Gérer ses références bibliographiques avec Zotero Formations Doctorales Nantes (Sciences) 18...

Gérer ses références bibliographiques avec Zotero

Formations Doctorales Nantes (Sciences)

18 février 2011SCD / URFIST Bretagne et Pays de la Loire

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Quels besoins ?

Importer automatiquement des lots de références résultant de recherches documentaires (bases de données ou pages web)

Exploiter facilement de gros corpus de références

Récupérer ses références pour la rédaction d’un travail scientifique, pour établir une bibliographie, un produit documentaire spécifique (liste des publications d’un établissement, etc.)

Appliquer à ses références un style de présentation conforme aux normes

Faire une saisie unique des données et adapter ensuite en fonction de la publication à éditer

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Que peut-on faire avec Zotero ?

… Etc.

Bibliographie

1__________2__________3__________4__________5__________

Article avec citations et bibliographie

Pages web

Base Zotero de références

biblio en ligne, groupes

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Travailler avec Zotero

Qu’est-ce que Zotero ?

Comment installer Zotero ?

L’interface de travail

Importer des références

Créer et manipuler des références

Classer, organiser, gérer ses références

Gérer les documents correspondant aux références

Choisir un style et produire une bibliographie

Utiliser zotero en travaillant sur un traitement de texte

Exporter ses références

Synchroniser ses références

Partager ses références et travailler à plusieurs

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Qu’est-ce que Zotero ?

Téléchargement de la version 2.0.9 synchronisation et accès

aux références en ligne via un serveur Avec Firefox 3

Maintenant : « Zotero Everywhere »

Zotero indépendant API / gestion web et

mobiles de bibliothèques zotero

« Zotero Commons »

Une extension (plugin) de Firefox À partir de la version 2 de

Firefox

Open source : logiciel libre et gratuit

Lancé en octobre 2006 par le Centre for History and New Media) de l’Université  George Mason (USA)

Soutenu par divers organismes, dont la Andrew W. Mellon Foundation

Un outil de gestion de références et de signets

Site de référence : http://www.zotero.org

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Qu’est-ce que Zotero ?

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Fonctionnalités de Zotero

Zotero permet principalement de :

Constituer sa base personnelle de références en saisissant ou important les données

Annoter ses références Trier, classer ses références et organiser sa base Rechercher des références précises dans sa base Gérer le texte intégral Produire automatiquement sa bibliographie dans un style donné Récupérer des références pour intégrer des citations et sa

bibliographie en rédigeant sur un traitement de texte Exporter ses références

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Fonctionnalités de Zotero

Depuis la version 2, Zotero permet notamment :

D’accéder à sa base de références où qu’on soit De détecter automatiquement les métadonnées PDF D’enrichir les notes De créer des groupes De diffuser et partager sa base de références De suivre d’autres personnes sur le serveur Zotero (Zotero

People) D’ajouter des styles depuis le gestionnaire de styles

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Quelques ressources sur Zotero

Le site de Zotero, http://www.zotero.org En particulier fr/quick start guide

Le blog francophone de Zotero, http://zotero.hypotheses.org Les tutoriels de Julien Sicot, sur Vimeo, http://vimeo.com/ et bientôt sur

Formadoct, http://guides-formadoct.ueb.eu/ Manuel Zotero (Hospices Civils de Lyon),

http://portaildoc.chu-lyon.fr/hcldoc/uploads/media/manuel_Zotero.pdf Fiche Zotero / ECLORE, http://www.projet-plume.org/ressource/eclore FAQ Zotero / URFIST de Nice,

http://wiki-urfist.unice.fr/wiki_urfist/index.php/ZOTERO_un_Logiciel_de_bibliographie_2.0

La rubrique Zotero, sur la « Boîte à outils des historiens », http://laboiteaoutils.blogspot.com/search/label/Zotero

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Installer Zotero (v. 2)3 possibilités :

A partir de la page http://www.zotero.org À partir de la page https://addons.mozilla.org/fr/firefox/ Sous Firefox, à partir du menu Outils > Modules

complémentaires

À utiliser avec Mozilla Firefox, version 2, ou 3 pour zotero 2.0

Citation pendant la rédaction : Installation complémentaire du module d’interfaçage avec le

traitement de texte (Word et Open Office)

