27
Etablissement : Université de Annaba Intitulé du master : Chimie organique fine Page 1 Année universitaire : 2016/2017 III - Programme détaillé par matière Master : Chimie Organique

III - Programme détaillé par matièrefacsc.univ-annaba.dz/wp-content/uploads/2018/04/Master-chimie... · -Spectrométrie de masse (principe, principales réactions de fragmentation

  • Upload
    lyliem

  • View
    217

  • Download
    0

Embed Size (px)

Citation preview

Page 1: III - Programme détaillé par matièrefacsc.univ-annaba.dz/wp-content/uploads/2018/04/Master-chimie... · -Spectrométrie de masse (principe, principales réactions de fragmentation

Etablissement : Université de Annaba Intitulé du master : Chimie organique fine Page 1 Année universitaire : 2016/2017

III - Programme détaillé par matière

Master : Chimie Organique

Page 2: III - Programme détaillé par matièrefacsc.univ-annaba.dz/wp-content/uploads/2018/04/Master-chimie... · -Spectrométrie de masse (principe, principales réactions de fragmentation

Etablissement : Université de Annaba Intitulé du master : Chimie organique Page 2 Année universitaire : 2016/2017

Intitulé du Master : Chimie Organique

Semestre : S1

Intitulé de l’UE : Mécanismes réactionnels avancés UEF1

Intitulé de la matière : Mécanismes réactionnels avancés

Crédits : 6

Coefficients : 3

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme

compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).

L’étudiant est censé conforter ou acquérir un complément de connaissance en ce qui concerne la synthèse organique, les réactions de bases, leurs modes de réactivité et leurs mécanismes.

Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances

requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes).

Les enseignements de chimie organique de base.

Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en

présentiel et du travail personnel)

Réactions d’additions. -Additions Electrophiles. Sur les liaisons multiples : alcènes, alcynes. Additions nucléophiles. Réactions de substitutions. Substitutions Electrophiles. Sur les aromatiques : halogénation, nitration, sulfonation, alkylation, acylation, cyclisation. Substitutions nucléophiles. Sur les aromatiques activés. Les groupes carboxyliques. Les dérivés dicarbonylés. Réactions d’Elimination. Nucléophile. Sur un carbone saturé. Sur un carbone insaturé Les grandes réactions et les mécanismes. Les réactions : dégradation d’Hofmann, , Wagneir-Mervein, les variantes de Wittig, Transposition. : par carbocation : pinacolique apparentée. ; par carbanion : Nitrène, Imminium, Thermique.

Mode d’évaluation : Contrôle continu

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Page 3: III - Programme détaillé par matièrefacsc.univ-annaba.dz/wp-content/uploads/2018/04/Master-chimie... · -Spectrométrie de masse (principe, principales réactions de fragmentation

Etablissement : Université de Annaba Intitulé du master : Chimie organique Page 3 Année universitaire : 2016/2017

Page 4: III - Programme détaillé par matièrefacsc.univ-annaba.dz/wp-content/uploads/2018/04/Master-chimie... · -Spectrométrie de masse (principe, principales réactions de fragmentation

Etablissement : Université de Annaba Intitulé du master : Chimie organique Page 4 Année universitaire : 2016/2017

Intitulé du Master : Chimie Organique

Semestre : S1

Intitulé de l’UE : Complexes organométalliques UEF2

Intitulé de la matière : Complexes organométalliques

Crédits : 4

Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme

compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).

Initiation à la catalyse organométallique. Ce cours a pour but d'acquérir des notions spécialisées en chimie organique impliquant des processus catalysés par des métaux de transition.

Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances

requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes).

Aucune

Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en

présentiel et du travail personnel)

Généralités sur les complexes organométalliques:

configuration électronique, classification périodique, métaux de transition, liaison par

coordinence, états de valence, stéréo-isomérie, loi des équilibres, solubilité et produit de

solubilité, diamagnétisme et paramagnétisme.

Les complexes organométalliques : structure électronique et géométrie propriétés

chimiques - Réactions organiques catalysées par les complexes organométalliques.

Etapes élémentaires.

Applications industrielles.

Préparation de molécules biologiquement actives (médicaments)

Mode d’évaluation : examen en janvier

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Chimie moléculaire des éléments de transition par François Mathey et Alain Sevin (éditions de

l’École polytechnique)

Chimie organométallique par Didier Astruc (EDP Sciences, 2000)

Page 5: III - Programme détaillé par matièrefacsc.univ-annaba.dz/wp-content/uploads/2018/04/Master-chimie... · -Spectrométrie de masse (principe, principales réactions de fragmentation

Etablissement : Université de Annaba Intitulé du master : Chimie organique Page 5 Année universitaire : 2016/2017

Intitulé du Master : Chimie Organique

Semestre : S1

Intitulé de l’UE : Chimie organique pour un développement durable UEF3

Intitulé de la matière : Chimie organique pour un développement durable

Crédits : 4

Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme

compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).

