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ENSEIGNEMENTS OBLIGATOIRES - DEUXIEME ANNEE

Biochimie pour biologistes Pour les biologistes, ce cours est composé de 2 cours :

• Le cours 12C002A « Biochimie II », au semestre d’automne, • Le cours 12C002P « Biochimie II, partie Méthodes » (inclus dans le cours Biochimie II

printemps suivi par les chimistes et biochimistes) au semestre de printemps. Ces cours doivent êtres suivis dans leur intégralité pour obtenir les 5 ECTS. La note finale est la moyenne pondérée de deux notes : 1) la note de l’examen de Biochimie II du semestre d’automne (qui compte pour 75%), et 2) la note de l'examen de « Biochimie II, partie Méthodes » au semestre de printemps (qui compte pour 25%). 12C002A Biochimie II Semestre automne Nbe d’heures par semaine 3 Nbe d’heures par année 42 Jours & lieux lundi 9h15-10h / Sciences II, salle A150

vendredi 8h15-10h / Sciences II, salle A300 Mode d’évaluation examen écrit Sessions offertes janvier-février + rattrapage août-septembre Responsable Monsieur H. RIEZMAN – 022.379.6469 – Howard.Riezman@unige.ch

Enseignants Messieurs F. BARJA (cc), M. GOLDSCHMIDT-CLERMONT (pt).

J. GRUENBERG (po), V. OSSIPOW (ce), H. RIEZMAN (po)

Objectifs Ce cours introduit les principes de base de l'enzymologie et du métabolisme

Contenu - Enzymologie - Catabolisme et anabolisme - Photosynthèse - Glycolyse - Respiration cellulaire

Documentation et bibliographie

J. Berg, J.L. Tymoczko, L. Stryer (2006). Biochemistry, 6e edition, W.H. Freeman, New York. ISBN 10-7167-6766X. Compléments par des chapitres choisis.

E-learning https://chamilo.unige.ch/home/courses/12C002/ 12C002P Biochimie II – partie Méthodes Semestre printemps Nbe d’heures par semaine 1 Nbe d’heures par année 14 Jours & lieu lundi 9h15-10h / Sciences II, salle A150 Mode d’évaluation Examen écrit Sessions offertes Juin-juillet + rattrapage août-septembre Responsable Monsieur A. ROUX – 022 379 3532 – aurelien.roux@unige.ch

Enseignants Messieurs Ch. BAUER (cc), J-M. MATTER (mer), A. ROUX (pas),

Contenu - Imagerie cérébrale

- Optogénétique - Microscopie optique - Microscopie électronique - Fractionnement cellulaire

E-learning https://chamilo.unige.ch/home/courses/12C002/

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12B012 BIOINFORMATIQUE Semestre printemps Nbe d’heures par semaine 1 ECTS 1.5 (cours et TP intégrés)

2 (mineure: biologie) Nbe d’heures par année 14

Jour vendredi 08h15 – 09h00 Lieu Sciences III, salle 0019 Mode d’évaluation examen écrit

Sessions offertes juin-juillet + rattrapage août-septembre Responsable Madame F. LISACEK – 022.379.5988 – frederique.lisacek@unige.ch Enseignant(e)s Madame F. LISACEK (mer) et intervenants, N.N

Objectifs Familiarisation avec les outils de bioinformatique les plus couramment utilisés en biologie moléculaire et leur utilisation raisonnée

Contenu

1. La place de la bioinformatique dans la biologie moderne et le rôle central de la notion de séquence (1h)

2. Base de données des séquences de gènes et génomes (2h) 3. Comparaison et recherche dans les bases de données (2h) 4. Données d’expression et de transcriptomes (2h) 5. Données structurales pour les différents types d’ARNs (1h) 6. Séquences protéiques et protéomes (2h) 7. Comparaison et classification (1h) 8. Données structurales pour les protéines (1h) 9. Alignement et phylogénie (2h)

Travaux pratiques intégrés Semestre printemps Nbe d’heures par semaine 1 Jour vendredi 09h15 – 10h00 Nbe d’heures par année 14 Lieu Sciences III, salle 0019 Responsable Madame F. LISACEK – 022.379.5988 – frederique.lisacek@unige.ch Enseignant(e)s Madame F. LISACEK (mer) et intervenants, N.N

