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BIN1001, H2005, Hervé Philippe, Université de Montré al 1 Gène Rappel historique « un gène = une protéine » Cas des Procaryotes Cas des Eucaryotes

Gène

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Gène. Rappel historique « un gène = une protéine » Cas des Procaryotes Cas des Eucaryotes. Les lois de Mendel. Le moine tchèque Gregor Mendel (1822-1884) constate :. certains caractères s'imposent aux autres pendant la première génération - PowerPoint PPT Presentation

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Gène

Rappel historique

« un gène = une protéine »

Cas des Procaryotes

Cas des Eucaryotes

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Les lois de MendelLe moine tchèque Gregor Mendel (1822-1884) constate :

certains caractères s'imposent aux autres pendant la première génération

les proportions de plantes ayant tel ou tel caractère sont fixes dans les générations suivantes

Les descendants héritent de chaque parent un “élément déterminant“ du caractère,

transmissible et inaltérable.

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Theorie chromosomique de l’héréditéLes chromosomes se comportent comme les “éléments déterminants“ proposés par Mendel

Sutton (1902)

http://cellbank.nihs.go.jp/celldata/jcrb9083.htm

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1 gène=1 enzyme 1 gène=1 protéine

Cistron : un segment d’ADN codant pour un polypeptide

Pas de complémentation

Mutant 2

Mutant 1

Mutant 2

Mutant 1

Complémentation

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Le “dogme central”

Un gène est un "morceau" de l’ ADN contenu dans le noyau de nos cellules et qui porte le plan de fabrication d’une protéine

http://www.cite-sciences.fr/lexique/definition1.php

Un gène est traduit sous forme de protéine en passant par une copie de ce gène. L’ordre des constituants du gène (A, C, G, T) définit l’ordre des composants de la protéine (acides aminés).

Francis Crick et George Gamov (1957)

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Gènes non-codants

http://www.dil.univ-mrs.fr/~vancan/optionBio1/documents/1ercours2003_4.pdf

• ARN de transfert ou ARNt• ARN tm (transfer-messenger)• ARN ribosomal ou ARNr• ARN sn (small nuclear)• ARN sno (small nucleolar)• ARN i (interference)• etc.

