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REPUBLIQUE TUNISIENNE ___****___ Ministère de l’Enseignement Supérieur, de la Recherche Scientifique et de la Technologie ___****___ DIRECTION GENERALE DE LA RENOVATION UNIVERSITAIRE REFORME LMD BIOLOGIE LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE PROPOSEE PAR LA COMMISSION NATIONALE SECTORIELLE DE BIOLOGIE Octobre 2009

REFORME LMD BIOLOGIE - mesrst.tn · Biologie cellulaire 1H30 0H30 0H45 3 3 X 4 Biologie cellulaire Génétique UF ... Cours TD TP Crédits 1- Biologie végétale 1h30 0H 1H15 3 2-

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REPUBLIQUE TUNISIENNE ___****___

Ministère de l’Enseignement Supérieur, de la Recherche Scientifique

et de la Technologie ___****___

DIRECTION GENERALE DE LA RENOVATION UNIVERSITAIRE

REFORME LMD

BIOLOGIE

LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET

EXPERIMENTALE

PROPOSEE PAR LA COMMISSION NATIONALE SECTORIELLE DE BIOLOGIE

Octobre 2009

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 2

TABLE DES MATIERES

TABLE DES MATIERES .............................................................................................................................................. 2 

INTRODUCTION....................................................................................................................................................... 3 

LA BAE ‐ PROGRAMME L1........................................................................................................................................ 4 

PLAN DE FORMATION.....................................................................................................................................................5 CONTENU DES PROGRAMMES .......................................................................................................................................7 

LA BAE ‐ PROGRAMME L2...................................................................................................................................... 32 

PLAN DE FORMATION...................................................................................................................................................33 CONTENU DES PROGRAMMES .....................................................................................................................................35 

LA BAE ‐ PROGRAMME L3...................................................................................................................................... 51 

PLAN DE FORMATION...................................................................................................................................................53 CONTENU DES PROGRAMMES .....................................................................................................................................55 

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 3

INTRODUCTION

LA LICENCE APPLIQUEE

EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE

DOMAINE : SCIENCES ET TECHNOLOGIES MENTION : BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE OBJECTIFS : Cette licence vise la formation de techniciens de laboratoires d’enseignement, de recherche et d’analyse biologique dans différents secteurs. Elle a pour objectifs l’acquisition de compétences

- dans les domaines biochimiques, cellulaires, tissulaires et physiologiques

- dans l’expérimentation animale, végétale et microbienne - ainsi que dans les domaines d’interfaces de la biologie avec la

chimie, la physique et l’informatique En vue de

- la maîtrise de techniques biologiques aussi bien analytiques que préparatives

- une connaissance des équipements des laboratoires de biologie et des bonnes pratiques de laboratoire

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 4

LA BAE - PROGRAMME L1

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 5

PLAN DE FORMATION Licence Appliquée en Biologie Analytique et Expérimentale

Universités : Tunis El Manar

Etablissements : Faculté des Sciences de Tunis

Licence Appliquée Biologie Analytique et Expérimentale

Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biologie Analytique et Expérimentale

Semestre 1

Volume horaire semestriel (14 semaines) Crédits Coefficients Régime d'examen N

° Unité

d'enseignement Nature de l'UE

Elément constitutif d'UE (ECUE)

Cours TD TP Cours Intégré ECUE UE ECUE UE Contrôle

continu Régime mixte

C2i 2H 2 2 X Anglais 2H 2 2 X 1 Unité

Transversale UT Droit de l’Homme 1H30 2

6 2

6 X

Math appliquées 1H30 1H 3 3 X 2 Math Physique UF Physique 1H30 0H45 0H45 3

6 3

6 X

Chimie Générale 1H30 0H30 0H45 3 2 X 3 Chimie UF Chimie Organique 1H30 0H30 0H45 3

6 3

6 X Biologie cellulaire 1H30 0H30 0H45 3 3 X

4 Biologie cellulaire Génétique

UF Génétique 1H30 0H45 0H30 3

6 3

6 X

Biologie animale 1H30 1H15 3 3 X 5 Diversité du vivant UF

Biologie végétale 1H30 1H15 3 6

3 6 X

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 6

Licence Appliquée en Biologie Analytique et Expérimentale

Universités : Tunis El Manar

Etablissements : Faculté des Sciences de Tunis

Licence Appliquée Biologie Analytique et Expérimentale

Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biologie Analytique et Expérimentale

Semestre 2

Volume horaire semestriel

(14 semaines) Crédits Coefficients Régime d'examen N Unité d'enseignement Nature

de l'UE Elément constitutif

d'UE (ECUE) Cours TD TP Cours

Intégré ECUE UE ECUE UE Contrôle continu

Régime mixte

C2I 2H 2 2 X Anglais 2H 2 2 X 1

C2I Langues Droit de l'homme

UET Droit de l'homme 1H30 2

6 2

6 X

Biochimie Structurale 1H30 0H30 1H 3 3 X

2 Biochimie Structurale Techniques d'analyses biochimiques

UEF Techniques d'analyses biochimiques

1H 0H30 1H 3 6

3 6

X

Biologie moléculaire 1H30 0H45 0H30 3 3 X 3 Biologie moléculaire

Microbiologie UEF Microbiologie 1H30 1H15 3

6 3

6 X

OPT1.1 3 3 X 4 OPTIONNELLE 1 UEO OPT1.2 3

6 3

6 X

OPT2.1 3 3 X 5 OPTIONNELLE 2 UEO OPT2.2 3

6 3

6 X

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 7

CONTENU DES PROGRAMMES Fiche descriptive d’une unité d’enseignement (EU)

et des éléments constitutifs d’une unité d’enseignement (ECUE)

Intitulé de l’UE

DIVERSITE DU VIVANT

Nombre de crédits………6…… Code UE………………………….

Université :………………………………………………. Etablissement :…………………………………………..

Domaine de la formation : Sciences et Technologie

Mention Biologie Analytique et Expérimentale et autres mentions des Sciences du vivant

Diplôme et Parcours LA Biologie Analytique et Expérimentale Parcours : Tous les parcours de la mention LF……………………………………………………Parcours :

Semestre S1

1- Objectifs de l’UE (savoirs, aptitudes et compétences)

Permettre à l’étudiant d’acquérir une formation de base sur - la diversité et l’importance du règne végétal et du règne animal dans la Biosphère - la morphologie et le développement des végétaux inférieurs et des plantes à fleurs - les Protozoaires, la biologie et la diversité des Métazoaires ( invertébrés et vertébrés)

2- Pré-requis (définir les UE et les compétences indispensables pour suivre l’UE concernée) 3-

Niveau du Baccalauréat en sciences expérimentales ou équivalent. 3-Eléments constitutifs de l’UE (ECUE) 3.1- Enseignements

Volume horaire Eléments constitutifs Cours TD TP Crédits

1- Biologie végétale

1h30

0H

1H15

3

2- Biologie animale

1h30

0H

1H15

3

Total 3H 0H 2H30 6 3.2- Activités pratiques (Projets, stages, mémoires….)

Durée Activités pratiques de l’UE Travaux au

laboratoire Projets Stages Autres (terrain)

Crédits

Total

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 8

4- Contenu (descriptifs et plans des cours) 4.1- Enseignements (Présenter une description succincte des programmes de chaque ECUE et joindre le programme détaillé à la fiche descriptive de l’UE)

1- Biologie végétale : Introduction, les grandes lignes de la classification du règne végétal, étude des angiospermes 2- Biologie animale : Introduction, les protozoaires, les métazoaires : invertébrés et vertébrés 4.2- Activités pratiques de l’UE (Présenter une description succincte des objets, des contenus et des procédures d’organisation de chaque activité)

1- Biologie végétale : Réalisation de coupes anatomiques, reconnaissance des organes et utilisation d’une flore, terrain, histologie, morphologie et anatomie des appareils végétatif et reproducteur des angiospermes. Reproduction sexuée et multiplication végétative 2-Biologie animale : Reconnaissance et classification des différents taxons : étude des Protozoaires, des Spongiaires et des Cnidaires ; étude des Vers, des Mollusques et des Arthropodes ; étude des Vertébrés (Poissons, Amphibiens, Reptiles, Oiseaux et Mammifères) 5 – Méthodes pédagogiques et moyens didactiques spécifiques à l’UE (méthodes et outils pédagogiques, ouvrages de référence, recours aux TIC- possibilités d’enseignement à distance) Utilisation de préparations microscopiques Présentation de documents audiovisuels en cours et en TP Sorties sur le terrain ; Collections de référence ; Confection d’herbier Ouvrages de référence : - Initiation à la Biologie Végétale par J. ZAFFRAN édition Ellipse - Biologie végétale – les Cormophytes par R. GORENFLOT et B. DE FOUCAULT édition Dunod - Biologie animale. Structures et Fonctions par J. COUSIN édition Ellipse - Croissance et développement des animaux par J.-Y. PATTIER édition Ellipse 6-Examens et évaluation des connaissances 6.1- Méthode d’évaluation et régime d’examens (Préciser le régime d’évaluation préconisé : contrôle continu uniquement ou régime mixte : contrôle continu et examens finaux) Régime mixte : Contrôle continu et Examen final de l’UE (Epreuve commune entre ECUE ou Epreuves séparées) 6.2- Validation de l’UE (Préciser les poids des épreuves d’examens pour le calcul de la moyenne de l’ECUE, les coefficients des ECUE et le coefficient de l’UE au sein du parcours).

Contrôle continu (30%) Examen final (70%) EPREUVES EPREUVES ECUE

Ecrit TP Autres

Pondéra -tion Ecrit Oral TP et

Autres

Pondéra -tion

Coef. de l’ECUE

Coef. de l’UE au sein du

parcours 1-Biologie Végétale

5% 5% 5% 50% 25% 10% 50% 3

2- Biologie Animale

5% 5% 5% 50% 25% 10% 50% 3 6

TOTAL 10% 10% 10% 50 20 6 6 6.3- Validation des stages et des projets.... …………………………………………………………………………………………………………..

