SIÈGE HES-SO / PRÉSIDENCE DU COMITÉ DIRECTEUR COMMUNICATION RUE DE LA JEUNESSE 1 / CASE POSTALE 452 / 2800 DELÉMONT 1 TÉL. : 032 424 49 00 / FAX 032 424 49 01 COMMUNICATION@HES-SO.CH WWW.HES-SO.CH

Conférence de presse du mardi 9 novembre 2010, 10h30 – 11h15 Projet de recherche européen Khresmoi (e-santé) mené par HES-SO Valais Wallis Lieu : HES-SO//Master, Av. Provence 6, 1007 Lausanne, Salle une Programme

Présentation des travaux de recherche en matière d’e-santé de la HES-SO Valais Wallis Laurent Sciboz, professeur HES, responsable de l'Institut Informatique de gestion, HES-SO Valais Wallis

Présentation détaillée du projet Khresmoi qui s’inscrit dans le développement d’une suite de projets de recherche Henning Müller, professeur HES, collaborateur de l’Institut Informatique de gestion HES-SO Valais Wallis, responsable du projet

Les participations HES-SO à la recherche européenne Vincent Moser, conseiller Recherche appliquée & Développement, HES-SO

La HES-SO Valais Wallis confirme son engagement dans les projets de recherche

européens Claude Roch, conseiller d’état, chef du Département de l'éducation, de la culture et du sport du canton du Valais, vice-président des Comités stratégiques HES-SO

Delémont et Lausanne, 9 novembre 2010

09.11.2010

1

Institu

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s

1

eSanté : Travaux de recherche en cours

Prof. Laurent Sciboz, Responsable Institut d’informatique, Coordinateur ISnet

Institu

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Research Institutes & IT progress

Source : Forrester research

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Institu

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The Institute of Business Information Systems: Towards the digital organization

• The Institute of Business Information Systems is closely related to the bachelor and master degree course of the same name and is active in the fields of Software engineering, eServices, business process management and ERP systems.

• The Institute has been carrying out applied research and development projects for almost 20 years. These projects are partly financed by the Swiss Confederation’s Innovation Promotion Agency (CTI) and European research commission.

Institu

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4

Staff and Main infrastructure

• Staff : The Institute of Business Information Systems and Icare research Institute currently have a staff of 52, about 15 of which are Professors. The number of middle-level research staff varies according to the projects being carried out.

– Main infrastructure :

- eHealth Lab

- RFID & Middleware Lab

- SAP & Cloud computing Lab

- Close collaborations with

09.11.2010

3

Institu

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Applied research with SME & Value creation

SME(jobs)

Incubator Ra&Dteaching

TechnoArk

Influence on SME economic development

Processstart-up SME

Attraction for ICT Start-Up

Economicgrowth

Industrialreputation

Innovationreputation

Attraction for start-up

"co-sourcing"

Researchpartner

Spin-Off

Technopole Image

Start-Uplocaux

Open innovation

MediCoordination project: Partners in health

6

PublicHospitals

PrivateHospitals

RegionalHealthBoards

GeneralPractitioners

PublicInstitutions

SoftwareCompanies

StandardizationBoards

Laboratories Insurances

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4

MediCoordination project: Deployed Prototype

7

Nano-Tera G-DEMANDE

• Gestational diabetes mellitus (GDM)occurs during pregnancy (4%) due to increased resistance to insulin.

• With CHUV

• Goal of the project:1. Automatic alerts to medical staff;

2. Constant monitoring and recording to ease treatment adjustment

• Use of intelligent agents

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5

EU Cost Action Agreement Technologies• Project Open Interaction Frameworks:

normative multiagent systems in eHealth

• With University of Lugano

• Applied to negotiation platforms between hospitals

Promise

• http://www.promise-noe.eu/

• FP7, CA, started 1.1.2010

• Evaluation of multilingual and multimedia retrieval systems– Based on the CLEF benchmark and its partners

• Use cases– Patent retrieval

– Unlocking culture

– Medical decision support

• Visualization and user interfaces

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6

Chorus+

• http://www.ist-chorus.org/

• FP7, CA, started 1.1.2010

• Coordination of European activities in networked media such as multimedia retrieval– Organization of workshops, cluster

meeting, ICT events

• Application areas– Enterprise search

– Mobile search

• Policy making

InstitutInformatique de gestion

Medical image retrieval in mANY dimensions — MANY

Henning Müller, Adrien Depeursinge, Laurent Sciboz

09.11.2010

7

InstitutInformatique de gestion

Objectives (1/3)

