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Le suivi génétique des loups en 2018 1 1 – ONCFS 2 – ANTAGENE LE SUIVI GENETIQUE DES LOUPS EN 2018 BILAN DE LA 1 ERE ANNEE DE MISE EN ŒUVRE DU NOUVEAU MARCHE PUBLIC Mots-clés : Rapport, Génétique, Hybridation, Loup, Canis lupus lupus Le suivi des animaux sauvages par les techniques moléculaires fait aujourd’hui légion pour étudier l’évolution des populations dans leur milieu naturel. Son application au Loup n’est pas en reste. Cette technique, dite « non invasive » car ne nécessitant pas l’immobilisation de l’animal, est particulièrement intéressante pour suivre cette espèce difficilement observable. En effet, elle utilise des excréments, urines ou autres poils que les animaux laissent sur le terrain. Une nouvelle méthode du suivi génétique des loups en France a été ainsi mise au point pour à la fois contribuer à la détection de nouveaux sites de présence, mais aussi identifier les profils génétiques des loups présents en France et surveiller les taux d’hybridation avec le chien, sujet banal chez beaucoup d’espèces mais régulièrement polémique chez le Loup. RESUME 1. Un marché public pour la conduite des analyses génétiques sur la population de loups en France a été conclu entre le laboratoire Antagene et l’ONCFS pour la période 2018-2021. Le cahier des charges requiert l’identification de l’espèce et des lignées populationnelles, l’élaboration de cartes d’identité ADN individuelles et robustes par un génotypage sur 22 marqueurs microsatellites, et la caractérisation du potentiel caractère d’hybridation entre le loup et le chien. Les analyses se basent sur l’exploitation d’échantillons d’excréments, de poils, d’urine ou de sang collectés par le Réseau Loup/Lynx de surveillance patrimoniale de l’espèce. 2. En 2018, les 6 premiers mois ont été consacrés à un lourd travail de reprofilage des loups déjà identifiés sur les 10 dernières années avec une nouvelle résolution de génotypage. Ce travail fastidieux mais néanmoins incontournable permet d’assurer la continuité d’identification des animaux actuels avec ceux déjà identifiés historiquement dans la population. Des analyses courantes sur des échantillons actuels ont complété les sessions bimestrielles pour rester réactif sur l’identification de nouveaux secteurs de présence du loup. 3. Cette étape de calibration a également permis un travail de recherche important pour affiner le pouvoir de détection des hybrides en mesurant notamment la variabilité des probabilités d’assignation « Chien » ou « Loup », pour distinguer l’hybridation récente et active d’un héritage plus ancien. 4. Sur près de 1250 analyses conduites, 763 profils génétiques différents ont pu être été identifiés entre 2008 et 2018. Parmi ceux-ci, hormis les espèces non cibles, ressortent 53 chiens (Canis lupus familiaris) et 586 loups (Canis lupus lupus), tous de la Direction de la Recherche et de l’Expertise Unité Prédateurs et Animaux déprédateurs (UPAD) Equipe loup lynx (ELL) Auteurs : Christophe Duchamp 1 , Guillaume Queney 2 Mars 2019 NT/2019/DRE/ UPAD/04

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Le suivi génétique des loups en 2018

1

1 – ONCFS 2 – ANTAGENE

LE SUIVI GENETIQUE DES LOUPS EN 2018

BILAN DE LA 1ERE ANNEE DE MISE EN ŒUVRE DU NOUVEAU MARCHE PUBLIC Mots-clés : Rapport, Génétique, Hybridation, Loup, Canis lupus lupus

Le suivi des animaux sauvages par les techniques moléculaires fait aujourd’hui légion pour étudier l’évolution des populations

dans leur milieu naturel. Son application au Loup n’est pas en reste. Cette technique, dite « non invasive » car ne nécessitant pas

l’immobilisation de l’animal, est particulièrement intéressante pour suivre cette espèce difficilement observable. En effet, elle utilise des

excréments, urines ou autres poils que les animaux laissent sur le terrain. Une nouvelle méthode du suivi génétique des loups en France a été

ainsi mise au point pour à la fois contribuer à la détection de nouveaux sites de présence, mais aussi identifier les profils génétiques des loups

présents en France et surveiller les taux d’hybridation avec le chien, sujet banal chez beaucoup d’espèces mais régulièrement polémique chez

le Loup.

RESUME 1. Un marché public pour la conduite des analyses génétiques sur la population de loups en France a été conclu entre le

laboratoire Antagene et l’ONCFS pour la période 2018-2021. Le cahier des charges requiert l’identification de l’espèce et des

lignées populationnelles, l’élaboration de cartes d’identité ADN individuelles et robustes par un génotypage sur 22 marqueurs

microsatellites, et la caractérisation du potentiel caractère d’hybridation entre le loup et le chien. Les analyses se basent sur

l’exploitation d’échantillons d’excréments, de poils, d’urine ou de sang collectés par le Réseau Loup/Lynx de surveillance

patrimoniale de l’espèce.

2. En 2018, les 6 premiers mois ont été consacrés à un lourd travail de reprofilage des loups déjà identifiés sur les 10 dernières

années avec une nouvelle résolution de génotypage. Ce travail fastidieux mais néanmoins incontournable permet d’assurer

la continuité d’identification des animaux actuels avec ceux déjà identifiés historiquement dans la population. Des analyses

courantes sur des échantillons actuels ont complété les sessions bimestrielles pour rester réactif sur l’identification de

nouveaux secteurs de présence du loup.

3. Cette étape de calibration a également permis un travail de recherche important pour affiner le pouvoir de détection des

hybrides en mesurant notamment la variabilité des probabilités d’assignation « Chien » ou « Loup », pour distinguer

l’hybridation récente et active d’un héritage plus ancien.

4. Sur près de 1250 analyses conduites, 763 profils génétiques différents ont pu être été identifiés entre 2008 et 2018. Parmi

ceux-ci, hormis les espèces non cibles, ressortent 53 chiens (Canis lupus familiaris) et 586 loups (Canis lupus lupus), tous de la

Direction de la

Recherche et

de l’Expertise

Unité Prédateurs et Animaux déprédateurs (UPAD) Equipe loup lynx

(ELL)

Auteurs :

Christophe

Duchamp1,

Guillaume Queney 2

Mars 2019

NT/2019/DRE/

UPAD/04

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Le suivi génétique des loups en 2018

2

lignée italo-alpine sauf 2 individus d’une lignée « w1 » retrouvée en Europe de l’est1. A noter que des tests réalisés sur des

chiens de race « Chien-loup de Sarloos » et « Chien-loup tchécoslovaque » montrent que ceux-ci peuvent être porteurs d’un

ADN mitochondrial de Loup (lignée « Europe de l’est » ancestrale à la race) mais leur profil génétique individuel les assigne

clairement au groupe « Chien ». La méthode mise en œuvre permet donc de bien différencier ces races génétiquement très

proches du loup.

5. Les analyses d’hybridation menées sur les 586 profils génétiques Canis lupus lupus, donnent les résultats suivants :

- 88,7% présentent un patrimoine génétique de loup, de lignée italo-alpine standard « w22 ».

- 3,6% présentent un profil hybride de première génération F1 (tous Louve x Chien) parmi lesquels deux portées

isolées, en Tinée (06) et Maurienne (73), rassemblent 13 de ces individus F1

- 7,5% ont été identifiés comme porteurs d’un héritage « Chien » plus ancien

6. Un focus sur les données récentes (2017 et 2018) permet de mettre en évidence 4 hybrides F1 dont 2 sont morts en 2017, en

Tinée (06) et en Maurienne (73). Les deux autres étaient encore détectés en 2017 au travers d’un dépôt d’urine et de fèces,

respectivement en Maurienne (73) et dans le Vercors (26).

7. Un focus parmi 197 dépouilles permet d’identifier 7 hybrides F1 :

- 2016 et avant : 2 par tirs en Tinée (06), 1 mort d’origine traumatique et 1 par tir en Maurienne (73) et 1 tir dans

le Vercors (26)

- Sur 2017 et 2018 : 1 tir en 2017 en Tinée2 (06),) et 1 collision en 2017 en Maurienne (73)

1 Cf. communiqué de presse www.oncfs.gouv.fr 2 Communiqué Gpe national Loup 2018

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Le suivi génétique des loups en 2018

3

TABLE DES MATIERES Résumé ............................................................................................................................................................................. 1

Les objectifs de la surveillance génétique les loups .......................................................................................................... 4

Encart : Le laboratoire Antagène ...................................................................................................................................... 4

Matériels et méthodes ...................................................................................................................................................... 5

Résultats ........................................................................................................................................................................... 9

Publication des données .................................................................................................................................................. 15

Bibliographie ................................................................................................................................................................... 16

Contributions - Remerciements ....................................................................................................................................... 17

Annexes .......................................................................................................................................................................... 18

1/ Méthodologie d’ANTAGENE ......................................................................................................................................... 18

2/ Liste des marqueurs .................................................................................................................................................... 19

3/ Séquence type d’ADNm de la région de contrôle– haplotype w22 ............................................................................. 19

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Le suivi génétique des loups en 2018

4

LES OBJECTIFS DE LA SURVEILLANCE GENETIQUE LES LOUPS Le suivi à long terme de la population de loups a débuté en France dès 1994, peu après les premières identifications

de présence de l’espèce au début des années 1990. Précurseur des techniques non invasives de pistage

moléculaire, le laboratoire du CNRS-LECA a développé les premières méthodes de détection de l’espèce sur la base

de l’ADN retrouvé dans les excréments, urines, poils ou en encore sur les tissus d’animaux morts (Taberlet et

Luikard 1999, Duchamp et Quenette 2005). Le suivi avait initialement pour principal objectif de détecter la présence

de l’espèce sur les nouveaux secteurs au travers du séquençage de l’ADN mitochondrial pour déterminer la lignée

d’appartenance des premiers animaux colonisateurs (Valière et al. 2003). Très vite, le développement d’outils

moléculaires a été mis en place pour individualiser les animaux au travers des échantillons non invasifs collectés

par le Réseau Loup. L’ADN mitochondrial est hérité uniquement de la mère. L’ADN nucléaire est hérité des deux

parents et donc un premier panel de 6 marqueurs nucléaires biparentaux dit « microsatellites » a été sélectionné

parmi 42 marqueurs candidats. Cela a permis d’éditer les premières « cartes d’identité ADN », ou génotypes, ou

profils génétiques, des loups présents en France (Valière et Taberlet 2000, Miquel et al. 2006) avec une résolution

suffisante pour ne pas confondre 2 individus apparentés (pIdsib<1/1000). Un passage à 10 puis 13 marqueurs a pris

la suite. Ce panel de marqueurs était dédié à l’identification individuelle pour assurer les mesures de dynamique

des populations. Si le panel initial des 6 marqueurs permettait par l’expertise des profils obtenus, de surveiller

l’apparition d’allèles rares, il n’était en revanche pas développé pour répondre spécifiquement à la question de

quantification de l’hybridation, à l’époque sans actualité en France.

Avec la fin du marché public de 2012-2016 , un nouveau cahier des charges a été dressé en 2017 pour 1) toujours

permettre de vérifier la lignée populationnelle des loups retrouvés sur le territoire, 2) disposer d’un panel de

marqueurs qui puisse permettre un haut degré de différentiation des animaux y compris les individus apparentés,

et chose nouvelle 3) permettre de calculer, pour chaque échantillon, la probabilité d’une hybridation avec le chien,

et de distinguer une hybridation récente d’un héritage plus ancien. Le laboratoire ANTAGENE (cf encart) a répondu

à l’appel d’offre en garantissant une résolution optimale de la méthode pour atteindre ces objectifs.

ENCART : LE LABORATOIRE ANTAGENE

Créé en 2002, le laboratoire ANTAGENE a construit un haut niveau d’expertise sur les pedigrees et

tests ADN des canidés et félidés. Rayonnant à l’échelle internationale, celui-ci propose plus de 130

tests ADN dans une cinquantaine de pays pour plus de 100 000 clients dans le monde. ANTAGENE

déploie, depuis 15 ans, une expertise très pointue dans les technologies de l’ADN et plus

particulièrement dans les domaines des maladies héréditaires, de la génétique moléculaire, de la

génomique animale, de la bio-informatique et de la génétique des populations. Activité

essentiellement basée sur les animaux domestiques, le laboratoire a développé par ailleurs une

compétence majeure en matière d’études et recherche en génétique des populations animales

sauvages. Son fondateur et PDG, généticien des populations et ancien chercheur au CNRS, collabore

depuis de nombreuses années sur les programmes de recherche en génétique des populations, en

particulier sur les techniques de cartographie des maladies et d’hybridation génétique3.

Pour en savoir plus https://www.antagene.com/fr

3 https://www.researchgate.net/profile/Guillaume_Queney/publications

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Le suivi génétique des loups en 2018

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MATERIELS ET METHODES

1/ Provenance des échantillons génétiques

Les échantillons de fèces, poils, sang ou dépôts urinaires sont récoltés par les correspondants du Réseau loup lynx

formés et déployés sur l’ensemble des départements de présence connue des loups. Une surveillance dite

« sentinelle » est engagée par l’ONCFS sur le front de colonisation (départements contigus à la zone de présence

connue), et une surveillance est également maintenue par l’ONCFS sur l’ensemble du territoire français, pour

traiter tout nouvel échantillon potentiel qui pourrait permettre d’identifier un nouveau secteur de présence de

manière réactive. L’ADN des animaux dépositaires, déposé sur ce type d’échantillons, reste en quantité faible et

souvent déjà dégradé. Des procédures de prélèvement et de conservation sont mises en œuvre pour préserver au

maximum la qualité des prélèvements : un conditionnement sous sac ziploc, stocké à -18°C puis conditionné en

piluliers sous Ethanol 96% en conservant la chaine du froid (Miquel et al. 2006, Duchamp et al. 2012). Des protocoles

spécifiques sont employés pour les urines et le sang (Valière et al. 2000). Une traçabilité par numéro de référence

unique est maintenue pour chaque échantillon tout le long de la chaîne de traitement.

Les prélèvements de salive sur proie domestique, bien que potentiellement source d’adn, ne sont pas utilisés car

outre leurs faibles taux de réussite en extraction ADN (Harms et al 2015, Dufresne et al, 2019), présentent des

risques de contaminations croisées par le prédateur et/ou les charognards lors des prélèvements si ceux-ci ne sont

pas réalisés dans des conditions optimales (potentiel de faux diagnostics).

La mise en service de la nouvelle méthodologie a commencé en janvier 2018 avec la signature du marché public

conclu pour 4 ans. Le cahier des charges du marché public prévoit l’assurance de la continuité du suivi moléculaire

des loups avec l’historique. L’ensemble des échantillons provenant de loups génétiquement détectés sur les 10

dernières années a donc été repris et reprofilé sous un nouveau panel de marqueurs, pour assurer la passerelle.

Les animaux identifiés avant 2008 n’ont pas fait l’objet de ce « passerellage » par manque de double d’échantillons

ADN et contraintes budgétaires, d’autant que ceux-ci sont pour la majorité sans doute déjà morts vu la durée de

vie de l’espèce en nature.

Durant cette période de calibrage, des sessions courantes ont également été réalisées en parallèle tous les 2 mois

(figure 1) pour assurer les analyses des échantillons par ordre de priorité :

- Echantillons récents sur les nouveaux secteurs de présence identifiés par le réseau Loup

- Echantillons de tissus des dépouilles prélevés ou trouvé morts

- Le rattrapage de la dernière année 2017 (année restée blanche en l’absence de marché public à l’exception

d’un test méthodologique sur les diagnostics d’hybridation – cf http://www.oncfs.gouv.fr)

Ainsi, en 2018, 1246 échantillons ont été analysés, parmi lesquels 486 reprofilages d’animaux déjà connus

(passerelles) et 760 nouveaux échantillons lors des sessions courantes (figure 1).

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Le suivi génétique des loups en 2018

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Figure 1 : Calendrier de mise en œuvre des analyses génétiques pour le suivi des loups en France. Source :

Réunions de restitution du Réseau Loup Lynx 2018

2/ Démarche d’analyse génétique

Le laboratoire est configuré dans son infrastructure pour analyser les échantillons collectés de façon classique ou

de façon non-invasive (où souvent l’ADN est dégradé et rare, on parle d’ADN trace) afin d’éviter les risques de

contamination croisée entre échantillons et de garantir la traçabilité et la qualité des résultats produits (salles

dépressurisées, marche en avant). La méthode d’extraction, purification, amplification est synthétisée en annexe

et détaillée dans les rapports consultables en ligne. La méthode d’analyse de l’ADN est présentée en figure 2.

L’analyse porte de manière systématique sur deux types de molécules : l’ADN présent dans les mitochondries des

cellules, hérité uniquement de la mère, et l’ADN présent dans le noyau des cellules, hérité des deux parents, tous

deux complémentaires pour assoir respectivement et pour chaque échantillon un diagnostic d’origine

populationnelle des animaux et de leur génotypage individuel.

3/ Espèce et lignée génétique populationnelle

L’ADN mitochondrial permet d’évincer les espèces non cibles et porte l’information de la lignée populationnelle.

Facilement exploitable par séquençage d’une portion dite « région de contrôle -ou Dloop », celui-ci est amplifié et

séquencé dans les deux sens (forward et reverse, Vila 1999, Randi 2000, Pires 2006). Ces séquences ADNm sont

ensuite comparées aux séquences types d’ADN mitochondrial de référence disponibles dans les bases de données

internationales (NCBI – Genbank cf Benson et al 2005) et dans les articles scientifiques de référence. Ce traitement

informatique de comparaison de séquence permet de déterminer avec une fiabilité supérieure à 99% l’espèce et la

lignée génétique héritée de la mère. Potentiellement tous les haplotypes de loups recensées de par le monde sont

identifiables, et nous pouvons notamment confirmer si l’échantillon provient d’un loup de la lignée dite italo-alpine,

présente en France, cette lignée présentant des caractéristiques uniques (haplotype unique – cf annexe et Lucchini

et al, 2004). Ce séquençage mitochondrial ne présage pas en revanche du diagnostic d’un éventuel caractère

d’hybridation, ce dernier relevant de l’analyse des marqueurs microsatellites nucléaires bi-parentaux (cf après).

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Le suivi génétique des loups en 2018

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Figure 2 : Démarche d’analyse des échantillons sous l’approche multitube : chaque échantillon fait l’objet d’un séquençage de la région de

contrôle de l’ADN mitochondrial, permettant une première identification de l’espèce, suivi du génotypage des marqueurs microsatellites sur

l’ADN nucléaire pour obtenir le profil génétique individuel. Cette étape est répétée 4 fois pour assurer la qualité du génotypage. Seuls les

profils génétiques présentant un indice qualité suffisant (bonne répétabilité) et un nombre suffisant de marqueurs génotypés sont

interprétables. Le croisement d’un loup et d’un chien donne un hybride de première génération (HYBF1). Si celui-ci survit et se recroise avec

un loup, le descendant est classé « BC» (pour backcross ou rétrocroisement). Ces catégories sont identifiables par l’analyse bio-informatique

des profils génétiques.

4/Génotypage individuel

Les ADN nucléaires biparentaux sont amplifiés et analysés au niveau du panel de marqueurs microsatellites

spécifiquement mis au point pour le Loup (Godinho 2011, Godinho 2014, Randi 2014) et d’un marqueur de sexe

(Amélogénine). Pour assurer la continuité avec l’historique, le génotypage a repris les 6 marqueurs historiques

(LECA) assortis des 4 marqueurs communs avec les autres pays alpins, auxquels 12 marqueurs supplémentaires ont

été ajoutés pour permettre une résolution accrue des profils individuels et des analyses d’hybridation chien-loup.

Chaque profil génétique est donc constitué des allèles ayant été séquencés sur 24 marqueurs (22 microsatellites et

le marqueur de sexe en double – cf annexe). Onze d’entre eux sont spécifiquement dédiés à l’analyse d’hybridation.

Chaque génotypage est répété 4 fois (approche multitube) en 2 multiplexes pour pallier les potentielles pertes

d’allèles inhérentes à l’amplification de l’ADN dégradé. Une étude préalable de la performance du jeu de marqueurs

a été réalisée pour éviter toute fausse identification ou au contraire confusion de deux individus en cas de profil

génétique partiel ou non répétable. Un indice qualité (IQ) mesure la répétabilité du génotypage. Seuls sont retenus

les génotypages avec IQ>0.5 (échelle 0 à 1) et avec un profil présentant au moins 14 marqueurs, minimum requis

pour ce panel pour assurer les analyses d’hybridation. Après tests, deux profils génétiques similaires mais

présentant plus de 2 allèles différents sont considérés comme distincts, règle au préalable testée par mise en

concurrence avec un autre jeu de marqueurs. Un contrôle visuel des potentiels artéfacts issus du génotypage

permet de prendre en compte les potentielles pertes alléliques et/ou faux allèles inhérents aux analyses génétiques

sur échantillons dégradés (Miller et al. 2002, Pompanon et al. 2005, Wang 2017).

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Le suivi génétique des loups en 2018

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5/ Hybridation récente et héritage ancestral

L’identification de la lignée d’origine ne conclut en rien sur le caractère hybride ou non des animaux, vu la

transmission monoparentale de l’ADN mitochondrial. Le caractère hybride ne peut se mesurer qu’en analysant le

profil génétique individuel dressé sur l’ADN hérité des 2 parents, l’ADN nucléaire (cf infra). La proximité génétique

entre C. l. familiaris et C. l. lupus est telle qu’aucun allèle diagnostic n’est connu pour être exclusif de l’une ou l’autre

sous-espèce. Aussi, l’identification du caractère hybride doit reposer sur une démarche probabiliste à savoir la

probabilité qu’un profil génétique donné appartienne à un groupe d’échantillons de référence « Loup » ou « Chien »

préalablement constitué. Le groupe d’échantillons de référence « Loup » a été constitué au sein de la population

italo-alpine, celui de « Chien » à partir de 40 races différentes de manière à intégrer la diversité allélique potentielle.

Le groupe de référence « Loup » n’est volontairement pas étendu aux autres lignées pour éviter les effets de

dilution, qui en retour restreindraient le pouvoir de diagnostic des hybrides au sein de la population d’intérêt. Le

scan préalable et systématique de l’ADNm reste disponible pour identifier une origine populationnelle autre que

Italo-alpine. Chacun de ces deux groupes de référence présente une diversité de combinaisons alléliques qui, après

analyse, les sépare parfaitement. Si un animal est issu du croisement entre un loup et un chien, alors celui-ci

présente un profil génétique individuel qui le classe entre les 2, c’est-à-dire qu’il présente une probabilité autour de

50% de chance d’appartenir à l’un ou à l’autre des 2 groupes (hybride de première génération F1). Le sens de

l’hybridation est connu grâce à l’héritage maternel de l’ADN mitochondrial.

Le niveau d’hybridation pour chaque échantillon est donné par une probabilité d’assignation à la classe « Loup ».

Les profils génétiques sont analysés informatiquement à l’aide du logiciel d’inférence bayésienne STRUCTURE

(Pritchard 2000, Falush 2003) en utilisant le paramétrage du modèle « avec hybridation » et « fréquences alléliques

corrélées ». Le nombre de classes n’est pas fixé au préalable mais mesuré par le processus statistique (K=2), afin

de ne pas brider les analyses sur ce paramètre (cf annexe pour le détail). Les analyses informatiques consistent en

un très grand nombre de simulations (longueur de burn-in de 100 000 et longueur de chaîne de Monte-Carlo de

100 000), chaque simulation étant répétée 20 fois. Ces analyses statistiques permettent de déterminer la

probabilité d’assignation aux deux sous-espèces de référence, le chien et le loup, et l’intervalle de crédibilité à 95%

de cette probabilité. Dès lors que l’intervalle de crédibilité ne recouvre ni la borne 0 (probabilité 0%) ni la borne 1

(probabilité 100%) alors l’échantillon est considéré comme hybride (Bohling 2011). Cette méthode permet de

détecter avec fiabilité des hybrides de première génération (F1) et les hybrides de deuxième génération (back-cross

ou rétrocroisement, c’est-à-dire croisement d’un loup ou d’un chien avec un F1). Comme l’ensemble de la littérature

internationale sur le sujet, l’identification de rétrocroisement au-delà de la 2ème génération (dans le sens chien ou

dans le sens loup) présente trop de risque d’erreur pour apporter une conclusion fiable.

Encart : Etudes et Recherche sur les hybrides

En marge du travail d’analyse dans le cadre du marché public, une phase d’études et recherche sur les hybrides a été menée sur 5 mois

en 2018, entre autres pour s’assurer de la bonne résolution de notre méthode de détection des hybrides. Ce travail a permis de mesurer

la variance des probabilités d’assignation, notamment au travers de simulations sur le jeu de données français (croisements virtuels

d’animaux connus et vérification de l’assignation de leurs produits). Les

intervalles de crédibilité de la probabilité d’assignation, mesurés sur chaque

échantillon, permettent de classer les échantillons en « HYBF1 » si p=0.5 est

inclus dans l’intervalle, dans le groupe « Loup » si la borne supérieure de

l’intervalle contient p=1, et « back-cross » (BC) si les bornes de l’intervalle

excluent 0.5 et 1. L’échantillon est assigné au groupe « Chien » lorsque

l’intervalle de crédibilité contient p=0. NB : sur le graphique ci-contre, la

probabilité d’assignation est représentée par la « Q-value ». Cette phase

d’études et recherche a confirmé la robustesse de notre méthode et du jeu

de marqueurs pour identifier les F1 sans risque, ainsi que les rétrocroisements

de 2eme génération avec un risque modéré de 6% d’erreur. Les potentiels

rétrocroisements de générations antérieures sont trop dilués pour être

détectés avec une robustesse suffisante (Beugin et al. en préparation).

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Le suivi génétique des loups en 2018

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RESULTATS

1/ Séquençage de l’ADN mitochondrial : tous les Canis lupus lupus sont de la lignée italo-alpine originelle, sauf deux

Sur les 1246 échantillons analysés, les séquences d’ADN mitochondrial proviennent pour 7% de renards, 6% (n=75)

de C. l. familiaris et pour 76% (n=947) de C. l. lupus (figure 3). Tous les C. l. lupus sont de la lignée italo-alpine w22

(sensus nomenclature internationale de Pilot et al. 2010) sauf 4 échantillons appartenant à 2 individus différents

provenant de Lozère. Ces derniers sont identifiés comme appartenant à une lignée proche de « w1 » (sensus Pilot

et al. 2010) non encore recensée en France. Cette lignée - faussement dénommé « balte » par association

géographique - est retrouvée dans de nombreux pays d’Europe de l’est incluant l’Allemagne, les pays baltes mais

aussi en Pologne, Russie ou encore en Finlande. L’origine de ces deux animaux reste inconnue. Depuis la collecte

des échantillons en 2017, aucune nouvelle donnée ne vient pour l’instant documenter leur présence, malgré les

recherches intensives menées sur site (Cf communiqué de presse).

Un reliquat de 10% présente des séquences impossibles à examiner et/ou n’identifie que le genre sans possibilité

de préciser l’espèce (i.e. Canis sp., n=25). Malgré leur ADNm de faible qualité, une partie d’entre eux (n=19) est

« repêchée » par l’analyse concluante de leur ADN nucléaire permettant leur assignation à la sous espèce loup ou

chien.

Figure 1 : Répartition géographique des résultats des analyses d’ADN mitochondrial. Le pourcentage de C. l. lupus est plus important dans le

massif alpin, où le volume disponible d’échantillons permet aux correspondants du réseau Loup de sélectionner les plus caractéristiques. Les

consignes de récolte des échantillons sur le front de colonisation sont volontairement moins sélectives en regard de leur faible nombre, dans

l’objectif de détecter toute nouvelle présence potentielle de l’espèce.

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Le suivi génétique des loups en 2018

10

2/ L’obtention de l’ensemble des profils génétiques individuels collectés depuis 2008

Parmi les 1246 échantillons analysés, 763 profils individuels différents ont pu être dressés, certains étant identifiés

à plusieurs reprises. Sur ces 763 empreintes, 124 possédaient un indice qualité et/ou un nombre de marqueurs

insuffisants pour être interprétés. Ainsi 53 empreintes individuelles de chiens, et 586 empreintes individuels de

loups ont pu faire l’objet d’analyses pour caractériser le degré d’hybridation (cf. ci-après).

Figure 2 : Nombres d’échantillons analysés en 2018 et décomposition des résultats.

Il faut bien comprendre que ces profils génétiques ne proviennent pas tous d’animaux encore vivants mais bien

d’échantillons récoltés lors des dix dernières années. A ce titre ils ne représentent pas l’effectif contemporain. En

revanche, c’est sur ce panel d’animaux connus, dont la signature génétique sera retrouvée (ou pas) d’une année

sur l’autre au travers de leurs fèces, urines ou poils laissées sur le terrain, que l’on va pouvoir établir des historiques

de suivi de chaque animal pré-identifié Ces historiques vont être utilisés pour calculer le risque statistique de

« rater » un animal alors que celui-ci est bien vivant. C’est précisément cette mesure de la probabilité de détection

qui va servir, grâce à des modèles mathématiques dédiés de « capture – marquage (génétique) – recapture », de

facteur de correction à l’estimation de l’effectif de la population, mise à jour annuellement à la fin de chaque hiver

(cf. Bulletin Loup hiver 2017-2018).

3/ Quid des Chiens-loup et races de chiens issues d’une hybridation ?

Issus du croisement récent d’une louve et d’un berger allemand au milieu des années 30 et 50 respectivement, les

chiens de race « Chien-loup de Sarloss » (louve d’origine sibérienne) et « Chien-Loup tchécoslovaque » (louve

d’origine des Carpates) ont hérité, de fait, de nombreuses caractéristiques lupines. La ressemblance

morphologique reflète la forte proximité génétique. La question se posait donc de savoir si le panel de marqueurs

utilisés permettait de distinguer ces races de chien-loup.

Deux échantillons provenant d’animaux de ces races ont été analysés en aveugle. Les résultats confirment le

portage d’un ADN mitochondrial de loup d’« Europe de l’est » (en général w7, w23 ou w14, sensus Pilot et al. 2010).

L’assignation de leur profil génétique les classe en revanche sans ambiguïté dans la classe « Chien » (cf tableau 1 -

probabilité d’être assigné à la classe « Loup » comprise entre 0% et 17%). Ainsi, bien que ces races de chiens soient

porteurs potentiels d’un haplotype de loup, notre méthode permet, à l’instar d’autres études sur le sujet

(Smetanova et al. 2015), de les différencier clairement des profils génétiques de loups purs, quelle que soit leur

lignée. Une dépouille retrouvée dans les Alpes maritimes en 2015 appartient également à cette catégorie de chien.

Nombre echantillons analysés

n=1246Nombre de profils individuels différents

n=763Empreintes Canis l. lupus exploitables

n=586

Empreintes Canis l. familiaris exploitables

n=53

Empreintes non exploitables (IQ faible)

n=124

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Le suivi génétique des loups en 2018

11

Tableau 1 : Profils génétiques de 3 chiens-loups porteurs d’un ADN mitochondrial hérité de loup (lignées « Europe de l’Est ») et leurs allèles

sur les 22 marqueurs. L’assignation statistique de leur profil génétique les classe sans ambiguïté dans la classe « Chien » (La borne inférieure

de l’intervalle de crédibilité CI95_bott inclut zéro). La borne supérieure de l’intervalle de crédibilité de la probabilité d’appartenir à la classe

« Loup » (CI95_up) ne dépasse pas 17%.

4/ Des expertises hors marché public, commanditées par les préfets

En marge du marché public contracté par l’ONCFS pour les analyses courantes, les préfets peuvent recourir à des

analyses en urgence pour diagnostiquer une situation particulière, généralement dans les nouveaux départements

concernés par une possible présence de loups. Des échantillons de Dordogne (n=3), Pyrénées atlantiques (n=11),

Aube (n=1) ont utilisé cette procédure. La majorité des analyses sont restées infructueuses, en identifiant des

espèces non cibles (notamment renard). Deux ont permis l’identification d’un loup respectivement dans l’Aube et

dans les Pyrénées atlantiques, tous deux de lignée italo-alpine. L’animal identifié dans les Pyrénées atlantiques

présentait des caractéristiques d’hybridation d’héritage ancien (cf communiqué presse préf 644)

5/ Surveillance des taux d’hybridation : bilan rétrospectif

Les analyses d’hybridation ont été réalisées sur les 586 profils génétiques exploitables de loup et les 53 profils

génétiques exploitables de chiens. L’analyse montre que tous les échantillons classés « loups » par l’analyse

présentent des probabilités d’assignation à la population de référence en moyenne égales à 99% (variant de 94% à

100%). Des valeurs de probabilité d’assignation entre 36 et 77% caractérise les hybrides F1, tandis que les animaux

porteur d’un potentiel héritage ancestral par rétrocroisements « BC » présente des probabilités d’assignation

intermédiaires variant de 59% et 92% (cf. figure 5). Compte tenu de cette variance, quelques individus peuvent alors

présenter des probabilités en limite de classe (par exemple un intervalle de confiance supérieur égal à 0.997 très

proche de 1) dont la classification est soldée par expertise approfondie du génotypage concerné et de ses

répétitions.

