Conception_et_réalisation_d’un_module_clinique_pour_les_DSE_(Dossier_de_Santé_Électronique)-

Mmoire de Fin dtudes

Pour lobtention du diplme dingnieur dtat en informatique

Option : Systme dinformation

Thme :

Ralis par : Encadr par :

- BOUZERD Mohamed Ouchabane. - Mr ABBASSENE Ali (CDTA).

- LACHEHEB Tarek. - Mr AT NOURI El Mehdi

(CDTA- GPEMA CANADA).

- Mr HIDOUCI Walid-Khaled (ESI).

Promotion : 2012/2013.

Conception et ralisation dun module clinique

pour les DSE (Dossier de Sant lectronique)

Ddicaces

Je ddie ce modeste travail

mes chers parents, sans leur soutien aprs

celui dALLAH je n'aurai jamais

eu l'occasion d'arriver jusque-l.

Je vous suis d'une grande reconnaissance

et d'une admiration indniable.

QuALLAH les prserve et les protge.

A tous mes frres et toutes mes surs.

A toute ma famille et tous mes Amis.

Tarek.

Ddicaces

Je tiens ddier ce travail mes parents

et les remercier pour tout ce quils mont apport

pour lducation et les principes quils mont inculqu

et pour leurs amours

et leurs soutiens quotidiens et permanents

je vous suis dune reconnaissance infinie.

A mon frre et ma sur.

A mes amis.

Merci tous.

Mohamed Ouchabane.

Remerciements

Nous remercions ALLAH le tout puissant de nous avoir donn le courage et la

volont d'achever ce travail, sans Lui il naurait jamais t accompli.

Nous remercions nos familles pour leur prsence et leur soutien, nous ne vous

remercierons jamais assez.

Nous tenons remercier lquipe qui a assur notre encadrement en

loccurrence Mr Ali ABBASSENE, Mr Elmehdi ATNOURI et Mr Walid Khaled HIDOUCI.

Nous remercions les enseignants de lESI qui tout au long dans notre cursus

nous ont transmis leur savoir.

Nous noublions surtout pas de remercier toute personne ayant aid

laboutissement de ce travail, ne serait-ce quun conseil ou des encouragements.

Tarek & Mohamed Ouchabane

VI

Rsum

Lapplication de linformatique aux soins de sant, principalement travers le DSE

(Dossier de Sant lectronique) est loin dtre gnralise.

La principale raison qui a fait que lutilisation des DSE nest pas gnralise est la

difficult de concevoir des modules qui grent efficacement linformation mdicale relative

l'tat de sant d'un patient.

En effet, dune part les praticiens de la sant veulent utiliser la description textuelle,

pour dcrire et capturer toute linformation clinique, bien quelle soit trs subjective. Dautre

part, les informaticiens prfrent plutt que linformation clinique soit capture dans des

formats structurs.

Le prsent projet vise mettre en uvre un module clinique au sein du DSE, qui peut

satisfaire les deux exigences, celles des praticiens et celles des informaticiens, savoir

capturer linformation clinique mme subjective dune manire structure.

Lors dune consultation un mdecin prend les signes mdicaux (ensemble des

paramtres (tension artrielle, rythme cardiaque, temprature corporelle, )) de son patient

ainsi que ses symptmes la base desquels il dcide du diagnostic. Les signes mdicaux et

les symptmes tant linformation capture, elle sera prsente dans un format structur pour

faciliter au mdecin lidentification du diagnostic correspondant.

En plus, il serait intressant de conserver le diagnostic propos pour lensemble des

symptmes et signes mdicaux capturs, dans lobjectif de capitaliser lexprience et

concevoir au futur, un systme capable de suggrer des diagnostiques potentiels pour des cas

similaires.

Mots cls : DSE (Dossier de Sant Electronique), Smiologie et Diagnostic, Capture des

donnes dobservation, Symptmes et signes cliniques, Pattern dobservation clinique,

Capitalisation de lexprience.

VII

Table des matires

Rsum ............................................................................................................................... VI

Table des matires ............................................................................................................ VII

Liste des figures : ................................................................................................................ X

Liste des tableaux : ........................................................................................................... XII

Liste des abrviations : .................................................................................................... XIV

Contexte gnral :................................................................................................................. 1

Introduction gnrale : ......................................................................................................... 1

Contexte : ............................................................................................................................. 2

Problmatique : .................................................................................................................... 2

Objectifs : ............................................................................................................................. 3

Solution propose : ............................................................................................................... 3

Organisation du mmoire : ................................................................................................... 3

Partie I : tat de lart ................................................................................................................. 5

Chapitre I La connaissance dans le domaine mdical ............................................................. 6

Introduction : ........................................................................................................................ 6

I.1 Concepts de base : ...................................................................................................... 6

I.1.1 Systme dInformation (SI) : .................................................................................. 6

I.1.2 Fournisseur de Soin (FDS) :(Care Delivery Organization CDO) ....................... 6

I.1.3 Systme dInformation Hospitalier (SIH) : ............................................................ 6

I.1.4 Le Dossier de Sant Electronique (DSE) et le Dossier Mdical Electronique (DME)

: ................................................................................................................................. 9

I.1.5 Linformation mdicale : ...................................................................................... 12

Sous Problmatique : .......................................................................................................... 13

Conclusion :........................................................................................................................ 13

Chapitre II Les normes et terminologies mdicales : un outil pour la standardisation de

linformation mdicale ........................................................................................................... 14

Introduction : ...................................................................................................................... 14

II.1 Dfinitions : .............................................................................................................. 14

II.1.1 Normalisation : .................................................................................................. 14

II.1.2 Norme : .............................................................................................................. 14

II.1.3 Terminologie : ................................................................................................... 15

II.1.4 Ontologie : ......................................................................................................... 15

VIII

II.2 Normes et terminologies mdicales : ....................................................................... 16

II.2.1 Comparaison des terminologies mdicales SNOMED CT et CIM 10 : ............ 20

Sous problmatique : .......................................................................................................... 40

Conclusion :........................................................................................................................ 40

Partie II : Analyse et Conception ........................................................................................... 41

Introduction : ...................................................................................................................... 42

Chapitre III Description dtaille de la solution ................................................................... 43

III.1 Capture de linformation : ........................................................................................ 43

Introduction : .................................................................................................................. 43

III.1.1 Types dinformations potentiels : ...................................................................... 44

III.1.2 Mise en place du modle de capture : Structuration de lespace dobservation 45

III.1.3 SNOMED CT en pratique : ............................................................................... 50

III.1.4 Logique floue :................................................................................................... 54

Conclusion : .................................................................................................................... 56

III.2 Traitement de l'information capture : ..................................................................... 57

Introduction .................................................................................................................... 57

III.2.1 Le pattern observation ....................................................................................... 57

III.2.2 Passage du pattern observation au pattern rsultat : .......................................... 57

III.2.3 Etude dun cas clinique : ................................................................................... 67

Conclusion : .................................................................................................................... 71

III.3 Reprsentation graphique : ....................................................................................... 72

Introduction : .................................................................................................................. 72

III.3.1 Reprsentation graphique du pattern rsultat : .................................................. 72

Conclusion : .................................................................................................................... 78

Chapitre IV Conception dtaille de la solution.................................................................... 79

Introduction : ...................................................................................................................... 79

IV.1 La base de donnes BDD 1 : .................................................................................... 80

IV.2 Conception de la BDD 2 : ........................................................................................ 80

IV.2.1 Identification des acteurs : ................................................................................. 80

IV.2.2 Identification des cas dutilisation : ................................................................... 81

IV.2.3 Description dtaille des cas dutilisation : ....................................................... 81

IV.2.4 Diagramme de classes de la base de donnes : ................................................. 90

IV.2.5 Dictionnaire de donnes : .................................................................................. 90

IX

IV.2.6 Passage au modle relationnel : ......................................................................... 91

IV.2.7 Codification : ..................................................................................................... 92

Conclusion :........................................................................................................................ 92

Conclusion de la partie II: .................................................................................................. 92

Partie III : Mise en uvre, tests et rsultats ........................................................................... 93

Chapitre V Mise en uvre Tests et rsultats ........................................................................ 94

Introduction : ...................................................................................................................... 94

V.1 Outils et environnement de dveloppement : ........................................................... 94

V.1.1 HTML : .............................................................................................................. 95

V.1.2 CSS : .................................................................................................................. 95

V.1.3 JavaScript : ........................................................................................................ 95

V.1.4 PHP : .................................................................................................................. 95

V.1.5 SQL : .................................................................................................................. 96

V.1.6 Le systme de gestion de base de donnes (MySQL) : ..................................... 96

V.1.7 Serveur Web (Apache) : .................................................................................... 97

V.1.8 Mediboard :........................................................................................................ 97

V.2 Tests et rsultats : ..................................................................................................... 98

V.2.1 Dfinition des cas cliniques et prsentation des mdecins : .............................. 99

V.2.2 Etablissement des patterns observations, des patterns rsultats et des

reprsentations graphiques : ......................................................................................... 101

V.2.3 Traitement des cas cliniques : .......................................................................... 109

V.2.4 Comparaison et interprtation des rsultats obtenus : ..................................... 111

Conclusion gnrale : ....................................................................................................... 112

Perspectives : .................................................................................................................... 112

Bibliographie : .................................................................................................................. 114

Webographie : .................................................................................................................. 117

X

Liste des figures :

Figure 1. Acteurs internes et externes dun SIH.