• Go beyond 3D surfaces and towards 3D textures

Analyze multidimensional (3D, 4D, nD) medical imaging data for visual similarity retrieval:

InstitutInformatique de gestion

Objectives (2/3)• Reuse and develop user interfaces and feedback models

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8

Other projects• WIDTH

– EU FP7 Marie Curie Action, 2011

– Medical image retrieval

• NinaPro– FNS Synergia, to start in 2011

– Robotics, with IDIAP, DLR, Germany

• Med/LTPC– SWITCH/AAA

– Grid networks, collaboration with EIG, Geneva

• ImageCLEF (http://www.imageclef.org/)– Benchmark in multimedia retrieval

Selected Publications• Interoperability prototype between hospitals and general practitioners in

SwitzerlandB. Alves, H. Müller, D. Godel, O. Abu Khaled, and M. Schumacherin Medinfo 2010, Cape Town, South Africa, 2010.

• MediCoordination: A practical approach to interoperabilitiy in the Swiss health systemHenning MÜLLER, Michael SCHUMACHER, David GODEL, Abu Khaled OMAR, Francois MOOSER, Sandrine DINGProceedings of Medical Informatics Europe, Sarajevo, September 2009

• MediCoordination: Regional implementation for the Swiss e-health strategyDavid Godel, Omar Abou Khaled, Michael Schumacher, Henning Müller, François Mooser, Sandrine Ding, Elena MugelliniProceedings of the IADIS Multi conference on Computer Science and Information Systems, June 2009, Algarve, Portugal

• Une approche pratique de l’interopérabilité entre hôpitaux et médecins traitants en SuisseMichael SCHUMACHER, Henning MÜLLER, Bruno Alves, David GODEL, Abu

Khaled OMAR, Francois MOOSER, Sandrine DINGProceedings of the 22nd Annual Symposium of the Swiss Society for Medical Informatics, Bern, August 2009

16

09.11.2010

9

17

Pour la digitalisation des services :Institut d’informatique HES-SO // ValaisLaurent.Sciboz@hevs.ch

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Objectifs principauxKHRESMOI vise à développer un système de recherche multilingue et multimodal donnant accès à de l’information

et des documents biomédicaux, au travers des fonctionnalités suivantes :

Cas d’utilisation• Le grand public veut un accès à de l’information médicale fiable et compréhensible dans sa langue maternelle.

• Les médecins ont besoin de réponses précises et rapides – une recherche sur PubMed demande en moyenne

30 minutes, alors qu’ils ont typiquement 5 minutes à disposition. En outre, plus de 40% des recherches échouent

à fournir de l’information pertinente.

• Les radiologues croulent sous les images et ont besoin d’outils automatiques améliorés pour leurs analyses – dans

les grands hôpitaux, plus de 100GB (dépassant les 100.000 images) sont produits tous les jours.

Des groupes représentatifs des utilisateurs finaux sont disponibles pour des évaluations importantes, accessibles au

travers d’un moteur de recherche médical avec 11.000 requêtes par jour, ainsi qu’une association professionnelle de

2.700 médecins et deux départements de radiologie avec 175 radiologues.

Impact attenduImpact médical: Amélioration de l’accès à l’information médicale pour les médecins, de manière à ce qu’ils aient plus

de temps pour parler aux patients et les traiter, en ayant toute l’information nécessaire pour le faire plus efficacement.

Conversion de la quantité d’images radiologiques en une aubaine plutôt qu’une malédiction.

Impact scientifique: Fourniture de bases de données à grande échelles inexistantes actuellement pour le grand

public et de scénarios réalistes sur lesquels évaluer les nouvelles technologies.

Mise à disposition des techniques de pointe implémentées en logiciel open source.

Impact industriel: Amélioration de la stabilité, de la performance et des caractéristiques des produits existants open

source, et de là, leur attractivité et leur pertinence pour un déploiement plus large.

Impact public: Le grand public pourra utiliser le moteur de recherche de Health on the Net, amélioré par la

technologie KHRESMOI, relativement tôt dans le projet.

