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Centre pour la médecine des poissons et des animaux sauvages (FIWI) Projets actuels du FIWI concernant la santé des populations de poissons Thomas Wahli, Heike Schmidt-Posthaus, Beat von Siebenthal, Nicolas Diserens TW/17

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Centre pour la médecine des poissons et

des animaux sauvages (FIWI)

Projets actuels du FIWI concernant la santé des populations de poissons

Thomas Wahli, Heike Schmidt-Posthaus, Beat von Siebenthal, Nicolas Diserens

TW/17

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TW/2017

Projets actuels

• Maladie rénale proliférative (MRP)

• Influence de la température sur la réponse de l’hôte chez les

truites arc-en-ciel • Comparaison de la susceptibilité à la MRP des truites arc-en-

ciel et des truite fario

• Influence des obstacles à la migration et des mesures de repeuplement sur la MRP chez les populations de truites fario indigènes

• Saprolegniose

• Situation épidémiologique (SHV, NHI, NPI) en Suisse

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Tetracapsuloides bryosalmonae,

Malacosporea, Myxozoa

Maladie Rénale Proliférative (MRP)

3

Malacospore

Actinospore

Hôte Invertébré (bryozoaires)

Hôte Vertébré (salmonidés)

Cycle de Tetracapsuloides bryosalmonae: passage de l’hôte invertébré (bryozoaire) à l’hôte vertébré (salmonidé) et vice versa

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Influence de la température sur la réponse de l’hôte chez les truites arc-en-ciel

4

• La température de l’eau influence le développement de la MRP chez

les truites

• Mécanisme de cette influence pas encore élucidé : Causé par le

parasite ou par l’hôte

Question

• Est-ce que la température de l’eau influence la réponse de l’hôte

chez les truites arc-en-ciel contre une infection par

Tetracapsuloides bryosalmonae?

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Influence de la température sur la réponse de l’hôte chez les truites arc-en-ciel

5

Méthode:

- Infection de truite arc-en-ciel avec la même concentration de parasite

à 12°C et 15°C

- Echantillonnages réguliers

- Mesure de la prévalence, de l’intensité de l’infection et de

l’expression de différents gènes (tous dans le rein)

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Influence de la température sur la réponse de l’hôte chez les truites arc-en-ciel

6

Résultats:

- Différences de prévalence et d’intensité d’infection en fonction de la température de l’eau

Prévalence Intensité de l’infection

Nb

re d

e co

pie

s d

’AD

N d

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bry

osa

lm.

% d

e p

ois

son

s in

fect

és

Semaines après infection Semaines après infection

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Influence de la température sur la réponse de l’hôte chez les truites arc-en-ciel

7

Résultats :

Augmentation et diminution relative par rapport au contrôle

Température de l’eau

- L’augmentation/diminution des gènes à différentes températures chez des poissons infectés par rapport à des animaux non-infectés présente clairement un tableau différent

- La température de l’eau n’influence pas uniquement la prévalence et l’intensité de l’infection, mais également le type de réponse de l’hôte

Conclusions:

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Comparaison de la susceptibilité à la MRP des truites arc-en-ciel et des truite fario

8

Beaucoup d’expériences sur la MRP réalisées avec des truites arc-en-ciel

Questions

• Est-ce que l’exposition de truites arc-en-ciel et de truites fario à la

même quantité de parasites dans les même conditions aboutit à

une évolution d’infection identique?

• Est-ce que les résultats obtenus avec des truites arc-en-ciel se

laissent transposer aux truites fario?

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Comparaison de la susceptibilité à la MRP des truites arc-en-ciel et des truite fario

9

Méthode:

- Infection de truites arc-en-ciel et de truites fario avec la même

concentration de parasites à 12°C et 15°C

- Echantillonnages réguliers

- Mesure de la prévalence et de l’intensité de l’infection

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Comparaison de la susceptibilité à la MRP des truites arc-en-ciel et des truite fario

10

Résultats:

Truites fario 12°C

% d

e p

ois

son

s in

fect

és

Truites arc-en-

ciel 12°C

Truites fario 15°C

Truites arc-en-

ciel 15°C

Truites fario 12°C

A

DN

de

par

asit

es p

ar r

ein

Truites arc-en-

ciel 12°C

Truites fario 15°C

Truites arc-en-

ciel 15°C

Prévalence Intensité de l’infection

- Différences de prévalence et d’intensité d’infection en fonction de l’espèce de poisson

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Comparaison de la susceptibilité à la MRP des truites arc-en-ciel et des truite fario

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- Aussi bien la prévalence que l’intensité d’infection est plus élevée chez les truites fario que chez les truites arc-en-ciel

- L’influence de la température sur la prévalence est plus marquée chez les truites fario que chez les truites arc-en-ciel

Transposition directe des résultats d’une espèce à une autre guère possible

Conclusions:

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Influence des mesures de repeuplement sur la MRP

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Hypothèse

Les mesures de repeuplement sont déterminantes dans des nombreuses rivières pour le maintien des populations de truites fario, en particulier en présence de la MRP

Cantons participants jusqu’à: Saint-Gall, Argovie

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MRP et repeuplement – Saint-Gall

Analyses Brübach (plus de repeuplement depuis 2014)

