Laurent Toubiana

INSERM U444 « Epidémiologie et Sciences de l’Information »

Faculté de Médecine Saint Antoine27, rue Chaligny

75571 Paris

13H30 - 14H15 : SIG et STIC en Santé INSERM CNRS

STIC en Santé INSERM/CNRS

Aide à la décision et optimisation de l’offre de soin pour l’insuffisance rénale terminale.

Système d’Information Géographique en Santé :

Approche spatio-temporelle des déterminants de santé.

STIC en Santé INSERM/CNRS

Grenoble Du

12-13 Février 2003

au21-22 Décembre 2004

22 mois

Réseau collaboratifProjet STIC Santé INSERM/CNRS

Paul LandaisLBIM SIMS-REIN Hôpital NeckerParis

Michel SimonetTIMC-CNRSGrenoble

Philippe MosséLEST – CNRSAix en Provence

Laurent ToubianaINSERM U444 Paris

Christian JacquelinetEtabl. Français des GreffesParis

Christophe TufferyESRI-FranceParis

Rappel : Réseau collaboratif

Objectifs

Répondre aux besoins de représentations, d’analyses et de prédictions nécessaires à la prise de décision

Répondre à la question de l’adéquation de l’offre à la demande de soins.

Améliorer la maîtrise des coûts et d’anticiper les évolutions du système de soin.

Le retour d’InformationLe retour d’Informationclientsuniverselsclients

universels

serveur web dynamique serveur web dynamique

donnéesdonnées

Base d’évènementsBase d’évènements

Base d’identitéBase d’identité

Datamart REINDatamart REIN

VUESEntrepôt

Outilstableaux

debord

SIG

Analysesstatistiques

Une architecture n-tiersUne architecture n-tiers

REIN (Réseau Epidémiologie et Information en Néphrologie)

Données

Support cartographique et Système d’Information Géographique

La représentation cartographique au centre de l’interface du système d’information

MapoFlash : Une boîte à outils cartographique Web

MapoFlash : Accueil

MapoFlash : chargement de données

MapoFlash : représentation de données

MapoFlash : Manipulation cartes

MapoFlash : échelles et couleurs

MapoFlash : Krigeage

Intégration du module de cartographie interactive sur le site SentiWeb

Intégration du module de cartographie interactive sur le site SentiWeb

PaGeom : Annuaire cartographique

Intégration du module de cartographie interactive sur le site SarsNet

GripSite : Epidémiologie expérimentale des syndromes grippaux

GripSite : Epidémiologie expérimentale des syndromes grippaux

MetaSurv : Création de plateformes de surveillance incluant un SIG interactif

MetaSurv 

La surveillance des maladies transmissibles émergentes nécessite la mise en place rapide d’outils efficaces pour

la collecte de données, le retour d’information pour l’aide à la décision en cas de crise

Le projet MetaSurv : un outil de création rapide de plateforme de surveillance à la disposition de non‑spécialistes de l’informatique.

MetaSurv : 2 Aspects Principaux du projet

La souplesse d’adaptation du système à de nouvelles surveillances comportant :

la possibilité de mettre en place de nouvelles surveillances de pathologie sans effort de développement important.

la possibilité « cloner » le système pour créer rapidement de nouveaux systèmes complets de surveillance.

La restitution graphique et cartographique interactive des données observées.

MetaSurv : Initialisation de la plateforme

Nous appelons « Administrateur » la personne qui met en place et gère un réseau de surveillance.

Le statut d’administrateur ouvre tous les droits de gestion du site

tant du point de vue de la création des surveillances que de celui de l’animation du réseau de collaborateurs de surveillance.

MetaSurv : Mise en place des surveillances

Pour créer une nouvelle surveillance, il suffit de remplir quelques champs :

1) Le nom de la pathologie 2) L’espace sur lequel opère la surveillance (Monde, pays, ou tout autre lieu d’intérêt)

3) Un texte qui sera affiché pendant la saisie des cas.

Validation Les tables de la bases de données relatives à cette nouvelle maladie sont automatiquement crées.

Il faut maintenant définir les variables à surveiller

MetaSurv : Mise en place des surveillancesEtape 2 :création des variables

Créer les champs relatifs aux variables à surveiller est très facile il suffit de renseigner :

1) Le nom de la variable2) Le type de cette variable (numérique liste, radiobox texte date…)3) le cas échéant des valeur de contrôle du champ

Cette procédure est itérative tant qu’il y a de nouvelles variables pour la surveillance de cette maladie

C’est tout : La nouvelle surveillance est disponible.

