations des individus 0+ sont atteints par la PKD le pourcentage drsquoindividus malades peut atteindre 35

- Seuls les individus sauvages semblent toucheacutes par la PKD cependant le nombre drsquoindividus introduits est trop faible pour permettre une comparaison

- Toutes les stations sont eacutegalement toucheacutees par les maladies bacteacuteriennes avec des taux de contamination variant de 15 agrave 30

- Les maladies bacteacuteriennes touchent agrave la fois les individus introduits et les individus naturels

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Le sexe ratio apparaicirct eacutequilibreacute sur lrsquoensemble des stations- On observe des macircles matures degraves le stade 0+ sur lrsquoensemble des stations- Le taux de macircles matures au stade 0+ peut atteindre 15

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

Pourcentage de macircles au stade 0+

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

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Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

Pourcentage de macircles au stade 0+

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Pourcentage de macircles matures au stade 0+

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

31

22Caracteacuteristiques morphologiques

221 Longueur totale des individus

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Giffre

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

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Taille moyenne des 0+ sur le Giffre

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32

Sur la quasi-totaliteacute des stations eacutetudieacutees les individus marqueacutes preacutesentent une taillemoyenne supeacuterieure agrave celle des individus naturels Sur 18 stations ougrave les effectifs permettent des comparaisons statistiques la longueur totale des individus marqueacutes est significativement supeacuterieure agrave celle des truites sauvages pour 13 stations

Les 5 stations faisant exception sont laquo aval barrage Taninges raquo et laquo Pont du Giffre raquo sur le Giffre laquoAval St Jeoire raquo sur le Risse laquo Bonnavaz raquo sur le Foron de Taninges et laquo Couvette raquo sur le Foron de Fillinges Cependant sur ces stations les diffeacuterences ne sont pas significatives

Le fait que les marqueacutes aient une plus grande taille moyenne que les non marqueacutes au stade 0+ nrsquoimplique pas que cela soit systeacutematiquement le cas aux stades ulteacuterieurs En effet CAUDRON (1998) et CHAMPIGNEULLE et CACHERA (2003) ont montreacute respectivement sur le Doubs et le Fier que les diffeacuterences de tailles entre marqueacutes et non marqueacutes au stade 0+ sestompaient au stade 1+ et chez les adultes

Par ailleurs lrsquoexistence drsquoune plus grande taille au stade 0+ en automne pour les marqueacutes ne leur garantit pas un meilleur taux de seacutedentarisation En effet plusieurs eacutetudes dont celle de JONSSON et JONSSON (1993) indiquent que le taux de deacutevalaison peut ecirctre plus eacuteleveacute pour les individus agrave plus forte croissance au stade 0+ La deacutevalaison peut donc toucher preacutefeacuterentiellement les individus marqueacutes en raison de leur forte croissance

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Foron du Reposoir

0

20

40

60

80

100

120

140

La Touviegravere Le Reposoir

F du Reposoir F du Reposoir

Long

ueur

tota

le e

n m

mTaille moyenne des 0+ sur le Foron de Fillinges

0

20

40

60

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100

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Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Long

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le e

n m

m

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Foron du Reposoir

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La Touviegravere Le Reposoir

F du Reposoir F du Reposoir

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mTaille moyenne des 0+ sur le Foron de Fillinges

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Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Long

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tota

le e

n m

m

33

222 Taille des nageoires pectorales

La figure ci-dessus montre qursquoil existe une diffeacuterence entre marqueacutes et non marqueacutes du rapport entre la longueur de la nageoire pectorale et la longueur totale du poisson

Il a sembleacute important drsquoanalyser plus en deacutetail ce caractegravere morphologique car il peut preacutesager de lrsquoaptitude des truites agrave se maintenir dans nos riviegraveres de montagne

Relation entre la longueur de la nageoire pectorale et la longueur totale des individus marqueacutes et non marqueacutes

5

7

9

11

13

15

17

19

21

23

25

27

30 50 70 90 110 130 150 170Longueur totale en mm

Long

ueur

nag

eoire

pec

tora

le e

n m

mMarqueacuteNon marqueacute

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron du Reposoir

12

14

16

18

20

La Touviegravere Le Reposoir

F du Reposoir F du Reposoir

Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron de Fillinges

12

14

16

18

20

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron du Reposoir

12

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La Touviegravere Le Reposoir

F du Reposoir F du Reposoir

Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron de Fillinges

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Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

34

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Giffre

12

14

16

18

20

Am

ont

Tine

s

Rev

eacute-P

eacuteret

Mon

tess

uit

Theacute

ziegraver

es

Ava

lba

rrag

eT

anin

ges

Pon

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Ris

se

Bon

nava

z

Am

ont

rout

e

Ava

l rou

te

Ande

lier

Tre

biet

Ava

l St

Jeoi

re

Le Giffre Le Giffre Le Giffre Le Giffre Le Giffre Le Giffre Le FdeTaninges

LEtroitDenteacute

LEtroitDenteacute

Le F deMieussy

Le F deMieussy

Le Risse

Taille relative moyenne des pectorales sur la Filliegravere

12

14

16

18

20

Le J

ourd

il

Pis

cicu

lture

Milla

rd

Long

cham

ps

D55

Bru

chon

Mol

liet

Le

Plo

t

Dau

dens

Ava

l

Dis

onch

e

La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere Le Flan Le Flan Le Flan LeDaudens

LeDaudens

LeCrenant

LeCrenant

Taille relative moyenne des pectorales sur le Borne

12

14

16

18

20

GrandBornand

Les Etroits Entremont Beffay St Pierre en F

Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Chinaillon La Duche LOveacuteran

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Giffre

12

14

16

18

20

Am

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Tine

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Le Giffre Le Giffre Le Giffre Le Giffre Le Giffre Le Giffre Le FdeTaninges

LEtroitDenteacute

LEtroitDenteacute

Le F deMieussy

Le F deMieussy

Le Risse

Taille relative moyenne des pectorales sur la Filliegravere

12

14

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Le J

ourd

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Pis

cicu

lture

Milla

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Long

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Bru

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Mol

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La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere Le Flan Le Flan Le Flan LeDaudens

LeDaudens

LeCrenant

LeCrenant

Taille relative moyenne des pectorales sur le Borne

12

14

16

18

20

GrandBornand

Les Etroits Entremont Beffay St Pierre en F

Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Chinaillon La Duche LOveacuteran

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Sur les 24 stations ougrave des individus marqueacutes et non marqueacutes coexistent la taille relative des nageoires pectorales est systeacutematiquement plus importante chez les individus naturelsLes truites issues du repeuplement preacutesentent donc des nageoires pectorales de longueur infeacuterieure agrave celle des truites sauvagesCette diffeacuterence morphologique est tregraves importante car le deacuteveloppement des nageoires est un eacuteleacutement deacuteterminant pour la survie du poisson dans son milieu notamment pour la stabiliteacute la reacutesistance au courant et la recherche de nourriture an action de chasse

Il semble donc possible que cette caracteacuteristique anatomique soit le reacutesultat drsquoune adaptation agrave la vie en torrent

BOSAKOWSKI et al (1993) ont eacutegalement observeacutes des reacutesultats comparables chez des truites arc-en-ciel et des truites brunes de plus grande taille entre poissons drsquoeacutelevage et poissons sauvages Dans cette eacutetude les poissons deacutelevage preacutesentaient des nageoires nettement plus courtes (10-50) que les poissons sauvages Selon les auteurs cette diffeacuterence semblait ecirctre causeacutee par les conditions de vie des poissons dans les bassins des piscicultures(agression intraspeacutecifique stress qualiteacute de leau et densiteacutes de poissons) qui provoquaient une eacuterosion des nageoires

Dans le cas preacutesent les poissons de repeuplement ont eacuteteacute introduits agrave des stades preacutecoces dans le milieu et ont eacuteteacute preacuteleveacutes 4 agrave 5 mois apregraves leur introduction En conseacutequence ils ont veacutecu peu de temps en pisciculture et ont par contre passeacute lessentiel de leur vie dans le mecircme milieu naturel que les poissons sauvages Ainsi il semble que ce dimorphisme de la nageoire entre poissons sauvages et introduits soit drsquoorigine geacuteneacutetique Une eacutetude de RIDDELL et al (1981) a montreacute chez le saumon que les diffeacuterences de deacuteveloppement de nageoires eacutetaient une adaptation des poissons agrave leur milieu qui preacutesentait une origine geacuteneacutetiqueIl est donc tout agrave fait probable qursquoun pheacutenomegravene similaire se rencontre chez la truite fario et que les truites sauvages soient mieux adapteacutees sur le plan morphologique (gracircce agrave des diffeacuterences geacuteneacutetiques) aux conditions du milieu que les poissons introduits mecircme agrave des stades preacutecoces

Outre lrsquoaspect purement geacuteneacutetique les facteurs environnants peuvent eacutegalement jouer un rocircle important En effet McLAUGHLIN et al (2002) ont montreacute que cette diffeacuterence au niveau des nageoires peut eacutegalement ecirctre due agrave des caracteacuteristiques du milieu environnant dans les premiegraveres semaines de vie des poissons En effet plusieurs lots drsquoune mecircme souche de saumon de fontaine soumis degraves lrsquoeacuteclosion agrave des conditions de vie diffeacuterentes montrent des diffeacuterences dans le deacuteveloppement des nageoires Ainsi degraves les premiegraveres semaines les poissons exposeacutes agrave un fort courant sont pourvus de nageoires plus longues

