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Session Mai 2018 L'apport de la cytométrie en flux et de la biologie moléculaire dans l'évaluation précoce de la maladie résiduelle dans les leucémies aiguës myéloïdes MEMOIRE PRESENTE PAR : Docteur AMRANI Kawthar Née le 03 Octobre 1982 à Fès POUR L'OBTENTION D DIPLOME DE SPECIALITE MEDECINE U EN OPTION : BIOLOGIE MEDICALE Professeurs: AMRANI HASSANI MONCEF TLAMCANI IMANE Sous la direction de :

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Session Mai 2018

L'apport de la cytométrie en flux et de la biologie moléculaire dans l'évaluation précoce de la maladie résiduelle

dans les leucémies aiguës myéloïdes

MEMOIRE PRESENTE PAR :Docteur AMRANI Kawthar

Née le 03 Octobre 1982 à Fès

POUR L'OBTENTION D DIPLOME DE SPECIALITE MEDECINEU EN OPTION : BIOLOGIE MEDICALE

Professeurs: AMRANI HASSANI MONCEF TLAMCANI IMANE

Sous la direction de :

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2.1 Epidémiologie............................................................................ 8

2.2 Physiopathologie ....................................................................... 9

2.3 Présentation clinico-biologique ............................................... 11

2.4 Classification actuelle des leucémies aiguës myéloïdes et

néoplasies associées selon l’OMS 2016 (tableau 3) ................. 266

2.5 Les bases thérapeutiques actuelles ........................................ 277

2.6 Les facteurs pronostiques ...................................................... 288

4.1 La Cytométrie en Flux .............................................................. 31

4.2 Biologie moléculaire ................................................................ 51

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BIOMOL : Biologie moléculaire

CIVD : Coagulation intraveineuse disséminée

CMF : Cytométrie en flux

FAB : French American British

LAIP : Immunophénotype(s) aberrant(s) associé(s) à la leucémie

LAM : Leucémie myéloïde aigue

LDH : Lactates déshydrogénases

MDR : La maladie résiduelle

MRC : Medical research council

NASDA : Estérases non spécifiques

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Les leucémies aiguës myéloïdes (LAM) est l’ensemble de proliférations

clonales aboutissant à l’accumulation dans la moelle, le sang et éventuellement

d’autres organes, de précurseurs hématopoïétiques de nature myéloïde avec blocage

à un stade précoce de leur différenciation.

Bien que la majorité des patients atteints de leucémie aiguë obtienne une

rémission complète à l’issue de la chimiothérapie d’induction, près d’un patient sur

deux rechutes à plus ou moins long terme.

Il existe des facteurs pronostiques qui permettent d’identifier plus

précocement ces patients à risque et qui sont:

les facteurs pré thérapeutiques liés au patient lui-même (âge, comorbidités)

les facteurs liés à sa maladie (leucocytose, immunophénotype et surtout

anomalies cytogénétiques et/ou moléculaires) constituent généralement de bons

indicateurs pronostiques.

Par ailleurs, ces facteurs ne permettent pas de prendre en compte les

différences inter-individuelles dans le métabolisme des molécules ou la réponse

immune anti-leucémique, c’est dans ce contexte que vient se placer l’évaluation de

la maladie résiduelle (MRD) comme un outil de choix qui permet l’évaluation précise,

sensible et objective de la réponse thérapeutique à l’échelle individuelle.

La MRD est ainsi définie comme la persistance de cellules leucémiques ayant

survécu à la chimiothérapie et présentes en nombre inférieur au seuil de détection

des méthodes cytologiques classiques.

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L’importance de la MRD est devenue en quelques années l’un des facteurs

pronostiques majeurs pour le risque de rechute dans les leucémies aiguës. Elle

permet de suivre l’évolution de la masse tumorale et permet ainsi de mieux

apprécier la sensibilité des cellules tumorales aux divers traitements et d’évaluer la

qualité de la rémission complète.

Les contrôles réguliers et suffisamment rapprochés permettent de détecter

une ré-ascension, synonyme de rechute moléculaire. Elle permet ainsi de prédire la

rechute hématologique avant qu’elle ne se manifeste cliniquement et d’orienter plus

précocement le patient vers une intensification thérapeutique.

Les leucémies aiguës myéloïdes (LAM) constituent un groupe de maladies

agressives hétérogènes, caractérisées par une prolifération clonale et non contrôlée

de cellules hématopoïétiques immatures, communément appelées blastes, qui ont

perdu leur capacité de différenciation et s’accumulent dans la moelle osseuse et le

sang [1].

Les leucémies aiguës myéloïdes (LAM) représentent 1 % des cancers et 80 %

des leucémies aiguës de l’adulte dont l’incidence est en constante augmentation.

Selon les données du réseau FRANCIM, les LAM, tous types confondus, ont

un taux d’incidence brute de 4,7/100 000 h/an et un taux standardisé à la

population mondiale de 2,8/100 000 h/an chez l’homme et de 2,5/100 000 h/an

chez la femme. En termes de nombre de cas, on estime qu’en 2012 en France, il y a

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eu environ 2 000 nouveaux cas (1 470 cas chez les hommes et 1 514 chez les

femmes) [2].

L’incidence des LAM est globalement stable au cours du temps avec des taux

d’évolution annuels de -1,1 % chez l’homme et de 1,1 % chez la femme en France,

entre 2005 et 2012 [3]. En Europe et aux USA, ces taux d’évolution sont

sensiblement identiques (3, 4). Aux USA, le taux d’incidence est ainsi passé de

3,8/100 000 h/an en 2000 à 4,06/100 000 h/an en 2011 [4].

Le phénotype leucémique est conféré à une cellule-souche hématopoïétique

(CSH) normale ou à un progéniteur déjà engagé dans la différenciation, par

l’addition d’au moins deux événements mutationnels [5].

Au moins deux altérations géniques aux conséquences fonctionnelles

distinctes sont nécessaires à l’apparition d’une LAM selon la théorie de « two-hit

model »:

une mutation de type I, aboutissant à un avantage de survie ou de

prolifération suite à l’activation anormale d’une voie de transduction.

une mutation de type II, aboutissant à un blocage de différenciation. Celles-

ci sont des mutations de facteurs de transcription ou de co-activateurs.

La caractérisation des anomalies moléculaires issues de ces événements

chromosomiques ou mutationnels a permis de démontrer que des traitements ciblés

sur des oncogènes peuvent changer le cours de la maladie.

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Malgré une apparente uniformité, l’hématopoïèse leucémique conserve des

caractéristiques comparables à celle de l’hématopoïèse normale. Le clone

leucémique est schématiquement organisé de façon hiérarchique en trois

compartiments distincts :

un compartiment minoritaire de cellules souches leucémiques pour la plupart

quiescentes, mais capables d’auto renouvellement ou d’engagement dans un

processus de prolifération/maturation ;

un compartiment plus mature de progéniteurs leucémiques ayant perdu des

capacités d’auto renouvellement, mais hautement proliférant et ayant des

propriétés clonogènes ;

un compartiment majoritaire de cellules leucémiques (blastes leucémiques)

ayant des capacités de différenciation limitée à un stade donné de

différenciation granulomonocytaire, représentant la grande majorité des

cellules leucémiques retrouvées dans le sang et la moelle osseuse, et

définissant la classification morphologique du French American British (FAB).

Les chimiothérapies conventionnelles sont très efficaces pour éradiquer les blastes

et les progéniteurs leucémiques, mais beaucoup moins sur les compartiments

souches expliquant les taux élevés de rémission, mais également de rechute.

L’hématopoïèse leucémique est associée à une inhibition de l’hématopoïèse normale

par des mécanismes mal connus et qui conduisent à un état d’insuffisance

médullaire majeure qui fait la gravité de cette maladie.