Après l’installation de Zotero : redémarrer Firefox Icône Zotero en bas à droite de l’écran (réduire ou développer) +

Menu Outils > Zotero

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Installer / activer Zotero (v. 2)

Activation / désactivation de Zotero

Menu « Outils > Modules complémentaires » de Firefox

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Installer / activer Zotero (v. 2)

Pour utiliser un autre logiciel bibliographique : Utiliser les Préférences >

Générales Décocher « Utiliser

Zotero… » Cliquer sur « Mettre à jour

maintenant »

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Premières références Zotero

Récupération de références

Ex : requête « thérapie cellulaire» sur le SUDOC, (http://www.sudoc.abes.fr/)

Récupération d’un lot de références : cliquer sur le dossier

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Premières références Zotero

Récupération de références

Sélectionner les références que l’on souhaite récupérer

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Premières références Zotero.

Récupération de références

Références récupérées dans Zotero

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L’interface de travail de Zotero

L’interface de Zotero : en 3 panneaux

La bibliothèque et ses collections

La liste des références d’une collection donnée

Le détail de la référence sélectionnée

+ la barre d’outils et le panneau des marqueurs

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L’interface de travail de Zotero

Bibliothèque et ses

collections

Liste des signets / références

Une référence

Panneau des

marqueurs

+ Requêtes

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L’interface de travail de Zotero

La barre d’outils

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L’interface de travail de Zotero

La barre d’outils Créer une nouvelle collection (ou une sous-collection)

Créer un nouveau groupe

Actions : Importer, exporter une bibliothèque, créer une chronologie, gérer les préférences …

Nouvel élément : créer un type de document et faire le lien vers le fichier de texte intégral

Créer un nouvel élément à partir de la page courante = à partir de la page ouverte dans le navigateur en utilisant les métadonnées du site; une capture d’écran est liée à la notice

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L’interface de travail de Zotero

Créer une référence à partir de l’identifiant du document (ISBN, DOI ou PMID)

Créer une note Indépendante Liée à une référence

Attacher Une capture de la page

courante Le lien vers la page

courante Une copie d’un fichier Le lien vers le fichier

Recherche dans la base Recherche avancée Boîte de recherche simple

Synchronisation des données avec le serveur Zotero

Passage en mode plein écran

Fermeture de l’interface Zotero

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L’interface de travail de Zotero

Actions > Préférences dans la barre d’outils

1er onglet : Préférences générales

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L’interface de travail de Zotero

Actions > Préférences dans la barre d’outils

2ème onglet : Sync, pour synchroniser les données de la bibliothèque sur le serveur Zotero et créer une bibliothèque en ligne

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L’interface de travail de Zotero

Actions > Préférences dans la barre d’outils

3ème onglet : Recherche, pour l’indexation et la gestion des documents en texte intégral

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L’interface de travail de Zotero

Actions > Préférences dans la barre d’outils

4ème onglet : Exportation, pour paramétrer les options de copie rapide et l’encodage des caractères

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L’interface de travail de Zotero

Actions > Préférences dans la barre d’outils

5ème onglet : Styles, pour choisir les styles à afficher par défaut dans le gestionnaire de bibliographie

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L’interface de travail de Zotero

Actions > Préférences dans la barre d’outils

6ème onglet : pour définir des proxies

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L’interface de travail de Zotero

Actions > Préférences dans la barre d’outils

7ème onglet : Raccourcis clavier

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L’interface de travail de Zotero

Actions > Préférences dans la barre d’outils

8ème onglet : Préférences avancées

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Importer des références Sites « Zotero compatibles » :

voir http://www.zotero.org/translators ex : ScienceDirect, Google Scholar et Books, Amazon,

Revues.org, Citeseer, Bases Ebsco Host, SUDOC … Plateformes de partage de références comme CiteUlike Icone dans la barre d’adresse

Sites partiellement compatibles (ex : HAL)

Récupération sur les sites compatibles de références multiples (en cliquant sur le dossier jaune

dans barre d’adresse)

référence par référence (en cliquant sur l’icône de document)

Source des images :