4 https://france3-regions.francetvinfo.fr/nouvelle-aquitaine/pyrenees-atlantiques/bearn/bearn-tirs-defense-autorises-apres-confirmation-du-loup-hybride-vallee-ossau-1528654.html

Figure 3 : Etendue des valeurs de probabilité d’assignation aux

classes Loup, Chien, Hybride F1 (HYBF1) et rétrocroisement

(Backcross BC). Un profil est classé Loup si l’intervalle de

confiance de sa probabilité d’assignation contient 1 (100% de

chance d’appartenir à la classe Loup), Chien si l’intervalle de

confiance contient p=0, HybF1 si l’intervalle de confiance

comprend p=0.5, ou BC si les bornes de son intervalle de

confiance sont >0.5 et <1. (Voir encart 2)

Série N_Antagene Nu_ONCFS Genotype_trans Type Tri IQ mtDNA mitotype (Pilot 2010)DNA_ext Sexe HybridationProba_Loup CI95_bott CI95_up

2018-S4 584277 D7017001 CHS55-31 D 2-Chien 1 Canis lupus Saarloos (w14) XY Chien 0,006 0,000 0,062

2018-S4 584262 D1216001 CHS55-29 P 2-Chien 0,99 Canis lupus Saarloos (w7) XX Chien 0,003 0,000 0,039

2017-S1 543620 D0615014 CHS52-19 D 2-Chien 1 Canis lupus Saarloss (w23) XY Chien 0,025 0,000 0,172

01-AHT103 02-AHT111 03-AHTk211 04-FH2096 05-CPH02 06-FH2088 07-C0917308-CPH05 09-FH2004 10-CFX3037111-CXX279

584277 D7017001 096102 098104 092092 092096 114114 132132 124132 127131 239301 172172 118118

584262 D1216001 098098 104104 086088 096100 114114 132132 124124 131131 235239 168172 124124

543620 D0615014 100102 102102 088090 096096 114118 120128 124126 127131 301301 176176 122124

12-C09250 13-FH2161 14-FH2140 15-INU030 16-FH2137 17-FH2054 18-C2744219-Dbar1 20-REN162C04 21-PEZ17 22-FH2010

584277 D7017001 166176 237241 127131 150152 181181 172172 186188 219246 201203 206210 245253

584262 D1216001 166166 237237 126126 150150 165181 141149 186186 243246 205215 206214 241245

543620 D0615014 166166 229251 131131 146146 169183 141157 186190 182182 191201 193193 249249

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Le suivi génétique des loups en 2018

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Les 53 profils porteurs de l’Adn mitochondrial de C. l. familiaris sont tous assignés sans ambiguïté à la classe

« Chien » par l’analyse microsatellite sans signe d’hybridation avec le loup.

Les résultats sur les 586 profils C. l. lupus montrent que :

- 88,7% (n=520) sont assignés sans ambiguïté à la classe « Loup », lignée italo-alpine). Dix

profils dont la borne supérieure de l’IC de probabilité était non égale mais très proche de

100% ont été rattachés à cette catégorie, après expertise fine des génotypages.

- 3,6% (n=21) présentent un profil hybride de première génération dans le sens Louve x Chien

(tableau 2). Parmi ces hybrides F1, 7 individus sont potentiellement issus d’une seule et

même portée détectée en 2011 en Tinée (06) et 6 individus d’une même portée en 2015 en

Maurienne (73).

- 7,5% (n=44) ont été identifiés comme porteurs de gènes de chiens hérités par

rétrocroisements, héritage de leur ascendance plus ou moins lointaine. A noter que la

fiabilité de ce diagnostic présente un risque non négligeable de 6% de faux diagnostic pour

un héritage de 2ème génération et de plus de 45% de risque de faux diagnostic pour les

héritages plus anciens.

- 0.2% (n=1) représente le profil w1 (parmi les deux individus, un seul présente un génotype

exploitable) dont l’analyse d’hybridation est sans objet car non assignable à une population

de référence potentielle en l’absence de connaissance complémentaire de son origine

naturelle ou captive.

Sur les deux dernières années écoulées, la situation contemporaine se résume donc à 4 individus hybrides F1

détectés en 2017 et 2018 :

- une louve morte lors d’une collision en Maurienne (73) en 2017

- une louve tuée en Tinée (06) en 2017 (annoncé au Groupe national Loup de 2018)

- une louve encore présente en Maurienne en 2018 retrouvée au travers d’un dépôt d’urine,

- un loup mâle identifié par une fèces récoltée en 2017 dans le Vercors (26) non retrouvé depuis.

La cartographie par périodes (figure 6) montre que l’occurrence des hybrides de première génération ne persiste

pas au fil des années. En 2011 en revanche, plusieurs animaux hybrides détectés au même endroit en Tinée (06) a conduit à la comparaison de ces empreintes localisées à un instant donné : après analyse comparative deux à deux, ces profils présentent tous les points communs pour identifier une portée unique issue d’un accouplement louve x chien dont les 7 descendants (HYB F1) ne sont pas retrouvés depuis 2014 dans les échantillons jusqu’ici analysés. De même en Savoie (73), la comparaison deux à deux des individus F1 sur le même secteur de moyenne Maurienne montre que 6 individus sont apparentés, et issus d’une portée hybrides en 2015, localisée en bordure des deux meutes connues de Haute-Maurienne et du Thabor-Galibier. Si la présence d’animaux était bien documentée sur ce secteur par le Réseau, l’analyse génétique confirme ici une reproduction.

Depuis, trois de ces animaux sont déjà morts, deux autres non retrouvés depuis 2016. Une femelle encore

vivante est retrouvée par la génétique au travers d’un dépôt d’urine en 2018. La collecte des crottes et autres échantillons biologiques opérée par le Réseau assure la continuité annuelle du suivi moléculaire de la population de loups pour, le cas échéant, détecter ces animaux si ceux-ci sont encore vivants.

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Le suivi génétique des loups en 2018

13

Tableau 2 : Liste des 21 Hybrides F1 identifiés en primo-détection entre 2008 et 2018. F=Fèces ; D=Dépouille. IQ=indice qualité. Identification

des mitotypes initialement réalisé par le LECA et ensuite sur la base de la nomenclature de Pilot 2010, les deux étant identiques sur la séquence

type de la région de contrôle.

Type N°Dpt

Année_ primo

détection

N°Ref Massif Nom commune Genotype_n

om

DNAmt mitotype (Pilot 2010)

Hybridation

IQ Statut actuel

F 06 2011 1109190

Hte Tinée ST ETIENNE DE T. S36-H3 C. l. lupus

italo-alpine (w22) HYBF1 0,843 disparu depuis 2013

F 06 2011 1112261 Hte Tinée ISOLA S36-H4 C. l. lupus

italo-alpine (LECA) HYBF1 0,993 disparu depuis 2012

F 06 2011 1111216 Hte Tinée ST ETIENNE DE T. S36-H6 C. l. lupus

italo-alpine (LECA) HYBF1 0,8504 disparu depuis 2011

F 06 2011 1111204 Hte Tinée ST ETIENNE DE T. S36-H7 C. l. lupus

italo-alpine (w22) HYBF1 0,958 disparu depuis 2014

F 06 2011 1111219 Hte Tinée ST ETIENNE DE T. S36-H1 C. l. lupus

italo-alpine (w22) HYBF1 0,932 disparu depuis 2012

F 06 2012 1201064

Hte Tinée ENTRAUNES S36-H2 C. l. lupus

italo-alpine (LECA) HYBF1 0,791 disparu depuis 2012

F 06 2012 1203186

Hte Tinée GUILLAUMES S36-H8 C. l. lupus

italo-alpine (w22) HYBF1 0,718 disparu depuis 2012

F 06 2013 1312034

Hte Tinée CHATEAUNEUF D E. S38-19 C. l. lupus

italo-alpine (LECA) HYBF1 0,972 disparu depuis 2013

F 73 2013 F7313017

Hte Maurienne VILLARODIN BOUR. S33-7 C. l. lupus

italo-alpine (w22) HYBF1 0,677 Vivant en 2018

F 06 2014 1401049

Hte Tinée ST ETIENNE DE T. S55-08 C. l. lupus

Italo-alpine (w22) HYBF1 0,71 disparu depuis 2014

D 73 2015 D7315006

Hte Maurienne ST ANDRE S46-8 C. l. lupus

italo-alpine (w22) HYBF1 0,916 Mort (tir)

D 06 2015 D0615010

Moy Tinée ISOLA S49-13 C. l. lupus

italo-alpine (w22) HYBF1 1 Mort (tir)

D 06 2015 D0615009

Moy Tinée ISOLA S49-12 C. l. lupus

italo-alpine (w22) HYBF1 1 Mort (tir)

D 73 2015 D7315008

Hte Maurienne MODANE S54-13 C. l. lupus

italo-alpine (w22) HYBF1 1 Mort (chute)

F 73 2015 F7315050

Hte Maurienne VILLARODIN BOUR. S56-28 C. l. lupus

Italo-alpine (w22) HYBF1 0,625 disparu depuis 2015

F 04 2015 F0415061

Coulomp Daluis THORAME HAUTE S56-25 C. l. lupus

Italo-alpine (w22) HYBF1 0,79 disparu depuis 2015

D 26 2016 D2616004

Roanne VOLVENT S54-07 C. l. lupus

italo-alpine (w22) HYBF1 1 Mort (tir)

F 73 2016 F7316016

Hte Maurienne MODANE S56-01 C. l. lupus

Italo-alpine (w22) HYBF1 1 disparu depuis 2016

D 73 2017 D7317013

Galibier Thabor FRENEY S56-29 C. l. lupus

Italo-alpine (w22) HYBF1 1 Mort (collision)

F 26 2017 F2617035

Vercors HP LA CHAPELLE EN V. S55-13 C. l. lupus

Italo-alpine (w22) HYBF1 0,880 Vivant en 2017

D 06 2017 D0617015

Moy Tinée ROUBION S55-42 C. l. lupus

Italo-alpine (w22) HYBF1 1 Mort (tir)

Chaque année sont également identifiées des empreintes présentant un degré d’introgression plus ancien par

héritage de la génération précédente. Ces 44 empreintes reflétant des rétrocroisements ou « backcross » entre un

F1 et un loup (cf. supra) apparaissent ponctuellement dans tous les départements alpins selon les années et de

façon anecdotique sur un cas dans les Pyrénées ou encore l’animal mort dans le Doubs. Par effet de dilution,

l’influence de ces profils sur le patrimoine génétique des espèces s’efface, pour autant que les accouplements

hybrides chien/loup à l’origine des F1 ne soit pas récurrents en amont. Une récurrence plus marquée de profils

« BC » apparait en Maurienne (73) sur la période récente. La possibilité d’une reproduction d’un des F1

précédemment identifiée sur ce site est possible, que seules des analyses plus poussées des liens de parenté sur

plusieurs années pourront éclairer. Le nombre de BC est plus important sur la dernière biennale mais

l’échantillonnage concerne majoritairement les animaux morts analysés en priorité. L’échantillonnage sur ces

années reste encore incomplet (rattrapage en cours) pour l’ensemble des échantillons récoltés par le Réseau pour

pouvoir analyser une évolution temporelle des fréquences d’apparition. Contrairement aux hybrides de 1ere

génération identifiables quasiment sans faille, il faut noter que le risque de faux diagnostic est non négligeable (6%

en 2eme génération) pour l’identification d’un rétrocroisement (BC) : un génotypage incomplet sur certains

marqueurs, une perte allélique ou encore un faux allèle peuvent en effet également créer du biais dans le

diagnostic. Des recherches complémentaires sont en cours à l’échelle internationale sur ces points pour mesurer

la robustesse d’identification de ces cas d’introgression héritée des générations précédentes.

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Le suivi génétique des loups en 2018

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2008-2010

2011-2012

2013-2014

2015-2016

2017-2018 (en cours)

Cartographie : ONCFS UPAD– Fev 2018 Source des données : Réseau Loup/Lynx Oncfs

Fond topo : IGN BD carto ©

Figure 4 : Répartition géographique des profils génétiques des différents loups et chiens échantillonnés depuis 2008 par période de 2 années.

HYBF1 identifie les hybrides de première génération, BC les « backcross » (i.e. animaux dont le profil présente un héritage chien plus ancien).

Les croix identifient les individus morts.

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Le suivi génétique des loups en 2018

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PUBLICATION DES DONNEES Les données brutes sont communiquées en P. J.* de ce rapport. Celles-ci ne sont utilisables qu’avec l’accord

préalable des auteurs et ne peuvent être détachées de leur contexte d’analyse et de production, détaillé ici. Les

indices qualité associés aux génotypages sont notamment des clés de lecture importantes pour asseoir les

interprétations.

Résultat d’un long et minutieux travail pour vérifier les profils, homogénéiser les nomenclatures anciennes,

actuelles et passées, résoudre les incohérences, etc., la table de correspondance des profils génétiques ainsi

finalisée permet d’assurer la continuité du suivi des animaux au travers des années. Chaque nouveau profil

génétique (c’est-à-dire chaque nouvel individu) vient alimenter cette table. Il faut cependant noter que cet exercice

difficile et chronophage est susceptible de faire l’objet de mises à jours rétroactives par exemple au fur et à mesure

de la capitalisation de nouvelles données. Il convient de signaler deux principaux écueils dans lesquels il ne faudrait

pas tomber à la lecture de ces résultats :

- Les différents niveaux de résultats (échantillons, génotypes répétés, profils, animaux individualisés)

font l’objet de consolidations, a posteriori, soit par correction des données, consolidation des

empreintes partielles, vérification de la cohérence avec les données de terrain, etc. Il faut avoir

conscience que ces résultats sont dynamiques et non pas garantis fixe une fois pour toutes. A titre

d’exemple, le génotype partiel d’un animal peut être amené à être complété (ou infirmé) lors d’une

recapture ADN, mettant à jour en cascade le profil consolidé, son indice qualité, l'animal identifié, ses

recaptures, et éventuellement le niveau d'hybridation qui se basera sur une empreinte de meilleure

qualité que la précédente.

- Par souci de transparence, nous présentons ici les résultats pour chaque échantillon (identifiés par

leur numéro unique assurant la traçabilité). Un même individu peut donc présenter une empreinte

qui diffère légèrement (notamment pour les empreintes de qualité suffisante mais incomplètes sur

les 22 marqueurs) demandant une expertise consensus pour son identification. Si notre expertise

conclue à un même individu, son profil génétique est amendé.

Les résultats des analyses génétiques étaient jusqu’ici publiés dans les bulletins Loup du Réseau disponibles en

ligne sur le site de l’ONCFS. Ils étaient associés à la liste exhaustive des indices de présence. L’objectif visait avant

tout à effectuer un retour vers les correspondants du Réseau Loup Lynx et collecteurs de terrain, pour vérifier que

l’ensemble des indices soient bien pris en compte. Cela permettait également un retour vers les acteurs locaux. La

stratégie de publication de l’ONCFS sur le loup évolue par le biais du nouveaux site internet ONCFS spécialement

dédié au Loup (https://www.loupfrance.fr). Cet outil vise une meilleure réactivité par la publication d’actualités

mensuelles et la mise en ligne des bilans périodiques du suivi patrimonial du loup. Les productions basées sur nos

études et recherches tel que ce rapport, alimenteront au fur et à mesure l’onglet Boîte à outils. De plus, à la manière

des rubriques « Zoom sur » des bulletins du réseau, l’ONCFS s’attachera à la production d’analyses plus fines qui

correspondent mieux à la visualisation des animaux dans leurs territoires, pour faciliter l’interprétation biologique

locale.

* Pour pouvoir afficher les pièces jointes, vérifier dans la barre du lecteur PDF que l'option Afficher > Afficher / Masquer > Volets du navigateur > Pièces jointes est cochée puis cliquez dans la barre à gauche du document PDF sur le symbole enforme de trombone.

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Le suivi génétique des loups en 2018

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155, 945–959

Randi E, et al. (2000) Mitochondrial DNA variability in Italian and East European wolves: detecting the

consequences of small population size and hybridization, Conservation Biology, 14, 464-473

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Le suivi génétique des loups en 2018

17

Taberlet P & Luikart G (1999) Non-invasive genetic sampling and individual identification. Biological

Journal of the Linnean Society 68:41–55.

Valière N & Taberlet P (2000) Urine collected in the field as a source of DNA for species and individual

identification. Molecular Ecology 9, 2149–2154

Vila et al. (1999) Mitochondrial DNA phylogeography and population history of the gray wolf Canis lupus.

Mol Ecol 8: 2089–2103.

CONTRIBUTIONS - REMERCIEMENTS Ce travail est le fruit de l’investissement initial de l’ensemble des correspondants du Réseau Loup Lynx qui

contribuent tout au long des années à l’échantillonnage de terrain et à la collecte des échantillons. Les animateurs

régionaux du Réseau constituent la plaque tournante essentielle de coordination, consolidation, traçabilité et

interprétation biologique de l’ensemble des données. Enfin les équipes d’ANTAGENE ont œuvré durant l’année en

complément des prestations pour élaborer les protocoles toujours plus optimisés dans un cadre de recherche et

développement scientifique.

Ce travail est financé sur la base d’un appel d’offre à marché public N°2017-01 sur ressources propres

ONCFS et subventions ministérielles dédiées. La DREAL AURA a contribué à un financement complémentaire pour

l’étude de l’hybridation.

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Le suivi génétique des loups en 2018

18

ANNEXES

1/ METHODOLOGIE D’ANTAGENE

La méthodologie détaillée est disponible dans le rapport Antagene en ligne http://www.oncfs.gouv.fr/IMG/pdf/ANTAGENE-Rapport-ONCFS-Loup310817.pdf

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Le suivi génétique des loups en 2018

19

2/ LISTE DES MARQUEURS

3/ SEQUENCE TYPE D’ADNM DE LA REGION DE CONTROLE– HAPLOTYPE W22 (sensus Pilot et al2010) caractéristique de la lignée populationnelle italo-alpine retrouvé en Italie, France, et Suisse.

>582208

TCCCCGGTCTTGTAAACCAAAAATGGAGAGTAACCGCCCTCCCTAAGACTCAAGGAAGAAGCTCTTGCTCCACCATCAGCACC

CAAAGCTGAAATTCTTCTTAAACTATTCCCTGACACCCCTACATTCATATATTGAATCACCCCTACTGTGCTATGTCAGTATCTC

CAGGTAAACCCTTCTCCCCTCCCCCTATGTACGTCGTGCATTAATGGTTTGCCCCATGCATATAAGCATGTACATAATATTATA

TCCTTACATAGGACATACTAACTCAATCTCACAATTCACTGACCTATCAACAGTAATCGAATGCATATCACTTAGTCCAATAA

GGGCTTAATCACCATGCCTCGAGAAACCATCAACCCTTGCTCGTAATGTCCCTCTTCTCGCTCCGGGCCCATACTAACGTGGG

GGTTACTATCATGAAACTATACCTGGCATCTGGTTCCTACTTCA

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ONCFS-ANTAGENE-Session2018-S4

Population N°Antagene RefONCFS N°Loup(basefinale)

Typeprélèvement Tri Espèce

(mtDNA)Mitotype(Pilot2010) IQ Sexe Hybridation Proba_Loup CI95_bott CI95_up 01-

AHT10302-

AHT11103-

AHTk211 04-FH2096

2018-S4 584248 F1318003 #NA F 0-Contaminé #NA #NA 0,12 #NA #NA #NA #NA #NA 000000 000000 084084 0960962018-S4 584129 F1917001 #NA F 0-Noncanis Vulpesvulpes #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA NA NA NA NA2018-S4 584130 F1918001 #NA F 0-Noncanis (Campagnolroussâtre) #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA NA NA NA NA2018-S4 584133 F3417002 #NA F 0-Noncanis Vulpesvulpes #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA NA NA NA NA2018-S4 584134 F3417005 #NA F 0-Noncanis Vache #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA NA NA NA NA2018-S4 584136 F3418001 #NA F 0-Noncanis Susscrofa #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA NA NA NA NA2018-S4 584139 F4817008 #NA F 0-Noncanis Vulpesvulpes #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA NA NA NA NA2018-S4 584141 F4817010 #NA F 0-Noncanis Vulpesvulpes #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA NA NA NA NA2018-S4 584142 F4817011 #NA F 0-Noncanis Vulpesvulpes #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA NA NA NA NA2018-S4 584170 1403052 #NA F 0-Noncanis Vulpesvulpes #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA NA NA NA NA2018-S4 584177 1403076 #NA F 0-Noncanis #NA #NA 0,13 #NA #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 0000002018-S4 584184 F3817078 #NA F 0-Noncanis Vulpesvulpes #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA NA NA NA NA2018-S4 584203 F7418003 #NA F 0-Noncanis (Chamois) #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA NA NA NA NA2018-S4 584208 F2618007 #NA F 0-Noncanis Vulpesvulpes #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA NA NA NA NA2018-S4 584221 F0416205 #NA F 0-Noncanis (Chamois) #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA NA NA NA NA2018-S4 584222 F0416206 #NA F 0-Noncanis Vulpesvulpes #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA NA NA NA NA2018-S4 584225 F0417012 #NA F 0-Noncanis (Cerf) #NA 0,28 XX #NA #NA #NA #NA 098098 100100 084084 0960962018-S4 584227 F0417014 #NA F 0-Noncanis Vulpesvulpes #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA NA NA NA NA2018-S4 584228 F0417015 #NA F 0-Noncanis Vulpesvulpes #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA NA NA NA NA2018-S4 584231 F0615007 #NA F 0-Noncanis (Chevreuil) #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA NA NA NA NA2018-S4 584232 F0615010 #NA F 0-Noncanis Vulpesvulpes #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA NA NA NA NA2018-S4 584237 F0616021 #NA F 0-Noncanis Vulpesvulpes #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA NA NA NA NA2018-S4 584238 F1316012 #NA F 0-Noncanis Vulpesvulpes #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA NA NA NA NA2018-S4 584245 F1317003 #NA F 0-Noncanis Vulpesvulpes #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA NA NA NA NA2018-S4 584252 F8317010 #NA F 0-Noncanis (Chevreuil) #NA 0,43 XX #NA #NA #NA #NA 098098 100106 084084 0920962018-S4 584267 U8818001 #NA U 0-Noncanis (Humain) #NA 0,00 #NA #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 0000002018-S4 584269 U7418001 #NA U 0-Noncanis Vulpesvulpes #NA 0,22 XY #NA #NA #NA #NA 096100 000000 092096 0000002018-S4 584123 F1118001 #NA F 1-IQ<0,5 Canisfamiliaris #NA 0,26 #NA #NA #NA #NA #NA 096098 100104 086086 0961002018-S4 584125 F1118003 #NA F 1-IQ<0,5 Canisfamiliaris #NA 0,00 #NA #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 0000002018-S4 584131 F3017004 #NA F 1-IQ<0,5 #NA #NA 0,00 #NA #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 0000002018-S4 584132 F3416005 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus Italo-alpine(w22) 0,39 XY #NA #NA #NA #NA 098098 100106 084084 0920962018-S4 584143 F4818002 #NA F 1-IQ<0,5 Canissp. #NA 0,43 XY #NA #NA #NA #NA 098098 102108 084084 100100

2018-S4-Pass 584144 1003087 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus Italo-alpine(w22) 0,13 #NA #NA #NA #NA #NA 098098 000000 000000 0000002018-S4-Pass 584145 1104151 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus Italo-alpine(w22) 0,00 #NA #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 0000002018-S4-Pass 584146 F0511011 #NA F 1-IQ<0,5 Canissp. #NA 0,00 #NA #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 0000002018-S4-Pass 584147 F1216002 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus Italo-alpine(w22) 0,45 XY #NA #NA #NA #NA 098098 100100 088088 0961002018-S4-Pass 584148 F2609007 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus Italo-alpine(w22) 0,43 #NA #NA #NA #NA #NA 098098 100106 084084 0960962018-S4-Pass 584149 F7315031 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus Italo-alpine(w22) 0,21 #NA #NA #NA #NA #NA 098098 100106 000000 0960962018-S4-Pass 584158 FIT00109093 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus Italo-alpine(w22) 0,32 #NA #NA #NA #NA #NA 000000 106106 084084 092092

2018-S4 584160 1401029 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus Italo-alpine(w22) 0,15 #NA #NA #NA #NA #NA 000000 000000 084084 0960962018-S4 584171 1403055 #NA F 1-IQ<0,5 Canissp. #NA 0,18 #NA #NA #NA #NA #NA 098098 100106 083083 0920962018-S4 584172 1403056 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus Italo-alpine(w22) 0,28 XX #NA #NA #NA #NA 000000 100102 088088 0960962018-S4 584173 1403065 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus Italo-alpine(w22) 0,36 XY #NA #NA #NA #NA 098098 100102 000000 0920962018-S4 584176 1403073 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus Italo-alpine(w22) 0,49 XX #NA #NA #NA #NA 098098 100106 084084 0920922018-S4 584182 F3817053 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus Italo-alpine(w22) 0,21 #NA #NA #NA #NA #NA 098098 106106 000000 0920922018-S4 584183 F3817076 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus Italo-alpine(w22) 0,31 #NA #NA #NA #NA #NA 098098 000000 084086 0920922018-S4 584186 F3817083 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus Italo-alpine(w22) 0,14 #NA #NA #NA #NA #NA 098098 000000 084084 0960962018-S4 584188 F3817089 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus Italo-alpine(w22) 0,00 #NA #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 0000002018-S4 584199 F3818061 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus Italo-alpine(w22) 0,40 #NA #NA #NA #NA #NA 098098 000000 084084 0920922018-S4 584200 F3818062 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus Italo-alpine(w22) 0,28 #NA #NA #NA #NA #NA 098098 000000 084084 0920922018-S4 584201 F3818063 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus Italo-alpine(w22) 0,45 XX #NA #NA #NA #NA 098098 096100 084084 0920922018-S4 584204 F7418004 #NA F 1-IQ<0,5 #NA #NA 0,00 #NA #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 0000002018-S4 584213 F7317032 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus Italo-alpine(w22) 0,30 #NA #NA #NA #NA #NA 000000 100102 000000 096096

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ONCFS-ANTAGENE-Session2018-S4

Population N°Antagene RefONCFS N°Loup(basefinale)

Typeprélèvement Tri Espèce

(mtDNA)Mitotype(Pilot2010) IQ Sexe Hybridation Proba_Loup CI95_bott CI95_up 01-

AHT10302-

AHT11103-

AHTk211 04-FH2096

2018-S4 584216 F7317063 #NA F 1-IQ<0,5 Canissp. #NA 0,39 #NA #NA #NA #NA #NA 098098 100100 084084 0920962018-S4 584220 F0416204 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus Italo-alpine(w22) 0,22 #NA #NA #NA #NA #NA 098098 100100 084084 0000002018-S4 584223 F0416210 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus Italo-alpine(w22) 0,00 #NA #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 0000002018-S4 584224 F0416215 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus Italo-alpine(w22) 0,44 XX #NA #NA #NA #NA 098098 100100 000000 0960962018-S4 584230 F0417064 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus Italo-alpine(w22) 0,44 XX #NA #NA #NA #NA 098098 100100 084086 0960962018-S4 584234 F0615016 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus Italo-alpine(w22) 0,31 #NA #NA #NA #NA #NA 098098 094106 084084 0921092018-S4 584236 F0616006 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus Italo-alpine(w22) 0,02 #NA #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 0000002018-S4 584239 F1316014 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus Italo-alpine(w22) 0,47 XX #NA #NA #NA #NA 098098 100106 088088 0920962018-S4 584240 F1316016 #NA F 1-IQ<0,5 #NA #NA 0,00 #NA #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 0000002018-S4 584241 F1316017 #NA F 1-IQ<0,5 #NA #NA 0,00 #NA #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 0000002018-S4 584242 F1316018 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus Italo-alpine(w22) 0,05 XX #NA #NA #NA #NA 098100 000000 084084 0000002018-S4 584243 F1317001 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus Italo-alpine(w22) 0,28 XY #NA #NA #NA #NA 098098 100100 000000 0960962018-S4 584247 F1318002 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus Italo-alpine(w22) 0,02 #NA #NA #NA #NA #NA 098098 106106 000000 0000002018-S4 584249 F6816002 #NA F 1-IQ<0,5 Canisfamiliaris #NA 0,28 #NA #NA #NA #NA #NA 100100 094104 084084 1001002018-S4 584251 F8317009 #NA F 1-IQ<0,5 Canissp. #NA 0,24 #NA #NA #NA #NA #NA 098098 100100 084084 0920962018-S4 584254 F8318002 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus Italo-alpine(w22) 0,38 XX #NA #NA #NA #NA 098098 102106 084084 0960962018-S4 584255 F8318003 #NA F 1-IQ<0,5 #NA #NA 0,04 #NA #NA #NA #NA #NA 000000 100100 000000 0000002018-S4 584256 F8318004 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus Italo-alpine(w22) 0,10 XY #NA #NA #NA #NA 000000 100100 084084 0000002018-S4 584258 F8417001 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus Italo-alpine(w22) 0,09 #NA #NA #NA #NA #NA 000000 100100 084084 0000002018-S4 584260 P5418003 #NA P 1-IQ<0,5 #NA #NA 0,00 #NA #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 0000002018-S4 584263 D5218001 #NA P 1-IQ<0,5 Canisfamiliaris #NA 0,22 #NA #NA #NA #NA #NA 090090 104110 088092 0961002018-S4 584265 U4816007 #NA U 1-IQ<0,5 #NA #NA 0,00 #NA #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 0000002018-S4 584276 D5417001 #NA D 1-IQ<0,5 Canisfamiliaris #NA 0,21 #NA #NA #NA #NA #NA 000000 100100 088088 0000002018-S4 584289 D0617010 #NA D 1-IQ<0,5 Canislupus Italo-alpine(w22) 0,00 #NA #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 0000002018-S4 584298 D3818001 #NA D 1-IQ<0,5 Canislupus Italo-alpine(w22) 0,00 #NA #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 0000002018-S4 584301 D7417002 #NA D 1-IQ<0,5 Canissp. #NA 0,00 #NA #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 0000002018-S4 584124 F1118002 CH55-02 F 2-Chien Canisfamiliaris #NA 0,870 XY Chien 0,003 0,000 0,028 000000 102104 084086 0960962018-S4 584126 F1118004 CH55-03 F 2-Chien Canisfamiliaris #NA 0,990 XY Chien 0,009 0,000 0,094 098098 104108 090092 1001002018-S4 584127 F1118005 CH55-04 F 2-Chien Canisfamiliaris #NA 0,880 XY Chien 0,004 0,000 0,049 096102 104104 086086 0961002018-S4 584128 F1118006 CH55-05 F 2-Chien Canisfamiliaris #NA 0,740 XX Chien 0,007 0,000 0,082 102104 094098 084088 0961002018-S4 584135 F3417006 CH55-06 F 2-Chien Canisfamiliaris #NA 0,720 XX Chien 0,009 0,000 0,102 096098 104104 088090 0961002018-S4 584140 F4817009 CH55-07 F 2-Chien Canisfamiliaris #NA 0,580 XX Chien 0,004 0,000 0,050 098098 098104 084088 1001002018-S4 584202 F7417017 CH55-15 F 2-Chien Canissp. #NA 0,690 XY Chien 0,005 0,000 0,062 102104 100108 084086 1001002018-S4 584209 F2618018 CH55-08 F 2-Chien Canisfamiliaris #NA 0,940 XX Chien 0,007 0,000 0,075 098100 104104 092092 1001002018-S4 584226 F0417013 CH55-01 F 2-Chien #NA #NA 0,700 XY Chien 0,011 0,000 0,121 104104 094100 084086 1001002018-S4 584259 P1118002 CH53-02 P 2-Chien Canisfamiliaris #NA 1,000 XX Chien 0,011 0,000 0,119 100100 104108 084086 0961002018-S4 584262 D1216001 CH55-13 P 2-Chien Canislupus saarloos(w7) 0,990 XX Chien 0,003 0,000 0,039 098098 104104 086088 0961002018-S4 584264 U5417003 CH55-10 U 2-Chien Canisfamiliaris #NA 0,640 XX Chien 0,004 0,000 0,049 100100 104104 090090 0961002018-S4 584266 U5418001 CH55-11 U 2-Chien Canisfamiliaris #NA 0,640 XY Chien 0,019 0,000 0,180 098098 000000 000000 0961002018-S4 584275 S4816001 CH55-12 S 2-Chien Canisfamiliaris #NA 0,860 XY Chien 0,010 0,000 0,106 098100 104108 086088 1001002018-S4 584277 D7017001 CH55-14 D 2-Chien Canislupus saarloos(w14) 1,000 XY Chien 0,006 0,000 0,062 096102 098104 092092 0920962018-S4 584137 F3418002 S37-3 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 0,880 XY Loup 0,998 0,973 1,000 098098 100106 084084 0920962018-S4 584138 F3916004 S53-10 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 0,800 XX Loup 0,996 0,956 1,000 098098 100100 084084 096096

2018-S4-Pass 584150 F7415001 S42-14 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 0,840 XY Loup 0,979 0,884 1,000 098098 106106 000000 0920962018-S4-Pass 584151 F8316003 #NA F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 1,000 XY BC 0,883 0,700 0,994 098098 100102 086086 0960962018-S4-Pass 584152 F8316026 S51-33 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,998 0,973 1,000 098098 100106 086086 0920962018-S4-Pass 584153 F8316028 S51-34 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 0,950 XY Loup 0,998 0,977 1,000 098098 106106 084084 0960962018-S4-Pass 584154 F8316035 S51-36 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 0,950 XY Loup 0,997 0,970 1,000 098098 106106 086086 0920922018-S4-Pass 584155 F8316036 S51-32 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 0,780 XX Loup 0,994 0,938 1,000 098098 106106 086088 0920922018-S4-Pass 584156 F8316043 S51-35 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 1,000 XY BC 0,816 0,636 0,952 098098 102106 088088 0960962018-S4-Pass 584157 F8816003 S50-2 F 3-Exploitable Canissp. #NA 0,660 XY Loup 0,996 0,956 1,000 098098 100100 083083 096096

2018-S4 584159 1401028 S32-10 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 0,550 XY Loup 0,997 0,969 1,000 098098 100106 084084 0920962018-S4 584161 1401036 S55-07 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 0,820 XY Loup 0,937 0,761 1,000 098100 100100 084084 092096

Page 22: ILAN DE LA ERE E DE MISE EN ŒUVRE DU ... - Le loup en France · et chose nouvelle 3) permettre de calculer, pour chaque échantillon, la probabilité d’une hybridation avec le

ONCFS-ANTAGENE-Session2018-S4

Population N°Antagene RefONCFS N°Loup(basefinale)