Figure 2. Sous-systmes dun SIH.

Figure 3. Schma illustratif de la hirarchie de CIM 10.

Figure 4. Historique de la SNOMED CT.

Figure 5. Composants de la SNOMED CT.

Figure 6. Exemple illustratif des relations de SNOMED CT.

Figure 7. Schma explicatif du contexte initial de la solution propose.

Figure 8. Hirarchie des signes/symptmes dans SNOMED CT.

Figure 9. Modalits de lattribut Dclenchement dans SNOMED CT.

Figure 10. Exemple de symptme reli une modalit de dclenchement.

Figure 11. Modalits de lattribut Intensit dans SNOMED CT.

Figure 12. Exemple pour lattribut Localisation dans SNOMED CT.

Figure 13. Modalits de lattribut Qualit dans SNOMED CT.

Figure 14. Modalits de lattribut Priodicit dans SNOMED CT.

Figure 15. Les principes de la logique floue.

Figure 16. Schma explicatif du calcul de la force dun pattern observation.

Figure 17. Niveaux de couleurs allant du vert au rouge.

Figure 18. Rayon du cercle allant de 0 5.

Figure 19. Les couleurs associes aux niveaux de validit.

Figure 20. Reprsentation graphique individuelle du pattern 1.




Figure 24. Reprsentation complte dun cas clinique.

Figure 25. Diagramme dactivit du cas n1.

Figure 26. Diagramme de squence du cas n1.

Figure 27. Diagramme dactivit de cas n2.

XI






Figure 33. Diagramme de classes associ la base de donnes des SSQ.

Figure 34. Architecture dun environnement Web.

Figure 35. Visualisation complte du cas clinique N1.





Figure 40. Histogramme de la comparaison des rsultats des tests.

XII

Liste des tableaux :

Tableau 1. Tableau rcapitulatif des diffrences entre un DME et un DES.

Tableau 2. Tableau rcapitulatif des types de normes.

Tableau 3. Normes principales du domaine mdical.

Tableau 4. Tableau rcapitulatif des chapitres de CIM 10.

Tableau 5. Tableau rcapitulatif des axes de SNOMED CT.

Tableau 6. Tableau comparatif entre SNOMED CT et CIM 10.

Tableau 7. Structure de modlisation dun signe/symptme SSQ .

Tableau 8. Types et caractristiques des attributs dun SSQ.

Tableau 9. Fusion dattributs quantitatifs.

Tableau 10. Valeurs de la fonction force.

Tableau 11. Tableau rcapitulatif des signes et symptmes capturs.

Tableau 12. Tableau descriptif du symptme insomnie .

Tableau 13. Rayons du cercle correspondant aux niveaux de force

Tableau 14. Les couleurs associes aux niveaux de validit.

Tableau 15. Donnes relatives aux patterns du cas clinique C.

Tableau 16. Tableau rcapitulatif des besoins satisfaire.

Tableau 17. Liste des cas dutilisation associs leurs acteurs.

Tableau 18. Description textuelle du cas n1.




Tableau 22. Dictionnaire de donnes.

Tableau 23. Pattern observation du symptme n1 du cas n1.







XIII




Tableau 33. Tableau rcapitulatif des rsultats obtenus par les tests.

XIV

Liste des abrviations :

ASCP : American Society of Clinical Pathologists

BPM : Battements par minute.

CAP : College of American Patholigists

CCD : Continuity of Care Document

CCR : Continuity of Care Record

CDSS : Clinical Decision Support System

CDTA : Centre de Dveloppement des Technologies Avances

CIM-10 : Classification Internationale des maladies v10

CSS : Cascading Style Sheets

CST : Consistance dun pattern observation

DICOM : Digital Imaging Communications

DME : Dossier mdical lectronique

DSE : Dossier de sant lectronique

FC : Frquence cardiaque.

FDS : Fournisseur de Soin

FR : Frquence respiratoire.

HL7 CCOW : Health Level 7 Clinical Concept Object Workgroup

HL7 CDA : Health Level 7 - Clinical Document Architecture

HL7 v3 RIM : Health Level 7 Version 3_ Reference Information Model

HL7 : Health Level Seven

HTML : Hypertext Markup Language

IEEE : Institute of Electrical and Electronics Engeneers

IHTSDO : Internationl Health Terminology Standards Developement Organisation

LOINC : Logical Observation Identifiers Names Ccodes

MTA : Malaise thoracique aigu

NCP : Nom complet prcis

NCPDP : National Council for Prescription Drug Programs

XV

NHIN : National Health Information Network

OBJ : Objectivit dun pattern observation

OMS : Organisation Mondiale de Sant

PHP : Personal Home Page : Hypertext Preprocessor

RPC : Raisonnement partir de cas

RCPath : Royal College of Pathologists

RdS : Revue des systmes

SGBD : Systmes de gestion de bases de donnes

SGBDR : Systmes de gestion de bases de donnes relationnelles

SGDP : Systme de Gestion du Dossier Patient

SI : Systme d'information

SIH : Systme dInformation Hospitalier

SNOMED CT : Systematized Nomenclature Of Medicine Clinical terms

SNOMED RT : Systematized Nomenclature Of Medicine Reference terminologie

SNOMED : Systematized Nomenclature Of Medicine

SNOP : Systematized Nomenclature of Pathology

SPP : Support of a pattern

SPPmax : Maximum Support of a pattern

SQL : Structured Query Language

SSQ : Standard Symptom Qualifiers

TA : Tension artrielle.

TP : Terme privilgi

UMLS : Unifed Medical Language System

Introduction gnrale

1

Contexte gnral :

Le projet de fin dtudes que nous somme sur le point dentreprendre dans ce rapport

fait partie dun projet propos par le Centre de Dveloppement des Technologies Avances

(CDTA). Il comprend en plus de notre projet intitul conception et ralisation dun module

clinique pour les DSE qui concerne ce qui va tre dfinis comme Espace dobservation, le

projet de fin dtudes intitul lEspace de prdispositions dans les donnes mdicales et

le projet intitul lAnnotation des descriptions cliniques textuelles ce dernier prend en

charge lannotation des descriptions cliniques, incluses dans les deux premiers projets, par

des termes issus dune norme mdicale ceci pour objectif de standardisation.

Le projet du CDTA intitul Systme de Gestion du Dossier Patient (SGDP) est

dvelopp pour le domaine de la sant publique, afin de servir de rfrentiel pour les

praticiens. Ses applications sont multiples notamment en permettant davoir un accs simple,

rapide et scuris aux informations mdicales structures et non structures (imageries,

rsultats danalyses et dexplorations, diagnostics, antcdents mdicaux, rsums

dhospitalisation, etc.) relatives un patient particulier.

Introduction gnrale :

La sant de lhumain est lun des dons les plus importants dont il a t investi et quil

doit prserver. Pour cela, les mdecins ne cessent de dvelopper les diffrentes branches de

la mdecine. Les informaticiens de leur ct font profiter la mdecine des avances

technologiques du domaine informatique, que ce soit en terme de traitement, de stockage ou

de partage de linformation ou bien mme dadministration ou daide la dcision.

Notre travail fait partie des applications daide la dcision, plus prcisment laide

du mdecin lidentification dun diagnostic.

Introduction gnrale

2

Contexte :

Pour identifier un diagnostic deux acteurs sont indispensables, le mdecin et le patient

concern. Le mdecin commence par demander au patient la cause de sa venue qui reprsente

les symptmes initiaux (relevs par le patient sur lui-mme), puis relve dautres symptmes

qui ne peuvent tre constats que par un praticien. Il passe ensuite la prise des signes

mdicaux (tension artrielle, rythme cardiaque, temprature corporelle, etc.) et termine par

lexamen des systmes vitaux (respiratoire, cardiaque, digestif, etc.) ; Toutes ces tapes sont

comprises dans la phase de la capture des informations cliniques dnotant lespace

dobservation1.

