7 avril 2010

Mise en œuvre et usages de l’outil de cartographie : intérêts et limites pour la lutte contre le choléra

l’exemple de la République de Guinée (2009-2010)

Implementation and use of cartography tools :Avantages and limits for the fight against cholera as used in Guinea (2009-2010)

7 avril 2010

Conakry

Dabola

Dalaba

Fria

Gaoual

Kindia

Koubia

Kouroussa

Macenta

Tougué

Yomou

Boké

Mali

Koundara

PitaTélimélé

Boffa

Dubréka

Coyah

Forécariah

LéloumaLabé

Mamou

DinguirayeSiguiri

Kerouané

Kankan

Mandiana

Faranah

Kissidougou

Geckedou

N'Zerekoré

Lola

Beyla

UMR CNRS 6249

Div. Prévention et Lutte contre la MaladieMinistère de la Santé et de l’Hygiène PubliqueRépublique de Guinée

Boffa-Centre

Colia

Douprou

Lisso

Mankountan

Tougnifili

Bintimodia

Boké-Centre

Dabiss

Kamsar

Kolaboui

Malapouyah

SangarédiTanéné (B)

Kanfarandé

Sansalé

Koba (B)

CAPITALISATION DES EXPERIENCES SOUS-REGIONALES DE LUTTE CONTRE LE CHOLERA POUR L’ELABORATION D’UN GUIDE PRATIQUE DE PREPARATION ET DE REPONSE AUX EPIDEMIES DAKAR – AVRIL 2010

1.1 Présentation des outils /contexteOverview of tools/context

Guinée : façade littorale & Contrastes géographiquesCoast and geographic profil & contrasted climats

! en Afrique de l’ouest côtière, Guinée = un « élément cartographique » côtier …Un ensemble complexe affecté par le choléra(Guinea is only one element in a complex sub-regional cholera epidemiology)

Fait avec Philcarto * 03/04/2008 22:56:21 * http://philgeo.club.fr

Y_1976 1 point = 2.86


Y_1976 1 point = 2.86


Y_1976 1 point = 2.86


Y_1976 1 point = 2.86

0200040006000

1970 1980 1990 2000 2010

Cote d'Ivoire

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1970 1980 1990 2000 2010

Guinée

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1970 1980 1990 2000 2010

Guinée-bissau

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Sénégal

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Sierra Leone

cas


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Liberia

cas


SENEGAL

MALI

COTE D’IVOIRE

LIBERIA

S.LEONE

GUINEE

GUINEE-BISSAU

1970 1980 1990 2000 2010

WORLD HEALTH ORGANIZATION Global Task Force on Cholera Control [CHOLERA COUNTRY PROFILE (2010)]

Guinée Bissau

Pays / Régions (n=5) / Préfectures (n=38) / Sous-préfectures (n > 300)En zone urbaine : Quartiers / secteurs (urban settings : quarters, sectors)

Nécessité d’analyse à des échelles complémentaires (temps et espace)A clear need of complementary studies with different scales of time and space

Conakry

Dabola

Dalaba

Fria

Gaoual

Kindia

Koubia

Kouroussa

Macenta

Tougué

Yomou

Boké

Mali

Koundara

PitaTélimélé

Boffa

Dubréka

Coyah

Forécariah

LéloumaLabé

Mamou

DinguirayeSiguiri

Kerouané

Kankan

Mandiana

Faranah

Kissidougou

Geckedou

N'Zerekoré

Lola

Beyla

1.2 Présentation des outils /contexteGeneral presentation of tools/context

Préfectures (n=38)

Taux d’incidence cumulée pour 10 000 hab.

Répartition de la maladieDécoupage préfectoralGeographic pattern of cholera(prefectoral scale)

Profondeur temporelle suffisante pour dégager les caractéristiques épidémiologiques.

We need a longer temporal period in order to obtain a better understanding of cholera epidemiological characteristics

Taux d’incidence cumulée pour 10 000 hab.

