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Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Les problèmes de couple dans les symbiosesnémato-bactériennes parasites d’insecte
Vanya Emelianoff
Équipe InteractionsInstitut des Sciences de l’Évolution de Montpellier
1er juillet 2008
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Contexte général
Symbioses mutualistes...
sources d’innovationécologique etévolutive
trèsanciennes
10 µm
trèsrépandues
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Contexte général
Symbioses mutualistes...
ont évoluédans denombreuxgroupes
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Contexte général
Vue d’un peu loin, une association mutualiste présente les deuxcaractères du ménage parfait, fidélité et bonne entente [...](C. Combes, Interactions Durables, p 466)
Bonne entente ?interaction bénéfique pour lesdeux partenaires ?
Fidélité ?interaction avec le mêmepartenaire ?
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Contexte général
Vue d’un peu loin, une association mutualiste présente les deuxcaractères du ménage parfait, fidélité et bonne entente [...](C. Combes, Interactions Durables, p 466)
Bonne entente ?interaction bénéfique pour lesdeux partenaires ?
Fidélité ?interaction avec le mêmepartenaire ?
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Contexte général
Vue d’un peu loin, une association mutualiste présente les deuxcaractères du ménage parfait, fidélité et bonne entente [...](C. Combes, Interactions Durables, p 466)
Bonne entente ?interaction bénéfique pour lesdeux partenaires ?
Fidélité ?interaction avec le mêmepartenaire ?
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Contexte général
Divers cas de figure
négatif(parasitisme) (mutualisme)
positif
bilan de l’interactionpour l’autre partenaire
diversitédes partenaires
faible(spécifique)
forte(généraliste)
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Contexte général
Divers cas de figure
Epipactishelleborine(généraliste)
forte
pour l’insecte pollinisateurbilan de l’interactionnégatif
(parasitisme)positif
(mutualisme)
diversité despartenaires insectes
faible(spécifique)
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Contexte général
Divers cas de figure
Epipactis helleborine
positif(mutualisme)(parasitisme)
négatif
faible(spécifique)
forte(généraliste)
Ophrys bilunulata(pollinisateur :
Andrena flavipes)
bilan pourl’insecte
partenaires insectesdiversité des
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Contexte général
Divers cas de figure
Epipactis helleborine
Platanthera chloranta
négatif(parasitisme)
positif(mutualisme)
Ophrys bilunulata(Andrena flavipes)
Orchis moriodiversité des
(généraliste)
bilan de l’interactionpour l’insecte pollinisateur
forte
(spécifique)faible
partenaires insectes
Angraecum
morgani)(Xanthopan
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Contexte général
Transitions évolutives... de bilan coûts/bénéfices
-
diversité despartenaires
l’interactionbilan de
faible
forte
+
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Contexte général
Transitions évolutives... de spécificité
Whittall & Hodges 2007
Aquilegia vulgaris∼ 1 cm
∼ 2 cmAquilegia canadensis
Aquilegia coerula∼ 12 cm
bilan del’interactionpour l’insecteforte
faible
diversité des partenaires
(spécialiste)
(généraliste)
+-
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Contexte général
Questions générales
bilan coûts-bénéfices→ nature de l’interaction
-
diversité despartenaires
l’interactionbilan de
faible
forte
+
degré d’interdépendance→ spécificité de l’interaction
diversité despartenaires
bilan del’interaction
-
forte
faible+
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Modèle biologique
Partenaires de la symbiose
Stade infestant de S. carpocapsaeavec bactéries GFP
Zoom sur la vésiculecontenant les bactéries
(clichés M. Sicard)
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Modèle biologique
Partenaires de la symbiose
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Modèle biologique
Cycle de vie des couples Steinernema-Xenorhabdus
PHASE LIBRE (dans le sol)
PHASEPARASITE (dansl’insecte)
multiplication des bactériesreproduction des nématodes
lutte à mort :
et la multiplication bactériennetuent l’insecte
bactéries
réassociationdes partenaires
|L2 L1L3L4~
|L3 ~
émergence
L4
dessin N. Le Brun
IJ
les toxines des deux partenaires
libération des
infestation
StadesInfestants (IJs)
phaseparasitairebactérie
bactériesnématode
(stade infestant)
nématode
phase libre
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Modèle biologique
Avantages du modèle biologique
