Recherche documentaire et critique de l’information ... · • optimisation de la présentation d’un document scientifique (article, thèse…) Vous familiariser Introduction

Formation doctorale en Sciences vétérinaire (ULg) - Année académique 2011/2012 S. Vandenput - 1er cours

Recherche documentaire et critique de l’information scientifique

Bibliothèque des Sciences de la Vie partim Médecine vétérinaire

Année académique 2011-2012

Sandrine Vandenput

[email protected]

Formation doctorale en Sciences vétérinaires

Recherche documentaire et critique de l’information

scientifique

  4 x 2 heures de cours

  formation pratique : par groupe (à organiser)

  examen : petit travail à présenter

En pratique

Introduction

du lundi au vendredi de 8.30 à 21.00

+ samedi de 9.00 à 18.00

Bibliothèque des Sciences de la Vie - ULg

Où ? Au CHU (niveau -1)

Où ? À la Faculté de Médecine vétérinaire

Antenne de proximité lundi au vendredi : de 9.00 à 13.00

+ mercredi de 13.30 à 17.00

Introduction



•  avec le langage documentaire

•  avec les outils de recherche de l’information scientifique et leur interface d’interrogation

--> vous permettre de répondre de façon autonome et efficace à une question documentaire

•  avec l’approche critique de l’information

•  optimisation de la présentation d’un document scientifique

(article, thèse…)

Vous familiariser

Introduction

•  pouvoir déterminer la nature et l’étendue de l’information nécessaire

•  être capable de trouver l’information adéquate

•  être capable de l’évaluer de manière critique

•  être capable de l’utiliser efficacement

Maîtrise de l’information

Introduction

? Question ?

recherche de références bibliographiques

bases de données

trouver les documents catalogue

lecture et analyse du contenu

incorporation des informations dans la

recherche et la publication scientifique

Introduction



  Comment le savoir est-il organisé ?

ü  sources d’info : documents primaires ü  présentation des références bibliographiques   Comment trouver l’information et y accéder ? ü  localisation des documents physiques ü  recherche de références bibliographiques ü  les + du web

  Critique de l’information & rédaction scientifique ü  travail - examen ü  lecture critique & Evidence-based medicine ü  publication scientifique : le parcours du tapuscrit… ü  quelques règles de typographie et précautions

Plan

Comment le savoir est-il organisé ?

diffusion écrite du savoir

1.  dans quels documents trouve-t-on l’information scientifique ?

2.  signalisation standardisée des sources d’information dans un document scientifique

Sources d’information(s)

chapitre de livre article scientifique « littérature grise »

= documents primaires

par déf. : document original, support d’une information émise pour la 1re fois

du point de vue du « contenu intellectuel »

3 sources majeures :




« contenu » -> point de vue intellectuel

« contenant » -> point de vue physique

Document primaire Document physique

chapitre / livre livre

article scientifique périodique scientifique

communication à un congrès

actes du congrès (proceedings)

1 document primaire = 1 unité « information »


Chaque document primaire est notamment identifié par la (les) personne(s) qui l’ont rédigé

= auteur(s)

par définition : personne(s) ou collectivité(s) responsable(s) du contenu intellectuel d’un document

auteur (author)


ouvrage collectif, dont les chapitres sont rédigés par différentes personnes,

sous la responsabilité d’un éditeur scientifique

ouvrage écrit par une ou plusieurs personnes (les auteurs)

à distinguer

1re source d’information scientifique :

le contenu des livres




  + de 48 pages

  ISBN (International Standard Book Number)

Livre = par définition (Petit Robert), volume imprimé d’un nombre assez grand de pages

= « contenant » = document physique

Monographie = par définition (Petit Robert) = étude complète et détaillée qui se propose d’épuiser un sujet précis relativement restreint (<- contenu intellectuel)

synonyme : ouvrage


= monographie écrite par une seule personne

Auteur : N.J. Salkind

Titre : Statistics for People Who (Think They) Hate Statistics

Mention d’édition : 3rd edition


= monographie écrite par 2 personnes

Auteurs : M. Moll & N. Moll

Titre : Précis des risques alimentaires

ISBN : 978-2-7430-0407-1




par définition : personne(s) ou collectivité(s) responsable(s) du contenu intellectuel d’un document

auteur (author)

