196
1 N° d’ordre : 04-ISAL-0076 année 2004 THESE Présentée DEVANT L’INSTITUT NATIONAL DES SCIENCES APPLIQUEES DE LYON Pour obtenir LE GRADE DE DOCTEUR Formation doctorale: Biochimie Ecole doctorale interdisciplinaire sciences-santé Par Hiba KOMATI IMPLICATION DE LA PHOSPHOLIPASE D ET DE SON PRODUIT, L’ACIDE PHOSPHATIDIQUE, DANS LA DIFFERENCIATION MYOGENIQUE Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : Mme le Dr. M.BRETON-DOUILLON (Rapporteur) Mme Le Dr. B.GENY (Rapporteur) M. le Pr. M.LAGARDE (Président) M. le Dr. F.NARO M. le Dr. G.NEMOZ (Directeur de thèse) Mme le Dr. A.F.PRIGENT Cette thèse a été préparée au Laboratoire de Physiopathologie des Lipides et Membranes de l’INSA (INSERM UMR585)

Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

  • Upload
    dinhbao

  • View
    213

  • Download
    0

Embed Size (px)

Citation preview

Page 1: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

1

N° d’ordre : 04-ISAL-0076 année 2004

THESE Présentée

DEVANT L’INSTITUT NATIONAL DES SCIENCES APPLIQUEES DE LYON

Pour obtenir

LE GRADE DE DOCTEUR

Formation doctorale: Biochimie

Ecole doctorale interdisciplinaire sciences-santé

Par

Hiba KOMATI

IMPLICATION DE LA PHOSPHOLIPASE D ET DE SON PRODUIT, L’ACIDE

PHOSPHATIDIQUE, DANS LA DIFFERENCIATION MYOGENIQUE

Soutenance le 03 décembre 2004

Jury de thèse : Mme le Dr. M.BRETON-DOUILLON (Rapporteur)

Mme Le Dr. B.GENY (Rapporteur)

M. le Pr. M.LAGARDE (Président)

M. le Dr. F.NARO

M. le Dr. G.NEMOZ (Directeur de thèse)

Mme le Dr. A.F.PRIGENT

Cette thèse a été préparée au Laboratoire de Physiopathologie des Lipides et Membranes de l’INSA (INSERM UMR585)

Page 2: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

2

Novembre 2003

INSTITUT NATIONAL DES SCIENCES APPLIQUEES DE LYON

Directeur : STORCK A.

Professeurs :

AMGHAR Y. LIRIS

AUDISIO S. PHYSICOCHIMIE INDUSTRIELLE

BABOT D. CONT. NON DESTR. PAR RAYONNEMENTS IONISANTS

BABOUX J.C. GEMPPM***

BALLAND B. PHYSIQUE DE LA MATIERE

BAPTISTE P. PRODUCTIQUE ET INFORMATIQUE DES SYSTEMES MANUFACTURIERS

BARBIER D. PHYSIQUE DE LA MATIERE

BASKURT A. LIRIS

BASTIDE J.P. LAEPSI****

BAYADA G. MECANIQUE DES CONTACTS

BENADDA B. LAEPSI****

BETEMPS M. AUTOMATIQUE INDUSTRIELLE

BIENNIER F. PRODUCTIQUE ET INFORMATIQUE DES SYSTEMES MANUFACTURIERS

BLANCHARD J.M. LAEPSI****

BOISSE P. LAMCOS

BOISSON C. VIBRATIONS-ACOUSTIQUE

BOIVIN M. (Prof. émérite) MECANIQUE DES SOLIDES

BOTTA H. UNITE DE RECHERCHE EN GENIE CIVIL - Développement Urbain

BOTTA-ZIMMERMANN M. (Mme) UNITE DE RECHERCHE EN GENIE CIVIL - Développement Urbain

BOULAYE G. (Prof. émérite) INFORMATIQUE

BOYER J.C. MECANIQUE DES SOLIDES

BRAU J. CENTRE DE THERMIQUE DE LYON - Thermique du bâtiment

BREMOND G. PHYSIQUE DE LA MATIERE

BRISSAUD M. GENIE ELECTRIQUE ET FERROELECTRICITE

BRUNET M. MECANIQUE DES SOLIDES

BRUNIE L. INGENIERIE DES SYSTEMES D’INFORMATION

BUFFIERE J-Y. GEMPPM***

BUREAU J.C. CEGELY*

CAMPAGNE J-P. PRISMA

CAVAILLE J.Y. GEMPPM***

CHAMPAGNE J-Y. LMFA

CHANTE J.P. CEGELY*- Composants de puissance et applications

CHOCAT B. UNITE DE RECHERCHE EN GENIE CIVIL - Hydrologie urbaine

COMBESCURE A. MECANIQUE DES CONTACTS

COURBON GEMPPM

COUSIN M. UNITE DE RECHERCHE EN GENIE CIVIL - Structures

DAUMAS F. (Mme) CENTRE DE THERMIQUE DE LYON - Energétique et Thermique

DJERAN-MAIGRE I. UNITE DE RECHERCHE EN GENIE CIVIL

DOUTHEAU A. CHIMIE ORGANIQUE

DUBUY-MASSARD N. ESCHIL

DUFOUR R. MECANIQUE DES STRUCTURES

DUPUY J.C. PHYSIQUE DE LA MATIERE

Page 3: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

3

EMPTOZ H. RECONNAISSANCE DE FORMES ET VISION

ESNOUF C. GEMPPM***

EYRAUD L. (Prof. émérite) GENIE ELECTRIQUE ET FERROELECTRICITE

FANTOZZI G. GEMPPM***

FAVREL J. PRODUCTIQUE ET INFORMATIQUE DES SYSTEMES MANUFACTURIERS

FAYARD J.M. BIOLOGIE FONCTIONNELLE, INSECTES ET INTERACTIONS

FAYET M. (Prof. émérite) MECANIQUE DES SOLIDES

FAZEKAS A. GEMPPM

FERRARIS-BESSO G. MECANIQUE DES STRUCTURES

FLAMAND L. MECANIQUE DES CONTACTS

FLEURY E. CITI

FLORY A. INGENIERIE DES SYSTEMES D’INFORMATIONS

FOUGERES R. GEMPPM***

FOUQUET F. GEMPPM***

FRECON L. (Prof. émérite) REGROUPEMENT DES ENSEIGNANTS CHERCHEURS ISOLES

GERARD J.F. INGENIERIE DES MATERIAUX POLYMERES

GERMAIN P. LAEPSI****

GIMENEZ G. CREATIS**

GOBIN P.F. (Prof. émérite) GEMPPM***

GONNARD P. GENIE ELECTRIQUE ET FERROELECTRICITE

GONTRAND M. PHYSIQUE DE LA MATIERE

GOUTTE R. (Prof. émérite) CREATIS**

GOUJON L. GEMPPM***

GOURDON R. LAEPSI****.

GRANGE G. (Prof. émérite) GENIE ELECTRIQUE ET FERROELECTRICITE

GUENIN G. GEMPPM***

GUICHARDANT M. BIOCHIMIE ET PHARMACOLOGIE

GUILLOT G. PHYSIQUE DE LA MATIERE

GUINET A. PRODUCTIQUE ET INFORMATIQUE DES SYSTEMES MANUFACTURIERS

GUYADER J.L. VIBRATIONS-ACOUSTIQUE

GUYOMAR D. GENIE ELECTRIQUE ET FERROELECTRICITE

HEIBIG A. MATHEMATIQUE APPLIQUEES DE LYON

JACQUET-RICHARDET G. MECANIQUE DES STRUCTURES

JAYET Y. GEMPPM***

JOLION J.M. RECONNAISSANCE DE FORMES ET VISION

Novembre 2003

JULLIEN J.F. UNITE DE RECHERCHE EN GENIE CIVIL - Structures

JUTARD A. (Prof. émérite) AUTOMATIQUE INDUSTRIELLE

KASTNER R. UNITE DE RECHERCHE EN GENIE CIVIL - Géotechnique

KOULOUMDJIAN J. (Prof. émérite) INGENIERIE DES SYSTEMES D’INFORMATION

LAGARDE M. BIOCHIMIE ET PHARMACOLOGIE

LALANNE M. (Prof. émérite) MECANIQUE DES STRUCTURES

LALLEMAND A. CENTRE DE THERMIQUE DE LYON - Energétique et thermique

LALLEMAND M. (Mme) CENTRE DE THERMIQUE DE LYON - Energétique et thermique

LAREAL P (Prof. émérite) UNITE DE RECHERCHE EN GENIE CIVIL - Géotechnique

LAUGIER A. (Prof. émérite) PHYSIQUE DE LA MATIERE

LAUGIER C. BIOCHIMIE ET PHARMACOLOGIE

LAURINI R. INFORMATIQUE EN IMAGE ET SYSTEMES D’INFORMATION

LEJEUNE P. UNITE MICROBIOLOGIE ET GENETIQUE

Page 4: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

4

LUBRECHT A. MECANIQUE DES CONTACTS

MASSARD N. INTERACTION COLLABORATIVE TELEFORMATION TELEACTIVITE

MAZILLE H. (Prof. émérite) PHYSICOCHIMIE INDUSTRIELLE

MERLE P. GEMPPM***

MERLIN J. GEMPPM***

MIGNOTTE A. (Mle) INGENIERIE, INFORMATIQUE INDUSTRIELLE

MILLET J.P. PHYSICOCHIMIE INDUSTRIELLE

MIRAMOND M. UNITE DE RECHERCHE EN GENIE CIVIL - Hydrologie urbaine

MOREL R. (Prof. émérite) MECANIQUE DES FLUIDES ET D’ACOUSTIQUES

MOSZKOWICZ P. LAEPSI****

NARDON P. (Prof. émérite) BIOLOGIE FONCTIONNELLE, INSECTES ET INTERACTIONS

NAVARRO Alain (Prof. émérite) LAEPSI****

NELIAS D. LAMCOS

NIEL E. AUTOMATIQUE INDUSTRIELLE

NORMAND B. GEMPPM

NORTIER P. DREP

ODET C. CREATIS**

OTTERBEIN M. (Prof. émérite) LAEPSI****

PARIZET E. VIBRATIONS-ACOUSTIQUE

PASCAULT J.P. INGENIERIE DES MATERIAUX POLYMERES

PAVIC G. VIBRATIONS-ACOUSTIQUE

PECORARO S. GEMPPM

PELLETIER J.M. GEMPPM***

PERA J. UNITE DE RECHERCHE EN GENIE CIVIL - Matériaux

PERRIAT P. GEMPPM***

PERRIN J. INTERACTION COLLABORATIVE TELEFORMATION TELEACTIVITE

PINARD P. (Prof. émérite) PHYSIQUE DE LA MATIERE

PINON J.M. INGENIERIE DES SYSTEMES D’INFORMATION

PONCET A. PHYSIQUE DE LA MATIERE

POUSIN J. MODELISATION MATHEMATIQUE ET CALCUL SCIENTIFIQUE

PREVOT P. INTERACTION COLLABORATIVE TELEFORMATION TELEACTIVITE

PROST R. CREATIS**

RAYNAUD M. CENTRE DE THERMIQUE DE LYON - Transferts Interfaces et Matériaux

REDARCE H. AUTOMATIQUE INDUSTRIELLE

RETIF J-M. CEGELY*

REYNOUARD J.M. UNITE DE RECHERCHE EN GENIE CIVIL - Structures

RICHARD C. LGEF

RIGAL J.F. MECANIQUE DES SOLIDES

RIEUTORD E. (Prof. émérite) MECANIQUE DES FLUIDES

ROBERT-BAUDOUY J. (Mme) (Prof. émérite) GENETIQUE MOLECULAIRE DES MICROORGANISMES

ROUBY D. GEMPPM***

ROUX J.J. CENTRE DE THERMIQUE DE LYON – Thermique de l’Habitat

RUBEL P. INGENIERIE DES SYSTEMES D’INFORMATION

SACADURA J.F. CENTRE DE THERMIQUE DE LYON - Transferts Interfaces et Matériaux

SAUTEREAU H. INGENIERIE DES MATERIAUX POLYMERES

SCAVARDA S. (Prof. émérite) AUTOMATIQUE INDUSTRIELLE

SOUIFI A. PHYSIQUE DE LA MATIERE

SOUROUILLE J.L. INGENIERIE INFORMATIQUE INDUSTRIELLE

THOMASSET D. AUTOMATIQUE INDUSTRIELLE

THUDEROZ C. ESCHIL – Equipe Sciences Humaines de l’Insa de Lyon

UBEDA S. CENTRE D’INNOV. EN TELECOM ET INTEGRATION DE SERVICES

Page 5: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

5

VELEX P. MECANIQUE DES CONTACTS

VERMANDE P. (Prof émérite) LAEPSI

VIGIER G. GEMPPM***

VINCENT A. GEMPPM***

VRAY D. CREATIS**

VUILLERMOZ P.L. (Prof. émérite) PHYSIQUE DE LA MATIERE

Directeurs de recherche C.N.R.S. :

BERTHIER Y. MECANIQUE DES CONTACTS

CONDEMINE G. UNITE MICROBIOLOGIE ET GENETIQUE

COTTE-PATAT N. (Mme) UNITE MICROBIOLOGIE ET GENETIQUE

ESCUDIE D. (Mme) CENTRE DE THERMIQUE DE LYON

FRANCIOSI P. GEMPPM***

MANDRAND M.A. (Mme) UNITE MICROBIOLOGIE ET GENETIQUE

POUSIN G. BIOLOGIE ET PHARMACOLOGIE

ROCHE A. INGENIERIE DES MATERIAUX POLYMERES

SEGUELA A. GEMPPM***

VERGNE P. LaMcos

Directeurs de recherche I.N.R.A. :

FEBVAY G. BIOLOGIE FONCTIONNELLE, INSECTES ET INTERACTIONS

GRENIER S. BIOLOGIE FONCTIONNELLE, INSECTES ET INTERACTIONS

RAHBE Y. BIOLOGIE FONCTIONNELLE, INSECTES ET INTERACTIONS

Directeurs de recherche I.N.S.E.R.M. :

KOBAYASHI T. PLM

PRIGENT A.F. (Mme) BIOLOGIE ET PHARMACOLOGIE

MAGNIN I. (Mme) CREATIS**

* CEGELY CENTRE DE GENIE ELECTRIQUE DE LYON

** CREATIS CENTRE DE RECHERCHE ET D’APPLICATIONS EN TRAITEMENT DE L’IMAGE ET DU SIGNAL

***GEMPPM GROUPE D'ETUDE METALLURGIE PHYSIQUE ET PHYSIQUE DES MATERIAUX

****LAEPSI LABORATOIRE D’ANALYSE ENVIRONNEMENTALE DES PROCEDES ET SYSTEMES INDUSTRIELS

Page 6: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

6

SIGLE ECOLE DOCTORALE NOM ET COORDONNEES DU RESPONSABLE

CHIMIE DE LYON M. Denis SINOU

Université Claude Bernard Lyon 1

Lab Synthèse Asymétrique UMR UCB/CNRS

5622

Bât 308

2ème étage

43 bd du 11 novembre 1918

69622 VILLEURBANNE Cedex

Tél : 04.72.44.81.83

[email protected]

E2MC

ECONOMIE, ESPACE ET MODELISATION DES COMPORTEMENTS

M. Alain BONNAFOUS

Université Lyon 2

14 avenue Berthelot

MRASH

Laboratoire d’Economie des Transports

69363 LYON Cedex 07

Tél : 04.78.69.72.76

[email protected]

E.E.A.

ELECTRONIQUE,

ELECTROTECHNIQUE,

AUTOMATIQUE

M. Daniel BARBIER

INSA DE LYON

Laboratoire Physique de la Matière

Bâtiment Blaise Pascal

69621 VILLEURBANNE Cedex

Tél : 04.72.43.64.43

[email protected]

E2M2

EVOLUTION, ECOSYSTEME,

MICROBIOLOGIE, MODELISATION

http://biomserv.univ-lyon1.fr/E2M2

M. Jean-Pierre FLANDROIS

UMR 5558 Biométrie et Biologie Evolutive

Equipe Dynamique des Populations

Bactériennes

Faculté de Médecine Lyon-Sud Laboratoire de

Bactériologie BP 1269600 OULLINS

Tél : 04.78.86.31.50

[email protected]

EDIIS

INFORMATIQUE ET INFORMATION

POUR LA SOCIETE

http://www.insa-lyon.fr/ediis

M. Lionel BRUNIE

INSA DE LYON

EDIIS

Bâtiment Blaise Pascal

Page 7: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

7

69621 VILLEURBANNE Cedex

Tél : 04.72.43.60.55

[email protected]

EDISS

INTERDISCIPLINAIRE SCIENCES-

SANTE

http://www.ibcp.fr/ediss

M. Alain Jean COZZONE

IBCP (UCBL1)

7 passage du Vercors

69367 LYON Cedex 07

Tél : 04.72.72.26.75

[email protected]

MATERIAUX DE LYON

http://www.ec-lyon.fr/sites/edml

M. Jacques JOSEPH

Ecole Centrale de Lyon

Bât F7 Lab. Sciences et Techniques des

Matériaux et des Surfaces

36 Avenue Guy de Collongue BP 163

69131 ECULLY Cedex

Tél : 04.72.18.62.51

[email protected]

Math IF

MATHEMATIQUES ET

INFORMATIQUE FONDAMENTALE

http://www.ens-lyon.fr/MathIS

M. Franck WAGNER

Université Claude Bernard Lyon1

Institut Girard Desargues

UMR 5028 MATHEMATIQUES

Bâtiment Doyen Jean Braconnier

Bureau 101 Bis, 1er étage

69622 VILLEURBANNE Cedex

Tél : 04.72.43.27.86

[email protected]

MEGA

MECANIQUE, ENERGETIQUE,

GENIE CIVIL, ACOUSTIQUE

http://www.lmfa.ec-

lyon.fr/autres/MEGA/index.html

M. François SIDOROFF

Ecole Centrale de Lyon

Lab. Tribologie et Dynamique des Systêmes

Bât G8

36 avenue Guy de Collongue

BP 163

69131 ECULLY Cedex

Tél :04.72.18.62.14

[email protected]

Page 8: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

8

A mon futur proche époux dont l’amour me comble, à toi Mohamad.

Pour ton amour, ta tendresse, ta confiance en moi, ta compréhension, ta patience,

ton amitié et ton soutien de tous les jours pendant toute cette épreuve et tout le

reste…..

A mes parents que je ne pourrai jamais assez remercier de tout ce qu’ils

ont fait pour moi.

Tout l’amour et le bonheur que vous me donnez m’ont portée pendant ces longues

années d’études. J’ai vraiment une chance fabuleuse d’avoir des parents comme

vous et une famille formidable. Je vous dédie cette thèse, qui n’aurait jamais pu

aboutir sans votre soutien et votre confiance constants et sans bornes. Merci pour

tout.

Page 9: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

9

Remerciements

Le travail présenté dans ce manuscrit a été réalisé au sein du laboratoire de

« Physiopathologie des Lipides et Membranes », INSERM/INSA-Lyon UMR 585.

« L’Homme est un Homme avec l’autre » selon Nietzsche. Au cours de cette longue traversée

incertaine qu’est la thèse, j’ai appris au contact des uns, partagé des moments intenses avec

d’autres. En espérant n’oublier personne, je tiens à remercier tous ceux qui de près ou de loin

m’ont entouré durant ces 3 années de thèse.

Je tiens à remercier M. le Professeur Michel Lagarde pour la confiance qu’il m’a témoignée

en m’accueillant au sein du laboratoire de Physiopathologie des Lipides et Membranes. Je le

remercie aussi pour l’intérêt qu’il a porté à mon travail, pour ses suggestions et critiques

scientifiques durant les réunions d’équipe et pour son acceptation de présider le jury de ma

thèse.

Je suis très reconnaissante envers Mme le Docteur Annie-France Prigent de m’avoir

acceptée dans son équipe de recherche. Sa gentillesse, sa générosité et sa disponibilité m’ont

toujours beaucoup touchée. Je la remercie sincèrement pour ses conseils et discussions

scientifiques qui m’ont toujours été profitables et pour avoir accepté de participer au jury de

ma thèse.

Un remerciement chaleureux à M. le Docteur Georges Nemoz sans qui ce travail n’aurait pu

aboutir. Merci d’avoir guidé mes premiers coups de pinceaux sur la toile de la recherche tout

en m'accordant liberté et autonomie. Ses précieux conseils, sa gentillesse, ses qualités

humaines, son enthousiasme inaltérable, sa rigueur scientifique et sa passion pour la recherche

m’ont beaucoup appris et aidé tout au long de ce travail. Nos nombreuses discussions

resteront des souvenirs marquants. Je tiens à lui exprimer ma vive reconnaissance et mon

profond respect.

Je tiens à remercier Mme le Docteur Blandine Gény et Mme le Docteur Monique Breton-

Douillon de me faire l’honneur d’avoir accepté d’être rapporteurs de cette thèse, me

permettant ainsi de bénéficier de leur expertise. Je les remercie pour le temps qu’elles ont

Page 10: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

10

consacré pour juger ce travail et je tiens à leur exprimer ma respectueuse considération et ma

sincère gratitude.

Un grand merci évidemment à «nos amis italiens» du département d’Histologie et

d’Embryologie Médicale à l’université de Rome «La Sapienza» et plus particulièrement le

Docteur Fabio Naro avec qui nous avons établi une collaboration étroite et enrichissante qui

s’est transformée en une réelle amitié. Il a rendu ce travail plus motivant par son

enthousiasme, son optimisme et ses compétences. Je lui suis reconnaissante pour les

nombreuses discussions scientifiques très intéressantes que nous avons pu avoir. Grâce à son

amitié et sa générosité, j’ai eu l’opportunité de visiter une des plus belles et historiques villes

du monde, Rome. Pour cela comme pour tout le reste, je l’en remercie sincèrement. Un merci

aussi au Docteur Vania De Arcangelis pour sa gentillesse et son aide pleinement appréciée.

Je lui adresse tous mes remerciements pour sa complaisance et son aimabilité.

Mener à bien une thèse est un travail passionnant qui ne saurait être possible sans la

compagnie et l’appui des amis. Merci donc à Saïda, Amal, Nada, Nader, Imad et Jahjah

qui sont tout simplement ma petite famille et avec qui j’ai partagé tant de moments de joie et

parfois de tristesse. Ces années d’études parfois longues et difficiles ont été facilitées par leur

présence. Je suis heureuse de les avoir traversées avec eux. Je garderai de cette période de

beaux souvenirs, une belle solidarité et une profonde amitié. Amal et Saïda, cette année n’a

pas été la plus facile, on s’est soutenues mutuellement et ça m’a beaucoup aidée. Merci

d’avoir supporté mes moments de stress et d’angoisse. Saida, ma petite sœur, je n’oublierai

jamais ton soutien solide et ton aide précieuse aux moments clés. C’est vraiment agréable et

important d’avoir des amies sur qui on peut compter pour vous remonter le moral. Je vous

remercie pour ces moments partagés où les tourments du thésard s’effaçaient, pour nos

manips en parallèle faites dans la bonne humeur, pour votre soutien sans faille et pour votre

amitié. Les drôles de dames commencent à ne plus être très nombreuses au labo, et vous êtes

parmi les prochaines sur la liste, courage et bonne chance. Nada et Nader, que dire… il

faudrait bien plus d’une page pour exprimer tout ce que j’éprouve comme sentiments et

reconnaissance envers vous deux. Merci pour votre précieux soutien, vos encouragements

dans les moments difficiles et votre amitié fidèle sans lesquels je n’aurai pu y arriver. C’est

l’occasion pour moi de vous témoigner ma profonde amitié. L’aventure continue… à bientôt,

à Montréal.

Page 11: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

11

J’aurai sans nul doute un souvenir très ému de l’ambiance du laboratoire. Je tiens à remercier

tout particulièrement :

Bader, pour les fous rires qu’on a eus grâce à toi et à ta bonne humeur permanente. J’aurais

aimé plus te connaître encore et je te remercie d’être toujours là prêt à nous rendre service. Un

conseil, n’embête pas trop saïda quand je ne serai plus là☺.

Caroline, pour tes encouragements, pour la recherche des références sur EndNote (c’était

vraiment sympa) et pour les moments partagés dans le bureau durant cette dernière année.

Elodie, Karen et Nelly, mes collègues de fin de rédaction de thèse, pour vos marques de

sympathie, vos encouragements et votre gentillesse. C’est la dernière ligne droite, bonne

chance et bon courage.

Anisio, pour ta gentillesse et ta sincérité, j’ai bien apprécié nos discussions variées durant les

petites pauses café. Bonne chance pour la suite.

Sandrine, pour ton aide précieuse à la fin de ma thèse concernant toutes les formalités

administratives de dépôt de thèse.

Patrick, pour ta gentillesse, ta disponibilité et ton aide en informatique.

Madeleine Dubois, pour ta bonne humeur, tes qualités humaines remarquables, ton grand

coeur et ton écoute toujours attentive face à mes problèmes. Un grand merci à toi.

Laurence et Véronique, pour votre gentillesse et votre aide administrative précieuse.

Delphine, pour ton dynamisme et ta sympathie. L’ambiance du laboratoire n’est pas la même

sans toi.

Salim, pour ta gentillesse, ta bonne humeur et ta disponibilité.

Mes amis libanais, Nansy, Loubna, Radwan, Salam, Tamara, Wassim.....

Ahmad, pour ton soutien dans les moments difficiles et pour les nombreux matchs de tennis

qui m’ont aidée à diminuer le stress important de la thèse. J’aurais quand même voulu gagner

un dernier match avant mon départ☺

Enfin je remercie l’ensemble des personnes qui travaillent ou qui ont travaillé dans l’Unité

INSERM 585 et dans l’équipe Merck pour leur disponibilité et leur gentillesse. Je prends

soin de ne pas les nommer ce qui est un moyen, certes commode, de n’oublier personne.

Page 12: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

12

RESUME

Lors de la myogénèse, les myoblastes précurseurs sortent du cycle cellulaire, fusionnent, et expriment

l'appareil contractile myocytaire. Des données préliminaires suggéraient l'implication de la

phospholipase D (PLD) dans la différenciation de myoblastes L6 en culture, induite par l'arginine-

vasopressine (AVP). En réponse aux agonistes, la PLD hydrolyse la phosphatidylcholine des

membranes cellulaires, donnant naissance à l'acide phosphatidique (PA), messager impliqué dans

diverses fonctions. Nous avons cherché à définir le rôle de cette voie dans la différenciation des

myoblastes L6. Nous avons caractérisé le système de la PLD dans ce modèle, et observé que son

activation par l'AVP dépend de la médiation de la protéine G monomérique RhoA, dont l'implication

dans la formation des fibres de stress et la myogénèse est reconnue. Les myoblastes expriment les

deux isoformes connues de PLD, PLD1 et PLD2, et leur expression est différentiellement régulée au

cours de la différenciation. L'inhibition pharmacologique de la production de PA bloque la

différenciation. Inversement, la surexpression de l'isoforme PLD1, mais pas celle de l'isoforme PLD2,

stimule la différenciation. Nous en déduisons que la PLD, et spécifiquement l'isoforme PLD1, est

nécessaire à la myogénèse, conclusion confirmée par l'observation que l'ester de phorbol TPA est

capable d'induire une activation soutenue de PLD et une différenciation myogénique complète. En

réponse aux agents myogéniques AVP et TPA, nous avons observé la formation rapide de fibres de

stress d'actine, et montré que cette formation est PLD-dépendante. Nous avons observé par

immunofluorescence une translocation de PLD1 du Golgi vers les fibres de stress. A l'aide d'une sonde

fluorescente sélective du PA, nous avons pu observer pour la première fois que ce messager est

accumulé au niveau des fibres de stress naissantes. Ces résultats démontrent que PLD1 et PA sont

directement impliqués dans le remodelage du cytosquelette lors de la stimulation myogénique. Un lien

entre la production de PA par la PLD et la production de PIP2 par la PI4P-5-kinase étant reconnu,

nous avons recherché et mis en évidence une synthèse PLD-dépendante de PIP2 lors de la stimulation

myogénique. De plus, nous avons montré par immunofluorescence que le PIP2 est accumulé, comme

le PA, au niveau des fibres de stress. Il apparaît donc que la PLD est impliquée dans les

réarrangements de l'actine via la production de PIP2, dont le rôle dans la réorganisation du

cytosquelette est prouvé. Il est admis que les réarrangements du cytosquelette jouent un rôle

primordial dans la myogénèse. Nos résultats permettent de proposer l'hypothèse que PLD1 intervient

dans ce processus en provoquant la formation PA- et PIP2-dépendante de fibres d'actine. Nous

poursuivons ce travail en essayant de montrer que ces remaniements s'accompagnent d'une activation

actine-dépendante de l'expression des gènes spécifiques du muscle, impliquant le facteur de

transcription SRF "serum response factor".

Page 13: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

13

AVANT-PROPOS

Publications scientifiques :

- Fabio Naro, Vania De Arcangelis, Claudio Sette, Caterina Ambrosio, Hiba Komati, Mario

Molinaro, Sergio Adamo, Georges Nemoz. A bimodal modulation of the cAMP pathway is

involved in the control of myogenic differentiation in L6 cells.

J Biol Chem. 2003 Dec 5; 278(49): 49308-15.

- Hiba Komati, Alessandra Minasi, Fabio Naro, Michel Lagarde, Annie-France Prigent,

Sergio Adamo, Georges Nemoz. Phorbol ester-induced differentiation of L6 myogenic cells

involves phospholipase D activation.

FEBS Letters. 2004 Oct 5; 577(3): 409-414.

- Hiba Komati, Fabio Naro, Saïda Mebarek, Vania De Arcangelis, Sergio Adamo, Michel

Lagarde, Annie-France Prigent, Georges Nemoz. Phospholipase D is involved in myogenic

differentiation through remodeling of actin cytoskeleton (sous presse, Molecular Biology of

the Cell).

- Birbes, H., Komati, H., Lagarde, M., Nemoz, G., and Prigent, A.F. Involvement of

Phospholipase D in TNFα-induced apoptosis (à soumettre).

- Saïda Mebarek, Hiba Komati, Fabio Naro, Michel Lagarde, Annie-France Prigent, Georges

Nemoz. Ceramides are implicated in the control of myogenic differentiation in L6 cells via

modulation of Phospholipase D expression (en preparation).

Communications orales:

- Hiba Komati, Fabio Naro, Michel Lagarde, Annie France Prigent, Georges Nemoz.

Implication of phospholipase D in the myogenic differentiation of L6 myoblasts. Congrès du

GERLI, Paris, France, 2-5 septembre, 2003

Page 14: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

14

Communications affichées:

- Saïda Mebarek, Hiba Komati, Fabio Naro, Michel Lagarde, Annie France Prigent, Georges

Nemoz. Rôle de la phospholipase D dans le contrôle de la perméabilité endothéliale. XXI ème

Congrès "Biologie et pathologie du coeur et des vaisseaux" la Baule, France, 22-23 Avril,

2004.

- Birbes, H., Komati, H., Lagarde, M., Nemoz, G., and Prigent, A.F. Involvement of

Phospholipase D in TNFα-induced apoptosis. XXI ème Congrès "Biologie et pathologie du

coeur et des vaisseaux" la Baule, France, 22-23 Avril, 2004.

- Hiba Komati, Fabio Naro, Michel Lagarde, Annie France Prigent, Georges Nemoz.

Implication of phospholipase D in the myogenic differentiation of l6 myoblasts. Congrès du

GERLI, Paris, France, 2-5 septembre, 2003.

- H. Birbes, H. Komati, G. Nemoz, M. Lagarde, A.F. Prigent. Involvement of Phospholipase

D in TNFα-induced apoptosis. Congrès du GERLI, Paris, France, 2-5 septembre, 2003.

- Hiba Komati, Fabio Naro, Saïda Mebarek, Michel Lagarde, Annie France Prigent, Georges

Nemoz. Rôle de la phospholipase D et de son produit, l’acide phosphatidique, dans la

différenciation du muscle squelettique. 14ème rencontre régionale Rhône-Alpes, Saint-Étienne,

France, 21 octobre, 2003.

- Hiba Komati, Fabio Naro, Saïda Mebarek, Michel Lagarde, Annie France Prigent, Georges

Nemoz. Rôle de la phospholipase D et de son produit, l’acide phosphatidique, dans la

différenciation du muscle squelettique. Meeting of “Institut Multidisciplinaire Biologie des

Lipides”, Villeurbanne, France, September 25, 2002.

- Hiba Komati, Fabio Naro, Michel Lagarde, Annie France Prigent, Georges Nemoz.

Implication of phospholipase D in the myogenic differentiation of L6 myoblasts. Pris du

meilleur poster de la 7ème journée de l’ EDISS (Ecole Doctorale Interdisciplinaire Science et

Santé), villeurbanne, France, 16 avril, 2003.

Page 15: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

15

- Birbes, H., Komati, H., Lagarde, M., Nemoz, G., and Prigent, A.F. Involvement of

Phospholipase D in TNFα-induced apoptosis. XX ème Congrès GRRC, Grenoble, France, 15-

16 avril, 2003.

Page 16: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

16

TABLES DES MATIERES

TABLE DES FIGURES ET TABLEAUX .............................................................................. 21

ABREVIATIONS .................................................................................................................... 24

I Introduction ...................................................................................................................... 26

II Rappels bibliographiques ................................................................................................. 29

II.1 Les phospholipases D............................................................................................... 29

II.1.1 Caractéristiques enzymatiques des phospholipases D ..................................... 29

II.1.1.1 La transphosphatidylation ............................................................................ 29

II.1.1.2 Mesure de l’activité enzymatique ................................................................ 31

II.1.1.2.1 Mesure du produit hydrosoluble............................................................ 31

II.1.1.2.2 Mesure du produit lipidique .................................................................. 31

II.1.1.3 Purification ................................................................................................... 32

II.1.2 Clonage et caractérisation des PLD ................................................................. 33

II.1.3 Structure primaire des phospholipases D ......................................................... 35

II.1.3.1 Domaines HKD et mécanismes catalytiques ............................................... 35

II.1.3.2 Les régions conservées I et III...................................................................... 37

II.1.3.3 Les domaines PH et PX................................................................................ 38

II.1.3.4 La boucle centrale de PLD1 ......................................................................... 39

II.1.3.5 Le domaine de liaison au PIP2 ou «motif polybasique».............................. 39

II.1.3.6 Les séquences amino- et carboxy-terminales............................................... 39

II.1.4 Régulation des PLD ......................................................................................... 40

II.1.4.1 Régulation par le PIP2.................................................................................. 40

II.1.4.1.1 Rôles physiologiques de PIP2 ............................................................... 40

II.1.4.1.2 PIP2 et cytosquelette d’actine................................................................ 42

II.1.4.1.3 PIP2 et PLD........................................................................................... 42

II.1.4.2 Régulation par les petites protéines G.......................................................... 43

II.1.4.2.1 Régulation par les protéines Rho........................................................... 43

II.1.4.2.1.1 Les protéines de la famille Rho ...................................................... 43

II.1.4.2.1.2 Rôles physiologiques de Rho ......................................................... 45

II.1.4.2.1.3 Les effecteurs de Rho ..................................................................... 46

II.1.4.2.1.4 Rho et PLD ..................................................................................... 47

Page 17: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

17

II.1.4.2.2 Régulation par les protéines ARF.......................................................... 48

II.1.4.2.2.1 Les protéines G de la famille ARF ................................................. 48

II.1.4.2.2.2 ARF et PLD.................................................................................... 49

II.1.4.3 Régulation par les protéines kinases C......................................................... 49

II.1.4.3.1.1 PKC et PLD.................................................................................... 50

II.1.4.3.1.2 Mécanismes d’activation de la PLD par les PKC........................... 50

II.1.4.4 Régulation par les tyrosines kinases............................................................. 51

II.1.4.5 Régulation par les ions calcium ................................................................... 52

II.1.4.6 Régulation par des facteurs inhibiteurs ........................................................ 52

II.1.5 Localisation des PLD ....................................................................................... 53

II.1.5.1 Localisation tissulaire................................................................................... 53

II.1.5.2 Localisation subcellulaire............................................................................. 53

II.1.6 Rôles physiologiques de la PLD et de son produit, l’acide phosphatidique .... 55

II.1.6.1 Rôle de la PLD dans le trafic vésiculaire, l’exocytose et la sécrétion ......... 57

II.1.6.1.1 La PLD est impliquée dans la formation ARF-dépendante des vésicules

coatées 57

II.1.6.1.2 PLD et sécrétion .................................................................................... 57

II.1.6.1.3 Rôle fusogène du PA ............................................................................. 58

II.1.6.2 Rôle de la PLD dans le réarrangement du cytosquelette.............................. 60

II.1.6.2.1 La PLD et le cytosquelette d’actine....................................................... 60

II.1.6.2.2 Implication des petites protéines G dans les effets de PLD sur le

cytosquelette............................................................................................................. 61

II.1.6.3 Rôle de la PLD dans la différenciation cellulaire ........................................ 61

II.1.6.4 Cibles intracellulaires de l’acide phosphatidique......................................... 62

II.1.6.4.1 Raf-1 kinase........................................................................................... 63

II.1.6.4.2 PI(4)P 5-kinase ...................................................................................... 64

II.2 La myogénèse du muscle squelettique ..................................................................... 66

II.2.1 La myogénèse durant le développement embryonnaire................................... 66

II.2.2 La myogénèse in vitro: les lignées cellulaires myogéniques ........................... 68

II.2.3 Facteurs régulateurs de la myogénèse.............................................................. 69

II.2.3.1 Les protéines à domaine bHLH.................................................................... 69

II.2.3.2 Les protéines de la famille MADS-box........................................................ 72

II.2.3.2.1 Le Facteur de Réponse au Sérum (SRF) ............................................... 72

II.2.3.2.2 SRF et différenciation musculaire squelettique..................................... 72

Page 18: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

18

II.2.3.2.3 La famille des Myocyte Enhancer Factor 2 (MEF2)............................. 73

II.2.3.2.4 MEF2 et différenciation musculaire squelettique.................................. 74

II.2.4 Effecteurs de la différenciation myogénique ................................................... 76

II.2.4.1 Inhibiteurs..................................................................................................... 76

II.2.4.1.1 Le facteur de croissance TGF-β............................................................. 76

II.2.4.1.2 Le facteur de croissance FGF ................................................................ 76

II.2.4.2 Inducteurs ..................................................................................................... 77

II.2.4.2.1 Les facteurs IGFs................................................................................... 77

II.2.4.2.2 L’hormone AVP .................................................................................... 77

II.2.5 Myofribrillogénèse ........................................................................................... 79

II.2.5.1 Protéines spécifiques du muscle................................................................... 79

II.2.5.2 Les myofibrilles............................................................................................ 80

II.2.5.3 Modèle de myofibrillogénèse....................................................................... 82

III Materiels et methodes................................................................................................... 84

III.1 Réactifs..................................................................................................................... 84

III.2 Méthodes .................................................................................................................. 85

III.2.1 Culture et traitements des cellules.................................................................... 85

III.2.1.1 Culture des cellules L6C5 ........................................................................ 85

III.2.1.2 Traitement des cellules L6C5................................................................... 85

III.2.1.3 Evaluation de la différenciation ............................................................... 86

III.2.2 Dosage de l’activité créatine kinase ................................................................. 86

III.2.3 Transfections transitoires ................................................................................. 87

III.2.4 Immunofluorescence ........................................................................................ 87

III.2.4.1 Immunofluorescence de la myogénine..................................................... 87

III.2.4.2 Immunofluorescence de la myosine......................................................... 88

III.2.4.3 Immunofluorescence des PLD ................................................................. 88

III.2.4.4 Immunofluorescence du PIP2 .................................................................. 88

III.2.4.5 Marquage de l’actine. ............................................................................... 88

III.2.5 Dosage des protéines par la méthode de Bradford (1976) ............................... 89

III.2.6 Préparation des échantillons pour électrophorèse en conditions dénaturantes

(SDS-PAGE) .................................................................................................................... 89

III.2.6.1 RhoA ........................................................................................................ 89

III.2.6.2 PLD1 et PLD2.......................................................................................... 89

III.2.6.3 Myogénine................................................................................................ 90

Page 19: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

19

III.2.6.4 Les différentes isoformes de PKC............................................................ 90

III.2.7 Electrophorèse en SDS-PAGE et "Western-blotting"...................................... 90

III.2.7.1 Conditions spécifiques à chaque protéine détectée .................................. 91

III.2.8 Mesure de l’activité PLD dans les cellules L6................................................. 92

III.2.9 Traitement par l’exoenzyme C3 avec la méthode de « Scrape loading » ........ 93

III.2.10 Dosage du PIP2 néosynthétisé ..................................................................... 93

III.2.11 Préparation des ARN.................................................................................... 94

III.2.12 RT-PCR........................................................................................................ 94

III.2.12.1 Trancription inverse (RT)......................................................................... 94

III.2.12.2 Réaction en chaîne de la polymérase (PCR) ............................................ 95

III.2.12.3 Electrophorèse sur gel d'agarose des ADN .............................................. 95

III.2.13 Construction des plasmides pEGFP-hPLD1, pEGFP-hPLD2 et pEGFP-

PABD 96

III.2.13.1 Amplification des séquences d'ADN codantes pour hPLD1, hPLD2 et

domaine de fixation de PA........................................................................................... 96

III.2.13.2 Insertion des séquences amplifiées dans pEGFP-C1 ............................... 97

III.2.13.3 Transformation des bactéries ................................................................... 97

III.2.13.3.1 Compétence des bactéries .................................................................. 97

III.2.13.3.2 Transformation des bactéries compétentes ........................................ 98

III.2.14 Mutagénèse dirigée ...................................................................................... 98

IV Resultats ..................................................................................................................... 100

IV.1 Activation de la PLD par les inducteurs myogéniques .......................................... 100

IV.1.1 Activation de la PLD par l’AVP via ARF, PKC et Rho ................................ 100

IV.1.2 Activation de la PLD par le TPA via PKC..................................................... 104

IV.1.2.1 Le TPA, à une faible concentration, induit la différenciation myogénique

104

IV.1.2.2 La régulation de l’activité PLD par le TPA est dose-dépendante .......... 106

IV.2 L’activité PLD est nécessaire à la différenciation myogénique............................. 110

IV.3 La PLD1 est impliquée positivement dans la différenciation myogénique ........... 116

IV.4 La PLD1 est sélectivement down-régulée au cours de la différenciation .............. 118

IV.4.1 Au niveau des ARNm .................................................................................... 118

IV.4.2 Au niveau des protéines ................................................................................. 119

IV.4.3 Au niveau de l’activité ................................................................................... 121

Page 20: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

20

IV.5 La stimulation myogénique déclenche la formation PLD-dépendante des « stress

fiber like structures» (SFLS) .............................................................................................. 123

IV.5.1 La formation des SFLS est induite par l’AVP et le TPA dans les cellules L6

123

IV.5.2 La formation de SFLS par l’AVP et le TPA est PLD-dépendante................. 123

IV.5.3 La PLD1 est impliquée positivement dans la formation des SFLS................ 127

IV.6 La PLD1 et le PA participent directement à la formation des SFLS ..................... 128

IV.6.1 La PLD1, et non la PLD2, transloque vers les SFLS lors de la stimulation

myogénique .................................................................................................................... 128

IV.6.2 RhoA est partiellement relocalisée au niveau des SFLS................................ 131

IV.6.3 Le PA est sélectivement accumulé au niveau des SFLS lors de la réponse

myogénique .................................................................................................................... 132

IV.6.3.1 Cinétique de marquage des fibres d’actine par le PA ............................ 134

IV.6.3.2 Spécificité de la sonde pour le PA ......................................................... 134

IV.7 La PLD et le PA interviennent dans la formation des SFLS en induisant la synthèse

localisée de PIP2 ................................................................................................................ 137

V Discussion, conclusion et perspectives .......................................................................... 140

VI references ................................................................................................................... 148

Page 21: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

21

TABLE DES FIGURES ET TABLEAUX

Figure 1 : Schéma de réaction de la phospholipase D.............................................................. 30

Figure 2 : Représentation schématique des 2 isoformes de PLD (PLD1 et PLD2). ................ 34

Figure 3 : Domaines I-IV conservés chez les PLD de différentes espèces (d'après Cockcroft et

al., 2001)........................................................................................................................... 35

Figure 4 : Modèle de mécanisme catalytique des PLD............................................................ 36

Figure 5 : Structure tridimentionnelle de la protéine Nuc dimérisée. ...................................... 37

Figure 6: Production de PIP2 au niveau de plusieurs sites cellulaires. .................................... 41

Figure 7 : Implication des protéines G de la famille Rho dans le réarrangement du

cytosquelette..................................................................................................................... 45

Figure 8 : Modèle hypothétique résumant le rôle de la PLD1 ARF6-dépendante dans

l’exocytose. ...................................................................................................................... 59

Figure 9 : Représentation schématique de Raf1 contenant le domaine de fixation de PA (Rizzo

et al., 2002)....................................................................................................................... 64

Figure 10 : Représentation schématique de coupes transversales.d’un embryon de poulet. ... 67

Figure 11 : Définition des rôles des facteurs de transcription MRF durant l’embryogénèse.

(Sabourin et al., 2000). ..................................................................................................... 70

Figure 12 : Inter-régulations entre les facteurs myogéniques au cours de l’embryogénèse

(Kitzmann, 1999). ............................................................................................................ 71

Figure 13 : Structure du muscle squelettique. .......................................................................... 80

Figure 14 : Disposition des molécules de titine dans le sarcomère.......................................... 81

Figure 15 : Modèle de myofibrillogénèse proposé par Dabiri et al. (1997)............................. 82

Figure 16: Principe de la méthode mutagénèse dirigée avec le kit QuickChange Stratagene. 99

Figure 17 : Effet de la bréfeldine A et de la « down-régulation » des PKC sur l'activation de la

PLD par AVP. ................................................................................................................ 101

Figure 18 : Effet de l’AVP sur la translocation de la protéine RhoA vers la fraction insoluble.

........................................................................................................................................ 102

Figure 19 : Effet de l’exoenzyme C3 sur l’activation de la PLD par l’AVP. ........................ 103

Figure 20 : Effet de deux doses différentes de TPA sur l’expression de la myogénine......... 105

Figure 21 : Effet de deux doses différentes de TPA sur l’accumulation nucléaire de la

myogénine. ..................................................................................................................... 106

Page 22: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

22

Figure 22 : Cinétique d’activation de la PLD par 1 et 100 nM TPA. .................................... 107

Figure 23 : Effet sur l’activité PLD du retraitement des cellules par le TPA après un

traitement prolongé. ....................................................................................................... 108

Figure 24 : Effet d’un traitement prolongé par 1 ou 100 nM de TPA sur « la down-

régulation » des PKCs. ................................................................................................... 109

Figure 25 Effet de l’inhibition de la production de PA sur l’expression de la myogénine

induite par AVP.............................................................................................................. 111

Figure 26 : Effet de l’inhibition de la production de PA sur l’accumulation nucléaire de la

myogénine induite par AVP........................................................................................... 113

Figure 27 : Effet de l’inhibition de la production de PA sur l’accumulation nucléaire de la

myogénine induite par 1 nM de TPA. ............................................................................ 114

Figure 28 : Effet de l’inhibition de la production de PA sur la formation des myotubes induite

par AVP.......................................................................................................................... 115

Figure 29 : Effet de la surexpression de deux isoformes de PLD (PLD1b et PLD2) sur

l’accumulation nucléaire de la myogénine..................................................................... 117

Figure 30 : Recherche de l’expression des PLD par RT-PCR au cours de la différenciation

myogénique induite par AVP......................................................................................... 119

Figure 31 : Recherche de l’expression des PLD par Western-Blotting dans les cellules L6 non

différenciées ou différenciées en myotubes. .................................................................. 120

Figure 32 : Activité de la créatine kinase dans les cellules L6 différenciées, ou non, en

myotubes. ....................................................................................................................... 121

Figure 33 : Mesure de l’activité PLD dans les cellules non différenciées ou différenciées en

myotubes. ....................................................................................................................... 122

Figure 34 : Effet de l’AVP (10-7M) et du TPA (1 nM) sur la formation des SFLS.............. 124

Figure 35: Effet du propranolol, de l’exoenzyme C3, de 0,5% butanol-1 et de 0,5% butanol-2

sur la formation des SFLS.............................................................................................. 125

Figure 36: Effet de l’AVP, du propranolol, du butanol-1 et du butanol-2 sur le pourcentage

des cellules présentant des SFLS. .................................................................................. 126

Figure 37: Effet de la surexpression de la PLD1b sur le pourcentage des cellules présentant

des SFLS. ....................................................................................................................... 127

Figure 38: Localisation de la PLD1 endogène dans les cellules L6 par immunofluorescence.

........................................................................................................................................ 128

Figure 39: Effet de l’AVP sur la localisation de la PLD1 endogène dans les cellules L6. .... 129

Figure 40: Effet de l’AVP sur la localisation de la PLD2 endogène dans les cellules L6. .... 130

Page 23: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

23

Figure 41: Effet de l’AVP sur la localisation de Rho endogène dans les cellules L6............ 131

Figure 42: Marquage du PA à l’aide d’une sonde fluorescente spécifique............................ 132

Figure 43: Effet de l’AVP et du TPA sur la localisation du PA dans les cellules L6. ........... 133

Figure 44: Cinétique de marquage de SFLS par la sonde de PA. .......................................... 135

Figure 45: Contrôle de la spécificité de la sonde de PA. ....................................................... 136

Figure 46: Effet de l’inhibition de la production de PA sur la néosynthèse de PIP2 induite par

AVP................................................................................................................................ 138

Figure 47 : Effet de l’AVP sur la localisation du PIP2 dans les cellules L6.......................... 139

Figure 48 : Séquences de signalisation déclenchées par la stimulation myogénique. ........... 144

Figure 49 : Topographie des évènements impliquant la PLD lors de l’initiation de la

myogénèse. ..................................................................................................................... 147

Tableau 1 Les familles des petites protéines G (Takai et al., 2001) ........................................ 44

Tableau 2 Activation de la PLD dans divers types cellulaires par différents agonistes (Rizzo et

al., 2002)........................................................................................................................... 56

Page 24: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

24

ABREVIATIONS

ADP : adénosine diphosphate

ADNc : acide désoxyribonucléique complémentaire

AMPc : adénosine monophosphate 3’, 5’ cyclique

ARF : facteur d'ADP-ribosylation

ARN : acide ribonucléique

AVP : arginine8-vasopressine

bHLH: “basic helix-loop-helix”: hélice-boucle-hélice basique

BHT : butyl-hydroxy-toluène

BET : bromure d’éthidium

BFA : bréfeldine A

BSA : albumine sérique bovine

CCM : chromatographie sur couche mince

CK: créatine kinase

DAG : diacylglycérol

DAPI : 4’,6’-diamidino-2-phénylindole

ECL : « enhanced chemiluminescence » : chimioluminescence amplifiée

EDTA : acide éthylènediamine tétraacétique

EGF : facteur épidermal de croissance

EGTA : acide éthylèneglycol tétraacétique

FGF: facteur de croissance des fibroblastes

GDP : guanosine diphosphate

GFP : protéine fluorescente verte

GTP : guanosine triphosphate

GTPγS : guanosine 5'-O-3-thiotriphosphate

HA: hémaglutinine

HEPES : acide N-(2-hydroxyéthylpipérazine)N’-(2-éthanesulfonique).