Il est donc possible que les alevins produits en pisciculture nrsquoeacutetant pas exposeacutes agrave des courants importants au cours de leurs premiegraveres semaines de vie deacuteveloppent des nageoires pectorales moins longues que les individus sauvages

Il y a probablement pour cette caracteacuteristique morphologique des interactions combinant geacuteneacutetique et conditions environnementales

Cette diffeacuterence morphologique peut eacutegalement avoir une importance dans la compeacutetition entre poissons sauvages et introduits notamment au stade juveacutenile En effet GIBSON (1973) a deacutemontreacute limportance des nageoires dans la compeacutetition interspeacutecifique

36

entre le saumon atlantique (Salmo salar L) et le saumon de fontaine (Salvenius fontinalis) deux poissons consommant la mecircme nourriture Le fait de posseacuteder des nageoires pectorales plus deacutevelopper permet au saumon atlantique de se maintenir dans les courants pour se nourrir tout en deacutepensant moins drsquoeacutenergie

Dans le cas des torrents haut-savoyards une compeacutetition intraspeacutecifique entre truites sauvages et introduites comparable agrave leacutetude de GIBSON peut se deacutevelopper La diffeacuterence morphologique entre les truites sauvages et issues du repeuplement peut donc avoir une influence lors de la compeacutetition entre ces deux types dindividus

37

3 Premiegraveres implications pour la gestion

En fonction des reacutesultats obtenus lors de la campagne de preacutelegravevements 2002 des orientations de gestion sont proposeacutees pour chaque riviegravere eacutetudieacutee Certaines propositions impliquent des changements relativement importants des pratiques actuelles de gestion

Lrsquoeacutetude de lrsquoefficaciteacute des repeuplements srsquoappuient sur une deacutemarche scientifique rigoureuse dans lrsquointeacuterecirct des gestionnaires directs (AAPPMA) puisqursquoelle permet agrave ces derniers de prendre des deacutecisions en srsquoappuyant sur des reacutesultats concrets et indiscutables Elle est conduite dans un souci drsquoeacutevaluer en toute objectiviteacute les pratiques drsquoalevinage dans le seul but drsquoameacuteliorer la gestion actuelle des populations et des milieux Concregravetement elle permet de connaicirctre rapidement les zones ougrave lrsquoalevinage en truite fario est inefficace et donc inutile et les zones ougrave celui-ci est efficace et donc neacutecessaire

En plus des reacutesultats obtenus gracircce aux marquages des juveacuteniles les propositions prennent en compte les premiers reacutesultats issus des pecircches de sondage drsquoadultes reacutealiseacutees pour le programme INTERREG (reacutedaction en cours) Lrsquointeacutegration des diffeacuterentes donneacutees (marquage juveacutenile + adultes) permet de faire des propositions coheacuterentes selon un diagnostic le plus complet possible de la population de truite preacutesente

31 Bassin du Borne

Sur les riviegraveres du bassin du Borne les orientations de gestion proposeacutees ci-apregraves restent conformes agrave celles deacutejagrave eacutevoqueacutes par CAUDRON et CHAMPIGNEULLE (2002)

Arrecirct du repeuplement selon les pratiques actuelles sur lrsquoensemble du cours principal Cette proposition est motiveacutee par deux principales raisons

- Lrsquoalevinage est inefficace agrave lrsquoamont du seuil drsquoEntremont car apregraves plus de 15 ans il nrsquoa pas permis drsquoinstaller une population en place eacutequilibreacutee

- Il semble impeacuteratif de preacuteserver lrsquoimportante population de truite sauvage preacutesente agrave lrsquoaval du seuil drsquoEntremont Les reacutesultats geacuteneacutetiques indiquent que la population preacutesente est une population sauvage qui nrsquoa pas eacuteteacuteimplanteacutee suite agrave lrsquoalevinage Elle preacutesente un degreacute de pureteacute geacuteneacutetique important Cette population repreacutesente un patrimoine unique dans le Faucigny Le but drsquoarrecircter les alevinages sur ce secteur est drsquoeacuteviter les hybridations qui peuvent entraicircner une perte de plasticiteacute geacuteneacutetique et une deacutegeacuteneacuterescence de la souche sauvage actuelle

Arrecirct du repeuplement sur lrsquoaval de lrsquoOveacuteran Ce secteur est utiliseacute comme zone de reproduction par les geacuteniteurs du Borne et la reproduction naturelle y est abondante Lrsquoalevinage nrsquoest donc pas neacutecessaire et risque comme sur le Borne de provoquer une hybridation de la population naturelle

Essayer drsquoinstaller une population naturelle agrave lrsquoamont du seuil drsquoEntremont par transferts de geacuteniteurs

Sur les autres affluents deux sceacutenarii de gestion peuvent ecirctre envisageacutes selon la volonteacute politique des gestionnaires directs

Sceacutenario ndeg1 vision patrimoniale

38

- Arrecirct du repeuplement en truite drsquoorigine Atlantique pendant 3 anneacutees conseacutecutives pour diminuer leur preacutesence sur le bassin

- Puis reprise de lrsquoalevinage pendant uniquement 3 anneacutees agrave partir de poissons sauvages issus du Borne pour essayer drsquoinstaller une population naturelle

Sceacutenario ndeg2 vision halieutique- Maintien des pratiques drsquoalevinage en atlantique pour soutenir

artificiellement le stock de poissons dans un inteacuterecirct uniquement halieutique Attention cette pratique risque de provoquer par deacutevalaison des individus introduits une hybridation des poissons sauvages preacutesents dans le Borne

Eventuellement repeuplement en truites Arc en Ciel surdensitaires sur des secteurs preacutecis du Borne pendant la peacuteriode estivale afin de contenter une certaine cateacutegorie de pecirccheurs Les repeuplements en Arc en Ciel ne risquent pas de provoquer drsquohybridation de la souche fario locale Attention prendre des preacutecautions aupregraves des fournisseurs concernant la qualiteacute sanitaire des poissons

32 Bassin du Giffre

Les propositions sur le bassin du Giffre prennent en compte les reacutesultats du marquage mais eacutegalement la situation actuelle de la riviegravere suite agrave lrsquoeacuteboulement de Sixt Fer agrave Cheval

Ne pas aleviner le cours principal du Giffre en alevins de fario pendant 5 anneacutees conseacutecutives Cette proposition est motiveacutee par les raisons suivantes

- Il est impossible de savoir comment va eacutevoluer dans les prochains mois et les prochaines anneacutees le glissement agrave lrsquoamont de Sixt Il semble donc risqueacute drsquoentreprendre un alevinage pour installer une nouvelle population

- Les reacutesultats des marquages sur le Giffre sont tregraves contrasteacutes Sauf au niveau de Sixt ils montrent qursquoil existait avant le glissement une reproduction naturelle importante et capable de soutenir une population

- Les reacutesultats geacuteneacutetiques reacutecents indiquent que les populations en place sont en majoriteacute drsquoorigine atlantique mais qursquoil existe encore des individus meacutediterraneacuteens non hybrideacutes jusque dans les zones amont Ces reacutesultats prouvent qursquohistoriquement la souche meacutediterraneacuteenne eacutetait bien preacutesente sur lrsquoensemble du Giffre

- Il est envisageable que cette souche sauvage eacutegalement preacutesente sur les parties basses des affluents recolonise naturellement le Giffre

- Lrsquoexemple du Borne montre qursquoapregraves une catastrophe la riviegravere a eacuteteacute recoloniseacutee par une souche sauvage malgreacute des alevinages massifs Les reacutesultats obtenus sur cette riviegravere doivent servir de base de reacuteflexions pour la nouvelle gestion agrave entreprendre sur le Giffre

- Entre le Risse et Marignier la population de truites avant le glissement eacutetait deacutejagrave totalement deacuteseacutequilibreacutee et en quasi disparition (peu de juveacuteniles quasi absence de geacuteniteurs et absence de classes drsquoacircges intermeacutediaires) malgreacute les alevinages massifs sur ce secteur

39

Reacutealiser un bilan de lrsquoimpact du glissement de terrain sur le peuplement piscicole

- Une eacutetude piscicole sera reacutealiseacutee tregraves prochainement (2004 ou 2005) sur le Giffre dans le cadre du contrat de riviegravere Cette eacutetude permettra de faire un premiereacutetat des lieux complet du peuplement piscicole suite au glissement

Accomplir un diagnostic de lrsquoeacutetat de recolonisation du Giffre par les populations naturelles

- En lrsquoabsence drsquoalevinage il sera possible de reacutealiser en 2008 un bilan des populations de truites installeacutees sur le Giffre

- A partir de lrsquoeacutetat de la population agrave cette eacutepoque un plan drsquoalevinage coheacuterent en truite fario pourra ecirctre eacutetabli pour permettre drsquoinstaller de nouvelles populations ou de soutenir des populations preacutesentes

Mettre en place des deacuteversements de truites Arc en Ciel pendant toute la peacuteriode drsquoarrecirct de lrsquoalevinage en fario Attention prendre des preacutecautions aupregraves des fournisseurs concernant la qualiteacute sanitaire des poissons

Reacuteintroduire lrsquoOmbre commun sur la plaine de Samoeumlns et agrave lrsquoaval de la confluence avec le Risse

Arrecirct de lrsquoalevinage sur lrsquoensemble du Risse sur lrsquoaval du Foron de Mieussy et sur lrsquoEtroit Denteacutee