Aprs la phase de la capture des informations cliniques de lespace dobservation le

mdecin passe la phase du raisonnement clinique, en se basant sur ces dernires, lespace

de prdisposition2 (histoire mdicale du patient,) et dans certains cas sur des examens

complmentaires, pour identifier le diagnostic.

Problmatique :

Aprs la phase de la capture des informations cliniques (Espace dobservation), la

prochaine tape du processus didentification du diagnostic est le raisonnement clinique, qui

se base essentiellement sur ces informations captures. Lespace dobservation tant

compos de signes et symptmes pralablement de diffrent effet sur un cas clinique donn

et tant eux mme composs dinformations lmentaires combines pour leur donner une

description plus prcise (lintensit, la localisation, la dure, etc.), ces dernires ont une

importance diffrente pour un signe/symptme donn et dun signe/symptme un autre.

Le mdecin doit mettre et garder en tte toutes ces informations avec tous leurs dtails

simultanment pour pouvoir appliquer son raisonnement clinique et arriver identifier avec

le plus de fiabilit possible le diagnostic qui leur correspond, chose qui devient difficile

proportionnellement au nombre de signes/symptmes associs un cas clinique donn.

1 Lespace dobservation est lensemble dinformations cliniques (une dfinition plus dtaille est donne dans le chapitre suivant). 2 Lespace de prdisposition est lensemble dinformations prcliniques (une dfinition plus dtaille est donne dans le chapitre suivant).

Introduction gnrale

3

Objectifs :

Lobjectif majeur de ce travail est laide du mdecin dans sa prise de dcision

concernant un diagnostic et do en dcoulent les objectifs suivants :

Rduire le temps destin la consultation.

Rduire le risque derreur dans le processus didentification du diagnostic.

Rduire leffort ncessaire pour le raisonnement clinique fourni par le mdecin.

Solution propose :

La solution que nous proposons pour remdier la problmatique sus pose consiste

en le dveloppement dun module qui va permettre de :

Capturer linformation clinique (signes et symptmes).

Traiter pour synthtiser linformation modlise.

Reprsenter graphiquement linformation synthtise.

Organisation du mmoire :

Partie I : Etat de lart

Cette partie est divise en deux chapitres :

Chapitre 1 : La connaissance dans le domaine mdical.

Dans ce chapitre est faite une tude sur les informations mdicales ceci du point de vue

dun informaticien cest--dire en identifiant la source de ces informations (le praticien),

comment elles existent (leurs types) o elles existent (le SIH Systme dinformation

hospitalier) et o elles sont stockes (DSE Dossier de sant lectronique ou DME

Dossier mdical lectronique ).

Chapitre 2 : Les normes et terminologies mdicales : un outil pour la standardisation de

linformation mdicale.

Ce chapitre dbute par une tude sur la normalisation, en passant par des dfinitions

de bases (normalisation, norme, terminologie, ontologie), poursuit par une tude sur les

normes et terminologies mdicales en incluant un rcapitulatifs de ces normes et termine par

une comparaison entre elles et le choix de la norme utiliser dans la suite du travail.

Introduction gnrale

4

Partie II : Analyse et conception

Cette partie est divise elle aussi en deux chapitres :

Chapitre 3 : Description dtaille de la solution.

Ce chapitre est divis en trois parties : La capture de linformation qui consiste en la

mise en place dun modle capable de capturer et de structurer linformation mdicale

clinique, le traitement de linformation qui consiste en ltablissement des formules pour le

traitement de ces informations et enfin la reprsentation graphique des rsultats du traitement.

Chapitre 4 : Conception dtaille de la solution.

Dans ce chapitre sont conus notre systme et les bases de donnes ncessaires son

fonctionnement.

Partie III : Mise en uvre, tests et rsultats

Cette partie est constitue dun seul chapitre :

Chapitre 5 : Mise en uvre, tests et rsultats

Au dbut de ce chapitre sont dfinis les outils utiliss pour le dveloppement de

lapplication et lenvironnement qui lui est ncessaire pour fonctionner.

A la fin sont prsents les diffrents rsultats des tests effectus par notre application

et la comparaison entre les rsultats des tests effectus laide notre application et ceux

obtenues sans lutiliser.

5

Partie I :

tat de lart

Chapitre I La connaissance dans le domaine mdical

6

Chapitre I La connaissance dans le domaine

mdical

Introduction :

Lenvironnement du mdecin est compos principalement de trois concepts. Le

systme dinformation hospitalier qui rgit lensemble de la structure hospitalire, le dossier

de sant mdical et linformation mdicale stocke dans ce dernier et que le mdecin doit lire

ou inscrire.

I.1 Concepts de base :

I.1.1 Systme dInformation (SI) :

Systme constitu des ressources humaines (le personnel), des ressources matrielles

(l'quipement) et des procdures permettant d'acqurir, de stocker, de traiter et de diffuser les

lments d'information pertinents pour le fonctionnement d'une entreprise ou d'une

organisation. [GDT 13] (Office qubcois de la langue franaise, 2004).

I.1.2 Fournisseur de Soin (FDS) :(Care Delivery Organization

CDO)

Cest toute entit ou organisme dont la tche principale est de fournir des services de

soins [Gartner 13] (hpital, clinique, mdecin, infermire, laboratoire danalyse) [IBM 08].

I.1.3 Systme dInformation Hospitalier (SIH) :

I.1.3.1 Dfinition :

Cest un systme d'information (SI) appliqu aux tablissements de sant [Mediboard

13]. Comme tout SI, il facilite la gestion de l'ensemble des informations, mdicales et

administratives, dans un hpital [Degoulet 04]. Un SIH est destin assurer la communication

de l'information entre tous les acteurs d'une organisation de sant [Mediboard 13].


7

Il traite linformation et garantit sa cohrence. Linformation, une fois capture, doit

tre disponible en tous lieux, en tous moments et dans des dlais acceptables.

I.1.3.2 Domaines et vocations dun SIH :

Le SIH gre deux domaines diffrents :

Les systmes de gestion :

Ils concernent la gestion des ressources humaines, les affaires financires et

conomiques, la logistique, les achats et toutes les activits dites dintendance, savoir la

gestion des repas, la gestion de la lingerie, etc. [insa-lyon 13]

Les systmes relatifs la prise en charge du patient :

Il sagit de la prise en charge administrative, mdicale et paramdicale qui concerne le

cur de mtier de lhpital savoir la production de soins. [insa-lyon 13]

I.1.3.3 Analyse du SIH :

Acteurs :

Figure 1. Acteurs internes et externes dun SIH. [Degoulet 04]


8

Sous-systmes :

Figure 2. Sous-systmes dun SIH. [Degoulet 04]

I.1.3.4 Objectifs dun SIH :

Les enjeux dun SIH sorientent autour de deux grands objectifs : [Degoulet 04],

[insa-lyon 13].

a. Lamlioration de la qualit des soins :

Aider la prise de dcision.

Amliorer et faciliter le partage et la communication entre acteurs.

Rduire les dlais dattente.

Amliorer la continuit des soins.

Matriser lusage des consommables.

Amliorer la scurit et la traabilit des actions de soins.

b. La matrise des cots :

Rduire la dure des sjours.

Optimiser les diverses ressources.

Pilotage

Mdico-Economique. Financier et Budgtaire.

Qualit.

Logistique

Gestion des ressources Approvisionnements

Communication

Production des soins

dossier patient. gestion des actes.


9

Diminuer les tches administratives.

Diminuer les frais du personnel.

I.1.3.5 La ncessit dinformatiser le SIH :

Malgr la disponibilit des informations mdicales, objectif que le SIH a uvr pour,

ces informations ne sont pas toujours bien collectes ni bien exploites. De ce fait, elles nont

pas limpact rel quelles devraient avoir sur lamlioration de la qualit du systme de sant

[BAGAYOKO 10].

Les informations mdicales mme bien collectes ne sont pas totalement exploites

[insa-lyon 13] cause du volume important du flux dinformations circulant dans le SIH.

A cet effet il est intressant dinformatiser le SIH, ce qui permet de constituer une base

de donnes sur lactivit hospitalire qui peut tre support de multiples analyses tant

mdicales, que comptables ou managriales en vue de mieux comprendre les phnomnes,

leurs volutions et denvisager leurs amliorations continues. [insa-lyon 13]

Linformatisation du SIH est invitable et introduit implicitement le concept de dossier

mdical informatis qui remplacera la version papier de ce mme dossier.