HPLC : chromatographie liquide haute performance

IGF : facteur de croissance « insulin like »

LPA : acide lysophosphatidique

Page 25: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

25

MAP Kinase: Mitogen Activated Protein Kinase

MEF2 : “myocyte enhancer factor 2”: facteur stimulateur des myocytes

MRF : myogenic regulator factor

MADS: MCM1-Agamous-Deficiens-SRF

PA : acide phosphatidique

PABD : domaine de fixation de PA

PAGE : électrophorèse en gel de polyacrylamide

PBS : tampon phosphate salin

PBu : phosphatidylbutanol

PC : phosphatidylcholine

PCR : réaction en chaîne de la polymérase

PDE : phosphodiestérase

PE : phosphatidyléthanolamine

PIP2 : phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate

PKC : protéine kinase C

PL : phospholipide

PLA2 : phospholipase A2

PLC: phospholipase C

PLD : phospholipase D

PMSF : fluorure de phenylmethylsulfonyle

PS: phosphatidylsérine

SDS : dodécylsulfate de sodium

SFLS : stress fiber like structures

Si RNA : petits ARNs interférants

SRF : facteur de réponse au sérum

SVF : sérum de veau foetal

TBS-T : tampon tris salin + tween

TEMED : N,N,N’,N’-tetramethylethylenediamine 1,2-bis(dimethylamino)ethane

TGF-β: transforming growth factor β

TGN : “Trans Golgi Network”: réseau trans-golgien

TPA : 12-O-tétradécanoylphorbol-13-accétate

Tween : monolaurate de polyéthylène-sorbitane

Page 26: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

26

I INTRODUCTION

La phospholipase D, ou PLD, hydrolyse la liaison phosphodiester distale des

phosphatidylcholines des membranes cellulaires, libérant de la choline et de l'acide

phosphatidique (PA), en réponse à des stimuli extracellulaires. Chez les mammifères, deux

gènes distincts, PLD1 et PLD2, ne présentant que 50% d'homologie de séquence ont été

décrits (Frohman et al., 1999), chaque gène donnant naissance à plusieurs variants d'épissage

(Hammond et al., 1997; Katayama et al., 1998; Steed et al., 1998). Ces deux isoformes de

PLD nécessitent du phosphatidylinositol bisphosphate (PIP2) comme cofacteur pour leur

activité mais sont régulées différemment. La PLD1 caractérisée par une activité basale faible

est activée synergiquement par les petites protéines G des familles Rho et ARF, et par les

PKC conventionnelles. La PLD2 au contraire a une activité basale élevée, et sa sensibilité à

des protéines activatrices est moins bien documentée (Exton, 2002). Les fonctions cellulaires

où une implication de la PLD a été démontrée sont multiples. On peut citer le trafic

vésiculaire, la réorganisation agoniste-dépendante du cytosquelette (Kam and Exton, 2001),

l'explosion respiratoire chez les neutrophiles, la prolifération et la survie cellulaires

(McDermott et al., 2004). Diverses cibles intracellulaires du PA ont été identifiées, ce qui

permet de considérer ce phospholipide comme un second messager majeur. On peut citer

divers constituants de la cascade des MAPkinases, notamment Raf-1 (Andresen et al., 2002),

des protéines impliquées dans le trafic vésiculaire (Ktistakis et al., 2003), l'AMPc-

phosphodiestérase PDE4D3 (Grange et al., 2000), etc. De manière très importante pour notre

projet, le PA a aussi été proposé comme un régulateur de la synthèse de PIP2, par sa capacité

à stimuler certaines PI4P-5-kinases (Anderson et al., 1999).

Au cours du processus myogénique, les myoblastes, cellules précurseurs, cessent de

proliférer et fusionnent pour se différencier en myotubes polynucléés, exprimant les protéines

spécifiques du tissu musculaire, notamment les constituants du système contractile. La

myogénèse intervient au cours de la vie embryonnaire, mais aussi lors de la réparation des

blessures du tissu musculaire déjà constitué, et dans la régénération du muscle dystrophique,

chez les patients atteints de myopathies (Perry and Rudnick, 2000). La myogénèse peut être

perturbée dans diverses situations pathologiques, telles que l'exposition à certains toxiques

environnementaux (Coletti et al., 2001). La compréhension des mécanismes qui la sous-

Page 27: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

27

tendent présente donc un intérêt majeur en physiopathologie. Une équipe italienne avec

laquelle nous entretenons une collaboration suivie (Pr. S. Adamo, université de Rome-La

Sapienza) avait montré que l'hormone neuro-hypophysaire arg8-vasopressine (AVP) est un

puissant inducteur de la différenciation, chez diverses lignées myogéniques, et chez des

myoblastes en culture primaire, en l'absence de facteurs sériques (Nervi et al., 1995). En

outre, cette équipe avait montré que l'AVP induit, dans la lignée myoblastique de rat L6,

l'activation des voies de la phospholipase C (PLC) et de la phospholipase D (PLD). La

réponse myogénique pouvant intervenir pour des concentrations nanomolaires d'AVP,

auxquelles seule la PLD, et non la PLC, est activée, l'implication de la voie PLD paraissait

prépondérante dans ce système (Naro et al., 1997). Notre équipe a montré, en collaboration

avec le laboratoire italien, le rôle crucial joué par les AMPc-phosphodiestérases (PDE4) dans

le processus myogénique: l’AVP induit une stimulation prolongée de l’activité PDE4, et par

ailleurs, l’inhibition de ces enzymes par des composés sélectifs bloque puissamment la

différenciation. L’inactivation de la voie de l’AMPc consécutive à l’activation des PDE4 est

indispensable au déroulement de la myogénèse (Naro et al. 1999). La régulation des PDE4

sous l’effet de l’AVP semble être un processus complexe: deux phases de stimulation sont

apparentes (un premier maximum est atteint à 2 min, puis un plateau est atteint en 15 min,

après quoi l’activité se maintient élevée plus de 48h). Plusieurs mécanismes d’activation de

PDE sont donc probablement en jeu. L’isoforme PDE4D3, majoritaire dans les L6, étant

sélectivement activable par la fixation du second messager PA en système acellulaire, et une

accumulation rapide de PA résultant de l’activation de la PLD en réponse à L’AVP, il est

permis de penser que le PA accumulé provoque directement la phase rapide de stimulation de

la PDE.

Une autre intervention possible de la PLD dans la signalisation de l’AVP se situe au niveau de

la production de prostaglandines : nous avons récemment montré (Naro et al., 2003) que

l’AVP induit chez les L6 une synthèse et une sécrétion rapides de prostaglandines,

responsables d’une activation transitoire de la voie de l’AMPc au tout début de la stimulation.

Cette activation exerce un effet positif sur la différenciation. La PLD pourrait être impliquée

dans cette production de prostaglandines, puisqu’elle intervient dans l’activation de la cascade

des MAP kinases, le PA étant nécessaire au recrutement membranaire et à l’activation de la

kinase Raf-1, effecteur en amont de cette cascade ( Rizzo et al., 1999). Les MAP kinases sont

capables à la fois d’activer la libération d’acide arachidonique par la phospholipase A2, et de

stimuler son métabolisme en prostaglandines, via une augmentation de l’expression de la

prostaglandine H synthase 2 (Daniel et al, 1999).

Page 28: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

28

C'est pourquoi, l’objectif principal de cette étude a été de déterminer le rôle de la PLD

dans la différenciation myogénique des myoblastes L6. Afin d'évaluer le rôle joué par la voie

de signalisation de la PLD lors de la myogénèse, nous avons entrepris de caractériser ce

système enzymatique et ses régulations dans les myoblastes L6 en différenciation. Nous nous

sommes ensuite attaché à démontrer que la PLD est nécessaire à la réponse myogénique. Nos

observations allant clairement dans ce sens, nous avons alors entrepris de préciser les

mécanismes impliquant la PLD.

Grâce à des techniques d’imagerie cellulaire, nous avons pu observer que le

cytosquelette joue un rôle central dans les effets de la PLD sur la différenciation myogénique.

Nous avons donc été amené à proposer un modèle intégrant la phospholipase D, ses

régulateurs et ses effecteurs, les remaniements du cytosquelette, et l’acquisition du phénotype

myocytaire. Ce modèle est basé sur l’hypothèse que le remaniement PLD-dépendant de

l’actine intervient à la fois dans la mise en place des myofibibrilles, et dans l’expression des

gènes spécifiques du muscle.

La première partie de ce mémoire est consacrée aux Rappels Bibliographiques et

comporte deux chapitres. Le premier chapitre fait état des connaissances actuelles sur les PLD

de mammifères, leur régulation et leurs fonctions physiologiques. Dans le second, nous

rapportons les données concernant la myogénèse, les facteurs de transcriptions musculaires et

la myofibrillogénèse. Le reste de ce mémoire concerne notre travail personnel et s'articule

autour de trois parties distinctes. La première partie traite les méthodes d'étude utilisées. La

deuxième partie est consacrée aux résultats expérimentaux. Ce mémoire se termine par une

discussion et une conclusion générale, et par l’exposé des perspectives qui découlent de notre

travail.

Page 29: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

29

II RAPPELS BIBLIOGRAPHIQUES

II.1 Les phospholipases D

La phospholipase D (PLD) est une phosphodiestérase qui catalyse la réaction

d’hydrolyse de la liaison phosphodiester distale d’un phospholipide pour libérer d’une part sa

tête polaire, et d’autre part l’acide phosphatidique (PA), un lipide considéré comme un second

messager (English, 1996). Les PLD intracellulaires de mammifères hydrolysent

majoritairement la phosphatidylcholine (PC), un des principaux phospholipides des

membranes. L’activité PLD a été identifiée la première fois dans les feuilles de chou en 1947

(Hanahan and Chaikoff, 1947). Depuis, il a été montré que la PLD est très répandue dans tout

le règne végétal. Pendant plusieurs années, cette enzyme a été considérée comme absente du

monde animal, mais aujourd’hui elle apparaît ubiquitaire. Elle a été retrouvée dans les

organismes procaryotes, la levure, et chez les mammifères où la reconnaissance de

l’importance de son rôle en fait une enzyme particulièrement intéressante.

La première activité PLD décrite chez les mammifères a été découverte en 1973 dans

des extraits membranaires de cerveau de rat (Saito and Kanfer, 1973; Saito and Kanfer 1975).

Ce n’est que dans les années 1980 que cette activité a été impliquée dans la transduction du

signal via des récepteurs membranaires (Billah et al., 1989). Depuis lors, les travaux portant

sur l’identification, la purification, l’isolement de la (ou des) PLD et la détermination de leurs

mécanismes d’action se sont succédés. Ainsi, on distingue des formes de PLD nécessitant ou

non du phosphatidylinositol 4,5 diphosphate (PIP2), sensibles ou non à l’oléate. Ces travaux

ont conduit à penser que la PLD pouvait intervenir dans différents processus physiologiques.

II.1.1 Caractéristiques enzymatiques des phospholipases D

II.1.1.1 La transphosphatidylation

La PLD dans les conditions physiologiques (en milieu aqueux) hydrolyse les

phospholipides pour former d’une part un produit soluble, la choline, dans le cas où le

substrat est la phosphatidylcholine et d’autre part un médiateur phospholipidique, l’acide

phosphatidique. En présence d’alcools primaires, la PLD catalyse une réaction de

transphosphatidylation. Dans ce cas, l’alcool primaire sert d’accepteur pour le groupe

Page 30: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

30

phosphatidyl, au détriment de l’eau (Dawson and Hemington, 1967). L’alcool primaire est un

excellent accepteur nucléophile, montrant 1000 fois plus d’affinité que l’eau (Yang et al.,

1967; Frohman et al., 1999). En présence de faibles concentrations d’alcool primaire, on

observe donc une formation préférentielle de phosphatidylalcool aux dépens du PA (Figure

1). Le phosphatidylalcool est un métabolite stable et représente un marqueur d’activation de la

PLD fiable et spécifique (Morris et al., 1997). En ce qui concerne la réaction de

transphosphatidylation, il est bien établi que la PLD ne peut utiliser que des alcools primaires

à chaîne courte. Il a été montré que la PLD de membranes de cerveau de rat utilise de manière

plus efficace le butanol-1 par rapport au propanol et à l’éthanol (Möhn et al., 1992). Par

contre, les alcools secondaires ne sont pas utilisables par les PLD animales et végétales

(Danin et al., 1993).

Figure 1 : Schéma de réaction de la phospholipase D.

1: En présence d'un milieu aqueux, la PLD forme à partir de la PC du PA et de la choline. 2: En

présence d'un alcool primaire (butanol-1) la PLD forme à partir de la PC du phosphatidylalcool, ici

du phosphatidylbutanol.

Page 31: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

31

II.1.1.2 Mesure de l’activité enzymatique

Plusieurs méthodes ont été décrites pour mesurer l’activité enzymatique de la

phospholipase D en système acellulaire et sur cellules intactes. Elles peuvent être distinguées

en fonction de la méthodologie utilisée pour isoler et quantifier le produit de catalyse: produit

hydrosoluble (la tête polaire) ou le produit lipidique (PA, phosphatidylalcool).

II.1.1.2.1 Mesure du produit hydrosoluble

L’activité PLD peut être mesurée par dosage de la choline libérée lors de l’activation

de l’enzyme. Cette méthode consiste à marquer la tête polaire de la PC avec de la choline

tritiée. L’action d’une PLD spécifique de la PC libère, dans le milieu réactionnel, la choline

radioactive qui peut être dosée. Toutefois la choline libérée dans des cellules intactes est

rapidement phosphorylée en phosphocholine qui peut provenir aussi d’une activité PLC

(Besterman et al., 1986; Purkiss et al., 1991). En effet l’activation d’une PLC spécifique de la

PC conduit à la formation de phosphocholine d’une part et de diglycéride d’autre part. La

phosphocholine peut aussi être transformée en choline sous l’action d’une phosphatase.

Ce type de mesure n’est possible que sur des cellules perméabilisées, des membranes ou des

vésicules artificielles dans lesquelles la choline libérée dans le milieu réactionnel n’est plus

accessible aux kinases intracellulaires. La phase aqueuse contenant la choline marquée peut

être séparée de la phase lipidique selon la méthode de Bligh et Dyer (Bligh and Dyer, 1959).

La choline radioactive est alors quantifiée grâce à sa radioactivité, proportionnelle à l'activité

PLD. Il est également possible de quantifier la choline par mesure de chimiluminescence

(Pedruzzi et al., 1998).

II.1.1.2.2 Mesure du produit lipidique

Dans ce cas, la radioactivité est incorporée au groupement phosphatidyl du substrat.

Plusieurs acides gras ont été employés pour marquer la partie lipidique de la PC (oléique,

myristique, arachidonique, palmitique). L'activité PLD est déterminée par la mesure de la

radioactivité liée à l'acide phosphatidique (PA) libéré après activation de la PLD. Toutefois,

cette technique de mesure de l'activité PLD présente certaines limitations. Dans la cellule, le

PA peut être rapidement converti en diacylglycérol (DAG) par une phosphatidate

phosphohydrolase, ou transformé en un acide lysophosphatidique (LPA) par une

phospholipase A2 (PLA2). Le PA peut également être utilisé pour la synthèse de

phosphatidylglycérol et de phosphatidylinositol. De plus il peut provenir d'une

Page 32: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

32

phosphorylation du DAG par une DAG-kinase ou résulter de la voie de biosynthèse des

phospholipides. Sa mesure ne reflète donc pas toujours de façon certaine une activité PLD.

Afin de remédier à cela il est possible d'utiliser la propriété de transphosphatidylation de la

PLD. C'est une méthode de mesure sensible et hautement spécifique de l'activité enzymatique

de la PLD (Morris et al., 1997). En présence d'un alcool primaire à chaîne courte (éthanol,

propanol-1, butanol-1), comme décrit précédemment, la PLD catalyse une réaction de

transfert du groupe phosphatidyl sur l'alcool pour produire de la choline et un

phosphatidylalcool au dépens du PA. L'emploi d'un alcool (à des concentrations de 0,2 à 2%)

empêche toute confusion avec le PA issu du DAG, et le phosphatidylalcool formé reflète

spécifiquement une activité PLD (Randall et al., 1990; Cook and Wakelam, 1992).

Pour mesurer l'activité de transphosphatidylation on peut utiliser un alcool primaire marqué

au tritium (Randall et al., 1990) ou une PC marquée sur le groupe phosphatidyl avec des

acides gras insaturés comme le [3H]-oléate, le [3H]-arachidonate,… ou saturés tels que le

[3H]-palmitate, le [3H]-myristate,… qui s'incorporent majoritairement dans le pool des PC

(Huang and Cabot, 1990). Le [3H]-alkyl-2-lyso-PC, appelé aussi lyso-PAF, permet également

de marquer sélectivement le pool de PC et de mesurer de façon spécifique l'acitivité PC-PLD.

Les phosphatidylalcools sont extraits dans la phase organique et séparés des autres

phospholipides par chromatographie sur couche mince ou par HPLC.

II.1.1.3 Purification

Plusieurs tentatives de purification de la PLD à homogénéité ont échoué,

principalement à cause d’une perte de l’activité enzymatique au cours des différentes étapes

de la purification. Cependant, ces études ont permis de mettre en évidence l’existence de

plusieurs isoformes différentes de PLD ayant des mécanismes de régulation distincts. Kanfer

et ses collègues ont partiellement solubilisé une PLD de 200 KDa à partir des membranes de

cerveau de rat. Son activité est optimale à PH 6, stimulée par l’oléate de sodium et faiblement

activée par le calcium et le magnésium à des concentrations comprises entre 1 et 10 mM.

Cependant, le calcium utilisé à des concentrations physiologiques (0,1-1 µM), n’a pas d’effet

sur l’activité (Saito and Kanfer, 1975; Taki and Kanfer 1979; Kanfer 1980; Chalifour and

Kanfer 1982; Kobayashi and Kanfer 1987; Chalifa et al., 1990). Une activité PLD

partiellement purifiée à partir des membranes de cellules HL-60 est stimulable par PIP2 et la

petite protéine G ARF (ADP Ribosylation Factor), mais pas par l’oléate de sodium (Brown et

al., 1993). Ensuite, Massenburg et al. ont rapporté la présence de deux activités PC-PLD dans

le cerveau de rat: une PLD activable par ARF qui requiert du PIP2, et l’autre activable par

Page 33: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

33

l’oléate de sodium non stimulée en présence de PIP2 (Massenburg et al., 1994). Ce n’est

qu’en 1994 qu’Okamura et Yamashita ont pu purifier une PLD à homogénéité, à partir de

microsomes de poumon de porc. La PLD isolée présente des propriétés très proches de celle

de la PLD de cerveau de rat. Elle a une masse moléculaire apparente de 190 KDa et son pH

optimal est de 6,6. Elle est stimulée par 1 mM de calcium et 2 mM de magnésium. Cette

activité PLD est stimulée par l’acide oléique et ne requiert pas de PIP2, ni de petite protéine

G. Une autre PLD de 95 KDa, partiellement purifiée à partir de cerveau de porc, est activable

par PIP2, ARF, et Rho. (Brown et al., 1995).

II.1.2 Clonage et caractérisation des PLD

Les PLD de plusieurs espèces procaryotes et eucaryotes ont été clonées. Le premier

gène humain codant une isoforme dénommée PLD1 a pu être isolé à partir d’une banque

d’ADN complémentaire de cellules HeLa, par homologie de séquence avec celui de la levure

(Hammond et al., 1995). L’alignement de cinq séquences de PLD représentatives de chaque

règne (vertébrés, invertébrés, champignons, végétaux et bactéries) révèle la présence de

caractéristiques communes. La comparaison du gène hPLD1 avec ses homologues clonés

dans d’autres espèces, montre qu’il fait partie d’une famille de gènes hautement conservés

chez les eucaryotes (Liscovitch et al., 2000). Tous les gènes eucaryotes de PLD clonés à ce

jour possèdent un centre catalytique très conservé, entouré de régions N-terminales et C-

terminales de séquence plus variable. Le gène de la hPLD1 code une protéine de 1072 acides

aminés correspondant à une masse moléculaire de 120 KDa. Cette protéine présente une

activité PLD PC-spécifique (hydrolyse et transphosphatidylation). La PLD1, caractérisée par

une activité basale faible, est activée par trois classes d’effecteurs: les protéines G de la

famille ARF, les protéines G de la famille Rho et plusieurs membres de la famille des

protéines kinases C (PKC). Elle nécessite la présence de PIP2 et elle est inhibée par l’oléate

(Hammond et al., 1995). La PLD1 présente deux variants, PLD1a et PLD1b, produits par

épissage alternatif. PLD1b comporte une délétion de 38 acides aminés (résidus 585 à 624) par

rapport à PLD1a (Hammond et al., 1997; Katayama et al., 1998). Ces deux variants

d’épissage présentent la même structure et les mêmes caractéristiques d’activité et de

sensibilité aux effecteurs.

Après le clonage de PLD1 d'autres séquences homologues ont été identifiées chez les

mammifères (Ribbes et al., 1996). La séquence complète d'une nouvelle PLD appelée PLD2 a

été décrite (Colley et al., 1997b; Kodaki and Yamashita, 1997). C'est une protéine de 932

Page 34: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

34

acides aminés, d'une masse moléculaire de 100 kDa environ, et présentant 50 à 53%

d'homologie de séquence avec PLD1. PLD2 est délétée d'une boucle centrale de 116 acides

aminés présente dans PLD1 juste en aval de la triade catalytique HKD du motif I (hPLD1a

∆505-620) (Figure 2). De plus PLD1 et PLD2 diffèrent également dans leurs parties C-

terminale et N-terminale. Trois variants d'épissage de la PLD2 humaine ont été décrits à ce

jour. Le variant le plus long est hPLD2a. Il existe un variant plus court de 11 acides aminés

(hPLD2a ∆810-820) dénommé hPLD2b et un variant tronqué ne conservant que les 335

premiers acides aminés de la séquence (hPLD2a ∆336-932), nommé hPLD2c (Steed et al.,

1998). Même si la PLD2 a pour substrat majeur la phosphatidylcholine et si elle nécessite du

PIP2 comme la PLD1, elle est régulée différemment. La PLD2 a une activité basale élevée

qui est peu ou pas stimulée par les protéines activatrices de PLD1 (Colley et al., 1997a;

Kodaki and Yamashita, 1997; Lopez et al., 1998).

Figure 2 : Représentation schématique des 2 isoformes de PLD (PLD1 et PLD2).

Les rectangles représentent les séquences très conservées dans les PLD de mammifères (CRI, HKD,

CRIII et domaines PH et PX) ou la région unique de la PLD1 (boucle ou « loop »).

Certains travaux ont décrit une activation de PLD2 par PKC mais d'une amplitude plus faible

que celle de PLD1 (Han et al., 2002; Chen and Exton, 2004). Le groupe de Colley et Frohman

a montré que les PLD2 humaines et murines ne sont pas activables par les petites protéines G

de la famille Rho ni par la PKCα. La sensibilité de la PLD2 à ARF est variable dans

différentes espèces. En effet, alors qu’ ARF n’a aucun effet sur la PLD2 murine in vitro

(Jenco et al., 1998), il a été montré que la PLD2 humaine est activée par cette protéine mais à

Page 35: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

35

un degré moindre que la PLD1 (1,5 fois pour la PLD2 contre 50 à 100 fois pour la PLD1)

(Lopez et al., 1998).

II.1.3 Structure primaire des phospholipases D

II.1.3.1 Motifs HKD et mécanismes catalytiques

La séquence peptidique de la PLD montre quatre domaines fortement conservés entre

les diverses isoformes et entre espèces (Figure 3) (nommés CRI à CRIV) pouvant être soit des

sites catalytiques soit des motifs de liaison à des cofacteurs ou des activateurs de la PLD.

Deux domaines particuliers (II et IV) ont été nommés «HKD» parce qu’ils contiennent

chacun un motif chargé invariable «HxKxxxxD/E» (Hammond et al., 1995). Ces motifs sont

caractérisés par la présence de résidus conservés (histidine, lysine et acide aspartique) qui sont

indispensables à la catalyse in vitro et pour le fonctionnement de la PLD in vivo (Sung et al.,

1997). De plus, il a été montré dans les cellules Cos7 que la délétion de l’un de ces motifs

provoque la perte de l’activité catalytique de l’enzyme. Cette activité peut être restaurée par la

cotransfection de ce mutant de délétion avec le domaine manquant de l’enzyme. Ceci

s’explique par le fait que les deux parties N et C-terminales peuvent s’associer physiquement

lorsqu’elles sont exprimées dans les cellules Cos7 (Xie et al., 2000).

Figure 3 : Domaines I-IV conservés chez les PLD de différentes espèces (d'après Cockcroft et al., 2001).

Page 36: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

36

Toutes ces observations ont permis d’établir un modèle de catalyse théorique qui met en jeu

un intermédiaire phosphatidyl-enzyme selon un mécanisme ping-pong (Figure 4) (Sung et al.,

1997).

Figure 4 : Modèle de mécanisme catalytique des PLD.

Au commencement du cycle (bas de la figure au centre), l’histidine du motif HKD amino-terminal est

protonnée alors que celle du carboxy-terminal ne l'est pas. La première moitié de la réaction conduit

à la formation d'un intermédiaire PA-PLD et la choline est ensuite libérée. La seconde moitié de la

réaction conduit à la rupture de la liaison entre l'enzyme et le PA ou le Phosphatidylalcool,

respectivement, selon la nature de l’accepteur nucléophile H2O ou alcool primaire (McDermott et al.,

2004).

Les PLD de mammifères n’ont pas encore pu être cristallisées. Cependant, la structure

cristalline des PLD bactériennes a pu être étudiée par la méthode de dispersion anormale

multi-longueur d'ondes (MAD). Ainsi, le modèle structural déterminé pour NUC (Leiros et

Page 37: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

37

al., 2000; Stuckey et Dixon, 1999) (Figure 5) issue de Salmonella typhimurium, a confirmé la

nécessité d'une dimérisation de deux monomères comportant chacun une triade catalytique

HKD pour obtenir un site actif. Il est à noter que le résidu aspartate très conservé du motif

HKD ne participe pas à la catalyse puisqu’il est situé loin du site actif de l’enzyme.

Figure 5 : Structure tridimensionnelle de la protéine Nuc dimérisée.

Forme catalytique de NUC obtenue à l'aide du programme MOLSCRIPT (Stukey et Dixon, 1999). Les

deux monomères sont représentés respectivement en jaune et bleu. Les flèches représentent des

feuillets β et les hélices sont des hélices α. Les résidus conservés sont représentés en couleur et

reportés au bas de la structure.

II.1.3.2 Les régions conservées I et III

Des mutations effectuées dans le domaine CRI de la PLD1 ont montré que certains des

acides aminés sont indispensables au fonctionnement de l’enzyme (Sung et al., 1999b).

Cependant la délétion de cette région n’affecte ni l’activité enzymatique ni la dépendance de

cette enzyme envers le PIP2.

Le motif «IYIENQFF» dans le domaine CRIII est important pour l’activité catalytique

puisque les mutations de la tyrosine en sérine, cystéine ou isoleucine, diminuent l’activation

Page 38: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

38

de l’enzyme. De plus, le domaine CRIII est enrichi en résidus aromatiques, comme le

domaine de liaison à la choline présent dans le récepteur à l’acétylcholine (Harel et al., 1993;

Gilson et al., 1994). Ainsi le domaine CRIII pourrait faciliter la catalyse ou plus

vraisemblablement limiter la spécificité de la PLD aux phospholipides qui portent un

groupement polaire de type choline (Frohman et al., 1999). Cette région code également une

séquence consensus de liaison à la cavéoline, ØxØxxxxØ, où Ø est un acide aminé

aromatique (Okamato et al., 1998).

II.1.3.3 Les domaines PH et PX

Il existe dans la région N-terminale des PLD adjacente au CRI une séquence

significativement semblable à la séquence consensus des domaines PH, ou domaines

d’homologie à la pleckstrine (Steed et al., 1998). Les domaines PH permettent généralement

une interaction spécifique des protéines avec les inositides diphosphorylés possédant leurs

phosphates en position vicinale, comme le PIP2 (Hodgkin et al., 2000). Cependant, l’analyse

de mutants de délétion de la partie N-terminale de PLD1 et PLD2 contenant le domaine PH a

révélé qu’il n’est ni nécessaire à l’activité enzymatique, ni à la dépendance envers le PIP2

(Sung et al., 1999a; Sung et al., 1999b; Hoër et al., 2000), ce qui implique la présence d’un

autre domaine de liaison au PIP2 responsable de l’activation de l’enzyme par ce

phosphoinositide (Sciorra et al., 1999). Le domaine PH des PLD semble jouer un rôle dans la

localisation subcellulaire de la protéine. La délétion de ce domaine supprime l’association de

la PLD avec la membrane (Sciorra et al., 2002).

Les PLD possèdent dans leur partie N-terminale un domaine ressemblant de façon

significative à un domaine PX, ou domaine d’homologie à PHOX (Ponting and Kerr, 1996;

Liscovitch et al., 2000). Les domaines PX ont été décrits comme impliqués dans une grande

variété d’interactions protéine-protéine incluant la liaison à des kinases ou des domaines SH3.

Il a été récemment montré que ces domaines peuvent fixer PI3P, PI(3,4)P2, PI(4,5)P2,

PI(3,5)P2, PI(3,4,5)P3 (Xu et al., 2001). Des mutations ponctuelles de la PLD1 ont suggéré

que le domaine PX n’est pas essentiel pour la catalyse in vitro. Cependant, les PLD1 mutées

dans le domaine PX présentent une activité basale plus élevée in vivo, qui peut être stimulée

par le PMA mais moins que celle de la PLD1 sauvage (Sung et al., 1999b). Très récemment,

on a montré que le domaine PX de PLD1 peut lier le PI5P et cibler la protéine vers les

vésicules d’endocytose (Du et al., 2003). Les domaines PX qui possèdent un acide aminé

basique en position centrale (Lysine ou Arginine en position 58) lient plus particulièrement le

PI3P (Ellson et al., 2002). Les PLD possèdent une lysine à cette position. Comme la PLD1

Page 39: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

39

intacte peut fixer le PI3P mais que cela n’est pas dû au domaine PH (Hodgkin et al., 2000), le

domaine PX pourrait être responsable de la liaison de ce lipide.

II.1.3.4 La boucle centrale de PLD1

La PLD1 possède une région de 100 à 150 acides aminés au centre de la protéine (aa

505-620), absente de la PLD2 ou des PLD des organismes inférieurs (Hammond et al., 1995;

Colley et al., 1997a). Cette région appelée «boucle» aurait une activité régulatrice négative:

d’une part, la délétion de la région «boucle» ou de la partie N-terminale de la PLD1 provoque

une augmentation de l’activité basale de l’enzyme et ceci suggère que ces deux régions sont

des domaines de régulation négative qui permettent de maintenir l’activité PLD1 basale à un

niveau faible. D’autre part, l’activité basale de la PLD2, qui ne possède pas de séquence

boucle, est très élevée. Cette boucle au centre de PLD1 serait donc impliquée dans un

mécanisme d’autoinhibition, levée par les activateurs de l’enzyme.

II.1.3.5 Le domaine de liaison au PIP2 ou «motif polybasique»

Les activités PLD1 et PLD2 sont fortement dépendantes du PIP2. Un domaine de

liaison au PIP2 situé entre les deux domaines HKD a été identifié. L’association de ce

domaine avec le PIP2 est nécessaire à l’activité enzymatique des PLD de levure et de

mammifères, ce qui suggère que ce domaine est responsable de la dépendance des PLD

envers le PIP2 (Sciorra et al., 1999). Ce domaine contient un motif riche en acides aminés

aromatiques et basiques (motif polybasique).

II.1.3.6 Les séquences amino- et carboxy-terminales

Les séquences amino-terminales des PLD de nombreuses espèces, de la levure à

l’homme, sont relativement peu conservées et semblent tolérer des modifications comme la

fusion à d’autres protéines telles que la protéine fluorescente verte (GFP). Ces modifications

n’influent pas sur l’activité PLD (Hammond et al., 1995; Sung et al., 1997). Dans cette partie

N-terminale de la PLD1 se trouve une zone qui serait impliquée dans la régulation par la PKC

(Xie et al., 1998; Sung et al., 1999b). En effet, des mutants de PLD1 délétés de leur partie N-

terminale perdent leur sensibilité aux esters de phorbol, puissants activateurs des PKCs. Par

contre la partie N-terminale de PLD2 semble nécessaire à son activité basale. La délétion des

308 premiers acides aminés de cette région conduit à une enzyme de faible activité basale qui,

de façon surprenante, devient sensible à l'activation par ARF.

Page 40: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

40

La séquence C-terminale est plutôt conservée et l'activité enzymatique semble très

sensible aux modifications de cette région (Sung et al., 1999a et 1999b). L’analyse de

différentes protéines chimères de la PLD1 et de la PLD2, suggère que le domaine

interagissant avec ARF se trouve dans l’extrémité C-terminale des PLD. La séquence C-

terminale de PLD1 est indispensable pour l’interaction avec Rho (discuté plus en détail dans

la partie «Régulation»).

II.1.4 Régulation des PLD

II.1.4.1 Régulation par le PIP2

II.1.4.1.1 Rôles physiologiques de PIP2

Le phosphatidylinositol 4,5-diphosphate (PIP2) est connu comme précurseur de

seconds messagers dans plusieurs voies de signalisation. Ainsi l’hydrolyse de PIP2 par la

phospholipase C libère de l’inositol-trisphosphate (IP3), responsable de la mobilisation du

calcium des compartiments intracellulaires, et du diacylglycérol (DAG), un activateur des

PKC. Le PIP2 est aussi par lui-même un second messager impliqué dans plusieurs fonctions

cellulaires incluant le trafic vésiculaire, l’exocytose, la formation des adhésions focales et la

régulation du cytosquelette d’actine (Hinchliffe et al., 1998) (Figure 6).

La production de PIP2 est assurée par les phosphatidylinositol phosphate kinases (PIP

kinases). Ces dernières sont divisées en trois sous-familles: les types I, II et III. Les PIP

kinases de types I et II comportent chacune trois isoformes α, β et γ (Ishihara et al., 1996;

1998; Itoh et al., 2000; Loijens and Anderson; 1996). Les PIP kinases de type I sont des

PI(4)P 5-kinases qui produisent le PI(4,5)P2 à partir de PI(4)P, alors que les PIP kinases de

type II sont des PI(5)P 4-kinases qui utilisent le PI(5)P comme substrat pour former le

PI(4,5)P2 (Rameh et al., 1997). Les PIP kinases de type III sont des PI(3)P 5-kinases qui

produisent le PI(3,5)P2 en utilisant le PI(3)P comme substrat (Gary et al., 1998; Sbrissa et al.,

1999). Les PIP kinases de type I ont été localisées dans la membrane plasmique, les «ruffles»

(ou fronces membranaires), le Golgi, le noyau et les adhésions focales (Boronenkov et al.,

1998; Godi et al., 1999; Di Paolo et al., 2002; Ling et al., 2002). Elles jouent un rôle dans la

sécrétion, l’endocytose et le réarrangement du cytosquelette d’actine, (Hay et al., 1995;

Shibasaki et al., 1997; Di Paolo et al., 2002). Les PIP kinases de type II ont été retrouvées

dans le cytosol, le réticulum endoplasmique et le noyau. Contrairement aux PIP kinases de

type I, elles ne régulent pas la réorganisation du cytosquelette d’actine. Les PIP kinases de

Page 41: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

41

types I et II ont des localisations subcellulaires différentes et ciblent ainsi la production de

PIP2 au niveau des sites subcellulaires spécifiques riches en protéines effectrices du PIP2.

(Doughman et al., 2003).

Figure 6: Production de PIP2 au niveau de plusieurs sites cellulaires.

Divers processus cellulaires comme l’endocytose, l’exocytose, la réorganisation du cytosquelette

d’actine (lamellipodes, adhésions focales et fibres de stress) et autres nécessitent une synthèse locale

du PIP2 (Doughman et al., 2003).

Le PIP2 est capable de lier les protéines ayant des domaines PH (Harlan et al., 1994). Les

domaines PH sont retrouvés dans de nombreuses protéines intervenant dans la signalisation

cellulaire dont les PLCγ et PLCδ, certaines PKC, Ras-GAP, Db1 (facteur d’échange des

protéines Rho) et dans des protéines appartenant au cytosquelette dont la fodrine, l’α-actinine.

Cependant, l’affinité du domaine PH pour le PIP2 est très variable en fonction des protéines

considérées (Boivin and Lecomte, 1997). Il est à noter que le domaine PH de PLCδ (PH-

PLCδ) fusionné à la GFP a servi comme sonde spécifique de PIP2 et a permis d’étudier sa

Page 42: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

42

localisation dans les cellules vivantes (Balla et al, 2000). Il existe aussi des anticorps

spécifiques de PIP2 qui permettent son immunolocalisation. Il a ainsi été déterminé que la

synthèse et la dégradation du PIP2 sont régulées de manière spatio-temporelle lors des

différents processus cellulaires impliquant ce phospholipide.

II.1.4.1.2 PIP2 et cytosquelette d’actine

Le PIP2 est connu pour interagir avec au moins 30 protéines liant l’actine, régulant

ainsi la polymérisation de l’actine et la formation des ruffles ou des fibres de stress. Par

exemple le PIP2 peut interagir avec la profiline, protéine de sequestration des monomères

d’actine G, la gelsoline, une protéine de «capping» et de sectionnement des filaments

d’actine, l’actinine-α, une protéine d’empaquetage, et la taline une protéine d’adhésion focale

(Janmey et al., 1999). Une surexpression de la PIP kinase Iα dans les cellules COS-7 induit

une polymérisation massive d’actine (Shibasaki et al., 1997). Gilmore et Burridge (1996) ont

montré que l’injection des anticorps anti-PIP2 dans les fibroblastes inhibe la formation des

fibres de stress et des adhésions focales induite par l’acide lysophosphatidique (LPA) via la

protéine Rho. La surexpression de la synaptojanine, une PIP2-5 phosphatase, diminue le

nombre des fibres de stress dans les cellules COS-7 (Sakisaka et al., 1997). Inversement, dans

les cellules CV1, la surexpression de la PIP kinase Iβ augmente le nombre de fibres de stress

de manière Rho dépendante (Yamanoto et al., 2001).

II.1.4.1.3 PIP2 et PLD

Les premières constatations de l’importance de PIP2 comme cofacteur dans

l’activation de la PLD ont été réalisées sur des vésicules artificielles de PE/PC, contenant ou

pas ce phosphoinositide. Dans les cellules U937, l’utilisation d’anticorps qui bloquent la

PI(4)P 5-kinase, et par conséquent la synthèse de PIP2, inhibe complètement l’activité PLD

stimulable par le GTPγS (Pertile et al., 1995). L’utilisation de la néomycine, un antibiotique

capable de fixer le PIP2 avec une grande affinité, provoque une inhibition de l’activité PLD

dans les cellules neuronales, les cellules HL60 et les neutrophiles (Liscovitch et al., 1991;

Geny and Cockcroft, 1992; Ohguchi et al., 1996). Les deux isoformes PLD1 et PLD2

requièrent du PIP2 pour leur activation (Colley et al., 1997a; Hammond et al., 1997). Il est

possible que le PIP2 interagisse avec les PLD sur le motif polybasique entre les deux

domaines HKD (Sciorra et al., 1999) mais pas sur le domaine PH qui n’est pas impliqué dans

l’activation des PLD par le PIP2 (Hoër et al., 2000). Les PLD1 et PLD2 pourraient interagir

Page 43: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

43

directement avec la PI(4)P 5-kinase α. De plus la PLD2 est capable de recruter cette kinase à

la membrane (Divecha et al., 2000). Le PIP2 est nécessaire à l’effet stimulant de la PKC et

des petites protéines G ARF et RhoA sur la PLD recombinante, la PLD des membranes de

cerveau de rat ou de porc, et de cellules HL-60 (Massenburg et al., 1994; Brown et al., 1995 ;

Kuribara et al., 1995 ; Ohguchi et al., 1996 ; Hammond et al., 1997).

II.1.4.2 Régulation par les petites protéines G

Les GTPases monomériques forment une super-famille de 150 membres environ, dont

les masses moléculaires varient de 20 à 30 KDa. Ces protéines possèdent un motif consensus

de liaison au GTP. Elles sont classées, en fonction de leurs homologies de séquence en 5

familles: Ras, Rho, Rab, ARF et Ran. (Tableau 1). La phospholipase D est activée par les

petites protéines G Rho et ARF.

II.1.4.2.1 Régulation par les protéines Rho

II.1.4.2.1.1 Les protéines de la famille Rho

Les protéines Rho les mieux connues sont RhoA, Rac1 et Cdc42. Les protéines Rho

existent sous deux formes distinctes, l’une active se liant au GTP et l’autre inactive se liant au

GDP. Dans le cytosol, les protéines Rho sont liées par leurs extrémités C-terminale aux

inhibiteurs de dissociation de GDP (GDIs) qui les maintiennent sous forme inactive. Lors de

l’activation, les protéines Rho sont transloquées aux membranes où les facteurs d’échange

GEF (guanine nucleotide exchange factor) favorisent la dissociation du GDP et la liaison du

GTP. Les protéines Rho peuvent alors activer leurs protéines effectrices. Il existe aussi des

protéines activatrices de l’activité GTPase (GAP) qui favorisent le retour des protéines Rho à

leur état inactif. Les protéines de la famille Rho sont activées et transloquées du cytosol vers

la membrane après fixation de nombreux agonistes dont le LPA, l’endothéline-1, la trombine

et l’insuline sur leurs récepteurs. Le mécanisme par lequel ces agonistes activent les protéines

Rho n’est pas bien compris, mais plusieurs expériences laissent penser que des PKC, des

tyrosines kinases, des PI-3 kinases et surtout les sous-unités α et βγ de protéines G

hétérotrimériques pourraient être impliquées (Exton, 1999). En particulier, la sous-unité α des

protéines G hétérotrimériques G13 est capable d’activer directement un facteur d’échange de

Rho, P115-RhoGEF (Hart et al., 1998; Kozasa et al., 1998). Plusieurs autres études ont

montré que les protéines Gαq/11, Gα12 ou Gα13 peuvent activer les protéines Rho (Seasholtz et

al., 1999). L’activation de Gq peut résulter en l’activation de PKC, et il semble que les PKC

Page 44: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

44

pourraient phosphoryler Gα12 et Gα13 suggérant ainsi une voie de régulation des protéines Rho

par Gαq (Kozasa and Gilman, 1996; Offermanns et al., 1996).

Ras

Family

Rho

Family

Rab

Family

Sar1/Arf

Family

Ran

Family

Mammal Ha-Ras

Ki-Ras

N-Ras

R-Ras

M-Ras

RalA

RalB

Rap1A

Rap1B

Rap2A

Rap2B

Tc21

Rit

Rin

Rad

Kir/Gem

Rheb

ΚB-

Ras1

ΚB-

Ras2

RhoA

RhoB

RhoC

RhoD

RhoE/

Rnd3/

Rho8

RhoG

RhoH/

TTF

Rac1

Rac2

Rac3

Cdc42

Rnd1/

Rho6

Rnd2/

Rho7

Tcl0

Rab1A

Rab1B

Rab2

Rab3A

Rab3B

Rab3C

Rab3D

Rab4

Rab5A

Rab5B

Rab5C

Rab6

Rab7

Rab8

Rab9

Rab10

Rab11A

Rab11B

Rab12

Rab13

Rab14

Rab15

Rab16

Rab17

Rab18

Rab19

Rab20

Rab21

Rab22

Rab23

Rab24

Rab25

Rab26

Rab27A

Rab27B

Rab28

Rab29

Rab30

Rab31

Rab32

Rab33A

Rab33B

Arf1

Arf2

Arf3

Arf4

Arf5

Arf6

Sar1a

Sar1b

Arl1

Arl2

Arl3

Arl4

Arl5

Arl6

Arl7

Ard1

Ran

Yeast Ras1

Ras2

Rsr1

Yct7

Rho1

Rho2

Rho3

Rho4

Cdc42

Yns0

Ypt1

Sec4

Ypt31/

Ypt8

Ypt32/

Ypt9

Ypt51/

Vps21

Ypt52

Ypt53

Ypt6

Ypt7

Ypt10

Ypt11

Arf1

Arf2

Arf3

Sar1

Arl1

Arl2

Cin4

Gsp1

Gsp2

Tableau 1 Les familles des petites protéines G (Takai et al., 2001)

Page 45: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

45

II.1.4.2.1.2 Rôles physiologiques de Rho

Les protéines Rho contrôlent une multitude de processus biologiques incluant la

prolifération, la régulation de la transcription génique (Hill et al., 1995; Fukuhara et al.,

1999), la différenciation myogénique (Carnac et al., 1998; Takano et al., 1998; Wei et al.,

1998) et surtout le réarrangement du cytosquelette (Van Aelst and D’Souza-Schorey, 1997).

RhoA, Rac et Cdc42 sont les trois GTPases monomériques modulatrices du cytosquelette

d’actine. Cdc42 est responsable de la formation des filopodes, protrusions ou extensions

cytoplasmiques à l’avant de la cellule (Kozma et al., 1995; Nobes and Hall, 1995). Rac1 est

responsable de la formation des lamellipodes et des «ruffles», par son action au niveau du

réseau d’actine corticale (Ridley et al., 1992). RhoA est impliquée dans la formation des

adhésions focales et des fibres de stress, faisceaux de filaments d’actine qui traversent la

cellule de part en part (Nobes and Hall, 1995; Mackay and Hall, 1998) (Figure 7).

Figure 7 : Implication des protéines G de la famille Rho dans le réarrangement du cytosquelette.

Les protéines RhoA, Rac et Cdc42 sont respectivement impliquées dans la formation des fibres de

stress, des lamellipodes et "ruffles", et des filopodes. Les différents agonistes agissant en amont des

protéines G dans les fibroblastes Swiss 3T3 sont indiqués (Takai et al., 2001).

Page 46: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

46

Une toxine bactérienne, l’exoenzyme C3 de Clostridium botulinum, qui inactive Rho par une

ADP-ribosylation, a été utilisée pour montrer les différentes fonctions de Rho. Ainsi

l’utilisation de cette toxine a suggéré le rôle de Rho dans le remaniement du cytosquelette

d’actine (Chardin et al., 1989; Paterson et al., 1990). L’implication de Rho dans la formation

des fibres de stress et des adhésions focales a été montrée dans les fibroblastes soit par

surexpression de mutants dominants négatifs ou des RhoGDIs (Ridley and Hall, 1992; Miura

et al., 1993; Ridley and Hall, 1994), soit par microinjection d’un mutant constitutivement actif

de Rho, RhoV14 (Ridley and Hall,1992). Plusieurs études ont montré que les protéines Gα12

et Gα13 contrôlent la formation des fibres de stress Rho-dépendante (Buhl et al., 1995; Hooley

et al., 1996). Ainsi une microinjection des formes actives de Gα12 et Gα13 dans les cellules

Swiss 3T3 peut induire la formation Rho-dépendante des fibres de stress et des adhésions

focales (Gohla et al., 1998). Dans les fibroblastes, la formation des fibres des stress induite

par le LPA est médiée par Gα13 alors que celle induite par la thrombine et l’arginine-

vasopressine (AVP) est médiée par Gα12 (Gohla et al., 1999).

II.1.4.2.1.3 Les effecteurs de Rho

Le mécanisme moléculaire par lequel Rho induit le réarrangement du cytosquelette

d’actine n’est pas complètement connu. Plusieurs effecteurs de Rho ont été identifiés chez les

mammifères dont la Rho kinase (ROCK), Citron, Rhophilin, Rhotekin, P140mDia,

phospholipase D (Madaule et al., 1995; Reid et al., 1996; Watanabe et al., 1996; Bishop and

Hall, 2000). ROCK, une sérine/thréonine kinase, est un des effecteurs de Rho fortement

impliqué dans la formation des fibres de stress. Des mutants constitutivement actifs de ROCK

peuvent stimuler l’assemblage des fibres de stress (Aspenström P, 1999) alors que des

inhibiteurs de cette kinase empêchent la formation de ces fibres (Uehata et al., 1997). ROCK

induit la phosphorylation et donc active la chaîne légère de la myosine ou MLC «myosin light

chain» en inhibant la MLC-phosphatase (Kimura et al., 1996). ROCK peut aussi jouer le rôle

de MLC kinase et phosphoryle directement la MLC (Amano et al., 1996). ROCK peut ainsi

provoquer la formation des fibres de stress et/ou leur contractilité en activant la myosine. Elle

est capable aussi d’activer la LIM kinase, une protéine qui phosphoryle et inactive la cofiline.

Cette dernière est une protéine fixatrice de l’actine et dépolymérise les filaments d’actine

(Maekawa et al., 1999). La surexpression de LIM kinase induit la formation des fibres de

stress d’actine de manière ROCK-dépendante, en inhibant la dépolymérisation des filaments

d’actine. Quel que soit le mode d’action de ROCK, l’épaisseur, le nombre et la distribution

des fibres de stress induites par des mutants constitutivement actifs de ROCK sont clairement

Page 47: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

47

différents de ceux induits par l’activation de Rho (Sahai et al., 1998; Watanabe et al., 1999),

indiquant ainsi l’implication d’autres effecteurs de Rho. La protéine P140 mDia, qui interagit

avec la profiline (protéine fixant les monomères de l’actine G), coopère avec ROCK pour

former les fibres de stress (Watanabe et al., 1999). De plus, l’activation de PI(4)P 5-kinase par

Rho a été aussi rapportée in vitro (Toker, 1998). D’autres études ont montré que Rho et Rac

stimulent la synthèse de PIP2 (Chong et al., 1994; Hartwig et al., 1995), lui-même impliqué

dans la formation des fibres de stress par sa liaison à des protéines fixatrices de l’actine. Le

mécanisme exact par lequel Rho active la PI(4)P 5-kinase n’est pas encore bien connu. Cela

pourrait être par interaction directe, mais aussi via l’activation de la phospholipase D et la

formation d’acide phosphatidique, un activateur de PI(4)P 5-kinase.

II.1.4.2.1.4 Rho et PLD

En 1991, Olson et al. ont été les premiers à mettre en évidence une régulation de la

PLD par les protéines de la famille Rho. Ces auteurs ont montré que l’effet activateur du

GTPγS sur la PLD dans des membranes de neutrophiles est supprimé par RhoGDI, inhibiteur

spécifique de la dissociation du GDP des protéines Rho. Il a ensuite été montré, dans des

études utilisant des membranes d’hépatocytes de rat, de cellules HL-60 ou bien de

neutrophiles, que RhoA était la protéine de la famille Rho la plus efficace sur la PLD

(Malcolm et al., 1994; Siddiqi et al., 1995; Kwak et al., 1995). De plus RhoA stimule aussi la

PLD dans des fractions d’autres cellules ou dans des préparations d’enzyme partiellement

purifiées (Provost et al., 1996; Balboa and Insel, 1995; Singer et al., 1995; Shimooku et al.,

1996). D’autres protéines de la famille de Rho peuvent activer la PLD1 recombinante: il

s’agit de Rac1 et Cdc42. Le rôle des protéines Rho en tant que régulatrices de la PLD a été

confirmé par l’utilisation de toxines comme l’exoenzyme C3 de C.botulinum qui inactive

spécifiquement RhoA, RhoB et RhoC en les ADP ribosylant en Asn41 (Sekine et al., 1989),

et les toxines de C.difficile et de C. sordelli qui inactivent plusieurs protéines de la famille

Rho en les glucosylant. L’utilisation de ces toxines a permis de montrer l’implication de Rho

dans la stimulation de la PLD par divers agonistes tels que le LPA, les esters de phorbol,

l’endothéline-1 et le PDGF dans les fibroblastes (Malcolm et al., 1996; Hess et al., 1997).

L’activation de la PLD par les agonistes est associée à la translocation de Rho vers les

membranes. Les toxines inhibent l’activité PLD en empêchant la translocation de Rho, soit en

le maintenant sous forme liée à RhoGDI (toxine C3), soit en bloquant la petite protéine G

sous une forme inactive liée au GDP. L’action de Rho sur la PLD est synergique avec celle

Page 48: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

48

d’autres facteurs cytosoliques tels que les PKCα et ARF (Exton et al., 1997). Bien que

l’activation de la PLD par des protéines de la famille Rho soit bien établie, le mécanisme par

lequel ces protéines influencent la PLD restait controversé jusqu’aux expériences qui ont

montré que Rho interagit directement avec le domaine CRIV de PLD1 (Sung et al., 1997). Le

domaine d’interaction de la PLD1 avec RhoA se situe du côté C-terminal de la protéine au

niveau de la séquence des acides aminés 873-1024, particulièrement riche en résidus basiques

(Cai et Exton, 2001). Aucune activation directe de la PLD2 par Rho n’a pu être observée

(Sung et al., 1999a). Il est aussi possible que Rho active la PLD indirectement via l’activation

de ROCK, puisque l’inhibition de l’activité de la Rho kinase par des agents pharmacologiques

ou par expression de mutants catalytiquement inactifs bloque l’activation de la PLD via le

récepteur m3 de l’acétylcholine (Schmidt et al., 1999b). Cependant, le mécanisme par lequel

ROCK peut activer la PLD n’est pas encore connu. Une autre possibilité d’activation indirecte

de la PLD passe par l’effet de RhoA sur la PI(4)P 5-kinase qui régule la synthèse de PIP2

(Chong et al., 1994; Ren et al., 1996).

