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Epidémiologie des maladies infectieuses et écologie Apport des modélisations déterministe et stochastique

Epidémiologie des maladies infectieuses et écologie Apport des modélisations déterministe et stochastique

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Page 1: Epidémiologie des maladies infectieuses et écologie Apport des modélisations déterministe et stochastique

Epidémiologie des maladies infectieuseset écologie

Apport des modélisations déterministe et stochastique

Page 2: Epidémiologie des maladies infectieuses et écologie Apport des modélisations déterministe et stochastique

Comprendre les mécanismes de propagation des parasites afin d’identifier les processus de sélection

Modélisation dynamique

Analyses statistiquesparamétrage

Suivis à long terme de populations

naturelles

Dynamique des populations du réservoir/vectricesTraits d’histoire de vie des individus

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1 - Un modèle de maladie émergente:la néphropathie épidémique (NE)

Ardennes(région étudiée)

NE sporadique

Pas de NE

NE endémique

?

Quel est le mécanisme qui permet de comprendre la géographie de la propagation du virus ?

Chletrionomys glareolus

Hantavirus Puumala

Page 4: Epidémiologie des maladies infectieuses et écologie Apport des modélisations déterministe et stochastique

Circulation du virus Puumala chez les rongeurs et l’homme

campagnols

Dépôts d’urine et de fecès

Travailleurs forestiers,promeneurs

FORET

Contamination de l’homme via poussières contaminées. Mais insuffisant / géographie

Elément additionnel:Elément additionnel: dynamique entre la zone d’endémie et la zone indemne

Modélisationdéterministe

Page 5: Epidémiologie des maladies infectieuses et écologie Apport des modélisations déterministe et stochastique

Mécanisme d’émergence de la NE chez l’Homme

sensibles

Cas humains

Zone d’endémie

Zone indemne

Dynamique de population du rongeur influence la propagation du virus

Sélection de souches capables de survivre hors de leur hôte

infectés

Page 6: Epidémiologie des maladies infectieuses et écologie Apport des modélisations déterministe et stochastique

2 - Mode de transmission du VIF ■ verticalement (placenta, lait)

■ sexuellement (sperme)

■ par morsure (salive)

expérimentalementmode detransmissionnaturel

pourquoi ce mode de transmission ?

simple conséquenceou processus de sélection ?

Modélisation stochastique

Petites populations (60-300 hôtes), prévalence VIF = 15 – 30% Mâles dominants = « core-group »

Page 7: Epidémiologie des maladies infectieuses et écologie Apport des modélisations déterministe et stochastique

Patron de persistance du VIF en milieu ruralModèle stochastique SI en population ferméestructurée par âge, sexe, comportement (dominant vs subordonnés)

pro

ba

bili

prévalence

années

probabilité d’extinction 70%

après 10 ans

1000 simulations du réseau de Petri sur 30 ans

Page 8: Epidémiologie des maladies infectieuses et écologie Apport des modélisations déterministe et stochastique

Patron de persistance du VIF en milieu rural

très forte probabilité d’extinction du VIFen population close

pas en adéquation avec les observations

prise en compte de la structure en métapopulation

Réintroduction fréquente du virus

populationB

populationA

Mâles dominantscombats

Page 9: Epidémiologie des maladies infectieuses et écologie Apport des modélisations déterministe et stochastique

Patron de persistance du VIF en milieu rural

prob

abili

téprévalence

années

prob

abili

prévalenceannées

70% 12%

Le mode de transmission par morsure maximise les chances de persistance du virus

processus de sélection du mode de transmission du VIF

sans contact entre pop avec contacts entre pop

Page 10: Epidémiologie des maladies infectieuses et écologie Apport des modélisations déterministe et stochastique

Perspectives

Fonctionnement des populations hôtes

Facteurs de sélection des pathogènes

Pathocénoses et émergence des maladies transmissibles : Pathocénoses et émergence des maladies transmissibles : un concept unificateur mis à l’épreuve sur des pathologies exemplairesun concept unificateur mis à l’épreuve sur des pathologies exemplaires

(coord. D. Pontier)(coord. D. Pontier)

Programme Santé-environnement et Santé-travail

Généralisation de l’approche à plusieurs parasites