- Sur ces riviegraveres le suivi du marquage a montreacute que lrsquoalevinage nrsquoeacutetait pas neacutecessaire pour soutenir les populations de truites preacutesentes

Maintenir lrsquoalevinage sur lrsquoamont du Foron de Mieussy (vers Sommand) et lrsquoamont du Foron de Taninges (Bonnavaz)

- Sur ces secteurs le suivi du marquage a montreacute que les juveacuteniles preacutesents dans le milieu naturel eacutetaient en majoriteacute des individus introduits

33 Le Foron du Reposoir

Les propositions de gestion sur le Foron du Reposoir sont

Maintenir les alevinages actuels avec la souche Chazey Bons Rhodanienne

Suivre lrsquoeacutevolution de la population pour savoir si cet alevinage permet drsquoinstaller une population fonctionnelle

- Ce suivi peut comprendre des pecircches de sondages en deacutebut de peacuteriode de reproduction pour voir si les poissons adultes deviennent matures des releveacutes de frayegraveres sur la riviegravere pour savoir si les poissons se reproduisent et de nouveaux preacutelegravevements de poissons pour suivre lrsquoeacutevolution du taux de marqueacutes dans la population

34 Bassin de la Filliegravere

Les orientations pour une gestion coheacuterente des populations de la Filliegravere sont les suivantes

40

Arrecirct de lrsquoalevinage sur le cours principal de la Filliegravere sur le Crenant et sur lrsquoaval du Flan

- Sur ces 3 riviegraveres lrsquoalevinage nrsquoest pas neacutecessaire car il ne permet pas de soutenir les populations preacutesentes et de plus la reproduction naturelle est tregraves importante

- Sur la Filliegravere les pecircches drsquoadultes dans le cadre du programme INTERREG ont mis en eacutevidence la preacutesence drsquoune population sauvage drsquoorigine meacutediterraneacuteenne Il semble important drsquoentreprendre une mesure de conservation de cette souche en arrecirctant lrsquoalevinage pour eacuteviter lrsquohybridation

- Sur lrsquoamont du Flan il est neacutecessaire de continuer le suivi des poissons marqueacutes pour savoir si lrsquoalevinage doit ecirctre maintenu

Sur le Daudens deux sceacutenarii de gestion peuvent ecirctre envisageacutes selon la volonteacute politique des gestionnaires directs

Sceacutenario ndeg1 vision patrimoniale- Arrecirct du repeuplement en truite drsquoorigine Atlantique pendant 3 anneacutees

conseacutecutives pour diminuer leur preacutesence sur le bassin- Commencer les proceacutedures afin de rendre le seuil du Plot

franchissable pour les geacuteniteurs de la Filliegravere- Reacutealiser un bilan notamment deacutemographique de la population en place

apregraves lrsquoarrecirct de lrsquoalevinage- Puis reprise de lrsquoalevinage pendant uniquement 3 anneacutees agrave partir de

poissons sauvages issus de la Filliegravere pour essayer drsquoinstaller une population naturelle

Sceacutenario ndeg2 vision halieutique- Maintien des pratiques drsquoalevinage en atlantique pour soutenir

artificiellement le stock de poissons dans un inteacuterecirct uniquement halieutique Attention cette pratique risque de provoquer par deacutevalaison des individus introduits une hybridation des poissons sauvages preacutesents dans la Filliegravere

35 Le Foron de Fillinges

Les reacutesultats obtenus sur le Foron de Fillinges ont conduit agrave formuler les propositions de gestion suivantes

Arrecirct de lrsquoalevinage sur lrsquoensemble du Foron de Fillinges- Quelque soit la souche utiliseacutee et les quantiteacutes introduites les poissons

alevineacutes ne repreacutesentent qursquoune tregraves faible minoriteacute des poissons preacutesents dans le milieu Le Foron abrite une population naturelle fonctionnelle et eacutequilibreacutee

Suivi de la population suite agrave lrsquoarrecirct du repeuplement- Reacutealisation de 5 stations de pecircches eacutelectriques la derniegravere anneacutee de

lrsquoalevinage afin de reacutealiser un eacutetat des lieux preacutecis de la population de truites et du peuplement piscicole

- Reacutealisation drsquoun nouveau bilan de la population du Foron respectivement 3 ans puis 6 ans apregraves lrsquoarrecirct de lrsquoalevinage

41

4 Investigations suppleacutementaires

Suite aux premiers reacutesultats obtenus lors de la campagne 2002 des investigations suppleacutementaires permettant de preacuteciser certains points seront reacutealiseacutees

Reacutealiser une analyse bacteacuteriologique des diffeacuterents lots de poissons alevineacutes qui ont transiteacutes dans les piscicultures associatives Cette recherche de pathologie permettra de savoir si les poissons issus de pisciculture sont porteurs drsquoune maladie bacteacuterienne avant drsquoecirctre introduits dans le milieu ou si ils contractent la maladie dans le milieu naturel

Rechercher les raisons pour lesquelles on nrsquoobserve pas drsquoalevins naturels sur certains secteurs Les causes drsquoune telle situation peuvent ecirctre

- Lrsquoabsence totale de geacuteniteurs dans la population Les poissons nrsquoont pas le temps de devenir adulte (3+) et sont captureacutes avant par les pecirccheurs

- La preacutesence drsquoadultes non matures Les poissons deviennent adultes mais sont immatures (eacutetat sanitaire des poissons souche geacuteneacutetiquement deacutegeacuteneacutereacutee)

- Survie nulle durant la phase de vie sous graviers Les poissons pondent mais les œufs nrsquoarrivent pas agrave se deacutevelopper et la mortaliteacute est totale

Sur les secteurs du Chinaillon de la Duche de lrsquoOveacuteran amont et du Foron de Mieussy amont (Sommand) les actions suivantes peuvent ecirctre entreprises

- Pecircches eacutelectriques de sondage en deacutebut de la peacuteriode de reproduction pour savoir si les poissons deviennent matures

- Releveacutes de frayegraveres permettant drsquoobserver ou non une activiteacute de reproduction- Mise en place drsquoincubateurs-tests contenant des œufs de truites pour connaicirctre le taux

de survie des œufs dans les frayegraveres

Reacutealiser des preacutelegravevements suppleacutementaires aux classes drsquoacircge supeacuterieures (1+ et 2+) sur certaines stations pour voir lrsquoeacutevolution du taux de marqueacutes au cours des anneacutees Ces recherches suppleacutementaires peuvent ecirctre effectueacutees sur 8 cours drsquoeau ougrave le taux de marqueacutes deacutepasse 60 au stade 0+

Le ruisseau de la Duche amontLe ruisseau du Chinaillon amontLe Foron du ReposoirLe Risse avalLe Foron de Taninges amont (Bonnavaz)Le Foron de Mieussy amont (Sommand)Le Daudens amont et avalLe Flan amont

Dans les eacutetudes preacuteceacutedentes reacutealiseacutees sur le Fier (CAUDRON et CHAMPIGNEULLE 2002) et sur le Doubs (CHAMPIGNEULLE et al 2002) les taux de marqueacutes aux stades 1+ et 2+ dans la population en place srsquoeffondraient et devenaient tregraves faibles ou nuls

Pour informations le graphique suivant montre lrsquoeacutevolution du taux de marqueacutes agrave diffeacuterents stades sur les stations ougrave le taux de 0+ marqueacutes eacutetait eacuteleveacute

42

Les reacutesultats montrent agrave part pour une station une chute importante des taux de marqueacutes entre les stades 0+ et 1+ Cette chute se poursuit eacutegalement au stade 2+Ces reacutesultats obtenus sur le Fier et le Doubs semblent laisser peu drsquoespoirs sur le devenir des poissons marqueacutes sur les bassins eacutetudieacutes en 2002

Reacutesultats sur leacutevolution du taux de m arqueacutes aux diffeacuterents stades obtenus lors des eacutetudes preacuteceacutedentes sur le Fier et le Doubs

0102030405060708090

100

0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 0+ 1+ 0+ 1+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+

Station A Station B Station C StationD

StationE

StationF

Station A Station B StationC

Stations et stades

Pou

rcen

tage

de

mar

queacutes

Le Fier Le Doubs

Reacutesultats sur leacutevolution du taux de m arqueacutes aux diffeacuterents stades obtenus lors des eacutetudes preacuteceacutedentes sur le Fier et le Doubs

0102030405060708090

100

0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 0+ 1+ 0+ 1+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+

Station A Station B Station C StationD

StationE

StationF

Station A Station B StationC

Stations et stades

Pou

rcen

tage

de

mar

queacutes

Le Fier Le Doubs

43

BIBLIOGRAPHIE

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14

Sur les Affluents

Sur les 3 affluents eacutetudieacutes la situation est tregraves simple En effet soit on observe 0 de marqueacutes soit 100

- Sur lrsquoOveacuteran aval aucun poisson marqueacute nrsquoa eacuteteacute trouveacute puisqursquoil nrsquoy a pas eu de repeuplement sur ce secteur en 2002 Le reacutesultat obtenu montre une importante reproduction naturelle des geacuteniteurs du Borne qui remontent sur lrsquoaval de ce cours drsquoeau

- Sur la Duche et le Chinaillon il y a absence totale de reproduction naturelle puisque 100 des 0+ eacutechantillonneacutes sont marqueacutes Pourtant on observe de nombreux poissons adultes sur ces secteurs susceptibles drsquoecirctre des geacuteniteurs ainsi que diffeacuterentes classes drsquoacircge Lrsquoeacutequilibre de ces populations est artificiellement maintenu par les alevinages