Cas particulier des ouvrages collectifs : La rédaction de chaque chapitre est confiée à un ou plusieurs auteurs Mais le tout est supervisé par un ou plusieurs éditeurs scientifiques

par définition : personne(s) ou collectivité(s) responsable(s) de la préparation, pour la publication, d’un document du point de vue de son contenu intellectuel

Éditeur scientifique (editor)


ISBN 978-1437-70746-5

éditeur commercial

= Saunders (Elsevier)

n° ouvrage

n° contrôle

Depuis le 1er janvier 2007 : 10 -> 13 chiffres

pour augmenter la capacité de numérotation du système ISBN


Ouvrage collectif

Éditeurs scientifiques (sur la page de couverture) :

Tobias & Johnston


Table des matières



Ouvrage collectif


edited by… (éditeurs scientifiques)

Ouvrage collectif


En pratique : nom et ville

par définition : personne(s) ou collectivité(s) responsable(s) de la production et de la diffusion d’un document

Éditeur commercial (publisher)

exemple : Mosby - St Louis

Dernière notion concernant les ouvrages scientifiques




éditeur commercial (publisher)


LC

EF20

2011


Classement thématique alpha-numérique

à l’antenne de proximité (FMV) de la Bibliothèque

des Sciences de la Vie

LC EF20 2011

Ouvrages

E-books

de plus en plus d’ouvrages sont également (ou exclusivement) accessibles en version électronique

avec ou non une plus-value quant à l’information disponible






Sources majeures : •  chapitre de livre •  article scientifique

Ø  périodique scientifique Ø  « notoriété » des périodiques

•  « littérature grise »


  de 2-3 à ± 50 pages

  1 ou plusieurs auteur(s) (on parle alors des co-auteurs)

= information structurée, publiée, selon certaines règles, dans un périodique scientifique

soumise préalablement à l’approbation des pairs (comité de lecture) (peer-reviewing)

= grand majorité de l’information scientifique

2e source d’information scientifique :

les articles scientifiques


Principalement 3 types d’articles scientifiques

1. Article original (expérimentation ou observation)

2. Revue de la littérature : synthèse

3. Article descriptif : cas clinique(s)




  publication à intervalles réguliers

  ISSN (International Standard Serial Number)

  disponible en format papier et/ou électronique

= document physique, contenant des articles scientifiques


Périodiques scientifiques Revues scientifiques

Le Point Vétérinaire

Environmental Microbiology

Plant and Soil

Journal of Food Science International Journal of Primatology Journal of Agronomy and Crop Science

Périodiques scientifiques Revues scientifiques


Dans le « monde vétérinaire » :

ü  ± 7400 périodiques (+ de 50 langues différentes)

titres « essentiels » : ± 500

+ tous les titres multi-disciplinaires (agriculture, denrées alimentaires…)

À l’ULg : ü  223 titres format papier (à la BSV) ü  + 661 autres titres accessibles uniquement en format

électronique

dont 64 % également électronique




fascicule de mars

n° 1

fascicule de juin

n° 2

volume

Chaque fascicule est composé de x articles

scientifiques


En pratique :

la revue “The Veterinary Record ”

1 fascicule par semaine

2 volumes par an comprenant chacun 26 fascicules

Pour 2011 : volume 168 et volume 169


En pratique :

Le périodique “ The Veterinary Journal ”

Décembre 2011 Volume 190, fascicule 3 pages 301–418 Ce fascicule contient 24 articles (dont des éditoriaux)

ISSN : 1090-0233

Périodicité : mensuel – 4 volumes par an avec 3 fascicules




« Notoriété » des périodiques

« index bibliométriques » = mesures internationalement validées permettant d’estimer la notoriété d’un périodique dans la communauté scientifique

  facteur d’impact

  demi-vie citée

  index d’instantanéité

calculées par l’ISI (Institute for Scientific Information)


Accessible uniquement via l’intranet


En attendant le site spécifique aux bibliothèques/ULg

1.

2.

clic 3.