II.1.4.2.2 Régulation par les protéines ARF

II.1.4.2.2.1 Les protéines G de la famille ARF

Les petites protéines G ARF peuvent être groupées, selon leur structure, en trois

classes: la classe I incluant ARF1, ARF2, ARF3; la classe II incluant ARF4, ARF5 et la

classe III incluant ARF6 (Moss and Vaughan, 1998; Chavrier and Goud, 1999). Les protéines

ARF sont impliquées dans différentes fonctions cellulaires incluant le trafic vésiculaire (Moss

et al., 1998; Roth et al., 1999), et la sécrétion (D’Souza-Schorey et al., 1995; Radhakrishna

and Donaldson, 1997; D’Souza-Schorey et al., 1998; Zhang et al., 1998; Altschuler et al.,

1999). Ceci concerne principalement ARF6, qui est aussi impliquée dans la formation des

«ruffles» induites par Rac1 (Radhakrishna et al., 1999). Comme les protéines Rho, les

protéines ARF sont activées par les facteurs d’échange GEFs et inhibées par les GAPs, mais

elles ne dépendent pas des GDIs. Le lien entre les protéines G couplées à des récepteurs à sept

passages transmembranaires, les récepteurs à activité tyrosine kinase et l’activation des

protéines ARF n’est pas bien connu. L’implication des facteurs d’échange est tentante: l’un

des candidats est ARNO «ARF Nucleotide site Opener», qui dépend du PIP2 pour son

association à la membrane et sa capacité à activer les protéines ARF (Paris et al., 1997).

Page 49: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

49

II.1.4.2.2.2 ARF et PLD

Des études utilisant le GTPγS, un analogue de GTP non hydrolysable qui maintient les

protéines G sous forme active, sur des cellules HL60 perméabilisées, ont permis de montrer

que l’activation de la PLD par le GTPγS requiert des facteurs cytosoliques (Anthes et al.,

1991). La purification de ces facteurs a permis d’identifier les protéines ARF comme facteurs

activateurs de la PLD (Brown et al., 1993; Cockcroft et al., 1994). L’activité de la PLD est

stimulée par ARF1, ARF3, ARF 5 et ARF6, c’est à dire toutes les classes des protéines ARF

(Brown et al., 1995; Caumont et al., 1998). La bréfeldine A est une toxine fongique inhibitrice

de l’échange GDP/GTP au niveau des protéines ARF, qui empêche donc son activation

(Donaldson et al., 1992; Helms and Rothman, 1992). Utilisée à de fortes concentrations, elle

détruit l’appareil de Golgi. L’inhibition par la bréfeldine A de l’activation de la PLD par de

nombreux agonistes incluant l’insuline (Shome et al., 1995; Shome et al., 1997), le PDGF,

l’angiotensine II, l’endothéline-1 (Shome et al., 2000) et les agonistes des recepteurs

muscariniques M3 (Rümenapp et al., 1995) démontre qu’in vivo, les protéines ARF doivent

être impliquées dans leur effet activateur. La stimulation de la PLD par des agonistes coïncide

avec une translocation des protéines ARF à la membrane (Hammond et al. 1997). Le domaine

N-terminal de ARF semble être impliqué dans l’activation de la PLD1. La myristylation de

ARF qui permet son association avec la membrane plasmique, augmente considérablement

l’activation de la PLD1 (Cockcroft et al., 1994; Brown and Sternweis, 1995). Les deux

variants d’épissage de hPLD1 et de rPLD1 sont activables par ARF (Hammond et al., 1995;

Hammond et al., 1997; Park et al., 1997; Min et al., 1998). La hPLD2 semble être activable

par ARF mais à un moindre degré (Lopez et al., 1998). L'activation de la PLD par ARF a été

détectée dans de nombreux compartiments subcellulaires: la membrane plasmique (Provost et

al., 1996; Whatmore et al., 1996), le noyau (Banno et al., 1997), l’appareil de Golgi

(Whatmore et al., 1996; Morgan et al., 1997), et le cytosol (Siddiqi et al., 1995). Dans le

Golgi, l'activité PLD sensible aux ARF apparaît comme impliquée dans le trafic vésiculaire.

II.1.4.3 Régulation par les protéines kinases C

Les protéines kinases C sont des sérine/thréonine kinases et peuvent être divisées en

trois sous-familles: Les PKC conventionnelles (PKCα, βI, βII et γ) activables par le calcium,

le DAG et la phosphatidylsérine (PS), les PKC nouvelles (PKCδ, ε, η, θ) activables par le

DAG et la PS mais indépendantes du calcium et les PKC atypiques (PKCζ, λ, et ι) activables

seulement par la PS. Les différentes isoformes de PKC ont des distributions tissulaires et

Page 50: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

50

subcellulaires différentes, suggérant des fonctions physiologiques diverses (Hug and Sarre,

1993) incluant la différenciation.

II.1.4.3.1.1 PKC et PLD

L’activation de la PLD par les PKC a été démontrée dans de nombreux types

cellulaires en utilisant des esters de phorbol PMA (ou TPA). Ces esters de phorbol peuvent

activer les PKC conventionnelles et nouvelles selon un mécanisme similaire à l’activation par

le DAG. Cependant, la translocation des PKC à la membrane provoque aussi leur dégradation

par des protéases. Par conséquent, un traitement prolongé par le PMA provoque une

élimination complète de l’activité enzymatique, appelée rétrocontrôle négatif. Le traitement

prolongé par le PMA supprime la capacité de divers agonistes à stimuler la PLD dans

plusieurs types cellulaires (Exton, 1997). Cependant, dans certains cas, le rétrocontrôle

négatif des PKC ne provoque qu’une inhibition partielle de la stimulation de la PLD, ou n’a

pas d’effet, ce qui implique une activité PLD indépendante des PKC. D’autre part,

l’utilisation des inhibiteurs de PKC sélectifs comme la chélérythrine et le Ro-31-8220, ou

moins sélectifs comme la staurosporine et la sphingosine, bloque partiellement ou totalement

l’activation de la PLD par certains agonistes (Bosch et al., 1999; Khan and Hichami, 1999;

Slaaby et al., 2000). La surexpression de la PKCα ou β dans des fibroblastes augmente

l’activité PLD basale et stimulée par l’endothéline, la thrombine, et le PDGF (Pai et al., 1991;

Pachter et al., 1992; Eldar et al., 1993). La déplétion de la PKCα par transfection des ADNc

antisens dans les cellules MDCK, diminue l’activation de la PLD par les agonistes

purinergiques (Balboa et al., 1994).

II.1.4.3.1.2 Mécanismes d’activation de la PLD par les PKC

Tous ces résultats indiquent que les PKC jouent un rôle important dans la régulation

de l’activité PLD. Cependant, une question très débattue concerne le mécanisme d’activation

de PLD par les PKC: est-ce par une interaction protéine-protéine, ou est-ce par un mécanisme

dépendant de l’activité kinasique des PKC? Plusieurs travaux ont montré que l’activation de

la PLD par les PKC se fait en absence d’ATP. La PKCα est capable de reconstituer l’activité

PLD, en absence d’ATP, dans des cellules perméabilisées et déplétées de leur cytosol (Singer

et al., 1995). De plus, des expériences d’immunoprécipitation ont permis de montrer que le

traitement de fibroblastes NIH 3T3 par le PMA induit l’association de la PLD1 avec la PKCα

(Lee et al., 1997b). De même, des études récentes ont confirmé que l’activation de la PLD1

Page 51: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

51

par le PMA se fait par une interaction de la PKCα avec la PLD1 plutôt que par un mécanisme

de phosphorylation (Hu and Exton, 2003). Enfin, il a été montré que le domaine régulateur de

la PKC est capable à lui seul de stimuler la PLD (Singer et al., 1996). Cette activation de la

PLD1 par une PKC est synergique avec celle induite par les protéines ARF et Rho (Singer et

al., 1996), et par le PIP2 (Ohguchi et al., 1996). Des expériences de mutagénèse dirigée ont

montré que la PLD1 interagit directement avec la PKCα via son domaine N-terminal (Xie et

al., 1998) mais indépendamment des domaines PH et PX (Sung et al., 1999b). Tous ces

résultats suggèrent que la PKCα module l’activité PLD par interaction directe. D’autres

études ont montré que la PKC phosphoryle la PLD1 in vivo (Kim et al., 2000). De plus,

l’activation de la PLD par les esters de phorbol est fortement diminuée par les inhibiteurs de

PKC, compétiteurs du site actif (Davis et al., 1989). Certains sites de phosphorylation ont été

identifiés dans la séquence de PLD1, dont le résidu Thr 137, qui apparaît important dans la

régulation de PLD1 par la PKC (Kim et al., 1999). La PLD2 a été initialement décrite comme

insensible aux PKC (Colley et al., 1997b). Néanmoins, des travaux récents ont montré une

activation de PLD2 par les esters de phorbol dans des cellules Sf9 co-exprimant la PKCα et la

PLD2 (Siddiqi et al., 2000). Dans des cellules PC12, la surexpression d'un mutant de PKCδ

dépourvu d'activité kinasique supprime l'activation et la phosphorylation de PLD2 par les

esters de phorbol. De plus l'inhibition spécifique de cette isoforme de PKC par la rottlerine,

abolit complètement l'activation par les esters de phorbol. Dans ce cas, l'activation de PLD2

par PKCδ se fait via une phosphorylation directe (Han et al., 2002).Très récemment, des

expériences ont pu montrer que La PKCα interagit in vivo avec la PLD2 et l’active suite à une

stimulation par le PMA. Cette activation de la PLD2 par la PKCα est accompagnée d’une

phosphorylation qui contribue à désactiver l’enzyme. Dans ce cas, l’activation de PLD2 par

PKCα se fait par une interaction protéine-protéine (Chen and Exton, 2004).

II.1.4.4 Régulation par les tyrosines kinases

Dans plusieurs types cellulaires, la PLD est activée après stimulation des cellules par

différents facteurs de croissance comme l’EGF et le PDGF qui possèdent des récepteurs à

activité tyrosine kinase intrinsèque (Cockroft et al., 1997). D’autres voies d’activation de PLD

mettent en jeu des tyrosines kinases cytosoliques. La tyrosine kinase v-src est capable

d’activer la PLD via l’oncogène p21 ras (Jiang et al., 1994).

Page 52: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

52

II.1.4.5 Régulation par les ions calcium

L’implication du Ca2+ dans l’activation de la PLD a pu être montrée grâce à

l’utilisation d’ionophores de Ca2+, comme l’ionomycine et l’A23187, qui permettent

l’augmentation de la concentration du calcium intracellulaire, ou à celle de chélateurs de Ca2+

comme l’EGTA (chélateur du calcium extracellulaire) et le BAPTA (chélateur du calcium

intracellulaire). L’ionomycine et l’A23187 stimulent la PLD dans plusieurs types cellulaires

(Billah et al., 1989; Reihold et al., 1990; Liahi et al., 1992). Les chélateurs de calcium (EGTA

ou BAPTA) inhibent l’activation de la PLD par différents agonistes, dans plusieurs types

cellulaires (Pai et al., 1988; Kessels et al., 1991, Garcia et al., 1992). Ces études suggèrent que

la PLD peut être activée soit par la libération de Ca2+ du réticulum endoplasmique, soit par un

apport de Ca2+ extracellulaire, soit par les deux mécanismes, selon le type cellulaire

considéré. Cependant, dans certains systèmes cellulaires comme les fibroblastes stimulés par

l’EGF, le calcium n’est pas necessaire à l’activation de la PLD (Cook and wakelam, 1992).

Donc, il pourrait exister des PLD calcium dépendante ou indépendante. Cette activation de la

PLD par le calcium pourrait être directe, mais plus probablement indirecte par l’intermédiaire

d’autres protéines comme la calmoduline qui interagirait avec ARF pour activer la PLD

(Takahashi et al., 1996), les isoformes de PKC dépendantes du calcium ou les tyrosines

kinases (Earp et al., 1995; Yu et al., 1996; Ito et al., 1997).

II.1.4.6 Régulation par des facteurs inhibiteurs

Plusieurs protéines semblent avoir un rôle inhibiteur sur l’activité PLD mais leur rôle

physiologique en tant qu’inhibiteurs de PLD n’est pas encore clair. La fodrine, une protéine

du cytosquelette inhibe spécifiquement la PLD activée par ARF dans les cellules HL60

perméabilisées (Lukowski et al., 1996) en diminuant le taux de PIP et PIP2 membranaires

(Lukowski et al., 1998). La synaptojanine, une PIP2 5-phosphatase inhibe l’activité PLD en

diminuant la quantité de son cofacteur PIP2 (Chung et al., 1997). La protéine d’assemblage de

la clathrine spécifique des synapses, l’AP3, inhibe la PLD1 par interaction directe (Lee et al.,

1997a). Les amphiphysines I et II ont également été décrites comme inhibitrices des PLD

(Lee et al., 2000). La gelsoline, protéine fixatrice de l’actine, inhibe l’activation de la PLD par

la bradykinine dans les fibroblastes NIH 3T3 (Banno et al., 1999). Au contraire, Steed et al.

(1996) ont montré in vitro que la gelsoline interagit avec -et active - la PLD en absence de

nucléosides triphosphates. Les synucléines α et β inhibent de façon sélective la PLD2 (Jenco

et al., 1998). Dans le muscle cardiaque, l’α-actinine interagit avec la PLD2 en l’inhibant de

manière réversible et dépendante de ARF (Park et al., 2000). Il a également été montré que la

Page 53: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

53

β-actine régule négativement la PLD1 et la PLD2 par interaction directe (Lee et al., 2001).

Des facteurs non protéiques pourraient réguler physiologiquement la PLD. Ainsi plusieurs

études ont montré l’inhibition de l’activité PLD par les céramides (Gomez-Munoz et al.,

1995; Venable et al., 1996; Abousalham et al., 1997).

II.1.5 Localisation des PLD

II.1.5.1 Localisation tissulaire

La distribution tissulaire des différentes isoformes de PLD est très variable. Les

isoformes issues du gène PLD1 ont une expression restreinte à certains tissus comme la

moelle épinière, le cerveau, le cœur, le placenta, la rate et le pancréas. Leur expression est

particulièrement faible dans les poumons, le thymus, la trachée, les ganglions lymphatiques et

les leucocytes (Steed et al., 1998). Les transcrits de PLD1 ne sont pas détectables dans le

muscle adulte de rat (Katayama et al., 1998). La PLD1b semble majoritairement exprimée et

le niveau relatif de la PLD1a varie selon les tissus (Steed et al., 1998; Katayama et al., 1998;

Millar et al., 1999). L’expression de PLD2 semble beaucoup moins restreinte. La hPLD2 est

fortement exprimée dans le placenta, le thymus, la prostate, les ovaires, la thyroide, la trachée

et la moelle épinière. Les mPLD2 et rPLD2 ont une répartition tissulaire semblable à celle de

la hPLD2, à l’exception du thymus et de la rate où cette enzyme est beaucoup plus abondante

chez l’homme que chez les rongeurs (Colley et al., 1997b; Kodaki and Yamashita, 1997). La

PLD2a est l’isoforme la plus abondante dans la plupart des tissus examinés (cerveau,

placenta, muscle, etc.).

II.1.5.2 Localisation subcellulaire

Les études de fractionnement subcellulaire démontrent la présence d’une activité PLD

dans différents compartiments cellulaires incluant la membrane plasmique (Whatmore et al.,

1996), l’enveloppe nucléaire (Balboa and Insel, 1995), le réticulum endoplasmique, l’appareil

de Golgi et les vésicules de transport et de sécrétion (Decker et al., 1996; Czarny et al., 1999).

La distribution de l’activité PLD stimulée par RhoA et ARF a été étudiée in vitro lors de

fractionnements subcellulaires de foie de rat (Provost et al., 1996). Cette étude montre que

l’activité PLD1 la plus importante est au niveau de la membrane plasmique, bien qu’une

activité significative soit également retrouvée au niveau du noyau et de l’appareil de Golgi.

Une autre étude montre que l’activité PLD stimulée par ARF est plus forte dans les

membranes du Golgi que dans les membranes du réticulum endoplasmique ou que dans la

Page 54: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

54

membrane plasmique (Ktistakis et al., 1995). Cependant, la PLD1 surexprimée ne semble pas

colocaliser avec des marqueurs de Golgi, mais plutôt avec des marqueurs du réticulum, des

granules sécrétoires des lysosomes ou des endosomes tardifs (Colley et al., 1997a; Brown et

al., 1998, Toda et al., 1999). Par contre, Freyberg et al. (2001) ont montré que la PLD1

endogène est localisée au niveau de l’appareil de Golgi et du noyau en utilisant des anticorps

spécifiques. Ces auteurs suggèrent que la surexpression de la PLD1 peut causer une

localisation artefactuelle de l’enzyme, hors de l’appareil de Golgi, dans une classe hétérogène

de structures vésiculaires. Dans les cellules basophiles leucémiques de rat RBL-2H3

transfectées avec la PLD1b fusionnée à la GFP ou étiquetée par l’hémaglutinine (HA), la

PLD1b a été trouvée au niveau des granules de sécrétion et sous l’effet d’une activation

cellulaire, elle est transloquée à la membrane plasmique (Brown et al., 1998; Powner et al.,

2002). A l’inverse, dans les cellules chromaffines, la PLD1 est constitutivement retrouvée à la

membrane plasmique. Cependant, elle n’est active que lorsque la cellule est stimulée et que

ARF6 est transloquée des granules chromaffines vers la membrane plasmique (Caumont et

al., 1998). D’autre part, il a été montré que la PLD pouvait être activée par RhoA, ARF et

différents agonistes au niveau des noyaux dans plusieurs types cellulaires (Balboa et al., 1995;

Balboa and Insel, 1995; Baldassare et al., 1997). La PLD2 recombinante est localisée à la

membrane plasmique dans les cellules au repos et elle est redistribuée vers les compartiments

vésiculaires sous-membranaires lorsque les cellules sont stimulées (Colley et al., 1997b). La

PLD2 est associée aux microdomaines détergents-insolubles de la membrane plasmique (ou

rafts), qui sont associés ou non, selon le type cellulaire, aux caveolae (Czarny et al., 2000; Xu

et al., 2000). Une localisation de la PLD1 au niveau des microdomaines a été aussi rapportée

(Kim et al, 2000; Meacci et al., 2000; Xu et al., 2000; Diaz et al., 2002). Une activité «PLD-

like» a été détectée dans les mitochondries de cellules de mammifères. Elle hydrolyse

préférentiellement la phosphatidyléthanolamine (PE) en présence du calcium et ne catalyse

pas la réaction de transphosphatidylation (Madesh and Balasubramanian, 1997; Madesh et al.,

1997). De manière tout à fait intéressante puisqu’elle suggère un rôle physiologique de la

PLD, une association de la PLD1 avec le cytosquelette a aussi été rapportée. Dans les cellules

U937, la PLD1, activée par RhoA et ARF, peut s’associer avec une fraction insoluble à

l’octylglucoside qui correspondrait au cytosquelette puisqu’elle contient l’actine F, l’α-

actinine, la vinculine, la taline et la paxilline (Iyer and Kusner, 1999). Dans les cellules HL60,

la PLD1 est également retrouvée dans les fractions du cytosquelette insolubles au Triton X-

100 (Hodgkin et al., 1999). La PLD2 peut interagir directement avec l’α-actinine (Park et al.,

2000) et la β-actine (Lee et al., 2001). Plusieurs autres études ont montré que les PLD1 (Lee

Page 55: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

55

et al., 2001; Powner et al., 2002) et PLD2 recombinantes (O’luanaigh et al., 2002; Honda et

al., 1999) colocalisent avec l’actine F corticale près de la membrane plasmique dans les

cellules PC12, les cellules COS-7, les cellules RBL-2H3. Ces diverses observations suggèrent

une implication de la PLD dans les processus de remaniement du cytosquelette.

II.1.6 Rôles physiologiques de la PLD et de son produit, l’acide

phosphatidique

De nombreux agonistes sont capables de stimuler la PLD: hormones,

neurotransmetteurs, facteurs de croissance, cytokines, antigènes et molécules d’adhésion

cellulaire (Exton, 1999; Rizzo et al., 2002) (Tableau 2). La mise en évidence d’une activation

de la PLD, après stimulation des cellules via des récepteurs membranaires, a permis

d’impliquer la PLD dans la transduction des signaux intracellulaires et de montrer que cette

enzyme était susceptible de jouer divers rôles physiologiques. On peut citer le trafic

vésiculaire (Ktistakis et al., 1996), l’exocytose et la sécrétion (Caumont et al., 1998; Vitale et

al., 2002; Gasman et al.,2003), la réorganisation agoniste-dépendante du cytosquelette (Cross

et al., 1996; Kam and Exton, 2001), la différenciation, la prolifération et la survie cellulaires

(Boarder MR, 1994; McDermott et al, 2004). L’action de la PLD sur son substrat majeur la

PC, aboutit à la production de PA et de choline. La choline est une molécule largement

répandue dans divers tissus, mais n’a pas, par elle-même, un rôle de second messager. Le PA

est considéré comme un second messager intracellulaire et peut être métabolisé en deux autres

seconds messagers: le DAG sous l’action d’une phosphatidate-phosphohydrolase (Jamal et

al., 1991) et le LPA sous l’action d’une PLA2 (Thomson and Clark, 1995). Le PA peut aussi

provenir de la phosphorylation du DAG par une DAG-kinase. Grâce à la propriété de

transphosphatidylation de la PLD, l’emploi d'un alcool primaire pour bloquer une réponse

physiologique donnée permet de montrer sans ambiguïté l’implication de la PLD, le

phosphatidylalcool formé reflétant spécifiquement une activité PLD (Cook and Wakelam,

1992). L’utilisation d’un alcool primaire peut toutefois présenter un inconvénient: l’alcool

pourrait par lui-même avoir un effet sur les processus de transduction cellulaire. Ainsi

l’utilisation en parallèle d’un alcool secondaire, qui n’est pas un substrat de la PLD, est

nécessaire comme contrôle pour évaluer d’éventuels effets aspécifiques.

Page 56: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

56

Tableau 2 Activation de la PLD dans divers types cellulaires par différents agonistes (Rizzo et al., 2002).

Agonists Cell types

Agents acting via tyrosine kinase

receptors

EGF

b-FGF

Erythropoietin

HGF

Insulin

G-CSF, GM-CSF

NGF

PDGF

Prolactin

Agonists that act via G-protein-

linked receptors

Acetylcholine, carbachol

Angiotensin II

ATP, adenosine

Bradykinin

Endothelin

Epinephrine, norepinephrine

Glutamate

IL-8, f MLP

LPA

Vasopressin

Miscellaneous agents

Ca2+ ionophores

Phorbol esters

Fibroblasts (Rat 1, Rat 2, Swiss 3T3, 3Y1), epidermal (A431, HEL-37)

Fibroblasts (Rat-1, NIH 3T3), endothelium, osteoblast primary cultures, L6 myoblasts,

pancreatic acinar cells

Hematopoietic stem cell lines

Hepatocyte primary cultures

Fibroblasts (HIRcB), primary adipocytes, myoblasts and myotubes (L6)

Neutrophils

Pheochromocytoma (PC12)

Fibroblasts (Rat 1, Rat 6, 3T3-L1 pre-adipocytes, HIRcB, Swiss 3T3, 3T3-F44A, BHK),

vascular smooth muscle cells (A10)

Astrocytes

Secretory cells (submandibular acinar cells, adrenal glomerulosa cells), neuroblastoma

(SH-SY5Y), pheochromocytoma (PC-12), astrocytes, cardiac myocytes

Vascular smooth muscle cells (A10, primary cultures), hepatocyte primary cultures,

adrenal glomerulosa cells, cardiac fibroblasts, renal mesangial cells

Ovarian carcinoma (EFO-21, EFO-27), macrophages (primary), astrocytes,

pheochromocytoma (PC12), hepatocytes (primary), endothelial cells (primary culture)

Pheochromocytoma (PC12), vascular smooth muscle cells, C2C12 myotubes, fibroblasts

(NIH 3T3), adenocarcinoma (A549), primary keratinocytes

Osteoblasts (MC3T3-E1,UMR-106), vascular smooth muscle cells (A-10, primary

cultures), myometrium, astrocytes, fibroblasts (primary cultures, Rat1)

Kidney (MDCK), primary hepatocytes, neurons, astroglia, primary vascular smooth

muscle cells, ischemic heart

Astrocytes, hippocampus, cerebral cortex

Neutrophils, monocytes

Fibroblasts (Rat 1, NIH 3T3, embryonic primary cultures), primary astrocytes, PC3

prostate cancer cells

Primary hepatocyes, Leydig cells, vascular smooth muscle (primary cultures, A7r5, A10),

myoblasts (L6)

Cerebral cortex, hippocampus, neutrophils, hepatocytes

(primary), kidney (MDCK)

Fibroblasts (primary, NIH 3T3, Swiss 3T3, Rat 1, Rat 2, HIRcB), monocytes,

lymphocytes, neutrophils, vascular smooth muscle (primary, A10, A7r5), epidermal

(A431), kidney (MDCK),

pheochromocytoma (PC12), cerebral cortex, myoblasts (L6), pancreatic islets,

myometrium, osteoblasts

Page 57: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

57

II.1.6.1 Rôle de la PLD dans le trafic vésiculaire, l’exocytose et la sécrétion

II.1.6.1.1 La PLD est impliquée dans la formation ARF-dépendante des

vésicules coatées

Les diverses formes d'ARF sont impliquées dans de nombreuses voies de transport

vésiculaire, couvrant virtuellement toutes les routes cellulaires depuis la membrane nucléaire

jusqu’à la membrane plasmique (Vidal and Stah1, 1993; Boman et al., 1995; Lenhard et al.,

1994). ARF contrôle l'assemblage de divers types de complexes protéiques, ou manteaux,

impliqués dans la formation des vésicules de transport, incluant notamment, au niveau du

Golgi, le complexe COPI qui comprend six polypeptides collectivement nommés

"coatomère". L’identification d’ARF comme un activateur de la PLD (Brown et al., 1993) a

attiré l’attention de la communauté scientifique sur le rôle que peut jouer cette enzyme

comme médiateur du trafic vésiculaire, en liaison avec le recrutement des complexes

protéiques constituant le manteau des vésicules (Singer et al., 1997). L’activité PLD stimulée

par ARF a été retrouvée dans les membranes du Golgi des cellules CHO (Ktistakis et al.,

1995). L' inhibition de la production du PA par la PLD par adjonction d'éthanol empêche le

recrutement des protéines COPI et la formation de vésicules coatées à partir de ces

membranes (Ktistakis et al., 1996). Le transport de glycoprotéines virales du réticulum

endoplasmique vers le Golgi est aussi inhibé par l'éthanol (Bi et al., 1997). Les effets de

l’éthanol peuvent être réversés par l'apport de PA exogène. De plus, l’ajout de PLD

bactérienne aux membranes du Golgi induit la fixation du coatomère et la formation des

vésicules en absence d’ARF, et des vésicules artificielles contenant du PA lient mieux les

protéines du manteau que des vésicules contrôles (Ktistakis et al., 1996). Ces diverses

observations ont suggéré que l'activation de la PLD est un mécanisme important par lequel

ARF intervient dans le recrutement des protéines du manteau et la formation des vésicules

coatées, et donc dans le transport vésiculaire.

II.1.6.1.2 PLD et sécrétion

La PLD semble également impliquée dans la formation des vésicules sécrétoires issues du

réseau trans-golgien (TGN). Ainsi, La hPLD1 purifiée provoque le bourgeonnement des

vésicules issues du TGN alors qu’un mutant inactif de la PLD ou que l’ajout d’un alcool

primaire l’empêchent (Chen et al., 1997). L’inhibition de la synthèse du PA en présence d’un

alcool primaire bloque la sécrétion dans divers types cellulaires stimulés par des agonistes,

dont les mastocytes, les plaquettes et les cellules HL60 différenciées (Benistant and Rubin,

Page 58: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

58

1990; Stutchfield and Cockcroft, 1993; Way et al., 2000). De plus, l’addition de PA exogène

ou la génération de ce lipide par une PLD exogène d’origine bactérienne, stimulent les

fonctions sécrétoires dans différents types cellulaires, comme la sécrétion d’aldostérone par

les cellules glomérulaires surrénales (Bollag et al., 1990) et la sécrétion d’insuline par les îlots

du pancréas (Metz and Dunlop, 1990). Dans les cellules épithéliales bronchiques humaines, la

PLD1 et la PLD2 participent à la sécrétion de l’IL-8 induite par la sphingosine-1-phosphate

(Wang et al., 2002). Dans les cellules chromaffines, la PLD1 est constitutivement retrouvée à

la membrane plasmique. Cependant, elle n’est active que lorsque la cellule est stimulée, et

que ARF6 est transloqué des granules de sécrétion vers la membrane plasmique. Dans ces

cellules, l’activation de la PLD via le calcium est corrélée avec la sécrétion, qui est atténuée

par l’inhibition de la production du PA par la PLD (Caumont et al., 1998). Dans une autre

étude, les auteurs montrent que c’est la PLD1b activée par ARF6 qui est impliquée dans la

sécrétion des cellules neuroendocrines (Vitale et al., 2001). Le facteur d’échange ARNO

semble aussi impliqué dans la régulation PLD-dépendante de la sécrétion. Ce facteur, qui

possède à son extrémité N-terminale un domaine PH responsable de son association PIP2-

dépendante à la membrane, active ARF en favorisant l'échange GDP/GTP (Paris et al., 1997).

Des anticorps anti-ARNO empêchent la sécrétion médiée par l’activation ARF-dépendante de

la PLD dans les cellules chromaffines (Caumont et al., 2000). ARNO est également

nécessaire à l’activation de la PLD1 par ARF6 au niveau de la membrane plasmique et à

l'induction de l’exocytose dans les cellules neuroendocrines PC12 (Vitale et al., 2002). Un

modèle résumant la régulation de l’exocytose par la PLD1 activée par ARF6 a été proposé par

Gasman et al. (2003) (Figure 8).

II.1.6.1.3 Rôle fusogène du PA

Dans les neurones, la PLD1 est spécifiquement impliquée dans le contrôle du statut

fusogénique des sites présynaptiques d’exocytose de l’acétylcholine (Humeau et al., 2001).

De plus, dans les mastocytes, la PLD2 et peut-être la PLD1, sont impliquées dans la fusion

calcium dépendante des granules sécrétoires avec la membrane plasmique (Choi et al., 2002).

Dans un certain nombre de réactions de fusion, incluant la fusion virale et l’exocytose, la

fusion membranaire pourrait être, de manière réversible, inhibée par des lipides qui induisent

des courbures positives de la membrane et stimulée par des lipides qui provoquent des

courbures négatives. Le PA est un phospholipide anionique, induisant une instabilité de la

bicouche lipidique, et possédant des propriétés fusogènes. Sa molécule ayant une forme en

cône, il pourrait être responsable d’une courbure négative importante de la membrane,

Page 59: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

59

provoquant une hémifusion et la formation du pore de fusion exocytotique (Gasman et al.,

2003). L'observation que la formation de PA par un mécanisme indépendant de la PLD,

catalysée par l'endophiline, une lyso-PA acyltransférase, a un rôle central dans l'endocytose

des vésicules synaptiques, apporte confirmation à l'hypothèse du rôle fusogène du PA

(Schmidt et al., 1999a).

Figure 8 : Modèle hypothétique résumant le rôle de la PLD1 ARF6-dépendante dans l’exocytose.

Dans les cellules chromaffines et PC12, ARF6 est associé à la membrane des granules de sécrétion

sous sa forme inactive liée au GDP.La PLD1 est constitutivement présente dans la membrane

plasmique. Cependant, elle n’est active que lorsque la cellule est stimulée, et que ARF6 est transloqué,

suite à une augmentation du taux de calcium cytosolique, des granules de sécrétion vers la membrane

plasmique où il interagit avec son facteur d’échange « ARNO ». La PLD1 activée par ARF6 produit

localement du PA qui pourrait être responsable d’une courbure négative importante de la membrane,

provoquant une hémifusion et la formation du pore de fusion exocytotique. Les cellules PC12

surexprimant ARF6, ARNO et PLD1 stimulées ou pas (resting), sont représentées (Gasman et al.,

2003).

Page 60: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

60

II.1.6.2 Rôle de la PLD dans le réarrangement du cytosquelette

II.1.6.1.3 La PLD et le cytosquelette d’actine

Une des fonctions proposées pour les PLD de mammifères est de médier le

remaniement du cytosquelette induit par différents agonistes. Plusieurs équipes ont pu établir

un lien entre l’acide phosphatidique et la polymérisation de l’actine, dans différents types

cellulaires dont les fibroblastes Rat-1, Swiss 3T3 et IIC9 (Ridley et al., 1992; Ven der Bend,

1992; Ha and Exton, 1993; Ha et al., 1994), les cellules endothéliales de l’aorte de porc

(PAEC) (Cross et al., 1996), les neutrophiles (Siddiqui and English, 1997) et les monocytes

(Zhou et al., 1995). De plus, dans ces différentes études, les effets observés apparaissent très

spécifiques du PA. Ha et Exton (1993) ont en effet montré que la stimulation des fibroblastes

IIC9 par l’α-thrombine provoque une réorganisation du cytosquelette d’actine avec apparition

de fibres de stress et allongement des cellules. Sur ces mêmes cellules, l’ajout de PA exogène

ou d’une PLD bactérienne, produit les mêmes effets. Les auteurs ont également constaté une

hausse de DAG intracellulaire, mais ni le traitement des cellules par de la PLC exogène, ni

par le PMA, qui induisent pourtant une translocation de la PKC, n’ont d’effet sur la

polymérisation de l’actine. De plus, un inhibiteur de PKC, H7, ne bloque pas la

polymérisation de l’actine induite par l’α-thrombine. Un rôle éventuel du DAG ou de

l’activation d’une PKC a donc été exclu. Dans une seconde étude, Ha et al. (1994) ont

examiné l’hypothèse d’une désacylation par une PLA2 du PA exogène en LPA, ce dernier

composé pouvant être responsable de l’induction de la polymérisation de l’actine. Ils ont

constaté que le LPA induit une augmentation dose-dépendante de la quantité des filaments

d’actine intracellulaire, avec une efficacité légèrement supérieure à celle obtenue avec le PA.

Le LPA induit une augmentation de la polymérisation de l’actine rapide et soutenue, mais il

provoque également une hausse très rapide des taux de PA endogènes, par une activation de la

PLD. Comme la toxine pertussique inhibe cette production de PA, les auteurs concluent que

le LPA active la PLD via une protéine G sensible à la toxine, et que le PA formé est

responsable de l’induction de la polymérisation de l’actine observée. Il a été aussi montré que

la sphingosine-1-phosphate (S1P) induit la formation des fibres de stress dans les cellules

épithéliales humaines et que la PLD serait un des composants de la voie de signalisation en

aval du récepteur de la S1P (Porcelli et al., 2002). Une étude d’Amsterdam et al. (1994)

fournit un exemple physiologique de régulation exercée par le PA sur le remaniement du

cytosquelette, qui concerne le processus de différenciation des cellules de la granulosa. La

GnRH exerce un effet anti-différenciateur sur ces cellules, alors que la FSH induit leur

Page 61: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

61

différenciation, qui se caractérise par la rupture de l’association des fibres d’actine permettant

un arrondissement des cellules. De façon opposée, la GnRH provoque une activation de la

PLD, une accumulation de PA, et une polymérisation de l’actine empêchant la rupture des

fibres, ce qui explique son effet inhibiteur. Les différents agents qui induisent des hausses de

PA endogène, le propranolol ou le TPA, reproduisent cet effet inhibiteur de la différenciation.

II.1.6.1.4 Implication des petites protéines G dans les effets de PLD sur le

cytosquelette

Il est bien établi que les protéines G de la famille Rho sont responsables de la

formation des fibres de stress après activation des fibroblastes 3T3 (Ridley, 1999). Dans les

PAEC, le LPA induit la formation des fibres de stress de manière PLD-dépendante, mimée

par l’addition de PA exogène (Cross et al., 1996). Les auteurs suggèrent que la protéine Rho

serait impliquée dans la voie de signalisation, en aval du récepteur du LPA, car l’inhibition de

Rho par l’exoenzyme C3 de C. botulinum empêche la formation des fibres de stress, qu’elle

soit induite par le LPA ou par le PA (Cross et al., 1996). La transfection stable de fibroblastes

Rat-2 par une forme dominante négative de PLD1 inhibe la formation des fibres de stress

induite par le LPA (Kam and Exton, 2001). Le LPA active aussi Rho et la Rho-Kinase, mais

ces réponses ne sont pas affectées par la baisse d’activité PLD1. Ces résultats suggèrent que la

PLD agit sur la formation des fibres de stress en aval de Rho, mais indépendamment de la

Rho-Kinase. D’autre part, dans les cellules basophiles leucémiques de rat RBL-2H3

transfectées avec la PLD1b étiquetée par l’hémaglutinine (HA), la PLD1b a été trouvée au

niveau des granules de sécrétion. Sous l’effet d’une activation cellulaire par l’antigène, elle

est transloquée à la membrane plasmique où elle colocalise avec ses activateurs Rac1, ARF6,

et PKCα dans des structures membranaires riches en actine, les lamellipodes et les «ruffles»

(Powner et al., 2002). Au contraire, O’Luanaigh et al. (2002) ont observé une localisation de

la GFP-PLD2, mais pas de la GFP-PLD1, au niveau des «ruffles» membranaires après

stimulation des cellules par l’antigène. La PLD2 semble ainsi plus impliquée dans le

réarrangement de l’actine corticale. Par exemple, la surexpression de PLD2 provoque

l’apparition de filopodes dans les cellules fibroblastiques (Colley et al., 1997b).

II.1.6.2 Rôle de la PLD dans la différenciation cellulaire

La différenciation de divers types cellulaires est accompagnée d’une augmentation de

l’activité et/ou de l’expression des PLD suggérant l’implication de cette enzyme dans le

processus de différenciation. Par exemple, dans les cellules myéloïdes humaines de la lignée

Page 62: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

62

HL60, l’activité de la PLD stimulée par le PMA augmente au cours de la différenciation en

granulocytes induite par l’acide rétinoïque ou le dibutyryl-AMPc (Ohguchi et al., 1997;

Nakashima et al., 1998; El Marjou et al., 2000). L’activation de la PLD par le GTPγS est

également plus importante, ce qui suggère que les facteurs activateurs de la PLD ou que la

PLD elle-même puissent être régulés à la hausse durant la différenciation. Effectivement, au

cours de la différenciation de ces cellules, l’expression des isoformes α et β des PKC est

augmentée (Nakashima et al., 1996). De même, les protéines G activatrices de la PLD, ARF,

Cdc42, et RhoA, sont plus exprimées dans les cellules différenciées (Ohguchi et al., 1997).

L’augmentation de l’activité PLD observée au cours du processus de différenciation serait

donc due à l’augmentation du niveau d’expression de ses régulateurs. Cependant, une

augmentation de l’expression des ARN messagers des PLD1 et PLD2 a également été

observée dans les cellules différenciées (Nakashima et al., 1998, El Marjou et al., 2000). Des

résultats similaires ont été obtenus dans les cellules HT-29, les kératinocytes, les cellules

gliales C6 et les cellules PC12: la différenciation est accompagnée d’une augmentation de

l’activité et/ou de l’expression des PLD (Madesh et al., 1998; Hayakawa et al., 1999; Jung et

al., 1999; Nakashima and Nozawa, 1999; Min et al., 2001). De même, l’hormone neuro-

hypophysaire arg8-vasopressine (AVP), un puissant inducteur de la différenciation

myogénique (Nervi et al., 1995), déclenche précocement l’activation des voies de la PIP2-

PLC et de la PLD dans les myoblastes. De manière intéressante, la réponse myogénique peut

intervenir pour des concentrations nanomolaires d’AVP, auxquelles seule la PLD, et non la

PLC, est activée, ce qui suggère l’implication prépondérante de la voie PLD, et donc de son

produit le PA, dans ce processus (Naro et al., 1997).

II.1.6.3 Cibles intracellulaires de l’acide phosphatidique

Diverses cibles intracellulaires du PA ont été identifiées, ce qui permet de l’impliquer

dans un grand nombre de fonctions cellulaires. On peut citer divers constituants de la cascade

des MAPKinases, notamment Raf-1 (Ghosh et al., 1996; Andresen et al., 2002), des protéines

impliquées dans le trafic vésiculaire comme le « coatomère », les protéines ARF, le facteur

NSF (N-éthylmaléimide sensitive factor) et la kinésine (Manifava et al., 2001; Ktistakis et al.,

2003), l’AMPc-phosphodiestérase PDE4D3 (Grange et al., 2000), la protéine mTOR

(mammalian target of rapamycin) (Fang et al., 2001), la tyrosine phosphatase 1 (SHP1)

(Frank et al., 1999) et la PI(4)P 5-kinase (Moritz et al., 1992; Jenkins et al., 1994; Jones et al.,

2000; Ktistakis et al., 2003).

Page 63: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

63

II.1.6.3.1 Raf-1 kinase

Raf-1 est une sérine/thréonine kinase impliquée dans l’activation de la cascade des

MAP kinases lors de l’activation mitogénique. La cascade des MAP kinases (MAPK) est une

voie de signalisation de première importance dans la régulation de la mitose induite par des

signaux extracellulaires. L'un des points cruciaux de cette régulation est le recrutement de la

protéine Raf-1 au niveau de la membrane où elle est activée par les petites protéines G Ras ou

d'autres kinases. Le recrutement de Raf-1 au niveau de la membrane a été pendant longtemps

décrit comme la fonction principale de Ras. Mais des modifications de Raf-1 augmentant son

association à la membrane n'induisent qu'une faible activation indépendante de Ras (Leevers

et al., 1994; Stokoe et al, 1994), et une activation directe de Raf-1 par Ras n'a pas pu être

démontrée initialement in vitro (Hall, 1994). D'autres travaux plus récents ont montré que

lorsque la protéine Raf-1 était rendue constitutivement membranaire par une farnésylation,

son activation par Ras-GTP était accrue et que cette activation était directe (Mineo et al.,

1997). Toutefois la liaison de Raf-1 à la membrane n'est pas suffisante pour son activation

complète.

Récemment, il a été montré que Raf-1 pouvait interagir directement avec les lipides

membranaires et en particulier le PA (Ghosh et al., 1996). L’interaction se fait au niveau d’un

site distinct de celui de la PS antérieurement caractérisé. En effet, c’est dans une région riche

en cystéines au niveau de l’extrémité N-terminale de Raf-1 que se fixe la PS (Ghosh et al.,

1994), alors que le PA se lie avec une forte affinité dans une région d’environ 35 acides

aminés de la partie C-terminale de la kinase. Des travaux de délétion d'une partie de la

séquence du côté C-terminal de la protéine Raf-1 ont montré que le site d'interaction avec le

PA se trouve entre les acides aminés 390 et 426 (Ghosh et al., 1996) (Figure 9). De plus,

l'inhibition de la production de PA par l’éthanol diminue fortement la translocation de Raf-1

aux membranes induite par le PMA dans les cellules MDCK. La fixation de Raf-1 sur le PA

membranaire provoquerait donc son recrutement à la membrane plasmique, et permettrait

ainsi son activation par des facteurs membranaires (dont Ras) (Ghosh et al., 1996). Ce résultat

a par la suite été confirmé et approfondi par le travail de Rizzo et al. (1999). Ces auteurs ont

pu déduire que l’insuline stimule la production de PA dans les fibroblastes via une PLD2 de

manière ARF-dépendante, et que le PA produit est nécessaire à la translocation de Raf-1 aux

membranes. Le groupe de Rizzo a notamment montré qu'après liaison de Raf-1 au PA, Ras et

Raf-1 transitoirement associées à la membrane plasmique sont transloquées conjointement

Page 64: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

64

avec le récepteur de l’insuline dans le compartiment endosomal riche en cholestérol et PA,

contenant MEK et MAPK, et que la régulation de la cascade se fait dans le compartiment

endosomal. De plus, lorsque Raf-1 est mutée sur son domaine de liaison au PA, elle agit

comme un dominant négatif et inhibe la voie des MAPK dans les cellules HIRcB (Rizzo et

al., 2000). Ces données suggèrent donc bien un rôle crucial du PA dans le recrutement de Raf-

1 et la régulation de la cascade des MAP Kinases.

Figure 9 : Représentation schématique de Raf1 contenant le domaine de fixation de PA (Rizzo et al., 2002).

II.1.6.3.2 PI(4)P 5-kinase

Dans les membranes des cellules HL-60, où l’activation de la PLD est ARF-

dépendante, la synthèse de PIP2 est augmentée après activation de la PLD par ARF et

formation de PA (Fensome et al., 1996). Par ailleurs, Arneson et al. (1999) ont montré que

l’inhibition de la production de PA par les alcools primaires bloque la synthèse de PIP2 dans

les membranes lysosomales, suggérant que la production de PIP2 peut être contrôlée par le

PA. La Phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase (PI(4)P 5-kinase) responsable de la

synthèse du PIP2 a été décrite comme une cible du PA (Jones et al., 2000). Moritz et al.

(1992) ont montré que la PI(4)P 5-kinase purifiée à partir de membranes de cerveau de bœuf

est spécifiquement stimulée par le PA. Cet effet activateur est obtenu aussi bien avec du PA

exogène qu’avec du PA endogène produit de la PLD. Une autre équipe a montré que le PA

peut stimuler la PI(4)P 5-kinase (PIP kinase de type I), mais pas la PI(5)P 4-kinase (PIP

kinase de type II) (Jenkins et al., 1994). La PI(4)P 5-kinase peut être stimulée aussi par ARF,

Page 65: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

65

notamment ARF6 (Honda et al., 1999; Jones et al., 1999). Des expériences de

chromatographie d’affinité réalisées à l'aide de PA greffé sur une résine (Lim et al., 2002), ont

permis de mettre en évidence plusieurs protéines cibles du PA dans le cytosol préparé à partir

de cerveau de mouton. Une interaction directe et spécifique du PA avec la PI(4)P 5-kinase

mais pas avec la PI(5)P 4-kinase a ainsi pu être démontrée (Ktistakis et al., 2003).

L'augmentation de la concentration intracellulaire de PIP2, qui résulte de l'activation de la

PI(4)P 5-kinase par le PA, augmente à son tour l'activité PLD, générant ainsi une boucle de

rétro-contrôle positif. Ce dispositif d’amplification permettant une accumulation localisée

massive de PA et PIP2, pourrait jouer un rôle physiologique important. Ainsi, par exemple, le

PA et le PIP2, accumulés localement au niveau de l’actine corticale pourraient être

responsables de la formation des «ruffles» induits par la stimulation antigénique des cellules

RBL (O’Luanaigh et al., 2002).

Page 66: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

66

II.2 La myogénèse du muscle squelettique

Le développement du muscle squelettique lors de l’embryogénèse est un processus

complexe qui consiste en une séquence d’événements cellulaires incluant la détermination des

cellules souches du mésoderme somitique ou paraxial en cellules de la lignée musculaire

squelettique, la prolifération des myoblastes précurseurs, leur sortie du cycle cellulaire et leur

fusion en myotubes polynucléés exprimant des protéines spécifiques du muscle squelettique

différencié, notamment le système contractile. La myogénèse intervient aussi dans le muscle

adulte, lors de la régénération musculaire faisant suite à une lésion traumatique ou

pathologique, à partir d’un pool de cellules précurseurs appelées cellules satellites.

II.2.1 La myogénèse durant le développement embryonnaire

La musculature squelettique dérive du mésoderme somitique ou paraxial de l’embryon

(Chevalier et al., 1977; Currie and Ingham, 1998). Ainsi, le long de chaque côté du tube

neural en formation, des structures sphériques appelées somites s’organisent régulièrement de

l’avant vers l’arrière à partir du mésoderme paraxial (Meier et al., 1979). Les somites sont des

organes embryonnaires transitoires. En effet, peu de temps après leur formation, les cellules

de chaque somite se compartimentent en deux parties: ventrale et dorsale. La partie ventrale

donne de son côté le sclérotome, qui donne naissance aux vertèbres et aux côtes (Kalcheim et

al., 1999). La partie dorsale qui reste épithéliale est dénommée dermamyotome, du fait qu’elle

abrite les précurseurs de la lignée dermique et de la lignée myogénique. Cette partie des

somites semble être composée de précurseurs de deux lignées myogéniques (Ordhal and Le

Douarin, 1992): les somites de la partie dorsale sont divisés en 2 moitiés, latérale et médiane,

qui contiennent des cellules précurseurs qui évoluent selon leur position dans cet épithélium.

Dans la partie médiane, les cellules restent dans le territoire somitique et donnent le myotome

qui sera à l’origine de la musculature axiale. Dans la moitié latérale, les précurseurs sont

destinés à quitter le territoire des somites et migrent vers leur localisation finale où ils forment

la musculature des membres et de l’abdomen (Christ and Ordhal, 1995; Brand-Saberi and

Christ, 1999) (Figure 10). Ces cellules expriment le gène Pax3 avant, pendant et après cette

migration, et l’expression de ce gène semble nécessaire à cette migration (Christ and Ordhal,

1995). Pour donner naissance au tissu musculaire adulte, les cellules des somites subissent un

Page 67: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

67

processus de détermination qui fait évoluer ces cellules précurseurs en cellules fusiformes,

dénommées myoblastes présomptifs ou prémyoblastes.

Figure 10 : Représentation schématique de coupes transversales.d’un embryon de poulet.

Dans un premier temps, les cellules mésodermiques se condensent près du complexe "tube

neural/notochorde" afin de former les somites. Ensuite, les somites donnent naissance à deux types de

tissus différents : le dermamyotome et le sclérotome. Enfin, trois territoires différents se différencient :

les précurseurs des cellules destinées à la musculature des membres et de l’abdomen (cellules

migratrices), les précurseurs des cellules destinées à la musculature axiale (myotome), et le

sclérotome donnant naissance aux côtes et aux vertèbres.

Ces cellules migrent vers leur localisation finale où elles forment, après la différenciation, les

fibres musculaires adultes (Olson, 1992). Pour cela, ces cellules localisées prolifèrent,

expriment différents gènes régulateurs spécifiques du muscle et deviennent des myoblastes

(Sabourin and Rudnicki, 2000). Les myoblastes subissent ainsi plusieurs cycles de division

avant de sortir du cycle et de s’engager dans la différenciation myogénique: ils fusionnent

alors, donnant naissance à des myotubes polynucléés (Cossu et al., 1996), exprimant diverses

protéines spécifiques du muscle comme l’actine-α sarcomérique, les chaînes lourdes et légères

de la myosine sarcomérique, la tropomyosine, la troponine, la créatine kinase musculaire et

les récepteurs nicotiniques de l’acétylcholine.

Page 68: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

68

II.2.2 La myogénèse in vitro: les lignées cellulaires myogéniques

Au cours des années, il a été développé divers systèmes permettant d’observer la

myogénèse in vitro: soit des cultures primaires de cellules musculaires squelettiques

provenant essentiellement de muscles pectoraux d’embryon de poulet et de caille (de 10-14

jours) et de muscles des membres postérieurs de rat et souris nouveau-nés (jusqu’à 3 jours),

soit des cultures de lignées cellulaires myogéniques stabilisées. Ces systèmes de culture

cellulaire reproduisent diverses phases de la myogénèse, parmi lesquelles la détermination, la

prolifération, la différenciation, et constituent donc des modèles optimaux d’étude de la

myogénèse. En particulier, il a été possible de définir les conditions optimales pour induire

des myoblastes non encore spécialisés du point de vue morphologique, à se différencier en

myotubes multinucléés capables de se contracter sur la boîte de culture, et ainsi d’ analyser les

modifications qui interviennent dans la différenciation myogénique. Dans les années 60, un

progrès important a été accompli dans l’étude de la différenciation cellulaire in vitro, par la

réalisation de cultures clonales de cellules embryonnaires non spécialisées. Le développement

des cultures clonales a rendu possible l’étude des conditions déterminant soit la prolifération,

soit la différenciation des cellules myogéniques. L’identification des facteurs qui jouent un

rôle important pour ces fonctions a permis d’accroître les connaissances du processus

myogénique in vitro et in vivo. L’étude des mécanismes qui régulent le processus myogénique

chez les mammifères est effectuée dans une large mesure sur des lignées cellulaires

immortalisées, essentiellement d’origine murine, les plus utilisées étant les lignées C2C12 et

L6.

La lignée C2C12 est un sub-clone qui dérive de la lignée originelle C2 isolée par culture

primaire de myoblastes obtenus de muscles de la patte postérieure de souris (Yaffe, 1968).

Parmi les cellules adhérentes obtenues, le clone C2C12 spontanément immortalisé a été

selectionné. La lignée C2C12 est caractérisée par sa capacité à se différencier rapidement et à

former de grands myotubes contractiles sous l’effet d’une diminution du pourcentage du

serum dans le milieu de culture.

