IV. biostatistique

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  • 8/6/2019 IV. biostatistique

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    Mesure de base enpidmiologie

    Dpartement de mdecine communautaire

    1re anne mdecine

    Monastir

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    Introduction

    A sa naissance , ltre humain ouvre un livre

    Ce livre est ferm la mort de la personne

    Les pages de ce livre sont faites par la compilation des diffrents

    vnements Record Linkage est le terme qui dfinit ce processus dassemblage

    de ces pages dans un mme volume La cause de dcs, nom prnom, nom du pre, nom de la mre, le n

    de la scurit sociale

    Ceci suppose lutilisation de plusieurs sources dinformation.

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    pi = sur ou travers

    dmos = population

    Dfinition de l'pidmiologie

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    L'pidmiologie peut tre dfinie (Levy).

    Par son objet : tude de la distribution des maladies et des

    tats de sant dans les populations humaines ainsi que les

    facteurs qui influencent cette distribution

    Par ses objectifs : au nombre de trois tude de la rpartition des maladies et des phnomnes de

    sant dans la population : pidmiologie descriptive.

    tude des causes et des facteurs de risque des maladies:

    pidmiologie tiologique ou analytique.

    Evaluation des interventions : pidmiologie valuative.

    Outre son apport dans le domaine de la sant publique,l'pidmiologie occupe aussi une place importante dans la

    recherche

    Dfinition de l'pidmiologie

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    La dmarche de sant publique repose sur l'pidmiologie.

    Lpidmiologie permet: d'identifier les problmes de sant ;

    de mesurer leur ampleur ;

    d'tudier leur distribution et l'identifier des groupes risque lev ;

    d'identifier les causes et les facteurs de risque ;

    d'valuer des techniques, des procdures ou desactions.

    Les objectifs de l'pidmiologie

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    On peut identifier diffrents axes l'pidmiologie:

    a) pidmiologie descriptive

    b) pidmiologie analytique (recherche tiologique)

    c) pidmiologie valuative (valuation des interventions)

    Les axes de l'pidmiologie

    populationE

    TransversalesLongitudinales

    Temps

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    Les tudes vise analytiques

    2. LONGITUDINALES :

    ETUDES DE COHORTES

    ETUDES CAS -TEMOINS

    Population E

    exposition

    Population E

    Malade

    E

    PopulationNE Population

    NE

    MaladeNE

    MaladeMaladeE

    Non malade(tmoins )

    Non malade(tmoins )E

    populationE+/M+ E-/M+1. TRANSVERSALES

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    pidmiologie descriptive

    Identifier les problmes de sant d'unecollectivit, grce la surveillance sanitairesystmatique et les enqutes.

    Mesurer l'ampleur de ces problmes

    Identifier des groupes risque lev pourchacun des problmes identifis

    Pour cela, elle utilise des indicateurs de mesurede la morbidit et de la mortalit.

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    La mortalit : L'vnement est unique et instantan. La mortalit est tudie

    de faon globale, par ge, sexe, catgories socioprofessionnelles; la mortalit par cause est trs utile la planification

    des services de sant et la recherche. La morbidit :

    La mesure de la morbidit est plus dlicate: lamaladie est caractrise par plusieurs stades: dbut,dure, terminaison.

    Pour la caractriser, il faudra alors considrer uncertain nombre de paramtres : incidence,prvalence, dure, ltalit...

    pidmiologie descriptive

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    Les mesures enLes mesures enpidmiologiepidmiologie

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    Mesure de frquence en pidmiologie

    La mesure de l'tat de sant de la population repose

    sur des indicateurs :

    - taux, proportions, ratios .

    - indicateurs de morbidit et de mortalit.

    Aucun n'est parfait ; aucun n'est global et universel.

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    Principes gnraux1. RatioRelation entre deux nombres sous forme x/y ou x(k)/y.

    Le numrateur et le dnominateur sont des entits distinctes et mutuellement exclusives ; k est une constante.

    Ex : Dans une population de 80,000 naissances on compare le nombrede naissances masculines celui des naissances fminines.