Typeprélèvement Tri Espèce

(mtDNA)Mitotype(Pilot2010) IQ Sexe Hybridation Proba_Loup CI95_bott CI95_up 01-

AHT10302-

AHT11103-

AHTk211 04-FH2096

2018-S4 584162 1401049 S55-08 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 0,710 XX HYBF1 0,536 0,310 0,743 098102 000000 090090 0920962018-S4 584163 1402030 S44-3 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 0,740 XY Loup 0,997 0,966 1,000 098098 100100 086086 0920962018-S4 584164 1402032 S36-17 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,998 0,975 1,000 098098 100106 084084 0920962018-S4 584165 1402033 S55-09 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,998 0,973 1,000 098098 100100 084084 0920962018-S4 584166 1402034 S55-10 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 0,760 XX Loup 0,996 0,960 1,000 098098 100106 084084 0920922018-S4 584167 1402037 S55-11 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 0,980 XY Loup 0,987 0,901 1,000 098098 100106 084084 0960962018-S4 584168 1402048 S38-1 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 0,960 XX Loup 0,998 0,976 1,000 098098 100106 084084 0920962018-S4 584169 1403051 S55-12 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 0,640 XY Loup 0,997 0,963 1,000 098098 100106 083083 0920962018-S4 584174 1403067 S52-26 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 0,950 XX Loup 0,998 0,977 1,000 098098 106106 084084 0920962018-S4 584175 1403070 S32-10 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 0,640 XY Loup 0,998 0,974 1,000 098098 100106 084084 0920962018-S4 584178 1403089 S50-14 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 0,660 XX Loup 0,998 0,974 1,000 098098 106106 084084 0920922018-S4 584179 F2617017 S54-01 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 0,960 XY BC 0,692 0,508 0,848 098098 100102 084084 0920962018-S4 584180 F2617035 S55-13 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 0,880 XY HYBF1 0,627 0,421 0,807 098108 100102 090090 0920962018-S4 584181 F2617036 S54-01 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 0,840 XY BC 0,724 0,536 0,878 098098 000000 084084 0920962018-S4 584185 F3817081 S55-01 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,997 0,963 1,000 098098 100106 084084 0960962018-S4 584187 F3817088 S55-14 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 0,920 XX Loup 0,998 0,972 1,000 098098 100106 084084 0920922018-S4 584189 F3817097 S55-01 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,997 0,963 1,000 098098 100106 084084 0960962018-S4 584190 F3818001 S55-15 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,986 0,861 1,000 098098 100102 086086 0961002018-S4 584191 F3818010 S55-02 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 0,860 XY Loup 0,995 0,943 1,000 098098 100106 084084 0960962018-S4 584192 F3818022 S54-53 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 0,920 XX BC 0,748 0,539 0,914 098098 100106 084084 0960962018-S4 584193 F3818023 S55-16 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 0,940 XY Loup 0,998 0,976 1,000 098098 100106 084084 0920922018-S4 584194 F3818025 S55-03 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 0,910 XX Loup 0,997 0,966 1,000 098098 106106 084084 0960962018-S4 584195 F3818026 S45-17 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 0,750 XX Loup 0,998 0,976 1,000 098098 100106 000000 0920922018-S4 584196 F3818027 S55-17 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 0,590 XX BC 0,730 0,505 0,904 098100 100100 084084 0920962018-S4 584197 F3818028 S55-02 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 0,910 XY Loup 0,995 0,941 1,000 098098 100106 084084 0960962018-S4 584198 F3818031 S55-03 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,997 0,969 1,000 098098 106106 084084 0960962018-S4 584205 F2617047 S54-47 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,997 0,962 1,000 098098 100100 084084 0920922018-S4 584206 F2617048 S54-47 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,997 0,961 1,000 098098 100100 084084 0920922018-S4 584207 F2617049 S55-18 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 0,960 XY Loup 0,997 0,961 1,000 098098 100100 084084 0920962018-S4 584210 F7317012 S54-19 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 0,920 XY BC 0,774 0,589 0,917 098102 100100 088088 0920962018-S4 584211 F7317013 S55-04 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 0,840 XX BC 0,869 0,705 0,977 098098 100100 084084 0920962018-S4 584212 F7317031 S55-04 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 0,770 XX BC 0,870 0,698 0,979 098098 100100 084084 0920962018-S4 584214 F7317050 S55-04 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 1,000 XX BC 0,848 0,681 0,966 098098 100100 084084 0920962018-S4 584215 F7317062 S40b-19 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 0,900 XX Loup 0,994 0,933 1,000 098098 100100 084084 0920962018-S4 584217 F7317064 S54-23 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 0,890 XX Loup 0,994 0,932 1,000 098098 100100 086086 0920922018-S4 584218 F0416201 S55-19 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 0,640 XY Loup 0,969 0,868 1,000 098098 100100 084084 0920962018-S4 584219 F0416203 S55-20 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 0,640 XY Loup 0,964 0,843 1,000 098098 100100 084084 0920962018-S4 584229 F0417016 S55-21 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 0,810 XX Loup 0,987 0,908 1,000 098098 106106 083083 0920922018-S4 584233 F0615015 S55-22 F 3-Exploitable #NA #NA 0,550 #NA Loup 0,786 0,541 1,000 098098 094106 084084 0920922018-S4 584235 F0615017 S44-5 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 0,910 XY Loup 0,997 0,969 1,000 098098 100100 084084 0960962018-S4 584244 F1317002 S55-23 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 0,990 XX BC 0,830 0,666 0,949 098098 100106 088088 0920962018-S4 584246 F1318001 S55-24 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 0,660 XX Loup 0,932 0,743 1,000 098098 102106 084084 0960962018-S4 584250 F8317002 S55-25 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 0,650 #NA Loup 0,997 0,969 1,000 098098 106106 086086 0920962018-S4 584253 F8318001 S55-26 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 0,650 XY Loup 0,997 0,970 1,000 098098 106106 084084 0920922018-S4 584257 F8416016 S55-27 F 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,997 0,972 1,000 098098 100100 084084 0920922018-S4 584261 P0617001 S55-28 P 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,983 0,877 1,000 098098 100102 084084 0920962018-S4 584268 U3818015 S49-23 U 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 1,000 XY BC 0,711 0,519 0,872 098100 102106 084084 0920962018-S4 584270 U7418003 S55-30 U 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,997 0,969 1,000 098098 100106 086086 0920922018-S4 584271 U2618003 S55-05 U 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 0,550 XY Loup 0,997 0,970 1,000 098098 000000 000000 0920962018-S4 584272 U2618004 S55-05 U 3-Exploitable Canissp. #NA 0,900 XY Loup 0,997 0,964 1,000 098098 100102 000000 0920962018-S4 584273 U7317003 S53-04 U 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,996 0,953 1,000 098098 100100 084084 0920922018-S4 584274 U7318003 S33-7 U 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 1,000 XX HYBF1 0,558 0,343 0,755 098102 100102 084088 0960962018-S4 584278 DES6918001 S51-35 D 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 1,000 XY BC 0,816 0,636 0,952 098098 102106 088088 096096

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ONCFS-ANTAGENE-Session2018-S4

Population N°Antagene RefONCFS N°Loup(basefinale)

Typeprélèvement Tri Espèce

(mtDNA)Mitotype(Pilot2010) IQ Sexe Hybridation Proba_Loup CI95_bott CI95_up 01-

AHT10302-

AHT11103-

AHTk211 04-FH2096

2018-S4-Pass 584279 D0608001 S20-4 D 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,998 0,974 1,000 098098 100106 084084 0920922018-S4 584280 D0616002 S55-32 D 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,998 0,976 1,000 098098 100106 084084 0960962018-S4 584281 D0617001 S55-33 D 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 1,000 XY BC 0,853 0,664 0,984 098098 100102 084084 0961002018-S4 584282 D0617002 S55-34 D 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,997 0,969 1,000 098098 100106 086086 0920922018-S4 584283 D0617003 S55-35 D 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,994 0,931 1,000 098098 100100 084084 0961002018-S4 584284 D0617004 S55-36 D 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,998 0,974 1,000 098098 100100 084084 0920922018-S4 584285 D0617005 S55-37 D 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,987 0,901 1,000 098098 100100 083083 0920962018-S4 584286 D0617007 S51-15 D 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,998 0,975 1,000 098098 100106 086086 0920962018-S4 584287 D0617008 S55-38 D 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 0,960 XX Loup 0,998 0,978 1,000 098098 100106 084084 0920922018-S4 584288 D0617009 S55-06 D 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 1,000 XY BC 0,745 0,554 0,897 098102 102106 086086 0920962018-S4 584290 D0617011 S55-39 D 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,998 0,973 1,000 098098 100100 084084 0920962018-S4 584291 D0617012 S38-1 D 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,998 0,976 1,000 098098 100106 084084 0920962018-S4 584292 D0617013 S55-40 D 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,998 0,976 1,000 098098 100100 086086 0920922018-S4 584293 D0617014 S55-41 D 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,950 0,828 1,000 098098 100100 084084 0920962018-S4 584294 D0617015 S55-42 D 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 1,000 XX HYBF1 0,626 0,430 0,800 098100 100106 084090 0920922018-S4 584295 D0617016 S55-43 D 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,998 0,976 1,000 098098 100106 084084 0960962018-S4 584296 D0617017 S55-06 D 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 1,000 XY BC 0,745 0,554 0,897 098102 102106 086086 0920962018-S4 584297 D3817002 S49-30 D 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 0,550 XX Loup 0,990 0,904 1,000 098098 100106 086088 0920922018-S4 584299 D3818002 S55-44 D 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 1,000 XX BC 0,742 0,552 0,894 098098 100102 086086 0920962018-S4 584300 D3818003 S55-45 D 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 0,510 XX Loup 0,996 0,951 1,000 098098 100106 084084 0920962018-S4 584302 D8418001 S55-46 D 3-Exploitable Canislupus Italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,997 0,969 1,000 098098 100106 084084 092092

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ONCFS-ANTAGENE-Session2018-S4

N°Antagene RefONCFS

584248 F1318003584129 F1917001584130 F1918001584133 F3417002584134 F3417005584136 F3418001584139 F4817008584141 F4817010584142 F4817011584170 1403052584177 1403076584184 F3817078584203 F7418003584208 F2618007584221 F0416205584222 F0416206584225 F0417012584227 F0417014584228 F0417015584231 F0615007584232 F0615010584237 F0616021584238 F1316012584245 F1317003584252 F8317010584267 U8818001584269 U7418001584123 F1118001584125 F1118003584131 F3017004584132 F3416005584143 F4818002584144 1003087584145 1104151584146 F0511011584147 F1216002584148 F2609007584149 F7315031584158 FIT00109093584160 1401029584171 1403055584172 1403056584173 1403065584176 1403073584182 F3817053584183 F3817076584186 F3817083584188 F3817089584199 F3818061584200 F3818062584201 F3818063584204 F7418004584213 F7317032

05-CPH02 06-FH2088 07-C09.173 08-CPH05 09-FH2004 10-

CFX30371 11-CXX279 12-C09.250 13-FH2161 14-FH2140 15-INU030 16-FH2137 17-FH2054 18-

C27.442 19-Dbar120-

REN162C04

21-PEZ17 22-FH2010

000000 000000 000000 000000 000000 172172 000000 000000 000000 000000 000000 163177 000000 000000 000000 207207 000000 000000NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA

000000 000000 000000 129129 297297 000000 000000 156160 000000 130152 000000 000000 000000 184184 182182 000000 000000 237245NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA

000000 096128 124126 129141 000000 000000 116122 162166 000000 000000 000000 157163 149149 000000 182182 000000 000000 000000NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA

120120 096120 126126 127129 000000 000000 116122 166170 000000 000000 000000 000000 000000 184184 000000 199199 000000 241241000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000000000 000000 000000 000000 000000 000000 114126 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 193193 000000000000 000000 000000 131133 243243 168168 112118 164170 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 245245000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000120120 096120 128128 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 145149 184184 000000 000000 000000 237245000000 000000 120124 131131 243243 000000 122124 170170 000000 000000 150150 000000 145176 186186 000000 000000 000000 000000000000 000000 000000 000000 329329 000000 116122 162162 267267 000000 000000 181181 153153 000000 182182 000000 000000 000000000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000112120 096096 124126 127127 000000 000000 116118 162166 000000 000000 144144 000000 000000 000000 000000 201201 000000 000000112112 000000 126126 129141 000000 000000 122122 166170 000000 130130 144144 157157 000000 000000 000000 000000 198198 000000000000 000000 000000 129129 235297 172172 122122 000000 000000 000000 000000 181181 000000 184186 227227 201201 000000 000000000000 000000 126126 127129 297297 000000 116124 162170 000000 130130 000000 157177 145165 000000 182182 201201 194198 000000000000 000000 000000 129141 000000 172172 116116 160162 000000 000000 000000 000000 141153 000000 182182 199201 000000 000000000000 000000 126132 000000 000000 000000 122124 160170 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000000000 000000 000000 127129 000000 172176 116124 160166 229229 131152 144146 169169 145157 186186 182182 191191 193193 000000000000 096128 124126 125129 000000 172172 124124 000000 000000 152152 000000 157181 145171 184184 182182 201201 000000 237245118120 096120 124124 129141 000000 172172 116116 160170 000000 000000 000000 157157 000000 184186 000000 201201 000000 000000000000 000000 126132 129129 000000 172172 000000 162174 000000 130130 000000 163171 145165 184184 000000 000000 000000 000000000000 000000 126126 141141 000000 000000 116116 162164 000000 130130 144144 000000 145145 184184 000000 000000 198198 000000000000 000000 000000 127127 000000 000000 116116 162162 000000 000000 144144 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000000000 120120 124126 129129 000000 172172 122122 166166 000000 130152 000000 157181 149149 184190 182182 201201 193202 245245000000 120132 124126 129129 000000 172172 116122 166166 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000112112 000000 124126 129129 000000 172172 122122 166166 000000 130130 144144 157181 000000 000000 000000 201201 202202 000000000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000000000 096120 124124 127129 000000 000000 114122 162166 000000 131138 000000 171183 141141 184190 182182 000000 000000 000000

Page 25: ILAN DE LA ERE E DE MISE EN ŒUVRE DU ... - Le loup en France · et chose nouvelle 3) permettre de calculer, pour chaque échantillon, la probabilité d’une hybridation avec le

ONCFS-ANTAGENE-Session2018-S4

N°Antagene RefONCFS

584216 F7317063584220 F0416204584223 F0416210584224 F0416215584230 F0417064584234 F0615016584236 F0616006584239 F1316014584240 F1316016584241 F1316017584242 F1316018584243 F1317001584247 F1318002584249 F6816002584251 F8317009584254 F8318002584255 F8318003584256 F8318004584258 F8417001584260 P5418003584263 D5218001584265 U4816007584276 D5417001584289 D0617010584298 D3818001584301 D7417002584124 F1118002584126 F1118004584127 F1118005584128 F1118006584135 F3417006584140 F4817009584202 F7417017584209 F2618018584226 F0417013584259 P1118002584262 D1216001584264 U5417003584266 U5418001584275 S4816001584277 D7017001584137 F3418002584138 F3916004584150 F7415001584151 F8316003584152 F8316026584153 F8316028584154 F8316035584155 F8316036584156 F8316043584157 F8816003584159 1401028584161 1401036

05-CPH02 06-FH2088 07-C09.173 08-CPH05 09-FH2004 10-

CFX30371 11-CXX279 12-C09.250 13-FH2161 14-FH2140 15-INU030 16-FH2137 17-FH2054 18-

C27.442 19-Dbar120-

REN162C04

21-PEZ17 22-FH2010

000000 000000 124126 129129 000000 172172 116116 000000 237238 000000 000000 000000 000000 186190 229229 201201 000000 000000000000 116116 126126 000000 000000 172172 124124 162174 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000120120 000000 126132 129141 000000 172172 122124 160174 000000 000000 144144 000000 145149 184184 000000 199201 000000 000000120120 120120 132132 129141 000000 172172 122122 000000 000000 000000 144144 000000 149149 184184 000000 000000 000000 000000000000 096128 000000 000000 000000 172172 116124 162170 000000 000000 144144 157157 000000 184184 000000 000000 202202 237245000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 177177 000000 000000 000000 000000 000000 000000120120 120128 126126 129129 000000 172172 116124 160162 000000 000000 000000 000000 141145 000000 000000 000000 000000 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245245120120 120128 126132 129129 243243 172172 122122 162170 000000 130130 144144 171171 141145 184184 182182 199201 194198 000000120120 120128 124126 127129 243301 172172 116124 160162 251267 130152 144144 163169 145145 184184 182182 201201 198198 245245112120 096120 126126 127129 243297 000000 122122 166166 000000 130130 000000 157181 153165 184184 182182 201201 194198 000000112118 096120 124132 129129 000000 172172 000000 160162 000000 130152 144144 157157 000000 184184 000000 201201 194198 000000112120 120120 126126 129129 243243 172172 118118 162164 000000 130130 144146 181181 145153 184184 182182 199201 194202 237245

Page 26: ILAN DE LA ERE E DE MISE EN ŒUVRE DU ... - Le loup en France · et chose nouvelle 3) permettre de calculer, pour chaque échantillon, la probabilité d’une hybridation avec le

ONCFS-ANTAGENE-Session2018-S4

N°Antagene RefONCFS

584162 1401049584163 1402030584164 1402032584165 1402033584166 1402034584167 1402037584168 1402048584169 1403051584174 1403067584175 1403070584178 1403089584179 F2617017584180 F2617035584181 F2617036584185 F3817081584187 F3817088584189 F3817097584190 F3818001584191 F3818010584192 F3818022584193 F3818023584194 F3818025584195 F3818026584196 F3818027584197 F3818028584198 F3818031584205 F2617047584206 F2617048584207 F2617049584210 F7317012584211 F7317013584212 F7317031584214 F7317050584215 F7317062584217 F7317064584218 F0416201584219 F0416203584229 F0417016584233 F0615015584235 F0615017584244 F1317002584246 F1318001584250 F8317002584253 F8318001584257 F8416016584261 P0617001584268 U3818015584270 U7418003584271 U2618003584272 U2618004584273 U7317003584274 U7318003584278 DES6918001

05-CPH02 06-FH2088 07-C09.173 08-CPH05 09-FH2004 10-

CFX30371 11-CXX279 12-C09.250 13-FH2161 14-FH2140 15-INU030 16-FH2137 17-FH2054 18-

C27.442 19-Dbar120-

REN162C04

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Page 27: ILAN DE LA ERE E DE MISE EN ŒUVRE DU ... - Le loup en France · et chose nouvelle 3) permettre de calculer, pour chaque échantillon, la probabilité d’une hybridation avec le

ONCFS-ANTAGENE-Session2018-S4

N°Antagene RefONCFS

584279 D0608001584280 D0616002584281 D0617001584282 D0617002584283 D0617003584284 D0617004584285 D0617005584286 D0617007584287 D0617008584288 D0617009584290 D0617011584291 D0617012584292 D0617013584293 D0617014584294 D0617015584295 D0617016584296 D0617017584297 D3817002584299 D3818002584300 D3818003584302 D8418001

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C27.442 19-Dbar120-

REN162C04

21-PEZ17 22-FH2010

118120 120120 126126 129141 309309 172172 116122 160162 267267 130130 144144 181181 153153 184190 182182 199201 198198 237245120120 096096 132132 129129 297309 172172 122124 160162 267267 130130 144144 171177 145165 184184 182182 201201 198198 245245112120 120128 124126 129141 243297 172172 116122 166170 237241 123130 144144 161181 141162 184184 182182 201207 194198 245245112120 120128 126126 129141 309309 172172 122124 170174 237267 130130 144144 157163 141149 184186 182182 199199 194198 237237120120 120128 124126 127141 247297 172172 116116 166170 241241 152152 144144 157163 149149 184184 182182 199201 198202 237245112120 096128 124126 129141 243309 172172 116122 160170 241271 130152 144144 157181 145149 184184 182182 201201 194198 245245120120 096128 124126 127141 243297 172172 116122 160170 241245 130130 144144 177181 145162 184184 182182 199201 198202 245245120120 120120 126126 127129 243297 172172 122122 160162 237271 130152 144144 157177 141149 184184 182182 199201 198202 237245120120 096120 126126 129141 309309 172172 000000 162162 271271 130152 144144 157181 141145 184184 182182 201201 194198 245245120120 096096 124126 129129 301309 176176 122122 166170 241241 130138 144144 157177 141145 184190 182182 201201 193198 245249112112 096120 126126 127129 297309 172172 122124 162166 237241 130130 144144 157181 141145 184184 182182 201201 198202 245245120120 096096 124126 127141 243309 172172 122122 160162 241241 130130 144144 157181 145145 184184 182182 201201 194198 245245120120 120120 126126 129129 243297 172172 122122 162162 267267 130138 144144 157163 145162 184184 182182 199201 198198 237245112120 128128 124126 129141 297297 172172 116116 160162 267271 130130 144144 157181 145145 184190 182226 201201 194198 245253114118 120128 124132 129131 309309 172172 124124 166166 251267 131152 144146 157169 141157 184184 182182 191201 193194 245245112118 096096 126132 129141 243243 172172 122122 160162 237267 130130 144144 177177 145153 184184 182182 199201 198198 245245120120 096096 124126 129129 301309 176176 122122 166170 241241 130138 144144 157177 141145 184190 182182 201201 193198 245249112120 000000 126126 129141 000000 000000 116122 000000 000000 000000 144144 163177 000000 184184 000000 201201 198198 000000118120 096120 132132 129131 297301 172172 122122 160162 237267 131152 144146 177183 145165 184190 182182 191199 202202 237249000000 000000 000000 127127 243243 172172 122124 162162 267271 000000 144144 000000 000000 000000 000000 000000 194202 237237112118 120120 126126 129129 297297 172172 124124 160170 237237 130130 144144 171181 145149 184186 182182 201201 198198 237237

Page 28: ILAN DE LA ERE E DE MISE EN ŒUVRE DU ... - Le loup en France · et chose nouvelle 3) permettre de calculer, pour chaque échantillon, la probabilité d’une hybridation avec le

ONCFS-ANTAGENE-Session2018-S1S2

Population N°Antagene RefONCFS N°Loup(basefinale)

Typeprélèvement Tri Espèce

(mtDNA)Mitotype(Pilot2010) IQ Sexe Hybridation Proba_Loup CI95_bott CI95_up 00-Clu-

Amelo-A00-Clu-Amelo-B 01-AHT103 02-AHT111 03-AHTk211 04-FH2096

S1-2018_Pass17 543658 F0414044 S49-4 F 0-Contaminé Canislupus italo-alpine(w22) 0,307 XX #NA #NA #NA #NA 901901 000000 098098 106106 084084 092092S1-2018_Urgences 551753 F1217009 #N/A F 0-NonCanis Vulpesvulpes #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NAS1-2018_Urgences 551755 F1217012 #N/A F 0-NonCanis Vulpesvulpes #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NAS1-2018_Urgences 551769 F4317001 #N/A F 0-NonCanis Vulpesvulpes #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NAS1-2018_Urgences 551770 F6317001 #N/A F 0-NonCanis Vulpesvulpes #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NAS1-2018_Urgences 551774 P0105004 #N/A P 0-NonCanis Vulpesvulpes #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NAS1-2018_Urgences 551779 U3816007 #N/A U 0-NonCanis Vulpesvulpes #NA 0,521 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 094098 106118 000000 092092S1-2018_Pass17 543648 F0413128 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,375 XX #NA #NA #NA #NA 901901 901901 096098 100106 084084 092092S1-2018_Pass17 543657 F0414041 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,323 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 100100 084084 096096S1-2018_Pass17 543659 F0414049 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,135 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 106106 084084 092092S1-2018_Pass17 543693 F0515014 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,370 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 100100 084084 092092S1-2018_Pass17 543726 F1314005 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,250 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 100102 086086 092096S1-2018_Pass17 543748 F3814020 #N/A F 1-IQ<0,5 Vulpesvulpes #NA 0,234 XX #NA #NA #NA #NA 000000 901901 096096 106110 096098 000000S1-2018_Pass17 543759 F3815041 #N/A F 1-IQ<0,5 #NA #NA 0,224 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 100106 084084 092092S1-2018_Pass17 543760 F3816001 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,417 XX #NA #NA #NA #NA 000000 901901 098098 100106 088088 092092S1-2018_Pass17 543771 F4815017 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,172 XY #NA #NA #NA #NA 000000 901902 098098 100100 084084 092092S1-2018_Pass17 543784 F7314036 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,130 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 100100 084084 000000S1-2018_Pass17 543786 F7314049 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,469 XX #NA #NA #NA #NA 901901 901901 098098 100106 084084 092096S1-2018_Pass17 543787 F7314050 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,469 XX #NA #NA #NA #NA 000000 901901 098098 100100 084084 092096S1-2018_Pass17 543803 F8314028 #N/A F 1-IQ<0,5 Canissp #NA 0,250 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 100100 084084 092092S1-2018_Pass17 543806 F8415001 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,234 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 100100 084084 092092S1-2018_Pass17 543815 1201078 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,031 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 100100 084084 000000S1-2018_Pass17 543817 1202123 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,219 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 100106 084084 092096S1-2018_Pass17 543819 1210236 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,214 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 100100 084084 000000S1-2018_Pass17 543829 1307138 #N/A F 1-IQ<0,5 #NA #NA 0,208 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 106106 084084 092092

S1-2018_Urgences 546549 2017069A #N/A P 1-IQ<0,5 #NA #NA 0,000 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 000000 000000 000000S1-2018_Pass18 551494 D0513002 #N/A D 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,406 XX #NA #NA #NA #NA 000000 901901 098098 100102 084086 092096S1-2018_Pass18 551505 D8316001 #N/A D 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,333 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 100106 084084 092096S1-2018_Pass18 551510 1004102 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,359 XX #NA #NA #NA #NA 000000 901901 098098 100100 000000 092092S1-2018_Pass18 551513 1011200 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,453 XX #NA #NA #NA #NA 000000 901901 098098 100106 000000 092096S1-2018_Pass18 551521 1106180 #N/A F 1-IQ<0,5 #NA #NA 0,177 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 100100 084084 092096S1-2018_Pass18 551526 1201005 #N/A F 1-IQ<0,5 Canissp #NA 0,354 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 100100 084084 092096S1-2018_Pass18 551527 1201025 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,198 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098100 100102 084088 092096S1-2018_Pass18 551541 2802032 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,156 XX #NA #NA #NA #NA 000000 901901 098098 100106 084084 000000S1-2018_Pass18 551542 2802040 #N/A F 1-IQ<0,5 Canissp #NA 0,052 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 000000 000000 000000S1-2018_Pass18 551553 2902031 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,297 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 100100 084084 092096S1-2018_Pass18 551556 2903080 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,359 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 100106 000000 092096S1-2018_Pass18 551557 2903081 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,328 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 100106 086086 092096S1-2018_Pass18 551559 2905108 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,453 XY #NA #NA #NA #NA 000000 901902 098098 100100 084084 092096S1-2018_Pass18 551560 2905114 #N/A F 1-IQ<0,5 #NA #NA 0,260 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 100106 084084 092096S1-2018_Pass18 551563 F0404022 #N/A F 1-IQ<0,5 #NA #NA 0,052 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 000000 000000 096096S1-2018_Pass18 551574 F0409008 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,323 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 106110 084084 092092S1-2018_Pass18 551575 F0409016 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,370 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 100100 084084 000000S1-2018_Pass18 551577 F0409066 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,245 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 100106 084084 092092S1-2018_Pass18 551579 F0409087 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,172 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 000000 084084 092100S1-2018_Pass18 551580 F0409090 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,276 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 000000 000000 000000S1-2018_Pass18 551583 F0410041 #N/A F 1-IQ<0,5 #NA #NA 0,297 XY #NA #NA #NA #NA 000000 901902 098098 100106 000000 092092S1-2018_Pass18 551587 F0410085 #N/A F 1-IQ<0,5 #NA #NA 0,010 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 000000 000000 000000S1-2018_Pass18 551594 F0411061 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,089 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 100106 000000 000000S1-2018_Pass18 551596 F0411084 #N/A F 1-IQ<0,5 Canissp #NA 0,359 XY #NA #NA #NA #NA 000000 901902 000000 000000 083084 092096S1-2018_Pass18 551603 F0412115 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,417 XX #NA #NA #NA #NA 000000 901901 098098 106106 084084 000000S1-2018_Pass18 551608 F0413027 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,401 XX #NA #NA #NA #NA 000000 901901 098098 106106 084084 092092S1-2018_Pass18 551612 F0413064 #N/A F 1-IQ<0,5 #NA #NA 0,490 XX #NA #NA #NA #NA 000000 901901 098098 106106 000000 092092S1-2018_Pass18 551615 F0414054 #N/A F 1-IQ<0,5 #NA #NA 0,198 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 100106 084084 000000S2-2018_Pass18 551629 F0508064 #N/A F 1-IQ<0,5 #NA #NA 0,115 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 000000 084084 092092S2-2018_Pass18 551632 F0508102 #N/A F 1-IQ<0,5 Canissp #NA 0,203 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 100100 000000 092092S2-2018_Pass18 551633 F0510014 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,484 XY #NA #NA #NA #NA 901902 901902 098098 106106 084084 092092S2-2018_Pass18 551638 F0511026 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,292 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 100106 084084 092092S2-2018_Pass18 551640 F0511055 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,354 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 100102 084084 092092S2-2018_Pass18 551644 F0512053 #N/A F 1-IQ<0,5 #NA #NA 0,000 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 000000 000000 000000

Page 29: ILAN DE LA ERE E DE MISE EN ŒUVRE DU ... - Le loup en France · et chose nouvelle 3) permettre de calculer, pour chaque échantillon, la probabilité d’une hybridation avec le

ONCFS-ANTAGENE-Session2018-S1S2

Population N°Antagene RefONCFS N°Loup(basefinale)

Typeprélèvement Tri Espèce

(mtDNA)Mitotype(Pilot2010) IQ Sexe Hybridation Proba_Loup CI95_bott CI95_up 00-Clu-

Amelo-A00-Clu-Amelo-B 01-AHT103 02-AHT111 03-AHTk211 04-FH2096

S2-2018_Pass18 551649 F0515027 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,167 XX #NA #NA #NA #NA 000000 901901 098098 100102 084086 096100S2-2018_Pass18 551650 F0607004 #N/A F 1-IQ<0,5 #NA #NA 0,286 XY #NA #NA #NA #NA 000000 902902 098098 100106 084084 096096S2-2018_Pass18 551653 F0616010 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,333 XX #NA #NA #NA #NA 901901 000000 098098 100106 000000 092096S2-2018_Pass18 551655 F1216003 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,052 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 100100 000000 092092S2-2018_Pass18 551656 F1216008 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,448 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 100106 084084 092096S2-2018_Pass18 551659 F1316009 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,182 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 102106 000000 096096S2-2018_Pass18 551660 F1316010 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,307 XX #NA #NA #NA #NA 000000 901901 098098 102106 084084 096096S2-2018_Pass18 551664 F2609029 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,380 XX #NA #NA #NA #NA 000000 901901 098098 100106 084084 092092S2-2018_Pass18 551667 F2611065 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,083 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 100100 000000 092092S2-2018_Pass18 551672 F2612024 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,443 XX #NA #NA #NA #NA 901901 901901 098098 100100 084084 092096S2-2018_Pass18 551674 F2613009 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,380 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 100100 084084 092092S2-2018_Pass18 551677 F2614014 #N/A F 1-IQ<0,5 #NA #NA 0,089 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098100 100106 000000 092092S2-2018_Pass18 551678 F2615009 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,427 XX #NA #NA #NA #NA 901901 000000 098098 100106 000000 096096S2-2018_Pass18 551679 F3807014 #N/A F 1-IQ<0,5 #NA #NA 0,219 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 000000 084084 092092S2-2018_Pass18 551680 F3807020 #N/A F 1-IQ<0,5 #NA #NA 0,380 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 100106 084084 092096S2-2018_Pass18 551681 F3810018 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,031 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 000000 084084 000000S2-2018_Pass18 551682 F3811018 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,365 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 100100 084084 092092S2-2018_Pass18 551683 F3811034 #N/A F 1-IQ<0,5 #NA #NA 0,094 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 100106 000000 000000S2-2018_Pass18 551687 F3816033 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,000 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 000000 000000 000000S2-2018_Pass18 551688 F3816060 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,031 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 000000 000000 092092S2-2018_Pass18 551691 F4812010 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,042 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 000000 084084 000000S2-2018_Pass18 551693 F6812004 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,448 XY #NA #NA #NA #NA 000000 901902 098098 106106 084084 092096S2-2018_Pass18 551700 F7312017 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,208 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 100106 084084 096096S2-2018_Pass18 551702 F7313001 #N/A F 1-IQ<0,5 #NA #NA 0,000 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 000000 000000 000000S2-2018_Pass18 551707 F7313064 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,354 XX #NA #NA #NA #NA 000000 901901 098098 100100 084084 092092S2-2018_Pass18 551726 F8310010 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,411 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 100106 084084 096096S2-2018_Pass18 551731 F8313029 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,255 XX #NA #NA #NA #NA 901901 000000 098098 100106 084084 092096S2-2018_Pass18 551736 F8316021 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,344 XX #NA #NA #NA #NA 901901 000000 098098 100106 084084 096096S2-2018_Pass18 551739 F8316041 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,031 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 000000 000000 000000S2-2018_Pass18 551743 F8416008 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,474 XY #NA #NA #NA #NA 000000 902902 098098 100100 000000 092096S2-2018_Pass18 551746 FIT00110981 #N/A F 1-IQ<0,5 #NA #NA 0,073 XX #NA #NA #NA #NA 000000 901901 100100 000000 000000 000000S2-2018_Pass18 551748 FIT00109093 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,380 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 106106 084084 000000