La lignée L6 dérive de myoblastes obtenus de la patte postérieure de rat nouveau-né,

stabilisés par traitement avec un carcinogène chimique (Yaffe, 1977). Lors des premiers

passages, l'adhésion des myoblastes transformés nécessitait un prétraitement du support par le

collagène, et par la suite les sous-lignées obtenues par clonage ont perdu cette exigence. Le

sous clonage et la caractérisation de la lignée L6 ont été rapportés par Teti et al. (1993). Les

cellules du clone C5 (L6C5) constituent un bon modèle pour l’étude de la myogénèse

Page 69: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

69

puisqu’elles ont une forte capacité de différenciation dans des milieux de cultures contenant

1% de serum, ou des milieux dépourvus de serum additionnés de différents inducteurs

myogéniques (Nervi et al., 1995; Minotti et al., 1998). Ces cellules fusionnent en formant des

fibres musculaires striées, même si lors de la multiplication des passages en culture la

tendance à la fusion diminue et rend nécessaire le reclonage périodique de la lignée.

II.2.3 Facteurs régulateurs de la myogénèse

II.2.3.1 Les protéines à domaine bHLH

Des études portant sur la transcription dans le muscle squelettique ont abouti à

l’isolement et la caractérisation fonctionnelle du facteur MyoD (Davis et al., 1987). D’autres

travaux ont ensuite permis le clonage de plusieurs facteurs homologues: Myf5 (Braun et al.,

1989), myogénine (Edmondson and Olson, 1989; Wright et al., 1989) et MRF4 (Rhodes and

Konieczny, 1989). Ces quatre facteurs régulateurs de la myogénèse (MRFs), de la famille

MyoD, sont des facteurs de transcription spécifiques du muscle squelettique. Ils appartiennent

à la superfamille des facteurs de transcription de type basique hélice-boucle-hélice (bHLH).

La région basique est responsable de leur fixation à l’ADN. Cette fixation se produit via la

séquence consensus (CANNTG), appelée boîte E (E-box), qui est présente dans les

promoteurs de plusieurs gènes spécifiques du muscle squelettique (Lassar et al., 1989; Olson

and Klein, 1994; Sabourin and Rudnicki, 2000). Le domaine HLH leur permet de

s’hétérodimériser avec d’autres facteurs ubiquitaires à domaine HLH (Protéines E12, E47 ou

Id) lesquelles favorisent (E12 et E47) ou inhibent (Id) la liaison des facteurs myogéniques à

l’ADN (Murre et al., 1989; Blackwell and Weintraub; 1990). Les protéines de la famille Id ne

possèdent pas de région basique, ce qui rend le complexe MRF/Id inactif et incapable de se

lier à la boîte E. Les MRFs ont la capacité de convertir des cellules non musculaires en

cellules musculaires squelettiques soit in vitro (Choi et al., 1990; Weintraub et al., 1991) soit

in vivo (Miner et al, 1992, Santerre et al., 1993), ce qui suggère qu’ils jouent un rôle

important dans la détermination et la différenciation des précurseurs myogéniques. Plusieurs

études effectuées sur la souris suggèrent que la détermination et/ou la survie des précurseurs

myogéniques requièrent soit MyoD, soit Myf5. L’inactivation du gène MyoD, réalisée par

Rudnicki et al. (1992), n’a tout d’abord pas apporté d’indices précis sur la fonction de la

protéine MyoD. En effet, la souris MyoD-/- présente une myogénèse embryonnaire normale.

L’animal adulte est viable et fertile, et, à l’exception du fort taux d’ARNm de Myf5 post-

natal, présente un phénotype musculaire apparemment normal. De même, la souris Myf5-/-

Page 70: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

70

semble avoir un phénotype musculaire normal mais elle subit une mortalité périnatale suite à

une sévère défaillance du développement des côtes (Braun et al., 1992). Cependant, les souris

«doubles KO» (knock out) pour MyoD et Myf5 montrent une absence complète des

myoblastes et des myofibres. Les fonctions de MyoD et Myf5 semblent donc redondantes

(Rudnicki et al., 1993) et chacun des gènes possède des propriétés d’autoactivation

importantes (Weintraub, 1993). Les souris inactivées pour la myogénine meurent à la

naissance à cause d’une sévère déficience en fibres musculaires différenciées, bien qu’elles

présentent un nombre normal de myoblastes déterminés (Hasty et al., 1993; Nabeshima et al.,

1993). MRF4 est le facteur myogénique majoritairement exprimé dans la fibre mature adulte.

Il est de ce fait impliqué dans la différenciation terminale (Zhang et al., 1995). Tous ces

résultats suggèrent un modèle selon lequel MyoD et Myf5 seraient responsables de la

détermination des précurseurs myogéniques, alors que la myogénine et MRF4 seraient

importants pour la différenciation et le maintien du phénotype différencié (Rudnicki and

Jaenish, 1995) (Figure 11).

Figure 11 : Définition des rôles des facteurs de transcription MRF durant l’embryogénèse. (Sabourin et al., 2000).

Des expériences de mutation chez la souris (Rudnicki et al., 1993) suggèrent que MyoD et

Myf5 sont à partir d’un certain seuil de concentration, les signaux primitifs permettant de

surmonter les messages répresseurs et d’activer en aval le gène de la myogénine. Ce facteur

Myf5 MyoD

myogenin MRF4

Page 71: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

71

de transcription caractéristique de la différenciation des cellules myogéniques stimule à son

tour l’expression des gènes spécifiques du muscle squelettique (Weintraub, 1993; Lassar et

al., 1994). Les inter-régulations entre les MRFs ont été étudiées au cours du développement

embryonnaire et bien que les conclusions restent floues, il est toutefois possible d’établir un

schéma global (Figure 12). Les relations entre MyoD et Myf5 présentent un intérêt particulier.

En effet, en absence de Myf5, au cours de l’embryogenèse, le niveau d ’expression de MyoD

est plus faible que la normale (Braun et al., 1992). Au contraire, les souris MyoD-/- présentent

une augmentation du niveau d’expression de Myf5. Ces observations suggèrent que MyoD et

Myf5 peuvent avoir des rôles redondants ou compensatoires in vivo, et ont amené S.M.

Hughes en 1992 à proposer que Myf5 et MyoD forment, au cours du développement, une

boucle de régulation dans laquelle Myf5 serait un activateur du gène MyoD, tandis que MyoD

réprimerait le gène Myf5.

Figure 12 : Inter-régulations entre les facteurs myogéniques au cours de l’embryogénèse (Kitzmann, 1999).

Page 72: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

72

II.2.3.2 Les protéines de la famille MADS-box

La famille des protéines à domaine MADS-box regroupe divers facteurs de

transcription. Elle est définie sur la base d’une similitude de séquences primaires chez des

protéines issues d’organismes eucaryotes, dont la levure, les insectes et des mammifères

(Shore and Sharrocks, 1995). Le motif conservé est appelé boîte MADS (MCM1-Agamous-

Deficiens-SRF). Il est composé de 56 acides aminés, dont 9 sont strictement conservés chez

tous les membres de la famille, et se compose de deux régions fonctionnelles: l’extrémité N-

terminale constitue le déterminant majeur de spécificité de liaison à l’ADN, chacun des

membres possédant sa propre spécificité, tandis que l’extrémité C-terminale est nécessaire à la

dimérisation. Ainsi, la formation d’homo ou d’hétérodimères entre les différentes protéines de

la famille crée toute une combinaison de spécificités de liaison.

II.2.3.2.1 Le Facteur de Réponse au Sérum (SRF)

Le Facteur de Réponse au Sérum (SRF) est l’un des membres les plus étudiés de la

famille MADS-box. D’une masse moléculaire de 67 KDa, ce facteur de transcription se fixe

en homodimère sur une séquence de dix nucléotides CC(AT)6GG appelée boîte CArG. Les

fonctions de la protéine sont multiples puisqu’il existe une trentaine de sites CArGs

fonctionnels dans des promoteurs de différents gènes (Chai and Tarnawski, 2002), dont le

gène c-fos (Treisman, 1986), les gènes d’α-actines squelettique (Muscat et al., 1992) ou

cardiaque (Miwa and Kedes, 1987). Son inactivation génique n’apporte que peu d’indices

quant à ses différentes fonctions: en effet, les embryons SRF-/- se développent normalement

jusqu’à E6.5 puis meurent in utero lors de la gastrulation, essentiellement par absence de

formation du mésoderme (Arsenian et al., 1998). Ainsi, des études fonctionnelles menées sur

la protéine ont été en grande partie réalisées ex vivo dans des lignées cellulaires. Elles ont

permis de distinguer deux fonctions principales de la protéine SRF: l’induction de gènes

impliqués dans la prolifération et le cycle cellulaire (Chai and Tarnawski, 2002; Miano,

2003), ainsi que la régulation des processus de différenciation, notamment dans le tissu

musculaire squelettique.

II.2.3.2.2 SRF et différenciation musculaire squelettique

La protéine SRF est exprimée de façon constitutive au niveau messager et protéine

dans les cellules musculaires en culture, son niveau d’expression, de même que sa localisation

Page 73: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

73

nucléaire ne variant pas selon le stade prolifératif ou différencié de la cellule (Vandromme et

al., 1992). Cette étude de Vandromme et al. démontre que l’inactivation de la protéine SRF,

par microinjection d’anticorps anti-SRF, inhibe la différenciation de la lignée musculaire C2

en empêchant la transition myoblaste-myotube. Cela s’accompagne de l’inhibition de

l’expression de la Troponine T, marqueur tardif de la différenciation, mais également de la

myogénine, témoignant ainsi d’un rôle précoce de la protéine SRF dans le programme de

différenciation myogénique (Gauthier-Rouvière et al., 1996; Soulez et al., 1996). Il est par

ailleurs important de noter que, alors que le gène de la Troponine T est effectivement une

cible directe de la protéine SRF (Wang et al., 1994), aucune séquence CArG fonctionnelle n’a

été identifiée dans les séquences régulatrices du gène de la myogénine. Son inhibition par

extinction de la protéine SRF témoigne alors d’un rôle général de cette dernière dans le

processus de différenciation, et non d’une régulation directe du gène. Afin de préciser le rôle

fonctionnel ainsi que la régulation de la protéine SRF dans le muscle squelettique, plusieurs

promoteurs de gènes spécifiques du tissu musculaire comme l’α-actine squelettique, ont été

analysés (Minty and Kedes, 1986; Lee et al., 1991). La protéine SRF sous forme de dimère

n’a pas ou peu d’activité (Treisman et al., 1992). Elle doit, pour être activée, être

phosphorylée et/ou s’associer à des cofacteurs, et assurer ainsi une sorte d’ancrage pour la

formation de complexes multiprotéiques sur les régions régulatrices de ses gènes cibles. Outre

de nombreux gènes impliqués dans l’organisation du cytosquelette au cours de la

différenciation, les gènes de la famille bHLH, et notamment MyoD, représentent des cibles

potentielles importantes de la protéine SRF. L’implication de SRF dans la régulation du gène

MyoD a été suggérée en 1996 par deux études de Gauthier-Rouvière et al., puis Soulez et al..

Ces travaux démontrent successivement que l’inactivation de la protéine SRF par

microinjection d’anticorps bloquants dans des myoblastes prolifératifs, ou par utilisation de

lignées C2 SRF anti-sens, se traduit par une perte d’expression de la protéine MyoD. Des

travaux ultérieurs de Carnac et al. (1998) et Wei et al (1998) confirment cette régulation de

MyoD dépendante de SRF: l’inactivation de la petite protéine G RhoA, régulateur positif du

facteur SRF, entraîne une perte d’expression de la protéine MyoD, sans toutefois altérer

l’expression du facteur bHLH Myf5.

II.2.3.2.3 La famille des Myocyte Enhancer Factor 2 (MEF2)

En 1989, MEF2 (Myocyte Enhancer Factor-2) est initialement décrit comme un

facteur nucléaire présent dans les cellules musculaires différenciées, mais absent des cellules

en prolifération, ainsi que des cellules non musculaires. Cette protéine, par sa liaison à une

Page 74: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

74

séquence consensus riche en A/T (CTA(A/T)4TAG) dans les promoteurs de gènes

musculaires, est alors décrite comme nécessaire à l’expression de la Créatine Kinase

Musculaire (MCK), ainsi que de la chaîne légère de la myosine de rat (Gossett et al., 1989).

Depuis, une famille de protéines MEF2 a été caractérisée après clonage de leur ADNc. Chez

les vertébrés, elle se compose de quatre gènes mef2 appelés mef2a, b, c et d, localisés sur des

chromosomes différents (Pollock et Treisman, 1991; McDermott et al, 1993; Morisaki et al.,

1997). Au cours du développement, les quatre gènes sont transcrits dès le 14ème jour de

gestation. L’expression de mef2c reste restreinte au muscle squelettique, au cerveau et à la

rate. Les trois autres gènes mef2a, b et d sont quant à eux transcrits de façon ubiquitaire. Cette

observation est pourtant en désaccord avec la restriction tissulaire de l'activité des facteurs

MEF2 correspondants, retrouvée uniquement dans les tissus musculaires squelettique,

cardiaque et lisse ainsi que dans le système nerveux. De plus, l'emploi d'anticorps dirigés

contre une région commune aux protéines MEF2A, B et D a permis de montrer qu’elles ne

sont exprimées qu’au niveau des tissus où leur activité est décelée, suggérant l’existence de

mécanismes post-transcriptionnels contrôlant la biosynthèse tissulaire de ces facteurs (Yu et

al., 1992).

Chaque isoforme possède, outre un domaine MADS-box, un domaine MEF2 constitué de 29

acides aminés. Celui-ci représente une extension de la boîte MADS constituant une région qui

assure essentiellement la liaison de la protéine à l’ADN, mais aussi son interaction avec des

partenaires. Les membres de la famille MEF2 peuvent s’homo et s’hétérodimériser. Le site de

liaison MEF2 présent dans de nombreux promoteurs peut aussi lier des facteurs autres que

ceux de la famille MEF2, créant ainsi des mécanismes de compétition qui participent à la

régulation de certains gènes. Ainsi, l’enhancer du gène de la MCK possède un site MEF2

essentiel à son activité dans les cellules musculaires squelettiques et cardiaques. Bien que la

liaison de MEF2 soit nécessaire à l’expression (Cserjesi et al., 1994), ce site peut aussi être lié

par d’autres protéines. D’autres exemples similaires de compétition ont été mis en évidence

sur le promoteur de la chaîne légère de la myosine (Zhu et al., 1993), et très récemment sur les

promoteurs de la desmine, de la myoglobine ainsi que de la chaîne lourde de la myosine

(βMHC) (Karasseva et al., 2003).

II.2.3.2.4 MEF2 et différenciation musculaire squelettique

L’analyse du profil d’expression du produit des quatre gènes mef2a, b, c et d dans le

muscle squelettique démontre une accumulation séquentielle. MEF2B et MEF2D sont

exprimés dès le stade myoblaste, bien que ce dernier n’acquière une activité transcriptionnelle

Page 75: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

75

que lors de la sortie du cycle cellulaire (Breitbart et al., 1993; Molkentin et al., 1996). La

protéine MEF2A s’accumule dès l’entrée en différenciation des cellules, tandis que MEF2C

n’est induite que plus tardivement au cours de la différenciation, la protéine n’étant détectée

qu’au stade des myotubes plurinucléés (Martin et al., 1993; McDermott et al., 1993).

Il existe une régulation bidirectionnelle entre les MRFs et les MEF2. En effet, une activité

MEF2 est induite dans des cellules non musculaires transfectées par la myogénine (Cserjesi

and Olson, 1991; Cserjesi et al., 1994) ou MyoD (Yu et al., 1992), ce qui suggère que les

MRFs peuvent activer MEF2. Pourtant, Kaushal et al. (1994) démontrent que l’apport

exogène de la protéine MEF2A est capable de convertir des fibroblastes en myotubes

plurinucléés. D’après cette étude, l’efficacité de conversion observée avec MEF2A est

similaire à celle induite par MyoD. Comme précisé dans sa description de 1989, le facteur

MEF2 s’avère être un transactivateur puissant des gènes impliqués dans la régulation de la

myogénèse, démontrant ainsi un rôle central de ce facteur dans l’architecture musculaire. Dès

1992, plusieurs études successives démontrent l’existence, dans le promoteur de la

myogénine, d’un site MEF2 fonctionnel nécessaire à l’expression du gène dans des lignées

cellulaires (Edmondson et al., 1992; Buchberger et al., 1994), mais aussi in vivo, au cours du

développement des bourgeons des membres et de la formation des somites (Cheng et al.,

1993; Yee and Rigby, 1993). En 1995, deux études de Naidu et Black révèlent l’existence,

dans le promoteur du gène MRF4, d’un site MEF2 nécessaire à la régulation positive du gène,

sa mutation entraînant une forte réduction d’activité du promoteur lors de la différenciation

des cellules C2 ainsi que des myoblastes primaires de poulet (Black et al., 1995; Naidu et al.,

1995). Outre un site MEF2, le promoteur de MRF4 contient aussi une boîte E fonctionnelle

(Kaushal et al., 1994; Naidu et al., 1995). Des études de cotransfection démontrent

l’activation synergique du promoteur de MRF4 en présence des deux facteurs MEF2 et

myogénine. Pourtant, tandis qu’une double mutation de leurs sites fixateurs entraîne une perte

totale d’activité, toute simple mutation de l’une ou l’autre des boîtes E ou MEF2 n’altère pas

la synergie entre les deux facteurs. Ce résultat démontre l’existence d’une coopération de ces

deux facteurs sur l’un ou l’autre des deux sites et suggère leur interaction. Deux études de

Ridgeway et al. (2000) et Rogerson et al. (2002) par criblage des domaines de transactivation

de chaque MRF, définissent la myogénine et non MyoD comme le candidat idéal pour la

régulation du gène MEF2C.

Page 76: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

76

II.2.4 Effecteurs de la différenciation myogénique

Le passage de la prolifération à la différenciation terminale des cellules myogéniques

est influencé par l’environnement extracellulaire, et, dans le cas des cellules en culture, par la

présence d’hormones et facteurs de croissance. Dans les cultures de myoblastes squelettiques,

le sérum et les facteurs de croissance exogènes induisent un mécanisme répresseur qui

empêche l’initiation du processus de différenciation, tant que leur concentration n’est pas

réduite sous une valeur-seuil. A la suite de la suppression des facteurs de croissance, le

programme de différenciation est activé, et s’accompagne de la formation des myotubes

polynucléés, de la détermination irréversible des myoblastes au stade post-mitotique, de

l’activation transcriptionnelle des gènes spécifiques du muscle qui deviennent réfractaires à la

répression exercée par les facteurs de croissance.

Les facteurs de croissance et hormones connus pour avoir des effets sur la

différenciation des cellules du muscle squelettique appartiennent à trois familles différentes

(Florini et al., 1991). La famille des facteurs-transformants-β (TGF-β) et celle du FGF

montrent un effet inhibiteur sur la différenciation, alors que la famille des facteurs «insulin-

like» (IGFs) favorise soit la prolifération, soit la différenciation des cellules musculaires.

II.2.4.1 Inhibiteurs

II.2.4.1.1 Le facteur de croissance TGF-β

Le TGF-β a été initialement caractérisé comme un inducteur du phénotype transformé

dans les cellules fibroblastiques. Par la suite, cependant, on a observé qu’il peut influencer la

prolifération et la différenciation de types cellulaires d’origine mésenchymateuse (Ignotz and

Massague, 1985). Le traitement de lignées cellulaires de muscle squelettique (L6A1, L6E9,

C2 et BC3H1), et de cellules musculaires primaires (rat, caille) par TGF-β inhibe, de manière

dose-dépendante, l’expression de tous les marqueurs principaux de la différenciation

myogénique (augmentation de l’activité créatine kinase; expression de la myosine, des

récepteurs de l’acétylcholine, et autres gènes spécifiques du muscle), et, en parallèle, stimule

la prolifération de ces cellules. L’inhibition de la différenciation induite par le TGF-β peut-

être reversée par l’élimination du facteur du milieu, suggérant que celui-ci induit un sinal

transitoire chez les myoblastes (Florini et al., 1991).

II.2.4.1.2 Le facteur de croissance FGF

Page 77: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

77

Le FGF est un mitogène pour les cellules des tissus dérivés du mésoderme et du

neuroectoderme, mais surtout c’est un puissant inhibiteur du processus myogénique, du moins

in vitro. Il inhibe l’activation des gènes spécifiques du muscle en régulant négativement les

protéines myogéniques bHLH. Il a été démontré que le FGF induit la phosphorylation de la

thréonine 114 située dans le domaine basique de la myogénine, lui faisant perdre ainsi la

capacité de se lier à l’ADN (Olson, 1993). La présence de ce site de phosphorylation dans

toutes les protéines myogénique bHLH fait penser que les signaux induits par le FGF utilisent

la phosphorylation comme étape finale commune pour inhiber de manière coordonnée les

activités des MRFs.

II.2.4.2 Inducteurs

II.2.4.2.1 Les facteurs IGFs

Les IGFs appartiennent à une famille de petits peptides caractérisés par une structure

très proche de celle de la pro-insuline humaine. Les plus importants sont IGF I et II et

l’insuline. Les trois sont synthétisés en quantité notable par les cellules musculaires en

culture, alors qu’in vivo IGF I et II sont produits principalement par le foie (Florini et al.,

1991). Des premières études ont montré que l’insuline stimule la différenciation des cellules

musculaires d’embryon de poulet à des concentrations de l’ordre du µM. Ensuite, il a été

montré que les taux physiologiques d’IGFs stimulent la différenciation au niveau

morphologique (fusion) et au niveau biochimique (activité CK) (Florini et al., 1991), soit sur

des lignées (myoblastes de rat L6), soit sur des cellules primaires d’embryon de poulet ou des

cellules satellites de rat (Ewton et al., 1994). Des études impliquent aussi les IGFs dans les

phénomènes de régénération du muscle squelettique in vivo (Musaro et al., 1999). La liaison

de l’IGF-I sur son récepteur tyrosine-kinase conduit à la stimulation des MAP-kinases et de

PI3K : ceci démontre que l’effet différenciateur est précédé par une phase proliférative

(Coolican et al., 1997). En effet, si le signal des IGFs est inhibé, les cellules maintiennent un

taux élevé de protéines Id, et il n’y a pas d’augmentation de la protéine p21-ras essentielle

pour l’arrêt du cycle cellulaire et pour procéder à la différenciation.

II.2.4.2.2 L’hormone AVP

La vasopressine (AVP) est une hormone nonapeptidique, produite par l’hypothalamus

et secrétée par la neurohypophyse dans le courant sanguin, par lequel elle atteint ses tissus-

cibles. Sa fonction d’antidiurétique est bien connue, ainsi que son effet vasoconstricteur. Elle

est aussi capable d’agir sur les cellules hépatiques en stimulant la glycogénolyse, et d’agir

Page 78: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

78

comme neurotransmetteur dans le système sympathique (Hanley et al., 1984). La réponse

cellulaire est médiée par deux types de récepteurs, V1 et V2, appartenant à la famille des

récepteurs à sept domaines transmembranaires qui activent diverses voies de signalisation.

Les récepteurs V1, localisés sur les hépatocytes, les cellules musculaires lisses des vaisseaux,

et sur les cellules neuronales, agissent en activant diverses phospholipases (PLA, PLD, PLC),

qui produisent des seconds messagers capables de moduler divers types de canaux calciques

(Michell et al., 1979). Localisés dans les canaux collecteurs des tubules rénaux, les récepteurs

de type V2 sont responsables de l’action anti-diurétique de l’AVP, via l’activation d’une

adénylate cyclase qui conduit à la production d’AMPc comme second messager. Les deux

types de récepteurs peuvent être exprimés simultanément dans le même tissu, si l’on

considère les diverses fonctions régulées par l’AVP (Valloton, 1991). Le calcium libéré, à la

suite de l’activation du récepteur V1, induit la translocation de la forme cytosolique inactive

de la PKC sur la face interne de la membrane plasmique, où elle est activée par les DAG

libérés par la PLC, et où elle peut agir sur les substrats importants pour divers processus

cellulaires.

L’action de l’AVP sur le tissu musculaire squelettique n’est pas encore bien clarifiée,

même si les études antérieures, menées soit in vitro, soit in vivo, ont suggéré son implication

dans le métabolisme glucidique. En outre, il a été mis en évidence le présence de récepteurs

V1 dans la lignée myogénique de rat L6 (Wakelam, 1987), et la réponse à l’AVP a été

caractérisée, au niveau de la transduction du signal, dans diverses lignées myogéniques (L6,

L5, RD), une lignée de cellules satellites de souris (C2C12), et des cultures primaires de

poulet (Teti et al., 1993). La stimulation par l’AVP, à des concentrations comprises entre 10-9

et 10-6 M, induit, de manière dose-dépendante, la production d’inositol-phosphates en

quelques secondes, et est suivie d’un pic transitoire de calcium libéré à partir du réticulum

endoplasmique. Les signaux induits par l’AVP dans les lignées étudiées sont hétérogènes et

indépendants du stade de différenciation des cultures, mais corrélés à leur potentiel

myogénique (Teti et al., 1993).

En ce qui concerne le rôle de l’AVP dans l’induction de la différenciation des cellules

musculaires squelettiques, il a été démontré que les myoblastes L6C5 cultivés dans un milieu

contenant 5% de SVF en présence d’AVP ont une augmentation du pourcentage de fusion,

après 3-4 jours de traitement, et forment des myotubes plus grands qu’en l’absence

d’hormone. De plus, l’AVP est capable d’induire la différenciation des myoblastes en

l’absence d’autres facteurs en milieu contrôlé, et agit en synergie avec l’IGF-I pour augmenter

l’expression du phénotype différencié (Minotti et al., 1998). Le mécanisme de transduction du

Page 79: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

79

signal AVP-dépendant co-implique les phospholipases C et D (Naro et al., 1997) et est corrélé

d’abord avec une augmentation rapide de l’expression du co-régulateur myogénique des

MRFs, MEF2, nécessaire pour l’activation transcriptionnelle de la myogénine (Scicchitano et

al., 2002), suivie d’une augmentation de l’expression des MRFs myogénine et Myf5 (Nervi et

al., 1995), et ensuite, des marqueurs terminaux comme la myosine et les diverses formes de

récepteurs de l’acétylcholine.

Tous les résultats impliquant l’AVP dans l’induction de la différenciation ayant été

obtenus en culture, le rôle physiologique de l’AVP dans la myogénèse in vivo reste à

démontrer. Il a été constaté qu'il existe de fortes concentrations d’AVP dans le muscle fœtal

humain, et que celles-ci ne décroissent qu' après la naissance (Smith et al., 1992).

II.2.5 Myofribrillogénèse

II.2.5.1 Protéines spécifiques du muscle

Depuis plusieurs décennies, de nombreuses études ont clairement montré que les

myoblastes postmitotiques mononucléés sont capables de synthétiser et d’accumuler des

protéines spécifiques du muscle dont l’actine-α sarcomérique, les chaînes lourdes et légères

de la myosine, la tropomyosine, la troponine et la créatine kinase. La plupart de ces protéines

sont codées par des familles multigéniques et sont présentes sous différentes isoformes

exprimées à différentes périodes du développement (Buckingham, 1985; Stromer, 1992;

Bandman, 1992; Schiaffino and Reggiani, 1994). L’expression de l’actine sarcomérique a fait

l’objet de données contradictoires, peut-être dues à des sensibilités différentes des méthodes

de détection de la protéine ou du transcrit. On connaît au moins six gènes codant pour

différentes isoformes d’actine chez les vertébrés (Vandekerckhove and Weber, 1978), à savoir

les deux isoformes non musculaires β et γ, et 4 isoformes exprimées différentiellement dans

les muscles: la forme α-squelettique, la forme α-cardiaque, la forme α-vasculaire et la forme

α-entérique. Les myoblastes en prolifération expriment dans leur cytoplasme les isoformes

ubiquitaires β et γ, alors que, quand le programme de différenciation se poursuit, l’expression

de ces deux isoformes est réduite tandis que l’expression de l’isoforme α-squelettique est

activée. Bien que des études effectuées sur des myoblastes de poulet aient suggéré que la

synthèse de l’actine-α sarcomérique ainsi que l’accumulation des ARNm codant pour cette

protéine n’interviennent qu’après la fusion (Lawrence et al., 1989), des travaux postérieurs

ont montré que les myoblastes pré-fusionnels des myotomes d’embryon de rat et de souris

expriment l’actine α sarcomérique (Babai et al., 1990), de même que les myoblastes de

Page 80: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

80

muscles embryonnaires de poulet en culture primaire, quelques heures après la sortie du cycle

cellulaire (Lin et al., 1994). Dès le moment où le cycle cellulaire cesse, les cellules

postmitotiques d’allure fusiforme et allongée commencent à exprimer des protéines

myofrillaires et à réorganiser leur cytosquelette.

II.2.5.2 Les myofibrilles

Les cellules du muscle squelettique sont peut-être celles dont la structure atteint le plus

haut niveau d’organisation dans l’organisme. Une coupe transversale dans une fibre

musculaire (Figure 13) montre qu’elle est semblable à un cable formé de centaines de

filaments cylindriques plus minces, les myofibrilles. Celles-ci sont séparées les unes des

autres par un cytoplasme contenant un système complexe de membranes intracellulaires, ainsi

qu’un ensemble servant à la production d’énergie qui consiste en mitochondries, gouttelettes

lipidiques et granules de glycogène.

Figure 13 : Structure du muscle squelettique.

Schéma représentant les niveaux d’organisation du muscle squelettique depuis l’ensemble du muscle

dans l’organisme jusqu’au sarcomère individuel. Le premier encadré montre une micrographie

Page 81: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

81

optique d’une fibre multinucléée. Le second encadré montre une micrographie électronique d’un

sarcomère individuel dont les bandes ont été marquées par des lettres.

Chaque myofibrille se compose de filaments fins d’actine-α et de filaments épais de myosine

organisés spatialement par un éventail de filaments intermédiaires et de protéines de liaison

de l’actine, de façon à constituer une succession d’unités contractiles, les sarcomères,

délimitées par les stries Z (Figure 14). Les stries Z sont formées par l'organisation de

filaments d'alpha-actinine qui servent à relier les extrémités des filaments fins de chaque

sarcomère entre elles et avec les extrémités des filaments fins du sarcomère adjacent. Chaque

sarcomère s’étend d’une strie Z à la suivante et contient plusieurs bandes sombres et claires.

Ainsi les bandes sombres A sont caractérisées par la présence des filaments épais de myosine

qui s’arrêtent au niveau des bandes I. Les filaments fins d’actine parcourent tout le sarcomère

à l’exception de la zone H. Au milieu de celle-ci, les filaments de myosine s’unissent pour

former la strie M. A partir de la strie M, de longs filaments de titine liés fermement aux

filaments épais s’étendent le long des bandes A et I jusqu’aux stries Z. La titine est un

filament protéique qui, dans chaque demi-sarcomère, relie chaque filament épais à la strie Z.

Une autre protéine, la nébuline, part des stries Z et s’associe étroitement avec les filaments

fins d’actine. La nébuline pourrait servir comme support à l’assemblage des filaments

d’actine.

Figure 14 : Disposition des molécules de titine dans le sarcomère.

Ces énormes molécules élastiques s’étendent de la strieZ à la bande M au centre du sarcomère. Trois

à six molécules de titine sont associées à chaque moitié d’un filament de myosine. Les molécules de

Page 82: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

82

nébuline sont associées aux filaments minces et sont supposées réguler la longueur (c.à.d le nombre

de monomères d’actine). (Keller, 1995).

II.2.5.3 Modèle de myofibrillogénèse

Un des grands défis de la recherche concernant la compréhension de la physiologie et

la biologie du muscle, est d’identifier la séquence des événements à l’origine de l’assemblage

des filaments contractiles et de la strie Z dans le sarcomère. Dans la mesure où la cellule

musculaire présente une organisation exceptionnelle, les mécanismes régissant la mise en

place des structures myofibrillaires doivent vraisemblablement être très restrictifs et d'une

grande complexité. Plusieurs études ont suggéré que les filaments d’actine organisés en SFLS

(stress fiber like structures) semblent jouer un rôle important dans la myofibrillogénèse des

Figure 15 : Modèle de myofibrillogénèse proposé par Dabiri et al. (1997).

Page 83: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

83

cardiomyocytes en culture (Dlugosz et al., 1984; Handel et al., 1991; Lu et al., 1992; Rhee et

al., 1994). Un traitement des cardiomyocytes par la cytochalasine D qui détruit les filaments

d’actine des SFLS, arrête la myofrillogénèse de novo (Auerbach et al., 1997). De plus,

plusieurs études effectuées sur des cardiomyocytes (Rhee et al., 1994; Dabiri et al., 1997;

Sanger et al., 2000; Sanger and Sanger, 2001), des cellules précardiaques embryonnaires (Du

et al., 2003) ou des myoblastes squelettiques de souris (Sanger et al., 2002) ont pu suggérer un

modèle de formation des myofibrilles qui consiste en trois étapes: les prémyofibrilles ou

SFLS (stress fiber like structures) servent d’échafaudage pour la formation des myofibrilles

naissantes qui vont, à leur tour, former les myofibrilles matures (Figure 15). Les

prémyofibrilles sont composées de minisarcomères contenant l’actine α et l’α-actinine

spécifiques du muscle ainsi que la Myosine II non musculaire (Rhee et al., 1994). L’α-

actinine se concentre dans des structures appelées corps Z (Z-bodies). Les corps Z délimitent

les minisarcomères rappelant les stries Z dans les sarcomères. Les filaments d’actine sont

attachés à ces corps Z et aux filaments de myosine II non musculaire organisés en mini-

bandes A. Ensuite, les prémyofibrilles s’alignent les unes à côté des autres pour former les

myofibrilles naissantes par recrutement de la titine et des filaments de myosine II musculaire.

La formation des myofibrilles naissantes est une étape transitoire entre les prémyofibrilles et

les myofibrilles matures. Ces dernières se forment après l’élimination des filaments de

myosine non musculaire, l’alignement des filaments de myosine musculaire dans des bandes

A, et la fusion des corps Z en bandes Z (Dabiri et al., 1997; Sanger et al., 2002; Du et al.,

2003). Malgré toutes les études effectuées, les mécanismes de régulation de l'assemblage des

différentes protéines dans ces structures restent mal connus.

Page 84: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

84

III MATERIELS ET METHODES

III.1 Réactifs

L'acide L-α-dipalmityl [glycérol-14C(U)] phosphatidique (144mCi/mmol) et l’acide [9,10-3H(N)] palmitique (57,00 Ci/mmol), proviennent de PERKIN ELMER Life Sciences.

L’orthophosphate [33P] (2500 Ci/mmol) provient de AMERCHAM BIOSCIENCES

L'acide phosphatidique (1-arachidonoyl, 2-stéaroyl) et le phosphatidylbutanol proviennent de

TEBU.

L'anticorps monoclonal anti- PIP2 provient de Assay Designs, EUROMEDEX.

L'anticorps polyclonal anti-RhoA provient de SANTA-CRUZ BIOTECHNOLOGY.

L'anticorps monoclonal F5D anti-myogénine provient de DEVELOPMENTAL STUDIES

HYBRIDOMA BANK, UNIVERSITY OF IOWA.

L'anticorps monoclonal anti-tubuline-α provient de SIGMA.

Les anticorps polyclonaux anti-PLD1 et anti-PLD2 ont été gracieusement fournis par le Dr.

Sylvain Bourgoin (Université de Laval, Québec, Canada).

Les anticorps monoclonaux anti-PKCα, β1, γ et ι proviennent de TRANSDUCTION

LABORATORIES.

L'anticorps monoclonal anti 58k (marqueur de Golgi) provient de SIGMA.

L'anticorps secondaire anti-IgG de souris couplé à la peroxydase de raifort et le kit ECL

proviennent de AMERSHAM PHARMACIA BIOTECH.

L’anticorps secondaire anti-IgG de lapin couplé à la peroxydase de raifort provient de

BIORAD.

La phalloïdine couplée à la rhodamine, le DAPI, l’anticorps secondaire Alexa Fluor-488 anti-

lapin proviennent de MOLECULAR PROBES.

Les vecteurs pCDNA3-hPLD1 et pCDNA3-hPLD2 sont un don du Dr. Michel Record

(INSERM U326, Toulouse), le vecteur pcDNA3-HA1-cRaf1 est un don du Dr. A. Eychene

(CNRS U146, Orsay) et le vecteur pEGFP-C1 provient de CLONTECH.

Le kit « QuikChangeTM Site-Directed Mutagenesis kit » provient de STRATAGENE.

Le kit « Rapid DNA Ligation Kit », le FuGENE 6, la Taq polymerase et la sérumalbumine

bovine proviennent de ROCHE APPLIED SCIENCE.

La transcriptase inverse M-MLV vient de PROMEGA.

Page 85: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

85

Le cocktail d'inhibiteurs de protéases (Inhibitor Cocktail), l’arginine-vasopressine (AVP), le

milieu DMEM (Dulbecco’s modified Eagle’s medium) enrichi en glucose (4500 mg/L), le Tri

Reagent et la bréfeldine A proviennent de SIGMA.

L’exoenzyme C3 de Clostridum botulinum est un don du Dr. P.Boquet (INSERM U452,

Nice).

Le sérum de veau fœtal, le PBS stérile, la penicilline, la streptomycine et la L-glutamine

proviennent de GIBCO.

III.2 Méthodes

III.2.1 Culture et traitements des cellules

Les cellules sont cultivées sous une atmosphère humide à 37°C avec 5% de CO2 et

95% d’air dans un incubateur Stéricult.

III.2.1.1 Culture des cellules L6C5

Les cellules utilisées sont des cellules myogéniques de rat L6C5 (type L6, clone C5)

possédant une capacité de différenciation significative. Elles sont ensemencées à raison de

10000 cellules / cm2. Elles forment un tapis cellulaire monocouche qui devient jointif à

confluence. Ces cellules sont mises en culture dans un milieu nutritif liquide DMEM de base

riche en glucose (4500mg/L) supplémenté avec 200 mM de L-Glutamine, 20 mM de tampon

HEPES, 100µg/ml de streptomycine plus 100U/ml de pénicilline, ce qui donne un milieu

incomplet, auquel on ajoute 10% de sérum de veau fœtal décomplémenté (S.V.F.) afin

d’obtenir un milieu complet.

Les cellules sont passées tous les 3-4 jours. Pour ce faire, le milieu est aspiré, les cellules sont

lavées avec du tampon PBS (sans Ca++, sans Mg++), puis 2 ml de trypsine/EDTA sont

déposés sur les cellules pendant 1 minute puis aspirés. Les cellules sont incubées ainsi

pendant 5 minutes à 37°C. Les cellules décollées sont resuspendues dans 10 ml de milieu

complet, et ré-ensemencées.

III.2.1.2 Traitement des cellules L6C5

Vingt-quatre heures après ensemencement des cellules et avant tout traitement, ces

dernières sont lavées deux fois avec du PBS à 37°C, puis elles sont mises en présence d’un

milieu DMEM dépourvu de SVF mais contenant de la BSA à 1% ce qui permet de rendre les

cellules quiescentes par arrêt de la prolifération cellulaire. Les cellules sont ensuite traitées

Page 86: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

86

par les effecteurs à la concentration voulue et laissées en culture le temps nécessaire comme

cité dans chaque expérience. A noter que l’addition de bréfeldine A ou de butanol-1 et

butanol-2 dans le milieu précède de 10 min le traitement par l’AVP ou le TPA. Dans le cas

précis des alcools, le milieu est changé tous les jours pour éviter leur évaporation.

III.2.1.3 Evaluation de la différenciation

Les cellules L6C5 peuvent être différenciées soit après leur traitement par l’AVP à 10-

7 M dans un milieu DMEM dépourvu de SVF et contenant 1% BSA pendant plusieurs jours,

soit en les cultivant plusieurs jours dans un milieu DMEM contenant 1% de SVF. La

différenciation myogénique peut être évaluée sur des critères précoces comme l’expression et

l’accumulation nucléaire de la myogénine, facteur de transcription spécifique du muscle, 24h

après l’induction de la différenciation. Son expression est déterminée par des expériences de

western-blotting et son accumulation nucléaire est détectée par immunofluorescence (voir

protocole ci-dessous). La différenciation terminale des cellules L6 peut être évaluée sur des

critères tardifs comme la mesure de l’activité créatine kinase ou l’expression de la myosine

sarcomérique détectée par immunofluorescence dans les myotubes plurinucléés formés après

6-8 jours de l’induction myogénique (voir protocole ci-dessous).

III.2.2 Dosage de l’activité créatine kinase

Ce dosage est effectué d’après les conditions de réactions optimales déterminées par

Scasz et al., 1976. Huit jours après la mise en culture des cellules soit dans le milieu contenant

10% ou 1% SVF, soit dans un milieu dépourvu de SVF et supplémenté par 1% BSA, en

présence ou non d’AVP, les cellules sont lavées au PBS, puis décollées par incubation dans

du PBS contenant 1 mM d’EDTA pendant 15 minutes à 37°C, et récupérées grâce à une

centrifugation de 10 minutes à 2500g. Les culots sont repris par 300 µl de tampon Tris-HCl

20 mM, PH 6,7, EDTA 1mM, puis soniqués 5 secondes à 4°C afin d’obtenir une suspension

homogène, puis centrifugés 15 minutes à 14000g. Les surnageants sont récupérés et utilisés

pour le dosage qui se fait sur une micro-plaque de 96 puits. Ce dernier se fait sur 50 µl

d’échantillon par puits en présence de 100 µl de milieu réactionnel (CK 47-10 Sigma)

contenant 30 mM de créatine phosphate, 2 mM de NAD, 20 mM de N-acétyl-L-cystéine,

3000U/L d’hexokinase de levure, 2000U/L de glucose-6-phosphate déshydrogénase, 10 mM

d’ions magnésium, 20 mM de D-glucose, 10 µM d’ADP et 2 mM d’EDTA.

Page 87: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

87

On suit la formation de NADH, pour cela la quantification se fait pendant 15 minutes à 30°C

par mesure de la vitesse de variation de l’absorption à 340 nm qui est proportionnelle à

l’activité créatine kinase. L’ appareil utilisé est un lecteur de plaque Powerwave-X (BIO-TEK

INSTRUMENTS).

III.2.3 Transfections transitoires

La méthode de transfection utilisée est basée sur la formation d’un complexe entre

l'ADN plasmidique et des liposomes cationiques, permettant l'entrée du plasmide à l'intérieur

de la cellule. Le réactif utilisé pour cette méthode est le FuGENE™ 6 (ROCHE Molecular

Biochemicals). 6 µl de réactif FuGENE 6 sont dilués dans 100µl de milieu incomplet (sans

SVF) et laissés à température ambiante 5 min. Le FuGENE dilué est ensuite ajouté sur 2 µg

de plasmide (pour pCDNA3) ou sur 3 µg de plasmide (pour pEGFP) placés au fond d'un tube

eppendorf. L’ensemble FuGENE/ADN est incubé 15 minutes à température ambiante en

tapotant de temps à autre. Ensuite le mélange de 100 µl Fugène/ADN est déposé sur 200 000

cellules en suspension dans 1 ml de milieu complet (10% de SVF). Les cellules sont ensuite

ensemencées dans des boîtes de culture de 35 mm et laissées 18h à 37°C. Pour les expériences

dans lesquelles on doit évaluer l’accumulation nucléaire de la myogénine par

immunofluorescence, le milieu des cellules transfectées est remplacé par du milieu sans

sérum additionné de 1% de BSA et les cellules sont cultivées pendant encore 24 h en présence

ou en absence de 10-7M AVP. Pour les expériences dans lesquelles on doit marquer l’actine

par une toxine fluorescente, le milieu des cellules transfectées est remplacé par du milieu sans

sérum additionné de 1% de BSA pendant 3h et les cellules sont ensuite traitées par l’AVP

pendant 10 min.

III.2.4 Immunofluorescence

III.2.4.1 Immunofluorescence de la myogénine

Vingt-quatres heures après culture des cellules dans 1% de BSA en présence ou en

absence des agonistes appropriés, les cellules sont lavées dans du PBS et fixées par 3,7% de

formaldéhyde pendant 10 min à 4°C. Les cellules sont ensuite perméabilisées avec 0,1% de

Triton-X100 pendant 15 min à 4°C et incubées avec 1% BSA pendant 20 min à température

ambiante. Ensuite on incube les cellules avec l’anticorps primaire monoclonal anti-myogénine

Page 88: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

88

F5D pendant la nuit à température ambiante. Enfin, les cellules sont lavées avec 1% de BSA

et mises en présence d’un anticorps secondaire, couplé à la rhodamine ou à la fluorescéine,

dilué à 1:200 dans une solution de PBS contenant 1% de BSA.

III.2.4.2 Immunofluorescence de la myosine

Neuf jours après culture des cellules en absence ou en présence d’AVP (10-7M) après

addition, ou pas, de 0,5% butanol-1 ou 0,5% butanol-2, les cellules sont fixées,

perméabilisées, comme pour la myogénine, et ensuite, incubées avec l’anticorps primaire

monoclonal anti-myosine sarcomérique dilué à 1:50 pendant 1h à température ambiante. Les

cellules sont lavées avec 1% de BSA et mises en présence d’un anticorps secondaire, couplé à

la rhodamine dilué à 1:200 dans une solution de PBS contenant 1% de BSA. On ajoute

ensuite le DAPI qui est un colorant spécifique du noyau pendant 5 minutes à température

ambiante (1µg/ml).

III.2.4.3 Immunofluorescence des PLD

Les cellules sont fixées par du formaldéhyde à 3,7% pendant 30 minutes. Elles sont

ensuite traitées pendant 10 min avec du NH4Cl puis par de la BSA à 0,1% pendant 20

minutes. Les anticorps polyclonaux anti-PLD1 ou anti-PLD2 dilués à 1:1000 dans du PBS

contenant 0,05% de saponine, 0,1% de BSA sont ensuite ajoutés pour la nuit à 4°C. Après

avoir lavé au PBS, on ajoute l’anticorps secondaire Alexa-Fluor anti-lapin (Molecular Probes)

dilué à 1:1000 pendant 1 heure. Le co-marquage avec le marqueur du Golgi a été effectué à

l’aide d’un anticorps monoclonal anti-G58k dilué à 1:50 et un anticorps secondaire, couplé à

la rhodamine, dilué à 1:200 dans une solution de PBS contenant 1% de BSA.

III.2.4.4 Immunofluorescence du PIP2

On a utilisé le même protocole que pour les PLD. L’anticorps primaire utilisé est un

anticorps monoclonal anti-PIP2 dilué à 1:500. l’anticorps secondaire est couplé à la

fluoresceine et dilué à 1:200 dans une solution de PBS contenant 1% de BSA.

III.2.4.5 Marquage de l’actine.

Après l’ajout de l’anticorps secondaire et lavage des cellules avec du PBS dans les

expériences d’immunofluorescence de PLD1, PLD2, PIP2, les cellules sont incubées en

présence de la phalloïdine couplée à la rhodamine. La phalloïdine est une toxine qui marque

spécifiquement l’actine F dans les cellules et qui nous permet de détecter les SFLS dans les

myoblastes L6.

Page 89: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

89

III.2.5 Dosage des protéines par la méthode de Bradford (1976)

Pour réaliser ce dosage, on utilise le kit "Bio-Rad's protein assay". Ce dosage est basé

sur le changement de coloration du bleu de Coomassie en présence de concentrations

variables de protéines. Une fraction aliquote de la solution à doser est prélevée et complétée à

50µl avec de l'eau ou le tampon constituant la solution à doser. On ajoute 200µl de solution

"BioRad protein assay" diluée 5 fois dans de l'eau. Après agitation, la densité optique à

595nm est lue en microplaque 96 puits à l'aide d'un lecteur spectrophotométrique de plaques

multipuits (PowerWave X, BIOTEK INSTRUMENTS) et la concentration est déterminée par

comparaison à une gamme étalon d’albumine sérique bovine (1-20µg de protéines) réalisée

dans les mêmes conditions.

III.2.6 Préparation des échantillons pour électrophorèse en conditions

dénaturantes (SDS-PAGE)

III.2.6.1 RhoA

Les cellules L6C5, cultivées dans des boîtes de culture de 100 mm de diamètre, sont

mises dans un milieu DMEM contenant de la BSA à 1% pendant 3h avant leur traitement ou

non par l’AVP pour 1 minute. Les cellules sont ensuite lavées deux fois avec du PBS à 4°C

puis sont récoltées par grattage dans 0,5 ml de tampon d’homogénéisation (20 mM Tris-HCl

PH 7.6) contenant un mélange d'inhibiteurs de protéases (Inhibitor Cocktail, Sigma P2714)

dilué à 1/4. Les cellules sont lysées et homogénéisées au potter de Dounce par 40 allers et

retours. Les homogénats cellulaires sont ultracentrifugés à 100 000g pendant 1h afin de

séparer la fraction cytosolique (soluble) de la fraction particulaire (insoluble). Cette dernière

est reprise dans un volume minimum de tampon de lyse avec inhibiteurs de protéases. Le

dosage des protéines (par méthode de Bradford) est réalisé sur un aliquot de chaque

échantillon. Un aliquot de chaque fraction est alors dilué dans le tampon de Laemmli

(composition finale : Tris 125mM, pH=6,8, saccharose 10%, SDS 2%, mercaptoéthanol 1% et

bleu de bromophénol 0,05%).

III.2.6.2 PLD1 et PLD2

Après huit jours de culture dans le milieu approprié, les cellules sont lavées deux fois

avec du PBS à 4°C, récoltées dans du PBS et centrifugées à 1000g pendant 10 min. Le culot

cellulaire homogénéisé dans le tampon (20 mM Tris-HCl PH 7.6, 100 mM NaCl, 1% Triton

Page 90: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

90

X-100) contenant un mélange d'inhibiteurs de protéases (Inhibitor Cocktail, Sigma P2714)

dilué à 1/4 est congelé à -20°C. Après décongélation, le dosage des protéines (par méthode de

Bradford) est réalisé sur un aliquot de chaque échantillon et le reste est dilué dans le tampon

de Laëmmli supplémenté avec de l’urée (2M).

III.2.6.3 Myogénine

Vingt-quatre heures après culture des cellules dans 1% de BSA en présence ou en

absence des agonistes appropriés, Les cellules sont lavées deux fois avec du PBS à 4°C puis

sont récoltées par grattage dans 0,5 ml de tampon d’homogénéisation (20 mM Tris-HCl PH

7.6) contenant un mélange d'inhibiteurs de protéases (Inhibitor Cocktail, Sigma P2714) dilué

à 1/4. Les cellules sont lysées et homogénéisées au potter de Dounce par 40 allers et retours.

Le dosage des protéines (par la méthode de Bradford) est réalisé sur un aliquot de chaque

échantillon. Un aliquot de chaque fraction est alors dilué dans le tampon de Laëmmli.

III.2.6.4 Les différentes isoformes de PKC

Vingt-quatre heures après culture de cellules en présence de TPA (1 nM ou 10 nM),

les cellules sont homogénéisées dans le tampon (20 mM Tris pH 7.5, 2 mM EDTA, 2 mM

EGTA, 250 mM sucrose, 5 mM DTT, 100 mg/ml leupeptin, 100 mg/ml aprotinin and 3.5

mg/ml PMSF), et soniquées. Les homogénats cellulaires sont ultracentrifugés à 100 000g

pendant 1h afin de séparer la fraction cytosolique (soluble) de la fraction particulaire

(insoluble). Cette dernière est reprise dans un volume minimum de tampon de lyse. Le dosage

des protéines (par méthode de Bradford) est réalisé sur un aliquot de chaque échantillon. Un

aliquot de chaque fraction est alors dilué dans le tampon de Laëmmli.

III.2.7 Electrophorèse en SDS-PAGE et "Western-blotting"

Les électrophorèses sont réalisées sur un gel de polyacrylamide dont la concentration

dépend de la taille des protéines à séparer, en présence de 0,1% de SDS grâce à un appareil

pour électrophorèse pour minigels Biorad. Brièvement, pour deux mini gels on prépare le gel

de séparation en mélangeant dans un tube 6.9ml d'urée 8M, 4ml d'un mélange d'acrylamide à

30%, 3,8ml de Tris 1,5M pH8,8, 0,15ml de SDS 10%, 0,15ml d'ammonium persulfate 10% et

0,009ml de TEMED. Le mélange est vortexé avant d'être coulé. Après polymérisation, on

prépare un gel de concentration en mélangeant dans un tube 2,1ml d'eau, 0,5ml d'un mélange

d'acrylamide à 30%, 0,38ml de Tris 1M pH6,8, 0,03ml de SDS 10%, 0,03ml d'ammonium

Page 91: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

91

persulfate 10% et 0,003ml de TEMED. Le gel de concentration est coulé au-dessus du gel de

séparation. Après polymérisation les gels sont placés dans la cuve de migration du système.