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

- Toutes les stations eacutetudieacutees ne sont pas concerneacutees par ces symptocircmes de maladies- Les maladies bacteacuteriennes semblent toucher majoritairement les poissons introduits- Cependant les 0+ de lrsquoOveacuteran aval tous naturels sont infecteacutes agrave 15 Ce reacutesultat

peut refleacuteter une contamination par deacutevalaison provenant drsquoindividus atteints situeacutes plus en amont de lrsquoOveacuteran ou une contamination naturelle par des agents pathogegravenes preacutesents dans le milieu

- Les poissons marqueacutes peuvent ecirctre contamineacutes agrave un taux non neacutegligeable pouvant atteindre plus de 30

Pourcentage dindividus preacutesentant des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

0

10

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GrandBornand

Les Etroits Entremont Beffay St Pierre enF

Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Chinaillon La Duche LOveacuteran

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

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Pourcentage dindividus preacutesentant des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

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Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Le sexe ratio est relativement eacutequilibreacute pour les marqueacutes comme pour les non marqueacutes Seule une station sur le Borne (Beffay) montre 85 de macircle dans la population de 0+

- Seules 2 stations montrent des macircles matures au stade 0+- Le pourcentage de macircles matures au stade 0+ est plus important chez les non

marqueacutes que chez les marqueacutes

Pourcentage de macircles au stade 0+

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Pourcentage de macircles matures au stade 0+

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Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Borne

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Pourcentage de macircles au stade 0+

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Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Borne

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

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212 Le Giffre

Sur le bassin du Giffre 6 stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal et 7 sur des affluents Au total ce sont 536 poissons 0+ qui ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

Sur le cours principal

La carte de synthegravese des reacutesultats met en eacutevidence des taux de marqueacutes tregraves contrasteacutes variant entre 0 et 100 Sauf deux cas particuliers la campagne de preacutelegravevements a permis de montrer qursquoune reproduction naturelle existait sur lrsquoensemble du Giffre

Il est possible de distinguer trois zones successives sur ce cours deau

La zone aval est composeacutee de la station Pont du Giffre ougrave le taux de marqueacutes est de 74 Cette station sur le Giffre doit ecirctre rapprocheacutee des stations eacutetudieacutees sur le Risse (station laquo Risse aval St Jeoire raquo) et le Hisson(laquo station La Pallud raquo) pour mieux comprendre le fonctionnement de la population

- Sur le Giffre aval la situation semble tregraves critique La station dite laquo Pont du Giffre raquosrsquoeacutetend de lrsquoamont de Marignier agrave lrsquousine du Pont du Giffre soit sur environ 25 km Sur cette distance seulement 31 0+ ont pu ecirctre captureacutes De plus les pecircches drsquoadultes dans le cadre drsquoInterreg montrent un deacuteficit inquieacutetant de geacuteniteurs sur ce secteur ainsi qursquoune surabondance de Chabot La situation du bas Giffre montre une population de truitetotalement deacuteseacutequilibreacutee loin du potentiel de la riviegravere et qui ne peut pas ecirctre reacutehabiliteacutee par le seul fait de lrsquoalevinage Cette situation peut ecirctre le reacutesultat du faible deacutebit reacuteserveacute qui appauvrit lrsquohabitat aquatique et provoque des eacuteleacutevations de tempeacuterature inquieacutetantes Les reacutesultats de pecircche drsquoinventaire dans la reacuteserve de Marignier montrent que les poissons sont concentreacutes agrave lrsquoaval immeacutediat des seuils ougrave lrsquoon note la preacutesence de fosses de tempeacuteratures plus faibles et drsquoune meilleure oxygeacutenation

La zone moyenne situeacutee entre le barrage de Mieussy et Samoeumlns qui est composeacutee des stations laquo aval barrage Taninges raquo laquo Theacuteziegraveres raquo et laquo Montessuit raquo Sur ce secteur les 0+ marqueacutes sont en minoriteacutes puisqursquoils repreacutesentent 11 agrave 38 du peuplement

- Sur le Giffre aval barrage de Taninges le secteur nrsquoest pas alevineacute il est donc normal que pregraves de 90 des poissons ne soient pas marqueacutes Les 0+ marqueacutes proviennent certainement du ruisseau de lrsquoEtroit Denteacute qui est fortement alevineacute et agrave partir duquel une deacutevalaison doit avoir lieu- Le secteur des laquo Theacuteziegraveres raquo et de laquo Montessuit raquo bien que reacuteguliegraverement alevineacute montre un taux important drsquoalevins naturels (62 agrave 77) Ce reacutesultat est tout agrave fait en accord avec le suivi de la reproduction naturelle et le recensement de frayegraveres reacutealiseacute par lrsquoAAPPMA du Faucigny et le CSP en 1999 En effet de nombreuses frayegraveres naturelles avaient eacuteteacute observeacutees sur ce site Le peuplement drsquoadultes nrsquoest pas tregraves important mais est en rapport avec les potentialiteacutes du milieu

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La zone amont caracteacuteriseacutee par les stations laquo Reveacute-Peacuteret raquo et laquo amont Tines raquo ougrave le taux de marqueacutes varie de 70 agrave 79

- Pour ces deux stations la population de juveacuteniles est faible et ils sont majoritairement marqueacutes Cependant au stade adulte les pecircches Interreg montrent une majoriteacute de poissons drsquoorigine meacutediterraneacuteenne La forte contribution de poissons introduits au stade 0+ ne semble pas se retrouver au stade adulte Les conditions de vie dans ce milieu sont tregraves difficiles et ne permettent pas drsquoatteindre des densiteacutes de poissons importantes

Sur les Affluents

Le Risse - Le Hisson montre une majoriteacute drsquoalevins naturels alors que les preacutelegravevements ont eacuteteacute reacutealiseacutes seulement deux mois apregraves le repeuplement Ce cours drsquoeau possegravede un fort potentiel de frai qui est utiliseacute notamment par les geacuteniteurs du Risse- Sur lrsquoaval du Risse le taux de marqueacutes est de 68 Il est le reflet drsquoun alevinage en quantiteacute importante sur le secteur (10 000 alevins) Les alevins naturels repreacutesentent tout de mecircme plus de 30 trois mois apregraves le repeuplement De plus les eacutechantillonnages drsquoadultes reacutealiseacutes sur ce secteur dans le cadre drsquoInterreg ont mis en eacutevidence une quantiteacute importante de geacuteniteurs sauvages La population sur ce secteur est agrave mettre en eacutevidence avec celle du Hisson puisque certains geacuteniteurs du Risse y migrent pour se reproduireLa population sur ce secteur est naturellement fonctionnelle

Le Foron de Mieussy - La station laquo Andelier raquo situeacutee en amont du Foron preacutesente 100 de marqueacutes Cette situation montre une absence totale de reproduction naturelle Le milieu est extrecircmement deacutefavorable agrave lrsquoinstallation drsquoune population fonctionnelle en raison du faible deacutebit de la riviegravere (assegravechement reacutegulier) Aucune classe drsquoacircge intermeacutediaire et aucun adulte nrsquoa eacuteteacute observeacute sur ce secteur Les poissons alevineacutes sont certainement victimes des assegravechements- La station laquo Trebiet raquo situeacutee plus en aval preacutesente au contraire 0 de marqueacutes alors que cette zone a eacuteteacute alevineacutee Ce reacutesultat montre la capaciteacute du Foron sur ce secteur a accueillir une population fonctionnelle Il existe une reproduction naturelle importante sur cette zone avec eacutegalement beaucoup de geacuteniteurs- Vers Sommand une pecircche de sondage a eacuteteacute reacutealiseacutee mais aucun alevin nrsquoa eacuteteacute preacuteleveacute puisque cette zone nrsquoa pas eacuteteacute alevineacutee en 2002 Cependant les reacutesultats de ce sondage mettent en eacutevidence une absence totale de reproduction naturelle (aucun alevin naturel nrsquoa eacuteteacute trouveacute) alors que la population semble eacutequilibreacutee (preacutesence drsquoadultes et de truitelles drsquoacircge intermeacutediaire)

LrsquoEtroit Denteacute Globalement le taux de marqueacutes sur les deux stations eacutetudieacutees est faible (11 agrave 33)- Sur la station laquo aval route raquo la majoriteacute des alevins est naturelle Cette zone montre un habitat tregraves favorable pour la reproduction des geacuteniteurs qui remontent du Giffre- Sur la station laquo amont route raquo une population fonctionnelle de pheacutenotype meacutediterraneacuteen est installeacutee De nombreux geacuteniteurs sont preacutesents et le recrutement naturel est important

19

Le Foron de Taninges - En amont (station Bonnavaz) le taux de marqueacutes est tregraves important (95) Il existe donc une reproduction naturelle mais insuffisante pour permettre lrsquoinstallation drsquoune population et maintenir une activiteacute halieutique Les alevinages passeacutes nrsquoont pas permis drsquoinstaller une population fonctionnelle dans cette zone apicale- Plus en aval sur les zones non alevineacutees les pecircches eacutelectriques drsquoinventaire et de sondage reacutealiseacutees ont montreacute la preacutesence drsquoune population eacutequilibreacutee de pheacutenotype meacutediterraneacuteen avec une importante reproduction naturelle

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

Les principales remarques concernant les pathologies observeacutees sur le bassin du Giffre sont