Maire - AgroParisTech-Engref, Montpellier

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Importer des références

Import d’un ensemble de références

Import de références individualisées

Alimenter la base en choisissant diverses sources

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Des problèmes pour récupérer les références ? Problème :

Pas d’icône zotero dans la barre d’adresse Échec de l’enregistrement

Ex : Dans ScienceDirect

Une solution : Voir si l’import par référence individuelle fonctionne Sinon :

Enregistrer les résultats sous forme d’un fichier au format RIS ou BibTeX

Importer ensuite le fichier dans Zotero Si dans les Préférences, on a coché « Utiliser Zotero pour les

fichiers RIS/ Refer téléchargés », on aura un import automatique dans Zotero

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Des problèmes pour récupérer les références ?

Possibilité de créer la référence à partir du fichier PDF Sauvegarder le fichier PDF en

local

Le faire glisser dans la bibliothèque Zotero

Le sélectionner et choisir dans le menu contextuel (clic droit) : «  Récupérer les métadonnées du PDF »

La référence est créée

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Premières références Zotero.

Récupération de références

Récupération du fichier PDF associé à la référence

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Importer des références

Références de pages web

Création d’un élément à partir de la page web courante (métadonnées)

Capture d’écran État de la page à un

moment donné

Choisir la collection adéquate

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Importer des références

Références de pages web

Attacher à une référence existante :

Une capture de la page courante

Un lien vers la page courante

La copie d’un fichier local Le lien vers un fichier

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Manipuler les captures de pages webIl est possible d’annoter et de surligner les captures web

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Importer des références

Importer des fichiers de références depuis d’autres logiciels

Ex : formats RIS, bibteX

Utiliser le menu Actions > Importer, après avoir fait une procédure d’export de fichier sous l’autre outil bibliographique

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Créer et manipuler des références

Une référence complète : onglet info

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Créer et manipuler des références

Créer une nouvelle référence

40

Créer et manipuler des références

La référence

Onglet Info = les différents éléments de la référence Localiser : résolveur de lien Afficher … : la capture d’écran, le fichier, la page

Onglets Marqueurs = possibilité d’apposer des tags (mots clés libres) sur une référence

Onglet Connexe = possibilité de faire un lien entre deux éléments (référence, notes)

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Créer et manipuler des références

La référence

Bouton « Afficher » / Onglet Info Afficher : Afficher le fichier, Afficher la page ou la capture

d’écran liés à une référence

Bouton « Localiser » / Onglet Info Pour lancer le résolveur de lien OpenURL à partir des

données bibliographiques de l’élément Voir les préférences générales de Zotero pour le

paramétrage du serveur de résolution

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Créer et manipuler des références

Menu déroulant

34 types de références

Les types de référence

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Créer et manipuler des références Ensemble de champs pour chaque type de

référence

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Créer et manipuler des références

Entrée manuelle de nouveaux éléments et / ou modification des éléments importés

Zone de modification des éléments

45

Créer et manipuler des références

Modifier une référence

Modification d’un champ

Ajout de données supplémentaires

46

Classer, organiser, gérer ses références Ma bibliothèque

Contient toutes les références

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Classer, organiser, gérer ses références

Gestion des collections de la bibliothèque Créer une collection /

des sous-collections Nouvelle sous-

collection Renommer la collection Supprimer la collection Exporter la collection Classer les références

Clic droit

C’est la collection sélectionnée qui reçoit les références importées Déplacement d’éléments par glisser-

déposer dans une collection

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Classer, organiser, gérer ses références

Gestion de la base personnelle

Modification de référencesGestion du texte intégralRecherche dans la baseTri des noticesAjout de notes de lectureAjout de tags (marqueurs)Export de la bibliothèque de référencesLien de deux notices

49

Classer, organiser, gérer ses références Enrichir ses références : annoter ses collections de

références Ajouter un tag

Afficher les tags et rechercher

par tag

50

Classer, organiser, gérer ses références

Créer une note indépendante ou liée à une référence

Zone de création de la note

51

Classer, organiser, gérer ses références

Capturer la page courante : page figée

Enregistrer le lien vers la page courante : l’URL de la page

Stocker une copie du fichier : lien plus pérenne (stockage dans un sous-répertoire du dossier système de zotero