Objectifs Compréhension et maîtrise des outils de bioinformatique les plus couramment utilisés en biologie moléculaire

Contenu ∗ Navigation dans les serveurs génériques : NCBI, EBI

∗ Rechercher des informations dans les bases de données de gènes (par ex : GenBank)

∗ Utiliser les outils de visualisation des données de génomique (par ex : EnsEMBL)

∗ Rechercher/identifier des séquences avec BLAST ; comprendre et interpréter les résultats

∗ Utiliser les outils d’alignement de séquences (par ex : ClustalW) ∗ Rechercher des informations dans les bases de données d’expression

(par ex : GEO) ∗ Rechercher des informations dans UniProtKB ∗ Utiliser les ressources pour la classification des protéines (par ex :

Pfam) ∗ Utiliser les outils de construction de phylogénie (par ex : Phylemon2)

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12B010 BIOLOGIE ET SOCIETE I : Les enjeux actuels des sciences

de la vie

Cours obligatoire de 2ème année Bachelor en biologie Cours à choix restreint de 3ème année Semestre automne Nbe d’heures par semaine 2 ECTS 2.5

3 (cours à choix restreint) Nbe d’heures par année 28

Jour mardi 12h15-13h45 Lieu Sciences II, salle A150 Mode d’évaluation examen écrit

Sessions offertes janvier-février + rattrapage août-septembre

Responsables Messieurs B. STRASSER – 022.379.0712 - bruno.strasser@unige.ch & K. KAMPOURAKIS - kostas.kampourakis@unige.ch

Enseignant(e)s Messieurs B. STRASSER (po), K. KAMPOURAKIS (ce), et autres intervenants

Divers Biologie et Société I (semestre d’automne) donne accès au cours Biologie et Société II (semestre de printemps). Le cours 12B010 Biologie et société I : Les enjeux actuels des sciences de la vie du semestre d’automne et le cours 12B011 Biologie et Société II: Analyser les controverses scientifiques du semestre de printemps, doivent être suivis dans leur intégralité pour obtenir 5 ECTS.

Le cours pris comme cours à choix restreint de 3ème année doit être suivi dans son intégralité (semestres d’automne et de printemps) pour obtenir 6 ECTS.

La note finale est alors la moyenne des deux notes des semestres d’automne et de printemps.

Contenu La biologie soulève nombre d’enjeux sociaux, éthiques et politiques qui influencent profondément le développement de la discipline. Ce cours propose une réflexion critique et une mise en perspective de ces enjeux pour mieux comprendre leurs effets sur la biologie contemporaine et le métier de biologiste. Nous aborderons notamment les révolutions intellectuelles (darwinisme, génétique, biologie moléculaire), les concepts clés (l'individu, la population, l'espèce), les controverses publiques (les races humaines, l'eugénisme, la biodiversité, le génie génétique), les questions éthiques (l'expérimentation animale; l'intégrité scientifique), et les pratiques des biologistes (la publication scientifique, le "DIY Biology").

Objectifs à Identifier des enjeux de société posés par la recherche en biologie à Argumenter sur des enjeux éthiques et sociaux de la recherche biomédicale à Analyser des éléments clés des pratiques de recherche en biologie

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12B011 BIOLOGIE ET SOCIETE II: Analyser les controverses

scientifiques Cours obligatoire de 2ème année Bachelor en biologie Cours à choix restreint de 3ème année Semestre printemps Nbe d’heures par semaine 2 ECTS 2.5

3 (cours à choix restreint) Nbe d’heures par année 28

Jour mercredi 12h15-13h45 Lieu Sciences III, salle A150 Mode d’évaluation travail de recherche et présentation orale et écrite d'une analyse de controverse

publique Sessions offertes juin-juillet + rattrapage août-septembre Responsables Messieurs B. STRASSER – 022.379.0712 - bruno.strasser@unige.ch &

K. KAMPOURAKIS - kostas.kampourakis@unige.ch Enseignant(e)s Messieurs B. STRASSER (po), K. KAMPOURAKIS (ce).

Divers Biologie et Société I semestre d’automne est un prérequis pour Biologie et Société II semestre de printemps. Le cours 12B010 Biologie et société I: Les enjeux actuels des sciences de la vie du semestre d’automne et le cours 12B011 Biologie et Société II : Analyser les controverses scientifiques du semestre de printemps, doit être suivi dans son intégralité pour obtenir 5 ECTS.