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

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Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Giffre

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Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Giffre

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- La PKD est preacutesente sur le cours du Giffre mais uniquement agrave lrsquoaval du barrage de Taninges Cette situation est agrave mettre en relation avec le deacutebit reacuteserveacute insuffisant qui entraicircne une augmentation de tempeacuterature pendant la peacuteriode estivale

- Sur les affluents la PKD a eacuteteacute observeacutee sur les secteurs preacutesentant des faibles deacutebits estivaux (aval du Risse et Foron de Mieussy Andelier) qui sont certainement responsables drsquoune augmentation de tempeacuterature

- La PKD atteint agrave la fois les poissons introduits que les poissons naturels- Le pourcentage drsquoindividus toucheacutes par la PKD varie drsquoun site agrave lrsquoautre mais peut

atteindre une valeur importante avec 50 sur certain secteur- Les maladies bacteacuteriennes sont plus freacutequentes chez les individus marqueacutes Soit ces

poissons sont plus fragiles que les poissons naturels et contractent les maladies plus facilement soit les maladies sont contracteacutees en pisciculture pendant lrsquoeacutelevage

- Le pourcentage drsquoindividus toucheacutes par des symptocircmes bacteacuteriens nrsquoest pas neacutegligeable puisqursquoil peut atteindre 20

- Lrsquoensemble des stations eacutetudieacutees est toucheacute par des symptocircmes de maladies bacteacuteriennes ce qui laisse penser que lrsquoensemble du bassin peut ecirctre atteint

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

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21

- Le sexe ratio apparaicirct globalement eacutequilibreacute sur lrsquoensemble des stations du Giffre- On observe des diffeacuterences entre les poissons introduits et les poissons naturels sur

seulement 3 stations Ces diffeacuterences sont en faveur des poissons marqueacutes qui montrent un pourcentage de macircles plus important

- Une maturiteacute sexuelle preacutecoce des macircles existe sur certaines stations quelle que soit lrsquoorigine des poissons

- Cette maturiteacute peut ecirctre importante et concerner jusqursquoagrave 20 des 0+

22

213 Le Foron du Reposoir

Deux stations (La Touviegravere et Le Reposoir) ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le Foron du Reposoir Seulement 15 0+ ont eacuteteacute eacutetudieacutes en raison principalement de la difficulteacute drsquoeacutechantillonner des poissons de petite taille (6-7 cm) sur ces milieux torrentiels

Le taux de marqueacutes

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23

- Sur les deux stations eacutetudieacutees le taux de marqueacutes est de 100 Lrsquoensemble des 0+ mecircme si le nombre est faible est donc issu de lrsquoalevinage Ce cours drsquoeau fait lrsquoobjet actuellement drsquoun essai drsquoimplantation drsquoune population agrave partir de la souche Chazey-Bons Rhodanienne Cette souche provient de geacuteniteurs de la riviegravere Furan (Ain) Des analyses geacuteneacutetiques reacutecentes reacutealiseacutees par analyse de microsatellites diagnostic de lrsquoADN ont montreacute que ces poissons ont un pourcentage dallegraveles meacutediterraneacuteens voisin de 65

Ce reacutesultat montre que le cours deau avait un niveau de population tregraves faible avant le repeuplement par la souche Chazey-Bons sauvagesDe plus les pecircches drsquoinventaires du CSP et les pecircches de sondage Interreg montrent qursquoune population de truites se met progressivement en place En effet on observe chaque anneacutee despoissons agrave des stades de plus avanceacutes et les captures par pecircche agrave la ligne commencent agrave ecirctre effectivesLes pecircches eacutelectriques reacutealiseacutees agrave lrsquoautomne 2002 indique que le stock de geacuteniteurs est en cours de reconstitution mais que les truites femelles nrsquoont pas encore atteint le stade geacuteniteurIl nrsquoest donc pas encore possible de dire si lrsquohabitat et la population du Foron du Reposoir sont propices agrave lrsquoinstallation drsquoune population naturellement fonctionnelle

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

Aucun symptocircme reacutenal et heacutemorragique nrsquoapparaicirct sur les 0+ eacutechantillonneacutes sur ce cours deau

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Le sexe ratio est eacutequilibreacute puisqursquoil varie de 50 agrave 60- Il nrsquoy a aucun macircle mature au stade 0+ dans les eacutechantillons preacuteleveacutes sur ce cours

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

24

214 La Filliegravere

Cinq stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal de la Filliegravere ainsi que sept stations sur les trois affluents principaux (Flan Creacutenant et Daudens) Au total 582 poissons 0+ ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

Sur le cours principal

Pour les 5 stations eacutetudieacutees sur le cours principal le taux de 0+ marqueacutes varie de 4 agrave 56 il est donc de tregraves faible agrave moyen et montre une forte reproduction naturelle sur toute la riviegravere Il y a un gradient amont-aval du taux de marqueacutes avec un pourcentage de poissons marqueacutes plus important en amont Cependant sur lrsquoensemble de la Filliegravere le recrutement naturel est dominant et constitue lrsquoessentiel de la population de truite

De plus les pecircches de sondages pour Interreg ont montreacute la preacutesence de nombreux drsquoadultes drsquoorigine naturelle meacutediterraneacuteenne Ceci confirme que la population de truite de la riviegravere principale est naturellement fonctionnelle

Sur les affluents

Les reacutesultats sont diffeacuterents selon que lrsquoaffluent est en connexion ou non avec la riviegravere principale

- Sur le Flan on observe en zone aval et meacutediane (stations laquo D 55 raquo et laquo Bruchon raquo) des taux de marqueacutes faibles (38 et 27) qui mettent en eacutevidence la preacutesence drsquoune forte reproduction naturelle notamment de poissons migrants de la Filliegravere Les releveacutes de frayegraveres reacutealiseacutes par lrsquoAAPPMA avaient deacutejagrave permis drsquoobserver de nombreuses frayegraveres naturelles sur ce secteurEn zone plus amont station laquo Molliet raquo le taux de marqueacutes est plus important (73) il met en eacutevidence la preacutesence drsquoun recrutement naturel mais qui reste au stade 0+ minoritaire par rapport aux individus introduits

- Sur le Daudens les deux stations (laquo Le Plot raquo et Daudens raquo) montrent des taux de marqueacutes importants (86 et 92) La reproduction naturelle est donc tregraves faible et la population de truite ne semble pas fonctionnelle Lrsquoobstacle agrave lrsquoaval de la route deacutepartementale semble preacutejudiciable car il ne permet pas aux geacuteniteurs de la Filliegravere de remonter sur le Daudens et drsquoinstaller une population fiable

- Sur le Crenant Les deux stations eacutechantillonneacutees (laquo aval raquo et Disonche raquo) ne sont pas situeacutees sur des zones alevineacutees en 2002 et il est normal de trouver 0 de marqueacutes Cependant ces reacutesultats montrent qursquoil y a une forte reproduction naturelle sur ce cours drsquoeau mecircme en zone amont et que la population semble naturellement fonctionnelle Les alevins introduits sur le Crenant ne semblent pas avoir deacutevaleacutes sur pour coloniser lrsquoaval du Crenant

25

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26

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

- La PKD semble quasiment absente du bassin de la Filliegravere sauf preacutesence anecdotique uniquement chez les non marqueacutes sur une station (laquo Millard raquo)

- Les individus marqueacutes ne sont pas toucheacutes par la PKD- Les maladies bacteacuteriennes sont preacutesentes sur lrsquoensemble du bassin mais touchent en

prioriteacute et majoritairement les individus marqueacutes

Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

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Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

Pourcentage dindividus preacutesentant les symptocircmes de la maladie PKD

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

27

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Sur lrsquoensemble des stations le sexe ratio est eacutequilibreacute il montre une plus grande variation chez les individus marqueacutes

- Des macircles matures au stade 0+ ont eacuteteacute observeacutes sur trois stations uniquement chez les individus naturels

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

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Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin de la Filliegravere

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

28

215 Le Foron de Fillinges

Trois stations ont eacuteteacute eacutechantillonneacutees sur le cours principal du Foron de Fillinges agrave savoir de lrsquoamont vers lrsquoaval laquo Bovet ndash Boex raquo laquo Pont de Fillinges raquo et laquo Couvette raquo Au total 178 poissons 0+ ont eacuteteacute eacutetudieacutes

Le taux de marqueacutes

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29

Sur les 3 stations eacutetudieacutees les taux de marqueacutes sont faibles agrave tregraves faibles- Sur la station laquo Bovet ndash Boex raquo le taux de marqueacutes est de seulement 31- A lrsquoaval sur les stations laquo Pont de Fillinges raquo et laquo Couvette raquo les taux de marqueacutes

sont respectivement de 0 et 2

Les reacutesultats indiquent la preacutesence drsquoune importante reproduction naturelle sur lrsquoensemble du Foron de Fillinges Quelque soit la souche utiliseacutee pour lrsquoalevinage atlantique dans le secteur Faucigny ou Meacutediterraneacuteenne Pont de Gys dans le secteur Chablais les poissons introduits restent minoritaires

Cette situation traduit la preacutesence drsquoune population bien installeacutee et fonctionnelle sur cette riviegravere

Pathologies et eacutetat sanitaire des 0+

Pathologies observeacutees au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

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30

- Sur lrsquoensemble des stations des individus 0+ sont atteints par la PKD le pourcentage drsquoindividus malades peut atteindre 35

