CBGP Thématiques de recherche : Caractérisation de la biodiversité. Biologie des bio-agresseurs...

CBGP

Thématiques de recherche :•Caractérisation de la biodiversité.•Biologie des bio-agresseurs et de leurs antagonistes.•Origine, évolution et conséquences des invasions biologiques.•Caractérisation des réservoirs des maladies émergentes.•Compréhension des règles d’assemblage des communautés.

► Taxonomie systématique et phylogénie ► Génétique des populations et phylogéographie ► Biologie de l’adaptation : génétique, génomique et traits d’histoire de vie ► Écologie des populations et des communautés

Groupes de réflexion

Projets génomique/transcriptomique

Projets obtenus ou prévus en 2014 : 12 pour du séquençage de génomes, 13 pour du transcriptome, 4 pour des profils d’expression, 17 pour du génotypage par séquençage, 14 pour des amplicons, 8 pour de la capture 5 pour des séquençages de grands fragments.

BioinformatiqueDéveloppement de logiciels

– Génétique des populations– Analyse bioinformatique

Analyse de séquences_ génomique_transcriptomique

Infrastructure informatiqueCalcul : Cluster de 400 cœurs

Stockage : 40 To

Transcriptomique

Comparaison de deux populations de la processionnaire du pin (ThaumetopoeaPityocampa).

Bernhard Gschloessl a,*, Heiko Vogel b, Christian Burban c, David Heckel b, Réjane Streiff a, Carole Kerdelhué

transcriptomique

ModèlesPyraleProcessionnaire du

pain

Données Illumina :

Outils d’assemblageOasesTrinity