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 9

Annexe 1

Unité d’Enseignement DIVERSITE DU VIVANT

Code UE :……………

ECUE n° 1 BIOLOGIE ANIMALE

Code ECUE :…………… COURS 21H I. Introduction: Diversité du vivant A. Place du règne animal dans le monde vivant B. Diversité et évolution du monde animal C. Principes de la classification: systémique et nomenclature II. Les Protistes à affinité animale: les Protozoaires

A. Présentation générale et particularités (Amibe- Trypanosome- Paramécie) B. Intérêt médical (maladies- épidémies…) et écologique (espèces indicatrices) des

protozoaires C. Etude de cycles biologiques (1ou plus: Leishmaniose par exemple)

III. Biologie et Diversité des Métazoaires

A. Les Invertébrés

1. Spongiaires et Cnidaires: plan d’organisation - diversité- intérêts économique et écologique (exploitation et valorisation)

2. Les vers: Plathelminthes- Némathelminthes – Annélides: plan d’organisation- diversité- intérêts médical (étude de cycles biologiques parasitaires), écologique et biologique

3. Les Mollusques: - Classification et Diversité - Intérêts écologique et économique (espèces comestibles: exploitation et

valorisation) 4. Les Arthropodes:

- Classification et Diversité. - Intérêts médical, agronomique, écologique, économique…: espèces

utiles- nuisibles – venimeuses, bio indicateurs…) 5. Les Echinodermes: présentation générale et intérêt biologique

B. Les Vertébrés

1. Particularités morphologiques et biologiques 2. Diversité (Poissons – Amphibiens – Reptiles – Oiseaux- Mammifères) 3. Intérêt biologique, écologique et économique

TRAVAUX DIRIGES & PRATIQUES

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 10

1. Etude des Protozoaires (Amibe – Trypanosome- Paramécie) – des Spongiaires et des

Cnidaires (comparaison et reconnaissance de quelques taxons des côtes tunisiennes) II. Etude des Vers

• Comparer Trématodes – Cestodes- Nématodes et Annélides • Reconnaissance des principaux taxons (Douve- Ténia- Ascaris- Ver de terre…) •

III. Etude des Mollusques • Diversité du groupe- Reconnaissance des espèces fréquentes, comestibles… • Dissection d’un mollusque (escargot ou moule)

IV. Etude des Arthropodes • Diversité du groupe – Reconnaissance: scorpions- myriapodes- araignées et tiques- insectes

à intérêt en agronomie ou autre • Etude du criquet et de quelques larves d’insectes •

V. Etude des Vertébrés I: Poissons – Amphibiens et Reptiles • Classification: poissons cartilagineux et poissons osseux • Classification, diversité et reconnaissance des Amphibiens: grenouilles - crapauds et têtards • Classification et reconnaissance des Reptiles: tortues- lézards- couleuvres et vipères

VI. Etude des Vertébrés II: Oiseaux et Mammifères • Classification, diversité et reconnaissance de quelques espèces d’oiseaux • Classification, diversité et reconnaissance de quelques espèces de Mammifères

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 11

Annexe 1

Unité d’Enseignement DIVERSITE DU VIVANT

Code UE :……………

ECUE n° 2 BIOLOGIE VEGETALE

Code ECUE :…………… COURS 21H I. Introduction: Importance du règne végétal dans la biosphère II. Les Grandes lignes de la classification et de diversité du règne végétal

D. Les thallophytes (Algues- Champignons- Lichens). E. Les Cormophytes

1. Bryophytes (Mousses) 2. Ptéridophytes 3. Spermaphytes

i. Gymnospermes (Ex. Pin) ii. Angiospermes (mono- et Dicotylédones)

III. Etude des Angiospermes

A. Les caractéristiques propres à la cellule végétale B. Les Tissus végétaux, notamment les méristèmes primaires et secondaires C. L’appareil végétatif (tige- feuille- racine) et adaptations fonctionnelles D. La multiplication végétative E. L’appareil reproducteur et biologie de la reproduction sexuée

TRAVAUX DIRIGES & PRATIQUES (Intégrés)

I. Cellule végétale et tissus végétaux II. Appareil végétatif (morphologie) III. Appareil végétatif (anatomie) IV. Fleur et inflorescence: biologie florale V. Fruits et graines VI. Multiplication végétative naturelle et artificielle

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 12

Fiche descriptive d’une unité d’enseignement (EU)

et des éléments constitutifs d’une unité d’enseignement (ECUE)

Intitulé de l’UE

CHIMIE

Nombre de crédits………6…… Code UE………………………….

Université :………………………………………………. Etablissement :…………………………………………..

Domaine de la formation : Sciences et Technologie

Mention Biologie Analytique et Expérimentale et autres mentions des Sciences du vivant

Diplôme et Parcours LA Biologie Analytique et Expérimentale Parcours : Tous les parcours de la mention LF……………………………………………………Parcours :

Semestre S1

4- Objectifs de l’UE (savoirs, aptitudes et compétences)

Chimie générale : Connaître la structure des atomes, des liaisons chimiques ainsi que la thermodynamique chimique afin de comprendre la stabilité et les transformations des produits. Chimie organique : connaître les principales fonctions chimiques ainsi que leurs caractéristiques.

5- Pré-requis (définir les UE et les compétences indispensables pour suivre l’UE concernée) 6-

Niveau du Baccalauréat en sciences expérimentales ou équivalent. 3-Eléments constitutifs de l’UE (ECUE) 3.1- Enseignements

Volume horaire Eléments constitutifs Cours TD TP Crédits

1- Chimie générale

1h30

0H30

0H45

3

2- Chimie organique

1h30

0H30

0H45

3

Total 3H 1H 1H30 6 3.2- Activités pratiques (Projets, stages, mémoires….)

Durée Activités pratiques de l’UE Travaux au

laboratoire Projets Stages Autres (terrain)

Crédits

Total 4- Contenu (descriptifs et plans des cours)

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 13

4.1- Enseignements (Présenter une description succincte des programmes de chaque ECUE et joindre le programme détaillé à la fiche descriptive de l’UE)

1- Chimie générale : Atomistique et liaison chimique, thermodynamique chimique et cinétique chimique 2- Chimie organique : Analyse élémentaire de composés organiques, propriétés chimiques des hydrocarbures, Propriétés des alcools, les amines, les dérivés carbonylés, les acides et leurs dérivés 4.2- Activités pratiques de l’UE (Présenter une description succincte des objets, des contenus et des procédures d’organisation de chaque activité)

1-Chimie générale: Dosages volumétriques (méthodes de calcul, Préparation de solution titrée, Acidimétrie, Manganimétrie, Iodométrie, Argentimétrie 2-Chimie organique : Extraction de produits organiques, Synthèse d’acide salicylique, Identification par chromatographie. 5 – Méthodes pédagogiques et moyens didactiques spécifiques à l’UE (méthodes et outils pédagogiques, ouvrages de référence, recours aux TIC- possibilités d’enseignement à distance) 6-Examens et évaluation des connaissances 6.1- Méthode d’évaluation et régime d’examens (Préciser le régime d’évaluation préconisé : contrôle continu uniquement ou régime mixte : contrôle continu et examens finaux) Régime mixte : Contrôle continu et Examen final de l’UE (Epreuve commune entre ECUE ou Epreuves séparées) 6.2- Validation de l’UE (Préciser les poids des épreuves d’examens pour le calcul de la moyenne de l’ECUE, les coefficients des ECUE et le coefficient de l’UE au sein du parcours).

Contrôle continu (30%) Examen final (70%) EPREUVES EPREUVES ECUE

Ecrit TP Autres

Pondéra -tion Ecrit Oral TP et

Autres

Pondéra -tion

Coef. de l’ECUE

Coef. de l’UE au sein du

parcours 1-Chimie générale

5% 5% 5% 50% 25% 10% 50% 3

2- Chimie organique

5% 5% 5% 50% 25% 10% 50% 3 6

TOTAL 10% 10% 10% 50 20 6 6 6.3- Validation des stages et des projets.... …………………………………………………………………………………………………………..

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 14

Annexe 1

Unité d’Enseignement CHIMIE 1

Code UE :……………

ECUE n° 1 CHIMIE GENERALE

Code ECUE :…………… COURS 21 H

I. Atomistique et liaison chimique - Structure des atomes - Classification périodique des éléments - Liaison chimique - Théorie L.C.A.O. - Hybridation sp3, sp2, sp de l’atome de carbone II. Thermodynamique chimique - Système - Variable et fonction d’état - Transfert - Réactions réversibles ou irréversibles - Le premier principe : Transfert de travail et transfert de chaleur - Condition d’équilibre - Le deuxième principe : énoncé, expression et fonction thermodynamique - Loi d’action de masse, constante d’équilibre - Calcul du PH des solutions aqueuses - Etude expérimentale des vitesses de réaction : Réaction d’ordre 1et 2 III. Cinétique chimique - Effet de la température sur la vitesse de réaction - Formule d’ARRHENIUS - Notion de catalyseur

TRAVAUX DIRIGES & PRATIQUES Objectifs : Maîtriser et connaître différents dosages avec des applications concrètes sur les dosages volumétriques 1. Méthode de calcul 2. Préparation de solutions titrées Acide/base, permanganate de potassium, iode, nitrate d’argent 3. Acidimétrie Dosage des sulfites, de l’acidité du vin ou des jus, de l’acidité de la matière grasse 4. Manganimétrie Dosage direct de l’acide oxalique et dosage indirect des sucres réducteurs 5. Iodométrie Degré colorimétrique de l’eau de Javel et Indice d’Iode de la matière grasse 6. Argentimétrie Méthode de Mohr

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 15

Annexe 1

Unité d’Enseignement CHIMIE 1

Code UE :……………

ECUE n° 2 CHIMIE ORGANIQUE

Code ECUE :…………… COURS 21 H

I. Analyse élémentaire d’un composé organique - Formule brute - Formule composée

II. Représentation spatiale d’un carbone saturé

- Représentation de CRAM - Projection de FISHER et de NEWMAN

III. Propriétés chimiques des Hydrocarbures - Alcanes - Alcènes - Alcynes

IV. Propriétés des alcools V. Les amines

VI. Les dérivés carbonylés

- Aldéhydes - Cétones

VII. Les acides et leurs dérivés

TRAVAUX DIRIGES & PRATIQUES

Extraction de produits organiques : Liquide/Liquide Synthèse d’acide salicylique Identification par chromatographie en couche mince

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 16

Fiche descriptive d’une unité d’enseignement (EU)

et des éléments constitutifs d’une unité d’enseignement (ECUE)

Intitulé de l’UE

BIOLOGIE CELLULAIRE ET GENETIQUE

Nombre de crédits………6…… Code UE………………………….

Université :………………………………………………. Etablissement :…………………………………………..

Domaine de la formation : Sciences et Technologie

Mention Biologie Analytique et Expérimentale et autres mentions des Sciences du vivant

Diplôme et Parcours LA Biologie Analytique et Expérimentale Parcours : Tous les parcours de la mention LF……………………………………………………Parcours :

Semestre S1

1- Objectifs de l’UE (savoirs, aptitudes et compétences)

Permettre à l’étudiant d’acquérir une formation de base sur la structure des cellules vivantes, les divisions cellulaires (méïose et mitose), l’analyse de la transmission des gènes chez les Procaryotes et les Eucaryotes.

2- Pré-requis (définir les UE et les compétences indispensables pour suivre l’UE concernée)

Niveau du Baccalauréat en sciences expérimentales ou équivalent. 3-Eléments constitutifs de l’UE (ECUE) 3.1- Enseignements

Volume horaire Eléments constitutifs Cours TD TP Crédits

1- Biologie cellulaire

1h30

0h30

0H45

3

2- Génétique

1h30

0h45

0H30

3

Total 3H 1h15 1h15 6 3.2- Activités pratiques (Projets, satges, mémoires….)

Durée Activités pratiques de l’UE Travaux au

laboratoire Projets Stages Autres Crédits

4- Contenu (descriptifs et plans des cours)

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 17

4.1- Enseignements (Présenter une description succincte des programmes de chaque ECUE et joindre le programme détaillé à la fiche descriptive de l’UE)

1- Biologie cellulaire : Introduction, membrane plasmique, cytosol, organites, noyau et divisions cellulaires 2- Génétique : Introduction, génétique des procaryotes, génétique des eucaryotes, complémentation fonctionnelle, génétique extrachromosomique. 4.2- Activités pratiques de l’UE (Présenter une description succincte des objets, des contenus et des procédures d’organisation de chaque activité)

1- Biologie cellulaire : Techniques d’étude de la cellule,observation des cellules et des organites, mitose, méïose 2-Génétique : Transformation bactérienne, croisements chez les champignons, croisements chez la Drosophile. 5 – Méthodes pédagogiques et moyens didactiques spécifiques à l’UE (méthodes et outils pédagogiques, ouvrages de référence, recours aux TIC- possibilités d’enseignement à distance) Utilisation de préparation microscopiques Présentation de documents audiovisuels en cours et en TP Ouvrages de référence : - La Cellule de PRESCOTT - Introduction à l’analyse génétique de GRIFFITHS et Collaborateurs de BOECK 6-Examens et évaluation des connaissances 6.1- Méthode d’évaluation et régime d’examens (Préciser le régime d’évaluation préconisé : contrôle continu uniquement ou régime mixte : contrôle continu et examens finaux)

Régime mixte : Contrôle continu et Examen final de l’UE (Epreuve commune entre ECUE ou Epreuves séparées) 6.2- Validation de l’UE (Préciser les poids des épreuves d’examens pour le calcul de la moyenne de l’ECUE, les coefficients des ECUE et le coefficient de l’UE au sein du parcours).