Imprégnation des principes de chimie verte et initiation aux bonnes pratiques. Application

à la chimie organique. Comparaison des avantages et des inconvénients de procédés.

.

Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances

requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes).

Aucune

Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en

présentiel et du travail personnel)

Processus durables, économie d’atomes ; limitation des déchets ; agro ressources ; choix

des solvants ; recyclage; Valorisation du dioxyde de carbone.

Les nouvelles méthodes d'activation en synthèse organique : Ultrasons, micro-ondes,

haute pression.

Les nouveaux milieux réactionnels : Liquides ionique, CO2 supercritique, Phases

perfluorées Utilisation de la catalyse. Catalyseurs recyclables et récupérables.

Comparer les avantages et les inconvénients des procédés de synthèse du point de vue

du respect de l’environnement

Mode d’évaluation: examen en janvier

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

P.T. Anastas, J.C. Warner, Green chemistry: Theory and Practice; Oxford University Press:

New York, 2000, p. 132

Jacques Amouroux, La chimie et la nature, , éditions EDP Sciences

Page 6: III - Programme détaillé par matièrefacsc.univ-annaba.dz/wp-content/uploads/2018/04/Master-chimie... · -Spectrométrie de masse (principe, principales réactions de fragmentation

Etablissement : Université de Annaba Intitulé du master : Chimie organique Page 6 Année universitaire : 2016/2017

Intitulé du Master : Chimie Organique

Semestre : S1

Intitulé de l’UE : Modélisation moléculaire UEF4

Intitulé de la matière : Modélisation moléculaire

Crédits : 4

Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme

compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).

Connaissance des principes de base de la modélisation moléculaire.

Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances

requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes).

Aucune

Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en

présentiel et du travail personnel)

-Modélisation moléculaire (Objectifs d’utilisation de la modélisation moléculaire,

principes, approches de la structure moléculaire)

-Représentation des méthodes de calcul :

La Mécanique Moléculaire (MM) : principe et applications

Dynamique moléculaire (DM) : principe et applications

Simulations de Monte Carlo : principe et applications

Méthodes de la mécanique quantique : Les méthodes ab initio (Hartree-Fock et post HF),

les méthodes semi-empiriques, les méthodes de la fonctionnelle de la densité (DFT).

-Le logiciel de modélisation moléculaire : les calculs et la minimisation de l'énergie,

choix de la méthode de calcul et types de calculs (Single point, Optimisation de la

géométrie, Etats de transition TS), méthodes de recherche des minimas.

-Les méthodes hybrides QM/MM : la méthodologie ONIOM (version 2 et 3) principe et

applications.

-Les modèles de solvatation : solvatation explicite, solvatation implicite.

Mode d’évaluation : examen en janvier

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Page 7: III - Programme détaillé par matièrefacsc.univ-annaba.dz/wp-content/uploads/2018/04/Master-chimie... · -Spectrométrie de masse (principe, principales réactions de fragmentation

Etablissement : Université de Annaba Intitulé du master : Chimie organique Page 7 Année universitaire : 2016/2017

Intitulé du Master : Chimie Organique

Semestre : S1

Intitulé de l’UE : Outils spectroscopiques I UEM1

Intitulé de la matière : Outils spectroscopiques I

Crédits : 4

Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme

compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).

Acquisition des techniques spectroscopiques qui constituent la base pour analyser les composés organiques. . Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances

requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes).

Notions de base acquises en Licence

Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en

présentiel et du travail personnel)

Programme en présentiel :

- Absorption atomique.

- Spectrométrie d’absorption de l’ultraviolet et du visible (transitions électroniques des composés organiques, groupements chromophores, solvatochromie, règles de Woodward-Fieser, analyse quantitative et lois de l’absorption moléculaire, applications de la spectroscopie UV-Vis)

- Spectroscopie du moyen et du proche Infrarouge (présentation des absorptions dans l’infrarouge, bandes de vibration-rotation dans l’IR, modèle simplifié des interactions vibrationnelles, bandes caractéristiques des principales fonctions des composés organiques)

- Spectroscopie Raman (effet Raman, règles de sélection, application aux molécules organiques)