Pour le Veterinary Journal en 2010

Facteur d’impact (Impact Factor)

Rapport, pour les deux années précédentes, du nombre de fois qu’une revue a été citée (dans des revues recensées), par rapport au nombre total d’articles parus dans cette revue pendant la même période

Par ex. pour le Veterinary Journal nbre de citations en 2010 (2008 & 2009) : 664 + 622 = 1286 nbre d’articles publiés (2008 & 2009) : 229 + 231= 460 FI du Vet. J. en 2010 = 1286/460 = 2.796


Limites du facteur d’impact


•  prise en compte uniquement des périodiques peer-reviewed (pas des ouvrages ni de la littérature grise…)

•  ne mesure pas directement la qualité scientifique d’un périodique ou des articles qui y sont publiés mais aussi le dynamisme de la publication et la disponibilité du périodique

•  influence des auto-citations (surtout à court-terme)

•  différence importante en fonction des domaines de recherche

-> il ne devrait pas être utilisé pour évaluer le CV d’un chercheur



Evaluation d’un chercheur : indice H


ou facteur de Hirsch

D’après un article publié en 2005 par J.E. Hirsch (DOI: 10.1073/pnas.0507655102) : Hirsch propose une méthode simple pour quantifier l’impact du travail scientifique individuel

si l’indice h du chercheur x est de 22, cela signifie qu’environ 22 de ses publications ont été citées au moins 22 fois

Proc. Natl Acad. Sci. USA, 2005, 102, 16569-16572

Comment trouver l’indice H d’un auteur ?


En interrogeant la base de données Web of Science Comment ? •  introduire dans Search le nom et initiale(s) de prénom du

chercheur •  cliquer sur Create Citation Report

Demi-vie citée (cited half-life)

rend compte de l’ancienneté ou du caractère récent des articles cités dans une revue


Pour le Veterinary Journal, en 2010 : Cited Half-Life = 3.8 years

Cela signifie que la moitié des articles issus de ce périodique et cités en 2010 ont été publiés depuis moins de 3,8 années



Index d’instantanéité (immediacy index)

rapport, pour l’année concernée, du nombre d’articles publiés dans une revue faisant l’objet de citations sur le nombre total d’articles publiés par cette revue la même année = rapidité avec laquelle un article est cité (moyenne par revue)

Par ex. pour le Veterinary Journal 180 articles de 2010 ont été cités en 2010 sur les 241 articles publiés en 2010 dans le Vet. J. -> 180/241 = 0.747


1 2 3

1. périodiques citant des articles publiés dans le Vet. J. 2.  périodiques cités par le Vet. J. 3.  graphe représentant l’évolution du facteur d’impact sur les 5

dernières années






Subject categories Veterinary Sciences : n = 145


Pour le périodique « Animal Conservation »

Journal ranking : en terme de

facteur d’impact






Sources majeures : •  chapitre de livre •  article scientifique

Ø  périodique scientifique Ø  « notoriété » des périodiques

•  « littérature grise »


Définition AFNOR* : « document dactylographié ou imprimé, produit à l’intention d’un public restreint, en dehors des circuits commerciaux de l’édition et de la diffusion »

« non conventionnelle » ou « souterraine »

* Association française de Normalisation!

3e source d’information scientifique :

la « littérature grise »


  plus difficile à consulter (plus difficile à se procurer)

  et donc plus délicat à référencer !

la « littérature grise »

car une bonne référence se doit être (i) pertinente et (ii) facile à consulter par tout lecteur !

•  compte-rendus de congrès (proceedings) •  thèses non publiées, mémoires •  rapports de commission d’étude, etc. •  brevets et normes •  notes de cours, syllabus •  etc.






1.  dans quels documents trouve-t-on l’information scientifique?

2.  signalisation standardisée des sources d’information dans un document scientifique

= les références bibliographiques

Plan

Importance de la standardisation de ces références : obligation de contenir tous les éléments permettant au lecteur de retrouver le document référencé

Pour n’importe quel texte scientifique !

Indispensable pour appuyer les propos tenus, pour justifier tout fait énoncé ! (plagiat !)

En pratique :

Dans le texte scientifique : appels de référence ou citations

En fin de texte : références bibliographiques

Références bibliographiques

Choix des références dans une bibliographie

  doivent illustrer les propos   à éviter : toutes les références non facilement accessibles par le lecteur

•  références à des thèses •  références des congrès non publiés •  références à des communications personnelles •  références d’un article « sous presse » •  références de « seconde main »




dans le texte

en fin de document


Place des citations (ou appels de références) dans le texte scientifique

•  une référence peut être placée au milieu d’une phrase •  une référence peut revenir plusieurs fois

le plus tôt possible après l’énoncé du fait !





Riebold (1996) …


… (Gavier and others 1988).


Les références en fin de document sont présentées de façon standardisées !