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La présentation clinique d’une leucémie aiguë est très variable. Parfois

asymptomatique et suspectée sur la seule biologie, elle peut au contraire entrainer

des complications inaugurales bruyantes nécessitant une prise en charge urgente en

milieu spécialisé.

Sur le plan clinique, deux syndromes témoins d’une prolifération tumorale sont

classiquement retrouvés :

L’insuffisance médullaire, manifestation la plus fréquente de la maladie,

reflète l’infiltration médullaire blastique et est caractérisée par un syndrome

anémique, un syndrome hémorragique et/ou un syndrome infectieux.

Le syndrome tumoral, plus rare.

Le syndrome anémique est d’autant plus bruyant que l’anémie s’est installée de

manière rapidement progressive. Ses symptômes sont en rapport avec une

diminution de l’hémoglobine et une diminution du transport de l’oxygène aux

organes : pâleur cutanéo-muqueuse, tachycardie, douleur thoracique, dyspnée et

asthénie.

Les hémorragies, secondaires à la diminution du taux de plaquettes, sont

essentiellement cutanéo-muqueuses et peuvent être aggravées en cas d’association

à une coagulation intravasculaire disséminée (CIVD).

Les infections, secondaires à la neutropénie, sont volontiers de localisation ORL.

Elles sont souvent associées à des signes de gravité hémodynamique plus précoces

ou se présentent sous la forme d’une hyperthermie résistante aux antibiotiques.

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Le syndrome tumoral peut se manifester sous plusieurs formes:

atteinte des organes hématopoïétiques secondaires : hépatomégalie,

splénomégalie et adénopathies,

atteinte extramédullaire:

les leucémides fréquemment associées aux LAM à composante

monoblastique ou monocytaire,

l’hypertrophie gingivale surtout retrouvée dans les LAM à composante

monocytaire ou monoblastique,

l’atteinte neuroméningée suspectée devant la présence d’une paralysie des

nerfs crâniens le plus souvent mais aussi de céphalées,

les sarcomes granulocytaires (masses de cellules blastiques) pouvant

atteindre toutes les localisations extramédullaires.

Les formes hyperleucocytaires des LAM peuvent être associées à une leucostase

dans les capillaires dont les manifestations très variées sont principalement

pulmonaires, neurologiques et oculaires.

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Cet examen permet dans la majorité des cas d’évoquer le diagnostic.

L’atteinte peut porter d’emblée sur les trois lignées avec une pancytopénie mais elle

peut être dissociée et n’atteindre qu’une ou deux lignées.

L’anémie est classiquement arégénérative, normo ou macrocytaire. La

thrombopénie est profonde souvent inférieure à 20 G/L. Cette pancytopénie

s’associe de manière inconstante à une blastose circulante. Dans certains cas, une

hyperleucocytose majeure dépassant 100 G/L est retrouvée définissant les formes

hyperleucocytaires (le plus souvent associées aux leucémies à composante

monocytaire ou monoblastique).

Ce bilan peut mettre en évidence un syndrome de lyse spontané associant

une hyperuricémie, une hausse des lactates déshydrogénases (LDH),

hyperphosphorémie, hypocalcémie et une hyperkaliémie. Ce syndrome de lyse se

complique souvent d’une insuffisance rénale.

- Des troubles de la coagulation à type de CIVD peuvent être mis en évidence

notamment dans les leucémies aigues promyélocytaires et dans les formes

hyperleucocytaires. Ils doivent être systématiquement recherchés car ils imposent

une prise en charge urgente.

Le diagnostic de leucémie aiguë repose sur l’analyse cytologique du

médullogramme et/ou des frottis sanguins. Après coloration des frottis par la

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coloration de May-Grunwald-Giemsa, un décompte cellulaire est réalisé. Selon les

critères de qualité, le décompte cellulaire doit être établi sur plus de 200 leucocytes

pour l’étude du frottis sanguin et sur plus de 500 cellules nucléées pour l’étude des

frottis médullaires [4]. Une blastose médullaire ou sanguine supérieure à 20%

permet de retenir le diagnostic de leucémie aiguë. Ce chiffre peut être revu à la

baisse pour les leucémies présentant une translocation équilibrée t (15;17), t (8;21),

inv(16) ou t(16;16) (5).

Afin de déterminer le caractère myéloïde ou lymphoïde de la leucémie aiguë,

des analyses cytochimiques permettent de compléter l’analyse cytologique. La

réaction cytochimique de la myélopéroxidase est la plus souvent pratiquée et

permet la mise en évidence de cette enzyme dans les granules cytoplasmiques des

cellules myéloïdes (l’enzyme dégrade le perhydrol et oxyde la benzidine qui

précipite sous forme de granulations colorées en brun-noir, on peut utiliser le

chloronaphtol qui précipite en un produit rouge). Une positivité sur les blastes

supérieure ou égale à 3% en en faveur d’une LAM. Sa négativité n’exclut cependant

pas le diagnostic. D’autres analyses cytochimiques peuvent présenter un intérêt

dans certains cas particuliers. Ainsi les estérases non spécifiques (NASDA) sont par

exemple très positives dans la majorité des monoblastes, promonocytes et

monocytes et plus faiblement dans les myéloblastes et cette positivité est seulement

inhibée dans la lignée monocytaire par le fluorure de sodium.

Le groupe coopératif FAB (French American British) a proposé une

classification en 1976 [6] révisée en 1985 [6-7] puis en 1991 [7] qui se base sur les

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caractéristiques cytologiques et cytochimiques du myélogramme et celles du frottis

sanguin pour répartir les LAM en 8groupes distincts (Tableau 1).

A noter que les diagnostics de LAM0 et LAM7 ne peuvent pas être retenu sur

de simples critères morphologiques mais nécessite une analyse

immunophénotypique (6, 7).

Le diagnostic cytologique présente un intérêt majeur dans le cadre des LAP

(ou LAM3) qui sont associées presque exclusivement à une translocation (15;17).

Dans ces leucémies, les complications initiales grèvent le pronostic et le diagnostic

doit donc être posé rapidement afin d’initier un traitement dans les plus brefs

délais, sans attendre de confirmation cytogénétique.

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L’utilisation de la cytométrie en flux (CMF) au diagnostic est fondamentale et fait

partie intégrante des examens réalisés sur les prélèvements initiaux. Cette

technique repose sur la détection de marqueurs antigéniques membranaires ou

cytoplasmiques à l’aide d’anticorps spécifiques couplés à un fluorochrome.

Les panels de détection antigénique utilisés en pratique courante permettent :

d’identifier la lignée d’une leucémie aiguë, même pauci cellulaire, par

un panel d’orientation incluant des marqueurs myéloïdes, lymphoïdes B

ou T et d’immaturité [8, 9]. La positivité d’au moins 2 marqueurs

appartenant à une même lignée est nécessaire [10]. Un marqueur est

généralement considéré comme positif lorsque son expression intéresse

au moins 10-20% des blastes[8]. En outre, la comparaison des

marqueurs immunophénotypiques des blastes avec les marqueurs de

différenciation des précurseurs hématopoïétiques permet de déterminer

le niveau du blocage de maturation des cellules blastiques [8, 10].

d’établir le diagnostic des LAM peu différenciées (LAM0),

mégacaryoblastiques (LAM7) ou de leucémie aiguë avec ambiguïté de

lignée dont le diagnostic ne peut être retenu sur les seuls arguments

cytologiques [9, 11].

de rechercher des marqueurs dont l’expression aberrante constituera la

base d’un suivi de maladie résiduelle par CMF [7].