S1-2018_Urgences 551752 F1217008 #N/A F 1-IQ<0,5 #NA #NA 0,042 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 094094 000000 000000 000000S1-2018_Urgences 551754 F1217011 #N/A F 1-IQ<0,5 Canisfamiliaris #NA 0,188 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 104108 000000 092092S1-2018_Urgences 551756 F1517001 #N/A F 1-IQ<0,5 #NA #NA 0,010 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 000000 000000 092092S1-2018_Urgences 551757 F2617019 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,010 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 102106 000000 000000S1-2018_Urgences 551758 F2617020 #N/A F 1-IQ<0,5 #NA #NA 0,057 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 000000 084094 000000S1-2018_Urgences 551760 F2617026 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,219 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 100100 084084 000000S1-2018_Urgences 551761 F2617028 #N/A F 1-IQ<0,5 Vulpesvulpes #NA 0,135 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 100102 114114 094100 000000S1-2018_Urgences 551763 F3816024 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,276 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098100 100100 083084 092092S1-2018_Urgences 551765 F3817022 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,099 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 106106 084084 092096S1-2018_Urgences 551773 F7317057 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,099 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 000000 084084 000000S1-2018_Urgences 551776 P8816003 #N/A P 1-IQ<0,5 #NA #NA 0,073 XX #NA #NA #NA #NA 901901 901901 100100 000000 000000 000000S1-2018_Urgences 551778 U2616003 #N/A U 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,349 XY #NA #NA #NA #NA 000000 901902 098100 106106 084084 092096S2-2018_Pass18 551657 F1315032 CH53-01 F 2-Chien Canissp #NA 0,766 XX Chien 0,003 0,000 0,038 901901 901901 100102 104104 088090 096096

S1-2018_Urgences 551751 F1217007 CH53-03 F 2-Chien Canisfamiliaris #NA 1,000 XX Chien 0,003 0,000 0,033 901901 901901 098104 104108 088088 100100S1-2018_Urgences 551775 P1117001 CH53-02 P 2-Chien Canisfamiliaris #NA 0,917 XX Chien 0,009 0,000 0,108 901901 901901 100100 104108 084086 096100S1-2018_Urgences 551777 S4317001 CH53-04 S 2-Chien Canisfamiliaris #NA 1,000 XY Chien 0,003 0,000 0,038 901902 901902 102102 106106 088092 100100S1-2018_Pass17 543640 F0413011 S37-2 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,505 XY #NA #NA #NA #NA 901902 901902 098098 100106 084084 092096S1-2018_Pass17 543653 F0414029 S47-8 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,729 XY Loup 0,998 0,978 1,000 000000 901902 098098 106106 084084 092096S1-2018_Pass17 543655 F0414039 S49-1 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,802 XX Loup 0,998 0,980 1,000 901901 901901 098098 106106 086086 092092S1-2018_Pass17 543656 F0414040 S49-2 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,958 XY Loup 0,997 0,965 1,000 901902 901902 098098 100106 084084 092092S1-2018_Pass17 543660 F0414057 S48-13 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,807 XY Loup 0,979 0,885 1,000 901902 901902 098098 100106 084084 092096S1-2018_Pass17 543661 F0414059 S48-14 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,943 XY Loup 0,998 0,978 1,000 901902 901902 098098 100100 084084 092096S1-2018_Pass17 543662 F0414065 S48-15 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,865 XX Loup 0,998 0,981 1,000 901901 901901 098098 106106 084084 092092S1-2018_Pass17 543664 F0414083 S48-16 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,589 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 100100 086086 096100S1-2018_Pass17 543665 F0414084 S48-17 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,771 XY Loup 0,998 0,971 1,000 901902 901902 098098 100106 084084 096096S1-2018_Pass17 543666 F0414085 S40-3 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,998 0,981 1,000 901902 901902 098098 100100 084084 092096S1-2018_Pass17 543669 F0415002 S46-10 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,573 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 106106 000000 092096S1-2018_Pass17 543670 F0415011 S46-1 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,958 XX Loup 0,997 0,963 1,000 901901 901901 098098 100106 084084 092092

Page 30: ILAN DE LA ERE E DE MISE EN ŒUVRE DU ... - Le loup en France · et chose nouvelle 3) permettre de calculer, pour chaque échantillon, la probabilité d’une hybridation avec le

ONCFS-ANTAGENE-Session2018-S1S2

Population N°Antagene RefONCFS N°Loup(basefinale)

Typeprélèvement Tri Espèce

(mtDNA)Mitotype(Pilot2010) IQ Sexe Hybridation Proba_Loup CI95_bott CI95_up 00-Clu-

Amelo-A00-Clu-Amelo-B 01-AHT103 02-AHT111 03-AHTk211 04-FH2096

S1-2018_Pass17 543671 F0415014 S46-2 F 3-Exploitable Canissp #NA 0,745 XX Loup 0,978 0,817 1,000 000000 901901 098098 100102 086086 100100S1-2018_Pass17 543676 D0515003 S45-2 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,998 0,974 1,000 901901 901901 098098 100102 084084 092092S1-2018_Pass17 543687 F0514024 S48-7 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,958 XY Loup 0,998 0,980 1,000 901902 901902 098098 100100 084084 092096S1-2018_Pass17 543688 F0514025 S45-1 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,604 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 106106 086086 092096S1-2018_Pass17 543689 F0514028 S21-1 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,797 XX Loup 0,965 0,853 1,000 901901 901901 098098 106106 084084 092100S1-2018_Pass17 543690 F0515009 S48-9 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,740 XY Loup 0,899 0,722 1,000 901902 901902 098098 100106 083084 092096S1-2018_Pass17 543691 F0515010 S45-3 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,958 XX Loup 0,998 0,981 1,000 901901 901901 098098 100106 084084 092092S1-2018_Pass17 543692 F0515011 S45-4 F 3-Exploitable Canissp #NA 0,948 XX Loup 0,998 0,979 1,000 901901 901901 098098 100106 084084 092096S1-2018_Pass17 543694 F0515025 S46-3 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,698 XX Loup 0,951 0,798 1,000 000000 901901 098098 106106 084084 092100S1-2018_Pass17 543696 F0515032 S48-11 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,979 XX Loup 0,998 0,974 1,000 901901 901901 098098 100102 084084 092096S1-2018_Pass17 543697 F0515033 S45-6 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,998 0,981 1,000 901902 901902 098098 106106 084084 092092S1-2018_Pass17 543698 F0515044 S46-6 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,839 XY Loup 0,995 0,939 1,000 000000 901902 098098 100100 084086 092096S1-2018_Pass17 543699 D0614003 S45-7 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,958 XX Loup 0,998 0,979 1,000 901901 901901 098098 100100 084084 092096S1-2018_Pass17 543700 D0614005 S45-8 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,998 0,979 1,000 901902 901902 098098 100106 084084 092092S1-2018_Pass17 543702 D0614007 S45-9 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,998 0,978 1,000 901902 901902 098098 100100 084084 096096S1-2018_Pass17 543703 D0615001 S49-5 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,998 0,980 1,000 901902 901902 098098 100100 084084 092092S1-2018_Pass17 543704 D0615002 S49-6 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,958 XY Loup 0,998 0,978 1,000 901902 901902 098098 100106 084084 092092S1-2018_Pass17 543705 D0615003 S49-7 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,998 0,975 1,000 901902 901902 098098 100106 086086 092096S1-2018_Pass17 543706 D0615004 S49-8 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,997 0,963 1,000 901902 901902 098098 100106 086086 092096S1-2018_Pass17 543707 D0615005 S49-9 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,992 0,926 1,000 901902 901902 098098 100100 083084 092092S1-2018_Pass17 543708 D0615006 S49-10 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,991 0,900 1,000 901902 901902 098098 100106 084084 100100S1-2018_Pass17 543709 D0615008 S49-11 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,998 0,978 1,000 901902 901902 098098 100106 084084 092096S1-2018_Pass17 543710 D0615009 S49-12 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY HYBF1 0,656 0,458 0,829 901902 901902 098098 102106 090090 096096S1-2018_Pass17 543711 D0615010 S49-13 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY HYBF1 0,635 0,431 0,815 901902 901902 098102 102106 086086 092096S1-2018_Pass17 543712 D0615011 S49-14 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,998 0,981 1,000 901902 901902 098098 100100 084084 092096S1-2018_Pass17 543713 D0615013 S41-2 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,917 XY Loup 0,998 0,980 1,000 901902 901902 098098 106106 084084 092092S1-2018_Pass17 543722 F0615001 S44-5 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,755 XY Loup 0,996 0,950 1,000 000000 901902 098098 100100 084084 096096S1-2018_Pass17 543723 F0615006 S45-10 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,536 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 100106 084084 092092S1-2018_Pass17 543730 F1315028 S45-12 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,870 XY Loup 0,998 0,979 1,000 901902 901902 098098 100106 084084 092096S1-2018_Pass17 543731 D2615002 S50-5 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,917 0,741 1,000 901902 901902 098100 100100 084084 096096S1-2018_Pass17 543732 D2615003 S50-6 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,998 0,978 1,000 901901 901901 098098 100100 083084 092092S1-2018_Pass17 543749 F3815007 S45-17 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,656 XX #NA #NA #NA #NA 000000 901901 098098 100106 086086 092092S1-2018_Pass17 543750 F3815008 S48-5 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,813 XY Loup 0,997 0,959 1,000 000000 902902 098098 100106 086086 092092S1-2018_Pass17 543751 F3815011 S45-16 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,938 XY Loup 0,997 0,969 1,000 901902 901902 098098 106106 086086 092092S1-2018_Pass17 543752 F3815015 S47-7 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,997 0,969 1,000 901902 901902 098098 100100 084084 092096S1-2018_Pass17 543756 F3815024 S44-8 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,870 XY Loup 0,998 0,975 1,000 902902 901902 098098 100100 084084 092092S1-2018_Pass17 543758 F3815032 S49-30 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,714 XX Loup 0,998 0,977 1,000 901901 901901 098098 100106 086086 092092S1-2018_Pass17 543761 F3816013 S49-23 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,854 XY HYBF1 0,685 0,490 0,851 901902 901902 098100 102106 084084 092096S1-2018_Pass17 543762 F3816020 S49-31 F 3-Exploitable Canissp #NA 0,536 XY #NA #NA #NA #NA 000000 901902 000000 000000 084084 092096S1-2018_Pass17 543763 F3816021 S49-33 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,599 XX #NA #NA #NA #NA 000000 901901 098098 106106 000000 092092S1-2018_Pass17 543764 F3816029 S49-25 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,698 -- Loup 0,995 0,935 1,000 000000 000000 098098 100106 084084 096096S1-2018_Pass17 543765 F3816035 S50-7 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,698 XX Loup 0,996 0,949 1,000 000000 901901 098098 100100 084084 096096S1-2018_Pass17 543766 F3816046 S47-1 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,557 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 100106 084084 092092S1-2018_Pass17 543767 F3816048 S50-8 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,958 XY Loup 0,997 0,968 1,000 901902 901902 098098 100106 086086 092096S1-2018_Pass17 543768 F3816049 S50-9 F 3-Exploitable #NA #NA 0,589 XY #NA #NA #NA #NA 000000 901902 098098 100106 086086 092092S1-2018_Pass17 543775 D7314002 S47-4 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,993 0,915 1,000 901902 901902 098098 100100 084084 096096S1-2018_Pass17 543776 D7315003 S47-5 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,955 0,816 1,000 901902 901902 098098 102106 084084 096096S1-2018_Pass17 543777 D7315006 S46_8 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,917 XY HYBF1 0,556 0,334 0,758 901902 901902 098102 100102 088088 092096S1-2018_Pass17 543782 F7314026 S47-3 F 3-Exploitable #NA #NA 0,979 XX Loup 0,997 0,967 1,000 901901 901901 098098 100100 084084 092092S1-2018_Pass17 543783 F7314027 S48-3 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,599 XY #NA #NA #NA #NA 000000 901902 098102 100102 084084 096096S1-2018_Pass17 543785 F7314041 S49-28 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,896 XX Loup 0,997 0,958 1,000 901901 901901 098098 100100 084084 092096S1-2018_Pass17 543788 F7314056 S49-26 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,833 XX Loup 0,998 0,976 1,000 901901 901901 098098 100106 084084 092092S1-2018_Pass17 543790 F7314065 S48-2 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,979 XY Loup 0,998 0,978 1,000 901902 901902 098098 100106 084084 092092S1-2018_Pass17 543792 F7315015 S46-4 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,958 XY Loup 0,996 0,953 1,000 901902 901902 098098 100100 084084 092092S1-2018_Pass17 543793 F7315021 S48-1 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,677 XY #NA #NA #NA #NA 000000 901902 098098 100100 084084 092092S1-2018_Pass17 543794 F7315027 S47-6 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,979 XX Loup 0,998 0,976 1,000 901901 901901 098098 100100 084084 092092S1-2018_Pass17 543808 1005163 S44-3 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,729 -- Loup 0,998 0,975 1,000 000000 000000 098098 100100 086086 092096S1-2018_Pass17 543816 1202090 S49-17 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,760 XY Loup 0,994 0,932 1,000 000000 901902 098098 100100 084084 096100S1-2018_Pass17 543818 1203165 S49-19 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,958 XX Loup 0,997 0,970 1,000 901901 901901 098098 100106 086086 096096S1-2018_Pass17 543822 1301015 S50-10 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,998 0,980 1,000 901902 901902 098098 100106 084084 092092

Page 31: ILAN DE LA ERE E DE MISE EN ŒUVRE DU ... - Le loup en France · et chose nouvelle 3) permettre de calculer, pour chaque échantillon, la probabilité d’une hybridation avec le

ONCFS-ANTAGENE-Session2018-S1S2

Population N°Antagene RefONCFS N°Loup(basefinale)

Typeprélèvement Tri Espèce

(mtDNA)Mitotype(Pilot2010) IQ Sexe Hybridation Proba_Loup CI95_bott CI95_up 00-Clu-

Amelo-A00-Clu-Amelo-B 01-AHT103 02-AHT111 03-AHTk211 04-FH2096

S1-2018_Pass17 543823 1301038 S50-11 F 3-Exploitable Canislupus #NA 0,917 XX Loup 0,998 0,975 1,000 901901 901901 098098 100102 084084 092092S1-2018_Pass17 543824 1302060 S50-12 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,984 XX Loup 0,945 0,727 1,000 901901 901901 098098 100104 084084 096100S1-2018_Pass17 543825 1302064 S50-13 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,656 XX #NA #NA #NA #NA 000000 901901 098098 100106 083084 092096S1-2018_Pass17 543826 1302072 S50-14 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,547 XX #NA #NA #NA #NA 000000 901901 098098 106106 084084 092092S1-2018_Pass17 543827 1302076 S50-15 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,998 0,975 1,000 901901 901901 098098 100106 086086 092096S1-2018_Pass17 543839 1410009 S50-3 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,766 XY Loup 0,998 0,979 1,000 901902 901902 098098 100100 084084 096096S1-2018_Pass17 543840 1410134 S50-4 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,698 XY Loup 0,998 0,974 1,000 000000 901902 098098 100100 084084 092096S1-2018_Pass18 551487 D0410001 S27-10 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,792 XX Loup 0,998 0,979 1,000 000000 901901 098098 106106 084084 092096S1-2018_Pass18 551488 D0411003 S32-2 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,958 XX Loup 0,998 0,979 1,000 901901 901901 098098 100106 084084 092092S1-2018_Pass18 551489 D0416001 S51-12 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,996 0,954 1,000 901902 901902 098098 100100 084084 096100S1-2018_Pass18 551490 D0416002 S51-13 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,998 0,980 1,000 901902 901902 098098 100106 084084 092096S1-2018_Pass18 551491 D0509001 S20-2 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,999 0,982 1,000 901901 901901 098098 100106 084084 092096S1-2018_Pass18 551492 D0509005 S25-14 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,958 XX Loup 0,998 0,982 1,000 901901 901901 098098 106106 084084 092092S1-2018_Pass18 551493 D0511003 S31-4 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,996 0,958 1,000 901901 901901 098098 100106 086086 092092S1-2018_Pass18 551495 D0610001 S27-1 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,998 0,978 1,000 901901 901901 098098 100100 086086 092092S1-2018_Pass18 551496 D0613001 S36-1 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,958 XX Loup 0,998 0,979 1,000 901901 901901 098098 100100 084084 092096S1-2018_Pass18 551497 D0613007 S37-10 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,792 XX Loup 0,998 0,972 1,000 901901 901901 098098 100100 086086 092096S1-2018_Pass18 551498 D1213001 S37-1 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,998 0,980 1,000 901902 901902 098098 100106 084084 092096S1-2018_Pass18 551499 D2415001 S50-1 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,998 0,976 1,000 901902 901902 098098 100100 084084 092092S1-2018_Pass18 551500 D2608002 S22-21 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,958 XY Loup 0,998 0,981 1,000 901902 901902 098098 106106 084084 092092S1-2018_Pass18 551501 D2611001 S32-22 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,998 0,981 1,000 901902 901902 098098 100106 086086 092096S1-2018_Pass18 551502 D3810003 S29-2 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,998 0,981 1,000 901902 901902 098098 100106 084084 092096S1-2018_Pass18 551503 D7314001 S40b-8 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,998 0,980 1,000 901902 901902 098098 100106 086086 092092S1-2018_Pass18 551504 D7316001 S51-9 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,958 XX Loup 0,998 0,980 1,000 901901 901901 098098 106106 086086 092092S1-2018_Pass18 551506 D8316002 S51-22 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX BC 0,854 0,691 0,964 901901 901901 098100 100100 084084 092096S1-2018_Pass18 551507 D8316003 S51-23 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX BC 0,746 0,554 0,899 901901 901901 098100 102106 084088 096096S1-2018_Pass18 551508 1002026 S30-9 F 3-Exploitable Canissp #NA 0,839 XX Loup 0,998 0,982 1,000 901901 901901 098098 106106 084084 092092S1-2018_Pass18 551509 1003058 S37-8 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,969 XX Loup 0,998 0,982 1,000 901901 901901 098098 100106 084084 092092S1-2018_Pass18 551511 1004103 S33-5 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,854 XY Loup 0,998 0,979 1,000 000000 901902 098098 100106 086086 092096S1-2018_Pass18 551512 1006175 S36-18 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,568 XX #NA #NA #NA #NA 000000 901901 098098 100106 084084 092096S1-2018_Pass18 551514 1101011 S37-12 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,656 XX #NA #NA #NA #NA 000000 901901 098098 100104 084084 096096S1-2018_Pass18 551515 1101012 S37-13 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,771 XX Loup 0,994 0,928 1,000 000000 901901 098098 100104 084084 096096S1-2018_Pass18 551516 1102042 S37-11 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,906 XY Loup 0,998 0,980 1,000 901902 901902 098098 100106 084084 092096S1-2018_Pass18 551517 1103112 S44-1 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,698 XX Loup 0,997 0,969 1,000 000000 901901 098098 100100 084084 096096S1-2018_Pass18 551518 1103113 S36-13 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,979 XX Loup 0,998 0,979 1,000 901901 901901 098098 100106 084084 092096S1-2018_Pass18 551519 1105159 S44-2 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,818 XY Loup 0,983 0,891 1,000 000000 901902 098098 106106 086086 092092S1-2018_Pass18 551520 1105172 S30-10 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,833 XX Loup 0,998 0,982 1,000 901901 901901 098098 106106 084084 092092S1-2018_Pass18 551522 1109190 S36-H3 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,844 XY HYBF1 0,425 0,209 0,643 000000 901902 098100 100102 090090 092096S1-2018_Pass18 551523 1111204 S36-H7 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,958 XX HYBF1 0,568 0,358 0,760 901901 901901 098100 100102 090090 092096S1-2018_Pass18 551524 1111219 S36-H1 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,932 XY HYBF1 0,590 0,367 0,788 901902 901902 098100 100102 084088 092096S1-2018_Pass18 551525 1201004 S36-15 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,917 XY Loup 0,998 0,979 1,000 901902 901902 098098 100100 084084 092096S1-2018_Pass18 551528 1201035 S36-12 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,948 XX Loup 0,998 0,972 1,000 901901 901901 098098 106106 086086 092092S1-2018_Pass18 551529 1203186 S36-H8 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,719 XX HYBF1 0,366 0,118 0,602 000000 901901 098102 100102 088088 096096S1-2018_Pass18 551530 1204193 S49-20 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,998 0,975 1,000 901902 901902 098098 100100 086086 092096S1-2018_Pass18 551531 1301055 S38-23 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,990 XY Loup 0,997 0,964 1,000 901902 901902 098098 100106 086086 092100S1-2018_Pass18 551532 1303100 S36-17 F 3-Exploitable Canislupus #NA 0,880 XX Loup 0,998 0,979 1,000 000000 901901 098098 100106 084084 092096S1-2018_Pass18 551533 2701019 S22-4 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,766 XY Loup 0,998 0,979 1,000 901902 901902 098098 100106 084084 092096S1-2018_Pass18 551534 2702055 S22-6 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,844 XY Loup 0,997 0,966 1,000 000000 901902 098098 100106 084084 092092S1-2018_Pass18 551535 2702081 S22-5 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,672 XX #NA #NA #NA #NA 000000 901901 098098 100106 084084 092096S1-2018_Pass18 551536 2703045 S22-7 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,839 XY Loup 0,998 0,977 1,000 000000 901902 098098 100100 086086 092096S1-2018_Pass18 551537 2705246 S22-14 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,998 0,982 1,000 901902 901902 098098 100100 084084 092092S1-2018_Pass18 551538 2709194 S30-15 F 3-Exploitable #NA #NA 0,813 XY BC 0,764 0,571 0,911 901902 901902 000000 098106 084084 096100S1-2018_Pass18 551539 2801014 S33-14 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,958 XX Loup 0,998 0,982 1,000 901901 901901 098098 100106 084084 092092S1-2018_Pass18 551540 2801022 S40-6 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,998 0,979 1,000 901902 901902 098098 100100 084084 092092S1-2018_Pass18 551543 2802053 S30-7 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,938 XX Loup 0,998 0,977 1,000 901901 901901 098098 100106 086086 096096S1-2018_Pass18 551544 2803063 S30-16 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,958 XY Loup 0,998 0,981 1,000 901902 901902 098098 100106 084084 092096S1-2018_Pass18 551545 2803074 S22-8 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,531 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 100100 000000 092096S1-2018_Pass18 551546 2805106 S33-14 F 3-Exploitable Canissp #NA 0,719 -- Loup 0,998 0,978 1,000 000000 000000 098098 100106 084084 092092S1-2018_Pass18 551547 2809151 S30-16 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,854 XY Loup 0,998 0,981 1,000 000000 901902 098098 100106 084084 092096S1-2018_Pass18 551548 2811178 S33-13 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,917 XX Loup 0,998 0,976 1,000 901901 901901 098098 100106 086086 096096

Page 32: ILAN DE LA ERE E DE MISE EN ŒUVRE DU ... - Le loup en France · et chose nouvelle 3) permettre de calculer, pour chaque échantillon, la probabilité d’une hybridation avec le

ONCFS-ANTAGENE-Session2018-S1S2

Population N°Antagene RefONCFS N°Loup(basefinale)

Typeprélèvement Tri Espèce

(mtDNA)Mitotype(Pilot2010) IQ Sexe Hybridation Proba_Loup CI95_bott CI95_up 00-Clu-

Amelo-A00-Clu-Amelo-B 01-AHT103 02-AHT111 03-AHTk211 04-FH2096

S1-2018_Pass18 551549 2811180 S24-1 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,703 XY Loup 0,998 0,977 1,000 000000 901902 098098 100106 086086 092092S1-2018_Pass18 551550 2812185 S33-11 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,698 XY Loup 0,998 0,980 1,000 000000 902902 098098 100106 084084 092092S1-2018_Pass18 551551 2812187 S33-10 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,807 XY Loup 0,998 0,979 1,000 901902 901902 098098 100100 084084 092092S1-2018_Pass18 551552 2901006 S34-6 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,998 0,980 1,000 901901 901901 098098 100106 084084 092092S1-2018_Pass18 551554 2903061 S34-7 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,797 XY Loup 0,998 0,980 1,000 000000 901902 098098 100106 086086 092096S1-2018_Pass18 551555 2903065 S34-8 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,615 XX #NA #NA #NA #NA 000000 901901 098098 100106 086086 092092S1-2018_Pass18 551558 2904103 S34-2 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,917 XY Loup 0,998 0,980 1,000 000000 901902 098098 100106 084084 092096S1-2018_Pass18 551561 2905115 S25-12 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,927 XX Loup 0,998 0,981 1,000 901901 901901 098098 106106 084084 092092S1-2018_Pass18 551562 2909139 S30-5 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,536 XX #NA #NA #NA #NA 000000 901901 098098 100106 086086 092096S1-2018_Pass18 551564 F0406007 S22-10 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,500 XX #NA #NA #NA #NA 000000 901901 098098 100100 084084 096096S1-2018_Pass18 551565 F0406057 S22-11 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,573 XY #NA #NA #NA #NA 000000 901902 098098 106106 084084 092096S1-2018_Pass18 551566 F0406062 S22-12 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,750 XY Loup 0,998 0,976 1,000 000000 901902 098098 100100 086086 092092S1-2018_Pass18 551567 F0406067 S22-13 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,917 XY Loup 0,998 0,981 1,000 901902 901902 098098 100100 084084 092092S1-2018_Pass18 551568 F0406073 S22-15 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,688 XY #NA #NA #NA #NA 901902 901902 098098 100100 084084 092092S1-2018_Pass18 551569 F0407015 S24-2 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,792 XY Loup 0,981 0,895 1,000 000000 901902 098098 100106 084084 092092S1-2018_Pass18 551570 F0407051 S27-15 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,958 XY Loup 0,998 0,981 1,000 901902 901902 098098 100106 086086 092092S1-2018_Pass18 551571 F0408014 S28-9 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,958 XY Loup 0,998 0,979 1,000 901902 901902 098098 100100 084084 096096S1-2018_Pass18 551572 F0408036 S28-4 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,807 XX Loup 0,999 0,982 1,000 901901 901901 098098 100106 084084 092092S1-2018_Pass18 551573 F0408086 S28-10 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,615 XY #NA #NA #NA #NA 901902 901902 098098 100106 084084 092092S1-2018_Pass18 551576 F0409065 S35-1 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,792 XY Loup 0,998 0,971 1,000 901902 901902 098098 100106 084084 092092S1-2018_Pass18 551578 F0409072 S32-6 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,964 XY Loup 0,998 0,979 1,000 901902 901902 098098 100106 084084 092096S1-2018_Pass18 551581 F0410005 S28-5 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,997 0,968 1,000 901901 901901 098098 100106 084084 092100S1-2018_Pass18 551582 F0410014 S32-9 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,854 XY Loup 0,998 0,982 1,000 901902 901902 098098 106106 084084 092092S1-2018_Pass18 551584 F0410045 S28-3 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,750 XX Loup 0,998 0,980 1,000 000000 901901 098098 106106 084084 092096S1-2018_Pass18 551585 F0410060 S29-9 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,922 XX Loup 0,971 0,858 1,000 901901 901901 098098 100106 083084 092092S1-2018_Pass18 551586 F0410073 S32-23 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,557 XX #NA #NA #NA #NA 000000 901901 098098 100106 084084 092092S1-2018_Pass18 551588 F0411001 S29-1 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,594 XY #NA #NA #NA #NA 000000 901902 098098 106106 084084 092092S1-2018_Pass18 551589 F0411015 S31-3 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,714 XY Loup 0,998 0,979 1,000 000000 901902 098098 100106 000000 096096S1-2018_Pass18 551590 F0411025 S32-25 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,724 XX Loup 0,995 0,936 1,000 000000 901901 098098 100100 086086 096096S1-2018_Pass18 551591 F0411031 S32-16 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,922 XX Loup 0,998 0,980 1,000 901901 901901 098098 106106 084084 092092S1-2018_Pass18 551592 F0411048 S32-17 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,740 XY Loup 0,998 0,977 1,000 902902 901902 098098 100106 086086 096096S1-2018_Pass18 551593 F0411052 S32-18 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,646 XX #NA #NA #NA #NA 901901 901901 098098 000000 084084 092096S1-2018_Pass18 551595 F0411073 S33-6 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,766 XX Loup 0,998 0,979 1,000 901901 901901 098098 106106 084084 092096S1-2018_Pass18 551597 F0412006 S32-24 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,938 XX Loup 0,998 0,981 1,000 901901 901901 098098 106106 083084 092096S1-2018_Pass18 551598 F0412024 S25-1 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,990 XX Loup 0,998 0,982 1,000 901901 901901 098098 100100 084084 092092S1-2018_Pass18 551599 F0412025 S34-10 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,948 XY Loup 0,998 0,980 1,000 901902 901902 098098 100106 083084 092096S1-2018_Pass18 551600 F0412048 S34-14 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,958 XX Loup 0,993 0,916 1,000 901901 901901 098098 100100 084084 092100S1-2018_Pass18 551601 F0412058 S35-19 F 3-Exploitable Canissp #NA 0,776 XX Loup 0,993 0,922 1,000 901901 901901 098098 100104 000000 092096S1-2018_Pass18 551602 F0412076 S35-17 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,911 XX Loup 0,997 0,968 1,000 901901 901901 098098 100106 086086 092096S1-2018_Pass18 551604 F0413001 S36-5 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,932 XY Loup 0,998 0,980 1,000 901902 901902 098098 100106 084084 092096S1-2018_Pass18 551605 F0413008 S27-6 F 3-Exploitable Canissp #NA 0,979 XX Loup 0,998 0,981 1,000 901901 901901 098098 100106 084084 092096S1-2018_Pass18 551606 F0413013 S40b-9 F 3-Exploitable #NA #NA 0,870 XX Loup 0,998 0,971 1,000 000000 901901 098098 100106 084084 092092S1-2018_Pass18 551607 F0413023 S37-3 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,677 XY #NA #NA #NA #NA 902902 901902 098098 100106 084084 092096S1-2018_Pass18 551609 F0413033 S37-9 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,896 XY Loup 0,998 0,971 1,000 901902 901902 098098 100106 000000 092096S1-2018_Pass18 551610 F0413038 S37-14 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,891 XY Loup 0,998 0,979 1,000 901902 901902 098098 100100 084084 092092S1-2018_Pass18 551611 F0413046 S27-13 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,880 XY Loup 0,992 0,905 1,000 901902 901902 098098 100100 084084 092100S1-2018_Pass18 551613 F0413069 S34-15 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,938 XX Loup 0,993 0,926 1,000 901901 901901 098098 100104 084084 096096S1-2018_Pass18 551614 F0413138 S37-3 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,922 XY Loup 0,998 0,978 1,000 901902 901902 098098 100106 084084 092096S1-2018_Pass18 551616 F0414110 S32-19 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,979 XX Loup 0,998 0,978 1,000 901901 901901 098098 100106 084084 092096S1-2018_Pass18 551617 F0506024 S21-6 F 3-Exploitable Canissp #NA 0,766 XY Loup 0,998 0,979 1,000 000000 901902 098098 106106 084084 092096S1-2018_Pass18 551618 F0506044 S21-6 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,984 XY Loup 0,998 0,980 1,000 901902 901902 098098 106106 084084 092096S1-2018_Pass18 551619 F0507002 S24-5 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,998 0,976 1,000 901902 901902 098098 100106 086086 092096S1-2018_Pass18 551620 F0507007 S21-1 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,958 XX Loup 0,997 0,968 1,000 901901 901901 098098 106106 084084 092100S1-2018_Pass18 551621 F0507020 S22-9 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,979 XY Loup 0,997 0,969 1,000 901902 901902 098098 106106 084084 092092S1-2018_Pass18 551622 F0507025 S24-14 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,984 XX Loup 0,998 0,978 1,000 901901 901901 098098 106106 084084 092096S2-2018_Pass18 551623 F0507039 S21-7 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,911 XY Loup 0,998 0,980 1,000 902902 901902 098098 106106 084084 092092S2-2018_Pass18 551624 F0507059 S25-11 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,911 XY Loup 0,997 0,962 1,000 901902 901902 098098 106106 084084 096100S2-2018_Pass18 551625 F0507078 S24-3 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,911 XY Loup 0,998 0,982 1,000 901902 901902 098098 106106 084084 092092S2-2018_Pass18 551626 F0507117 S22-18 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,953 XX Loup 0,999 0,983 1,000 901901 901901 098098 106106 084084 092092S2-2018_Pass18 551627 F0507121 S22-18 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,880 XX Loup 0,999 0,982 1,000 901901 901901 098098 106106 084084 092092

Page 33: ILAN DE LA ERE E DE MISE EN ŒUVRE DU ... - Le loup en France · et chose nouvelle 3) permettre de calculer, pour chaque échantillon, la probabilité d’une hybridation avec le

ONCFS-ANTAGENE-Session2018-S1S2

Population N°Antagene RefONCFS N°Loup(basefinale)

Typeprélèvement Tri Espèce

(mtDNA)Mitotype(Pilot2010) IQ Sexe Hybridation Proba_Loup CI95_bott CI95_up 00-Clu-