Contrôle continu (30%) Examen final (70%) EPREUVES EPREUVES ECUE

Ecrit TP Autre Pondéra

-tion Ecrit Oral TP et Autres

Pondéra -tion

Coef. de l’ECUE

Coef. de l’UE au sein du

parcours 1-Biologie Cellulaire 5% 5% 5% 50% 25% 10% 50% 3 2-Génétique 5% 5% 5% 50% 25% 10% 50% 3

6

Total 10% 10% 10% 50% 20% 6 6

6.3- Validation des stages et des projets.... ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 18

Annexe 1

Unité d’Enseignement BIOLOGIE CELLULAIRE & GENETIQUE

Code UE :……………

ECUE n° 1 BIOLOGIE CELLULAIRE

Code ECUE :……………

COURS 21H I. Introduction A. Propriétés communes à toutes les cellules vivantes B. Structure cellulaire et structure acellulaires (Virus) C. Cellule Procaryotes et cellules Eucaryotes D. Diversité des cellules eucaryotes: cellule végétale- cellule animale- cellules des champignons II. Etude de la membrane plasmique

F. Structure et organisation moléculaire G. Rôle physiologique de la membrane B1. Transport de substances B2. Transfert de l’information H. Différenciation morpho-fonctionnelle de la Membrane

III. Le Cytosol IV. Les organites

A. Ribosomes B. Réticulum endoplasmique C. Appareil de Golgi D. Lysosomes E. Mitochondries F. Peroxysomes et glyoxysomes G. Chloroplastes H. Cytosquelette I. Noyau

V. Division Cellulaire A. Mitose B. Méiose TRAVAUX PRATIQUES ET TRAVAUX DIRIGES

I. Techniques d’étude de la cellule Avec exercices d’application et observation et étude de cellules II Etude et observation des organites II. Mitose III. Méiose

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 19

Annexe 1

Unité d’Enseignement BIOLOGIE CELLULAIRE & GENETIQUE

Code UE :……………

ECUE n° 2 GENETIQUE

Code ECUE :……………

COURS 21H I. Introduction à la Génétique A. Rappels de la Mitose et de la Méiose B. Notions de caractères – gènes – allèles - mutations II. Analyse génétique des Procaryotes III. Analyse génétique des Eucaryotes

I. Cas des Haploïdes J. Cas des Diploïdes On traitera la transmission des caractères contrôlés par: 1. un couple d’allèles 2. deux ou plusieurs couples d’allèles.

III. Notions préliminaires de génétiques extra-chromosomique TRAVAUX DIRIGES & TRAVAUX PRATIQUES

1. Transformation bactérienne 2. Réalisation et étude des croisements chez les champignons 3. Analyse et croisements chez la drosophile Des séries d’exercices seront proposées parallèlement aux étudiants comme complément du cours.

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 20

Fiche descriptive d’une unité d’enseignement (EU) et des éléments constitutifs d’une unité d’enseignement (ECUE)

Intitulé de l’UE

MATHEMATIQUES ET PHYSIQUE

Nombre de crédits………6…… Code UE………………………….

Université :………………………………………………. Etablissement :…………………… ……

Domaine de la formation : Sciences et Technologie

Mention Biologie Analytique et Expérimentale et autres mentions des Sciences du vivant

Diplôme et Parcours LA Biologie Analytique et Expérimentale Parcours : Tous les parcours de la mention LF……………………………………………………Parcours :

Semestre S1

3- Objectifs de l’UE (savoirs, aptitudes et compétences)

Mathématiques appliquées : Permettre à l’étudiant en biologie d’acquérir l’essentiel des outils et des techniques mathématiques et statistiques pour savoir traduire et modéliser certains problèmes issus de la Biologie Physique 1 : Permettre à l’étudiant en biologie de comprendre les phénomènes physiques liés au vivant et les principes physiques de fonctionnement des équipements utilisés dans l’observation et l’étude des cellules, des molécules et des organismes

4- Pré-requis (définir les UE et les compétences indispensables pour suivre l’UE concernée)

Niveau du Baccalauréat en sciences expérimentales ou équivalent. 3-Eléments constitutifs de l’UE (ECUE) 3.1- Enseignements

Volume horaire Eléments constitutifs Cours TD TP Crédits

1- Mathématiques appliquées 1H30 1H 3

2-Physique 1 1H30 0H45 0H45 3 Total 3H 1H45 0H45 6

3.2- Activités pratiques (Projets, satges, mémoires….)

Durée Activités pratiques de l’UE Travaux au

laboratoire Projets Stages Autres Crédits

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 21

4- Contenu (descriptifs et plans des cours) 4.1- Enseignements (Présenter une description succincte des programmes de chaque ECUE et joindre le programme détaillé à la fiche descriptive de l’UE)

1- Mathématiques appliquées : Fonction numériques d’une variable réelle, Equations différentielles, Fonctions à plusieurs variables, Calcul matriciel et système d’équations linéaires, Probabilités élémentaires, Statistique. 2- Physique 1 : Mécanique, Electricité et électronique, Optique géométrique, mécanique des fluides. 4.2- Activités pratiques de l’UE (Présenter une description succincte des objets, des contenus et des procédures d’organisation de chaque activité)

Mathématiques appliqués : Pour les applications, l’accent sera mis sur des exemples simples relevés en biologie Physique 1 : 5 – Méthodes pédagogiques et moyens didactiques spécifiques à l’UE (méthodes et outils pédagogiques, ouvrages de référence, recours aux TIC- possibilités d’enseignement à distance) 6-Examens et évaluation des connaissances 6.1- Méthode d’évaluation et régime d’examens (Préciser le régime d’évaluation préconisé : contrôle continu uniquement ou régime mixte : contrôle continu et examens finaux)

Régime mixte : Contrôle continu et Examens finaux de l’UE 6.2- Validation de l’UE (Préciser les poids des épreuves d’examens pour le calcul de la moyenne de l’ECUE, les coefficients des ECUE et le coefficient de l’UE au sein du parcours).

Contrôle continu (30%) Examen final (70%) EPREUVES EPREUVES ECUE

Ecrit TP Autre Pondéra

-tion Ecrit Oral TP et Autres

Pondéra -tion

Coef. de l’ECUE

Coef. de l’UE au sein du

parcours 1-Maths appliquées 10% 5% 50% 25% 10% 50% 3 2-Physique 1 5% 5% 5% 50% 25% 10% 50% 3

6

Total 15% 5% 10% 50% 20%1 6 6

6.3- Validation des stages et des projets.... ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 22

Annexe 1

Unité d’Enseignement MATHEMATIQUES & PHYSIQUE

Code UE :……………

ECUE n° 1 MATHEMATIQUES APPLIQUEES

Code ECUE :……………

COURS 21H Recommandations : L’accent sera mis sur les concepts de base sans trop s’attarder sur les démonstrations Fonctions numériques d’une variable réelle - Rappels : domaine de définition, opérations sur les fonctions (fonctions puissances, polynomiales, rationnelles, trigonométriques, exponentielle et logarithme) - Dérivabilité. Formule de Taylor (à l’ordre 2 ou 3), développements, limites, calculs approchés, exemples et applications - Représentations graphiques - Primitives et intégrales : définitions, méthodes de calculs (changement de variables et intégration par parties) Equations différentielles - Définitions et exemples - Equations différentielles linéaires du premier ordre. Méthodes de résolution. Applications - Equation différentielles linéaires du second ordre à coefficients constants. Méthodes de résolution. Applications Fonctions à plusieurs variables - Définitions et exemples (on se limitera à 2 variables) - Dérivées partielles, recherche d’extremum d’une fonction, gradient et applications. Calcul matriciel et systèmes d’équations linéaires - Définition d’une matrice, opération sur les matrices, inversion d’une matrice carrée - Applications : résolution de systèmes linéaires Probabilités élémentaires - Introduction à l’analyse combinatoire - Espaces de probabilités : illustration par des exemples simples - Probabilités conditionnelles et évènements indépendants - Variables aléatoires discrètes et lois de probabilités usuelles Statistique - Echantillonnage statistique. Représentation de données : séries statistiques, tableaux statistiques - Estimation : définition et propriétés d’un estimateur, estimation ponctuelle et par intervalle - Tests de signification : procédure générale, niveau de signification d’un test, test de comparaison - Test d’adéquation du Khi-deux.

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 23

Annexe 1

Unité d’Enseignement MATHEMATIQUES & PHYSIQUE

Code UE :……………

ECUE n° 2 PHYSIQUE 1

Code ECUE :……………

COURS 21H Mécanique - Cinématique du point : référentiels, trajectoire, vitesse, accélération, relativité du mouvement - Dynamique : notions de forces, principes de la dynamique, travail et énergie, lois de conservation, chocs, oscillateur harmonique. Electricité et électronique - Loi de Coulomb, champ potentiel électrostatique - Moment dipolaire - Action d’un champ extérieur - Eléments de magnétostatique - Notions sur les fonctions de l’électronique Optique géométrique - Lois de Snell-Descartes, systèmes plans, systèmes sphériques - Lentilles, applications : l’œil, la loupe, le microscope Mécanique des fluides - Hydrostatique : pression, statique des fluides, théorème d’Archimède, tension superficielle - Hydrodynamique : différents types d’écoulement, théorème de Bernouilli et applications - Viscosité d’un fluide - Phénomène de diffusion, loi de Fick. TRAVAUX PRATIQUES ET DIRIGES 21H

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 24

Fiche descriptive d’une unité d’enseignement (EU)

et des éléments constitutifs d’une unité d’enseignement (ECUE)

Intitulé de l’UE

Microbiologie et Biologie Moléculaire

Nombre de crédits…6………… Code UE………………………….

Université :………………………………………………. Etablissement :…………………………………………..

Domaine de la formation : Sciences et Technologie

Mention :… Biologie Analytique et Expérimentale et autres mentions des Sciences du vivant

Diplôme et Parcours LA Biologie Analytique et Expérimentale Parcours : Tous les parcours de la mention LF……………………………………………………Parcours :

Semestre S2

1- Objectifs de l’UE (savoirs, aptitudes et compétences) Aborder les grands mécanismes moléculaires nécessaires pour la compréhension du fonctionnement des organismes vivants, en donnant une importance aux approches expérimentales : structure et synthèse des macromolécules informationnelles et régulation de l’expression des gènes. Faire découvrir aux étudiants la diversité du monde des microorganismes et les méthodologies d’étude ainsi que l’importance de ces organismes dans différents secteurs. 2- Pré-requis (définir les UE et les compétences indispensables pour suivre l’UE concernée) Biologie cellulaire et Génétique, Biochimie structurale. 3-Eléments constitutifs de l’UE (ECUE) 3.1- Enseignements

Volume horaire Eléments constitutifs Cours TD TP Crédits

1- Microbioloie 1H30 1H15 3 2- Biologie Moléculaire 1H30 0H45 0H30 3

Total 3H 0H45 1H45 6 3.2- Activités pratiques (Projets, stages, mémoires….)