Répartition de la maladieDécoupage préfectoralGeographic pattern of cholera(prefectoral scale)

Les principaux problèmes :(Main difficulties)

Archivage(records) Accessibilité des données « papier »(availability of registers under paper format) Sous-notification/complétude interne(Under notification and internal quality of recorded data)

Boffa-Centre

Colia

Douprou

Lisso

Mankountan

Tougnifili

Bintimodia

Boké-Centre

Dabiss

Kamsar

Kolaboui

Malapouyah


Kanfarandé

Sansalé

Koba (B)

Boffa-Centre

Colia

Douprou

Lisso

Mankountan

Tougnifili

Bintimodia

Boké-Centre

Dabiss

Kamsar

Kolaboui

Malapouyah


Kanfarandé

Sansalé

Koba (B)

Boffa-Centre

Colia

Douprou

Lisso

Mankountan

Tougnifili

Bintimodia

Boké-Centre

Dabiss

Kamsar

Kolaboui

Malapouyah


Kanfarandé

Sansalé

Koba (B)

2005

2006

2007

Boffa-Centre

Colia

Douprou

Lisso

Mankountan

Tougnifili

Bintimodia

Boké-Centre

Dabiss

Kamsar

Kolaboui

Malapouyah


Kanfarandé

Sansalé

Koba (B)

2008

boke_boffa_TA by TA_2008

10 to 100 (2)5 to 10 (1)1 to 5 (1)0,1 to 1 (1)0 to 0,1 (13)


10 to 100 (2)5 to 10 (2)1 to 5 (6)0,1 to 1 (2)0 to 0,1 (6)


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10 to 100 (4)5 to 10 (2)1 to 5 (2)0,1 to 1 (1)0 to 0,1 (9)

Taux d’incidence cumulée annuelle pour 10 000 hab. pour les sous-préfectures des préfectures littorales de Boké et Boffa.

N

60 km

Un exemple de changement d’échelle : Focus sous-préfectoralPref. de Boke et Boffa

Geographic pattern of cholera(sub-prefectoral scale)Boke and Boffa

Boffa-Centre

Colia

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Mankountan

Tougnifili

Bintimodia

Boké-Centre

Dabiss

Kamsar

Kolaboui

Malapouyah


Kanfarandé

Sansalé

Koba (B)

Boffa-Centre

Colia

Douprou

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Mankountan

Tougnifili

Bintimodia

Boké-Centre

Dabiss

Kamsar

Kolaboui

Malapouyah


Kanfarandé

Sansalé

Koba (B)

Boffa-Centre

Colia

Douprou

Lisso

Mankountan

Tougnifili

Bintimodia

Boké-Centre

Dabiss

Kamsar

Kolaboui

Malapouyah


Kanfarandé

Sansalé

Koba (B)

2005

2006

2007

Boffa-Centre

Colia

Douprou

Lisso

Mankountan

Tougnifili

Bintimodia

Boké-Centre

Dabiss

Kamsar

Kolaboui

Malapouyah


Kanfarandé

Sansalé

Koba (B)

2008


10 to 100 (2)5 to 10 (1)1 to 5 (1)0,1 to 1 (1)0 to 0,1 (13)


10 to 100 (2)5 to 10 (2)1 to 5 (6)0,1 to 1 (2)0 to 0,1 (6)


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10 to 100 (4)5 to 10 (2)1 to 5 (2)0,1 to 1 (1)0 to 0,1 (9)

Taux d’incidence cumulée annuelle pour 10 000 hab. pour les sous-préfectures des préfectures littorales de Boké et Boffa.

N

60 km

Orientations opérationnelles (Fieldwork support)

Aide à la définition de zone d’intervention(a support to define intervention zones)

Implantation d’un système « sentinelle»

(set up « sentinelle » system)

Orientations opérationnelles (Fieldwork support)

Aide à la définition de zone d’intervention(a support to define intervention zones)

Implantation d’un système « sentinelle»

(set up « sentinelle » system)

Un exemple de changement d’échelle : Focus sous-préfectoralPref. de Boke et Boffa

Geographic pattern of cholera(sub-prefectoral scale)Boke and Boffa

2. Quels usages ? Quelles précisions ? Quelles informations à visées opérationnelles ?

Trans-national

National

Régional/préfectoral

Sous-préfectoral

Zone urbaine

Quartier

Epidémiologie MACRO (approche globale: écologie marine, climat, … )Epidemiology MACRO (Integrated and global approach, climat …) /Aide à la décision programme trans-nationaux(Support / orientation of international programs)