cycle de vie rapide (14-20 jours)nombreux couples nématodes-bactéries au sein du genreSteinernemapartenaires cultivables séparément
Hôte insecte
Galleria mellonella(Lépidoptère, Pyralidae)
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Coûts-bénéfices dans lasymbiose
-
diversité despartenaires
l’interactionbilan de
faible
forte
+
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
État de l’art
Bénéfice : reproduction en phase parasitaire
(1) réussite parasitaire (d’après Sicard & al. 2003)
0.0
0.2
0.4
0.6
0.8
APO SYM APO SYM
S.carpocapsae S.scapterisci
p=0.001 p=0.003
réus
site
par
asita
ire
phaseparasitairebactérie
bactériesnématode
(stade infestant)
nématode
phase libre
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
État de l’art
Bénéfice : reproduction en phase parasitaire
(2) succès reproductif (d’après Sicard & al. 2003)
0e+
002e
+04
4e+
046e
+04
8e+
041e
+05
APO SYM APO SYM
S.carpocapsae S.scapterisci
p<0.001 (x 7) p=0.036 (x 1.3)
nom
bre
d'IJ
s ém
is
phaseparasitairebactérie
bactériesnématode
(stade infestant)
nématode
phase libre
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
État de l’art
Bénéfice : reproduction en phase parasitaire
(2) succès reproductif (d’après Sicard & al. 2003)
0e+
002e
+04
4e+
046e
+04
8e+
041e
+05
APO SYM APO SYM
S.carpocapsae S.scapterisci
p<0.001 (x 7) p=0.036 (x 1.3)
nom
bre
d'IJ
s ém
is
phaseparasitairebactérie
bactériesnématode
(stade infestant)
nématode
phase libre
- +bilan
faible
forte
diversité
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
État de l’art
Coût : survie en phase libre0
24
68
1012
●●
●●●
●
●●
●
●
●
●
●
●
● ●
●●
●
●
APO SYM APO SYM
S.carpocapsae S.scapterisci
p<0.0001 p=0.49
% m
orte
s
limite : S. scapterisci”symbiotique“...
phaseparasitairebactérie
bactériesnématode
(stade infestant)
nématode
phase libre
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
État de l’art
Coût : survie en phase libre0
24
68
1012
●●
●●●
●
●●
●
●
●
●
●
●
● ●
●●
●
●
APO SYM APO SYM
S.carpocapsae S.scapterisci
p<0.0001 p=0.49
% m
orte
s
limite : S. scapterisci”symbiotique“...
phaseparasitairebactérie
bactériesnématode
(stade infestant)
nématode
phase libre
faible- +
bilan
diversité
forte
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
État de l’art
Observations (interspécifique)
Pour le nématode :
bénéfice en phase parasitaire : reproduction
coût en phase libre : mortalité à 25° C
Hypothèses (intraspécifique)
+ de bactéries −→ meilleure reproduction ?
+ de bactéries −→ + de mortalité ?
compromis survie - reproduction ? Lien avec la symbiose ?
Modèle et méthodecouple S. carpocapsae - X. nematophila : nombre variablede bactéries portées (Flores-Lara et al. 2007)
mesures de reproduction, survie et nombre de bactériesportées
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
État de l’art
Observations (interspécifique)
Pour le nématode :
bénéfice en phase parasitaire : reproduction
coût en phase libre : mortalité à 25° C
Hypothèses (intraspécifique)
+ de bactéries −→ meilleure reproduction ?
+ de bactéries −→ + de mortalité ?
compromis survie - reproduction ? Lien avec la symbiose ?
Modèle et méthodecouple S. carpocapsae - X. nematophila : nombre variablede bactéries portées (Flores-Lara et al. 2007)
mesures de reproduction, survie et nombre de bactériesportées
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
État de l’art
Observations (interspécifique)
Pour le nématode :
bénéfice en phase parasitaire : reproduction
coût en phase libre : mortalité à 25° C
Hypothèses (intraspécifique)
+ de bactéries −→ meilleure reproduction ?
+ de bactéries −→ + de mortalité ?
compromis survie - reproduction ? Lien avec la symbiose ?
Modèle et méthodecouple S. carpocapsae - X. nematophila : nombre variablede bactéries portées (Flores-Lara et al. 2007)
mesures de reproduction, survie et nombre de bactériesportées
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
État de l’art
Observations (interspécifique)
Pour le nématode :
bénéfice en phase parasitaire : reproduction
coût en phase libre : mortalité à 25° C
Hypothèses (intraspécifique)
+ de bactéries −→ meilleure reproduction ?
+ de bactéries −→ + de mortalité ?
compromis survie - reproduction ? Lien avec la symbiose ?
Modèle et méthodecouple S. carpocapsae - X. nematophila : nombre variablede bactéries portées (Flores-Lara et al. 2007)
mesures de reproduction, survie et nombre de bactériesportées
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
État de l’art
Observations (interspécifique)
Pour le nématode :
bénéfice en phase parasitaire : reproduction
coût en phase libre : mortalité à 25° C
Hypothèses (intraspécifique)
+ de bactéries −→ meilleure reproduction ?