--> variable en fonction du document primaire

monographie chapitre de livre article scientifique page web




•  en pratique : toujours suivre les instructions aux auteurs

•  uniformisation “ absolue ” à tout le document

Rédaction d’une bibliographie : règle


Rédaction d’une bibliographie

répond à une série de normes (ISO*) quant à l’abréviation des titres de périodiques

Journal --> J Vétérinaire, veterinary --> Vet American --> Am British --> Br Animal --> Anim Food --> non abrégé Small --> non abrégé Science --> Sci

Si un seul mot, jamais abrégé !

* International Organisation for Standardization http://www.iso.org/


Instructions aux

auteurs pour le

périodique

Journal of Heredity




Advances in Veterinary Science and Comparative Medicine ISO Abbr. : Adv. Vet. Sci. Comp. Med.

Annales de Médecine Vétérinaire ISO Abbr. : Ann. Méd. Vét.

Journal of Dairy Science ISO Abbr. : J. Dairy Sci.

Food Science and Agricultural Chemistry ISO Abbr. : Food Sci. Agric. Chem.

Nature ISO Abbr. : Nature

Nature Genetics ISO Abbr. : Nat. Genet.

Rédaction d’une bibliographie


normes ISO

pour vous aider : le Journals in NCBI Databases de PubMed (www.pubmed.gov)

Abréviation des titres de périodiques


En pratique :

1. Commence toujours par la(les) personne(s) ou collectivité responsable(s) du contenu -> AUTEUR(S)

2. le contenu, représenté par le TITRE du document primaire (titre toujours dans la langue originale)

3. les infos pratico-pratiques concernant le document physique (varie en fonction du type de document physique)




Rappel : personne(s) ou collectivité

responsable(s) du contenu intellectuel

du document

Auteur(s) ou éditeur(s) scientifique(s)

Titre de l’ouvrage

Mention d’édition

Nom de l’éditeur commercial

Ville de l’éditeur commercial

Année de parution

Nombre de pages numérotées

Si la référence renvoie le lecteur vers une monographie :



Notice bibliographique de cet ouvrage collectif D’Mello J.P.F. Food safety : contaminants and toxins. CABI Publishing : Oxon, 2003, 452 p.

D’MELLO, J.P.F., 2003, Food safety - contaminants and toxins. Oxon, CABI Publishing, 452 p.

Présentation variable en fonction des instructions aux auteurs

D’Mello JPF, (2003) Food safety : contaminants and toxins. Oxon : CABI Publishing, 452 p.




auteur(s) du chapitre titre du chapitre

infos concernant le livre 1re et dernière page du chapitre

Si la référence renvoie le lecteur vers une partie (chapitre) d’une monographie :


Chapitre 3 p. 47 à 63

2 auteurs Gago Martinez A. et

Lawrence J.F.


Notice bibliographique du chapitre 2 (ouvrage collectif) Gago Martinez A., Lawrence J.F. Shellfish toxins. In : D’Mello

J.P.F. Food safety : contaminants and toxins. CABI Publishing : Oxon, 2003, 47-63.

GAGO MARTINEZ, A and LAWRENCE, JF, 2003, Shellfish toxins. Food safety : contaminants and toxins. D’Mello, JPF (ed.), CABI Publishing, Oxon, 47-63.

Présentation variable en fonction des instructions aux auteurs




Chapitre d’une monographie Euzéby J. Entomoses des muscles striés. In : Euzéby J., Les parasites

des viandes : épidémiologie, physiopathologie, incidences zoonotiques. Techniques & Documentation : Paris, 1998, p. 227-243.


Ouvrage rédigé par un seul auteur

auteur(s) de l’article titre de l’article titre du périodique année de publication n° de volume (n° fascicule)

1re et dernière page de l’article

Si la référence renvoie le lecteur vers un article :


2008, Vol. 104 (1) : 276-284




Notice bibliographique de cet article Delcenserie V., Loncaric D., Bonaparte C., Upmann M., China B., Daube G., Gavini F. Bifidobacteria as indicators of faecal contamination along a sheep meat production chain. Journal of Applied Microbiology, 2008, 104, 276-284.

Delcenserie V., Loncaric D., Bonaparte C., Upmann M., China B., Daube G. and Gavini F. 2008. Bifidobacteria as indicators of faecal contamination along a sheep meat production chain. J. Appl. Microbiol., 104, 276-84.