- Spectroscopie de la résonance magnétique nucléaire : principes physiques de base (phénomène de résonance, déplacement chimique, couplage spin-spin, intensité), spectroscopie de RMN 1H (facteurs influant les déplacements chimiques 1H, couplage 1H-1H, couplages avec d’autres noyaux, données RMN 1H de quelques classes de composés organiques), spectroscopie de RMN 13C (déplacements chimiques de 13C, couplage 13C-1H, données de RMN 1H et RMN 13C de molécules représentatives)

- Résonance paramagnétique électronique (RPE) : principe et applications en chimie organique

- Spectrométrie de masse (principe, principales réactions de fragmentation des molécules organiques, application aux principales classes de composés organiques, SM-CPG, SM-HPLC)

Programme du travail personnel :

- Initiation à la recherche bibliographique et exposés sur les applications de l’outil spectroscopique en chimie organique (applications sur les molécules organiques classées par fonction)

Page 8: III - Programme détaillé par matièrefacsc.univ-annaba.dz/wp-content/uploads/2018/04/Master-chimie... · -Spectrométrie de masse (principe, principales réactions de fragmentation

Etablissement : Université de Annaba Intitulé du master : Chimie organique Page 8 Année universitaire : 2016/2017

Mode d’évaluation : Contrôle continu

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Page 9: III - Programme détaillé par matièrefacsc.univ-annaba.dz/wp-content/uploads/2018/04/Master-chimie... · -Spectrométrie de masse (principe, principales réactions de fragmentation

Etablissement : Université de Annaba Intitulé du master : Chimie organique Page 9 Année universitaire : 2016/2017

Intitulé du Master : Chimie Organique

Semestre : S1

Intitulé de l’UE : Techniques d’analyse chromatographique UEM2

Intitulé de la matière : Techniques d’analyse chromatographique

Crédits : 5

Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme

compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).

L’étudiant est censé acquérir des compétences concernant la séparation et l’analyse chromatographique.

Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances

requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes).

Aucune

Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en

présentiel et du travail personnel)

1ère partie : Principes généraux, fondements théoriques Introduction : Définition et différentes classes, historique, Buts de la chromatographie, Comparaison CG/CL- Grandeurs fondamentales : coefficient de distribution, pic chromato, temps de rétention, facteur de capacité, sélectivité, résolution, efficacité - Equations fondamentales : relations entre Rs et N, équation de Van Deemter.- La chromatographie gazeuse : colonne, gaz vecteur, injecteur, four, detecteur- La chromatographie liquide : colonne, phase mobile, systèmes de pompage.- Applications de la chromatographie: exemples pratiques. 2ème partie : Applications aux différentes techniques Etude de la chromatographie en fonction des différents phénomènes de séparation ; chromatographie d’adsorption, de partage, d’échange d’ions d’exclusion……..) Application aux différents procédés chromatographiques et à la nature des substances. Choix de la technique. 3ème partie : Chromatographie chirale. Ce cours concerne l’enseignement des différents systèmes chromatographiques, que ce soit parmi les techniques analytiques ou préparatives, en Chromatographie chirale.

Mode d’évaluation : Contrôle continu

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Page 10: III - Programme détaillé par matièrefacsc.univ-annaba.dz/wp-content/uploads/2018/04/Master-chimie... · -Spectrométrie de masse (principe, principales réactions de fragmentation

Etablissement : Université de Annaba Intitulé du master : Chimie organique Page 10 Année universitaire : 2016/2017

Intitulé du Master : Chimie Organique

Semestre : S1

Intitulé de l’UE : Anglais et outils de communication UET1

Intitulé de la matière : Anglais et outils de communication

Crédits : 3

Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme

compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).

Le perfectionnement de l'anglais dans sa pratique scientifique et technique est obligatoire

Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances

requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes).

Aucune

Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en

présentiel et du travail personnel)

Mode d’évaluation : examen en janvier

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Page 11: III - Programme détaillé par matièrefacsc.univ-annaba.dz/wp-content/uploads/2018/04/Master-chimie... · -Spectrométrie de masse (principe, principales réactions de fragmentation

Etablissement : Université de Annaba Intitulé du master : Chimie organique Page 11 Année universitaire : 2016/2017

Intitulé du Master : Chimie Organique

Semestre : S2

Intitulé de l’UE : Composés organiques polyfonctionnels et grandes réactions organiques UEF1

Intitulé de la matière : Composés organiques polyfonctionnels et grandes réactions organiques

Crédits : 6

Coefficients : 4

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme

compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).

Compléter la formation en synthèse organique avec les composés polyfonctionnels et les grandes réactions. Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances

requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes).