Durée Activités pratiques de l’UE Travaux sur

terrain Projets Stages Autres Crédits

Total 4- Contenu (descriptifs et plans des cours)

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 25

4.1- Enseignements (Présenter une description succincte des programmes de chaque ECUE et joindre le programme détaillé à la fiche descriptive de l’UE) 1- Stabilité et variabilité de l’information génétique, son organisation et son fonctionnement……… …………………………………………………………………………………………………………2- Cellule bactérienne, techniques d’étude des bactéries, croissance bactérienne, identification et systématique bactérienne. Les virus, structure, cycle et interaction avec la cellule. 4.2- Activités pratiques de l’UE (Présenter une description succincte des objets, des contenus et des procédures d’organisation de chaque activité) Selon les disponibilités des institutions, des séances de travaux pratiques seront réalisées si possible de façon intégrée entre les deux ECUE, pour illustrer les enseignements théoriques. Au cours d’une même séance, on peut à la fois présenter les propriétés de l’information génétique d’une bactérie ou d’un virus tout en la purifiant, en analysant sa structure, son mode de transmission, sa stabilité et sa variabilité. Par ailleurs, la croissance bactérienne et le titrage de bactériophages seront réalisés par la même occasion. 5 – Méthodes pédagogiques et moyens didactiques spécifiques à l’UE (méthodes et outils pédagogiques, ouvrages de référence, recours aux TIC- possibilités d’enseignement à distance) ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… 6-Examens et évaluation des connaissances 6.1- Méthode d’évaluation et régime d’examens (Préciser le régime d’évaluation préconisé : contrôle continu uniquement ou régime mixte : contrôle continu et examens finaux) ……………Mixte…………………………………………………………………………………… ……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… 6.2- Validation de l’UE (Préciser les poids des épreuves d’examens pour le calcul de la moyenne

Contrôle continu (30%) Examen final (70%) EPREUVES EPREUVES ECUE

Ecrit TP Autre

Pondéra

-tion Ecrit Oral TP et Autres

Pondéra -tion

Coef. de l’ECUE

Coef. de l’UE au sein du

parcours 1- Microbioloie 5% 5% 5% 50% 25% 10% 50% 3 2- Biologie Moléculaire 5% 5% 5% 50% 25% 10% 50% 3 6

Total 10% 10% 10% 50% 20% 6 6 6.3- Validation des stages et des projets.... …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 26

Annexe 1 Unité d’Enseignement BIOLOGIE MOLECULAIRE ET MICROBIOLOGIE

Code UE :…………… ECUE n° 1 BIOLOGIE MOLECULAIRE

Code ECUE :……………

Cours 21 H

Introduction - Notion de stabilité et de variabilité

- Rappel sur la structure des molécules porteuses de l’information génétique Chapitre I Organisation de l’information génétique

- SectionI…. Information génétique chez les Virus - Section II…Information génétique chez les Procaryotes - Section III...Information génétique chez les Eucaryotes

Chapitre II Fonctionnement de l’information génétique

- Section I. …. Réplication et réparation de l’ADN chez les Procaryotes - Section II …. Transcription - Section III ….Traduction - Section IV…..Régulation de l’expression des gènes

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 27

Annexe 1 Unité d’Enseignement BIOLOGIE MOLECULAIRE ET MICROBIOLOGIE

Code UE :…………… ECUE n° 2 MICROBIOLOGIE

Code ECUE :……………

Cours 21 H

Introduction

Historique Présentation des différents groupes de microorganismes Importance et rôle des microorganismes Chapitre I : La cellule bactérienne Section I : Morphologie bactérienne Sections II : Constituants communs et spécifiques Chapitre II : Techniques d’étude des bactéries Section I : Milieux de culture, confinement et stérilisation Section II : Pasteurisation et tyndallisation Chapitre III : Etude de la croissance bactérienne Section I : Paramètres (taux de croissance et temps de génération) Section II : Facteurs de croissance (Température, pH et substrat) Section III : Techniques d’étude de la croissance bactérienne Chapitre IV : Notion de systématique bactérienne Section I : Identification des bactéries Section II : Classification des bactéries Chapitre V : Les virus Section I : Définition Section II : Composition et structure Section III : Classification Section IV : Interaction virus cellule et cycle viral Section V : Exemples de virus Enseignements pratiques Objectifs spécifiques des TP: Selon les disponibilités des institutions, des séances de travaux pratiques seront réalisées si possible de façon intégrée entre les deux ECUE, pour illustrer les enseignements théoriques. Au cours d’une même séance, on peut à la fois présenter les propriétés de l’information génétique d’une bactérie ou d’un virus tout en la purifiant, en analysant sa structure, son mode de transmission, sa stabilité et sa variabilité. Par ailleurs, la croissance bactérienne et le titrage de bactériophages seront réalisés par la même occasion.

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 28

Fiche descriptive d’une unité d’enseignement (EU)

et des éléments constitutifs d’une unité d’enseignement (ECUE)

Intitulé de l’UE

Biochimie structurale et Techniques d’Analyses Physicochimiques

Nombre de crédits…6………… Code UE………………………….

Université :…………………………… Etablissement :…………………………..

Domaine de la formation : Sciences et Technologie

Mention :… Biologie Analytique et Expérimentale et autres mentions des Sciences du vivant

Diplôme et Parcours LA Biologie Analytique et Expérimentale Parcours : Tous les parcours de la mention LF……………………………………………………Parcours :

Semestre S2

1- Objectifs de l’UE (savoirs, aptitudes et compétences)

Permettre aux étudiants d’acquérir les formations de base sur les structures des biomolécules ; leurs propriétés physicochimiques ainsi que des techniques de caractérisation et d’analyse 2- Pré-requis (définir les UE et les compétences indispensables pour suivre l’UE concernée)

Chimie ; physique et Biologie cellulaire 3-Eléments constitutifs de l’UE (ECUE) 3.1- Enseignements

Volume horaire Eléments constitutifs Cours TD TP Crédits

1- Biochimie structurale 1H30 0H30 1H 3 2- Techniques d’analyse 1H 0H30 1H 3

Total 2H30 1H 2H 6 3.2- Activités pratiques (Projets, stages, mémoires….)

Durée Activités pratiques de l’UE Travaux sur

terrain Projets Stages Autres Crédits

Total 4- Contenu (descriptifs et plans des cours)

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 29

4.1- Enseignements (Présenter une description succincte des programmes de chaque ECUE et joindre le programme détaillé à la fiche descriptive de l’UE) 1- Propriétés et étude structurale des glucides, des lipides, des protéines et des acides nucléiques. 2- Méthodes d’extraction, de séparation, d’identification et de dosage des molécules biologiques : méthodes spectroscopiques, chromatographiques, électrophorétiques et radioisotopiques. 4.2- Activités pratiques de l’UE (Présenter une description succincte des objets, des contenus et des procédures d’organisation de chaque activité) Selon les disponibilités des institutions, des séances de travaux pratiques seront réalisées si possible de façon intégrée entre les deux ECUE, pour illustrer les enseignements théoriques. A l’occasion d’une même séance, on peut à la fois présenter les propriétés d’une molécule, la purifier, la doser et analyser sa structure, tout en effectuant un choix pertinent entre les différentes méthodes présentées ci-dessus. 5 – Méthodes pédagogiques et moyens didactiques spécifiques à l’UE (méthodes et outils pédagogiques, ouvrages de référence, recours aux TIC- possibilités d’enseignement à distance) A préciser par les institutions………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… 6-Examens et évaluation des connaissances 6.1- Méthode d’évaluation et régime d’examens (Préciser le régime d’évaluation préconisé : contrôle continu uniquement ou régime mixte : contrôle continu et examens finaux) ……………Mixte……………………………………………………………………………………. ……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… 6.2- Validation de l’UE (Préciser les poids des épreuves d’examens pour le calcul de la moyenne

Contrôle continu (30%) Examen final (70%) EPREUVES EPREUVES ECUE

Ecrit TP Autre Pondéra

-tion Ecrit Oral TP et Autres

Pondéra -tion

Coef. de l’ECUE

Coef. de l’UE au sein du

parcours 1-Biochimie structurale 5% 5% 5% 50% 25% 10% 50% 3 2- Techniques d’analyses 5% 5% 5% 50% 25% 10% 50% 3

6

TOTAL 10% 10%

10%

50% 20% 6 6

6.3- Validation des stages et des projets.... …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………

Page 30: REFORME LMD BIOLOGIE - mesrst.tn · Biologie cellulaire 1H30 0H30 0H45 3 3 X 4 Biologie cellulaire Génétique UF ... Cours TD TP Crédits 1- Biologie végétale 1h30 0H 1H15 3 2-

LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 30

Annexe 1 Unité d’Enseignement BIOCHIMIE STRUCTURALE

ET TECHNIQUES D’ANALYSES PHYSICOCHIMIQUES Code UE :……………

ECUE n° 1 BIOCHIMIE STRUCTURALE Code ECUE :……………

Objectifs : Renforcer les connaissances de Base des étudiants sur les structures des molécules biologiques ainsi que sur leurs principales caractéristiques. Cours 21 H

I- Introduction générale

II- Les glucides - Structure, composition et classification - Propriétés physicochimiques - Identification, dosage et utilisation III- Les lipides - Structure, composition et classification - Propriétés physicochimiques - Identification, dosage et utilisation IV- Les acides aminés et les protéines - Les acides aminés * Structure, composition et classification * Propriétés physicochimiques *Identification, dosage et utilisation - Les protéines

* Structures, composition et fonction * Propriétés physicochimiques * Méthodes d’analyse

V- Les nucléotides et acides nucléiques - Structure des nucléotides - Structure des acides nucléiques - Propriétés physicochimiques des nucléotides et des acides nucléiques - Identification et dosage des nucléotides et des acides nucléiques.

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 31

Unité d’Enseignement BIOCHIMIE STRUCTURALE ET TECHNIQUES D’ANALYSES PHYSICOCHIMIQUES

Code UE :…………… ECUE n° 2 TECHNIQUES D’ANALYSES PHYSICOCHIMIQUES DES

BIOMOLECULES Code ECUE :……………

Objectifs : Concrétiser les connaissances théoriques de base des étudiants dans le domaine de la Biochimie en leur présentant les techniques d’extraction, de séparation, d’identification et de dosage des molécules biologiques. Cours 14H

I- Méthodes d’extraction, de préparation et de fractionnement - Prélèvement - Conservation (congélation et lyophilisation) - Précipitation, dialyse et filtration - Centrifugation et ultracentrifugation II- Méthodes spectroscopiques - Spectre de lumière (UV, visible, IR) - Colorimétrie et spectrophotométrie - Principe de la fluorimétrie III- Méthodes chromatographiques - Principe de la chromatographie - Les différents types de chromatographie IV- Méthodes électrophorétiques - Principe de l’électrophorèse - Les différents types d’électrophorèse - Les différentes méthodes de révélation V- Méthodes isotopiques - Principe de l’utilisation des radio-isotopes - Utilisation et mesure de la radioactivité - Radio-protection.

Enseignements pratiques Objectifs spécifiques des TP: Selon les disponibilités des institutions, des séances de travaux pratiques seront réalisées si possible de façon intégrée entre les deux ECUE, pour illustrer les enseignements théoriques. A l’occasion d’une même séance, on peut à la fois présenter les propriétés d’une molécule, la purifier, la doser et analyser sa structure, tout en effectuant un choix pertinent entre les différentes méthodes présentées ci-dessus.