    41384 naissances masculines------------------------------------------- = 1,07

    38616 naissances fminines

    ou encore 107 naissances masculines par 100 naissances fminines.

    Mesure de frquence en pidmiologie

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    Le ratio= un rapport dans lequel le numrateur et le dnominateur

    sont les effectifs correspondant ceux de deuxmodalits (classes) d'une mme variable :

    Exemple : la rpartition de 200 femmes prsentant un

    cancer du sein selon le stade est la suivante :- stade 1 : 50- stade 2 : 120- stade 3 : 10- stade 4 : 20

    Le ratio stade 1/stade 4 = 50 = 2,520

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    Exemple : la rpartition selon le sexe de 50personnes est 20 sujets de sexe masculin et

    30 de sexe fminin.Le sexe ratio (Masculin/Fminin) =

    20 = 0,65

    30

    65 H pour 100 F

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    2. Proportion

    Le numrateur est inclus dans le dnominateurx ou x (k)

    x+y x+yEx: proportion de travailleurs manuels dans la

    population active:

    1,2 millions (100)--------------------------- = 44 %2,7 millions

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    Proportion

    appliques aux phnomnes stables

    NOMBRE DE PERSONNES AYANT LE CARACTERE TUDINOMBRE TOTAL DE PERSONNES DU MOMENT

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    3. Taux

    Type de proportion qui fait intervenir le temps. C'est la Mesure de baseen pidmiologie.Nombre d'vnements au cours d'une priode (K)------------------------------------------------------------

    Population risque durant cette priode

    Ex: Taux de mortalit par canceren 1990 :

    Nombre de dcs par cancer en 1990 x (100)----------------------------------------------------------------------

    population en 1990.

    447120------------------- = 186,3/100,000244 millions

    =

    =

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    Les indices

    Tous les rapports qui ne peuvent tre classscomme taux, proportions ou ratios sont appelsindice.

    Exemple : indice habitants/mdecin Indice PNB/habitant

    Pour toutes ces mesures, on doit spcifier : la population concerne, le lieu, et le temps.

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    Mesure de morbiditPosent des problmes lis aux diffrents aspects de la

    morbidit:- morbidit ressentie,

    - morbidit relle,- morbidit diagnostique

    Les mesures de la morbidit utilisent gnralementl'incidence et la prvalence.

    La prvalence recense tous les cas (nouveaux etanciens) prsents un instant t.

    L'incidence concerne uniquement les nouveaux caspendant une priode.

    Les mesures de mortalit et de morbidit

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    Lincidence

    On distingue deux types de mesures de l'incidence : l'incidence cumulative: pour les maladies aigues (pop

    fixe) et

    l'incidence instantane : pour les maladies chroniques(pop dynamique)

    Il faut distinguer entre l'incidence o un sujet ne peut compter qu'une seule fois ( exmple K

    poumon)et, l'incidence o un mme sujet peut tre compt plusieurs fois

    (exemple grippe)

    I.C. : Nombre de nouveaux cas malades pendant la priodeNombre total de personnes au dbut de la priode

    li = Nombre de nouveaux cas malades pendant la priodePersonnes-temps (PT)

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    Entres

    Cas incidents

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    Incidence

    cas incidents

    Nombre de nouveaux cas observs au cours

    d'une priode de temps.- units : cas/ temps

    Ex: 160 nouveaux cas de cancer du poumonpar an:

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    Taux d'incidence :

    Nombre de nouveaux cas----------------------------------------------------- :Population risque au dbut de la priode d'observation

    Pour une priode de temps

    Ex: nouveaux cas de cancer du poumon par

    100,000 personnes par an.

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    3Densit de l'incidence :

    Nombre de nouveaux cas observs

    ---------------------------------------------------

    Nombre de personnes-temps d'observation

    - unit = cas/personne-temps

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    Ex: 7 sujets suivis pendant 10 ans pour leucmie.sujets Total

    1________________________Leucmie 52_______________________________________________103_________Dcs suite un accident 2

    4______________________________________________ 105_______________________________________________106_____________Sujet abandonne l'tude 37_______________________________________________10

    50 PA

    7 sujets l'tude et 50 personnes-annes

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    1 cas de leucmie---------------------------

    50 personnes - annes

    incidence : 1 leucmie/10 ans taux d'incidence : 1 leucmie/7 sujets

    risque Densit de l'incidence : 1 leucmie/50

    personnes-annes

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    Prvalence

    1. Dfinition:

    Nombre total de cas observs dans une

    population dtermine un certain momentdans le temps.