Le projet va naviguer entre plusieurs composants open source, qui seront intégrés dans une architecture innovante

et ouverte pour offrir une recherche robuste et évolutive d’information biomédicale.

• Extraction efficace et automatique d’information à partir de

documents biomédicaux, incluant des améliorations utilisant

un approvisionnement par la foule (crowdsourcing) et un

apprentissage actif, ainsi qu’une estimation automatique du

niveau de confiance et d’expertise de l’utilisateur cible

• Analyse automatique et indexation d’images médicales en

2D (Rayons X), 3D (IRM, CT), ainsi que 4D (IRMf)

• Mise en relation de l’information extraite d’images et de

textes biomédicaux non structurés ou à moitié structurés

et de l’information structurée au sein de bases de données

de connaissances.

• Support de recherche inter-langue, incluant des requêtes

multilingues, et retournant des extraits pertinents traduits

automatiquement.

• Set d’interfaces utilisateur adaptatives pour l’assister lors

de la formulation de la requête et afficher les résultats de

recherche au travers d’une visualisation ergonomique et

interactive

Coordinateur de projetHenning Müller Haute Ecole Spécialisée de Suisse occidentale Tel: +41 27 606 90 36 Fax: +41 27 606 90 00 henning.mueller[at]hevs.ch

Coordinateur scientifiqueAllan Hanbury Information Retrieval Facility Tel: +43 1 236 94 74 6042 a.hanbury[at]ir-facility.org

PartenairesHaute Ecole Spécialisée de Suisse occidentale (CH), Information Retrieval Facility (AT), Atos Origin (ES), ELDA (FR), Ontotext (BG), Université de Dublin City (IE), Université de Duisburg-Essen (DE), Université Charles à Prague (CZ), Université de Sheffield (UK), Health on the Net (CH), Université médicale de Vienne (AT), Société des médecins de Vienne (AT)

Durée:09/2010 - 08/2014

Schéma de financement: IP

Coût total:€ 10.534 m

Contribution de l’EC:€ 8.036 m

Numéro GA: 257528

http://khresmoi.eu

En un coup d’oeil

KHRESMOIRecherche et Analyse

d’Information Médicale

Données sémantiques

Images

Livres

Journaux

Sites Internet

Ressourceslinguistiques

Radiologues

Médecins

Grand public

Members of the general public want access to reliable and understandable medical information in their own language

Clinicians and general practitioners need accurate answers rapidly—a search on PubMed requires on average 30 minutes, while clinicians typically have 5 minutes available. Furthermore, over 40% of searches fail to provide relevant information

Radiologists are drowning in images—at larger hospitals over 100GB (over 100’000 images) are produced per day

Representative groups of end users are available for sizable evaluations, accessed through a medical search engine with 11’000 queries per day, a professional association of 2’700 medical doctors, and two radiology departments with 175 radiologists.

Main Objectives Project Coordinator

Henning Müller HES-SO Valais

Tel: +41 27 606 90 36 Fax: +41 27 606 90 00

henning.mueller[at]hevs.ch

Scientific Coordinator

Allan Hanbury Information Retrieval Facility

Tel: +43 1 236 94 74 6042 a.hanbury[at]ir-facility.org

Partners

University of Applied Sciences of Western Switzerland (CH),

Information Retrieval Facility (AT), Atos Origin (ES),

ELDA (FR), Ontotext (BG),

Dublin City University (IE), University of Duisburg-Essen (DE), Charles University in Prague (CZ), The University of Sheffield (UK),

Health on the Net (CH), Medical University of Vienna (AT),

Society of Physicians in Vienna (AT)

Duration: 09/2010-08/2014

Funding scheme: IP

Total Cost: € 10.534 m

EC Contribution: € 8.036 m

GA number: 257528

At a glance

Use Cases

Make available cutting edge techniques implemented in open source software. Industrial Impact: Improve existing open source products’ stability, features and performance, and hence their attractiveness and suitability for wider deployment. Public Impact: Members of the public will be using the Health on the Net search engine, improved by the KHRESMOI technology, relatively early in the project.

Medical Impact: Improve the access to medical information for doctors, so that they have more time to talk to and to treat patients, having all the information required for doing so more effectively. Convert the flood of radiological image data into a boon instead of a curse. Scientific Impact: Address the lack of publicly available large-scale data sets and realistic task-based scenarios on which to assess new technologies.

