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A L I M E N T A T I O N
A G R I C U L T U R E
E N V I R O N N E M E N T
Journées INRA-INRIA Mai 2007
Présentation générale du département MIA
Quelques exemples de réalisations
Eléments de cohérence et complémentarité avec l’INRIA
Journées INRA-INRIA Mai 2007
-52 chercheurs; 35 ingénieurs; 23 techniciens et administratifs; 21 enseignants chercheurs ; 51 doctorants (au cours des 4 dernières années)
-Discipline principale des chercheurs : Statistique : 66 % Informatique : 23 % Système dynamique et contrôle : 11 %
Le département MIA
Journées INRA-INRIA Mai 2007
Politique scientifique :
Développer de la recherche dans nos disciplines pour faire avancer les sciences de la vie et de l’environnement
Privilégier les grands enjeux exprimés par nos partenaires des autres départements de l’INRA
Et sélectionner ceux pour lesquels nos disciplines peuvent apporter un plus décisif (essentiellement par de la recherche, mais aussi ingénierie et expertise).
Le département MIA
Journées INRA-INRIA Mai 2007
Deux champs thématiques : Bioinformatique, mathématiques et informatique pour les modèles issus du gène à l’individu
Localisation de régions fonctionnelles dans les séquences et prédiction de leur fonction Cartographie génétique Analyse de données d’expression : transcrits et protéines Réseaux de régulation et biologie des systèmes
Modèles et décision pour l’agriculture, l’environnement et l’alimentation
Ecologie et environnement Epidémiologie Gestion d’agro-éco-systèmes Analyse du risque alimentaire Conception et conduite de procédés
Le département MIA
Journées INRA-INRIA Mai 2007
Nos priorités méthodologiques visent à dépasser les clivages entre disciplines
Représentation et exploitation d’informations dynamiques et spatialisées
Algorithmique et complexité calculatoire
Modélisation et analyse statistique des données
Système d’information et ingénierie des connaissances
Modèles pour l’action
Systèmes complexes
Analyse et gestion du risque
Le département MIA
Journées INRA-INRIA Mai 2007
Le département MIA
Journées INRA-INRIA Mai 2007
Quelques réalisations
Journées INRA-INRIA Mai 2007
Quelques réalisations
Une structure de gène est un chemin dans le graphe
Les arrêtes sont pondérées par une « probabilité conditionnelle » (HMM) à paramètres variables
Le meilleur chemin est déterminé par un algorithme linéaire en temps
Eugene: détecteur de gène
Journées INRA-INRIA Mai 2007
Quelques réalisationsEugene: détecteur de gène
Journées INRA-INRIA Mai 2007
Quelques réalisations
Meta analyse de QTL
Journées INRA-INRIA Mai 2007
Quelques réalisations
Journées INRA-INRIA Mai 2007
Projets et réalisations
Projet Selommes : flux de gènes OGM à l’échelle du paysage
Journées INRA-INRIA Mai 2007
Projets et réalisationsQuelques réalisations
Journées INRA-INRIA Mai 2007
Projets et réalisationsQuelques réalisations
Journées INRA-INRIA Mai 2007
Il y a de grands besoins en mathématiques appliqués et en informatique pour répondre aux enjeux des sciences de la vie et de l’environnement
complémentarité géographique
complémentarité méthodologique
construire des réseaux sur des enjeux méthodologiques
Cohérence et complémentarité avec l’INRIA
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