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Evaluation génétique des bovins laitiers sous le modèle de lactation de référence et
le modèle de contrôle individuel
I. Boujenane, M. Benbouajili et A. Tijani
De quoi s’agit-il au juste?L’évaluation génétique des bovins laitiers se base sur l’analyse de la PL par lactation de référence
Ce système présente plusieurs lacunes:• La PLR est calculée à partir des contrôles laitiers mensuels en utilisant différentes méthodes
• Pour les lactations non terminées, la PLR est obtenue par extension des lactations partielles àla durée de 305 j
• L’utilisation de la PLR ne permet pas de tenir compte directement des influences des facteurs de variation de la PL
• Certains facteurs de variation ont une influence significative sur la PL, mais le système d’évaluation actuel ne permet pas de les prendre en compte
L’utilisation directe des productions laitières journalières obtenues le jour du contrôle laitier
Modèle de contrôle individuel
Modèle de test journalier
« Test day model »
Quelle est l’alternative?
Les avantages du TDM
�Disparition des procédures de calcul et d’extension de la PLR imposées par le système actuel
� Prise en compte des effets génétiques et du milieu sur les performances de PL mesurées le jour du contrôle laitier
� Evaluation génétique rapide et, donc sélection précoce des reproducteurs
� Evaluation génétique précise des animaux puisqu’elle sera basée sur une dizaine de mesures de PLJ au lieu de la seule information de PLR
� Une grande souplesse dans les protocoles de contrôle laitier par un prolongement de l’intervalle entre les contrôles
� Réduction du coût de l’opération de contrôle laitier à travers l’allégement du schéma de collecte des données
Objectifs de l’étude
�Evaluation génétique des bovins laitiers sous le modèle de lactation de référence et le modèle de contrôle individuel
�Estimation du progrès génétique réalisé
Matériel & Méthodes
• Résultats du contrôle laitier réalisé dans une exploitation privée entre 1997 et 2006
• Contrôles mensuels sont réguliers; l’intervalle entre 2 contrôles successifs est en moyenne de 33 jours
Origine des données
Matériel animal• 1655 vaches de race Holstein• Rang de lactation: de 1 à 5• Age au vêlage: 3,5 ans• Vêlages étalés sur toute l’année
Conduite de la reproduction• Génisses mises à la reproduction à l’âge de 16 à 17 mois, avec un poids > 380 kg• IA est la plus utilisée, la MN en cas d’échec sur 3 IA
Conduite alimentaire• Vaches en stabulation libre et permanente durant
toute l’année• Alimentation à base de fourrages et de concentré
� La ration de base couvre une PL de 25 l� 1 kg de concentré pour toute production de 2,5 l de lait supplémentaire
Analyse des données
Le fichier analysé inclut:�2537 lactations�21466 contrôles laitiers réalisés entre le 5ème et le 305ème jour de lactation
Les variables étudiées sont: �PLR�PLJ
Détermination des effets du milieu
• PLR:- Vache: 1655- Age au vêlage: 5- Rang de lactation: 5- Saison de vêlage: 2- Année de vêlage: 9
• PLJ:- Vache: 1655 -Age au vêlage: 5- Rang de lactation: 5- Saison de vêlage: 2- Année de vêlage: 9- Stade de lactation: 10- Jour de contrôle: 109
Le modèle mixte utilisé inclut:
Estimation des paramètres génétiques et évaluation génétique
• Méthode BLUP appliquée à un modèle unicaractère du type répétitif
• Modèle mixte:- Effets fixes du milieu- Effet génétique additif de la vache- Effet de l’environnement permanent- Effet résiduel
Coefficient de régression de la valeur génétique additive de chaque animal sur son année de naissance
Estimation du progrès génétique
33,527,6PLJ (kg)
23,97693PLR (kg)
CV (%)MoyenneCaractère
Moyennes arithmétiques de la PLR et PLJ des vaches
Résultats
Courbe de lactation moyenne des vaches
PLJ max.: 33,6 kgPic de lactation: 45ème jour
26,77828Age > 5
26,876244 < Age ≤ 5
27,374753 < Age ≤ 4
25,264722 < Age ≤ 3
23,66184Age ≤ 2
*****
PLJ (kg)PLR (kg)Age au vêlage (ans)
Effet de l’âge au vêlage
25,465744
27,783273
24,262435
26,270792
26,173611
******
PLJ (kg)PLR (kg)Rang de lactation
Effet du rang de lactation
25,77268Oct. - Avril
26,16965Mai - Sept.
NS***
PLJ (kg)PLR (kg)Saison de vêlage
Effet de la saison de vêlage
5000
5500
6000
6500
7000
7500
8000
1997
1998
1999
2000
2001
2002
2003
2004
2005
Année de vêlage
PL3
05J
(kg)
1012141618202224262830
PLJ
(kg
)
PL305J PLJ
Effet de l’année de vêlage
18,9275 < DIM ≤ 305
20,1245 < DIM ≤ 275
21,5215 < DIM ≤ 245
23,2185 < DIM ≤ 215
25,1155 < DIM ≤ 185
27,1125 < DIM ≤ 155
29,095 < DIM ≤ 125
30,965 < DIM ≤ 95
32,435 < DIM ≤ 65
30,65 ≤ DIM ≤ 35
***
PLJ (kg)Stade de lactation (jours)
Effet du stade de lactation
Effet du jour de contrôle
Très hautement significatif sur la PLJ
0,110,25Héritabilité
0,340,26Répétabilité
PLJPLRParamètre
Répétabilité et héritabilité
1,37
577,8
Ecart-type
-4,18
-1961,0
Min.
+5,250,13Index PLJ (kg)
+2702,940,3Index PLR (kg)
Max.MoyenneCaractère
Moyenne, écart-type, minimum et maximum des index PLR et PLJ des animaux
-150
-100
-50
0
50
100
150
200
250
300
350
89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 00 01 02 03
Année de naissance
Moy
enne
des
inde
x P
L305
J (k
g)
-0.6
-0.4
-0.2
0
0.2
0.4
0.6
0.8
1
1.2
Moy
enne
des
inde
x P
LJ (
kg)
PL305 PLJ
Evolution des moyennes des index PLR et PLJselon l’année de naissance
• 11,5 kg/an pour la PLR
• 0,06 kg/an pour la PLJ
Le progrès génétique réalisé est de:
∆Gannuel représente 1% de la moyenne, soit 60 à 100 kg/an pour la PLR
Coefficient de corrélation de rang= 0,17
Conclusions
� Le progrès génétique réalisé est faible
� La production laitière des vaches est élevée
� Le modèle de contrôle individuel semble plus précis que le modèle de lactation de référence, car il a permis de:
� Le classement des animaux sur la base de leurs index PLR et PLJ est différent
� Eliminer les erreurs dues au calcul de laPLR et à l’extension des lactations partielles
� Utiliser toutes les informations des contrôles journaliers disponibles
�Modéliser correctement les facteurs de variation affectant la production laitière
�Réformer rapidement les vaches faibles productrices
� Révision du système de contrôle laitier�Allégement du schéma de collecte des données�Réduction du coût de l’opération CL�Retour de l’information aux éleveurs
Implications
� Adoption du modèle de contrôle individuel pour l’évaluation génétique des bovins laitiers�Constitution de la population de référence�Confirmation des index génomiques�Connaissance des vaches laitières à utiliser en
race pure ou en croisement industriel
Merci de votre attention