Amelo-A00-Clu-Amelo-B 01-AHT103 02-AHT111 03-AHTk211 04-FH2096

S2-2018_Pass18 551628 F0508016 S27-8 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,698 -- Loup 0,997 0,963 1,000 000000 000000 098098 106106 000000 092100S2-2018_Pass18 551630 F0508088 S20-3 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,917 XX Loup 0,998 0,979 1,000 901901 901901 098098 100106 086086 092096S2-2018_Pass18 551631 F0508090 S24-8 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,573 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 106106 084084 096100S2-2018_Pass18 551634 F0510030 S28-8 F 3-Exploitable Canissp #NA 0,922 XY Loup 0,998 0,981 1,000 901902 901902 098098 100100 084084 092096S2-2018_Pass18 551635 F0510052 S30-2 F 3-Exploitable #NA #NA 0,724 XX Loup 0,998 0,973 1,000 000000 901901 098098 100100 084084 092092S2-2018_Pass18 551636 F0510054 S29-5 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,854 XY Loup 0,998 0,980 1,000 902902 901902 098098 100100 084084 092096S2-2018_Pass18 551637 F0511012 S38-12 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,917 XY Loup 0,998 0,972 1,000 901902 901902 098098 106106 084084 092092S2-2018_Pass18 551639 F0511039 S37-4 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,990 XY Loup 0,998 0,982 1,000 901902 901902 098098 106106 084084 092092S2-2018_Pass18 551641 F0511061 S31-2 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,542 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 100100 084084 092092S2-2018_Pass18 551642 F0511087 S33-3 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,979 XY Loup 0,997 0,969 1,000 901902 901902 098098 100106 084084 092100S2-2018_Pass18 551643 F0512046 S34-16 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,677 XY #NA #NA #NA #NA 000000 901902 098098 100100 084084 092092S2-2018_Pass18 551645 F0512054 S25-5 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,984 XY Loup 0,998 0,978 1,000 901902 901902 098098 100100 084084 092096S2-2018_Pass18 551646 F0512066 S35-20 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,969 XY Loup 0,998 0,971 1,000 901902 901902 098098 106106 086086 092096S2-2018_Pass18 551647 F0513047 S38-10 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,998 0,974 1,000 901902 901902 098098 100106 086086 092092S2-2018_Pass18 551648 F0514029 S29-7 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,661 XX #NA #NA #NA #NA 000000 901901 098098 100106 084084 092100S2-2018_Pass18 551651 F0613008 S46-10 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,958 XX Loup 0,998 0,981 1,000 901901 901901 098098 106106 086086 092096S2-2018_Pass18 551652 F0615013 S45-11 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,766 XX Loup 0,998 0,978 1,000 000000 901901 098098 100106 086086 092092S2-2018_Pass18 551654 F0616038 S51-15 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,563 XX #NA #NA #NA #NA 000000 901901 098098 100106 086086 092096S2-2018_Pass18 551658 F1316002 S51-18 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,609 XY #NA #NA #NA #NA 901902 901902 098098 100100 000000 096096S2-2018_Pass18 551661 F2606020 S21-4 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,958 XX Loup 0,998 0,980 1,000 901901 901901 098098 100106 084084 092096S2-2018_Pass18 551662 F2607025 S25-10 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,693 XY #NA #NA #NA #NA 901902 901902 098098 100106 084084 092096S2-2018_Pass18 551663 F2608007 S25-13 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,979 XX Loup 0,999 0,984 1,000 901901 901901 098098 100106 084084 092092S2-2018_Pass18 551665 F2611003 S25-9 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,573 XY #NA #NA #NA #NA 000000 901902 098098 100100 084084 092096S2-2018_Pass18 551666 F2611061 S24-10 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,995 XX Loup 0,999 0,983 1,000 901901 901901 098098 100100 084084 092096S2-2018_Pass18 551668 F2612001 S35-4 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,943 XY Loup 0,999 0,983 1,000 000000 901902 098098 100100 084084 092096S2-2018_Pass18 551669 F2612006 S35-7 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,844 XY Loup 0,999 0,983 1,000 000000 901902 098098 100100 084084 092096S2-2018_Pass18 551670 F2612020 S35-15 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,948 XX Loup 0,998 0,979 1,000 901901 901901 098098 100100 084084 092096S2-2018_Pass18 551671 F2612023 S35-13 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,740 XY Loup 0,996 0,954 1,000 000000 901902 098098 100100 084084 092096S2-2018_Pass18 551673 F2612025 S35-12 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,981 0,876 1,000 901902 901902 098098 100106 086086 092096S2-2018_Pass18 551675 F2613013 S37-16 F 3-Exploitable Canissp #NA 0,656 XY #NA #NA #NA #NA 901902 901902 098098 100106 084084 092092S2-2018_Pass18 551676 F2613016 S35-8 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,953 XY Loup 0,998 0,978 1,000 901902 901902 098098 100106 086086 092096S2-2018_Pass18 551684 F3812029 S35-2 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,995 XX Loup 0,997 0,968 1,000 901901 901901 098098 100106 084084 092096S2-2018_Pass18 551685 F3816014 S39-12 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,667 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 100106 084084 092096S2-2018_Pass18 551686 F3816031 S51-7 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,932 XY Loup 0,991 0,893 1,000 901902 901902 098098 100100 084084 096100S2-2018_Pass18 551689 F3816077 S51-4 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,995 XY BC? 0,860 0,670 0,990 901902 901902 098098 100106 084084 092100S2-2018_Pass18 551690 F3816078 S51-11 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,994 0,930 1,000 901902 901902 098098 100100 086086 092096S2-2018_Pass18 551692 F6614013 S24-8 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,516 XY #NA #NA #NA #NA 000000 901902 098098 106106 084084 096100S2-2018_Pass18 551694 F7306056 S21-2 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,990 XX Loup 0,998 0,981 1,000 901901 901901 098098 100100 084084 092096S2-2018_Pass18 551695 F7308020 S22-20 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,984 XX Loup 0,998 0,976 1,000 901901 901901 098098 100106 084084 096096S2-2018_Pass18 551696 F7309010 S24-4 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,839 XY Loup 0,998 0,973 1,000 901902 901902 098098 100100 086086 092096S2-2018_Pass18 551697 F7309021 S22-19 F 3-Exploitable #NA #NA 0,964 XY Loup 0,998 0,977 1,000 901902 901902 098098 100106 084084 096096S2-2018_Pass18 551698 F7309028 S25-17 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,833 XX Loup 0,998 0,980 1,000 000000 901901 098098 100106 086086 096096S2-2018_Pass18 551699 F7310003 S25-7 F 3-Exploitable Canissp #NA 0,693 XY #NA #NA #NA #NA 901902 901902 098098 100100 000000 092096S2-2018_Pass18 551701 F7312029 S38-3 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,998 0,980 1,000 901902 901902 098098 100106 084084 096096S2-2018_Pass18 551703 F7313012 S38-2 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,995 XY Loup 0,998 0,982 1,000 901902 901902 098098 106106 084084 092096S2-2018_Pass18 551704 F7313014 S38-4 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,990 XX Loup 0,999 0,983 1,000 901901 901901 098098 100100 084084 092096S2-2018_Pass18 551705 F7313017 S33-7 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,677 XX #NA #NA #NA #NA 901901 901901 098102 100102 084088 096096S2-2018_Pass18 551706 F7313030 S27-7 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,661 XY #NA #NA #NA #NA 000000 901902 098098 106106 084084 096096S2-2018_Pass18 551708 F7315028 S40b-19 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,974 XX Loup 0,993 0,917 1,000 901901 901901 098098 100100 084084 092096S2-2018_Pass18 551709 F7316019 S51-10 F 3-Exploitable #NA #NA 0,714 XX Loup 0,995 0,944 1,000 901901 901901 098098 100100 084084 092092S2-2018_Pass18 551710 F7408018 S23-5 F 3-Exploitable Canissp #NA 0,990 XY Loup 0,998 0,977 1,000 901902 901902 098098 100106 084084 096096S2-2018_Pass18 551711 F7409004 S23-4 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,998 0,978 1,000 901902 901902 098098 100106 084084 092096S2-2018_Pass18 551712 F7409010 S23-3 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,865 XY Loup 0,998 0,980 1,000 000000 901902 098098 100100 084084 092096S2-2018_Pass18 551713 F7409015 S24-6 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,714 XY Loup 0,997 0,961 1,000 000000 901902 098098 100106 084084 096096S2-2018_Pass18 551714 F7410007 S28-11 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,998 0,980 1,000 901902 901902 098098 100106 084084 092096S2-2018_Pass18 551715 F7411002 S23-1 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,964 XX Loup 0,998 0,981 1,000 901901 901901 098098 100106 084084 092096S2-2018_Pass18 551716 F7411005 S24-11 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,865 XX Loup 0,998 0,973 1,000 901901 901901 000000 100106 084084 096096S2-2018_Pass18 551717 F7411016 S32-3 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,661 XY #NA #NA #NA #NA 901902 901902 098098 100100 084084 092092S2-2018_Pass18 551718 F7411049 S32-3 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,740 XY Loup 0,998 0,973 1,000 000000 901902 098098 100100 084084 092092S2-2018_Pass18 551719 F7412001 S27-9 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,974 XY Loup 0,998 0,982 1,000 901902 901902 098098 100106 084084 092096

Page 34: ILAN DE LA ERE E DE MISE EN ŒUVRE DU ... - Le loup en France · et chose nouvelle 3) permettre de calculer, pour chaque échantillon, la probabilité d’une hybridation avec le

ONCFS-ANTAGENE-Session2018-S1S2

Population N°Antagene RefONCFS N°Loup(basefinale)

Typeprélèvement Tri Espèce

(mtDNA)Mitotype(Pilot2010) IQ Sexe Hybridation Proba_Loup CI95_bott CI95_up 00-Clu-

Amelo-A00-Clu-Amelo-B 01-AHT103 02-AHT111 03-AHTk211 04-FH2096

S2-2018_Pass18 551720 F7412002 S36-8 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,813 XY Loup 0,997 0,959 1,000 901902 901902 098098 100100 084084 092096S2-2018_Pass18 551721 F7412003 S36-9 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,932 XX Loup 0,981 0,883 1,000 901901 901901 098098 100106 084084 096096S2-2018_Pass18 551722 F7412005 S34-20 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,771 XY Loup 0,998 0,980 1,000 901902 901902 098098 106106 084084 092096S2-2018_Pass18 551723 F7413006 S36-10 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,896 XX Loup 0,998 0,979 1,000 901901 901901 098098 106106 084084 092096S2-2018_Pass18 551724 F7414006 S24-11 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,828 XX Loup 0,998 0,971 1,000 901901 901901 098098 100106 084084 096096S2-2018_Pass18 551725 F8309022 S23-2 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,999 0,983 1,000 901902 901902 098098 100106 084084 092092S2-2018_Pass18 551727 F8310020 S25-15 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,958 XX Loup 0,998 0,981 1,000 901901 901901 098098 100100 084084 092096S2-2018_Pass18 551728 F8311013 S37-6 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,927 XX Loup 0,998 0,970 1,000 901901 901901 098098 100106 084084 092092S2-2018_Pass18 551729 F8313015 S38-5 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,667 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 100106 084084 092096S2-2018_Pass18 551730 F8313016 S38-18 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,917 XY Loup 0,998 0,981 1,000 901902 901902 098098 106106 084084 092096S2-2018_Pass18 551732 F8313044 S39-12 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,901 XY Loup 0,998 0,981 1,000 901902 901902 098098 100106 084084 092096S2-2018_Pass18 551733 F8313049 S39-13 F 3-Exploitable #NA #NA 0,875 XX Loup 0,999 0,982 1,000 901901 901901 098098 106106 084084 092096S2-2018_Pass18 551734 F8313074 S49-19 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,938 XX Loup 0,997 0,958 1,000 901901 901901 098098 100106 000000 096096S2-2018_Pass18 551735 F8315064 S39-13 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,979 XX Loup 0,998 0,982 1,000 901901 901901 098098 106106 084084 092096S2-2018_Pass18 551737 F8316022 S51-25 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,781 XX BC 0,862 0,696 0,971 901901 901901 098098 100100 084084 096096S2-2018_Pass18 551738 F8316023 S51-26 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,828 XY Loup 0,958 0,806 1,000 901902 901902 098098 106106 086086 092096S2-2018_Pass18 551740 F8316042 S51-28 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,750 XY BC 0,835 0,646 0,972 901902 901902 098098 102106 084084 096096S2-2018_Pass18 551741 F8412002 S35-11 F 3-Exploitable #NA #NA 0,927 XY Loup 0,998 0,978 1,000 902902 901902 098098 100100 086086 092096S2-2018_Pass18 551742 F8416005 S51-30 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,969 XY Loup 0,998 0,979 1,000 901902 901902 098098 100100 086086 092092S2-2018_Pass18 551744 F8416013 S35-11 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,557 XY #NA #NA #NA #NA 902902 901902 098098 100100 086086 092096S2-2018_Pass18 551745 FIT00109087 S32-20 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,999 0,983 1,000 901902 901902 098098 100106 084084 092092S2-2018_Pass18 551747 FIT00112037 S35-6 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,573 XY #NA #NA #NA #NA 901901 901902 098098 102106 084084 092096

S1-2018_Urgences 551749 D0417006 S53-02 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,998 0,979 1,000 901902 901902 098098 100100 084084 096096S1-2018_Urgences 551750 D7417001 S53-03 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY BC 0,851 0,689 0,961 901902 901902 098098 106106 084084 096096S1-2018_Urgences 551759 F2617025 S53-08 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,786 XY Loup 0,998 0,978 1,000 901902 901902 098098 106106 086086 092092S1-2018_Urgences 551762 F3816023 S53-11 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,615 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 100100 083084 000000S1-2018_Urgences 551764 F3816025 S52-43 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,917 XX Loup 0,996 0,947 1,000 901901 901901 098098 100102 084084 092092S1-2018_Urgences 551766 F3817037 S53-09 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,786 XX Loup 0,988 0,908 1,000 901901 901901 098098 100100 083084 092096S1-2018_Urgences 551767 F3817079 S53-07 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,854 XY HYBF1 0,688 0,466 0,868 000000 901902 098098 100102 090090 092096S1-2018_Urgences 551768 F3916004 S53-10 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,703 XX Loup 0,997 0,960 1,000 901901 901901 098098 100100 084084 096096S1-2018_Urgences 551771 F7317002 S53-04 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,997 0,959 1,000 901902 901902 098098 100100 084084 092092S1-2018_Urgences 551772 F7317036 S53-05 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,984 XY Loup 0,998 0,980 1,000 901902 901902 098098 100106 084084 092092S1-2018_Urgences 551780 U3816008 S53-01 U 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,698 XY Loup 0,998 0,977 1,000 901902 901902 098098 100100 083084 092092S1-2018_Urgences 551781 U3816009 S53-01 U 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,998 0,979 1,000 901902 901902 098098 100100 083084 092092

Page 35: ILAN DE LA ERE E DE MISE EN ŒUVRE DU ... - Le loup en France · et chose nouvelle 3) permettre de calculer, pour chaque échantillon, la probabilité d’une hybridation avec le

ONCFS-ANTAGENE-Session2018-S1S2

N°Antagene RefONCFS

543658 F0414044551753 F1217009551755 F1217012551769 F4317001551770 F6317001551774 P0105004551779 U3816007543648 F0413128543657 F0414041543659 F0414049543693 F0515014543726 F1314005543748 F3814020543759 F3815041543760 F3816001543771 F4815017543784 F7314036543786 F7314049543787 F7314050543803 F8314028543806 F8415001543815 1201078543817 1202123543819 1210236543829 1307138546549 2017069A551494 D0513002551505 D8316001551510 1004102551513 1011200551521 1106180551526 1201005551527 1201025551541 2802032551542 2802040551553 2902031551556 2903080551557 2903081551559 2905108551560 2905114551563 F0404022551574 F0409008551575 F0409016551577 F0409066551579 F0409087551580 F0409090551583 F0410041551587 F0410085551594 F0411061551596 F0411084551603 F0412115551608 F0413027551612 F0413064551615 F0414054551629 F0508064551632 F0508102551633 F0510014551638 F0511026551640 F0511055551644 F0512053

05-CPH02 06-FH2088 07-C09.173 08-CPH05 09-FH2004 10-CFX30371 11-CXX279 12-C09.250 13-FH2161 14-FH2140 15-INU030 16-FH2137 17-FH2054 18-C27.442 19-Dbar1 20-

REN162C04 21-PEZ17 22-FH2010

000000 000000 126132 127129 000000 000000 116124 160162 000000 000000 000000 157177 000000 184184 182182 201201 000000 245245#NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA#NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA#NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA#NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA#NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA

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Page 36: ILAN DE LA ERE E DE MISE EN ŒUVRE DU ... - Le loup en France · et chose nouvelle 3) permettre de calculer, pour chaque échantillon, la probabilité d’une hybridation avec le

ONCFS-ANTAGENE-Session2018-S1S2

N°Antagene RefONCFS

551649 F0515027551650 F0607004551653 F0616010551655 F1216003551656 F1216008551659 F1316009551660 F1316010551664 F2609029551667 F2611065551672 F2612024551674 F2613009551677 F2614014551678 F2615009551679 F3807014551680 F3807020551681 F3810018551682 F3811018551683 F3811034551687 F3816033551688 F3816060551691 F4812010551693 F6812004551700 F7312017551702 F7313001551707 F7313064551726 F8310010551731 F8313029551736 F8316021551739 F8316041551743 F8416008551746 FIT00110981551748 FIT00109093551752 F1217008551754 F1217011551756 F1517001551757 F2617019551758 F2617020551760 F2617026551761 F2617028551763 F3816024551765 F3817022551773 F7317057551776 P8816003551778 U2616003551657 F1315032551751 F1217007551775 P1117001551777 S4317001543640 F0413011543653 F0414029543655 F0414039543656 F0414040543660 F0414057543661 F0414059543662 F0414065543664 F0414083543665 F0414084543666 F0414085543669 F0415002543670 F0415011

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ONCFS-ANTAGENE-Session2018-S1S2

N°Antagene RefONCFS

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Page 38: ILAN DE LA ERE E DE MISE EN ŒUVRE DU ... - Le loup en France · et chose nouvelle 3) permettre de calculer, pour chaque échantillon, la probabilité d’une hybridation avec le

ONCFS-ANTAGENE-Session2018-S1S2

N°Antagene RefONCFS

543823 1301038543824 1302060543825 1302064543826 1302072543827 1302076543839 1410009543840 1410134551487 D0410001551488 D0411003551489 D0416001551490 D0416002551491 D0509001551492 D0509005551493 D0511003551495 D0610001551496 D0613001551497 D0613007551498 D1213001551499 D2415001551500 D2608002551501 D2611001551502 D3810003551503 D7314001551504 D7316001551506 D8316002551507 D8316003551508 1002026551509 1003058551511 1004103551512 1006175551514 1101011551515 1101012551516 1102042551517 1103112551518 1103113551519 1105159551520 1105172551522 1109190551523 1111204551524 1111219551525 1201004551528 1201035551529 1203186551530 1204193551531 1301055551532 1303100551533 2701019551534 2702055551535 2702081551536 2703045551537 2705246551538 2709194551539 2801014551540 2801022551543 2802053551544 2803063551545 2803074551546 2805106551547 2809151551548 2811178

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REN162C04 21-PEZ17 22-FH2010

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Page 39: ILAN DE LA ERE E DE MISE EN ŒUVRE DU ... - Le loup en France · et chose nouvelle 3) permettre de calculer, pour chaque échantillon, la probabilité d’une hybridation avec le

ONCFS-ANTAGENE-Session2018-S1S2

N°Antagene RefONCFS

551549 2811180551550 2812185551551 2812187551552 2901006551554 2903061551555 2903065551558 2904103551561 2905115551562 2909139551564 F0406007551565 F0406057551566 F0406062551567 F0406067551568 F0406073551569 F0407015551570 F0407051551571 F0408014551572 F0408036551573 F0408086551576 F0409065551578 F0409072551581 F0410005551582 F0410014551584 F0410045551585 F0410060551586 F0410073551588 F0411001551589 F0411015551590 F0411025551591 F0411031551592 F0411048551593 F0411052551595 F0411073551597 F0412006551598 F0412024551599 F0412025551600 F0412048551601 F0412058551602 F0412076551604 F0413001551605 F0413008551606 F0413013551607 F0413023551609 F0413033551610 F0413038551611 F0413046551613 F0413069551614 F0413138551616 F0414110551617 F0506024551618 F0506044551619 F0507002551620 F0507007551621 F0507020551622 F0507025551623 F0507039551624 F0507059551625 F0507078551626 F0507117551627 F0507121

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REN162C04 21-PEZ17 22-FH2010

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ONCFS-ANTAGENE-Session2018-S1S2

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245245112120 128128 126126 129141 239243 172172 122122 162166 000000 130156 144144 177177 145153 184184 182182 201201 194202 245245120120 120120 126126 129141 297297 172172 116122 174174 000000 130138 144144 171177 141165 184186 182182 201201 198202 245245120120 120120 126126 129141 000000 172172 116122 170174 000000 130138 144144 171177 141165 184186 182182 201201 198202 245245112120 120120 126132 127129 243297 172172 116116 162162 237267 130130 144144 163177 145149 184184 182182 199201 198202 237245

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ONCFS-ANTAGENE-Session2018-S1S2

N°Antagene RefONCFS

551720 F7412002551721 F7412003551722 F7412005551723 F7413006551724 F7414006551725 F8309022551727 F8310020551728 F8311013551729 F8313015551730 F8313016551732 F8313044551733 F8313049551734 F8313074551735 F8315064551737 F8316022551738 F8316023551740 F8316042551741 F8412002551742 F8416005551744 F8416013551745 FIT00109087551747 FIT00112037551749 D0417006551750 D7417001551759 F2617025551762 F3816023551764 F3816025551766 F3817037551767 F3817079551768 F3916004551771 F7317002551772 F7317036551780 U3816008551781 U3816009

05-CPH02 06-FH2088 07-C09.173 08-CPH05 09-FH2004 10-CFX30371 11-CXX279 12-C09.250 13-FH2161 14-FH2140 15-INU030 16-FH2137 17-FH2054 18-C27.442 19-Dbar1 20-

REN162C04 21-PEZ17 22-FH2010

120120 096120 126126 129129 243297 168172 116122 166170 000000 130156 144146 157177 141145 184186 182182 201201 194198 245245112120 120128 126126 127141 239243 172172 116122 162162 251267 130156 144144 177177 149153 184184 182182 199201 194202 237245120120 120128 126126 129129 243243 172172 116122 162162 000000 130130 144146 163177 145145 184184 182182 201201 194202 237245000000 120128 126126 127141 243297 172172 116122 162166 237267 130130 144144 177177 145149 184184 182182 199201 194202 245245000000 128128 126126 129141 239243 172172 122124 162166 000000 130156 144144 177177 145153 184184 182182 201201 194202 245245120120 120120 126126 141141 243243 172172 116116 160162 267267 130130 144144 171181 145145 184184 182182 199199 194198 245245120120 120120 126132 127129 243243 172172 122124 162162 267267 130152 144144 163171 141149 184184 182182 199199 198198 245245120120 120120 126126 127129 243243 168172 122122 162166 000000 130152 144146 163163 145149 184184 182182 199201 198198 237245120120 120128 126126 129129 243309 172172 116124 160162 000000 130130 146146 163163 141145 184184 182182 199201 198198 000000120120 120120 126126 127141 243243 172172 116124 162162 000000 152152 144144 163177 145149 184184 182182 199199 194198 237237120120 128128 132132 127129 243309 172172 116116 160162 241267 130152 144144 157177 141145 184184 182182 201201 194202 245245120120 120120 126126 127129 243243 172172 122122 162166 267267 130130 144144 157163 145145 184184 182182 199201 198198 237245112120 096128 132132 129129 243243 168172 122122 160170 241267 138152 144144 157171 141145 184186 182182 201201 194198 245245120120 120120 126126 127129 243243 172172 122122 162166 267267 130130 144144 157163 145145 184184 182182 199201 198198 245245120120 128128 126126 127129 243243 172172 116116 160166 000000 130131 144144 157163 141141 184186 182182 191201 198198 237249000000 128128 132132 127129 243243 172172 124124 160170 000000 000000 144144 171177 145149 184184 182182 201201 194202 241245120120 120128 126126 127129 301301 172172 124124 160166 000000 130152 144144 163169 141145 184186 182182 000000 198198 237245120120 120120 126126 129129 243243 172172 124124 162166 267267 130130 144144 163171 145149 184184 182182 199201 198198 245245120120 120120 124126 129129 243309 172172 122122 166170 237267 130130 144144 163177 145165 184184 182182 201201 198198 237245120120 120120 126126 129129 243243 172172 124124 162166 000000 130130 144144 163171 145149 184184 182182 199199 198198 245245120120 120120 126132 127129 297309 172172 116122 162162 241267 130152 144144 177177 145149 184184 182182 201201 198202 237245120120 128128 126126 129141 321321 000000 116122 162166 237237 130131 144144 000000 145145 184184 182182 201201 198198 237237112120 096096 124126 141141 243297 172172 122124 162162 241241 130152 144144 163177 145162 184184 182182 201201 198198 245245120120 096120 126132 129131 239301 172172 116124 162170 241251 130130 144144 157177 145153 184184 182182 201201 198202 245249000000 120120 126126 127129 243243 172172 116116 162162 237241 130130 144144 157171 141149 184184 182182 201201 198202 237245000000 096128 124126 127129 297297 168172 122122 160164 000000 000000 146146 157171 145145 184184 182182 199201 194202 245245118118 096120 124126 127129 297297 168172 122122 160170 000000 130130 146146 171177 145162 184184 182182 199201 202202 245245112118 096120 124124 129129 243297 172172 122122 162166 267267 130130 144144 157175 145165 184184 182182 199199 194202 237245118120 120120 126132 129131 243297 172172 122122 166170 000000 131138 144146 153157 000000 184190 182182 191201 202202 245245000000 120120 124126 127129 243297 172172 116116 162166 000000 000000 144144 177181 141145 186190 182182 201201 198202 245245112116 120120 124126 127129 247297 172172 122122 162166 241267 152152 144144 157177 145149 184184 182182 201201 202202 245245118120 096120 124132 127129 297297 172172 116116 166170 263267 130130 144144 157177 141145 184184 182182 199199 194198 245245000000 096128 124126 127129 297297 172172 122122 160166 237267 130152 144146 157171 145145 184184 182182 199201 194202 245245112118 096128 124126 127129 297297 172172 122122 160166 237267 130152 144146 157171 145145 184184 182182 199201 194202 245245

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ONCFS-ANTAGENE-Session2018-S5a

Population N°Antagene RefONCFS N°Loup(basefinale)

Typeprélèvement Tri Espèce

(mtDNA)Mitotype(Pilot2010)

QualitémtDNA IQ Sexe Hybridation Proba_Loup CI95_bott CI95_up 01-

AHT10302-

AHT11103-

AHTk21104-

FH2096

2018-S5 598481 F8315061 #N/A Crotte 0-Contaminé Loup Italo-alpine(w22) + 0,57 XY Loup 0,997 0,966 1,000 098098 106106 084086 0920962018-S5 598507 F8315020 #N/A Crotte 0-Contaminé Chien - + 0,77 XY Chien 0,004 0,000 0,051 096106 094108 088090 0961002018-S5 598542 F7317045 #N/A Crotte 0-Contaminé Loup Italo-alpine(w22) ++ 0,74 XY #N/A #N/A #N/A #N/A 098102 100100 084088 0920962018-S5 598587 D3818004 #N/A Dépouille 0-Contaminé Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,54 XY Loup 0,976 0,838 1,000 098098 000000 084088 0920962018-S5 598678 F7317055 #N/A Crotte 0-Contaminé Loup Italo-alpine(w22) + 0,58 XY Loup 0,995 0,938 1,000 098098 100102 084084 0920962018-S5 598825 F0415089 #N/A Crotte 0-Contaminé Chien - +++ 0,76 XY Chien 0,006 0,000 0,074 098102 094104 086088 0961002018-S5 598829 F0516009 #N/A Crotte 0-Contaminé Loup Italo-alpine(w22) + 0,90 XX Loup 0,997 0,963 1,000 098098 100102 084084 0920962018-S5 598259 F1218014 #N/A Crotte 0-Noncanis Mulotsylvestre - + NA -- NA NA NA NA NA NA NA NA2018-S5 598267 F3418003 #N/A Crotte 0-Noncanis Renard - +++ NA -- NA NA NA NA NA NA NA NA2018-S5 598270 F3417007 #N/A Crotte 0-Noncanis Renard - +++ NA -- NA NA NA NA NA NA NA NA2018-S5 598271 F4818003 #N/A Crotte 0-Noncanis Vache - - NA -- NA NA NA NA NA NA NA NA2018-S5 598275 F4817012 #N/A Crotte 0-Noncanis Renard - + NA -- NA NA NA NA NA NA NA NA2018-S5 598458 F3816122 #N/A Crotte 0-Noncanis Renard - + NA -- NA NA NA NA NA NA NA NA2018-S5 598459 F3817071 #N/A Crotte 0-Noncanis Renard - -- NA -- NA NA NA NA NA NA NA NA2018-S5 598460 F3817112 #N/A Crotte 0-Noncanis Cerfélaphe - ++ NA -- NA NA NA NA NA NA NA NA2018-S5 598486 F8315049 #N/A Crotte 0-Noncanis Renard - ++ NA -- NA NA NA NA NA NA NA NA2018-S5 598487 F8315045 #N/A Crotte 0-Noncanis Renard - +++ NA -- NA NA NA NA NA NA NA NA2018-S5 598493 F8315044 #N/A Crotte 0-Noncanis Renard - ++ NA -- NA NA NA NA NA NA NA NA2018-S5 598494 F8315034 #N/A Crotte 0-Noncanis Homme - + NA -- NA NA NA NA NA NA NA NA2018-S5 598495 F8315052 #N/A Crotte 0-Noncanis Renard - - NA -- NA NA NA NA NA NA NA NA2018-S5 598501 F8315041 #N/A Crotte 0-Noncanis Renard - + NA -- NA NA NA NA NA NA NA NA2018-S5 598506 F8315043 #N/A Crotte 0-Noncanis Renard - + NA -- NA NA NA NA NA NA NA NA2018-S5 598516 F0415029 #N/A Crotte 0-Noncanis Homme - -- NA -- NA NA NA NA NA NA NA NA2018-S5 598519 F0415044 #N/A Crotte 0-Noncanis Renard - + NA -- NA NA NA NA NA NA NA NA2018-S5 598524 F0415065 #N/A Crotte 0-Noncanis Renard - - NA -- NA NA NA NA NA NA NA NA2018-S5 598555 F7316006 #N/A Crotte 0-Noncanis Cerfélaphe - - NA -- NA NA NA NA NA NA NA NA2018-S5 598556 F7316025 #N/A Crotte 0-Noncanis Homme - + NA -- NA NA NA NA NA NA NA NA2018-S5 598559 F7316012 #N/A Crotte 0-Noncanis Cerfélaphe - + NA -- NA NA NA NA NA NA NA NA2018-S5 598658 F3816098 #N/A Crotte 0-Noncanis Renard - +++ NA -- NA NA NA NA NA NA NA NA2018-S5 598667 F7316030 #N/A Crotte 0-Noncanis Renard - +++ NA -- NA NA NA NA NA NA NA NA2018-S5 598668 F7316033 #N/A Crotte 0-Noncanis Renard - +++ NA -- NA NA NA NA NA NA NA NA2018-S5 598669 F7316035 #N/A Crotte 0-Noncanis Renard - + NA -- NA NA NA NA NA NA NA NA2018-S5 598671 F7316028 #N/A Crotte 0-Noncanis Renard - +++ NA -- NA NA NA NA NA NA NA NA2018-S5 598673 F7316027 #N/A Crotte 0-Noncanis Renard - +++ NA -- NA NA NA NA NA NA NA NA2018-S5 598674 F7316036 #N/A Crotte 0-Noncanis Renard - ++ NA -- NA NA NA NA NA NA NA NA2018-S5 598675 F7316054 #N/A Crotte 0-Noncanis Renard - + NA -- NA NA NA NA NA NA NA NA2018-S5 598778 F0514055 #N/A Crotte 0-Noncanis Campagnolsouterrain - - NA -- NA NA NA NA NA NA NA NA2018-S5 598781 F0514058 #N/A Crotte 0-Noncanis Renard - - NA -- NA NA NA NA NA NA NA NA2018-S5 598793 F0415017 #N/A Crotte 0-Noncanis Homme - + NA -- NA NA NA NA NA NA NA NA2018-S5 598810 F1315004 #N/A Crotte 0-Noncanis Renard - +++ NA -- NA NA NA NA NA NA NA NA2018-S5 598831 F0516021 #N/A Crotte 0-Noncanis Renard - +++ NA -- NA NA NA NA NA NA NA NA2018-S5 598834 F0516043 #N/A Crotte 0-Noncanis Renard - +++ NA -- NA NA NA NA NA NA NA NA2018-S5 598841 F0516075 #N/A Crotte 0-Noncanis Renard - - NA -- NA NA NA NA NA NA NA NA2018-S5 598853 F1317004 #N/A Crotte 0-Noncanis Homme - + NA -- NA NA NA NA NA NA NA NA2018-S5 598858 F0417137 #N/A Crotte 0-Noncanis Sanglier - + NA -- NA NA NA NA NA NA NA NA2018-S5 598254 F6618005 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,27 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 106106 084084 0961002018-S5 598255 F1518004 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Canissp. - - 0,27 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 100102 000000 0920962018-S5 598256 F1518005 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 NA - --- 0,06 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 000000 000000 0961002018-S5 598262 F1218017 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Chien - +++ 0,26 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 000000 104104 000000 0000002018-S5 598264 F1218019 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) - 0,45 XX #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 100106 084084 0920962018-S5 598268 F3418004 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Canissp. - + 0,44 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 104108 088088 1001002018-S5 598269 F3418006 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) - 0,00 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 000000 000000 000000 000000

Page 43: ILAN DE LA ERE E DE MISE EN ŒUVRE DU ... - Le loup en France · et chose nouvelle 3) permettre de calculer, pour chaque échantillon, la probabilité d’une hybridation avec le

ONCFS-ANTAGENE-Session2018-S5a

Population N°Antagene RefONCFS N°Loup(basefinale)

Typeprélèvement Tri Espèce

(mtDNA)Mitotype(Pilot2010)