Le cours pris comme cours à choix restreint de 3ème année doit être suivi dans son intégralité (semestres d’automne et de printemps) pour obtenir 6 ECTS.

La note finale est alors la moyenne des deux notes des semestres d’automne et de printemps.

Contenu Les résultats scientifiques donnent souvent lieu à des controverses publiques impliquant des acteurs très divers. Les téléphones portables sont-ils dommageables pour le cerveau? Les OGM présentent-ils un risque pour la santé? Les analyses génétiques disponibles sur internet sont-elles fiables? Dans ce cours, nous aborderons les différentes méthodes pour analyser ces controverses scientifiques et techniques. Nous discuterons les sources de l’incertitude dans ces controverses et leur place dans une “société du risque”. Les étudiant(e)s réaliseront un travail de recherche sur une controverse, l’analyseront dans un travail écrit et feront une présentation orale.

Objectifs àAnalyser des enjeux de société posés par la recherche en biologie àIdentifier et évaluer des sources d'informations sur des controverses publiques àMettre en relation les différents arguments avec les identités des acteurs àProduire une analyse argumentée originale et convaincante pour expliquer l’issue d’une controverse publique àCollaborer en groupe, répartir le travail et arriver à une conclusion commune àPrésenter une analyse et des arguments par oral et par écrit

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12B013 BIOLOGIE VEGETALE Semestre printemps Nbe d’heures par semaine 2 ECTS 3.5 Nbe d’heures par année 28

Jour & lieu mercredi 14h15-16h Sciences III, salle 1S059

Sessions offertes juin-juillet + rattrapage août-septembre

Mode d’évaluation examen écrit

Responsables Monsieur R. DEGLI AGOSTI - 022.379.0765 – robert.degliagosti@unige.ch Monsieur S. LOUBERY – 022.379.6568 - sylvain.loubery@unige.ch

Enseignants Messieurs R. DEGLI AGOSTI (cc) & S. LOUBERY(cc).

Divers Le cours de biologie végétale est structuré en deux parties (morphologie et physiologie). Le cours doit être suivi avec les TP dans leur intégralité pour obtenir 3.5 ECTS. La participation aux travaux pratiques intégrés est obligatoire pour se présenter à l’examen.

Contenu Partie morphologie et anatomie : • les parois des cellules végétales • les tissus végétaux : types cellulaires, organisation et fonction • les organes végétatifs : la racine, la tige et la feuille • croissance secondaire : le bois

Partie physiologie et biochimie : • transport de l’eau et des solutés dans les végétaux • la photosynthèse : aspects physiologiques et écologiques • perception et réponse à différentes qualités de lumière • les hormones végétales : auxine, gibbérellines, cytokinines, éthylène,

acide abscissique • stress biotique et abiotique

Objectifs Le but de ce cours est de permettre aux étudiant(e)s qui ne se spécialiseront

pas en biologie végétale d'avoir malgré tout une vue d'ensemble des concepts de morphologie et de physiologie végétale.

Travaux pratiques intégrés Semestre printemps Nbe d’heures par semaine 3 Nbe d’heures par année 15

Jours & lieux Morphologie : 14h15-17h15 – salle 0059 (Sciences III) 28.04.2017, 02.05.2017, 09.05.2017, 16.05.2017, 23.05.2017, 30.05.2017

Physiologie : 14h15-17h15 – salle 0059 (Sciences III) 28.02.2017, 03.03.2017, 07.03.2017, 10.03.2017, 04.04.2017, 07.04.2017, 11.04.2017, 25.04.2017

Ces séances ont lieu en coordination avec les travaux pratiques de la Génétique moléculaire (12B017P). Se référer aux calendriers et aux groupes établis A et B lors du premier semestre.

Responsables Physiologie : Monsieur R. DEGLI AGOSTI – 022.379.0765 - robert.degliagosti@unige.ch Morphologie-anatomie: Monsieur S. LOUBERY – 022.379.6568 - sylvain.loubery@unige.ch

Enseignants Monsieur R. DEGLI AGOSTI (cc), Monsieur S. LOUBERY (cc).

Divers La participation à ces travaux pratiques est obligatoire pour se présenter à l’examen.