13

Année

Pêches électriques Tetracapsuloides bryosalmonae

dans les truites fario

N estivaux

N

animaux

plus âgé

Nombre

d‘estivaux

analysés

Prévalence (%)

Pathologie

Histologie PCR Intensité

d‘infection

2014 33 53 27 96 n.d. 5.4 3.9

2015 29 38 26 69 85 4 3.5

2016 72 19 27 85 100 4 3.8

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MRP et repeuplement – Argovie

Analyses Wyna Dernier repeuplement d’estivaux durant l’été 2015

14

Localité

Tetracapsuloides bryosalmonae dans les truites fario

Nombre

d‘estivaux

analysés

Prévalence (%) Intensité

d‘infection Pathologie

Histologie PCR

2015 2016 2015 2016 2015 2016 2015 2016 2015 2016

Menziken 27 25 0 0 0 0 0 0 0 0

Gontenschwil n.d. 34 n.d. 85 n.d. 100 n.d. 4 n.d. 4.1

Oberkulm 27 25 100 92 n.d. 100 2 3.7 1.6 3.9

Suhr 23 25 100 100 n.d. n.d. 3.3 4 3.5 3.9

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Frai naturel / repeuplement

Rapport

Frai naturel / repeuplement 2:1 1:1.6 8.5:1.5 9:1

Wyna

Comparaison frai naturel et repeuplement

Repeuplement (génétique)

Repeuplement (marquage)

Frai naturel

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TW/2017

Saprolegniose Détection et identification de Saprolegnia

Projet commun entre le «Laboratorio di microbiologia applicata Dipartimento ambiente, costruzioni e design» SUPSI (Bellinzone) et le FIWI Objectifs du projet: • Établissement d’une méthode de détection

pour Saprolgenia parasitica • Analyse de la relation génétique entre

les isolats

Méthodes pour la détection: • MALDI-TOF spectrométrie de masse

• PCR et séquençage ITS nrDNA

Méthode pour la génétique

• MLST Typing (7 Loci)

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Cycle de vie de Saprolegnia

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TW/2017

Saprolegniose Détection et identification de Saprolegnia

Résultats: Détection • Maldi-Tof MS est approprié pour la détection de culture pure • Séquençage ITS nrDNA aussi utilisable avec du matériel provenant

directement des poissons • Bonne corrélation entre les résultats obtenus par les deux méthodes

Génétique • 39 isolats analysés jusqu’à présent • 6 types d’isolats différents identifiés • Parfois 2 types différents dans la même rivière

Conclusions: • Isolats provenant de différents endroits non clonal Pas d’isolat unique

responsable pour l’infection en Suisse • Sur la base de la génétique, isolats présents depuis longtemps en Suisse

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TW/2017

Situation épidémiologique dans les cours d’eau

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Aucun virus détecté!!!

Truite fario Truite de lac ▲ Omble chevalier Ombre commun 65 lieux d’échantillonnage 322 poissons analysés

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Situation épidémiologique dans les exploitations aquacoles

• 38 piscicultures représentatives

• 1 à 10 échantillons par exploitation

• 1 échantillon = Pool de 5 poissons

• 210 échantillons au total

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Nbre de bassins testés positifs par exploitation Aar 1 1/6 17% SHV

Ticino 1 2/4 50% NHI

Aar 2 1/4 25% NPI

Aar 3 9/10 90% NPI

Limmat/Reuss 1 1/5 20% NPI

Rhin 1 1/4 25% NPI

Rhône 1 7/10 70% NPI

Rhône 2 7/10 70% NPI

Rhône 3 2/2 100% NPI

Bassin versant Positif SHV Positif NHI Positif NPI

Aar 1 (6.7%) 0 2 (13.3%)

Limmat/Reuss 0 0 1 (14.3%)

Rhin 0 0 1 (20%)

Rhône/Doubs 0 0 3 (33%)

Ticino 0 1 (50%) 0

Total 1 (2.6%) 1 (2.6%) 7 (18.4%)

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Analyse phylogénétique du virus de la NPI

Analyse phylogénétique des virus de la NPI isolés en Suisse depuis 2004 Routes de propagation: • Transfert de poissons vivants comme

vecteur principal • Rôle secondaire de l’eau et des poissons

sauvages

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Conclusions sur la situation épidémiologique

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• Exploitations aquacoles commerciales:

• NPI relativement largement répandue

• NHI et SHV rarement détectée

• Détection à chaque fois chez des animaux ne présentant aucun symptôme

Surveillance active (y.c. échantillonnage) importante, en particulier pour la lutte contre la NPI

• Cours d’eau:

• Aucune maladie virale à déclaration obligatoire détectée

chez des poissons sauvages

• Aucun indice de transmission du virus de la NPI par les cours d’eau

Aucun indice de transmission entre les populations de poissons sauvages et d’élevage et vice versa

La NPI sera probablement retirée de la liste

des maladies à déclaration obligatoire

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Un grand merci à:

• OFEV, OSAV, cantons et particuliers pour le soutien

financier

• Pêcheurs et autorités pour l’envoi des poissons

• Toutes les personnes et cantons impliqués

Nous espérons que la bonne collaboration se poursuivra!

Remerciements

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