Expected Impact

Khresmoi- Medical Information Analysis and Retrieval

Medical information retrieval, multilingual information access, multimedia and multimodal information management, large-scale 3D, 4D data sets

http://khresmoi.eu

unstructured or semi-structured biomedical texts and images to structured information in knowledge bases

Support of cross-language search, including multi-lingual queries, and returning machine-translated pertinent excerpts

Adaptive user interfaces to assist in formulating queries and display search results via ergonomic and interactive visualizations

The research will flow into several open source components, which will be integrated into an innovative open architecture for robust and scalable biomedical information search.

The KHRESMOI platform consists of a multi-lingual multi-modal search and access system for biomedical information and documents. This will be achieved by:

Effective automated information extraction from biomedical documents, including improvements using crowd sourcing and active learning, and automated estimation of the level of trust and target user expertise

Automated analysis and indexing for medical images in 2D (X-Rays), 3D (MRI, CT), and 4D (fMRI)

Linking information extracted from

Members of the general public want access to reliable and understandable medical information in their own language

Clinicians and general practitioners need accurate answers rapidly—a search on PubMed requires on average 30 minutes, while clinicians typically have 5 minutes available. Furthermore, over 40% of searches fail to provide relevant information

Radiologists are drowning in images—at larger hospitals over 100GB (over 100’000 images) are produced per day

Representative groups of end users are available for sizable evaluations, accessed through a medical search engine with 11’000 queries per day, a professional association of 2’700 medical doctors, and two radiology departments with 175 radiologists.

Main Objectives Project Coordinator

Henning Müller HES-SO Valais

Tel: +41 27 606 90 36 Fax: +41 27 606 90 00

henning.mueller[at]hevs.ch

Scientific Coordinator

Allan Hanbury Information Retrieval Facility

Tel: +43 1 236 94 74 6042 a.hanbury[at]ir-facility.org

Partners

University of Applied Sciences of Western Switzerland (CH),

Information Retrieval Facility (AT), Atos Origin (ES),

ELDA (FR), Ontotext (BG),

Dublin City University (IE), University of Duisburg-Essen (DE), Charles University in Prague (CZ), The University of Sheffield (UK),

Health on the Net (CH), Medical University of Vienna (AT),

Society of Physicians in Vienna (AT)

Duration: 09/2010-08/2014

Funding scheme: IP

Total Cost: € 10.534 m

EC Contribution: € 8.036 m

GA number: 257528

At a glance

Use Cases

Make available cutting edge techniques implemented in open source software. Industrial Impact: Improve existing open source products’ stability, features and performance, and hence their attractiveness and suitability for wider deployment. Public Impact: Members of the public will be using the Health on the Net search engine, improved by the KHRESMOI technology, relatively early in the project.

Medical Impact: Improve the access to medical information for doctors, so that they have more time to talk to and to treat patients, having all the information required for doing so more effectively. Convert the flood of radiological image data into a boon instead of a curse. Scientific Impact: Address the lack of publicly available large-scale data sets and realistic task-based scenarios on which to assess new technologies.

Expected Impact

Khresmoi- Medical Information Analysis and Retrieval

Medical information retrieval, multilingual information access, multimedia and multimodal information management, large-scale 3D, 4D data sets

http://khresmoi.eu

unstructured or semi-structured biomedical texts and images to structured information in knowledge bases

Support of cross-language search, including multi-lingual queries, and returning machine-translated pertinent excerpts

Adaptive user interfaces to assist in formulating queries and display search results via ergonomic and interactive visualizations

The research will flow into several open source components, which will be integrated into an innovative open architecture for robust and scalable biomedical information search.

