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PAES
cours spécifique Pharmacie
CHIMIE ORGANIQUE
Professeur Marcel HIBERT
Directeur du Laboratoire d’Innovation Thérapeutique
Faculté de Pharmacie
Université de Strasbourg / CNRS
Remerciements: Pr Maurice Goeldner
GENERALITES
Professeur Marcel HIBERT
Directeur du Laboratoire d’Innovation Thérapeutique
Faculté de Pharmacie
Université de Strasbourg / CNRS
PACES – Premier semestre
Généralités
Structure
Stéréoisomérie
Réactivité
Résonance
Chimie organique descriptive
PACES – Second semestre
Synthèse organique
Manuels : • Cours de Chimie Organique, P Arnaud, Dunod Ed.
• Traité de Chimie Organique, Vollhardt et Schore, DeBoeck Ed.
• Chimie Organique, Y Rival, EdiScience Ed.
Présentation générale du cours
Les électrons mènent la danse !
Quels électrons?
Doublets non-liants sur les hétéroatomes (N et O principalement)
Doublets p (liaison double, triple, aromatique)
Carbanion
Entités Nucléophiles, riches en électrons, notées:
Les électrons mènent la danse !
Un principe simple: les riches (en électrons) donnent aux pauvres
Les électrons du Nucléophile vont attaquer un site Electrophile
Electrophile = entité déficiente en électrons
Cette déficience peut être partielle (E +) ou totale (E+)
Exemples: proton (H+), carbocation (C+), halogénure d’alkyle
Chapitre 1
ALCANES
Professeur Marcel HIBERT
Directeur du Laboratoire d’Innovation Thérapeutique
Faculté de Pharmacie
Université de Strasbourg / CNRS
1. Rappel:
Définition
Structure
1. Rappel:
Caractéristiques physiques: • gaz jusqu’à C4, liquides à partir de C5 • Insolubles dans l’eau. Solubles dans les solvants organiques
Réactivité: • Liaisons fortes (350kJ/mol), très peu polarisées et très peu polarisables
• Très stables, très peu réactives
• Rupture homolytique et chimie radicalaire (substitution radicalaire)
• Combustion / explosion : CnH2n+2 + (3n+1) O2 2n CO2 + (2n+2)H2O H=- 50 kJ/g
Etat naturel; molécules importantes • Gisements naturels de gaz (méthane) et de pétrole (C1 à C40)
• Solvants apolaires aprotiques
• Squelette des molécules organiques
Méthane butane octane
2. Préparation
A partir d’alcènes
Hydrogénation catalytique: H2/Cat Hydrogène adsorbé par un catalyseur déposé sur un support solide (ex: Pd/C)
Addition cis d’hydrogène Pd sur charbon
2. Préparation
A partir d’alcynes
Hydrogénation catalytique: H2/Cat
Réactions successives: 2 éq. H2 ( min.) sont nécessaires
2. Préparation
A partir d’halogénures d’alkyles: R-X
Hydrogènolyse:
Réaction de Wurtz:
2. Préparation
Réduction de Clemmensen:
Réduction de Wolff-Kischner:
A partir d’aldéhydes (RCHO) ou de cétones (RCOR’)
2. Préparation
A partir d’acides carboxyliques : RCO2H
Décarboxylation thermique ( ), avec perte d’un atome de C :
3. Propriétés chimiques
Oxydation
Combustion
CnH2n+2 + O2 CO2 + H2O + CHALEUR
Réaction exothermique
3. Propriétés chimiques
Thermodynamique d’une réaction
énergie
E. I.
E. F.
énergie
E. I.
E. F.
Chemin réactionnel de l’état initial (E.I.) à l’état final (E.F.)
Eréact = Energie de réaction = (énergie à E.F.) – (énergie à E.I.)
Eréact. < 0 : réaction exothermique Eréact. > 0 : réaction endothermique
3. Propriétés chimiques
Halogénation
- 25 Kcal/mole
exothermique
Rupture de liaison
Formation de liaison
+ 104 Kcal/mole
+ 58 Kcal/mole
- 84 Kcal/mole
- 103 Kcal/mole
h
h
3. Propriétés chimiques
Halogénation
initiation
propagation
terminaison
Étape limitante
Réaction sous contrôle cinétique
h
3. Propriétés chimiques
Halogénation
Carbone 1aire
Vitesse x 1
Carbone 2aire
Vitesse x 30 Carbone 3aire
Vitesse x 1600
majoritaire
h
3. Propriétés chimiques
Halogénation
Stabilisation par effet inductif donneur des substituants
Stabilisation par résonance
> >
Radical 3aire Radical 1aire Radical 2aire
h
3. Propriétés chimiques
Poly-halogénation
contrôle
4. Cycloalcanes
Énergie intramoléculaire due à la tension du cycle
• déformation par rapport aux angles de 109° d’un C sp3
• gènes entre atomes d’H voisins
Etension jusqu’à 30 Kcal/mole
Energie de tension de cycle
Cyclohexane: deux conformations remarquables en équilibre
4. Cycloalcanes
Flexibilité conformationnelle
chaise chaise bateau
6 liaisons C-H axiales 6 liaisons C-H équatoriales Les 12 liaisons C-H
Topologie des liaisons
Du fait de la tension de cycle, le cyclopropane réagit de manière similaire à un alcène
Réactivité particulière du cyclopropane
4. Cycloalcanes
Remarques générales
Hydrocarbures saturés:
Uniquement des liaisons stables C-C et C-H
Pas d’hétéroatomes (électrons non liants) ni d’insaturations (électrons )
Propriétés chimiques:
Réactivité très faible
Activation h ) nécessaire
Professeur Marcel HIBERT
Directeur du Laboratoire d’Innovation Thérapeutique
Faculté de Pharmacie
Université de Strasbourg / CNRS