Embed Size (px)
Citation preview
Hos
pita
l de
la S
anta
Cre
u i S
ant P
auG
astr
oent
eriti
s ví
rique
s. D
iagn
òstic
1
Gastroenteritis víriques:
Diagnòstic microbiològic.Quan i com?
Núria Rabella27 maig 2010
Hos
pita
l de
la S
anta
Cre
u i S
ant P
auG
astr
oent
eriti
s ví
rique
s. D
iagn
òstic
21972
19791977
1973
1984
Virus causants de gastroenteritis
1972
19751989
Hos
pita
l de
la S
anta
Cre
u i S
ant P
auG
astr
oent
eriti
s ví
rique
s. D
iagn
òstic
3
* Els virus han de ser empassats
* Resistir l’àcid clorhídric de l'estómac
* Resistir els àcids biliars del duodè
* Trobar les cèl.lules susceptibles de l'intestí
Virus causants de gastroenteritis
Persistència a pesar de les mesures de desinfecció que usualment eradiquen la contaminació bacteriana
Hos
pita
l de
la S
anta
Cre
u i S
ant P
auG
astr
oent
eriti
s ví
rique
s. D
iagn
òstic
4
Gastroenteritis víricaEtiologia
Rotavirus NorovirusSapovirusAstrovirusAdenovirus 40, 41
CoronavirusTorovirusParechovirusAichi virusBirnavirusBocavirus
Hos
pita
l de
la S
anta
Cre
u i S
ant P
auG
astr
oent
eriti
s ví
rique
s. D
iagn
òstic
5
Etiologia de la gastroenteritisnosocomial
Lopman BA et al. Clinical manifestation of norovirus gasroenteritis in health care settings. CID 2004.
Anys: 2002-2003Seguiment prospectiu de brots de gastroenteritisAvon County, Regne Unit
Hospitals: 4 grans, 11 de petits / 238B / 122E / 61N (50%)Residències: 135 / 33B / 19E / 14N (74%)
Hos
pita
l de
la S
anta
Cre
u i S
ant P
auG
astr
oent
eriti
s ví
rique
s. D
iagn
òstic
6
Etiologia de la gastroenteritis
Lopman BA et al. Clinical manifestation of norovirus gasroenteritis in health care settings. CID 2004.
Hos
pita
l de
la S
anta
Cre
u i S
ant P
auG
astr
oent
eriti
s ví
rique
s. D
iagn
òstic
7
Etiologia de la gastroenteritisde la comunitat
Bacteris enteropatògens 17 (2,4%)Virus 232 (21%)
Norovirus 114Rotavirus 52Sapovirus 43Adenovirus 27Astrovirus 14
Paràsits 48 (6,8%)Toxines bacterianes 24 (7,8%)
Total de diagnòstics 46%
De Wit MAS et al. Sensor, a population-based cohort study on gastroenteritis in the Netherlands: Incidence and etiology. Am J Epidemiol 2001
Hos
pita
l de
la S
anta
Cre
u i S
ant P
auG
astr
oent
eriti
s ví
rique
s. D
iagn
òstic
8
Reoviridae
Rotavirus
Sis grups antigènics. A-F
A, B, C detectats en humans
7 P serotipus segons la VP4 de càpside
Capacitat de recombinació del material genètic(11 fragments)
Codifiquen una enterotoxina
Hos
pita
l de
la S
anta
Cre
u i S
ant P
auG
astr
oent
eriti
s ví
rique
s. D
iagn
òstic
9
Adenoviridae
MastadenovirusAdenovirus 40, 41
Sis subgrups: A-F
Subgrup F associat a gastroenteritis
Altres serotipus en pacients immunodeprimits
No es detecta en cultius cel·lulars
Circula tot l’any
Hos
pita
l de
la S
anta
Cre
u i S
ant P
auG
astr
oent
eriti
s ví
rique
s. D
iagn
òstic
10
Astroviridae
Genogrup A: serotipus 1-5 i 8
Genogrup B: serotipus 6 i 7 12 genotipus
No hi ha una completa correlació entre genotipus iserotipus. El més prevalent HAstV-1
No immunitat creuada
Múltiples tipus circulant al mateix temps en una zonageogràfica
Astrovirus
Hos
pita
l de
la S
anta
Cre
u i S
ant P
auG
astr
oent
eriti
s ví
rique
s. D
iagn
òstic
11
Astroviridae
Astrovirus
Diferències en virulència segons el genotipus.