Abréviations selon normes internationales


Si la référence renvoie le lecteur vers un article publié dans un périodique uniquement édité en version électronique :


Robbins MM, Gray M, Fawcett KA, Nutter FB, Uwingeli P, Mburanumwe I, Kagoda E, Basabose A, Stoinski TS, Cranfield MR, Byamukama J, Spelman LH, Robins AM, 2011 Extreme conservation leads to recovery of the Virunga Mountain gorillas. PLoS ONE 6(6): e19788. doi:10.1371/journal.pone.0019788

Digital object identifier (DOI) = identifiant d'objet numérique

http://www.doi.org/




auteur(s) du document titre du document type de support date de création ou de dernière mise à jour adresse URL ou référence du support pour page Web : date de consultation du site

Si la référence renvoie le lecteur vers une page web ou autre référence électronique :


BILLER D.S., DIBARTOLA S., LAGERWERF W.J. Autosomal dominant polycystic kidney disease in persian cats. (sans date) http://www.cfainc.org/health/pkd.html Consulté le 05/09/05.

Page web ou autre référence électronique

ORGANISATION DES NATIONS UNIES POUR L’ALIMENTATION ET L’AGRICULTURE Ressources génétiques animales: adoption d’un plan d‘action mondial. [en ligne] (2007) Adresse URL : www.fao.org/newsroom/fr/news/2007/1000655/index.html Consulté le 05/12/11.


  Système « auteur-date »

= système de Harvard

  Système numérique séquentiel

= système de Vancouver

Deux systèmes reconnus




(Dupont, 2001).

selon Durand (2000),

Références :

Dupont S. 2001 … Durant P. 2000 …

citation ou

appel de référence

Système « auteur-date » ou système de Harvard


dans le corps du texte

d’après Dupond et Dupont (1998), … … (Dupond et Dupont, 1998). d’après Dupond et Dupont (1998b), … (Martin et coll., 1999) (Martin et al., 1999)

Pour « et alii »



•  pas de numéro d’ordre !

•  par ordre alphabétique

•  si plusieurs références du même 1er auteur : par ordre

chronologique

•  si plusieurs références du même 1er auteur, la même année : a,

b, c ...


dans la liste de références (en fin de document)




Système « auteur-date » (Harvard)


À la fin de l’article : liste des références citées dans le texte

Adams and others 2000

Extrait du texte


Extrait du texte

À la fin de l’article

Nielson and others 2001





•  numérotées avec un chiffre arabe, entre ( ) ou [ ] ou en exposant

•  par ordre d’apparition dans le texte (la plupart du temps)

•  si plusieurs références successives citées : (3-6)

Système numérique séquentiel ou système de Vancouver


(1).

(2-4).

Références :

1. …… 2. …… 3. …… 4. ……

citation ou

appel de référence

Système numérique

séquentiel ou système de Vancouver







•  numérotées avec un chiffre arabe

Inconvénients de ce système: insérer une nouvelle référence !!

dans la liste de références (en fin de document)

Système numérique séquentiel ou système de Vancouver


à la fin du texte : liste des références




… de l’importance des recommandations (instructions) aux auteurs

Chaque périodique définit une ligne éditoriale et impose une série de règle quant à la présentation du tapuscrit soumis (nombre de lignes maximum, appel de citation dans le texte, références…)

Donc une même référence bibliographique pourra prendre des formes différentes en fonction du périodique dans lequel est publié l’article qui la cite

Par exemple :


Kimura AC, Palumbo MS, Meyer H, Abbott S, Rodriguez R, Werner SB A multi-state outbreak of Salmonella serotype Thompson infection from commercially distributed bread contaminated by an ill food handler. EPIDEMIOLOGY AND INFECTION, 2005, 133 : 823-828.

Selon le Veterinary Record

Selon le Journal of Wildlife Diseases


Selon le Clinical Infectious Diseases

Selon le Journal of Food Safety




En pratique : où trouver les instructions aux auteurs ?

Guides for authors Authors guidelines Instructions for authors






Gerchman et al. Veterinary Research 2011, 42:90


  Comment le savoir est-il organisé ?

ü  sources d’info : documents primaires ü  présentation des références bibliographiques   Comment trouver l’information et y accéder ? ü  localisation des documents physiques ü  recherche de références bibliographiques ü  les + du web

  Critique de l’information & rédaction scientifique ü  lecture critique & Evidence-based medicine ü  publication scientifique : le parcours du tapuscrit… ü  quelques règles de typographie et précautions

Plan : le prochain cours

Documents

Recherche documentaire et critique de l’information ... · • optimisation de la présentation d’un document scientifique (article, thèse…) Vous familiariser Introduction