Il existe diffrents types de dossiers de sant informatiss qui contiennent la plupart le

mme type d'information, parmi eux le dossier de sant lectronique (DSE) et le dossier

mdical lectronique (DME). Le plus souvent, les gens emploient les deux termes DSE

(dossier de sant lectronique) et DME (le dossier mdicale lectronique) alternativement et

croient quils sont identiques, cependant ils ne le sont pas, comme prsent dans ce qui suit :

I.1.4 Le Dossier de Sant Electronique (DSE) et le Dossier

Mdical Electronique (DME) :

I.1.4.1 Dossier Mdicale Electronique (DME) :

Le dossier mdical lectronique (DME) se concentre sur les renseignements

mdicaux spcifiques au mdecin. Sa structure reflte les besoins individuels des mdecins

ou des groupes de mdecins impliqus directement dans les soins d'un patient. En d'autres

mots, sa structure est centre sur l'intervenant. [CFPC 13]


10

Cest une application dont lenvironnement est compos dentrepts de donnes

cliniques, daide la dcision clinique, de vocabulaire mdical contrl, de pharmacies et

dapplications de documents cliniques. Le DME est utilis par des FDS pour documenter,

surveiller et contrler les soins. Les donnes contenues dans le DME sont un compte rendu

de la rencontre du patient avec le FDS, le DME tant la proprit de ce dernier. [Garets &

Davis 06]

I.1.4.2 Dossier de Sant Electronique (DSE):

Le dossier de sant lectronique est un document centr sur le patient qui peut

contenir des renseignements provenant d'un large ventail de FDS. De faon gnrale, il

contient un sous-ensemble d'informations que l'on peut partager, y compris les profils

cumulatifs des patients avec les ordonnances, les allergies et les antcdents d'immunisation.

On y retrouvera des renseignements intgrs touchant les rencontres intra et extrahospitalires

avec le systme de soins de sant. [CFPC 13]

Cest un sous-ensemble de DME, actuellement connu pour tre des rcapitulatifs de

soins comme le dossier de soin continue Continuity of Care Record CCR de lASTM

International (AMERICAN SOCIETY FOR TESTING AND MATERIALS INTERNATIONAL) et le document de soin

continu Continuity of Care Document CCD de la HL7 (HEALTH LEVEL 7) ; Le DSE est

possd par le patient qui a le droit de le consulter, il comporte des pisodes de soin provenant

de plusieurs FDS dans une communaut, une rgion, ou un tat (ou dans certains pays, le pays

entier). [Garets & Davis 06]

I.1.4.3 Diffrence entre le DSE et le DME :

Le DME Contient toute information mdicale sur le patient concernant un seul FDS

tandis que le DSE est un ensemble de tous ou quelques DME dun seul patient peu importe

le FDS ; Tout amalgame subsistant sera lev par le tableau suivant qui contient les principales

diffrences entre un DSE et un DME :


11

DME DSE

Dossier des services cliniques fournit lors

dune consultation un patient par un

FDS.

Sous-ensemble d'informations

provenant de divers FDS o le patient

a eu des consultations.

Appartient un FDS donn. Appartient un patient donn.

Se rapporte aux confins d'un FDS et ne

contient que des informations provenant

de ce FDS.

Se rapporte au partage des documents

travers diffrents FDS.

Cest un systme vendu par des

entreprises et install par des FDS.

Cest un systme commun adopt par

une rgion, une communaut ou un

pays entier, reli par un rseau national

de linformation de sant comme le

NHIN (National Health Information

Network).

le patient peut avoir accs quelques

informations depuis un terminal sans

pouvoir les modifies (accs non

interactif).

Fournit un accs interactif aux patients

permettant la consultation ainsi que la

modification de certaines informations.

Contient les informations de toutes les

consultations ncessaires pour identifier

un seul diagnostic.

Est une vue complte de l'tat de sant

du patient.

Sera cltur et deviendra statique au

moment o lon identifie le diagnostic.

Est mis jours par lajout de tous

nouveau DME contenant ainsi

linformation la plus rcente sur ltat

de sant du patient.

Tableau 1. Tableau rcapitulatif des diffrences entre un DME et un DSE.


12

Il n'est pas toujours ncessaire [CFPC 13] d'avoir accs l'information que l'on

retrouve dans le DSE chacune des consultations mais on y fera appel lorsque des

informations supplmentaires sont ncessaires.

I.1.5 Linformation mdicale :

I.1.5.1 Dfinition :

Cest l Information relative la mdecine et la sant, qui est non nominative et

d'intrt gnral, et qui est largement diffuse et facilement accessible. [GDT 13] (Office

qubcois de la langue franaise, 2007)

En dautres termes cest lensemble des informations concernant les patients et

lesquelles le mdecin a affaire. Elle peut tre rpartie en dix classes diffrentes :

Symptmes.

Signes.

Revue des systmes.

Histoire mdicale passe.

Laboratoires.

Condition mdicale prsente.

Style de vie.

Histoire familiale.

La mdication prsente.

Donnes dmographiques.

et en deux grandes catgories :

I.1.5.2 Espace dobservation :

Regroupe les informations cliniques qui dcrivent la manifestation du phnomne de

la maladie, savoir les symptmes, les signes et la revue des systmes.

Les informations le composant sont collectes au moment de la consultation entre le

mdecin et le patient, sont stockes dans le DME (cf. section I.1.4.1) et reprsentent ltat de

sant actuel du patient qui deviendra automatiquement, aprs identification du diagnostic, une

partie du DSE (cf. section I.1.4.2).


13

I.1.5.3 Espace de prdispositions :

Reprsente les conditions prcliniques du patient qui peuvent influencer lvolution de

la pathologie tel que (Histoire mdicale passe, Laboratoires, Prsente condition mdicale,

Style de vie, Histoire familiale, Mdication actuelle, Donnes dmographique).

Le mdecin na pas recueillir ces informations puisquelles sont dj stockes dans

le DSE, il ne fait que le consulter pour les utiliser trs ventuellement dans la dmarche pour

lidentification du diagnostic.

Sous Problmatique :

Lors de la capture des informations cliniques de lespace dobservation une nouvelle

problmatique sest pose et qui consiste en le fait que ces informations captures ne sont pas

standardises cest--dire pour une situation donne on peut trouver deux descriptions

totalement diffrentes, ceci dans les termes utiliss non pas dans le sens souhait.

Pour y remdier cette problmatique on utilisera un support de standardisation qui

soccupera de la normalisation et de lunification des termes cliniques de lespace

dobservation utiliss par le mdecin.

Conclusion :

Les Systmes dInformation Hospitalier (SIH) sont loutil de base utilis pour la

gestion dentits hospitalires. Les informations mdicales circulant dans le SIH sont stockes

dans un dossier de sant lectronique (DSE) ou un dossier mdical lectronique (DME).

Ces informations doivent tre standardises chose que le chapitre suivant va prendre

en charge.


linformation mdicale

14

Chapitre II Les normes et terminologies

mdicales : un outil pour la standardisation

de linformation mdicale

Introduction :

La normalisation est souvent synonyme dusage commun, standardisation dchanges

ou encore dinteroprabilit. Dans ce chapitre et pour le contexte de notre travail nous allons

prsenter un autre aspect de standardisation qui va mettre en vidence la ncessit et

lutilisation invitable de cet outil.

II.1 Dfinitions :

II.1.1 Normalisation :

La normalisation a pour objet de fournir des documents de rfrence comportant des

solutions des problmes, techniques et commerciaux concernant les produits, biens et

services, qui se posent de faon rpte dans des relations entre partenaires conomiques,

scientifiques, techniques et sociaux (extrait du Dcret n84-74 du 26 janvier 1984). [UTC 13]

Processus qui mne la dfinition et la mise en application de normes relatives

des produits, des activits ou leurs rsultats, afin de rpondre des besoins

d'uniformisation, de performance ou de qualit dans un domaine donn. (Office qubcois

de la langue franaise, 2006). [GDT 13]

II.1.2 Norme :

La norme est un document tabli par consensus, qui fournit, pour des usages

communs et rpts, des rgles, des lignes directrices ou des caractristiques, pour des

activits ou leurs rsultats, garantissant un niveau dordre optimal dans un contexte donn

(extrait du Guide ISO/CEI 2). [UTC 13]



15

Ensemble de rgles fonctionnelles ou de prescriptions techniques relatives des

produits, des activits ou leurs rsultats, tablies par consensus de spcialistes et

consignes dans un document produit par une autorit lgitime.