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D’utiliser des thérapies ciblées, notamment des anticorps monoclonaux

( le Gemtuzumab Ozogamicin dans le cadre de la prise en charge des

LAM CD33+) .

Le tableau 2 ci-dessous présente les différents marqueurs de surface ou

cytoplasmiques utilisés dans le cadre du diagnostic d’une leucémie aiguë myéloïde.

Ils doivent être réalisés lors de la prise en charge au diagnostic de chaque

nouvelle leucémie aigüe. Ils apportent des données importantes dans le diagnostic,

le pronostic et le suivi des leucémies. On distingue traditionnellement le caryotype

conventionnel de la technique d’hybridation in situ en fluorescence (FISH,

Fluorescence In Situ Hybridization).

Cette technique repose sur l’observation des chromosomes permettant de

déterminer des anomalies de nombre et/ou de structure. Elle peut être réalisée sur

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des prélèvements sanguins ou médullaires. Elle consiste à placer les cellules en

culture pendant 24 à 48 heures dans un milieu contenant du G-CSF (Granulocytes

Colony-Stimulating Factor). Les cellules sont ensuite traitées afin d’obtenir le plus

grand nombre de cellules en métaphases qui seront ultérieurement éclatées afin

d’analyser les chromosomes grâce à plusieurs méthodes de coloration (quinacrine,

Giemsa). Pour une interprétation optimale, une analyse sur un minimum de 20

cellules en métaphase est recommandée [12].

Selon les études, un caryotype est interprétable pour environ 80% des

patients atteints de LAM [13, 15]. Chez les sujets jeunes, environ 40% des patients

présentent un caryotype normal et 12-14% des patients présentent un caryotype

complexe au diagnostic [12-13]. Un caryotype complexe est défini, selon les études

[14-15], par la présence de 3 ou 4 anomalies au caryotype à l’exclusion des

anomalies récurrentes.

Environ un tiers des patients atteint de LAM présentent une translocation

équilibrée au diagnostic.

Certaines de ces anomalies sont associées à des types particuliers de

leucémies d’après la classification FAB:

Les LAM avec t(15;17) sont exclusivement des LAP (ou LAM3) (15).

Les LAM avec t(8;21) sont associées aux LAM2 (80%) et inversement 25% des

LAM2 présentent une t(8;21) [32, 33].

A noter que la présence d’une translocation t(8;21) confère aux LAM2 un

aspect cytologique et phénotypique particulier : les blastes présentent un

cytoplasme basophile à l’intérieur duquel on retrouve un corps d’Auer unique, piqué

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dans le noyau. Un excès d’éosinophiles ou de mastocytes peut être retrouvé (15). Le

phénotype est fréquemment CD33+ et CD13+, associé parfois à des marqueurs

aberrants (CD19, Tdt, CD56) (16).

- Les LAM associées à une t(16 ;16) ou une inv (16) sont des LAM4 avec éosinophiles

anormaux (LAM4Eo).

Ces translocations équilibrées aboutissent à la naissance de transcrits de fusions

détectables par biologie moléculaire (BM) dont nous aborderons par la suite les

caractéristiques

Cette technique repose sur la détection de séquences d’acides nucléiques à l’aide de

sondes d’hybridation constituées d’ADN complémentaire et couplées à un

fluorochrome. Elle peut être réalisée sur des préparations cytogénétiques (noyaux en

métaphase) ou cytologiques (noyaux en interphase). Il existe une grande variété de

sondes : des sondes de fusion pour détecter des gènes de fusion et des sondes de

réarrangement (break-apart) pour la détection des réarrangements géniques. C’est

une technique intéressante car elle peut être réalisée sur des noyaux en interphase,

les résultats sont donc en général obtenus plus rapidement. Cependant, cette

technique d’étude est ciblée (dépendante des sondes utilisées) ce qui en limite

l’utilisation.

Dans l’étude des LAM, la FISH est utilisée dans certains contextes :

- Détection d’anomalies cryptiques :

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Les réarrangements de KMT2A (MLL) (du fait des nombreux partenaires et

des nombreux points de cassure existants) (19, 36) qui constituent son

principal intérêt en pratique clinique.

L’inv(16) ou la t(16;16)

- Caryotype conventionnel non réalisable (pas assez de métaphases, défaut de

culture) : l’étude par FISH peut permettre de rechercher des anomalies génétiques

pronostiques.

L’utilisation de la cytogénétique a constitué une avancée majeure dans la prise en

charge des LAM, toutefois une proportion non négligeable des LAM (environ 40%)

présentent un caryotype normal au diagnostic [14-16]. Le développement récent des

nouvelles méthodes de séquençage haut débit a permis de compléter nos

connaissances sur les bases moléculaires des LAM. Ces nouvelles données sont

particulièrement pertinentes dans le cas des LAM à caryotype normal (LAM-CN).

Malgré l’engouement actuel pour ces nouvelles technologies, les recommandations

établies par l’European Leukemia Net (ELN) en 2010 limitent le recours à la BM:

- A la validation d’un diagnostic en cas d’échec des techniques de cytogénétique,

- A la recherche de mutation de NPM1, FLT3, CEBPA lorsque le caryotype est

normal [17].

Au vu de la littérature récente, la quantification de ces anomalies est

souhaitable, même en dehors du cadre des recommandations actuelles (uniquement

recommandé pour les LAP [15] ). En effet, les données quantitatives permettent de

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mieux apprécier la profondeur de la réponse au traitement et de suivre la maladie

résiduelle (MRD).

Nous présentons ici quelques exemples d’anomalies moléculaires retrouvées

et/ou apparaissant dans la classification de l’Organisation Mondiale de la Santé

(OMS) 2016. Ces anomalies sont regroupées ci-dessous en catégories fonctionnelles

telles qu’elles sont décrites par le Cancer Genome Atlas Research Network.

RUNX1-RUNX1T1 : Ce gène de fusion est issu de la t(8;21)(q22;q22) , Les

LAM avec transcrit de fusion RUNX1-RUNX1T1 représentent environ 5 à 10% des

LAM de l’adulte. Le gène RUNX1 est situé sur le chromosome 21 et code pour la

sous-unité transcriptionnelle α du Cord Binding Factor (CBF) qui est essentielle dans

la régulation de la croissance et de la différenciation granulocytaire. Elle possède un

domaine RHD (Runt Homology Domain) de liaison à l’ADN. Le gène RUNX1T1 est

quant à lui situé sur le chromosome 8 et code une protéine interagissant avec des

récepteurs nucléaires ayant une fonction de corépresseurs (par le recrutement

d’histone désacétylase (HDAC) et de la protéine Sin3A. La protéine chimérique

générée par la fusion de ces deux gènes est responsable d’une répression

transcriptionnelle des gènes cibles de RUNX1[18] . Cette anomalie moléculaire est

associée dans environ 70% des cas à des anomalies cytogénétiques additionnelles et

environ 50% des cas à des anomalies géniques [17].

CBFB-MYH11 : La présence d’une t(16;16)(p13;q22) ou d’une inv(16), aboutit

à la fusion du gène CBFB présent sur le chromosome 16q22 avec le gène MYH11 en

16p13.1 [39]. Le gène CBFB code pour la sous-unité β de l’hétérodimère CBF. Cette

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sous unité stabilise la liaison à l’ADN de la sous unité α et participe donc également

à la régulation de l’hématopoïèse normale. Le gène MYH11 code pour la chaîne

lourde de la myosine muscle lisse. La protéine de fusion de ces deux gènes se lie à

la sous unité α et la séquestre aboutissant à des anomalies transcriptionnelles des

gènes cibles de RUNX1 [18]. Plus d’une dizaine de formes du transcrit de fusion sont

décrites dans la littérature parmi lesquelles les formes A, D ou E représentent 95 %

des transcrits.