Contenu Morphologie - anatomie végétale : 3 séances (salle 0059) Physiologie végétale : 2 séances en rotation (salle 0059)

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12B015 BIOSTATISTIQUES II Semestre automne Nbe d’heures par semaine 1 ECTS 2 (cours et TP intégrés) Nbe d’heures par année 14 Jour mercredi 14h15-15h00 Lieu Sciences III – salle 1S059 Mode d’évaluation Le mode d'évaluation sera présenté lors

du 1er cours (contrôles continus + examen)

Sessions offertes janvier-février + rattrapage août-septembre Responsable MonsieurJ.M. NUNES – 022.379.(3683)/(6967),

jose.deabreununes@unige.ch

Enseignant Monsieur J.M. NUNES (ce) Contenu Une approche pratique des statistiques où, à l'aide de R et dans des

contextes biologiques, seront abordés : + Types de variables, leurs distributions, leurs représentations et leur simulation + Modèles linéaires : variables et termes, paramètres et coefficients, ajustement et son interprétation, coefficient de détermination + Tests d'hypothèses, hypothèse nulle, taille d'effet, valeur de p + Validation du modèle et transformations de variables + Table d'analyse de variance + Tests classiques paramétriques et non paramétriques + Multicolinéarité et projection de variables

Objectifs + Identifier les principaux types de variables et les représenter de façon appropriée + Décrire la variabilité d'une variable, identifier des distributions (lois de probabilité) convenables et les simuler. + Formuler explicitement des modèles décrivant des relations entre variables et des hypothèses de recherche et hypothèses nulles associées + Valider un modèle linéaire + Rapporter le résultat d'un modèle linéaire et l'interpréter dans le contexte de l'analyse + Identifier et utiliser des modèles linéaires équivalents aux tests classiques + Comparer des modèles linéaires + Distinguer corrélation et causalité + Construire des modèles linéaires adressant les effets de la multicolinéarité + Présenter et commenter une analyse statistique

Travaux pratiques intégrés Semestre automne Nbe d’heures par semaine 1 Nbe d’heures par année 14 Jour mercredi 15h15-17h

(2 groupes, une semaine sur deux, à convenir lors du 1er cours)

Lieu Sciences III – salle 0019 Enseignant Monsieur J.M. NUNES (ce) et assistants Contenu Ces sessions de travail sur ordinateur sont complètement intégrées au

cours de Biostatistiques II (12B015) et font partie de l'évaluation.

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12B016 DEVELOPPEMENT ANIMAL Semestre printemps Nbe d’heures par semaine 3 ECTS 4 Nbe d’heures par année 42 Jours mardi 8h15 – 10h00 & mercredi 8h – 9h00

Lieu Sciences III – salle 1S081

Mode d’évaluation examen écrit de 4 heures, aucun document autorisé. Sessions offertes juin-juillet + rattrapage août-septembre Responsable Monsieur I. RODRIGUEZ - 022.379.3101 - ivan.rodriguez@unige.ch

Enseignant (e)s Mesdames B. GALLIOT (pas), M. GOTTA (pas), E. NAGOSHI (pa)

Messieurs J. DAL COL (adj. sci.), P. HERRERA (pas), F. KARCH (po), I. RODRIGUEZ (po)

Contenu Objectifs

Les grands principes dirigeant le développement d’invertébrés (mouche, hydre,…) et de vertébrés (des mammifères en particulier) seront discutés. Le cours couvre le développement précoce, embryonnaire, mais également celui de l’individu après la naissance. Un accent est mis sur les similitudes et les différences entre processus développementaux chez diverses espèces. En dehors de l'intégration des données brutes du cours, il est attendu que les étudiants acquièrent la capacité de proposer des expériences pour répondre à des questions précises liées au développement.

12B019 DEVELOPPEMENT VEGETAL Semestre printemps Nbe d’heures par semaine 2 ECTS 3 Nbe d’heures par année 28 Jour mardi 10h15 – 12h

Lieu Sciences III - salle 1S059 Mode d’évaluation examen écrit de 4 heures, aucun document autorisé. Sessions offertes juin-juillet + rattrapage août-septembre Responsable Monsieur L. LOPEZ-MOLINA, - 022.379.3206 -

Luis.LopezMolina@unige.ch

Enseignant (e)s M. GOLDSCHMIDT-CLEMONT (pt), L. LOPEZ-MOLINA (pas), X. PERRET (mer).