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 32

LA BAE - PROGRAMME L2

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 33

PLAN DE FORMATION Licence Appliquée en Biologie Analytique et Expérimentale

Universités : Tunis El Manar,

Etablissements : Faculté des Sciences de Tunis,

Licence Appliquée Biologie Analytique et Expérimentale

Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biologie Analytique et Expérimentale

Semestre 3 Volume horaire semestriel

(14 semaines) Crédits Coefficients Régime d'examen N° Unité

d'enseignement

Nature de

l'UE Elément constitutif

d'UE (ECUE) Cours TD TP Cours

Intégré ECUE UE ECUE UE Contrôle continu

Régime mixte

Anglais 2H 2 2 x Tic et multimédia 2H 2 2 x 1 Unité Transversale UT Culture de l'Entreprise 1H30 2

6

2

6

x

Physiologie et Expérimentation animales

1H30 0H30 0H45 3 3 X

2 Physiologie et expérimentation UF

Physiologie et Expérimentation végétales

1H30 0H30 0H45 3

6

3

6

X

Métabolisme 1H30 0H30 0H45 3 3 X 3 Métabolisme / Enzymologie UF

Enzymologie 1H30 0H30 0H45 3 6

3 6

X Analyses génétiques 1H30 0H30 0H45 3 3 X

4

Analyses génétiques / Technologies

immunologiques et cellulaires

UF Technologies immunologiques et cellulaires

1H30 0H30 0H45 3 6

3 6

X

UO 1 3 X 5 OPTIONNELLE UO UO 2

6 3

6 X

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 34

Licence Appliquée en Biologie Analytique et Expérimentale

Universités : Tunis El Manar

Etablissements : Faculté des Sciences de Tunis

Licence Appliquée Biologie Analytique et Expérimentale

Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biologie Analytique et Expérimentale

Semestre 4 Volume horaire semestriel

(14 semaines) Crédits Coefficients Régime d'examen N

Unité d'enseignement Nature

de l'UE Elément constitutif

d'UE (ECUE) Cours TD TP Cours

Intégré ECUE UE ECUE UE Contrôle continu

Régime mixte

Anglais 2H 2 2 x Culture de l’Entreprise (Gestion de l'Entreprise)

1H30 2 2 x 1 Unité Transversale UT

Bioéthique / biosécurité 2H 2

6

2

6

x

Analyses microbiologiques 1H30 0H30 0H45 3 3 X

2 Analyses microbiologiques / Toxicologie

UF

Toxicologie 1H30 0H30 0H45 3 6

3 6

X Analyses physicochimiques des biomolécules

1H30 0H30 0H45 3 3 X 3

Analyses physicochimiques des biomolécules / Biostatistique et Bioinformatique

UF Biostatistique et Bioinformatique 1H30 1H15 3

6

3

6

X

Instrumentation et métrologie 1H30 0H30 0H45 3 3 X

4

Instrumentation et métrologie / Management de la qualité

UF Management de la qualité 1H30 0H30 0H45 3

6 3

6 X

UO 1 3 X 5 OPTIONNELLE 4 UO UO 2 6

3 6

X

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 35

CONTENU DES PROGRAMMES

Fiche descriptive d’une unité d’enseignement (EU) et des éléments constitutifs d’une unité d’enseignement (ECUE)

Intitulé de l’UE Analyses génétiques / Technologies Immunologiques et cellulaires

Nombre de crédits…6…… Code UE…………………..

Université :………………………………………………. Etablissement :………………………………………..

Domaine de la formation : Sciences et Technologies Mention : Biologie Analytique et Expérimentale

Diplôme et Parcours LA : Appliquée Parcours : tous les parcours de la mention LF Parcours :

Semestre … L2 S3 ……

1- Objectifs de l’UE (savoirs, aptitudes et compétences) 1- Analyses génétiques : Permettre à l’étudiant de maitriser les méthodes et les technologies d’analyses génétiques en relation avec ses connaissances sur le génome et les approches théoriques et pratiques en génétique moléculaire et des populations. 2- Les technologies immunologiques et cellulaires sont utilisées dans un but de diagnostic d’analyse, de production, de prévention et de traitement. Elles sont enseignées en relation avec les connaissances immunologiques et hématologiques fondamentales que l’étudiant devra maîtriser. L’utilisation des propriétés des réponses immunes, des anticorps, des cellules immunitaires et des techniques immunologiques dans divers domaines de recherche, de contrôle, d’analyse biomédicale et de production doit apparaître à travers les exemples et les applications. 2- Pré-requis (définir les UE et les compétences indispensables pour suivre l’UE concernée) Biologie cellulaire, biologie moléculaire, microbiologie, génétique, biochimie et techniques d’analyses biochimiques. 3-Eléments constitutifs de l’UE (ECUE) 3.1- Enseignements

Volume horaire Eléments constitutifs Cours TD TP Crédits

1- Analyses génétiques 1h30 0h30 0h45 3

2-Technologies Immuno-logiques et cellulaires

1h30 0h30 0h45 3

Total 3H00 1H 1H30 6 3.2- Activités pratiques (Projets, stages, mémoires….)

Durée Activités pratiques de l’UE Travaux au

laboratoire Projets Stages Autres Crédits

Total

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4- Contenu (descriptifs et plans des cours) 4.1- Enseignements (Présenter une description succincte des programmes de chaque ECUE et joindre le programme détaillé à la fiche descriptive de l’UE) 1- Analyses génétiques: Les différents types de mutations et le code génétique, effet des mutations sur l’expression génétique (structure et fonction des macromolécules affectées), les méthodes d’analyses cytologiques, caryologiques, moléculaires et quantitatives ; les domaines d’applications. 2-Technologies Immunologiques et cellulaires: Les fonctions du système immunitaire, les cellules et les organes de l’immunité, les réponses immunes, la réaction antigène anticorps, les techniques immunochimiques et cellulaires, les anticorps monoclonaux et recombinants, les applications en diagnostic, immunothérapie, thérapie cellulaire et recherche. 4.2- Activités pratiques de l’UE (Présenter une description succincte des objets, des contenus et des procédures d’organisation de chaque activité) 1- Analyses génétiques: Purification, séparation et identification des protéines et des acides nucléiques, PCR, RFLP, AFLP, RAPD, Southern, Northern blotting, Applications 2-Technologies Immunologiques et cellulaires: Purification d’Immunoglobulines et d’anticorps par chromatographie, ELISA, Immuno-empreinte, Immunohistochimie, Immunofluorescence, préparation d’anticorps monoclonaux, marquage, numération et séparation des cellules 5 – Méthodes pédagogiques et moyens didactiques spécifiques à l’UE (méthodes et outils pédagogiques, ouvrages de référence, recours aux TIC- possibilités d’enseignement à distance) - Présentation de documents audiovisuels et EXAO - Titres d’ouvrages les plus pertinents pour tout le programme à présenter au début de chaque UE. 6-Examens et évaluation des connaissances 6.1- Méthode d’évaluation et régime d’examens (Préciser le régime d’évaluation préconisé : contrôle continu uniquement ou régime mixte : contrôle continu et examens finaux) Régime mixte : Contrôle continu et examens finaux 6.2- Validation de l’UE (Préciser les poids des épreuves d’examens pour le calcul de la moyenne de l’ECUE, les coefficients des ECUE et le coefficient de l’UE au sein du parcours).

Contrôle continu Examen final EPREUVES EPREUVES ECUE

Ecrit Oral TP et

Autres

Pondéra -tion Ecrit Oral TP et

Autres

Pondéra -tion

Coef. de l’ECUE

Coef. de l’UE au sein du

parcours 1- Analyses génétiques 5% 5% 5% 50% 25% 10% 50% 3

2-Technologies Immuno-logiques et cellulaires

5% 5% 5% 50% 25% 10% 50% 3

TOTAL 10% 10% 10% 50% 20% 6

6

6.3- Validation des stages et des projets.... ………………………………………………………………………………………………………………

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 37

Annexe I Unité d’Enseignement : Analyses Génétiques / Technologies Immunologiques et

Cellulaires

Code UE :……………

ECUE 1 : Analyses Génétiques

Plan du Cours (21H)

Introduction (1H30)

- Stabilité et variabilité de l’hérédité. -

I : Les différents types de mutations (6H) - Mutations chromosomiques (polyploïdie, aneuploïdie, inversion, translocation) - Mutations de répétition (microsatellites et minisatellites) - Mutations ponctuelles (substitution, frameshift,…)

II : Méthodes d’analyse génétique (7H30) - Techniques cytologiques et caryologiques - Techniques biochimiques et cellulaires - Techniques des acides nucléiques (PCR, RFLP, RAPD, AFLP, ISSR, séquençage…) - Approches d’analyse des populations

III: Génotypage et empreinte génétique (6H) - Applications en agriculture (identification variétale, certification des semences et des races animales, détection des OGM) - Applications légales (empreinte génétique, test de paternité,…) - Applications médicales (diagnostic anténatal, conseil génétique,…)

TD/TP (18H)

Les TD/TP sont des applications sur le continu du cours

Code ECUE :……………

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 38

Annexe II Unité d’Enseignement : Analyses Génétiques / Technologies Immunologiques et

Cellulaires

Code UE :……………

ECUE 2 : Technologies Immunologiques et Cellulaires

Plan du Cours (21H) Introduction à l’immunologie (1H30)

- Notion d’antigène et structures de reconnaissance - Soi, Non soi, tolérance et auto-immunité - Rôles et propriétés du système immunitaire

Chapitre I : Les organes, les cellules et les molécules de l’immunité (4H30) - Les organes lymphoïdes : localisation, structure et fonction - Les différentes cellules immunitaires : morphologie, fonction, marqueurs de différentiation - Différentiation du système hématopoïétique et ontogénie de lymphocytes B et T - La circulation des cellules de l’immunité - les principales molécules : les anticorps, le complément, les cytokines

Chapitre II : L’immunité innée (1H30) - Les barrières naturelles - La réaction inflammatoire

Chapitre III : L’immunité adaptative (5H30) - Propriétés : notion de spécificité, diversité et mémoire, application à la vaccination et la sérothérapie - Les étapes de la réponse : activation, prolifération, différentiation, - Les étapes effectrices

Chapitre IV: Exploration cellulaire et moléculaire du système immunitaire (2H30) Chapitre V : Les anticorps monoclonaux et recombinants (3H)

- Principe d’obtention : hybridation cellulaire - Banques combinatoires d’anticorps et banques de peptides - Production in vitro et in vivo

Applications (2H30) - Utilisation des anticorps pour la recherche, le diagnostic et l’immunothérapie - Utilisation des cytokines en immunothérapie - Thérapies cellulaires

Travaux pratiques et dirigés (18H)

- Structure et diversité des anticorps : purification des Ig et d’anticorps par chromatographie - Préparation d’anticorps monoclonaux - Les réactions antigène anticorps et techniques d’étude - Notion d’affinité, d’avidité, de spécificité - La précipitation Ag/AC - ELISA et Immunoempreinte - Utilisation des anticorps en tant qu’outils de recherche et de diagnostic - Méthodes de séparation des cellules immunitaires : gradient de densité, immunocapture - Marquage et numération des lymphocytes : Immunofluorescence, Cytométrie de flux

Code ECUE :……………

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Fiche descriptive d’une unité d’enseignement (EU) et des éléments constitutifs d’une unité d’enseignement (ECUE)

Intitulé de l’UE

Physiologie et Expérimentation

Nombre de crédits………6…… Code UE………………………

Université :………………………………………… Etablissement :…………………………………………..