- Seuls les individus sauvages semblent toucheacutes par la PKD cependant le nombre drsquoindividus introduits est trop faible pour permettre une comparaison

- Toutes les stations sont eacutegalement toucheacutees par les maladies bacteacuteriennes avec des taux de contamination variant de 15 agrave 30

- Les maladies bacteacuteriennes touchent agrave la fois les individus introduits et les individus naturels

Sexe et maturiteacute sexuelle des 0+

- Le sexe ratio apparaicirct eacutequilibreacute sur lrsquoensemble des stations- On observe des macircles matures degraves le stade 0+ sur lrsquoensemble des stations- Le taux de macircles matures au stade 0+ peut atteindre 15

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

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0

102030405060

708090

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Pourcentage de macircles matures au stade 0+

05

101520253035404550

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Sexe ratio et maturiteacute sexuelle au stade 0+ sur les stations drsquoeacutetude du bassin du Foron de Fillinges

Pourcentage de macircles au stade 0+

0

102030405060

708090

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Pourcentage de macircles matures au stade 0+

05

101520253035404550

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

31

22Caracteacuteristiques morphologiques

221 Longueur totale des individus

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Giffre

0

20

40

60

80

100

120

140Am

ont

Tine

s

Rev

eacute-Peacute

ret

Mon

tess

uit

Theacutez

iegravere

s

Aval

barr

age

Tani

nges

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Bonn

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tro

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Aval

rout

e

Ande

lier

Treb

iet

La P

allu

d

Aval

St

Jeoi

re

LeGiffre

LeGiffre

LeGiffre

LeGiffre

LeGiffre

LeGiffre

Le FdeTaninges

LEtroitDenteacute

LEtroitDenteacute

Le F deMieussy

Le F deMieussy

LeHisson

Le Risse

Long

ueur

tota

le e

n m

m

Taille moyenne des 0+ sur le Borne

0

20

40

60

80

100

120

140

GrandBornand

Les Etroits Entremont Beffay St Pierre en F

Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Chinaillon La Duche LOveacuteran

Long

ueur

tota

le e

n m

m

Taille moyenne des 0+ sur la Filliegravere

0

20

40

60

80

100

120

140

Le J

ourd

il

Pisc

icul

ture

Milla

rd

Long

cham

ps

D55

Bruc

hon

Mol

liet

Le

Plot

Dau

dens

Aval

Dis

onch

e

La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere Le Flan Le Flan Le Flan LeDaudens

LeDaudens

LeCrenant

LeCrenant

Long

ueur

tota

le e

n m

m

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Giffre

0

20

40

60

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140Am

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LeGiffre

LeGiffre

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LeGiffre

Le FdeTaninges

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Le F deMieussy

Le F deMieussy

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Taille moyenne des 0+ sur le Borne

0

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GrandBornand

Les Etroits Entremont Beffay St Pierre en F

Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Chinaillon La Duche LOveacuteran

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Taille moyenne des 0+ sur la Filliegravere

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LeDaudens

LeCrenant

LeCrenant

Long

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tota

le e

n m

m

32

Sur la quasi-totaliteacute des stations eacutetudieacutees les individus marqueacutes preacutesentent une taillemoyenne supeacuterieure agrave celle des individus naturels Sur 18 stations ougrave les effectifs permettent des comparaisons statistiques la longueur totale des individus marqueacutes est significativement supeacuterieure agrave celle des truites sauvages pour 13 stations

Les 5 stations faisant exception sont laquo aval barrage Taninges raquo et laquo Pont du Giffre raquo sur le Giffre laquoAval St Jeoire raquo sur le Risse laquo Bonnavaz raquo sur le Foron de Taninges et laquo Couvette raquo sur le Foron de Fillinges Cependant sur ces stations les diffeacuterences ne sont pas significatives

Le fait que les marqueacutes aient une plus grande taille moyenne que les non marqueacutes au stade 0+ nrsquoimplique pas que cela soit systeacutematiquement le cas aux stades ulteacuterieurs En effet CAUDRON (1998) et CHAMPIGNEULLE et CACHERA (2003) ont montreacute respectivement sur le Doubs et le Fier que les diffeacuterences de tailles entre marqueacutes et non marqueacutes au stade 0+ sestompaient au stade 1+ et chez les adultes

Par ailleurs lrsquoexistence drsquoune plus grande taille au stade 0+ en automne pour les marqueacutes ne leur garantit pas un meilleur taux de seacutedentarisation En effet plusieurs eacutetudes dont celle de JONSSON et JONSSON (1993) indiquent que le taux de deacutevalaison peut ecirctre plus eacuteleveacute pour les individus agrave plus forte croissance au stade 0+ La deacutevalaison peut donc toucher preacutefeacuterentiellement les individus marqueacutes en raison de leur forte croissance

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Foron du Reposoir

0

20

40

60

80

100

120

140

La Touviegravere Le Reposoir

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mTaille moyenne des 0+ sur le Foron de Fillinges

0

20

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Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Long

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m

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille moyenne des 0+ sur le Foron du Reposoir

0

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La Touviegravere Le Reposoir

F du Reposoir F du Reposoir

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mTaille moyenne des 0+ sur le Foron de Fillinges

0

20

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Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Long

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tota

le e

n m

m

33

222 Taille des nageoires pectorales

La figure ci-dessus montre qursquoil existe une diffeacuterence entre marqueacutes et non marqueacutes du rapport entre la longueur de la nageoire pectorale et la longueur totale du poisson

Il a sembleacute important drsquoanalyser plus en deacutetail ce caractegravere morphologique car il peut preacutesager de lrsquoaptitude des truites agrave se maintenir dans nos riviegraveres de montagne

Relation entre la longueur de la nageoire pectorale et la longueur totale des individus marqueacutes et non marqueacutes

5

7

9

11

13

15

17

19

21

23

25

27

30 50 70 90 110 130 150 170Longueur totale en mm

Long

ueur

nag

eoire

pec

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le e

n m

mMarqueacuteNon marqueacute

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron du Reposoir

12

14

16

18

20

La Touviegravere Le Reposoir

F du Reposoir F du Reposoir

Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron de Fillinges

12

14

16

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20

Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron du Reposoir

12

14

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La Touviegravere Le Reposoir

F du Reposoir F du Reposoir

Taille relative moyenne des pectorales sur le Foron de Fillinges

12

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Bovet - Boex Pont de Fillinges Couvette

Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges Le Foron de Fillinges

34

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Giffre

12

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18

20

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Le F deMieussy

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Taille relative moyenne des pectorales sur la Filliegravere

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Taille relative moyenne des pectorales sur le Borne

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Les Etroits Entremont Beffay St Pierre en F

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Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Individus marqueacutes (issus de lrsquoalevinage)

Individus non marqueacutes (issus de la reproduction naturelle)

Taille relative moyenne des pectorales sur le Giffre

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Le F deMieussy

Le F deMieussy

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Taille relative moyenne des pectorales sur la Filliegravere

12

14

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20

Le J

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La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere La Filliegravere Le Flan Le Flan Le Flan LeDaudens

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Taille relative moyenne des pectorales sur le Borne

12

14

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GrandBornand

Les Etroits Entremont Beffay St Pierre en F

Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Borne Le Chinaillon La Duche LOveacuteran

35

Sur les 24 stations ougrave des individus marqueacutes et non marqueacutes coexistent la taille relative des nageoires pectorales est systeacutematiquement plus importante chez les individus naturelsLes truites issues du repeuplement preacutesentent donc des nageoires pectorales de longueur infeacuterieure agrave celle des truites sauvagesCette diffeacuterence morphologique est tregraves importante car le deacuteveloppement des nageoires est un eacuteleacutement deacuteterminant pour la survie du poisson dans son milieu notamment pour la stabiliteacute la reacutesistance au courant et la recherche de nourriture an action de chasse

Il semble donc possible que cette caracteacuteristique anatomique soit le reacutesultat drsquoune adaptation agrave la vie en torrent

BOSAKOWSKI et al (1993) ont eacutegalement observeacutes des reacutesultats comparables chez des truites arc-en-ciel et des truites brunes de plus grande taille entre poissons drsquoeacutelevage et poissons sauvages Dans cette eacutetude les poissons deacutelevage preacutesentaient des nageoires nettement plus courtes (10-50) que les poissons sauvages Selon les auteurs cette diffeacuterence semblait ecirctre causeacutee par les conditions de vie des poissons dans les bassins des piscicultures(agression intraspeacutecifique stress qualiteacute de leau et densiteacutes de poissons) qui provoquaient une eacuterosion des nageoires

Dans le cas preacutesent les poissons de repeuplement ont eacuteteacute introduits agrave des stades preacutecoces dans le milieu et ont eacuteteacute preacuteleveacutes 4 agrave 5 mois apregraves leur introduction En conseacutequence ils ont veacutecu peu de temps en pisciculture et ont par contre passeacute lessentiel de leur vie dans le mecircme milieu naturel que les poissons sauvages Ainsi il semble que ce dimorphisme de la nageoire entre poissons sauvages et introduits soit drsquoorigine geacuteneacutetique Une eacutetude de RIDDELL et al (1981) a montreacute chez le saumon que les diffeacuterences de deacuteveloppement de nageoires eacutetaient une adaptation des poissons agrave leur milieu qui preacutesentait une origine geacuteneacutetiqueIl est donc tout agrave fait probable qursquoun pheacutenomegravene similaire se rencontre chez la truite fario et que les truites sauvages soient mieux adapteacutees sur le plan morphologique (gracircce agrave des diffeacuterences geacuteneacutetiques) aux conditions du milieu que les poissons introduits mecircme agrave des stades preacutecoces