MetaSurv : Inscriptions et création du réseau

MetaSurv : Fonction d’animation du réseau

Serveur de NewsForumFiches personnellesPartage de documentStatistiques de connexionAide contextuelle

Visualisations : Graphiques interactifs

SCEPID : Remerciements

Tous mes remerciements aux étudiants qui au cours de leur stage se sont relayés depuis un an pour la réalisation de ce projet :

Alexandre Herer (UTT)

Elodie Dusch (MST-ISASH)

Romain Rousselin (UTT)

Carole Chapoy (UTT)

Gaetan Bonnard (UTC)

Stéphane Moreau(UTC)

http://www.scepid.org

Annexe 1 : Publications relatives au projet Initiative « STIC Santé INSERM »

Revues à comité de lecture

Toubiana L, Richard JB, Landais P. A Geographical Information System for End-Stage Renal Disease : the SIGNe. Nephrol Dial Transplant 2004 (in press)Ben Said M, Simonet A, Guillon D, Jacquelinet C, Gaspoz F, Dufour E, Mugnier C, Jais JP, Simonet M, Landais P. A dynamic Web application within an n-tier architecture: a

Multi-Source Information System for end-stage renal disease. Stud Health Technol Inform 2003;95: 95-100. Landais P. Supply of care and prevention. Presse Med. 2002 Feb 2; 31(4): 176-85.Landais P. Epidemiology of care demand. Presse Med. 2002 Feb 2; 31(4): 167-75. Autres communications

Richard JB, Toubiana L, Ben Said M, Le Mignot L, Jais JP, Mugnier C, Landais P. Projet SIGNe : Intégration d’un Système d’Information Géographique pour la Néphrologie Congrès ADELF (15-17 septembre 2004) Rev Epidemiol Santé Publique, 2004, 52 :1S122

Ben Said M, Mugnier C, , Le Mignot L, Richard JB, Jais JP, Le Bihan C, Toubiana L, Landais P. Multi sources InformationSystem and Epidemiologic Follow-up of Chronic DiseasesCongrès ADELF (15-17 septembre 2004) Rev Epidemiol Santé Publique, 2004, 52 :1S122

Flahault A., Vibert JF, Thomas G, Toubiana L, Hanslik T, Boelle PY, Dorleans Y, Blanchon T, Viboud C, Vergu I, Alvarez F, Le Menac’h A., Legrand J, Sarter H, Jacob S, Carrat F, Massari V, Le Pont, Gropetis G, Valleron AJ, Le réseau Sentinelles 1984-2004 : 20ans d’expérience en France. Congrès ADELF (15-17 septembre 2004) Rev Epidemiol Santé Publique, 2004, 52 :1S37.

Duny Y, Landais P, Ben Saïd M,de Cornelissen F, Marty L, Daurès JP. Réseau Epidémiologie et Information en Néphrologie (REIN). Résultats du contrôle de qualité du réseau R.E.I.N en Languedoc-Roussillon. ADELF Bordeaux, septembre 2004.

Le Mignot L, Mugnier C, Ben saïd M, Jais J-P, Richard J-B, Le Bihan C, Landais P. Dédoublonnage d'identités dans des bases web dynamiques multi-sources. ADELF Bordeaux, septembre 2004.

Ben Said M, Simonet A, Guillon D, Jacquelinet C, Gaspoz F, Dufour E, Mugnier C, Jais JP, Simonet M, Landais P. A dynamic Web application within an n-tier architecture: a Multi-Source Information System for end-stage renal disease. MEDINFO. San Francisco, september 2004.

Richard J-B, Toubiana L, Ben saïd M, Le Mignot L, Jais J-P, Mugnier C, Landais P. GIS Integration in Nephrology : a SIGNe. European Congress of Epidemiology. Porto Portugal September 2004. Journal of Epidemiology and Community Health. 2004 Aug; vol 58; A47-A48

Ben saïd M, Mugnier C, Le Mignot L, Richard J-B, Jais J-P, Landais P. Multi Sources Information System and Epidemiologic Follow-up of Chronic Disease. European Congress of Epidemiology. Porto Portugal September 2004.

Le Mignot L, Mugnier C, Ben saïd M, Jais J-P, Richard J-B, Le Bihan C, Landais P. A patient identification web server for avoiding doublons in web dynamic databases. Porto Portugal September 2004.