Contenu Objectifs

Le cours suivra le cycle de vie d’une plante : germination de la graine, croissance et maturation (racines, feuilles, plastes, tiges et fleurs), gamétogenèse, fertilisation et embryogenèse, menant à la formation d’une nouvelle graine. En dehors de l'intégration des données brutes du cours, il est attendu que les étudiants acquièrent la capacité de proposer des expériences pour répondre à des questions précises liées au développement.

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12B017A GENETIQUE – Génétique générale Semestre automne Nbe d’heures par semaine 3 ECTS 11 (cours + TP + ex.), voir sous

« Divers » Nbe d’heures par année 42

Jours lundi 8h15 -9h

jeudi 8h15 -10h

Lieu Sciences III, salle 1S081 Mode d’évaluation examen écrit – la note finale est la moyenne des notes des examens de

Génétique automne (12B017A) et Génétique printemps (12B017P) examen écrit pour les deux sessions

Sessions offertes janvier-février + rattrapage août-septembre Responsables Monsieur D. PAULI – 022 379 67 55 – daniel.pauli@unige.ch Enseignant Monsieur D. PAULI (ce). Divers Le cours de génétique générale (12B017A) dispensé au semestre

d'automne est rattaché au cours de génétique moléculaire (12B017P) dispensé au semestre de printemps. Les cours 12B017A, 12B017P, les exercices et les TP doivent être suivis dans leur intégralité pour obtenir les 11 ECTS.

Contenu Approfondissement de l’analyse mendélienne Relation génotype-phénotype. Interaction des gènes Liaison et cartographie des chromosomes eucaryotes Mécanisme et fonction des crossing-over chez les eucaryotes Mutations Eléments transposables des eucaryotes Effets épigénétiques Détermination du sexe.

Objectifs Les étudiants devront être capables de: - définir, expliquer et utiliser les concepts principaux. - à partir d’un problème ou de la description d’une situation expérimentale simple, identifier les informations importantes et émettre une hypothèse ou effectuer les déductions. Proposer un moyen de tester cette hypothèse et prédire ce qu’on peut attendre de ce test.

Travaux pratiques intégrés Semestre automne Nbe d’heures par semaine 3 Nbe d’heures par année 30 Jour jeudi 14h15 -17h Lieu Sciences III, salle de TP n° 5050 Mode d’évaluation intégré à l’examen du cours Enseignant Monsieur D. PAULI (ce). Contenu Génétique et embryologie de la mouche Drosophila melanogaster.

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12B017P GENETIQUE - Génétique moléculaire Semestre printemps Nbe d’heures par semaine 3 ECTS 11 (cours + TP + ex.), voir sous

« Divers » Nbe d’heures par année 42

Jours lundi 8h15 -9h mercredi 9h15 -10h jeudi 9h15 -10h

Lieu Sciences III – salle 1S081 Mode d’évaluation examen écrit- la note finale est la moyenne des notes des examens de

Génétique générale (12B017A) et Génétique moléculaire (12B017P) examen oral pour la session de rattrapage

Sessions offertes juin + rattrapage août-septembre Responsable Monsieur D. SHORE - 022.379.6183 - david.shore@unige.ch

Enseignants Messieurs D. BELIN (po), D. SHORE (po), F.STEINER (past) Divers Le cours de génétique moléculaire (12B017P) dispensé au semestre de

printemps est rattaché au cours de génétique générale (12B017A) dispensé au semestre d'automne. Les cours 12B017A, 12B017P, les exercices et les TP doivent être suivis dans leur intégralité pour obtenir les 11 ECTS.

Contenu Bactéries et virus - Mutation - Structure fine du gène - Code génétique - La réplication - Les plasmides - La conjugaison - La transduction - Génomes (D. Belin). Régulation transcriptionnelle chez la bactérie - Circuit de régulation du bactériophage lambda - Les levures : le cycle de vie et la génétique - La recombinaison – Génie-génétique de la levure - Régulation transcriptionnelle des gènes GAL et du type conjuguant chez la levure (D. Shore).