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CGATTAAAGATAGAAATACACGATGCGAGCAATCAAATTTCATAACATCACCATGAGTTTGGTCCGAAGCATGAGTGTTTACAATGTTTGAATACCTTATACAGTTCTTATACATACTTTATAAATTATTTCCCAAGCTGTTTTGATACACTCACTAACAGATATTCTATAGAAGGAAAAGTTATCCACTTATGCACATTTATAGTTTTCAGAATTGTGGATAATTAGAAATTACACACAAAGTTATACTATTTTTAGCAACATATTCACAGGTATTTGACATATAGAGAACTGAAAAAGTATAATTGTGTGGATAAGTCGTCCAACTCATGATTTTATAAGGATTTATTTATTGATATTTACATAAAAATACTGTGCATAACTAATAAGCAGGATAAAGTTATCCACCGATTGTTATTAACTTGTGGATAATTATTAACATGGTGTGTTTAGAAGTTATCCACGGCTGTTATTTTTGTGTATAACTTAAAAATTTAAGAAAGATGGAGTAAATTTATGTCGGAAAAAGAAATTTGGGAAAAAGTGCTTGAAATTGCTCAAGAAAAATTATCAGCTGTAAGTTACTCAACTTTCCTAAAAGATACTGAGCTTTACACGATTAAAGATGGTGAAGCTATCGTATTATCGAGTATTCCTTTTAATGCAAATTGGTTAAATCAACAATATGCTGAAATTATCCAAGCAATCTTATTTGATGTTGTAGGCTATGAAGTTAAACCTCACTTTATTACTACTGAAGAATTAGCAAATTATAGTAATAATGAAACTGCTACTCCAAAAGAAACAACAAAACCTTCTACTGAAACAACTGAGGATAATCATGTGCTTGGTAGAGAGCAATTCAATGCCCATAACACATTTGACACTTTTGTAATCGGACCTGGTAACCGCTTTCCACATGCAGCAAGTTTAGCTGTAGCCGAAGCACCAGCCAAAGCGTACAATCCATTATTTATCTATGGAGGGGTTGGTTTAGGAAAAACCCATTTAATGCATGCCATTGGTCATCATGTTTTAGATAATAATCCAGATGCCAAAGTGATTTACACATCAAGTGAAAAATTCACAAATGAATTTATTAAATCAATTCGTGATAACGAAGGTGAAGCTTTCAGAGAAAGATATCGTAATATCGACGTCTTATTAATCGATGATATTCAGTTCATACAAAATAAAGTACAAACACAAGAAGAATTTTTCTATACTTTTAATGAATTGCATCAGAATAACAAGCAAATAGTTATTTCGAGTGATCGACCACCAAAGGAAATTGCACAATTAGAAGACCGATTACGTTCACGCTTTGAATGGGGGCTAATTGTTGATATTACGCCACCAGATTATGAAACTCGAATGGCAATTTTGCAGAAGAAAATTGAAGAAGAAAAATTAGATATTCCACCAGAAGCTTTAAATTATATAGCAAATCAAATTCAATCTAATATTCGTGAATTAGAAGGTGCATTAACACGTTTACTTGCATATTCACAATTATTAGGAAAACCAATTACAACTGAATTAACTGCTGAAGCTTTAAAAGATATCATTCAAGCACCAAAATCTAAAAAGATTACCATCCAAGATATTCAAAAAATTGTAGGCCAGTACTATAATGTTAGGATTGAAGATTTCAGTGCAAAAAAACGTACAAAGTCAATTGCATATCCGCGTCAAATAGCTATGTACTTGTCTAGAGAGCTTACAGATTTCTCATTACCTAAAATTGGTGAAGAATTTGGTGGGCGTGATCATACGACCGTCATTCATGCTCATGAAAAAATATCTAAAGATTTAAAAGAAGATCCTATTTTTAAACAAGAAGTAGAGAATCTTGAAAAAGAAATAAGAAATGTATAAGTAGGAAACTTTGGGAAATGTAATCTGTTATATAACAGCACTAATAATAACTGTCATTTTTTACATTTCTATATACTAATGTGACAAGATGAGCAAAACTCATTTTGTGGATAATGTTTAAAAGTCATACACACCATACACAAGTTATCAACATGTGTATAACTTCGCCAAATCTATGTTTTTACGACTTATCCACCAATCCACAGCACCTACTACTATTACTAAGAACTTAAAACCTATATAATTATATATAAACGACTGGAAGGAGTTTTAATTAATGATGGAATTCACTATTAAAAGAGATTATTTTATTACACAATTAAATGACACATTAAAAGCTATTTCACCAAGAACAACATTACCTATATTAACTGGTATCAAAATCGATGCGAAAGAACATGAAGTTATACTAACTGGTTCAGACTCTGAAATTTCAATAGAAATCACTATTCCTAAAACTGTAGATGGCGAAGATATTGTCAATATTTCAGAAACAGGCTCAGTAGTACTTCCTGGACGATTCTTTGTTGATATTATAAAAAAATTACCTGGTAAAGATGTTAAATTATCTACAAATGAACAATTCCAGACATTAATTACATCAGGTCATTCTGAATTTAATTTAAGTGGCTTAGATCCAGATCAATATCCTTTATTACCTCAAGTTTCTAGAGATGACGCAATTCAATTGTCGGTAAAAGTGCTTAAAAACGTGATTGCACAAACGAATTTTGCAGTGTCCACCTCAGAAACACGCCCAGTACTAACTGGTGTGAACTGGCTTATACAAGAAAATGAATTAATATGCACAGCGACTGACTCACACCGCTTGGCTGTAAGAAAGTTGCAGTTAGAAGATGTTTCTGAAAACAAAAATGTCATCATTCCAGGTAAGGCTTTAGCTGAATTAAATAAAATTATGTCTGACAATGAAGAAGACATTGATATCTTCTTTGCTTCAAACCAAGTTTTATTTAAAGTTGGAAATGTGAACTTTATTTCTCGATTATTAGAAGGACATTATCCTGATACAACACGTTTATTCCCTGAAAACTATGAAATTAAATTAAGTATAGACAATGGGGAGTTTTATCATGCGATTGATCGTGCCTCTTTATTAGCACGTGAAGGTGGTAATAACGTTATTAAATTAAGTACAGGTGATGACGTTGTTGAATTATCTTCTACATCACCAGAAATTGGTACTGTAAAAGAAGAAGTTGATGCAAACGATGTTGAAGGTGGTAGCCTGAAAATTTCATTCAACTCTAAATATATGATGGATGCTTTAAAAGCAATCGATAATGATGAGGTTGAAGTTGAATTCTTCGGTACAATGAAACCATTTATTCTAAAACCAAAAGGTGACGACTCGGTAACGCAATTAATTTTACCAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAAAACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAGATGCGTATGTAAAATAAATTTGACAGCATTTTAAACAGCAAATAAAAGACGCCAATTAAATTTATGACAAATGTATCCAAAATTTAATAAGTGTGCTTATATGCCCTTTAAATTTAAAATTTTAATAGTCAATAACAAGTTGAATATTAAAGTTAAACGCCGTTAAATAGCGTTAAAAAATTGAAAATGACAGTATTGCCAAAAAATAAGAATTAATTATTTATATGTAAACGGTTTCTACCTCTATTTTAAATGAAATTTGTGACAAAAAAAGGTATAATATATTAATGACACACAAAGAAATGGAGTGATTATTTTGGTTCAAGAAGTTGTAGTAGAAGGAGACATTAATTTAGGTCAATTTCTAAAAACAGAAGGGATTATTGAATCTGGTGGTCAAGCAAAATGGTTCTTGCAAGACGTTGAAGTATTAATTAATGGAGTGCGTGAAACACGTCGCGGTAAAAAGTTAGAACATCAAGATCGTATAGATATCCCAGAATTACCTGAAGATGCTGGTTCTTTCTTAATCATTCATCAAGGTGAACAATGAAGTTAAATACACTCCAATTAGAAAATTATCGTAACTATGATGAGGTTACGTTGAAATGTCATCCTGACGTGAATATCCTCATTGGAGAAAATGCACAAGGAAAGACAAATTTACTTGAATCAATTTATACCTTAGCTTTAGCAAAAAGTCATAGAACGAGTAATGATAAGGAACTCATACGTTTTAATGCTGATTATGCTAAAATAGAAGGTGAGCTTAGTTATAGACACGGCACGATGCCATTAACAATGTTTATAACTAAAAAAGGTAAACAAGTCAAAGTGAATCACTTAGAGCAAAGTCGTCTAACTCAATATATTGGACACCTCAATGTGGTTCTATTTGCGCCAGAAGATTTGAATATTGTAAAAGGCTCTCCTCAAATAAGACGACGCTTTATAGATATGGAGTTGGGCCAAATTTCTGCTGTTTACTTAAATGATTTAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAACTGATAAACGTGCACATTTTATTCAAGAGCTAGAGTCGTTAGCTAAACCGATTCATGCTGGTATCACAAATGATAAAGAAGCGTTGTCGCTAAATTATTTACCTAGTCTTAAATTTGATTATGCTCAAAATGAAGCGGCACGACTTGAAGAAATTATGTCTATTCTTAGCGATAATATGCAAAGAGAAAAAGAACGAGGCATTAGCTTATTCGGACCACATCGAGATGATATAAGTTTTGATGTGAATGGCATGGATGCTCAAACATATGGTTCTCAAGGACAGCAACGTACAACGGCTTTGTCCATTAAATTAGCTGAAATTGAGTTAATGAATATCGAAGTTGGGGAATATCCCATCTTATTATTAGACGATGTACTCAGTGAATTAGATGATTCGCGTCAAACGCATTTATTAAGTACGATTCAGCATAAAGTACAAACATTTGTCACTACGACATCTGTAGATGGTATTGATCATGAAATCATGAATAACGCTAAATTGTATCGTATT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http://www.phschool.com/science/biology_place/biocoach/images/translation/centdogtl.gif