Les échantillons préparés comme décrit précédemment sont dénaturés à 100°C puis déposés.

La migration électrophorétique s’effectue à 120V à voltage constant. La migration peut être

suivie grâce au dépôt de marqueurs moléculaires précolorés dans un puits de référence. Les

masses moléculaires des protéines étudiées sont déterminées en référence à ces marqueurs

moléculaires. L’électrotransfert sur membrane Immobilon Millipore est ensuite réalisé dans

un appareil de transfert semi-sec Semi-Phor (Hoeffer Scientific Instruments). Le transfert se

fait dans un système de « sandwich » imbibé de tampon de transfert (25mM de TrisHCl,

pH=8,3, 0,19 M de glycine, 20% de méthanol) par un courant électrique de 40 mA pendant

1h30. Le transfert effectué, les marqueurs de masse moléculaire sont également transférés et

peuvent servir de contrôle. La membrane est rincée par un tampon salin TBS-T (Tris-HCl

20mM, NaCl 137mM, pH=7,6, Tween 20 à 0,1%) puis saturée dans un bain TBS-T/BSA 1%

durant une nuit à 4°C. La membrane est ensuite rincée trois fois par du TBS-T durant 10 min,

puis incubée à température ambiante avec l'anticorps primaire dilué à la concentration voulue

pendant 1h. Elle est rincée 7 fois par du TBS-T puis incubée avec l'anticorps secondaire anti-

IgG couplé à la peroxydase. La membrane est soumise à une dernière série de lavages avant

révélation spécifique des protéines immunoréactives par chimiluminescence (kit ECL

Amersham).

III.2.7.1 Conditions spécifiques à chaque protéine détectée

- PLD1 et PLD2 (~120 KDa et ~90 KDa respectivement)

Le gel est à 8% de polyacrylamide, 0,1% de SDS et 4M d’urée. Les deux isoformes de

PLD sont détectées grâce à un anticorps anti-PLD1 ou anti-PLD2 (dilution 1/2000).

L’anticorps anti-PLD1 est dirigé contre des peptides correspondant aux résidus 1-16, 144-

162, 967-981, et 1027-1040 tandis que l’anticorps anti-PLD2 est dirigé contre une séquence

d’acides aminés située en N-terminal, les résidus 13-33. L’anticorps secondaire anti-lapin est

ensuite utilisé (dilution 1/5000). La saturation de la membrane s’effectue avec du lait à 10%

pendant 2 heures.

- Myogénine (~36 KDa)

Le gel est à 15 %. L’anticorps monoclonal anti-myogénine est dilué à 1/50 dans du

TBST-BSA 0,01 % et l’anticorps secondaire anti-IgG de souris est dilué au 1/10000.

Page 92: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

92

- RhoA ( 24 KDa)

Le gel est à 15 %. L’anticorps polyclonal anti-RhoA est dilué à 1/400 dans du TBST-

BSA 0,01 % et l’anticorps secondaire anti-lapin est dilué au 1/5000.

- Différentes isoformes de PKC

Le gel est à 10 %. Les anticorps monoclonaux anti-PKC-α, β1, γ, ι sont dilués à 1/500

dans du TBST-BSA 0,01 % et l’anticorps secondaire anti-IgG de souris est dilué au 1/10000.

- Tubuline (50 KDa)

Pour la normalisation, les membranes ont été «strippées» (décapées de leurs anticorps)

et ré-incubées avec l’anticorps monoclonal anti-tubuline-α dilué à 1/2000 dans du TBST-BSA

0,01 % et l’anticorps secondaire anti-IgG de souris dilué au 1/10000.

III.2.8 Mesure de l’activité PLD dans les cellules L6

Nous avons utilisé la propriété spécifique de la PLD, la transphosphatidylation.

L’emploi d’un alcool primaire comme le butanol-1 bloque la production du PA en faveur de

la formation du phosphatidylbutanol. Les cellules (15 x 104 cellules / boîte de 35 mm)

cultivées en présence de 10% de SVF, sont lavées avec du PBS et incubées pendant 2h dans

un milieu dépourvu de SVF, en présence de 2µCi/ml de [3H]-acide palmitique. Après deux

lavages avec du PBS, les cellules sont placées en milieu 1% BSA et traitées ou non, pendant

30 minutes, avec de l’AVP à 10-7 M ou du TPA à 1 et 100 nM en présence de 1% de butanol-

1. Dans certaines expériences la bréfeldine A (10 µg/ml) est apportée dans le milieu 1,5 h

avant ajout de l’AVP; dans d’autres, le TPA est ajouté au milieu de culture 24 h avant le

radio-marquage des cellules. Les incubations sont stoppées par élimination rapide du milieu,

lavage des cellules avec du PBS froid et addition de 0,5 ml de HCL 0,1 N dans du PBS. Les

cellules grattées sont transférées dans des tubes de verre bouchés à vis. Avant l'extraction

lipidique selon la technique de Bligh et Dyer (1959), de l'acide dipalmityl-phosphatidique

marqué au [14C] (144mCi/mmole) utilisé comme standard interne et du phosphatidylbutanol

(PBu) (1µg) utilisé comme entraîneur sont rajoutés dans chaque tube. Les lipides sont extraits

dans un mélange de solvants (méthanol/chloroforme 2/1 v/v) contenant 50 µM de

buthylhydroxytoluène (BHT) utilisé comme antioxydant. Les tubes sont vortexés durant 30

secondes. Après 30 minutes à température ambiante, un mélange de NaCl 0,15 M /

Page 93: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

93

chloroforme (1/1 v/v) est ajouté et les tubes sont vortexés pendant une minute. Les phases

organique et aqueuse sont séparées par centrifugation de 5 minutes à 2500 rpm. La phase

organique est prélevée et évaporée à sec sous azote. Les résidus secs sont repris par un

mélange chloroforme/méthanol (2/1 v/v) et déposés sur plaque de silice. Le PBu et l'acide

phosphatidique (PA) sont séparés des autres phospholipides par CCM bidimensionnelle. Le

premier système de solvant est un mélange chloroforme/méthanol/ammoniaque aqueux 28%

(65/35/5.5 v/v/v). Après séchage des plaques sous atmosphère réduite pendant 2h, un mélange

de PBu/PA standards est déposé. La seconde migration s'effectue dans un mélange acétate

d'éthyle/isooctane/acide acétique (90/50/20 v/v/v). Les plaques sont séchées et colorées au

bleu de Coomassie à 0.03% dans une solution de NaCl 0.9%/méthanol 20% pendant 20 min,

puis lavées par une solution de NaCl 0.9%/méthanol 20% pendant 10min. Chacun des spots

d'intérêt est gratté puis sa radioactivité est mesurée par comptage en scintillation liquide dans

un compteur Packard 1900TR. La quantité de PBu formé dans l'essai est exprimée en

pourcentage de la radioactivité liée aux phospholipides totaux, et corrigée par le rendement de

récupération de l’acide phosphatidique.

III.2.9 Traitement par l’exoenzyme C3 avec la méthode de « Scrape

loading »

Cette méthode est nécessaire pour faire pénétrer l’exoenzyme C3 de C.botulinum à

l’intérieur des cellules, la toxine n’ayant aucun effet lorsqu’elle est simplement ajoutée au

milieu de culture des cellules L6. Après vingt-quatre heures de culture en boîtes de 100 mm,

les cellules sont lavées deux fois par du PBS, puis par un tampon de grattage (114 mM KCl,

1mM NaCl, 5,5 mM MgCl2, 10 mM Tris-HCl, pH7,5), grattées avec précaution dans 0,5 ml

du même tampon, contenant ou non 5µg/ml d’exoenzyme C3, lavées dans le milieu de culture

et ré-ensemencées dans une boîte de 35 mm. Après 24h de culture, la PLD est dosée comme

précédemment.

III.2.10 Dosage du PIP2 néosynthétisé

Les cellules L6 cultivées dans des plaques de 6 puits sont lavées deux fois par du

milieu MEM sans phosphate et sans sérum et incubées avec 50µci/ml de 33P-Pi à 37°C. Après

10 min, les cellules sont traitées, ou pas, avec 1% butanol-1 ou butanol-2 pour encore 10 min.

Ensuite, on ajoute 1nM d’AVP pour 5 min, et la réaction est stoppée par addition de 1 ml de

Page 94: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

94

méthanol dans chaque puits. Les lipides sont extraits après acidification selon la méthode de

Bligh et Dyer (1959) et ensuite analysés par CCM monodimensionnelle. Les plaques de silice,

traitées par l’oxalate de potassium, sont développées dans un mélange de solvant: méthanol/

chloroforme/ammoniaque 28%/H2O (40/28/6/10 v/v/v/v), révélées par analyse au

Phosphorimager Storm afin de localiser le PIP2 marqué au P33. La radioactivité est ensuite

quantifiée par analyse des images digitales obtenues par Phosphorimager, à l’aide du logiciel

Image Quant.

III.2.11 Préparation des ARN

Les ARN totaux des cellules L6 sont extraits à l'aide du kit d'extraction Tri Reagent

(SIGMA). Les cellules récupérées dans du PBS-EDTA sont culottées à 1000 rpm à 4°C. Le

culot est repris dans 1ml de réactif Tri Reagent et les cellules sont homogénéisées par passage

dans une seringue. Les homogénats obtenus sont laissés 5 min à température ambiante pour

assurer une dissociation complète des complexes nucléoprotéiques. Ensuite, on ajoute 0,2ml

de chloroforme et on agite vigoureusement pendant 15 sec. Les échantillons sont laissés 15

min à température ambiante puis centrifugés à 12000g pendant 15 min à 4°C. Le mélange se

sépare alors en une phase organique rouge contenant les protéines, une interphase contenant

l'ADN et une phase aqueuse incolore contenant l'ARN. La phase aqueuse est transférée dans

un autre tube auquel on ajoute 0,5ml d'isopropanol. Le mélange est incubé 10 min à

température ambiante, centrifugé ensuite à 12000g pendant 10 min à 4°C. L'ARN précipité

forme un culot au fond du tube. Le surnageant est éliminé et le culot est lavé par 1ml

d'éthanol 75%. L'échantillon est de nouveau centrifugé à 7500g, le surnageant est éliminé et le

culot est séché à l'air, avant d'être repris dans un volume minimum d'eau stérile. La

quantification des ARN se réalise par lecture spectrophotométrique à la longueur d'onde de

260nm. Les ARN sont ensuite conservés à -80°C.

III.2.12 RT-PCR

III.2.12.1 Trancription inverse (RT)

A partir des ARN préparés comme décrit ci-dessus, l'ADN complémentaire est

transcrit à l'aide de la transcriptase inverse M-MLV (PROMEGA). La réaction se déroule en

deux étapes. La première est la dénaturation des ARN en présence des amorces oligo (dT).

Page 95: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

95

Dans un volume final de 16,5µl, 5µg d'ARN totaux sont incubés en présence de 500µM de

dNTP, 3,5µM d'oligo(dT), pendant 10 min à 70°C. Les tubes sont ensuite placés dans la glace

avant la deuxième étape de transcription. Dans le milieu de réaction sont alors ajoutés le

tampon concentré 10X (concentration finale: Tris-HCl 50mM, pH 8,3, 40mM KCl, 8mM

MgCl2, 1mM DTT), l'inhibiteur d'ARNase (1U/µl) ainsi que la transcriptase inverse (1U/µl).

Le tout est incubé 15 min à 25°C, puis 50 min à 42°C pour permettre la synthèse d’ADNc et

enfin 15 min à 70°C pour dénaturer les complexes ARN/ADNc.

III.2.12.2 Réaction en chaîne de la polymérase (PCR)

L'ADNc ainsi synthétisé sert de matrice à l'amplification des transcrits de PLD1,

PLD2 et β-actine par « Polymerase Chain Reaction » (PCR). Les amorces spécifiques pour

l'amplification des transcrits de PLD1 ont été préparées sur la base des séquences publiées

afin de pouvoir discriminer les isoformes rPLD1a et rPLD1b. Les amorces sens et antisens

sont: 5’- AGGACAGTCTCTGGGCTCTC -3’ et 5’- TGCCTTTCCGTGAACCACAG -3’

respectivement. Les amorces spécifiques pour l'amplification des transcrits de PLD2 ont été

préparées sur la base de la séquence publiée de rPLD2. Les amorces sens et antisens sont:

5’- TGAACAGGGGCAGTGTTTCC -3’ et 5’- AGGTCTGGCCAGGTATTTGC -3’

respectivement. Les transcrits de la β-actine ont été amplifiés en utilisant les amorces sens et

antisens5’- TCATGAAGTGTGACGTTGACATCCGT-3’ et 5’-CCTAGAAGCATTTGC

GGTGCACGATG –3’ respectivement. Dans un volume final de réaction de 50µl, on incube

5µl du milieu de réaction de la transcription inverse en présence de 200µM de dNTP, 0,4µM

de chaque amorce spécifique et 2 unité d'ADN polymérase Taq (Roche), dans un milieu

tamponné Tris-HCl 10mM, pH8,3, 50mM KCl, 1,5 mM MgCl2. Les conditions

d'amplification programmées sur le thermocycleur sont les suivantes: pour PLD1, 94°C

pendant 45 s, 54°C pendant 45 s et 72°C pendant 45 s, pendant 40 cycles; pour PLD2, 94°C

pendant 45 s, 56°C pendant 45 s et 72°C pendant 30 s, pendant 35 cycles; pour β-actine, 94°C

pendant 45 s, 65°C pendant 45 s et 72°C pendant 30 s, pendant 35 cycles.

III.2.12.3 Electrophorèse sur gel d'agarose des ADN

Les fragments d'ADN amplifiés par PCR sont ensuite analysés par électrophorèse sur

gel d'agarose 2%. Le gel est préparé extemporanément en diluant 1g d'agarose dans 50ml de

tampon TBE (Tris-Borate 90mM, pH8, EDTA 1mM). La solution est portée à ébullition, puis

refroidie avant ajout de 5µl d'une solution de bromure d'éthydium (BET) 10 mg/ml. La

solution encore tiède est coulée dans la cuve de migration horizontale et après

Page 96: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

96

refroidissement, le gel polymérise. Il est ensuite immergé dans le tampon de migration. Les

échantillons préparés dans une solution de dépôt (0,05% de bleu de bromophénol, 0,05% de

xylène cyanol et 6% de glycérol) sont déposés dans les puits du gel d’agarose. La migration

se fait de la cathode vers l’anode sous tension constante à raison d’environ 100 volts, et en

présence d’un marqueur de taille. La position des fragments d’ADN ayant fixé du bromure

d’éthidium (BET) est révélée sous lumière UV et le gel est photographié à l'aide d'une caméra

CCD (ImageMaster VDS-CL, AMERSHAM BIOTECH).

III.2.13 Construction des plasmides pEGFP-hPLD1, pEGFP-hPLD2

et pEGFP-PABD

III.2.13.1 Amplification des séquences d'ADN codantes pour hPLD1, hPLD2

et domaine de fixation de PA

Les plasmides pCDNA3 contenant la séquence complète codante pour hPLD1b, hPLD2, ou

cRaf-1, ont servi de matrice pour l'amplification des séquences d'ADN de PLD1, PLD2 ou du

domaine de fixation de PA (PABD) de cRaf-1, par PCR.

Les amorces spécifiques pour l'amplification de PLD1, préparées sur la base de la séquence

publiée de hPLD1, sont:

5’-AGGTCGACATGTCACTGAAAAACGAGCCAC-3’ : sens

5’-AGGTCGACTTAAGTCCAAACCTCCATGGGC-3’ : antisens

(les nucléotides soulignés correspondent au site de restriction Sal1 ajouté afin de permettre

l'insertion du gène PLD1 dans le plasmide pEGFP-C1).

Les amorces spécifiques pour l'amplification de PLD2, préparées sur la base de la séquence

publiée de hPLD2, sont:

5’-AGGAATTCGATGACGGCGACCCCTGAGAGC-3’ : sens

5’-AGGTCGACCTATGTCCACACTTCTAGGGG-3’ : antisens

(les nucléotides soulignés correspondent aux sites de restriction EcoRI et Sal1 ajoutés afin de

permettre l'insertion du gène PLD2 dans le plasmide pEGFP-C1).

Les amorces spécifiques pour l'amplification du domaine de fixation de PA, préparées sur la

base de la séquence publiée de cRaf-1 humain, sont:

5’-AGAGATCTTTCAGGAATGAGGTGGCTGT-3’

5’-AGGAATTCGCCCTCGCACCACTGGGTCA-3’

Page 97: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

97

(les nucléotides soulignés correspondent aux sites de restriction BglII et EcoRI ajoutés afin de

permettre l'insertion du domaine de fixation de PA dans le plasmide pEGFP-C1).

Dans un volume final de 100µl, on incube 1µg d’ADN plasmidique en présence de 200µM de

dNTP, 0,4µM de chaque amorce spécifique et 0,05U/µl d'ADN polymérase Taq « Expand

High Fidelity » (Roche), 10 µl de tampon 10X. Les conditions d'amplification programmées

sur le thermocycleur sont identiques pour PLD1 et PLD2 (94°C pendant 60 s, 52°C pendant

60 s et 72°C pendant 180 s, pendant 30 cycles). Pour amplier le domaine de fixation de PA,

les conditions utilisées sont les suivantes: (94°C pendant 45 s, 51°C pendant 45 s et 72°C

pendant 30 s, pendant 30 cycles).

III.2.13.2 Insertion des séquences amplifiées dans pEGFP-C1

Les séquences amplifiées par PCR sont analysées par électrophorèse sur gel d'agarose. Le gel

est visionné sous lampe UV et les bandes correspondant aux séquences de PLD1 et PLD2

sont découpées dans le gel et placées à 4°C. L'ADN amplifié est ensuite purifié à l'aide du kit

d'extraction Qiaquick gel (Qiagen). Comme décrit dans le protocole du kit, un volume de gel

est dissous dans 3 volumes de tampon QG et incubé 10 min à 50°C. Après dissolution totale

du gel, 1 volume d'isopropanol est ajouté. La totalité du volume est déposé sur une colonne

QIAquick et centrifugé 1 min. L'ADN est alors fixé sur la colonne et le filtrat est éliminé. La

colonne est lavée par 0,75ml de tampon PE afin d'éliminer toute trace d'agarose de la colonne.

L'ADN est élué du support par 50µl d'eau stérile par centrifugation.

A ce stade les séquences d'ADN de PLD1, PLD2, et du domaine de fixation de PA, amplifiées

grâce aux amorces décrites dans le paragraphe III.13.1 puis purifiées, possèdent à chacune de

leurs extrémités les sites de restriction introduits. Afin d'ouvrir ces sites, les séquences d'ADN

sont soumises à une digestion par les enzymes de restriction correspondantes. Parallèlement,

le plasmide pEGFP-C1 est ouvert dans les mêmes conditions et puis déphosphorylé par une

phosphatase alcaline. On réalise ensuite une ligation des séquences de PLD1, PLD2 ou

domaine de fixation de PA avec le plasmide pEGFP-C1 ouvert (Rapid DNA Ligation Kit,

Roche). Dans un volume final de 10µl, sont incubés 50 ng de plasmide avec 50 ng d'insert, en

présence de 1UI d'ADN ligase T4, 1µl tampon de dilution et 1µl de tampon de réaction 2X

pendant 30 min à température ambiante. La réaction est arrêtée par le froid à 4°C.

III.2.13.3 Transformation des bactéries

III.2.13.3.1 Compétence des bactéries

Page 98: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

98

Des bactéries DH5α sont rendues compétentes afin de pouvoir être transformées avec les

plasmides préparés précédemment. L'ensemble des manipulations est réalisé à 4°C. Les

colonies de bactéries DH5α, isolées sur boîte de Petri, sont ensemencées dans 50ml de milieu

de culture BL. L'ensemble est incubé à 37°C pendant environ 3h sous agitation. Lorsque la

DO atteint 0,4 à 600 nm, la culture bactérienne est centrifugée à 3000rpm pendant 10 min. Le

culot est repris par 5ml de solution de CaCl2 0,1M et laissé 10 min dans la glace, puis la

solution est centrifugée à 3000 rpm pendant 10 min. Le culot bactérien est de nouveau repris

par 5ml de solution de CaCl2 0,1M et de nouveau centrifugé. Le culot bactérien final est

repris dans une solution de CaCl2 0,1M contenant 15% de glycérol. La suspension de

bactéries compétentes obtenue est divisée en aliquotes de 100µl et congelée à -80°C.

III.2.13.3.2 Transformation des bactéries compétentes

On ajoute 2µl du milieu de la ligation (paragraphe III.13.2) à 100µl de suspension de bactéries

compétentes fraîchement décongelées. Les bactéries sont incubées 30 min dans la glace avant

de leur faire un choc thermique à 42°C pendant 90 sec. Les bactéries sont ensuite remises

dans la glace pendant 5 min, on leur ajoute alors 1ml de milieu BL et on les incube à 37°C

pendant 1h. Après centrifugation, le culot de bactéries est repris dans 100µl de milieu BL puis

étalé sur boîte de Petri GL contenant de la kanamycine. Les bactéries non transformées par les

plasmides pEGFP-hPLD1b, pEGFP-hPLD2 ou pEGFP-PABD ne porteront pas la résistance à

la kanamycine et ne pourront donc pas pousser sur les boîtes.

III.2.14 Mutagénèse dirigée

Nous avons construit par mutagénèse dirigée une sonde mutée, dépourvue d’affinité pour le

PA, en substituant deux arginines (R398 et R401) par des alanines. Cette mutagénèse dirigée

a été effectuée à l’aide du kit « QuikChangeTM Site-Directed Mutagenesis kit » de Stratagene.

Il utilise un couple d’oligonucléotides complémentaires, longs d’une quarantaine de bases, qui

portent la mutation en leur milieu. Le principe est très semblable à celui de la PCR avec

quelques modifications: un cycle long de polymérisation avec l’ADN polymérase « Pfu

turbo » permet la reconstitution d’un plasmide muté, entier, double brin et circulaire. L’ADN

parental est ensuite digéré par l’enzyme de restriction DpnI, spécifique des ADN méthylés

produits in vivo, alors que le plasmide muté synthétique est conservé. Les bactéries

compétentes transformées par le plasmide muté, assurent l’amplification de ce nouveau

plasmide (Figure 16). Dans un volume final de 50 µl, on incube 10 ng d’ADN plasmidique

Page 99: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

99

parental (pEGFP-PABD) en présence de 200µM de dNTP, 125 ng des amorces sens et anti-

sens qui portent la mutation, 2,5 UI de Pfu turbo et 5 µl de tampon 10X. Les conditions

d'amplification programmées sur le thermocycleur sont: un cycle de 95°C pendant 30 sec

suivi de 16 cycles (95°C pendant 30 sec; 78°C pendant 60 sec; 68°C pendant 5 min). Ensuite,

on met les échantillons dans la glace jusqu’à que la température atteigne ~37°C et on ajoute

10 UI de l’enzyme DpnI. Enfin, on remet les échantillons dans le thermocycleur à 37°C

pendant 1h.

Figure 16: Principe de la méthode de mutagénèse dirigée avec le kit QuickChange Stratagene.

Page 100: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

100

IV RESULTATS

IV.1 Activation de la PLD par les inducteurs myogéniques

IV.1.1 Activation de la PLD par l’AVP via ARF, PKC et Rho

Il a été montré que l’hormone neuro-hypophysaire arg8-vasopressine (AVP), un

puissant inducteur de la différenciation myogénique, déclenche précocément l’activation des

voies de la PIP2-phospholipase C (PLC) et de la phospholipase D (PLD) dans les myoblastes

L6. De manière intéressante, la réponse myogénique peut intervenir pour des concentrations

nanomolaires d’AVP, auxquelles seule la PLD, et non la PLC, est activée (Naro et al., 1996).

Nous avons mesuré l’activité PLD en nous basant sur sa propriété de transphosphatidylation

et en mesurant la radioactivité du phopsphatidylbutanol formé, comme décrit dans Matériels

et Méthodes. En accord avec la littérature, nous avons observé une forte activation de la PLD

dans les cellules L6 dès 1 min de traitement par l’AVP; l'activité atteint un plateau à 5 min et

reste stable jusqu’à 30 min de traitement (non montré). Dans de nombreux systèmes

cellulaires, l’activité PLD est régulée par les petites protéines G Rho et ARF, ainsi que par les

PKCs.

Afin de déterminer les voies de stimulation de la PLD par l’AVP dans les cellules L6, nous

avons tout d’abord utilisé un inhibiteur spécifique de la protéine ARF, la bréfeldine A (BFA),

qui inhibe l'échange GDP/GTP au niveau de la protéine. Lorsque les cellules sont traitées

avec cet inhibiteur utilisé à une concentration de 10µg/ml, l'activation de la PLD induite par

l’AVP est diminuée de 46% (Figure 17). Ceci suggère donc que ARF est partiellement

impliquée dans l'activation de la PLD par l’AVP dans les cellules L6. Ensuite, nous avons

réalisé des expériences de rétrocontrôle négatif ou « down-régulation » des PKCs. Le

traitement prolongé des cellules par un ester de phorbol tel que le TPA inactive les PKCs.

Dans les cellules prétraitées pendant 24h avec 100nM de TPA, l'activation de la PLD par

l’AVP n’est que faiblement inhibée (-29%), ce qui suggère un rôle restreint des PKC (Figure

17).

Page 101: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

101

Figure 17 : Effet de la bréfeldine A et de la « down-régulation » des PKC sur l'activation de la PLD par AVP.

Les cellules ont été incubées en absence ou présence de 100nM de TPA pendant 24h (pré-traitement

avec TPA). Les cellules ont ensuite été radiomarquées avec de l'acide [3H]-palmitique pendant 2h,

puis ont été lavées et traitées, ou non, par la Bréfeldine A (10µg/ml) pendant 1,5h avant la stimulation

par l’AVP (10-7M) pendant 30 min en présence de 1% de butanol-1. La réaction est arrêtée par

extraction puis les phospholipides sont fractionnés par CCM. La radioactivité associée au

phosphatidylbutanol est exprimée en % de la radioactivité associée aux PL totaux. Les résultats

représentent la moyenne ± SEM de 3 expériences indépendantes. Les résultats sont analysés par

ANOVA et les moyennes sont comparées par un test de t protégé. * significativement différent des

cellules traitées avec de l’AVP seule p<0.05, ** p<0,01.

Page 102: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

102

Pour rechercher l’implication de Rho dans la stimulation de la PLD par AVP, nous avons

évalué par Western-blotting l’effet de l’AVP sur l’activation de Rho c.à.d sur la translocation

de Rho du cytosol (fraction soluble) où elle est sous forme inactive, vers la fraction

particulaire insoluble où elle est sous sa forme active liée au GTP. Nous avons pu observer

une activation rapide de Rho dès 1 min de traitement par l’AVP (Figure 18).

Figure 18 : Effet de l’AVP sur la translocation de la protéine RhoA vers la fraction insoluble.

Les myoblastes L6 ont été cultivés en absence de serum et en présence de 1% BSA pendant 3h avant

leur traitement, ou non, par l’AVP pendant 1 minute. Les cellules ont été lysées et la fraction

particulaire séparée de la fraction cytosolique par ultracentrifugation à 100000g pendant 1h. Les

protéines (30µg) ont été analysées par Western-blotting avec un anticorps polyclonal anti-RhoA. Afin

de normaliser, les membranes ont étédécapées et révélées à nouveau par un anticorps anti-tubuline-α;

nous avons ainsi vérifié l'égalité des dépôts de protéines dans les divers puits.

Nous avons ensuite procédé à l’inactivation de la protéine Rho par un traitement des cellules

avec l’exoenzyme C3 de C.botulinum. Ce traitement induit la suppression quasi totale de

Page 103: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

103

l’activation de la PLD par l’AVP (-74%), suggérant qu’elle est majoritairement Rho-

dépendante dans les cellules L6 (Figure 19).

Figure 19 : Effet de l’exoenzyme C3 sur l’activation de la PLD par l’AVP.

Selon la méthode de « scrape loading » décrite dans la partie Matériels et Méthodes, les cellules

récupérées dans 0,5 ml du tampon de grattage contenant ou pas l’exoenzyme C3 à 5µg/ml ont été

resuspendues et mises en culture 24h dans 10% de serum. Ensuite, les cellules ont été marquées puis

traitées ou non avec de l’AVP 10-7M pendant 30 min en présence de butanol-1 1% et l’activité PLD a

été mesurée. Les résultats représentent la moyenne ± SEM de 3 expériences indépendantes. Les

résultats sont analysés par ANOVA et les moyennes sont comparées par un test de t protégé. *** :

significativement différent des cellules non traitées avec l’exoenzyme p<0.0001.

Ces observations se sont avérées essentielles pour la suite des travaux, car la protéine

Rho est considérée comme un acteur important de la différenciation myogénique. Du fait que

l’AVP, un inducteur myogénique, active la PLD majoritairement via Rho, nous pouvons

suggérer que la PLD pourrait être impliquée dans la différenciation des cellules L6.

- C3 + C3

Page 104: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

104

IV.1.2 Activation de la PLD par le TPA via PKC

IV.1.2.1 Le TPA, à une faible concentration, induit la différenciation

myogénique

La PLD des L6 peut aussi être activée sous l’effet de la stimulation des PKC par l’

ester de phorbol TPA (Thompson et al., 1994). Nous avons cherché à déterminer si cette

activation s’accompagne d’une différenciation myogénique. Pour ceci, Nous avons traité les

cellules L6 quiescentes, cultivées dans un milieu dépourvu de sérum et contenant 1% de BSA,

avec du TPA utilisé à deux doses différentes (1 nM et 100 nM). Ensuite, nous avons étudié

l’effet de ces traitements sur une étape précoce de la différenciation qui consiste en

l’expression ainsi que l’accumulation nucléaire d’un facteur de transcription spécifique du

muscle, la myogénine. De manière intéressante, nous avons observé par Western-blotting que

le TPA utilisé à une faible dose (1 nM) induit l’expression de la myogénine de manière

similaire à l’AVP (utilisée comme contrôle positif montrant l’engagement des cellules dans la

différenciation). Au contraire, le TPA utilisé à une forte dose (100 nM) n’induit pas

l’expression de la myogénine (Figure 20). De plus, nous avons cherché à déterminer l’effet de

l’addition du TPA sur l’expression de la myogénine induite par l’AVP. Alors que le TPA

utilisé à 1 nM ne modifie pas l’effet de l’AVP, le TPA utilisé à 100 nM supprime totalement

la réponse myogénique induite par l’AVP (Figure 20).

Nous avons aussi évalué la différenciation myogénique en cherchant l’accumulation

nucléaire de la myogénine par immunofluorescence. Nous avons estimé le pourcentage de

noyaux myogénine-positifs par rapport aux noyaux totaux des cellules traitées. Ces

expériences montrent que le TPA à la concentration de 1nM, mais pas à celle de 100 nM,

induit une accumulation nucléaire de la myogénine similaire à celle induite par l’AVP (39%

des noyaux myogénine-positifs dans le premier cas, 38% dans le deuxième cas).

De plus, le TPA (100 nM) inhibe presque totalement l’accumulation nucléaire de la

myogénine induite par l’AVP. (Figure 21).

Page 105: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

105

Figure 20 : Effet de deux doses différentes de TPA sur l’expression de la myogénine.

Les cellules ont été traitées, ou non, avec de l’AVP 10-7M, avec du TPA (1nM ou 100 nM) ou

conjointement avec les deux. Elles ont ensuite été homogénéisées dans un tampon hypotonique et les

extraits cellulaires ont été analysés par Western-blotting avec un anticorps monoclonal anti-

myogénine. Les spots sont quantifiés par vidéodensitométrie et les résultats sont exprimés en unités

arbitraires après normalisation avec la tubuline. Ils représentent la moyenne ± SEM de 3 expériences

indépendantes

Toutes ces observations nous amènent à conclure que le TPA à 1 nM est capable par lui-

même, indépendamment des facteurs sériques, d'induire la réponse myogénique des

myoblastes L6. Par contre, utilisé à une forte dose (100 nM), le TPA est un inhibiteur de la

différenciation des cellules L6.

Page 106: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

106

Figure 21 : Effet de deux doses différentes de TPA sur l’accumulation nucléaire de la myogénine.

Les cellules ont été traitées, ou non, avec de l’AVP 10-7M, avec du TPA (1nM ou 100 nM) ou

conjointement avec les deux. Les cellules ont ensuite été fixées, perméabilisées puis incubées avec

l’anticorps primaire monoclonal anti-myogénine et l’anticorps secondaire FITC anti-souris qui

permet la révélation par fluorescence au microscope. Le diagramme à droite représente le

pourcentage moyen des noyaux myogénine-positifs par rapport aux noyaux totaux, déterminé dans 5

champs différents.

IV.1.2.2 La régulation de l’activité PLD par le TPA est dose-dépendante

Nous avons ensuite mesuré l’activité de la PLD dans les cellules L6 intactes traitées

avec les deux doses de TPA, 1nM et 100 nM (Figure 23). Le TPA stimule fortement l’activité

de la PLD, de l’ordre de 14,7 fois quand il est utilisé à 100 nM, et de l’ordre de 8,6 fois

AVP +TPA 1nM

AVP +TPA

100 nM

Page 107: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

107

lorsqu’il est utilisé à 1 nM. Par ailleurs, nous avons remarqué que le TPA (1nM) stimule la

phospholipase D de manière similaire à l’AVP (Figure 23).

Figure 22 : Cinétique d’activation de la PLD par 1 et 100 nM TPA.

Pour les temps longs (4 à 20h) les cellules ont été incubées le temps indiqué avec 1 ou 100 nM de

TPA, puis ont été radiomarquées avec de l'acide [3H]-palmitique, et la PLD a été dosée comme

précédemment indiqué. Pour les temps courts (15 min à 2h), les cellules préalablement radiomarquées

ont été traitées avec les deux doses de TPA pendant le temps indiqué, en présence de butanol-1 1%

pendant les trente dernières minutes, et le phosphatidylbutanol a été quantifié comme précedemment

indiqué.

Nous avons évalué les cinétiques de l’activation de la PLD par les deux doses de TPA.

L’activation de la PLD par le TPA (1 nM et 100 nM) est maximale à 30-60 min et diminue

progressivement pour arriver au niveau basal après 20h de traitement (Figure 22).

Etant donné qu’il n’y a pas de différence entre les deux cinétiques, nous avons recherché

l’effet d’une restimulation des cellules L6 par les même doses de TPA, après un traitement

prolongé de 24h avec 1 et 100 nM de TPA. Cette fois-ci, nous avons observé un effet

Temps (heures)

PBut

(% d

es p

hosp

holip

ides

)

Page 108: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

108

différent sur l’activité de la PLD, en fonction de la dose utilisée. Le TPA à 1 nM peut

restimuler l’activité de la PLD alors que le TPA à 100 nM n’a aucun effet (Figure 23).

Figure 23 : Effet sur l’activité PLD du retraitement des cellules par le TPA après un traitement prolongé.

Les cellules ont été incubées en absence ou en présence de 1 ou de 100nM de TPA pendant 24h (pré-

traitement avec TPA). Les cellules ont ensuite été radiomarquées avec de l'acide [3H]-palmitique

pendant 2h, puis ont été lavées et stimulées, ou non (Ctrl), avec de l’AVP (10-7M) ou du TPA (1 ou

100 nM) pendant 30 min en présence de butanol-1 1%. La réaction est arrêtée par extraction puis les

phospholipides sont fractionnés par CCM. La radioactivité associée au phosphatidylbutanol est

exprimée en % de la radioactivité associée aux PL totaux. Les résultats représentent la moyenne ±

SEM de 3ou 4 expériences indépendantes.

Page 109: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

109

Ces observations suggèrent que les effecteurs de la PLD, probablement les PKCs, sont

« down-régulés » après un traitement de 24h avec 100 nM de TPA, mais pas avec 1 nM de

TPA.

Figure 24 : Effet d’un traitement prolongé par 1 ou 100 nM de TPA sur « la down-régulation » des PKCs.

Après un traitement prolongé de 24h par le TPA à 1 ou 100 nM, les myoblastes L6 ont été lysés et la

fraction particulaire a été séparée de la fraction cytosolique par ultracentrifugation à 100000g

pendant 1h. Les protéines ont été analysées par Western-blotting avec des anticorps monoclonaux

anti-PKC-α, β1, γ, ι.

Page 110: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

110

Pour vérifier cette hypothèse, nous avons réalisé des expériences de Western-blotting pour

quantifier les isoformes de PKC dans les fractions particulaires et cytosoliques des cellules L6

traitées avec 1 nM et 100 nM de TPA. La quantité des PKCα et PKCγ est fortement diminuée

dans les deux fractions après 24h de traitement avec 100 nM de TPA alors que la quantité des

PKCβ1 et PKCι ne change pas. Par contre, un traitement prolongé avec 1 nM de TPA ne

down-régule aucune des isoformes de PKC (Figure 24).

De tous ces résultats nous avons pu conclure que le TPA, à une concentration de

l’ordre de 1 nM, suffisante pour induire une activation soutenue de PLD sans provoquer de

down-régulation des PKCα et PKCγ, est capable d’induire une différenciation complète des

myoblastes L6 en myotubes. A l’inverse, à forte concentration, le TPA qui induit une

activation importante mais transitoire de PLD, n’induit pas la différenciation et même inhibe

l’effet myogénique de l’AVP. Ces résultats confirment que l’activation de la PLD, à condition

que la PKC ne soit pas down-régulée, corrèle avec la différenciation.

IV.2 L’activité PLD est nécessaire à la différenciation myogénique

Pour rechercher une éventuelle implication de l’activité PLD dans le processus

myogénique, nous avons soit partiellement inhibé l’enzyme en traitant les cellules L6 avec la

BFA, soit inhibé la formation de son produit l’acide phosphatidique en utilisant le butanol-1,

qui en tant qu’alcool primaire détourne l’activité de la PLD vers la production du

phosphatidylbutanol au détriment du PA. Nous avons étudié l’effet de ces traitements sur la

différenciation myogénique induite par l’AVP en évaluant l’expression de la myogénine par

Western-botting. Nous avons observé que les deux traitements inhibent significativement

l’expression de la myogénine induite après 24h de traitement par l’AVP. Cette inhibition est

de l’ordre de 67% pour la BFA et de 60% pour le butanol-1. L’adjonction d’un alcool

secondaire, le butanol-2, qui n’est pas un substrat de la PLD et qui est considéré comme

contrôle pour évaluer d’éventuels effets aspécifiques de butanol-1, n’a pas d’effet inhibiteur

sur l’expression de la myogénine. (Figure 25).

Page 111: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

111

Figure 25 Effet de l’inhibition de la production de PA sur l’expression de la myogénine induite par AVP..

Les cellules ont été traitées, ou non, avec de l’AVP 10-7M seule ou en présence de 10µg/ml de

bréfeldine A, de 0,5% butanol-1 ou de 0,5% butanol-2 (utilisé comme contrôle) pendant 24 h. Elles

ont ensuite été homogénéisées dans un tampon hypotonique et les extraits cellulaires ont été analysés

par Western-blotting avec un anticorps monoclonal anti-myogénine. Les spots sont quantifiés par

vidéodensitométrie et les résultats sont exprimés en unités arbitraires après normalisation avec la

tubuline. Ils représentent la moyenne ± SEM de 3 expériences indépendantes. Les résultats sont

ensuite analysés par ANOVA et les moyennes sont comparées par un test de t protégé. * :

significativement différent des cellules traitées avec l’AVP seule, p<0.01.

Myogénine

C AVP AVP+ AVP+ BuOH-1 BuOH-2

AVP+BFA AVP BFA C

Page 112: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

112

De plus, nous avons étudié l’effet de l’inhibition de la PLD par la BFA et le butanol-1 sur

l’accumulation nucléaire de la myogénine induite par AVP, par immunofluorescence. Nous

avons évalué le pourcentage de noyaux myogénine-positifs par rapport aux noyaux totaux des

cellules traitées. La BFA inhibe totalement l’accumulation nucléaire de la myogénine. Le

butanol-1 inhibe le pourcentage de noyaux myogénine-positifs de 72% alors que le butanol-2

n’a qu’un faible effet (-14%) (Figure 26).

En parallèle, nous avons recherché si l’activité PLD est aussi impliquée dans la

différenciation myogénique induite par 1 nM de TPA. Nous avons alors traité les cellules L6

avec 1 nM de TPA en présence de butanol-1, et observé également que l’inhibition de la

formation de l’acide phosphatidique empêche la différenciation myogénique induite par le

TPA. En effet, nous avons observé une inhibition totale par le butanol-1 de l’accumulation

nucléaire de la myogénine induite par le TPA alors que le butanol-2 n’inhibe cette réponse de

TPA que de 25% (Figure 27).

L’un des marqueurs tardifs de la différenciation terminale des myoblastes L6 est

l’expression de la myosine sarcomérique dans les myotubes formés après un traitement par

l’AVP de plusieurs jours. Pour vérifier l’effet de l’inhibition de la production de l’acide

phosphatidique sur la différenciation terminale des myoblastes L6, nous avons laissé les

cellules traitées avec l’AVP en culture pendant 9 jours, en présence ou en absence de butanol-

1 et butanol-2. Les cellules contrôles, traitées avec l’AVP, fusionnent et donnent naissance à

des myotubes polynucléés exprimant la myosine sarcomérique détectée par

immunofluorescence. L’addition du butanol-1 empêche totalement la formation des myotubes

même si un très faible pourcentage de cellules arrivent à exprimer la myosine. Le butanol-2

n’a pas d’effet inhibiteur ni sur la formation des myotubes, ni sur l‘expression de la myosine

sarcomérique (Figure 28).

Page 113: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

113

Figure 26 : Effet de l’inhibition de la production de PA sur l’accumulation nucléaire de la myogénine induite par AVP.

Les cellules ont été traitées, ou non, avec de l’AVP 10-7M seule ou en présence de 10µg/ml de

bréfeldine A, de 0,5% butanol-1 ou de 0,5% butanol-2 (utilisé comme contrôle) pendant 24 h. Les

cellules ont ensuite été fixées, perméabilisées puis incubées avec l’anticorps primaire monoclonal

anti-myogénine et l’anticorps secondaire FITC anti-souris qui permet la révélation par fluorescence

au microscope. Le diagramme du bas représente le pourcentage moyen des noyaux myogénine-positifs

par rapport aux noyaux totaux, déterminé dans 5 à 9 champs différents. Les résultats sont ensuite

analysés par ANOVA et les moyennes sont comparées par un test de t protégé. * : significativement

différent des cellules traitées avec l’AVP seule, p<0.01.

Page 114: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

114

Figure 27 : Effet de l’inhibition de la production de PA sur l’accumulation nucléaire de la myogénine induite par 1 nM de TPA.

Les cellules ont été traitées, ou non, avec du TPA 1 nM seul ou en présence de 0,5% butanol-1 ou de

0,5% butanol-2 (utilisé comme contrôle) pendant 24 h. Les cellules ont ensuite été fixées,

perméabilisées puis incubées avec l’anticorps primaire monoclonal anti-myogénine et l’anticorps

secondaire rhodamine anti-souris qui permet la révélation par fluorescence au microscope. Le

diagramme du bas représente le pourcentage moyen des noyaux myogénine-positifs par rapport aux

noyaux totaux, déterminé dans 10 champs différents.

Page 115: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

115

Figure 28 : Effet de l’inhibition de la production de PA sur la formation des myotubes induite par AVP.

Les cellules L6 ont été cultivées pendant 9 jours en absence (C) ou en présence d’AVP (10-7M) seule,

ou additionnée de 0,5% butanol-1 ou de butanol-2. Les cellules ont ensuite été fixées, perméabilisées

puis incubées avec l’anticorps primaire monoclonal anti-myosine sarcomérique et l’anticorps

secondaire rhodamine anti-souris qui permet la révélation par fluorescence au microscope. Les

noyaux sont marqués en bleu par le DAPI.

De tous ces résultats, nous pouvons conclure que la PLD et son produit, l’acide

phosphatidique sont impliqués positivement dans la différenciation myogénique évaluée aussi

bien sur des critères précoces (expression et accumulation nucléaire de la myogénine), que

des critères terminaux (fusion des myoblastes et expression de la myosine sarcomérique).

Page 116: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

116

IV.3 La PLD1 est impliquée positivement dans la différenciation

myogénique

Pour confirmer l’implication de la PLD dans la différenciation myogénique, nous avons

étudié l’effet de la surexpression des isoformes PLD1 et PLD2 sur ce processus. Pour cela,

nous avons transfecté les myoblastes L6 avec le plasmide pCDNA3, vide ou codant la PLD1b

ou la PLD2, étiquetées par l’hémaglutinine (HA). Afin d’estimer le taux de transfection, nous

avons cotransfecté les cellules avec des plasmides pEGFP-C1, codant pour la protéine à

fluorescence verte (GFP), et évalué le pourcentage de cellules à fluorescence verte. Nous

avons trouvé une même efficacité de transfection pour les trois plamisdes pCDNA3 (vide,

PLD1b et PLD2). Ensuite, nous avons traité les cellules transfectées avec ou sans AVP

pendant 24h et évalué leur capacité à accumuler la myogénine dans les noyaux par

immunofluorescence. Nous avons évalué le pourcentage de noyaux myogénine-positifs par

rapport aux noyaux totaux des cellules (Figure 29). En absence d’AVP, les cellules témoins

transfectées avec le pCDNA3 vide ainsi que celles transfectées avec le pCDNA3-PLD2 ne

présentent que 1% de noyaux myogénine-positifs, alors que les cellules transfectées avec le

pCDNA3-PLD1 présentent 6,8% de noyaux myogénine-positifs, reflétant l’engagement d’un

certain pourcentages de cellules dans la différenciation. Il est à signaler que le taux de

transfection apparent est relativement faible (~13%) et que le fait que nous ayons quand

même pu observer un effet significatif de la transfection de PLD1 sur la réponse myogénique

suggére qu’elle joue un rôle très important dans ce processus. De plus, en présence d’AVP,

les cellules témoins transfectées avec le pCDNA3 vide présentent 17,3% de noyaux

myogénine-positifs et la surexpression de la PLD1 potentialise l’effet de l’AVP, augmentant

de 62% la proportion des cellules présentant des noyaux myogénine-positifs par rapport aux

cellules témoins. Au contraire, la surexpression de la PLD2 a un effet négatif et diminue de

42% la proportion des cellules myogénine-positives. L’activité PLD des cellules transfectées

dans les mêmes conditions que précédemment a également été mesurée. Une augmentation de

l'ordre de 74 % et 44 % est observée pour les cellules transfectées avec les plasmides

pCDNA3-hPLD1b et pCDNA3-hPLD2 respectivement. Ainsi une augmentation sensible de

l'activité PLD cellulaire a été obtenue malgré le faible taux de transfection. Ceci montre donc

bien que les plasmides pCDNA3-hPLD1b et pCDNA3-hPLD2 permettent d'exprimer des

protéines PLD1 et PLD2 fonctionnelles.

Page 117: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

117

Figure 29 : Effet de la surexpression de deux isoformes de PLD (PLD1b et PLD2) sur l’accumulation nucléaire de la myogénine.

Les cellules L6 ont été transfectées transitoirement pendant 18h avec les vecteurs pCDNA3 vide,

pCDNA3-PLD1b, ou pCDNA3-PLD2. Les cellules ont ensuite été traitées, ou non, avec de l’AVP

pendant 24h puis fixées, perméabilisées et incubées avec l’anticorps primaire monoclonal anti-

myogénine et l’anticorps secondaire rhodamine anti-souris qui permet la révélation par fluorescence

au microscope. Le diagramme du bas représente le pourcentage moyen des noyaux myogénine-

positifs par rapport aux noyaux totaux, déterminé dans 10 champs différents. Les résultats ont été

analysés par ANOVA et les moyennes comparées par un test de t protégé. ** : significativement

différent des cellules transfectées avec le vecteur vide, p<0.0001.

Page 118: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

118

Tous ces résultats confirment l’implication positive de la PLD, et spécifiquement de la

PLD1b, dans la différenciation myogénique des myoblastes L6. Par contre, la PLD2 semble

avoir un effet négatif sur la réponse myogénique.

IV.4 La PLD1 est sélectivement down-régulée au cours de la

différenciation

IV.4.1 Au niveau des ARNm

Etant donné que les deux isoformes PLD1 et PLD2 ont un rôle diffférent dans la

différenciation myogénique, nous avons cherché à déterminer leur profil d’expression au

niveau des ARNm dans les myoblastes indifférenciés proliféralifs ou quiescents et dans les

cellules engagées dans la différenciation après un traitement par l’AVP de 2 jusqu’à 8 jours.

L'expression des ARNm de PLD1 et PLD2 a été recherchée par des expériences de RT-PCR à

partir des ARN totaux des cellules L6. Des couples d'amorces spécifiques de chaque isoforme

ont été choisis à partir des séquences publiées de la rPLD1 et de la rPLD2. Le couple

d'amorces spécifiques de PLD1 entoure la délétion présente chez PLD1b, permettant ainsi de

révéler simultanément la présence de deux variants d’épissage PLD1a et PLD1b. La séquence

de PLD2 à amplifier a été choisie dans une région non homologue à PLD1. Nous avons aussi

utilisé un couple d’amorces spécifiques de l’actine-β pour pouvoir normaliser. Dans la RT-

PCR réalisée avec les amorces spécifiques de PLD1, nous avons obtenu deux bandes d'ADN

amplifié, de 437 et 554 pb correspondant respectivement aux deux variants rPLD1a et

rPLD1b. Pour rPLD2, nous avons obtenu une bande de 488 pb correspondant au fragment

attendu (Figure 30). L’expression des rPLD1a et rPLD1b au niveau des ARNm est la même

dans les cellules prolifératives, quiescentes, et les cellules engagées dans la différenciation

après deux jours de traitement par l’AVP. Par contre, les ARNm de ces deux variants rPLD1a

et rPLD1b sont down-régulés à partir du jour 4 de la différenciation et deviennent presque

indétectables dans les myotubes différenciées par un traitement de six et huit jours en

présence d’AVP. Au contraire, l’ARNm de la rPLD2 reste exprimé à un niveau constant au

cours de la différenciation myogénique (Figure 30).

Donc nous avons pu montrer que les myoblastes L6 expriment les deux isoformes PLD1 et

PLD2 et que leur expression varie différemment au cours de la différenciation.

Page 119: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

119

IV.4.2 Au niveau des protéines

Afin de confirmer l’expression des diverses isoformes de PLD au niveau des protéines, nous

avons réalisé des expériences de Western-blotting sur des extraits de cellules L6 quiescentes,

prolifératives ou différenciées, soit par un traitement de huit jours en présence d’AVP, soit par

une diminution du pourcentage du sérum dans le milieu de culture (Figure 31).

Figure 30 : Recherche de l’expression des PLD par RT-PCR au cours de la différenciation myogénique induite par AVP.

Les ARN totaux extrait de cellules L6 cultivées de 0 à 8 jours dans un milieu dépourvu de serum et

contenant 1% BSA en absence (Ctrl) ou en présence d’AVP (10-7M) ont été soumis à une transcription

inverse. Les ADNc ainsi obtenus ont été amplifiés par PCR avec des couples d’amorces spécifiques de

PLD1, PLD2 et actine-β (utilisée pour normalisation). Les résultats sont représentatifs de 3

expériences indépendantes.

Nous avons ensuite fait des analyses densitométriques pour la quantification des bandes

obtenues. Ces expériences montrent clairement la présence des protéines PLD1 et PLD2 dans

les myoblastes L6. Dans les cellules différenciées par un traitement de huit jours en présence

d’AVP, la quantité de la protéine PLD1 est réduite de 60% par rapport aux cellules

quiescentes. De manière similaire, les cellules différenciées par réduction du pourcentage de

sérum à 1% dans le milieu de culture expriment seulement 42% de la quantité de la protéine

PLD1 par rapport aux myoblastes en prolifération, cultivés en présence de 10% de sérum.