Outre lrsquoaspect purement geacuteneacutetique les facteurs environnants peuvent eacutegalement jouer un rocircle important En effet McLAUGHLIN et al (2002) ont montreacute que cette diffeacuterence au niveau des nageoires peut eacutegalement ecirctre due agrave des caracteacuteristiques du milieu environnant dans les premiegraveres semaines de vie des poissons En effet plusieurs lots drsquoune mecircme souche de saumon de fontaine soumis degraves lrsquoeacuteclosion agrave des conditions de vie diffeacuterentes montrent des diffeacuterences dans le deacuteveloppement des nageoires Ainsi degraves les premiegraveres semaines les poissons exposeacutes agrave un fort courant sont pourvus de nageoires plus longues

Il est donc possible que les alevins produits en pisciculture nrsquoeacutetant pas exposeacutes agrave des courants importants au cours de leurs premiegraveres semaines de vie deacuteveloppent des nageoires pectorales moins longues que les individus sauvages

Il y a probablement pour cette caracteacuteristique morphologique des interactions combinant geacuteneacutetique et conditions environnementales

Cette diffeacuterence morphologique peut eacutegalement avoir une importance dans la compeacutetition entre poissons sauvages et introduits notamment au stade juveacutenile En effet GIBSON (1973) a deacutemontreacute limportance des nageoires dans la compeacutetition interspeacutecifique

36

entre le saumon atlantique (Salmo salar L) et le saumon de fontaine (Salvenius fontinalis) deux poissons consommant la mecircme nourriture Le fait de posseacuteder des nageoires pectorales plus deacutevelopper permet au saumon atlantique de se maintenir dans les courants pour se nourrir tout en deacutepensant moins drsquoeacutenergie

Dans le cas des torrents haut-savoyards une compeacutetition intraspeacutecifique entre truites sauvages et introduites comparable agrave leacutetude de GIBSON peut se deacutevelopper La diffeacuterence morphologique entre les truites sauvages et issues du repeuplement peut donc avoir une influence lors de la compeacutetition entre ces deux types dindividus

37

3 Premiegraveres implications pour la gestion

En fonction des reacutesultats obtenus lors de la campagne de preacutelegravevements 2002 des orientations de gestion sont proposeacutees pour chaque riviegravere eacutetudieacutee Certaines propositions impliquent des changements relativement importants des pratiques actuelles de gestion

Lrsquoeacutetude de lrsquoefficaciteacute des repeuplements srsquoappuient sur une deacutemarche scientifique rigoureuse dans lrsquointeacuterecirct des gestionnaires directs (AAPPMA) puisqursquoelle permet agrave ces derniers de prendre des deacutecisions en srsquoappuyant sur des reacutesultats concrets et indiscutables Elle est conduite dans un souci drsquoeacutevaluer en toute objectiviteacute les pratiques drsquoalevinage dans le seul but drsquoameacuteliorer la gestion actuelle des populations et des milieux Concregravetement elle permet de connaicirctre rapidement les zones ougrave lrsquoalevinage en truite fario est inefficace et donc inutile et les zones ougrave celui-ci est efficace et donc neacutecessaire

En plus des reacutesultats obtenus gracircce aux marquages des juveacuteniles les propositions prennent en compte les premiers reacutesultats issus des pecircches de sondage drsquoadultes reacutealiseacutees pour le programme INTERREG (reacutedaction en cours) Lrsquointeacutegration des diffeacuterentes donneacutees (marquage juveacutenile + adultes) permet de faire des propositions coheacuterentes selon un diagnostic le plus complet possible de la population de truite preacutesente

31 Bassin du Borne

Sur les riviegraveres du bassin du Borne les orientations de gestion proposeacutees ci-apregraves restent conformes agrave celles deacutejagrave eacutevoqueacutes par CAUDRON et CHAMPIGNEULLE (2002)

Arrecirct du repeuplement selon les pratiques actuelles sur lrsquoensemble du cours principal Cette proposition est motiveacutee par deux principales raisons

- Lrsquoalevinage est inefficace agrave lrsquoamont du seuil drsquoEntremont car apregraves plus de 15 ans il nrsquoa pas permis drsquoinstaller une population en place eacutequilibreacutee

- Il semble impeacuteratif de preacuteserver lrsquoimportante population de truite sauvage preacutesente agrave lrsquoaval du seuil drsquoEntremont Les reacutesultats geacuteneacutetiques indiquent que la population preacutesente est une population sauvage qui nrsquoa pas eacuteteacuteimplanteacutee suite agrave lrsquoalevinage Elle preacutesente un degreacute de pureteacute geacuteneacutetique important Cette population repreacutesente un patrimoine unique dans le Faucigny Le but drsquoarrecircter les alevinages sur ce secteur est drsquoeacuteviter les hybridations qui peuvent entraicircner une perte de plasticiteacute geacuteneacutetique et une deacutegeacuteneacuterescence de la souche sauvage actuelle

Arrecirct du repeuplement sur lrsquoaval de lrsquoOveacuteran Ce secteur est utiliseacute comme zone de reproduction par les geacuteniteurs du Borne et la reproduction naturelle y est abondante Lrsquoalevinage nrsquoest donc pas neacutecessaire et risque comme sur le Borne de provoquer une hybridation de la population naturelle

Essayer drsquoinstaller une population naturelle agrave lrsquoamont du seuil drsquoEntremont par transferts de geacuteniteurs

Sur les autres affluents deux sceacutenarii de gestion peuvent ecirctre envisageacutes selon la volonteacute politique des gestionnaires directs

Sceacutenario ndeg1 vision patrimoniale

38

- Arrecirct du repeuplement en truite drsquoorigine Atlantique pendant 3 anneacutees conseacutecutives pour diminuer leur preacutesence sur le bassin

- Puis reprise de lrsquoalevinage pendant uniquement 3 anneacutees agrave partir de poissons sauvages issus du Borne pour essayer drsquoinstaller une population naturelle

Sceacutenario ndeg2 vision halieutique- Maintien des pratiques drsquoalevinage en atlantique pour soutenir

artificiellement le stock de poissons dans un inteacuterecirct uniquement halieutique Attention cette pratique risque de provoquer par deacutevalaison des individus introduits une hybridation des poissons sauvages preacutesents dans le Borne

Eventuellement repeuplement en truites Arc en Ciel surdensitaires sur des secteurs preacutecis du Borne pendant la peacuteriode estivale afin de contenter une certaine cateacutegorie de pecirccheurs Les repeuplements en Arc en Ciel ne risquent pas de provoquer drsquohybridation de la souche fario locale Attention prendre des preacutecautions aupregraves des fournisseurs concernant la qualiteacute sanitaire des poissons

32 Bassin du Giffre

Les propositions sur le bassin du Giffre prennent en compte les reacutesultats du marquage mais eacutegalement la situation actuelle de la riviegravere suite agrave lrsquoeacuteboulement de Sixt Fer agrave Cheval

Ne pas aleviner le cours principal du Giffre en alevins de fario pendant 5 anneacutees conseacutecutives Cette proposition est motiveacutee par les raisons suivantes

- Il est impossible de savoir comment va eacutevoluer dans les prochains mois et les prochaines anneacutees le glissement agrave lrsquoamont de Sixt Il semble donc risqueacute drsquoentreprendre un alevinage pour installer une nouvelle population

- Les reacutesultats des marquages sur le Giffre sont tregraves contrasteacutes Sauf au niveau de Sixt ils montrent qursquoil existait avant le glissement une reproduction naturelle importante et capable de soutenir une population

- Les reacutesultats geacuteneacutetiques reacutecents indiquent que les populations en place sont en majoriteacute drsquoorigine atlantique mais qursquoil existe encore des individus meacutediterraneacuteens non hybrideacutes jusque dans les zones amont Ces reacutesultats prouvent qursquohistoriquement la souche meacutediterraneacuteenne eacutetait bien preacutesente sur lrsquoensemble du Giffre

- Il est envisageable que cette souche sauvage eacutegalement preacutesente sur les parties basses des affluents recolonise naturellement le Giffre

- Lrsquoexemple du Borne montre qursquoapregraves une catastrophe la riviegravere a eacuteteacute recoloniseacutee par une souche sauvage malgreacute des alevinages massifs Les reacutesultats obtenus sur cette riviegravere doivent servir de base de reacuteflexions pour la nouvelle gestion agrave entreprendre sur le Giffre

- Entre le Risse et Marignier la population de truites avant le glissement eacutetait deacutejagrave totalement deacuteseacutequilibreacutee et en quasi disparition (peu de juveacuteniles quasi absence de geacuteniteurs et absence de classes drsquoacircges intermeacutediaires) malgreacute les alevinages massifs sur ce secteur

39

Reacutealiser un bilan de lrsquoimpact du glissement de terrain sur le peuplement piscicole

- Une eacutetude piscicole sera reacutealiseacutee tregraves prochainement (2004 ou 2005) sur le Giffre dans le cadre du contrat de riviegravere Cette eacutetude permettra de faire un premiereacutetat des lieux complet du peuplement piscicole suite au glissement

Accomplir un diagnostic de lrsquoeacutetat de recolonisation du Giffre par les populations naturelles

- En lrsquoabsence drsquoalevinage il sera possible de reacutealiser en 2008 un bilan des populations de truites installeacutees sur le Giffre