+ de bactéries −→ + de mortalité ?
compromis survie - reproduction ? Lien avec la symbiose ?
Modèle et méthodecouple S. carpocapsae - X. nematophila : nombre variablede bactéries portées (Flores-Lara et al. 2007)
mesures de reproduction, survie et nombre de bactériesportées
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
État de l’art
Observations (interspécifique)
Pour le nématode :
bénéfice en phase parasitaire : reproduction
coût en phase libre : mortalité à 25° C
Hypothèses (intraspécifique)
+ de bactéries −→ meilleure reproduction ?
+ de bactéries −→ + de mortalité ?
compromis survie - reproduction ? Lien avec la symbiose ?
Modèle et méthodecouple S. carpocapsae - X. nematophila : nombre variablede bactéries portées (Flores-Lara et al. 2007)
mesures de reproduction, survie et nombre de bactériesportées
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
État de l’art
Observations (interspécifique)
Pour le nématode :
bénéfice en phase parasitaire : reproduction
coût en phase libre : mortalité à 25° C
Hypothèses (intraspécifique)
+ de bactéries −→ meilleure reproduction ?
+ de bactéries −→ + de mortalité ?
compromis survie - reproduction ? Lien avec la symbiose ?
Modèle et méthodecouple S. carpocapsae - X. nematophila : nombre variablede bactéries portées (Flores-Lara et al. 2007)
mesures de reproduction, survie et nombre de bactériesportées
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Plan d’expérience
ancestralaposymbiotiques
stock d’IJs
pour chaquelignée
G0
aposymbiotique
mesures :
mesures :
succès repro parental
bactérienative
pour chaquelignée
symbiotique
{
parentauxeffets
mortalité
succès reproductifparasitaireréussite parasitairephase
rétention{phase libre G1
×37
×50 ×50
G1
×36
G2 G2
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Résultats
corrélation réussite parasitaire - nombre de bactériesportées
phaseparasitairebactérie
bactériesnématode
(stade infestant)
nématode
phase libre
facteur significativité sens de l’effet
succès reproductif parental n.s.
nombre de bactéries portées *** +
succès repro parental
× *** -nombre de bactéries portées
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Résultats
corrélation réussite parasitaire - nombre de bactériesportées
facteur significativité sens del’effet
succèsreproductif n.s.parental
nombre debactéries *** +portées
succès reproparental
× nombre de *** -bactériesportées
phaseparasitairebactérie
bactériesnématode
(stade infestant)
nématode
phase libre 0 50 100 150 200 250
0.2
0.3
0.4
0.5
0.6
0.7
0.8
0.9
1.0
●
●
●
●
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●●
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●● ●●
●
●
●
●
● ●
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●
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●
●●
●
●
●
●
● ●
●
●
J 14
rétention (bactéries par nématode)
réus
site
par
asita
ire
●
●
grandes fratriespetites fratries
p<0.0001 (0.009)
p=0.014 (0.271)
J28 : p<0.0001 (0.033) ; p=0.268
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Résultats
corrélation réussite parasitaire - nombre de bactériesportées
facteur significativité sens del’effet
succèsreproductif n.s.parental
nombre debactéries *** +portées
succès reproparental
× nombre de *** -bactériesportées
phaseparasitairebactérie
bactériesnématode
(stade infestant)
nématode
phase libre 0 50 100 150 200 250
0.2
0.3
0.4
0.5
0.6
0.7
0.8
0.9
1.0
●
●
●
●
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●
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●
●
●
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●
●
●
●
● ●
●
●
J 14
rétention (bactéries par nématode)
réus
site
par
asita
ire
●
●
grandes fratriespetites fratries
p<0.0001 (0.009)
p=0.014 (0.271)
J28 : p<0.0001 (0.033) ; p=0.268
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Résultats
(pas de) corrélation succès reproductif - nombre debactéries portées
facteur significativitésuccès reproductif n.s.
parentalnombre de
bactéries portées n.s.succès repro parental× nombre de n.s.
bactéries portées
phaseparasitairebactérie
bactériesnématode
(stade infestant)
nématode
phase libre
0 50 100 150 200 250
1600
0020
0000
2400
00
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●
rétention (bactéries par nématode)
succ
ès r
epro
duct
if (n
émat
odes
)p=0.155
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Résultats
corrélation mortalité - nombre de bactéries portées
facteur significativité sens del’effet
succèsreproductif * +parental
nombre debactéries * +portées
succès reproparental
× nombre de ** -bactériesportées
phaseparasitairebactérie
bactériesnématode
(stade infestant)
nématode
phase libre
0 50 100 150 200 250
−4.