UEF1 : mécanismes réactionnels avancés

Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en

présentiel et du travail personnel)

1ère partie : composés organiques polyfonctionnels : diènes, polyènes, composés di et polyhalogénés, diols, polyols, composés polycarbonylés, diacides, composés carbonylés insaturés, hydroxyacides, lactones, phénols, quinones, oxiranes, plymères, hétérocycles. 2ème partie : les grandes réactions en chimie organique : groupes protecteurs, oxydations, réductions, nitrations, halogénations, diazotations, estérifications- saponification, transpositions, allongements de chaînes, synthèses totales.

Mode d’évaluation : Contrôle continu

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Page 12: III - Programme détaillé par matièrefacsc.univ-annaba.dz/wp-content/uploads/2018/04/Master-chimie... · -Spectrométrie de masse (principe, principales réactions de fragmentation

Etablissement : Université de Annaba Intitulé du master : Chimie organique Page 12 Année universitaire : 2016/2017

Intitulé du Master : Chimie Organique

Semestre : S2

Intitulé de l’UE : Stéréochimie approfondie et analyse conformationnelle UEF2

Intitulé de la matière : Stéréochimie approfondie et analyse conformationnelle

Crédits : 4

Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme

compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).

Approfondir les notions de stéréochimies acquises en chimie organique descriptive. Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances

requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes).

Aucune

Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en

présentiel et du travail personnel)

Historique de l’analyse conformationnelle - Représentation des molécules. Conformation de quelques molécules (en série acyclique et cyclique). Isomèrie stérique : éléments de symétrie, configuration, conformation, chiralité (centrale, axiale, planaire), chiralité conformationnelle. Différentiation des molécules (Topicité). Description

Mode d’évaluation : Contrôle continu

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Page 13: III - Programme détaillé par matièrefacsc.univ-annaba.dz/wp-content/uploads/2018/04/Master-chimie... · -Spectrométrie de masse (principe, principales réactions de fragmentation

Etablissement : Université de Annaba Intitulé du master : Chimie organique Page 13 Année universitaire : 2016/2017

Intitulé du Master : Chimie Organique

Semestre : S2

Intitulé de l’UE : Chimie radicalaire UEF3

Intitulé de la matière : Chimie radicalaire

Crédits : 4

Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme

compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).

Initiation à la chimie organométallique et approfondissement des connaissances de la chimie radicalaire. Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances

requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes).

Aucune

Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en

présentiel et du travail personnel)

Structure des radicaux (conformation, configuration, état électronique). Radicaux carbonés. Stabilité des radicaux. Réactions élémentaires et mécanismes. Réactivité des radicaux (facteurs contrôlant la réactivité, détermination des constantes de vitesse des réactions radicalaires). Applications des réactions radicalaires à la synthèse organique : [Fonctionnalisation de la liaison C-H - Transformation des fonctions -Fonctionnalisation des liaisons multiples -Cyclisations]

Mode d’évaluation : examen en juin

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Page 14: III - Programme détaillé par matièrefacsc.univ-annaba.dz/wp-content/uploads/2018/04/Master-chimie... · -Spectrométrie de masse (principe, principales réactions de fragmentation

Etablissement : Université de Annaba Intitulé du master : Chimie organique Page 14 Année universitaire : 2016/2017

Intitulé du Master : Chimie Organique

Semestre : S2

Intitulé de l’UE : Chimie de produits naturels à activité biologique UEF4 Intitulé de la matière : Chimie de produits naturels à activité biologique

Crédits : 4

Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme

compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).

Acquisition de connaissances en chimie des produits naturesls. Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances

requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes).

Chimie organique de base.

Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en

présentiel et du travail personnel)

1ère partie : Synthèse asymétrique de produits naturels :

Exemples sélectionnés de synthèses stéréocontrolées de substances naturelles optiquement actives et ayant des propriétés biologiques intéressantes. Introduction générale- Utilisation d’inducteurs chiraux : a-phényléthylamine – éphédrine - les acides aminés- Synthèse de la tryptamine optiquement active- Synthèse d’alcaloides à chromophore aniline acyclique - Synthèse totale d’alcaloides indoliques : à partir de la tryptamine et d’une entité élaborée à dix carbones – à partir des carbolines optiquement actives- Synthèse totale de l’ajmaline à partir du L-tryptophane- Synthèse totale de phéromones ((-)-périplamone..............). 2ère partie : La synthèse organique vue au travers de la chimie des sucres : Présentation générale de la structure des sucres. Développement des aspects conformationnels. Réactions stéréocontrôlées au niveau du carbone anomère. Synthèse osidique. Emploi des sucres simples pour la synthèse de molécules complexes optiquement actives. Les glycoconjugués : leur importance en biologie et leur émergence à l'interface chimie-biologie.