    Ex: Nombre de cas de cancer du poumonrpertoris Monastir en 1988.

    - units : individus

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    2. Prvalence ponctuelle (instantane):

    Nombre total de cas observs dans une

    population dtermine un moment prcisdans le temps.

    Ex: nombre de cas de SIDA en Tunisie le 1erJanvier 1988.

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    3. Taux de prvalence:

    Nombre total de cas observs un certain moment dans le temps

    -------------------------------------------------------------------------------

    Population l'tude

    Ex: 120 cas de cancer du poumon /100,000 personnes en 1987.

    Exemple 2 : On a recens au 1er juin d'une anne X, 100 cas dediabte dans une population de 5000 habitants

    Pi = 100 = 2 %

    5000

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    D. Relation entre prvalence et incidence:

    D = dure moyenne de la maladie

    P = prvalence

    I = incidence

    P = I x D O

    Cette formule est valable si I est relativement stabledans le temps.

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    On observe que la dure dune maladie A peut varier dans une populationde patients.

    Pour un groupe1 de patients, la dure est de 2 ans (D1)

    alors que pour l'autre groupe 2, elle est de 4 ans (D2).

    L'incidence de la dune maladie A de plus courte dure

    l1 est de 30 cas par anne, I2 est de 70 cas par anne.

    L'incidence totale est de 100 cas par anne.La dure moyenne D = D1 x i1 + D2 x i2 :

    D = 2(ans) x 30/100 cas + 4 x 70/100= 3,4 ansLa prvalence peut tre calcule partir de l'quation suivante:

    P = I x D i = 100 cas / an D = 3,4 ans P = 100 cas /an x 3,4 ans = 340 cas

    Condition: l'incidence i (100 nouveaux cas/an) et les dures D1 (2 ans) etD2 (4 ans) demeurent constantes durant au moins 4 ans.

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    E. Mesures de la mortalit:

    La mortalit constitue dans la plupart des pays ladonne la plus disponible et relativement la plusfiable.

    - Elle peut tre mesure de cinq faons :. le taux brut ;. le taux spcifique. les proportions selon la cause de

    dcs. le taux de ltalit. les taux standardiss.

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    1. Taux brut de mortalitIl est gal au du nombre total de dcs, dans une communaut durant

    une priode donne, sur sa population totale.

    Tous les dcs durant l'anne (1000)

    EX:--------------------------------------------------------- =

    Population au milieu de l'anne*

    Le TBM est gnralement calcul pour une priode d'un an

    Dcs pour1000hab

    TBM = nombre de dcs durant la priodePersonnes temps

    PT est gal la population moyenne (moyenne arithmtique de la population, au

    dbut et la fin de la priode), ou encore la population recense au milieu del'anne (PCA).

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    Dans ce cas PT est gal la population moyenne(moyenne arithmtique de la population, au dbut et la fin de la priode), ou encore la populationrecense au milieu de l'anne (PCA).

    Exemple : Dans une population d'un effectifmoyen (PCA) gal 133580, il y a eu 32855

    dcs.

    TBM = 6,4 dcs/1000 personnes annes.

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    Taux de mortalit spcifiquesIls apportent des informations :

    . sur certains groupes de population

    . ou sur certaines causes.Ils permettent de faire tat de la variation intra-populationnelle.

    Ex: Taux de mortalit spcifique pour l'ge (chez les 25-34 ans) =

    Nbre de dcs chez les 25-34 ans d'une rgion au cours de l'anne---------------------------------------------------------------------------------------------

    Taille moyenne de la population ge de 25-34 ans dans la rgionpour cette mme anne.