Travaux pratiques intégrés Semestre printemps (6 séances) Nbe d’heures par semaine 4 Nbe d’heures par année 24 Jour Jeudi ou Vendredi 14h00 -18h00

1ère séance (2 et 3 mars 2017) 2ème séance (9 et 10 mars 2017) 3ème séance (16 et 17 mars 2017) 4ème séance (23 et 24 mars 2017) 5ème séance (30 et 31 avril 2017) 6ème séance (6 et 7 avril 2017)

Ces séances ont lieu en coordination avec les travaux pratiques de Biologie Végétale (12B013). Se référer aux calendriers et aux groupes établis A et B lors du premier semestre. Lieu Sciences III – salle de TP n° 0035 Mode d’évaluation examen écrit (avec examen écrit du cours)

1. La participation aux 6 séances de TP est obligatoire. Afin d’obtenir la signature nécessaire pour se présenter à l’examen de Génétique Moléculaire, tous les rapports exigés doivent être rédigés et 1 seul rapport insuffisant est toléré

2. Questions intégrées à l’examen écrit de Génétique moléculaire (12B017P)

Enseignant Monsieur F.STEINER (past)

Contenu Génétique microbienne.

Exercices Semestre printemps Nbe d’heures par semaine 1 Nbe d’heures par année 14 Jour jeudi 8h15 -9h chaque semaine

Lieu Sciences III – salle 1S081

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12B014 PHYSIOLOGIE ANIMALE Semestre automne Nbe d’heures par semaine 3 ECTS 4 Nbe d’heures par année 42 Jours mardi 8h15 -10h00, mercredi 8h15 -9h00 Lieu Sciences III – salle 1S081 Sessions offertes janvier-février + rattrapage août-septembre Mode d’évaluation examen écrit – la note finale comprend aussi la partie sur les travaux

pratiques Responsable Madame M. FRIEDEN – 022.379.5198 maud.frieden@unige.ch Enseignante Madame M. FRIEDEN (mer) Contenu Etude des différents systèmes physiologiques principalement chez

l’Homme. Les systèmes suivants seront étudiés : nerveux, musculaire, respiratoire, cardiovasculaire, digestif, excréteur, endocrinien. Quelques aspects de physiologie comparée seront aussi abordés.

Objectif Le but de ce cours est de permettre aux étudiant(e)s d'avoir une vue

d'ensemble de la physiologie humaine.

12B914 PHYSIOLOGIE ANIMALE – Histologie-Physiologie animale eLE –

Travaux pratiques Semestre automne Nbe d’heures par semaine 3 ECTS 1.5 Nbe d’heures par année 42 Jour mardi 14h15-17h00 Lieu Sciences III - salles de TP 5050 Responsable Madame P. Soulié – 022.379.5215 – Priscilla.Soulie@unige.ch Enseignant Madame P. Soulié (CS) Mode d’évaluation examen oral (qui aura lieu à la fin des TP), dont la note comptera dans la

note finale de l’examen du cours de physiologie animale

Contenu Histologie animale et physiologie animale: 14 séances, dont examen oral

Objectif Le but de ces TP est d’établir le lien entre la structure des organes et leur fonction (histologie), et d’illustrer certains concepts de physiologie.

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12X020 PROGRAMMATION Semestre automne Nbe d’heures par semaine 1 ECTS 3.5 (cours et TP intégrés) Nbe d’heures par année 14 Jour mercredi 12h15-13h Lieu Sciences III – salle A100 Mode d’évaluation examen écrit Sessions offertes janvier-février + rattrapage août-septembre Responsable Monsieur J.-L. FALCONE - 022.379.0204 – jean-luc.falcone@unige.ch Enseignants Messieurs J.-L. FALCONE (cs 2 et ce), J.M. NUNES (ce)

Divers Les évaluations du cours se déroulent sur machine dans les mêmes conditions que les travaux pratiques. Tout matériel, papier ou informatique, est autorisé.

Contenu Ce cours offre une introduction à la programmation, en utilisant le langage Python 3. L’accent est porté sur la rédaction de petits programmes visant à automatiser les tâches répétitives liées au traitement de données scientifiques. En suivant ce cours, les étudiant-e-s devront acquérir les compétences suivantes : (1) Ecrire de petits programmes scientifiques utiles en laboratoire ; (2) Utiliser les structures de contrôles et les structures de donnée les plus courantes; (3) Intéragir et collaborer avec des informaticiens ; (4) Apprendre plus rapidement un second langage de programmation.

