Maïté NIEPCERONMaïté NIEPCERON

UMR CNRS 6143 « Morphodynamique continentale et UMR CNRS 6143 « Morphodynamique continentale et côtière »côtière »

Interactions entre la diversité microbienne et la contamination diffuse aux HAP (Hydrocarbures Aromatiques Polycycliques) dans les sols

agricoles contrastés.

Directeurs : J. BODILIS et S. BARRAY

Caractérisation des communautés bactériennes impliquées dans la dégradation des HAP à l’échelle de :

- la communauté bactérienne totale,

- le genre bactérien Pseudomonas,

- les gènes fonctionnels codant les enzymes de dégradation des HAP, les dioxygènases.

Identification et quantification des biosurfactants produits par les bactéries en présence ou non de HAP.

Les objectifs de la thèse sont :

E. coli

PCR

HAP

HAP

HAPHAPHAP

HAPHAP

HAPHAP

Naphtalene Phenanthrene

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16

a

b

c

d

a

e e

a a

f

h g

FluorescenceFluorescence ((QtéQté Gène amplifié)Gène amplifié)

Cycle de PCRCycle de PCR11 22 33 44 55 66 77 88

FluorescenceFluorescence ((QtéQté Gène amplifié)Gène amplifié)

Cycle de PCRCycle de PCR11 22 33 44 55 66 77 88