Mode d’évaluation : Contrôle continu

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Page 15: III - Programme détaillé par matièrefacsc.univ-annaba.dz/wp-content/uploads/2018/04/Master-chimie... · -Spectrométrie de masse (principe, principales réactions de fragmentation

Etablissement : Université de Annaba Intitulé du master : Chimie organique Page 15 Année universitaire : 2016/2017

Intitulé du Master : Chimie Organique

Semestre : S2

Intitulé de l’UE : Outils spectroscopiques II UEM1 Intitulé de la matière : Outils spectroscopiques II

Crédits : 4

Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme

compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).

Approfondissement des techniques de la spectroscopie liée aux molécules organiques et application sur les molécules naturelles et synthétisées. Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances

requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes).

Outils spectroscopiques I

Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en

présentiel et du travail personnel)

Programme en présentiel : RMN 1H Différents types de couplage, systèmes de spin et spectres du second ordre :

- Couplage géminal, couplage vicinal, couplage à longue distance et couplage hétéronucléaire

- Systèmes de spin selon la notation de Pople ( AX, AB, AMX, ABX, A2X2, A2B2, AA’XX’, AA’BB’)

RMN de proton et chiralité RMN13C La séquence DEPT Application de la RMN 1H et 13C à la détermination des structures des molécules naturelles et de synthèse RMN bidimentionnelle :

- Corrélation homonucléaire (COSY)

- Effet nucléaire Overhauser (NOESY,..)

- Corrélation hétéronucléaire (HETCOR, HMQC,..)

Application à la détermination des structures des molécules biologiques (protéines et sucres) Spectroscopie de corrélation multi-dimensionnelle homo et hétéronucléaire Etude approfondie de la spectrométrie de Masse Abondance isotopiques et isotopomérie, poids moléculaire et masses exactes Méthodes d'ionisation (EI, CI, LSIMS,….) Fragmentométrie Méthodologie d'attribution et interprétation de la fragmentation Application à l’analyse moléculaire, la détection de traces, la composition isotopique

Page 16: III - Programme détaillé par matièrefacsc.univ-annaba.dz/wp-content/uploads/2018/04/Master-chimie... · -Spectrométrie de masse (principe, principales réactions de fragmentation

Etablissement : Université de Annaba Intitulé du master : Chimie organique Page 16 Année universitaire : 2016/2017

Couplage GC /MS et LC/MS Application de diverses méthodes spectroscopiques combinées pour la révélation des structures des composés naturels et synthétisés.

Programme du travail personnel :

- Approfondissement de la recherche bibliographique avec accès aux bases de

données de la recherche scientifique et exposés sur les applications de l’outil

spectroscopique en chimie organique (applications sur les biomolécules)

Mode d’évaluation : Contrôle continu

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Page 17: III - Programme détaillé par matièrefacsc.univ-annaba.dz/wp-content/uploads/2018/04/Master-chimie... · -Spectrométrie de masse (principe, principales réactions de fragmentation

Etablissement : Université de Annaba Intitulé du master : Chimie organique Page 17 Année universitaire : 2016/2017

Intitulé du Master : Chimie Organique

Semestre : S2

Intitulé de l’UE : Méthodes d’analyse des corps organiques UEM2 Intitulé de la matière : Méthodes d’analyse des corps organiques

Crédits : 5

Coefficients : 3

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme

compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).

Compléments de méthodes d’analyse et de purifications des corps spécifiques aux composés organiques. Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances

requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes).

Techniques d’analyse chromatographique

Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en

présentiel et du travail personnel)

1ère partie : Méthodes de séparation et de purification des corps organiques Généralités ; (Mélanges homogènes, hétérogènes) toutes les techniques (dissolution fractionnée, cristallisation, recristallisation, relargage, extraction, sublimation, distillation, distillation fractionnée entraînement à la vapeur, filtration, centrifugation, décantation,) seront abordées. 2ème partie : Analyse élémentaire et fonctionnelle Constantes physiques des corps organiques ; Analyse élémentaire ; Analyse chimique fonctionnelle ; polarimétrie

Mode d’évaluation : Contrôle continu

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Page 18: III - Programme détaillé par matièrefacsc.univ-annaba.dz/wp-content/uploads/2018/04/Master-chimie... · -Spectrométrie de masse (principe, principales réactions de fragmentation

Etablissement : Université de Annaba Intitulé du master : Chimie organique Page 18 Année universitaire : 2016/2017

Intitulé du Master : Chimie Organique

Semestre : S2

Intitulé de l’UE : Anglais + Histoire des sciences UET 1 Intitulé de la matière : Anglais + Histoire des sciences

Crédits : 3

Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme

compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).

Le perfectionnement de l'anglais dans sa pratique scientifique et technique est obligatoire

Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances

requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes).

Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en

présentiel et du travail personnel)

Mode d’évaluation : examen en juin

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Page 19: III - Programme détaillé par matièrefacsc.univ-annaba.dz/wp-content/uploads/2018/04/Master-chimie... · -Spectrométrie de masse (principe, principales réactions de fragmentation

Etablissement : Université de Annaba Intitulé du master : Chimie organique Page 19 Année universitaire : 2016/2017

Intitulé du Master : Chimie Organique

Semestre : S3

Intitulé de l’UE : Chimie enzymatique et bioconversions UEF 1 Intitulé de la matière : Chimie enzymatique et bioconversions

Crédits : 4

Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme

compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).

Initiation aux bioconversions en chimie organique. Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances

requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes).

Aucune

Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en

présentiel et du travail personnel)

Introduction- Les aminoacides - La liaison peptidique – Les protéines : principales fonctions des protéines- Les différents niveaux de structure des protéines.- Les enzymes : Nomenclature et types de réaction – Aspects cinétique et mécanistique – Les sources d’enzyme.- Applications des catalyseurs en chimie organique – Avantage et inconvénients de l’utilisation des biocatalyseurs- Rappels de stéréochimie- Utilisations des hydrolases en synthèse organique– Mécanismes d’action- Réactions d’hydrolyse – Réactions en milieu organique. Effets des solvants organiques. Les différentes techniques d’immobilisation des biocatalyseurs- Autres biocatalyseurs utilisés en synthèse organique.

Mode d’évaluation : Contrôle continu

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Page 20: III - Programme détaillé par matièrefacsc.univ-annaba.dz/wp-content/uploads/2018/04/Master-chimie... · -Spectrométrie de masse (principe, principales réactions de fragmentation

Etablissement : Université de Annaba Intitulé du master : Chimie organique Page 20 Année universitaire : 2016/2017

Intitulé du Master : Chimie Organique

Semestre : S3

Intitulé de l’UE : Modes d’accès aux molécules chirales UEF 2 Intitulé de la matière : Modes d’accès aux molécules chirales

Crédits : 4

Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme

compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).

Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances

requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes).

Stéréochimie et la synthèse organique

Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en

présentiel et du travail personnel)

Introduction- Propriétés des énantiomères et racémiques.- Séparation des stéréoisomères. Méthodes d’analyse de la pureté énantiomèrique.- Modes d’accès aux molécules chirales. Les grands types de réactions stéréosélectives. Synthèse asymétrique : résolution cinétique; utilisation d’enzymes dans des réactions énantiosélectives (esterases, lipases, deshydrogénases). Méthodes de synthèse basées sur l’utilisation d’auxiliaires et de catalyseurs chiraux. Techniques industrielles : synthèse de principes actifs sous forme énantiomériquement pure. Déracémisations. Notions de catalyse homogène : méthodes de synthèse basées sur l’utilisation de métaux de transition (, Pd, Ru, Ni, etc.). Chimie des lanthanides. Application a la synthèse de composés d’intérêt biologique.

Mode d’évaluation : Contrôle continu

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Page 21: III - Programme détaillé par matièrefacsc.univ-annaba.dz/wp-content/uploads/2018/04/Master-chimie... · -Spectrométrie de masse (principe, principales réactions de fragmentation

Etablissement : Université de Annaba Intitulé du master : Chimie organique Page 21 Année universitaire : 2016/2017

Intitulé du Master : Chimie Organique

Semestre : S3

Intitulé de l’UE : Biomolécules UEF 3 Intitulé de la matière : Biomolécules

Crédits : 3

Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme

compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).

Synthèse de molécules complexes biologiquement actives. Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances

requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes).

Synthèse organique approfondie

Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en

présentiel et du travail personnel)

Acide amines, peptides et proteines. Stratégies de synthèse de longs peptides récurrente

et par fragments ; nouveaux réactifs de couplage. Synthèse en solution versus synthèse

sur support. Nouveaux supports solides utilisables pour la synthèse de longs peptides.

Nouveaux groupements protecteurs utilisables dans la synthèse de peptides longs.

Stratégies de synthèse de ponts di-sulfures. Réactifs supportés utilisés en synthèse

peptidique. Synthèse de protéines par ligation. Méthodes de cyclisation de peptides et

pseudopeptides. Méthodes de caractérisation de peptides longs et mini-protéines. Notions

d’analyse structurale. Exemples de structure/activité de peptides hormones.