Travaux pratiques intégrés

Semestre automne Nbe d’heures par semaine 3 ECTS 2 Nbe d’heures par année 42 Jours jeudi 10h-11h (séance de rattrapage)

vendredi 12h-14h (séance principale) Lieu salle d’informatique au passage Baud-Bovy Mode d’évaluation examens semestriels, voir plus haut Enseignant(e)s Messieurs Th. GOEURY (as) ; P. KUENZLI (as), J. RIO (as). Divers Les travaux pratiques ont lieu sur les ordinateurs à disposition des

étudiant-e-s et sont parfois précédés d'une courte introduction orale de la part des assistants. Les exercices consistent en une mise en œuvre des concepts vus en cours. La participation aux travaux pratiques n'est pas soumise à un contrôle, mais est très vivement recommandée, la programmation ne pouvant réellement être acquise que par la pratique. La séance principale a lieu le vendredi de 12h00 à 14h00; la séance du jeudi est éventuellement utilisée pour les personnes n'ayant pas pu terminer le travail pratique le vendredi.

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12B018A/12B018P SYSTEMATIQUE ET BIODIVERSITE Semestres automne/printemps Nbe d’heures par semaine 3 ECTS 11 (12B018A+12B018P+TP) Nbe d’heures par année 84 Jours semestre d’automne : les lundi 10h15-12h et vendredi 10h15-11h

semestre de printemps : Le cours commence le lundi 20.2.2017 à 10h15, puis le vendredi 24.2 de 10h15-11h00, et ensuite les lundis de 10h15 à 13h00.

Lieu Sciences III, salle 1S081 Mode d’évaluation examen écrit – la note finale est la moyenne des notes des deux cours

12B018A et 12B018P (parties animale et végétale) Sessions offertes janvier-février + juin-juillet - rattrapage

août-septembre

Responsable Partie automne

Monsieur J. PAWLOWSKI - 022.379.3069 - jan.pawlowski@unige.ch Monsieur J. MONTOYA - 022.379.6786 - juan.montoya@unige.ch Partie printemps Monsieur P.-A. LOIZEAU 022.418.5100 – pierre-andre.loizeau@unige.ch

Enseignant(e)s Partie automne

Messieurs J. PAWLOWSKI (pas), J. MARIAUX (pt), J. MONTOYA (ce), L. MONOD (cc) Madame M. HOLZMANN (adj. scientifique) Partie printemps Madame M. PRICE (cc), Messieurs K. PERRON (ce), P.-A. LOIZEAU (cc), Ph. CLERC (cc)

Divers Participation obligatoire aux travaux pratiques.

Le cours de systématique et biodiversité est structuré en deux parties (animale et végétale). Le cours doit être suivi dans son intégralité (12B018A + 12B018P) avec les TP pour obtenir 11 ECTS.

Contenu La 1ère partie (semestre automne – 12B018A) comprend : Systématique, évolution et diversité des protistes et des animaux, Les bases de leur classification phylogénétique L’origine de la symbiose, le parasitisme. Phylogénie, évolution et biodiversité des invertébrés et vertébrés. La 2ème partie (semestre printemps – 12B018P) comprend Systématique et évolution des bactéries, des champignons, des bryophytes, des fougères, des gymnospermes et des plantes à fleurs. Pour les angiospermes (plantes à fleurs), un choix de familles à l'intérieur des principaux ordres sera présenté pour faire ressortir d'une manière concrète les caractéristiques de ces groupes, les applications possibles et la logique de leur classification. La biodiversité sera expliquée par des thèmes transversaux.