Toubiana L, Herer A, Rousselin R, Chapoy C ,Dusch E, Flahault A MetaSurv : Un outil téléchargeable pour la création rapide de plateformes de surveillance sur Internet incluant un système d’information géographique interactif. Congrès MEDEC 2004 16-19 mars 2004 Paris

Annexe 1 : Publications relatives au projet Initiative « STIC Santé INSERM » (suite)

Autres communications (suite)

Crépey P, FP Alvarez, M Barthélémy, L Toubiana. Étude de la variabilité d'un modèle de réseau "scale-free" de taille finie. 1ère Conférence Internationale de la SFTB, Marrakech, Maroc (21-25 mai 2004).

Alvarez FP, P Crépey, L Toubiana, M Barthélémy. Dynamique de la propagation d'une maladie infectieuse sur un réseau "scale free" à liens fluctuants. 1ère Conférence Internationale de la SFTB, Marrakech, Maroc (21-25 mai 2004).

Simonet M, Toubiana L, Simonet A, Ben Saïd M , Landais P Ontology and Geographical Information System for End-Stage Renal Disease: the SIGNe. COSIT’03 Conference on Spatial InformationTheory 24-28 September2003,  Ittingen, Switzerland

Toubiana L "Utilisation des SIG et des NTIC en Epidémiologie" Colloque RISE Réseau International Santé Environnement (INVS) ‑ Bierville (16-17 mai 2003) Ben Said M, Simonet A, Guillon D, Jacquelinet C, Gaspoz F, Dufour E, Mugnier C, Jais JP, Simonet M, Landais P. A dynamic Web application within an n-tier architecture: a

Multi-Source Information System for end-stage renal disease. Medical Informatics in Europe. Saint Malo, 2003.Toubiana L "Système d’Information Géographique en Santé pour l’Insuffisance Rénale Terminale" 15eme rencontres Européennes de la Géomatique « Le GeoEvenement 2003 »

‑ Paris (4, 5, 6 mars 2003) Guillon D, Landais P. for the SIMS@REIN working Group. A multi-source information system for End-Stage Renal Disease. EDTA registry meeting Berlin 2003.Ben Saïd M, Simonet A, Guillon D, Jacquelinet C, Gaspoz F, Mugnier C, Taupin P, Jais JP, Simonet M, Landais P. Interface web dynamique et architecture n-tier pour

l’insuffisance rénale terminale. E-Colloque® Interrégional 3ème édition Télémédecine 2002, 27-28 septembre 2002. Landais P, pour le groupe SIMS REIN. Un Système d’Information Multi-Sources pour l’Insuffisance Rénale terminale. Colloque Technologies pour la santé. Ministère de la

Recherche et de la Technologie. Paris, Juin 2002.Guillon D, Ben Saïd M, Gaspoz F, Simonet A, Jacquelinet C, Mugnier C, Simonet M, Landais P. Fusion d’un environnement de développement : du client à l’entrepôt de

données. 1ères Journées de l’Information Médicale et de Santé – Stratégie Qualité Paris, 23-24 mai 2002Landais P, Simonet A, Guillon D, Jacquelinet C, Ben Saïd M, Mugnier C, Simonet M et le groupe SIMS@REIN Un Système d’Information Multi-sources pour le Réseau

Epidémiologie et Information en Néphrologie (REIN). Colloque AIM. Paris, 2001. Toubiana L, "Système d’Information Géographique et Internet pour la surveillance des épidémie " SIG2002 Conférence Francophone ESRI ‑ Issy-les-Moulineaux (2-3 octobre

2002) Toubiana L, Flahault A, Vibert JF, Valleron AJ "A customizable internet-based system with geographic representation for health surveillance" IEA XVI World Congress of

Epidemiology, Montreal, Canada (18-22 Aout 2002)Tuckwell HC, Hanslik T, Flahault A, Toubiana L, Valleron AJ "Neisseria Meningitidis: Dynamical Models for its Evolution and Control under Various Vaccination Schedules"

IEA XVI World Congress of Epidemiology, Montreal, Canada (18-22 Aout 2002)Massari V, Toubiana L "A significant decrease in volontary HIV testing in general population in France" AIDS2002 XIV International AIDS Conference, Barcelone Spain (7-12