5−
4.0
−3.
5−
3.0
−2.
5−
2.0
●
●
●●
●●
●
●
●
●
●
●
●
●●
● ●●
●●
●
●
●
●
●●
●
●
●
●
●
●
●
●
●
●
rétention (bactéries par nématode)
log(
mor
talit
é)
●
●
grandes fratriespetites fratries
p=0.586
p=0.00015(0.014)
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Résultats
corrélation réussite parasitaire - mortalité
−7 −6 −5 −4 −3 −2
0.0
0.2
0.4
0.6
0.8
1.0
J 14
log(mortalité)
réus
site
par
asita
ire
p=0.967sym, grandes fratries
p<0.0001 (0.012)sym, petites fratries
APO
−7 −6 −5 −4 −3 −2
0.0
0.2
0.4
0.6
0.8
1.0
J 28
log(mortalité)
réus
site
par
asita
ire
sym, grandes fratriesp=0.241
p<0.0001 (0.152)sym, petites fratries
p=0.049 (0.579)APO
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Discussion
Un compromis symbiotique...
existence d’un compromis survie - reproduction
compromis lié à la présence des bactériescorrélations avec le nombre de bactéries portéescomparaison symbiotiques / aposymbiotiques
sévérité dépend des conditions environnementales(détection plus facile en conditions ”restrictives“ que ”favorables“)
8IJs
14 j
20IJs
28 j
+-
forte
faible
diversité des
bilan de l’interaction
partenaires
neutre
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Discussion
Un compromis symbiotique...
existence d’un compromis survie - reproduction
compromis lié à la présence des bactériescorrélations avec le nombre de bactéries portéescomparaison symbiotiques / aposymbiotiques
sévérité dépend des conditions environnementales(détection plus facile en conditions ”restrictives“ que ”favorables“)
8IJs
14 j
20IJs
28 j
+-
forte
faible
diversité des
bilan de l’interaction
partenaires
neutre
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Discussion
Un compromis symbiotique...
existence d’un compromis survie - reproduction
compromis lié à la présence des bactériescorrélations avec le nombre de bactéries portéescomparaison symbiotiques / aposymbiotiques
sévérité dépend des conditions environnementales(détection plus facile en conditions ”restrictives“ que ”favorables“)
8IJs
14 j
20IJs
28 j
+-
forte
faible
diversité des
bilan de l’interaction
partenaires
neutre
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Discussion
Mécanisme du bénéfice ?
nombre debactéries parinsecte
SI de l’insecte : HS
800
80
3 8temps aprèsinjection (h)
∆t1∆t2
(d’après Sicard & al. 2004)
importanceprécoce desbactéries : effetssur la réussiteparasitaire, jamaissur le succèsreproductif
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Discussion
Mécanisme du bénéfice ?
nombre debactéries parinsecte
SI de l’insecte : HS
800
80
3 8temps aprèsinjection (h)
∆t1∆t2
(d’après Sicard & al. 2004)
importanceprécoce desbactéries : effetssur la réussiteparasitaire, jamaissur le succèsreproductif
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Discussion
Mécanisme du coût ?
phaseparasitairebactérie
bactériesnématode
(stade infestant)
nématode
phase libre
les bactéries se multiplient, les nématodes ne senourrissent pasdétecté à 24°C mais pas à 8°Ceffet de la température sur la multiplication bactérienne
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Discussion
Mécanisme du coût ?
phaseparasitairebactérie
bactériesnématode
(stade infestant)
nématode
phase libre
les bactéries se multiplient, les nématodes ne senourrissent pasdétecté à 24°C mais pas à 8°Ceffet de la température sur la multiplication bactérienne
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Discussion
Importance évolutive du compromis ?
−→ effectif dans la nature ?conditionsd’infestation ? (hôtessusceptibles ;rencontre facile)
coût in natura ?(données J.-M. Ourcival)
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Discussion
Importance évolutive du compromis ?
−→ effectif dans la nature ?
conditionsd’infestation ? (hôtessusceptibles ;rencontre facile)
coût in natura ?(données J.-M. Ourcival)
janv févr mars avril mai juin juill août sept oct nov déc
05
1015
2025
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sous couvert, 15 cmfriche hors couvert, 10 cmfriche hors couvert, 40 cm
tem
péra
ture
du
sol (
°C)
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Discussion
Importance évolutive du compromis ?
−→ déterminisme génétique des traits ?
Méthode : évolution expérimentale / sélection artificiellesur le couple némato-bactériensur les bactéries
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Spécificité
diversité despartenaires
bilan del’interaction
-
forte
faible+
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Dans la nature...