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    Mortalit infantile

    Naissance28SA

    Mortinatalit

    1 an

    1/ Taux de Mortalit Infantile (%o) :Nombre de dcs entre la naissance et 1 an

    Nombre des naissances vivantes

    2/ Taux de Mortalit Maternelle :

    Nombre de dcs de femmes au cours de laGrossesse, accouchement ou 42 j de post-partum100000 naissances vivantes

    3/ Taux de Mortinatalit:Nombre de dcs entre 28SA et la naissance

    Total des naissances

    42j

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    Taux de mortalit nonatale prcoce(%o) :Nombre de dcs entre la naissance et J7 de vie

    Total des naissances vivantes

    Taux de mortalit nonatale tardive(%o ):

    Nombre de dcs entre J7 et J28 de vieTotal des naissances vivantesTaux de mortalit post-nonatale (%o ):

    Nombre de dcs entre J28 et 1an de vieTotal des naissances vivantes

    Taux de mortalit prinatale (%o) :Nombre de dcs entre 28SA et J7 de vie

    Total des naissances

    Mortalit nonatale

    Naissance28

    SA

    Mortalit prinatale

    1 an28j

    Mortalit post nonatalePrcoce Tardive

    J7

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    La Standardisation:= comparer des taux d'incidence ou de mortalit entre

    plusieurs groupes: une mme population diffrentes poques ou

    plusieurs populations la mme poque.

    Ces taux permettent de neutraliserles diffrences dues des variables influenant le phnomne tudi, telles l'ge, le sexe et le niveau socio-conomique (variables

    confondantes).

    le plus souvent applique la mortalit mais elle peut

    galement l'tre la morbidit.Il existe deux mthodes de standardisation :

    directe et

    indirecte.

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    La mthode directe. Si nous prenons comme exemple de

    phnomne observ le taux de mortalit et comme variable confondante l'ge :

    elle consiste appliquer

    les taux spcifiques de chacune des populations compares une population de

    rfrence commune,

    liminant ainsi l'effet de la structure d'ge sur les taux de mortalit.

    La mthode indirecte.

    Elle consiste appliquer chacune des populations comparer les taux

    spcifiques de mortalit d'une population de rfrence.

    Le nombre de cas de dcs ainsi calcul est ensuite compar au nombre de

    cas observs : on obtient l'indice comparatif de mortalit. Cette mthode

    doit tre utilis quand on ne dispose pas des taux spcifiques de mortalit

    dans les populations compares.

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    Prvalence du diabte (tauxbrut) surlge

    Tunisie 2005

    Hommes Femmes

    Grand Tunis 11.4 10.6

    Nord Est 8.8 8.9

    Nord Ouest 4.7 6.1

    Centre Est

    Centre Ouest

    10.8

    7.4

    11.2

    4.8

    Sud Est 8.0 10.9

    Sud Ouest

    Tunisie

    7.7

    9.1

    9.5

    9.1

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    Prvalence du diabte standardise surlge

    Tunisie 2005

    Hommes Femmes

    Grand Tunis 12.6 13.6

    Nord Est 9.3 10.2

    Nord Ouest 5.5 6.9

    Centre Est

    Centre Ouest

    12.2

    6.1

    12.2

    4.5

    Sud Est 10.3 12.0

    Sud Ouest

    Tunisie

    9.8

    10.3

    12.0

    9.2

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    MERCI POUR VOTRE ATTENTION

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    pidmiologie descriptive: Permet de dcrire la frquence des tats de

    sant(maladie, exposition des facteurs de risque...)

    et mettre des hypothses sur les facteurs quiinfluencent leurs distributions (caractristiquesde temps, personnes, lieux..).

    outils: . statistiques sanitaires. enqute pidmiologique

    objectifs: . planification. surveillance pidmiologique. aide la recherche tiologique

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    pidmiologie analytique

    Elle vrifie les hypothses tiologiques.

    Objectifs: . lutte contre les maladies

    outils: . tudes tiologiques

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    pidmiologie valuativeElle permet d'valuer l'efficacit des interventions cliniques : essai thrapeutique sant publique : efficacit d'un vaccin

    efficacit d'un programme de sant

    Outils: . Enqute valuative Objectifs: Choisir les actions les plus efficaces