QualitémtDNA IQ Sexe Hybridation Proba_Loup CI95_bott CI95_up 01-

AHT10302-

AHT11103-

AHTk21104-

FH2096

2018-S5 598273 F3418007 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Chien - + 0,26 XX #N/A #N/A #N/A #N/A 098106 104104 088088 0961002018-S5 598274 F3418008 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Canissp. - - 0,19 XX #N/A #N/A #N/A #N/A 000000 100106 084084 0000002018-S5 598447 F3816107 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) + 0,36 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 106106 000000 0920922018-S5 598448 F3816110 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 NA - --- 0,00 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 000000 000000 000000 0000002018-S5 598452 F3816114 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) + 0,34 XX #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 106106 086086 0920922018-S5 598453 F3816103 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) + 0,00 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 000000 000000 000000 0000002018-S5 598456 F3816120 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Canissp. - -- 0,19 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 000000 000000 0920922018-S5 598461 F3818009 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) + 0,13 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 000000 000000 0920962018-S5 598462 F3818012 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) + 0,00 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 000000 000000 000000 0000002018-S5 598465 F3818089 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,24 XY #N/A #N/A #N/A #N/A 000000 100100 000000 0961002018-S5 598466 F2616021 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Canissp. - - 0,19 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 100106 084084 0920922018-S5 598469 D2618001 #N/A Dépouille 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,26 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 000000 100106 084084 0920922018-S5 598470 F7317071 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,00 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 000000 000000 000000 0000002018-S5 598471 F7317028 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) + 0,00 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 000000 000000 000000 0000002018-S5 598472 F7317069 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) + 0,42 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 000000 084084 0960962018-S5 598479 F8315058 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Canissp. - - 0,38 XY #N/A #N/A #N/A #N/A 102106 104108 088090 0961002018-S5 598480 F8315062 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,00 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 000000 000000 000000 0000002018-S5 598482 F8315063 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) ++ 0,18 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 100106 000000 0920962018-S5 598485 F8315048 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 NA - --- 0,00 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 000000 000000 000000 0000002018-S5 598489 F8315046 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) + 0,22 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 000000 000000 0960962018-S5 598490 F8315036 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Canissp. - -- 0,08 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 000000 000000 084090 0920922018-S5 598498 F8315055 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,15 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 100106 084084 0920962018-S5 598500 F8315037 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) + 0,40 XX #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 100100 084084 0920922018-S5 598504 F8315040 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) + 0,00 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 000000 000000 000000 0000002018-S5 598508 F8315024 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) + 0,27 XX #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 100106 000000 0960962018-S5 598509 F8315025 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) - 0,00 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 000000 000000 000000 0000002018-S5 598512 F0415093 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 NA - --- 0,00 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 000000 000000 000000 0000002018-S5 598517 F0415046 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Chien - + 0,24 XY #N/A #N/A #N/A #N/A 000000 104104 000000 0000002018-S5 598520 F0415054 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 NA - --- 0,00 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 000000 000000 000000 0000002018-S5 598522 F0415077 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) + 0,00 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 000000 000000 000000 0000002018-S5 598526 F0415081 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Chien - +++ 0,26 XX #N/A #N/A #N/A #N/A 098100 098104 090090 0961002018-S5 598527 F0415092 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Chien - +++ 0,09 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 000000 000000 092092 1001002018-S5 598528 F0415049 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 NA - --- 0,00 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 000000 000000 000000 0000002018-S5 598539 F7317029 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) + 0,09 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 102102 100102 084088 0960962018-S5 598543 F7317009 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) + 0,08 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 098102 100100 084088 0000002018-S5 598546 F7317049 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) + 0,28 XX #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 100100 084084 0920962018-S5 598547 F7317042 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,00 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 000000 000000 000000 0000002018-S5 598552 F7316017 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,45 XY #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 100102 084088 0920962018-S5 598553 F7316018 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,48 XY #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 100100 084084 0920962018-S5 598554 F7316001 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) - 0,04 XX #N/A #N/A #N/A #N/A 000000 000000 084084 0000002018-S5 598558 F7316013 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 NA - --- 0,00 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 000000 000000 000000 0000002018-S5 598560 F7316007 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) + 0,33 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 098102 100102 084088 0960962018-S5 598562 F7316005 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) - 0,24 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 098102 100102 084088 0960962018-S5 598564 F7315051 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) ++ 0,44 XY #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 100100 084090 0920922018-S5 598565 F7315052 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) ++ 0,38 XY #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 100100 084084 0920962018-S5 598566 F7315054 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) + 0,00 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 000000 000000 000000 0000002018-S5 598609 F3816055 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) ++ 0,00 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 000000 000000 000000 0000002018-S5 598612 F3816041 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) + 0,36 XX #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 100106 000000 0920922018-S5 598614 F3815047 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,00 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 000000 000000 000000 0000002018-S5 598615 F3815048 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) ++ 0,00 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 000000 000000 000000 0000002018-S5 598617 F3815046 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) ++ 0,09 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 000000 100106 000000 0920922018-S5 598618 D7315004 #N/A Dépouille+Poils 1-IQ<0,5 NA - --- 0,00 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 000000 000000 000000 000000

Page 44: ILAN DE LA ERE E DE MISE EN ŒUVRE DU ... - Le loup en France · et chose nouvelle 3) permettre de calculer, pour chaque échantillon, la probabilité d’une hybridation avec le

ONCFS-ANTAGENE-Session2018-S5a

Population N°Antagene RefONCFS N°Loup(basefinale)

Typeprélèvement Tri Espèce

(mtDNA)Mitotype(Pilot2010)

QualitémtDNA IQ Sexe Hybridation Proba_Loup CI95_bott CI95_up 01-

AHT10302-

AHT11103-

AHTk21104-

FH2096

2018-S5 598624 F7314022 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,32 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 100100 084084 0920962018-S5 598627 F3814019 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) + 0,08 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 100100 084084 0920922018-S5 598628 F7316050 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) ++ 0,13 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 100106 000000 0000002018-S5 598630 F2617040 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Canissp. - - 0,00 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 000000 000000 000000 0000002018-S5 598633 F2617051 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) ++ 0,46 XY #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 100100 084084 0920922018-S5 598641 F2617067 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) + 0,23 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 100106 084084 0920922018-S5 598642 F2617068 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) + 0,27 XY #N/A #N/A #N/A #N/A 098102 100106 084084 0920922018-S5 598643 F2617033 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) - 0,03 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 096096 000000 084084 0000002018-S5 598652 F7416008 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) - 0,00 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 000000 000000 000000 0000002018-S5 598663 F7316037 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 NA - --- 0,00 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 000000 000000 000000 0000002018-S5 598666 F7316029 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 NA - --- 0,00 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 000000 000000 000000 0000002018-S5 598670 F7316034 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Canissp. - - 0,00 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 000000 000000 000000 0000002018-S5 598672 F7316032 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 NA - --- 0,00 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 000000 000000 000000 0000002018-S5 598780 F0514059 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) ++ 0,00 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 000000 000000 000000 0000002018-S5 598782 F0514061 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Canissp. - - 0,00 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 000000 000000 000000 0000002018-S5 598783 F0514062 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Canissp. - - 0,24 XY #N/A #N/A #N/A #N/A 096100 106114 084092 0000002018-S5 598791 F1315010 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Chien - + 0,28 XY #N/A #N/A #N/A #N/A 098102 000000 086092 1001002018-S5 598794 F0415013 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) + 0,07 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 000000 000000 0000002018-S5 598795 F0415022 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 NA - --- 0,00 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 000000 000000 000000 0000002018-S5 598796 F0415023 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) + 0,00 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 000000 000000 000000 0000002018-S5 598798 F0515087 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) + 0,18 XX #N/A #N/A #N/A #N/A 000000 000000 084084 0920962018-S5 598799 F1315012 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,40 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 106106 084084 0920962018-S5 598802 F0415043 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 NA - --- 0,23 XY #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 100106 000000 0920962018-S5 598803 F1315014 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 NA - --- 0,25 XX #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 106106 084084 0920962018-S5 598806 F1315019 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) + 0,44 XX #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 106106 084084 0920962018-S5 598813 F1315007 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) + 0,26 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 106106 084084 0920962018-S5 598815 F1315008 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) ++ 0,39 XX #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 106106 084084 0920962018-S5 598816 F1315017 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) + 0,19 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 000000 084084 0920962018-S5 598817 F1315018 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) + 0,16 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 000000 084084 0000002018-S5 598818 F1315022 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) + 0,34 XX #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 106106 084084 0920962018-S5 598820 F1315025 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) + 0,48 XX #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 106106 084084 0920962018-S5 598821 F1315021 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) + 0,46 XX #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 106106 084084 0920962018-S5 598833 F0516040 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) ++ 0,26 XY #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 100100 000000 0920922018-S5 598835 F0516044 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,16 XY #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 000000 000000 0920962018-S5 598839 F0516050 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) + 0,11 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 000000 000000 0000002018-S5 598840 F0516051 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) + 0,28 XX #N/A #N/A #N/A #N/A 098100 100100 084084 0920962018-S5 598842 F1316011 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) ++ 0,10 XX #N/A #N/A #N/A #N/A 000000 000000 000000 0000002018-S5 598844 F1316015 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) + 0,24 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 100100 000000 0960962018-S5 598847 F0417225 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Chien - +++ 0,22 XX #N/A #N/A #N/A #N/A 100104 104108 086092 1001052018-S5 598849 F0417071 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) + 0,40 XY #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 100100 084084 0920922018-S5 598850 F0517012 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,04 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 000000 000000 086086 0920962018-S5 598851 F0417061 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 NA - --- 0,00 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 000000 000000 000000 0000002018-S5 598852 F0417062 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,24 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 100102 084084 0960962018-S5 598854 F0417093 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) + 0,21 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 098100 100102 084084 0000002018-S5 598856 F0417059 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) + 0,21 XY #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 100102 084084 0960962018-S5 598857 F0517020 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 NA - --- 0,34 XX #N/A #N/A #N/A #N/A 096098 098104 084092 0921002018-S5 598859 F1317006 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) + 0,48 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 100106 088088 0920962018-S5 598860 F1317007 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) ++ 0,32 XY #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 100100 000000 0960962018-S5 598861 F0617061 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) + 0,28 XY #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 100102 084084 0920922018-S5 598862 F8417007 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) + 0,42 XY #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 100100 084084 0920962018-S5 598863 F8417008 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,22 XX #N/A #N/A #N/A #N/A 098098 100100 084084 0920962018-S5 598864 F8417009 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) + 0,00 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 000000 000000 000000 000000

Page 45: ILAN DE LA ERE E DE MISE EN ŒUVRE DU ... - Le loup en France · et chose nouvelle 3) permettre de calculer, pour chaque échantillon, la probabilité d’une hybridation avec le

ONCFS-ANTAGENE-Session2018-S5a

Population N°Antagene RefONCFS N°Loup(basefinale)

Typeprélèvement Tri Espèce

(mtDNA)Mitotype(Pilot2010)

QualitémtDNA IQ Sexe Hybridation Proba_Loup CI95_bott CI95_up 01-

AHT10302-

AHT11103-

AHTk21104-

FH2096

2018-S5 598865 F0617064 #N/A Crotte 1-IQ<0,5 Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,00 -- #N/A #N/A #N/A #N/A 000000 000000 000000 0000002018-S5 598257 F1518006 CH56-04 Crotte 2-Chien Chien - ++ 0,95 XX Chien 0,004 0,000 0,040 098100 104104 088088 0961002018-S5 598260 F1218015 CH53-03 Crotte 2-Chien Chien - ++ 0,85 XX Chien 0,003 0,000 0,036 098104 104108 088088 1001002018-S5 598261 F1218016 CH56-08 Crotte 2-Chien Chien - +++ 0,97 XX Chien 0,006 0,000 0,070 098098 094108 088088 1001002018-S5 598276 F4816009 CH56-10 Crotte 2-Chien Chien - ++ 0,93 XX Chien 0,013 0,000 0,116 098100 094104 084092 0921002018-S5 598484 F8315038 CH56-12 Crotte 2-Chien Canissp. - + 0,84 XX Chien 0,003 0,000 0,036 096100 104104 088088 0961002018-S5 598492 F8315039 CH56-06 Crotte 2-Chien Chien - ++ 0,74 XX Chien 0,005 0,000 0,052 096104 098104 088090 0960962018-S5 598502 F8315059 CH56-02 Crotte 2-Chien Chien - +++ 0,84 XX Chien 0,003 0,000 0,033 102106 098108 090090 0960962018-S5 598561 F7316008 CH56-09 Crotte 2-Chien Chien - +++ 0,87 XY Chien 0,008 0,000 0,086 102102 100104 084088 0960962018-S5 598650 F7416006 CH56-01 Crotte 2-Chien Chien - +++ 0,93 XX Chien 0,003 0,000 0,032 102102 102104 088090 1001002018-S5 598651 F7416007 CH56-11 Crotte 2-Chien Chien - ++ 0,88 XX Chien 0,013 0,000 0,131 098098 104104 090090 0960962018-S5 598846 F0417227 CH56-07 Crotte 2-Chien Chien - ++ 0,63 XX Chien 0,005 0,000 0,054 098100 104104 086092 1001002018-S5 598848 F0417213 CH56-05 Crotte 2-Chien Chien - ++ 0,69 XY Chien 0,004 0,000 0,047 098100 100102 088088 0961002018-S5 598263 F1218018 S51-3 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) + 0,52 -- Loup 0,997 0,964 1,000 098098 100106 084084 0920962018-S5 598265 F1218020 S51-3 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) + 0,80 XX Loup 0,998 0,975 1,000 098098 100106 084084 0920962018-S5 598266 F1218021 S44-10 Crotte 3-Exploitable Canissp. - - 0,67 XY Loup 0,832 0,588 1,000 098098 100100 088088 0961002018-S5 598272 F4818005 S56-11 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,95 XY BC? 0,880 0,720 0,983 098098 100106 084084 0920962018-S5 598449 F3816111 S49-31 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) ++ 0,93 XY Loup 0,998 0,973 1,000 098098 100106 084084 0920962018-S5 598450 F3816112 S56-12 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) ++ 0,76 XX Loup 0,997 0,971 1,000 098098 100106 000000 0920962018-S5 598451 F3816113 S49-31 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) + 0,97 XY Loup 0,998 0,975 1,000 098098 100106 084084 0920962018-S5 598454 F3816126 S56-13 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) + 0,67 XX Loup 0,998 0,978 1,000 098098 106106 086086 0920922018-S5 598455 F3816127 S49-31 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) + 0,61 XY Loup 0,997 0,966 1,000 098098 100106 084084 0920962018-S5 598457 F3816121 S47-1 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) + 0,95 XY Loup 0,997 0,971 1,000 098098 100106 084084 0920922018-S5 598464 D7318004 S56-14 Dépouille 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) ++ 1,00 XY Loup 0,907 0,745 1,000 098098 100102 084084 0920962018-S5 598467 F2616020 S54-12 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,74 XX Loup 0,997 0,970 1,000 098098 100106 084084 0920922018-S5 598473 D7318007 S55-30 Dépouille 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) +++ 1,00 XY Loup 0,997 0,971 1,000 098098 100106 086086 0920922018-S5 598474 D7318005 S56-15 Dépouille 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) ++ 1,00 XY Loup 0,998 0,975 1,000 098098 100100 084084 0920922018-S5 598475 D7318002 S56-16 Dépouille 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) ++ 1,00 XX BC? 0,884 0,730 0,993 098098 100100 084084 0920962018-S5 598476 D7318003 S56-17 Dépouille 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) + 1,00 XX Loup 0,987 0,897 1,000 098098 100100 084084 0920922018-S5 598477 D7318006 S56-18 Dépouille 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) +++ 1,00 XY Loup 0,996 0,957 1,000 098098 100100 084084 0920922018-S5 598483 F8315053 S49-19 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) + 0,96 XX Loup 0,997 0,961 1,000 098098 100106 086086 0960962018-S5 598488 F8315033 S56-02 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) + 0,82 XX Loup 0,998 0,974 1,000 098098 100106 084084 0920962018-S5 598491 F8315047 S56-20 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) ++ 0,72 XY Loup 0,997 0,966 1,000 098098 100106 000000 0920962018-S5 598496 F8315057 S56-21 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,89 XX Loup 0,998 0,974 1,000 098098 100106 000000 0920962018-S5 598497 F8315050 S49-19 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,98 XX Loup 0,997 0,963 1,000 098098 100106 086086 0960962018-S5 598499 F8315035 S56-22 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) + 0,67 XX Loup 0,998 0,975 1,000 098098 100100 084084 0920922018-S5 598503 F8315042 S49-19 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) -- 0,52 XX Loup 0,996 0,955 1,000 098098 100106 086086 0960962018-S5 598505 F8315051 S56-02 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,73 XX Loup 0,998 0,973 1,000 098098 100106 084084 0920962018-S5 598510 F8313066 S54-04 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) + 0,93 XX Loup 0,998 0,978 1,000 098098 100106 084084 0920922018-S5 598511 F0415084 S37-9 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) + 0,59 XY Loup 0,957 0,808 1,000 098098 100106 000000 0920962018-S5 598513 F0415085 S32-19 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) ++ 0,91 XX Loup 0,998 0,976 1,000 098098 100106 084084 0920962018-S5 598514 F0415062 S56-23 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) + 0,82 -- BC 0,769 0,591 0,908 098100 102106 084084 0920962018-S5 598515 F0415047 S32-19 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,91 XX Loup 0,998 0,972 1,000 098098 100106 084084 0920962018-S5 598518 F0415076 S48-16 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) ++ 0,75 XX Loup 0,996 0,950 1,000 098098 100100 086086 0961002018-S5 598521 F0415059 S56-24 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) - 0,89 XY Loup 0,988 0,909 1,000 098098 100100 084084 0920962018-S5 598523 F0415061 S56-25 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,79 XX HYBF1 0,592 0,380 0,783 098100 100102 090090 0920962018-S5 598525 F0415055 S32-19 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) ++ 0,95 XX Loup 0,998 0,975 1,000 098098 100106 084084 0920962018-S5 598536 F7317044 S56-03 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) + 0,71 XX BC 0,805 0,612 0,943 098098 100100 084084 0920962018-S5 598537 F7317047 S54-16 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) + 0,73 XY BC 0,753 0,556 0,903 098102 100100 084088 0920962018-S5 598538 F7317016 S54-19 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,93 XY BC 0,770 0,591 0,908 098102 100100 088088 0920962018-S5 598540 F7317005 S56-03 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) + 0,86 XX BC 0,805 0,612 0,943 098098 100100 084084 0920962018-S5 598541 F7317048 S54-16 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,91 XY BC 0,754 0,557 0,903 098102 100100 084088 092096

Page 46: ILAN DE LA ERE E DE MISE EN ŒUVRE DU ... - Le loup en France · et chose nouvelle 3) permettre de calculer, pour chaque échantillon, la probabilité d’une hybridation avec le

ONCFS-ANTAGENE-Session2018-S5a

Population N°Antagene RefONCFS N°Loup(basefinale)

Typeprélèvement Tri Espèce

(mtDNA)Mitotype(Pilot2010)

QualitémtDNA IQ Sexe Hybridation Proba_Loup CI95_bott CI95_up 01-

AHT10302-

AHT11103-

AHTk21104-

FH2096

2018-S5 598544 F7317010 S54-19 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) ++ 0,54 XY BC 0,796 0,583 0,945 098102 100100 088088 0920962018-S5 598545 F7317001 S56-01 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) ++ 0,82 XX BC 0,713 0,501 0,882 098102 100100 088088 0920962018-S5 598548 F7317007 S56-26 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) ++ 0,97 XY BC 0,722 0,524 0,880 098098 100102 088088 0920962018-S5 598550 F7317056 S53-05 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) + 0,92 XY Loup 0,998 0,976 1,000 098098 100106 084084 0920922018-S5 598551 F7317004 S54-16 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,94 XY BC 0,783 0,605 0,916 098102 100100 084088 0920962018-S5 598557 F7316004 S56-27 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) + 0,93 XY Loup 0,920 0,769 1,000 098098 100100 084084 0920962018-S5 598563 F7316016 S56-01 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) +++ 1,00 XX HYBF1? 0,670 0,466 0,843 098102 100100 088088 0920962018-S5 598567 F7315050 S56-28 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) ++ 0,63 XY HYBF1 0,564 0,287 0,803 098098 100102 088088 0920962018-S5 598568 F7317046 S56-04 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) ++ 0,97 XY BC 0,834 0,657 0,960 098098 100102 084088 0920962018-S5 598592 D7317013 S56-29 Dépouille 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) +++ 1,00 XY HYBF1 0,672 0,470 0,844 098098 100102 088088 0960962018-S5 598608 F3816054 S56-30 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,58 XY Loup 0,998 0,975 1,000 098098 106106 000000 0920922018-S5 598610 F3816084 S50-9 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) + 0,77 XX Loup 0,998 0,974 1,000 098098 100106 086086 0920922018-S5 598611 F3816004 S56-31 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) ++ 1,00 XX Loup 0,998 0,978 1,000 098098 100106 086086 0920922018-S5 598613 F3816005 S56-32 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,58 XY Loup 0,997 0,964 1,000 098098 100106 084084 0920922018-S5 598616 F3815030 S47-1 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) + 0,57 XY Loup 0,997 0,961 1,000 098098 100106 084084 0920922018-S5 598619 F3816091 S56-33 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,95 XY BC 0,798 0,618 0,935 098098 100102 084084 0920922018-S5 598620 D7317010 S56-34 Dépouille 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) +++ 1,00 XY BC 0,803 0,608 0,946 098098 102106 084084 0961002018-S5 598621 F7314016 S56-05 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) ++ 0,66 XY Loup 0,997 0,961 1,000 098098 100100 084084 0921002018-S5 598622 F7314017 S56-05 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) ++ 0,99 XY Loup 0,996 0,953 1,000 098098 100100 084084 0921002018-S5 598623 F7314018 S56-06 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,95 XX Loup 0,995 0,948 1,000 098098 100106 084084 0920962018-S5 598625 F3814012 S56-06 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) + 0,68 XX Loup 0,994 0,928 1,000 098098 100106 084084 0920962018-S5 598626 F3814013 S56-05 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) ++ 0,97 XY Loup 0,996 0,954 1,000 098098 100100 084084 0921002018-S5 598631 F2617046 S54-47 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) ++ 1,00 XY Loup 0,997 0,964 1,000 098098 100100 084084 0920922018-S5 598632 F2617050 S55-18 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) ++ 0,86 XY Loup 0,997 0,964 1,000 098098 100100 084084 0920962018-S5 598648 F7416002 S24-11 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,88 XX Loup 0,997 0,966 1,000 098098 100106 084084 0960962018-S5 598649 F7416005 S24-11 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) ++ 0,98 XX Loup 0,997 0,969 1,000 098098 100106 084084 0960962018-S5 598653 F7416009 S56-35 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,96 XY Loup 0,991 0,918 1,000 098098 100102 084084 0920922018-S5 598657 F3816080 S56-07 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,95 XX Loup 0,998 0,974 1,000 098098 100100 084084 0960962018-S5 598659 F3816128 S56-07 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,95 XX Loup 0,998 0,974 1,000 098098 100100 084084 0960962018-S5 598664 F7316044 S56-36 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) ++ 0,79 XX Loup 0,997 0,961 1,000 098098 100100 084084 0960962018-S5 598665 F7316045 S54-20 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) + 0,89 XX Loup 0,998 0,977 1,000 098098 100100 084084 0920962018-S5 598676 F7317040 S52-33 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) + 0,97 XY Loup 0,998 0,975 1,000 098098 100100 084084 0960962018-S5 598677 F7317041 S54-17 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) + 0,97 XX Loup 0,997 0,969 1,000 098098 100100 084084 0920962018-S5 598773 F0514018 S48-11 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) + 0,99 XX Loup 0,997 0,967 1,000 098098 100102 084084 0920962018-S5 598774 F0514034 S40-12 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,77 XX Loup 0,997 0,971 1,000 098098 106106 084084 0920922018-S5 598775 F0514035 S40-14 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,75 XX Loup 0,996 0,955 1,000 098098 106106 084084 0921002018-S5 598776 F0514040 S29-7 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) + 1,00 XX Loup 0,996 0,956 1,000 098098 100106 084084 0921002018-S5 598777 F0514041 S29-7 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,94 XX Loup 0,996 0,955 1,000 098098 100106 084084 0921002018-S5 598779 F0514057 S40-15 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) + 0,98 XY Loup 0,998 0,976 1,000 098098 100106 084084 0920922018-S5 598784 F0514063 S40-14 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,98 XX Loup 0,996 0,957 1,000 098098 106106 084084 0921002018-S5 598785 F0514066 S21-1 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,92 XX Loup 0,997 0,962 1,000 098098 106106 084084 0921002018-S5 598786 F0514065 S40-12 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) +++ 1,00 XX Loup 0,998 0,976 1,000 098098 106106 084084 0920922018-S5 598787 F0514067 S21-1 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,96 XX Loup 0,997 0,965 1,000 098098 106106 084084 0921002018-S5 598788 F0514072 S54-60 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) + 0,96 XX Loup 0,997 0,967 1,000 098098 100100 084084 0920922018-S5 598789 F0514073 S56-37 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,57 -- Loup 0,913 0,754 1,000 098098 100106 084084 0920922018-S5 598790 F0514074 S56-38 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,88 XY BC 0,748 0,535 0,911 098098 100100 084086 0920962018-S5 598792 F0515015 S29-7 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) + 0,51 XX Loup 0,994 0,929 1,000 098098 100106 084084 0921002018-S5 598797 F0515086 S45-2 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) + 0,83 XX Loup 0,997 0,964 1,000 098098 100102 084084 0920922018-S5 598800 F0415091 S56-39 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) + 0,85 XX Loup 0,996 0,960 1,000 098098 100106 083083 0920962018-S5 598801 F1315013 S39-13 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) + 0,93 XX Loup 0,998 0,975 1,000 098098 106106 084084 0920962018-S5 598804 F1315016 S39-13 Crotte 3-Exploitable Canissp. - - 0,99 XX Loup 0,998 0,977 1,000 098098 106106 084084 0920962018-S5 598805 F1315015 S39-13 Crotte 3-Exploitable Canissp. - - 0,72 XX Loup 0,998 0,972 1,000 098098 106106 084084 092096

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ONCFS-ANTAGENE-Session2018-S5a

Population N°Antagene RefONCFS N°Loup(basefinale)

Typeprélèvement Tri Espèce

(mtDNA)Mitotype(Pilot2010)

QualitémtDNA IQ Sexe Hybridation Proba_Loup CI95_bott CI95_up 01-

AHT10302-

AHT11103-

AHTk21104-

FH2096

2018-S5 598807 F0415048 S56-40 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) ++ 0,76 XX Loup 0,913 0,758 1,000 098098 100106 086090 0920922018-S5 598808 F1315001 S39-13 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) + 0,82 XX Loup 0,998 0,977 1,000 098098 106106 084084 0920962018-S5 598809 F1315002 S39-13 Crotte 3-Exploitable Canissp. - - 0,94 XX Loup 0,998 0,975 1,000 098098 106106 084084 0920962018-S5 598811 F1315005 S39-13 Crotte 3-Exploitable Canissp. - - 0,96 XX Loup 0,998 0,975 1,000 098098 106106 084084 0920962018-S5 598812 F1315006 S39-13 Crotte 3-Exploitable Canissp. - - 0,96 XX Loup 0,998 0,975 1,000 098098 106106 084084 0920962018-S5 598814 F1315009 S39-13 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) + 0,79 XX Loup 0,998 0,975 1,000 098098 106106 084084 0920962018-S5 598819 F1315024 S39-13 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) + 0,93 XX Loup 0,998 0,975 1,000 098098 106106 084084 0920962018-S5 598822 F1315026 S56-41 Crotte 3-Exploitable Canissp. - - 0,99 XY Loup 0,997 0,967 1,000 098098 100102 086086 0920962018-S5 598823 F1315027 S56-42 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) + 0,76 XX Loup 0,997 0,963 1,000 098098 102106 084084 0960962018-S5 598824 F1315029 S39-13 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) + 0,74 XX Loup 0,998 0,975 1,000 098098 106106 084084 0920962018-S5 598826 F0516003 S56-08 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,96 XY Loup 0,997 0,967 1,000 098098 100100 086086 0920922018-S5 598827 F0516002 S56-08 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,93 XY Loup 0,997 0,967 1,000 098098 100100 086086 0920922018-S5 598828 F0516008 S56-43 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) + 0,91 XX Loup 0,998 0,973 1,000 098098 100100 084084 0920922018-S5 598830 F0516011 S56-44 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) ++ 0,85 XX Loup 0,997 0,964 1,000 098098 100102 086086 0920962018-S5 598832 F0516032 S56-45 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,92 XY Loup 0,997 0,967 1,000 098098 100102 086086 0920922018-S5 598836 F0516052 S56-09 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,80 XX Loup 0,998 0,976 1,000 098098 100100 086086 0920922018-S5 598837 F0516049 S56-09 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,68 XX Loup 0,998 0,974 1,000 098098 100100 086086 0920922018-S5 598838 F0516045 S56-46 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) ++ 0,98 XX Loup 0,998 0,976 1,000 098098 100106 086086 0920922018-S5 598843 F1316013 S51-19 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,66 XX Loup 0,985 0,866 1,000 098100 102106 084084 0960962018-S5 598845 F0417011 S56-47 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,91 XX BC 0,776 0,583 0,922 098100 100106 084090 0920922018-S5 598855 F0417082 S56-48 Crotte 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) +++ 0,74 XX Loup 0,995 0,946 1,000 098098 100100 086086 0960962018-S5 598906 D0418004 S56-49 Dépouille 3-Exploitable Loup Italo-alpine(w22) +++ 1,00 XY Loup 0,998 0,975 1,000 098098 106106 084084 092092

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ONCFS-ANTAGENE-Session2018-S5a

N°Antagene RefONCFS

598481 F8315061598507 F8315020598542 F7317045598587 D3818004598678 F7317055598825 F0415089598829 F0516009598259 F1218014598267 F3418003598270 F3417007598271 F4818003598275 F4817012598458 F3816122598459 F3817071598460 F3817112598486 F8315049598487 F8315045598493 F8315044598494 F8315034598495 F8315052598501 F8315041598506 F8315043598516 F0415029598519 F0415044598524 F0415065598555 F7316006598556 F7316025598559 F7316012598658 F3816098598667 F7316030598668 F7316033598669 F7316035598671 F7316028598673 F7316027598674 F7316036598675 F7316054598778 F0514055598781 F0514058598793 F0415017598810 F1315004598831 F0516021598834 F0516043598841 F0516075598853 F1317004598858 F0417137598254 F6618005598255 F1518004598256 F1518005598262 F1218017598264 F1218019598268 F3418004598269 F3418006

05-CPH02 06-FH2088

07-C09.173 08-CPH05 09-

FH200410-

CFX3037111-

CXX27912-

C09.25013-

FH216114-

FH214015-

INU03016-

FH213717-

FH205418-

C27.442 19-Dbar120-

REN162C04

21-PEZ17 22-FH2010

120120 096128 132132 127129 243309 172172 124124 162170 000000 130138 144144 157177 000000 184184 182182 201201 000000 245245114114 120132 120130 127129 247251 168168 122122 162170 241241 138152 146146 000000 000000 186186 223226 201205 206206 241245114118 120120 124132 129129 000000 168172 124124 162162 000000 130131 144144 000000 141145 000000 182182 199201 193202 245245118120 000000 124126 127129 000000 172172 122124 162162 000000 000000 000000 000000 141149 184184 182182 201201 198198 000000000000 000000 126126 129129 000000 172172 116124 000000 000000 130152 144144 157163 145149 184186 182182 199201 000000 245245114114 120124 120127 127127 243243 168168 116124 156156 237245 122146 000000 165171 149153 184186 223223 000000 202214 000000118120 120120 124132 127129 243297 172172 122122 162162 000000 130152 144144 161177 141162 184184 182182 201201 198202 245245NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NANA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA

120122 000000 000000 129129 000000 172172 000000 162162 000000 000000 000000 000000 000000 184184 000000 201201 000000 000000114118 120120 124132 129129 000000 172172 122124 162162 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 245249000000 000000 000000 129129 000000 000000 122122 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 245245000000 000000 000000 129131 243243 172172 000000 162164 000000 121131 150150 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000000000 120120 124126 000000 000000 172172 122122 162166 000000 130130 000000 163177 145162 184184 182182 201201 194194 000000000000 000000 122128 127127 000000 168172 116116 162162 000000 131131 144148 000000 145149 180186 000000 199205 000000 000000000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000

Page 49: ILAN DE LA ERE E DE MISE EN ŒUVRE DU ... - Le loup en France · et chose nouvelle 3) permettre de calculer, pour chaque échantillon, la probabilité d’une hybridation avec le

ONCFS-ANTAGENE-Session2018-S5a

N°Antagene RefONCFS

598273 F3418007598274 F3418008598447 F3816107598448 F3816110598452 F3816114598453 F3816103598456 F3816120598461 F3818009598462 F3818012598465 F3818089598466 F2616021598469 D2618001598470 F7317071598471 F7317028598472 F7317069598479 F8315058598480 F8315062598482 F8315063598485 F8315048598489 F8315046598490 F8315036598498 F8315055598500 F8315037598504 F8315040598508 F8315024598509 F8315025598512 F0415093598517 F0415046598520 F0415054598522 F0415077598526 F0415081598527 F0415092598528 F0415049598539 F7317029598543 F7317009598546 F7317049598547 F7317042598552 F7316017598553 F7316018598554 F7316001598558 F7316013598560 F7316007598562 F7316005598564 F7315051598565 F7315052598566 F7315054598609 F3816055598612 F3816041598614 F3815047598615 F3815048598617 F3815046598618 D7315004