The KHRESMOI platform consists of a multi-lingual multi-modal search and access system for biomedical information and documents. This will be achieved by:

Effective automated information extraction from biomedical documents, including improvements using crowd sourcing and active learning, and automated estimation of the level of trust and target user expertise

Automated analysis and indexing for medical images in 2D (X-Rays), 3D (MRI, CT), and 4D (fMRI)

Linking information extracted from

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Les participations HES-SO à la recherche européenne

Vincent Moser, conseiller Ra&DLausanne, 9.11.2010

2

Neuf hautes écolesspécialisées (HES) en Suisse

• 7 HES publiques• 2 HES privées• Plus de 70’000

étudiantes et étudiants

• Une seule HES pour toute la Suisse occidentale: la HES-SO fondée en 1997

2

3

La HES-SO en bref• Plus de 15’000 étudiantes et étudiants

la plus grande HES de Suisse • 27 écoles dans 7 cantons• Quelque 10’000 collaborateurs-trices

(plus de 3000 équivalents plein temps)• 6 domaines de formation• 530 millions de francs de budget dont• env. 100 millions investis dans la recherche

appliquée et le développement

4

Recherche appliquée et développement Ra&D

• Mission prioritaire de toutes les HES• Objectif stratégique de la recherche HES-SO :

impact régional niveau international importance d’être présents au niveau européen

• Financement à trois niveaux– Projets de Ra&D menés dans les

instituts, avec des partenaires– Mise en réseau des compétences

thématiques (13 RCSO)– Soutien spécifique p. ex. pour le

montage de projets européens

Réseaux

Instituts

3

5

Participation HES-SO au FP7• Participation à 15 projets• Dont 3 avec la fonction de coordinateur• Montant de la subvention ~env. 5 mio € la plus forte participation d’une HES suisse

• Demandes en augmentation, une dynamique est lancée

Bravo à l’équipe de Khresmoi etplein succès pour la conduite du projet !

Conférence de presse – FP7 KHRESMOI

Date: 9 novembre 2010 Nbre de pages : 1

Sujet : La HES-SO // Valais confirme son engagement dans les projets de recherche européen

La recherche réalisée dans une HES a pour but premier d’actualiser le savoir dispensé dans les différentes filières de formation. Cette activité est une des caractéristiques des établissements de formation supérieure tertiaire. Les activités de la HES-SO // Valais sont proches du terrain, pratiquement toujours orientée sur des besoins concrets de l’économie et de la société. On parle de recherche appliquée, orientée, voire de recherche exploratoire. Cette activité répond à des besoins à moyen terme et est parfaitement complémentaire à la recherche fondamentale réalisée dans les EPF et les universités. Les HES ont également pour mission de participer au transfert de technologie en déployant des activités de type « Innovation ». Dans ce cas, les clients ne sont plus les filières de formation mais les acteurs du tissu socio-économique régional et national. En conséquence, les activités déployées par nos instituts doivent à la fois prendre en considération les besoins de la formation (client interne) ainsi que les besoins de l’économie et de la société (client externe). De ce fait, ces deux aspects sont systématiquement pris en compte au niveau du positionnement de chaque institut. Une volonté d’ouverture sur l’international en faisant valoir quelques unes de nos compétences de pointe et savoir-faire, participe à la stratégie de positionnement de chacun de nos centres de recherche. Le succès remporté par l’attribution de ce nouveau projet européen à notre Institut d’informatique démontre l’engagement de notre canton dans ce domaine. Concernant le rôle de la HES-SO // Valais dans le domaine de l’informatique, son Institut basé au Technopôle de Sierre se positionne depuis 10 ans au travers de ses compétences-clés, telles que le développement de systèmes d’informations distribuées et la digitalisation des services. Les applications de ces nouvelles technologies sont multiples et particulièrement utiles dans des domaines comme la eSanté, la cyberadministration et l’internet de l’énergie. En effet, l’économie numérique (télécommunications, audiovisuel, logiciel, services informatiques, services en ligne) représente le secteur le plus dynamique de l’économie mondiale. Dans la plupart des pays développés, son taux de croissance est deux fois supérieur à celui de l’économie. Ce secteur représente désormais plus de 25 % de la croissance mondiale. Elle en représentera 30 % avant 5 ans.i L’économie numérique est le principal facteur de gain de compétitivité des économies développées. Les investissements dans ce domaine sont identifiés comme les plus productifs, parce qu’ils accroissent la compétitivité de l’ensemble des autres secteurs de l’économie.

Finalement, à l’horizon 2012, les HES seront régies par les mêmes lois universitaires que les EPF et les universités. Cette nouvelle situation implique un positionnement clair et fort de la part de chaque institut de recherche HES, condition sine qua non pour survivre et à fortiori pour se développer au niveau de la recherche européenne.

i Rapport Plan de développement de l’Economie numérique, E. Besson, Secrétariat d’Etat, 2008