Page 120: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

120

Cette dernière observation montre que la down-régulaion de la PLD1 est liée au processus de

la différenciation, lui-même, et qu’elle n’est pas restreinte à l’effet de l’AVP. Concernant la

quantité de la protéine PLD2, nous n’avons pas observé de variation durant la différenciation

cellulaire (Figure 31).

Figure 31 : Recherche de l’expression des PLD par Western-Blotting dans les cellules L6 non différenciées ou différenciées en myotubes.

Les cellules sont cultivées pendant huit jours, soit dans un milieu dépourvu de sérum et contenant 1%

de BSA en présence, ou non, de l’AVP 10-7M, soit dans un milieu contenant 1% ou 10% de SVF. Elles

ont ensuite été homogénéisées, comme décrit dans Matériels et Méthodes, et les extraits cellulaires ont

été analysés par Western-blotting avec des anticorps polyclonaux anti-PLD1 et anti-PLD2. Les

bandes ont été quantifiées par vidéodensitométrie et les résultats normalisés avec la tubuline. Les

résultats donnés dans le texte représentent la moyenne de 6 expériences indépendantes.

En parallèle et comme contrôle de la différenciation des myoblastes, nous avons mesuré

l’activité de la créatine kinase, un marqueur tardif de la différenciation terminale, dans les

cellules traitées de la même manière que pour les expériences de Western-blotting (Figure

32).

Tous ces résultats montrent clairement que les deux isoformes de PLD sont exprimées

au niveau des ARNm et des protéines, et que l’expression de la PLD1, mais pas celle de la

PLD2, est down-régulée au cours de la différenciation myogénique. Nous en déduisons que

les deux isoformes de PLD jouent des rôles distincts. PLD1 pourrait être requise pour le

Page 121: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

121

déclenchement du processus myogénique, et disparaître lorsque les cellules sont engagées.

PLD2 pourrait jouer plutôt un rôle de maintenance des fonctions cellulaires de base.

Figure 32 : Activité de la créatine kinase dans les cellules L6 différenciées, ou non, en myotubes.

Comme contrôle de la différenciation, l’activité de la créatine kinase (marqueur tardif de la

différenciation) a été mesurée pour les différents traitements. Elle a été mesurée dans les cellules

quiescentes (BSA), prolifératives (10% SVF), ou différenciées, soit après huit jours de traitement par

l’AVP, soit après huit jours de culture dans un milieu contenant 1% de SVF. Les activités sont

exprimées en mD0 par min et par µg de protéines.

IV.4.3 Au niveau de l’activité

Du fait que l’expression de la PLD1 est diminuée au cours de la différenciation, nous

avons décidé d’étudier la conséquence de cette down-régulation sur l’activité de la PLD des

cellules L6 indifférenciées prolifératives (cultivées en présence de 10% de sérum),

quiescentes (cultivées dans un milieu dépourvu de sérum) et différenciées soit par un

traitement de huit jours avec de l’AVP soit par réduction du pourcentage du sérum dans le

(mD

O/m

in/µ

g)

Page 122: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

122

milieu de culture. Nous avons pu observer une baisse de 50% de l’activité de la PLD dans les

cellules différenciées par rapport à l’activité des cellules quiescentes ou en prolifération

(Figure 33). Donc, l’inhibition de l’expression de la PLD1 est accompagnée d’une diminution

de moitié de l’activité basale dans les cellules différenciées suggérant que l’activité restante

pourrait être attribuée à l’activité de la PLD2.

Figure 33 : Mesure de l’activité PLD dans les cellules non différenciées ou différenciées en myotubes.

L’activité PLD basale a été mesurée dans les cellules quiescentes (BSA), prolifératives (10% SVF), ou

différenciées, soit après huit jours de traitement par l’AVP, soit après huit jours de culture dans un

milieu contenant 1% de SVF. Les cellules sont radiomarquées avec de l'acide [3H]-palmitique

pendant 2h, puis sont lavées et incubées pendant 30 min en présence de butanol-1 1%. La réaction est

arrêtée par extraction puis les phospholipides sont fractionnés par CCM. La radioactivité associée au

phosphatidylbutanol est exprimée en % de la radioactivité associée aux PL totaux. Les résultats

représentent la moyenne ± SEM de 4 expériences indépendantes.

Page 123: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

123

IV.5 La stimulation myogénique déclenche la formation PLD-

dépendante des « stress fiber like structures» (SFLS)

IV.5.1 La formation des SFLS est induite par l’AVP et le TPA dans les

cellules L6

Dans les cellules musculaires striées (squelettiques ou cardiaques), les SFLS, qui

perdurent pendant les premiers jours de la différenciation sont supposées jouer un rôle

primordial, en tant qu’ébauches des futures myofibrilles, sur lesquelles vont venir s’attacher

les multiples protéines sarcomériques formant finalement les fibres striées caractéristiques.

Du fait que l’AVP active Rho dans les cellules L6, et étant donné le rôle positif connu de Rho

dans la différenciation myogénique, dans la réorganisation du cytosquelette et dans la

formation des fibres de stress d’actine, nous nous sommes demandé si les inducteurs de la

myogénèse avaient une influence sur le cytosquelette d’actine des myoblastes L6. En réponse

aux deux agents myogéniques étudiés (AVP et TPA), nous avons observé que les myoblastes

L6 développent rapidement des SFLS détectées par marquage de l’actine F à la phalloïdine en

microscopie à fluorescence. Ces SFLS sont détectables dès 1 min de traitement, deviennent

plus épaisses à 10 min et restent stables pendant au moins 1 heure de traitement par AVP ou

TPA (Figure 34).

IV.5.2 La formation de SFLS par l’AVP et le TPA est PLD-dépendante

Ensuite, nous avons cherché à déterminer si la PLD est impliquée dans la formation

des fibres de stress induite par les deux inducteurs myogéniques (AVP et TPA). Pour ceci,

nous avons traité les myoblastes L6 avec le butanol-1 et le butanol-2 et nous avons observé

que la formation des SFLS induite par l’AVP et le TPA est totalement inhibée par le butanol-

1, alors qu’elle est peu affectée par le butanol-2 (Figure 35). Elle est donc dépendante de la

présence de PA. Cela est confirmé par l’effet du propranolol, un inhibiteur de la PA-

phosphatase qui provoque l’accumulation intracellulaire du PA en bloquant son métabolisme.

En effet, le propranolol induit, par lui-même, la formation des SFLS, suggérant ainsi que le

PA, par lui-même, est capable d’induire la formation les SFLS. L’exoenzyme C3, qui inhibe

fortement l’activation de la PLD par l’AVP, inhibe la formation des SFLS induite par l’AVP

(Figure 35), ce qui est en accord avec l’hypothèse d’un rôle de PLD dans leur formation.

Page 124: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

124

Figure 34 : Effet de l’AVP (10-7M) et du TPA (1 nM) sur la formation des SFLS.

Les cellules ont été traitées, ou non, avec de l’AVP 10-7M ou du TPA 1 nM de 30 sec à 60 min. Les

cellules ont ensuite été fixées, perméabilisées puis incubées avec la phalloïdine couplée à la

rhodamine qui permet la révélation des fibres d’actine par fluorescence au microscope.

Page 125: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

125

Figure 35: Effet du propranolol, de l’exoenzyme C3, de 0,5% butanol-1 et de 0,5% butanol-2 sur la formation des SFLS.

Les cellules ont été traitées avec de l’AVP 10-7M ou du TPA 1 nM seuls, ou en présence de 0,5%

butanol-1 ou de 0,5% butanol-2 (utilisé comme contrôle), pendant 10 min. Elles ont aussi été traitées

par le propranolol 100 µM seul, pendant 15 min, ou prétraitées par 5 µg/ml de l’exoenzyme C3 avant

l’ajout d’AVP pour 10 min. Les cellules ont ensuite été fixées, perméabilisées, puis incubées avec la

phalloïdine couplée à la rhodamine qui permet la révélation des fibres d’actine par fluorescence au

microscope.

Cependant, du fait que l’exoenzyme C3 supprime aussi l’activation d’autres effecteurs de la

protéine G Rho qui sont, avec la PLD, nécessaires à la formation des fibres de stress, il est

difficile de conclure que la PLD est le seul facteur responsable de la formation des SFLS

induite par l’AVP. Nous avons quantifié le pourcentage de cellules présentant des SFLS après

traitement par le propranolol et par l’AVP en présence ou en absence de butanol-1 ou de

butanol-2. Nous avons trouvé que 3% des cellules témoins présentent des SFLS contre 24%

pour les cellules traitées avec du propranolol et 56% pour les cellules traitées avec de l’AVP.

En présence du butanol-1, seulement 1,6% de cellules traitées avec de l’AVP présentent des

SFLS contre 40% pour les cellules traitées avec l’AVP en présence de butanol-2 (Figure 36).

Page 126: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

126

De plus nous avons étudié la réversibilité de l’effet des alcools primaires sur la formation de

SFLS. Pour ceci, après l’addition du butanol-1 ou butanol-2 nous avons abondamment lavé

les cellules avec du PBS pour enlever toute trace d’alcool, et ensuite nous les avons traitées

avec l’AVP. Nous avons observé que l’élimination du butanol-1 rétablit presque totalement la

formation des SFLS par l’AVP (non montré).

Figure 36: Effet de l’AVP, du propranolol, du butanol-1 et du butanol-2 sur le pourcentage des cellules présentant des SFLS.

Les cellules ont été traitées, ou non, avec de l’AVP 10-7M seule, ou en présence de 0,5% butanol-1 ou

de 0,5% butanol-2 (utilisé comme contrôle), pendant 10 min. Elles ont aussi été traitées par le

propranolol 100 µM seul pendant 15 min. Les cellules ont ensuite été fixées, perméabilisées, puis

incubées avec la phalloïdine couplée à la rhodamine qui permet la révélation des fibres d'actine par

fluorescence au microscope. Le diagramme représente le pourcentage moyen ± SEM des cellules

présentant des SFLS par rapport au nombre de cellules totales, déterminé dans 10 champs différents.

4 expériences indépendantes ont donné des résultats similaires.

Page 127: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

127

* †

IV.5.3 La PLD1 est impliquée positivement dans la formation des SFLS

Du fait que c’est l’isoforme PLD1 qui semble être impliquée dans la différenciation

myogénique des myoblastes L6, nous avons voulu déterminer l’effet de la surexpression de

cette isoforme sur la formation des SFLS. Nous avons donc transfecté les myoblastes L6 avec

les plasmides pCDNA3 vide et pCDNA3-PLD1b et nous avons ensuite traité ou pas les

cellules transfectées avec l’AVP. Nous avons observé que 32,6% des cellules surexprimant la

PLD1 présentent des SFLS, en absence d’AVP, par rapport à 2,54% pour les cellules témoins.

En présence d’AVP, 61,12% des cellules transfectées par la PLD1 présentent des SFLS,

contre 45,84% pour les cellules transfectées par le vecteur vide (Figure 37). Nous en

déduisons que la PLD1 joue un rôle positif dans la formation des SFLS dans les myoblastes

L6, et faisons l’hypothèse que cela est relié à l’effet de la PLD1 sur la différenciation

myogénique.

Figure 37: Effet de la surexpression de la PLD1b sur le pourcentage des cellules présentant des SFLS.

Les cellules L6 ont été transfectées transitoirement pendant 18h avec les vecteurs pCDNA3-vide ou

pCDNA3-PLD1b. Les cellules ont ensuite été traitées, ou non, avec de l’AVP pendant 10 min puis

fixées, perméabilisées et incubées avec la phalloïdine couplée à la rhodamine qui permet la révélation

par fluorescence au microscope. Le diagramme représente le pourcentagemoyen ±SEM des cellules

présentant des SFLS par rapport au nombre de cellules totales, déterminé dans 10 champs différents.

*: différent de transfecté PLD1b sans AVP, p<0,0001. †: différent de mock-transfecté + AVP,

p<0,001. Trois expériences indépendantes ont donné des résultats similaires.

0

10

20

30

40

50

60

70

pCDNA3 pCDNA3-PLD1b

pCDNA3 +AVP

pCDNA3-PLD1b +

AVP

pour

cent

age

des

Cel

lule

s av

ec S

FLS

Page 128: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

128

IV.6 La PLD1 et le PA participent directement à la formation des

SFLS

IV.6.1 La PLD1, et non la PLD2, transloque vers les SFLS lors de la

stimulation myogénique

Etant donné l’implication de la PLD dans la formation des SFLS, nous avons voulu

étudier la localisation de la PLD endogène après la stimulation myogénique par l’AVP. Par

des expériences d’immunofluorescence, nous avons détecté la PLD1 endogène à l’aide d’un

anticorps polyclonal anti-PLD1 dans les myoblastes L6 stimulés ou non par l’AVP. Dans les

cellules témoins quiescentes, non stimulées, nous avons observé que la PLD1 est localisée

dans une zone péri-nucléaire qui pourrait correspondre à l’appareil de Golgi (Figure 38). Nous

avons co-marqué les cellules avec un anticorps monoclonal anti-G58k utilisé comme un

marqueur de l’appareil de Golgi (Figure 38). Après superposition des deux marquages, nous

avons observé une colocalisation partielle de la PLD1 avec le marqueur Golgien suggérant

que la PLD1 pourrait être localisée dans une sous fraction de compartiment golgien.

Figure 38: Localisation de la PLD1 endogène dans les cellules L6 par immunofluorescence.

Les cellules L6 quiescentes ont été fixées, perméabilisées puis incubées avec deux anticorps primaires,

anti-PLD1 (polyclonal ) et anti-G58k (monoclonal), et les anticorps secondaires Alexa anti-lapin et

rhodamine anti-souris, qui permettent la révélation par fluorescence au microscope, respectivement

de PLD1 (fluorescence verte) et G58k (fluorescence rouge). Les images ont été superposées (merge).

Page 129: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

129

De manière intéressante, la simulation myogénique des cellules L6 par l’AVP induit une

translocation partielle de la PLD1 de la zone périnucléaire vers des structures filamenteuses.

Après un co-marquage des cellules avec la toxine phalloïdine qui reconnaît l’actine, nous

avons clairement observé que la PLD1 est relocalisée partiellement au niveau des SFLS lors

de la stimulation myogénique (Figure 39).

Figure 39: Effet de l’AVP sur la localisation de la PLD1 endogène dans les cellules L6.

Les cellules traitées, ou non, avec de l’AVP 10-7M pendant 10 min, ont été fixées, perméabilisées puis

incubées avec l’anticorps primaire polyclonal, anti-PLD1 et l’anticorps secondaire Alexa anti-lapin.

Elles ont été comarquées avec la phalloïdine couplée à la rhodamine, et observées au microscope à

fluorescence. Les images ont été superposées (merge).

Page 130: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

130

Ces résultats suggèrent que la PLD1 participe à la formation des SFLS induite par AVP, ce

qui pourrait expliquer son implication dans la réponse myogénique. Pour vérifier la spécificité

de ces observations, nous avons étudié la localisation de la PLD2 dans les cellules

quiescentes, ou stimulées par l’AVP. Etant donné que la PLD2 joue un rôle négatif dans la

réponse myogénique à l’AVP, elle ne devrait pas être impliquée dans la formation des SFLS

si notre hypothèse est correcte. Par immunofluorescence et à l’aide d’un anticorps polyclonal

anti-PLD2, nous avons observé que la PLD2, localisée, dans les myoblastes quiescents, au

niveau d’une zone périnucléaire qui se prolonge par des zones de marquage plus diffus, n’est

pas relocalisée au niveau des SFLS après traitement des cellules avec de l’AVP (Figure 40).

Nous pouvons ainsi proposer que la PLD2, contrairement à la PLD1, ne participe pas à la

formation des SFLS.

Figure 40: Effet de l’AVP sur la localisation de la PLD2 endogène dans les cellules L6.

Les cellules traitées, ou non, avec de l’AVP 10-7M pendant 10 min, ont été fixées, perméabilisées puis

incubées avec l’anticorps primaire polyclonal anti-PLD2 et l’anticorps secondaire Alexa anti-lapin.

Elles ont été comarquées avec la phalloïdine couplée à la rhodamine, et observées au microscope à

fluorescence. Les images ont été superposées (merge).

Page 131: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

131

IV.6.2 RhoA est partiellement relocalisée au niveau des SFLS

Nous avons déjà montré que l’AVP active la PLD majoritairement via Rho dans les

myoblastes L6. Du fait que RhoA interagit directement avec le domaine CRIV de PLD1

(Sung et al., 1997) alors qu’elle n’active pas directement la PLD2 (Sung et al., 1999a), nous

avons cherché à déterminer la localisation de RhoA, à l’aide d’un anticorps polyclonal anti-

RhoA, lors de la stimulation myogénique. Nous avons clairement observé que RhoA,

localisée dans les cellules L6 quiescentes dans le cytosol ainsi que dans des compartiments

vésiculaires, est aussi partiellement transloquée vers les SFLS après stimulation des cellules

par l’AVP (Figure 41). La colocalisation de RhoA et SFLS a été mise en évidence par co-

marquage des cellules avec la phalloïdine.

Figure 41: Effet de l’AVP sur la localisation de Rho endogène dans les cellules L6.

Les cellules traitées, ou non, avec de l’AVP 10-7M pendant 10 min, ont été fixées, perméabilisées puis

incubées avec l’anticorps primaire polyclonal anti-RhoA et l’anticorps secondaire Alexa anti-lapin.

Elles ont été comarquées avec la phalloïdine couplée à la rhodamine, et observées au microscope à

fluorescence. Les images ont été superposées (merge).

Page 132: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

132

Ces résultats nous permettent de suggérer que RhoA co-transloque avec la PLD1 au niveau

des SFLS lors de la stimulation myogénique, et que la stimulation de PLD1 par Rho se

produit à ce niveau.

IV.6.3 Le PA est sélectivement accumulé au niveau des SFLS lors de la

réponse myogénique

Pour aller plus loin dans la recherche du rôle de PLD, nous avons cherché à localiser

son produit, l’acide phosphatidique. Pour cela, nous avons construit un vecteur permettant

d’exprimer une sonde fluorescente reconnaissant spécifiquement le PA. Cette sonde est

constituée par le domaine fixateur de PA de la protéine Raf-1 couplé à la GFP (pEGFP-

PABD). Quand elle est exprimée dans les myoblastes quiescents, cette sonde montre une

fluorescence diffuse dans le cytosol et le noyau. Après stimulation par les deux agents

myogéniques, AVP et TPA, elle marque sélectivement de petites vésicules qui s’alignent

progressivement le long de structures fibreuses rappelant les SFLS (Figure 42). De plus, dans

les cellules traitées avec le TPA, la sonde marque aussi la membrane plasmique.

Figure 42: Marquage du PA à l’aide d’une sonde fluorescente spécifique.

Les cellules ont été transfectées transitoirement, pendant 18h, avec le plasmide pEGFP-PABD (sonde-

PA fluorescente). Les cellules ont ensuite été traitées, ou non, avec de l’AVP 10-7M ou du TPA 1 nM

pendant 10 min (AVP) ou 15 min (TPA), fixées, et visualisées au microscope à fluorescence.

Page 133: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

133

Afin de savoir si les vésicules marquées par la sonde pEGFP-PABD s’alignent au niveau des

SFLS, nous avons co-marqué les cellules transfectées par la sonde avec la phalloïdine. Nous

avons observé que les vésicules marquées s’alignent tout au long des SFLS après 10 min de

traitement par l’AVP et 15 min de traitement par le TPA (Figure 43).

Figure 43: Effet de l’AVP et du TPA sur la localisation du PA dans les cellules L6.

Les cellules ont été transfectées transitoirement, pendant 18h, avec le plasmide pEGFP-PABD (sonde-

PA fluorescente). Les cellules ont ensuite été traitées, ou non, avec de l’AVP 10-7M ou du TPA 1 nM

pendant 10 min (AVP) ou 15 min (TPA), fixées, perméabilisées, puis incubées avec la phalloïdine

couplée à la rhodamine, et observées au microscope à fluorescence. Les images ont été superposées

(merge).

Page 134: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

134

IV.6.3.1 Cinétique de marquage des fibres d’actine par le PA

Ensuite nous avons cherché à localiser, dans le temps et l’espace, la formation du PA

dans la cellule, afin de savoir si la synthèse du PA précède la formation des SFLS. Pour ceci,

nous avons transfecté les cellules L6 avec le pEGFP-PABD. Ensuite, nous avons traité ou pas

les cellules exprimant la sonde fluorescente avec l’AVP pendant des temps courts (30

secondes à 10 min). Comme nous l’avons déjà observé précédemment, la sonde montre une

fluorescence diffuse dans le cytosol et le noyau dans les cellules témoins quiescentes. Dès

30sec de traitement par l’AVP, les vésicules fluorescentes marquées par la sonde commencent

à se former et à s’aligner alors que les SFLS ne sont pas encore mises en place. Après 5-10

min de traitement par l’AVP, les SFLS sont clairement formées et marquées: la fluorescence

verte de la sonde suit des lignes ponctuées et les vésicules fluorescentes sont ainsi alignées au

niveau des SFLS (Figure 44). Ces observations suggèrent que le PA est formé localement dès

l’étape de mise en place des SFLS, et pourrait ainsi participer à leur formation.

IV.6.3.2 Spécificité de la sonde pour le PA

Afin de vérifier la spécificité du marquage de PA par la sonde, nous avons construit

une sonde contrôle mutée ayant perdu son affinité pour le PA. En fait, le PA se lie avec une

forte affinité dans une région d’environ 35 acides aminés de la partie C-terminale de la

protéine Raf1. Le site d'interaction avec le PA se trouve entre les acides aminés 390 et 426 de

Raf1 (Ghosh et al., 1996). Dans ce domaine de fixation de PA, il existe plusieurs acides

aminés basiques comme l’arginine et la lysine qui sont essentiels pour l’interaction avec le

PA. En se référant à la publication de Rizzo et al. (2002), nous avons construit par

mutagénèse dirigée une sonde mutée en substituant les deux arginines R398 et R401 par deux

alanines. Ensuite, nous avons exprimé cette sonde mutée dans les cellules L6 et comparé sa

localisation avec celle de la « sonde sauvage ». Après traitement par l’AVP, cette sonde mutée

conduit à un marquage périnucléaire sans relation avec les fibres d’actine, c.à.d. un marquage

totalement différent de celui induit par l’expression de la sonde sauvage (Figure 45).

Pour confirmer la spécificité de la sonde sauvage pour le PA, nous avons traité les

cellules qui expriment la sonde sauvage avec le propranolol, un inhibiteur de la PA-

phosphatase qui provoque l’accumulation intracellulaire du PA en bloquant son métabolisme,

même en absence d’une stimulation cellulaire (Naro et al., 1997; Grange et al., 2000).

Page 135: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

135

Figure 44: Cinétique de marquage de SFLS par la sonde à PA.

Les cellules ont été transfectées transitoirement, pendant 18h, avec le plasmide pEGFP-PABD (sonde-

PA fluorescente). Les cellules ont ensuite été traitées, ou non, avec de l’AVP 10-7M de 30 sec à 10 min,

fixées, perméabilisées, puis incubées avec la phalloïdine couplée à la rhodamine et observées au

microscope à fluorescence. Les images ont été superposées (merge).

Page 136: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

136

Nous avons déjà montré que le propranolol, par lui-même, est capable d’induire la formation

des SFLS dans les myoblastes L6. De manière intéressante, le propranolol provoque la

localisation de la sonde au niveau de ces structures (Figure 45), confirmant la spécificité de

liaison de la sonde pour le PA, ainsi que la spécificité de son marquage au niveau des SFLS.

Figure 45: Contrôle de la spécificité de la sonde à PA.

Les cellules ont été transfectées transitoirement, pendant 18h, avec les plasmides pEGFP-PABD

(sonde-PA sauvage) ou pEGFP-PABD muté par substitution de deux arginines en alanines (sonde-PA

mutée). Les cellules transfectées avec la sonde-PA mutée ont été traitées avec de l’AVP 10-7M pendant

10 min. Les cellules transfectées avec la sonde-PA sauvage ont été traitées avec 100 µM de

propranolol pendant 15 min. Les cellules ont ensuite été fixées, perméabilisées, puis incubées avec la

phalloïdine couplée à la rhodamine, et observées au microscope à fluorescence. Les images ont été

superposées (merge).

Page 137: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

137

Nous montrons ainsi pour la première fois, par visualisation directe, que le PA est

formé localement au niveau des fibres d’actine, et au moment où les SFLS s’assemblent.

Toutes ces observations nous permettent de conclure que la PLD1 et le PA participent

directement au remodelage du cytosquelette d’actine induit lors de la myogénèse.

IV.7 La PLD et le PA interviennent dans la formation des SFLS en

induisant la synthèse localisée de PIP2

Des relations étroites entre la production de PA et la synthèse de PIP2 ont été décrites,

le PA étant régulateur de la PI(4)P 5-kinase, l’enzyme qui donne naissance à ce

phosphoinositide connu pour jouer un rôle majeur dans la réorganisation de l’actine cellulaire

et la formation des fibres de stress. Nous avons donc recherché si la stimulation myogénique

par l’AVP s’accompagne d’une synthèse de PIP2. Jusqu’à présent, la concentration d’AVP

que nous avons utilisée était de 100 nM. Du fait que cette concentration d’AVP active aussi la

PIP2-PLC qui hydrolyse le PIP2, nous avons, pour cette série d’expériences, utilisé l’AVP à 1

nM qui active la PLD sans induire l’hydrolyse du PIP2 par la PLC (Naro et al., 1997). En

adoptant une technique de marquage métabolique par le Pi-P33 pendant un temps très court,

qui privilégie le marquage du PIP2 néosynthétisé, suivi d’une analyse des phosphoinositides

par chromatographie sur couche mince, nous avons réussi à montrer que la stimulation

myogénique par l’AVP à 1 nM s’accompagne d’une synthèse rapide de PIP2. De plus, nous

avons observé que cette synthèse est inhibée sélectivement par le butanol-1, et non le butanol-

2, démontrant ainsi qu’elle dépend de l’activation de la PLD par l’AVP (Figure 46). Ce

résultat montre que le PA, produit de l’activation de la PLD par l’AVP, est impliqué dans la

synthèse du PIP2, probablement en activant la PI(4)P 5-kinase dans les myoblastes L6.

Etant donné que la PLD1 est transloquée au niveau des fibres de stress lors de la stimulation

myogénique par l’AVP et que le PA est accumulé au niveau de ces structures, nous avons

voulu étudier la localisation du PIP2 formé après stimulation des cellules par l’AVP afin de

savoir si ce phosphoinositide est synthétisé localement au niveau des SFLS. Pour ceci, nous

avons réalisé des expériences d’immunofluorescence, en utilisant un anticorps monoclonal

anti-PIP2 hautement spécifique, sur les cellules L6 traitées, ou non, par l’AVP. Nous avons

observé que le PIP2, localisé dans les cellules non stimulées dans des compartiments

périnucléaires, est accumulé dans les myoblastes stimulés le long des SFLS selon un pattern

identique à celui du PA (Figure 47).

Page 138: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

138

Figure 46: Effet de l’inhibition de la production de PA sur la néosynthèse de PIP2 induite par AVP.

Les cellules ont été marquées métaboliquement par le Pi-P33 pendant un temps très court (10 min), qui

privilégie le marquage du PIP2 néosynthétisé. Les cellules ont ensuite été traitées, ou non, avec de

l’AVP 10-9 M seule, ou en présence de 1% butanol-1 ou de 1% butanol-2. La réaction est arrêtée par

1 ml de méthanol et les lipides sont extraits, analysés par CCM et révélés par analyse au

Phosphorimager Storm afin de localiser le PIP2 marqué au P33. Les spots sont quantifiés par

vidéodensitométrie et les résultats sont exprimés en unités arbitraires, en pourcentage par rapport à

la valeur +AVP. Ils représentent la moyenne ± SEM de 3 expériences indépendantes. Les résultats

sont ensuite analysés par ANOVA et les moyennes sont comparées par un test de t protégé. *:

significativement différent de la valeur +AVP, p<0.05; **:p<0,01; NS: pas de différence significative.

Ces observations montrent que le PIP2 est localement accumulé au niveau des SFLS où le PA

est formé, ce qui conforte l’hypothèse que le PA induit la synthèse du PIP2 au niveau des

SFLS en activant la PI(4)P 5-kinase. Le rôle du PIP2 dans la formation des fibres de stress

étant largement connu, nous pouvons ainsi mieux comprendre comment la PLD1 et le PA

participent directement à la formation des SFLS.

Page 139: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

139

Figure 47 : Effet de l’AVP sur la localisation du PIP2 dans les cellules L6.

Les cellules traitées, ou non, avec de l’AVP 10-7M pendant 10 min, ont été fixées, perméabilisées puis

incubées avec l’anticorps primaire monoclonal anti-PIP2, et l’anticorps secondaire FITC anti-souris.

Elles ont été comarquées avec la phalloïdine couplée à la rhodamine, et observées au microscope à

fluorescence. Les images ont été superposées (merge).

Page 140: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

140

V DISCUSSION, CONCLUSION ET

PERSPECTIVES

L'objectif des travaux présentés dans ce manuscrit a été d’étudier le rôle de la PLD

dans la différenciation myogénique des myoblastes L6. Plusieurs résultats montrent

l’implication de la PLD dans la myogénèse. Tout d’abord, la PLD est activée de manière

similaire par deux inducteurs myogéniques différents, l’AVP et le TPA. L’effet myogénique

in vitro de l’AVP a déjà été décrit (Nervi et al., 1995; Minotti et al., 1998). Nous avons

observé que le TPA à 1 nM est capable, par lui-même, d’induire les étapes précoces de la

différenciation myogénique mise en évidence par l’expression et l’accumulation nucléaire du

facteur de transcription myogénine. Ainsi, l’activation de la PLD par le TPA via PKC, ou par

l’AVP via l’activation d’un récepteur couplé aux protéines G (V1aR), est corrélée avec

l’induction de la différenciation. Le fait qu’une faible dose d’ester de phorbol induise une

réponse myogénique est nouveau, puisque le TPA est généralement considéré comme un

inhibiteur de la myogénèse (Cossù et al., 1983; Boczan et al., 2001). Cependant, ceci est en

accord avec certaines observations de la littérature, puisque le traitement des myoblastes de

poulet par les inhibiteurs de PKC inhibe leur fusion (David et al., 1990).

D’autre part, nous avons montré qu’une forte concentration de TPA (100 nM) qui

empêche la restimulation de la PLD après un premier traitement, inhibe fortement la

myogénèse. Cette perte de l’activation de PLD peut être attribuée à la « down-régulation » des

PKCα et PKCγ induite en 24h par cette dose de TPA (mais pas par 1nM de TPA). Même si

les cinétiques d’activation de PLD lors d’un premier traitement par les deux doses de TPA

sont similaires, on peut prévoir que le remplacement périodique du milieu de culture

contenant 100 nM de TPA maintient l’activité de la PLD à un niveau basal, alors qu’en

présence d’1 nM de TPA, un fort niveau d’activité PLD peut être restauré. On peut donc faire

l’hypothèse que le maintien de la PLD dans un état stimulable est nécessaire à la

différenciation myogénique.

Par ailleurs, nous avons observé que l’inhibition partielle de l’activité PLD par la

BFA inhibe la réponse myogénique à l’AVP. De plus, l’inhibition de la production de son

produit, l’acide phosphatidique, par le butanol-1 inhibe la différenciation myogénique induite

par le TPA ou l’AVP. Enfin, nous avons pu montrer que la surexpression de la PLD1b induit

Page 141: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

141

la différenciation et potentialise l’effet de l’AVP. Tous ces résultats confirment l’implication

de la PLD, et particulièrement, la PLD1 dans le processus myogénique.

De manière surprenante, contrairement à la PLD1, nous avons trouvé que la

surexpression de la PLD2 exerce un effet négatif sur la différenciation des L6. Le fait que les

deux isoformes PLD1 et PLD2 ont des fonctions différentes dans un même type cellulaire a

souvent été rapporté. Par exemple, dans les mastocytes la PLD2, et non la PLD1, est

impliquée dans la formation des «ruffles» au niveau de l’actine corticale après la stimulation

antigénique (O’Luanaigh et al., 2002). La PLD2 est aussi l’isoforme impliquée dans

l’activation des ERKs dans les cellules HIRcB (Rizzo et al., 1999). Au contraire, la PLD1, et

non la PLD2, participe à la formation des fibres de stress dans les fibroblastes (Kam and

Exton, 2001). Cette différence dans les rôles physiologiques des deux isoformes de PLD peut

être attribuée au fait qu’elles ont des localisations subcellulaires distinctes (Colley et al.,

1997; Diaz et al., 2002). Ceci nous permet de suggérer que la PLD2, contrairement à la PLD1,

induit une accumulation de PA dans des compartiments non reliés aux acteurs moléculaires de

la myogénèse.

Nous avons trouvé que les myoblastes prolifératifs ou quiescents expriment la PLD2 et

les deux variants d’épissage de la PLD1 (PLD1a et PLD1b). De plus, nous avons observé que

les isoformes de la PLD1, mais pas la PLD2, sont « down-régulées » au cours de la

différenciation myogénique, aussi bien au niveau des ARNm que des protéines. Cette

régulation conduit à une baisse de l’activité basale de la PLD de 50% dans les myotubes

différenciés. L’activité résiduelle pourrait être attribuée à la PLD2, caractérisée par une

activité basale élevée. La diminution de l’expression de la PLD1 au cours de la différenciation

myogénique peut paraître contradictoire par rapport à son implication positive dans ce

processus. Cependant, étant donné que la PLD est rapidement activée par l’AVP ou le TPA et

que les réponses précoces à ces inducteurs myogéniques apparaissent dans un temps court (1-

15 min pour la formation des SFLS, 24 h pour l’expression et l’accumulation nucléaire de la

myogénine) et le fait que la down-régulation des ARNm de la PLD1 n’a lieu qu’à partir du

4ème jour de traitement, l’implication de la PLD1 dans les étapes précoces de la myogénèse est

tout à fait compatible. Par contre, les étapes tardives de la différenciation, comme la fusion

des cellules et l’expression des protéines contractiles, qui ont lieu après le 4ème jour peuvent

ne pas dépendre directement de la présence d’une PLD1 active.

Nous avons aussi montré que l’activation de la PLD par l’AVP dans les myoblastes L6

est partiellement PKC et ARF-dépendante, mais majoritairement Rho-dépendante vu la forte

inhibition (-74%) de cette activation par l’exoenzyme C3 de Clostridium botulinum. De plus,

Page 142: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

142

nous avons observé que l’AVP induit la translocation et donc l’activation de Rho dans ces

cellules, ce qui suggère que Rho agit en amont de la PLD après le traitement par l’AVP.

L’implication de la protéine Rho dans l’activation de la PLD dans divers types cellulaires a

été décrite (Exton et al., 2002), et notamment dans l’activation de la PLD par l’insuline dans

les myotubes L6 (Standaert et al., 1996). Rho interagit directement avec la PLD1, et cette

interaction est indispensable à l’activation de cette enzyme (Sung et al., 1997; Du et al.,

2000). De plus, il est connu que Rho et PLD peuvent être activées par divers récepteurs à sept

domaines transmembranaires. Plusieurs études ont montré que les protéines Gαq/11, Gα12 ou

Gα13 peuvent activer les protéines Rho (Seasholtz et al., 1999). De manière intéressante, dans

les fibroblastes, l’AVP peut induire une formation Rho-dépendante des fibres de stress via la

médiation des protéines Gα12 (Gohla at al., 1999). Il semble donc probable que la stimulation

Rho-dépendante de la PLD par l’AVP dans les myoblastes L6 soit médiée par les protéines G

de type Gα12, mais ceci reste à démontrer. D’autre part, il est connu que Rho joue un rôle

essentiel dans la différenciation myogénique (Carnac et al., 1998; Takano et al., 1998; Wei et

al., 1998). De plus, il a été proposé que l’activation de Rho est un facteur déterminant pour le

devenir des cellules précurseurs myogéniques. En effet, les fibroblastes embryonnaires

peuvent subir soit une différenciation myogénique, soit une différenciation adipogénique

selon le statut d’activation de Rho, un niveau élevé d’activation orientant la différenciation

vers la myogénèse (Sordella et al., 2003). En se basant sur nos observations, nous pouvons

proposer que les effets myogéniques de Rho dépendent de sa capacité à activer, entre autres,

la PLD.

La différenciation de divers types cellulaires est accompagnée d’une augmentation de

l’activité et/ou de l’expression des PLD, suggérant l’implication de cette enzyme dans le

processus de différenciation. Même si le rôle de la PLD dans la différenciation de plusieurs

types cellulaires a été rapporté, les mécanismes par lesquels la PLD pourrait intervenir dans

les processus de différenciation ne sont pas encore bien précisés. Concernant l’implication de

la PLD dans la myogénèse, son intervention à différents niveaux pourrait être considérée.

Tout d’abord, la PLD pourrait activer l’isoforme de la phosphodiestérase AMPc-spécifique

(PDE4D3) sélectivement activable par la fixation du PA (Grange et al., 2000) et exprimée

dans les cellules L6. L’activation de la PLD par l’AVP conduisant à une accumulation de PA,

elle pourrait être responsable de l’activation rapide de la PDE4D3, et ainsi le PA pourrait

réguler les taux cellulaires de l’AMPc. Du fait que la différenciation myogénique requiert une

baisse des taux d’AMPc (Naro et al., 1999), l’activation de la PDE4D3 par le PA pourrait

participer aux étapes précoces de la réponse myogénique.

Page 143: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

143

Une autre intervention possible de la PLD dans le processus de différenciation se situe

au niveau de l’expression de gènes spécifiques du muscle: l’inhibition de la production de PA

par la BFA ou le butanol-1 diminue de manière efficace l’expression de la myogénine, facteur

de transcription spécifique du muscle. De manière intéressante, l’AVP induit une

augmentation rapide de l’expression du co-régulateur myogénique des MRFs, MEF2,

nécessaire pour l’activation transcriptionnelle de la myogénine (Scicchitano et al., 2002). Par

ailleurs, il a été montré que RhoA est impliquée dans l’activation transcriptionnelle via la

régulation du facteur SRF (Hill et al., 1995). De plus, la protéine RhoA active est requise pour

l’expression des deux facteurs de transcription MEF2 et myogénine (Takano et al., 1998).

L’induction des gènes spécifiques du muscle par RhoA, y-compris la myogénine, implique

l’activation et l’augmentation de l’expression de SRF (Wei et al., 1998). Le mécanisme précis

par lequel RhoA active SRF n’étant pas encore clair (Sahai et al., 1998), une implication

possible de la PLD doit être considérée. Cette hypothèse est appuyée par le fait qu’il existe un

lien direct entre la réorganisation du cytosquelette d’actine et l’induction de la transcription

génique par SRF (Sotiropoulos et al., 1999). Cette dernière étude démontre que les signaux

affectant la polymérisation d’actine, incluant l’activation de RhoA, sont capables de réguler

l’activité transcriptionnelle de SRF, probablement via la diminution des taux cellulaires des

monomères d’actine, l’actine G. De plus il a été montré dans les cardiomyocytes néonataux

que l’organisation des fibres d’actine est aussi requise pour l’induction de l’activité

transcriptionnelle du SRF par RhoA (Wei et al., 2001). Du fait que l’implication de la PLD

dans le réarrangement du cytosquelette d’actine est bien acceptée (Cross et al., 1996; Kam

and Exton, 2001; O’Luanaigh et al., 2002), et que nos observations montrent clairement que

la PLD et le PA participent à la formation des SFLS induite par AVP et TPA, nous pouvons

proposer que la PLD est impliquée dans la transcription des gènes spécifiques du muscle via

la réorganisation du cytosquelette d’actine et l’activation de SRF qui en résulte.

Le remodelage du cytosquelette d’actine, PLD-dépendant, peut aussi participer d’une

autre manière à l’induction de la différenciation myogénique. En fait, contrairement aux

cellules non musculaires dans lesquelles les fibres de stress contrôlent surtout la

cytoarchitecture, les SFLS jouent un rôle crucial dans les cellules musculaires puisqu’elles

sont impliquées dans les étapes précoces de la myofibrillogénèse (Dabiri et al., 1997; Sanger

et al., 2002; Du et al., 2003). Comme nous avons observé que la formation des SFLS est PLD-

dépendante dans les myoblastes L6, nous pouvons suggérer que la PLD promeut la

différenciation myogénique en favorisant la myofibrillogénèse.

Page 144: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

144

Comment la PLD1 pourrait contribuer à la formation des fibres de stress reste

hypothétique. Diverses données de la littérature permettent de proposer l’implication d’un

autre messager phospholipidique, le phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate (PIP2). En effet, la

biosynthèse du PIP2 dépend d’une famille de PI4P 5-kinases, dont l’isoforme de type I est

stimulable par le PA (Jenkins et al., 1994). Comme le PIP2 est un cofacteur indispensable à

l’activité de PLD, il est supposé que l’activation de cette dernière induise une boucle

d’amplification conduisant à une accumulation massive et localisée des deux produits

phospholipidiques PA et PIP2. Le rôle du PIP2 dans la polymérisation de l’actine est

largement reconnu (Hilpela et al., 2004), et est attribué à la capacité qu’a ce phospholipide

d’interagir avec diverses protéines régulant l’état de l’actine en séquestrant les monomères, en

bloquant les filaments, ou en provoquant leur coupure, telles que profiline, gelsoline, cofiline

(Janmey et al., 1999). Le PA pourrait donc être considéré comme un facteur majeur contrôlant

localement les taux de PIP2, et par ce biais, le cytosquelette d’actine. Nos résultats montrant

que la stimulation de la PLD par l’AVP s’accompagne d’une synthèse et d’une accumulation

de PIP2 au niveau des fibres de stress sont en accord avec cette hypothèse (Figure 48).

Figure 48 : Séquences de signalisation déclenchées par la stimulation myogénique.

Page 145: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

145

En conclusion, nous avons établi le rôle de la voie de signalisation de la PLD dans des

réponses physiologiques importantes pour la fonction du muscle squelettique. Notre travail

permet de démontrer, pour la première fois, que la PLD, et spécifiquement l'isoforme PLD1,

est nécessaire à la différenciation myogénique. Nous avons montré que le remodelage du

cytosquelette est impliqué de façon majeure. Selon le modèle que nous proposons, la PLD1

stimulée en réponse à RhoA induit l'accumulation de PA au niveau de l'actine. Le PA à son

tour provoque l'accumulation localisée de PIP2. Ce composé, de par ses actions sur diverses

protéines régulatrices de l'actine provoque (en synergie avec diverses autres protéines

effectrices de Rho) l'assemblage des SFLS. Comme évoqué dans les rappels bibliographiques,

les SFLS jouent un rôle important dans les phases initiales de la myofibrillogénèse. La PLD

peut donc promouvoir la myogénèse en favorisant la mise en place des fibres striées. Le

remodelage du cytosquelette d'actine, dont nous avons prouvé qu'il nécessite l'activité PLD,

semble intervenir aussi, lors de la myogénèse, à un autre niveau. En effet, il a été démontré

l'existence d'un lien direct entre le degré de polymérisation de l'actine cellulaire et l'activité du

"serum response factor" (SRF), un facteur de transcription connu pour réguler l'expression de

gènes spécifiques du muscle, directement (tels que l'α-actine), ou indirectement (tels que la

myogénine). Un système détecteur de la concentration de l'actine globulaire gouvernerait

l'activité de SRF. Cette régulation de SRF par l'actine est connue dans la cellule musculaire

lisse (Mack et al., 2001), et le cardiomyocyte (Wei et al., 2001), mais n'a pas été décrite dans

le myoblaste squelettique. Nos résultats montrant que l'inhibition de la PLD supprime

l'expression de la myogénine permettent de supposer l'existence d'une régulation de

l'expression génique, lors de la myogénèse, selon le schéma: PLD --> remodelage de l'actine -

-> activation de SRF --> expression des gènes du programme myogénique (Figure 49).

Une des questions majeures qui restent à résoudre est celle du mécanisme par lequel la

PLD et son produit PA interviennent dans la formation des SFLS. Le rôle respectif de PA et

PIP2 dans la formation des fibres de stress sera étudié de manière détaillée dans les

myoblastes.

- Pour vérifier l’hypothèse d’une boucle d’amplification impliquant simultanément PA et

PIP2, l’accumulation de PIP2 en réponse aux agonistes, AVP et TPA, sera comparée entre

cellules témoins et cellules n’exprimant pas la PLD (transfectants stables surexprimant une

PLD-dominante négative, ou cellules traitées par siRNA). Cette accumulation sera d’une part

évaluée par dosage du phospholipide, et d’autre part, par cytoimmunofluorescence.

Inversement, l’accumulation de PA (évaluée par dosage et par marquage à l’aide de la sonde

Page 146: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

146

fluorescente spécifique) sera comparée entre cellules témoins et cellules surexprimant une

PI4P 5-kinase type I dominante négative, ou le domaine PH de PLCδ (fixateur spécifique de

PIP2, destiné à «titrer» ce messager dans la cellule).

- L’effet du blocage du PIP2 par microinjection de l’anticorps spécifique, ou par injection

d’un anticorps anti-PI4P 5-kinase, ou l’effet du blocage de PLD par injection d’un anticorps

anti-PLD, sur l’accumulation du phospholipide partenaire, et sur la réponse physiologique

(SFLS) sera évalué. De même, l’effet de la microinjection de PA ou de PIP2 sera étudié, ainsi

que l’effet de l’injection simultanée de PA et d’anticorps anti-PIP2. Ces expériences devraient

nous permettre de déterminer si le PA a un effet par lui-même, ou si son effet passe

obligatoirement par une accumulation de PIP2.

- Les effets in vitro du PA sur la polymérisation de l’actine seront étudiés à l’aide de

composants purifiés.

En ce qui concerne spécifiquement la différenciation myogénique, un lien direct entre

le réarrangement du squelette d’actine et l’acquisition du phénotype myocytaire sera

recherché. Pour ce faire, l’effet sur la réponse myogénique des drogues agissant

spécifiquement sur l’actine sera étudié. Seront testés notamment, les inhibiteurs de

polymérisation de l’actine latrunculine B et toxine clostridiale C2. Le jasplakinolide, qui

stabilise l’actine fibreuse, et donc promeut la polymérisation, le swinholide A et la

cytochalasine D qui séquestrent l’actine, seront aussi étudiés.

Les effets d’une surexpression d’actine, ou d’actine mutée ne pouvant s’intégrer aux

filaments, sur la différenciation seront étudiés. Enfin, on étayera l’hypothèse selon laquelle la

formation des fibres de stress en réponse aux agents différenciateurs (AVP ou TPA) module

l’expression des gènes spécifiques du muscle via l’activation de SRF. Pour ce faire, on

recherchera si l’activation des myoblastes est corrélée à une augmentation de l’expression de

gènes reporters gouvernés par un promoteur SRF-dépendant, tel que celui de l’α-actine

squelettique. On cherchera aussi à mettre en évidence la formation des complexes promoteur

de l’actine/SRF par la technique d’ « electrophoretic mobility shift assay ».

Enfin, l’implication de la PLD dans la différenciation des cellules myogéniques

primaires (cellules satellites du muscle de souris adultes, normales ou transgéniques atteintes

de dystrophies musculaires) sera étudiée à l’aide d’ outils moléculaires adaptés, notamment de

vecteurs viraux permettant la surexpression efficace de chacune des isoformes de PLD.

Page 147: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

147

Figure 49 : Topographie des évènements impliquant la PLD lors de l’initiation de la myogénèse.

Page 148: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

148

VI REFERENCES

ABOUSALHAM, A., LIOSSIS, C., O'BRIEN, L., BRINDLEY, D.N. Cell-permeable

ceramides prevent the activation of phospholipase D by ADP-ribosylation factor and RhoA. J

Biol Chem, 1997, vol 272 (2), p.1069-75.

ALTSCHULER, Y., LIU, S., KATZ, L., TANG, K., HARDY, S., BRODSKY, F.,

APODACA, G., MOSTOV, K. ADP-ribosylation factor 6 and endocytosis at the apical

surface of Madin-Darby canine kidney cells. J Cell Biol, 1999, vol 147 (1), p.7-12.

AMANO, M., ITO, M., KIMURA, K., FUKATA, Y., CHIHARA, K., NAKANO, T.,

MATSUURA, Y., KAIBUCHI, K. Phosphorylation and activation of myosin by Rho-

associated kinase (Rho-kinase). J Biol Chem, 1996, vol 271 (34), p.20246-9.

AMSTERDAM, A., DANTES, A., LISCOVITCH, M. Role of phospholipase-D and

phosphatidic acid in mediating gonadotropin-releasing hormone-induced inhibition of

preantral granulosa cell differentiation. Endocrinology, 1994, vol 135 (3), p.1205-11.

ANDERSON, R.A., BORONENKOV, I.V., DOUGHMAN, S.D., KUNZ, J., LOIJENS,

J.C. Phosphatidylinositol phosphate kinases, a multifaceted family of signaling enzymes. J

Biol Chem, 1999, vol 274 (15), p.9907-10.

ANDRESEN, B.T., RIZZO, M.A., SHOME, K., ROMERO, G. The role of phosphatidic

acid in the regulation of the Ras/MEK/Erk signaling cascade. FEBS Lett, 2002, vol 531 (1),

p.65-8.

ANTHES, J.C., WANG, P., SIEGEL, M.I., EGAN, R.W., BILLAH, M.M. Granulocyte

phospholipase D is activated by a guanine nucleotide dependent protein factor. Biochem

Biophys Res Commun, 1991, vol 175 (1), p.236-43.

Page 149: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

149

ARNESON, L.S., KUNZ, J., ANDERSON, R.A., TRAUB, L.M. Coupled inositide

phosphorylation and phospholipase D activation initiates clathrin-coat assembly on

lysosomes. J Biol Chem, 1999, vol 274 (25), p.17794-805.

ARSENIAN, S., WEINHOLD, B., OELGESCHLAGER, M., RUTHER, U.,

NORDHEIM, A. Serum response factor is essential for mesoderm formation during mouse

embryogenesis. Embo J, 1998, vol 17 (21), p.6289-99.

ASPENSTROM, P. Effectors for the Rho GTPases. Curr Opin Cell Biol, 1999, vol 11 (1),

p.95-102.

AUERBACH, D., ROTHEN-RUTHISHAUSER, B., BANTLE, S., LEU, M., EHLER, E.,

HELFMAN, D., PERRIARD, J.C. Molecular mechanisms of myofibril assembly in heart.

Cell Struct Funct, 1997, vol 22 (1), p.139-46.

BABAI, F., MUSEVI-AGHDAM, J., SCHURCH, W., ROYAL, A., GABBIANI, G.

Coexpression of alpha-sarcomeric actin, alpha-smooth muscle actin and desmin during

myogenesis in rat and mouse embryos I. Skeletal muscle. Differentiation, 1990, vol 44 (2),

p.132-42.

BALBOA, M.A., BALSINDE, J., DENNIS, E.A., INSEL, P.A. A phospholipase D-

mediated pathway for generating diacylglycerol in nuclei from Madin-Darby canine kidney

cells. J Biol Chem, 1995, vol 270 (20), p.11738-40.

BALBOA, M.A., FIRESTEIN, B.L., GODSON, C., BELL, K.S., INSEL, P.A. Protein

kinase C alpha mediates phospholipase D activation by nucleotides and phorbol ester in

Madin-Darby canine kidney cells. Stimulation of phospholipase D is independent of

activation of polyphosphoinositide-specific phospholipase C and phospholipase A2. J Biol

Chem, 1994, vol 269 (14), p.10511-6.

BALBOA, M.A., INSEL, P.A. Nuclear phospholipase D in Madin-Darby canine kidney

cells. Guanosine 5'-O-(thiotriphosphate)-stimulated activation is mediated by RhoA and is

downstream of protein kinase C. J Biol Chem, 1995, vol 270 (50), p.29843-7.

Page 150: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

150

BALDASSARE, J.J., JARPE, M.B., ALFERES, L., RABEN, D.M. Nuclear translocation

of RhoA mediates the mitogen-induced activation of phospholipase D involved in nuclear

envelope signal transduction. J Biol Chem, 1997, vol 272 (8), p.4911-4.

BALLA, T., BONDEVA, T., VARNAI, P. How accurately can we image inositol lipids in

living cells? Trends Pharmacol Sci, 2000, vol 21 (7), p.238-41.

BANDMAN, E. Contractile protein isoforms in muscle development. Dev Biol, 1992, vol

154 (2), p.273-83.

BANNO, Y., FUJITA, H., ONO, Y., NAKASHIMA, S., ITO, Y., KUZUMAKI, N.,

NOZAWA, Y. Differential phospholipase D activation by bradykinin and sphingosine 1-

phosphate in NIH 3T3 fibroblasts overexpressing gelsolin. J Biol Chem, 1999, vol 274 (39),

p.27385-91.