Domaine de la formation : Sciences et Technologies Mention : Biologie Analytique et Expérimentale Diplôme et Parcours LA : Appliquée Parcours : tous les parcours de la mention LF Parcours :

Semestre … L2 S3 ……

1- Objectifs de l’UE (savoirs, aptitudes et compétences) Physiologie et expérimentation animales : Permettre à l’étudiant d’acquérir un approfondissement des concepts et méthodologies de travail en physiologie intégrée utilisés et en bioexpérimentation animale in vivo et in vitro à des fins scientifiques, biomédicales et cosmétologiques, en adéquation avec la législation correspondante. L’acquisition des ces compétences permettra de prendre en charge des protocoles expérimentaux dans les laboratoires d’analyses, de recherche, d’enseignement ou dans l’industrie pharmaceutique et cosmétique en respectant le cadre réglementaire et éthique des métiers liés particulièrement à l’animal de laboratoire. Physiologie et expérimentation végétales : Permettre à l’étudiant d’acquérir une formation sur la nutrition, l’activité photosynthétique, la croissance, la différentiation et le développement chez les végétaux, les techniques de culture végétale, l’amélioration des plantes et les produits végétaux d’intérêt, 2- Pré-requis (définir les UE et les compétences indispensables pour suivre l’UE concernée) Biologie cellulaire, biochimie et techniques d’analyses biochimiques., biologie animale, génétique, microbiologie, biologie moléculaire, biologie végétale. 3-Eléments constitutifs de l’UE (ECUE) 3.1- Enseignements

Volume horaire Eléments constitutifs Cours TD TP Crédits Physiologie et expérimentation animales

1H30 0H30 0H45 3 Physiologie et expérimentation végétales

1H30 0H30 0H45 3

TOTAL 3H 1H 1H30 6 3.2- Activités pratiques (Projets, satges, mémoires….)

Durée Activités pratiques de l’UE Travaux au

laboratoire Projets Stages Autres Crédits

4- Contenu (descriptifs et plans des cours) 4.1- Enseignements (Présenter une description succincte des programmes de chaque ECUE et joindre le programme détaillé à la fiche descriptive de l’UE).

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 40

Physiologie et expérimentation animales : physiologie de base (homéostasie, physiologie de la reproduction chez les mammifères, physiologie des cellules nerveuses et musculaires, mécanismes endocriniens, mécanismes de thermorégulation), physiologie de la nutrition (digestion, alimentation équilibrée et régime alimentaire, affections métaboliques), physiologie de la bioexpérimentation (éthique de la bioexpérimentation, hygiène et santé animale, psychophysiologie de l’animal de laboratoire, physiopathologie des animaux de laboratoire. Physiologie et expérimentation végétales: relations hydriques et nutrition minérale; photosynthèse; régulateurs de croissance et du développement, dormance et physiologie de la germination et de la floraison, vernalisation et fructification, les techniques de culture végétale (culture in vitro des tissus végétaux et leur utilisation dans les différents domaines de la production végétale, la micropropagation et l'amélioration des plantes, culture hydroponique, culture hors sol,…), les produits du métabolisme secondaire des végétaux. 4.2- Activités pratiques de l’UE (Présenter une description succincte des objets, des contenus et des procédures d’organisation de chaque activité) Physiologie et expérimentation animales : manipulation et soin des animaux de laboratoire, potentiels d’action, contraction musculaire, régulation hormonale, dosage physiologique et métabolique, groupes sanguins et hémostase, dissection, injection et prélèvement, anesthésie, réanimation, euthanasia, visite d’animalerie, expérimentations assistées par ordinateur (EXAO), Physiologie et expérimentation végétales : Physiologie de la germination ; activités photosynthétique et respiratoire ; dosage des ions et de l'azote protéique ; confection de milieux de culture et repiquage ; culture de méristème,… ; visite de centres spécialisés en expérimentation végétale,… 5 – Méthodes pédagogiques et moyens didactiques spécifiques à l’UE (méthodes et outils pédagogiques, ouvrages de référence, recours aux TIC- possibilités d’enseignement à distance) 6-Examens et évaluation des connaissances 6.1- Méthode d’évaluation et régime d’examens (Préciser le régime d’évaluation préconisé : contrôle continu uniquement ou régime mixte : contrôle continu et examens finaux) Régime mixte : contrôle continu et examens finaux 6.2- Validation de l’UE (Préciser les poids des épreuves d’examens pour le calcul de la moyenne de l’ECUE, les coefficients des ECUE et le coefficient de l’UE au sein du parcours).

Contrôle continu (30%) Examen final ( 70%) Epreuves Epreuves ECUE

Ecrit TP AutresPondéra

-tion Ecrit TP Autres

Pondéra

-tion

Coef. de l’ECUE

Coef. de l’UE au sein du parcours

1- Physiologie et expérimentation animales

5% 5% 5% 50% 25% 10% - 50% 3

2- Physiologie et expérimentation végétales

5% 5% 5% 50% 25% 10% - 50% 3

TOTAL 10% 10% 10% 50% 20% 6

6

6.3- Validation des stages et des projets.... ……………………………………………………………………………………………………

Annexe I

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 41

Unité d’Enseignement : Physiologie et Expérimentation

Code UE :……………

ECUE 1 : Physiologie et Expérimentation Animales

Plan du Cours : (21H)

I - Physiologie Générale (14H) A- Physiologie de base (9H)

- Notion d’homéostasie : milieu intérieur et régulation de la balance hydro électrolytique - Physiologie de la reproduction chez les mammifères : régulation hormonale du cycle ovarien, de la gestation et de la lactation - Physiologie des cellules nerveuses et musculaires ; régulation de l’excitabilité et neuromédiation ; transmission neuromusculaire - Notion sur les mécanismes de la thermorégulation.

B- Physiologie de la Nutrition (5H) - La digestion : régulation neuroendocrine et métabolique - Alimentation équilibrée et régime alimentaire - Affections métaboliques

II - Physiologie Appliquée à la bioexpérimentation (7H)

- Cadre réglementaire et éthique de l’expérimentation animale - Notion d’hygiène et de santé animale - Aspects de pharmacologie (mécanismes de toxicité, risque toxicologiques…) - Notion sur la psychophysiologie de l’animal de laboratoire : exploration des états de stress, de souffrance (manifestations douloureuses) - Physiopathologie des animaux de laboratoire. Sémiologie des affections aigues : déshydratation, hypothermie, infection, déficit moteur, altération de l’état général.

Enseignements pratiques (18H)

Les enseignements pratiques porteront sur des applications aussi bien au laboratoire que par l’EXAO :

- Manipulation et soin des animaux de laboratoire - Simulation informatique des signaux électriques cellulaires - Etude de l’excitabilité nerveuse et musculaire (potentiels d’action, transmission synaptique, vitesse de propagation de l’influx nerveux) - Etude de la contraction de muscle squelettique - Etude de la digestion des aliments - Intervention chez les animaux de laboratoire (Dosages physiologique et métabolique, frottis sanguin et vaginal, dissection, injection et prélèvement), anesthésie, réanimation, euthanasia - Visite d’animalerie

Annexe II

Code ECUE :……………

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 42

Unité d’Enseignement : Physiologie et Expérimentation

Code UE :……………

ECUE 2 : Physiologie et Expérimentation Végétales

Plan du Cours : (21H)

- Nutritions minérale, carbonée et azotée, adaptation aux milieux - Physiologie de germination des graines et de plantules - Croissance et développement, contrôle - Phytohormones, floraison et rythmes de développement, vernalisation, fructification - Techniques de culture végétale

Culture des tissus (micropropagation, embryogenèse somatique), culture hydroponique/culture hors sol, etc…

- Produits du métabolisme secondaire des végétaux TP/TD (18H) - Milieux de culture, dosage des ions et des molécules, activité photosynthétique, culture et multiplication végétale,…

Code ECUE :……………

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 43

Fiche descriptive d’une unité d’enseignement (UE) Et des éléments constitutifs d’une unité d’enseignement (ECUE)

Intitulé de l’UE Métabolisme / Enzymologie Appliquée

Nombre des crédits : 6 ... Code UE : ......................

Université : Etablissement :

Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention : Biologie Analytique et Expérimentale Diplôme et parcours

Semestre LA : Licence Appliquée Parcours : Tous les Parcours de la Mention Biologie Analytique et Expérimentale

L2-S3

LF Parcours : 1- Objectifs de l’UE (Savoir, aptitudes et compétences)

1- Biochimie métabolique : Permettre à l’étudiant d’acquérir des connaissances sur les principales voies du métabolisme intermédiaire jusqu’au cycle de l’Urée, en faisant ressortir le bilan des différentes voies en ATP et en métabolites. Le métabolisme du glycogène est traité comme modèle de régulation hormonale. 2- Enzymologie appliquée : l’étudiant devra acquérir les connaissances élémentaires concernant les enzymes, les propriétés des réactions enzymatiques dans le cas la cinétique Michaelienne. Il devra aussi être capable de déterminer leurs paramètres cinétiques en présence ou en absence des effecteurs biologiques, chimiques et physiques de la réaction enzymatique. Cet enseignement aura également pour objectif de faire connaître les méthodes de préparation, d’immobilisation des enzymes et d’établissement de protocoles expérimentaux pour pouvoir les utiliser en analyses et bioexpérimentation.

2- Pré-requis (définir les UE et les compétences indispensables pour suivre l’UE concernée)

Chimie générale, chimie organique, biochimie structurale et techniques d’analyses biochimiques, math et physique, biologie cellulaire et génétique, microbiologie et biologie moléculaire.

3- Elément constitutifs de l’UE (ECUE) 3.1- Enseignements

Volume horaire Eléments constitutifs Cours TD TP Crédits

1- Métabolisme 1H30 0H30 0H45 3 2- Enzymologie appliquée 1H30 0H30 0H45 3

Total 3H 1H 1H30 6 3.2- Activités pratiques (Projets, stages, mémoires ….)

Durée Crédits

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 44

Durée Activités pratiques de l’UE Travaux sur

terrain Projets Stages Autres Crédits

Total 4- Contenu (descriptifs et plans des cours) 4.1- Enseignements (Présenter une description succincte des programmes de chaque ECUE et joindre le

programme détaillé à la fiche descriptive de l’UE) 1- Métabolisme des glucides, des lipides, des acides aminés ; bilan des voies métaboliques. 2- Catalyse chimique et enzymatique, cinétique michaelienne, constantes cinétiques, dosages enzymatiques, effecteurs enzymatiques, applications des enzymes en analyses et bioexpérimentation.

4.2- Activités pratiques de l’UE (Présenter une description succincte des objectifs, des contenus des

procédures d’organisation de chaque activité) 1- Biochimie métabolique: les TP intégrés doivent permettre la mise en évidence de certaines étapes des voies métaboliques. 2- Enzymologie appliquée : Acquérir une formation pratique en enzymologie de base indispensable en analyses et en biotechnologie en maîtrisant les conditions expérimentales permettant d’optimiser une réaction enzymatique, de déterminer les paramètres cinétiques et de régulation de l’activité de l’enzyme et de conduire correctement des protocoles expérimentaux.

5- Méthodes pédagogiques moyens didactiques spécifiques à l’UE (méthodes et outils pédagogiques, ouvrages de référence, recours aux TIC – possibilités d’enseignement à distance …)

Rétroprojecteur, Data show soutenus par des supports de cours, ppaass ddee ppoossssiibbiilliittééss dd’’eennsseeiiggnneemmeenntt àà ddiissttaannccee. 6- Examen et évaluation des connaissances 6.1- Méthode d’évaluation et régime d’examens (Préciser le régime d’évaluation préconisé : contrôle continu

uniquement ou régime mixte : contrôle continu et examens finaux)

Régime mixte

6.2- Validation de l’UE (préciser les poids des épreuves d’examens pour le calcul de la moyenne de l’ECUE,

les coefficients des ECUE et le coefficient de l’UE au sein du parcours). Contrôle continu (30%) Examen final ( 70%)

Epreuves Epreuves ECUE Ecrit TP Autres

Pondéra-tion Ecrit TP Autres

Pondéra

-tion

Coef. de l’ECUE

Coef. de l’UE au sein du parcours

1- Métabolisme 5% 5% 5% 50% 25% 10% - 50% 3 2- Enzymologie appliquée 5% 5% 5% 50% 25% 10% - 50% 3

TOTAL 10% 10% 10% 50% 20% 6 6

6.3- Validation des stages et des projets …..