Les normes permettent de fournir une certaine garantie de performance, de qualit,

d'interchangeabilit. (Le grand dictionnaire terminologique, 2006). [GDT 13]

II.1.3 Terminologie :

La terminologie est ltude systmique de la dnomination des notions appartenant

des domaines spcialiss de l'exprience humaine et considres dans leur fonctionnement

social [GDT 13]. En tant que science, sintresse au recensement des concepts dun domaine

et des termes qui les dsignent ainsi que la compilation des concepts dun domaine et de leurs

termes associs. La plupart des terminologies ont une vise normative. [Zweigenbaum 98]

La diversit des types de terminologies est une consquence de la multitude des

objectifs du traitement de linformation, on cite quelques exemples :

Objectif Nom du type Exemple de

terminologie

La recherche dinformation Thsaurus MESH

Recueil de donnes des fins

statistiques Classification CIM10

La description dobservations cliniques Nomenclature SNOMED CT

Tableau 2. Tableau rcapitulatif des types de normes. [Zweigenbaum 98]

II.1.4 Ontologie :

Ensemble d'informations dans lequel sont dfinis les concepts utiliss dans un

langage donn et qui dcrit les relations logiques qu'ils entretiennent entre eux (Office

qubcois de la langue franaise, 2006) [GDT 13].On peut considrer quune ontologie est

laboutissement formel de la dfinition dune terminologie [Zweigenbaum 98].



16

II.2 Normes et terminologies mdicales :

Une terminologie clinique est un ensemble de termes et leurs synonymes qui

normalisent l'enregistrement des constatations, des circonstances, des vnements en relation

avec le patient. Elle intervient comme soutient pour les soins cliniques, l'aide la dcision et

l'amlioration de la qualit de service [AMIA & AHIMA 07]. Nous citons au titre dexemples

des terminologies tels que LOINC pour des rsultats de laboratoires, SNOMED pour les

termes cliniques, et CIM-10 pour les diagnostics mdicaux. [Kim 05]

Une terminologie clinique groupe les maladies, les procdures semblables et organise

l'information mdicale [AMIA & AHIMA 07], parmi ses objectifs :

Assurer lorganisation et la normalisation des descriptions mdicales.

Permettre la capture, le stockage, l'change et la rcupration de l'information

mdicale.

Faciliter la communication et linteroprabilit entre diffrents prestataires de soins.

Aider normaliser les descriptions des causes de dcs et de maladies, les types et

causes de blessures, les traitements, les procdures, et les interventions des mdecins

et des infirmires.

Aider galement capturer les symptmes, les signes, la complexit du soin, et autres

caractristiques du soin ou des personnes recevant ce soin.

Les terminologies forment l'information contenue dans les dossiers de sant. Elles sont

la base des rapports sur la sant publique. Elles sont une assurance d'interoprabilit,

et ainsi, elles permettent le dploiement d'un rseau pour lchange de l'information

mdicale.

Pour notre travail le premier objectif est indispensable savoir lorganisation et la

normalisation des descriptions mdicales.

Le tableau suivant est un rcapitulatif des normes et terminologies mdicales rparties

selon leur domaine dutilisation :



17

Standard

Acronyme Domaine Description

Echange de donnes /Transmission de messages

Health Level Seven

Messaging Standards

version 2 and version

3

HL7 v2.x,

v3.0

transmission de

messages

d'change de

donnes

une norme de transmission de

messages pour l'change des

donnes cliniques, financires,

et administratives.

Digital Imaging

Communications in

Medicine Consortium

DICOM

transmission de

messages de

radiologie

une structure de langage

commun pour partager des

images de radiologie.

Institut des ingnieurs

lectriciens et

lectroniciens

(Institute of Electrical

and Electronics

Engeneers)

IEEE

transmission de

messages

d'appareil mdical

une structure commune de

transmission de messages pour

partager des communications

d'appareil mdical.

National Council for

Prescription Drug

Programs

NCPDP

transmission de

messages de

prescription

une norme pour l'change

d'information prescription-

connexe. facilite en ligne

prescrire et d'autres processus

pharmacie-connexes.

Terminologie

Classification

Internationale des

maladies (International

CIM-10 termes cliniques

Un ensemble commun de

termes et codes pour des

diagnostics cliniques. Utilis



18

Classification of

Diseases)

gnralement dans la

facturation et les applications

cliniques

Logical Observation

Identifiers Names

Ccodes

LOINC termes de

laboratoire

Un ensemble standard de noms

et de codes universels pour

identifier les rsultats de

laboratoire. Facilite l'change

d'information de laboratoire

entre diffrents systmes.

Systematized

Nomenclature Of

Medicine

SNOMED

CT termes cliniques

Un large ensemble de termes

clinique normalis utilis

gnralement dans une srie

d'applications de logiciel

comprenant EHRs.

Unifed Medical

Language System

UMLS termes et

concepts mdical

Une grande base de donnes

de vocabulaire qui trace une

srie de termes mdical aux

concepts cliniques communs.

Document

Continuity of Care

Record

CCR

documents

rcapitulatifs

cliniques

Une norme de document qui

codifie la faon par laquelle

l'information clinique

importante (telle que la liste et

les allergies de problme)

devrait tre partage



19

Health Level 7 -

Clinical Document

Architecture

HL7 CDA documents

cliniques

Un modle standard d'change

pour les documents cliniques

tels que des rsums de

dcharge et des notes de

progrs. Autrefois connu

comme l'Architecture de

Dossier Patient.

Conceptuel

Reference Information

Model : Health Level

7 Version 3

HL7 v3

RIM

concepts

cliniques

Un modle standard d'change

pour les documents cliniques

tels que des rsums de

dcharge et des notes de

progrs. Autrefois connu

comme l'Architecture de

Dossier Patient.

Application

Health Level 7

Clinical Concept

Object Workgroup

HL7

CCOW

interoprabilit

d'application

Une architecture qui permet

l'accs scuris aux dfrentes

applications software.

Tableau 3. Normes principales du domaine mdical. [CHF 04]

Le type dinformations mdicales qui nous concerne est purement clinique, on la

nomm espace dobservation. Ceci nous permet de rduire le choix de la norme utiliser

seulement celles qui traitent directement de laspect clinique, savoir :

CIM 10.

SNOMED CT.

Pour ce faire on va suivre une approche de comparaison bien dtermine, prsente ci-

dessous.



20

II.2.1 Comparaison des terminologies mdicales SNOMED

CT et CIM 10 :

Lapproche de comparaison consiste en les quatre tapes suivantes :

1. Prsentation des deux normes.

2. Dfinition des critres de comparaison.

3. La comparaison selon les critres dfinis.

4. Discussion et rsultats.

II.2.1.1 La prsentation des deux normes :

A. CIM 10 :

a. Prsentation :

La CIM (Classification internationales des maladies) au nom complet (Classification

statistique Internationale des Maladies et des problmes de sant connexes) est une norme

mdicale prvue avant tout pour la classification des maladies et des traumatismes assortis

d'un diagnostic explicite [OMS 08].

La CIM est gre par lOrganisation Mondiale de Sant (OMS) depuis 1948, cette

dernire a publi la dixime version de la CIM en 1993.

Le but de la CIM est de permettre l'analyse systmatique, l'interprtation et la

comparaison des donnes de mortalit et de morbidit recueillies dans diffrents pays ou

rgions et des poques diffrentes [OMS 08].

La CIM est utilise pour transposer les diagnostics de maladies ou autres problmes de

sant, en codes alphanumriques, ce qui facilite le stockage, la recherche et l'analyse des

donnes [OMS 08].

b. Historique :

Lorigine de la CIM revient au dbut du dix-huitime (18) sicle avec la premire

statistique sur les causes de dcs des enfants gs de moins de 6ans ralise par J. Graunt et

a volu depuis pour passer par :

Premier essai de classement systmatique des maladies :



21

-Les travaux de F. Bossier de Lacroix (1706-1777) (plus connu sous le nom de

Sauvages ) dans sa publication Nosologia methodica

-Louvrage de Linn (1707-1778) intitul Genera morborum .

-La classification de William Cullen (1710-1790) Synopsis nosologia methodicae

publie en 1785 et fut la classification des maladies la plus couramment utilise au dbut du

dix-neuvime (19) sicle.

Nomenclature uniforme des causes de dcs :

Etablie par la coordination des travaux du Dr William Farr (1807-1883) et du Dr Marc

d'Espine sous la demande du Premier Congrs international de Statistique en 1853.

Nomenclature internationale des causes de dcs :

Ralise sous la demande de l'Institut international de Statistique par le Dr Jacques

Bertillon (1851-1922) et ses collaborateurs en 1891 et rvise chaque dix (10) ans depuis

1900.

Nomenclature internationale des maladies et causes de dcs :

En sa sixime (6) rvision, des travaux aboutirent l'tablissement d'un document

intitul Classification statistique internationale des Maladies, Traumatismes et Causes de

Dcs et son adoption en 1948 par lOrganisation Mondiale de la Sant (OMS).

Classification internationale des Maladies, Traumatismes et Causes de Dcs

9me rvision (CIM 9) en 1975.

Classification statistique internationale des maladies et des problmes de sant

connexes 10me rvision (CIM 10) en 1993 (version anglaise) et publie sous forme de trois

(3) volumes.