05-CPH02 06-FH2088

07-C09.173 08-CPH05 09-

FH200410-

CFX3037111-

CXX27912-

C09.25013-

FH216114-

FH214015-

INU03016-

FH213717-

FH205418-

C27.442 19-Dbar120-

REN162C04

21-PEZ17 22-FH2010

000000 000000 000000 127133 000000 168168 000000 162162 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 203207 000000 000000000000 000000 000000 000000 243243 000000 122122 162166 000000 000000 000000 163177 145145 184184 182182 000000 194198 245245112120 120120 126126 000000 000000 172172 116116 162162 000000 130130 144144 000000 145145 184184 182182 000000 000000 000000000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000112120 000000 126126 141141 000000 172172 116116 162162 000000 130130 144144 000000 000000 184184 000000 000000 000000 000000000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000000000 000000 000000 000000 000000 172172 000000 000000 000000 000000 000000 000000 145145 184184 000000 000000 000000 237237000000 000000 000000 129129 000000 000000 000000 162166 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 201201 000000 245245000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000000000 120120 000000 127129 239239 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 198198 000000000000 000000 126126 000000 000000 172172 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000000000 000000 000000 000000 000000 172172 116116 000000 000000 000000 000000 157163 000000 000000 000000 199199 198202 000000000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000000000 120128 000000 127127 000000 172172 116116 162166 000000 000000 144144 157177 141149 184184 182182 201201 000000 237237000000 120132 120130 000000 251251 168168 122122 000000 000000 000000 000000 000000 165172 186186 000000 000000 000000 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000000000000 000000 000000 129129 000000 172172 122122 160170 000000 000000 144144 171171 000000 184186 000000 000000 000000 000000000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000000000 000000 128128 131133 000000 168168 000000 000000 000000 000000 000000 000000 153153 000000 219219 000000 000000 241245000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000000000 128128 120130 129129 000000 168168 122122 166166 000000 131138 000000 157157 145172 186186 000000 000000 000000 245245000000 120132 000000 000000 000000 000000 116116 000000 000000 131131 000000 179179 000000 192192 000000 000000 000000 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245245000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000000000 000000 000000 141141 000000 000000 116116 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000

Page 50: ILAN DE LA ERE E DE MISE EN ŒUVRE DU ... - Le loup en France · et chose nouvelle 3) permettre de calculer, pour chaque échantillon, la probabilité d’une hybridation avec le

ONCFS-ANTAGENE-Session2018-S5a

N°Antagene RefONCFS

598624 F7314022598627 F3814019598628 F7316050598630 F2617040598633 F2617051598641 F2617067598642 F2617068598643 F2617033598652 F7416008598663 F7316037598666 F7316029598670 F7316034598672 F7316032598780 F0514059598782 F0514061598783 F0514062598791 F1315010598794 F0415013598795 F0415022598796 F0415023598798 F0515087598799 F1315012598802 F0415043598803 F1315014598806 F1315019598813 F1315007598815 F1315008598816 F1315017598817 F1315018598818 F1315022598820 F1315025598821 F1315021598833 F0516040598835 F0516044598839 F0516050598840 F0516051598842 F1316011598844 F1316015598847 F0417225598849 F0417071598850 F0517012598851 F0417061598852 F0417062598854 F0417093598856 F0417059598857 F0517020598859 F1317006598860 F1317007598861 F0617061598862 F8417007598863 F8417008598864 F8417009

05-CPH02 06-FH2088

07-C09.173 08-CPH05 09-

FH200410-

CFX3037111-

CXX27912-

C09.25013-

FH216114-

FH214015-

INU03016-

FH213717-

FH205418-

C27.442 19-Dbar120-

REN162C04

21-PEZ17 22-FH2010

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Page 51: ILAN DE LA ERE E DE MISE EN ŒUVRE DU ... - Le loup en France · et chose nouvelle 3) permettre de calculer, pour chaque échantillon, la probabilité d’une hybridation avec le

ONCFS-ANTAGENE-Session2018-S5a

N°Antagene RefONCFS

598865 F0617064598257 F1518006598260 F1218015598261 F1218016598276 F4816009598484 F8315038598492 F8315039598502 F8315059598561 F7316008598650 F7416006598651 F7416007598846 F0417227598848 F0417213598263 F1218018598265 F1218020598266 F1218021598272 F4818005598449 F3816111598450 F3816112598451 F3816113598454 F3816126598455 F3816127598457 F3816121598464 D7318004598467 F2616020598473 D7318007598474 D7318005598475 D7318002598476 D7318003598477 D7318006598483 F8315053598488 F8315033598491 F8315047598496 F8315057598497 F8315050598499 F8315035598503 F8315042598505 F8315051598510 F8313066598511 F0415084598513 F0415085598514 F0415062598515 F0415047598518 F0415076598521 F0415059598523 F0415061598525 F0415055598536 F7317044598537 F7317047598538 F7317016598540 F7317005598541 F7317048

05-CPH02 06-FH2088

07-C09.173 08-CPH05 09-

FH200410-

CFX3037111-

CXX27912-

C09.25013-

FH216114-

FH214015-

INU03016-

FH213717-

FH205418-

C27.442 19-Dbar120-

REN162C04

21-PEZ17 22-FH2010

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Page 52: ILAN DE LA ERE E DE MISE EN ŒUVRE DU ... - Le loup en France · et chose nouvelle 3) permettre de calculer, pour chaque échantillon, la probabilité d’une hybridation avec le

ONCFS-ANTAGENE-Session2018-S5a

N°Antagene RefONCFS

598544 F7317010598545 F7317001598548 F7317007598550 F7317056598551 F7317004598557 F7316004598563 F7316016598567 F7315050598568 F7317046598592 D7317013598608 F3816054598610 F3816084598611 F3816004598613 F3816005598616 F3815030598619 F3816091598620 D7317010598621 F7314016598622 F7314017598623 F7314018598625 F3814012598626 F3814013598631 F2617046598632 F2617050598648 F7416002598649 F7416005598653 F7416009598657 F3816080598659 F3816128598664 F7316044598665 F7316045598676 F7317040598677 F7317041598773 F0514018598774 F0514034598775 F0514035598776 F0514040598777 F0514041598779 F0514057598784 F0514063598785 F0514066598786 F0514065598787 F0514067598788 F0514072598789 F0514073598790 F0514074598792 F0515015598797 F0515086598800 F0415091598801 F1315013598804 F1315016598805 F1315015

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Page 53: ILAN DE LA ERE E DE MISE EN ŒUVRE DU ... - Le loup en France · et chose nouvelle 3) permettre de calculer, pour chaque échantillon, la probabilité d’une hybridation avec le

ONCFS-ANTAGENE-Session2018-S5a

N°Antagene RefONCFS

598807 F0415048598808 F1315001598809 F1315002598811 F1315005598812 F1315006598814 F1315009598819 F1315024598822 F1315026598823 F1315027598824 F1315029598826 F0516003598827 F0516002598828 F0516008598830 F0516011598832 F0516032598836 F0516052598837 F0516049598838 F0516045598843 F1316013598845 F0417011598855 F0417082598906 D0418004

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CXX27912-

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REN162C04

21-PEZ17 22-FH2010

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ONCFS-ANTAGENE-Session2018-S3

Population N°Antagene RefONCFS N°Loup(basefinale)

Typeprélèvement Tri Espèce

(mtDNA)Mitotype(Pilot2010) IQ Sexe Hybridation Proba_Loup CI95_bott CI95_up 00-Clu-

Amelo-A00-Clu-Amelo-B

01-AHT103

02-AHT111

03-AHTk211

04-FH2096

2018-S3 582278 F1218009 #NA F 0-Contaminé Canisfamiliaris #NA 0,292 XX #NA #NA #NA #NA 901901 901901 098098 094104 086088 1001002018-S3 582238 U5417004 #NA U 0-NonCanis Vulpesvulpes #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA2018-S3 582239 U5417009 #NA U 0-NonCanis Vulpesvulpes #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA2018-S3 582240 P4218002 #NA P 0-NonCanis Ovisaries #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA2018-S3 582244 P3917001 #NA P 0-NonCanis Vulpesvulpes #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA2018-S3 582247 F1518001 #NA F 0-NonCanis Vulpesvulpes #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA2018-S3 582248 F1518002 #NA F 0-NonCanis Vulpesvulpes #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA2018-S3 582249 F1518003 #NA F 0-NonCanis Vulpesvulpes #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA2018-S3 582250 F3417002 #NA F 0-NonCanis Vulpesvulpes #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA #NA2018-S3 582251 F3417004 #NA F 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ONCFS-ANTAGENE-Session2018-S3

Population N°Antagene RefONCFS N°Loup(basefinale)

Typeprélèvement Tri Espèce

(mtDNA)Mitotype(Pilot2010) IQ Sexe Hybridation Proba_Loup CI95_bott CI95_up 00-Clu-

Amelo-A00-Clu-Amelo-B

01-AHT103

02-AHT111

03-AHTk211

04-FH2096

2018-S3 582298 F2618002 #NA F 1-IQ<0,5 Canissp #NA 0,370 XY #NA #NA #NA #NA 000000 901902 000000 100106 084084 0961092018-S3 582301 F3815021 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,130 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 000000 000000 0000002018-S3 582308 F3817005 #NA F 1-IQ<0,5 Canisfamiliaris #NA 0,344 XY #NA #NA #NA #NA 000000 901902 096102 104104 088092 1001002018-S3 582309 F3817021 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,281 XY #NA #NA #NA #NA 000000 901902 000000 000000 084084 0920962018-S3 582313 F3817095 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,000 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 000000 000000 0000002018-S3 582314 F3817096 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,000 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 000000 000000 0000002018-S3 582318 F1314007 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,453 XX #NA #NA #NA #NA 000000 901901 098098 106106 084084 0920962018-S3 582319 F8312014 #NA F 1-IQ<0,5 Canissp #NA 0,479 XY #NA #NA #NA #NA 901902 901902 000000 100106 084084 0920962018-S3 582322 F8312019 #NA F 1-IQ<0,5 Canisfamiliaris #NA 0,438 XX #NA #NA #NA #NA 000000 901901 000000 104108 088090 0961002018-S3 582323 F8312024 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,115 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 106106 084084 0000002018-S3 582325 F8313010 #NA F 1-IQ<0,5 Canisfamiliaris #NA 0,052 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 094108 000000 0000002018-S3 582326 F8313012 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,250 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 100106 084084 0000002018-S3 582327 F8313017 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,052 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 000000 000000 0000002018-S3 582329 F8313057 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,052 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 000000 000000 0000002018-S3 582333 F8313061 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,234 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 100106 084084 0920922018-S3 582334 F8313062 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,344 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 100106 084092 0920962018-S3 582338 F8313067 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,104 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 000000 084084 0920962018-S3 582342 F8313072 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,161 XX #NA #NA #NA #NA 901901 901901 000000 100106 000000 0920962018-S3 582343 F8313075 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,172 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 106106 084084 0920922018-S3 582344 F8313076 #NA F 1-IQ<0,5 #NA #NA 0,135 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 106106 084084 0000002018-S3 582347 F8313080 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,208 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 100106 000000 0000002018-S3 582349 1309150 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,307 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 106106 084084 0920922018-S3 582357 1402031 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,010 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 000000 084084 0000002018-S3 582359 1403058 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,042 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 000000 084084 0000002018-S3 582368 F0614015 #NA F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,271 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 100106 083083 0920962018-S3 582242 P4817002 CH54-05 P 2-Chien Canisfamiliaris NA 1,000 XX Chien 0,001 0 0,017 901901 901901 098098 104108 086086 1001002018-S3 582243 P1918002 CH54-01 P 2-Chien Canisfamiliaris NA 0,714 XX Chien 0,004 0 0,044 901901 901901 100100 104110 084090 0961002018-S3 582264 F6618004 CH54-04 F 2-Chien Canisfamiliaris NA 0,958 XY Chien 0,001 0 0,018 901902 901902 098104 000000 088088 1001052018-S3 582275 F1218006 CH54-06 F 2-Chien Canisfamiliaris NA 1,000 XX Chien 0,003 0 0,030 901901 901901 096104 100104 086092 0961002018-S3 582280 F2118002 CH54-03 F 2-Chien Canisfamiliaris NA 0,953 XY Chien 0,003 0 0,035 901902 901902 098098 094108 086094 1001002018-S3 582282 F6518001 #NA F 2-Chien Canisfamiliaris #NA 0,635 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098104 104104 086088 1051052018-S3 582320 F8312016 CH54-02 F 2-Chien Canisfamiliaris NA 0,922 XX Chien 0,001 0 0,016 901901 901901 106106 102104 088090 0961002018-S3 582189 D2518001 S54-01 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY BC 0,693 0,507 0,850 901902 901902 098098 100102 084084 0920962018-S3 582190 D2616002 S25-9 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,875 XY Loup 0,999 0,988 1 901902 901902 098098 100100 084084 0920962018-S3 582191 D2616003 S54-06 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,938 XY BC 0,869 0,702 0,975 901902 901902 098098 100100 086086 0920962018-S3 582192 D2616004 S54-07 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX HYBF1? 0,644 0,437 0,826 901901 901901 098100 102106 090090 0920962018-S3 582193 D2617001 S54-08 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,984 XY Loup 0,997 0,965 1 901902 901902 098098 100100 084084 0961002018-S3 582194 D2617002 S54-09 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,996 0,947 1 901901 901901 098098 100106 084084 0961002018-S3 582195 D3816001 S54-10 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,958 XX Loup 0,999 0,987 1 901901 901901 098098 100100 084084 0920922018-S3 582196 D3816002 S54-11 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,999 0,987 1 901901 901901 098098 100106 084084 0920922018-S3 582197 D3817003 S54-12 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,999 0,985 1 901901 901901 098098 100106 084084 0920922018-S3 582198 D7315008 S54-13 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX HYBF1 0,651 0,442 0,829 901901 901901 098102 100100 088088 0920962018-S3 582199 D7315009 S54-14 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,998 0,970 1 901902 901902 098098 100100 084084 0920962018-S3 582200 D7316003 S54-15 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,953 XX Loup 0,998 0,970 1 901901 901901 098098 100100 086086 0920962018-S3 582201 D7317001 S54-16 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY BC 0,787 0,612 0,918 901902 901902 098102 100100 084088 0920962018-S3 582202 D7317002 S54-17 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,990 XX Loup 0,999 0,983 1 901901 901901 098098 100100 084084 0920962018-S3 582203 D7317003 S54-18 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY BC 0,714 0,520 0,873 901902 901902 100100 100102 086086 0920962018-S3 582204 D7317004 S54-19 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,958 XY BC 0,761 0,579 0,904 901902 901902 098102 100100 088088 0920962018-S3 582205 D7317005 S54-20 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,999 0,986 1 901901 901901 098098 100100 084084 0920962018-S3 582206 D7317006 S54-21 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,998 0,968 1 901902 901902 098098 100106 086086 0961002018-S3 582207 D7317007 S54-22 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,999 0,984 1 901902 901902 098098 100100 084084 0960962018-S3 582208 D7317008 S54-23 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,997 0,966 1 901901 901901 098098 100100 086086 0920922018-S3 582209 D7317011 S54-24 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX BC 0,772 0,584 0,914 901901 901901 098098 100100 084088 0920962018-S3 582210 D7317012 S54-25 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,990 XY Loup 0,999 0,986 1 901902 902902 098098 100106 086086 0920962018-S3 582211 D7318001 S54-26 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,970 0,859 1 901902 901902 098098 100100 084084 096096

Page 56: ILAN DE LA ERE E DE MISE EN ŒUVRE DU ... - Le loup en France · et chose nouvelle 3) permettre de calculer, pour chaque échantillon, la probabilité d’une hybridation avec le

ONCFS-ANTAGENE-Session2018-S3

Population N°Antagene RefONCFS N°Loup(basefinale)

Typeprélèvement Tri Espèce

(mtDNA)Mitotype(Pilot2010) IQ Sexe Hybridation Proba_Loup CI95_bott CI95_up 00-Clu-

Amelo-A00-Clu-Amelo-B

01-AHT103

02-AHT111

03-AHTk211

04-FH2096

2018-S3 582212 D0416007 S54-27 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,999 0,987 1 901901 901901 098098 100106 084084 0920922018-S3 582213 D0417005 S54-28 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,999 0,984 1 901902 901902 098098 100102 084084 0920922018-S3 582214 D0418001 S54-29 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,997 0,963 1 901902 901902 098098 100106 084084 0920922018-S3 582215 D0418002 S54-30 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,999 0,985 1 901902 901902 098098 100100 084084 0960962018-S3 582216 D0517001 S54-31 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,998 0,980 1 901902 901902 098098 100106 084084 0920922018-S3 582217 D0517006 S54-32 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,999 0,985 1 901901 901901 098098 100100 084084 0920922018-S3 582218 D0517007 S54-33 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,995 XX Loup 0,999 0,986 1 901901 901901 098098 100106 084084 0920962018-S3 582219 D0517008 S54-34 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,999 0,986 1 901902 901902 098098 100106 086086 0920962018-S3 582220 D0517009 S54-35 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,999 0,985 1 901902 901902 098098 100106 084084 0920962018-S3 582221 D0517010 S54-36 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,979 XX BC 0,885 0,717 0,990 901901 901901 098098 100102 084086 0920962018-S3 582222 D0517011 S54-37 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,984 XY Loup 0,999 0,984 1 901902 901902 098098 100106 084084 0920922018-S3 582223 D0518001 S54-38 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,906 XY Loup 0,997 0,962 1 901902 901902 098098 100104 084084 0920962018-S3 582224 D0518002 S54-39 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,917 XX Loup 0,999 0,983 1 901901 901901 000000 100106 000000 0920962018-S3 582225 D0518003 S54-40 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,994 0,920 1 901902 901902 098098 100102 084084 1001002018-S3 582226 D0616012 S54-41 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX BC 0,728 0,541 0,879 901901 901901 098102 100102 090090 0960962018-S3 582227 D0616013 S54-42 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,999 0,985 1 901901 901901 098098 106106 086086 0920962018-S3 582228 D0616014 S44-5 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,999 0,983 1 901902 901902 098098 100100 084084 0960962018-S3 582229 D0616015 S54-43 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,967 0,848 1 901902 901902 098098 100100 084084 0920962018-S3 582230 D0618001 S54-44 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX BC 0,728 0,536 0,886 901901 901901 098100 100102 084088 0920922018-S3 582231 S8817002 S50-2 S 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,938 XY Loup 0,997 0,959 1 901902 901902 098098 100100 083083 0960962018-S3 582234 U6618001 S16-10 U 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,953 XY Loup 0,999 0,986 1 901902 901902 098098 106106 084084 0920922018-S3 582235 U6618002 S16-10 U 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,911 XY Loup 0,999 0,986 1 901902 901902 098098 106106 084084 0920922018-S3 582241 P4817001 S52-37 P 3-Exploitable Canislupus est-europe(w1) 1,000 XY #NA 0,413 0,221 0,609 901902 901902 098098 098108 088088 0921002018-S3 582246 F0918001 S24-8 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,998 0,974 1 901902 901902 098098 106106 084084 0961002018-S3 582253 F4816017 S54-45 F 3-Exploitable Canissp NA 0,771 XY Loup 0,999 0,982 1 901902 901902 098098 100100 084084 0920922018-S3 582261 F6618001 S16-10 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,609 XY #NA #NA #NA #NA 000000 901902 098098 106106 084084 0920922018-S3 582286 F2616002 S54-02 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,792 XY BC 0,733 0,541 0,885 901902 901902 098098 100100 090090 0920962018-S3 582287 F2616003 S54-02 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,500 XY #NA #NA #NA #NA 000000 901902 098098 100100 000000 0920962018-S3 582288 F2616010 S54-02 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY BC 0,763 0,588 0,900 901902 901902 098098 100100 090090 0920962018-S3 582289 F2617004 S54-46 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,958 XY Loup 0,998 0,979 1 901902 901902 098098 100106 084084 0960962018-S3 582295 F2617042 S54-47 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,625 XY #NA #NA #NA #NA 000000 901902 098098 100100 084084 0920922018-S3 582297 F2617066 S54-48 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,573 XX #NA #NA #NA #NA 000000 901901 098098 100106 090090 0920962018-S3 582299 F2618014 S54-49 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,958 XX Loup 0,999 0,984 1 901901 901901 098098 100106 086086 0920962018-S3 582300 F2618015 S54-50 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,651 XY #NA #NA #NA #NA 901902 901902 098098 100106 084084 0920922018-S3 582302 F3816016 S44-8 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,672 XY #NA #NA #NA #NA 901902 901902 098098 100100 084084 0920922018-S3 582303 F3816032 S54-51 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,958 XY Loup 0,999 0,987 1 901902 901902 098098 106106 086086 0920922018-S3 582305 F3816104 S54-52 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,719 -- BC 0,850 0,675 0,968 000000 000000 098098 100100 090090 0920962018-S3 582306 F3816116 S54-01 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,526 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 100102 084084 0920962018-S3 582310 F3817023 S54-53 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,948 XX BC 0,823 0,638 0,952 901901 901901 098098 100106 084084 0960962018-S3 582311 F3817027 S51-11 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,995 XY Loup 0,997 0,956 1 901902 901902 098098 100100 086086 0920962018-S3 582312 F3817042 S54-54 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,859 XY Loup 0,998 0,982 1 901902 901902 098098 100100 084084 0920922018-S3 582315 F7317026 S54-55 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,625 XX #NA #NA #NA #NA 901901 901901 000000 100100 088088 0920962018-S3 582316 F7317066 S42-13 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,656 XX #NA #NA #NA #NA 901901 901901 098098 100100 084084 0960962018-S3 582317 F0413051 S34-15 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,917 XX Loup 0,996 0,950 1 901901 901901 098098 100104 084084 0960962018-S3 582321 F8312018 S54-56 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,625 XY #NA #NA #NA #NA 000000 902902 000000 106106 084084 0920922018-S3 582324 F8312025 S49-19 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,870 XX Loup 0,998 0,979 1 901901 901901 098098 100106 086086 0960962018-S3 582328 F8313020 #NA F 3-Exploitable #NA #NA 0,635 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 100106 084084 0920962018-S3 582330 F8313058 S39-13 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,552 XX #NA #NA #NA #NA 000000 901901 098098 106106 084084 0920962018-S3 582331 F8313059 S54-04 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,999 0,987 1 901901 901901 098098 100106 084084 0920922018-S3 582332 F8313060 S54-04 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,990 XX Loup 0,999 0,987 1 901901 901901 098098 100106 084084 0920922018-S3 582335 F8313063 S54-03 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,999 0,988 1 901902 901902 098098 100106 084084 0920962018-S3 582336 F8313064 S54-04 F 3-Exploitable - NA 0,854 XX Loup 0,999 0,987 1 901901 901901 098098 100106 084084 0920922018-S3 582337 F8313065 S54-03 F 3-Exploitable Canissp NA 0,703 XY Loup 0,999 0,987 1 901902 901902 000000 100106 084084 0920962018-S3 582341 F8313071 S49-19 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,740 XX Loup 0,998 0,980 1 901901 901901 098098 100106 000000 0960962018-S3 582345 F8313078 S49-19 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,969 XX Loup 0,997 0,961 1 901901 901901 098098 100106 086086 096096

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ONCFS-ANTAGENE-Session2018-S3

Population N°Antagene RefONCFS N°Loup(basefinale)

Typeprélèvement Tri Espèce

(mtDNA)Mitotype(Pilot2010) IQ Sexe Hybridation Proba_Loup CI95_bott CI95_up 00-Clu-

Amelo-A00-Clu-Amelo-B

01-AHT103

02-AHT111

03-AHTk211

04-FH2096

2018-S3 582346 F8313079 S49-19 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,625 XX #NA #NA #NA #NA 000000 901901 098098 100106 086086 0960962018-S3 582348 1309148 S36-17 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,984 XX Loup 0,999 0,987 1 901901 901901 098098 100106 084084 0920962018-S3 582350 1401019 S54-05 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,999 0,987 1 901901 901901 098098 100106 084084 0920962018-S3 582351 1401021 S36-21 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,828 XY BC 0,851 0,657 0,983 901902 901902 098098 100100 083084 0920922018-S3 582352 1401022 S54-05 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,557 XX #NA #NA #NA #NA 000000 901901 098098 100106 084084 0920962018-S3 582353 1401023 S50-3 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,958 XY Loup 0,999 0,988 1 901902 901902 098098 100100 084084 0960962018-S3 582354 1401024 S54-57 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,641 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 100100 084084 0960962018-S3 582355 1401027 S41-9 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,999 0,983 1 901901 901901 098098 100106 084084 0920922018-S3 582356 1402018 S54-58 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,998 0,978 1 901901 901901 098098 100102 086086 0920962018-S3 582360 1403059 S50-4 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,677 XY #NA #NA #NA #NA 901902 901902 098098 100100 084084 0920962018-S3 582361 1403060 S54-59 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,771 XX BC 0,846 0,678 0,961 901901 901901 098098 100104 084084 0960962018-S3 582362 1403071 S41-9 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,990 XX Loup 0,999 0,983 1 901901 901901 098098 100106 084084 0920922018-S3 582363 1403074 S41-9 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,745 XX Loup 0,998 0,980 1 901901 901901 098098 100106 084084 0920922018-S3 582364 1403075 S41-9 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,516 XX #NA #NA #NA #NA 901901 000000 098098 100106 084084 0920922018-S3 582366 F0514069 S54-60 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,989 0,910 1 901901 901901 098098 100100 084084 092092

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ONCFS-ANTAGENE-Session2018-S3

N°Antagene RefONCFS

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Page 59: ILAN DE LA ERE E DE MISE EN ŒUVRE DU ... - Le loup en France · et chose nouvelle 3) permettre de calculer, pour chaque échantillon, la probabilité d’une hybridation avec le

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Page 60: ILAN DE LA ERE E DE MISE EN ŒUVRE DU ... - Le loup en France · et chose nouvelle 3) permettre de calculer, pour chaque échantillon, la probabilité d’une hybridation avec le

ONCFS-ANTAGENE-Session2018-S3

N°Antagene RefONCFS

582212 D0416007582213 D0417005582214 D0418001582215 D0418002582216 D0517001582217 D0517006582218 D0517007582219 D0517008582220 D0517009582221 D0517010582222 D0517011582223 D0518001582224 D0518002582225 D0518003582226 D0616012582227 D0616013582228 D0616014582229 D0616015582230 D0618001582231 S8817002582234 U6618001582235 U6618002582241 P4817001582246 F0918001582253 F4816017582261 F6618001582286 F2616002582287 F2616003582288 F2616010582289 F2617004582295 F2617042582297 F2617066582299 F2618014582300 F2618015582302 F3816016582303 F3816032582305 F3816104582306 F3816116582310 F3817023582311 F3817027582312 F3817042582315 F7317026582316 F7317066582317 F0413051582321 F8312018582324 F8312025582328 F8313020582330 F8313058582331 F8313059582332 F8313060582335 F8313063582336 F8313064582337 F8313065582341 F8313071582345 F8313078

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Page 61: ILAN DE LA ERE E DE MISE EN ŒUVRE DU ... - Le loup en France · et chose nouvelle 3) permettre de calculer, pour chaque échantillon, la probabilité d’une hybridation avec le

ONCFS-ANTAGENE-Session2018-S3

N°Antagene RefONCFS

582346 F8313079582348 1309148582350 1401019582351 1401021582352 1401022582353 1401023582354 1401024582355 1401027582356 1402018582360 1403059582361 1403060582362 1403071582363 1403074582364 1403075582366 F0514069

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REN162C04

21-PEZ17 22-FH2010

000000 096128 132132 129129 243243 172172 122122 160170 000000 138152 000000 157157 141145 184186 182182 201201 194198 245245118120 128128 124126 127129 243309 172172 122122 160162 267271 130130 144144 157163 145145 184184 182182 199201 194202 237245120120 120128 126126 129129 243309 172172 116116 160166 237267 130130 144144 157181 145145 184184 182182 201201 194198 237245112112 120120 124126 125129 000000 172172 118118 162170 000000 130152 144146 171181 153153 184190 182223 199201 198202 245245120120 000000 126126 129129 000000 172172 116118 160166 000000 130130 144144 157181 145145 184184 182182 201201 198198 000000120120 096120 126126 141141 243297 172172 000000 162162 267267 130130 144144 157171 145145 184184 182182 199199 194202 245245120120 096120 126128 141141 243243 172172 000000 162162 267271 130130 144144 157171 145145 184184 182182 199199 194194 245245118120 120120 124124 129141 297297 172172 116116 160170 241241 130152 144144 157171 141165 184186 182182 201201 194198 237245112120 120128 124126 129141 243243 172172 122122 162162 241267 130130 144144 177181 145162 184190 182182 201201 194202 245245118120 128128 124126 127141 243297 172172 116122 160170 000000 000000 144144 157177 141153 184190 182182 201201 194194 245245120120 120128 126126 129141 239309 172172 126126 162166 241241 130152 144144 163181 141149 184184 182182 201205 198202 237245118120 120120 124124 129141 297297 172172 116116 160170 241241 130152 144144 157171 141165 184186 182182 201201 194198 237245118120 120120 124124 129141 000000 172172 116116 160170 000000 130152 000000 157171 141165 184186 182182 201201 194198 237245000000 120120 124124 129141 297297 172172 116116 160170 241241 130152 144144 157171 141165 184186 182182 201201 000000 237237120120 120120 124126 127127 297297 172172 116122 166166 241241 130130 144144 153177 141141 184184 182182 199201 198198 237245

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ONCFS-ANTAGENE-Session2017-S1

Série N°Antagene RefONCFS N°Loup(basefinale)

Typeprélèvement Tri Espèce

(mtDNA)Mitotype(Pilot2010) IQ Sexe Hybridation Proba_Loup CI95_bott CI95_up 00-Clu-

Amelo-A00-Clu-Amelo-B

01-AHT103

02-AHT111

03-AHTk211

Nouveau_2017 543521 U1217002 #N/A U 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,000 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 000000 000000Nouveau_2017 543523 F3916003 #N/A F 1-IQ<0,5 #NA - 0,000 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 000000 000000Nouveau_2017 543526 F4816010 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,370 XY #NA #NA #NA #NA 901902 000000 000000 100104 084084Nouveau_2017 543535 P4816004 #N/A P 1-IQ<0,5 Canisfamiliaris - 0,286 XY #NA #NA #NA #NA 000000 901902 098098 098104 088088Nouveau_2017 543536 P4816005 #N/A P 1-IQ<0,5 Canisfamiliaris - 0,021 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 104104 000000Nouveau_2017 543538 F6616002 #N/A F 1-IQ<0,5 Canisfamiliaris - 0,255 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 102102 104104 086088Nouveau_2017 543542 U8117001 #N/A U 1-IQ<0,5 #NA - 0,146 XY #NA #NA #NA #NA 901902 000000 100100 000000 084088Nouveau_2017 543546 P5216002 #N/A P 1-IQ<0,5 Canisfamiliaris - 0,031 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 102102 000000Nouveau_2017 543562 P8817005 #N/A P 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,302 XY #NA #NA #NA #NA 901902 901902 098098 100100 083083Nouveau_2017 543564 U8817001 #N/A U 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,052 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 096098 000000 000000Nouveau_2017 543569 F3816051 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,333 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 100106 084084Nouveau_2017 543572 F3816124 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,094 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 000000 084084Nouveau_2017 543576 F3817006 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,120 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 100100 000000Nouveau_2017 543577 F3817018 #N/A F 1-IQ<0,5 Canisfamiliaris - 0,047 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 100110 000000Nouveau_2017 543579 F3817034 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,188 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 106106 084084Nouveau_2017 543580 F3817055 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,031 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 000000 084084Nouveau_2017 543581 F3817056 #N/A F 1-IQ<0,5 #NA - 0,042 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 000000 000000Nouveau_2017 543582 F3817060 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,078 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 000000 084084Nouveau_2017 543583 F3817062 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,000 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 000000 000000Nouveau_2017 543587 U3817010 #N/A U 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,313 XY #NA #NA #NA #NA 000000 901902 098098 100100 000000Nouveau_2017 543591 F7317003 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,469 XX #NA #NA #NA #NA 901901 901901 000000 100100 084084Nouveau_2017 543592 F7317017 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,250 XY #NA #NA #NA #NA 000000 901902 098098 100106 000000Nouveau_2017 543594 F7317021 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,094 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 100100 000000Nouveau_2017 543597 F7317025 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,479 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 100106 084084Nouveau_2017 543599 F7416003 #N/A F 1-IQ<0,5 Canislupus italo-alpine(w22) 0,000 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 000000 000000Passerelle_2017 543643 F0413090 #N/A F 1-IQ<0,5 #N/A - 0,208 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 100100 000000Passerelle_2017 543650 F0413153 #N/A F 1-IQ<0,5 #N/A - 0,250 XX #NA #NA #NA #NA 901901 000000 098098 100100 000000Passerelle_2017 543663 F0414075 #N/A F 1-IQ<0,5 #N/A - 0,153 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 100102 088088Passerelle_2017 543721 F0614017 #N/A F 1-IQ<0,5 #N/A - 0,104 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 000000 000000Passerelle_2017 543739 F3813024 #N/A F 1-IQ<0,5 #N/A - 0,000 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 000000 000000Passerelle_2017 543741 F3813036 #N/A F 1-IQ<0,5 #N/A - 0,181 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 106106 000000Passerelle_2017 543742 F3813037 #N/A F 1-IQ<0,5 #N/A - 0,222 XX #NA #NA #NA #NA 901901 000000 000000 106106 000000Passerelle_2017 543744 F3813039 #N/A F 1-IQ<0,5 #N/A - 0,201 XX #NA #NA #NA #NA 000000 901901 000000 106106 000000Passerelle_2017 543745 F3814010 #N/A F 1-IQ<0,5 #N/A - 0,382 XX #NA #NA #NA #NA 901901 901901 000000 100100 084084Passerelle_2017 543746 F3814015 #N/A F 1-IQ<0,5 #N/A - 0,479 XX #NA #NA #NA #NA 901901 901901 000000 106106 000000Passerelle_2017 543753 F3815017 #N/A F 1-IQ<0,5 #N/A - 0,486 XY #NA #NA #NA #NA 901902 902902 098098 100106 084084Passerelle_2017 543754 F3815019 #N/A F 1-IQ<0,5 #N/A - 0,451 XX #NA #NA #NA #NA 901901 901901 000000 100100 084084Passerelle_2017 543769 F4814008 #N/A F 1-IQ<0,5 #N/A - 0,417 XY #NA #NA #NA #NA 902902 901902 000000 100106 084084Passerelle_2017 543773 F6814001 #N/A F 1-IQ<0,5 #N/A - 0,083 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 100100 084084Passerelle_2017 543795 F7412032 #N/A F 1-IQ<0,5 #N/A - 0,318 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 100100 000000Passerelle_2017 543800 F8313038 #N/A F 1-IQ<0,5 #N/A - 0,172 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 098098 100106 000000Passerelle_2017 543807 1004097 #N/A F 1-IQ<0,5 #N/A - 0,354 -- #NA #NA #NA #NA 902902 902902 000000 102102 088090Passerelle_2017 543814 1104150 #N/A F 1-IQ<0,5 #N/A - 0,271 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 100100 000000Passerelle_2017 543821 1212007 #N/A F 1-IQ<0,5 #N/A - 0,306 XX #NA #NA #NA #NA 000000 901901 000000 100106 084084Passerelle_2017 543830 1401044 #N/A F 1-IQ<0,5 #N/A - 0,368 XX #NA #NA #NA #NA 902902 901901 000000 100102 090090Passerelle_2017 543833 1402047 #N/A F 1-IQ<0,5 #N/A - 0,326 -- #NA #NA #NA #NA 000000 902902 000000 100102 086086Passerelle_2017 543841 1412005 #N/A F 1-IQ<0,5 #N/A - 0,465 XX #NA #NA #NA #NA 901901 901901 000000 100100 084084Passerelle_2017 543842 1412006 #N/A F 1-IQ<0,5 #N/A - 0,229 XX #NA #NA #NA #NA 901901 901901 000000 100108 084092Passerelle_2017 543843 1412007 #N/A F 1-IQ<0,5 #N/A - 0,014 -- #NA #NA #NA #NA 000000 000000 000000 000000 000000Nouveau_2017 543516 F1217003 CH52-01 F 2-Chien Canisfamiliaris - 0,609 XY Chien 0,003 0,000 0,017 000000 901902 098098 108108 088088Nouveau_2017 543522 F3017001 CH52-02 F 2-Chien Canisfamiliaris - 0,714 XY Chien 0,006 0,000 0,036 000000 901902 098102 104108 084092Nouveau_2017 543525 F4815016 CH52-03 F 2-Chien Canisfamiliaris - 0,635 XX Chien 0,004 0,000 0,023 901901 901901 098100 104110 088092Nouveau_2017 543528 F4816018 CH52-04 F 2-Chien Canisfamiliaris - 0,885 XY Chien 0,005 0,000 0,033 901902 901902 098098 102104 088090Nouveau_2017 543537 F6417001 CH52-05 F 2-Chien Canisfamiliaris - 0,599 XX Chien 0,007 0,000 0,044 901901 901901 098100 104108 086090Nouveau_2017 543548 U5417005 CH52-06 U 2-Chien Canisfamiliaris - 0,854 XY Chien 0,006 0,000 0,042 901902 901902 096096 104108 088088