Chimie de sucres : Préparation et assemblage de ribonucléosides et polynucléotides. Les

différents principes d'assemblage : biosynthèse ribosomale de protèines, synthèse

chimioenzymatique d'oligopeptides, synthèse chimique d'oligopeptides en solution et sur

support solide, sont présentés et comparés. De même pour la polymérisation enzymatique

de nucléoside-triphosphates, synthèse chimique par la méthode de couplage de

nucléosidyl-phosphoramidites. Les acides nucléiques (bases puriques et pyrimidiques).

Les analogues synthétiques de biomolécules et de médicaments commerciaux)

Mode d’évaluation : Contrôle continu

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Page 22: III - Programme détaillé par matièrefacsc.univ-annaba.dz/wp-content/uploads/2018/04/Master-chimie... · -Spectrométrie de masse (principe, principales réactions de fragmentation

Etablissement : Université de Annaba Intitulé du master : Chimie organique Page 22 Année universitaire : 2016/2017

Intitulé du Master : Chimie Organique

Semestre : S3

Intitulé de l’UE : Chimie du médicament UEF 4 Intitulé de la matière : Chimie organique pharmaceutique

Crédits : 4

Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme

compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).

Acquérir de compétences en synthèse de molécules thérapeutiques. Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances

requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes).

Synthèse organique approfondie

Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en

présentiel et du travail personnel)

I. Généralité (But de la chimie thérapeutique- Elaboration d’un composé thérapeutique) II. Méthodes qualitatives d’études des relations structure-activité (Synthèse d’analogues structuraux – Isostérie – Bioisostérie- Homologation et Vinylogation) III. Recherches initiées par les connaissances sur les récepteurs (Récepteurs alpha - Récepteurs béta - Récepteurs histaminiques H2 - Récepteurs 5HT3) IV. Synthèse de précurseurs (pro drogues, quelques exemples) ( - Inhibiteurs d’enzymes - Relations quantitatives entre la structure et l’activité biologique - L’activité optique et l’effet biologique) V. Antibiotiques et sites d’action (Béta lactamines - Sulfamides - Triméthoprime - Tétracycline- Céphalosporine- Carbapénèmes – Monobactames) VI.. Anti-inflammatoires (Anti-inflammatoires stéroïdiens (corticoïdes) - Anti-inflammatoires non stéroïdiens (AINS). VII. Anti-diabétiques et Normolipidémiants (Insuline - Sulfamides hypoglycémiants – Biguanides - Fibrates et dérivés VI. Médicaments cardiovasculaires (Digitaliques Bêtabloquants - Hypolipidemiants

Mode d’évaluation : Contrôle continu

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Page 23: III - Programme détaillé par matièrefacsc.univ-annaba.dz/wp-content/uploads/2018/04/Master-chimie... · -Spectrométrie de masse (principe, principales réactions de fragmentation

Etablissement : Université de Annaba Intitulé du master : Chimie organique Page 23 Année universitaire : 2016/2017

Intitulé du Master : Chimie Organique

Semestre : S3

Intitulé de l’UE : Chimie du médicament UEF 4 Intitulé de la matière : Conception rationnelle des médicaments

Crédits : 3

Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme

compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).

1. Faire la liaison entre la structure chimique et l’activité biologique.

2. Apprendre des connaissances sur les outils de datamining.

3. Savoir construire des modèles in-silico d’activité biologique.

4. Savoir manipuler les logiciels de statistiques et de modélisation moléculaire.

5. Connaissance sur la biologie moléculaire.

6. Savoir appliquer les méthodes computationnelles dans la conception in-silico des

médicaments.

Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances

requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes).

1. Les méthodes de modélisation moléculaire.

2. Calculs matriciel et méthodes mathématiques « analyse et algèbre »

3. Principe de base dans la stéréochimie.

Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en

présentiel et du travail personnel)

I- Méthodes de modélisation statistiques : QSAR/QSPR.

1. Introduction aux méthodes QSAR/QSPR 2-Méthodologie de QSAR/QSPR

2. Descripteurs moléculaires

3. Algorithmes de sélection de variables

4. Algorithmes d’apprentissage

5. Méthodes de validation d’un modèle QSAR/QSPR

6. Domaine d’applicabilité

7. Application, avantages et limites des méthodes QSAR.

II- Méthodes d’arrimage moléculaire : docking moléculaire.

