GénétiqueGénétique

Groupe 41Groupe 41

CONNAN DelphineCONNAN Delphine LOPEZ LiseLOPEZ Lise MOROS NICOLAS CarlaMOROS NICOLAS Carla ROZAND Camille ROZAND Camille

Paramètres génétiques de la croissance et des caractéristiques de la carcasse basés sur la

tomographie informatisée in vivo,

chez les lapins de souche Pannon White

ObjectifObjectif

Estimation des paramètres génétiques Estimation des paramètres génétiques concernant la croissance et les concernant la croissance et les caractéristiques de la carcasse :caractéristiques de la carcasse :

Gain Quotidien Moyen mesuré entre 5 et 10 Gain Quotidien Moyen mesuré entre 5 et 10 semaines (GQM)semaines (GQM)

Aire de section du muscle Longissimus dorsi Aire de section du muscle Longissimus dorsi (mesure entre vertèbres lombaires 2-3 et 4-5) (mesure entre vertèbres lombaires 2-3 et 4-5) (L)(L)

Rendement carcasse (mesure à l’âge de mise Rendement carcasse (mesure à l’âge de mise sur le marché) (DoP)sur le marché) (DoP)

Matériel et MéthodeMatériel et Méthode

Population de départPopulation de départ

Croisement à 3 voies :Croisement à 3 voies : Mères issues du croisement entre 2 lignées Mères issues du croisement entre 2 lignées

maternelles (effet hétérosis)maternelles (effet hétérosis) Pères : lignée pure issue d’une sélection sur Pères : lignée pure issue d’une sélection sur

GQM et poids corporel à l’âge de venteGQM et poids corporel à l’âge de vente

Lapins Pannon White sélectionnés pour Lapins Pannon White sélectionnés pour la viande la viande

Management de la populationManagement de la population 28686 lapins nés entre 2000 et 2003, issus de 5044 28686 lapins nés entre 2000 et 2003, issus de 5044

portéesportées Nombre de base : 149Nombre de base : 149 NourritureNourriture Sélection des animaux : GQM > moyenne du lotSélection des animaux : GQM > moyenne du lot

45g pour les femelles45g pour les femelles 47,6g pour les mâles47,6g pour les mâles

Tomographie (cm²)Tomographie (cm²) Pourcentage carcasse = (poids carcasses froides/ Pourcentage carcasse = (poids carcasses froides/

poids vif)*100poids vif)*100

Estimation des paramètres génétiquesEstimation des paramètres génétiques Modèle animal multivarié, approche Modèle animal multivarié, approche

BayésienneBayésienne Estimation des composantes de la Estimation des composantes de la

variance pour GQM, L, DoPvariance pour GQM, L, DoP Prise en compte de l’effet âge, nichée et Prise en compte de l’effet âge, nichée et

génétique additif pour les 3 caractèresgénétique additif pour les 3 caractères Prise en compte du PC pour L seulement, Prise en compte du PC pour L seulement,

et de l’âge de l’abattage pour DoPet de l’âge de l’abattage pour DoP Amplification de données pour obtenir un Amplification de données pour obtenir un

même type de matrice pour les 3même type de matrice pour les 3

Modèle obtenu : Modèle obtenu :

(y/b,c,a,R)~N(Xb+Za+Wc,Ro In)(y/b,c,a,R)~N(Xb+Za+Wc,Ro In)y : séquence des enregistrements pour GQM, L, DoPy : séquence des enregistrements pour GQM, L, DoP

X,Z,W : matrices connuesX,Z,W : matrices connues

In : matrice identitéIn : matrice identité

Ro : matrice résiduelle de varianceRo : matrice résiduelle de variance

b : affecté d’ une distribution uniforme délimitéeb : affecté d’ une distribution uniforme délimitée

a : effets génétiques supposés gaussiens : a~N(0,Go A)a : effets génétiques supposés gaussiens : a~N(0,Go A)

A: matrice en relation avec les effets génétiques A: matrice en relation avec les effets génétiques additifsadditifs

Go: matrice de la variance génétique additiveGo: matrice de la variance génétique additive

c : effets nichée supposés indépendants et gaussiens : c~N(0, c : effets nichée supposés indépendants et gaussiens : c~N(0, Co Io)Co Io)