CEBPA : Ce gène, situé en 19q13, code pour un facteur de transcription

impliqué dans la régulation de la prolifération et de la différentiation des

progéniteurs myéloïdes. Deux principaux types de mutations ont été décrits. Des

mutations non sens dans la région N-terminale et des mutations dans le cadre de

lecture de la région C-terminale leucine zipper. Dans plus de 50% des cas, les deux

allèles sont touchés. Ces mutations sont retrouvées dans environ 10% des LAM-CN

[19] .

RUNX1 : Les mutations de ce gène sont plus rares et concernent 5-15% des

LAM-CN. Dans les populations plus âgées (>70ans), la mutation est retrouvée dans

environ 15% des cas (20). La mutation peut être biallélique. Les mutations sont

localisées à la partie C-terminale de la protéine et entrainent la synthèse d’une

sous-unité α du CBF tronquée qui ne peut plus s’hétérodimériser avec CBF- β . Il en

résulte une perte de stabilité de la liaison de CBF-α à l’ADN et des anomalies

transcriptionnelles. Des mutations germinales de ce gène sont associées à des cas

de thrombopénie familiale et à une prédisposition familiale aux LAM [15].

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FLT3 : Ce gène, situé en 13q12, code pour un récepteur de tyrosine kinase

jouant un rôle dans la prolifération et la survie des CSH. On retrouve deux types de

mutations : le plus fréquent dénommé FLT3-ITD est associé à une duplication en

tandem de la partie interne de FLT3 ce qui entraine une activation constitutive du

récepteur. FLT3-ITD est retrouvé dans 25-30% des LAM de novo de l’adulte[15], 35-

40% des LAM-CN[17] et des LAP [19]. Le second type de mutation appelé FLT3-TKD

regroupe l’ensemble des mutations non sens localisées au niveau de la boucle

d’activation du domaine tyrosine kinase. Il est retrouvé dans 10-15% des LAM.

KIT : Le gène KIT, situé en 4q12, code pour un récepteur tyrosine kinase.

Plusieurs mutations ont été décrites et sont retrouvées dans environ 5% ou moins

des LAM (18) et plus fréquemment dans les LAM du groupe CBF[19] :

- Des mutations en position D816 qui touchent la boucle d’activation du domaine

kinase et aboutissent à un récepteur constitutionnellement actif sont retrouvées

dans 15 à 20% des LAM avec t(8;21) et dans 10 à 15% des LAM avec inv(16).

- Des mutations de l’exon 8 du gène, qui touchent la partie extracellulaire et

empêchent l’hétérodimérisation du récepteur, sont retrouvées dans 5-10% des

LAM t(8;21) et 15-20% des LAM avec inv(16).

RAS : La famille de gènes RAS code pour des protéines qui interviennent dans la

transduction du signal de nombreux récepteurs cellulaires (petite protéine à activité

GTPase). Elles sont notamment impliquées dans des voies de prolifération, survie, ou

différenciation cellulaire. Les mutations rencontrées dans les LAM intéressent les

gènes NRAS et KRAS. NRAS est muté dans 10-15% des LAM et KRAS dans seulement

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5%. Leur fréquence est augmentée dans les LAM du groupe CBF (30-40% pour les

LAM avec inv(16) et 10-20% pour les LAM avec t(8;21)) [54].

IDH : Il a été décrit deux gènes : IDH1 et 2 situés respectivement en 2q32 et

15q26. Ils codent pour des enzymes intervenant dans la régulation du cycle de

Krebs. La mutation R132H a été décrite pour IDH1 et les mutations R172K et R140Q

au niveau d’IDH2. Ces mutations sont retrouvées dans les gliomes et les LAM. Le

plus souvent monoalléliques elles entrainent l’accumulation intracellulaire de

l’onco-métabolite 2-hydroxy-glutarate (2HG). L’augmentation de 2HG est

responsable d’une inhibition du gène TET2 ce qui va entrainer des perturbations de

la méthylation de l’ADN. De plus, l’accumulation de 2HG est un marqueur diagnostic

et permet le suivi de la maladie résiduelle.

WT1 : Le gène de la tumeur de Wilms situé en 11p13 code pour un régulateur

trasncriptionnel jouant un rôle dans la croissance cellulaire et le développement

embryonnaire. Les mutations de WT1 sont associées à une dysfonction de TET2 et

entrainent donc des changements de méthylation de l’ADN qui vont altérer

l’expression de certains gènes notamment de gènes suppresseurs de tumeurs. Dans

les leucémies, on peut retrouver des mutations de ce gène dans environ 10% des

LAM-CN[20] mais surtout une surexpression du gène touchant environ 70% des LAM

[68] et permettant le suivi de la MRD.

De nombreuses études soulignent les liens entre ces anomalies moléculaires.

Certaines sont fréquemment associées alors que d’autres semblent exclusives.

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La prise en charge des LAM est adaptée à l’âge et aux comorbidités du

patient d’une part et aux caractéristiques de la maladie d’autre part, dont les

anomalies cytogénétiques et moléculaires présentes au diagnostic. La décision

thérapeutique est prise en réunion de concertation pluridisciplinaire, où sont réunis

cliniciens et biologistes. Les comorbidités et les facteurs pronostiques sont

soigneusement analysés en particulier chez les sujets âgés avant de débuter une

chimiothérapie intensive, en raison de l’importante toxicité liée à ce traitement ,

avec un nombre non négligeable de décès précoces même si le taux de décès à

l’induction ne cesse de diminuer avec le temps.

Le traitement s’articule en deux grandes phases : la première est le

traitement d’induction dont l’objectif est d’obtenir la rémission complète (RC),

condition nécessaire à une survie prolongée, et a fortiori à la guérison, dont la

définition d’usage est la persistance de la rémission complète pendant plus de cinq

ans.

Une fois la rémission complète atteinte, la deuxième phase du traitement

consiste en un traitement de consolidation, qui a pour but de réduire le risque de

rechute.

Différentes stratégies existent et la décision est guidée par l’état général du

patient (âge, comorbidités) et les caractéristiques de la maladie (indications

d’allogreffe en première RC en fonction des caractéristiques cytogénétiques et plus

récemment moléculaires). La poursuite de la chimiothérapie est une des possibilités

de traitement de consolidation.

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Aux côtés des facteurs pronostiques liés au patient, ceux liés à la maladie

sont principalement le taux de globules blancs au diagnostic, le statut secondaire de

la leucémie et les anomalies cytogénétiques et moléculaires. La cytogénétique est un

facteur pronostique indépendant majeur et un examen incontournable au

diagnostic.

La classification du groupe coopérateur britannique Medical research council (MRC),

mise à jour en 2010, est communément utilisée.

Plus récemment ont été individualisés les caryotypes monosomiques, de pronostic

catastrophique et définis par la présence d’une monosomie autosomique (délétion

d’un chromosome entier) associée à une autre monosomie autosomique ou à au

moins une autre anomalie de structure.

La découverte au cours de la dernière décade de l’importance pronostique de

certaines anomalies génétiques a permis d’affiner encore la classification

pronostique des LAM surtout au sein du groupe à caryotype normal dans lequel trois

gènes sont particulièrement importants par leur fréquence et leur impact

pronostique: il s’agit du gène de la nucléophosmine (NPM1), de la Fms-like tyrosine

kinase 3 (FLT3) et de la CCAAT/enhancer binding protein alpha (C/EBPA).

La mise en évidence d’un avantage de survie chez les patients ayant un caryotype

normal et une mutation du gène NPM1 ou de CEBPA sans mutation de FLT3-ITD,

permet de les classer dans le sous-groupe favorable, aux côtés des anomalies du

sous-groupe CBF t (8;21)

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(q22;q22) et inv(16)(p13.1;q22)], confirmant l’importance des mutations de ces

deux gènes, déjà soulignée par la classification OMS 2008. Les mutations de CEBPA

sont considérées de bon pronostic si elles sont bi-alléliques.