Objectifs 1: Connaître les fondamentaux de la taxonomie. 2: Identifier les grandes lignées phylogénétiques des procaryotes et eucaryotes. 3 : interpréter la morphologie de ces organismes. 4: Identifier les principaux embranchements des animaux et familles de plantes. 5 : expliquer la biodiversité végétale et animale

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Travaux pratiques intégrés Semestres automne/printemps Nbe d’heures par semaine 3 Nbe d’heures par année 84 Jour lundi 14h15-17h Lieux partie automne : Sciences III – salle de TP 5050 au 5ème étage

partie printemps : le mercredi 22 février 2017 salles 0019 & 0035 puis salle de TP 5050 au 5ème étage

Mode d’évaluation rapport et examen de détermination. Enseignant(e)s Semestre d’automne

Madame M. HOLZMANN (adj. scientifique) Messieurs J. PAWLOWSKI (pas), J. MARIAUX (pt), J. MONTOYA (ce), L. MONOD (cc) Semestre de printemps Madame M. PRICE (cc), Messieurs K. PERRON (ce), P.-A. LOIZEAU (cc), P. CLERC (cc), poste d’assistant à pourvoir

Contenu Partie automne : Observation des protistes, examen et dissection

d'animaux des principaux embranchements. Partie printemps : Etude de quelques exemples choisis de bactéries, de lichens, de champignons non lichénisés, de bryophytes, de fougères et de gymnospermes. Détermination et études des organes végétatifs, floraux et fructifères des espèces de plantes à fleurs appartenant aux principales familles de notre flore. 2 excursions prévues.

Objectif Reconnaître les caractères diagnostiques des grands groupes de protistes, d'animaux et des plantes. Savoir utiliser des clés de détermination. Connaître les principaux arbres (partie printemps).

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12B801 FORMATION DOCUMENTAIRE Pratique, obligatoire pour les étudiant(e)s en 2ème année de bachelor en biologie Semestre printemps ECTS certificat 5 heures par année Lieu formation en ligne Dates introduction en présentiel (salle annoncée en début de semestre) :

mercredi 1er mars 2017 10h15-11h Formation en ligne : 1er mars – 2 avril 2017

Mode d’évaluation QCM en ligne : 3 – 5 avril 2017

rattrapage : 24 – 26 avril 2017 Pré-requis Réservé aux étudiant(e)s inscrit(e)s en 2ème année de bachelor en

biologie Responsable A. Bellier 022.379.60.44 audrey.bellier@unige.ch

L. Mellifluo 022.379.64.41 laure.mellifluo@unige.ch Enseignant(e)s A. Bellier 022.379.60.44 audrey.bellier@unige.ch

L. Mellifluo 022.379.64.41 laure.mellifluo@unige.ch Divers La participation à la séance d’introduction est indispensable : toutes les

informations pratiques sur le déroulement de la formation et de l’évaluation en ligne seront transmises lors de cette séance. La réussite de l’évaluation octroie un certificat nécessaire pour la réussite de la 2e année de bachelor en biologie.

Contenu Cette formation en ligne permet aux étudiants d’acquérir les compétences informationnelles nécessaires à la poursuite de leurs études universitaires en biologie. Après avoir suivi cette formation, ils devront être en mesure de :

- Préparer une recherche documentaire - Identifier les ressources disponibles pour mener à bien leurs - recherches documentaires - Conduire des stratégies de recherche documentaire - Accéder à l’information - Evaluer la qualité et la pertinence de l’information - Organiser ses références et sa documentation - Communiquer efficacement - Eviter le plagiat - Citer ses sources et créer sa bibliographie

Objectif - Appliquer une méthode pour obtenir des informations scientifiques

pertinentes - Citer des références selon les normes et sans risque de plagiat

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ENSEIGNEMENTS OBLIGATOIRES - DEUXIEME ANNEE ORIENTATION PREHISTOIRE

Cours supplémentaires

11T003 GEOLOGIE (voir page 128) Semestre automne ECTS 5.5 Jours et lieu mardi 10h00 à 12h00 et vendredi 14h00 – 16h00

salle 001, Sciences de la Terre, 13 rue des Maraîchers

Responsable Monsieur A. MOSCARIELLO – 022.379.6601 andrea.moscariello@unige.ch Section des sciences de la Terre et de l’environnement

11T903 GEOLOGIE – travaux pratiques (voir page 128) Semestres automne ECTS 1.5 (2.5 pour l’orientation préhistoire) Jour & lieu lundi 10h00 - 12h00, salle 201, Sciences de la Terre, 13 rue Maraîchers Les étudiants du bachelor en biologie orientation préhistoire doivent faire un

rapport supplémentaire afin d’obtenir 1 ECTS de plus.

☞ Plus 12 ECTS de cours à prendre dans la liste des cours obligatoires de 2ème et 3ème années de l’orientation préhistoire.

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