Co : matrice de la variance additive commune pour la Co : matrice de la variance additive commune pour la taille de la portéetaille de la portée

Io : matrice identitéIo : matrice identité

Echantillonage de GibbsEchantillonage de Gibbs Algorithme : estimer les distributions Algorithme : estimer les distributions

ultérieures encore inconnuesultérieures encore inconnues + amplification de données+ amplification de données

Résultats et discussionRésultats et discussion

Effets génétiques Effets génétiques additifsadditifs --moyennes et médianes quasi égalesmoyennes et médianes quasi égales

-héritabilité GQM :-héritabilité GQM :

- modérée- modérée

- ne diffère pas de estimation - ne diffère pas de estimation prévue (0,25)prévue (0,25)

- post-sevrage : entre 0,11 et 0,48- post-sevrage : entre 0,11 et 0,48

- augmente avec l’âge- augmente avec l’âge

-héritabilité de L : -héritabilité de L :

-modérée, au moins 0,26-modérée, au moins 0,26

-héritabilité de DoP-héritabilité de DoP

-assez élevée, au moins 0,22-assez élevée, au moins 0,22

Effet nichée (c²)Effet nichée (c²)

-moyenne et médiane quasi identique

-Effet moyen pour GQM (moins expliqué par la variance phénotypique totale que par les effets génétiques additifs). Max 0,22, plus haut si animal jeune

-valeur plus basse pour L et DoP car animaux plus âgés

Effet maternel génétique (m²)Effet maternel génétique (m²)pas examiné dans cette étudepas examiné dans cette étude

Coefficient de corrélation génétiqueCoefficient de corrélation génétique

- Entre GQM et caractéristiques de carcasse (L et DoP) moyen et Entre GQM et caractéristiques de carcasse (L et DoP) moyen et négatifnégatif

- Relation entre GQM et DoP expliquée par changements Relation entre GQM et DoP expliquée par changements allométriquesallométriques

- Non favorable pour la croissance des lapins car un des critères de Non favorable pour la croissance des lapins car un des critères de sélection est le GQMsélection est le GQM

- Si sélection sur GQM, augmentation du PC aussi ( ! obésité)Si sélection sur GQM, augmentation du PC aussi ( ! obésité)- Poids fixé pour l’abattagePoids fixé pour l’abattage rendement carcasse plus faible rendement carcasse plus faible

- Corrélation relativement forte entre L et DoPCorrélation relativement forte entre L et DoP- Possibilité de sélection sur DoPPossibilité de sélection sur DoP

ConclusionConclusion Héritabilité moyenne de L et corrélation positive Héritabilité moyenne de L et corrélation positive

et assez élevée entre L et DoPet assez élevée entre L et DoP Sélection Sélection possible sur DoPpossible sur DoP

Mais réponse attendue sûrement moindre car Mais réponse attendue sûrement moindre car corrélation < 100% et héritabilité de DoP > à corrélation < 100% et héritabilité de DoP > à celle de Lcelle de L

Alternative : sélection sur L (idéal) mais prix Alternative : sélection sur L (idéal) mais prix élevé de la tomographie et un seul endroit!élevé de la tomographie et un seul endroit!

! Diminution du GQM si sélection sur L! Diminution du GQM si sélection sur Lpériode d’engraissement plus période d’engraissement plus

longue : économie??longue : économie?? Qualité de la viande ?Qualité de la viande ?

BibliographieBibliographie Nagy I.,Ibàñez N. Nagy I.,Ibàñez N. et alet al. Genetic parameters of growth and . Genetic parameters of growth and

in vivo computerized tomography based carcass traits in in vivo computerized tomography based carcass traits in Pannon White rabbits. Pannon White rabbits. Livestock science.Livestock science. 2006, 104 : 46- 2006, 104 : 46-5252

http://www.dcam.upv.es/8wrc/docs/Genetics%20and%20Bihttp://www.dcam.upv.es/8wrc/docs/Genetics%20and%20Biotechnology/Short%20Papers/175-180_SZEZSOP2_mod.pdotechnology/Short%20Papers/175-180_SZEZSOP2_mod.pdff

wwwwww.kaposvar..kaposvar.patepate..huhu/sertes//sertes/nyulasnapoknyulasnapok..htmhtm. .