Mais la mise au point de ces classifications pronostiques n’est pas définitive.

D’autres anomalies moléculaires sont intensément étudiées et pourraient venir

complexifier encore ces classifications ; il s’agit des mutations de la DNA methyl

transférase 3A (DNMT3A), des isocitrate déshydrogénases (IDH) 1 et 2, de tet

oncogene family member 2 (TET2), ou d’autres gènes.

La définition actuelle de la rémission complète(RC) se base sur des critères

cytologiques. Et notamment sur le compte cellulaire. Malgré les avancées sur le plan

moléculaire, la définition de la RC est restée la même au cours du temps. Elle est

définie, selon les critères ELN [19] par :

la présence de moins de 5% de blastes médullaires,

l’absence de blastes contenant des corps d’Auer,

l’absence de localisation extramédullaire,

une indépendance transfusionnelle

la sortie d’aplasie (caractérisée par la présence de polynucléaires

neutrophiles à plus de 1 G/L et d’un taux plaquettaire supérieur à 100 G/L).

La rémission cytologique est le reflet d’une diminution de la charge

leucémique et correspond au passage de 1012 ou plus de cellules au diagnostic à

1010 ou moins en post induction [21]. Cette définition ne permet donc pas

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d’apprécier la profondeur de la réponse et de distinguer différents groupes de

patients en fonction de la qualité de leur réponse. La RC est obtenue chez près de

80% des patients atteints de LAM. L’obtention d’une RC est un facteur de bon

pronostic mais ne signifie pas que le patient est guéri. En effet, la plupart des

patients va rechuter au cours du suivi. La MRD est définie comme la persistance,

après obtention d’une RC, d’une maladie détectable par d’autres techniques que la

cytologie. Le seuil à partir duquel on affirmera la présence d’une MRD est dépendant

du type de technique considérée (cytogénétique, FISH, cytométrie en flux, biologie

moléculaire) (Figure1).

Pour ces LAM, il n’existe cependant pas d’étude l’incluant dans la prise en charge

thérapeutique. Le suivi de la MRD est donc un domaine de recherche très dynamique

en particulier pour les LAM dépourvues de marqueurs propres de suivi.

Au cours des LAM, le suivi de la MRD est particulièrement utile dans plusieurs cas de

figure:

- Pour apprécier la profondeur de la réponse au traitement

- Pour réajuster le traitement du patient de façon évolutive (consolidation ou

intensification)

- Pour prévenir la rechute clinique en proposant un traitement dès la rechute

moléculaire

A l’avenir, son utilisation sera donc probablement de plus en plus recommandée afin

d’offrir une prise en charge personnalisée aux patients atteints de LAM.

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La CMF est une technique permettant l’analyse de cellules en suspension.

Les cellules sont injectées à grande vitesse au sein d’un flux liquide. Elles adoptent

alors une configuration en file indienne puis traversent différents lasers couplés à

une série de détecteurs ce qui permet d’analyser individuellement un grande

nombre de cellules en peu de temps. L’étude de la lumière réémise par diffusion ou

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fluorescence lors du passage d’une cellule permet d’obtenir des informations sur sa

taille, sa granulosité ou la présence d’un éventuel fluorochrome qui lui serait

adjoint. On peut ainsi quantifier au sein d’un échantillon des sous-types cellulaires

en fonction de leurs propriétés physiques et des marqueurs d’intérêt.

Au moment du diagnostic de LAM, les blastes isolés à partir des

prélèvements du patient sont étudiés en CMF avec des panels d’anticorps. Ainsi, il

est parfois possible de déterminer un ou plusieurs LAIP. Au cours du suivi, les

prélèvements ultérieurs sont techniqués de manière identique afin de quantifier le

nombre de cellules présentant le ou les LAIP, c’est à dire la MRD du patient.

La stratégie d’analyse actuelle est basée sur le fenêtrage des blastes puis la

recherche d’un LAIP.

Définition de la fenêtre « blastes » au diagnostic et lors du suivi (figure 2 et

3)

Un premier diagramme « TIME » permet de visualiser le nombre

d’événements acquis en fonction du temps. Il reflète ainsi la stabilité de l’acquisition

sur le cytomètre au cours du temps. Les diagrammes « FSint/FSpeak » et «

FSint/SSint » permettent respectivement d’éliminer les doublets puis les éléments de

petite taille (débris) ou de taille et/ou structure trop importante. Un premier

fenêtrage « cellules » définit la population d’intérêt pour la suite de l’analyse.

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Ce diagramme permet de distinguer les éléments CD45+ (sous-populations

leucocytaires) des populations CD45- (débris). La fenêtre « leucocytes » totalise le

nombre d’évènements leucocytaires acquis et servira de dénominateur pour la

quantification de la MRD.

On délimite ensuite les différentes fenêtres contenant les populations

granuleuses, les monocytes, les lymphocytes et les blastes selon l’expression du

CD45 et l’hétérogénéité de structure. La fenêtre « blastes » est délimitée

puis validée par un fenêtrage rétrograde à partir des éléments CD45faible/CD34+

(cf. Diagramme CD45/CD34).

L’analyse des leucocytes sur le diagramme CD45/CD34 permet de réaliser

plusieurs contrôles. Le fenêtrage des évènements CD45faible/CD34+ est appelé «

CD34+ ».

Celui-ci permet de vérifier le fenêtrage « blastes » réalisé sur

l’intensité du CD45 et la structure. Eventuellement, cette fenêtre est alors redessinée

si le nuage de point « CD34+ » n’est pas entièrement inclus dans la fenêtre blastes.

D’autre part, en rapportant le nombre d’événements CD34+ sur le nombre

d’événements CD45+, on obtient un pourcentage de blastes médullaires nous

permettant de juger de l’hémodilution du prélèvement. Un prélèvement non

hémodilué contient environ 3 à 4% de blastes lors des évaluations de MRD. Il est

ainsi possible d’évaluer le seuil technique qui permettrait de mettre en évidence une

MRD (définie par un nuage composé de 50 événements dans un prélèvement non

dilué ayant le même nombre de blastes).

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Les

granuleux apparaissent en rouge. Les monocytes sont colorés en vert et les

lymphocytes en rose. Les blastes sont initialement fenêtrés sur le

diagramme CD45/SS et apparaissent en bleu. Ils représentent la majorité des

cellules dans ce prélèvement. La population CD34+ est sélectionnée sur le

diagramme CD45/CD34 et apparait en orange. Par rétrocontrôle, on observe que la

population CD34+ de couleur orange est bien contenue dans la sélection blastes.

Les blastes de couleur noir représentent les blastes présentant le LAIP étudié.

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Les granuleux apparaissent en rouge. Les monocytes sont colorés en vert et

les lymphocytes en rose. Les blastes sont initialement fenêtrés sur le

diagramme CD45/SS et apparaissent en bleu. Les blastes ne représentent alors

qu’une fraction des leucocytes. La population CD34+ est sélectionnée sur le

diagramme CD45/CD34 et apparait en orange. Par rétrocontrôle, on observe que la

population CD34+ de couleur orange est bien contenue dans la sélection blastes.

Les blastes de couleur noire représentent les blastes présentant le LAIP étudié.