CIM 10 version franaise en 1994 le volume 1, en 1995 le volume 2 et en 1996 le

volume 3.

c. Contenu des trois volumes de la CIM-10 :

Volume 1. Table Analytique. Ce volume contient : [ICIS 12]

-Le rapport de la Confrence internationale sur la dixime version

-La classification elle-mme

-La classification de la morphologie des tumeurs



22

-Des tableaux spciaux de la mortalit et de la morbidit

-Des dfinitions et les rgles de nomenclature.

Volume 2. Manuel d'utilisation. Ce volume contient : [KOHLER 02]

-Des instructions sur l'utilisation du volume1

-Lhistorique de la CIM.

Volume 3. Index alphabtique. Ce volume contient : [KOHLER 02]

-Index des chapitres I XIX et XXI.

-Index des causes de mortalit et de morbidit (Chapitre XX).

-Index des mdicaments et produits chimiques.

Mises jour :

Les mises jour officielles des volumes publis de la CIM-10 sont disponibles, sur le

site internet de l'OMS, volet classifications (www.who.int/classifications). [ICIS 12]

d. Organisation et structure de la CIM 10 :

La CIM 10 est une classification hirarchique mono axiale [Zweigenbaum 04]. Elle

est focalise sur un double classement tiologique et organique [HONNORAT 09] et elle

comporte trente-milles (30 000) termes rpartis en 21 chapitres, dix-neuf (19) parmi eux sont

utiliss pour coder les pathologies ; En plus des vingt et un (21), deux (02) chapitres

supplmentaires ont t ajout. Le tableau suivant est une liste exhaustive des chapitres de la

CIM 10 :

Chapitre Code Titre

I A00-B99 Certaines maladies infectieuses et parasitaires.

II C00-D48 Tumeurs.

III D50-D89 Maladies du sang et des organes hmatopotiques et

certains troubles du systme immunitaire.

IV E00-E90 Maladies endocriniennes, nutritionnelles et mtaboliques.

V F00-F99 Troubles mentaux et du comportement.



23

VI G00-G99 Maladies du systme nerveux.

VII H00-H59 Maladies de l'il et de ses annexes.

VIII H60-H95 Maladies de l'oreille et de l'apophyse mastode.

IX I00-I99 Maladies de l'appareil circulatoire.

X J00-J99 Maladies de l'appareil respiratoire.

XI K00-K93 Maladies de l'appareil digestif.

XII L00-L99 Maladies de la peau et du tissu cellulaire sous-cutan.

XIII M00-M99 Maladies du systme osto-articulaire, des muscles et du

tissu conjonctif.

XIV N00-N99 Maladies de l'appareil gnito-urinaire.

XV O00-O99 Grossesse, accouchement et puerpralit (Priode entre

laccouchement et le retour des menstruations.).

XVI P00-P96 Certaines affections dont l'origine se situe dans la priode

prinatale.

XVII Q00-Q99 Malformations congnitales et anomalies

chromosomiques.

XVIII R00-R99 Symptmes, signes et rsultats anormaux d'examens

cliniques et de laboratoire, non classs ailleurs.

XIX S00-T98 Lsions traumatiques, empoisonnements et certaines

autres consquences de causes externes.

XX V01-Y98 Causes externes de morbidit et de mortalit.

XXI Z00-Z99 Facteurs influant sur l'tat de sant et motifs de recours

aux services de sant.

XXII 800-958 Morphologie des tumeurs.

XXIII U00-U99 Codes provisoires pour la recherche et les affectations

temporaires.

Tableau 4. Tableau rcapitulatif des chapitres de CIM 10. [OMS 08]



24

Chaque chapitre est lui-mme hirarchis, un chapitre est divis en catgories, les

catgories sont divises en sous-catgories comme le montre la figure suivante :

Figure 3. Schma illustratif de la hirarchie de CIM 10. [KOHLER 02]

Plus on descend dans la hirarchie plus on utilise de caractres pour la codification.

B. SNOMED CT :

a. Prsentation :

La SNOMED CT (Systematized Nomenclature of Medcine Clinical Terms) est une

terminologie mdicale clinique . [Jamoulle 10]

La SNOMED CT est actuellement gre lIHTSDO (Internationl Health Terminology

Standards Developement Organisation).

La SNOMED CT peut tre utilise pour coder les donnes cliniques mais aussi pour la

recherche et lanalyse de telles donnes.



25

b. Historique :

La SNOMED CT tant une terminologie multiaxiale [IHTSDO 11] son historique

est troitement li celui des terminologies multiaxiales :

1. Avant la cration de la SNOMED CT :

Figure 4. Historique de la SNOMED CT. [Fabry 09]

Systematized Nomenclature of Pathology (SNOP) 1965 :

-Cest une nomenclature de pathologies dveloppe par le CAP (College of American

Pathologists).

-Elle comporte quatre (04) axes

Systematized Nomenclature of Medicine (SNOMED) 1974 :

-Avec laide du Dr. Roger Cot la SNOP conue pour les pathologies a t tendue

plusieurs spcialits de la mdecine repartis sur six (06) axes, la chose qui a promu son

utilisation dans le domaine de la sant. En 1977 la version lectronique de la SNOMED a t

publie.

SNOMED II (Deuxime dition) 1979 :

-Comporte environs 50.000 termes et passe de six sept axes.



26

-En a deuxime (2) dition la Snomed a connu plus dacceptation, elle a t approuve

par lASCP (American Society of Clinical Pathologists) et le RCPath (Royal College of

Pathologists) du Royaume-Uni.

SNOMED III (SNOMED International) Septembre 1993 :

-Cest la premire dition de la Snomed approuve par la communaut internationale

de la sant.

-Elle comporte 130,580 termes repartis sur onze (11) axes.

-Cest une nomenclature multidimensionnelle structure pour l'indexation des

diagnostics et traitements mdicaux.

-En a version 3.5 la Snomed comportait 156,965 termes et 12 axes.

SNOMED RT (Reference terminologie) Mai 2000 :

-Remaniement de la structure de la Snomed III en concepts, relations et descriptions.

-Elle comporte 121,000 concepts relis 190,000 termes par plus de 340,000 relations.

2. Aprs la cration de la SNOMED CT :

SNOMED Clinical Terms (premire dition) Janvier 2002 :

-Cre partir de la fusion de la Snomed RT et la version 3 de la CT (Clinical terms)

une norme utilise au Royaume-Uni.

-Contient approximativement 325,000 concepts relis 800,000 descriptions par

950,000 liens appels relations smantiques.

SNOMED CT Avril 2007 :

Le CAP (College of American Patholigists) a cd la proprit intellectuelle de la

SNOMED CT lorganisation international pour le dveloppement de normes

terminologiques des soins de sant en anglais International Health Terminology Standards

Development Organisation (IHTSDO) qui gre, maintient et met jour cette terminologie.



27

c. Les composants de base la SNOMED CT :

La SNOMED CT comprend 3 composants principaux : des concepts, des descriptions

et des relations comme le montre la figure suivante :

Figure 5. Composants de la SNOMED CT. [Fabry 09]

Concept :

Cest un sens clinique identifi par un identifiant numrique unique (ConceptId) qui

ne change jamais . [IHTSDO 13] (www.ihtsdo.org)

Les concepts sont dfinis par les termes qui leur sont associs et par les relations quils

ont avec les autres concepts. [Fabry 09]

Les concepts de SNOMED CT passent par plusieurs tats savoir actif (au moment de

son insertion), inactif (synonyme, erron, ambigu, etc.).

Description :

Cest un ensemble de termes ou de mots associ un concept de SNOMED CT.

Terme dans ce contexte signifie une phrase utilise pour nommer un concept. Un unique

(DescriptionId) identifie une Description. Plusieurs Descriptions peuvent tre associes un

concept identifi par un (ConceptId). [IHTSDO 13]



28

Types de description :

1. Le Nom complet prcis (NCP - Fully Specified Name en anglais) :

Chaque Concept possde un seul NCP, qui est un ensemble de termes le nommant

dune manire comprhensible pour lhumain.

2. Le Terme privilgi (TP - Preferred term en anglais) :

Chaque concept possde un TP unique dans un dialecte donn. Le TP est ensemble de

termes utilis communment par des praticiens pour nommer ce concept.

3. Les Synonymes :

Un synonyme est un terme autre que le NCP ou le TP, qui peut tre utilis pour

reprsenter un Concept dans une langue ou un dialecte particulier.

Relations

Les relations dans SNOMED CT relient un concept dautres concepts selon quils

aient un sens relatif. Ces relations fournissent des dfinitions formelles et d'autres

caractristiques au concept.