Lien vers un fichier : lien vers fichier stocké en local (Mes documents, bureau)

52

Classer, organiser, gérer ses références Recherche dans la bibliothèque de

références

Fenêtre de recherche avancée,

accessible par la barre

d’outils

Possibilité d’enregistre

r la recherche

53

Classer, organiser, gérer ses références

Créer une chronologie Menu Actions

54

Exporter la bibliothèque

Menu Actions > Exporter la bibliothèque

Formats d’export : Zotero RDF, MODS, RIS,

Refer / BibiX, Unqualified Dublin Core RDF, Wikipedia Citation Templates, BibTeX

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Produire une bibliographie

Création d’une bibliographieÀ partir d’une collection donnée, d’une sous-

collection, d’éléments sélectionnés.Formatage dans un style donné (styles par

défaut + page Repository pour les styles : http://www.zotero.org/styles )

Passerelle avec les traitements de texteAvec Word et Open OfficeChoix d’un style Insertion de citationsGénération de la bibliographie

56

Produire une bibliographie

Générer automatiquement une bibliographie

En utilisant le menu contextuelà partir de la collection souhaitée (clic droit) :« Créer une bibliographie… »

57

Produire une bibliographie

Formater sa bibliographie Utilisation des styles fournis par Zotero

Enregistrement en format RTF ou HTML

Voir dans les préférences le style par défaut

58

Produire une bibliographie Styles Zotero

Choix de styles par défaut dans l’interface (17 styles)

Voir aussi http://www.zotero.org/styles Possibilité d’installer d’autres styles Aperçu du style en positionnant la souris sur le lien

Pas d’interface graphique de modification ou de création de style

Création de style avec le langage CSL Le générateur CSL de Zotero :

chrome://zotero/content/tools/csledit.xul Utilisation possible aussi de Simple Style Generator

http://www.somwhere.org/csl/ Projet de styles francophones de Zotero : https://

www.zotero.org/trac/ticket/1216

59

Produire une bibliographie

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Produire un rapportOption du menu contextuel : « générer un rapport à partir de la collection »

61

Utiliser Zotero dans Word ou Open Office

Plugin spécifique pour installer la barre d’outils Zotero dans le traitement de texte

Lié aux versions du système d’exploitation et du traitement de texte

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Utiliser Zotero dans Word ou Open Office Citer dans un traitement de texte depuis Zotero

Barre d’outils Zotero dans

Word

Editer une

référence

Insérer une référence

Créer la bibliographie

Editer la bibliograph

ie

Modifier les préférences du document

Rafraîchir l’affichage

des références

Supprimer les codes

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Utiliser Zotero en ligne

Version 2.0

Création d’un compte sur le serveur Zotero Accès à My Library Groupes Zotero People

Possibilité de synchroniser ses références

Partage des références

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Utiliser Zotero en ligne

Nouvelles fonctions collaboratives : Zotero 2.0La synchronisation :

Synchronisation de la bibliothèque / serveur Zotero

Sauvegarde et consultation en ligne via le site web et compte utilisateur zotero

Synchronisation des documents attachés avec un serveur WebDav

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Utiliser Zotero en ligneBouton de synchronisation

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Utiliser Zotero en ligne

Synchronisation des données

Paramétrage de la synchronisation

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Utiliser Zotero en ligne

La bibliothèque en ligne

Gratuit jusqu’à 100mb

Attention : problème des PDF partagés en public

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Utiliser Zotero en ligneCréation de groupes

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Utiliser Zotero en ligne

Paramétrage du groupe

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Utiliser Zotero en ligne Définition du groupe :

Nom Description Statut Disciplines concernées Logo, image Page web Commentaires

Gestion des membres

Options pour la gestion de la bibliothèque

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Utiliser Zotero en ligne

Un exemple de bibliothèque de groupe

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Utiliser Zotero en ligne

Groupes Zotero

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Utiliser Zotero en ligne Création de groupes

privés ou publics / interaction avec les bibliothèques propres à des groupes définis

Réseaux de personnes

Intégration de groupes publics et / ou suivi de bibliothèques publiques par flux RSS

Bibliothèque du groupe