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fondé en 2001 (1996/2001) Réseau international pour la biodiversité But: Rendre les données scientifiques et les informations relatives à la biodiversité libres et disponibles, de façon durable, sous forme digitalisée à travers Internet. GBIF. Bases du GBIF. - PowerPoint PPT Presentation
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fondé en 2001 (1996/2001)
Réseau international pour la biodiversité
But:Rendre les données scientifiques et les informations relatives à la biodiversité libres et disponibles, de façon durable, sous forme digitalisée à travers Internet.
GBIF
Bases du GBIF Pas de base de données centrale, mais des bases
“éparpillées”
Les données restent dans les bases d'originecontrôle total du fournisseur des données (Provider) concernant la mise à disposition des données
Le provider décide lui-même des parties des collections accessibles au travers du GBIF
L'accès au données se fait par l'intermédiaire d'un portal de recherche central
Déroulement d'une recherche dans le réseau GBIF
?
Utilisateur
Portail de recherche
EnregistrementIndex
!
http/html
ABCD
ODBC
Achillea atrata
Schéma de données ABCD Access to Biological Collection Data:
Schéma de données basé sur XML
pour la structuration de différents types de collections biologiques (vivant/conservé/observations,botanique/zoologie, marin/terrestre)
Description complète des informations relatives aux collections(version actuelle: 1055 champs de données)
Standard TDWG, actuellement v2.06
Provider-Software (“Wrapper”)Banques de données hétérogènes concernant:- Système de BD (Access, SQL-Server, mySQL, Postgres, ...)- Modèle de données- Étendue/Qualité des données- Degré d'atomisation
Collection A
Collection B Collection C
Collection D
Portal de recherche 1
Wrapper
Portail de recherche 2
ABCD
Conditions essentielles pour la connexion au GBIF
Bases de données compatibles SQL: Access, mySQL, Oracle, Microsoft SQL Server, dBase, Postgres, FireBird, InterBase, Sybase,
FoxPro
Un serveur connecté en permanence à l'internet (Apache, Microsoft Internet Information Server)
Installation du Provider-Software (Wrapper)
Étapes de la connexion Installation du provider software (“Wrapper”)
Préparation de la base de données pour la publication (au besoin: transformation des données, création d'une copie avec les données à publier)
Configuration du Wrapper: application de la structure de la base de données aux éléments du schéma ABCD
Test de la nouvelle installation
Inscription de la nouvelle installation
HelpdeskGBIF-France vous soutient pour:
les questions d'ordre général et ambiguïtés rencontrées
la préparation de la base de données pour la publication
l'installation et la mise en place du provider software
la configuration
par
aide téléphonique ou email
configuration à distance
soutien à domicile
Hébergement
Hébergement d'une collection au travers d'une institution ayant une infrastructure pré-existante
Inconvénient:Perte du contrôle direct sur la collection
Ce que GBIF ne peut pas faire
Prendre en charge les enregistrements digitalisés de collections (images, vidéos, sons...)
Fournir un accès internet à une collection
MAIS: Le développement de portails de recherche spécifiques (contenu et forme) est possible
Contacts
Support technique européen:Support technique français:
Adil El Filali & Patricia Kelbert
GBIF-France / Point Nodal
12 rue Cuvier
75 005 Paris
Tel: 01 44 27 49 84
Jörg Holetschek
Botanischer Garten & Botanisches Museum
Abteilung Biodiversitätsinformatik & Labors
Königin-Luise-Straße 6-8
14191 Berlin-Dahlem
Tel. 0049 308 38 50 150
