fondé en 2001 (1996/2001) Réseau international pour la biodiversité

fondé en 2001 (1996/2001)

Réseau international pour la biodiversité

But:Rendre les données scientifiques et les informations relatives à la biodiversité libres et disponibles, de façon durable, sous forme digitalisée à travers Internet.

GBIF

Bases du GBIF Pas de base de données centrale, mais des bases

“éparpillées”

Les données restent dans les bases d'originecontrôle total du fournisseur des données (Provider) concernant la mise à disposition des données

Le provider décide lui-même des parties des collections accessibles au travers du GBIF

L'accès au données se fait par l'intermédiaire d'un portal de recherche central

Déroulement d'une recherche dans le réseau GBIF

?

Utilisateur

Portail de recherche

EnregistrementIndex

!

http/html

ABCD

ODBC

Achillea atrata

Schéma de données ABCD Access to Biological Collection Data:

Schéma de données basé sur XML

pour la structuration de différents types de collections biologiques (vivant/conservé/observations,botanique/zoologie, marin/terrestre)

Description complète des informations relatives aux collections(version actuelle: 1055 champs de données)

Standard TDWG, actuellement v2.06

Provider-Software (“Wrapper”)Banques de données hétérogènes concernant:- Système de BD (Access, SQL-Server, mySQL, Postgres, ...)- Modèle de données- Étendue/Qualité des données- Degré d'atomisation

Collection A

Collection B Collection C

Collection D

Portal de recherche 1

Wrapper

Portail de recherche 2

ABCD

Conditions essentielles pour la connexion au GBIF

Bases de données compatibles SQL: Access, mySQL, Oracle, Microsoft SQL Server, dBase, Postgres, FireBird, InterBase, Sybase,

FoxPro

Un serveur connecté en permanence à l'internet (Apache, Microsoft Internet Information Server)

Installation du Provider-Software (Wrapper)

Étapes de la connexion Installation du provider software (“Wrapper”)

Préparation de la base de données pour la publication (au besoin: transformation des données, création d'une copie avec les données à publier)

Configuration du Wrapper: application de la structure de la base de données aux éléments du schéma ABCD

Test de la nouvelle installation

Inscription de la nouvelle installation

HelpdeskGBIF-France vous soutient pour:

les questions d'ordre général et ambiguïtés rencontrées

la préparation de la base de données pour la publication

l'installation et la mise en place du provider software

la configuration

par

aide téléphonique ou email

configuration à distance

soutien à domicile

Hébergement

Hébergement d'une collection au travers d'une institution ayant une infrastructure pré-existante

Inconvénient:Perte du contrôle direct sur la collection

Ce que GBIF ne peut pas faire

Prendre en charge les enregistrements digitalisés de collections (images, vidéos, sons...)

Fournir un accès internet à une collection

MAIS: Le développement de portails de recherche spécifiques (contenu et forme) est possible

Contacts

Support technique européen:Support technique français:

Adil El Filali & Patricia Kelbert

GBIF-France / Point Nodal

12 rue Cuvier

75 005 Paris

elfilali@gbif.fr

kelbert@gbif.fr

Tel: 01 44 27 49 84

Jörg Holetschek

Botanischer Garten & Botanisches Museum

Abteilung Biodiversitätsinformatik & Labors

Königin-Luise-Straße 6-8

14191 Berlin-Dahlem

j.holetschek@bgbm.org

Tel. 0049 308 38 50 150