●
●
●
●●
●
●M. Montagné
L. Chabaud
MalherbesValescure
Aresquiers
Maguelone
Grand Travers
Espiguette
Jarras
St Gély Castries
Melgueil
Grand Corbières
Bosquet
Montcalm
Mer Méditerranée
Hérault
MontpellierGard
Bouches−
du−Rhône
●
Nématodes rencontrés
les deux genres
Heterorhabditis
Steinernema
Milieux
plageprairiejardin biovigne
0 5 10 km
-
forte
faible+
diversité despartenaires
l’interactionbilan de
autres espèces
X. bovienii
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Au laboratoire...
ré-associer des nématodesavec des bactériesnon-partenaires
mesurer, sur les associationsnaturelles et chimériques :
souches et nombre debactéries portéesbénéficescoûts
phaseparasitairebactérie
bactériesnématode
(stade infestant)
nématode
phase libre
réassociation
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Au laboratoire...
ré-associer des nématodesavec des bactériesnon-partenaires
mesurer, sur les associationsnaturelles et chimériques :
souches et nombre debactéries portéesbénéficescoûts
phaseparasitairebactérie
bactériesnématode
(stade infestant)
nématode
phase libre
réassociation
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Méthode de ré-association nématode-bactéries
papier filtre chenille de
nématodesaposymbiotiques
Galleria melonnella
dans l’obscurité24h à 24°C
Ré-associationinjection des
les chenillesbactéries dans
dispositif de récolte
d’insectecadavre
parasitaireréussite
récolte des IJs
Infestation :
rétention
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Plan d’expérience
(1) Ré-associations avec Steinernema carpocapsae
Xenorhabdus nematophila
Xenorhabdus bovienii
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Plan d’expérience
(2) Ré-associations avec Steinernema feltiae
Xenorhabdus nematophila
Xenorhabdus bovienii
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Résultats
nombre de bactéries portées
Steinernema carpocapsae
● ●
●
●
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●
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● ●
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● ● ●
0.00 0.02 0.04 0.06 0.08 0.10 0.12
020
4060
80
distance phylogénétique à la bactérie native
réte
ntio
n (b
acté
ries
par
ném
atod
e)
X. nematophila
●
●
●
plus portéesautant portéesmoins portées
Steinernema feltiae
● ●●●
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● ●
0.00 0.02 0.04 0.06 0.08 0.10 0.12
05
1015
20
distance phylogénétique à la bactérie native
réte
ntio
n (b
acté
ries
par
ném
atod
e)
●
●
autant portéesmoins portées
X. bovienii
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Résultats
→ spécificité de rétention :
existe+ forte chezS. carpocapsae en inter-, maispas en intra-spécifiquenon-congruence de la phylogénie(ADNr 16s) et de la rétention :évolution différente des gènes
- +S. carpocapsae l’interaction
bilan de
diversité despartenaires
forte
faible
S. feltiae?
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Résultats
→ spécificité de rétention :
existe+ forte chezS. carpocapsae en inter-, maispas en intra-spécifiquenon-congruence de la phylogénie(ADNr 16s) et de la rétention :évolution différente des gènes
- +S. carpocapsae l’interaction
bilan de
diversité despartenaires
forte
faible
S. feltiae?
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Résultats
→ spécificité de rétention :
existe+ forte chezS. carpocapsae en inter-, maispas en intra-spécifiquenon-congruence de la phylogénie(ADNr 16s) et de la rétention :évolution différente des gènes
- +S. carpocapsae l’interaction
bilan de
diversité despartenaires
forte
faible
S. feltiae?
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Résultats
réussite parasitaire
Steinernema carpocapsae
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0.00 0.02 0.04 0.06 0.08 0.10 0.12
0.0
0.2
0.4
0.6
0.8
distance phylogénétique à la bactérie native
réus
site
par
asita
ire à
J28
●
●
●
bénéfiquesneutrestoxiques
X. nematophila
spécificité de bénéficesbactéries bénéfiques nonretenues→ gènes différents
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Résultats
réussite parasitaire
Steinernema carpocapsae
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distance phylogénétique à la bactérie native
réus
site
par
asita
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J28
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bénéfiquesneutrestoxiques
X. nematophila
spécificité de bénéficesbactéries bénéfiques nonretenues→ gènes différents
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Résultats
réussite parasitaire
Steinernema carpocapsae
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0.2
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distance phylogénétique à la bactérie native
réus
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par
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bénéfiquesneutrestoxiques
X. nematophila
spécificité de bénéficesbactéries bénéfiques nonretenues→ gènes différents
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Résultats
réussite parasitaire
Steinernema carpocapsae
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distance phylogénétique à la bactérie native
réus
site
par
asita
ire à
J28
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bénéfiquesneutrestoxiques
X. nematophila
Steinernema feltiae
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1.0
distance phylogénétique à la bactérie native
réus
site
par
asita
ire à
J28
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bénéfiquesneutrestoxiques
X. bovienii
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Résultats
réussite parasitaire
Observations
pas de signal globalementmais...
beaucoup de bactéries lointaineset bénéfiques
forte variation de réussite entresouches proches
Hypothèses
évolution rapide ?
transferts latéraux de gènes ?
autre mécanisme ?