BANNO, Y., TAMIYA-KOIZUMI, K., OSHIMA, H., MORIKAWA, A., YOSHIDA, S.,

NOZAWA, Y. Nuclear ADP-ribosylation factor (ARF)- and oleate-dependent phospholipase

D (PLD) in rat liver cells. Increases of ARF-dependent PLD activity in regenerating liver

cells. J Biol Chem, 1997, vol 272 (8), p.5208-13.

BENISTANT, C., RUBIN, R. Ethanol inhibits thrombin-induced secretion by human

platelets at a site distinct from phospholipase C or protein kinase C. Biochem J, 1990, vol

269 (2), p.489-97.

BESTERMAN, J.M., DURONIO, V., CUATRECASAS, P. Rapid formation of

diacylglycerol from phosphatidylcholine: a pathway for generation of a second messenger.

Proc Natl Acad Sci U S A, 1986, vol 83 (18), p.6785-9.

BI, K., ROTH, M.G., KTISTAKIS, N.T. Phosphatidic acid formation by phospholipase D

is required for transport from the endoplasmic reticulum to the Golgi complex. Curr Biol,

1997, vol 7 (5), p.301-7.

Page 151: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

151

BILLAH, M.M., PAI, J.K., MULLMANN, T.J., EGAN, R.W., SIEGEL, M.I. Regulation

of phospholipase D in HL-60 granulocytes. Activation by phorbol esters, diglyceride, and

calcium ionophore via protein kinase- independent mechanisms. J Biol Chem, 1989, vol 264

(15), p.9069-76.

BISHOP, A.L., HALL, A. Rho GTPases and their effector proteins. Biochem J, 2000, vol

348 Pt 2, p.241-55.

BLACK, B.L., MARTIN, J.F., OLSON, E.N. The mouse MRF4 promoter is trans-activated

directly and indirectly by muscle-specific transcription factors. J Biol Chem, 1995, vol 270

(7), p.2889-92.

BLACKWELL, T.K., WEINTRAUB, H. Differences and similarities in DNA-binding

preferences of MyoD and E2A protein complexes revealed by binding site selection. Science,

1990, vol 250 (4984), p.1104-10.

BLIGH, E.G., DYER, W.J. A rapid method of total lipid extraction and purification. Can J

Med Sci, 1959, vol 37 (8), p.911-7.

BOARDER, M.R. A role for phospholipase D in control of mitogenesis. Trends Pharmacol

Sci, 1994, vol 15 (2), p.57-62.

BOCZAN, J., BIRO, T., CZIFRA, G., LAZAR, J., PAPP, H., BARDOS, H., ADANY, R.,

MECHLER, F., KOVACS, L. Phorbol ester treatment inhibits proliferation and

differentiation of cultured human skeletal muscle satellite cells by differentially acting on

protein kinase C isoforms. Acta Neuropathol (Berl), 2001, vol 102 (1), p.55-62.

BOIVIN, P., LECOMTE, M. Les domaines homologues de la pleckstrine.

médecine/sciences, 1997, vol 13 (5), p.639-46.

BOLLAG, W.B., BARRETT, P.Q., ISALES, C.M., LISCOVITCH, M., RASMUSSEN,

H. A potential role for phospholipase-D in the angiotensin-II-induced stimulation of

aldosterone secretion from bovine adrenal glomerulosa cells. Endocrinology, 1990, vol 127

(3), p.1436-43.

Page 152: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

152

BOMAN, A.L., KAHN, R.A. Arf proteins: the membrane traffic police? Trends Biochem

Sci, 1995, vol 20 (4), p.147-50.

BORONENKOV, I.V., LOIJENS, J.C., UMEDA, M., ANDERSON, R.A.

Phosphoinositide signaling pathways in nuclei are associated with nuclear speckles

containing pre-mRNA processing factors. Mol Biol Cell, 1998, vol 9 (12), p.3547-60.

BOSCH, R.R., SMEETS, R.L., SLEUTELS, F., PATEL, A.M., EMST-DE VRIES, S.E.,

JOEP, J., DE PONT, H.H., WILLEMS, P.H. Concerted action of cytosolic Ca2+ and

protein kinase C in receptor-mediated phospholipase D activation in Chinese hamster ovary

cells expressing the cholecystokinin-A receptor. Biochem J, 1999, vol 337 ( Pt 2), p.263-8.

BRAND-SABERI, B., CHRIST, B. Genetic and epigenetic control of muscle development in

vertebrates. Cell Tissue Res, 1999, vol 296 (1), p.199-212.

BRAUN, T., BOBER, E., ARNOLD, H.H. Inhibition of muscle differentiation by the

adenovirus E1a protein: repression of the transcriptional activating function of the HLH

protein Myf-5. Genes Dev, 1992, vol 6 (5), p.888-902.

BRAUN, T., BUSCHHAUSEN-DENKER, G., BOBER, E., TANNICH, E., ARNOLD,

H.H. A novel human muscle factor related to but distinct from MyoD1 induces myogenic

conversion in 10T1/2 fibroblasts. Embo J, 1989, vol 8 (3), p.701-9.

BREITBART, R.E., LIANG, C.S., SMOOT, L.B., LAHERU, D.A., MAHDAVI, V.,

NADAL-GINARD, B. A fourth human MEF2 transcription factor, hMEF2D, is an early

marker of the myogenic lineage. Development, 1993, vol 118 (4), p.1095-106.

BROWN, F.D., THOMPSON, N., SAQIB, K.M., CLARK, J.M., POWNER, D.,

THOMPSON, N.T., SOLARI, R., WAKELAM, M.J. Phospholipase D1 localises to

secretory granules and lysosomes and is plasma-membrane translocated on cellular

stimulation. Curr Biol, 1998, vol 8 (14), p.835-8.

Page 153: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

153

BROWN, H.A., GUTOWSKI, S., KAHN, R.A., STERNWEIS, P.C. Partial purification

and characterization of Arf-sensitive phospholipase D from porcine brain. J Biol Chem,

1995, vol 270 (25), p.14935-43.

BROWN, H.A., GUTOWSKI, S., MOOMAW, C.R., SLAUGHTER, C., STERNWEIS,

P.C. ADP-ribosylation factor, a small GTP-dependent regulatory protein, stimulates

phospholipase D activity. Cell, 1993, vol 75 (6), p.1137-44.

BROWN, H.A., STERNWEIS, P.C. Stimulation of phospholipase D by ADP-ribosylation

factor. Methods Enzymol, 1995, vol 257, p.313-24.

BUCHBERGER, A., RAGGE, K., ARNOLD, H.H. The myogenin gene is activated during

myocyte differentiation by pre-existing, not newly synthesized transcription factor MEF-2. J

Biol Chem, 1994, vol 269 (25), p.17289-96.

BUCKINGHAM, M.E. Actin and myosin multigene families: their expression during the

formation of skeletal muscle. Essays Biochem, 1985, vol 20, p.77-109.

BUHL, A.M., JOHNSON, N.L., DHANASEKARAN, N., JOHNSON, G.L. G alpha 12

and G alpha 13 stimulate Rho-dependent stress fiber formation and focal adhesion assembly.

J Biol Chem, 1995, vol 270 (42), p.24631-4.

CAI, S., EXTON, J.H. Determination of interaction sites of phospholipase D1 for RhoA.

Biochem J, 2001, vol 355 (Pt 3), p.779-85.

CARNAC, G., PRIMIG, M., KITZMANN, M., CHAFEY, P., TUIL, D., LAMB, N.,

FERNANDEZ, A. RhoA GTPase and serum response factor control selectively the

expression of MyoD without affecting Myf5 in mouse myoblasts. Mol Biol Cell, 1998, vol 9

(7), p.1891-902.

CAUMONT, A.S., GALAS, M.C., VITALE, N., AUNIS, D., BADER, M.F. Regulated

exocytosis in chromaffin cells. Translocation of ARF6 stimulates a plasma membrane-

associated phospholipase D. J Biol Chem, 1998, vol 273 (3), p.1373-9.

Page 154: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

154

CAUMONT, A.S., VITALE, N., GENSSE, M., GALAS, M.C., CASANOVA, J.E.,

BADER, M.F. Identification of a plasma membrane-associated guanine nucleotide exchange

factor for ARF6 in chromaffin cells. Possible role in the regulated exocytotic pathway. J Biol

Chem, 2000, vol 275 (21), p.15637-44.

CHAI, J., TARNAWSKI, A.S. Serum response factor: discovery, biochemistry, biological

roles and implications for tissue injury healing. J Physiol Pharmacol, 2002, vol 53 (2), p.147-

57.

CHALIFA, V., MÖHN, H., LISCOVITCH, M. A neutral phospholipase D activity from rat

brain synaptic plasma membranes. Identification and partial characterization. J Biol Chem,

1990, vol 265 (29), p.17512-9.

CHALIFOUR, R., KANFER, J.N. Fatty acid activation and temperature perturbation of rat

brain microsomal phospholipase D. J Neurochem, 1982, vol 39 (2), p.299-305.

CHARDIN, P., BOQUET, P., MADAULE, P., POPOFF, M.R., RUBIN, E.J., GILL,

D.M. The mammalian G protein rhoC is ADP-ribosylated by Clostridium botulinum

exoenzyme C3 and affects actin microfilaments in Vero cells. Embo J, 1989, vol 8 (4), p.1087-

92.

CHAVRIER, P., GOUD, B. The role of ARF and Rab GTPases in membrane transport. Curr

Opin Cell Biol, 1999, vol 11 (4), p.466-75.

CHEN, J., SHAO, C., LAZAR, V., SRIVASTAVA, C.H., LEE, W.H., TISCHFIELD,

J.A. Localization of group IIc low molecular weight phospholipase A2 mRNA to meiotic cells

in the mouse. J Cell Biochem, 1997, vol 64 (3), p.369-75.

CHEN, J.S., EXTON, J.H. Regulation of phospholipase D2 activity by protein kinase C

alpha. J Biol Chem, 2004, vol 279 (21), p.22076-83.

CHENG, T.C., WALLACE, M.C., MERLIE, J.P., OLSON, E.N. Separable regulatory

elements governing myogenin transcription in mouse embryogenesis. Science, 1993, vol 261

(5118), p.215-8.

Page 155: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

155

CHEVALIER, A., KIENY, M., MAUGER, A. Limb-somite relationship: origin of the limb

musculature. J. Embryol. exp. Morph, 1977, vol 41, p.245-258.

CHOI, J., COSTA, M.L., MERMELSTEIN, C.S., CHAGAS, C., HOLTZER, S.,

HOLTZER, H. MyoD converts primary dermal fibroblasts, chondroblasts, smooth muscle,

and retinal pigmented epithelial cells into striated mononucleated myoblasts and

multinucleated myotubes. Proc Natl Acad Sci U S A, 1990, vol 87 (20), p.7988-92.

CHOI, W.S., CHAHDI, A., KIM, Y.M., FRAUNDORFER, P.F., BEAVEN, M.A.

Regulation of phospholipase D and secretion in mast cells by protein kinase A and other

protein kinases. Ann N Y Acad Sci, 2002, vol 968, p.198-212.

CHONG, L.D., TRAYNOR-KAPLAN, A., BOKOCH, G.M., SCHWARTZ, M.A. The

small GTP-binding protein Rho regulates a phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase in

mammalian cells. Cell, 1994, vol 79 (3), p.507-13.

CHRIST, B., ORDAHL, C.P. Early stages of chick somite development. Anat Embryol

(Berl), 1995, vol 191 (5), p.381-96.

CHUNG, J.K., SEKIYA, F., KANG, H.S., LEE, C., HAN, J.S., KIM, S.R., BAE, Y.S.,

MORRIS, A.J., RHEE, S.G. Synaptojanin inhibition of phospholipase D activity by

hydrolysis of phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate. J Biol Chem, 1997, vol 272 (25),

p.15980-5.

COCKCROFT, S. Signalling roles of mammalian phospholipase D1 and D2. Cell Mol Life

Sci, 2001, vol 58 (11), p.1674-87.

COCKCROFT, S., THOMAS, G.M., FENSOME, A., GENY, B., CUNNINGHAM, E.,

GOUT, I., HILES, I., TOTTY, N.F., TRUONG, O., HSUAN, J.J. Phospholipase D: a

downstream effector of ARF in granulocytes. Science, 1994, vol 263 (5146), p.523-6.

COCKROFT, D.L. A comparative and historical review of culture methods for vertebrates.

Int J Dev Biol, 1997, vol 41 (2), p.127-37.

Page 156: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

156

COLETTI, D., PALLESCHI, S., SILVESTRONI, L., CANNAVO, A., VIVARELLI, E.,

TOMEI, F., MOLINARO, M., ADAMO, S. Polychlorobiphenyls inhibit skeletal muscle

differentiation in culture. Toxicol Appl Pharmacol, 2001, vol 175 (3), p.226-33.

COLLEY, W.C., ALTSHULLER, Y.M., SUE-LING, C.K., COPELAND, N.G.,

GILBERT, D.J., JENKINS, N.A., BRANCH, K.D., TSIRKA, S.E., BOLLAG, R.J.,

BOLLAG, W.B., FROHMAN, M.A. Cloning and expression analysis of murine

phospholipase D1. Biochem J, 1997a, vol 326 ( Pt 3), p.745-53.

COLLEY, W.C., SUNG, T.C., ROLL, R., JENCO, J., HAMMOND, S.M.,

ALTSHULLER, Y., BAR-SAGI, D., MORRIS, A.J., FROHMAN, M.A. Phospholipase

D2, a distinct phospholipase D isoform with novel regulatory properties that provokes

cytoskeletal reorganization. Curr Biol, 1997b, vol 7 (3), p.191-201.

COOK, S.J., WAKELAM, M.J. Epidermal growth factor increases sn-1,2-diacylglycerol

levels and activates phospholipase D-catalysed phosphatidylcholine breakdown in Swiss 3T3

cells in the absence of inositol-lipid hydrolysis. Biochem J, 1992, vol 285 ( Pt 1), p.247-53.

COOLICAN, S.A., SAMUEL, D.S., EWTON, D.Z., MCWADE, F.J., FLORINI, J.R. The

mitogenic and myogenic actions of insulin-like growth factors utilize distinct signaling

pathways. J Biol Chem, 1997, vol 272 (10), p.6653-62.

COSSU, G., KELLY, R., TAJBAKHSH, S., DI DONNA, S., VIVARELLI, E.,

BUCKINGHAM, M. Activation of different myogenic pathways: myf-5 is induced by the

neural tube and MyoD by the dorsal ectoderm in mouse paraxial mesoderm. Development,

1996, vol 122 (2), p.429-37.

COSSU, G., MOLINARO, M., PACIFICI, M. Differential response of satellite cells and

embryonic myoblasts to a tumor promoter. Dev Biol, 1983, vol 98 (2), p.520-4.

CROSS, M.J., ROBERTS, S., RIDLEY, A.J., HODGKIN, M.N., STEWART, A.,

CLAESSON-WELSH, L., WAKELAM, M.J. Stimulation of actin stress fibre formation

mediated by activation of phospholipase D. Curr Biol, 1996, vol 6 (5), p.588-97.

Page 157: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

157

CSERJESI, P., LILLY, B., HINKLEY, C., PERRY, M., OLSON, E.N. Homeodomain

protein MHox and MADS protein myocyte enhancer-binding factor-2 converge on a common

element in the muscle creatine kinase enhancer. J Biol Chem, 1994, vol 269 (24), p.16740-5.

CSERJESI, P., OLSON, E.N. Myogenin induces the myocyte-specific enhancer binding

factor MEF-2 independently of other muscle-specific gene products. Mol Cell Biol, 1991, vol

11 (10), p.4854-62.

CURRIE, P.D., INGHAM, P.W. The generation and interpretation of positional

information within the vertebrate myotome. Mech Dev, 1998, vol 73 (1), p.3-21.

CZARNY, M., FIUCCI, G., LAVIE, Y., BANNO, Y., NOZAWA, Y., LISCOVITCH, M.

Phospholipase D2: functional interaction with caveolin in low-density membrane

microdomains. FEBS Lett, 2000, vol 467 (2-3), p.326-32.

CZARNY, M., LAVIE, Y., FIUCCI, G., LISCOVITCH, M. Localization of phospholipase

D in detergent-insoluble, caveolin-rich membrane domains. Modulation by caveolin-1

expression and caveolin-182-101. J Biol Chem, 1999, vol 274 (5), p.2717-24.

DABIRI, G.A., TURNACIOGLU, K.K., SANGER, J.M., SANGER, J.W.

Myofibrillogenesis visualized in living embryonic cardiomyocytes. Proc Natl Acad Sci U S A,

1997, vol 94 (17), p.9493-8.

DANIEL, L.W., SCIORRA, V.A., GHOSH, S. Phospholipase D, tumor promoters,

proliferation and prostaglandins. Biochim Biophys Acta, 1999, vol 1439 (2), p.265-76.

DANIN, M., CHALIFA, V., MÖHN, H., SCHMIDT, U.S., LISCOVITCH, M. Brain

membrane-bound phospholipase D. In Lipid Metabolism and Signaling Systems. J.N. Fain

(ed.) Meth. Neurosci., 1993, vol 18, p.14-24.

Page 158: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

158

DAVID, J.D., FASER, C.R., PERROT, G.P. Role of protein kinase C in chick embryo

skeletal myoblast fusion. Dev Biol, 1990, vol 139 (1), p.89-99.

DAVIS, J.S., WEAKLAND, L.L., FARESE, R.V., WEST, L.A. Luteinizing hormone

increases inositol trisphosphate and cytosolic free Ca2+ in isolated bovine luteal cells. J Biol

Chem, 1987, vol 262 (18), p.8515-21.

DAWSON, R.M., HEMINGTON, N. Some properties of purified phospholipase D and

especially the effect of amphipathic substances. Biochem J, 1967, vol 102 (1), p.76-86.

DECKER, C., MIRO OBRADORS, M.J., SILLENCE, D.J., ALLAN, D. Phorbol ester-

sensitive phospholipase D is mainly localized in the endoplasmic reticulum of BHK cells.

Biochem J, 1996, vol 320 ( Pt 3), p.885-90.

DI PAOLO, G., PELLEGRINI, L., LETINIC, K., CESTRA, G., ZONCU, R.,

VORONOV, S., CHANG, S., GUO, J., WENK, M.R., DE CAMILLI, P. Recruitment and

regulation of phosphatidylinositol phosphate kinase type 1 gamma by the FERM domain of

talin. Nature, 2002, vol 420 (6911), p.85-9.

DIAZ, O., BERQUAND, A., DUBOIS, M., DI AGOSTINO, S., SETTE, C.,

BOURGOIN, S., LAGARDE, M., NEMOZ, G., PRIGENT, A.F. The mechanism of

docosahexaenoic acid-induced phospholipase D activation in human lymphocytes involves

exclusion of the enzyme from lipid rafts. J Biol Chem, 2002, vol 277 (42), p.39368-78.

DIVECHA, N., ROEFS, M., HALSTEAD, J.R., D'ANDREA, S., FERNANDEZ-

BORGA, M., OOMEN, L., SAQIB, K.M., WAKELAM, M.J., D'SANTOS, C. Interaction

of the type Ialpha PIPkinase with phospholipase D: a role for the local generation of

phosphatidylinositol 4, 5-bisphosphate in the regulation of PLD2 activity. Embo J, 2000, vol

19 (20), p.5440-9.

DLUGOSZ, A.A., ANTIN, P.B., NACHMIAS, V.T., HOLTZER, H. The relationship

between stress fiber-like structures and nascent myofibrils in cultured cardiac myocytes. J

Cell Biol, 1984, vol 99 (6), p.2268-78.

Page 159: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

159

DONALDSON, J.G., FINAZZI, D., KLAUSNER, R.D. Brefeldin A inhibits Golgi

membrane-catalysed exchange of guanine nucleotide onto ARF protein. Nature, 1992, vol 360

(6402), p.350-2.

DOUGHMAN, R.L., FIRESTONE, A.J., ANDERSON, R.A. Phosphatidylinositol

phosphate kinases put PI4,5P(2) in its place. J Membr Biol, 2003, vol 194 (2), p.77-89.

D'SOUZA-SCHOREY, C., LI, G., COLOMBO, M.I., STAHL, P.D. A regulatory role for

ARF6 in receptor-mediated endocytosis. Science, 1995, vol 267 (5201), p.1175-8.

D'SOUZA-SCHOREY, C., VAN DONSELAAR, E., HSU, V.W., YANG, C., STAHL,

P.D., PETERS, P.J. ARF6 targets recycling vesicles to the plasma membrane: insights from

an ultrastructural investigation. J Cell Biol, 1998, vol 140 (3), p.603-16.

DU, A., SANGER, J.M., LINASK, K.K., SANGER, J.W. Myofibrillogenesis in the first

cardiomyocytes formed from isolated quail precardiac mesoderm. Dev Biol, 2003, vol 257

(2), p.382-94.

DU, G., ALTSHULLER, Y.M., KIM, Y., HAN, J.M., RYU, S.H., MORRIS, A.J.,

FROHMAN, M.A. Dual requirement for rho and protein kinase C in direct activation of

phospholipase D1 through G protein-coupled receptor signaling. Mol Biol Cell, 2000, vol 11

(12), p.4359-68.

DU, G., ALTSHULLER, Y.M., VITALE, N., HUANG, P., CHASSEROT-GOLAZ, S.,

MORRIS, A.J., BADER, M.F., FROHMAN, M.A. Regulation of phospholipase D1

subcellular cycling through coordination of multiple membrane association motifs. J Cell

Biol, 2003, vol 162 (2), p.305-15.

EARP, H.S., HUCKLE, W.R., DAWSON, T.L., LI, X., GRAVES, L.M., DY, R.

Angiotensin II activates at least two tyrosine kinases in rat liver epithelial cells. Separation of

the major calcium-regulated tyrosine kinase from p125FAK. J Biol Chem, 1995, vol 270 (47),

p.28440-7.

Page 160: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

160

EDMONDSON, D.G., CHENG, T.C., CSERJESI, P., CHAKRABORTY, T., OLSON,

E.N. Analysis of the myogenin promoter reveals an indirect pathway for positive

autoregulation mediated by the muscle-specific enhancer factor MEF-2. Mol Cell Biol, 1992,

vol 12 (9), p.3665-77.

EDMONDSON, D.G., OLSON, E.N. A gene with homology to the myc similarity region of

MyoD1 is expressed during myogenesis and is sufficient to activate the muscle differentiation

program. Genes Dev, 1989, vol 3 (5), p.628-40.

EL MARJOU, M., MONTALESCOT, V., BUZYN, A., GENY, B. Modifications in

phospholipase D activity and isoform expression occur upon maturation and differentiation in

vivo and in vitro in human myeloid cells. Leukemia, 2000, vol 14 (12), p.2118-27.

ELDAR, H., BEN-AV, P., SCHMIDT, U.S., LIVNEH, E., LISCOVITCH, M. Up-

regulation of phospholipase D activity induced by overexpression of protein kinase C-alpha.

Studies in intact Swiss/3T3 cells and in detergent-solubilized membranes in vitro. J Biol

Chem, 1993, vol 268 (17), p.12560-4.

ELLSON, C.D., ANDREWS, S., STEPHENS, L.R., HAWKINS, P.T. The PX domain: a

new phosphoinositide-binding module. J Cell Sci, 2002, vol 115 (Pt 6), p.1099-105.

ENGLISH, D. Phosphatidic acid: a lipid messenger involved in intracellular and

extracellular signalling. Cell Signal, 1996, vol 8 (5), p.341-7.

EWTON, D.Z., ROOF, S.L., MAGRI, K.A., MCWADE, F.J., FLORINI, J.R. IGF-II is

more active than IGF-I in stimulating L6A1 myogenesis: greater mitogenic actions of IGF-I

delay differentiation. J Cell Physiol, 1994, vol 161 (2), p.277-84.

EXTON, J.H. Phospholipase D: enzymology, mechanisms of regulation, and function.

Physiol Rev, 1997, vol 77 (2), p.303-20.

EXTON, J.H. Regulation of phospholipase D. Biochim Biophys Acta, 1999, vol 1439 (2),

p.121-33.

Page 161: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

161

EXTON, J.H. Regulation of phospholipase D. FEBS Lett, 2002, vol 531 (1), p.58-61.

FANG, Y., VILELLA-BACH, M., BACHMANN, R., FLANIGAN, A., CHEN, J.

Phosphatidic acid-mediated mitogenic activation of mTOR signaling. Science, 2001, vol 294

(5548), p.1942-5.

FENSOME, A., CUNNINGHAM, E., PROSSER, S., TAN, S.K., SWIGART, P.,

THOMAS, G., HSUAN, J., COCKCROFT, S. ARF and PITP restore GTP gamma S-

stimulated protein secretion from cytosol-depleted HL60 cells by promoting PIP2 synthesis.

Curr Biol, 1996, vol 6 (6), p.730-8.

FLORINI, J.R., EWTON, D.Z., MAGRI, K.A. Hormones, growth factors, and myogenic

differentiation. Annu Rev Physiol, 1991, vol 53, p.201-16.

FRANK, C., KEILHACK, H., OPITZ, F., ZSCHORNIG, O., BOHMER, F.D. Binding of

phosphatidic acid to the protein-tyrosine phosphatase SHP-1 as a basis for activity

modulation. Biochemistry, 1999, vol 38 (37), p.11993-2002.

FREYBERG, Z., SWEENEY, D., SIDDHANTA, A., BOURGOIN, S., FROHMAN, M.,

SHIELDS, D. Intracellular localization of phospholipase D1 in mammalian cells. Mol Biol

Cell, 2001, vol 12 (4), p.943-55.

FROHMAN, M.A., SUNG, T.C., MORRIS, A.J. Mammalian phospholipase D structure

and regulation. Biochim Biophys Acta, 1999, vol 1439 (2), p.175-86.

FUKUHARA, S., MURGA, C., ZOHAR, M., IGISHI, T., GUTKIND, J.S. A novel PDZ

domain containing guanine nucleotide exchange factor links heterotrimeric G proteins to

Rho. J Biol Chem, 1999, vol 274 (9), p.5868-79.

GARY, J.D., WURMSER, A.E., BONANGELINO, C.J., WEISMAN, L.S., EMR, S.D.

Fab1p is essential for PtdIns(3)P 5-kinase activity and the maintenance of vacuolar size and

membrane homeostasis. J Cell Biol, 1998, vol 143 (1), p.65-79.

Page 162: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

162

GASMAN, S., CHASSEROT-GOLAZ, S., BADER, M.F., VITALE, N. Regulation of

exocytosis in adrenal chromaffin cells: focus on ARF and Rho GTPases. Cell Signal, 2003,

vol 15 (10), p.893-9.

GAUTHIER-ROUVIERE, C., VANDROMME, M., TUIL, D., LAUTREDOU, N.,

MORRIS, M., SOULEZ, M., KAHN, A., FERNANDEZ, A., LAMB, N. Expression and

activity of serum response factor is required for expression of the muscle-determining factor

MyoD in both dividing and differentiating mouse C2C12 myoblasts. Mol Biol Cell, 1996, vol

7 (5), p.719-29.

GENY, B., COCKCROFT, S. Synergistic activation of phospholipase D by protein kinase

C- and G-protein-mediated pathways in streptolysin O-permeabilized HL60 cells. Biochem J,

1992, vol 284 ( Pt 2), p.531-8.

GHOSH, S., STRUM, J.C., SCIORRA, V.A., DANIEL, L., BELL, R.M. Raf-1 kinase

possesses distinct binding domains for phosphatidylserine and phosphatidic acid.

Phosphatidic acid regulates the translocation of Raf-1 in 12-O-tetradecanoylphorbol-13-

acetate-stimulated Madin-Darby canine kidney cells. J Biol Chem, 1996, vol 271 (14),

p.8472-80.

GHOSH, S., XIE, W.Q., QUEST, A.F., MABROUK, G.M., STRUM, J.C., BELL, R.M.

The cysteine-rich region of raf-1 kinase contains zinc, translocates to liposomes, and is

adjacent to a segment that binds GTP-ras. J Biol Chem, 1994, vol 269 (13), p.10000-7.

GILMORE, A.P., BURRIDGE, K. Regulation of vinculin binding to talin and actin by

phosphatidyl-inositol-4-5-bisphosphate. Nature, 1996, vol 381 (6582), p.531-5.

GILSON, M.K., STRAATSMA, T.P., MCCAMMON, J.A., RIPOLL, D.R., FAERMAN,

C.H., AXELSEN, P.H., SILMAN, I., SUSSMAN, J.L. Open "back door" in a molecular

dynamics simulation of acetylcholinesterase. Science, 1994, vol 263 (5151), p.1276-8.

Page 163: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

163

GODI, A., PERTILE, P., MEYERS, R., MARRA, P., DI TULLIO, G., IURISCI, C.,

LUINI, A., CORDA, D., DE MATTEIS, M.A. ARF mediates recruitment of PtdIns-4-OH

kinase-beta and stimulates synthesis of PtdIns(4,5)P2 on the Golgi complex. Nat Cell Biol,

1999, vol 1 (5), p.280-7.

GOHLA, A., HARHAMMER, R., SCHULTZ, G. The G-protein G13 but not G12 mediates

signaling from lysophosphatidic acid receptor via epidermal growth factor receptor to Rho. J

Biol Chem, 1998, vol 273 (8), p.4653-9.

GOHLA, A., OFFERMANNS, S., WILKIE, T.M., SCHULTZ, G. Differential

involvement of Galpha12 and Galpha13 in receptor-mediated stress fiber formation. J Biol

Chem, 1999, vol 274 (25), p.17901-7.

GOMEZ-MUNOZ, A., WAGGONER, D.W., O'BRIEN, L., BRINDLEY, D.N.

Interaction of ceramides, sphingosine, and sphingosine 1-phosphate in regulating DNA

synthesis and phospholipase D activity. J Biol Chem, 1995, vol 270 (44), p.26318-25.

GOSSETT, L.A., KELVIN, D.J., STERNBERG, E.A., OLSON, E.N. A new myocyte-

specific enhancer-binding factor that recognizes a conserved element associated with multiple

muscle-specific genes. Mol Cell Biol, 1989, vol 9 (11), p.5022-33.

GRANGE, M., SETTE, C., CUOMO, M., CONTI, M., LAGARDE, M., PRIGENT, A.F.,

NEMOZ, G. The cAMP-specific phosphodiesterase PDE4D3 is regulated by phosphatidic

acid binding. Consequences for cAMP signaling pathway and characterization of a

phosphatidic acid binding site. J Biol Chem, 2000, vol 275 (43), p.33379-87.

HA, K.S., EXTON, J.H. Activation of actin polymerization by phosphatidic acid derived

from phosphatidylcholine in IIC9 fibroblasts. J Cell Biol, 1993, vol 123 (6 Pt 2), p.1789-96.

HA, K.S., YEO, E.J., EXTON, J.H. Lysophosphatidic acid activation of

phosphatidylcholine-hydrolysing phospholipase D and actin polymerization by a pertussis

toxin-sensitive mechanism. Biochem J, 1994, vol 303 ( Pt 1), p.55-9.

Page 164: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

164

HALL, A. A biochemical function for ras--at last. Science, 1994, vol 264 (5164), p.1413-4.

HAMMOND, S.M., ALTSHULLER, Y.M., SUNG, T.C., RUDGE, S.A., ROSE, K.,

ENGEBRECHT, J., MORRIS, A.J., FROHMAN, M.A. Human ADP-ribosylation factor-

activated phosphatidylcholine-specific phospholipase D defines a new and highly conserved

gene family. J Biol Chem, 1995, vol 270 (50), p.29640-3.

HAMMOND, S.M., JENCO, J.M., NAKASHIMA, S., CADWALLADER, K., GU, Q.,

COOK, S., NOZAWA, Y., PRESTWICH, G.D., FROHMAN, M.A., MORRIS, A.J.

Characterization of two alternately spliced forms of phospholipase D1. Activation of the

purified enzymes by phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate, ADP-ribosylation factor, and Rho

family monomeric GTP-binding proteins and protein kinase C-alpha. J Biol Chem, 1997, vol

272 (6), p.3860-8.

HAN, J.M., KIM, J.H., LEE, B.D., LEE, S.D., KIM, Y., JUNG, Y.W., LEE, S., CHO,

W., OHBA, M., KUROKI, T., SUH, P.G., RYU, S.H. Phosphorylation-dependent

regulation of phospholipase D2 by protein kinase C delta in rat Pheochromocytoma PC12

cells. J Biol Chem, 2002, vol 277 (10), p.8290-7.

HANAHAN, D.J., CHAIKOFF, I.L. A new phospholipid-splitting enzyme specific for the

ester linkage between the nitrogenous base and the phosphoric acid grouping. J Biol Chem,

1947, vol 169, p.699-705.

HANDEL, S.E., GREASER, M.L., SCHULTZ, E., WANG, S.M., BULINSKI, J.C., LIN,

J.J., LESSARD, J.L. Chicken cardiac myofibrillogenesis studied with antibodies specific for

titin and the muscle and nonmuscle isoforms of actin and tropomyosin. Cell Tissue Res, 1991,

vol 263 (3), p.419-30.

HANLEY, M.R., BENTON, H.P., LIGHTMAN, S.L., TODD, K., BONE, E.A.,

FRETTEN, P., PALMER, S., KIRK, C.J., MICHELL, R.H. A vasopressin-like peptide in

the mammalian sympathetic nervous system. Nature, 1984, vol 309 (5965), p.258-61.

Page 165: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

165

HAREL, M., SCHALK, I., EHRET-SABATIER, L., BOUET, F., GOELDNER, M.,

HIRTH, C., AXELSEN, P.H., SILMAN, I., SUSSMAN, J.L. Quaternary ligand binding to

aromatic residues in the active-site gorge of acetylcholinesterase. Proc Natl Acad Sci U S A,

1993, vol 90 (19), p.9031-5.

HARLAN, J.E., HAJDUK, P.J., YOON, H.S., FESIK, S.W. Pleckstrin homology domains

bind to phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate. Nature, 1994, vol 371 (6493), p.168-70.

HART, M.J., JIANG, X., KOZASA, T., ROSCOE, W., SINGER, W.D., GILMAN, A.G.,

STERNWEIS, P.C., BOLLAG, G. Direct stimulation of the guanine nucleotide exchange

activity of p115 RhoGEF by Galpha13. Science, 1998, vol 280 (5372), p.2112-4.

HARTWIG, J.H., BOKOCH, G.M., CARPENTER, C.L., JANMEY, P.A., TAYLOR,

L.A., TOKER, A., STOSSEL, T.P. Thrombin receptor ligation and activated Rac uncap

actin filament barbed ends through phosphoinositide synthesis in permeabilized human

platelets. Cell, 1995, vol 82 (4), p.643-53.

HASTY, P., BRADLEY, A., MORRIS, J.H., EDMONDSON, D.G., VENUTI, J.M.,

OLSON, E.N., KLEIN, W.H. Muscle deficiency and neonatal death in mice with a targeted

mutation in the myogenin gene. Nature, 1993, vol 364 (6437), p.501-6.

HAY, J.C., FISETTE, P.L., JENKINS, G.H., FUKAMI, K., TAKENAWA, T.,

ANDERSON, R.A., MARTIN, T.F. ATP-dependent inositide phosphorylation required for

Ca(2+)-activated secretion. Nature, 1995, vol 374 (6518), p.173-7.

HAYAKAWA, K., NAKASHIMA, S., ITO, Y., MIZUTA, K., MIYATA, H., NOZAWA,

Y. Increased expression of phospholipase D1 mRNA during cAMP- or NGF-induced

differentiation in PC12 cells. Neurosci Lett, 1999, vol 265 (2), p.127-30.

HELMS, J.B., ROTHMAN, J.E. Inhibition by brefeldin A of a Golgi membrane enzyme that

catalyses exchange of guanine nucleotide bound to ARF. Nature, 1992, vol 360 (6402), p.352-

4.

Page 166: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

166

HESS, J.A., ROSS, A.H., QIU, R.G., SYMONS, M., EXTON, J.H. Role of Rho family

proteins in phospholipase D activation by growth factors. J Biol Chem, 1997, vol 272 (3),

p.1615-20.

HILL, C.S., WYNNE, J., TREISMAN, R. The Rho family GTPases RhoA, Rac1, and

CDC42Hs regulate transcriptional activation by SRF. Cell, 1995, vol 81 (7), p.1159-70.

HILPELA, P., VARTIAINEN, M.K., LAPPALAINEN, P. Regulation of the actin

cytoskeleton by PI(4,5)P2 and PI(3,4,5)P3. Curr Top Microbiol Immunol, 2004, vol 282,

p.117-63.

HINCHLIFFE, K.A., CIRUELA, A., IRVINE, R.F. PIPkins1, their substrates and their

products: new functions for old enzymes. Biochim Biophys Acta, 1998, vol 1436 (1-2), p.87-

104.

HODGKIN, M.N., CLARK, J.M., ROSE, S., SAQIB, K., WAKELAM, M.J.

Characterization of the regulation of phospholipase D activity in the detergent-insoluble

fraction of HL60 cells by protein kinase C and small G-proteins. Biochem J, 1999, vol 339 (

Pt 1), p.87-93.

HODGKIN, M.N., MASSON, M.R., POWNER, D., SAQIB, K.M., PONTING, C.P.,

WAKELAM, M.J. Phospholipase D regulation and localisation is dependent upon a

phosphatidylinositol 4,5-biphosphate-specific PH domain. Curr Biol, 2000, vol 10 (1), p.43-6.

HOËR, A., CETINDAG, C., OBERDISSE, E. Influence of phosphatidylinositol 4,5-

bisphosphate on human phospholipase D1 wild-type and deletion mutants: is there evidence

for an interaction of phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate with the putative pleckstrin

homology domain? Biochim Biophys Acta, 2000, vol 1481 (1), p.189-201.

HONDA, A., NOGAMI, M., YOKOZEKI, T., YAMAZAKI, M., NAKAMURA, H.,

WATANABE, H., KAWAMOTO, K., NAKAYAMA, K., MORRIS, A.J., FROHMAN,

M.A., KANAHO, Y. Phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase alpha is a downstream

effector of the small G protein ARF6 in membrane ruffle formation. Cell, 1999, vol 99 (5),

p.521-32.

Page 167: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

167

HOOLEY, R., YU, C.Y., SYMONS, M., BARBER, D.L. G alpha 13 stimulates Na+-H+

exchange through distinct Cdc42-dependent and RhoA-dependent pathways. J Biol Chem,

1996, vol 271 (11), p.6152-8.

HU, T., EXTON, J.H. Mechanisms of regulation of phospholipase D1 by protein kinase

Calpha. J Biol Chem, 2003, vol 278 (4), p.2348-55.

HUANG, C.F., CABOT, M.C. Phorbol diesters stimulate the accumulation of

phosphatidate, phosphatidylethanol, and diacylglycerol in three cell types. Evidence for the

indirect formation of phosphatidylcholine-derived diacylglycerol by a phospholipase D

pathway and direct formation of diacylglycerol by a phospholipase C pathway. J Biol Chem,

1990, vol 265 (25), p.14858-63.

HUG, H., SARRE, T.F. Protein kinase C isoenzymes: divergence in signal transduction?

Biochem J, 1993, vol 291 ( Pt 2), p.329-43.

HUGHES, S.M. Muscle development. Running without regulators. Nature, 1992, vol 360

(6404), p.536-7.

HUMEAU, Y., VITALE, N., CHASSEROT-GOLAZ, S., DUPONT, J.L., DU, G.,

FROHMAN, M.A., BADER, M.F., POULAIN, B. A role for phospholipase D1 in

neurotransmitter release. Proc Natl Acad Sci U S A, 2001, vol 98 (26), p.15300-5.

IGNOTZ, R.A., MASSAGUE, J. Type beta transforming growth factor controls the

adipogenic differentiation of 3T3 fibroblasts. Proc Natl Acad Sci U S A, 1985, vol 82 (24),

p.8530-4.

ISHIHARA, H., SHIBASAKI, Y., KIZUKI, N., KATAGIRI, H., YAZAKI, Y., ASANO,

T., OKA, Y. Cloning of cDNAs encoding two isoforms of 68-kDa type I phosphatidylinositol-

4-phosphate 5-kinase. J Biol Chem, 1996, vol 271 (39), p.23611-4.

Page 168: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

168

ISHIHARA, H., SHIBASAKI, Y., KIZUKI, N., WADA, T., YAZAKI, Y., ASANO, T.,

OKA, Y. Type I phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinases. Cloning of the third isoform and

deletion/substitution analysis of members of this novel lipid kinase family. J Biol Chem, 1998,

vol 273 (15), p.8741-8.

ITO, Y., NAKASHIMA, S., NOZAWA, Y. Hydrogen peroxide-induced phospholipase D

activation in rat pheochromocytoma PC12 cells: possible involvement of Ca2+-dependent

protein tyrosine kinase. J Neurochem, 1997, vol 69 (2), p.729-36.

ITOH, T., ISHIHARA, H., SHIBASAKI, Y., OKA, Y., TAKENAWA, T.

Autophosphorylation of type I phosphatidylinositol phosphate kinase regulates its lipid kinase

activity. J Biol Chem, 2000, vol 275 (25), p.19389-94.

IYER, S.S., KUSNER, D.J. Association of phospholipase D activity with the detergent-

insoluble cytoskeleton of U937 promonocytic leukocytes. J Biol Chem, 1999, vol 274 (4),

p.2350-9.

JAMAL, Z., MARTIN, A., GOMEZ-MUNOZ, A., BRINDLEY, D.N. Plasma membrane

fractions from rat liver contain a phosphatidate phosphohydrolase distinct from that in the

endoplasmic reticulum and cytosol. J Biol Chem, 1991, vol 266 (5), p.2988-96.

JANMEY, P.A., XIAN, W., FLANAGAN, L.A. Controlling cytoskeleton structure by

phosphoinositide-protein interactions: phosphoinositide binding protein domains and effects

of lipid packing. Chem Phys Lipids, 1999, vol 101 (1), p.93-107.

JENCO, J.M., RAWLINGSON, A., DANIELS, B., MORRIS, A.J. Regulation of

phospholipase D2: selective inhibition of mammalian phospholipase D isoenzymes by alpha-

and beta-synucleins. Biochemistry, 1998, vol 37 (14), p.4901-9.

JENKINS, G.H., FISETTE, P.L., ANDERSON, R.A. Type I phosphatidylinositol 4-

phosphate 5-kinase isoforms are specifically stimulated by phosphatidic acid. J Biol Chem,

1994, vol 269 (15), p.11547-54.

Page 169: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

169

JIANG, H., ALEXANDROPOULOS, K., SONG, J., FOSTER, D.A. Evidence that v-Src-

induced phospholipase D activity is mediated by a G protein. Mol Cell Biol, 1994, vol 14 (6),

p.3676-82.

JONES, D.H., BAX, B., FENSOME, A., COCKCROFT, S. ADP ribosylation factor 1

mutants identify a phospholipase D effector region and reveal that phospholipase D

participates in lysosomal secretion but is not sufficient for recruitment of coatomer I.

Biochem J, 1999, vol 341 ( Pt 1), p.185-92.

JONES, D.R., SANJUAN, M.A., MERIDA, I. Type Ialpha phosphatidylinositol 4-

phosphate 5-kinase is a putative target for increased intracellular phosphatidic acid. FEBS

Lett, 2000, vol 476 (3), p.160-5.

JUNG, E.M., BETANCOURT-CALLE, S., MANN-BLAKENEY, R., GRINER, R.D.,

BOLLINGER BOLLAG, W. Sustained phospholipase D activation is associated with

keratinocyte differentiation. Carcinogenesis, 1999, vol 20 (4), p.569-76.

KALCHEIM, C., CINNAMON, Y., KAHANE, N. Myotome formation: a multistage

process. Cell Tissue Res, 1999, vol 296 (1), p.161-73.

KAM, Y., EXTON, J.H. Phospholipase D activity is required for actin stress fiber formation

in fibroblasts. Mol Cell Biol, 2001, vol 21 (12), p.4055-66.

KANFER, J.N. The base exchange enzymes and phospholipase D of mammalian tissue. Can

J Biochem, 1980, vol 58 (12), p.1370-80.

KARASSEVA, N., TSIKA, G., JI, J., ZHANG, A., MAO, X., TSIKA, R. Transcription

enhancer factor 1 binds multiple muscle MEF2 and A/T-rich elements during fast-to-slow

skeletal muscle fiber type transitions. Mol Cell Biol, 2003, vol 23 (15), p.5143-64.

KATAYAMA, K., KODAKI, T., NAGAMACHI, Y., YAMASHITA, S. Cloning,

differential regulation and tissue distribution of alternatively spliced isoforms of ADP-

ribosylation-factor-dependent phospholipase D from rat liver. Biochem J, 1998, vol 329 ( Pt

3), p.647-52.

Page 170: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

170

KAUSHAL, S., SCHNEIDER, J.W., NADAL-GINARD, B., MAHDAVI, V. Activation of

the myogenic lineage by MEF2A, a factor that induces and cooperates with MyoD. Science,

1994, vol 266 (5188), p.1236-40.

KELLER, T.C., 3RD Structure and function of titin and nebulin. Curr Opin Cell Biol, 1995,

vol 7 (1), p.32-8.

KHAN, N.A., HICHAMI, A. Ionotrophic 5-hydroxytryptamine type 3 receptor activates the

protein kinase C-dependent phospholipase D pathway in human T-cells. Biochem J, 1999, vol

344 Pt 1, p.199-204.

KIM, Y., HAN, J.M., HAN, B.R., LEE, K.A., KIM, J.H., LEE, B.D., JANG, I.H., SUH,

P.G., RYU, S.H. Phospholipase D1 is phosphorylated and activated by protein kinase C in

caveolin-enriched microdomains within the plasma membrane. J Biol Chem, 2000, vol 275

(18), p.13621-7.

KIM, Y., HAN, J.M., PARK, J.B., LEE, S.D., OH, Y.S., CHUNG, C., LEE, T.G., KIM,

J.H., PARK, S.K., YOO, J.S., SUH, P.G., RYU, S.H. Phosphorylation and activation of

phospholipase D1 by protein kinase C in vivo: determination of multiple phosphorylation

sites. Biochemistry, 1999, vol 38 (32), p.10344-51.

KIMURA, K., ITO, M., AMANO, M., CHIHARA, K., FUKATA, Y., NAKAFUKU, M.,

YAMAMORI, B., FENG, J., NAKANO, T., OKAWA, K., IWAMATSU, A.,

KAIBUCHI, K. Regulation of myosin phosphatase by Rho and Rho-associated kinase (Rho-

kinase). Science, 1996, vol 273 (5272), p.245-8.

KITZMANN, M., VANDROMME, M., SCHAEFFER, V., CARNAC, G., LABBE, J.C.,

LAMB, N., FERNANDEZ, A. cdk1- and cdk2-mediated phosphorylation of MyoD Ser200 in

growing C2 myoblasts: role in modulating MyoD half-life and myogenic activity. Mol Cell

Biol, 1999, vol 19 (4), p.3167-76.

KOBAYASHI, M., KANFER, J.N. Phosphatidylethanol formation via

transphosphatidylation by rat brain synaptosomal phospholipase D. J Neurochem, 1987, vol

48 (5), p.1597-603.

Page 171: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

171

KODAKI, T., YAMASHITA, S. Cloning, expression, and characterization of a novel

phospholipase D complementary DNA from rat brain. J Biol Chem, 1997, vol 272 (17),

p.11408-13.

KOZASA, T., GILMAN, A.G. Protein kinase C phosphorylates G12 alpha and inhibits its

interaction with G beta gamma. J Biol Chem, 1996, vol 271 (21), p.12562-7.

KOZASA, T., JIANG, X., HART, M.J., STERNWEIS, P.M., SINGER, W.D., GILMAN,

A.G., BOLLAG, G., STERNWEIS, P.C. p115 RhoGEF, a GTPase activating protein for

Galpha12 and Galpha13. Science, 1998, vol 280 (5372), p.2109-11.

KOZMA, R., AHMED, S., BEST, A., LIM, L. The Ras-related protein Cdc42Hs and

bradykinin promote formation of peripheral actin microspikes and filopodia in Swiss 3T3

fibroblasts. Mol Cell Biol, 1995, vol 15 (4), p.1942-52.

KTISTAKIS, N.T., BROWN, H.A., STERNWEIS, P.C., ROTH, M.G. Phospholipase D is

present on Golgi-enriched membranes and its activation by ADP ribosylation factor is

sensitive to brefeldin A. Proc Natl Acad Sci U S A, 1995, vol 92 (11), p.4952-6.

KTISTAKIS, N.T., BROWN, H.A., WATERS, M.G., STERNWEIS, P.C., ROTH, M.G.

Evidence that phospholipase D mediates ADP ribosylation factor-dependent formation of

Golgi coated vesicles. J Cell Biol, 1996, vol 134 (2), p.295-306.

KTISTAKIS, N.T., DELON, C., MANIFAVA, M., WOOD, E., GANLEY, I., SUGARS,

J.M. Phospholipase D1 and potential targets of its hydrolysis product, phosphatidic acid.

Biochem Soc Trans, 2003, vol 31 (Pt 1), p.94-7.

KURIBARA, H., TAGO, K., YOKOZEKI, T., SASAKI, T., TAKAI, Y., MORII, N.,

NARUMIYA, S., KATADA, T., KANAHO, Y. Synergistic activation of rat brain

phospholipase D by ADP-ribosylation factor and rhoA p21, and its inhibition by Clostridium

botulinum C3 exoenzyme. J Biol Chem, 1995, vol 270 (43), p.25667-71.

Page 172: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

172

KWAK, J.Y., LOPEZ, I., UHLINGER, D.J., RYU, S.H., LAMBETH, J.D. RhoA and a

cytosolic 50-kDa factor reconstitute GTP gamma S-dependent phospholipase D activity in

human neutrophil subcellular fractions. J Biol Chem, 1995, vol 270 (45), p.27093-8.

LASSAR, A.B., BUSKIN, J.N., LOCKSHON, D., DAVIS, R.L., APONE, S.,

HAUSCHKA, S.D., WEINTRAUB, H. MyoD is a sequence-specific DNA binding protein

requiring a region of myc homology to bind to the muscle creatine kinase enhancer. Cell,

1989, vol 58 (5), p.823-31.

LASSAR, A.B., SKAPEK, S.X., NOVITCH, B. Regulatory mechanisms that coordinate

skeletal muscle differentiation and cell cycle withdrawal. Curr Opin Cell Biol, 1994, vol 6 (6),

p.788-94.

LAWRENCE, J.B., TANEJA, K., SINGER, R.H. Temporal resolution and sequential

expression of muscle-specific genes revealed by in situ hybridization. Dev Biol, 1989, vol 133

(1), p.235-46.

LEE, C., KANG, H.S., CHUNG, J.K., SEKIYA, F., KIM, J.R., HAN, J.S., KIM, S.R.,

BAE, Y.S., MORRIS, A.J., RHEE, S.G. Inhibition of phospholipase D by clathrin assembly

protein 3 (AP3). J Biol Chem, 1997a, vol 272 (25), p.15986-92.

LEE, C., KIM, S.R., CHUNG, J.K., FROHMAN, M.A., KILIMANN, M.W., RHEE, S.G.

Inhibition of phospholipase D by amphiphysins. J Biol Chem, 2000, vol 275 (25), p.18751-8.

LEE, S., PARK, J.B., KIM, J.H., KIM, Y., SHIN, K.J., LEE, J.S., HA, S.H., SUH, P.G.,

RYU, S.H. Actin directly interacts with phospholipase D, inhibiting its activity. J Biol Chem,

2001, vol 276 (30), p.28252-60.

LEE, T.C., CHOW, K.L., FANG, P., SCHWARTZ, R.J. Activation of skeletal alpha-actin

gene transcription: the cooperative formation of serum response factor-binding complexes

over positive cis-acting promoter serum response elements displaces a negative-acting

nuclear factor enriched in replicating myoblasts and nonmyogenic cells. Mol Cell Biol, 1991,

vol 11 (10), p.5090-100.

Page 173: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

173

LEE, T.W., COTECCHIA, S., MILLIGAN, G. Up-regulation of the levels of expression

and function of a constitutively active mutant of the hamster alpha1B-adrenoceptor by ligands

that act as inverse agonists. Biochem J, 1997b, vol 325 ( Pt 3), p.733-9.