HAstV-3, particularment el genotipus IV implicat en casosde diarrea persistent de durada fins a 3 mesos
Correlació entre la càrrega vírica i la durada de la diarrea
Descobriment de que la càpside vírica te propietatssimilars a les enterotoxines que són dosi-depenents
Hos
pita
l de
la S
anta
Cre
u i S
ant P
auG
astr
oent
eriti
s ví
rique
s. D
iagn
òstic
12
Caliciviridae
NorovirusSapovirus
Hos
pita
l de
la S
anta
Cre
u i S
ant P
auG
astr
oent
eriti
s ví
rique
s. D
iagn
òstic
13
Genogrups I-II-IV,com a mínim 40 genotipusnombrosos subgrups
Acumulació de mutacions puntuals i recombinació
Expressió dels gens de la càpside en baculovirus perproduir VLP
Receptors: antígens de grup sanguini ABO, relacionatsamb susceptibilitat
Emergència de noves variants que substitueixen lasanteriors: nova soca pandèmica cada 2-4 anys
Norovirus
Hos
pita
l de
la S
anta
Cre
u i S
ant P
auG
astr
oent
eriti
s ví
rique
s. D
iagn
òstic
14
Únic hoste l’home
Dosi infectiva baixa (10 -100)
Transmissió: gotes, fomites, contacte persona-persona,contaminació ambiental. Casos secundaris:30%
Excreció vírica abans símptomes i després (109)
Virus manté la seva infectivitat en un ampli rang detemperatures des de la congelació fins 60ºC
Degut a la gran diversitat de soques i a la falta d’immunitatcreuada les infeccions es repeteixen al llarg de la vida
Norovirus
Hos
pita
l de
la S
anta
Cre
u i S
ant P
auG
astr
oent
eriti
s ví
rique
s. D
iagn
òstic
15
És la causa més comuna de
gastroenteritis en els adults i la
segona en nens:
5%-31% de pacients hospitalitzats pergastroenteritis
5%-36% de pacients que consulten al metge
Norovirus
Patel MM et al. Systematic literature review of role of noroviruses in sporadic gastroenteritis. Emerg Infect dis 2008
Hos
pita
l de
la S
anta
Cre
u i S
ant P
auG
astr
oent
eriti
s ví
rique
s. D
iagn
òstic
16
Infecció nosocomial:
30%-50% brots epidèmics en hospitals i residències
altament transmissible
múltiples maneres de transmissió (seqüencial 7)
resistent als desinfectants
Complicacions
Eliminació prolongada
Infecció crònica: noves variants?
Norovirus
Said MA et al. Gastrointestinal flu: norovirus in health care and long-term facilities. CID2008.
Hos
pita
l de
la S
anta
Cre
u i S
ant P
auG
astr
oent
eriti
s ví
rique
s. D
iagn
òstic
17
Diagnòstic:
RT-PCR detecten la majoria de soques però nototes
RT-PCR a temps real més sensible
EIA molt específic per alguns genotipus, lasensibilitat és genotipus depenent. Útil en brots.Confirmació negatius amb RT-PCR
Norovirus
Patel MM et al. Noroviruses : A comprehensive review. J Clin Virol 2009
Hos
pita
l de
la S
anta
Cre
u i S
ant P
auG
astr
oent
eriti
s ví
rique
s. D
iagn
òstic
18
Altres virus
Parechovirus (picornavirus)
Virus Aichi (picornavirus)
Birnavirus
CoronaviridaeCoronavirus
Torovirus
Bocavirus (parvovirus)
Hos
pita
l de
la S
anta
Cre
u i S
ant P
auG
astr
oent
eriti
s ví
rique
s. D
iagn
òstic
19
• Una mostra tenia 7 virus diferents • Les mesures que serveixen per eliminar els
“coliformes” no serveixen pels virus
Hos
pita
l de
la S
anta
Cre
u i S
ant P
auG
astr
oent
eriti
s ví
rique
s. D
iagn
òstic
20
Gastroenteritis víricaTransmissió a través de l’aigua o dels alimentsTransmissió persona a personaTransmissió nosocomial
Alguns amb distribució estacional característicaAfectació de nens i adults
Incubació: 1 a 4 diesDurada: 2 a 7 diesEliminació vírica més enllà del quadre clínic
Hos
pita
l de
la S
anta
Cre
u i S
ant P
auG
astr
oent
eriti
s ví
rique
s. D
iagn
òstic
21
Gastroenteritis víricaDiagnòstic etiològic
QUAN?
Gastroenteritis que requereixen hospitalitzacióBrots epidèmicsGEA de nova aparició en hospitals o residències
Hos
pita
l de
la S
anta
Cre
u i S
ant P
auG
astr
oent
eriti
s ví
rique
s. D
iagn
òstic
22
Gastroenteritis víricaDiagnòstic etiològic
COM?
Microscopia electrònica: poc sensible i laboriosa per moltes mostres
Immunomicroscopia
Hos
pita
l de
la S
anta
Cre
u i S
ant P
auG
astr
oent
eriti
s ví
rique
s. D
iagn
òstic
23
Gastroenteritis víricaDiagnòstic etiològic
COM?
Detecció d’antigen: EIA, làtex, ICGpoc sensible
comercialitzats: rotavirus, adenovirus, astrovirus, norovirus
Hos
pita
l de
la S
anta
Cre
u i S
ant P
auG
astr
oent
eriti
s ví
rique
s. D
iagn
òstic
24
Gastroenteritis víricaDiagnòstic etiològic
COM?
Detecció d’àcids nucleics: molt sensiblePCR multiplex atenció a les diverses variantscorrelació amb infectivitat
Hos
pita
l de
la S
anta
Cre
u i S
ant P
auG
astr
oent
eriti
s ví
rique
s. D
iagn
òstic
25
Gastroenteritis víricaConclusions
1) Alta freqüència, gran impacte social i sanitari
2) Recomanable fer un diagnòstic etiològic
3) Diversitat de reactius disponibles i només per alguns dels virus, amb sensibilitats i especificitats variables
4) No existeix cap tècnica per avaluar infectivitat
Hos
pita
l de
la S
anta
Cre
u i S
ant P
auG
astr
oent
eriti
s ví
rique
s. D
iagn
òstic
26