Juillet 2002) Landais P. Evolution of the care procedures for end-stage renal disease. Colloque Franco-allemand. La greffe en 2001. Strasbourg, 24 juin 2002.Toubiana L, "Intégration de la Géostatistique au SIG : de nouveaux horizons pour l'Information Géographique. L’exemple du Réseau SENTINELLE - INSERM " 14eme

rencontres Européennes de la Géomatique « Le GeoEvenement 2002 » ‑ Paris (9-11 avril 2002)

Annexe 1 : Publications relatives au projet Initiative « STIC Santé INSERM »

(suite)

Mémoires d'étudiant

Gaetan Bonnard "MapoFlash : Développement d'un système d'information géographique interactif sur le Web" Mémoire de stage d’ingénieur Université Technologique de Compiègne - 6 mois (Dir. Toubiana L) 2004

Stéphane Moreau "MetaSurv : Développement d'un site de surveillance épidémiologique paramétrable en technologie Flash." Mémoire de stage d’ingénieur Université Technologique de Compiègne - 6 mois (Dir. Toubiana L) 2004

Carole Chapoy "Réalisation d’un système d’information paramétrable pour le recueil épidémiologique sur internet et cartographie dynamique interactive" Mémoire de stage d’ingénieur Université Technologique de Troyes - 6 mois (Dir. Toubiana L) 2004

Romain Rousselin "Réalisation d’un système d’information paramétrable pour le recueil épidémiologique sur internet et cartographie dynamique interactive" Mémoire de stage d’ingénieur Université Technologique de Troyes - 6 mois (Dir. Toubiana L) 2003

Benoist J, Poulain C, Lobo D, Klepper C, Crémieu H, Labescat AL."Développement d’un algorithme de lissage par potentiel fondée sur les voisinages spatiaux de portée variable sous Matlab » Mémoire de stage du certificat de biostatistiques et modélisation de la Maîtrise des sciences Biologiques et Médicales Université Pierre et Marie Curie – Paris VI (Dir. Toubiana L) 2003

Dutsch E "Implémentation d’algorithmes d’analyse spatiale et de leur représentation graphique en technologie interactive « swf » sur internet" Mémoire de stage de MST Informatique et Statistique Appliquée aux Sciences de l’Homme, Université René Descarte, Paris V - 3 mois (Dir. Toubiana L) 2003

Diouf ML "Approche spatio-temporelle des déterminants de santé, aide à la décision et optimisation des l’offre de soin : le cas de l’insuffisance rénale terminale dans la région du Limousin" DESS Geomarketing université de Créteil - 6 mois (Dir. Toubiana L) 2003

Nguyen Sothavy " Création d’un portail Web sur les ressources documentaires concernant les thèmes « Géographie de la Santé » et «Epidémiologie et Environnement » en France et dans le monde. " Mémoire de stage de DESS en sciences de l'information et de la documentation spécialisée de L'Institut National des Techniques de la Documentation - 2 mois (Dir. Toubiana L) 2003

Herer A "Réalisation d’un système d’information paramétrable pour le recueil épidémiologique sur internet et cartographie dynamique interactive" Mémoire de stage d’ingénieur Université Technologique de Troyes - 6 mois (Dir. Toubiana L) 2003

Grech G "Système d’Information Géographique sur Internet pour la surveillance des épidémies" Mémoire de stage de DESS de Géomatique de l’Université d’Orléans - 6 mois (Dir. Toubiana L) 2002

Elluard M, Miel M, Piel B "Effet spatial de la mortalité au USA" Mémoire de stage du certificat de biostatistiques et modélisation de la Maîtrise des sciences Biologiques et Médicales Université Pierre et Marie Curie – Paris VI (Dir. Toubiana L) 2002

Livres

Hiesse C, Jacquelinet C, Landais P. Insuffisance rénale chronique. Traité de Santé Publique. F. Bourdillon, G. Brücker, D. Tabuteau Edit. Med Sciences Flammarion Publ. Paris 2004. pp 239-244.

Toubiana L, Viboud C. Flahault A. Valleron AjV. Geography and Health Edition INSERM 1-228, Paris 2003Landais P, Simonet A, Guillon D, Jacquelinet C, Ben Saïd M, Mugnier C, Simonet M et le groupe SIMS@REIN: Un Système d’Information Multi-sources pour le Réseau

Epidémiologie et Information en Néphrologie (REIN). AIM 2001.

Développements à venir

Développer l’interface entre Data Warehouse du système d’information REIN (Réseau Epidémiologie et Information en Néphrologie) et un SIG-Internet.

Proposer des simulations et envisager des scénarios d’optimisation Offre/Demande de soins.

http://www.scepid.org