Versant recherche / Versant opérationnel

Epidémiologie : étude de la diffusion et cartes thématiques(Epidemiology : spread of outbreak, thematic maps)/Plan de contingence régionaux (contengency plan)

Epidémiologie MESO : facteurs environnementaux (Epidemiology MESO : environmental factors)(météorologie, biologie marine, prélvmts environnementaux, microbiologie, …) / Pré-positionnement , recherche des populations à risque, « site sentinelle » sur la zone littorale(Risk factors, target populations for prevention, early warning system : e.g. costal points)

Epidémiologie MICRO en zone urbaine : dynamique de distribution des cas, étude des facteurs de risques, recherche de cluster(Epidemiology MICRO : urban settings , dynamic of outbreak, risk factors, cluster identification)/ Prévention, orientation des activités de riposte (sensibilisation, CTC, stocks, ….)(position of treatment center, register, follow-up, prevention …)

Projet de préparation aux épidémies de choléra. Conakry, Guinée.

UMR CNRS 6249

Taux d’incidence du choléra 2007 à Conakry (Guinée) Analyses préliminaires (preliminary analyses)

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Taux d'incidence du choléra pour 10 000 hab.Conakry - Rep. de Guinée. Année : 2007.

80 to 140 (4)60 to 80 (4)40 to 60 (3)20 to 40 (12)0,1 to 20 (70)0 to 0,1 (4)

Boulbinet 1 Hamdallaye 2 54Manquepas 2 Hamdallaye 1 53Sandervalia 3 Hamdallaye Mosquée 42kouléwondy 4 Taouyah 55Almamya 5 Ratoma Dispensaire 56Téminétaye 6 Ratoma Centre 57Sans Fil 7 Dar Es Salam_r 60Coronthie 8 Koloma 2 59Tombo 9 Koloma 1 76

Kipé 58Lansébounyi 10 Kaporo Rails 77Coléah Domino 12 Kaporo Centre 78Coléah Centre 15 Nongo 79Coléah Imprimerie 16 Simbaya Gare 80Coléah Cité 14 Sangoyah Mosquée 88Mafanco Centre 17 Wanindara 89Mafanco 19 Lambandji 90Madina Centre 18 Kobaya 91Madina Cité 20 Sonfonia Centre 97Madina Ecole 23 Sonfonia Gare 96Boussoura 25 Yattayah 92Madina Mosquée 24Madina Marché 22 Dabondy 1 45Touguiwondiy 36 Dabondy Rails 52Matam Lido 35 Dabondy 3 49Matam 37 Dabondy 2 50Bonfi 48 Gbessia Port 2 67Bonfi Marché 47 Gbessia Port 1 66Carrière 38 Gbessia Centre 65Hermakono 46 Gbessia Cité 1 63

Dabondy Ecole 51Cameroun 11 Gbessia Cité 3 62Camayenne 13 Dar Es Salam_m 61Landréah 21 Gbessia Ecole 68Dixinn Port 28 Gbessia Cité 2 64Dixinn Mosquée 27 Gbessia Cité de l'Air 69Dixinn Centre 2 30 Béhanzin 70Dixinn Rails 26 Tanéné Marché 71Dixinn Gare 31 Tanéné Mosquée 72Belle Vue Ecole 32 Camp Alpha Yaya Diallo 75Dixinn Centre 1 29 Yimbaya Permanence 74Kénien 34 Yimbaya Ecole 73Hafia Mosquée 39 Yimbaya Tannerie 82Hafia 2 43 Simbaya 2 83Belle Vue Marché 33 Simbaya 1 81Hafia 1 40 Matoto Centre 85Minière 41 Matoto Khabitaya 86Hafia Minière 44 Matoto Marché 84

Sangoyah Centre 87Kissosso 93Tombolia 94Dabompa 95

Commune de Kaloum

Commune de Matam

Commune de Dixinn

Commune de Ratoma

Commune de Matoto

Div. Prévention et Lutte contre la MaladieMinistère de la Santé et de l’Hygiène PubliqueRépublique de Guinée

0 2 4

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Taux d'incidence du choléra pour 10 000 hab.Conakry - Rep. de Guinée. Année : 2007.