Comment identifier un gène codant

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Cas des Procaryotes

http://www.mun.ca/biology/scarr/Transcription_&_Translation_Prokaryotes.htm

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http://www.uark.edu/campus-resources/mivey/m4233/promoter.gif

Page 11: Gène

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http://weblogo.berkeley.edu/img/

Faible conservation des promoteurs

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http://cwx.prenhall.com/horton/medialib/media_portfolio/text_images/FG22_17.JPG

Séquence de Shine & Dalgarno

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Conservation de la région 5’

http://www-lmmb.ncifcrf.gov/~toms/gallery/ribo.logo.gif

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www.millerandlevine.com/ Code-Table-circular.html

Le code génétique

Phases ouvertes de lecture (ORFs)

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Cas des Eucaryotes

http://campus.queens.edu/faculty/jannr/Genetics/images/FG13_01dogma.jpg

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Activation des gènes

Lewin (2000) Gene VII

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Etude mutationelle d’un enhancer

Lewin (2000) Gene VII

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Etude mutationelle d’un promoteur

Lewin (2000) Gene VII

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Introns

http://oregonstate.edu/instruction/

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http://www.wellcome.ac.uk/en/genome/images/hg02b001structure_gene.gif

Structure d’un gène chez les Eucaryotes

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Mécanismes d’épissage

http://oregonstate.edu/instruction/bb492/fignumbers/figL12-24.html

Page 22: Gène

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Caractéristiques d’un intron

http://www-lmmb.ncifcrf.gov/~toms/sequencelogo.html99.24% GT-AG, 0.69% GC-AG 0.05% AT-AC

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Epissage alternatif

http://www.exonhit.com/alternativesplicing/

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http://www.phytoplankton.uconn.edu/research_rnaediting2.htm

Edition des ARN messagers

ADN génomique

ADN génomique

ARN messager

ARN messager

Mitochondrie de Dinoflagellés

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Gène mitochondrial du cytochrome b de Leishmania tarentolae

http://www.tcd.ie/Genetics/staff/Noel.Murphy/trypanosome%20molecular%20genetics%20ge4/papers/rna%20editing-simpson.pdf

Un cas extrême édition

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La prédiction des séquences codantes est efficace chez les Procaryotes

http://www.tcd.ie/Genetics/staff/Noel.Murphy/trypanosome%20molecular%20genetics%20ge4/papers/rna%20editing-simpson.pdf

En pratique …

La prédiction des séquences codantes est très imprécise chez les Eucaryotes :• utilisation des ESTs (Expressed Sequence

Tag)• comparaison avec des organismes proches

(environ 15% des gènes de Saccharomyces)• etc.