Les relations dans SNOMED CT sont divises en deux types principaux :

1. Les relations hirarchiques :

Comporte uniquement la relation is-a (est un), ce type de relation est lorigine de

larchitecture hirarchique de SNOMED CT tel que la racine est SNOMED CT qui

possde 19 fils appels axes.

2. Les relations transversales :

Comporte plusieurs relations lexemple de finding site (localisation), causative

agent (agent causatif), etc. Ce type de relation permet de relier des concepts de diffrents

axes pour reprsenter dautres aspects de leur dfinition.



29

Figure 6. Exemple illustratif des relations de SNOMED CT. [IHTSDO 13]

d. Contenu :

SNOMED CT comporte actuellement : [IHTSDO 13]

-Beaucoup plus que 300.000 concepts actifs.

-Presque un million de descriptions.

-Beaucoup plus quun million de relations.

e. Organisation et structure de la SNOMED CT :

La SNOMED CT est une terminologie hirarchique multiaxiale possdant dix-neuf

(19) axes de faon quun concept soit une combinaison : [DANIEL-LE BOZEC 07]

-De lanomalie releve.

-Du site anatomique.

-De la cause.



30

-Des actions entreprises pour traiter lanomalie.

-Des circonstances dapparition.

-etc.

Le tableau suivant prsente lensemble des axes :

Code de laxe Nom de laxe Contenu de laxe

404684003 Constatation clinique (Clinical

finding)

Comporte des concepts dcrivant le

rsultat d'une observation clinique,

une valuation ou une constatation et

inclut les tats cliniques normaux et

anormaux.

71388002 Procd (Procedure) Comporte des concepts dcrivant les

activits excutes pour la prestation

du soin. Il comporte aussi une varit

tendue dactivits comme, les

procdures invasives,

ladministration des mdicaments,

les procdures dimagerie, les

procdures dducation (rgimes) et

les procdures administratives.

243796009 Situation avec un contexte

explicite (Situation with

explicit context)

Les concepts dans cette hirarchie

peuvent tre utiliss dans le dossier

mdical pour prsenter :

Les Conditions et les procdures qui ne se sont pas

encore produites.

Les Conditions et les procdures qui se rapportent

quelqu'un dautre que le patient. (lhistorique mdical familial).

Les Conditions et les procdures qui se sont

produites un patient, avant

ltablissement dun enregistrement dans le



31

dossier mdical. (lhistorique mdical du patient).

363787002 Entit observable (Observable

entity)

Comporte les questions ou des

procds qui peuvent produire des

rponses ou des rsultats. C'est des

entits qui peuvent tre utilises pour

coder des lments dans une check-

list ou n'importe quel lment tel que

sa valeur peut tre assigne.

123037004 Structure du corps (Body

structure)

Comporte les structures anatomiques

normales et anormales. Des

structures anatomiques normales

peuvent tre utilises pour spcifier

la partie du corps implique dans une

maladie ou une procdure.

410607006 Organisme (organism)

Comporte les organismes

significatifs pour la mdecine

humaine ou animale. Les organismes

sont aussi utiliss pour la

modlisation des causes des

maladies dans SNOMED CT.

105590001 Substance (substance)

Contient les concepts qui peuvent

tre utiliss pour lenregistrement

des constituants chimiques des

mdicaments, les allergnes

alimentaires et chimiques et les

informations de toxicit ou

d'empoisonnement. Les concepts de

cette hirarchie reprsentent les

substances gnrales et les

constituants chimiques des produits

pharmaceutiques/biologiques.

410607006 Produits

pharmaceutiques/biologiques

(Pharmaceutical/ biologic

product)

Cet axe est diffrent de celui des

Substances. Il a t introduit comme

axe pour mettre en vidence la

diffrence entre les mdicaments



32

(produits) de leurs composants

chimiques (substances).

123038009 Spcimen (Specimen)

Comporte les concepts reprsentant

les chantillons qui sont obtenues

(souvent du patient) pour examens

ou analyses.

260787004 Objet physique (Physical

object)

Comporte les concepts incluant des

objets naturels ou usins. Une des

utilisations de ces concepts est la

modlisation des procdures

utilisant ce genre dobjets

78621006 Force physique (Physical force)

Comporte des concepts

principalement orients la

reprsentation des forces physiques

qui peuvent jouer un rle comme

mcanismes daltration du corps

humain.

272379006 vnement (Event) Comporte les concepts dcrivant des

situations causant des pathologies

(sans inclure les procdures et les

interventions).

308916002 Environnements et

localisations gographiques

(Environments and geographic

locations)

Comporte des types

d'environnements aussi bien que des

noms d'endroits tels que des pays,

des tats et des rgions.

48176007 Contexte social (Social

context)

Comporte des conditions et des

circonstances sociales significatives

la sant. Cet axe comporte aussi

des secteurs tels que le statut

conomique, l'appartenance

ethnique et religieuses, le style de vie



33

et les mtiers. Ces concepts

reprsentent des aspects sociaux

affectant la sant et le traitement du

patient.

254291000 Degrs et graduation (Staging

and scales)

Comporte des sous-hirarchies

comme niveaux de contribution

(Assessment scales) qui numre les

niveaux de contribution de diverses

entits, et des degrs datteinte par

des tumeurs (tumor staging) qui

numre divers degrs et de types

datteinte par une tumeur ou un

cancer.

362981000 Valeur du qualificateur

(Qualifier value)

Comporte des concepts utiliss

comme des valeurs pour des attributs

de SNOMED CT et qui nexiste

nulle part ailleurs.

419891008 Enregistrement dartefact

(Record artifact)

Cest une entit qui est cre par une

ou plusieurs personnes afin de

fournir d'autres personnes des

informations sur des vnements ou

des tats d'affaires. Les

enregistrements dartefacts ne sont

pas obligatoirement des rapports ou

enregistrements complets. Ils

peuvent tre des parties

denregistrements plus grands.

370115009 Concept spcial

(Special concept)

Comporte les concepts qui sont

inactifs que ce soit :

Concept de navigation (Navigational concept).

Concepts inactifs (synonyme, erron, ambigu, etc.).

Concept de nom despace (Namespace concept).



34

900000000000441003 SNOMED

CT Model

Component

Linkage

concept

Ce Sont des concepts qui

spcifient :

*La smantique des relations entre

concepts (Attributs (attribute)).

*les relations affirmes entre les

rapports dans un enregistrement.

(Affirmation dun lien (Link

assertion)).

Namespace

concept

Ce Sont des concepts qui

spcifient lextension pour les

Namespaces alloues par lIHTSDO.

Core

metadata

concept

Ce Sont des concepts qui sont

rfrencs de champs dnumration

inclus dans les versions

internationales (International

Release).

Foundation

metadata

concept

Les metadata ont une grande

contribution dans le mcanisme

dextensibilit.

Tableau 5. Tableau rcapitulatif des axes de SNOMED CT. [IHTSDO 13]



35

II.2.1.2 Dfinition des critres de comparaison :

Ce qui suit est une liste des principaux critres de comparaison qui vont nous permettre

de choisir la norme la plus adquate pour le contexte tudi (Standardisation des termes issus

de lespace dobservation) :

A. La description :

Ce critre mesure la capacit de la norme dcrire les informations de lespace

dobservation (signes et symptmes). Il est divis en deux critres :

Prcision

Ce critre mesure la prcision avec laquelle la norme dcrit le signe ou le symptme.

Combinaison et structure :

Ce critre mesure la complexit des combinaisons et leur capacit amliorer la

description.

B. Le contenu :

Ce critre mesure lampleur du contenu de la norme en gnrale et particulirement en

termes de signes et symptmes.

C. Facilit dutilisation :

Ce critre mesure la facilit dutilisation de la norme travers ces trois critres :

Codage :

Ce critre mesure laide que procure le codage en termes de facilit dutilisation.

Comprhensibilit :

Ce critre mesure la comprhension des nominations que ce soit les noms des concepts,

les noms des axes (chapitres), les noms des relations ou ceux des attributs.

Organisation :

Ce critre mesure lefficacit de la rpartition des concepts sur les axes (chapitres). En

dautres termes, il mesure la facilit de retrouver un concept donne en suivant la

hirarchisation de la norme.



36

D. La maniabilit :

Ce critre mesure ladaptabilit de la norme des situations nouvelles et/ou complexes.

II.2.1.3 La comparaison selon les critres dfinis :

Le tableau suivant effectue une comparaison entre les normes choisies savoir CIM

10 et SNOMED CT selon les critres dfinis ci-dessus :

Critres SNOMED

CT

CIM

10 Justification

Description

Prcision +++ +

Du fait que SNOMED CT est

multiaxiale (19 axes), elle offre la

capacit de dcrire un signe ou un

symptme avec un trs haut degr de

prcision cest d aussi la

profondeur de sa hirarchie 20

niveaux, compare CIM 10 qui est

mono-axiale et qui prsent

uniquement 4 niveaux de profondeur.