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Dr.AMRANI kawthar36

Recherche et mesure des LAIP (figures 4et 5)

La recherche et la quantification de la MRD sur un LAIP sont réalisées en

visualisant les blastes dans divers diagrammes permettant de caractériser leurs

profils d’expression pour les antigènes marqués. Au diagnostic, pour chaque

diagramme, la population blastique est fenêtrée. En combinant les événements

contenus dans ces fenêtres, on obtient le nombre de blastes présentant le

phénotype aberrant. En rapportant celui-ci au nombre de leucocytes, on obtient le

pourcentage de blastes présentant le phénotype aberrant. Un rétrocontrôle de la

population blastique fenêtrée est enfin réalisé sur un diagramme CD45/SS (figure 4).

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Le

profil phénotypique des blastes est visualisé dans plusieurs diagrammes. Le

fenêtrage permet de définir la population exprimant le LAIP (« MRD ») par une

fenêtre combinant les événements « Blastes+Y1+Y2+Y3+Y4+Y5+Y6 ». Celle-ci est

colorée en noir. Enfin, la quantification des blastes exprimant le LAIP est exprimée

en pourcentage du nombre de leucocytes total (ici 53%).

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Pour évaluer la MRD à un point de suivi ultérieur, le masque des fenêtrages

déterminés lors du diagnostic est appliqué sur les cellules étudiées. Un rétrocontrôle

de la position de ces blastes sur un diagramme CD45/SS est de nouveau effectué

permettant d’en apprécier la position, la dispersion et d’éviter un biais de sélection

(figure 5).

Pour une LAM, plusieurs types de LAIP peuvent ainsi être suivis.

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.

Le profil phénotypique des blastes est visualisé sur les mêmes diagrammes qu’au diagnostic. Le masque du fenêtrage réalisé au diagnostic est appliqué sur les cellules étudiées. Les nombre de blastes exprimant le LAIP (« MRD ») est obtenu en combinant les événements « Blastes+Y1+Y2+Y3+Y4+Y5+Y6 » qui sont colorés en noir. Enfin, la quantification des blastes exprimant le LAIP est exprimée en pourcentage du nombre de leucocytes total (ici 0.49%).

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Dr.AMRANI kawthar40

L’évaluation de la MRD passe par le calcul du pourcentage d’événements

présentant un phénotype inhabituel parmi les leucocytes totaux.

l’analyse est basée sur la comparaison des résultats par rapport à un pool de

moelles de « référence ». On utilise pour chaque combinaison antigénique 5 à 9

moelles témoins qui ont été marquées avec le même panel d’anticorps que le

prélèvement d’intérêt. Le nombre d’événements obtenus sur les moelles de

référence permet de déterminer l’expression normale ou physiologique d’un LAIP

donné et de calculer la valeur du seuil de positivité. Le seuil de positivité est alors

égal à la moyenne plus 2 écart-types du pourcentage de leucocytes exprimant le

LAIP observé dans les moelles de référence.

La CMF est un outil essentiel non seulement lors du diagnostic de LAM mais

aussi pour le suivi de la MRD [19]. Chez les adultes, on estime ainsi qu’environ 75-

95% des patients [19-22] présentent un ou plusieurs immunophénotype(s) aberrants

associé(s) à la leucémie (LAIP) au diagnostic. Il est donc possible de suivre la MRD

par CMF à différents temps du traitement chez une majorité de patients avec LAM.

Les avantages de cette technique sont une bonne disponibilité du matériel dans les

centres hospitaliers, un rendu rapide des résultats et un coût inférieur comparé aux

techniques de biologie moléculaire. Toutefois, l’analyse des données nécessite une

expertise importante, l’évaluation est dépendante du manipulateur [24] et des

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Dr.AMRANI kawthar41

variations phénotypiques peuvent être présentes à la rechute, ce qui peut en limiter

l’utilisation [18-22] .

L’évaluation de la MRD par CMF se fait au travers de l’analyse des LAIP, plus

récemment décrite comme une analyse des « différences par rapport à la normale ».

Ces LAIP peuvent être regroupés en 4 classes :

- Marqueurs d’infidélité de lignée

- Marqueurs d’asynchronisme de maturation

- Marqueurs non exprimés ou sous-exprimés

- Marqueurs surexprimés.

La sensibilité de ces marqueurs dépend de leur expression initiale sur les

cellules leucémiques (dans l’étude de Feller ils sont considérés comme

sensibles au-delà de 50%, peu sensibles entre 10 et 20% d’expression et enfin non

considérés comme marqueur de suivi en dessous de 10%) et leur spécificité de leur

expression sur moelles normales [22].

La détection de ces marqueurs est fonction du panel d’anticorps utilisé au

diagnostic. Initialement réalisée à l’aide de cytomètres 2 ou 3 couleurs, l’utilisation

plus récente de cytomètres 6-8 couleurs a permis un confort d’utilisation, un gain

de temps technique et une augmentation du seuil de détection.

Actuellement le suivi de la MRD est réalisé sur moelle osseuse compte tenu

du manque de sensibilité du phénotypage sur sang [24]. L’évaluation de la MRD par

CMF a montré un intérêt pronostique à différents temps du traitement à la fois dans

des études rétrospectives et prospectives (tableau 4) :

- lors de l’aplasie post-induction,

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Dr.AMRANI kawthar42

- au terme d’une cure d’induction,

- au terme des cures de consolidation.

Toutefois, la portée de ces résultats est limitée car ces études sont

majoritairement rétrospectives et incluent une population restreinte. De plus, seule

l’étude prospective AML02 sur une population pédiatrique, a intégré le suivi de la

MRD par CMF dans l’adaptation du traitement et la prise en charge des patients.

D’autres données prospectives sur l’intérêt ou non de fonder en partie la décision

thérapeutique sur les résultats de la MRD en CMF sont donc nécessaires. Enfin,

l’analyse de la MRD par CMF manque actuellement de standardisation et il existe

une grande hétérogénéité des seuils de positivité retenus dans chaque étude

(tableau 4).

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Dr.AMRANI kawthar43

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Dr.AMRANI kawthar44

L’évaluation de la MRD par CMF se fait au travers de l’analyse des LAIP, plus

récemment décrite comme une analyse des « différences par rapport à la normale ».

Ces LAIP peuvent être regroupés en 4 classes :

- Marqueurs d’infidélité de lignée

- Marqueurs d’asynchronisme de maturation

- Marqueurs non exprimés ou sous-exprimés

- Marqueurs surexprimés.

La sensibilité de ces marqueurs dépend de leur expression initiale sur les cellules

leucémiques [22].

La détection de ces marqueurs est fonction du panel d’anticorps utilisé au

diagnostic. Initialement réalisée à l’aide de cytomètres 2 ou 3 couleurs, l’utilisation

plus récente de cytomètres 6-8 couleurs a permis un confort d’utilisation, un gain

de temps technique et une augmentation du seuil de détection.

Actuellement le suivi de la MRD est réalisé sur moelle osseuse compte tenu

du manque de sensibilité du phénotypage sur sang [23]. L’évaluation de la MRD par

CMF a montré un intérêt pronostique à différents temps du traitement à la fois dans

des études rétrospectives et prospectives:

lors de l’aplasie post-induction [24],

au terme d’une cure d’induction [23-24-25],

au terme des cures de consolidation [16, 22, 24].

La recherche et la quantification de la MRD sur un LAIP sont réalisées en

visualisant les blastes dans divers diagrammes permettant de caractériser leurs

profils d’expression pour les antigènes marqués. Au diagnostic, pour chaque

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Dr.AMRANI kawthar45

diagramme, la population blastique est fenêtrée. En combinant les événements

contenus dans ces fenêtres, on obtient le nombre de blastes présentant le

phénotype aberrant. En rapportant celui-ci au nombre de leucocytes, on obtient le

pourcentage de blastes présentant le phénotype aberrant. Un rétrocontrôle de la

population blastique fenêtrée est enfin réalisé sur un diagramme CD45/SS.