..................................................................................................................................................................

..................................................................................................................................................................

..................................................................................................................................................................

..................................................................................................................................................................

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 45

Annexe I

Unité d’Enseignement : Métabolisme / Enzymologie Appliquée

Code UE : …………………

ECUE 1 : Métabolisme

Plan du Cours (21H) A- Métabolisme des Glucides 1- Catabolisme du glucose - Formation du Glu- 6- Phosphate (digestion, voie des pentoses phosphates, glycogénolyse) - La glycolyse (voie d’Embden- Meyerrhoff-Parnas) - Décarboxylation oxydative du pyruvate - Bilan en NADH de la glycolyse (aérobie et anaérobie) 2 – Cycle tricarboxylique - Entrée du pyruvate dans le cycle de l’acide citrique - différentes étapes enzymatiques du cycle - bilan du cycle de Krebs : énergétique, pouvoir réducteur, métabolites intermédiaires - cycle de Krebs carrefour du métabolisme cellulaire 3- Cycle glyoxylique, néoglucogenèse 4- Métabolisme du glycogène et sa régulation B – Métabolisme des lipides 1- Voies de dégradation des lipides et bilan énergétique 2- Voies de Biosynthèse des lipides

C- Cycle de l’Urée 1- Phases mitochondriale et cytosolique 2- bilan du cycle

D- Métabolisme des acides aminés 1- voie de Biosynthèse des A.A 2- voie de Dégradation des A.A

TP/TD (18H)

Illustrations de certaines réactions des voies métaboliques étudiées et dosages de métabolites intermédiaires (cholestérol, Glu-6-P, transamination, etc.)

Code ECUE : ……………

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 46

Annexe II

Unité d’Enseignement : Métabolisme / Enzymologie Appliquée

Code UE : …………………

ECUE 2 : Enzymologie Appliquée Plan du Cours (21H)

Enzymologie de base (13h) I- Catalyse enzymatique (4h) - Définition - La catalyse enzymatique : état de transition et énergie d’activation - Spécificité enzymatique - Les cofacteurs enzymatiques - Classification des enzymes II- Cinétique michaelienne (6h) - Equation de Michaelis - Menten - Les phases de la réaction enzymatique - Détermination des constantes cinétiques Km et Vmax - Etape limitante de la réaction et signification du Kcat, efficacité catalytique, unité enzymatique et

activité spécifique

- Détermination des constantes cinétiques à partir de représentations graphiques (Représentation de Lineweaver et Burk et Représentation d’Eadie Hofstee et autres représentations graphiques) III- Effecteurs de réaction enzymatique (3h) - Les différents types d’effecteurs de la réaction enzymatique - Les inhibiteurs (compétitifs, non compétitifs, incompétitifs) et détermination des paramètres cinétiques - Influence de la température et du pH

Enzymologie appliquée (8h) I - Nature et origine des enzymes II - Les préparations industrielles des enzymes III - Les méthodes d’immobilisation des enzymes

- Méthode physique : immobilisation par adsorption - Méthode chimique : immobilisation par fixation covalente sur un support.

IV - Les applications en analyses et en biotechnologie (exemples)

TP/TD (18H) Préparation d’une enzyme et dosage protéique ; étude de la cinétique enzymatique (détermination de Km, Vmax, activité spécifique) ; action des inhibiteurs sur la vitesse, effet de pH et de température sur l’activité enzymatique, immobilisation d’une enzyme,…

Code ECUE : ……………

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 47

UEF : INSTRUMENTATION ET METROLOGIE/ MANAGEMENT DE LA QUALITE  

ECUE1 : INSTRUMENTATION ET METROLOGIE   

OBJECTIFS  

- Acquisition des principes de Métrologie en entreprise : exigences génériques et guides d’application pour  le management du processus de mesure 

- Confirmation des équipements de mesure utilisés pour démontrer la conformité des procédés, des produits - Acquisition des principes de Validation des méthodes dans le cadre du Management de la qualité 

 PROGRAMME  1ère partie : Introduction  

Introduction • Place  de  la métrologie  dans  la  démarche  de management  des  risques  (qualité,  environnement, 

sécurité….) • Le système de mesure • Principes essentiels du Système de Mesure 

 2ème  partie : Système de mesure et fonction métrologie  

Définition du Système de Mesure • Les types de mesures • L’organisation internationale en termes de mesures • L’organisation tunisienne en termes de mesures • Rôle du système de mesure dans la transférabilité des produits de services :  

Le raccordement et la rigueur de la mesure  Le poinçonnage et la réglementation 

• La normalisation du Système de Mesure  

La fonction métrologie  

ISO 10012 version 2003 • Domaine d’application • Termes et définitions 

 3ème partie : Mesures et incertitudes  

Mesures et incertitudes • Le processus de mesure 

Conception  Mise en œuvre  

• La confirmation métrologique  Définition  Intervalles de confiance 

• Incertitude de mesure et traçabilité  

4ème partie : Introduction à la Validation des Méthodes  

Introduction • Principes de la validation des méthodes dans les domaines des essais 

Validation des méthodes selon ISO 17025 version 2005 • Termes et définitions 

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 48

• Prescriptions et management Maitrise des travaux d’essais et/ou d’étalonnage non conformes 

• Prescriptions techniques Personnel Installations et conditions ambiantes Méthodes d’essai et d’étalonnage et validation des méthodes  Equipement Traçabilité de mesure Echantillonnage Manutention des objets d’essai et d’étalonnage Rapport sur les résultats 

 5ème partie : Cas d’application de validation  

Définition d’une portée d’accréditation • Modalités de définition • Types de portées • Revue des portées d’accréditation 

La validation des méthodes : une solution pour l’accréditation de laboratoires • Validation selon la Pharmacopée 6ème édition • Validation selon les normes internationales 

Exercices pratiques de calcul de : • Robustesse et rugosité • Linéarité 

…. • Cas d’application : Elaboration de cartes de contrôle 

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 49

 UEF : INSTRUMENTATION ET METROLOGIE/ MANAGEMENT DE LA QUALITE 

ECUE2 : MANAGEMENT DE LA QUALITE  

OBJECTIFS  Acquisition des principes de Management de la Qualité  PROGRAMME  1ère partie : le Management de la qualité et le Système de la Reconnaissance Internationale  

Introduction • Historique du Management de la Qualité • Normalisations et principes de la Conformité 

  Organisation Internationale de la Reconnaissance mutuelle 

• Principes et bases de la reconnaissance internationale • Organisation en international : de l’habilitation à la certification • Organisation en Tunisie 

  Principes essentiels du Système de Management de la Qualité 

• Origine des incidents • Principe de cause à effet • Planification et recherche de l’efficacité • Amélioration continue et satisfaction du client • Maîtrise des activités des coûts et du SMQ • Relation entre système de Management de la qualité et les modèles d’excellence 

  Environnement Normatif du Management de la Qualité 

• Référentiels Guides • Référentiels Exigences • Référentiels Recommandations • Documents sectoriels 

 2ème partie : l’Approche Processus  

Approche Processus : Présentation de la Norme sectorielle FDX 50‐176/v2005 • Définition • Terminologie 

  Identification des processus : une exigence de la norme ISO 9001 v2008 

• Typologie des processus • Identification des processus clés de l’entreprise • Identification des interrelations des processus entre eux 

  Présentation de modèles de cartographies de processus 

  Paramétrage d’un processus : l’approche PDCA appliquée au processus 

  Cas pratiques : travail en groupe 

• Définition d’une cartographie des processus • Application d’un paramétrage de processus 

 3ème partie : Structure Documentaire d’appui au Système de Management de la Qualité  

Introduction à la maîtrise documentaire 

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 50

• Définition • Terminologie • Cycle de vie d’un document, d’une donnée, d’un enregistrement 

  La maitrise des documents, des données et des enregistrements d’un SMQ : exigence de la norme ISO 9001 v 2008  

• Typologie des familles de documents • Identification des processus clés de l’entreprise 

  Cas pratiques : travail en groupe 

• Définition d’une structure documentaire • Etablissement d’une procédure :  la procédure de  la maitrise des documents, des données  et des 

enregistrements  4ème partie : Les écarts et leur traitement : Principe de base de la Dynamique de Progrès  

Les systèmes et leur fiabilité • Etude des dysfonctionnements pour l’amélioration de la qualité • Analyse des causes 

  Coûts de la Qualité 

• Différents types de la qualité • Coûts de prévention • Coûts d’évaluation • Coûts de défaillance interne • Coûts de défaillance externe 

  Principes essentiels du Traitement des écarts 

• Origine de détection des écarts • Les types d’écarts • Les types de traitement • Les étapes de traitement des écarts • Analyse des données et amélioration des performances du Système 

  Cas pratiques 

• Application de l’outil Digramme Causes‐effets   

5ème partie : Efficacité d’un Système de Management de la Qualité  

Introduction aux normes sectorielles FDX 50‐171 / FDX 50‐174 • Principes de Management de la Qualité et de la mesure des performances 

  La norme FDX 50‐171 : Tableaux de bord et indicateurs qualité 

 • Analyse et amélioration 

- Analyse des données - Amélioration continue 

  La FDX 50‐174 : Evaluation de l’efficacité des Systèmes de Management 

• Domaine d’application • Termes et définitions • Efficacité • Efficience 

 

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 51

LA BAE - PROGRAMME L3

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 52

Licence Appliquée en Biologie Analytique et Expérimentale

Parcours : Analyses et Qualité (L3)

Objectifs :

Le parcours «Analyses et Qualité », L3 de Licence Appliquée en Biologie

Analytique et Expérimentale (LABAE), est une formation à finalité

professionnalisante visant un groupe de métiers.

Les enseignements des différentes UE doivent être assurés de manière

synthétique faisant apparaitre une interaction effective entre les spécialités. Une

partie des enseignements doit être assurée par des professionnels.

Au terme de la licence, les diplômés doivent être capables d’utiliser les

connaissances scientifiques, et les outils normatifs et réglementaires et de maitriser

les méthodes d’analyses biologiques, physico-chimiques, métrologiques, et de bonnes

pratiques de laboratoire développées pour le diagnostic, le contrôle qualité, la

recherche,…. dans plusieurs secteurs (agroalimentaire, biotechnologique,

pharmaceutique, cosmétique, de santé humaine et animale, de recherche

développement, d’enseignement ...)