Combinaison et

structure ++ +

Du fait que SNOMED CT

possde deux types de relations

savoir (hirarchique et transversal) ce

qui permet de crer des combinaisons

amliorant la description, par contre

CIM10 qui nest quune classification

napporte que les noms des concepts

et ne permet pas de crer des

combinaisons en utilisant les

concepts.

Exemple :



37

*CIM10 : Douleur thoracique

respiratoire (R07.1)

*SNOMED CT : signe/symptme :

Chest pain on breathing (douleur

thoracique respiratoire) (274664007),

rgion : entire sternal part of

diaphragm (sternum entier, partie du

diaphragme) (368049004), apparition

et dure : sudden onset AND short

duration (apparition soudaine et

courte dure) (425323003), svrit :

moderate (modr) (6736007)

Contenu +++ +

SNOMED CT contient plus de

300.000 concepts et parmi ceux-l

plus de 32,000 concernent les signes

et les symptmes [IHTSDO 08], ce

qui dpasse la totalit des termes de

CIM 10 savoir 30.000.

Facilit

dutilisation Codage + +

Code SNOMED CT : 223510005

Correspond : Algeria

(Axe : Environnements et endroits

gographiques)

Code CIM10 : D19

Correspond : chapitre Tumeurs

Le codage utilis dans

SNOMED CT est trs complexe et



38

nest pas utilisable par tous les

utilisateurs.

Le codage de CIM 10 est plus

simple que celui de SNOMED CT,

mais tellement simple quil napporte

que peu dinformation savoir le

chapitre contenant le concept.

Comprhensibilit ++ +

Dans SNOMED CT les

nominations utilises sont

gnralement courtes et

comprhensible, dans CIM10 elles

sont aussi comprhensibles mais trop

longues par rapport SNOMED CT.

Organisation +++ ++

CIM 10 comporte 21 chapitres

pourtant elle noffre que deux

classifications savoir (tiologique et

organique), ce qui rend difficile de

retrouver un concept donne et plus

important encore elle nidentifie pas

son appartenance clinique.

SNOMED CT comporte 19

axes et chaque axe est une

classification indpendante qui donne

lappartenance clinique dun concept

lexemple de : clinical finding

(Constatation clinique), body



39

structure (Structure du corps),

Organism (organisme)

Maniabilit +++ -

CIM10 de par sa constitution

est une classification ce qui limite son

utilisation pour dcrire aux situations

prtablies en utilisant des concepts

prtablis ce qui la rend statique.

SNOMED CT, elle, est

compose de concept trs basique

quon peut combiner pour dcrire

nimporte quelle situation qui se

prsente ce qui la rend dynamique.

Tableau 6. Tableau comparatif entre SNOMED CT et CIM 10.

II.2.1.4 Discussion et rsultats :

La terminologie mdicale SNOMED CT est tout simplement la plus adquate pour la

standardisation des descriptions cliniques portes par le mdecin, comme expos dans le

tableau de comparaison.

La SNOMED CT est de loin prfrable CIM 10, dj car cette dernire est ddie

aux statistiques de mortalit et de morbidit linverse de la premire qui elle est ddie pour

la description des informations cliniques. En plus, tant une terminologie, elle assure la

standardisation des termes de cette description.



40

Sous problmatique :

Les informations issues de lespace dobservation sont standardises ds lors quon

utilise la terminologie mdicale SNOMED CT, cependant elles ne sont toujours pas prtent

pour le traitement.

En effet, dune part les praticiens de la sant veulent utiliser la description textuelle,

pour dcrire et capturer linformation clinique. Dautre part, les informaticiens prfrent

plutt que linformation clinique soit capture dans des formats structurs, ce qui rend le

traitement automatique possible.

La prsente problmatique sera lobjet du prochain chapitre.

Conclusion :

Les normes mdicales tout comme les normes des autres domaines visent

essentiellement crer une certaine standardisation. Dans notre cas, a va prparer

linformation pour subir une procdure de structuration universelle.

La SNOMED CT est loutil par excellence utiliser pour standardiser linformation

mdicale clinique. L'information, tant capture et grce aux normes mdicales

standardise, est prte tre structure.

41

Partie II :

Analyse et

Conception

42

Introduction :

Durant une consultation entre le patient et le mdecin, ce dernier commence par couter

les plaintes du patient concernant son tat de sant celles-ci constituent lensemble des

symptmes, puis le mdecin prend des mesures en relation avec les symptmes relevs celles-

ci constituent lensemble des signes, il termine par un examen complet du patient dnomm

la revue des systmes ces trois groupes dinformations, en loccurrence les symptmes, les

signes et la revue des systmes sont les composants de ce quon a dfini comme espace

dobservation (cf. section I.1.5.2).

Afin dassurer la standardisation de linformation issue de lespace dobservation on a

eu recours une norme mdicale clinique savoir SNOMED CT (cf. section II.2.1.1B)

La figure qui suit est un schma global explicatif du contexte initial de la solution :

Figure 7. Schma explicatif du contexte initial de la solution propose.

La sous problmatique pose la fin du deuxime chapitre, relative la structuration

de linformation clinique, sera rsolue dans la section qui suit.

Symptmes

Autres symptmes + Signes + Revue des systmes

La norme mdicale clinique

SNOMED CT

Patient Mdecin

Information normalise

Information non

normalise (texte libre)

Organise et normalise des descriptions

mdicales.

Facilite la communication et

linteroprabilit entre les diffrents

prestataires de soins.

Etc.(cf. section II.2).

Chapitre III Description dtaille de la solution

43

Chapitre III Description dtaille de la

solution

La solution propose va tre ralise en trois tapes :

La capture de linformation :

Cette tape consiste en la mise en place dun modle capable de capturer et de

structurer linformation mdicale clinique qui nous concerne savoir lespace dobservation.

Le traitement de linformation :

Une fois linformation capture et structure, il sera ncessaire dtablir des formules

pour le traitement de ces informations dj stockes par le modle propos pour la capture.

La reprsentation graphique des informations :

Linformation tant traite elle est prte tre reprsente graphiquement.

III.1 Capture de linformation :

Introduction :

Ltape de capture commence par la conception dun modle capable de capturer et de

structurer linformation mdicale clinique issue de lespace dobservation, tout au long de la

capture on se basera sur la terminologie mdicale SNOMED CT pour assurer la

standardisation de linformation.

Les informations capturer tant souvent de nature imprcise et subjective il sera

ncessaire dutiliser un outil de quantification savoir la logique floue que lon introduira en

temps voulu.


44

III.1.1 Types dinformations potentiels :

Dans cette partie on numrera les diffrents types des informations faisant partie de

lespace dobservation :

Donnes numriques :

Ce sont des donnes quantitatives qui peuvent prendre des valeurs numriques entires

ou relles.

Exemple :

Le mdecin mesure la temprature dun patient et trouve sa valeur de

type numrique : ex. 37, 5 C.

Donnes binaires :

Ce sont des donnes qui ne peuvent prendre que deux modalits. (Vrai/Faux, Oui/Non,

Prsent/Absent, etc.)

Exemple :

Le mdecin voulant savoir si le patient souffre dune douleur au niveau

de labdomen, la rponse du patient ne peut tre que : oui ou non.

Donnes nominales/ordinales :

Ce sont des donnes appartenant des ensembles prdfinis ; les donnes appartenant

un ensemble nominal ne possdent pas dordre (ex. la liste de quelques fonctions vitales :

{Circulatoire, respiratoire, digestive, mtabolique, reproductrice, endocrinienne}) loppos

des ensembles ordinaux qui eux dfinissent une politique dordonnancement (ex. Les degrs

de svrit dun symptme dfinis par la SNOMED CT : {attnu, attnu--modr, modr,

modr--svre, svre, fatal, svrit menaant la vie}).

Donnes floues :

Ce sont des donnes qui ont la particularit dtre imprcises, ce type de donnes est

trait par des rsultats issues de la logique floue (cf. section III.1.4)


45

Exemple :

Le mdecin voulant savoir lintensit ou le degr de la douleur dont le

patient souffre, la rponse du patient est souvent de type flou : un peu, beaucoup, etc.

Donnes textuelles :

Ce sont des donnes de type texte utilises pour la description dune situation, un objet,

une sensation, etc. Ce type de donnes est utilis dans le cas o le type dune donne nest

pas lun de ceux dfinis ci-dessus, en effet le type texte est plus gnral et il peut inclure ces

Documents

Conception_et_réalisation_d’un_module_clinique_pour_les_DSE_(Dossier_de_Santé_Électronique)-