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Dr.AMRANI kawthar46

Le profil

phénotypique des blastes est visualisé dans plusieurs diagrammes. Le fenêtrage permet de définir la population exprimant le LAIP (« MRD ») par une fenêtre combinant les événements « Blastes+Y1+Y2+Y3+Y4+Y5+Y6 ». Celle-ci est colorée en noir. Enfin, la quantification des blastes exprimant le LAIP est exprimée en pourcentage du nombre de leucocytes total (ici 53%).

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Dr.AMRANI kawthar47

Pour évaluer la MRD à un point de suivi ultérieur, le masque des fenêtrages

déterminés lors du diagnostic est appliqué sur les cellules étudiées. Un rétrocontrôle

de la position de ces blastes sur un diagramme CD45/SS est de nouveau effectué

permettant d’en apprécier la position, la dispersion et d’éviter un biais de sélection

(figure5).

Pour une LAM, plusieurs types de LAIP peuvent ainsi être suivis.

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Dr.AMRANI kawthar48

.

Le profil phénotypique des blastes est visualisé sur les mêmes diagrammes qu’au diagnostic. Le masque du fenêtrage réalisé au diagnostic est appliqué sur les cellules étudiées. Les nombre de blastes exprimant le LAIP (« MRD ») est obtenu en combinant les événements « Blastes+Y1+Y2+Y3+Y4+Y5+Y6 » qui sont colorés en noir. Enfin, la quantification des blastes exprimant le LAIP est exprimée en pourcentage du nombre de leucocytes total (ici 0.49%).

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Dr.AMRANI kawthar49

L’évaluation de la MRD passe par le calcul du pourcentage d’événements

présentant un phénotype inhabituel parmi les leucocytes totaux.

L’analyse est basée sur la comparaison des résultats par rapport à un pool de

moelles de « référence ». On utilise pour chaque combinaison antigénique 5 à 9

moelles témoins qui ont été marquées avec le même panel d’anticorps que le

prélèvement d’intérêt. Le nombre d’événements obtenus sur les moelles de

référence permet de déterminer l’expression normale ou physiologique d’un LAIP

donné et de calculer la valeur du seuil de positivité. Le seuil de positivité est alors

égal à la moyenne plus 2 écart-types du pourcentage de leucocytes exprimant le

LAIP observé dans les moelles de référence.

Il est donc possible de suivre la MRD par CMF à différents temps du

traitement chez une majorité de patients avec LAM. Les avantages de cette

technique sont une bonne disponibilité du matériel dans les centres hospitaliers, un

rendu rapide des résultats et un coût inférieur comparé aux techniques de biologie

moléculaire. Toutefois, l’analyse des données nécessite une expertise importante,

l’évaluation est dépendante du manipulateur [22]et des variations phénotypiques

peuvent être présentes à la rechute, ce qui peut en limiter l’utilisation [22, 23].

Enfin, l’analyse de la MRD par CMF manque actuellement de standardisation

et il existe une grande hétérogénéité des seuils de positivité retenus dans chaque

étude (tableau7).

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Dr.AMRANI kawthar51

Le suivi de la MRD en biologie moléculaire s’effectue essentiellement en routine par

la quantification de différents marqueurs moléculaires par PCR quantitative en

temps réel (RQ-PCR). L’intérêt de cette technique repose sur sa grande sensibilité

avec une limite de détection pouvant atteindre 10-6 pour certaines cibles. Pour cela,

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Dr.AMRANI kawthar52

il faut disposer d’un marqueur le plus spécifique possible des cellules tumorales et

stable dans le temps. Il peut s’agir d’un transcrit de fusion récurrent, d’une mutation

génique, de la surexpression de certains gènes ou encore d’un réarrangement.

Le choix du marqueur constitue une étape déterminante. Si les transcrits de fusion

constituent une cible alliant à la fois spécificité, stabilité, applicabilité au plus grand

nombre et faisabilité technique en routine pour un coût acceptable, ceux-ci ne

concernent qu’environ 30 à 40 % rares imposant le design d’amorces spécifiques

d’un patient donné, approche à la fois lourde et consommatrice de temps. De

même, l’évolution clonale ou l’émergence de sous-clones peuvent parfois induire de

véritables échecs de suivi.

Les avancées de ces dernières années en matière de séquençage haut débit viennent

aujourd’hui révolutionner la façon d’appréhender le suivi de ces hémopathies. Outre

une excellente sensibilité, ces techniques sont capables de fournir une quantité

considérable d’informations permettant la prise en compte du caractère multiclonal

de ces pathologies et le suivi de plusieurs marqueurs simultanément en un temps

réduit. Il est aujourd’hui possible de suivre un clone minoritaire au sein d’une

population leucémique, voire d’observer l’émergence d’un clone résistant non

détecté au diagnostic. Les progrès continuels ayant contribué à abaisser les coûts,

les laboratoires disposant de ces techniques sont de plus en plus nombreux et le

séquençage de nouvelle génération va s’imposer peu à peu comme un outil de choix

dans l’évaluation de la maladie résiduelle [26].

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Dr.AMRANI kawthar53

Il n’existe pas de marqueur de BM associé à l’ensemble des LAM. Dans un

certain nombre de cas, il est possible de suivre de manière quantitative l’évolution

d’un transcrit de fusion associé spécifiquement à un type de leucémie. Lorsqu’il

s’agit d’une leucémie aigüe dépourvue de transcrit spécifique, le suivi moléculaire

repose alors sur la détection des mutations du gène NPM1 et sur la surexpression

du gène WT1.

Dans les leucémies aiguës promyélocytaires (LAP), la détection de la MRD

repose sur la mise en évidence du produit de la translocation t(15;17), le transcrit

PML-RARA, retrouvé dans 99% des cas. L’obtention de la rémission moléculaire

complète en fin de consolidation est nécessaire pour obtenir la guérison. Une MRD

positive après traitement ou la repositivation au cours du suivi précédent le plus

souvent la rechute hématologique. Dans le cas de la LAP,

la MRD permet de guider les thérapeutiques interventionnelles précoces par

chimiothérapie ou transplantation de cellules souches. De plus, des études ont

montré un gain de survie lié à l’intervention précoce devant une rechute moléculaire

[27].

Dans les LAM à core binding factor, le suivi des transcrits de fusion RUNX1-

RUNX1T1 et CBFB-MYH11 retrouvés respectivement dans les LAM avec t(8;21) et les

LAM inv(16), a montré un intérêt pronostique sur le risque de rechute.

Concernant les LAM avec réarrangement du gène MLL, la grande diversité des

gènes partenaires possibles ainsi que la grande variabilité des points de cassure

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L’apport de la cytométrie en flux et de la biologie moléculaire dans l’évaluation précoce de la maladie résiduelle dans les leucémies aiguës myéloïdes

Dr.AMRANI kawthar54

rendent difficile leur utilisation comme cible de MRD en pratique courante,

nécessitant souvent le design d’oligonucléotides patient-spécifiques.

Le gène de la nucléophosmine est muté dans environ 30% des LAM et dans

plus de la moitié des LAM-CN. Cette mutation est stable au cours du temps ce qui

en fait un marqueur de suivi intéressant pour détecter la rechute. Ainsi, chez des

patients présentant une mutation au diagnostic, la mutation est également

présente à la rechute dans la majorité des cas [27-28].

La quantification de la mutation de dans le cadre de l’évaluation de la

MRD repose sur l’utilisation de la PCR quantitative en temps réel (RQ-PCR) réalisée à

partir d’ARN/ADNc le plus souvent. L’évaluation sur ADN semble moins sensible [24]

. L’expression de la mutation est rapportée à l’activité du gène de référence

dans la plupart des cas.