- A partir de lrsquoeacutetat de la population agrave cette eacutepoque un plan drsquoalevinage coheacuterent en truite fario pourra ecirctre eacutetabli pour permettre drsquoinstaller de nouvelles populations ou de soutenir des populations preacutesentes

Mettre en place des deacuteversements de truites Arc en Ciel pendant toute la peacuteriode drsquoarrecirct de lrsquoalevinage en fario Attention prendre des preacutecautions aupregraves des fournisseurs concernant la qualiteacute sanitaire des poissons

Reacuteintroduire lrsquoOmbre commun sur la plaine de Samoeumlns et agrave lrsquoaval de la confluence avec le Risse

Arrecirct de lrsquoalevinage sur lrsquoensemble du Risse sur lrsquoaval du Foron de Mieussy et sur lrsquoEtroit Denteacutee

- Sur ces riviegraveres le suivi du marquage a montreacute que lrsquoalevinage nrsquoeacutetait pas neacutecessaire pour soutenir les populations de truites preacutesentes

Maintenir lrsquoalevinage sur lrsquoamont du Foron de Mieussy (vers Sommand) et lrsquoamont du Foron de Taninges (Bonnavaz)

- Sur ces secteurs le suivi du marquage a montreacute que les juveacuteniles preacutesents dans le milieu naturel eacutetaient en majoriteacute des individus introduits

33 Le Foron du Reposoir

Les propositions de gestion sur le Foron du Reposoir sont

Maintenir les alevinages actuels avec la souche Chazey Bons Rhodanienne

Suivre lrsquoeacutevolution de la population pour savoir si cet alevinage permet drsquoinstaller une population fonctionnelle

- Ce suivi peut comprendre des pecircches de sondages en deacutebut de peacuteriode de reproduction pour voir si les poissons adultes deviennent matures des releveacutes de frayegraveres sur la riviegravere pour savoir si les poissons se reproduisent et de nouveaux preacutelegravevements de poissons pour suivre lrsquoeacutevolution du taux de marqueacutes dans la population

34 Bassin de la Filliegravere

Les orientations pour une gestion coheacuterente des populations de la Filliegravere sont les suivantes

40

Arrecirct de lrsquoalevinage sur le cours principal de la Filliegravere sur le Crenant et sur lrsquoaval du Flan

- Sur ces 3 riviegraveres lrsquoalevinage nrsquoest pas neacutecessaire car il ne permet pas de soutenir les populations preacutesentes et de plus la reproduction naturelle est tregraves importante

- Sur la Filliegravere les pecircches drsquoadultes dans le cadre du programme INTERREG ont mis en eacutevidence la preacutesence drsquoune population sauvage drsquoorigine meacutediterraneacuteenne Il semble important drsquoentreprendre une mesure de conservation de cette souche en arrecirctant lrsquoalevinage pour eacuteviter lrsquohybridation

- Sur lrsquoamont du Flan il est neacutecessaire de continuer le suivi des poissons marqueacutes pour savoir si lrsquoalevinage doit ecirctre maintenu

Sur le Daudens deux sceacutenarii de gestion peuvent ecirctre envisageacutes selon la volonteacute politique des gestionnaires directs

Sceacutenario ndeg1 vision patrimoniale- Arrecirct du repeuplement en truite drsquoorigine Atlantique pendant 3 anneacutees

conseacutecutives pour diminuer leur preacutesence sur le bassin- Commencer les proceacutedures afin de rendre le seuil du Plot

franchissable pour les geacuteniteurs de la Filliegravere- Reacutealiser un bilan notamment deacutemographique de la population en place

apregraves lrsquoarrecirct de lrsquoalevinage- Puis reprise de lrsquoalevinage pendant uniquement 3 anneacutees agrave partir de

poissons sauvages issus de la Filliegravere pour essayer drsquoinstaller une population naturelle

Sceacutenario ndeg2 vision halieutique- Maintien des pratiques drsquoalevinage en atlantique pour soutenir

artificiellement le stock de poissons dans un inteacuterecirct uniquement halieutique Attention cette pratique risque de provoquer par deacutevalaison des individus introduits une hybridation des poissons sauvages preacutesents dans la Filliegravere

35 Le Foron de Fillinges

Les reacutesultats obtenus sur le Foron de Fillinges ont conduit agrave formuler les propositions de gestion suivantes

Arrecirct de lrsquoalevinage sur lrsquoensemble du Foron de Fillinges- Quelque soit la souche utiliseacutee et les quantiteacutes introduites les poissons

alevineacutes ne repreacutesentent qursquoune tregraves faible minoriteacute des poissons preacutesents dans le milieu Le Foron abrite une population naturelle fonctionnelle et eacutequilibreacutee

Suivi de la population suite agrave lrsquoarrecirct du repeuplement- Reacutealisation de 5 stations de pecircches eacutelectriques la derniegravere anneacutee de

lrsquoalevinage afin de reacutealiser un eacutetat des lieux preacutecis de la population de truites et du peuplement piscicole

- Reacutealisation drsquoun nouveau bilan de la population du Foron respectivement 3 ans puis 6 ans apregraves lrsquoarrecirct de lrsquoalevinage

41

4 Investigations suppleacutementaires

Suite aux premiers reacutesultats obtenus lors de la campagne 2002 des investigations suppleacutementaires permettant de preacuteciser certains points seront reacutealiseacutees

Reacutealiser une analyse bacteacuteriologique des diffeacuterents lots de poissons alevineacutes qui ont transiteacutes dans les piscicultures associatives Cette recherche de pathologie permettra de savoir si les poissons issus de pisciculture sont porteurs drsquoune maladie bacteacuterienne avant drsquoecirctre introduits dans le milieu ou si ils contractent la maladie dans le milieu naturel

Rechercher les raisons pour lesquelles on nrsquoobserve pas drsquoalevins naturels sur certains secteurs Les causes drsquoune telle situation peuvent ecirctre

- Lrsquoabsence totale de geacuteniteurs dans la population Les poissons nrsquoont pas le temps de devenir adulte (3+) et sont captureacutes avant par les pecirccheurs

- La preacutesence drsquoadultes non matures Les poissons deviennent adultes mais sont immatures (eacutetat sanitaire des poissons souche geacuteneacutetiquement deacutegeacuteneacutereacutee)

- Survie nulle durant la phase de vie sous graviers Les poissons pondent mais les œufs nrsquoarrivent pas agrave se deacutevelopper et la mortaliteacute est totale

Sur les secteurs du Chinaillon de la Duche de lrsquoOveacuteran amont et du Foron de Mieussy amont (Sommand) les actions suivantes peuvent ecirctre entreprises

- Pecircches eacutelectriques de sondage en deacutebut de la peacuteriode de reproduction pour savoir si les poissons deviennent matures

- Releveacutes de frayegraveres permettant drsquoobserver ou non une activiteacute de reproduction- Mise en place drsquoincubateurs-tests contenant des œufs de truites pour connaicirctre le taux

de survie des œufs dans les frayegraveres

Reacutealiser des preacutelegravevements suppleacutementaires aux classes drsquoacircge supeacuterieures (1+ et 2+) sur certaines stations pour voir lrsquoeacutevolution du taux de marqueacutes au cours des anneacutees Ces recherches suppleacutementaires peuvent ecirctre effectueacutees sur 8 cours drsquoeau ougrave le taux de marqueacutes deacutepasse 60 au stade 0+

Le ruisseau de la Duche amontLe ruisseau du Chinaillon amontLe Foron du ReposoirLe Risse avalLe Foron de Taninges amont (Bonnavaz)Le Foron de Mieussy amont (Sommand)Le Daudens amont et avalLe Flan amont

Dans les eacutetudes preacuteceacutedentes reacutealiseacutees sur le Fier (CAUDRON et CHAMPIGNEULLE 2002) et sur le Doubs (CHAMPIGNEULLE et al 2002) les taux de marqueacutes aux stades 1+ et 2+ dans la population en place srsquoeffondraient et devenaient tregraves faibles ou nuls

Pour informations le graphique suivant montre lrsquoeacutevolution du taux de marqueacutes agrave diffeacuterents stades sur les stations ougrave le taux de 0+ marqueacutes eacutetait eacuteleveacute

42

Les reacutesultats montrent agrave part pour une station une chute importante des taux de marqueacutes entre les stades 0+ et 1+ Cette chute se poursuit eacutegalement au stade 2+Ces reacutesultats obtenus sur le Fier et le Doubs semblent laisser peu drsquoespoirs sur le devenir des poissons marqueacutes sur les bassins eacutetudieacutes en 2002

Reacutesultats sur leacutevolution du taux de m arqueacutes aux diffeacuterents stades obtenus lors des eacutetudes preacuteceacutedentes sur le Fier et le Doubs

0102030405060708090

100

0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 0+ 1+ 0+ 1+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+

Station A Station B Station C StationD

StationE

StationF

Station A Station B StationC

Stations et stades

Pou

rcen

tage

de

mar

queacutes

Le Fier Le Doubs

Reacutesultats sur leacutevolution du taux de m arqueacutes aux diffeacuterents stades obtenus lors des eacutetudes preacuteceacutedentes sur le Fier et le Doubs

0102030405060708090

100

0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 0+ 1+ 0+ 1+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+ 2+ 0+ 1+

Station A Station B Station C StationD

StationE

StationF

Station A Station B StationC

Stations et stades

Pou

rcen

tage

de

mar

queacutes

Le Fier Le Doubs

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