Steinernema feltiae
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1.0
distance à la bactérie native
réus
site
par
asita
ire à
J28
●
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bénéfiquesneutrestoxiques
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Résultats
réussite parasitaire
Observations
pas de signal globalementmais...
beaucoup de bactéries lointaineset bénéfiques
forte variation de réussite entresouches proches
Hypothèses
évolution rapide ?
transferts latéraux de gènes ?
autre mécanisme ?
Steinernema feltiae
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distance à la bactérie native
réus
site
par
asita
ire à
J28
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●
bénéfiquesneutrestoxiques
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Discussion
Origine de la variabilité de réussite avec X. bovienii ?
observation : beaucoup de transferts horizontauxréussite : bénéfices nutritifs ET activités toxiques(antimicrobiens, nématicides)bactéries : arbitres des compétitions entre coupleslarge aire de répartition de S. feltiae, donc de X. bovienii→ compétitions fréquentes ?
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Discussion
Origine de la variabilité de réussite avec X. bovienii ?
observation : beaucoup de transferts horizontauxréussite : bénéfices nutritifs ET activités toxiques(antimicrobiens, nématicides)bactéries : arbitres des compétitions entre coupleslarge aire de répartition de S. feltiae, donc de X. bovienii→ compétitions fréquentes ?
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Discussion
Origine de la variabilité de réussite avec X. bovienii ?
observation : beaucoup de transferts horizontauxréussite : bénéfices nutritifs ET activités toxiques(antimicrobiens, nématicides)bactéries : arbitres des compétitions entre coupleslarge aire de répartition de S. feltiae, donc de X. bovienii→ compétitions fréquentes ?
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Discussion
Origine de la variabilité de réussite avec X. bovienii ?
observation : beaucoup de transferts horizontauxréussite : bénéfices nutritifs ET activités toxiques(antimicrobiens, nématicides)bactéries : arbitres des compétitions entre coupleslarge aire de répartition de S. feltiae, donc de X. bovienii→ compétitions fréquentes ?
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Discussion
Des couples qui fonctionnent différemment...
S. feltiaeX. bovienii
forte
faible
diversité despartenaires
S. carpocapsaeX. nematophila
rétention
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Discussion
Des couples qui fonctionnent différemment...
S. feltiaeX. bovienii
S. feltiaeX. bovienii
forte
faible
diversité despartenaires
S. carpocapsaeX. nematophila
rétention
réussite parasitaire
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Discussion
Des couples qui fonctionnent différemment...
X. innexiS. scapterisci
S. feltiaeX. bovienii
X. nematophilaS. carpocapsae
forte
faible
partenairesdiversité des
- bilan del’interaction
+neutre
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Perspectives
coûts : mortalité
réassociation
entre couplescompétitions
horizontauxtransferts
phase libre (dans le sol)
abondance des hôtes insectesdistribution des couples némato-bactériensconditions climatiques et édaphiques
bénéfices : reproductionphase parasitaire (dans l’insecte)
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Merci à...
équipe Interactions, Nath, Elo, BernardISEM ; EMIP : Sylvietechniciens, enseignants, chercheurs, thésards, étudiantsproducteurs bioamis, Mica, familleartistes : J.S. Bach, S. Barber, L.v. Beethoven, Bénabar, G.Brassens, F. Chopin, E. Elgar, les Fatals Picards, R.Garcia-Fons, G. Mahler, W.A. Mozart, Noir Désir, Paris Combo,J.-B. Pergolese, Radiohead, S. Rachmaninov, Renaud S., F.Schubert, D. Squiban...
merci de votre attention...
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Merci à...
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Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Merci à...
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Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Merci à...
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Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Rab
corrélation réussite parasitaire-rétention
0 50 100 150 200 250
0.2
0.3
0.4
0.5
0.6
0.7
0.8
0.9
1.0
20 L3, J14
rétention
réus
site
grandes fratriespetites fratries
p<0.0001 (0.202)
p=0.159
J28 : p<0.0001 (0.351) ; p=0.348
0 50 100 150 200 2500.
20.
30.
40.
50.
60.
70.
80.
91.