LEEVERS, S.J., PATERSON, H.F., MARSHALL, C.J. Requirement for Ras in Raf

activation is overcome by targeting Raf to the plasma membrane. Nature, 1994, vol 369

(6479), p.411-4.

LEIROS, I., SECUNDO, F., ZAMBONELLI, C., SERVI, S., HOUGH, E. The first crystal

structure of a phospholipase D. Structure Fold Des, 2000, vol 8 (6), p.655-67.

LENHARD, J.M., COLOMBO, M.I., STAHL, P.D. Heterotrimeric GTP-binding proteins

(G proteins) and ADP-ribosylation factor (ARF) regulate priming of endosomal membranes

for fusion. Arch Biochem Biophys, 1994, vol 312 (2), p.474-9.

LIM, J., YUSOFF, P., WONG, E.S., CHANDRAMOULI, S., LAO, D.H., FONG, C.W.,

GUY, G.R. The cysteine-rich sprouty translocation domain targets mitogen-activated protein

kinase inhibitory proteins to phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate in plasma membranes.

Mol Cell Biol, 2002, vol 22 (22), p.7953-66.

LIN, Y., ISHIKAWA, R., OKAGAKI, T., YE, L.H., KOHAMA, K. Stimulation of the

ATP-dependent interaction between actin and myosin by a myosin-binding fragment of

smooth muscle caldesmon. Cell Motil Cytoskeleton, 1994, vol 29 (3), p.250-8.

LING, K., DOUGHMAN, R.L., FIRESTONE, A.J., BUNCE, M.W., ANDERSON, R.A.

Type I gamma phosphatidylinositol phosphate kinase targets and regulates focal adhesions.

Nature, 2002, vol 420 (6911), p.89-93.

LISCOVITCH, M., CHALIFA, V., DANIN, M., ELI, Y. Inhibition of neural

phospholipase D activity by aminoglycoside antibiotics. Biochem J, 1991, vol 279 ( Pt 1),

p.319-21.

Page 174: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

174

LISCOVITCH, M., CZARNY, M., FIUCCI, G., TANG, X. Phospholipase D: molecular

and cell biology of a novel gene family. Biochem J, 2000, vol 345 Pt 3, p.401-15.

LOIJENS, J.C., ANDERSON, R.A. Type I phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinases are

distinct members of this novel lipid kinase family. J Biol Chem, 1996, vol 271 (51), p.32937-

43.

LOPEZ, I., ARNOLD, R.S., LAMBETH, J.D. Cloning and initial characterization of a

human phospholipase D2 (hPLD2). ADP-ribosylation factor regulates hPLD2. J Biol Chem,

1998, vol 273 (21), p.12846-52.

LU, M.H., DILULLO, C., SCHULTHEISS, T., HOLTZER, S., MURRAY, J.M., CHOI,

J., FISCHMAN, D.A., HOLTZER, H. The vinculin/sarcomeric-alpha-actinin/alpha-actin

nexus in cultured cardiac myocytes. J Cell Biol, 1992, vol 117 (5), p.1007-22.

LUKOWSKI, S., LECOMTE, M.C., MIRA, J.P., MARIN, P., GAUTERO, H., RUSSO-

MARIE, F., GENY, B. Inhibition of phospholipase D activity by fodrin. An active role for

the cytoskeleton. J Biol Chem, 1996, vol 271 (39), p.24164-71.

LUKOWSKI, S., MIRA, J.P., ZACHOWSKI, A., GENY, B. Fodrin inhibits

phospholipases A2, C, and D by decreasing polyphosphoinositide cell content. Biochem

Biophys Res Commun, 1998, vol 248 (2), p.278-84.

MACK, C.P., THOMPSON, M.M., LAWRENZ-SMITH, S., OWENS, G.K. Smooth

muscle alpha-actin CArG elements coordinate formation of a smooth muscle cell-selective,

serum response factor-containing activation complex. Circ Res, 2000, vol 86 (2), p.221-32.

MACKAY, D.J., HALL, A. Rho GTPases. J Biol Chem, 1998, vol 273 (33), p.20685-8.

MADAULE, P., FURUYASHIKI, T., REID, T., ISHIZAKI, T., WATANABE, G.,

MORII, N., NARUMIYA, S. A novel partner for the GTP-bound forms of rho and rac.

FEBS Lett, 1995, vol 377 (2), p.243-8.

Page 175: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

175

MADESH, M., BALASUBRAMANIAN, K.A. Nitric oxide inhibits enterocyte

mitochondrial phospholipase D. FEBS Lett, 1997, vol 413 (2), p.269-72.

MADESH, M., BENARD, O., BALASUBRAMANIAN, K.A. Increased phospholipase D

activity in butyrate-induced differentiation of HT-29 cells. Cancer Lett, 1998, vol 132 (1-2),

p.141-6.

MADESH, M., IBRAHIM, S.A., BALASUBRAMANIAN, K.A. Phospholipase D activity

in the intestinal mitochondria: activation by oxygen free radicals. Free Radic Biol Med, 1997,

vol 23 (2), p.271-7.

MAEKAWA, M., ISHIZAKI, T., BOKU, S., WATANABE, N., FUJITA, A.,

IWAMATSU, A., OBINATA, T., OHASHI, K., MIZUNO, K., NARUMIYA, S. Signaling

from Rho to the actin cytoskeleton through protein kinases ROCK and LIM-kinase. Science,

1999, vol 285 (5429), p.895-8.

MALCOLM, K.C., ROSS, A.H., QIU, R.G., SYMONS, M., EXTON, J.H. Activation of

rat liver phospholipase D by the small GTP-binding protein RhoA. J Biol Chem, 1994, vol

269 (42), p.25951-4.

MANIFAVA, M., THURING, J.W., LIM, Z.Y., PACKMAN, L., HOLMES, A.B.,

KTISTAKIS, N.T. Differential binding of traffic-related proteins to phosphatidic acid- or

phosphatidylinositol (4,5)- bisphosphate-coupled affinity reagents. J Biol Chem, 2001, vol

276 (12), p.8987-94.

MARTIN, J.F., SCHWARZ, J.J., OLSON, E.N. Myocyte enhancer factor (MEF) 2C: a

tissue-restricted member of the MEF-2 family of transcription factors. Proc Natl Acad Sci U

S A, 1993, vol 90 (11), p.5282-6.

MASSENBURG, D., HAN, J.S., LIYANAGE, M., PATTON, W.A., RHEE, S.G., MOSS,

J., VAUGHAN, M. Activation of rat brain phospholipase D by ADP-ribosylation factors 1,5,

and 6: separation of ADP-ribosylation factor-dependent and oleate-dependent enzymes. Proc

Natl Acad Sci U S A, 1994, vol 91 (24), p.11718-22.

Page 176: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

176

MCDERMOTT, J.C., CARDOSO, M.C., YU, Y.T., ANDRES, V., LEIFER, D.,

KRAINC, D., LIPTON, S.A., NADAL-GINARD, B. hMEF2C gene encodes skeletal

muscle- and brain-specific transcription factors. Mol Cell Biol, 1993, vol 13 (4), p.2564-77.

MCDERMOTT, M., WAKELAM, M.J., MORRIS, A.J. Phospholipase D. Biochem Cell

Biol, 2004, vol 82 (1), p.225-53.

MEACCI, E., DONATI, C., CENCETTI, F., ROMITI, E., FARNARARO, M., BRUNI,

P. Receptor-activated phospholipase D is present in caveolin-3-enriched light membranes of

C2C12 myotubes. FEBS Lett, 2000, vol 473 (1), p.10-4.

MEIER, S. Development of the chick embryo mesoblast. Formation of the embryonic axis

and establishment of the metameric pattern. Dev Biol, 1979, vol 73 (1), p.24-45.

MIANO, J.M. Serum response factor: toggling between disparate programs of gene

expression. J Mol Cell Cardiol, 2003, vol 35 (6), p.577-93.

MICHELL, R.H., KIRK, C.J., BILLAH, M.M. Hormonal stimulation of

phosphatidylinositol breakdown with particular reference to the hepatic effects of

vasopressin. Biochem Soc Trans, 1979, vol 7 (5), p.861-5.

MILLAR, C.A., JESS, T.J., SAQIB, K.M., WAKELAM, M.J., GOULD, G.W. 3T3-L1

adipocytes express two isoforms of phospholipase D in distinct subcellular compartments.

Biochem Biophys Res Commun, 1999, vol 254 (3), p.734-8.

MIN, D.S., AHN, B.H., RHIE, D.J., YOON, S.H., HAHN, S.J., KIM, M.S., JO, Y.H.

Expression and regulation of phospholipase D during neuronal differentiation of PC12 cells.

Neuropharmacology, 2001, vol 41 (3), p.384-91.

MIN, D.S., PARK, S.K., EXTON, J.H. Characterization of a rat brain phospholipase D

isozyme. J Biol Chem, 1998, vol 273 (12), p.7044-51.

Page 177: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

177

MINEO, C., ANDERSON, R.G., WHITE, M.A. Physical association with ras enhances

activation of membrane-bound raf (RafCAAX). J Biol Chem, 1997, vol 272 (16), p.10345-8.

MINER, J.H., MILLER, J.B., WOLD, B.J. Skeletal muscle phenotypes initiated by ectopic

MyoD in transgenic mouse heart. Development, 1992, vol 114 (4), p.853-60.

MINOTTI, S., SCICCHITANO, B.M., NERVI, C., SCARPA, S., LUCARELLI, M.,

MOLINARO, M., ADAMO, S. Vasopressin and insulin-like growth factors synergistically

induce myogenesis in serum-free medium. Cell Growth Differ, 1998, vol 9 (2), p.155-63.

MINTY, A., KEDES, L. Upstream regions of the human cardiac actin gene that modulate

its transcription in muscle cells: presence of an evolutionarily conserved repeated motif. Mol

Cell Biol, 1986, vol 6 (6), p.2125-36.

MIURA, Y., KIKUCHI, A., MUSHA, T., KURODA, S., YAKU, H., SASAKI, T.,

TAKAI, Y. Regulation of morphology by rho p21 and its inhibitory GDP/GTP exchange

protein (rho GDI) in Swiss 3T3 cells. J Biol Chem, 1993, vol 268 (1), p.510-5.

MIWA, T., KEDES, L. Duplicated CArG box domains have positive and mutually

dependent regulatory roles in expression of the human alpha-cardiac actin gene. Mol Cell

Biol, 1987, vol 7 (8), p.2803-13.

MÖHN, H., CHALIFA, V., LISCOVITCH, M. Substrate specificity of neutral

phospholipase D from rat brain studied by selective labeling of endogenous synaptic

membrane phospholipids in vitro. J Biol Chem, 1992, vol 267 (16), p.11131-6.

MORGAN, C.P., SENGELOV, H., WHATMORE, J., BORREGAARD, N.,

COCKCROFT, S. ADP-ribosylation-factor-regulated phospholipase D activity localizes to

secretory vesicles and mobilizes to the plasma membrane following N-formylmethionyl-

leucyl-phenylalanine stimulation of human neutrophils. Biochem J, 1997, vol 325 ( Pt 3),

p.581-5.

Page 178: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

178

MORISAKI, T., SERMSUVITAYAWONG, K., BYUN, S.H., MATSUDA, Y., HIDAKA,

K., MORISAKI, H., MUKAI, T. Mouse Mef2b gene: unique member of MEF2 gene family.

J Biochem (Tokyo), 1997, vol 122 (5), p.939-46.

MORITZ, A., DE GRAAN, P.N., GISPEN, W.H., WIRTZ, K.W. Phosphatidic acid is a

specific activator of phosphatidylinositol-4-phosphate kinase. J Biol Chem, 1992, vol 267

(11), p.7207-10.

MORRIS, A.J., FROHMAN, M.A., ENGEBRECHT, J. Measurement of phospholipase D

activity. Anal Biochem, 1997, vol 252 (1), p.1-9.

MOSS, J., VAUGHAN, M. Molecules in the ARF orbit. J Biol Chem, 1998, vol 273 (34),

p.21431-4.

MURRE, C., MCCAW, P.S., VAESSIN, H., CAUDY, M., JAN, L.Y., JAN, Y.N.,

CABRERA, C.V., BUSKIN, J.N., HAUSCHKA, S.D., LASSAR, A.B. Interactions

between heterologous helix-loop-helix proteins generate complexes that bind specifically to a

common DNA sequence. Cell, 1989, vol 58 (3), p.537-44.

MUSARO, A., MCCULLAGH, K.J., NAYA, F.J., OLSON, E.N., ROSENTHAL, N.

IGF-1 induces skeletal myocyte hypertrophy through calcineurin in association with GATA-2

and NF-ATc1. Nature, 1999, vol 400 (6744), p.581-5.

MUSCAT, G.E., PERRY, S., PRENTICE, H., KEDES, L. The human skeletal alpha-actin

gene is regulated by a muscle-specific enhancer that binds three nuclear factors. Gene Expr,

1992, vol 2 (2), p.111-26.

NABESHIMA, Y., HANAOKA, K., HAYASAKA, M., ESUMI, E., LI, S., NONAKA, I.

Myogenin gene disruption results in perinatal lethality because of severe muscle defect.

Nature, 1993, vol 364 (6437), p.532-5.

NAIDU, P.S., LUDOLPH, D.C., TO, R.Q., HINTERBERGER, T.J., KONIECZNY, S.F.

Myogenin and MEF2 function synergistically to activate the MRF4 promoter during

myogenesis. Mol Cell Biol, 1995, vol 15 (5), p.2707-18.

Page 179: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

179

NAKASHIMA, S., IWASAKI, Y., MIZUTANI, T., OHGUCHI, K., NAGATA, K.,

KITAJIMA, Y., NOZAWA, Y. Differential expression of protein kinase C isozymes and

small GTP-binding proteins during HL60 cell differentiation by retinoic acid and cyclic

AMP: relation with phospholipase D (PLD) activation. Immunobiology, 1996, vol 196 (5),

p.588-98.

NAKASHIMA, S., NOZAWA, Y. Possible role of phospholipase D in cellular

differentiation and apoptosis. Chem Phys Lipids, 1999, vol 98 (1-2), p.153-64.

NAKASHIMA, S., OHGUCHI, K., FROHMAN, M.A., NOZAWA, Y. Increased mRNA

expression of phospholipase D (PLD) isozymes during granulocytic differentiation of HL60

cells. Biochim Biophys Acta, 1998, vol 1389 (3), p.173-7.

NARO, F., DE ARCANGELIS, V., SETTE, C., AMBROSIO, C., KOMATI, H.,

MOLINARO, M., ADAMO, S., NEMOZ, G. A bimodal modulation of the cAMP pathway

is involved in the control of myogenic differentiation in l6 cells. J Biol Chem, 2003, vol 278

(49), p.49308-15.

NARO, F., DONCHENKO, V., MINOTTI, S., ZOLLA, L., MOLINARO, M., ADAMO,

S. Role of phospholipase C and D signalling pathways in vasopressin-dependent myogenic

differentiation. J Cell Physiol, 1997, vol 171 (1), p.34-42.

NARO, F., SETTE, C., VICINI, E., DE ARCANGELIS, V., GRANGE, M., CONTI, M.,

LAGARDE, M., MOLINARO, M., ADAMO, S., NEMOZ, G. Involvement of type 4

cAMP-phosphodiesterase in the myogenic differentiation of L6 cells. Mol Biol Cell, 1999, vol

10 (12), p.4355-67.

NERVI, C., BENEDETTI, L., MINASI, A., MOLINARO, M., ADAMO, S. Arginine-

vasopressin induces differentiation of skeletal myogenic cells and up-regulation of myogenin

and Myf-5. Cell Growth Differ, 1995, vol 6 (1), p.81-9.

NOBES, C.D., HALL, A. Rho, rac, and cdc42 GTPases regulate the assembly of

multimolecular focal complexes associated with actin stress fibers, lamellipodia, and

filopodia. Cell, 1995, vol 81 (1), p.53-62.

Page 180: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

180

OFFERMANNS, S., SIMON, M.I. Organization of transmembrane signalling by

heterotrimeric G proteins. Cancer Surv, 1996, vol 27, p.177-98.

OHGUCHI, K., BANNO, Y., NAKASHIMA, S., NOZAWA, Y. Regulation of membrane-

bound phospholipase D by protein kinase C in HL60 cells. Synergistic action of small GTP-

binding protein RhoA. J Biol Chem, 1996, vol 271 (8), p.4366-72.

OHGUCHI, K., NAKASHIMA, S., TAN, Z., BANNO, Y., DOHI, S., NOZAWA, Y.

Increased activity of small GTP-binding protein-dependent phospholipase D during

differentiation in human promyelocytic leukemic HL60 cells. J Biol Chem, 1997, vol 272 (3),

p.1990-6.

OKAMOTO, T., SCHLEGEL, A., SCHERER, P.E., LISANTI, M.P. Caveolins, a family

of scaffolding proteins for organizing "preassembled signaling complexes" at the plasma

membrane. J Biol Chem, 1998, vol 273 (10), p.5419-22.

OKAMURA, S., YAMASHITA, S. Purification and characterization of

phosphatidylcholine phospholipase D from pig lung. J Biol Chem, 1994, vol 269 (49),

p.31207-13.

OLSON, E.N. Signal transduction pathways that regulate skeletal muscle gene expression.

Mol Endocrinol, 1993, vol 7 (11), p.1369-78.

OLSON, E.N., KLEIN, W.H. bHLH factors in muscle development: dead lines and

commitments, what to leave in and what to leave out. Genes Dev, 1994, vol 8 (1), p.1-8.

OLSON, S.C., BOWMAN, E.P., LAMBETH, J.D. Phospholipase D activation in a cell-

free system from human neutrophils by phorbol 12-myristate 13-acetate and guanosine 5'-O-

(3-thiotriphosphate). Activation is calcium dependent and requires protein factors in both the

plasma membrane and cytosol. J Biol Chem, 1991, vol 266 (26), p.17236-42.

Page 181: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

181

O'LUANAIGH, N., PARDO, R., FENSOME, A., ALLEN-BAUME, V., JONES, D.,

HOLT, M.R., COCKCROFT, S. Continual production of phosphatidic acid by

phospholipase D is essential for antigen-stimulated membrane ruffling in cultured mast cells.

Mol Biol Cell, 2002, vol 13 (10), p.3730-46.

ORDAHL, C.P., LE DOUARIN, N.M. Two myogenic lineages within the developing

somite. Development, 1992, vol 114 (2), p.339-53.

PACHTER, J.A., PAI, J.K., MAYER-EZELL, R., PETRIN, J.M., DOBEK, E.,

BISHOP, W.R. Differential regulation of phosphoinositide and phosphatidylcholine

hydrolysis by protein kinase C-beta 1 overexpression. Effects on stimulation by alpha-

thrombin, guanosine 5'-O-(thiotriphosphate), and calcium. J Biol Chem, 1992, vol 267 (14),

p.9826-30.

PAI, J.K., DOBEK, E.A., BISHOP, W.R. Endothelin-1 activates phospholipase D and

thymidine incorporation in fibroblasts overexpressing protein kinase C beta 1. Cell Regul,

1991, vol 2 (11), p.897-903.

PAI, J.K., SIEGEL, M.I., EGAN, R.W., BILLAH, M.M. Phospholipase D catalyzes

phospholipid metabolism in chemotactic peptide-stimulated HL-60 granulocytes. J Biol

Chem, 1988, vol 263 (25), p.12472-7.

PARIS, S., BERAUD-DUFOUR, S., ROBINEAU, S., BIGAY, J., ANTONNY, B.,

CHABRE, M., CHARDIN, P. Role of protein-phospholipid interactions in the activation of

ARF1 by the guanine nucleotide exchange factor Arno. J Biol Chem, 1997, vol 272 (35),

p.22221-6.

PARK, J.B., KIM, J.H., KIM, Y., HA, S.H., YOO, J.S., DU, G., FROHMAN, M.A.,

SUH, P.G., RYU, S.H. Cardiac phospholipase D2 localizes to sarcolemmal membranes and

is inhibited by alpha-actinin in an ADP-ribosylation factor-reversible manner. J Biol Chem,

2000, vol 275 (28), p.21295-301.

Page 182: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

182

PARK, S.K., PROVOST, J.J., BAE, C.D., HO, W.T., EXTON, J.H. Cloning and

characterization of phospholipase D from rat brain. J Biol Chem, 1997, vol 272 (46),

p.29263-71.

PATERSON, H.F., SELF, A.J., GARRETT, M.D., JUST, I., AKTORIES, K., HALL, A.

Microinjection of recombinant p21rho induces rapid changes in cell morphology. J Cell Biol,

1990, vol 111 (3), p.1001-7.

PEDRUZZI, E., HAKIM, J., GIROUD, J.P., PERIANIN, A. Analysis of choline and

phosphorylcholine content in human neutrophils stimulated by f-Met-Leu-Phe and phorbol

myristate acetate: contribution of phospholipase D and C. Cell Signal, 1998, vol 10 (7),

p.481-9.

PERRY, L., AND RUDNICK MA. Molecular mechanisms regulating myogenic

determination and differentiation. Front Biosci, 2000, vol 5, p.D750-D767.

PERTILE, P., LISCOVITCH, M., CHALIFA, V., CANTLEY, L.C. Phosphatidylinositol

4,5-bisphosphate synthesis is required for activation of phospholipase D in U937 cells. J Biol

Chem, 1995, vol 270 (10), p.5130-5.

POLLOCK, R., TREISMAN, R. Human SRF-related proteins: DNA-binding properties and

potential regulatory targets. Genes Dev, 1991, vol 5 (12A), p.2327-41.

PONTING, C.P., KERR, I.D. A novel family of phospholipase D homologues that includes

phospholipid synthases and putative endonucleases: identification of duplicated repeats and

potential active site residues. Protein Sci, 1996, vol 5 (5), p.914-22.

PORCELLI, A.M., GHELLI, A., HRELIA, S., RUGOLO, M. Phospholipase D

stimulation is required for sphingosine-1-phosphate activation of actin stress fibre assembly

in human airway epithelial cells. Cell Signal, 2002, vol 14 (1), p.75-81.

POWNER, D.J., HODGKIN, M.N., WAKELAM, M.J. Antigen-stimulated activation of

phospholipase D1b by Rac1, ARF6, and PKCalpha in RBL-2H3 cells. Mol Biol Cell, 2002,

vol 13 (4), p.1252-62.

Page 183: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

183

PROVOST, J.J., FUDGE, J., ISRAELIT, S., SIDDIQI, A.R., EXTON, J.H. Tissue-

specific distribution and subcellular distribution of phospholipase D in rat: evidence for

distinct RhoA- and ADP-ribosylation factor (ARF)-regulated isoenzymes. Biochem J, 1996,

vol 319 ( Pt 1), p.285-91.

PURKISS, J., MURRIN, R.A., OWEN, P.J., BOARDER, M.R. Lack of phospholipase D

activity in chromaffin cells: bradykinin-stimulated phosphatidic acid formation involves

phospholipase C in chromaffin cells but phospholipase D in PC12 cells. J Neurochem, 1991,

vol 57 (3), p.1084-7.

RADHAKRISHNA, H., AL-AWAR, O., KHACHIKIAN, Z., DONALDSON, J.G. ARF6

requirement for Rac ruffling suggests a role for membrane trafficking in cortical actin

rearrangements. J Cell Sci, 1999, vol 112 ( Pt 6), p.855-66.

RADHAKRISHNA, H., DONALDSON, J.G. ADP-ribosylation factor 6 regulates a novel

plasma membrane recycling pathway. J Cell Biol, 1997, vol 139 (1), p.49-61.

RAMEH, L.E., TOLIAS, K.F., DUCKWORTH, B.C., CANTLEY, L.C. A new pathway

for synthesis of phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate. Nature, 1997, vol 390 (6656), p.192-6.

RANDALL, R.W., BONSER, R.W., THOMPSON, N.T., GARLAND, L.G. A novel and

sensitive assay for phospholipase D in intact cells. FEBS Lett, 1990, vol 264 (1), p.87-90.

REID, T., FURUYASHIKI, T., ISHIZAKI, T., WATANABE, G., WATANABE, N.,

FUJISAWA, K., MORII, N., MADAULE, P., NARUMIYA, S. Rhotekin, a new putative

target for Rho bearing homology to a serine/threonine kinase, PKN, and rhophilin in the rho-

binding domain. J Biol Chem, 1996, vol 271 (23), p.13556-60.

REN, X.D., BOKOCH, G.M., TRAYNOR-KAPLAN, A., JENKINS, G.H., ANDERSON,

R.A., SCHWARTZ, M.A. Physical association of the small GTPase Rho with a 68-kDa

phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase in Swiss 3T3 cells. Mol Biol Cell, 1996, vol 7 (3),

p.435-42.

Page 184: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

184

RHEE, D., SANGER, J.M., SANGER, J.W. The premyofibril: evidence for its role in

myofibrillogenesis. Cell Motil Cytoskeleton, 1994, vol 28 (1), p.1-24.

RHODES, S.J., KONIECZNY, S.F. Identification of MRF4: a new member of the muscle

regulatory factor gene family. Genes Dev, 1989, vol 3 (12B), p.2050-61.

RIBBES, G., HENRY, J., CARIVEN, C., PONTAROTTI, P., CHAP, H., RECORD, M.

Expressed sequence tags identify human isologs of the ARF-dependent phospholipase D.

Biochem Biophys Res Commun, 1996, vol 224 (1), p.206-11.

RIDGEWAY, A.G., WILTON, S., SKERJANC, I.S. Myocyte enhancer factor 2C and

myogenin up-regulate each other's expression and induce the development of skeletal muscle

in P19 cells. J Biol Chem, 2000, vol 275 (1), p.41-6.

RIDLEY, A.J. Rho family proteins and regulation of the actin cytoskeleton. Prog Mol

Subcell Biol, 1999, vol 22, p.1-22.

RIDLEY, A.J., HALL, A. The small GTP-binding protein rho regulates the assembly of

focal adhesions and actin stress fibers in response to growth factors. Cell, 1992, vol 70 (3),

p.389-99.

RIDLEY, A.J., HALL, A. Signal transduction pathways regulating Rho-mediated stress

fibre formation: requirement for a tyrosine kinase. Embo J, 1994, vol 13 (11), p.2600-10.

RIDLEY, A.J., PATERSON, H.F., JOHNSTON, C.L., DIEKMANN, D., HALL, A. The

small GTP-binding protein rac regulates growth factor-induced membrane ruffling. Cell,

1992, vol 70 (3), p.401-10.

RIZZO, M., ROMERO, G. Pharmacological importance of phospholipase D and

phosphatidic acid in the regulation of the mitogen-activated protein kinase cascade.

Pharmacol Ther, 2002, vol 94 (1-2), p.35-50.

Page 185: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

185

RIZZO, M.A., SHOME, K., VASUDEVAN, C., STOLZ, D.B., SUNG, T.C.,

FROHMAN, M.A., WATKINS, S.C., ROMERO, G. Phospholipase D and its product,

phosphatidic acid, mediate agonist-dependent raf-1 translocation to the plasma membrane

and the activation of the mitogen-activated protein kinase pathway. J Biol Chem, 1999, vol

274 (2), p.1131-9.

RIZZO, M.A., SHOME, K., WATKINS, S.C., ROMERO, G. The recruitment of Raf-1 to

membranes is mediated by direct interaction with phosphatidic acid and is independent of

association with Ras. J Biol Chem, 2000, vol 275 (31), p.23911-8.

ROGERSON, P.J., JAMALI, M., SKERJANC, I.S. The C-terminus of myogenin, but not

MyoD, targets upregulation of MEF2C expression. FEBS Lett, 2002, vol 524 (1-3), p.134-8.

ROTH, M.G. Lipid regulators of membrane traffic through the Golgi complex. Trends Cell

Biol, 1999, vol 9 (5), p.174-9.

ROTH, M.G., BI, K., KTISTAKIS, N.T., YU, S. Phospholipase D as an effector for ADP-

ribosylation factor in the regulation of vesicular traffic. Chem Phys Lipids, 1999, vol 98 (1-

2), p.141-52.

RUDNICKI, M.A., BRAUN, T., HINUMA, S., JAENISCH, R. Inactivation of MyoD in

mice leads to up-regulation of the myogenic HLH gene Myf-5 and results in apparently

normal muscle development. Cell, 1992, vol 71 (3), p.383-90.

RUDNICKI, M.A., JAENISCH, R. The MyoD family of transcription factors and skeletal

myogenesis. Bioessays, 1995, vol 17 (3), p.203-9.

RUDNICKI, M.A., SCHNEGELSBERG, P.N., STEAD, R.H., BRAUN, T., ARNOLD,

H.H., JAENISCH, R. MyoD or Myf-5 is required for the formation of skeletal muscle. Cell,

1993, vol 75 (7), p.1351-9.

RUMENAPP, U., GEISZT, M., WAHN, F., SCHMIDT, M., JAKOBS, K.H. Evidence for

ADP-ribosylation-factor-mediated activation of phospholipase D by m3 muscarinic

acetylcholine receptor. Eur J Biochem, 1995, vol 234 (1), p.240-4.

Page 186: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

186

SABOURIN, L.A., RUDNICKI, M.A. The molecular regulation of myogenesis. Clin Genet,

2000, vol 57 (1), p.16-25.

SAHAI, E., ALBERTS, A.S., TREISMAN, R. RhoA effector mutants reveal distinct

effector pathways for cytoskeletal reorganization, SRF activation and transformation. Embo

J, 1998, vol 17 (5), p.1350-61.

SAITO, M., KANFER, J. Solubilization and properties of a membrane-bound enzyme from

rat brain catalyzing a base-exchange reaction. Biochem Biophys Res Commun, 1973, vol 53

(2), p.391-8.

SAITO, M., KANFER, J. Phosphatidohydrolase activity in a solubilized preparation from

rat brain particulate fraction. Arch Biochem Biophys, 1975, vol 169 (1), p.318-23.

SANGER, J.W., AYOOB, J.C., CHOWRASHI, P., ZURAWSKI, D., SANGER, J.M.

Assembly of myofibrils in cardiac muscle cells. Adv Exp Med Biol, 2000, vol 481, p.89-102;

discussion 103-5.

SANGER, J.W., CHOWRASHI, P., SHANER, N.C., SPALTHOFF, S., WANG, J.,

FREEMAN, N.L., SANGER, J.M. Myofibrillogenesis in skeletal muscle cells. Clin Orthop,

2002, vol (403 Suppl), p.S153-62.

SANGER, J.W., SANGER, J.M. Fishing out proteins that bind to titin. J Cell Biol, 2001,

vol 154 (1), p.21-4.

SANTERRE, R.F., BALES, K.R., JANNEY, M.J., HANNON, K., FISHER, L.F.,

BAILEY, C.S., MORRIS, J., IVARIE, R., SMITH, C.K., 2ND Expression of bovine myf5

induces ectopic skeletal muscle formation in transgenic mice. Mol Cell Biol, 1993, vol 13

(10), p.6044-51.

SCHIAFFINO, S., REGGIANI, C. Myosin isoforms in mammalian skeletal muscle. J Appl

Physiol, 1994, vol 77 (2), p.493-501.

Page 187: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

187

SCHMIDT, A., WOLDE, M., THIELE, C., FEST, W., KRATZIN, H.,

PODTELEJNIKOV, A.V., WITKE, W., HUTTNER, W.B., SOLING, H.D. Endophilin I

mediates synaptic vesicle formation by transfer of arachidonate to lysophosphatidic acid.

Nature, 1999a, vol 401 (6749), p.133-41.

SCHMIDT, M., VOSS, M., WEERNINK, P.A., WETZEL, J., AMANO, M.,

KAIBUCHI, K., JAKOBS, K.H. A role for rho-kinase in rho-controlled phospholipase D

stimulation by the m3 muscarinic acetylcholine receptor. J Biol Chem, 1999b, vol 274 (21),

p.14648-54.

SCICCHITANO, B.M., SPATH, L., MUSARO, A., MOLINARO, M., ADAMO, S.,

NERVI, C. AVP induces myogenesis through the transcriptional activation of the myocyte

enhancer factor 2. Mol Endocrinol, 2002, vol 16 (6), p.1407-16.

SCIORRA, V.A., RUDGE, S.A., PRESTWICH, G.D., FROHMAN, M.A.,

ENGEBRECHT, J., MORRIS, A.J. Identification of a phosphoinositide binding motif that

mediates activation of mammalian and yeast phospholipase D isoenzymes. Embo J, 1999, vol

18 (21), p.5911-21.

SCIORRA, V.A., RUDGE, S.A., WANG, J., MCLAUGHLIN, S., ENGEBRECHT, J.,

MORRIS, A.J. Dual role for phosphoinositides in regulation of yeast and mammalian

phospholipase D enzymes. J Cell Biol, 2002, vol 159 (6), p.1039-49.

SEASHOLTZ, T.M., MAJUMDAR, M., BROWN, J.H. Rho as a mediator of G protein-

coupled receptor signaling. Mol Pharmacol, 1999, vol 55 (6), p.949-56.

SEKINE, A., FUJIWARA, M., NARUMIYA, S. Asparagine residue in the rho gene

product is the modification site for botulinum ADP-ribosyltransferase. J Biol Chem, 1989, vol

264 (15), p.8602-5.

SHIBASAKI, Y., ISHIHARA, H., KIZUKI, N., ASANO, T., OKA, Y., YAZAKI, Y.

Massive actin polymerization induced by phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase in vivo. J

Biol Chem, 1997, vol 272 (12), p.7578-81.

Page 188: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

188

SHIMOOKU, K., AKISUE, T., JINNAI, H., HITOMI, T., OGINO, C., YOSHIDA, K.,

NAKAMURA, S., NISHIZUKA, Y. Reconstitution of GTP-gamma-S-dependent

phospholipase D activity with ARF, RhoA, and a soluble 36-kDa protein. FEBS Lett, 1996,

vol 387 (2-3), p.141-4.

SHOME, K., RIZZO, M.A., VASUDEVAN, C., ANDRESEN, B., ROMERO, G. The

activation of phospholipase D by endothelin-1, angiotensin II, and platelet-derived growth

factor in vascular smooth muscle A10 cells is mediated by small G proteins of the ADP-

ribosylation factor family. Endocrinology, 2000, vol 141 (6), p.2200-8.

SHOME, K., VASUDEVAN, C., ROMERO, G. ARF proteins mediate insulin-dependent

activation of phospholipase D. Curr Biol, 1997, vol 7 (6), p.387-96.

SHOME, K., XU, X.Q., ROMERO, G. Brefeldin A inhibits insulin-dependent receptor

redistribution in HIRcB cells. FEBS Lett, 1995, vol 357 (2), p.109-14.

SHORE, P., SHARROCKS, A.D. The MADS-box family of transcription factors. Eur J

Biochem, 1995, vol 229 (1), p.1-13.

SIDDIQI, A.R., SMITH, J.L., ROSS, A.H., QIU, R.G., SYMONS, M., EXTON, J.H.

Regulation of phospholipase D in HL60 cells. Evidence for a cytosolic phospholipase D. J

Biol Chem, 1995, vol 270 (15), p.8466-73.

SIDDIQI, A.R., SRAJER, G.E., LESLIE, C.C. Regulation of human PLD1 and PLD2 by

calcium and protein kinase C. Biochim Biophys Acta, 2000, vol 1497 (1), p.103-14.

SIDDIQUI, R.A., ENGLISH, D. Phosphatidic acid elicits calcium mobilization and actin

polymerization through a tyrosine kinase-dependent process in human neutrophils: a

mechanism for induction of chemotaxis. Biochim Biophys Acta, 1997, vol 1349 (1), p.81-95.

SINGER, W.D., BROWN, H.A., BOKOCH, G.M., STERNWEIS, P.C. Resolved

phospholipase D activity is modulated by cytosolic factors other than Arf. J Biol Chem, 1995,

vol 270 (25), p.14944-50.

Page 189: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

189

SINGER, W.D., BROWN, H.A., JIANG, X., STERNWEIS, P.C. Regulation of

phospholipase D by protein kinase C is synergistic with ADP-ribosylation factor and

independent of protein kinase activity. J Biol Chem, 1996, vol 271 (8), p.4504-10.

SINGER, W.D., BROWN, H.A., STERNWEIS, P.C. Regulation of eukaryotic

phosphatidylinositol-specific phospholipase C and phospholipase D. Annu Rev Biochem,

1997, vol 66, p.475-509.

SLAABY, R., DU, G., ALTSHULLER, Y.M., FROHMAN, M.A., SEEDORF, K. Insulin-

induced phospholipase D1 and phospholipase D2 activity in human embryonic kidney-293

cells mediated by the phospholipase C gamma and protein kinase C alpha signalling cascade.

Biochem J, 2000, vol 351 Pt 3, p.613-9.

SMITH, A., STEPHEN, R.I., ARKLEY, M.M., MCINTOSH, N. Immunoreactive arginine

vasopressin in human fetal and neonatal skeletal muscle. Early Hum Dev, 1992, vol 28 (3),

p.215-22.

SORDELLA, R., JIANG, W., CHEN, G.C., CURTO, M., SETTLEMAN, J. Modulation

of Rho GTPase signaling regulates a switch between adipogenesis and myogenesis. Cell,

2003, vol 113 (2), p.147-58.

SOTIROPOULOS, A., GINEITIS, D., COPELAND, J., TREISMAN, R. Signal-regulated

activation of serum response factor is mediated by changes in actin dynamics. Cell, 1999, vol

98 (2), p.159-69.

SOULEZ, M., ROUVIERE, C.G., CHAFEY, P., HENTZEN, D., VANDROMME, M.,

LAUTREDOU, N., LAMB, N., KAHN, A., TUIL, D. Growth and differentiation of C2

myogenic cells are dependent on serum response factor. Mol Cell Biol, 1996, vol 16 (11),

p.6065-74.

STANDAERT, M.L., BANDYOPADHYAY, G., ZHOU, X., GALLOWAY, L., FARESE,

R.V. Insulin stimulates phospholipase D-dependent phosphatidylcholine hydrolysis, Rho

translocation, de novo phospholipid synthesis, and diacylglycerol/protein kinase C signaling

in L6 myotubes. Endocrinology, 1996, vol 137 (7), p.3014-20.

Page 190: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

190

STEED, P.M., CLARK, K.L., BOYAR, W.C., LASALA, D.J. Characterization of human

PLD2 and the analysis of PLD isoform splice variants. Faseb J, 1998, vol 12 (13), p.1309-17.

STEED, P.M., NAGAR, S., WENNOGLE, L.P. Phospholipase D regulation by a physical

interaction with the actin-binding protein gelsolin. Biochemistry, 1996, vol 35 (16), p.5229-

37.

STOKOE, D., MACDONALD, S.G., CADWALLADER, K., SYMONS, M., HANCOCK,

J.F. Activation of Raf as a result of recruitment to the plasma membrane. Science, 1994, vol

264 (5164), p.1463-7.

STROMER, M.H. Immunocytochemical localization of proteins in striated muscle. Int Rev

Cytol, 1992, vol 142, p.61-144.

STUCKEY, J.A., DIXON, J.E. Crystal structure of a phospholipase D family member. Nat

Struct Biol, 1999, vol 6 (3), p.278-84.

STUTCHFIELD, J., COCKCROFT, S. Correlation between secretion and phospholipase

D activation in differentiated HL60 cells. Biochem J, 1993, vol 293 ( Pt 3), p.649-55.

SUNG, T.C., ALTSHULLER, Y.M., MORRIS, A.J., FROHMAN, M.A. Molecular

analysis of mammalian phospholipase D2. J Biol Chem, 1999a, vol 274 (1), p.494-502.

SUNG, T.C., ROPER, R.L., ZHANG, Y., RUDGE, S.A., TEMEL, R., HAMMOND,

S.M., MORRIS, A.J., MOSS, B., ENGEBRECHT, J., FROHMAN, M.A. Mutagenesis of

phospholipase D defines a superfamily including a trans-Golgi viral protein required for

poxvirus pathogenicity. Embo J, 1997, vol 16 (15), p.4519-30.

SUNG, T.C., ZHANG, Y., MORRIS, A.J., FROHMAN, M.A. Structural analysis of

human phospholipase D1. J Biol Chem, 1999b, vol 274 (6), p.3659-66.

TAKAHASHI, K., TAGO, K., OKANO, H., OHYA, Y., KATADA, T., KANAHO, Y.

Augmentation by calmodulin of ADP-ribosylation factor-stimulated phospholipase D activity

in permeabilized rabbit peritoneal neutrophils. J Immunol, 1996, vol 156 (3), p.1229-34.

Page 191: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

191

TAKAI, Y., SASAKI, T., MATOZAKI, T. Small GTP-binding proteins. Physiol Rev, 2001,

vol 81 (1), p.153-208.

TAKANO, H., KOMURO, I., OKA, T., SHIOJIMA, I., HIROI, Y., MIZUNO, T.,

YAZAKI, Y. The Rho family G proteins play a critical role in muscle differentiation. Mol

Cell Biol, 1998, vol 18 (3), p.1580-9.

TAKI, T., KANFER, J.N. Partial purification and properties of a rat brain phospholipase. J

Biol Chem, 1979, vol 254 (19), p.9761-5.

TETI, A., NARO, F., MOLINARO, M., ADAMO, S. Transduction of arginine vasopressin

signal in skeletal myogenic cells. Am J Physiol, 1993, vol 265 (1 Pt 1), p.C113-21.

THOMSON, F.J., CLARK, M.A. Purification of a phosphatidic-acid-hydrolysing

phospholipase A2 from rat brain. Biochem J, 1995, vol 306 ( Pt 1), p.305-9.

TODA, K., NOGAMI, M., MURAKAMI, K., KANAHO, Y., NAKAYAMA, K.

Colocalization of phospholipase D1 and GTP-binding-defective mutant of ADP-ribosylation

factor 6 to endosomes and lysosomes. FEBS Lett, 1999, vol 442 (2-3), p.221-5.

TOKER, A. The synthesis and cellular roles of phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate. Curr

Opin Cell Biol, 1998, vol 10 (2), p.254-61.

TREISMAN, R. Identification of a protein-binding site that mediates transcriptional

response of the c-fos gene to serum factors. Cell, 1986, vol 46 (4), p.567-74.

TREISMAN, R., MARAIS, R., WYNNE, J. Spatial flexibility in ternary complexes between

SRF and its accessory proteins. Embo J, 1992, vol 11 (12), p.4631-40.

UEHATA, M., ISHIZAKI, T., SATOH, H., ONO, T., KAWAHARA, T., MORISHITA,

T., TAMAKAWA, H., YAMAGAMI, K., INUI, J., MAEKAWA, M., NARUMIYA, S.

Calcium sensitization of smooth muscle mediated by a Rho-associated protein kinase in

hypertension. Nature, 1997, vol 389 (6654), p.990-4.

Page 192: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

192

VALLOTTON, M.B. The multiple faces of the vasopressin receptors. Mol Cell Endocrinol,

1991, vol 78 (1-2), p.C73-6.

VAN AELST, L., D'SOUZA-SCHOREY, C. Rho GTPases and signaling networks. Genes

Dev, 1997, vol 11 (18), p.2295-322.

VAN DER BEND, R.L., DE WIDT, J., VAN CORVEN, E.J., MOOLENAAR, W.H.,

VAN BLITTERSWIJK, W.J. The biologically active phospholipid, lysophosphatidic acid,

induces phosphatidylcholine breakdown in fibroblasts via activation of phospholipase D.

Comparison with the response to endothelin. Biochem J, 1992, vol 285 ( Pt 1), p.235-40.

VANDEKERCKHOVE, J., WEBER, K. At least six different actins are expressed in a

higher mammal: an analysis based on the amino acid sequence of the amino-terminal tryptic

peptide. J Mol Biol, 1978, vol 126 (4), p.783-802.

VANDROMME, M., GAUTHIER-ROUVIERE, C., CARNAC, G., LAMB, N.,

FERNANDEZ, A. Serum response factor p67SRF is expressed and required during

myogenic differentiation of both mouse C2 and rat L6 muscle cell lines. J Cell Biol, 1992, vol

118 (6), p.1489-500.

VENABLE, M.E., BIELAWSKA, A., OBEID, L.M. Ceramide inhibits phospholipase D in

a cell-free system. J Biol Chem, 1996, vol 271 (40), p.24800-5.

VIDAL, M.J., STAHL, P.D. The small GTP-binding proteins Rab4 and ARF are associated

with released exosomes during reticulocyte maturation. Eur J Cell Biol, 1993, vol 60 (2),

p.261-7.

VITALE, N., CAUMONT, A.S., CHASSEROT-GOLAZ, S., DU, G., WU, S., SCIORRA,

V.A., MORRIS, A.J., FROHMAN, M.A., BADER, M.F. Phospholipase D1: a key factor

for the exocytotic machinery in neuroendocrine cells. Embo J, 2001, vol 20 (10), p.2424-34.

VITALE, N., CHASSEROT-GOLAZ, S., BAILLY, Y., MORINAGA, N., FROHMAN,

M.A., BADER, M.F. Calcium-regulated exocytosis of dense-core vesicles requires the

Page 193: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

193

activation of ADP-ribosylation factor (ARF)6 by ARF nucleotide binding site opener at the

plasma membrane. J Cell Biol, 2002, vol 159 (1), p.79-89.

WAKELAM, M.J., PATTERSON, S., HANLEY, M.R. L6 skeletal muscle cells have

functional V1-vasopressin receptors coupled to stimulated inositol phospholipid metabolism.

FEBS Lett, 1987, vol 210 (2), p.181-4.

WANG, G., YEH, H.I., LIN, J.J. Characterization of cis-regulating elements and trans-

activating factors of the rat cardiac troponin T gene. J Biol Chem, 1994, vol 269 (48),

p.30595-603.

WANG, L., CUMMINGS, R., USATYUK, P., MORRIS, A., IRANI, K., NATARAJAN,

V. Involvement of phospholipases D1 and D2 in sphingosine 1-phosphate-induced ERK

(extracellular-signal-regulated kinase) activation and interleukin-8 secretion in human

bronchial epithelial cells. Biochem J, 2002, vol 367 (Pt 3), p.751-60.

WATANABE, G., SAITO, Y., MADAULE, P., ISHIZAKI, T., FUJISAWA, K., MORII,

N., MUKAI, H., ONO, Y., KAKIZUKA, A., NARUMIYA, S. Protein kinase N (PKN) and

PKN-related protein rhophilin as targets of small GTPase Rho. Science, 1996, vol 271

(5249), p.645-8.

WATANABE, N., KATO, T., FUJITA, A., ISHIZAKI, T., NARUMIYA, S. Cooperation

between mDia1 and ROCK in Rho-induced actin reorganization. Nat Cell Biol, 1999, vol 1

(3), p.136-43.

WAY, G., O'LUANAIGH, N., COCKCROFT, S. Activation of exocytosis by cross-linking

of the IgE receptor is dependent on ADP-ribosylation factor 1-regulated phospholipase D in

RBL-2H3 mast cells: evidence that the mechanism of activation is via regulation of

phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate synthesis. Biochem J, 2000, vol 346 Pt 1, p.63-70.

WEI, L., WANG, L., CARSON, J.A., AGAN, J.E., IMANAKA-YOSHIDA, K.,

SCHWARTZ, R.J. beta1 integrin and organized actin filaments facilitate cardiomyocyte-

specific RhoA-dependent activation of the skeletal alpha-actin promoter. Faseb J, 2001, vol

15 (3), p.785-96.

Page 194: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

194

WEI, L., ZHOU, W., CROISSANT, J.D., JOHANSEN, F.E., PRYWES, R.,

BALASUBRAMANYAM, A., SCHWARTZ, R.J. RhoA signaling via serum response

factor plays an obligatory role in myogenic differentiation. J Biol Chem, 1998, vol 273 (46),

p.30287-94.

WEINTRAUB, H. The MyoD family and myogenesis: redundancy, networks, and thresholds.

Cell, 1993, vol 75 (7), p.1241-4.

WEINTRAUB, H., DAVIS, R., TAPSCOTT, S., THAYER, M., KRAUSE, M.,

BENEZRA, R., BLACKWELL, T.K., TURNER, D., RUPP, R., HOLLENBERG, S. The

myoD gene family: nodal point during specification of the muscle cell lineage. Science, 1991,

vol 251 (4995), p.761-6.

WHATMORE, J., MORGAN, C.P., CUNNINGHAM, E., COLLISON, K.S.,

WILLISON, K.R., COCKCROFT, S. ADP-ribosylation factor 1-regulated phospholipase

D activity is localized at the plasma membrane and intracellular organelles in HL60 cells.

Biochem J, 1996, vol 320 ( Pt 3), p.785-94.

WRIGHT, W.E., SASSOON, D.A., LIN, V.K. Myogenin, a factor regulating myogenesis,

has a domain homologous to MyoD. Cell, 1989, vol 56 (4), p.607-17.

XIE, Z., HO, W.T., EXTON, J.H. Association of N- and C-terminal domains of

phospholipase D is required for catalytic activity. J Biol Chem, 1998, vol 273 (52), p.34679-

82.

XIE, Z., HO, W.T., EXTON, J.H. Association of the N- and C-terminal domains of

phospholipase D. Contribution of the conserved HKD motifs to the interaction and the

requirement of the association for Ser/Thr phosphorylation of the enzyme. J Biol Chem, 2000,

vol 275 (32), p.24962-9.

XU, L., SHEN, Y., JOSEPH, T., BRYANT, A., LUO, J.Q., FRANKEL, P., ROTUNDA,

T., FOSTER, D.A. Mitogenic phospholipase D activity is restricted to caveolin-enriched

membrane microdomains. Biochem Biophys Res Commun, 2000, vol 273 (1), p.77-83.

Page 195: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

195

XU, Y., SEET, L.F., HANSON, B., HONG, W. The Phox homology (PX) domain, a new

player in phosphoinositide signalling. Biochem J, 2001, vol 360 (Pt 3), p.513-30.

YAFFE, D. Retention of differentiation potentialities during prolonged cultivation of

myogenic cells. Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A, 1968, vol 61, p.477-483.

YAFFE, D., SAXEL, O. Serial passaging and differentiation of myogenic cells isolated from

dystrophic mouse muscle. Nature, 1977, vol 270 (5639), p.725-7.

YAMAMOTO, M., HILGEMANN, D.H., FENG, S., BITO, H., ISHIHARA, H.,

SHIBASAKI, Y., YIN, H.L. Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate induces actin stress-fiber

formation and inhibits membrane ruffling in CV1 cells. J Cell Biol, 2001, vol 152 (5), p.867-

76.

YANG, S.F., FREER, S., BENSON, A.A. Transphosphatidylation by phospholipase D. J

Biol Chem, 1967, vol 242 (3), p.477-84.

YEE, S.P., RIGBY, P.W. The regulation of myogenin gene expression during the embryonic

development of the mouse. Genes Dev, 1993, vol 7 (7A), p.1277-89.

YU, Y.T., BREITBART, R.E., SMOOT, L.B., LEE, Y., MAHDAVI, V., NADAL-

GINARD, B. Human myocyte-specific enhancer factor 2 comprises a group of tissue-

restricted MADS box transcription factors. Genes Dev, 1992, vol 6 (9), p.1783-98.

ZHANG, Q., COX, D., TSENG, C.C., DONALDSON, J.G., GREENBERG, S. A

requirement for ARF6 in Fcgamma receptor-mediated phagocytosis in macrophages. J Biol

Chem, 1998, vol 273 (32), p.19977-81.

ZHANG, W., BEHRINGER, R.R., OLSON, E.N. Inactivation of the myogenic bHLH gene

MRF4 results in up-regulation of myogenin and rib anomalies. Genes Dev, 1995, vol 9 (11),

p.1388-99.

Page 196: Implication de la phospholipase d et de son produit, l ...csidoc.insa-lyon.fr/these/2004/komati/these.pdf · Soutenance le 03 décembre 2004 Jury de thèse : ... MIRAMOND M. UNITE

196

ZHOU, D., LUINI, W., BERNASCONI, S., DIOMEDE, L., SALMONA, M.,

MANTOVANI, A., SOZZANI, S. Phosphatidic acid and lysophosphatidic acid induce

haptotactic migration of human monocytes. J Biol Chem, 1995, vol 270 (43), p.25549-56.

ZHU, H., NGUYEN, V.T., BROWN, A.B., POURHOSSEINI, A., GARCIA, A.V., VAN

BILSEN, M., CHIEN, K.R. A novel, tissue-restricted zinc finger protein (HF-1b) binds to

the cardiac regulatory element (HF-1b/MEF-2) in the rat myosin light-chain 2 gene. Mol Cell

Biol, 1993, vol 13 (7), p.4432-44.