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ONCFS-ANTAGENE-Session2017-S1

Série N°Antagene RefONCFS N°Loup(basefinale)

Typeprélèvement Tri Espèce

(mtDNA)Mitotype(Pilot2010) IQ Sexe Hybridation Proba_Loup CI95_bott CI95_up 00-Clu-

Amelo-A00-Clu-Amelo-B

01-AHT103

02-AHT111

03-AHTk211

Nouveau_2017 543552 F6817002 CH52-07 F 2-Chien Canisfamiliaris - 0,734 XX Chien 0,003 0,000 0,017 901901 901901 098100 104110 088088Nouveau_2017 543566 P0717002 CH52-08 P 2-Chien Canisfamiliaris - 1,000 XX Chien 0,003 0,000 0,016 901901 901901 096096 098108 084084Nouveau_2017 543567 F2617001 CH52-09 F 2-Chien Canisfamiliaris - 0,917 XX Chien 0,008 0,000 0,056 901901 901901 098106 104106 086088Nouveau_2017 543574 F3817002 CH52-10 F 2-Chien Canisfamiliaris - 0,688 XY Chien 0,003 0,000 0,019 901902 901902 100102 102108 086088Nouveau_2017 543575 F3817004 CH52-11 F 2-Chien Canisfamiliaris - 0,526 XX Chien 0,004 0,000 0,026 000000 901901 098102 100104 086092Nouveau_2017 543620 D0615014 CH52-12 D 2-Chien Canislupus NA 1,000 XY Chien 0,026 0,000 0,149 901902 901902 100102 102102 088090Passerelle_2017 543779 F7313072 CH52-13 F 2-Chien #N/A - 0,771 XY Chien 0,004 0,000 0,025 901902 901902 000000 104104 084088Nouveau_2017 543514 F1217001 S51-3 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,998 0,990 1,000 901901 901901 098098 100106 084084Nouveau_2017 543515 F1217002 S51-3 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,948 XX Loup 0,998 0,990 1,000 901901 901901 098098 100106 084084Nouveau_2017 543519 P1217003 S51-3 P 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,969 XX Loup 0,998 0,990 1,000 901901 901901 098098 100106 084084Nouveau_2017 543520 U1217001 S52-36 U 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,911 XY BC 0,833 0,669 0,971 901902 901902 098098 100100 088088Nouveau_2017 543531 F4817002 S52-37 F 3-Exploitable Canislupus est-Europe(w1) 0,865 XY ND ND ND ND 901902 901902 098098 098108 088088Nouveau_2017 543532 F4817004 S52-37 F 3-Exploitable Canislupus est-Europe(w1) 0,661 XY ND ND ND ND 901902 901902 098098 098108 088088Nouveau_2017 543539 F6617002 S24-8 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,844 XY Loup 0,917 0,791 1,000 901902 901902 098098 106106 084084Nouveau_2017 543550 U5417007 S50-2 U 3-Exploitable Canissp - 0,995 XY Loup 0,996 0,951 1,000 901902 901902 098098 100100 083083Nouveau_2017 543560 P8817002 S50-2 P 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,813 XY Loup 0,996 0,972 1,000 901902 901902 098098 100100 083083Nouveau_2017 543561 P8817003 S50-2 P 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,996 0,973 1,000 901902 901902 098098 100100 083083Nouveau_2017 543563 S8817001 S50-2 S 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,996 0,973 1,000 901902 901902 098098 100100 083083Nouveau_2017 543565 U5417008 S50-2 U 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,996 0,973 1,000 901902 901902 098098 100100 083083Nouveau_2017 543568 D2616001 S52-01 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY BC 0,841 0,694 0,957 901902 901902 098098 102106 084084Nouveau_2017 543570 F3816103 S47-1 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,828 XY Loup 0,998 0,988 1,000 901902 901902 098098 100106 084084Nouveau_2017 543571 F3816115 S52-43 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,589 XX Loup 0,998 0,986 1,000 000000 901901 000000 100102 084084Nouveau_2017 543573 F3816125 S51-11 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,979 XY Loup 0,990 0,930 1,000 901902 901902 098098 100100 086086Nouveau_2017 543578 F3817020 S51-11 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,833 XY Loup 0,990 0,930 1,000 901902 901902 098098 100100 086086Nouveau_2017 543584 D3816003 S52-45 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,998 0,989 1,000 901902 901902 098098 100106 086086Nouveau_2017 543585 D3817001 S52-02 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,998 0,989 1,000 901901 901901 098098 100106 086086Nouveau_2017 543588 F7316041 S52-33 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,969 XY Loup 0,997 0,980 1,000 901902 901902 098098 100100 084084Nouveau_2017 543589 F7316052 S52-31 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,979 XX Loup 0,998 0,989 1,000 901901 901901 098098 100106 084084Nouveau_2017 543593 F7317019 S52-41 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,609 XY Loup 0,997 0,981 1,000 901902 901902 098098 100106 084084Nouveau_2017 543595 F7317022 S52-42 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,609 XY Loup 0,980 0,878 1,000 901902 901902 098098 100106 088088Nouveau_2017 543596 F7317024 S52-32 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,979 XY Loup 0,998 0,988 1,000 901902 901902 098098 100100 084084Nouveau_2017 543598 F7317037 S52-44 F 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,563 -- Loup 0,990 0,936 1,000 000000 000000 098098 100100 084084Nouveau_2017 543600 D0415002 S52-03 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,998 0,990 1,000 901902 901902 098098 100106 084084Nouveau_2017 543601 D0415004 S52-04 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,998 0,990 1,000 901901 901901 098098 106106 084084Nouveau_2017 543602 D0415006 S52-05 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,997 0,981 1,000 901901 901901 098098 100100 084084Nouveau_2017 543603 D0415007 S52-34 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,958 XY Loup 0,997 0,981 1,000 901902 901902 098098 100106 086086Nouveau_2017 543604 D0415008 S52-06 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,998 0,991 1,000 901901 901901 098098 100100 084084Nouveau_2017 543605 D0415009 S52-30 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,990 XY Loup 0,997 0,980 1,000 901902 901902 098098 100102 084084Nouveau_2017 543606 D0415011 S52-07 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY BC 0,850 0,712 0,963 901902 901902 098098 100106 090090Nouveau_2017 543607 D0415013 S52-08 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,998 0,990 1,000 901901 901901 098098 100100 084084Nouveau_2017 543608 D0416004 S52-35 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,958 XX Loup 0,997 0,980 1,000 901901 901901 000000 100100 084084Nouveau_2017 543609 D0416006 S52-09 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,989 0,924 1,000 901901 901901 098098 100100 084084Nouveau_2017 543610 D0510001 S52-10 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,998 0,991 1,000 901902 901902 098098 100106 084084Nouveau_2017 543611 D0513004 S52-11 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY BC 0,781 0,629 0,905 901902 901902 098098 100106 084084Nouveau_2017 543612 D0515005 S46-6 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,997 0,984 1,000 901902 901902 098098 100100 084086Nouveau_2017 543613 D0515006 S52-13 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,998 0,990 1,000 901901 901901 098098 100100 084084Nouveau_2017 543614 D0515008 S48-11 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,998 0,988 1,000 901901 901901 098098 100102 084084Nouveau_2017 543615 D0516001 S52-14 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,998 0,991 1,000 901901 901901 098098 100100 084084Nouveau_2017 543616 D0516002 S52-15 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,998 0,989 1,000 901902 901902 098098 100106 084084Nouveau_2017 543617 D0516003 S52-16 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,984 0,919 1,000 901901 901901 098098 100100 084084Nouveau_2017 543618 D0516004 S52-17 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,938 0,833 1,000 901901 901901 098098 102102 084084Nouveau_2017 543619 D0416005 S52-18 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,998 0,990 1,000 901901 901901 098098 100106 084084Nouveau_2017 543621 D0615016 S52-20 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,998 0,989 1,000 901902 901902 098098 100106 084084Nouveau_2017 543622 D0615018 S52-21 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,998 0,990 1,000 901901 901901 098098 100106 084084Nouveau_2017 543623 D0616001 S52-22 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,998 0,990 1,000 901902 901902 098098 106106 086086

Page 64: ILAN DE LA ERE E DE MISE EN ŒUVRE DU ... - Le loup en France · et chose nouvelle 3) permettre de calculer, pour chaque échantillon, la probabilité d’une hybridation avec le

ONCFS-ANTAGENE-Session2017-S1

Série N°Antagene RefONCFS N°Loup(basefinale)

Typeprélèvement Tri Espèce

(mtDNA)Mitotype(Pilot2010) IQ Sexe Hybridation Proba_Loup CI95_bott CI95_up 00-Clu-

Amelo-A00-Clu-Amelo-B

01-AHT103

02-AHT111

03-AHTk211

Nouveau_2017 543624 D0616003 S52-23 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,998 0,989 1,000 901901 901901 098098 100102 084084Nouveau_2017 543625 D0616004 S52-24 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,998 0,988 1,000 901901 901901 098098 100100 084084Nouveau_2017 543626 D0616005 S52-25 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,998 0,991 1,000 901901 901901 098098 106106 084084Nouveau_2017 543627 D0616007 S52-26 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,998 0,991 1,000 901901 901901 098098 106106 084084Nouveau_2017 543628 D0616008 S52-27 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,998 0,991 1,000 901901 901901 098098 100106 084084Nouveau_2017 543629 D0616011 S52-28 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,998 0,991 1,000 901901 901901 098098 100100 084084Nouveau_2017 543630 D1316001 S52-29 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,998 0,989 1,000 901901 901901 098098 100106 084084Nouveau_2017 543631 D8316001 S52-39 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 0,750 XY Loup 0,998 0,991 1,000 901902 901902 098098 100106 084084Nouveau_2017 543632 D8316002 S51-22 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX Loup 0,884 0,747 1,000 901901 901901 098100 100100 084084Nouveau_2017 543633 D8316003 S51-23 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XX BC 0,784 0,617 0,944 901901 901901 098100 102106 084088Nouveau_2017 543634 D8316004 S48-14 D 3-Exploitable Canislupus italo-alpine(w22) 1,000 XY Loup 0,998 0,989 1,000 901902 901902 098098 100100 084084Passerelle_2017 543636 D0414002 S34-23 D 3-Exploitable #N/A - 1,000 XX Loup 0,997 0,980 1,000 901901 901901 098098 100100 084084Passerelle_2017 543637 D0414004 S43-1 D 3-Exploitable #N/A - 1,000 XX Loup 0,998 0,988 1,000 901901 901901 098098 100106 086086Passerelle_2017 543638 D0414005 S43-2 D 3-Exploitable #N/A - 1,000 XY Loup 0,998 0,989 1,000 901902 901902 098098 094106 084084Passerelle_2017 543639 D0414006 S43-3 D 3-Exploitable #N/A - 1,000 XY Loup 0,998 0,991 1,000 901902 901902 098098 100106 084084Passerelle_2017 543641 F0413061 S40-37 F 3-Exploitable #N/A - 0,917 XY Loup 0,986 0,920 1,000 901902 901902 100106 106106 084084Passerelle_2017 543642 F0413082 S40b-10 F 3-Exploitable #N/A - 0,944 XX Loup 0,998 0,989 1,000 901901 901901 098098 100100 084084Passerelle_2017 543644 F0413105 S40-2 F 3-Exploitable #N/A - 0,528 XX Loup 0,983 0,917 1,000 000000 901901 098098 100106 084084Passerelle_2017 543645 F0413110 S28-8 F 3-Exploitable #N/A - 0,986 XY Loup 0,998 0,990 1,000 901902 901902 098098 100100 084084Passerelle_2017 543646 F0413124 S40-3 F 3-Exploitable #N/A - 1,000 XY Loup 0,998 0,991 1,000 901902 901902 098098 100100 084084Passerelle_2017 543647 F0413126 S40-4 F 3-Exploitable #N/A - 0,958 XY Loup 0,998 0,991 1,000 901902 901902 098098 106106 084084Passerelle_2017 543649 F0413150 S40-11 F 3-Exploitable #N/A - 0,924 XY Loup 0,980 0,883 1,000 901902 901902 098098 104106 086088Passerelle_2017 543651 F0414009 S40-10 F 3-Exploitable #N/A - 0,826 XX Loup 0,998 0,988 1,000 901901 901901 098098 100100 000000Passerelle_2017 543652 F0414019 S44-7 F 3-Exploitable #N/A - 0,806 XY Loup 0,984 0,894 1,000 901902 901902 098098 100104 086086Passerelle_2017 543654 F0414034 S43-7 F 3-Exploitable #N/A - 0,944 XY Loup 0,998 0,990 1,000 901902 901902 000000 106106 084084Passerelle_2017 543667 F0414106 S43-9 F 3-Exploitable #N/A - 0,882 XX Loup 0,998 0,989 1,000 901901 901901 000000 100100 086086Passerelle_2017 543668 F0414117 S43-10 F 3-Exploitable #N/A - 0,958 XY Loup 0,998 0,990 1,000 901902 901902 000000 100100 084084Passerelle_2017 543672 F0415033 S43-8 F 3-Exploitable #N/A - 0,958 XX Loup 0,998 0,989 1,000 901901 901901 098098 100100 084084Passerelle_2017 543673 D0514002 S40-13 D 3-Exploitable #N/A - 1,000 XX Loup 0,998 0,991 1,000 901901 901901 098098 100106 084084Passerelle_2017 543674 D0514003 S40-32 D 3-Exploitable #N/A - 0,917 XX Loup 0,998 0,991 1,000 901901 901901 000000 100106 000000Passerelle_2017 543675 D0515001 S43-5 D 3-Exploitable #N/A - 1,000 XX Loup 0,951 0,839 1,000 901901 901901 098098 102106 084084Passerelle_2017 543677 F0513008 S40-15 F 3-Exploitable #N/A - 0,972 XY Loup 0,996 0,976 1,000 901902 901902 100100 100106 084084Passerelle_2017 543678 F0513057 S40b-11 F 3-Exploitable #N/A - 0,500 XY Loup 0,997 0,979 1,000 901902 902902 098098 106106 084084Passerelle_2017 543679 F0514001 S40-15 F 3-Exploitable #N/A - 0,944 XY Loup 0,998 0,990 1,000 901902 901902 000000 100106 084084Passerelle_2017 543680 F0514003 S40-12 F 3-Exploitable #N/A - 0,889 XX Loup 0,998 0,990 1,000 901901 901901 098098 106106 084084Passerelle_2017 543681 F0514008 #N/A F 3-Exploitable #N/A - 0,694 XX #NA #NA #NA #NA 901901 901901 000000 106106 084084Passerelle_2017 543682 F0514012 S40-19 F 3-Exploitable #N/A - 0,986 XY Loup 0,998 0,991 1,000 901902 901902 098098 106106 084084Passerelle_2017 543683 F0514014 S40-48 F 3-Exploitable #N/A - 0,931 XY Loup 0,993 0,954 1,000 901902 901902 098098 104106 086086Passerelle_2017 543684 F0514015 S40-49 F 3-Exploitable #N/A - 0,667 XX Loup 0,997 0,982 1,000 901901 901901 000000 100102 084084Passerelle_2017 543685 F0514017 S40b-12 F 3-Exploitable #N/A - 0,583 XX Loup 0,998 0,987 1,000 901901 901901 000000 100100 084084Passerelle_2017 543686 F0514018 S48-11 F 3-Exploitable #N/A - 0,986 XX Loup 0,998 0,989 1,000 901901 901901 098098 100102 084084Passerelle_2017 543695 F0515031 S48-10 F 3-Exploitable #N/A - 0,819 XX Loup 0,974 0,886 1,000 901901 901901 098098 100102 084084Passerelle_2017 543701 D0614006 S41-11 D 3-Exploitable #N/A - 1,000 XX Loup 0,998 0,991 1,000 901901 901901 098098 106106 084084Passerelle_2017 543714 F0613015 S42-15 F 3-Exploitable #N/A - 0,729 XY Loup 0,997 0,984 1,000 901902 901902 098098 106106 000000Passerelle_2017 543715 F0614001 S42-5 F 3-Exploitable #N/A - 0,806 XX Loup 0,997 0,985 1,000 901901 901901 098098 100100 084084Passerelle_2017 543716 F0614004 S42-6 F 3-Exploitable #N/A - 0,694 XX Loup 0,995 0,967 1,000 901901 901901 000000 094106 083083Passerelle_2017 543717 F0614005 S42-7 F 3-Exploitable #N/A - 0,688 XX Loup 0,996 0,978 1,000 901901 901901 000000 094106 083083Passerelle_2017 543718 F0614008 S42-9 F 3-Exploitable #N/A - 0,931 XX Loup 0,998 0,989 1,000 901901 901901 098098 100106 084084Passerelle_2017 543719 F0614009 S42-10 F 3-Exploitable #N/A - 0,903 XY Loup 0,998 0,989 1,000 901902 901902 098098 106106 083084Passerelle_2017 543720 F0614014 S42-11 F 3-Exploitable #N/A - 0,701 XX Loup 0,993 0,952 1,000 901901 901901 088098 100100 084084Passerelle_2017 543724 F0714002 S40b-13 F 3-Exploitable #N/A - 0,958 XY Loup 0,995 0,971 1,000 901902 901902 000000 100106 084084Passerelle_2017 543725 F1314003 S42-3 F 3-Exploitable #N/A - 0,514 XX Loup 0,980 0,908 1,000 000000 901901 000000 106106 084084Passerelle_2017 543727 F1314009 S39-13 F 3-Exploitable #N/A - 0,535 XX Loup 0,998 0,988 1,000 901901 901901 000000 106106 084084Passerelle_2017 543728 F1314010 S44-7 F 3-Exploitable #N/A - 0,889 XY Loup 0,987 0,914 1,000 901902 901902 000000 100104 086086

Page 65: ILAN DE LA ERE E DE MISE EN ŒUVRE DU ... - Le loup en France · et chose nouvelle 3) permettre de calculer, pour chaque échantillon, la probabilité d’une hybridation avec le

ONCFS-ANTAGENE-Session2017-S1

Série N°Antagene RefONCFS N°Loup(basefinale)

Typeprélèvement Tri Espèce

(mtDNA)Mitotype(Pilot2010) IQ Sexe Hybridation Proba_Loup CI95_bott CI95_up 00-Clu-

Amelo-A00-Clu-Amelo-B

01-AHT103

02-AHT111

03-AHTk211

Passerelle_2017 543729 F1315023 S42-4 F 3-Exploitable #N/A - 0,542 XX Loup 0,998 0,989 1,000 901901 901901 000000 106106 084084Passerelle_2017 543733 F2613030 S40b-14 F 3-Exploitable #N/A - 0,563 XX Loup 0,998 0,988 1,000 901901 901901 098098 100106 084084Passerelle_2017 543734 F2613033 S40-35 F 3-Exploitable #N/A - 0,938 XX Loup 0,996 0,976 1,000 901901 901901 000000 100100 084084Passerelle_2017 543735 F2614001 S49-8 F 3-Exploitable #N/A - 0,792 XY Loup 0,996 0,979 1,000 901902 901902 000000 100106 000000Passerelle_2017 543736 F2614021 S40-35 F 3-Exploitable #N/A - 0,938 XX Loup 0,998 0,987 1,000 901901 901901 000000 100100 084084Passerelle_2017 543737 D3815001 S38-4 D 3-Exploitable #N/A - 1,000 XX Loup 0,998 0,991 1,000 901901 901901 098098 100100 084084Passerelle_2017 543738 F3813023 S40-31 F 3-Exploitable #N/A - 0,764 XY Loup 0,998 0,990 1,000 901902 901902 000000 106106 000000Passerelle_2017 543740 F3813025 S40-7 F 3-Exploitable #N/A - 0,535 XX Loup 0,998 0,990 1,000 901901 901901 000000 106106 000000Passerelle_2017 543743 F3813038 S51-9 F 3-Exploitable #N/A - 0,660 XX Loup 0,998 0,989 1,000 901901 901901 000000 106106 000000Passerelle_2017 543747 F3814017 S43-12 F 3-Exploitable #N/A - 0,549 XY Loup 0,997 0,982 1,000 902902 901902 000000 106106 084084Passerelle_2017 543755 F3815020 S46-9 F 3-Exploitable #N/A - 0,611 XY Loup 0,998 0,988 1,000 902902 901902 000000 106106 000000Passerelle_2017 543757 F3815025 S49-24 F 3-Exploitable #N/A - 0,563 XY Loup 0,948 0,839 1,000 902902 901902 000000 106106 000000Passerelle_2017 543770 F4815007 S45-14 F 3-Exploitable #N/A - 0,576 -- Loup 0,954 0,802 1,000 902902 902902 098098 100100 084094Passerelle_2017 543772 D5114001 S40b-7 D 3-Exploitable #N/A - 1,000 XY Loup 0,998 0,989 1,000 901902 901902 098098 100100 084084Passerelle_2017 543774 F6814002 S40-30 F 3-Exploitable #N/A - 0,681 XY Loup 0,997 0,983 1,000 902902 901902 000000 106106 084084Passerelle_2017 543778 F7313069 S44-11 F 3-Exploitable #N/A - 0,833 XY Loup 0,994 0,957 1,000 901902 901902 098098 100102 084088Passerelle_2017 543780 F7314007 #N/A F 3-Exploitable #N/A - 0,632 XY #NA #NA #NA #NA 902902 901902 000000 100102 084084Passerelle_2017 543781 F7314024 S42-13 F 3-Exploitable #N/A - 0,743 XX Loup 0,977 0,894 1,000 901901 901901 000000 100100 084084Passerelle_2017 543789 F7314063 S42-12 F 3-Exploitable #N/A - 0,833 XY Loup 0,920 0,770 1,000 901902 901902 100100 100100 000000Passerelle_2017 543791 F7315002 S42-14 F 3-Exploitable #N/A - 0,889 XY Loup 0,998 0,989 1,000 901902 901902 000000 100106 084084Passerelle_2017 543796 F7412035 S40-9 F 3-Exploitable #N/A - 0,734 XY Loup 0,997 0,981 1,000 901902 901902 098098 100106 084084Passerelle_2017 543797 D8314003 S41-25 D 3-Exploitable #N/A - 1,000 XY Loup 0,998 0,988 1,000 901902 901902 098098 100106 086086Passerelle_2017 543798 D8314004 S41-26 D 3-Exploitable #N/A - 1,000 XY Loup 0,997 0,985 1,000 901902 901902 098098 100106 086086Passerelle_2017 543799 D8314006 S41-28 D 3-Exploitable #N/A - 1,000 XY Loup 0,980 0,910 1,000 901902 901902 098098 100100 084084Passerelle_2017 543801 F8313039 S39-11 F 3-Exploitable #N/A - 0,531 XY Loup 0,998 0,987 1,000 000000 901902 098098 106106 084084Passerelle_2017 543802 F8313040 S40b-21 F 3-Exploitable #N/A - 0,901 XX Loup 0,998 0,990 1,000 901901 901901 098098 100106 084084Passerelle_2017 543804 F8314029 S41-27 F 3-Exploitable #N/A - 0,927 XY Loup 0,997 0,983 1,000 901902 901902 088098 100106 084084Passerelle_2017 543805 F8314031 S41-24 F 3-Exploitable #N/A - 0,901 XY Loup 0,880 0,739 1,000 901902 901902 098098 100102 088088Passerelle_2017 543809 1005164 S30-10 F 3-Exploitable #N/A - 0,882 XX Loup 0,988 0,933 1,000 901901 901901 000000 106106 084084Passerelle_2017 543810 1102047 S42-1 F 3-Exploitable #N/A - 0,597 XY Loup 0,998 0,989 1,000 901902 901902 000000 100106 084084Passerelle_2017 543811 1103092 S40-17 F 3-Exploitable #N/A - 0,597 XX Loup 0,997 0,985 1,000 901901 901901 000000 100100 084084Passerelle_2017 543812 1103120 S44-2 F 3-Exploitable #N/A - 0,729 XY Loup 0,998 0,988 1,000 901902 901902 000000 106106 084086Passerelle_2017 543813 1104125 S40b-3 F 3-Exploitable #N/A - 0,625 -- BC 0,895 0,779 0,981 000000 000000 098098 100106 084086Passerelle_2017 543820 1211024 S41-2 F 3-Exploitable #N/A - 0,903 XY Loup 0,998 0,991 1,000 901902 901902 000000 106106 084084Passerelle_2017 543828 1302084 S50-14 F 3-Exploitable #N/A - 0,764 XX Loup 0,998 0,990 1,000 901901 901901 000000 106106 084084Passerelle_2017 543831 1402045 S41-8 F 3-Exploitable #N/A - 0,625 XY Loup 0,978 0,895 1,000 901902 901902 000000 100100 084084Passerelle_2017 543832 1402046 S41-9 F 3-Exploitable #N/A - 0,833 XX Loup 0,995 0,972 1,000 901901 901901 000000 100106 084084Passerelle_2017 543834 1403061 S41-2 F 3-Exploitable #N/A - 0,806 XY Loup 0,989 0,934 1,000 901902 901902 000000 106106 084084Passerelle_2017 543835 1403068 S26-4 F 3-Exploitable #N/A - 0,889 XY Loup 0,998 0,986 1,000 901902 901902 098100 100106 084084Passerelle_2017 543836 1403095 S41-29 F 3-Exploitable #N/A - 0,771 XX Loup 0,998 0,990 1,000 901901 901901 000000 106106 084084Passerelle_2017 543837 1404102 #N/A F 3-Exploitable #N/A - 0,535 XY #NA #NA #NA #NA 901902 901902 000000 100106 000000Passerelle_2017 543838 1408130 S41-12 F 3-Exploitable #N/A - 0,875 XY Loup 0,998 0,990 1,000 901902 901902 000000 100106 000000

Page 66: ILAN DE LA ERE E DE MISE EN ŒUVRE DU ... - Le loup en France · et chose nouvelle 3) permettre de calculer, pour chaque échantillon, la probabilité d’une hybridation avec le

ONCFS-ANTAGENE-Session2017-S1

N°Antagene RefONCFS

543521 U1217002543523 F3916003543526 F4816010543535 P4816004543536 P4816005543538 F6616002543542 U8117001543546 P5216002543562 P8817005543564 U8817001543569 F3816051543572 F3816124543576 F3817006543577 F3817018543579 F3817034543580 F3817055543581 F3817056543582 F3817060543583 F3817062543587 U3817010543591 F7317003543592 F7317017543594 F7317021543597 F7317025543599 F7416003543643 F0413090543650 F0413153543663 F0414075543721 F0614017543739 F3813024543741 F3813036543742 F3813037543744 F3813039543745 F3814010543746 F3814015543753 F3815017543754 F3815019543769 F4814008543773 F6814001543795 F7412032543800 F8313038543807 1004097543814 1104150543821 1212007543830 1401044543833 1402047543841 1412005543842 1412006543843 1412007543516 F1217003543522 F3017001543525 F4815016543528 F4816018543537 F6417001543548 U5417005

04-FH2096 05-CPH02 06-

FH208807-

C09.173 08-CPH05 09-FH2004

10-CFX30371

11-CXX279

12-C09.250

13-FH2161

14-FH2140

15-INU030

16-FH2137

17-FH2054

18-C27.442 19-Dbar1

20-REN162C

0421-PEZ17 22-

FH2010

000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000096096 120120 120136 126126 127141 000000 168168 116116 162166 000000 000000 144146 157163 145145 184184 182182 199199 000000 000000096100 000000 132132 122128 127129 247247 000000 120122 156170 000000 125125 146146 161169 000000 180180 000000 000000 000000 000000000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 116116 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000 000000096096 000000 128128 120120 000000 000000 168168 124124 162166 000000 131152 000000 169169 157165 000000 000000 000000 000000 000000000000 000000 000000 122128 133133 247247 000000 116116 168168 000000 131131 144146 000000 000000 000000 000000 201203 202214 253253100100 000000 000000 000000 131131 000000 000000 000000 000000 000000 000000 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114124 128136 122122 129133 243243 168168 122122 166166 000000 131152 146152 168173 145153 186186 000000 201205 206210 000000100100 116116 128128 124132 127129 243247 172172 116116 168170 237253 152152 152152 173181 153157 180188 227234 201201 206206 245253

Page 67: ILAN DE LA ERE E DE MISE EN ŒUVRE DU ... - Le loup en France · et chose nouvelle 3) permettre de calculer, pour chaque échantillon, la probabilité d’une hybridation avec le

ONCFS-ANTAGENE-Session2017-S1

N°Antagene RefONCFS

543552 F6817002543566 P0717002543567 F2617001543574 F3817002543575 F3817004543620 D0615014543779 F7313072543514 F1217001543515 F1217002543519 P1217003543520 U1217001543531 F4817002543532 F4817004543539 F6617002543550 U5417007543560 P8817002543561 P8817003543563 S8817001543565 U5417008543568 D2616001543570 F3816103543571 F3816115543573 F3816125543578 F3817020543584 D3816003543585 D3817001543588 F7316041543589 F7316052543593 F7317019543595 F7317022543596 F7317024543598 F7317037543600 D0415002543601 D0415004543602 D0415006543603 D0415007543604 D0415008543605 D0415009543606 D0415011543607 D0415013543608 D0416004543609 D0416006543610 D0510001543611 D0513004543612 D0515005543613 D0515006543614 D0515008543615 D0516001543616 D0516002543617 D0516003543618 D0516004543619 D0416005543621 D0615016543622 D0615018543623 D0616001

04-FH2096 05-CPH02 06-

FH208807-

C09.173 08-CPH05 09-FH2004

10-CFX30371

11-CXX279

12-C09.250

13-FH2161

14-FH2140

15-INU030

16-FH2137

17-FH2054

18-C27.442 19-Dbar1

20-REN162C

0421-PEZ17 22-

FH2010

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ONCFS-ANTAGENE-Session2017-S1

N°Antagene RefONCFS

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Page 69: ILAN DE LA ERE E DE MISE EN ŒUVRE DU ... - Le loup en France · et chose nouvelle 3) permettre de calculer, pour chaque échantillon, la probabilité d’une hybridation avec le

ONCFS-ANTAGENE-Session2017-S1

N°Antagene RefONCFS

543729 F1315023543733 F2613030543734 F2613033543735 F2614001543736 F2614021543737 D3815001543738 F3813023543740 F3813025543743 F3813038543747 F3814017543755 F3815020543757 F3815025543770 F4815007543772 D5114001543774 F6814002543778 F7313069543780 F7314007543781 F7314024543789 F7314063543791 F7315002543796 F7412035543797 D8314003543798 D8314004543799 D8314006543801 F8313039543802 F8313040543804 F8314029543805 F8314031543809 1005164543810 1102047543811 1103092543812 1103120543813 1104125543820 1211024543828 1302084543831 1402045543832 1402046543834 1403061543835 1403068543836 1403095543837 1404102543838 1408130

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