0
8 L3, J14
rétention
réus
site
grandes fratriespetites fratries
p<0.0001 (0.009)
p=0.014 (0.271)
J28 : p<0.0001 (0.033) ; p=0.268
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Rab
corrélation réussite parasitaire (20 IJs) -mortalité
−4.5 −4.0 −3.5 −3.0 −2.5 −2.0
0.0
0.2
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0.6
0.8
1.0
J 14
log(mortalité)
réus
site
par
asita
ire
APO
sym, petites fratries
p<0.0001 (0.39)
sym, grandes fratries0.964
−4.5 −4.0 −3.5 −3.0 −2.5 −2.0
0.0
0.2
0.4
0.6
0.8
1.0
J 28
log(mortalité)
réus
site
par
asita
ire
APO : p=0.293
sym, petites fratries
p<0.0001 (0.597)
sym, grandes fratries0.427
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Rab
rétention-réussite, 8 IJs
0 50 100 150 200 250
0.2
0.3
0.4
0.5
0.6
0.7
0.8
0.9
1.0
8 L3, J14
rétention
réus
site
grandes fratriespetites fratries
p<0.0001 (0.009)
p=0.014 (0.271)
0 50 100 150 200 250
0.2
0.3
0.4
0.5
0.6
0.7
0.8
0.9
1.0
8 L3, J28
rétention
réus
site
grandes fratriespetites fratries
p<0.0001 (0.033)
p=0.268 (0.275)
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Rab
Couples trouvés sur le terrain
M. MontagnéL. Chabaud
MalherbesValescure
Aresquiers
Maguelone
Espiguette
Grand Travers
Jarras
St Gély Castries
Melgueil
Grand Corbières
Bosquet
Montcalm
Mer Méditerranée
HéraultGard
Bouches−
du−Rhône
Nématodes rencontrés
les deux genres
HeterorhabditisSteinernema
Milieux
plageprairiejardin biovigne
0 5 10 km
H. b. 1↔ P. l. ssp.kayaii
H. b. 2↔ P. l. ssp.laumondii sauf enun site (Montcalm)
S. feltiae ↔ X.bovienii
S. affine ↔ X.bovienii
S. ∼ arenarium ↔X. kozodoii
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Rab
Hypothèse
Xenorhabdusnematophila
+ + + ?
bovieniiXenorhabdus
+ ?
autresespèces
0 ?
notion detoxicitéévolution desgènes 16s -toxicité
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Rab
Hypothèse
Xenorhabdusnematophila
+ + + ?
bovieniiXenorhabdus
+ ?
autresespèces
0 ?
notion detoxicitéévolution desgènes 16s -toxicité
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Rab
Hypothèse (bis)
X. bovienii
parasitaireréussite
distance phylogénétique à la bactérie native
autres bactéries
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Rab
Corrélation positive là où on en attend une négative
W H Y M I G H T W E O B S E R V E T H E ' W R O N G ' T R A D E - O F F ? 8 1
(0) S A 4.8 Consider a trade-08 between reproduction ( R ) and survival ( S ) . The
3 total amount of energy acquired is set by A, where A = R + S. The fraction of _.- _-../IIC. L
r>O energy alrocatecfto reproduction is deter- mined by B, so R i = B i A i . In (a), the
2 general possibilities are sketched. In (b), f >C. : , / the ~ariaj ion among individuals in energy -; - '" '.:'c acquired ( A ) is large, but the variationin /? kdc,db , , I~c~~n~allocated-torepro~,y~i,~n , (B) is
1 small. The result is a p o s i f ! v e n - b e t w ~ . e ~ r e p r ~ d u c t i o n and s"rv7;al. In
(c), the variation-," A. is smali but the j i 4 w's ,' ::-, ~ I;
varigconw~n.B..is large. The result is a negative correlation between reproduction,';, -. (.. .. , - )
1 2 3 ,<..:: R ' . ' , .. ! and survival. . ; I
, , v.04 ',: - J
indicate each indiyjdual by a subscript i, then we have ,?,..: ;-,;.:'~:r> ' ~ c 2~ L , < .!,A.>:)
- ' c - r , ,c 3 ,q .?". --
R i = Bi Ai- (4.2)
Van Noordwijk and de Jong saw that the sign of the correlation between R and S depends on the degree to which each varies among individuals (Fig. 4.8).
They explain this result by an analogy with . economics: '11 the budget is fixed, people spending
''<, -. t , , - . ? .',7?
. ., .-Y - more on housing should spend less on cars. In
(:~<\, -- . -. " . fact, the amount of expendable income is variable,
, - .- - y . _ _ _ . _ _ . - - and in many situations positive correlations are observed between the per-family expenses on
i housing and on cars. There is little problem in identirying rich and poor families. . . . Where biologists have observed positive correlations between life history traits, they have often also identified individuals that perform well or poorly'.