Dans les différentes études évaluant l’impact de la MRD basée sur , la

MRD a été évaluée à plusieurs temps : en post-induction, en post-consolidation ou

encore en fin de traitement. Il a été mis en évidence un impact pronostique du suivi

de la MRD à des temps précoces (post induction voire au cours de l’aplasie) ou plus

tardifs (post consolidation ou en fin de traitement), aussi bien sur le risque de

rechute que sur la survie

Le gène de la nucléophosmine est muté dans environ 30% des LAM et dans

plus de la moitié des LAM-CN. Cette mutation est stable au cours du temps ce qui

en fait un marqueur de suivi intéressant pour détecter la rechute.

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L’apport de la cytométrie en flux et de la biologie moléculaire dans l’évaluation précoce de la maladie résiduelle dans les leucémies aiguës myéloïdes

Dr.AMRANI kawthar55

Toutefois, les seuils évalués pour définir une maladie résiduelle négative ou

positive varient selon les études et aucune étude publiée n’a intégré la MRD basée

sur dans la prise en charge thérapeutique des patients.

Le gène WT1 est exprimé chez les sujets sains et sa surexpression est

retrouvée dans la majorité des LAM (70-90% des cas). Le niveau de surexpression

varie entre les différents types de leucémies. Ainsi, une surexpression marquée de

WT1 est notamment détectée chez les patients atteints de LAM du groupe CBF ou

ayant une mutation de NPM1 alors que les LAM 5 selon la classification FAB

semblent présenter des taux inférieurs d’expression de WT1 [29].

C’est un marqueur stable. Ainsi, chez la plupart des patients ayant au

diagnostic une surexpression de , celle-ci sera retrouvée à la rechute [27-28].

C’est également un bon marqueur pour suivre la profondeur de la réponse au

traitement puisque ses variations quantitatives sont corrélées au statut de la

maladie. L’expression physiologique de chez les sujets sains est moins

importante dans le sang périphérique (quasiment indétectable) que dans la moelle

osseuse. Le seuil de détection a donc été abaissé dans le sang par rapport à la

moelle osseuse. Les taux de retrouvés au diagnostic ne varient pas

significativement entre ces deux types d’échantillons [30].

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Dr.AMRANI kawthar56

Ce travail permet de mettre en évidence l’intérêt de l’utilisation de la

cytométrie en flux et de la biologie moléculaire dans l’évaluation de la MRD. Obtenir

une quantification de la MRD de manière précoce pourrait permettre d’identifier les

patients à plus haut risque d’évolution et de proposer un schéma thérapeutique

incluant une intensification par allogreffe de cellules souches hématopoïétiques plus

précocement.

La cytométrie en flux est un moyen rapide, accessible permettant le suivi

d’une maladie résiduelle chez les patients, y compris ceux qui ne présentent pas de

marqueur de suivi par RQ-PCR et qui sont nombreux.

la biologie moléculaire occupe aujourd’hui une place de choix dans la prise

en charge des LA, du diagnostic à l’évaluation du pronostic, au suivi voire même à la

stratification thérapeutique. Elle a grandement contribué à étoffer nos

connaissances de la leucémogenèse humaine et permet aujourd’hui d’envisager une

prise en charge « à la carte » de chaque patient. Il est très probable qu’avec des

techniques toujours plus sensibles, standardisées et robustes, utilisables en routine,

la biologie moléculaire devrait occuper une place de plus en plus importante.

L’ensemble des données présentées valident l’intérêt d’une évaluation

précoce de la maladie résiduelle, quelle que soit la technique utilisée. Cependant,

une uniformisation des pratiques concernant l’évaluation de la MRD par CMF est

nécessaire.

Ainsi à plus long terme et après validation prospective, ces données

pourraient être utilisées dans des stratégies de stratifications thérapeutiques.

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Dr.AMRANI kawthar57

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L’apport de la cytométrie en flux et de la biologie moléculaire dans l’évaluation précoce de la maladie résiduelle dans les leucémies aiguës myéloïdes

Dr.AMRANI kawthar62

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L’apport de la cytométrie en flux et de la biologie moléculaire dans l’évaluation précoce de la maladie résiduelle dans les leucémies aiguës myéloïdes

Dr.AMRANI kawthar63

Bien que la majorité des patients atteints de leucémie aiguë obtienne une

rémission complète à l’issue de la chimiothérapie d’induction, près d’un patient sur

deux « rechute » à plus ou moins long terme. De nombreux facteurs pronostiques

ont été développés afin d’identifier plus précocement ces patients à risque. Si les

facteurs préthérapeutiques liés au patient lui-même (âge, comorbidités) ou à sa

maladie (leucocytose, immunophénotype et surtout anomalies cytogénétiques et/ou

moléculaires) constituent généralement de bons indicateurs pronostiques, aucun

d’entre eux ne permet de prendre en compte les différences interindividuelles dans

le métabolisme des molécules ou la réponse immune anti-leucémique.

On considère en général que le nombre de cellules tumorales au diagnostic

de LA est de l’ordre de 10 puissances 12 cellules. Dès que ce nombre passe en

dessous de 10 puissances 10 sous l’action de la chimiothérapie, les cellules

leucémiques ne sont plus détectées par l’examen cytologique du sang et de la

moelle osseuse. Le patient est alors considéré en rémission hématologique

complète. Ceci ne signifie pas pour autant que les cellules tumorales aient

totalement disparu de l’organisme mais qu’elles sont présentes à des taux inférieurs

aux limites de détection des techniques cytologiques. En plus d’une sensibilité assez

faible, ces techniques s’avèrent parfois difficiles d’interprétation (moelle de richesse

variable, présence de blastes de régénération). C’est dans ce contexte que vient se

placer l’évaluation de la maladie résiduelle (MRD) comme un outil de choix

permettant l’évaluation précise, sensible et objective de la réponse thérapeutique à

l’échelle individuelle.

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L’apport de la cytométrie en flux et de la biologie moléculaire dans l’évaluation précoce de la maladie résiduelle dans les leucémies aiguës myéloïdes

Dr.AMRANI kawthar64

La MRD est ainsi définie comme la persistance de cellules leucémiques ayant

survécu à la chimiothérapie et présentes en nombre inférieur au seuil de détection

des méthodes cytologiques classiques.

L’importance de la MRD est devenue en quelques années l’un des facteurs

pronostiques majeurs pour le risque de rechute dans les leucémies aiguës. Elle

permet de suivre l’évolution de la masse tumorale et permet ainsi de mieux

apprécier la sensibilité des cellules tumorales aux divers traitements et d’évaluer la

qualité de la rémission complète.

La MRD prend alors progressivement sa place comme un outil de

stratification thérapeutique dans les essais cliniques.

Le suivi de la MRD permet ainsi de prédire la rechute hématologique avant

qu’elle ne se manifeste cliniquement et d’orienter plus précocement le patient vers

une intensification thérapeutique.

Les techniques de cytogénétique conventionnelle ou de FISH peuvent être

utilisées mais leur sensibilité est relativement voisine de celles de la cytologie (10 -

à 10 - ). Depuis les années 2000, le développement de la MRD par

immunophénotypage en cytométrie en flux, fondée sur l’expression

d’immunophénotype aberrant associé à la leucémie (LAIP) par les blastes

leucémiques, constitue une alternative séduisante en particulier en absence de

marqueur moléculaire, mais avec une sensibilité généralement inférieure à celle de

la biologie moléculaire (de l’ordre de 10 - à 10 - ).

Le suivi de la MRD en biologie moléculaire s’effectue essentiellement en

routine par la quantification de différents marqueurs moléculaires par PCR

quantitative en temps réel (RQ-PCR).