1. Introduction à la méthode de docking moléculaire.

2. Principe du docking moléculaire

3. Algorithmes de recherche conformationnelle

4. Fonctions de score

5. Criblage virtuel

Page 24: III - Programme détaillé par matièrefacsc.univ-annaba.dz/wp-content/uploads/2018/04/Master-chimie... · -Spectrométrie de masse (principe, principales réactions de fragmentation

Etablissement : Université de Annaba Intitulé du master : Chimie organique Page 24 Année universitaire : 2016/2017

6. Applications et avantages du docking moléculaire : cas de réussite

7. Etudes de cas : réalisées par les étudiants

8. Méthodes basées sur le pharmacophore

9. Méthodes basées sur l‘approche de novo

Mode d’évaluation : Contrôle continu

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Page 25: III - Programme détaillé par matièrefacsc.univ-annaba.dz/wp-content/uploads/2018/04/Master-chimie... · -Spectrométrie de masse (principe, principales réactions de fragmentation

Etablissement : Université de Annaba Intitulé du master : Chimie organique Page 25 Année universitaire : 2016/2017

Intitulé du Master : Chimie Organique

Semestre : S3

Intitulé de l’UE : Chimie expérimentale et modélisation UEM 1 Intitulé de la matière : Chimie expérimentale et modélisation

Crédits : 4

Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme

compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).

Présentation des principes des approches théoriques modélisation moléculaire. Travaux

Pratiques adaptés à la chimie organique. Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances

requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes).

Aucune

Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en

présentiel et du travail personnel)

Méthodes physico-chimiques d’analyse. Analyses de composés organiques par IR. Absorption UV : étude d’une crème solaire. Détermination de structures par RMN 1D et 2D. Analyse d’hydrocarbures par CPG. Analyses de huiles essentielles par spectrométrie de masse. Dosage par HPLC d’une substance organique. Modélisation moléculaire. Rappels sur les approximations usuelles (Born et Oppenheimer, approximation orbitale, LCAO, ...). La dérivation des équations Hartree-Fock et leur formulation sous forme matricielle. La présentation du déroulement d'un calcul HF typique. Introduction rapide à l'analyse de population (Mulliken principalement) Introduction au calcul des principales propriétés moléculaires. Présentation des méthodes quantiques et empiriques ; analyse conformationnelle ; dynamique moléculaire ; applications en chimie bio-organique. Travaux pratiques : Exemples de modélisation moléculaire à l'aide de logiciels de modélisation moléculaire. Simulation numérique de type Monte-Carlo. Principe de la méthode de Monte Carlo : algorithme de Metropolis - conditions périodiques ; potentiels d'interactions ; ensemble statistique ; mise en oeuvre d'un algorithme de Monte Carlo. Travaux pratiques : Exemples de modélisation moléculaire à l'aide de logiciels de modélisation moléculaire.

Mode d’évaluation : Contrôle continu

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Page 26: III - Programme détaillé par matièrefacsc.univ-annaba.dz/wp-content/uploads/2018/04/Master-chimie... · -Spectrométrie de masse (principe, principales réactions de fragmentation

Etablissement : Université de Annaba Intitulé du master : Chimie organique Page 26 Année universitaire : 2016/2017

Intitulé du Master : Chimie Organique

Semestre : S3

Intitulé de l’UE : Stratégie de synthèse UEM 2 Intitulé de la matière : Stratégie de synthèse

Crédits : 5

Coefficients : 3

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme

compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).

Maîtrise des protocoles de synthèse des molécules organiques. Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances

requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes).

Toutes les matières de synthèse organique

Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en

présentiel et du travail personnel)

Quelques rappels en synthèse organique. Stratégie de synthèse : rétrosynthèse (analyse). Notion de dislocation. Synthons logiques…Vocabulaire utilisé en rétrosynthèse. Dislocation d’un groupe C-C. Dislocation des acides carboxyliques. Analyse des composés di-fonctionalisés : 1,2, 1,3, 1,4, 1,5,. Analyse des composés aromatiques et analyse des composés hétérocycliques -chimioseectivité -régiosélectivité -stéréosélectivité -groupes protecteurs : pour les cétones, aldéhydes, alcools, acides carboxyliques, amines.

Mode d’évaluation : Contrôle continu

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Page 27: III - Programme détaillé par matièrefacsc.univ-annaba.dz/wp-content/uploads/2018/04/Master-chimie... · -Spectrométrie de masse (principe, principales réactions de fragmentation

Etablissement : Université de Annaba Intitulé du master : Chimie organique Page 27 Année universitaire : 2016/2017

Intitulé du Master : Chimie Organique

Semestre : S3

Intitulé de l’UE : Anglais et Méthodologie de recherche bibliographique UET 1 Intitulé de la matière : Anglais et Méthodologie de recherche bibliographique Crédits : 3

Coefficients : 2

Objectifs de l’enseignement (Décrire ce que l’étudiant est censé avoir acquis comme

compétences après le succès à cette matière – maximum 3 lignes).

Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances

requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes).

Contenu de la matière (indiquer obligatoirement le contenu détaillé du programme en

présentiel et du travail personnel)

Mode d’évaluation : examen en juin

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).