If we observe a positive correlation where theory expects a negative one, this analysis
, !<, - - ;, - suggests that we ask 'Do the organisms Vary more
,' . / L..
, . > ... in the amount or energy acquired than in the fraction of energy allocated to each function?'.
Genotype by environment interactions We might also observe no trade-off or an unexpected one because of genotype x environ- ment interactions. M.icroevolutionar-y trade-offs in life bistory traits result both from genetic correla- .tions and from their expression. The mecbanisms involved in the expression of genetic correlations
include physiolog~cal trade-offs that allocate resources among reproduction, growth, main- tenance, and storage. These allocations change across environments; they have r e g i o n norms.
Al1 three levels contribute t o h o w a trade-off works. Natural selection acts on phenotypes; phenotypic correlations. determine- the .trade-offs presented to na.t.u~a.1-selection. The response to selection depends on genetic variation; genetic correlations determine whether, and in what direction, a response to selection will occur. Geno- type x environment interactions change genetic correlations across environments.
Strong, ~negative: -phenotyLpic,c.~~~gl~tions be- tween t u 0 .t,rai.ts with zero herita bility produce-no --- ,a-__l r".r"-~--
genetic,,.~c-spgn,s-e to selection. When a genetic .-.."W.,,- ,..., '.~ ..r,.. .:..~.
correlation is positive under some conditions and negative under others, then only in the latter would we perceive a trade-off (Gebhardt and Stearns 1988). When an environmental, factor\ affects one,trait more than another, the-pheno-t-ypic ' wlkt&*between the two traits cha-nges-eaws. .. enviro~msnas and alters the selection gradients. For example, the phenotypic correlation between developmental rate and size at metamorphosis in frogs changes from positive to negative within a full-sib family when food level and distribution Vary (Travis 1984). The environment can determine whether the trade-off appears at all.
Genotype by environment,interactions could ,,@ange the expression, of genetic correlations
betweeirepro&Ïcti-& investment vs.,s"rvival (Fig. 4.9). Where genetic variation exists for reaction
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Rab
De Mazancourt et al. 2005
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Rab
modèle mortalité manip trade-off
%vivantes = exp(A× t + b) (1)
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Rab
Gènes nil de Xenorhabdus nematophila
0, 01
0, 001
0, 1
1
10
100 a
b b
a
wt vecteur vecteurvide nil
∆
gènes nécessaires...
0, 001
0, 0001
0, 01
10
0, 1
1
Xenorhabduspoinarii
Xenorhabdusbovienii
avec nilsans nil
... et suffisants
pour la colonisation de Steinernema carpocapsae (Cowles &Goodrich-Blair 2008)
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Rab
Méthodes modélo
modèle inspiré du modèle SIdynamique adaptative :
initialement : population résidente à l’équilibre (1 seul typede nématodes),introduction d’un mutant de rétention => nouvel équilibre ?Conditions d’invasion ?
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Rab
Formalisme : population résidente
variables :
X : densité IJs
H : densité hôtes sains
I : densité hôtes infectésdXdt
= wI −mX − βHX
1 + aXdHdt
= rH(1− HK
)− βHX
1 + aXdIdt
= βHX
1 + aX− vI
paramètres :
w : fécondité du nématode
m : mortalité des IJs
β : transmissibilité des IJs
a : constante
r : taux de croissanceexponentiel de la pop d’hôtesinsectes
K : capacité biotique de lapop d’hôtes insectes
v : vitesse de décompositiond’un insecte infesté
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Rab
PHASE LIBRE (dans le sol)
L4
|L1L2L3
|
~
PHASE
l’insecte)
émergence
reproduction des nématodesmultiplication des bactéries
et la multiplication bactériennetuent l’insecte
lutte à mort :
bactéries~L3
L4
PARASITE (dans
des partenairesréassociation
StadesInfestants (IJs)
infestation
les toxines des deux partenaires
libération des
IJ
Introduction Coûts-bénéfices dans la symbiose Spécificité
Rab
PHASE LIBRE (dans le sol)
L4
|L1L2L3
|
~
PHASE
l’insecte)
émergence
reproduction des nématodesmultiplication des bactéries
et la multiplication bactériennetuent l’insecte
lutte à mort :
bactéries~L3
L4
succèsreproductif ?
PARASITE (dans
réussiteparasitaire ?
survie ?
bénéfices ?
coûts ?
des partenairesréassociation
StadesInfestants (IJs)
infestation
les toxines des deux partenaires
libération des
IJ