80 to 140 (4)60 to 80 (4)40 to 60 (3)20 to 40 (12)0,1 to 20 (70)0 to 0,1 (4)

3 sept - 23 septembre

13 aout - 2 septembre

-

11-30 septembre 12-29 septembre

13-23 octobre

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Ratio des cas de choléra observés/attendusCluster principal et clusters secondaires

3 to 7 (8)1,5 to 3 (7)1 to 1,5 (8)0,5 to 1 (21)0,25 to 0,5 (34)0 to 0,25 (19)

Recherche de cluster /modélisation

Enquête terrain Ménages (households)/Quartiers/cartographie thématique

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Indice environnement sanitaire des quartiersEnquête ACF-E (2010)

7,1 to 9,98 (21)6,02 to 7,1 (17)5,49 to 6,02 (20)4,36 to 5,49 (18)0 to 4,36 (21)

Modélisation du risque à partir des caractéristiques des unités spatiales

Complémentarité(Various strategies of anayses)

Choix raisonné des sites d’interventions Scientific-based choices

Synthesis based on published littérature and results(Conakry : Vibrio cholerae O1, poissons + (Boiro, 2005))

Orientations opérationnelles (work orientation: harbour, coastal areas)

Lieux spécifiques pour la préparation et la prévention• Débarcadères/Ports

• Zones de bras de mer et maraîchages• …

S 23S 23

S 29S 29

S 35S 35

3. Quelles méthodologies pour la confection de cartes ? Quels outils ?

• I/Recueil des fonds de carte (SIG layer for map )

– Sous format papier – Mutualiser les compétences nationales en Guinée (Observatoire National de la Guinée)

(to combine national competences /experiences)

• II/ Recueil des données de santé (record of health data)

– Partenariat avec les autorités sanitaires (Partnership with MoH)

• III/ Etude des facteurs de risques (risk factor analyses)

• Synergie avec les ONG : Enquêtes sur le typologie des quartiers à Conakry par Action Contre La Faim (partnership with non gouvernemental org.)

• Données environnementales ( pluviométrie, réseau hydrographique, réseau d’adduction eau …) (environmental data, precipitation, hydrographic network)

• Etude cas-témoin ciblée sur le début des épidemies à Conakry

4. Quelles contraintes pour la faisabilité ?

• Profondeur temporelle : comprendre l’épidémiologie et valider la modélisation

• Logiciel national pour la cartographie thématique déjà existant mais sous-utilisé(need to supervise Ministery of Health agents in critical administrative positions)

– Healthmapper (WHO) : besoin d’accompagnement individuel à des postes-clé – Mutualiser les compétences nationales (ONRG)

• Cartographie analytique : ? coût des logiciels payants SIG (Mapinfo et Arc GIS), mais des alternatives gratuites existent comme (cost of software but free alternatives exist)

– QGIS (logiciel libre gratuit en Français) ou R pour les analyses– Satscan (recherche de cluster)– Favoriser la formation pour le développement des capacités au long terme

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Somme de précipitation Somme de cas2003 2004 2005 2006 2007

Conakry (pluviométrie/cas)

5. Recommandations

1/ Déterminer les quartiers à risque à Conakry (DPLM, ACF et UNICEF)

2/ Mutualiser les moyens et les compétences (combine competences and supports)

3/ Etudier de l’hypothèse d’un réservoir environnemental /saisonnalité• Institut National de Santé Publique, Centre halieutique de Boussoura, Institut Pasteur de

Kindia, DPLM, ….

4/ Favoriser l’utilisation de la cartographie au sein du système sanitaire => amélioration de la surveillance épidémiologique

– Réaction plus précoce : seuil dans une zone géographique prédéfinie (par exemple Conakry)(to shorten delay of reaction : define a threshold in a geographic zone)

5/ Cartographie/séries temporelles combinée pour les pays au regard du plateau continental guinéen (Guinée-Bissau/Guinée/Sierra Leone et Liberia) => étude de la diffusion des épidémies

Conakry

Dabola

Dalaba

Fria

Gaoual

Kindia

Koubia

Kouroussa

Macenta

Tougué

Yomou

Boké

Mali

Koundara

PitaTélimélé

Boffa

Dubréka

Coyah

Forécariah

Lélouma Labé

Mamou

DinguirayeSiguiri

Kerouané

Kankan

Mandiana

Faranah

Kissidougou

Geckedou

N'Zerekoré

Lola

Beyla

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7 avril 2010