Les diplômés seront aussi adaptables au développement de nouvelles

technologies grâce à leurs capacités liées aux:

- sciences et techniques

- spécificités des secteurs d’activités

- rapports humains et organisationnels au sein des laboratoires, des entreprises, des

bureaux d’études et d’expertises, des cabinets conseil…

- normes d’hygiène, de sécurité et de qualité

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 53

PLAN DE FORMATION Licence Appliquée en Biologie Analytique et Expérimentale

Parcours : Analyses et Qualité (L3) Universités : Tunis El Manar Etablissements : Faculté des Sciences de Tunis Licence Appliquée Mention Biologie Analytique et

Expérimentale

Domaine de formation : Sciences et Technologies Parcours Analyses et Qualité Semestre 5

Volume horaire semestriel (14 semaines) Crédits Coefficients Régime

d'examen N°

Unité d'enseignement

Nature de l'UE

Elément constitutif d'UE (ECUE)

Cours TD TP Cours Intégré ECUE UE ECUE UE Contrôle

continu Régime mixte

Anglais 2H00 2 2 X Culture de l’entreprise (création d’entreprise) 1H30 2 2 X 1 Unité

Transversale UT

Banques et Traitement de données 1H 1H 2

6

2

6

X Outils et applications du management de la qualité 1H30 1H15 3 3 X

2

Management de laqualité et

métrologie appliquée

UE1 Métrologie et instrumentation appliquées 1H30 0H30 0H45 3

6 3

6 X

Analyses physico-chimiques et biologiques de l’environnement 1H30 0H30 0H45 3 3 X

3

Qualité de l’environnement et contrôle des

produits de biotechnologies

UE2 Contrôle des produits de biotechnologies 1H30 0H30 0H45 3

6 3

6 X

Analyses et contrôle qualité des produits agro-alimentaires et nutritionnels

1H30 0H30 0H45 3 3 X 4

Analyses technologiques et contrôle qualité des bioproduits

UE3 Analyses et contrôle qualité des produits pharmaceutiques et cosmétiques

1H30 0H30 0H45 3

6

3

6

X

UO1 3 3 X 5 UE Optionnelle UO UO2 3

6 3

6 X

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 54

Licence Appliquée en Biologie Analytique et Expérimentale Parcours : Analyses et Qualité (L3)

Universités : Tunis El Manar,

Etablissements : Faculté des Sciences de Tunis

Licence Appliquée

Mention

Biologie Analytique et Expérimentale

Domaine de formation : Sciences et Technologies Parcours Analyses et Qualité

Semestre 6 : Stage de fin d’études

Le projet de stage consiste en un travail personnel. Il porte sur l’étude, la mise en œuvre, l’optimisation et l’actualisation des

technologies d’analyses et de contrôle des produits en tenant compte des normes techniques et réglementaires des protocoles et des

modèles expérimentaux dans les laboratoires (analyses, contrôles conseil et expertises, recherche développement, police scientifique

et fraudes,....) et les entreprises (agroalimentaires, pharmaceutiques, cosmétiques, environnementales, centres de recherche…)

permettant d’assurer l’adéquation des procédés et la conformité des bioproduits et des pratiques d’analyses.

Les équipes pédagogiques des unités d’enseignements doivent contribuer à la recherche des lieux de stages. Le suivi pendant le

stage doit être assuré par les enseignants universitaires et les professionnels.

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CONTENU DES PROGRAMMES

UEF1 : MANAGEMENT QUALITE ET METROLOGIE APPLIQUES

ECUE1 : OUTILS ET APPLICATIONS DU MANAGEMENT DE LA

QUALITE

OBJECTIFS

- Connaissance des outils de management de la qualité - Acquisition des méthodes de mesure et d’analyse des données d’un système de Management de la

Qualité - Application des exigences d’un référentiel dans une démarche de Management de la Qualité

PROGRAMME 1ere partie : Introduction

Introduction • Les raisons de la mise en place des outils d’amélioration de la qualité selon les Référentiels Internationaux • Quels et comment utiliser ces outils ? • L’analyse des données • La recherche des solutions et les améliorations enregistrées • Démarche de mise en place d’un procédé d’amélioration • Applications et approche INTERACTIVE

2eme partie : Outils de mise en place

Outils de mise en place • Kaizen - les 5 S • Travail en équipe • Brainstorming • Logique « est & n’est pas » • Fiche d’acquisition des données • Histogramme des fréquences • QQOQCP • Logigramme

Outils de mise en œuvre • Diagramme de Pareto • Diagramme causes effets - méthode par familles • Diagramme causes effets - méthode par processus • Diagramme multicritères • Matrice de pondération • Typoscopie • Arbre de décision

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Outils d’amélioration • Diagramme de dispersion • Diagramme de progrès • Diagramme événementiel • Diagramme de Gantt • Diagramme polaire • Rapport de projet • Graphique

Les autres outils • AMDEC • Analyse de la valeur • 6 Sigma

3eme partie :

Cas d’application A

Cas d’application on line sur internet • La reconnaissance internationale • Le processus de certification : démarche et choix des organismes • Le processus d’accréditation : démarche et choix des programmes

Cas d’application B

Choix d’un ou plusieurs référentiels d’application avec les étudiants • ISO 9001 • ISO 22000/HACCP • ISO 17025 • ……..

Application des outils de Management de la Qualité étudiés dans le cadre des référentiels

choisis

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UEF1 : MANAGEMENT QUALITE ET METROLOGIE APPLIQUES

ECU2 : METROLOGIE & INSTRUMENTATION APPLIQUEES

OBJECTIFS

- Acquisition des principes de Métrologie en entreprise : exigences génériques et guides d’application pour le management du processus de mesure

- Confirmation des équipements de mesure utilisés pour démontrer la conformité des procédés, des produits.

PROGRAMME

1ere partie : Gestion d’un parc d’équipements

Les familles d'équipements Les principes de la qualification des équipements • Qualification de conception • Qualification d'installation • Qualification de fonctionnement • Qualification de performances Présentation de la procédure de maîtrise des équipements et plus

particulièrement les Equipements de Contrôle de Mesures et d’Essais • Identification • gestion

maintenance préventive étalonnage vérification calibrage

maintenance curative

2eme partie : Cas d’application

Cas d’application pratiques • Installations et conditions ambiantes • Equipement • Méthodes d’étalonnage et vérification

Application des exigences du référentiel à un type de mesure • Masses • Temperatures • volumes

Rapport sur les résultats

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 58

UEF2: QUALITE DE L’ENVIRONNEMENT ET CONTROLE DES

PRODUITS DE BIOTECHNOLOGIE

ECUE1 : ANALYSES PHYSICO-CHIMIQUES ET BIOLOGIQUES DE

L’ENVIRONNEMENT

COURS 21H

1. Les polluants et la pollution de l’Environnement : a. Les différents types de polluants et de pollution

i. La pollution chimique ii. La pollution organique

* Les polluants organiques * Les xénobiotiques * Les POP (Polluants Organiques Persistants)

iii. Evaluation de la toxicité * Les bioessais au laboratoire * Tests de toxicité : Test physiologique: µtox et Test de génotoxicité: Mutatest, Inductest, SOS chromotest.

b. Analyse des types de pollution affectant les divers écosystèmes (engrais, pesticides, pluies acides, métaux, ...).

c. Origine, circulation, transformation des polluants. d. Effets directs et indirects sur l'environnement. e. Interactions des polluants avec les autres facteurs du milieu.

2. Pollution des Eaux : a. Sources, mécanismes et symptômes de la pollution des eaux b. Mesures de la qualité des eaux.

i. Techniques et traitements physico-chimiques ii. Techniques microbiologiques

c. Principes de traitement et épuration des eaux usées. d. Prévention de la pollution des eaux.

3. Pollution de l'Air : a. Les sources de pollution (sources naturelles, combustion, industrie) b. Transfert et évolution des polluants. c. Mesures de la qualité de l’air d. Moyens de contrôle des émissions.

4. Pollution des Sols : a. Pollution minérale (métaux lourds) : origine et bilans des pollutions. b. Pollution organique. c. Pollution par les pesticides: prévention, mécanismes de fixation,

détoxification.

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 59

d. Pollution par les résidus d'élevage et autres matières organiques : influence sur les plantes, détermination des doses admissibles, réduction de la charge (biométhanisation).

5. Les déchets solides : a. Caractérisation et collecte des déchets solides. b. Méthodes de traitement : décharge contrôlée, compostage, tri simple,

appliqués aux déchets urbains. c. Recyclage des déchets solides.

6. Les déchets hospitaliers, dangereux et la pollution radioactive.

TP/TD : applications sur le contenu du cours + Visites d’entreprises

UEF2: QUALITE DE L’ENVIRONNEMENT ET CONTROLE DES PRODUITS DE BIOTECHNOLOGIE

ECUE2 : CONTROLE DES OGM

COURS 21H

1. Définition et historique des OGM 2. Avantages et risques liés aux OGM (sanitaires, agronomiques,

environnementaux et socioéconomiques) 3. Méthodes d’obtention 4. Identification, traçabilité et quantification des OGM 5. Normes d’utilisation et de commercialisation

TP/TD : applications sur le contenu du cours

a. Détection ‐ Extraction et purification de l’ADN ‐ PCR ‐ q-PCR

b. Immunodétection

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LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOLOGIE ANALYTIQUE ET EXPERIMENTALE 60

UEF3: ANALYSES TECHNOLOGIQUES ET CONTROLE QUALITE DES

BIOPRODUITS

ECUE1 : ANALYSES ET CONTROLE QUALITE DES PRODUITS AGRO-ALIMENTAIRES ET NUTRITIONNELS

COURS 21H

1- Principales filières alimentaires 2- Principales technologies de transformation et de production agro-alimentaire 3- L’aliment : composition biochimique et physico-chimique, aspects nutritionnels 4- Propriétés technologiques et organoleptiques 5- Arômes, additifs alimentaires, neutraceutiques, alicaments,… 6- Les outils analytiques spécifiques pour la gestion de la qualité et la sécurité des aliments

Risques (connaissance des principaux risques) chimiques, physiques, microbiologiques, parasitologiques, génétiques, toxiques naturels, fortifiants des aliments,…

Outils techniques spécifiques pour l’évaluation d’hygiène et du risque sanitaire. ‐ Outils analytiques de contrôles biochimiques et moléculaires ‐ Outils analytiques de contrôles microbiologiques et parasitaires

Qualités sensorielle des aliments (colorants, arômes, épaississants, gélifiants,… conséquences sur l’aliment).

Qualités hygiénique, organoleptique et nutritionnelle appliquées à la restauration collective (gastronomie moléculaire), aux aliments des animaux d’élevage intensif,…

Qualité des procédés de conservation, conditionnement et d’emballage.

TP/TD : applications sur le contenu du cours + Visites d’entreprises  

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UEF3: ANALYSES TECHNOLOGIQUES ET CONTROLE QUALITE DES BIOPRODUITS

ECUE2: ANALYSES ET CONTROLE QUALITE DES PRODUITS PHARMACEUTIQUES ET COSMETIQUES COURS 21H

1- Introduction à l’industrie de cosmétique et de parfumerie 2- Filières, matières premières, procédés, produits 3- Principales technologies de fabrication et de formulation, bonnes pratiques 4- Classes et formes galéniques des médicaments 5- Développement galénique (principes actifs des médicaments, des excipients, les

conditionnements,…) 6- Pharmacologie et bio-expérimentation : les différents cibles des médicaments (molécules,

membranes, principaux types de récepteurs…), notions d’agonistes, d’antagonistes et de synergie, développement pré-clinique et clinique des médicaments, biodisponibilité, gestion de vie du médicament,…

7- Biologie de la peau, hydratation et vieillissement cutanés, photoprotection, des structures telles que le poil, le cheveu, l’ongle,…

8- Qualitologie et bonnes pratiques de fabrication et d’essais Techniques d’analyses spécifiques de contrôle physico-chimiques (viscométrie,

rhéologie, turbidimétrie, colorimétrie, calorimétrie,…), choix des méthodes analytiques en fonction des molécules (HPLC, CPG, IR, SM, électrophorèse capillaire,…)

Techniques bioanalytiques : ‐ Analyses biochimiques et sensorielles ‐ Analyses microbiologiques ‐ Analyses toxicologiques et physiologiques ‐ Autres techniques

TP/TD : applications sur le contenu du cours, visite d’entreprise, analyses d’articles, ….